report_Run5_v13.txt
37.3 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.17523174658487245, 'c2': 0.008606397422078239}
best CV score:0.830775030715119
model size: 0.08M
Flat F1: 0.8168626183610946
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.590 0.557 0.573 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.925 0.795 0.855 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.864 0.838 0.851 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.859 0.783 0.817 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.705345
Supp -> Supp 5.561850
Med -> Med 5.243379
OD -> OD 5.231769
Anti -> Anti 4.871683
Gtype -> Gtype 4.640123
Air -> Air 4.621504
O -> O 4.333286
Gversion -> Gversion 4.315539
Technique -> Technique 3.630754
Phase -> Phase 3.392298
pH -> pH 2.958701
Agit -> Agit 2.178434
Substrain -> Gtype 2.087403
Gtype -> Supp 1.474024
O -> Supp 1.185452
Air -> O 1.154315
O -> Technique 1.061678
Technique -> Air 0.779973
O -> Gtype 0.742890
Supp -> O 0.627331
Temp -> O 0.593630
Med -> O 0.448582
OD -> O 0.032580
O -> Gversion 0.028216
O -> Med 0.012224
Anti -> O 0.010172
O -> Phase 0.000112
Gtype -> pH 0.000016
Gtype -> Med -0.094063
OD -> Air -0.191976
Technique -> pH -0.381175
Supp -> Med -0.388917
Gtype -> O -0.481315
Phase -> OD -0.886017
O -> Air -1.094327
Med -> Supp -1.258902
Substrain -> O -1.283571
Technique -> Gtype -1.501836
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.705345
Supp -> Supp 5.561850
Med -> Med 5.243379
OD -> OD 5.231769
Anti -> Anti 4.871683
Gtype -> Gtype 4.640123
Air -> Air 4.621504
O -> O 4.333286
Gversion -> Gversion 4.315539
Technique -> Technique 3.630754
Phase -> Phase 3.392298
pH -> pH 2.958701
Agit -> Agit 2.178434
Substrain -> Gtype 2.087403
Gtype -> Supp 1.474024
O -> Supp 1.185452
Air -> O 1.154315
O -> Technique 1.061678
Technique -> Air 0.779973
O -> Gtype 0.742890
Supp -> O 0.627331
Temp -> O 0.593630
Med -> O 0.448582
OD -> O 0.032580
O -> Gversion 0.028216
O -> Med 0.012224
Anti -> O 0.010172
O -> Phase 0.000112
Gtype -> pH 0.000016
Gtype -> Med -0.094063
OD -> Air -0.191976
Technique -> pH -0.381175
Supp -> Med -0.388917
Gtype -> O -0.481315
Phase -> OD -0.886017
O -> Air -1.094327
Med -> Supp -1.258902
Substrain -> O -1.283571
Technique -> Gtype -1.501836
Top positive:
7.254518 Gtype b'lemma:type'
7.213876 Phase b'lemma:mid-log'
6.519889 O b'lemma:1'
6.474331 O b'-2:lemma:_'
6.356337 O b'lemma:_'
6.231604 Anti b'-2:lemma:antibody'
6.210042 O b'lemma:2'
6.084761 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
5.968004 Air b'lemma:anaerobic'
5.944455 Technique b'lemma:chipseq'
5.881024 O b'lemma:3'
5.446547 O b'postag:VBG'
5.407336 Supp b'lemma:no3'
5.327394 Phase b'-2:lemma:phase'
5.164128 O b'lemma:-'
5.002342 Technique b'+2:lemma:ph5'
5.000914 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
4.929495 Supp b'lemma:pq'
4.917897 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
4.894398 Gtype b'lemma:wt'
4.888156 Supp b'-2:lemma:shake'
4.817395 Strain b'lemma:k-12'
4.747360 Air b'lemma:aerobic'
4.663432 O b'lemma:b'
4.583025 Supp b'lemma:Iron'
4.583025 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
4.567059 Med b'lemma:MOPS'
4.549514 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
4.534861 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
4.418049 O b'postag:IN'
4.384026 Technique b'lemma:rna-seq'
4.285166 Med b'lemma:LB'
4.257381 Supp b'lemma:nh4cl'
4.225229 O b'lemma:Cra'
4.173925 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
4.147835 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
4.085928 Supp b'lemma:glucose'
3.928442 O b'lemma:rpob'
3.913543 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.901221 O b'lemma:with'
