report_Run5_v13.txt 37.3 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.17523174658487245, 'c2': 0.008606397422078239}
best CV score:0.830775030715119
model size: 0.08M

Flat F1: 0.8168626183610946
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.925     0.795     0.855        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.864     0.838     0.851       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.859     0.783     0.817       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    5.705345
Supp   -> Supp    5.561850
Med    -> Med     5.243379
OD     -> OD      5.231769
Anti   -> Anti    4.871683
Gtype  -> Gtype   4.640123
Air    -> Air     4.621504
O      -> O       4.333286
Gversion -> Gversion 4.315539
Technique -> Technique 3.630754
Phase  -> Phase   3.392298
pH     -> pH      2.958701
Agit   -> Agit    2.178434
Substrain -> Gtype   2.087403
Gtype  -> Supp    1.474024
O      -> Supp    1.185452
Air    -> O       1.154315
O      -> Technique 1.061678
Technique -> Air     0.779973
O      -> Gtype   0.742890
Supp   -> O       0.627331
Temp   -> O       0.593630
Med    -> O       0.448582
OD     -> O       0.032580
O      -> Gversion 0.028216
O      -> Med     0.012224
Anti   -> O       0.010172
O      -> Phase   0.000112
Gtype  -> pH      0.000016
Gtype  -> Med     -0.094063
OD     -> Air     -0.191976
Technique -> pH      -0.381175
Supp   -> Med     -0.388917
Gtype  -> O       -0.481315
Phase  -> OD      -0.886017
O      -> Air     -1.094327
Med    -> Supp    -1.258902
Substrain -> O       -1.283571
Technique -> Gtype   -1.501836


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    5.705345
Supp   -> Supp    5.561850
Med    -> Med     5.243379
OD     -> OD      5.231769
Anti   -> Anti    4.871683
Gtype  -> Gtype   4.640123
Air    -> Air     4.621504
O      -> O       4.333286
Gversion -> Gversion 4.315539
Technique -> Technique 3.630754
Phase  -> Phase   3.392298
pH     -> pH      2.958701
Agit   -> Agit    2.178434
Substrain -> Gtype   2.087403
Gtype  -> Supp    1.474024
O      -> Supp    1.185452
Air    -> O       1.154315
O      -> Technique 1.061678
Technique -> Air     0.779973
O      -> Gtype   0.742890
Supp   -> O       0.627331
Temp   -> O       0.593630
Med    -> O       0.448582
OD     -> O       0.032580
O      -> Gversion 0.028216
O      -> Med     0.012224
Anti   -> O       0.010172
O      -> Phase   0.000112
Gtype  -> pH      0.000016
Gtype  -> Med     -0.094063
OD     -> Air     -0.191976
Technique -> pH      -0.381175
Supp   -> Med     -0.388917
Gtype  -> O       -0.481315
Phase  -> OD      -0.886017
O      -> Air     -1.094327
Med    -> Supp    -1.258902
Substrain -> O       -1.283571
Technique -> Gtype   -1.501836


Top positive:
7.254518 Gtype    b'lemma:type'
7.213876 Phase    b'lemma:mid-log'
6.519889 O        b'lemma:1'
6.474331 O        b'-2:lemma:_'
6.356337 O        b'lemma:_'
6.231604 Anti     b'-2:lemma:antibody'
6.210042 O        b'lemma:2'
6.084761 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
5.968004 Air      b'lemma:anaerobic'
5.944455 Technique b'lemma:chipseq'
5.881024 O        b'lemma:3'
5.446547 O        b'postag:VBG'
5.407336 Supp     b'lemma:no3'
5.327394 Phase    b'-2:lemma:phase'
5.164128 O        b'lemma:-'
5.002342 Technique b'+2:lemma:ph5'
5.000914 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
4.929495 Supp     b'lemma:pq'
4.917897 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
4.894398 Gtype    b'lemma:wt'
4.888156 Supp     b'-2:lemma:shake'
4.817395 Strain   b'lemma:k-12'
4.747360 Air      b'lemma:aerobic'
4.663432 O        b'lemma:b'
4.583025 Supp     b'lemma:Iron'
4.583025 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
4.567059 Med      b'lemma:MOPS'
4.549514 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
4.534861 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
4.418049 O        b'postag:IN'
4.384026 Technique b'lemma:rna-seq'
4.285166 Med      b'lemma:LB'
4.257381 Supp     b'lemma:nh4cl'
4.225229 O        b'lemma:Cra'
4.173925 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
4.147835 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
4.085928 Supp     b'lemma:glucose'
3.928442 O        b'lemma:rpob'
3.913543 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.901221 O        b'lemma:with'
