report_Run8_v9.txt 17.5 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70_v4.txt

best params:{'c1': 0.005890787510878062, 'c2': 0.06901405430753309}
best CV score:0.800439058983579
model size: 0.13M

Flat F1: 0.7875530357193007
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     0.405     0.577        37
         pH      1.000     1.000     1.000        12
  Technique      0.952     0.909     0.930        22
        Med      0.889     0.842     0.865        57
       Temp      0.818     1.000     0.900        18
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         0
      Phase      1.000     0.895     0.944        19
        Air      0.754     0.742     0.748        62
       Anti      1.000     0.444     0.615         9
     Strain      1.000     1.000     1.000         1
      Gtype      0.862     0.764     0.810       106
  Substrain      0.000     0.000     0.000         1
       Supp      0.865     0.662     0.750       136
   Gversion      0.000     0.000     0.000         0

avg / total      0.875     0.733     0.788       480


Top likely transitions:
OD     -> OD      5.295300
Med    -> Med     4.817027
Air    -> Air     4.541687
Temp   -> Temp    4.477980
Anti   -> Anti    4.403961
Agit   -> Agit    4.189406
O      -> O       4.155711
Gversion -> Gversion 3.926573
Phase  -> Phase   3.764540
Gtype  -> Gtype   3.728193
Supp   -> Supp    3.500024
Technique -> Technique 2.523454
pH     -> pH      2.120930
O      -> Supp    1.644804
Substrain -> Gtype   1.553365
Gtype  -> Supp    1.549696
Air    -> O       1.305073
O      -> Gtype   1.048094
Technique -> Air     1.030180
O      -> Technique 0.933161
O      -> Temp    0.764897
Gtype  -> pH      0.723788
Med    -> O       0.647341
Gtype  -> Air     0.646357
O      -> Anti    0.639501
OD     -> Phase   0.283925
O      -> Strain  0.281301
Phase  -> O       0.224883
O      -> Gversion 0.199014
O      -> Vess    0.165133
O      -> pH      0.164399
Supp   -> O       0.147494
Temp   -> O       0.060602
O      -> Med     0.024988
pH     -> Vess    -0.000034
Gversion -> Strain  -0.000143
Agit   -> Anti    -0.005756
Strain -> Gversion -0.006189
Vess   -> O       -0.008273
Vess   -> Technique -0.009171
Substrain -> Phase   -0.009186
Temp   -> Substrain -0.014198
Med    -> Strain  -0.014524
Vess   -> Med     -0.015908
Med    -> Agit    -0.017755
Agit   -> Gversion -0.019478
Med    -> Vess    -0.019502
Gversion -> Agit    -0.021787
Substrain -> Med     -0.022015
pH     -> Agit    -0.023370


Top unlikely transitions:
Gversion -> Gtype   -0.449091
Anti   -> Supp    -0.469341
Technique -> O       -0.471772
Air    -> Gtype   -0.471801
OD     -> Anti    -0.472176
Med    -> Air     -0.493933
Gversion -> Supp    -0.505303
Air    -> Temp    -0.514758
Anti   -> Gtype   -0.526422
Technique -> Gversion -0.527475
OD     -> Supp    -0.540365
Gversion -> Air     -0.543215
Gversion -> Technique -0.557808
OD     -> Technique -0.562317
Anti   -> OD      -0.572231
Air    -> Supp    -0.574414
Gtype  -> Phase   -0.589533
Supp   -> pH      -0.634245
Air    -> Med     -0.635679
OD     -> Med     -0.653630
O      -> Air     -0.677094
Supp   -> Phase   -0.687344
Gtype  -> Technique -0.694977
Technique -> Supp    -0.714796
OD     -> Temp    -0.724798
Supp   -> Temp    -0.735059
Gtype  -> Gversion -0.783076
Temp   -> Med     -0.785893
Phase  -> Technique -0.787474
OD     -> Gtype   -0.788802
Gtype  -> Med     -0.799774
Air    -> OD      -0.822597
Supp   -> Anti    -0.844375
Supp   -> Air     -0.856507
OD     -> O       -0.872397
Supp   -> OD      -0.885971
Supp   -> Gversion -0.902285
Gtype  -> Anti    -0.919969
Gtype  -> OD      -0.936809
Agit   -> O       -0.963196
Supp   -> Gtype   -0.973061
Supp   -> Technique -0.989494
OD     -> Air     -1.170906
Technique -> OD      -1.195273
Technique -> Gtype   -1.215623
Substrain -> O       -1.241298
Supp   -> Med     -1.319744
Technique -> pH      -1.339939
