report_Run6_v11.txt 39.1 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 1141 1142 1143 1144 1145 1146 1147 1148 1149 1150 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160 1161 1162 1163 1164 1165 1166 1167 1168 1169 1170 1171 1172 1173 1174 1175 1176 1177 1178 1179 1180 1181 1182
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.02823994728360004, 'c2': 0.003042874695186179}
best CV score:0.8443013668504182
model size: 0.11M

Flat F1: 0.8159186660193667
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.912     0.795     0.849        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.864     0.838     0.851       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.857     0.783     0.816       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    7.077989
Supp   -> Supp    5.862009
Med    -> Med     5.724442
Phase  -> Phase   5.702758
Gversion -> Gversion 5.352775
Gtype  -> Gtype   5.010060
Anti   -> Anti    4.987601
OD     -> OD      4.925548
Air    -> Air     4.172551
O      -> O       3.905949
pH     -> pH      3.850604
Technique -> Technique 2.883292
Agit   -> Agit    2.809805
Substrain -> Gtype   1.776723
O      -> Technique 0.457285
Gtype  -> Supp    0.401265
O      -> Supp    0.326303
O      -> Gtype   0.302483
Technique -> Air     0.300162
Agit   -> O       0.181925
O      -> Agit    0.071438
Gtype  -> pH      0.063081
Temp   -> O       0.047106
Air    -> Agit    -0.000059
Temp   -> Air     -0.000345
pH     -> O       -0.000501
Phase  -> Supp    -0.001931
Supp   -> Air     -0.033260
Technique -> Supp    -0.065687
Air    -> Med     -0.073086
Gtype  -> OD      -0.073724
Gversion -> O       -0.079250
Supp   -> Gtype   -0.089869
O      -> Temp    -0.147929
Air    -> O       -0.164547
Gtype  -> Med     -0.203136
O      -> Gversion -0.228797
O      -> OD      -0.230938
Med    -> O       -0.238193
Gtype  -> Phase   -0.311792
Phase  -> Air     -0.342206
O      -> Phase   -0.363932
Air    -> Supp    -0.364463
Anti   -> Supp    -0.374814
Gtype  -> Gversion -0.406251
OD     -> O       -0.460966
Air    -> Phase   -0.461763
Gtype  -> Technique -0.463245
Technique -> OD      -0.563377
Phase  -> Med     -0.564495
Anti   -> O       -0.632895
Air    -> OD      -0.650978
Gtype  -> Anti    -0.671636
Supp   -> O       -0.673583
Technique -> Gtype   -0.700648
O      -> Anti    -0.732234
O      -> Med     -0.735653
Gtype  -> Temp    -0.752003
Phase  -> O       -0.774742
Phase  -> OD      -0.834425
Anti   -> Gtype   -0.837321
OD     -> Air     -0.984999
Temp   -> Med     -1.166878
Technique -> O       -1.519860
Gtype  -> O       -1.539729
Agit   -> Air     -1.547365
Supp   -> Med     -1.591425
O      -> Air     -2.422798
Technique -> pH      -2.445063
Substrain -> O       -2.577283
Med    -> Supp    -3.243068


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    7.077989
Supp   -> Supp    5.862009
Med    -> Med     5.724442
Phase  -> Phase   5.702758
Gversion -> Gversion 5.352775
Gtype  -> Gtype   5.010060
Anti   -> Anti    4.987601
OD     -> OD      4.925548
Air    -> Air     4.172551
O      -> O       3.905949
pH     -> pH      3.850604
Technique -> Technique 2.883292
Agit   -> Agit    2.809805
Substrain -> Gtype   1.776723
O      -> Technique 0.457285
Gtype  -> Supp    0.401265
O      -> Supp    0.326303
O      -> Gtype   0.302483
Technique -> Air     0.300162
Agit   -> O       0.181925
O      -> Agit    0.071438
Gtype  -> pH      0.063081
Temp   -> O       0.047106
Air    -> Agit    -0.000059
Temp   -> Air     -0.000345
pH     -> O       -0.000501
Phase  -> Supp    -0.001931
Supp   -> Air     -0.033260
Technique -> Supp    -0.065687
Air    -> Med     -0.073086
Gtype  -> OD      -0.073724
Gversion -> O       -0.079250
Supp   -> Gtype   -0.089869
O      -> Temp    -0.147929
Air    -> O       -0.164547
Gtype  -> Med     -0.203136
O      -> Gversion -0.228797
O      -> OD      -0.230938
Med    -> O       -0.238193
Gtype  -> Phase   -0.311792
Phase  -> Air     -0.342206
O      -> Phase   -0.363932
Air    -> Supp    -0.364463
Anti   -> Supp    -0.374814
Gtype  -> Gversion -0.406251
OD     -> O       -0.460966
Air    -> Phase   -0.461763
Gtype  -> Technique -0.463245
Technique -> OD      -0.563377
Phase  -> Med     -0.564495
Anti   -> O       -0.632895
Air    -> OD      -0.650978
Gtype  -> Anti    -0.671636
Supp   -> O       -0.673583
Technique -> Gtype   -0.700648
O      -> Anti    -0.732234
O      -> Med     -0.735653
Gtype  -> Temp    -0.752003
Phase  -> O       -0.774742
Phase  -> OD      -0.834425
Anti   -> Gtype   -0.837321
OD     -> Air     -0.984999
Temp   -> Med     -1.166878
Technique -> O       -1.519860
Gtype  -> O       -1.539729
Agit   -> Air     -1.547365
Supp   -> Med     -1.591425
O      -> Air     -2.422798
Technique -> pH      -2.445063
Substrain -> O       -2.577283
Med    -> Supp    -3.243068


Top positive:
