report_Run5_v11.txt 37.7 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.11527309375814619, 'c2': 0.0007142903984410407}
best CV score:0.826756700790382
model size: 0.08M

Flat F1: 0.8183709699306458
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.595     0.568     0.581        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.925     0.795     0.855        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.864     0.838     0.851       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.860     0.785     0.818       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    5.779155
Med    -> Med     5.771266
OD     -> OD      5.482515
Gtype  -> Gtype   5.482078
Anti   -> Anti    5.472543
Supp   -> Supp    5.143678
Gversion -> Gversion 4.690733
O      -> O       4.664585
Air    -> Air     4.369471
Phase  -> Phase   4.148643
Agit   -> Agit    4.085440
Technique -> Technique 3.804596
pH     -> pH      2.781030
Substrain -> Gtype   2.045377
Gtype  -> Supp    1.277260
O      -> Gtype   0.981116
O      -> Technique 0.840686
O      -> Supp    0.652290
Technique -> Air     0.311671
Air    -> O       0.246398
Med    -> O       0.236063
Temp   -> O       0.192609
O      -> Med     0.042860
Anti   -> O       0.021313
O      -> pH      0.011135
O      -> Agit    0.009892
O      -> Gversion 0.004982
Phase  -> Air     0.000420
O      -> OD      -0.002481
OD     -> O       -0.069161
Technique -> O       -0.070663
Anti   -> Supp    -0.088861
Phase  -> O       -0.121606
Supp   -> O       -0.155840
O      -> Phase   -0.168448
Agit   -> Air     -0.201487
Temp   -> Med     -0.500580
Supp   -> Med     -0.549978
Gtype  -> O       -0.636834
Technique -> pH      -0.661482
O      -> Air     -0.927249
Phase  -> OD      -1.432028
Technique -> Gtype   -1.507254
Substrain -> O       -1.646472
Med    -> Supp    -1.953657


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    5.779155
Med    -> Med     5.771266
OD     -> OD      5.482515
Gtype  -> Gtype   5.482078
Anti   -> Anti    5.472543
Supp   -> Supp    5.143678
Gversion -> Gversion 4.690733
O      -> O       4.664585
Air    -> Air     4.369471
Phase  -> Phase   4.148643
Agit   -> Agit    4.085440
Technique -> Technique 3.804596
pH     -> pH      2.781030
Substrain -> Gtype   2.045377
Gtype  -> Supp    1.277260
O      -> Gtype   0.981116
O      -> Technique 0.840686
O      -> Supp    0.652290
Technique -> Air     0.311671
Air    -> O       0.246398
Med    -> O       0.236063
Temp   -> O       0.192609
O      -> Med     0.042860
Anti   -> O       0.021313
O      -> pH      0.011135
O      -> Agit    0.009892
O      -> Gversion 0.004982
Phase  -> Air     0.000420
O      -> OD      -0.002481
OD     -> O       -0.069161
Technique -> O       -0.070663
Anti   -> Supp    -0.088861
Phase  -> O       -0.121606
Supp   -> O       -0.155840
O      -> Phase   -0.168448
Agit   -> Air     -0.201487
Temp   -> Med     -0.500580
Supp   -> Med     -0.549978
Gtype  -> O       -0.636834
Technique -> pH      -0.661482
O      -> Air     -0.927249
Phase  -> OD      -1.432028
Technique -> Gtype   -1.507254
Substrain -> O       -1.646472
Med    -> Supp    -1.953657


Top positive:
8.618447 Supp     b'-2:lemma:shake'
8.382862 Phase    b'lemma:mid-log'
8.367079 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
8.199997 O        b'lemma:1'
7.807935 Gtype    b'lemma:type'
7.563209 Air      b'lemma:anaerobic'
7.474993 O        b'-2:lemma:_'
7.432784 O        b'lemma:2'
7.145254 O        b'lemma:_'
7.059441 Med      b'lemma:MOPS'
7.022345 Gtype    b'lemma:wt'
7.008471 O        b'lemma:3'
6.916272 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
6.901693 Supp     b'lemma:no3'
6.736617 Anti     b'-2:lemma:antibody'
6.685447 Supp     b'lemma:Iron'
6.685447 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
6.577181 O        b'postag:VBG'
6.568883 Air      b'lemma:aerobic'
6.545913 Supp     b'lemma:pq'
6.468772 Technique b'lemma:chipseq'
6.445276 Phase    b'-2:lemma:phase'
6.413269 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
6.213183 Technique b'+2:lemma:ph5'
6.144313 O        b'lemma:-'
6.126521 Strain   b'lemma:k-12'
5.984662 O        b'lemma:b'
5.540207 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
5.242931 O        b'lemma:with'
5.226969 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
5.223342 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
5.203264 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
5.199591 Gtype    b'lemma:pk4854'
5.141858 Supp     b'lemma:nh4cl'
5.140730 O        b'lemma:rpob'
5.140182 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
5.122656 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
5.107390 Med      b'lemma:LB'
4.922504 Supp     b'lemma:acetate'
4.782329 O        b'lemma:Cra'
4.772767 Supp     b'lemma:glucose'
4.760930 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.703116 O        b'+2:lemma:crp'
