report_Run6_v12.txt
39.1 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.04625567388660928, 'c2': 0.019278667317134065}
best CV score:0.8434032566660784
model size: 0.12M
Flat F1: 0.8147298617165236
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.897 0.398 0.551 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.939 0.795 0.861 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.870 0.838 0.854 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.919 0.754 0.815 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.900078
OD -> OD 5.557386
Phase -> Phase 5.277911
Med -> Med 5.255962
Supp -> Supp 5.109374
Anti -> Anti 4.947923
Gversion -> Gversion 4.532525
Gtype -> Gtype 4.450831
Air -> Air 3.898850
pH -> pH 3.518669
Technique -> Technique 3.277203
O -> O 3.111901
Agit -> Agit 2.517365
Substrain -> Gtype 1.797049
Technique -> Air 0.576458
Gtype -> Supp 0.424836
O -> Technique 0.389071
O -> Supp 0.215861
Med -> O 0.105317
Temp -> O 0.086005
Air -> O 0.045118
Gtype -> pH 0.000875
pH -> O -0.003573
O -> Substrain -0.004121
pH -> Supp -0.010581
O -> Gtype -0.015834
O -> Temp -0.026904
Air -> Agit -0.035332
Temp -> Air -0.036315
Gtype -> Gversion -0.059235
Technique -> OD -0.063946
Air -> OD -0.077646
O -> pH -0.097954
Supp -> O -0.126924
Air -> Temp -0.141335
Phase -> Air -0.147016
Phase -> OD -0.156231
Supp -> Air -0.184520
Phase -> O -0.212805
Gtype -> Anti -0.226839
Air -> Med -0.254780
Supp -> Gtype -0.260280
Technique -> Supp -0.292512
Supp -> Phase -0.317290
Anti -> Supp -0.338344
O -> OD -0.355572
Air -> Gtype -0.373011
O -> Gversion -0.376304
Gtype -> Technique -0.382712
Anti -> Gtype -0.402741
OD -> O -0.409534
Air -> Phase -0.435729
Anti -> O -0.490995
Agit -> Air -0.498320
O -> Phase -0.532626
Gversion -> O -0.536285
Air -> Supp -0.571992
Gtype -> Med -0.607023
Temp -> Med -0.656356
OD -> Air -0.705144
O -> Anti -0.762582
Gtype -> Phase -0.862953
O -> Med -0.904727
Technique -> Gtype -0.918946
Supp -> Med -0.993797
Gtype -> Temp -1.015010
Technique -> O -1.307542
Technique -> pH -1.434405
Gtype -> O -1.557662
Substrain -> O -1.653552
Med -> Supp -1.824683
O -> Air -2.193923
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.900078
OD -> OD 5.557386
Phase -> Phase 5.277911
Med -> Med 5.255962
Supp -> Supp 5.109374
Anti -> Anti 4.947923
Gversion -> Gversion 4.532525
Gtype -> Gtype 4.450831
Air -> Air 3.898850
pH -> pH 3.518669
Technique -> Technique 3.277203
O -> O 3.111901
Agit -> Agit 2.517365
Substrain -> Gtype 1.797049
Technique -> Air 0.576458
Gtype -> Supp 0.424836
O -> Technique 0.389071
O -> Supp 0.215861
Med -> O 0.105317
Temp -> O 0.086005
Air -> O 0.045118
Gtype -> pH 0.000875
pH -> O -0.003573
O -> Substrain -0.004121
pH -> Supp -0.010581
O -> Gtype -0.015834
O -> Temp -0.026904
Air -> Agit -0.035332
Temp -> Air -0.036315
Gtype -> Gversion -0.059235
Technique -> OD -0.063946
Air -> OD -0.077646
O -> pH -0.097954
Supp -> O -0.126924
Air -> Temp -0.141335
Phase -> Air -0.147016
Phase -> OD -0.156231
Supp -> Air -0.184520
Phase -> O -0.212805
Gtype -> Anti -0.226839
Air -> Med -0.254780
Supp -> Gtype -0.260280
Technique -> Supp -0.292512
Supp -> Phase -0.317290
Anti -> Supp -0.338344
O -> OD -0.355572
Air -> Gtype -0.373011
O -> Gversion -0.376304
Gtype -> Technique -0.382712
Anti -> Gtype -0.402741
OD -> O -0.409534
Air -> Phase -0.435729
Anti -> O -0.490995
Agit -> Air -0.498320
O -> Phase -0.532626
Gversion -> O -0.536285
Air -> Supp -0.571992
Gtype -> Med -0.607023
Temp -> Med -0.656356
OD -> Air -0.705144
O -> Anti -0.762582
Gtype -> Phase -0.862953
O -> Med -0.904727
Technique -> Gtype -0.918946
Supp -> Med -0.993797
Gtype -> Temp -1.015010
Technique -> O -1.307542
Technique -> pH -1.434405
Gtype -> O -1.557662
Substrain -> O -1.653552
Med -> Supp -1.824683
O -> Air -2.193923
Top positive:
6.485288 O b'lemma:_'
6.051991 Anti b'-2:lemma:antibody'
5.882689 O b'-2:lemma:_'
5.316658 Air b'lemma:anaerobic'
5.087995 Gtype b'lemma:wt'
5.079428 Supp b'lemma:pq'
4.866173 Supp b'lemma:no3'
4.704895 O b'lemma:-'
4.607307 Technique b'lemma:chipseq'
4.584288 O b'lemma:1'
4.549518 Phase b'-2:lemma:phase'
4.277503 Gtype b'hGreek'
4.150352 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
4.087828 O b'lemma:2'
4.085886 Gtype b'lemma:type'
4.012723 O b'lemma:.'
4.012723 O b'postag:.'
3.970084 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.953831 O b'postag::'
3.873082 Supp b'lemma:glucose'
3.842894 Supp b'lemma:Iron'
3.842894 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.807267 O b'lemma:3'
3.786745 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.745414 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
3.677841 Supp b'lemma:acetate'
3.634359 Supp b'-1:lemma:Cra'
3.618323 Supp b'lemma:nh4cl'
3.574073 O b'lemma:with'
3.511956 Supp b'lemma:2h'
3.511956 Supp b'-1:lemma:additional'
3.412882 Strain b'lemma:k-12'
3.383112 O b'lemma:Cra'
3.353708 Supp b'-2:lemma:shake'
3.349227 O b'lemma:b'
3.283790 Phase b'lemma:mid-log'
3.282543 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.242763 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.148653 Gtype b'-2:lemma:genotype'
3.117015 O b'+1:postag:RB'
3.090561 O b'lemma:rpob'
3.030567 O b'postag:VBG'
3.009391 Supp b'lemma:arginine'
2.994619 Technique b'lemma:ChIP-exo'
2.993897 Air b'-2:lemma:IP'
2.984891 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
2.976413 Substrain b'lemma:mg1655'
2.974367 Air b'lemma:aerobically'
2.950554 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.938353 Air b'-1:lemma:-'
2.936539 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.919585 Med b'lemma:MOPS'
2.889154 Gtype b'+1:lemma:type'
2.882007 Air b'lemma:aerobic'
2.851511 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
2.828977 O b'-1:postag:NNS'
2.806512 O b'lemma:CEL'
2.787866 Med b'+2:lemma:b2'
2.787598 O b'lemma:genotype/variation'
2.742256 Phase b'lemma:stationary'
2.742256 Phase b'lemma:exponential'
2.719657 Supp b'lemma:Adenine'
2.715331 O b'-1:lemma:tag'
2.711078 Supp b'lemma:iptg'
2.703278 Supp b'+1:lemma:1'
2.672781 O b'-1:lemma:0.3'
2.670727 Gtype b'lemma:dfnr'
2.642499 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.639312 Supp b'lemma:nacl'
2.637524 Technique b'-1:lemma:_'
2.617370 O b'+1:lemma:wt'
2.589331 O b'-2:lemma:myc'
2.584855 pH b'lemma:ph5'
2.584855 pH b'+1:lemma:.5'
2.580615 O b'postag:VBN'
2.560656 Gtype b'lemma:pk4854'
2.540717 O b'lemma:rep2'
2.540717 O b'lemma:rep1'
2.519463 Supp b'+1:lemma:2'
2.504732 Supp b'lemma:rifampicin'
2.500025 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.474531 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.444132 Air b'lemma:anaeroibc'
2.424569 Air b'postag:RB'
2.415781 Air b'-1:lemma:co2'
2.411364 O b'lemma:harbor'
2.394569 Supp b'-2:lemma:argr'
2.386473 Supp b'-1:lemma:+'
2.384187 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.383369 Supp b'-2:lemma:purr'
2.360147 Phase b'+2:lemma:o.d.'
2.356901 Med b'lemma:LB'
2.350376 O b'+2:lemma:crp'
2.345723 O b'-1:lemma:glucose'
2.326737 O b'postag:IN'
2.322822 O b'lemma:\xcf\x8332'
2.307010 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
2.305027 Med b'+2:lemma:b1'
2.304593 Med b'lemma:minimal'
2.303292 pH b'+1:postag:CD'
2.303094 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.298548 O b'-2:lemma:flagtag'
2.280768 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.275501 Technique b'hUpper'
2.244044 Technique b'-1:lemma:input'
2.223491 O b'lemma:a'
2.221893 Supp b'lemma:Leu'
2.221893 Supp b'-2:lemma:Lrp'
2.221670 O b'lemma::'
2.220196 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.219724 O b'-2:lemma:='
2.217754 Supp b'lemma:fructose'
2.205918 Supp b'-1:lemma:with'
2.174979 O b'-2:lemma:medium'
2.174521 Phase b'postag:NN'
2.167064 Supp b'+2:lemma:feso4'
2.160766 Gtype b'-2:lemma:delta'
2.156721 Temp b'-1:lemma:37'
2.150422 Temp b'lemma:37'
2.147441 O b'-1:lemma:wt'
2.128147 Med b'+1:lemma:0.4'
2.125293 O b'lemma:culture'
2.101449 Gtype b'lemma:deltaseqa'
2.101449 Gtype b'-1:lemma:old'
2.101449 Gtype b'-2:lemma:seqa'
2.100711 Supp b'+1:lemma:_'
2.099645 Supp b'-2:lemma:induce'
2.096572 O b'lemma:ompr'
2.091773 Med b'lemma:media'
2.083580 O b'-1:lemma:lb'
2.075333 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.075333 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.066126 Substrain b'lemma:mg1655star'
2.053310 Technique b'-2:lemma:wt'
2.050894 OD b'lemma:od450'
2.050728 Supp b'-1:lemma:ompr'
2.045968 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.031489 Air b'-2:lemma:fnr'
2.021941 O b'-1:lemma:type'
1.986063 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.981859 Temp b'lemma:43'
1.958766 Med b'-1:lemma:minimal'
1.957327 Med b'lemma:lb'
1.939441 O b'lemma:purr'
1.933151 Temp b'-1:lemma:sample'
1.927792 O b'+1:lemma:0.2'
1.922718 Med b'+2:postag:CC'
1.904042 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
1.895923 Supp b'lemma:Fe'
1.890065 O b'lemma:argr'
1.873691 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.869457 O b'lemma:for'
1.865277 Med b'+1:lemma:2.0'
1.854933 Air b'postag:JJ'
1.853028 Med b'lemma:m63'
1.841385 Technique b'lemma:rna-seq'
1.839201 Supp b'-2:lemma:media'
1.829099 Supp b'+1:lemma:Deficient'
1.819678 O b'lemma:soxr'
1.819678 O b'lemma:soxs'
1.816865 O b'lemma:chip-fnr'
1.816865 O b'+2:lemma:fnr8myc'
1.816746 Supp b'-2:lemma:agent'
1.813591 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.807411 Med b'-1:lemma:ml'
1.805575 O b'-1:lemma:media'
1.800036 O b'lemma:at'
1.799324 Temp b'-2:lemma:keep'
1.796023 Med b'-1:lemma:in'