8.085085 O        b'-2:lemma:_'
7.973785 Anti     b'-2:lemma:antibody'
7.455670 O        b'lemma:-'
7.335093 Supp     b'lemma:no3'
7.263321 O        b'lemma:_'
6.807003 O        b'lemma:1'
6.772066 Gtype    b'lemma:type'
6.765291 Phase    b'-2:lemma:phase'
6.730486 Supp     b'lemma:pq'
6.674897 Air      b'lemma:anaerobic'
6.390142 Gtype    b'lemma:wt'
6.235620 Med      b'lemma:MOPS'
6.168207 Technique b'lemma:chipseq'
5.890988 Gtype    b'hGreek'
5.850786 O        b'lemma:2'
5.724937 Supp     b'lemma:acetate'
5.437981 O        b'-1:postag:NNS'
5.434249 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
5.432597 Supp     b'lemma:Iron'
5.432597 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
5.350500 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
5.336537 Supp     b'lemma:arginine'
5.258511 O        b'lemma:3'
5.254893 O        b'lemma:with'
5.063500 Air      b'lemma:anaeroibc'
4.999880 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
4.960867 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
4.931570 Air      b'lemma:aerobic'
4.842016 Supp     b'lemma:glucose'
4.752078 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
4.738567 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
4.735766 Supp     b'lemma:2h'
4.735766 Supp     b'-1:lemma:additional'
4.726591 Supp     b'lemma:iptg'
4.722510 Technique b'+2:lemma:ph5'
4.718717 O        b'lemma:.'
4.718717 O        b'postag:.'
4.690271 O        b'lemma:b'
4.673972 O        b'+1:lemma:wt'
4.649080 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
4.637242 Gtype    b'+1:lemma:type'
4.610043 Supp     b'-1:lemma:Cra'
4.607644 Supp     b'lemma:nh4cl'
4.513239 O        b'lemma:Cra'
4.508782 Med      b'lemma:LB'
4.488287 O        b'-2:lemma:myc'
4.483433 O        b'+2:lemma:crp'
4.418787 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
4.408498 Phase    b'lemma:mid-log'
4.374546 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
4.270383 Med      b'+2:lemma:b2'
4.261552 O        b'lemma:harbor'
4.162893 Supp     b'lemma:nacl'
4.133573 Supp     b'-2:lemma:shake'
4.078677 Strain   b'lemma:k-12'
4.047059 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.969033 O        b'lemma:CEL'
3.962032 Air      b'-2:lemma:IP'
3.928614 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
3.900004 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.854526 Supp     b'-2:lemma:purr'
3.845412 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
3.807208 Gtype    b'lemma:dfnr'
3.793368 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
3.791117 Med      b'+2:lemma:b1'
3.710137 O        b'-1:lemma:type'
3.632876 O        b'-1:lemma:0.3'
3.617448 Air      b'postag:RB'
3.595208 O        b'lemma::'
3.587023 O        b'lemma:argr'
3.585614 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
3.582411 O        b'lemma:purr'
3.580351 Gtype    b'lemma:pk4854'
3.580154 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
3.552362 Phase    b'postag:NN'
3.527638 O        b'-2:lemma:='
3.511324 O        b'lemma:genotype/variation'
3.505986 Supp     b'-1:lemma:+'
3.502160 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.499690 Med      b'lemma:minimal'
3.484493 Supp     b'+1:lemma:1'
3.425435 O        b'lemma:rep2'
3.425435 O        b'lemma:rep1'
3.421872 O        b'lemma:trpr'
3.380464 O        b'-1:lemma:lb'
3.350624 Technique b'-1:lemma:input'
3.338066 Substrain b'lemma:mg1655'
3.334196 Air      b'postag:JJ'
3.331513 Gtype    b'-2:lemma:delta'
3.328876 Supp     b'lemma:Adenine'
3.316784 Supp     b'+1:lemma:2'
3.304934 O        b'postag:VBG'
3.249424 O        b'-1:lemma:tag'
3.198331 Supp     b'lemma:Leu'
3.198331 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
3.189218 Supp     b'-2:lemma:induce'
3.165199 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
3.165199 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
3.163516 O        b'lemma:rpob'
3.125377 O        b'-1:lemma:glucose'
3.124149 O        b'-2:lemma:medium'
3.106199 Supp     b'-1:lemma:with'
3.092873 Supp     b'lemma:fructose'
3.089820 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.081793 Air      b'lemma:aerobically'
3.065120 Supp     b'-2:lemma:media'
3.058784 pH       b'+1:lemma:5.5'
3.047812 pH       b'lemma:5.5'
3.000234 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
2.999581 O        b'lemma:for'
2.993123 Phase    b'lemma:stationary'
2.993123 Phase    b'lemma:exponential'
2.983082 O        b'+1:lemma:250'
2.982369 Med      b'-1:lemma:minimal'
2.973830 O        b'lemma:='
2.961546 Supp     b'-1:lemma:ompr'
2.960621 O        b'+1:lemma:od600'
2.959583 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
2.958266 Technique b'-1:lemma:_'
2.956635 OD       b'-2:lemma:od450'
2.925357 Supp     b'+2:lemma:feso4'
2.922930 pH       b'lemma:ph5'
2.922930 pH       b'+1:lemma:.5'
2.908167 O        b'lemma:ompr'
2.902476 O        b'-1:lemma:into'
2.900604 Supp     b'-2:lemma:agent'
2.896294 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.886810 O        b'-1:lemma:medium'
2.874243 Gversion b'lemma:asm584v2'
2.864340 O        b'lemma:soxr'
2.864340 O        b'lemma:soxs'
2.858550 Temp     b'-1:lemma:sample'
2.854944 O        b'lemma:culture'
2.851758 Air      b'-1:lemma:-'
2.846038 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.843622 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.841388 Temp     b'-1:lemma:37'
2.836333 O        b'+2:lemma:constant'
2.832862 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.805907 Air      b'-2:lemma:fnr'
2.795170 Med      b'-1:lemma:ml'
2.778445 Air      b'-2:lemma:0.3'
2.769200 O        b'lemma:affyexp'
2.763983 Temp     b'-2:lemma:keep'
2.720803 O        b'lemma:a'