3.874023 Supp     b'lemma:acetate'
3.865501 Technique b'lemma:chip-seq'
3.747544 O        b'lemma:.'
3.747544 O        b'postag:.'
3.744646 Supp     b'lemma:2h'
3.744646 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.734601 O        b'-2:lemma:myc'
3.718666 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
3.619321 Air      b'lemma:aerobically'
3.591541 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
3.527419 Gtype    b'+1:lemma:type'
3.493459 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
3.483085 Gtype    b'lemma:pk4854'
3.433987 O        b'-1:lemma:type'
3.423609 Gtype    b'lemma:dfnr'
3.416312 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
3.414330 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.395328 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.390298 O        b'+2:lemma:crp'
3.378883 Air      b'-2:lemma:IP'
3.361331 Supp     b'lemma:arginine'
3.353349 Technique b'lemma:chip-exo'
3.340593 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
3.311960 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
3.275648 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
3.274175 O        b'-1:postag:NNS'
3.265429 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.250561 Temp     b'-1:lemma:sample'
3.240952 O        b'-2:lemma:flagtag'
3.220393 O        b'postag:VBN'
3.170912 Substrain b'lemma:mg1655'
3.149599 O        b'+1:lemma:wt'
3.144760 O        b'lemma:rep2'
3.144760 O        b'lemma:rep1'
3.140517 Supp     b'lemma:nacl'
3.124319 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
3.106367 Supp     b'lemma:iptg'
3.097812 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
3.089816 Med      b'lemma:lb'
3.086471 O        b'-1:lemma:tag'
3.079636 Gtype    b'-2:lemma:delta'
3.067520 O        b'postag::'
3.056516 Med      b'+2:lemma:b2'
3.052389 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.973614 Supp     b'-1:lemma:Cra'
2.949791 Supp     b'lemma:Adenine'
2.946707 Med      b'lemma:media'
2.842244 O        b'lemma:gadx'
2.799968 Temp     b'-1:lemma:37'
2.778705 O        b'+1:postag:RB'
2.752541 O        b'lemma:a'
2.734242 O        b'lemma:CEL'
2.723993 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.666986 O        b'postag:CC'
2.645981 Med      b'+2:lemma:b1'
2.641330 O        b'lemma:\xcf\x8332'
2.639754 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.597882 Air      b'-1:lemma:co2'
2.591508 Air      b'-1:lemma:-'
2.555077 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.552568 Supp     b'+1:lemma:1'
2.505991 pH       b'lemma:ph5'
2.505991 pH       b'+1:lemma:.5'
2.502878 O        b'lemma:ompr'
2.469430 Agit     b'lemma:rpm'
2.456120 Supp     b'lemma:fructose'
2.454324 O        b'-1:lemma:glucose'
2.451963 O        b'-1:lemma:0.3'
2.451476 O        b'postag:VBD'
2.448769 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.433957 O        b'lemma:harbor'
2.423327 pH       b'+1:postag:CD'
2.420014 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.417206 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
2.417206 Gtype    b'+2:lemma:.5'
2.404388 Gversion b'lemma:.2'
2.404388 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.394564 Gtype    b'lemma:ptac'
2.388946 O        b'lemma:soxr'
2.388946 O        b'lemma:soxs'
2.385468 O        b'lemma:chip'
2.370998 Supp     b'+1:lemma:2'
2.340385 O        b'-2:lemma:medium'
2.322477 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.314945 Technique b'lemma:rnaseq'
2.314812 Temp     b'lemma:37'
2.297806 Supp     b'-1:lemma:with'
2.288584 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.279452 Supp     b'lemma:Leu'
2.279452 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
2.274757 O        b'lemma:for'
2.264072 O        b'postag:DT'
2.260705 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.255527 Agit     b'-1:lemma:250'
2.211148 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.211148 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.203918 O        b'lemma::'
2.194125 Technique b'-2:lemma:Fur'
2.189181 Supp     b'-2:lemma:purr'
2.188717 O        b'-1:lemma:lb'
2.156269 O        b'postag:NNS'
2.146834 Supp     b'-1:lemma:+'
2.145196 O        b'+1:lemma:od600'
2.100310 Air      b'postag:RB'
2.098733 Med      b'lemma:m63'
2.071094 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.058034 Gtype    b'+1:lemma:pq'
2.057298 O        b'lemma:affyexp'
2.047678 Med      b'-1:lemma:ml'
2.045906 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.034774 Med      b'lemma:minimal'
2.031535 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.028277 O        b'lemma:culture'
2.003812 Temp     b'lemma:43'
1.992678 O        b'-2:lemma:min'
1.985470 Air      b'lemma:anaeroibc'
1.982422 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.980979 O        b'+1:lemma:coli'
1.964202 Technique b'-1:lemma:IP'
1.959852 Supp     b'+2:lemma:feso4'
1.959539 O        b'+1:lemma:pq'
1.955638 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.946361 Vess     b'lemma:flask'
1.946361 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.946361 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.946361 Vess     b'+2:lemma:43'
1.944786 Technique b'-1:lemma:input'
1.940834 Air      b'-2:lemma:fnr'
1.935346 Gversion b'lemma:u00096'
1.935346 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.934845 Med      b'+2:postag:CC'
1.916720 O        b'+1:lemma:250'
1.844381 OD       b'lemma:0.3'
1.841526 Supp     b'-2:lemma:media'
1.826756 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
1.823662 O        b'lemma:ml'
1.821276 Temp     b'-1:lemma:43'
1.814597 O        b'+1:postag:NNP'
1.812329 O        b'lemma:genotype/variation'
1.797090 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.794390 Supp     b'lemma:dpd'
1.791738 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.791738 Strain   b'-2:lemma:str'
1.790683 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.788603 O        b'-1:lemma:min'
1.772047 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.760795 O        b'lemma:purr'
1.720111 O        b'lemma:argr'
1.716032 Med      b'+1:lemma:0.4'
1.709726 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.709122 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.709122 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.686456 Phase    b'-2:lemma:until'
1.677446 O        b'-2:lemma:overnight'
1.677035 Gtype    b'postag:JJ'
1.663768 OD       b'-2:lemma:od450'
1.663307 O        b'lemma:growth'
1.656708 Supp     b'-1:lemma:_'
1.642998 O        b'lemma:input'
