report_Run6_v10.txt
40.3 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
1217
1218
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.014200413757939939, 'c2': 0.0008386773263625183}
best CV score:0.8514396351676051
model size: 0.12M
Flat F1: 0.8134169839587185
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.895 0.386 0.540 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 1.000 0.769 0.870 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.858 0.846 0.852 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.925 0.750 0.813 484
Top likely transitions:
Phase -> Phase 7.228930
Temp -> Temp 7.128253
Supp -> Supp 5.825734
OD -> OD 5.310403
Med -> Med 5.291943
Air -> Air 4.853591
Anti -> Anti 4.734200
O -> O 4.366880
Gtype -> Gtype 4.339325
pH -> pH 3.866460
Gversion -> Gversion 3.799595
Agit -> Agit 3.338817
Substrain -> Gtype 2.127903
Technique -> Technique 1.856878
Technique -> Air 0.549922
Temp -> O 0.493576
O -> Technique 0.360239
O -> Supp 0.224412
Strain -> O 0.190888
Gtype -> pH 0.130160
O -> Strain 0.054457
Agit -> O 0.033834
Vess -> O 0.000045
O -> Vess 0.000030
Technique -> Med -0.000590
O -> Gtype -0.002110
Anti -> pH -0.046475
O -> pH -0.056152
Strain -> Phase -0.082768
Phase -> O -0.100965
Technique -> Supp -0.102552
pH -> Supp -0.120337
O -> Agit -0.134155
Gversion -> Supp -0.139909
Supp -> pH -0.183244
O -> OD -0.206493
OD -> O -0.211941
Gtype -> Phase -0.216396
O -> Anti -0.219982
Gtype -> Temp -0.222236
Med -> Phase -0.230130
Air -> Gtype -0.240790
Med -> O -0.245632
Gtype -> Air -0.269939
Anti -> O -0.276962
O -> Phase -0.285159
Gversion -> Gtype -0.287036
Supp -> O -0.291788
Gtype -> Supp -0.330182
Phase -> Air -0.331654
Air -> O -0.357013
Air -> Phase -0.424458
Technique -> Gversion -0.443383
Strain -> Supp -0.468051
Air -> Supp -0.475470
Supp -> Gtype -0.500563
Gversion -> O -0.551973
Anti -> Supp -0.552432
O -> Temp -0.581883
Phase -> Supp -0.791529
Phase -> Technique -0.796592
Gtype -> Gversion -0.871682
Supp -> Air -0.930252
O -> Med -0.980902
Phase -> Gtype -1.001267
Supp -> Med -1.040126
Anti -> Gtype -1.118957
Technique -> O -1.121474
Phase -> Med -1.131762
O -> Gversion -1.164503
Anti -> Phase -1.308426
Gtype -> O -1.409445
Gtype -> OD -1.446431
Supp -> Phase -1.477788
Phase -> OD -1.499796
Supp -> Technique -1.511117
Gtype -> Anti -1.532455
Technique -> OD -1.539308
Temp -> Med -1.596035
Agit -> Air -1.676006
Gtype -> Technique -1.898488
Gtype -> Med -1.989201
Air -> OD -2.082570
OD -> Air -2.100448
Substrain -> O -2.719498
O -> Air -2.808492
Technique -> Gtype -2.870355
Technique -> pH -3.577986
Med -> Supp -4.093955
Top unlikely transitions:
Phase -> Phase 7.228930
Temp -> Temp 7.128253
Supp -> Supp 5.825734
OD -> OD 5.310403
Med -> Med 5.291943
Air -> Air 4.853591
Anti -> Anti 4.734200
O -> O 4.366880
Gtype -> Gtype 4.339325
pH -> pH 3.866460
Gversion -> Gversion 3.799595
Agit -> Agit 3.338817
Substrain -> Gtype 2.127903
Technique -> Technique 1.856878
Technique -> Air 0.549922
Temp -> O 0.493576
O -> Technique 0.360239
O -> Supp 0.224412
Strain -> O 0.190888
Gtype -> pH 0.130160
O -> Strain 0.054457
Agit -> O 0.033834
Vess -> O 0.000045
O -> Vess 0.000030
Technique -> Med -0.000590
O -> Gtype -0.002110
Anti -> pH -0.046475
O -> pH -0.056152
Strain -> Phase -0.082768
Phase -> O -0.100965
Technique -> Supp -0.102552
pH -> Supp -0.120337
O -> Agit -0.134155
Gversion -> Supp -0.139909
Supp -> pH -0.183244
O -> OD -0.206493
OD -> O -0.211941
Gtype -> Phase -0.216396
O -> Anti -0.219982
Gtype -> Temp -0.222236
Med -> Phase -0.230130
Air -> Gtype -0.240790
Med -> O -0.245632
Gtype -> Air -0.269939
Anti -> O -0.276962
O -> Phase -0.285159
Gversion -> Gtype -0.287036
Supp -> O -0.291788
Gtype -> Supp -0.330182
Phase -> Air -0.331654
Air -> O -0.357013
Air -> Phase -0.424458
Technique -> Gversion -0.443383
Strain -> Supp -0.468051
Air -> Supp -0.475470
Supp -> Gtype -0.500563
Gversion -> O -0.551973
Anti -> Supp -0.552432
O -> Temp -0.581883
Phase -> Supp -0.791529
Phase -> Technique -0.796592
Gtype -> Gversion -0.871682
Supp -> Air -0.930252
O -> Med -0.980902
Phase -> Gtype -1.001267
Supp -> Med -1.040126
Anti -> Gtype -1.118957
Technique -> O -1.121474
Phase -> Med -1.131762
O -> Gversion -1.164503
Anti -> Phase -1.308426
Gtype -> O -1.409445
Gtype -> OD -1.446431
Supp -> Phase -1.477788
Phase -> OD -1.499796
Supp -> Technique -1.511117
Gtype -> Anti -1.532455
Technique -> OD -1.539308
Temp -> Med -1.596035
Agit -> Air -1.676006
Gtype -> Technique -1.898488
Gtype -> Med -1.989201
Air -> OD -2.082570
OD -> Air -2.100448
Substrain -> O -2.719498
O -> Air -2.808492
Technique -> Gtype -2.870355
Technique -> pH -3.577986
Med -> Supp -4.093955
Top positive:
10.632316 O b'-2:lemma:_'
9.387921 O b'lemma:-'
9.108587 Supp b'lemma:no3'
8.953851 Anti b'-2:lemma:antibody'
8.675723 Phase b'-2:lemma:phase'
8.621428 Air b'lemma:anaerobic'
8.570872 Technique b'lemma:chipseq'
7.482674 Supp b'lemma:pq'
7.101433 O b'lemma:1'
6.735610 Gtype b'lemma:wt'
6.373578 O b'lemma:with'
6.359731 O b'lemma:2'
6.272791 Med b'lemma:MOPS'
6.054250 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
5.897194 O b'lemma:b'
5.855428 Gtype b'hGreek'
5.849508 Supp b'lemma:acetate'
5.789494 Gtype b'lemma:type'
5.785160 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
5.774461 O b'+1:lemma:wt'
5.678098 OD b'lemma:0.3'
5.656833 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
5.629929 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
5.616452 Med b'lemma:LB'
5.581101 Supp b'-1:lemma:Cra'
5.572921 Supp b'-2:lemma:purr'
5.541236 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
5.532408 Supp b'-2:lemma:shake'
5.494424 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
5.379686 Supp b'lemma:nh4cl'
5.338727 O b'lemma:CEL'
5.298477 Supp b'lemma:Iron'
5.298477 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
5.246429 Air b'lemma:anaeroibc'
5.243482 O b'lemma:3'
5.213287 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
5.143816 O b'+2:lemma:crp'
5.138016 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
5.087688 O b'-1:lemma:lb'
5.075438 O b'lemma:argr'
5.035949 Supp b'lemma:2h'
5.035949 Supp b'-1:lemma:additional'
5.021894 O b'-1:postag:NNS'
5.020313 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.893866 Technique b'-1:lemma:input'