2.707216 Substrain b'lemma:mg1655star'
2.706423 OD       b'lemma:od450'
2.695052 Supp     b'-1:lemma:30'
2.690216 O        b'+1:postag:RB'
2.682423 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
2.682423 Gtype    b'-1:lemma:old'
2.682423 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
2.673104 O        b'-1:lemma:nitrate'
2.660210 O        b'lemma:chip'
2.649819 O        b'-1:lemma:pq'
2.643590 O        b'postag::'
2.618214 Air      b'+2:lemma:37'
2.614165 Temp     b'lemma:43'
2.603169 Technique b'hUpper'
2.577994 O        b'lemma:at'
2.577383 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.573283 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.569569 Temp     b'lemma:37'
2.541266 Technique b'lemma:rna-seq'
2.537541 O        b'-1:lemma:min'
2.517664 Med      b'+1:lemma:0.4'
2.482794 Technique b'-2:lemma:wt'
2.473097 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.447476 O        b'lemma:gadx'
2.446003 Supp     b'-1:lemma:_'
2.443979 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.440250 Gversion b'lemma:.2'
2.440250 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.430352 OD       b'-1:lemma:od450'
2.425220 Gtype    b'lemma:arca8myc'
2.425220 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
2.414235 O        b'-1:lemma:nacl'
2.406420 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.367681 O        b'postag:IN'
2.365401 Gtype    b'lemma:ptac'
2.365157 Gversion b'lemma:u00096'
2.365157 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.361629 O        b'+1:lemma:0.2'
2.342654 O        b'lemma:\xcf\x8332'
2.323424 pH       b'+1:postag:CD'
2.321210 Supp     b'lemma:glutamine'
2.321210 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
2.312415 O        b'lemma:oxyr'
2.311403 O        b'lemma:treatment'
2.294333 O        b'+1:lemma:mid-log'
2.282442 O        b'-1:lemma:induce'
2.277598 OD       b'-1:lemma:at'
2.271869 O        b'+2:lemma:allow'
2.257917 O        b'lemma:lrp'
2.257053 O        b'-2:lemma:overnight'
2.251752 Air      b'-1:lemma:_'
2.246814 O        b'lemma:ml'
2.237015 Supp     b'-2:lemma:argr'
2.233311 O        b'+1:lemma:coli'
2.233025 O        b'+1:lemma:sparging'
2.230595 O        b'postag:DT'
2.229130 O        b'lemma:chip-fnr'
2.229130 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
2.226961 Supp     b'-2:postag:VBG'
2.213929 O        b'-2:lemma:fructose'
2.212345 O        b'+2:lemma:4'
2.201519 Vess     b'lemma:flask'
2.201519 Vess     b'-1:lemma:warm'
2.201519 Vess     b'-2:lemma:pre'
2.201519 Vess     b'+2:lemma:43'
2.198257 O        b'lemma:chip-arca'
2.198257 O        b'+2:lemma:arca8myc'
2.197448 Agit     b'lemma:250'
2.195523 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
2.195523 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
2.187359 O        b'-1:lemma:wt'
2.178995 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
2.168287 Temp     b'-1:lemma:43'
2.168189 O        b'lemma:growth'
2.159504 Med      b'+1:lemma:g/l'
2.157440 Agit     b'+1:lemma:rpm'
2.140160 O        b'-1:lemma:rpm'
2.116394 Med      b'lemma:medium'
2.108067 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
2.103333 Gtype    b'-1:lemma:wild'
2.100000 O        b'+1:lemma:rifampicin'
2.098348 Supp     b'-2:lemma:trpr'
2.098230 Supp     b'+2:lemma:leucine'
2.093299 O        b'-2:lemma:reach'
2.091028 O        b'-1:lemma:-80'
2.067921 O        b'+2:lemma:_'
2.067173 Agit     b'lemma:rpm'
2.066288 Supp     b'-2:lemma:for'
2.065744 Supp     b'-1:lemma:wt'
2.058718 Supp     b'+2:lemma:A'
2.052046 Agit     b'-1:lemma:250'
2.034147 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
2.026217 Technique b'-1:lemma:IP'
2.015454 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
2.013311 Gversion b'-2:lemma:build'
2.005511 Med      b'lemma:lb'
2.003295 pH       b'lemma:.5'
2.003295 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.994130 Technique b'lemma:rnaseq'
1.987367 Gtype    b'postag:JJ'
1.986919 Supp     b'+1:lemma:_'
1.983699 O        b'lemma:input'
1.983699 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.978187 O        b'-1:lemma:acetate'
1.975801 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.974172 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.973201 Med      b'-2:lemma:minimal'
1.973016 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.972324 Med      b'lemma:media'
1.969636 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.963900 O        b'lemma:cra'
1.960472 Agit     b'+2:lemma:at'
1.951988 Med      b'+2:lemma:+'
1.948088 O        b'+1:postag:NNP'
1.940101 O        b'-1:lemma:media'
1.932309 Supp     b'-1:lemma:potassium'
1.932309 Supp     b'-2:lemma:mmol'
1.923062 Med      b'-2:lemma:fresh'
1.912153 Air      b'+2:lemma:250'
1.891240 Gtype    b'-2:lemma:dna'
1.882216 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.880171 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.880032 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.875147 O        b'postag:VBD'
1.869868 Air      b'-2:lemma:cm20'
1.864529 O        b'postag:VBN'
1.863283 Anti     b'-1:lemma:myc'
1.863283 Anti     b'-2:lemma:9e10'
1.858816 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.851138 Supp     b'lemma:30'
1.850288 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
1.844337 Phase    b'-1:lemma:until'
1.840172 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.838329 O        b'-2:lemma:minute'
1.833007 Phase    b'-2:lemma:until'
1.812619 Gtype    b'-1:lemma:vector'
1.811196 Med      b'-1:lemma:LB'
1.811196 Med      b'+2:lemma:1mm'
1.809112 Supp     b'lemma:Fe'
1.803386 Gtype    b'+1:postag::'
1.803131 Supp     b'+1:lemma:m'
1.796435 Air      b'-1:lemma:co2'