4.680769 Technique b'lemma:rna-seq'
4.568773 Supp     b'lemma:2h'
4.568773 Supp     b'-1:lemma:additional'
4.550188 O        b'lemma:.'
4.550188 O        b'postag:.'
4.520834 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
4.493398 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
4.394149 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
4.381664 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
4.346704 Supp     b'lemma:iptg'
4.300045 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
4.287732 O        b'-2:lemma:myc'
4.228000 Supp     b'lemma:arginine'
4.189609 Gtype    b'+1:lemma:type'
4.145376 O        b'-1:lemma:tag'
4.104093 O        b'postag:IN'
4.069385 Technique b'-2:lemma:Fur'
4.044774 Gtype    b'lemma:dfnr'
4.034521 O        b'-1:postag:NNS'
4.015135 Air      b'lemma:aerobically'
3.994489 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
3.984542 Substrain b'lemma:mg1655'
3.973822 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
3.925159 O        b'lemma:rep2'
3.925159 O        b'lemma:rep1'
3.828333 O        b'lemma:soxr'
3.828333 O        b'lemma:soxs'
3.726180 Med      b'+1:lemma:g/l'
3.698397 Supp     b'+2:lemma:iptg'
3.688090 Supp     b'lemma:nacl'
3.681447 O        b'lemma:a'
3.672146 Temp     b'-1:lemma:sample'
3.665427 Gtype    b'-2:lemma:delta'
3.657065 Technique b'lemma:chip-seq'
3.655407 pH       b'lemma:ph5'
3.655407 pH       b'+1:lemma:.5'
3.646503 Supp     b'-1:lemma:Cra'
3.620078 Technique b'lemma:chip-exo'
3.590886 O        b'lemma:gadx'
3.574758 Med      b'+2:lemma:b2'
3.545493 O        b'-1:lemma:lb'
3.483014 O        b'-1:lemma:type'
3.478535 Med      b'lemma:lb'
3.453274 O        b'+1:postag:RB'
3.400011 O        b'-1:lemma:glucose'
3.396068 O        b'postag:VBN'
3.378335 O        b'+1:lemma:wt'
3.377441 O        b'lemma:harbor'
3.350801 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.344331 Med      b'lemma:media'
3.307336 Technique b'-1:lemma:input'
3.298680 O        b'lemma:CEL'
3.264914 Air      b'-2:lemma:IP'
3.232429 Air      b'postag:RB'
3.209856 O        b'postag::'
3.200655 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
3.174387 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
3.161378 O        b'-1:lemma:0.3'
3.150753 Phase    b'lemma:stationary'
3.150753 Phase    b'lemma:exponential'
3.146015 Med      b'+2:lemma:b1'
3.129615 O        b'+1:lemma:250'
3.105860 Supp     b'lemma:rifampicin'
3.102800 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.094456 O        b'lemma:culture'
3.077441 Supp     b'-1:lemma:with'
3.052353 Supp     b'lemma:Adenine'
3.046727 O        b'-2:lemma:flagtag'
3.039570 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.993703 Supp     b'-2:lemma:purr'
2.965110 O        b'+1:lemma:od600'
2.939598 O        b'lemma:ompr'
2.922788 O        b'lemma:at'
2.920260 Supp     b'+1:lemma:1'
2.883064 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.847390 O        b'lemma:oxyr'
2.814960 pH       b'lemma:5.5'
2.806780 Temp     b'lemma:43'
2.790017 OD       b'lemma:od450'
2.758994 Supp     b'+1:lemma:2'
2.724114 Supp     b'lemma:fructose'
2.717357 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
2.709396 O        b'lemma:for'
2.701587 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.699480 Temp     b'lemma:37'
2.696838 Air      b'-2:lemma:fnr'
2.690384 O        b'lemma:chip'
2.686567 Supp     b'-1:lemma:+'
2.685490 pH       b'+1:lemma:5.5'
2.680393 Med      b'lemma:m63'
2.657054 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.632891 O        b'postag:VBD'
2.613922 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
2.613922 Gtype    b'+2:lemma:.5'
2.599525 Supp     b'-2:lemma:media'
2.585519 Temp     b'-2:lemma:keep'
2.550906 Gtype    b'lemma:ptac'
2.521680 Supp     b'lemma:Leu'
2.521680 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
2.515782 Temp     b'-1:lemma:37'
2.514683 O        b'-1:lemma:min'
2.507659 O        b'+1:lemma:rifampicin'
2.483656 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.452590 Gversion b'lemma:.2'
2.452590 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.449854 O        b'lemma:ml'
2.447105 O        b'-2:lemma:medium'
2.437943 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
2.426230 Air      b'-1:lemma:-'
2.411129 O        b'-1:lemma:into'
2.410447 O        b'postag:CC'