4.820059 Phase b'+2:lemma:o.d.'
4.809605 O b'lemma:_'
4.775665 O b'lemma:purr'
4.765188 Supp b'lemma:arginine'
4.756520 O b'-2:lemma:overnight'
4.749778 Med b'+2:lemma:b2'
4.743559 Supp b'lemma:iptg'
4.703930 O b'lemma:rpob'
4.530733 O b'lemma:lrp'
4.528785 O b'-1:lemma:type'
4.512427 O b'postag:VBG'
4.494959 Technique b'+2:lemma:ph5'
4.485508 O b'lemma:Cra'
4.461058 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
4.441090 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
4.437428 Gtype b'lemma:dfnr'
4.395181 Gtype b'-2:lemma:delta'
4.386215 O b'-2:lemma:minute'
4.379842 Air b'lemma:aerobic'
4.364145 Substrain b'-2:lemma:substr'
4.359307 Gtype b'-2:lemma:genotype'
4.354521 O b'lemma:trpr'
4.338128 Supp b'lemma:glucose'
4.330613 Supp b'-2:lemma:argr'
4.312400 O b'lemma:a'
4.218015 Phase b'lemma:stationary'
4.218015 Phase b'lemma:exponential'
4.217717 O b'+1:lemma:250'
4.162153 Temp b'-2:lemma:keep'
4.148342 O b'lemma:genotype/variation'
4.079357 Supp b'+2:lemma:iptg'
4.073084 Med b'+2:lemma:b1'
4.025052 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
4.013040 Supp b'+1:lemma:1'
4.011186 O b'-1:lemma:trpr'
3.989559 Strain b'lemma:k-12'
3.958319 O b'-2:lemma:='
3.946423 O b'+1:lemma:od600'
3.939116 Supp b'-1:lemma:ompr'
3.931869 OD b'lemma:od450'
3.913234 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.907613 O b'lemma:culture'
3.906861 O b'-1:lemma:medium'
3.896962 Phase b'postag:NN'
3.878066 Gtype b'-1:lemma:rpob'
3.859950 pH b'lemma:5.5'
3.855256 Gtype b'+1:lemma:type'
3.832320 Gtype b'+1:lemma:small'
3.797449 Air b'-1:lemma:-'
3.770291 OD b'-2:lemma:od450'
3.757525 Gtype b'lemma:pk4854'
3.746646 O b'-1:lemma:0.3'
3.712203 Technique b'lemma:rna-seq'
3.669666 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
3.657537 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.637638 O b'-1:lemma:tag'