3.874023 Supp b'lemma:acetate'
3.865501 Technique b'lemma:chip-seq'
3.747544 O b'lemma:.'
3.747544 O b'postag:.'
3.744646 Supp b'lemma:2h'
3.744646 Supp b'-1:lemma:additional'
3.734601 O b'-2:lemma:myc'
3.718666 Gtype b'-2:lemma:genotype'
3.619321 Air b'lemma:aerobically'
3.591541 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
3.527419 Gtype b'+1:lemma:type'
3.493459 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
3.483085 Gtype b'lemma:pk4854'
3.433987 O b'-1:lemma:type'
3.423609 Gtype b'lemma:dfnr'
3.416312 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
3.414330 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.395328 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.390298 O b'+2:lemma:crp'
3.378883 Air b'-2:lemma:IP'
3.361331 Supp b'lemma:arginine'
3.353349 Technique b'lemma:chip-exo'
3.340593 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
3.311960 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
3.275648 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
3.274175 O b'-1:postag:NNS'
3.265429 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.250561 Temp b'-1:lemma:sample'
3.240952 O b'-2:lemma:flagtag'
3.220393 O b'postag:VBN'
3.170912 Substrain b'lemma:mg1655'
3.149599 O b'+1:lemma:wt'
3.144760 O b'lemma:rep2'
3.144760 O b'lemma:rep1'
3.140517 Supp b'lemma:nacl'
3.124319 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
3.106367 Supp b'lemma:iptg'
3.097812 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
3.089816 Med b'lemma:lb'
3.086471 O b'-1:lemma:tag'
3.079636 Gtype b'-2:lemma:delta'
3.067520 O b'postag::'
3.056516 Med b'+2:lemma:b2'
3.052389 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.973614 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.949791 Supp b'lemma:Adenine'
2.946707 Med b'lemma:media'
2.842244 O b'lemma:gadx'
2.799968 Temp b'-1:lemma:37'
2.778705 O b'+1:postag:RB'
2.752541 O b'lemma:a'
2.734242 O b'lemma:CEL'
2.723993 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.666986 O b'postag:CC'
2.645981 Med b'+2:lemma:b1'
2.641330 O b'lemma:\xcf\x8332'
2.639754 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.597882 Air b'-1:lemma:co2'
2.591508 Air b'-1:lemma:-'
2.555077 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.552568 Supp b'+1:lemma:1'
2.505991 pH b'lemma:ph5'
2.505991 pH b'+1:lemma:.5'
2.502878 O b'lemma:ompr'
2.469430 Agit b'lemma:rpm'
2.456120 Supp b'lemma:fructose'
2.454324 O b'-1:lemma:glucose'
2.451963 O b'-1:lemma:0.3'
2.451476 O b'postag:VBD'
2.448769 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.433957 O b'lemma:harbor'
2.423327 pH b'+1:postag:CD'
2.420014 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.417206 Gtype b'+1:lemma:ph5'
2.417206 Gtype b'+2:lemma:.5'
2.404388 Gversion b'lemma:.2'
2.404388 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.394564 Gtype b'lemma:ptac'
2.388946 O b'lemma:soxr'
2.388946 O b'lemma:soxs'
2.385468 O b'lemma:chip'
2.370998 Supp b'+1:lemma:2'
2.340385 O b'-2:lemma:medium'
2.322477 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.314945 Technique b'lemma:rnaseq'
2.314812 Temp b'lemma:37'
2.297806 Supp b'-1:lemma:with'
2.288584 Supp b'lemma:rifampicin'
2.279452 Supp b'lemma:Leu'
2.279452 Supp b'-2:lemma:Lrp'
2.274757 O b'lemma:for'
2.264072 O b'postag:DT'
2.260705 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.255527 Agit b'-1:lemma:250'
2.211148 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.211148 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.203918 O b'lemma::'
2.194125 Technique b'-2:lemma:Fur'
2.189181 Supp b'-2:lemma:purr'
2.188717 O b'-1:lemma:lb'
2.156269 O b'postag:NNS'
2.146834 Supp b'-1:lemma:+'
2.145196 O b'+1:lemma:od600'
2.100310 Air b'postag:RB'
2.098733 Med b'lemma:m63'
2.071094 Anti b'+1:lemma:antibody'
2.058034 Gtype b'+1:lemma:pq'
2.057298 O b'lemma:affyexp'
2.047678 Med b'-1:lemma:ml'
2.045906 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.034774 Med b'lemma:minimal'
2.031535 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.028277 O b'lemma:culture'
2.003812 Temp b'lemma:43'
1.992678 O b'-2:lemma:min'
1.985470 Air b'lemma:anaeroibc'
1.982422 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.980979 O b'+1:lemma:coli'
1.964202 Technique b'-1:lemma:IP'
1.959852 Supp b'+2:lemma:feso4'
1.959539 O b'+1:lemma:pq'
1.955638 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.946361 Vess b'lemma:flask'
1.946361 Vess b'-1:lemma:warm'
1.946361 Vess b'-2:lemma:pre'
1.946361 Vess b'+2:lemma:43'
1.944786 Technique b'-1:lemma:input'
1.940834 Air b'-2:lemma:fnr'
1.935346 Gversion b'lemma:u00096'
1.935346 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.934845 Med b'+2:postag:CC'
1.916720 O b'+1:lemma:250'
1.844381 OD b'lemma:0.3'
1.841526 Supp b'-2:lemma:media'
1.826756 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
1.823662 O b'lemma:ml'
1.821276 Temp b'-1:lemma:43'
1.814597 O b'+1:postag:NNP'
1.812329 O b'lemma:genotype/variation'
1.797090 Gtype b'+1:lemma:with'
1.794390 Supp b'lemma:dpd'
1.791738 Strain b'+1:lemma:substr'
1.791738 Strain b'-2:lemma:str'
1.790683 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.788603 O b'-1:lemma:min'
1.772047 Supp b'-2:lemma:induce'
1.760795 O b'lemma:purr'
1.720111 O b'lemma:argr'
1.716032 Med b'+1:lemma:0.4'
1.709726 Med b'+1:lemma:g/l'
1.709122 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.709122 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.686456 Phase b'-2:lemma:until'
1.677446 O b'-2:lemma:overnight'
1.677035 Gtype b'postag:JJ'
1.663768 OD b'-2:lemma:od450'
1.663307 O b'lemma:growth'
1.656708 Supp b'-1:lemma:_'
1.642998 O b'lemma:input'
1.642998 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.642203 OD b'lemma:od450'
1.638459 O b'lemma:oxyr'
1.637073 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.635561 Technique b'-2:lemma:wt'
1.627297 O b'+2:postag:JJ'
1.622501 Supp b'+1:lemma:_'
1.616928 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.589517 O b'+1:lemma:20'
1.587379 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.579611 O b'-1:lemma:wt'
1.579569 Gtype b'lemma:wild-type'
1.577849 O b'-1:lemma:l1'
1.551644 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.551644 Gtype b'-1:lemma:old'
1.551644 Gtype b'-2:lemma:seqa'
1.551263 O b'-2:lemma:='
1.532119 O b'lemma:fresh'
1.519761 Gversion b'-2:lemma:build'
1.514293 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.512296 Gtype b'+1:lemma:_'
1.507109 Gversion b'lemma:nc'
1.507109 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.495619 Gtype b'-2:postag:JJ'
1.487875 Supp b'-2:lemma:20'
1.476228 O b'+1:lemma::'
1.473826 O b'lemma:at'
1.463423 O b'lemma:trpr'
1.462013 Air b'postag:JJ'
1.461600 O b'lemma:cra'
1.454664 Supp b'lemma:Fe'
1.454626 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.446572 Phase b'lemma:stationary'