1.787049 O        b'-1:lemma:genbank'
1.786687 Supp     b'-2:lemma:10'
1.756793 Substrain b'+2:lemma::'
1.747168 Med      b'-1:lemma:in'
1.742913 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.741089 Med      b'lemma:glucose'
1.732405 O        b'-1:lemma:dpd'
1.728105 Med      b'+1:lemma:+'
1.708901 Air      b'-2:lemma:mid-log'
1.706877 Gversion b'-2:postag:VB'
1.702867 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.702592 O        b'-1:lemma:genotype'
1.697959 Air      b'-2:postag:SYM'
1.696806 Air      b'-1:lemma:phase'
1.696761 Med      b'lemma:m63'
1.683239 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.681859 Supp     b'-2:lemma:condition'
1.681606 O        b'-1:lemma:Iron'
1.661076 Med      b'postag:NNS'
1.654030 O        b'+1:lemma:30'
1.650776 O        b'symb'
1.638927 O        b'lemma:additional'
1.638927 O        b'+1:lemma:2h'
1.635185 Supp     b'+1:lemma:hour'
1.633947 O        b'-2:lemma:min'
1.630879 Gtype    b'lemma:wild'
1.620409 O        b'+2:postag:VB'
1.618402 O        b'-1:lemma:fructose'
1.611868 OD       b'+1:postag:IN'
1.610461 O        b'+1:lemma::'
1.610341 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
1.598048 Med      b'-1:lemma:fresh'
1.597407 O        b'-2:lemma:ml'
1.593722 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.591158 O        b'-1:lemma:0.35'
1.573162 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.571217 Supp     b'+2:lemma:nh4cl'
1.564067 O        b'+2:lemma:wt'
1.560859 O        b'-1:lemma:4'
1.554554 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.554554 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.548614 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.548614 Strain   b'-2:lemma:str'
1.545147 Gtype    b'-1:postag:VBP'
1.527375 OD       b'lemma:0.3'
1.524888 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
1.516272 O        b'-1:lemma:l1'
1.516241 Air      b'+2:lemma:%'
1.514061 Strain   b'-2:lemma:strain'
1.513519 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.506825 Med      b'+2:postag:CC'
1.493521 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.492540 Air      b'-1:postag::'
1.484367 Supp     b'-1:lemma:without'
1.484074 Supp     b'lemma:tryptophan'
1.484074 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
1.483884 Gversion b'lemma:000913'
1.483884 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.480162 O        b'-2:lemma:no3'
1.479845 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
1.470160 Air      b'lemma:%'
1.467882 O        b'+1:lemma:20'
1.463058 Gtype    b'+1:lemma:the'
1.462447 OD       b'lemma:od600'
1.461098 O        b'-2:lemma:37'
1.459470 O        b'lemma:or'
1.444363 OD       b'+1:lemma:of'
1.442989 O        b'-2:lemma:co2'
1.435878 O        b'-1:lemma:w0002'
1.434848 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
1.430203 O        b'+2:lemma:w/v'
1.426622 Vess     b'+1:lemma:at'
1.425500 Supp     b'-1:lemma:respiration'
1.425500 Supp     b'+1:lemma:mmol'
1.425500 Supp     b'+2:lemma:potassium'
1.418765 O        b'+1:lemma:b1'
1.417662 O        b'+2:lemma:rpm'
1.417535 Gtype    b'-2:lemma:Fur'
1.416629 Supp     b'-2:lemma:20'
1.415796 Vess     b'-2:postag:JJ'
1.408760 O        b'+1:lemma:43'
1.406528 O        b'+1:lemma:anerobically'
1.406528 O        b'-2:lemma:600nm'
1.403131 OD       b'-1:postag:IN'
1.397212 Anti     b'hGreek'
1.392978 O        b'+1:lemma:k-12'
1.392062 Substrain b'-1:lemma:.'
1.392062 Substrain b'-1:postag:.'
1.382812 Gversion b'lemma:nc'
1.382812 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.379869 O        b'postag:CC'
1.379554 O        b'+2:lemma:ml'
1.378725 O        b'+1:lemma:pq'
1.378143 O        b'lemma:-lrb-'
1.375960 Gtype    b'lemma:the'
1.361468 pH       b'-1:lemma:at'
1.354987 Supp     b'-2:lemma:Fe'
1.353744 Technique b'-2:postag:NNP'
1.352502 Supp     b'-1:lemma::'
1.351413 Supp     b'lemma:0.2'
1.350232 Med      b'-2:postag:JJ'
1.347731 O        b'+2:lemma:fructose'
1.347303 Air      b'+1:lemma:at'
1.346154 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.345781 Gtype    b'-1:lemma:from'
1.340437 O        b'lemma:-80'
1.340437 O        b'-2:lemma:freeze'
1.326705 O        b'-2:lemma:~'
1.324317 Technique b'+1:lemma:gadx'
1.323586 Supp     b'-1:lemma:soxr'
1.323586 Supp     b'-1:lemma:soxs'
1.307622 Supp     b'lemma:leucine'
1.301568 O        b'lemma:A'
1.301288 OD       b'-2:lemma:phase'
1.300203 O        b'-2:postag:FW'
1.299838 O        b'lemma:old'
1.299838 O        b'-1:lemma:seqa'
1.299838 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
1.298851 Supp     b'lemma:Trp'
1.294206 Gtype    b'hUpper'
1.288934 OD       b'postag:IN'
1.285667 O        b'+2:postag:JJ'
1.284532 Med      b'-2:lemma:treatment'
1.280218 Med      b'-2:lemma:medium'
1.274348 Air      b'-2:lemma:%'
1.268944 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.266306 Anti     b'postag:JJ'
1.259937 O        b'+2:lemma:TEX'
1.257742 O        b'-2:lemma:Leu'
1.255332 O        b'lemma:-rrb-'
1.251911 Supp     b'-2:lemma:nitrate'
1.248527 O        b'+2:lemma:of'
1.245195 Supp     b'-2:lemma:source'
1.240730 Technique b'hLower'
1.239035 O        b'+1:postag:VBZ'
1.235924 Supp     b'-1:lemma:\xce\xb4ompr'
1.230842 O        b'lemma:Nac'
1.226871 Technique b'lemma:chip-exo'
1.220638 O        b'+2:lemma:k-12'
1.219302 Air      b'+1:lemma:%'
1.219029 O        b'-1:lemma:antibody'
1.214470 O        b'lemma:be'
1.210340 pH       b'-2:lemma:at'
1.209471 Supp     b'+1:lemma:be'
1.208587 Supp     b'-1:lemma:vol'
1.208587 Supp     b'-2:lemma:1/100'
1.208587 Supp     b'+2:lemma:1m'
1.199583 Air      b'-1:lemma:%'
1.195577 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.186048 OD       b'postag:CD'