1.794517 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.788601 Supp b'+2:lemma:A'
1.787235 O b'+1:lemma:coli'
1.777529 Gtype b'+1:postag::'
1.772503 OD b'+1:postag:IN'
1.771878 O b'symb'
1.768257 O b'+1:lemma:250'
1.765245 O b'lemma:chip-arca'
1.765245 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.760152 O b'-1:lemma:pq'
1.758555 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.752616 Gversion b'lemma:.2'
1.752616 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.752213 O b'postag:CC'
1.750484 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.750484 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.741378 Vess b'lemma:flask'
1.741378 Vess b'-1:lemma:warm'
1.741378 Vess b'-2:lemma:pre'
1.741378 Vess b'+2:lemma:43'
1.737032 O b'+1:postag:NNP'
1.731749 Gversion b'-2:lemma:build'
1.720940 Med b'lemma:medium'
1.702190 O b'-1:lemma:min'
1.700658 O b'lemma:affyexp'
1.696931 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.696201 O b'+1:lemma:od600'
1.692896 Supp b'-2:lemma:for'
1.689341 Agit b'lemma:rpm'
1.674502 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.647158 Supp b'lemma:dpd'
1.646997 Technique b'lemma:rnaseq'
1.641714 Temp b'-1:lemma:43'
1.640759 Gversion b'-2:postag:VB'
1.640735 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.637483 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.636655 O b'-1:lemma:into'
1.633501 Gtype b'-1:lemma:wild'
1.633188 O b'-1:lemma:-80'
1.626143 O b'-1:lemma:mg1655'
1.624585 O b'lemma:trpr'
1.600129 Strain b'+1:lemma:substr'
1.600129 Strain b'-2:lemma:str'
1.589754 Agit b'-1:lemma:250'
1.588821 pH b'lemma:.5'
1.588821 pH b'-1:lemma:ph5'
1.584149 O b'+1:lemma:pq'
1.584119 O b'lemma:input'
1.584119 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.583891 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.580224 O b'-2:lemma:overnight'
1.579859 Supp b'-2:postag:VBG'
1.578717 OD b'-1:lemma:at'
1.578106 Gtype b'+1:lemma:with'
1.577268 Technique b'-1:lemma:IP'
1.575900 Gtype b'lemma:crp'
1.573631 O b'lemma:chip'
1.572875 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.567922 O b'postag:DT'
1.564227 O b'lemma:-rrb-'
1.562637 Gtype b'+1:lemma:control'
1.560335 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.556866 O b'-1:lemma:nitrate'
1.545166 OD b'+1:lemma:of'
1.534502 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.527999 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.525805 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.520234 OD b'-2:lemma:od450'
1.516893 Med b'-2:lemma:medium'
1.516303 pH b'lemma:5.5'
1.514733 Gversion b'lemma:u00096'
1.514733 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.508006 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.492265 Supp b'-2:lemma:trpr'
1.490901 Gtype b'lemma:ptac'
1.486095 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.478830 O b'+2:lemma:_'
1.478045 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.475116 O b'-2:lemma:co2'
1.465370 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.465370 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.464924 Med b'postag:NNS'
1.461924 Gtype b'lemma:nsrr'
1.461924 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.461085 Air b'-2:lemma:0.3'
1.460939 Supp b'-1:lemma:_'
1.449237 O b'+2:lemma:constant'
1.430058 O b'+1:lemma:ph5'
1.430058 O b'+2:lemma:.5'
1.427153 O b'lemma:A'
1.420736 Med b'postag:NNP'
1.419606 Air b'-2:lemma:nh4cl'
1.419526 Air b'hLower'
1.414349 O b'lemma:-lrb-'
1.413329 O b'+2:lemma:rpm'
1.412651 O b'-2:lemma:min'
1.412112 Substrain b'+2:lemma::'
1.411329 O b'-1:lemma:aerobic'
1.406247 O b'+1:lemma:mid-log'
1.405090 Technique b'hLower'
1.404069 O b'-1:lemma:nacl'
1.399675 O b'-2:lemma:od600'
1.392111 O b'-2:lemma:fructose'
1.392011 Med b'+1:lemma:minimal'
1.382492 Gtype b'+1:lemma:_'
1.380082 OD b'lemma:of'
1.376532 O b'+1:lemma::'
1.375920 Vess b'-2:postag:JJ'
1.374853 OD b'lemma:0.3'
1.374294 Supp b'lemma:30'
1.370748 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.367953 Gtype b'postag:JJ'
1.364602 O b'lemma:additional'
1.364602 O b'+1:lemma:2h'
1.362560 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.361043 O b'+2:postag:JJ'
1.360509 Gtype b'hUpper'
1.360489 OD b'lemma:od600'
1.349448 Phase b'-2:lemma:until'
1.348925 O b'+1:lemma:43'
1.347401 Air b'-1:lemma:_'
1.345680 O b'lemma:growth'
1.341790 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.340671 Air b'-2:lemma:mid-log'
1.331359 Air b'-1:lemma:phase'
1.328066 pH b'+1:lemma:5.5'
1.322867 O b'-1:lemma:acetate'
1.320724 Supp b'lemma:Trp'
1.318654 Gversion b'postag:NN'
1.316491 Supp b'+2:lemma:add'
1.313347 Phase b'-1:lemma::'
1.307568 Agit b'lemma:250'
1.305440 O b'postag:-RRB-'
1.304101 Med b'+1:lemma:+'
1.302223 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.293912 Supp b'-1:lemma:30'
1.285554 O b'lemma:gadx'
1.284368 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
1.280144 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.279371 Gversion b'lemma:000913'
1.279371 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.277718 Air b'lemma:Anaerobic'
1.276623 Air b'+2:lemma:%'
1.274239 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.274239 Supp b'-2:lemma:mmol'
1.258088 O b'lemma:lrp'
1.257535 O b'lemma:ml'
1.254941 Med b'lemma:glucose'
1.246954 Air b'+1:lemma:%'
1.246863 O b'-2:lemma:Leu'
1.246116 O b'+2:lemma:allow'
1.242725 O b'lemma:from'
1.242146 Med b'+2:lemma:+'
1.241712 Air b'lemma:%'
1.240443 Substrain b'+2:postag::'
1.239601 O b'lemma:oxyr'
1.238940 Air b'-2:lemma:cm20'
1.231995 Strain b'-2:lemma:strain'
1.224954 Supp b'-1:lemma:final'
1.224797 Supp b'lemma:glutamine'
1.224797 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.222959 Technique b'+1:lemma:gadx'