1.446572 Phase b'lemma:exponential'
1.439217 O b'lemma:-lrb-'
1.439035 O b'postag:-RRB-'
1.425672 Temp b'-2:lemma:keep'
1.416457 Gtype b'postag:-RRB-'
1.414874 O b'lemma:additional'
1.414874 O b'+1:lemma:2h'
1.413007 O b'-1:lemma:into'
1.380040 Phase b'+2:lemma:o.d.'
1.375592 Air b'-2:postag:CD'
1.374314 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.366837 pH b'lemma:.5'
1.366837 pH b'-1:lemma:ph5'
1.365170 OD b'+1:lemma:of'
1.349344 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.346963 OD b'lemma:od600'
1.335909 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.317198 Supp b'-1:lemma:final'
1.307155 Technique b'lemma:-lrb-'
1.305931 O b'lemma:A'
1.305815 Technique b'-1:lemma:_'
1.304470 Supp b'-2:lemma:agent'
1.293399 O b'-1:lemma:nacl'
1.293379 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.291878 Technique b'postag:-LRB-'
1.272696 Gversion b'lemma:000913'
1.272696 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.266795 Med b'+2:lemma:+'
1.261267 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.260516 O b'lemma:-rrb-'
1.255374 O b'+1:lemma:k-12'
1.254856 Supp b'-1:postag:CD'
1.253039 Med b'+1:lemma:minimal'
1.246535 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.243518 Med b'-1:lemma:minimal'
1.238028 Vess b'+1:lemma:at'
1.230588 pH b'lemma:5.5'
1.225610 Med b'lemma:medium'
1.223253 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.223253 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.223253 Supp b'+2:lemma:potassium'
1.221477 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.221477 Supp b'-2:lemma:mmol'
1.221079 Med b'+1:lemma:+'
1.220054 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
1.215394 Air b'-2:lemma:%'
1.214048 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.213055 O b'+2:lemma:of'
1.211669 Supp b'+2:lemma:add'
1.210314 Med b'-1:lemma:in'
1.190490 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.188874 Supp b'lemma:0.2'
1.187835 Gtype b'-2:postag::'
1.182855 Vess b'-1:postag:VBN'
1.182802 Supp b'-2:lemma:argr'
1.182727 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.182727 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.178024 Supp b'-2:postag:VBG'
1.169099 Supp b'-2:lemma:for'
1.167115 Med b'+1:lemma:2.0'
1.160922 O b'-1:lemma:mg1655'
1.160584 Agit b'+2:lemma:at'
1.158194 O b'lemma:rnase'
1.155437 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.153171 Supp b'-2:lemma:10'
1.153132 Supp b'lemma:glutamine'
1.153132 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.151942 O b'postag:-LRB-'
1.150888 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.144819 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.143488 O b'+1:lemma:ph5'
1.143488 O b'+2:lemma:.5'
1.133275 Gversion b'+1:postag:CD'
1.132069 OD b'+1:postag:IN'
1.123217 Gversion b'-2:postag:VB'
1.123111 OD b'-1:postag:IN'
1.122020 Gtype b'+2:postag::'
1.119971 Agit b'lemma:250'
1.116170 O b'lemma:old'
1.116170 O b'-1:lemma:seqa'
1.116170 O b'+1:lemma:deltaseqa'
1.110463 OD b'+2:lemma:0.3'
1.108381 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.108261 Air b'+2:lemma:%'
1.101849 Gtype b'-2:postag:NNS'
1.080992 Med b'-2:postag:JJ'
1.077777 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.077777 Gtype b'-2:lemma:transcription'
1.074777 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.074277 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.069834 Med b'postag:NNP'
1.068303 O b'postag:FW'
1.066529 O b'+1:lemma:acetate'
1.063365 pH b'+1:lemma:5.5'
1.056599 pH b'-1:lemma:ph'
1.047708 Supp b'-2:lemma:pahse'
1.044753 O b'-1:lemma:aerobic'
1.042326 O b'-2:lemma:fructose'
1.026969 O b'lemma:genotype'
1.026483 OD b'postag:CD'
1.026157 O b'+2:postag:VBD'
1.024451 Gtype b'+2:postag:NN'
1.023963 O b'lemma:to'
1.023963 O b'postag:TO'
1.012188 OD b'-1:lemma:od450'
1.011918 pH b'lemma:ph'
1.011708 Gtype b'lemma:phtpg'
1.006361 Substrain b'+2:lemma::'
1.002519 Phase b'lemma:phase'
0.997087 O b'-2:lemma:co2'
0.994950 Gtype b'+1:postag::'
0.992546 Gversion b'postag:CD'
0.992044 Gtype b'-2:postag:NN'
0.986159 Air b'-1:postag:CD'
0.974550 Supp b'-1:lemma:without'
0.973723 Air b'+1:lemma:%'
0.969025 Agit b'-2:postag:RB'
0.964597 O b'-1:lemma:dpd'
0.963299 O b'+1:postag:VBN'
0.958930 Anti b'-1:lemma:myc'
0.958930 Anti b'-2:lemma:9e10'
0.956431 Supp b'+1:lemma:mm'
0.952424 O b'+2:lemma:constant'
0.948846 Supp b'-1:lemma:ompr'
0.947402 OD b'lemma:of'
0.943135 Supp b'-1:lemma:vol'
0.943135 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.943135 Supp b'+2:lemma:1m'