1.184793 Gtype    b'lemma:wild-type'
1.181149 Air      b'-2:postag:CD'
1.180933 Strain   b'-1:lemma:.'
1.180933 Strain   b'-1:postag:.'
1.179148 Technique b'lemma:chip-seq'
1.178448 O        b'-1:lemma:trpr'
1.177170 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.170611 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.168712 O        b'-1:lemma:.5'
1.168712 O        b'-2:lemma:ph5'
1.163713 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.163713 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.160954 O        b'-1:lemma:.2'
1.160954 O        b'-2:lemma:u00096'
1.155378 OD       b'lemma:of'
1.150834 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
1.145101 Supp     b'+1:lemma:iptg'
1.144247 Supp     b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
1.143652 Supp     b'-2:lemma:\xce\xb4fur'
1.136925 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
1.136731 O        b'-2:lemma:Adenine'
1.136358 Gtype    b'+2:lemma:rep2'
1.136358 Gtype    b'+2:lemma:rep1'
1.136131 O        b'postag:NNS'
1.134904 Gtype    b'lemma:ryhb'
1.130728 Substrain b'+2:postag::'
1.130469 Gtype    b'lemma:crp'
1.127820 Med      b'-2:lemma:100'
1.127631 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.127359 O        b'-1:lemma:Aerobic'
1.126413 Gversion b'postag:CD'
1.124908 Temp     b'-2:lemma:see'
1.124208 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.119053 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.119053 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.117650 O        b'lemma:ntrc'
1.117650 O        b'lemma:csir'
1.114043 Anti     b'-1:lemma:fnr'
1.112334 Air      b'+1:lemma:b'
1.111725 Supp     b'+2:lemma:add'
1.111164 Temp     b'lemma:sample'
1.110663 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
1.109717 Supp     b'lemma:nitrate'
1.107782 Supp     b'-1:lemma:0.2'
1.102976 O        b'-2:postag:VBP'
1.096633 Gtype    b'+2:postag::'
1.092907 O        b'+1:lemma:ph5'
1.092907 O        b'+2:lemma:.5'
1.090492 Gversion b'postag:NN'
1.087193 Phase    b'-1:lemma::'
1.073007 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
1.069199 O        b'lemma:s'
1.069199 O        b'-2:lemma:parameter'
1.063782 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.054752 Temp     b'-2:postag:VBD'
1.050341 O        b'+2:lemma:Cold'
1.049138 Anti     b'-1:lemma::'
1.046809 Gtype    b'lemma:vector'
1.045976 OD       b'+2:postag:CD'
1.044240 Supp     b'+1:lemma:min'
1.042811 Supp     b'-1:lemma:sodium'
1.042811 Supp     b'+2:lemma:1/100'
1.041697 O        b'-2:lemma:lb'


Top negative:
0.000164 Supp     b'+1:lemma:dpd'
0.000161 Supp     b'-2:lemma:300'
0.000116 Temp     b'postag:-RRB-'
0.000100 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
0.000094 O        b'+1:lemma:m63'
0.000083 O        b'+2:lemma:knock-out'
0.000052 Anti     b'lemma:\xcf\x8332'
0.000039 Supp     b'-2:postag:CC'
0.000030 O        b'-2:lemma:\xce\xbcl'
0.000028 Gtype    b'+2:lemma:-rrb-'
0.000026 Air      b'+2:lemma:95'
0.000021 O        b'-2:lemma:Wild'
0.000016 Temp     b'+1:lemma:in'
0.000012 Supp     b'+2:lemma:b'
0.000011 Air      b'-2:lemma:anaerobically'
0.000011 Gtype    b'+2:lemma:pk4854'
0.000010 O        b'-1:postag:-RRB-'
0.000008 Temp     b'lemma:30'
0.000007 O        b'-2:lemma:genotype'
0.000005 Supp     b'-1:lemma:300'
0.000003 Anti     b'-2:lemma:rna'
0.000003 Anti     b'-1:lemma:polymerase'
0.000002 O        b'+2:lemma:minimal'
0.000002 Gtype    b'+2:lemma:_'
0.000000 O        b'lemma:EB'
-0.000003 O        b'-1:lemma:300'
-0.000006 O        b'-1:lemma:k-12'
-0.000007 Med      b'-1:postag:NNP'
-0.000007 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.000010 Gtype    b'lemma:delta'
-0.000012 O        b'-1:postag:VB'
-0.000014 Med      b'+1:postag:CC'
-0.000020 Med      b'-2:postag:CC'
-0.000030 O        b'-2:lemma:300'
-0.000039 O        b'-1:lemma:harbor'
-0.000048 O        b'lemma:95'
-0.000054 Technique b'postag:-RRB-'
-0.000057 O        b'+1:lemma:95'
-0.000094 O        b'+2:lemma:pk4854'
-0.000141 Med      b'-2:postag:NNP'
-0.000180 Phase    b'-1:postag:NN'
-0.000190 O        b'+1:lemma:300'
-0.000236 O        b'-1:postag:SYM'
-0.000409 O        b'-2:lemma:nacl'
-0.000442 Supp     b'+1:lemma:with'
-0.000491 Med      b'+1:postag:IN'
-0.000537 Supp     b'lemma:1'
-0.000857 Gtype    b'postag:NNP'
-0.001474 Med      b'-1:lemma:MOPS'
-0.001477 O        b'+1:lemma:ph'
-0.001530 O        b'-2:lemma:ph'
-0.001534 OD       b'-2:postag:VBN'
-0.001798 Gtype    b'+2:lemma:cra'
-0.002417 Supp     b'-2:lemma:,'
-0.002417 Supp     b'-2:postag:,'
-0.002912 Air      b'-1:lemma::'
-0.003341 Anti     b'-2:postag:JJ'
-0.003342 O        b'lemma:sample'
-0.003662 O        b'lemma:phosphate'
-0.004259 O        b'-1:postag:DT'
-0.004557 O        b'+2:lemma:before'
-0.004921 Supp     b'+2:lemma:,'
-0.004921 Supp     b'+2:postag:,'
-0.005107 Gversion b'symb'
-0.005420 O        b'+2:postag:RB'
-0.005611 O        b'+2:lemma:5'
-0.005622 Supp     b'+1:postag:SYM'
-0.005702 O        b'+2:lemma:culture'
-0.006269 Temp     b'-2:postag:NN'
-0.006782 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.008476 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.009343 Temp     b'symb'