3.620369 O b'-2:lemma:medium'
3.616750 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
3.612594 O b'lemma:.'
3.612594 O b'postag:.'
3.590979 O b'lemma:ompr'
3.587362 Supp b'lemma:Leu'
3.587362 Supp b'-2:lemma:Lrp'
3.585155 Air b'-2:lemma:0.3'
3.551623 Supp b'-2:lemma:agent'
3.550433 Technique b'lemma:rnaseq'
3.533031 O b'+1:lemma:20'
3.521812 Supp b'lemma:Fe'
3.510958 Supp b'-1:lemma:+'
3.466874 O b'lemma:harbor'
3.465667 Supp b'lemma:nacl'
3.455383 O b'lemma:soxr'
3.455383 O b'lemma:soxs'
3.450208 O b'-1:lemma:pq'
3.443385 Substrain b'lemma:mg1655'
3.443270 O b'-1:lemma:min'
3.439413 O b'lemma:ml'
3.432419 O b'-1:lemma:anaerobic'
3.396802 Temp b'-1:lemma:sample'
3.395723 O b'lemma:gadx'
3.372206 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
3.368492 Supp b'+1:lemma:2'
3.356254 O b'-1:lemma:genotype/variation'
3.337149 O b'-1:lemma:glucose'
3.336088 pH b'lemma:ph5'
3.336088 pH b'+1:lemma:.5'
3.335021 O b'lemma:\xcf\x8332'
3.318449 Temp b'-1:lemma:43'
3.314961 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
3.311549 Supp b'lemma:Adenine'
3.303030 Med b'-2:lemma:medium'
3.297448 O b'postag:VBD'
3.287276 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
3.260912 Air b'-2:lemma:IP'
3.247314 O b'-2:lemma:fructose'
3.241090 O b'lemma:for'
3.236052 Anti b'+1:lemma:antibody'
3.221936 Gversion b'lemma:asm584v2'
3.200143 Air b'-2:lemma:nh4cl'
3.198103 Gtype b'lemma:arca8myc'
3.198103 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
3.195389 O b'lemma:oxyr'
3.190013 Med b'lemma:m63'
3.161464 Supp b'lemma:30'
3.156995 Air b'postag:RB'
3.156124 Gtype b'lemma:ptac'
3.121267 O b'lemma:chip'
3.120510 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
3.079489 O b'+1:lemma:0.2'
3.061184 Substrain b'lemma:mg1655star'
3.041110 O b'-1:lemma:nacl'
3.040626 Gversion b'-2:lemma:build'
3.027212 Supp b'lemma:fructose'
3.005553 O b'lemma:rep2'
3.005553 O b'lemma:rep1'
2.999899 Med b'lemma:media'
2.996667 O b'lemma:treatment'
2.974874 Phase b'lemma:mid-log'
2.956019 Supp b'-2:lemma:media'
2.950963 O b'lemma:cra'
2.945539 O b'-1:lemma:into'
2.945313 O b'lemma:affyexp'
2.944443 Temp b'lemma:43'
2.941475 O b'lemma:or'
2.919679 O b'postag::'
2.917000 Med b'+2:postag:CC'
2.913870 O b'+1:lemma:rifampicin'
2.905070 O b'-1:lemma:acetate'
2.887645 OD b'lemma:0.35'
2.886111 Supp b'+2:lemma:feso4'
2.877150 Supp b'-2:lemma:trpr'
2.876473 Med b'lemma:lb'
2.865165 O b'-2:lemma:reach'
2.861702 Gversion b'lemma:.2'
2.861702 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.842799 Air b'lemma:aerobically'
2.829984 O b'lemma:='
2.828290 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.805000 Supp b'+2:lemma:nh4cl'
2.795477 O b'+1:lemma:minute'
2.778275 O b'lemma:growth'
2.766634 O b'-1:lemma:fructose'
2.744323 O b'lemma:at'
2.743672 Gtype b'lemma:deltaseqa'
2.743672 Gtype b'-1:lemma:old'
2.743672 Gtype b'-2:lemma:seqa'
2.731865 Temp b'lemma:37'
2.730687 Supp b'+1:lemma:_'
2.726274 O b'lemma:chip-arca'
2.726274 O b'+2:lemma:arca8myc'
2.723460 Strain b'-2:lemma:strain'
2.722993 O b'+2:lemma:constant'
2.716590 Supp b'-1:lemma:30'
2.714631 Supp b'-1:lemma:wt'
2.699694 O b'-1:lemma:genotype'
2.683193 pH b'+1:postag:CD'
2.674883 Med b'+1:lemma:g/l'
2.670584 O b'+2:postag:VB'
2.668686 Supp b'-2:lemma:condition'
2.642059 Air b'postag:JJ'
2.625750 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4ompr'
2.625672 Supp b'lemma:leucine'
2.623371 O b'lemma:chip-fnr'
2.623371 O b'+2:lemma:fnr8myc'
2.623088 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.616850 O b'-2:lemma:flagtag'
2.615473 O b'-1:lemma:-80'
2.582798 O b'-1:lemma:wt'
2.571988 O b'lemma:Nac'
2.564618 Agit b'lemma:rpm'
2.557530 Air b'+1:lemma:b'
2.555291 Gtype b'lemma:fnr8myc'
2.555291 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
2.550171 Agit b'-1:lemma:250'
2.544042 O b'+1:lemma:coli'
2.537417 Med b'-2:lemma:fresh'
2.521762 O b'+2:lemma:4'
2.521549 O b'-1:lemma:leucine'
2.520957 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.516024 Gtype b'-1:lemma:wild'
2.510129 Air b'+2:lemma:250'
2.508465 Med b'-1:lemma:fresh'
2.500283 Med b'+1:lemma:+'
2.488845 Anti b'-1:lemma:myc'
2.488845 Anti b'-2:lemma:9e10'
2.481436 O b'-2:lemma:myc'
2.480625 Air b'-2:lemma:mid-log'
2.463220 Air b'-1:lemma:phase'
2.461072 O b'-1:lemma:genbank'
2.453007 Anti b'-1:lemma:fnr'
2.447622 Gtype b'lemma:crp'
2.430563 Vess b'lemma:flask'
2.430563 Vess b'-1:lemma:warm'
2.430563 Vess b'-2:lemma:pre'
2.430563 Vess b'+2:lemma:43'
2.426542 Technique b'+1:lemma:gadx'
2.420684 Temp b'-1:lemma:37'
2.417529 Anti b'-2:lemma:purify'
2.413239 O b'+2:lemma:allow'
2.383677 pH b'+1:lemma:5.5'
2.382376 O b'+1:lemma:mid-log'
2.382341 Technique b'-2:postag:NNP'
2.375134 Air b'-2:lemma:cm20'
2.373076 O b'lemma:ntrc'
2.373076 O b'lemma:csir'
2.364889 O b'-1:lemma:antibody'
2.361264 O b'-1:lemma:4'
2.354314 Supp b'+1:lemma:Deficient'
2.319041 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
2.318622 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.317787 Med b'-1:lemma:w2'