1.222401 Supp b'-2:lemma:+'
1.222220 Technique b'lemma:chip-seq'
1.221156 Gtype b'lemma:wild'
1.217195 Substrain b'-1:lemma:.'
1.217195 Substrain b'-1:postag:.'
1.216243 Agit b'+2:lemma:at'
1.205878 Gtype b'-2:postag:JJ'
1.205666 Gtype b'+1:lemma:the'
1.202773 Med b'+1:lemma:g/l'
1.200104 Air b'+2:lemma:37'
1.193339 O b'postag:-LRB-'
1.190130 Gtype b'-1:lemma:_'
1.187181 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.187181 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.187181 Supp b'+2:lemma:potassium'
1.185569 Air b'-2:lemma:%'
1.180965 Gtype b'-1:lemma:from'
1.179497 O b'lemma:-80'
1.179497 O b'-2:lemma:freeze'
1.173662 Air b'-2:postag:SYM'
1.172908 O b'-1:lemma:0.35'
1.172672 Gtype b'-2:lemma:dna'
1.170735 O b'postag:NNS'
1.169617 O b'+2:lemma:4'
1.161031 O b'+1:postag:VBZ'
1.160204 OD b'postag:IN'
1.155746 OD b'-1:postag:IN'
1.155318 Supp b'-1:lemma:without'
1.149768 O b'-2:lemma:no3'
1.149271 O b'-2:lemma:ml'
1.147391 Temp b'-2:postag:VBD'
1.145862 Vess b'-1:postag:VBN'
1.144773 Supp b'-2:lemma:10'
1.136240 OD b'-1:lemma:od450'
1.134915 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.129872 Med b'+1:lemma:medium'
1.126405 Air b'-2:postag:CD'
1.126261 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
1.125470 Supp b'-2:lemma:condition'
1.124708 O b'+1:lemma:20'
1.119914 O b'+2:lemma:of'
1.109214 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.107934 Supp b'-2:lemma:pahse'
1.098419 O b'-1:postag:NN'
1.096531 Supp b'postag:NNP'
1.096388 Air b'-1:lemma:%'
1.095235 Vess b'+1:lemma:at'
1.091004 pH b'lemma:ph'
1.090442 O b'+2:lemma:k-12'
1.088828 Technique b'-2:postag:NNP'
1.084737 O b'-1:lemma:l1'
1.081520 Technique b'lemma:chip-exo'
1.078661 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.078393 O b'postag:VBD'
1.074152 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.071989 Supp b'-1:lemma:mm'
1.070750 O b'+2:postag:NNP'
1.069555 O b'lemma:be'
1.067981 O b'+1:lemma:sparging'
1.060256 Temp b'+2:postag:DT'
1.058691 O b'lemma:fresh'
1.054344 O b'-1:lemma:fructose'
1.053455 O b'-1:lemma:0.3-0.35'
1.052065 Gtype b'+2:postag:NN'
1.051744 O b'lemma:,'
1.051744 O b'postag:,'
1.049151 Air b'+1:lemma:b'
1.048654 Phase b'-1:lemma:until'
1.044903 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.043537 Gversion b'lemma:nc'
1.043537 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.043245 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.043245 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.038119 pH b'-1:lemma:at'
1.037799 Gtype b'+1:lemma:ph5'
1.037799 Gtype b'+2:lemma:.5'
1.037022 Anti b'-1:lemma:fnr'
1.032073 O b'-1:lemma:antibody'
1.031982 O b'-1:lemma:4'
1.031242 Anti b'-1:lemma:myc'
1.031242 Anti b'-2:lemma:9e10'
1.030978 O b'-1:lemma:rpm'
1.028795 O b'lemma:cra'
1.028313 O b'-1:lemma:induce'
1.027501 Supp b'lemma:0.2'
1.025621 Gtype b'+2:postag::'
1.017243 Med b'-1:lemma:fresh'
1.015188 pH b'-1:lemma:ph'
1.012531 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.008071 Supp b'lemma:tryptophan'
1.008071 Supp b'-1:lemma:mg/l'
1.007048 Gtype b'hLower'
1.006869 O b'-2:lemma:~'
1.001685 Supp b'+1:lemma:1m'
1.001685 Supp b'-2:lemma:vol'
1.000075 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
0.998251 Supp b'-1:lemma:wt'
0.997982 O b'lemma:~'
0.994676 Med b'-2:lemma:minimal'
0.994162 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
0.991115 O b'lemma:genotype'
0.989891 O b'-2:lemma:37'
0.983229 O b'-1:lemma:nh4cl'
0.982897 Anti b'-1:lemma::'
0.981884 O b'+1:lemma:read'
0.980606 Gtype b'-2:postag:NNS'
0.980525 O b'+2:lemma:wt'
0.978647 O b'+1:lemma:k-12'
0.976203 O b'+2:lemma:w/v'
0.976120 Phase b'-1:postag::'
0.976088 Supp b'-1:lemma:cra'
0.972137 O b'lemma:s'
0.972137 O b'-2:lemma:parameter'
0.970118 O b'-1:postag:NNP'
0.969324 O b'postag:CD'
0.966392 pH b'-1:postag:NN'
0.963554 Supp b'+1:lemma:iptg'
0.960361 O b'+1:lemma:dpd'
0.953993 Supp b'+1:lemma:mm'
0.953928 O b'-1:lemma:genbank'
0.953784 OD b'+1:lemma:-rrb-'
0.953374 Med b'-1:lemma:LB'
0.953374 Med b'+2:lemma:1mm'
0.952330 Gtype b'+1:lemma:pq'
0.946915 Supp b'-1:lemma:vol'
0.946915 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.946915 Supp b'+2:lemma:1m'
0.943867 OD b'+1:postag:-RRB-'
0.941029 Gtype b'lemma:WT'
0.939932 Phase b'+1:lemma:phase'
0.938745 Technique b'postag:NNP'
0.938576 Med b'-2:lemma:100'
0.938010 Anti b'-2:lemma:polymerase'