1.642998 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.642203 OD       b'lemma:od450'
1.638459 O        b'lemma:oxyr'
1.637073 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.635561 Technique b'-2:lemma:wt'
1.627297 O        b'+2:postag:JJ'
1.622501 Supp     b'+1:lemma:_'
1.616928 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.589517 O        b'+1:lemma:20'
1.587379 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.579611 O        b'-1:lemma:wt'
1.579569 Gtype    b'lemma:wild-type'
1.577849 O        b'-1:lemma:l1'
1.551644 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.551644 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.551644 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
1.551263 O        b'-2:lemma:='
1.532119 O        b'lemma:fresh'
1.519761 Gversion b'-2:lemma:build'
1.514293 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.512296 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.507109 Gversion b'lemma:nc'
1.507109 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.495619 Gtype    b'-2:postag:JJ'
1.487875 Supp     b'-2:lemma:20'
1.476228 O        b'+1:lemma::'
1.473826 O        b'lemma:at'
1.463423 O        b'lemma:trpr'
1.462013 Air      b'postag:JJ'
1.461600 O        b'lemma:cra'
1.454664 Supp     b'lemma:Fe'
1.454626 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.446572 Phase    b'lemma:stationary'
1.446572 Phase    b'lemma:exponential'
1.439217 O        b'lemma:-lrb-'
1.439035 O        b'postag:-RRB-'
1.425672 Temp     b'-2:lemma:keep'
1.416457 Gtype    b'postag:-RRB-'
1.414874 O        b'lemma:additional'
1.414874 O        b'+1:lemma:2h'
1.413007 O        b'-1:lemma:into'
1.380040 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
1.375592 Air      b'-2:postag:CD'
1.374314 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.366837 pH       b'lemma:.5'
1.366837 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.365170 OD       b'+1:lemma:of'
1.349344 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.346963 OD       b'lemma:od600'
1.335909 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.317198 Supp     b'-1:lemma:final'
1.307155 Technique b'lemma:-lrb-'
1.305931 O        b'lemma:A'
1.305815 Technique b'-1:lemma:_'
1.304470 Supp     b'-2:lemma:agent'
1.293399 O        b'-1:lemma:nacl'
1.293379 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.291878 Technique b'postag:-LRB-'
1.272696 Gversion b'lemma:000913'
1.272696 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.266795 Med      b'+2:lemma:+'
1.261267 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.260516 O        b'lemma:-rrb-'
1.255374 O        b'+1:lemma:k-12'
1.254856 Supp     b'-1:postag:CD'
1.253039 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.246535 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.243518 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.238028 Vess     b'+1:lemma:at'
1.230588 pH       b'lemma:5.5'
1.225610 Med      b'lemma:medium'
1.223253 Supp     b'-1:lemma:respiration'
1.223253 Supp     b'+1:lemma:mmol'
1.223253 Supp     b'+2:lemma:potassium'
1.221477 Supp     b'-1:lemma:potassium'
1.221477 Supp     b'-2:lemma:mmol'
1.221079 Med      b'+1:lemma:+'
1.220054 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
1.215394 Air      b'-2:lemma:%'
1.214048 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.213055 O        b'+2:lemma:of'
1.211669 Supp     b'+2:lemma:add'
1.210314 Med      b'-1:lemma:in'
1.190490 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.188874 Supp     b'lemma:0.2'
1.187835 Gtype    b'-2:postag::'
1.182855 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.182802 Supp     b'-2:lemma:argr'
1.182727 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.182727 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.178024 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.169099 Supp     b'-2:lemma:for'
1.167115 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.160922 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.160584 Agit     b'+2:lemma:at'
1.158194 O        b'lemma:rnase'
1.155437 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.153171 Supp     b'-2:lemma:10'
1.153132 Supp     b'lemma:glutamine'
1.153132 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
1.151942 O        b'postag:-LRB-'
1.150888 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.144819 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.143488 O        b'+1:lemma:ph5'
1.143488 O        b'+2:lemma:.5'
1.133275 Gversion b'+1:postag:CD'
1.132069 OD       b'+1:postag:IN'
1.123217 Gversion b'-2:postag:VB'
1.123111 OD       b'-1:postag:IN'
1.122020 Gtype    b'+2:postag::'
1.119971 Agit     b'lemma:250'
1.116170 O        b'lemma:old'
1.116170 O        b'-1:lemma:seqa'
1.116170 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
1.110463 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.108381 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.108261 Air      b'+2:lemma:%'
1.101849 Gtype    b'-2:postag:NNS'
1.080992 Med      b'-2:postag:JJ'
1.077777 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.077777 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.074777 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.074277 Med      b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.069834 Med      b'postag:NNP'
1.068303 O        b'postag:FW'
1.066529 O        b'+1:lemma:acetate'
1.063365 pH       b'+1:lemma:5.5'
1.056599 pH       b'-1:lemma:ph'
1.047708 Supp     b'-2:lemma:pahse'
1.044753 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.042326 O        b'-2:lemma:fructose'
1.026969 O        b'lemma:genotype'
1.026483 OD       b'postag:CD'
1.026157 O        b'+2:postag:VBD'
1.024451 Gtype    b'+2:postag:NN'
1.023963 O        b'lemma:to'
1.023963 O        b'postag:TO'
1.012188 OD       b'-1:lemma:od450'
1.011918 pH       b'lemma:ph'
1.011708 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.006361 Substrain b'+2:lemma::'
1.002519 Phase    b'lemma:phase'
0.997087 O        b'-2:lemma:co2'
0.994950 Gtype    b'+1:postag::'
0.992546 Gversion b'postag:CD'
0.992044 Gtype    b'-2:postag:NN'
0.986159 Air      b'-1:postag:CD'
0.974550 Supp     b'-1:lemma:without'
0.973723 Air      b'+1:lemma:%'
0.969025 Agit     b'-2:postag:RB'
0.964597 O        b'-1:lemma:dpd'
0.963299 O        b'+1:postag:VBN'
0.958930 Anti     b'-1:lemma:myc'
0.958930 Anti     b'-2:lemma:9e10'
0.956431 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.952424 O        b'+2:lemma:constant'