2.300058 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
2.298775 Supp b'-1:lemma:with'
2.296237 Supp b'+2:lemma:A'
2.295829 O b'postag:DT'
2.290960 O b'lemma:additional'
2.290960 O b'+1:lemma:2h'
2.276648 Anti b'-2:lemma:polymerase'
2.257379 Strain b'+1:lemma:substr'
2.257379 Strain b'-2:lemma:str'
2.249445 Med b'-2:lemma:treatment'
2.244978 Supp b'+1:lemma:iptg'
2.229631 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.229631 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.226165 pH b'lemma:.5'
2.226165 pH b'-1:lemma:ph5'
2.216210 O b'lemma:pt7'
2.206178 O b'-1:lemma:aerobic'
2.196029 Gtype b'+1:lemma:control'
2.194497 Technique b'-2:lemma:Nac'
2.169476 Gtype b'lemma:WT'
2.165369 Gversion b'lemma:000913'
2.165369 Gversion b'-2:lemma:nc'
2.165000 Supp b'-2:lemma:for'
2.157172 Med b'+1:lemma:2.0'
2.148154 O b'+2:lemma:wt'
2.133943 O b'-2:lemma:min'
2.126785 Med b'-1:lemma:ml'
2.119784 O b'-1:lemma:l1'
2.118207 O b'+1:lemma:sparging'
2.117298 O b'+1:postag:VBZ'
2.114969 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
2.105837 Supp b'lemma:tryptophan'
2.105837 Supp b'-1:lemma:mg/l'
2.103537 Gtype b'-1:lemma:factor'
2.103537 Gtype b'-2:lemma:transcription'
2.089975 Technique b'-1:lemma:_'
2.082390 Phase b'-2:lemma:until'
2.081783 Med b'+2:lemma:+'
2.077341 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.076552 O b'-2:lemma:Leu'
2.069544 Gtype b'-1:postag:VBP'
2.068940 O b'postag:VBN'
2.057344 O b'postag:IN'
2.055922 Med b'+1:lemma:0.4'
2.053276 O b'-2:lemma:growth'
2.051343 O b'-1:lemma:w0002'
2.050701 Gversion b'-2:postag:VB'
2.048515 Gtype b'lemma:wild-type'
2.047733 Air b'-2:lemma:fnr'
2.035523 Supp b'-1:lemma:potassium'
2.035523 Supp b'-2:lemma:mmol'
2.028698 Supp b'lemma:glutamine'
2.028698 Supp b'-1:lemma:2g/l'
2.021916 O b'lemma:genotype'
2.020341 O b'lemma::'
2.019510 Technique b'-2:lemma:wt'
2.019366 Gtype b'+1:lemma:fur'
2.014157 Technique b'lemma:chip-exo'
2.013624 O b'+2:lemma:_'
2.010550 Gtype b'-1:lemma:vector'
2.007239 Anti b'hGreek'
2.006763 O b'lemma:A'
2.005148 Gtype b'+1:lemma:the'
2.002393 Gversion b'lemma:u00096'
2.002393 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.993868 O b'-1:lemma:dpd'
1.984277 Supp b'+1:lemma:m'
1.978512 Med b'-1:lemma:LB'
1.978512 Med b'+2:lemma:1mm'
1.975331 O b'+2:lemma:TEX'
1.962246 O b'+1:lemma:b1'
1.960470 O b'postag:SYM'
1.941970 Med b'lemma:glucose'
1.936049 Gversion b'postag:NN'
1.931617 Gtype b'-2:lemma:dna'
1.929386 Gtype b'+1:lemma:ryhb'
1.922890 Technique b'-2:lemma:Fe'
1.920648 Gtype b'+2:lemma:tag'
1.902449 O b'-2:lemma:ml'
1.896346 O b'-2:lemma:co2'
1.893754 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.890786 Med b'-1:lemma:in'
1.871488 O b'+1:lemma:anerobically'
1.871488 O b'-2:lemma:600nm'
1.868963 Supp b'-2:lemma:Fe'
1.867667 O b'+1:postag:NNP'
1.859817 O b'-1:lemma:rpm'
1.856884 Supp b'-2:lemma::'
1.851111 O b'lemma:supplement'
1.847370 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.847226 Technique b'lemma:chip-seq'
1.846745 O b'+1:postag:RB'
1.839923 O b'lemma:s'
1.839923 O b'-2:lemma:parameter'
1.834001 Gtype b'lemma:nsrr'
1.834001 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.831068 Technique b'hUpper'
1.828269 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.827970 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.822916 O b'lemma:\xce\xbcl'
1.817164 O b'lemma:~'
1.816021 Substrain b'+2:lemma::'
1.799710 Supp b'lemma:0.1'
1.795639 Supp b'-2:postag:VBG'
1.780911 Med b'+1:lemma:minimal'
1.774437 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.773800 O b'-2:lemma:sample'
1.772941 O b'-1:lemma:mg1655'
1.766382 O b'lemma:old'
1.766382 O b'-1:lemma:seqa'
1.766382 O b'+1:lemma:deltaseqa'
1.766380 OD b'lemma:0.3-0.35'
1.760896 Air b'-1:lemma:ryhb'
1.759713 O b'lemma:fresh'
1.759390 O b'+1:lemma:30'
1.756816 Phase b'-1:lemma:until'
1.751162 Supp b'+2:lemma:leucine'
1.747122 O b'lemma:be'
1.732292 O b'+1:lemma:read'
1.726720 Gtype b'lemma:wild'
1.714523 Supp b'lemma:Trp'
1.711035 O b'-1:lemma:Aerobic'
1.710075 Supp b'lemma:rifampicin'
1.692598 O b'-1:lemma:5.5'
1.692180 Technique b'-1:lemma:IP'
1.680549 Air b'-2:lemma:condition'
1.675770 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.654790 O b'-2:lemma:~'
1.636400 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.622805 Gtype b'+1:postag::'
1.618145 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.617123 Vess b'+1:lemma:at'
1.612847 Supp b'-2:lemma:induce'
1.612008 Air b'lemma:Anaerobic'
1.609492 OD b'+2:lemma:0.3-0.35'
1.607570 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.594416 O b'-1:lemma:.5'
1.594416 O b'-2:lemma:ph5'
1.584712 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
1.584712 Anti b'+2:lemma:NeoClone'
1.583948 Supp b'-1:lemma:without'
1.578958 O b'symb'
1.574148 Med b'lemma:medium'
1.571945 Gtype b'+1:lemma:with'
1.571781 O b'-2:lemma:neg'
1.566918 O b'+2:lemma:of'
1.558178 O b'+1:lemma:nh4cl'
1.557772 O b'lemma:input'
1.557772 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.554781 O b'lemma:rnase'