-0.010299 Gtype    b'postag:NN'
-0.010742 Supp     b'lemma:-rrb-'
-0.010986 O        b'-1:lemma:~'
-0.012046 Technique b'+2:postag:CD'
-0.012049 Supp     b'+2:lemma:mm'
-0.012480 O        b'lemma:25'
-0.012694 Air      b'-1:postag:CC'
-0.013135 O        b'-2:lemma:grow'
-0.013827 Air      b'lemma:,'
-0.013827 Air      b'postag:,'
-0.013988 Supp     b'postag:VBN'
-0.014100 Supp     b'lemma:ph'
-0.014125 O        b'-1:lemma:contain'
-0.015453 Temp     b'-2:postag:IN'
-0.017951 O        b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.019277 O        b'-1:lemma:cra'
-0.019495 Air      b'+1:postag:CD'
-0.019828 Supp     b'-1:lemma:20'
-0.023704 Supp     b'postag::'
-0.024815 pH       b'hUpper'
-0.025085 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.025397 O        b'+2:lemma:0.2'
-0.025904 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.025998 Supp     b'-2:lemma:of'
-0.026086 OD       b'lemma:~'
-0.026122 O        b'+2:lemma:25'
-0.026360 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.026424 O        b'+2:lemma:g/l'
-0.028272 Gtype    b'+2:postag:JJ'
-0.028329 Supp     b'-1:postag::'
-0.028416 Phase    b'+1:lemma:aerobically'
-0.028855 O        b'+1:lemma:a'
-0.029026 O        b'-1:lemma:in'
-0.029116 Med      b'-1:postag:CC'
-0.029506 O        b'lemma:the'
-0.030964 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.031058 O        b'-1:lemma:25'
-0.031096 O        b'lemma:mg/ml'
-0.031096 O        b'-1:lemma:150'
-0.031431 O        b'+1:postag:NNS'
-0.031966 O        b'-2:lemma:%'
-0.032811 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.033533 O        b'+2:lemma:sample'
-0.033999 O        b'-2:postag:DT'
-0.034199 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.034464 O        b'+2:lemma:Fe'
-0.035793 Med      b'-2:lemma:in'
-0.035811 Supp     b'lemma:and'
-0.036331 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.037045 O        b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.037559 Gtype    b'+1:lemma:-rrb-'
-0.037649 OD       b'+2:lemma:for'
-0.038143 O        b'lemma:70'
-0.039931 Supp     b'+2:lemma:final'
-0.040196 O        b'+1:lemma:medium'
-0.041471 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.043415 O        b'+1:lemma:sample'
-0.043893 O        b'+1:lemma:25'
-0.044214 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.046011 O        b'-2:lemma:fnr'
-0.046905 O        b'-2:lemma:5'
-0.048557 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.050957 O        b'-1:lemma:70'
-0.050971 Phase    b'+1:postag:RB'
-0.051156 O        b'-2:lemma:control'
-0.051398 O        b'+1:lemma:='
-0.052329 O        b'-2:lemma:at'
-0.052636 O        b'lemma:;'
-0.052636 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.052830 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.054313 O        b'+2:lemma:0.4'
-0.055830 O        b'+1:lemma:70'
-0.059623 O        b'+2:lemma:the'
-0.061800 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.062174 O        b'-2:lemma:phase'
-0.064805 Phase    b'+2:lemma:at'
-0.065720 Phase    b'+2:postag:IN'
-0.065734 O        b'+1:postag:CD'
-0.067444 O        b'-1:lemma:the'
-0.070856 OD       b'+2:lemma:a'
-0.073688 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.074044 Temp     b'-2:postag:JJ'
-0.074235 O        b'-2:lemma:for'
-0.075342 O        b'lemma:5'
-0.076106 O        b'+1:lemma:o2'
-0.081030 O        b'-1:lemma:for'
-0.081030 O        b'+2:lemma:total'
-0.082322 Supp     b'postag:-RRB-'
-0.084553 Supp     b'-2:postag:DT'
-0.085389 Supp     b'lemma:,'
-0.085389 Supp     b'postag:,'
-0.085824 O        b'+2:lemma:o2'
-0.089096 Supp     b'postag:NNS'
-0.089799 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.090300 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.090630 Med      b'lemma:-lrb-'
-0.091008 O        b'lemma:m9'
-0.092124 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.092830 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.092998 Gtype    b'symb'
-0.094137 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.094831 OD       b'+2:postag:DT'
-0.095951 O        b'+1:lemma:co2'
-0.096772 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.097620 O        b'+1:lemma:genome'
-0.097908 O        b'-2:lemma:into'
-0.097992 O        b'+2:lemma:rna'
-0.098917 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.100600 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.104458 O        b'-2:lemma:70'
-0.105140 Technique b'+1:lemma:-rrb-'
-0.105176 O        b'+2:lemma:until'
-0.105277 Gversion b'hLower'
-0.107167 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.107348 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.107348 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.107348 O        b'+2:lemma:vol'
-0.107626 O        b'-2:lemma:1'
-0.107891 Technique b'+1:postag:-RRB-'
-0.109337 O        b'+1:lemma:n2'
-0.111283 O        b'+2:lemma:od600'
-0.111880 OD       b'+2:postag:CC'
-0.112460 O        b'+1:lemma:b'
-0.112708 O        b'-1:lemma:at'
-0.113062 O        b'+2:lemma:~'
-0.114409 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.114409 Supp     b'-1:postag:.'