0.948846 Supp     b'-1:lemma:ompr'
0.947402 OD       b'lemma:of'
0.943135 Supp     b'-1:lemma:vol'
0.943135 Supp     b'-2:lemma:1/100'
0.943135 Supp     b'+2:lemma:1m'
0.932645 Substrain b'-1:lemma:.'
0.932645 Substrain b'-1:postag:.'
0.932487 pH       b'-1:postag:NN'
0.931103 Med      b'postag:NNS'
0.930794 Air      b'lemma:%'
0.919784 O        b'-1:lemma:pq'
0.917950 Supp     b'-1:lemma:mm'
0.917138 O        b'+1:lemma:sparging'
0.905430 pH       b'-2:lemma:at'
0.905022 O        b'-2:lemma:~'
0.903976 O        b'+1:postag::'
0.894178 Air      b'-2:lemma:mid-log'
0.891344 Air      b'-1:lemma:phase'
0.890324 Supp     b'-1:postag:IN'
0.887225 Technique b'-2:postag:NNP'
0.882013 Supp     b'lemma:20'
0.879988 O        b'+2:postag:NNP'
0.878093 O        b'lemma:s'
0.878093 O        b'-2:lemma:parameter'
0.875975 Air      b'-1:lemma:_'
0.870106 O        b'+2:lemma:wt'
0.868335 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
0.867092 O        b'+2:lemma:allow'
0.867005 O        b'lemma:Fur'
0.866387 O        b'lemma:chip-arca'
0.866387 O        b'+2:lemma:arca8myc'
0.862958 Anti     b'postag:JJ'
0.862750 Med      b'+1:lemma:medium'
0.862120 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.862120 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.859037 O        b'lemma:4'
0.851384 O        b'-2:lemma:in'
0.847891 Strain   b'+2:lemma:.'
0.847891 Strain   b'+2:postag:.'
0.839951 Gtype    b'-1:postag:VBP'
0.838977 Gtype    b'lemma:ryhb'
0.837171 OD       b'+2:postag:CD'
0.836348 O        b'-1:postag:NNP'
0.832547 pH       b'-1:lemma:at'
0.832208 Supp     b'+2:lemma:mid-log'
0.832136 OD       b'-2:lemma:phase'
0.831919 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
0.826860 Supp     b'lemma:of'
0.822498 Technique b'lemma:-rrb-'
0.820710 Gtype    b'lemma:nsrr'
0.820710 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
0.816448 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.816448 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.814474 OD       b'+2:lemma:~'
0.809727 O        b'-1:lemma:nitrate'
0.809708 Gtype    b'-2:lemma:the'
0.807317 Air      b'-2:lemma:0.3'
0.806051 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
0.799927 Air      b'-1:postag::'
0.799282 O        b'+2:postag:NN'
0.795332 Supp     b'-1:postag:CC'
0.793952 O        b'+2:lemma:fructose'
0.793416 O        b'-1:lemma:fructose'
0.792677 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
0.790974 Phase    b'+1:lemma:phase'
0.789635 O        b'-1:lemma:-80'
0.786916 Substrain b'+2:postag::'
0.781303 Gtype    b'-1:lemma:_'
0.776151 Supp     b'+1:lemma:be'
0.774015 Phase    b'-2:postag:IN'
0.773409 O        b'-1:lemma:antibody'
0.768685 Med      b'lemma:glucose'
0.763097 Air      b'-1:lemma:%'
0.759566 O        b'+1:postag:NN'
0.757946 Air      b'+2:postag:CD'
0.748247 Anti     b'+2:postag:NNP'
0.747528 O        b'-1:lemma:.5'
0.747528 O        b'-2:lemma:ph5'
0.746922 O        b'-2:lemma:be'
0.743720 Phase    b'postag:NN'
0.739866 O        b'-1:postag:JJ'
0.739833 O        b'+2:lemma:_'
0.738548 OD       b'-1:lemma:od600'
0.733965 O        b'-1:lemma:4'
0.731827 pH       b'-2:lemma:glucose'