1.547934 Anti b'-2:lemma:\xc3\x9f'
1.544737 O b'+1:lemma:43'
1.542147 Air b'+2:lemma:%'
1.539882 O b'-1:lemma:treatment'
1.537854 Substrain b'-1:lemma:.'
1.537854 Substrain b'-1:postag:.'
1.534722 O b'+2:lemma:k-12'
1.527976 Gtype b'-2:postag::'
1.527120 Supp b'-1:postag:SYM'
1.526410 O b'-1:lemma:induce'
1.523913 O b'+2:lemma:ml'
1.523419 Air b'-2:lemma:%'
1.520813 Air b'-2:postag:SYM'
1.520304 Supp b'lemma:0.2'
1.518860 Anti b'+1:lemma:from'
1.517164 O b'-1:lemma:genome'
1.516943 O b'+2:lemma:m63'
1.515296 Anti b'lemma:mab'
1.515296 Anti b'-1:lemma:anti-flag'
1.505749 O b'+1:lemma:dfnr'
1.498211 O b'lemma:-80'
1.498211 O b'-2:lemma:freeze'
1.492855 Air b'-2:postag:CD'
1.490557 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.489213 O b'-1:lemma:0.35'
1.487210 O b'lemma:Fur'
1.481373 Supp b'lemma:2g/l'
1.481373 Supp b'+1:lemma:glutamine'
1.477094 O b'lemma:-lrb-'
1.473500 Air b'-1:lemma:co2'
1.472990 O b'-1:lemma:.2'
1.472990 O b'-2:lemma:u00096'
1.466871 Med b'+2:lemma:0.2'
1.466052 O b'lemma:Lrp'
1.466052 O b'+2:lemma:Leu'
1.465761 Agit b'lemma:250'
1.464592 OD b'-1:lemma:about'
1.460356 O b'+2:lemma:w/v'
1.450723 O b'lemma:-rrb-'
1.448539 OD b'+1:postag:IN'
1.445935 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
1.444953 O b'+1:lemma:rnaseq'
1.442198 Supp b'+1:lemma:mm'
1.441697 Agit b'-2:postag:RB'
1.441038 O b'-1:postag:RB'
1.434595 Gtype b'lemma:ryhb'
1.433050 O b'+1:lemma:o.d.'
1.433050 O b'+2:lemma:600nm'
1.432395 O b'-1:lemma:arginine'
1.423356 O b'+2:postag:JJ'
1.422061 Gtype b'-2:lemma:Fur'
1.421731 Med b'postag:NNP'
1.418281 OD b'lemma:od600'
1.413402 Substrain b'+2:postag::'
1.412216 pH b'-1:lemma:at'
1.408248 Supp b'+1:lemma:hour'
1.404353 O b'-2:lemma:source'
1.396837 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.396837 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.396837 Supp b'+2:lemma:potassium'
1.386576 Technique b'-2:lemma:rifampicin'
1.383245 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.375985 O b'+2:lemma:dilute'
1.371727 Gtype b'lemma:delta-fnr'
1.371076 Air b'+1:lemma:%'
1.370071 Air b'+2:lemma:37'
1.365606 Med b'-1:lemma:minimal'
1.365117 O b'-1:lemma:Iron'
1.361058 O b'-2:lemma:final'
1.357196 O b'-1:lemma:condition'
1.356488 Supp b'-1:lemma:soxr'
1.356488 Supp b'-1:lemma:soxs'
1.354128 pH b'-2:lemma:at'
1.348572 Gtype b'-1:lemma:from'
1.344348 Air b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
1.341605 O b'lemma:k-12'
1.339809 Gtype b'hUpper'
1.337847 Gtype b'+1:lemma:_'
1.336624 Anti b'-1:lemma:polyclonal'
1.333416 O b'+1:lemma::'
1.332525 Supp b'-2:lemma:source'
1.330277 Air b'lemma:%'
1.326676 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.326612 Agit b'+2:lemma:at'
1.319829 Gversion b'lemma:nc'
1.319829 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.319718 Supp b'+2:lemma:add'
1.318079 Gtype b'+2:lemma:rep2'
1.318079 Gtype b'+2:lemma:rep1'
1.311458 Gtype b'postag:JJ'
1.304839 Anti b'-2:lemma:ihf'
1.300275 Gtype b'-1:lemma:pk4854'
1.289458 O b'-2:lemma:37'
1.288120 O b'-1:lemma:argr'
Top negative:
0.000006 Air b'+1:lemma:culture'
0.000005 Med b'postag:-RRB-'
0.000001 Substrain b'-2:postag:NN'
0.000000 Supp b'lemma:mg/l'
0.000000 Supp b'+1:lemma:tryptophan'
-0.000007 O b'+1:lemma:culture'
-0.000014 Gtype b'lemma:_'
-0.000025 O b'+2:lemma:g/l'
-0.000026 Temp b'+2:lemma:.'
-0.000026 Temp b'+2:postag:.'
-0.000057 O b'-2:lemma:2'
-0.000071 O b'-1:lemma:cra'
-0.000159 Med b'-2:postag:CC'
-0.000175 Supp b'postag::'
-0.000239 O b'+1:lemma:-'
-0.000279 O b'+1:lemma:deletion'
-0.000279 O b'+2:lemma:mutant'
-0.000299 Temp b'+2:postag:IN'
-0.000346 O b'+1:lemma:or'
-0.000422 Med b'+2:postag:JJ'
-0.000462 Anti b'-1:postag:NN'
-0.000514 Supp b'lemma:um'
-0.000514 Supp b'+2:lemma:paraquat'
-0.000522 O b'-1:lemma:g/l'
-0.000580 O b'lemma:anaerobic'
-0.000836 O b'+2:lemma:m9'
-0.001161 O b'-1:lemma:in'
-0.001225 Supp b'postag:CD'
-0.001360 Supp b'+1:lemma:final'
-0.001662 Gtype b'-2:lemma:-lrb-'
-0.001696 O b'+2:lemma:use'
-0.001797 O b'-2:lemma:glucose'
-0.001895 Supp b'+2:lemma:final'
-0.001968 O b'+1:lemma:um'
-0.002364 Supp b'-2:postag:DT'
-0.002368 O b'-2:lemma:5'
-0.002730 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.002814 O b'-1:lemma:1'
-0.002865 Gtype b'lemma:-lrb-'
-0.002970 Air b'-1:postag:CC'
-0.002975 O b'-2:lemma:into'
-0.003080 O b'+1:lemma:phase'
-0.003255 O b'+2:lemma:nacl'
-0.003321 O b'+1:lemma:5'
-0.003417 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.003966 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.004012 Gtype b'-2:lemma:,'
-0.004012 Gtype b'-2:postag:,'
-0.004780 Supp b'-1:postag:DT'
-0.006283 O b'-1:lemma:-'
-0.006327 O b'+1:lemma:95'
-0.006401 O b'+2:lemma:25'
-0.006617 Air b'-2:postag:-LRB-'
-0.007717 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.007862 O b'+1:lemma:25'
-0.007991 O b'+1:lemma:the'
-0.009506 Supp b'-1:lemma:.'