0.936301 O b'lemma:='
0.932550 Temp b'+1:postag:JJ'
0.929568 Gtype b'-1:lemma:vector'
0.927418 Supp b'-1:lemma:2'
0.925953 O b'-2:lemma:reach'
0.924570 O b'+2:postag:NN'
0.922661 OD b'+2:lemma:0.3'
0.919092 Air b'-1:postag::'
0.915154 O b'lemma:k-12'
0.913916 Gtype b'+1:lemma:mg1655'
0.913484 Supp b'lemma:nitrate'
0.913153 O b'-2:postag:FW'
0.912065 pH b'-2:lemma:at'
0.910213 O b'+2:lemma:chipseq'
0.909623 Med b'-1:lemma:glucose'
0.907791 O b'lemma:old'
0.907791 O b'-1:lemma:seqa'
0.907791 O b'+1:lemma:deltaseqa'
0.906614 O b'+1:postag:VBN'
0.903766 O b'-1:lemma:shake'
0.901991 O b'+2:postag:VB'
0.901807 O b'+2:lemma:ml'
0.900808 O b'+1:lemma:acetate'
0.900712 Supp b'-2:lemma:nitrate'
0.899224 Med b'+1:lemma:media'
0.898432 Gtype b'lemma:delta-fnr'
0.897657 O b'hLower'
0.896911 Anti b'postag:JJ'
0.895309 O b'-1:postag:JJ'
0.888235 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
0.888235 Anti b'+2:lemma:NeoClone'
0.888116 OD b'+2:postag:CD'
0.886046 Supp b'+2:lemma:mid-log'
0.884903 Gtype b'-2:lemma:ecolus'
0.881469 Temp b'-2:lemma:see'
0.879019 Gtype b'-2:lemma:mg1655'
Top negative:
0.000041 O b'+2:lemma:paraquat'
0.000034 Gtype b'-2:lemma:-lrb-'
0.000034 O b'-1:postag:VBZ'
0.000026 Anti b'-1:postag:VBN'
0.000023 OD b'+2:lemma:0.35'
0.000010 pH b'-2:postag:NNP'
0.000010 OD b'+1:lemma:about'
0.000008 Gtype b'-1:lemma:small'
0.000005 Gtype b'lemma:Fur'
0.000005 Air b'-1:postag:NNP'
0.000004 O b'+1:lemma:='
0.000001 Temp b'lemma:-lrb-'
0.000001 O b'lemma:carbon'
0.000001 OD b'lemma:0.15'
0.000000 Temp b'postag:-LRB-'
0.000000 Gtype b'+1:lemma:fnr'
-0.000000 Gtype b'-1:lemma:-'
0.000000 O b'+2:lemma:crosslink'
-0.000004 Gtype b'+2:lemma:1'
-0.000010 Gtype b'+1:postag:-LRB-'
-0.000011 O b'+1:lemma:rna'
-0.000011 O b'+2:lemma:use'
-0.000015 O b'+2:lemma:the'
-0.000016 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-0.000026 O b'+2:lemma:37'
-0.000028 O b'+2:lemma:od600'
-0.000031 Supp b'-1:lemma:250'
-0.000087 O b'+2:lemma:0.2'
-0.000113 O b'-1:lemma:300'
-0.000190 Med b'-1:lemma:MOPS'
-0.000229 O b'+2:lemma:25'
-0.000250 O b'+1:lemma:deletion'
-0.000292 O b'+2:lemma:mutant'
-0.000365 O b'lemma:mutant'
-0.000376 Supp b'-1:lemma:20'
-0.000395 O b'lemma:m'
-0.000420 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.000424 O b'+2:lemma:in'
-0.000443 Supp b'-1:lemma:the'
-0.000451 O b'-2:lemma:control'
-0.000602 O b'-2:postag:RB'
-0.000921 OD b'+2:postag:IN'
-0.001428 O b'+1:lemma:min'
-0.001535 Supp b'+1:lemma:glucose'
-0.001552 Gtype b'+2:lemma:_'
-0.001835 OD b'+2:lemma:for'
-0.002085 O b'+2:postag:RB'
-0.002186 Med b'-2:postag:NNP'
-0.002361 Technique b'+2:postag:CD'
-0.003444 O b'+1:lemma:95'
-0.003560 Gtype b'lemma:_'
-0.003894 O b'lemma:25'
-0.004153 O b'-2:lemma:300'
-0.004510 Temp b'+2:postag:JJ'
-0.005439 O b'+1:lemma:antibody'
-0.005618 Phase b'-1:lemma:at'
-0.006190 O b'+1:lemma:phase'
-0.006983 O b'-1:lemma:in'
-0.007110 O b'+1:lemma:ph'
-0.007114 O b'+1:lemma:anaerobically'
-0.007952 OD b'-2:postag:VBN'
-0.008093 O b'+2:lemma:dna'
-0.008130 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.008674 O b'+2:lemma:5'
-0.009117 O b'lemma:m9'
-0.009454 O b'-1:lemma:iptg'
-0.009679 Supp b'+2:lemma:with'
-0.009768 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.010282 Supp b'+2:lemma:mm'
-0.010482 O b'+2:lemma:culture'
-0.010850 O b'-2:lemma:m'
-0.011020 O b'-1:lemma:deletion'
-0.011164 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.011382 O b'lemma:phosphate'
-0.011997 Temp b'-2:postag:IN'
-0.012231 Phase b'+2:postag:CD'
-0.012642 Gtype b'-2:postag:CC'
-0.013430 O b'+2:lemma:95'
-0.014479 Med b'-2:lemma:m9'
-0.015092 Supp b'lemma:vol'
-0.015092 Supp b'-1:lemma:1/100'
-0.015118 Air b'-1:postag:VBN'
-0.016602 O b'+2:lemma:0.4'
-0.017233 Supp b'-2:postag:VBD'
-0.017413 O b'-1:postag:VB'
-0.018610 O b'-2:postag:DT'
-0.018874 Vess b'symb'
-0.019980 O b'-1:lemma:0.1'
-0.019992 Air b'+2:postag:JJ'
-0.021963 Phase b'+2:postag:NN'
-0.022307 Supp b'+2:lemma:final'
-0.022880 Gtype b'postag:NN'
-0.022918 O b'lemma:fnr'
-0.023239 OD b'+2:postag:DT'
-0.024802 Supp b'-2:lemma:grow'
-0.024894 O b'lemma:dpd'
-0.025140 O b'-1:lemma:um'
-0.025140 O b'+1:lemma:paraquat'
-0.026646 OD b'+1:lemma:for'
-0.026890 O b'+1:lemma:n2'
-0.027210 O b'lemma:95'
-0.027251 O b'lemma:final'
-0.027507 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.028241 OD b'+1:lemma:.'