0.932645 Substrain b'-1:lemma:.'
0.932645 Substrain b'-1:postag:.'
0.932487 pH b'-1:postag:NN'
0.931103 Med b'postag:NNS'
0.930794 Air b'lemma:%'
0.919784 O b'-1:lemma:pq'
0.917950 Supp b'-1:lemma:mm'
0.917138 O b'+1:lemma:sparging'
0.905430 pH b'-2:lemma:at'
0.905022 O b'-2:lemma:~'
0.903976 O b'+1:postag::'
0.894178 Air b'-2:lemma:mid-log'
0.891344 Air b'-1:lemma:phase'
0.890324 Supp b'-1:postag:IN'
0.887225 Technique b'-2:postag:NNP'
0.882013 Supp b'lemma:20'
0.879988 O b'+2:postag:NNP'
0.878093 O b'lemma:s'
0.878093 O b'-2:lemma:parameter'
0.875975 Air b'-1:lemma:_'
0.870106 O b'+2:lemma:wt'
0.868335 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
0.867092 O b'+2:lemma:allow'
0.867005 O b'lemma:Fur'
0.866387 O b'lemma:chip-arca'
0.866387 O b'+2:lemma:arca8myc'
0.862958 Anti b'postag:JJ'
0.862750 Med b'+1:lemma:medium'
0.862120 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.862120 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.859037 O b'lemma:4'
0.851384 O b'-2:lemma:in'
0.847891 Strain b'+2:lemma:.'
0.847891 Strain b'+2:postag:.'
0.839951 Gtype b'-1:postag:VBP'
0.838977 Gtype b'lemma:ryhb'
0.837171 OD b'+2:postag:CD'
0.836348 O b'-1:postag:NNP'
0.832547 pH b'-1:lemma:at'
0.832208 Supp b'+2:lemma:mid-log'
0.832136 OD b'-2:lemma:phase'
0.831919 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
0.826860 Supp b'lemma:of'
0.822498 Technique b'lemma:-rrb-'
0.820710 Gtype b'lemma:nsrr'
0.820710 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
0.816448 Supp b'+1:lemma:1m'
0.816448 Supp b'-2:lemma:vol'
0.814474 OD b'+2:lemma:~'
0.809727 O b'-1:lemma:nitrate'
0.809708 Gtype b'-2:lemma:the'
0.807317 Air b'-2:lemma:0.3'
0.806051 Supp b'+2:postag:-LRB-'
0.799927 Air b'-1:postag::'
0.799282 O b'+2:postag:NN'
0.795332 Supp b'-1:postag:CC'
0.793952 O b'+2:lemma:fructose'
0.793416 O b'-1:lemma:fructose'
0.792677 Gtype b'-2:lemma:mg1655'
0.790974 Phase b'+1:lemma:phase'
0.789635 O b'-1:lemma:-80'
0.786916 Substrain b'+2:postag::'
0.781303 Gtype b'-1:lemma:_'
0.776151 Supp b'+1:lemma:be'
0.774015 Phase b'-2:postag:IN'
0.773409 O b'-1:lemma:antibody'
0.768685 Med b'lemma:glucose'
0.763097 Air b'-1:lemma:%'
0.759566 O b'+1:postag:NN'
0.757946 Air b'+2:postag:CD'
0.748247 Anti b'+2:postag:NNP'
0.747528 O b'-1:lemma:.5'
0.747528 O b'-2:lemma:ph5'
0.746922 O b'-2:lemma:be'
0.743720 Phase b'postag:NN'
0.739866 O b'-1:postag:JJ'
0.739833 O b'+2:lemma:_'
0.738548 OD b'-1:lemma:od600'
0.733965 O b'-1:lemma:4'
0.731827 pH b'-2:lemma:glucose'
0.730826 Phase b'-1:lemma:until'
0.729562 Supp b'postag:NNP'
0.725961 Med b'-1:postag:JJ'
0.719715 O b'+1:lemma:mid-log'
0.718970 O b'lemma:,'
0.718970 O b'postag:,'
0.718023 Phase b'lemma:pahse'
0.717956 Supp b'+2:postag:IN'
0.716700 Med b'+2:lemma:with'
0.716572 Med b'+1:postag:JJ'
0.713213 Technique b'postag:-RRB-'
0.712609 OD b'postag:IN'
0.707932 OD b'-1:lemma:of'
0.705464 Technique b'postag:NNP'
0.703743 O b'lemma:or'
0.695759 Supp b'+2:lemma:ph'
0.690922 Strain b'-1:lemma:.'
0.690922 Strain b'-1:postag:.'
0.690450 O b'+1:postag:VBD'
0.687914 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.686632 OD b'lemma:o.d.'