Med    -> Supp    -1.354155
Phase  -> OD      -1.507830


Top positive:
6.001404 O        b'lemma:_'
5.108046 O        b'lemma:1'
4.607885 Air      b'lemma:anaerobic'
4.487322 O        b'lemma:2'
4.403039 Strain   b'lemma:k-12'
4.353066 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.261832 Technique b'lemma:chipseq'
4.120645 Air      b'lemma:aerobic'
4.097041 Supp     b'lemma:Iron'
4.006566 O        b'lemma:rpob'
3.971422 Supp     b'lemma:nh4cl'
3.946783 Supp     b'lemma:pq'
3.920412 Supp     b'lemma:glucose'
3.913288 O        b'postag:IN'
3.777202 O        b'lemma:3'
3.702196 Gtype    b'lemma:arca8myc'
3.696052 O        b'lemma:rep1'
3.694299 Gtype    b'lemma:wt'
3.684859 Phase    b'lemma:stationary'
3.619890 Gtype    b'lemma:flag-tag'
3.619890 Gtype    b'-1:lemma:c-terminal'
3.561287 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
3.436909 Substrain b'lemma:mg1655'
3.399977 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
3.390171 O        b'lemma:rep2'
3.367223 Supp     b'lemma:acetate'
3.313496 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.310220 Phase    b'lemma:mid-log'
3.304995 Gversion b'lemma:asm584v2'
3.270028 O        b'lemma:Cra'
3.220110 Supp     b'lemma:no3'
3.184611 O        b'lemma:b'
3.183606 O        b'postag::'
3.173832 Supp     b'lemma:nitrate'
3.172458 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.117942 O        b'lemma:a'
3.086615 Gtype    b'lemma:delta-arca'
3.060393 Med      b'lemma:LB'
3.052585 O        b'lemma:.'
3.052585 O        b'postag:.'
3.040998 O        b'-1:lemma:tag'
3.039527 Air      b'lemma:Aerobic'
3.034395 O        b'lemma:rep3'
3.030474 Med      b'lemma:lb'
3.013829 Supp     b'lemma:Fe'
2.993252 Technique b'lemma:rna-seq'
2.946753 Supp     b'lemma:dpd'
2.934731 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
2.888684 Technique b'lemma:chip-seq'
2.845234 Supp     b'lemma:fructose'
2.833231 OD       b'lemma:od600'
2.824550 O        b'-1:lemma:Aerobic'
2.820328 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.817149 O        b'lemma:\xcf\x8332'
2.807553 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.800013 O        b'+1:postag:RB'
2.767317 Supp     b'+1:lemma:1'
2.763849 Technique b'lemma:rnaseq'
2.736019 Anti     b'lemma:none'
2.735616 Med      b'lemma:MOPS'
2.704042 O        b'postag:VBN'
2.692426 Anti     b'lemma:seqa'
2.674687 O        b'lemma:CEL'
2.641978 Med      b'+1:lemma:0.4'
2.538323 O        b'lemma:Custom'
2.532184 OD       b'lemma:od450'
2.528303 Gtype    b'lemma:type'
2.515549 Gtype    b'+1:lemma:type'
2.508151 O        b'lemma:-'
2.506162 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
2.494354 pH       b'lemma:ph5'
2.494354 pH       b'+1:lemma:.5'
2.483580 Gversion b'lemma:nc'
2.472529 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.439115 Air      b'postag:RB'
2.437715 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
2.432663 Gtype    b'lemma:nsrr'
2.426483 O        b'lemma:affyexp'
2.426224 Vess     b'lemma:flask'
2.426224 Vess     b'-1:lemma:warm'
2.409664 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
2.401638 Supp     b'-1:lemma:Cra'
2.397836 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.376616 Gtype    b'+1:lemma:with'
2.376328 Supp     b'+1:lemma:2'
2.352749 O        b'+1:lemma:od600'
2.350360 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.340801 Supp     b'+1:lemma:_'
2.340243 Supp     b'lemma:arginine'
2.296460 O        b'lemma:chip-arca'
2.263142 O        b'-1:lemma:glucose'
2.259312 Gtype    b'lemma:wild-type'
2.256120 O        b'lemma:with'
2.252353 Gversion b'lemma:.2'
2.252353 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.250177 Gtype    b'lemma:WT'
2.244062 O        b'lemma:s'
2.242532 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
2.236704 Gtype    b'-1:lemma:_'
2.235688 O        b'lemma:argr'
2.232314 Gversion b'lemma:u00096'
2.232314 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.227051 Med      b'lemma:m63'