-0.009506 Supp b'-1:postag:.'
-0.009672 O b'+2:postag:-LRB-'
-0.010158 Phase b'+2:postag:CD'
-0.010338 Supp b'+1:postag:SYM'
-0.010507 O b'-1:lemma:25'
-0.011202 O b'lemma:70'
-0.011576 O b'+2:lemma:o2'
-0.011709 Gtype b'+2:lemma:-rrb-'
-0.011854 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.013308 O b'-1:lemma:~'
-0.014136 O b'-2:lemma:paraquat'
-0.014880 O b'hUpper'
-0.015136 O b'-2:lemma:nacl'
-0.015333 O b'+2:lemma:70'
-0.015980 O b'+1:lemma:co2'
-0.016161 Gversion b'symb'
-0.016530 O b'-1:lemma:70'
-0.018904 OD b'+2:lemma:for'
-0.018925 Supp b'lemma:ph'
-0.019010 O b'-2:lemma:70'
-0.019385 Gtype b'postag::'
-0.019979 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.020005 O b'-2:lemma:m9'
-0.020307 Supp b'postag:VBN'
-0.020528 O b'+1:lemma:o2'
-0.020665 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.023128 O b'lemma:n2'
-0.025201 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.027186 O b'-1:lemma:n2'
-0.027845 O b'+2:lemma:before'
-0.028223 O b'+1:lemma:1/100'
-0.028223 O b'-2:lemma:sodium'
-0.028223 O b'+2:lemma:vol'
-0.028234 Air b'-1:postag:VBN'
-0.028271 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.028857 O b'+1:lemma:arginine'
-0.029472 Vess b'hLower'
-0.029685 O b'-1:lemma:at'
-0.029971 O b'lemma:min'
-0.030216 O b'lemma:paraquat'
-0.030216 O b'-2:lemma:um'
-0.030591 O b'+1:lemma:min'
-0.030687 Air b'+2:lemma:,'
-0.030687 Air b'+2:postag:,'
-0.030850 Technique b'+2:postag:CD'
-0.031254 Supp b'+2:lemma:mm'
-0.031853 O b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.032061 O b'+2:lemma:30'
-0.034168 O b'-2:lemma:cell'
-0.034185 O b'+1:postag:VB'
-0.034214 O b'+2:lemma:at'
-0.034241 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.035149 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.035177 O b'+1:lemma:='
-0.037794 Agit b'hLower'
-0.038097 O b'+1:postag:NNS'
-0.038695 Supp b'-1:lemma:250'
-0.039231 Supp b'postag:IN'
-0.040349 O b'lemma:m'
-0.041204 Supp b'+2:lemma:agitation'
-0.041672 Gtype b'+2:lemma:1'
-0.042199 OD b'lemma:='
-0.043137 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.046149 O b'+2:lemma:n2'
-0.048043 O b'+1:lemma:sample'
-0.048359 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.049371 O b'-1:lemma:for'
-0.051179 O b'+1:lemma:medium'
-0.051979 O b'+2:lemma:sample'
-0.052353 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.053578 O b'lemma:;'
-0.053578 O b'-1:lemma:7.6'
-0.053777 O b'lemma:mg/ml'
-0.053777 O b'-1:lemma:150'
-0.053876 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.056098 Air b'postag:CD'
-0.056638 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.059193 Gtype b'postag:NN'
-0.059607 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.060356 Air b'+1:postag:NN'
-0.060910 O b'-2:lemma:;'
-0.061040 O b'+2:lemma:medium'
-0.062762 Supp b'lemma:and'
-0.064210 pH b'hUpper'
-0.064343 O b'+2:lemma:then'
-0.064705 O b'+2:lemma:until'
-0.065457 Air b'+1:postag:NNS'
-0.065466 O b'+1:lemma:mm'
-0.067199 O b'+2:lemma:10'
-0.067231 O b'+1:lemma:70'
-0.067344 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.067344 Gtype b'-1:postag:,'
-0.068255 O b'-2:lemma:phase'
-0.069526 Gtype b'postag:CD'
-0.071358 O b'-1:lemma:um'
-0.071358 O b'+1:lemma:paraquat'
-0.071410 O b'-2:lemma:20'
-0.071427 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.071437 O b'+1:lemma:%'
-0.072066 O b'-1:lemma:control'
-0.073091 O b'lemma:m9'
-0.073505 O b'+1:lemma:300'
-0.074965 Med b'+1:lemma:and'
-0.077565 O b'+1:lemma:ph'
-0.078252 O b'+1:lemma:pahse'
-0.078612 Supp b'lemma:,'
-0.078612 Supp b'postag:,'
-0.079628 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.079945 O b'-2:lemma:10'
-0.081141 O b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.082849 O b'+2:lemma:0.4'
-0.086182 O b'-2:lemma:25'
-0.086307 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.087010 Temp b'+2:lemma:with'
-0.088208 Supp b'-1:lemma:Fe'
-0.089415 Supp b'lemma:.'
-0.089415 Supp b'postag:.'