0.686632 OD b'+1:lemma:600nm'
0.684676 O b'+2:postag:VB'
0.670821 Gtype b'+1:lemma:the'
0.670569 O b'-1:lemma:medium'
0.666335 Supp b'+1:postag:VBD'
0.665353 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.661578 O b'-1:lemma:short'
0.660312 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.659185 Temp b'+1:lemma:see'
0.656559 OD b'-2:lemma:od600'
0.656286 Technique b'-2:lemma:-lrb-'
0.649904 O b'+1:postag:VBZ'
0.648568 Med b'-2:lemma:fresh'
0.644726 Air b'-2:lemma:cm20'
0.640962 Temp b'-2:lemma:see'
0.639834 OD b'-1:lemma:at'
0.638701 Air b'lemma:co2'
0.638379 Supp b'-2:postag:CD'
0.635086 Phase b'+1:lemma:-lrb-'
0.633036 Supp b'+1:lemma:Deficient'
0.630852 Phase b'-1:lemma::'
0.630721 Gtype b'+1:lemma::'
0.629766 Gtype b'lemma:the'
0.629138 Temp b'-2:postag:VBD'
0.628734 Med b'+1:postag:CD'
0.627863 Med b'+2:postag:IN'
0.626904 Phase b'+1:postag:-LRB-'
0.626679 Med b'-2:lemma:minimal'
0.625596 Anti b'lemma:antibody'
0.623179 Air b'-2:postag:SYM'
0.619030 O b'+1:lemma:0.2'
0.618910 Temp b'lemma:sample'
0.618711 O b'lemma:chip-fnr'
0.618711 O b'+2:lemma:fnr8myc'
0.617162 O b'-1:postag:NN'
0.616774 Phase b'+1:lemma:for'
0.615784 Supp b'+2:lemma:A'
0.615663 Supp b'-1:lemma:1m'
0.615663 Supp b'+2:lemma:7.6'
Top negative:
0.115880 Supp b'-1:lemma:ph'
0.115342 Supp b'lemma:150'
0.115342 Supp b'+1:lemma:mg/ml'
0.115342 Supp b'-2:lemma:concentration'
0.114673 Anti b'-2:lemma::'
0.113798 O b'lemma:0.4'
0.110792 Supp b'lemma:sodium'
0.106952 Gtype b'+2:postag:VBN'
0.105174 Temp b'+1:lemma:short'
0.104882 O b'-1:lemma:5'
0.103539 Supp b'lemma:in'
0.102222 O b'-1:lemma:Iron'
0.102080 O b'-2:lemma:mg/ml'
0.101457 O b'+2:lemma:to'
0.101457 O b'+2:postag:TO'
0.100867 Supp b'+1:lemma:phosphate'
0.100797 O b'-1:lemma:after'
0.097962 Supp b'lemma:leucine'
0.097511 OD b'+2:lemma:,'
0.097511 OD b'+2:postag:,'
0.096491 Gtype b'-1:lemma:vector'
0.092854 OD b'-2:postag:IN'
0.091736 O b'+1:lemma:o.d.'
0.091736 O b'+2:lemma:600nm'
0.091478 Supp b'-2:lemma:+'
0.090064 O b'lemma:c'
0.088017 O b'+1:lemma:be'
0.087673 Supp b'-2:lemma:cell'
0.086825 O b'-1:lemma:,'
0.086825 O b'-1:postag:,'
0.086411 O b'lemma:respiration'
0.086411 O b'+2:lemma:mmol'
0.085423 Phase b'+2:lemma:follow'
0.081598 Agit b'+1:postag:-RRB-'
0.080743 Gtype b'+1:lemma:nacl'
0.079550 OD b'lemma:0.3-0.35'
0.079270 Med b'+1:lemma:media'
0.076336 Temp b'+2:lemma:and'
0.075294 Air b'+1:postag:NN'
0.073624 Supp b'+2:lemma:agitation'
0.073202 O b'+1:lemma:co2'
0.072459 Strain b'-2:lemma:strain'
0.071927 O b'-2:lemma:Iron'
0.071286 Temp b'lemma:30'
0.068634 Med b'-1:lemma:2'
0.066598 Med b'-1:lemma:-rrb-'
0.066109 Gtype b'lemma:-rrb-'
0.065066 O b'-1:lemma:grow'
0.062497 OD b'-1:lemma:600nm'
0.062497 OD b'-2:lemma:o.d.'
0.062497 OD b'+2:lemma:anerobically'
0.062436 O b'-1:lemma:w0002'
0.060388 Anti b'+1:lemma:from'
0.059422 O b'-1:lemma:phase'
0.059051 Gtype b'-2:postag:-RRB-'
0.055828 O b'lemma:and'
0.055778 Gtype b'-1:lemma:Fur'
0.055758 O b'lemma:Nac'
0.055539 Med b'-1:postag:-RRB-'
0.054858 O b'-2:lemma:final'
0.054708 Air b'+1:postag:CC'
0.053562 OD b'+2:postag:DT'
0.052702 O b'lemma:cell'
0.052682 Temp b'lemma:-lrb-'
0.050895 O b'-2:lemma:37'
0.050858 Anti b'-2:postag::'
0.050261 Temp b'postag:-LRB-'
0.049357 O b'-2:lemma:culture'
0.047739 O b'+2:lemma:%'
0.044616 Anti b'-1:lemma:polymerase'
0.043556 O b'-1:lemma:n2'
0.042414 Anti b'-2:lemma:rna'
0.042127 O b'lemma:n2'
0.038866 Gtype b'+2:lemma:2'
0.037492 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
0.036308 Air b'+2:lemma:5'
0.034788 O b'+2:lemma:hour'
0.034772 Temp b'+2:lemma:short'
0.033865 O b'-1:lemma:anti-rpos'
0.033865 O b'+1:lemma:neoclone'
0.033335 O b'+1:lemma:anerobically'
0.033335 O b'-2:lemma:600nm'
0.028256 O b'+1:lemma:5'
0.025701 Gtype b'lemma:factor'
0.025701 Gtype b'-1:lemma:transcription'
0.025701 Gtype b'+1:lemma:Fur'
0.024398 O b'lemma:mg1655'
0.024207 O b'+1:lemma:lb'
0.022785 Anti b'-1:lemma:fnr'
0.021061 Supp b'+1:lemma:and'
0.021026 Supp b'+1:lemma:10'
0.020863 O b'-2:lemma:mm'
0.017387 O b'-2:lemma:lb'
0.016072 O b'-2:lemma:treat'
0.015934 Gtype b'-1:lemma:knock-out'
0.015934 Gtype b'-2:lemma:crp'
0.015308 Supp b'-1:lemma:iptg'
0.015163 Supp b'lemma:mmol'
0.015163 Supp b'+1:lemma:potassium'
0.015163 Supp b'-2:lemma:respiration'
0.014816 Supp b'postag:IN'
0.014750 Temp b'+2:lemma:rnase'
0.014449 Supp b'+2:lemma:nitrate'
0.014290 Med b'+1:lemma:2'
0.014036 Air b'+1:lemma:at'
0.013727 O b'-2:lemma:n2'
0.013606 O b'+2:lemma:5'
0.013441 O b'+2:lemma:1'
0.013023 Supp b'-2:lemma:\xc2\xb5m'
0.013023 Supp b'+2:lemma:\xc2\xb5l'
0.012633 Supp b'+1:lemma:300'
0.012053 O b'+2:lemma:70'
0.012021 O b'-2:lemma:genotype'
0.011776 O b'lemma:10'
0.010955 O b'+1:lemma:phase'
0.010869 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
0.010869 Supp b'+2:lemma:cm20'
0.009586 O b'-1:lemma:shake'
0.009206 Supp b'lemma:mg/ml'
0.009206 Supp b'-1:lemma:150'
0.008821 O b'-1:lemma:at'
0.008761 Supp b'+1:postag:CC'
0.008209 O b'+1:lemma:with'
0.006668 O b'+2:lemma:until'
0.006506 OD b'lemma:600nm'
0.006506 OD b'-1:lemma:o.d.'
0.006234 Med b'+2:postag:CD'
0.005681 Gtype b'-2:postag:-LRB-'
0.005352 O b'-2:lemma:%'
0.005203 O b'lemma:%'
0.004999 O b'lemma:mm'
0.004759 Supp b'-2:postag:CC'
0.004717 Temp b'+2:postag:CC'
0.004429 Supp b'-2:lemma:iptg'
0.004268 Supp b'-2:lemma:stir'
0.004113 Air b'-1:lemma:and'
0.003714 O b'-1:lemma:induce'
0.003454 O b'-2:lemma:or'
0.003109 Supp b'+1:postag:RB'
0.002901 O b'-1:lemma:genotype'
0.002627 Phase b'+1:lemma:culture'
0.002523 O b'+1:lemma:_'
0.002441 O b'-1:lemma:mid-log'
0.002279 Technique b'+1:postag:NN'
0.002271 O b'lemma:min'
0.002241 Supp b'+1:lemma:nitrate'
0.002231 O b'+1:lemma:43'
0.002069 Supp b'lemma:potassium'
0.002069 Supp b'-1:lemma:mmol'
0.001890 Agit b'-2:lemma:-lrb-'
0.001880 O b'+1:lemma:30'
0.001836 Agit b'-2:postag:-LRB-'
0.001816 Phase b'+1:postag:NNS'
0.001816 Supp b'lemma:30'
0.001749 Med b'+2:lemma:without'
0.001703 Phase b'-1:lemma:the'
0.001637 Phase b'-1:postag:DT'
0.001440 O b'lemma:um'
0.001440 O b'+2:lemma:paraquat'
0.001380 O b'-2:lemma:2.5'
0.001365 Phase b'+2:postag:VBN'
0.001363 O b'lemma:short'
0.001363 O b'+1:lemma:rnase'
0.001341 OD b'+2:postag:NNS'
0.001244 Temp b'-2:lemma:flask'
0.001231 Gtype b'lemma:crp'
0.001184 O b'-2:lemma:.2'
0.001154 O b'lemma:genbank'
0.000855 OD b'-2:postag:NN'
0.000760 O b'+1:lemma:for'
0.000760 O b'+2:lemma:30'
0.000754 Gtype b'-1:postag:DT'
0.000752 Supp b'-1:lemma:;'
0.000752 Supp b'-2:lemma:7.6'
0.000714 Air b'-2:lemma:,'
0.000714 Air b'-2:postag:,'
0.000677 Supp b'-1:lemma:wt'
0.000616 Gtype b'+2:postag:JJ'
0.000602 O b'+1:lemma:um'
0.000562 Med b'+1:postag:VBN'
0.000527 O b'-2:lemma:at'
0.000516 O b'+2:lemma:grow'
0.000473 Phase b'-2:postag:-RRB-'