-0.028241 OD b'+1:postag:.'
-0.028995 O b'+2:lemma:o2'
-0.029579 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.031875 Agit b'hLower'
-0.032096 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.032401 O b'-1:lemma:25'
-0.033164 OD b'lemma:2.0'
-0.033738 O b'-2:lemma:grow'
-0.033751 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.033794 O b'-1:lemma:~'
-0.034327 Med b'+2:lemma:contain'
-0.036746 O b'-2:lemma:5'
-0.039730 O b'-2:lemma:70'
-0.039832 Supp b'lemma:%'
-0.040029 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.040307 O b'+1:lemma:a'
-0.040446 Temp b'hGreek'
-0.040690 O b'-2:lemma:n2'
-0.041893 Supp b'+1:lemma:with'
-0.043853 O b'+2:lemma:pk4854'
-0.044001 pH b'hUpper'
-0.044660 O b'+1:lemma:medium'
-0.045428 O b'-2:lemma:cell'
-0.046616 Phase b'-2:postag:NN'
-0.046847 O b'-2:lemma:of'
-0.046924 O b'-2:lemma:-rrb-'
-0.047387 O b'+1:lemma:pahse'
-0.048562 O b'-2:lemma:%'
-0.048898 Temp b'-1:postag:IN'
-0.050296 O b'+2:lemma:total'
-0.050838 Supp b'-1:lemma:10'
-0.050904 OD b'+2:lemma:and'
-0.053125 Technique b'-2:postag:NN'
-0.053249 O b'lemma:paraquat'
-0.053249 O b'-2:lemma:um'
-0.054946 O b'+1:postag:CD'
-0.055485 O b'-1:lemma:gadx'
-0.056561 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.056924 O b'lemma:5'
-0.057126 Supp b'postag:NNS'
-0.057342 O b'-1:lemma:0.2'
-0.058827 O b'-1:postag:DT'
-0.061792 O b'+2:lemma:media'
-0.061958 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.062252 Supp b'lemma:.'
-0.062252 Supp b'postag:.'
-0.062811 Supp b'lemma:,'
-0.062811 Supp b'postag:,'
-0.062879 Air b'-1:postag:CC'
-0.063025 Med b'+1:postag:IN'
-0.063198 Temp b'+1:postag:IN'
-0.063505 Supp b'postag:CD'
-0.064690 O b'-2:lemma:chip-exo'
-0.065209 OD b'lemma:~'
-0.065384 Med b'-2:lemma:m63'
-0.066002 Supp b'-2:postag:NN'
-0.067762 Air b'-2:lemma:be'
-0.069323 Med b'-1:postag:IN'
-0.069649 Agit b'postag:NN'
-0.070236 Technique b'+1:lemma:-rrb-'
-0.070501 O b'+1:lemma:contain'
-0.070528 OD b'-2:lemma:a'
-0.071303 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.071616 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.073297 O b'-1:lemma:at'
-0.076801 Supp b'-1:postag:VBG'
-0.078646 O b'+1:lemma:1/100'
-0.078646 O b'-2:lemma:sodium'
-0.078646 O b'+2:lemma:vol'
-0.079495 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.079974 Temp b'+2:postag:IN'
-0.080207 O b'+1:lemma:300'
-0.082317 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.082600 Technique b'+1:postag:-RRB-'
-0.083732 O b'+1:lemma:o2'
-0.084589 O b'-2:lemma:0.1'
-0.084801 O b'-2:lemma:g/l'
-0.087259 Air b'-1:lemma:grow'
-0.089490 Supp b'-1:lemma:in'
-0.090083 O b'+2:lemma:~'
-0.090374 O b'-1:lemma:m9'
-0.092437 OD b'postag:NN'
-0.092641 O b'+1:postag:NNS'
-0.093467 O b'-1:lemma:g/l'
-0.094323 Med b'lemma:-lrb-'
-0.095044 O b'lemma:0.1'
-0.095168 OD b'+2:postag:CC'
-0.097132 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.097810 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.099113 Supp b'+2:postag:NN'
-0.099234 O b'+1:lemma:~'
-0.100685 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.101745 Med b'-1:lemma:m63'
-0.103068 Supp b'+1:postag:JJ'
-0.104481 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.105042 O b'+1:lemma:b'
-0.105912 O b'-1:lemma:o2'
-0.106004 Air b'lemma:,'
-0.106004 Air b'postag:,'
-0.108306 Temp b'-2:postag:JJ'
-0.109079 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.109556 OD b'-2:postag:DT'
-0.110428 O b'+1:lemma:genome'
-0.111446 Air b'-2:postag:VBD'
-0.111690 O b'+2:lemma:rnase'
-0.112156 OD b'+2:postag:RB'
-0.112561 O b'-2:lemma:glucose'
-0.113158 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.113857 O b'lemma:;'
-0.113857 O b'-1:lemma:7.6'
-0.114844 Substrain b'hLower'
-0.116301 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.116301 Gtype b'-1:postag:,'
-0.118114 Temp b'-2:postag:NN'
-0.118575 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.119182 O b'+2:lemma:rna'
-0.122399 O b'-2:lemma:25'
-0.125524 Phase b'+2:postag:IN'
-0.125803 OD b'lemma:='
-0.127310 Gtype b'postag:NNP'
-0.130042 O b'lemma:hour'
-0.134415 O b'+2:lemma:.'