-0.116463 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.116843 O        b'lemma:m63'
-0.117355 O        b'+2:lemma:.'
-0.117355 O        b'+2:postag:.'
-0.117458 Supp     b'-1:lemma:in'
-0.118367 O        b'-2:lemma:glucose'
-0.118681 O        b'lemma:hour'
-0.119374 O        b'+2:lemma:rnase'
-0.119383 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.120331 Supp     b'postag:CD'
-0.120998 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.121613 O        b'-1:lemma:um'
-0.121613 O        b'+1:lemma:paraquat'
-0.122526 O        b'+1:lemma:mm'
-0.122901 O        b'+1:lemma:~'
-0.125076 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.126850 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.127649 O        b'+1:lemma:contain'
-0.128670 pH       b'symb'
-0.130456 O        b'-1:lemma:o2'
-0.130531 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.131307 O        b'-2:lemma:25'
-0.131378 O        b'+2:lemma:media'
-0.132030 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.132943 Gtype    b'+1:lemma:-lrb-'
-0.135408 O        b'-1:lemma:m9'
-0.142327 O        b'-1:lemma:250'
-0.143988 O        b'+1:lemma:phase'
-0.144320 OD       b'+2:lemma:and'
-0.145691 Med      b'postag:-LRB-'
-0.147098 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.153910 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.154933 O        b'lemma:o2'
-0.160334 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.162080 Med      b'-1:postag:CD'
-0.162581 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.165928 O        b'lemma:150'
-0.165928 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.165928 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.166125 O        b'-1:lemma:final'
-0.166476 O        b'lemma:ph'
-0.172329 Technique b'-2:postag:NN'
-0.174367 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.175159 Supp     b'postag:IN'
-0.176262 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.178112 O        b'+1:postag:IN'
-0.187004 Supp     b'lemma:.'
-0.187004 Supp     b'postag:.'
-0.187715 O        b'lemma:0.1'
-0.192535 O        b'+1:lemma:5'
-0.195128 O        b'-2:lemma:cell'
-0.195171 O        b'-2:lemma:the'
-0.196584 Med      b'+2:lemma:supplement'
-0.197538 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.197960 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.198127 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.198770 O        b'-2:lemma:stir'
-0.206394 O        b'+2:lemma:follow'
-0.206594 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.206594 O        b'+2:lemma:1/100'
-0.207200 Med      b'+2:postag:VBG'
-0.211235 O        b'-2:lemma:n2'
-0.212006 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.212405 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.215083 Gtype    b'postag::'
-0.216207 O        b'-2:lemma:100'
-0.216268 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.216753 O        b'lemma:medium'
-0.218887 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.221945 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.222458 O        b'-1:lemma:of'
-0.222668 Med      b'-1:postag:NN'
-0.223114 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.223114 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.225590 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.225674 O        b'+2:lemma:m9'
-0.226268 O        b'lemma:min'
-0.227307 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.228662 O        b'+1:lemma:of'
-0.229254 O        b'-1:lemma:mm'
-0.233035 Air      b'+2:postag:IN'
-0.237202 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.237757 O        b'+1:lemma:%'
-0.238190 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.238334 O        b'-2:lemma:o2'
-0.243614 O        b'+2:lemma:at'
-0.245018 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.245215 O        b'-1:lemma:.'
-0.245215 O        b'-1:postag:.'
-0.248254 O        b'lemma:acetate'
-0.249315 Gtype    b'lemma:-lrb-'
-0.252590 O        b'-1:lemma:='
-0.254478 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.255212 OD       b'+2:postag:NN'
-0.259888 O        b'+1:lemma:media'
-0.262292 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.267131 O        b'lemma:methanol'
-0.267131 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.271958 O        b'-1:lemma:37'
-0.272417 O        b'lemma:7.6'
-0.272417 O        b'+1:lemma:;'
-0.275231 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.277808 OD       b'hUpper'
-0.278308 O        b'lemma:fructose'
-0.281212 O        b'-1:lemma:1m'
-0.281212 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.282164 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.282172 O        b'+2:lemma:n2'
-0.282694 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.283735 O        b'-2:lemma::'
-0.286554 Supp     b'+2:lemma:with'
-0.289574 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.289812 O        b'+2:lemma:glucose'
-0.290540 O        b'lemma:lb'
-0.290573 O        b'lemma:0.2'
-0.294679 OD       b'lemma:='
-0.295403 O        b'lemma:n2'
-0.295585 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.296184 Med      b'+2:lemma:contain'
-0.299599 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.299717 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.300240 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.301354 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.309080 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.315071 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.316606 O        b'+1:lemma:until'
-0.318747 O        b'-2:lemma:10'
-0.322119 O        b'+2:lemma:genome'
-0.323951 O        b'hGreek'
-0.325190 OD       b'postag:JJ'
-0.326910 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.330099 O        b'lemma:1m'
-0.330196 O        b'lemma:fecl2'
-0.333791 O        b'-1:lemma:n2'
-0.339784 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.342897 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.343933 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.345014 O        b'+2:lemma:10'
-0.347186 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.349842 O        b'-2:postag:SYM'
-0.351121 Temp     b'postag:NN'
-0.352193 O        b'+2:lemma:ph'