0.000471 O b'+2:lemma:glucose'
0.000464 Temp b'+2:lemma:the'
0.000427 O b'+2:postag:CC'
0.000396 O b'-2:lemma:m9'
0.000393 Supp b'+2:lemma:.'
0.000393 Supp b'+2:postag:.'
0.000308 O b'-1:lemma:with'
0.000227 Med b'+2:lemma:2'
0.000217 O b'-1:lemma:to'
0.000217 O b'-1:postag:TO'
0.000155 O b'-1:lemma:Aerobic'
0.000133 Gtype b'-1:lemma:dfnr'
0.000125 O b'lemma:C'
0.000112 Phase b'+2:postag:NN'
0.000098 Supp b'+1:lemma:7.6'
0.000098 Supp b'-2:lemma:1m'
0.000098 Supp b'+2:lemma:;'
0.000073 O b'+1:lemma:glucose'
0.000053 O b'+1:lemma:buffer'
0.000042 Supp b'+1:postag:JJ'
0.000032 Vess b'+1:postag:IN'
0.000032 Supp b'-1:postag::'
0.000032 O b'-2:lemma:m63'
0.000027 Supp b'+2:postag:JJ'
0.000026 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
0.000024 Med b'-1:lemma::'
0.000022 Med b'+2:postag:-RRB-'
0.000021 Supp b'lemma:ph'
0.000015 O b'-1:lemma:fnr'
0.000012 Med b'-2:lemma::'
0.000010 Supp b'-2:postag:NNS'
0.000006 Supp b'+2:lemma:,'
0.000006 Supp b'+2:postag:,'
0.000002 Air b'+2:lemma:95'
0.000001 O b'+1:lemma:genbank'
-0.000001 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.000002 Med b'-2:postag:CC'
-0.000005 Gtype b'postag:CD'
-0.000022 O b'+1:lemma:10'
-0.000028 O b'+1:lemma:ph'
-0.000029 O b'-2:lemma:ph'
-0.000045 O b'-2:lemma:10'
-0.000061 O b'lemma:150'
-0.000061 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.000061 O b'-2:lemma:concentration'
-0.000098 Air b'postag:CD'
-0.000102 Med b'-2:lemma:m9'
-0.000151 Temp b'+2:postag:IN'
-0.000161 Gtype b'-1:postag:JJ'
-0.000167 Med b'postag:JJ'
-0.000213 Temp b'postag:JJ'
-0.000247 O b'+2:lemma:co2'
-0.000266 Supp b'-1:lemma:250'
-0.000345 Supp b'-2:lemma:with'
-0.000711 Air b'lemma:,'
-0.000711 Air b'postag:,'
-0.000886 Med b'-1:lemma:m63'
-0.000963 O b'+1:lemma:supplement'
-0.001032 O b'-2:lemma:cell'
-0.001033 Temp b'+1:postag:IN'
-0.001175 Air b'+1:postag:CD'
-0.001254 O b'+2:lemma:follow'
-0.001568 Air b'postag:CC'
-0.001688 OD b'+2:postag:NN'
-0.002079 O b'lemma:phase'
-0.002191 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.002301 Supp b'-2:postag:IN'
-0.002690 OD b'postag:NN'
-0.003804 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.003962 Air b'postag:-RRB-'
-0.003992 O b'-2:postag:DT'
-0.004297 Supp b'-1:postag:NN'
-0.004717 Supp b'-1:lemma:%'
-0.005027 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.005787 O b'-2:lemma:to'
-0.005787 O b'-2:postag:TO'
-0.005843 O b'+2:lemma:rnase'
-0.005850 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.006026 O b'+2:lemma:at'
-0.006083 O b'+1:postag:CD'
-0.006367 Air b'+1:postag:-RRB-'
-0.006591 Phase b'-1:lemma:at'
-0.007273 O b'+1:lemma:b'
-0.007411 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.007620 O b'+1:lemma:300'
-0.008111 O b'-2:lemma:grow'
-0.008137 Air b'-1:lemma:-lrb-'
-0.008788 O b'-1:lemma:iptg'
-0.009610 Supp b'-2:lemma:,'
-0.009610 Supp b'-2:postag:,'
-0.013850 Technique b'-1:postag::'
-0.014702 Technique b'-2:postag:NN'
-0.015832 O b'-1:postag:DT'
-0.016722 O b'lemma:od600'
-0.017503 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.019372 O b'+2:postag:DT'
-0.019416 Air b'+2:lemma:70'
-0.021209 Air b'-1:lemma:n2'
-0.022574 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.028221 O b'-2:lemma:and'
-0.030872 O b'-1:lemma:.'
-0.030872 O b'-1:postag:.'
-0.032102 Med b'-2:postag:VBN'
-0.036750 O b'+2:lemma:genome'
-0.038188 O b'+1:lemma:hour'
-0.039135 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.040300 O b'lemma:m63'
-0.040472 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.041664 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.042813 O b'+1:lemma:1/100'
-0.042813 O b'-2:lemma:sodium'
-0.042813 O b'+2:lemma:vol'
-0.043634 O b'+2:lemma:~'
-0.044750 O b'+2:lemma:total'
-0.045004 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.045114 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.046849 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.047267 O b'+1:lemma:media'
-0.049277 O b'+2:lemma:in'
-0.050803 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.051713 O b'+1:lemma:of'
-0.052928 O b'-1:lemma:0.1'
-0.056882 O b'+2:lemma:antibody'
-0.057419 O b'lemma:;'
-0.057419 O b'-1:lemma:7.6'
-0.061626 Supp b'-1:lemma:10'
-0.061641 O b'lemma:ph'
-0.062445 Air b'+2:lemma:,'
-0.062445 Air b'+2:postag:,'
-0.064009 O b'+1:lemma:~'
-0.066550 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.072491 O b'lemma:sample'
-0.077141 O b'-2:lemma:g/l'
-0.077271 O b'+2:lemma:ph'
-0.077609 O b'+1:lemma:m'
-0.080776 O b'-2:lemma:glucose'
-0.082984 O b'+2:postag:RB'
-0.083074 Air b'-1:postag:CC'
-0.083979 O b'lemma:dissolve'
-0.083979 O b'+2:lemma:methanol'
-0.084777 Air b'+2:postag:CC'
-0.087933 Med b'-1:postag:IN'
-0.094361 Med b'+1:postag:IN'
-0.094705 Air b'lemma:n2'
-0.096806 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.098602 Supp b'+2:lemma:and'
-0.098847 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.099865 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.101772 Supp b'lemma:,'
-0.101772 Supp b'postag:,'
-0.107410 Supp b'+2:postag:NNS'
-0.108716 O b'-2:lemma:minimal'
-0.109914 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.112451 Temp b'+2:lemma:with'
-0.112860 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.116487 O b'+1:lemma:mm'
-0.116729 O b'+2:lemma:tag'
-0.124273 O b'lemma:7.6'
-0.124273 O b'+1:lemma:;'
-0.126199 O b'-2:lemma:20'
-0.126323 O b'+1:lemma:a'
-0.127945 Phase b'+1:postag:NN'
-0.128722 Air b'+2:lemma:-rrb-'