2.196925 Gversion b'lemma:000913'
2.195820 O        b'-1:lemma:stpa'
2.190615 O        b'lemma:oxyr'
2.167202 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.153126 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.138902 pH       b'+1:postag:CD'
2.137252 Strain   b'+1:lemma:substr'
2.135331 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.132696 Technique b'-1:lemma:IP'
2.130445 O        b'+1:lemma:pq'
2.121844 O        b'lemma:or'
2.120627 Med      b'+1:lemma:2.0'
2.119248 O        b'-1:lemma:0.3-0.35'
2.102124 Anti     b'lemma:anti-myc'
2.099119 Gtype    b'+1:lemma:pq'
2.097053 Gversion b'-1:lemma:nc'
2.095915 O        b'postag:SYM'
2.087696 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.068537 Phase    b'lemma:phase'
2.039522 O        b'-1:lemma:lb'
2.034656 O        b'lemma:ompr'
2.020219 Supp     b'lemma:nacl'
2.011236 O        b'+1:lemma:anti-fur'
2.002622 O        b'lemma:purr'
1.989136 Gtype    b'lemma:ptac'
1.986425 O        b'lemma:Lrp'
1.986041 Air      b'lemma:anaerobically'
1.984872 Technique b'postag:NNP'
1.982619 Supp     b'lemma:Leu'
1.963147 Air      b'-1:lemma:_'
1.960508 Air      b'-1:lemma:-'
1.951971 O        b'lemma:chip'
1.946660 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.946660 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.941357 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.929969 Anti     b'+1:lemma:antibody'
1.926992 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
1.917242 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.913616 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
1.907553 Temp     b'-1:lemma:37'
1.902343 O        b'-1:lemma:type'
1.899563 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
1.896818 Gtype    b'+1:lemma:aerobic'
1.896130 Supp     b'lemma:iptg'
1.891122 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.888582 Gtype    b'lemma:pk4854'
1.885003 Temp     b'lemma:43'
1.884992 Med      b'+1:lemma:+'
1.883373 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
1.883065 Air      b'-1:postag::'
1.880978 O        b'postag:DT'
1.869735 O        b'postag:CC'
1.867667 Supp     b'-1:lemma:with'
1.859135 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.850190 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
1.849895 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.830649 O        b'+1:lemma:43'
1.826705 Supp     b'+1:lemma:respiratory'
1.826425 Med      b'postag:NNP'
1.818906 O        b'lemma:culture'
1.815650 Med      b'-1:lemma:ml'
1.814335 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
1.807866 Technique b'-1:lemma:input'
1.801111 pH       b'lemma:.5'
1.801111 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.799448 Supp     b'lemma:Adenine'
1.798437 Air      b'+1:lemma:at'
1.797384 O        b'lemma:genotype/variation'
1.795853 Temp     b'-1:lemma:43'
1.792969 O        b'lemma:Fur'
1.792070 Technique b'-1:lemma:_'
1.790333 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.785178 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.777548 Anti     b'lemma:anti-rpos'
1.772627 Supp     b'+1:lemma:hour'
1.771735 O        b'lemma:chip-fnr'
1.766973 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.765244 Supp     b'lemma:methanol'
1.753576 OD       b'+1:lemma:stationary'
1.735182 O        b'lemma:for'
1.733859 Vess     b'+1:lemma:at'
1.726551 O        b'lemma:pt7'
1.711211 O        b'postag:VBG'
1.709643 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.699026 Temp     b'lemma:37'
1.698654 Gtype    b'+1:lemma:,'
1.698654 Gtype    b'+1:postag:,'
1.691558 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.691282 O        b'lemma:soxs'
1.691282 O        b'lemma:soxr'
1.691054 Supp     b'lemma:20'
1.680349 Gversion b'postag:CD'
1.680242 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.676394 O        b'lemma:at'
1.671037 Supp     b'-1:lemma:+'
1.657960 Phase    b'+1:lemma:for'