-0.089562 Air b'postag:NNP'
-0.089819 Temp b'+1:postag:IN'
-0.090099 pH b'postag:NN'
-0.090746 O b'-2:lemma:0.2'
-0.092979 O b'+1:lemma:glucose'
-0.094420 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.100222 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.100829 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.102026 Temp b'-1:postag:IN'
-0.102166 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.103117 Med b'+1:postag:IN'
-0.103172 O b'-1:postag:VB'
-0.103804 O b'+2:postag:RB'
-0.103927 Med b'hLower'
-0.104536 Phase b'-2:postag:NN'
-0.106406 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.106476 O b'lemma:phosphate'
-0.109069 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.110859 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.110954 O b'lemma:o2'
-0.111488 O b'-1:postag:IN'
-0.111678 Supp b'-2:lemma:glucose'
-0.112846 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.113526 Med b'+2:lemma:supplement'
-0.119285 Gtype b'symb'
-0.119504 OD b'postag:JJ'
-0.121182 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.122030 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.124261 O b'lemma:hour'
-0.124625 Phase b'+1:lemma:aerobically'
-0.127945 O b'+1:lemma:media'
-0.128156 Supp b'+1:postag:JJ'
-0.128875 Supp b'+2:postag:NN'
-0.129052 Gtype b'-2:lemma:and'
-0.131355 Phase b'+1:postag:RB'
-0.133008 Med b'-1:postag:IN'
-0.134023 Supp b'+1:postag:NNP'
-0.136498 Phase b'+2:postag:IN'
-0.136567 O b'lemma:sample'
-0.139127 O b'+1:lemma:a'
-0.140037 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.143710 O b'-2:lemma:m'
-0.144650 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.145119 O b'-2:postag:DT'
-0.146595 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.150297 Phase b'+2:lemma:at'
-0.151384 Med b'lemma:-lrb-'
-0.153347 O b'-1:lemma:o2'
-0.153445 Supp b'lemma:-rrb-'
-0.153599 O b'-1:lemma:final'
-0.154622 Supp b'-1:lemma:in'
-0.155038 O b'+2:lemma:total'
-0.155165 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.155385 O b'+1:lemma:genome'
-0.159092 O b'-2:lemma:chip-exo'
-0.160534 O b'-1:lemma:gadx'
-0.162262 O b'+2:lemma:the'
-0.163975 O b'-1:lemma:m9'
-0.164781 O b'-2:lemma:g/l'
-0.164927 O b'-2:lemma:for'
-0.165915 O b'+2:lemma:dna'
-0.168187 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.169817 Supp b'lemma:1'
-0.170677 O b'-2:lemma:grow'
-0.172785 Temp b'postag:NN'
-0.176316 O b'-2:lemma:minimal'
-0.179375 O b'-1:postag:DT'
-0.179496 O b'lemma:dpd'
-0.183649 O b'lemma:ph'
-0.185017 O b'-2:lemma:stir'
-0.185520 O b'lemma:150'
-0.185520 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.185520 O b'-2:lemma:concentration'
-0.186014 O b'-1:lemma:sodium'
-0.186014 O b'+2:lemma:1/100'
-0.188802 Med b'postag:-LRB-'
-0.189063 O b'-1:lemma:mm'
-0.190193 Supp b'postag:-RRB-'
-0.190280 Temp b'+1:lemma:with'
-0.190393 O b'+2:lemma:fnr'
-0.191797 O b'+1:lemma:~'
-0.194428 O b'+2:lemma:od600'
-0.194443 O b'+1:lemma:2.0'
-0.196005 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.197547 O b'-2:lemma:n2'
-0.197797 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.197869 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.198685 Med b'+1:postag:NN'
-0.206658 O b'+2:lemma:follow'
-0.209022 O b'+1:lemma:contain'
-0.212240 O b'-2:lemma:of'
-0.213409 Supp b'+2:lemma:,'
-0.213409 Supp b'+2:postag:,'
-0.214391 Supp b'-1:postag:VBG'
-0.216886 O b'lemma:co2'
-0.216903 Supp b'postag:-LRB-'
-0.220680 O b'lemma:7.6'
-0.220680 O b'+1:lemma:;'
-0.221677 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.222559 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.222995 O b'+2:lemma:.'
-0.222995 O b'+2:postag:.'
-0.223323 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.225021 O b'+2:lemma:rnase'
-0.225344 O b'+2:lemma:ph'
-0.232103 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.233774 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.236930 OD b'hUpper'
-0.238818 Air b'+2:postag:IN'
-0.242288 Gtype b'-2:postag:CC'
-0.244677 Technique b'-2:postag:NN'
-0.247654 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.248504 O b'lemma:methanol'
-0.248504 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.249929 O b'+1:lemma:until'
-0.251993 O b'lemma:m63'
-0.252623 O b'+2:lemma:genome'
-0.253977 O b'-2:lemma:o2'
-0.256028 O b'-1:lemma:delta'
-0.256424 O b'+1:postag:DT'
-0.256531 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.256570 O b'+2:lemma:co2'
-0.261339 O b'-2:lemma:100'
-0.267638 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.270831 O b'lemma:1m'
-0.274159 Supp b'+1:lemma:with'
-0.277935 Temp b'-2:postag:NN'
-0.279903 O b'+2:lemma:0.2'
-0.279981 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.280841 Supp b'-2:lemma:a'
-0.281362 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.285584 OD b'+2:postag:NN'
-0.285872 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.285940 O b'-2:lemma:rpob'
-0.286884 O b'+2:lemma:pk4854'
-0.288452 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.288548 Air b'symb'
-0.291039 Phase b'-1:postag:NN'
-0.293457 Med b'+2:postag:VBG'
-0.294372 Supp b'postag:NNS'
-0.296603 O b'+1:lemma:of'
-0.298319 O b'+1:lemma:minimal'
-0.311104 O b'lemma:dissolve'
-0.311104 O b'+2:lemma:methanol'
-0.318035 O b'+1:lemma:supplement'
-0.318712 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.319959 O b'lemma:minimal'
-0.320925 O b'-2:lemma:50'
-0.324757 O b'hGreek'
-0.324853 O b'-1:lemma:minimal'
-0.327152 O b'+1:lemma:b'
-0.327380 O b'-1:lemma:od600'
-0.328071 O b'-1:lemma:of'
-0.331250 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.331250 O b'+1:lemma:methanol'