-0.129802 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.132471 Supp b'postag:CD'
-0.132917 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.133815 Supp b'-2:postag:NN'
-0.136670 O b'lemma:nh4cl'
-0.140253 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.145513 O b'-1:lemma:~'
-0.146623 Phase b'+2:postag:CD'
-0.147570 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.148506 Air b'+2:postag:-RRB-'
-0.150892 O b'lemma:pahse'
-0.151932 O b'-2:postag::'
-0.158806 O b'-1:lemma:g/l'
-0.160447 O b'+2:lemma:10'
-0.160753 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.163984 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.171143 O b'-1:lemma:of'
-0.172009 O b'-2:lemma:of'
-0.178787 O b'-2:lemma:0.1'
-0.180837 O b'-1:lemma:contain'
-0.182409 Supp b'lemma:mm'
-0.188726 Phase b'-2:postag:NN'
-0.189086 O b'-1:lemma:until'
-0.192159 Gtype b'postag:VBG'
-0.196258 O b'-1:lemma:mm'
-0.209501 Air b'-1:lemma:,'
-0.209501 Air b'-1:postag:,'
-0.219013 Med b'postag:CD'
-0.219202 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.226375 O b'+1:lemma:g/l'
-0.227424 O b'-1:lemma:final'
-0.239301 O b'lemma:fecl2'
-0.243179 O b'+2:lemma:fnr'
-0.246021 O b'lemma:0.1'
-0.249941 Air b'-2:lemma:n2'
-0.251037 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.252351 Temp b'+1:lemma:with'
-0.253684 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.254041 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.254826 O b'lemma:0.2'
-0.255180 O b'-1:lemma:the'
-0.255837 O b'lemma:1m'
-0.263032 O b'lemma:nitrate'
-0.267716 O b'-1:lemma:rpob'
-0.272785 Med b'-1:postag:NN'
-0.274409 O b'lemma:medium'
-0.278943 Supp b'+2:postag:NN'
-0.280654 O b'-2:lemma:until'
-0.280741 O b'-1:postag:IN'
-0.285848 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.290062 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.290062 O b'+1:lemma:methanol'
-0.294617 Air b'+2:postag:IN'
-0.297643 O b'+2:lemma:m9'
-0.301893 O b'-2:lemma:rpob'
-0.304215 O b'+2:lemma:+'
-0.309732 O b'+2:lemma:.'
-0.309732 O b'+2:postag:.'
-0.326380 O b'-1:lemma:1m'
-0.326380 O b'+2:lemma:7.6'
-0.327905 O b'-1:lemma:fresh'
-0.328381 O b'+1:lemma:minimal'
-0.331796 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.333974 O b'+1:lemma:%'
-0.334792 O b'+1:postag:DT'
-0.336014 O b'-2:lemma:fresh'
-0.340862 O b'-1:lemma:ml'
-0.349234 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.350789 O b'-2:postag:VBG'
-0.365707 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.395568 O b'-2:lemma:genome'
-0.406115 O b'+2:lemma:add'
-0.407052 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.413270 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.425790 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.427044 Air b'-2:postag:CC'
-0.430866 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.432830 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.435236 O b'-1:lemma:minimal'
-0.440037 O b'+1:postag:IN'
-0.440630 O b'-2:lemma:iptg'
-0.442829 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.456085 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.472676 Med b'+1:postag:NN'
-0.476697 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.482726 Gtype b'-2:postag:CD'
-0.486405 Supp b'+1:lemma:,'
-0.486405 Supp b'+1:postag:,'
-0.496633 O b'-2:lemma:dpd'
-0.512557 O b'+1:lemma:1m'
-0.512557 O b'-2:lemma:vol'
-0.517729 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.522680 O b'-2:lemma:supplement'
-0.526930 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.527742 Supp b'lemma:2'
-0.534735 O b'-2:lemma:pahse'
-0.555970 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.556620 O b'+1:lemma:+'
-0.572668 O b'-2:lemma:IP'
-0.586251 O b'-1:lemma:vol'
-0.586251 O b'-2:lemma:1/100'
-0.586251 O b'+2:lemma:1m'
-0.633922 pH b'postag:NN'
-0.634493 O b'lemma:aerobic'
-0.651492 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.661288 O b'lemma:mid-log'
-0.697917 O b'lemma:minimal'
-0.726381 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.774470 O b'-2:postag:SYM'
-0.775356 Supp b'+2:postag:CC'
-0.788441 Temp b'postag:NN'
-0.817779 O b'+1:lemma:at'
-0.832169 O b'-1:postag::'
-0.833753 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.839899 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.851136 O b'-2:lemma::'
-0.851235 O b'+2:lemma:b'
-0.853974 O b'lemma:of'
-0.876284 Anti b'postag:NNP'
-0.899651 Med b'+2:postag:VBN'
-0.905250 O b'-2:lemma:media'
-0.918145 O b'-1:lemma:IP'
-0.936378 O b'lemma:wt'
-0.949407 Air b'postag:NN'
-1.000611 O b'-2:lemma:rifampicin'
-1.070337 O b'+1:lemma:in'
-1.144119 O b'-1:lemma:ph'
-1.198974 Supp b'postag:JJ'
-1.228118 O b'-2:lemma:the'
-1.254816 O b'-1:lemma:30'
-1.299729 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.302232 O b'lemma:30'
-1.313697 Supp b'+2:postag:CD'
-1.330050 OD b'+1:postag:NN'
-1.377978 O b'-1:lemma:co2'
-1.392282 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.395517 O b'-1:lemma:1'
-1.511210 O b'lemma:aerobically'
-1.538215 Supp b'+2:lemma:2'
-1.577403 O b'-2:lemma:0.3'
-1.581362 O b'lemma:media'
-1.581708 O b'+2:lemma:rifampicin'
-1.593202 O b'lemma:rifampicin'
-1.678298 Supp b'+2:lemma:1'
-1.684538 Phase b'postag:JJ'
-1.948904 OD b'+2:lemma:aerobically'
-2.016859 O b'lemma:0.3'
-2.175293 O b'+2:lemma:iptg'
-2.236915 O b'-1:lemma:sample'
-2.505380 O b'-1:lemma:2'
-2.850653 O b'+1:lemma:1'
-2.877501 O b'+1:lemma:2'
-4.084812 O b'-1:lemma::'
-4.637477 O b'-1:lemma:_'