1.657799 Technique b'-1:lemma:rna-seq'


Top negative:
-0.138337 OD       b'postag:IN'
-0.140202 O        b'lemma:n2'
-0.141199 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.141513 Med      b'postag:-LRB-'
-0.142816 O        b'lemma:aerobically'
-0.148531 Technique b'+1:postag:JJ'
-0.153818 Gtype    b'postag:VBG'
-0.163124 Supp     b'postag:CD'
-0.169140 O        b'-1:lemma:of'
-0.172938 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.175379 Technique b'-1:lemma::'
-0.175946 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.176380 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.177032 OD       b'+1:postag:CD'
-0.186317 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.188005 OD       b'+1:postag:NNS'
-0.189604 Med      b'+1:lemma:m9'
-0.194248 Gtype    b'postag:CD'
-0.196879 Med      b'-1:lemma:MOPS'
-0.200307 O        b'+1:lemma:purify'
-0.202100 Med      b'-1:postag:NN'
-0.209858 O        b'-1:lemma:delta'
-0.209949 O        b'lemma:10'
-0.214403 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.215059 O        b'lemma:co2'
-0.217010 Phase    b'postag:JJ'
-0.220806 Med      b'postag:CD'
-0.221059 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.221059 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.227070 O        b'lemma:mg/ml'
-0.227070 O        b'-1:lemma:150'
-0.228793 O        b'-1:lemma:grow'
-0.241460 Supp     b'lemma:and'
-0.241888 O        b'lemma:medium'
-0.246141 Gtype    b'+1:lemma:2'
-0.251300 Gtype    b'postag:NNS'
-0.251694 O        b'+1:lemma:sample'
-0.253709 Supp     b'+1:postag:IN'
-0.255442 Gtype    b'-1:lemma:-'
-0.263468 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.271432 Gtype    b'+1:postag:NNS'
-0.278350 Air      b'postag:CD'
-0.280151 O        b'postag:RB'
-0.286504 O        b'-1:lemma:purify'
-0.287229 Supp     b'-1:postag:VBG'
-0.291292 O        b'+1:lemma:%'
-0.295935 OD       b'+1:lemma:in'
-0.296047 O        b'-1:lemma:rna'
-0.296196 Gtype    b'lemma:ompr'
-0.297998 O        b'+1:lemma:phase'
-0.299404 Phase    b'-1:lemma:at'
-0.304065 O        b'lemma:30'
-0.305817 O        b'+1:lemma:-lcb-'
-0.308356 O        b'-1:lemma:20'
-0.308695 O        b'+1:lemma:mg1655'
-0.311346 O        b'+1:lemma:delta'
-0.313799 O        b'-1:postag:VBP'
-0.315020 O        b'lemma:e.'
-0.315230 O        b'-1:lemma:e.'
-0.319138 Gtype    b'+1:lemma:-lrb-'
-0.321739 Anti     b'+1:postag:JJ'
-0.322662 O        b'-1:lemma:30'
-0.329200 O        b'lemma:nacl'
-0.329442 Gtype    b'+1:lemma:cra'
-0.332012 O        b'-1:lemma:o2'
-0.332558 O        b'+1:lemma:from'
-0.333621 Gtype    b'+1:lemma:a'
-0.335398 O        b'+1:lemma:cell'
-0.339984 O        b'lemma:pahse'
-0.350806 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.364120 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.372799 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.374219 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.377677 Gtype    b'-1:postag:CD'
-0.390295 O        b'+1:postag:IN'
-0.390779 Med      b'-1:postag:CD'
-0.399008 Technique b'-1:postag::'
-0.401291 O        b'+1:lemma:strain'
-0.405578 O        b'-1:lemma:affinity'
-0.411039 O        b'lemma:minimal'
-0.413767 O        b'lemma:8'
-0.418867 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.420435 Med      b'+1:postag:NNS'
-0.421888 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.426304 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.427748 O        b'-1:lemma:um'
-0.427748 O        b'+1:lemma:paraquat'
-0.432025 Supp     b'+1:lemma:glucose'
-0.439327 OD       b'+1:postag:CC'
-0.440292 Gtype    b'+1:lemma:b'
-0.444597 Med      b'+1:postag:NN'
-0.449089 O        b'+1:lemma:shake'
-0.454608 O        b'-1:lemma:from'
-0.468184 O        b'lemma:of'
-0.472171 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
-0.475747 O        b'lemma:phase'
-0.483124 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.485719 O        b'+1:lemma:until'