0.730826 Phase    b'-1:lemma:until'
0.729562 Supp     b'postag:NNP'
0.725961 Med      b'-1:postag:JJ'
0.719715 O        b'+1:lemma:mid-log'
0.718970 O        b'lemma:,'
0.718970 O        b'postag:,'
0.718023 Phase    b'lemma:pahse'
0.717956 Supp     b'+2:postag:IN'
0.716700 Med      b'+2:lemma:with'
0.716572 Med      b'+1:postag:JJ'
0.713213 Technique b'postag:-RRB-'
0.712609 OD       b'postag:IN'
0.707932 OD       b'-1:lemma:of'
0.705464 Technique b'postag:NNP'
0.703743 O        b'lemma:or'
0.695759 Supp     b'+2:lemma:ph'
0.690922 Strain   b'-1:lemma:.'
0.690922 Strain   b'-1:postag:.'
0.690450 O        b'+1:postag:VBD'
0.687914 Supp     b'-1:lemma:0.2'
0.686632 OD       b'lemma:o.d.'
0.686632 OD       b'+1:lemma:600nm'
0.684676 O        b'+2:postag:VB'
0.670821 Gtype    b'+1:lemma:the'
0.670569 O        b'-1:lemma:medium'
0.666335 Supp     b'+1:postag:VBD'
0.665353 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.661578 O        b'-1:lemma:short'
0.660312 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.659185 Temp     b'+1:lemma:see'
0.656559 OD       b'-2:lemma:od600'
0.656286 Technique b'-2:lemma:-lrb-'
0.649904 O        b'+1:postag:VBZ'
0.648568 Med      b'-2:lemma:fresh'
0.644726 Air      b'-2:lemma:cm20'
0.640962 Temp     b'-2:lemma:see'
0.639834 OD       b'-1:lemma:at'
0.638701 Air      b'lemma:co2'
0.638379 Supp     b'-2:postag:CD'
0.635086 Phase    b'+1:lemma:-lrb-'
0.633036 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
0.630852 Phase    b'-1:lemma::'
0.630721 Gtype    b'+1:lemma::'
0.629766 Gtype    b'lemma:the'
0.629138 Temp     b'-2:postag:VBD'
0.628734 Med      b'+1:postag:CD'
0.627863 Med      b'+2:postag:IN'
0.626904 Phase    b'+1:postag:-LRB-'
0.626679 Med      b'-2:lemma:minimal'
0.625596 Anti     b'lemma:antibody'
0.623179 Air      b'-2:postag:SYM'
0.619030 O        b'+1:lemma:0.2'
0.618910 Temp     b'lemma:sample'
0.618711 O        b'lemma:chip-fnr'
0.618711 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
0.617162 O        b'-1:postag:NN'
0.616774 Phase    b'+1:lemma:for'
0.615784 Supp     b'+2:lemma:A'
0.615663 Supp     b'-1:lemma:1m'
0.615663 Supp     b'+2:lemma:7.6'


Top negative:
0.115880 Supp     b'-1:lemma:ph'
0.115342 Supp     b'lemma:150'
0.115342 Supp     b'+1:lemma:mg/ml'
0.115342 Supp     b'-2:lemma:concentration'
0.114673 Anti     b'-2:lemma::'
0.113798 O        b'lemma:0.4'
0.110792 Supp     b'lemma:sodium'
0.106952 Gtype    b'+2:postag:VBN'
0.105174 Temp     b'+1:lemma:short'
0.104882 O        b'-1:lemma:5'
0.103539 Supp     b'lemma:in'
0.102222 O        b'-1:lemma:Iron'
0.102080 O        b'-2:lemma:mg/ml'
0.101457 O        b'+2:lemma:to'
0.101457 O        b'+2:postag:TO'
0.100867 Supp     b'+1:lemma:phosphate'
0.100797 O        b'-1:lemma:after'
0.097962 Supp     b'lemma:leucine'
0.097511 OD       b'+2:lemma:,'
0.097511 OD       b'+2:postag:,'
0.096491 Gtype    b'-1:lemma:vector'
0.092854 OD       b'-2:postag:IN'
0.091736 O        b'+1:lemma:o.d.'
0.091736 O        b'+2:lemma:600nm'
0.091478 Supp     b'-2:lemma:+'
0.090064 O        b'lemma:c'
0.088017 O        b'+1:lemma:be'
0.087673 Supp     b'-2:lemma:cell'
0.086825 O        b'-1:lemma:,'
0.086825 O        b'-1:postag:,'
0.086411 O        b'lemma:respiration'
0.086411 O        b'+2:lemma:mmol'
0.085423 Phase    b'+2:lemma:follow'
0.081598 Agit     b'+1:postag:-RRB-'
0.080743 Gtype    b'+1:lemma:nacl'
0.079550 OD       b'lemma:0.3-0.35'
0.079270 Med      b'+1:lemma:media'
0.076336 Temp     b'+2:lemma:and'
0.075294 Air      b'+1:postag:NN'
0.073624 Supp     b'+2:lemma:agitation'
0.073202 O        b'+1:lemma:co2'
0.072459 Strain   b'-2:lemma:strain'
0.071927 O        b'-2:lemma:Iron'
0.071286 Temp     b'lemma:30'
0.068634 Med      b'-1:lemma:2'
0.066598 Med      b'-1:lemma:-rrb-'
0.066109 Gtype    b'lemma:-rrb-'
0.065066 O        b'-1:lemma:grow'
0.062497 OD       b'-1:lemma:600nm'
0.062497 OD       b'-2:lemma:o.d.'
0.062497 OD       b'+2:lemma:anerobically'
0.062436 O        b'-1:lemma:w0002'
0.060388 Anti     b'+1:lemma:from'
0.059422 O        b'-1:lemma:phase'
0.059051 Gtype    b'-2:postag:-RRB-'
0.055828 O        b'lemma:and'
0.055778 Gtype    b'-1:lemma:Fur'
0.055758 O        b'lemma:Nac'
0.055539 Med      b'-1:postag:-RRB-'
0.054858 O        b'-2:lemma:final'
0.054708 Air      b'+1:postag:CC'
0.053562 OD       b'+2:postag:DT'
0.052702 O        b'lemma:cell'
0.052682 Temp     b'lemma:-lrb-'
0.050895 O        b'-2:lemma:37'
0.050858 Anti     b'-2:postag::'
0.050261 Temp     b'postag:-LRB-'
0.049357 O        b'-2:lemma:culture'
0.047739 O        b'+2:lemma:%'
0.044616 Anti     b'-1:lemma:polymerase'
0.043556 O        b'-1:lemma:n2'
0.042414 Anti     b'-2:lemma:rna'
0.042127 O        b'lemma:n2'
0.038866 Gtype    b'+2:lemma:2'
0.037492 Supp     b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
0.036308 Air      b'+2:lemma:5'
0.034788 O        b'+2:lemma:hour'
0.034772 Temp     b'+2:lemma:short'
0.033865 O        b'-1:lemma:anti-rpos'
0.033865 O        b'+1:lemma:neoclone'
0.033335 O        b'+1:lemma:anerobically'
0.033335 O        b'-2:lemma:600nm'
0.028256 O        b'+1:lemma:5'
0.025701 Gtype    b'lemma:factor'
0.025701 Gtype    b'-1:lemma:transcription'
0.025701 Gtype    b'+1:lemma:Fur'
0.024398 O        b'lemma:mg1655'
0.024207 O        b'+1:lemma:lb'
0.022785 Anti     b'-1:lemma:fnr'
0.021061 Supp     b'+1:lemma:and'
0.021026 Supp     b'+1:lemma:10'
0.020863 O        b'-2:lemma:mm'
0.017387 O        b'-2:lemma:lb'
0.016072 O        b'-2:lemma:treat'
0.015934 Gtype    b'-1:lemma:knock-out'
0.015934 Gtype    b'-2:lemma:crp'
0.015308 Supp     b'-1:lemma:iptg'
0.015163 Supp     b'lemma:mmol'
0.015163 Supp     b'+1:lemma:potassium'
0.015163 Supp     b'-2:lemma:respiration'
0.014816 Supp     b'postag:IN'
0.014750 Temp     b'+2:lemma:rnase'
0.014449 Supp     b'+2:lemma:nitrate'
0.014290 Med      b'+1:lemma:2'
0.014036 Air      b'+1:lemma:at'
0.013727 O        b'-2:lemma:n2'
0.013606 O        b'+2:lemma:5'
0.013441 O        b'+2:lemma:1'
0.013023 Supp     b'-2:lemma:\xc2\xb5m'
0.013023 Supp     b'+2:lemma:\xc2\xb5l'
0.012633 Supp     b'+1:lemma:300'
0.012053 O        b'+2:lemma:70'
0.012021 O        b'-2:lemma:genotype'
0.011776 O        b'lemma:10'
0.010955 O        b'+1:lemma:phase'
0.010869 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
0.010869 Supp     b'+2:lemma:cm20'
0.009586 O        b'-1:lemma:shake'
0.009206 Supp     b'lemma:mg/ml'
0.009206 Supp     b'-1:lemma:150'
0.008821 O        b'-1:lemma:at'
0.008761 Supp     b'+1:postag:CC'
0.008209 O        b'+1:lemma:with'
0.006668 O        b'+2:lemma:until'
0.006506 OD       b'lemma:600nm'
0.006506 OD       b'-1:lemma:o.d.'
0.006234 Med      b'+2:postag:CD'
0.005681 Gtype    b'-2:postag:-LRB-'
0.005352 O        b'-2:lemma:%'
0.005203 O        b'lemma:%'
0.004999 O        b'lemma:mm'
0.004759 Supp     b'-2:postag:CC'
0.004717 Temp     b'+2:postag:CC'
0.004429 Supp     b'-2:lemma:iptg'
0.004268 Supp     b'-2:lemma:stir'
0.004113 Air      b'-1:lemma:and'
0.003714 O        b'-1:lemma:induce'
0.003454 O        b'-2:lemma:or'
0.003109 Supp     b'+1:postag:RB'
0.002901 O        b'-1:lemma:genotype'
0.002627 Phase    b'+1:lemma:culture'
0.002523 O        b'+1:lemma:_'
0.002441 O        b'-1:lemma:mid-log'
0.002279 Technique b'+1:postag:NN'
0.002271 O        b'lemma:min'
0.002241 Supp     b'+1:lemma:nitrate'
0.002231 O        b'+1:lemma:43'
0.002069 Supp     b'lemma:potassium'
0.002069 Supp     b'-1:lemma:mmol'
0.001890 Agit     b'-2:lemma:-lrb-'
0.001880 O        b'+1:lemma:30'
0.001836 Agit     b'-2:postag:-LRB-'
0.001816 Phase    b'+1:postag:NNS'
0.001816 Supp     b'lemma:30'
0.001749 Med      b'+2:lemma:without'
0.001703 Phase    b'-1:lemma:the'
0.001637 Phase    b'-1:postag:DT'
0.001440 O        b'lemma:um'
0.001440 O        b'+2:lemma:paraquat'
0.001380 O        b'-2:lemma:2.5'
0.001365 Phase    b'+2:postag:VBN'
0.001363 O        b'lemma:short'
0.001363 O        b'+1:lemma:rnase'
0.001341 OD       b'+2:postag:NNS'
0.001244 Temp     b'-2:lemma:flask'
0.001231 Gtype    b'lemma:crp'
0.001184 O        b'-2:lemma:.2'
0.001154 O        b'lemma:genbank'
0.000855 OD       b'-2:postag:NN'
0.000760 O        b'+1:lemma:for'
0.000760 O        b'+2:lemma:30'
0.000754 Gtype    b'-1:postag:DT'
0.000752 Supp     b'-1:lemma:;'
0.000752 Supp     b'-2:lemma:7.6'
0.000714 Air      b'-2:lemma:,'
0.000714 Air      b'-2:postag:,'
0.000677 Supp     b'-1:lemma:wt'
0.000616 Gtype    b'+2:postag:JJ'
0.000602 O        b'+1:lemma:um'
0.000562 Med      b'+1:postag:VBN'
0.000527 O        b'-2:lemma:at'
0.000516 O        b'+2:lemma:grow'
0.000473 Phase    b'-2:postag:-RRB-'
0.000471 O        b'+2:lemma:glucose'
0.000464 Temp     b'+2:lemma:the'
0.000427 O        b'+2:postag:CC'
0.000396 O        b'-2:lemma:m9'
0.000393 Supp     b'+2:lemma:.'
0.000393 Supp     b'+2:postag:.'
0.000308 O        b'-1:lemma:with'
0.000227 Med      b'+2:lemma:2'
0.000217 O        b'-1:lemma:to'