-0.335360 O b'-1:lemma:with'
-0.335725 O b'-1:lemma:contain'
-0.340847 O b'lemma:0.1'
-0.341020 O b'+1:lemma:g/l'
-0.341841 O b'lemma:250'
-0.345302 O b'lemma:0.2'
-0.345874 O b'-1:lemma:1m'
-0.345874 O b'+2:lemma:7.6'
-0.346203 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.368233 Supp b'+1:postag::'
-0.373223 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.376840 O b'-2:lemma:fnr'
-0.379547 Supp b'+2:lemma:with'
-0.380542 O b'-2:lemma:the'
-0.382770 O b'-1:lemma:vol'
-0.382770 O b'-2:lemma:1/100'
-0.382770 O b'+2:lemma:1m'
-0.391543 O b'lemma:acetate'
-0.394233 Supp b'-1:lemma:%'
-0.395082 Supp b'-2:lemma:and'
-0.397320 OD b'hLower'
-0.398040 O b'lemma:lb'
-0.400532 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.402014 O b'+2:lemma:~'
-0.402784 Technique b'-1:lemma::'
-0.406886 O b'-1:lemma:the'
-0.416933 O b'+2:lemma:0.3'
-0.420137 O b'+1:lemma:1m'
-0.420137 O b'-2:lemma:vol'
-0.425403 O b'-2:postag::'
-0.433678 O b'+1:lemma:hour'
-0.439762 O b'lemma:fecl2'
-0.439988 O b'lemma:of'
-0.442433 O b'-1:lemma:0.2'
-0.443764 O b'lemma:20'
-0.451435 O b'lemma:pahse'
-0.462487 O b'-2:lemma:1'
-0.469697 O b'+1:lemma:gadx'
-0.475429 Med b'-2:postag:VBN'
-0.476724 O b'+2:lemma:add'
-0.485946 O b'lemma:od600'
-0.492085 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.492437 Gtype b'postag:NNP'
-0.508539 Gtype b'postag:VBG'
-0.509446 O b'-1:lemma:rna'
-0.509753 O b'-2:lemma:genome'
-0.513800 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.523871 O b'+2:lemma:in'
-0.524865 O b'-1:lemma:ph'
-0.529735 O b'+2:lemma:reference'
-0.533755 O b'+2:lemma:250'
-0.533793 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.533793 Gtype b'+1:postag:,'
-0.535112 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.541137 Med b'+2:lemma:contain'
-0.543466 O b'+2:lemma:glucose'
-0.543621 Technique b'-1:postag::'
-0.551537 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.554281 O b'-2:lemma:media'
-0.555303 Supp b'+2:postag::'
-0.557156 O b'+1:lemma:m'
-0.565569 O b'+2:lemma:tag'
-0.568709 O b'lemma:glucose'
-0.568828 Supp b'hGreek'
-0.574151 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.587728 O b'-2:lemma:supplement'
-0.594148 O b'postag:RB'
-0.599597 pH b'symb'
-0.602642 O b'lemma:nitrate'
-0.609625 O b'-1:lemma:IP'
-0.610205 Supp b'postag:CC'
-0.614530 O b'+1:postag:IN'
-0.626239 Gversion b'hLower'
-0.628041 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.640296 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.647589 O b'-1:lemma:.'
-0.647589 O b'-1:postag:.'
-0.648526 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.662531 O b'lemma:fructose'
-0.667657 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.677766 Supp b'+2:lemma:and'
-0.682803 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.692459 O b'-1:lemma:until'
-0.713862 O b'-1:lemma:ml'
-0.721660 O b'-1:lemma:co2'
-0.728494 O b'-2:lemma:dna'
-0.728922 Supp b'lemma:2'
-0.731591 O b'-2:lemma:pahse'
-0.755452 O b'+2:lemma:media'
-0.757042 O b'lemma:37'
-0.762055 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.774059 O b'lemma:0.3'
-0.774624 O b'+1:lemma:in'
-0.789891 Temp b'hLower'
-0.791321 O b'lemma:medium'
-0.792008 Anti b'hUpper'
-0.806531 O b'-2:postag:SYM'
-0.811929 O b'+1:lemma:_'
-0.827172 Med b'postag:CD'
-0.842064 O b'+1:lemma:at'
-0.847857 O b'+2:lemma:antibody'
-0.851413 O b'-1:lemma:2'
-0.863341 O b'-1:lemma:30'
-0.867468 O b'+1:lemma:+'
-0.878836 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.891902 O b'lemma:mid-log'
-0.899644 Anti b'postag:NNP'
-0.901078 O b'-1:lemma:fresh'
-0.914240 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.939770 Supp b'+1:lemma:,'
-0.939770 Supp b'+1:postag:,'
-0.940340 O b'-1:postag::'
-0.951015 O b'-1:lemma:rpob'
-0.955671 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.959019 O b'-2:postag:VBG'
-0.969505 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.971246 Supp b'+2:postag:CC'
-0.971534 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.997772 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.998596 O b'+2:lemma:mid-log'
-1.025824 Supp b'+2:postag:CD'
-1.038316 O b'-2:lemma::'
-1.073332 O b'-2:lemma:rifampicin'
-1.073336 Air b'postag:NN'
-1.170235 O b'lemma:30'
-1.170425 O b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.173055 O b'lemma:nacl'
-1.206296 Substrain b'hLower'
-1.237167 O b'lemma:rifampicin'
-1.256546 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.303000 O b'-2:lemma:until'
-1.315566 O b'-2:lemma:fresh'
-1.318586 OD b'+1:postag:NN'
-1.397428 O b'lemma:media'
-1.416657 Med b'-2:lemma:grow'
-1.429992 Strain b'hLower'
-1.436161 O b'-2:lemma:IP'
-1.438388 Agit b'hUpper'
-1.438698 O b'-2:lemma:iptg'
-1.490446 Strain b'symb'
-1.513057 O b'+2:lemma:+'
-1.566762 O b'lemma:wt'
-1.572514 Med b'+2:postag:VBN'
-1.584740 Supp b'postag:JJ'
-1.595820 Vess b'hUpper'
-1.695311 Gtype b'-1:postag:CC'
-1.722183 Supp b'+2:postag:NNS'
-1.807323 O b'-1:lemma:sample'
-1.809960 O b'lemma:aerobic'
-1.906802 Supp b'-2:lemma:grow'
-1.969323 O b'lemma:nh4cl'
-1.990398 O b'-1:lemma:37'
-2.062129 O b'lemma:aerobically'
-2.139304 O b'-2:lemma:0.3'
-2.315053 Supp b'+2:lemma:2'
-2.317291 OD b'+2:postag:RB'
-2.381583 Gtype b'-2:postag:CD'
-2.613673 O b'+1:lemma:2'
-2.652379 O b'+2:lemma:b'
-2.761345 O b'+1:lemma:1'
-2.806883 O b'-2:lemma:dpd'
-2.928628 Phase b'postag:JJ'
-2.958894 Technique b'symb'
-2.960865 Supp b'+2:lemma:1'
-3.333038 O b'-1:lemma::'
-3.356826 O b'+2:lemma:rifampicin'
-3.490488 OD b'+2:lemma:aerobically'
-3.721930 Phase b'symb'
-3.954647 O b'+2:lemma:iptg'
-5.092497 Phase b'hUpper'
-5.150763 O b'-1:lemma:_'