-0.134415 O b'+2:postag:.'
-0.139511 O b'+2:lemma:follow'
-0.141736 O b'-2:lemma:for'
-0.142534 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.142672 O b'lemma:o2'
-0.143627 Supp b'-1:lemma:.'
-0.143627 Supp b'-1:postag:.'
-0.146916 Supp b'-1:postag:DT'
-0.153793 O b'lemma:150'
-0.153793 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.153793 O b'-2:lemma:concentration'
-0.157162 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.160151 O b'+2:lemma:n2'
-0.160688 Air b'-2:postag:CC'
-0.162339 Med b'+2:postag:VBG'
-0.162925 O b'+1:postag:IN'
-0.165305 O b'-1:lemma:of'
-0.165837 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.166871 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.167275 Air b'+2:lemma:70'
-0.167765 O b'+1:lemma:5'
-0.169392 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.170129 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.171178 Supp b'postag:IN'
-0.172321 O b'lemma:ph'
-0.173550 O b'+1:lemma:minimal'
-0.174871 O b'-1:lemma:.'
-0.174871 O b'-1:postag:.'
-0.175012 O b'+2:lemma:0.3'
-0.175483 O b'lemma:methanol'
-0.175483 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.177195 O b'lemma:lb'
-0.177405 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.177744 Supp b'+1:postag::'
-0.178142 O b'-1:lemma:sodium'
-0.178142 O b'+2:lemma:1/100'
-0.178392 O b'-2:lemma:10'
-0.182196 O b'lemma:n2'
-0.187431 O b'-1:lemma:the'
-0.192296 OD b'symb'
-0.197164 O b'+1:lemma:mm'
-0.197962 Air b'-2:lemma:95'
-0.199296 O b'+1:lemma:10'
-0.200108 O b'-1:lemma:cra'
-0.200714 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.203869 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.208281 O b'+2:lemma:at'
-0.209212 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.209486 O b'lemma:7.6'
-0.209486 O b'+1:lemma:;'
-0.211947 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.212078 O b'-1:lemma:od600'
-0.214480 O b'+1:lemma:2.0'
-0.214946 O b'-1:lemma:1m'
-0.214946 O b'+2:lemma:7.6'
-0.217004 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.219438 Anti b'postag:NNP'
-0.220436 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.230501 Gtype b'postag::'
-0.230662 O b'-1:lemma:n2'
-0.232983 O b'lemma:1m'
-0.233557 O b'+1:lemma:%'
-0.233672 O b'+2:lemma:tag'
-0.238791 O b'-2:lemma:o2'
-0.240566 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.250116 Gtype b'symb'
-0.252235 O b'+2:lemma:ph'
-0.258280 Temp b'-2:postag:CD'
-0.264655 O b'-1:lemma:final'
-0.268417 O b'-2:lemma:phase'
-0.269534 O b'+1:lemma:supplement'
-0.269714 O b'-1:lemma:250'
-0.277552 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.277552 O b'+1:lemma:methanol'
-0.279864 O b'+2:lemma:m9'
-0.281546 O b'lemma:dissolve'
-0.281546 O b'+2:lemma:methanol'
-0.281818 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.282291 O b'-2:lemma:fnr'
-0.286978 O b'+2:lemma:10'
-0.287245 O b'+1:lemma:of'
-0.288513 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.293811 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.293811 Gtype b'+1:postag:,'
-0.294368 Med b'-2:postag:VBN'
-0.297335 Gtype b'lemma:-lrb-'
-0.302280 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.306836 Med b'+2:lemma:supplement'
-0.307109 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.307735 O b'-2:lemma:stir'
-0.308013 O b'+1:lemma:sample'
-0.310535 O b'lemma:0.2'
-0.311219 O b'+1:lemma:hour'
-0.311860 O b'-1:lemma:mm'
-0.315115 O b'+1:lemma:media'
-0.316236 O b'-2:postag::'
-0.326536 O b'-1:lemma:rna'
-0.328857 O b'-2:lemma:supplement'
-0.331325 Temp b'+1:lemma:with'
-0.331503 O b'+2:lemma:co2'
-0.336700 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.337442 O b'+1:lemma:until'
-0.342383 O b'lemma:m63'
-0.342589 Temp b'postag:NN'
-0.343092 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.347073 Supp b'postag:-LRB-'
-0.347102 Supp b'lemma:1'
-0.351791 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.355797 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.357946 O b'lemma:20'
-0.358834 O b'lemma:co2'
-0.362547 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.362815 O b'-2:lemma:100'
-0.368096 O b'-1:lemma:contain'
-0.369650 O b'-1:lemma:37'
-0.376665 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.377111 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.377116 O b'lemma:of'
-0.377314 Supp b'+2:postag::'
-0.381002 Air b'+2:postag:IN'
-0.383105 O b'-2:lemma:rpob'
-0.386014 Med b'postag:CD'
-0.388946 O b'-1:lemma:minimal'
-0.390992 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.393601 O b'+2:lemma:genome'
-0.395571 O b'+1:lemma:m'
-0.398867 O b'+2:lemma:250'
-0.403216 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.404602 Supp b'+2:postag:NNS'
-0.405229 Med b'postag:-LRB-'
-0.418967 O b'-2:postag:SYM'
-0.420845 O b'lemma:od600'
-0.421475 O b'+2:lemma:sample'