0.000217 O        b'-1:postag:TO'
0.000155 O        b'-1:lemma:Aerobic'
0.000133 Gtype    b'-1:lemma:dfnr'
0.000125 O        b'lemma:C'
0.000112 Phase    b'+2:postag:NN'
0.000098 Supp     b'+1:lemma:7.6'
0.000098 Supp     b'-2:lemma:1m'
0.000098 Supp     b'+2:lemma:;'
0.000073 O        b'+1:lemma:glucose'
0.000053 O        b'+1:lemma:buffer'
0.000042 Supp     b'+1:postag:JJ'
0.000032 Vess     b'+1:postag:IN'
0.000032 Supp     b'-1:postag::'
0.000032 O        b'-2:lemma:m63'
0.000027 Supp     b'+2:postag:JJ'
0.000026 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
0.000024 Med      b'-1:lemma::'
0.000022 Med      b'+2:postag:-RRB-'
0.000021 Supp     b'lemma:ph'
0.000015 O        b'-1:lemma:fnr'
0.000012 Med      b'-2:lemma::'
0.000010 Supp     b'-2:postag:NNS'
0.000006 Supp     b'+2:lemma:,'
0.000006 Supp     b'+2:postag:,'
0.000002 Air      b'+2:lemma:95'
0.000001 O        b'+1:lemma:genbank'
-0.000001 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.000002 Med      b'-2:postag:CC'
-0.000005 Gtype    b'postag:CD'
-0.000022 O        b'+1:lemma:10'
-0.000028 O        b'+1:lemma:ph'
-0.000029 O        b'-2:lemma:ph'
-0.000045 O        b'-2:lemma:10'
-0.000061 O        b'lemma:150'
-0.000061 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.000061 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.000098 Air      b'postag:CD'
-0.000102 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.000151 Temp     b'+2:postag:IN'
-0.000161 Gtype    b'-1:postag:JJ'
-0.000167 Med      b'postag:JJ'
-0.000213 Temp     b'postag:JJ'
-0.000247 O        b'+2:lemma:co2'
-0.000266 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.000345 Supp     b'-2:lemma:with'
-0.000711 Air      b'lemma:,'
-0.000711 Air      b'postag:,'
-0.000886 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.000963 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.001032 O        b'-2:lemma:cell'
-0.001033 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.001175 Air      b'+1:postag:CD'
-0.001254 O        b'+2:lemma:follow'
-0.001568 Air      b'postag:CC'
-0.001688 OD       b'+2:postag:NN'
-0.002079 O        b'lemma:phase'
-0.002191 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.002301 Supp     b'-2:postag:IN'
-0.002690 OD       b'postag:NN'
-0.003804 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.003962 Air      b'postag:-RRB-'
-0.003992 O        b'-2:postag:DT'
-0.004297 Supp     b'-1:postag:NN'
-0.004717 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.005027 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.005787 O        b'-2:lemma:to'
-0.005787 O        b'-2:postag:TO'
-0.005843 O        b'+2:lemma:rnase'
-0.005850 O        b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.006026 O        b'+2:lemma:at'
-0.006083 O        b'+1:postag:CD'
-0.006367 Air      b'+1:postag:-RRB-'
-0.006591 Phase    b'-1:lemma:at'
-0.007273 O        b'+1:lemma:b'
-0.007411 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.007620 O        b'+1:lemma:300'
-0.008111 O        b'-2:lemma:grow'
-0.008137 Air      b'-1:lemma:-lrb-'
-0.008788 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.009610 Supp     b'-2:lemma:,'
-0.009610 Supp     b'-2:postag:,'
-0.013850 Technique b'-1:postag::'
-0.014702 Technique b'-2:postag:NN'
-0.015832 O        b'-1:postag:DT'
-0.016722 O        b'lemma:od600'
-0.017503 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.019372 O        b'+2:postag:DT'
-0.019416 Air      b'+2:lemma:70'
-0.021209 Air      b'-1:lemma:n2'
-0.022574 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.028221 O        b'-2:lemma:and'
-0.030872 O        b'-1:lemma:.'
-0.030872 O        b'-1:postag:.'
-0.032102 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.036750 O        b'+2:lemma:genome'
-0.038188 O        b'+1:lemma:hour'
-0.039135 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.040300 O        b'lemma:m63'
-0.040472 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.041664 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.042813 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.042813 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.042813 O        b'+2:lemma:vol'
-0.043634 O        b'+2:lemma:~'
-0.044750 O        b'+2:lemma:total'
-0.045004 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.045114 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.046849 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.047267 O        b'+1:lemma:media'
-0.049277 O        b'+2:lemma:in'
-0.050803 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.051713 O        b'+1:lemma:of'
-0.052928 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.056882 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.057419 O        b'lemma:;'
-0.057419 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.061626 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.061641 O        b'lemma:ph'
-0.062445 Air      b'+2:lemma:,'
-0.062445 Air      b'+2:postag:,'
-0.064009 O        b'+1:lemma:~'
-0.066550 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.072491 O        b'lemma:sample'
-0.077141 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.077271 O        b'+2:lemma:ph'
-0.077609 O        b'+1:lemma:m'
-0.080776 O        b'-2:lemma:glucose'
-0.082984 O        b'+2:postag:RB'
-0.083074 Air      b'-1:postag:CC'
-0.083979 O        b'lemma:dissolve'
-0.083979 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.084777 Air      b'+2:postag:CC'
-0.087933 Med      b'-1:postag:IN'
-0.094361 Med      b'+1:postag:IN'
-0.094705 Air      b'lemma:n2'
-0.096806 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.098602 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.098847 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.099865 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.101772 Supp     b'lemma:,'
-0.101772 Supp     b'postag:,'
-0.107410 Supp     b'+2:postag:NNS'
-0.108716 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.109914 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.112451 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.112860 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.116487 O        b'+1:lemma:mm'
-0.116729 O        b'+2:lemma:tag'
-0.124273 O        b'lemma:7.6'
-0.124273 O        b'+1:lemma:;'
-0.126199 O        b'-2:lemma:20'
-0.126323 O        b'+1:lemma:a'
-0.127945 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.128722 Air      b'+2:lemma:-rrb-'
-0.129802 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.132471 Supp     b'postag:CD'
-0.132917 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.133815 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.136670 O        b'lemma:nh4cl'