-0.352962 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.352962 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.354642 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.357208 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.358908 O        b'lemma:dissolve'
-0.358908 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.369970 O        b'+2:lemma:0.3'
-0.370956 Technique b'-1:lemma::'
-0.372285 O        b'+2:lemma:co2'
-0.373747 Temp     b'+2:postag:IN'
-0.374799 O        b'-1:lemma:with'
-0.375136 O        b'+1:postag:DT'
-0.385063 O        b'-1:lemma:ml'
-0.386613 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.390695 Gtype    b'-1:lemma:and'
-0.394117 Supp     b'+2:postag:NNS'
-0.396429 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.408244 O        b'+2:lemma:tag'
-0.411400 O        b'+2:lemma:add'
-0.411551 Supp     b'+1:postag:JJ'
-0.417008 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.430740 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.430740 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.432528 O        b'+2:lemma:250'
-0.433801 O        b'lemma:co2'
-0.437474 O        b'lemma:of'
-0.437989 O        b'+1:lemma:min'
-0.449155 O        b'lemma:minimal'
-0.457779 O        b'postag:RB'
-0.464970 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.467629 O        b'lemma:20'
-0.472734 O        b'-1:lemma:ph'
-0.476333 OD       b'hLower'
-0.477864 O        b'-2:lemma:50'
-0.488923 Anti     b'postag:NNP'
-0.497282 O        b'-2:lemma:genome'
-0.497566 O        b'-1:lemma:od600'
-0.499496 O        b'+1:lemma:hour'
-0.500844 O        b'lemma:dpd'
-0.502528 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.511192 O        b'+1:lemma:gadx'
-0.517750 O        b'+2:lemma:reference'
-0.523507 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.525443 Gtype    b'+1:lemma:and'
-0.542857 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.543827 Supp     b'+1:postag::'
-0.546276 O        b'lemma:pahse'
-0.546908 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.551830 Technique b'-1:postag::'
-0.574905 Med      b'postag:CD'
-0.577616 O        b'-1:lemma:1'
-0.586228 Supp     b'-1:postag:VBG'
-0.590506 O        b'lemma:250'
-0.591025 Supp     b'+2:postag::'
-0.598592 O        b'-2:postag::'
-0.604068 O        b'-2:lemma:20'
-0.612545 Gtype    b'+1:postag:CC'
-0.613183 Supp     b'postag:CC'
-0.617269 O        b'lemma:anaerobic'
-0.623499 O        b'-1:lemma:30'
-0.640082 O        b'lemma:mid-log'
-0.651684 Supp     b'hGreek'
-0.665267 O        b'+1:lemma:in'
-0.668812 O        b'-2:lemma:dna'
-0.678275 Strain   b'symb'
-0.684372 O        b'lemma:nacl'
-0.694157 O        b'+1:lemma:1m'
-0.694157 O        b'-2:lemma:vol'
-0.694885 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.695576 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.699229 O        b'-1:lemma:rna'
-0.704102 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.709508 O        b'+1:lemma:m'
-0.710025 O        b'lemma:glucose'
-0.713231 Strain   b'hLower'
-0.717316 O        b'-1:lemma:vol'
-0.717316 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.717316 O        b'+2:lemma:1m'
-0.725961 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.725961 Supp     b'+1:postag:,'
-0.728905 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.732264 Anti     b'hUpper'
-0.734593 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.736287 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.738895 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.753019 O        b'lemma:od600'
-0.753497 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.757827 Gtype    b'-1:postag:CC'
-0.772402 O        b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.781580 Med      b'-2:lemma:grow'
-0.811108 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.839440 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.862329 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.899208 O        b'-2:lemma:media'
-0.907192 O        b'-1:lemma:IP'
-0.910481 O        b'-1:lemma:until'
-0.917987 O        b'+1:lemma:+'
-0.920211 O        b'-2:postag:VBG'
-0.930121 O        b'lemma:37'
-0.940614 O        b'+2:lemma:in'
-0.953642 O        b'lemma:nitrate'
-0.971113 OD       b'+2:postag:RB'
-1.007433 Temp     b'hLower'
-1.014467 Supp     b'lemma:2'
-1.073664 O        b'+2:lemma:fnr'
-1.078848 Med      b'hLower'
-1.097441 Vess     b'hUpper'
-1.124237 O        b'-1:lemma:co2'
-1.141005 Gtype    b'-2:postag:CD'
-1.153446 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.189088 O        b'-1:postag::'
-1.202599 Supp     b'+2:postag:CC'
-1.205591 O        b'-2:lemma:fresh'
-1.206299 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.207117 O        b'-2:lemma:nitrate'
-1.215815 Med      b'+1:postag:NN'
-1.220068 OD       b'+1:postag:NN'
-1.248130 O        b'+1:lemma:_'
-1.250003 O        b'+1:lemma:g/l'
-1.256510 Phase    b'symb'
-1.263920 Air      b'postag:NN'
-1.290531 O        b'lemma:rifampicin'
-1.297115 O        b'lemma:aerobic'
-1.322091 O        b'-1:lemma:2'
-1.358809 O        b'+1:lemma:at'
-1.368962 O        b'-2:lemma:until'
-1.434416 Agit     b'hUpper'
-1.439976 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.470043 O        b'+2:lemma:+'
-1.522677 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.581726 Gtype    b'postag:VBG'
-1.625970 O        b'lemma:30'
-1.636897 O        b'lemma:media'
-1.683455 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.692798 O        b'-2:lemma:aerobically'
-1.703421 O        b'lemma:nh4cl'
-1.734862 O        b'lemma:wt'
-1.755281 O        b'-2:lemma:IP'
-1.803300 Phase    b'-1:postag:JJ'
-1.842735 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.853138 Supp     b'postag:JJ'
-1.947046 O        b'lemma:aerobically'
-2.050352 O        b'-2:lemma:iptg'
-2.062888 O        b'-2:lemma:dpd'
-2.168484 Phase    b'postag:JJ'
-2.169032 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-2.234204 Med      b'+2:postag:VBN'
-2.249954 O        b'lemma:0.3'
-2.295015 O        b'+1:lemma:2'
-2.340133 O        b'-2:lemma:0.3'
-2.361809 O        b'+2:lemma:b'
-2.478734 O        b'-1:lemma:sample'
-2.651537 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-2.748492 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.956812 Technique b'symb'
-3.093578 O        b'+1:lemma:1'
-3.706537 Phase    b'hUpper'
-4.276141 O        b'-1:lemma::'
-4.711909 O        b'-1:lemma:_'