-0.487110 Temp     b'postag:JJ'
-0.495708 O        b'-1:lemma:chip-exo'
-0.495761 O        b'-1:lemma:cra'
-0.499278 Temp     b'+1:lemma:to'
-0.499278 Temp     b'+1:postag:TO'
-0.502976 O        b'+1:lemma:rep1'
-0.516570 O        b'lemma:150'
-0.516570 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.517552 OD       b'+1:lemma:and'
-0.526042 O        b'lemma:dissolve'
-0.528223 O        b'lemma:m63'
-0.532678 O        b'lemma:glucose'
-0.539809 O        b'-1:lemma:mm'
-0.555116 O        b'+1:lemma:Aerobic'
-0.560647 Supp     b'postag:CC'
-0.568048 O        b'+1:lemma:b'
-0.574891 O        b'+1:lemma:300'
-0.583571 O        b'+1:lemma:c'
-0.591151 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.591330 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.600038 O        b'+1:postag:NNS'
-0.602099 OD       b'postag:JJ'
-0.605582 pH       b'postag:NN'
-0.607566 OD       b'+1:lemma:mid-log'
-0.610267 O        b'lemma:lb'
-0.612280 O        b'lemma:purify'
-0.617785 Gtype    b'lemma:_'
-0.625835 O        b'+1:lemma:0.4'
-0.638498 O        b'+1:lemma:arginine'
-0.643623 OD       b'lemma:-lrb-'
-0.644126 Gtype    b'-1:postag:SYM'
-0.658568 Temp     b'postag:NN'
-0.658731 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.661085 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.669040 O        b'lemma:mg1655'
-0.672673 O        b'lemma:dpd'
-0.698443 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.713908 O        b'-1:lemma:until'
-0.714588 O        b'-1:lemma:od600'
-0.721807 Gtype    b'-1:postag:DT'
-0.723775 Gtype    b'lemma:delta'
-0.727392 OD       b'postag:-LRB-'
-0.754913 O        b'-1:lemma:1'
-0.773161 OD       b'+1:postag:NN'
-0.785912 Anti     b'+1:lemma:anti-fur'
-0.798212 O        b'+1:lemma:0.3'
-0.806842 O        b'lemma:anaerobically'
-0.817840 O        b'lemma:od600'
-0.828895 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.832410 O        b'+1:lemma:in'
-0.838317 Med      b'+1:postag:IN'
-0.843570 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.853228 O        b'+1:lemma:at'
-0.895416 Air      b'-1:postag:JJ'
-0.900736 O        b'lemma:media'
-0.902081 O        b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.906592 O        b'lemma:0.3'
-0.918504 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.931732 O        b'+1:postag:VBG'
-0.943156 O        b'lemma:0.1'
-0.954406 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.954406 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.966339 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.995930 O        b'lemma:fecl2'
-1.003164 O        b'lemma:20'
-1.026277 O        b'lemma:mid-log'
-1.053295 O        b'-1:lemma:ompr'
-1.054899 O        b'lemma:anaerobic'
-1.057596 O        b'lemma:2h'
-1.057596 O        b'-1:lemma:additional'
-1.080282 O        b'+1:lemma:g/l'
-1.082820 O        b'lemma:0.2'
-1.104495 O        b'-1:lemma:~'
-1.121867 O        b'-1:lemma:ml'
-1.127613 O        b'lemma:k-12'
-1.175804 O        b'lemma:\xe2\x88\x86'
-1.176063 O        b'lemma:\xce\xb4fur'
-1.192468 O        b'+1:lemma:supplement'
-1.233751 O        b'-1:postag:VBG'
-1.236448 O        b'postag:VBP'
-1.249871 O        b'-1:lemma:sample'
-1.284753 O        b'-1:lemma:rpob'
-1.294533 O        b'-1:lemma:co2'
-1.310574 O        b'lemma:37'
-1.338283 O        b'-1:postag::'
-1.367124 Anti     b'postag:NNP'
-1.397494 O        b'-1:lemma:37'
-1.398009 Supp     b'postag:JJ'
-1.437506 Air      b'+1:postag:JJ'
-1.540588 O        b'lemma:wt'
-1.569408 O        b'-1:lemma:2'
-1.577711 O        b'+1:lemma:+'
-1.615554 O        b'+1:lemma:hour'
-1.616588 O        b'lemma:methanol'
-1.673269 O        b'lemma:rifampicin'
-1.677284 O        b'-1:lemma:IP'
-1.688519 O        b'-1:lemma:nsrr'
-1.716711 Air      b'postag:NN'
-1.806551 O        b'+1:lemma:2'
-1.992901 O        b'+1:lemma:1'
-2.768062 O        b'-1:lemma:_'
-2.825339 O        b'-1:lemma::'