-0.422887 O b'-1:lemma:with'
-0.428637 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.432717 Anti b'hUpper'
-0.436304 Gversion b'hLower'
-0.440294 O b'postag:RB'
-0.448243 O b'-1:lemma:1'
-0.450431 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.452587 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.455998 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.460673 O b'-2:lemma:20'
-0.462201 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.468456 Med b'-1:postag:CD'
-0.470447 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.474458 Supp b'+2:lemma:and'
-0.484042 O b'+2:lemma:reference'
-0.485949 O b'lemma:fecl2'
-0.493920 O b'lemma:mid-log'
-0.495714 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.495715 O b'+2:lemma:add'
-0.498337 O b'+1:lemma:_'
-0.501227 O b'lemma:250'
-0.504581 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.514040 O b'-1:lemma:ph'
-0.514566 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.518292 Med b'-2:lemma:grow'
-0.525481 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.536919 O b'-1:lemma:until'
-0.538626 O b'-2:lemma:minimal'
-0.543301 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.551805 O b'-1:lemma:30'
-0.558400 O b'lemma:pahse'
-0.558814 Technique b'-1:lemma::'
-0.568119 O b'+1:lemma:gadx'
-0.573548 O b'lemma:acetate'
-0.576531 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.578812 OD b'hLower'
-0.579809 O b'+2:lemma:antibody'
-0.582982 O b'-2:lemma:dna'
-0.589477 O b'-2:lemma::'
-0.592129 O b'-2:lemma:50'
-0.606021 O b'lemma:anaerobic'
-0.611479 O b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.626598 O b'lemma:sample'
-0.626851 O b'+1:lemma:in'
-0.628904 O b'-2:lemma:genome'
-0.638018 Supp b'+2:postag:CC'
-0.645790 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.648194 O b'-2:postag:VBG'
-0.649731 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.652133 Med b'-1:postag:NN'
-0.655477 pH b'symb'
-0.659436 Supp b'+1:lemma:,'
-0.659436 Supp b'+1:postag:,'
-0.665594 Temp b'+2:lemma:with'
-0.679640 O b'+1:lemma:1m'
-0.679640 O b'-2:lemma:vol'
-0.680381 O b'lemma:minimal'
-0.703826 Technique b'-1:postag::'
-0.719552 OD b'hUpper'
-0.720129 Strain b'hLower'
-0.754975 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.761411 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.768517 Med b'hLower'
-0.769231 O b'-1:lemma:co2'
-0.771571 O b'lemma:fructose'
-0.773680 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.774569 O b'lemma:medium'
-0.795507 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.796896 O b'-2:lemma:fresh'
-0.798340 O b'lemma:nitrate'
-0.798473 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.800463 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.825854 Supp b'lemma:2'
-0.848056 O b'-2:lemma:the'
-0.848574 O b'-1:lemma:fresh'
-0.868110 Vess b'hUpper'
-0.869965 O b'lemma:glucose'
-0.872473 Temp b'hLower'
-0.874492 O b'+1:postag:DT'
-0.899757 O b'+1:lemma:at'
-0.934026 Strain b'symb'
-0.944479 O b'-1:lemma:vol'
-0.944479 O b'-2:lemma:1/100'
-0.944479 O b'+2:lemma:1m'
-0.957118 O b'lemma:nacl'
-0.966640 O b'+2:lemma:+'
-0.967990 O b'-1:lemma:2'
-0.968083 O b'lemma:30'
-0.990011 O b'-1:lemma:ml'
-1.003137 O b'-2:lemma:until'
-1.008665 Air b'postag:NN'
-1.039141 O b'lemma:37'
-1.044503 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-1.045684 Med b'+1:postag:NN'
-1.060243 O b'+2:lemma:fnr'
-1.075222 Agit b'hUpper'
-1.094624 O b'hGreek'
-1.097883 O b'-1:lemma:rpob'
-1.098835 O b'-1:lemma:IP'
-1.100754 Supp b'+2:lemma:2'
-1.112027 O b'+1:lemma:g/l'
-1.117149 O b'-2:lemma:dpd'
-1.147369 O b'-2:lemma:rifampicin'
-1.175601 O b'lemma:nh4cl'
-1.176310 Supp b'hGreek'
-1.182777 O b'-2:lemma:iptg'
-1.186655 O b'+1:lemma:+'
-1.196645 O b'-2:lemma:pahse'
-1.228938 O b'-1:postag::'
-1.243036 Phase b'symb'
-1.257345 Gtype b'-2:postag:CD'
-1.262437 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.278069 O b'-2:lemma:0.3'
-1.312742 O b'-2:lemma:media'
-1.373616 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.483607 Supp b'postag:JJ'
-1.502147 Med b'+2:postag:VBN'
-1.511803 Supp b'+2:postag:CD'
-1.542971 O b'-2:lemma:IP'
-1.561893 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.568270 Supp b'+2:lemma:1'
-1.600096 OD b'+1:postag:NN'
-1.669060 O b'lemma:aerobic'
-1.669617 O b'-1:lemma:sample'
-1.684052 O b'+2:lemma:b'
-1.763602 O b'+2:lemma:rifampicin'
-1.775767 O b'lemma:rifampicin'
-1.781239 O b'lemma:media'
-1.908594 Gtype b'postag:VBG'
-1.910272 O b'lemma:wt'
-1.915395 O b'lemma:0.3'
-2.095031 Phase b'postag:JJ'
-2.102453 O b'+1:lemma:2'
-2.141688 O b'+2:lemma:iptg'
-2.225739 O b'+1:lemma:1'
-2.288107 OD b'+2:lemma:aerobically'
-2.383893 O b'lemma:aerobically'
-2.592125 Phase b'hUpper'
-2.820800 Technique b'symb'
-3.166146 O b'-1:lemma::'
-4.226040 O b'-1:lemma:_'