-0.140253 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.145513 O        b'-1:lemma:~'
-0.146623 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.147570 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.148506 Air      b'+2:postag:-RRB-'
-0.150892 O        b'lemma:pahse'
-0.151932 O        b'-2:postag::'
-0.158806 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.160447 O        b'+2:lemma:10'
-0.160753 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.163984 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.171143 O        b'-1:lemma:of'
-0.172009 O        b'-2:lemma:of'
-0.178787 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.180837 O        b'-1:lemma:contain'
-0.182409 Supp     b'lemma:mm'
-0.188726 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.189086 O        b'-1:lemma:until'
-0.192159 Gtype    b'postag:VBG'
-0.196258 O        b'-1:lemma:mm'
-0.209501 Air      b'-1:lemma:,'
-0.209501 Air      b'-1:postag:,'
-0.219013 Med      b'postag:CD'
-0.219202 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.226375 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.227424 O        b'-1:lemma:final'
-0.239301 O        b'lemma:fecl2'
-0.243179 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.246021 O        b'lemma:0.1'
-0.249941 Air      b'-2:lemma:n2'
-0.251037 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.252351 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.253684 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.254041 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.254826 O        b'lemma:0.2'
-0.255180 O        b'-1:lemma:the'
-0.255837 O        b'lemma:1m'
-0.263032 O        b'lemma:nitrate'
-0.267716 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.272785 Med      b'-1:postag:NN'
-0.274409 O        b'lemma:medium'
-0.278943 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.280654 O        b'-2:lemma:until'
-0.280741 O        b'-1:postag:IN'
-0.285848 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.290062 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.290062 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.294617 Air      b'+2:postag:IN'
-0.297643 O        b'+2:lemma:m9'
-0.301893 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.304215 O        b'+2:lemma:+'
-0.309732 O        b'+2:lemma:.'
-0.309732 O        b'+2:postag:.'
-0.326380 O        b'-1:lemma:1m'
-0.326380 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.327905 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.328381 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.331796 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.333974 O        b'+1:lemma:%'
-0.334792 O        b'+1:postag:DT'
-0.336014 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.340862 O        b'-1:lemma:ml'
-0.349234 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.350789 O        b'-2:postag:VBG'
-0.365707 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.395568 O        b'-2:lemma:genome'
-0.406115 O        b'+2:lemma:add'
-0.407052 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.413270 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.425790 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.427044 Air      b'-2:postag:CC'
-0.430866 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.432830 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.435236 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.440037 O        b'+1:postag:IN'
-0.440630 O        b'-2:lemma:iptg'
-0.442829 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.456085 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.472676 Med      b'+1:postag:NN'
-0.476697 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.482726 Gtype    b'-2:postag:CD'
-0.486405 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.486405 Supp     b'+1:postag:,'
-0.496633 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.512557 O        b'+1:lemma:1m'
-0.512557 O        b'-2:lemma:vol'
-0.517729 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.522680 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.526930 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.527742 Supp     b'lemma:2'
-0.534735 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.555970 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.556620 O        b'+1:lemma:+'
-0.572668 O        b'-2:lemma:IP'
-0.586251 O        b'-1:lemma:vol'
-0.586251 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.586251 O        b'+2:lemma:1m'
-0.633922 pH       b'postag:NN'
-0.634493 O        b'lemma:aerobic'
-0.651492 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.661288 O        b'lemma:mid-log'
-0.697917 O        b'lemma:minimal'
-0.726381 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.774470 O        b'-2:postag:SYM'
-0.775356 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.788441 Temp     b'postag:NN'
-0.817779 O        b'+1:lemma:at'
-0.832169 O        b'-1:postag::'
-0.833753 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.839899 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.851136 O        b'-2:lemma::'
-0.851235 O        b'+2:lemma:b'
-0.853974 O        b'lemma:of'
-0.876284 Anti     b'postag:NNP'
-0.899651 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.905250 O        b'-2:lemma:media'
-0.918145 O        b'-1:lemma:IP'
-0.936378 O        b'lemma:wt'
-0.949407 Air      b'postag:NN'
-1.000611 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-1.070337 O        b'+1:lemma:in'
-1.144119 O        b'-1:lemma:ph'
-1.198974 Supp     b'postag:JJ'
-1.228118 O        b'-2:lemma:the'
-1.254816 O        b'-1:lemma:30'
-1.299729 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.302232 O        b'lemma:30'
-1.313697 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.330050 OD       b'+1:postag:NN'
-1.377978 O        b'-1:lemma:co2'
-1.392282 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.395517 O        b'-1:lemma:1'
-1.511210 O        b'lemma:aerobically'
-1.538215 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.577403 O        b'-2:lemma:0.3'
-1.581362 O        b'lemma:media'
-1.581708 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-1.593202 O        b'lemma:rifampicin'
-1.678298 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.684538 Phase    b'postag:JJ'
-1.948904 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-2.016859 O        b'lemma:0.3'
-2.175293 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.236915 O        b'-1:lemma:sample'
-2.505380 O        b'-1:lemma:2'
-2.850653 O        b'+1:lemma:1'
-2.877501 O        b'+1:lemma:2'
-4.084812 O        b'-1:lemma::'
-4.637477 O        b'-1:lemma:_'