2.387351 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.387213 O        b'+1:lemma:20'
2.381414 O        b'lemma::'
2.364451 O        b'lemma:genotype/variation'
2.357225 Phase    b'-2:lemma:until'
2.356204 Technique b'lemma:rnaseq'
2.356078 Air      b'lemma:anaeroibc'
2.354445 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.337398 Supp     b'-2:lemma:agent'
2.326070 Gversion b'lemma:asm584v2'
2.323300 O        b'-2:lemma:overnight'
2.313673 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.313673 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.306576 Gtype    b'lemma:wild-type'
2.294696 Gversion b'lemma:u00096'
2.294696 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.291093 O        b'postag:DT'
2.278593 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.275176 Gversion b'-2:lemma:build'
2.269912 OD       b'lemma:0.3'
2.224967 O        b'+1:postag:NNP'
2.221841 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
2.207572 Vess     b'lemma:flask'
2.207572 Vess     b'-1:lemma:warm'
2.207572 Vess     b'-2:lemma:pre'
2.207572 Vess     b'+2:lemma:43'
2.187493 Med      b'+2:postag:CC'
2.182718 Med      b'+1:lemma:0.4'
2.173473 Supp     b'-2:lemma:argr'
2.149014 O        b'lemma:A'
2.126675 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.052815 Agit     b'lemma:rpm'
2.045246 Technique b'-2:lemma:Nac'
2.037611 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
2.037611 Gtype    b'-1:lemma:old'
2.037611 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
2.035008 Gtype    b'postag:JJ'
2.031939 pH       b'+1:postag:CD'
2.031438 O        b'postag:NNS'
2.029540 Agit     b'-1:lemma:250'
2.029113 Technique b'-1:lemma:IP'
2.026716 O        b'-2:lemma:min'
2.021933 O        b'lemma:input'
2.021933 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.980781 Gversion b'lemma:000913'
1.980781 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.980528 O        b'-2:lemma:='
1.973081 O        b'lemma:argr'
1.972224 O        b'lemma:purr'
1.917539 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.898521 O        b'-1:lemma:nacl'
1.890303 pH       b'lemma:.5'
1.890303 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.887812 Supp     b'-1:lemma:potassium'
1.887812 Supp     b'-2:lemma:mmol'
1.885728 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.885728 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.869599 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
1.851487 O        b'lemma:affyexp'
1.846323 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.846323 Strain   b'-2:lemma:str'
1.800325 Temp     b'-1:lemma:43'
1.791142 O        b'+1:lemma:acetate'
1.782421 Med      b'-1:lemma:ml'
1.769469 OD       b'+1:lemma:of'
1.758616 Supp     b'-1:lemma:without'
1.754828 Supp     b'+2:lemma:feso4'
1.744401 Supp     b'-1:lemma:ompr'
1.740676 O        b'-1:lemma:antibody'
1.740541 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.739069 O        b'lemma:trpr'
1.728134 O        b'lemma:growth'
1.723115 O        b'+1:lemma:coli'
1.718806 Air      b'-2:lemma:%'
1.675699 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.670666 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.650164 Gtype    b'+1:lemma:pq'
1.646002 O        b'+2:lemma:allow'
1.643221 O        b'-2:lemma:fructose'
1.640594 O        b'lemma:cra'
1.637914 OD       b'-2:lemma:od450'
1.626990 Supp     b'-1:lemma:final'
1.626045 O        b'lemma:fresh'
1.617540 O        b'-1:lemma:l1'
1.596443 Supp     b'-1:lemma:_'
1.595242 O        b'lemma:genotype'
1.594208 Air      b'+2:lemma:37'
1.587783 Air      b'postag:JJ'
1.587245 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.584948 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.584948 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.579055 Supp     b'-2:lemma:10'
1.570313 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.569527 O        b'lemma:from'
1.568014 Anti     b'postag:JJ'
1.553773 O        b'lemma:\xcf\x8332'
1.552760 Med      b'+2:lemma:+'
1.552612 Gtype    b'lemma:ryhb'
1.546244 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.519936 O        b'-2:lemma:co2'
1.511248 Agit     b'+2:lemma:at'
1.510774 O        b'-2:lemma:~'
1.504627 Technique b'-1:lemma:_'
1.502858 Supp     b'lemma:dpd'
1.502549 Supp     b'+1:lemma:_'
1.502065 Supp     b'-2:lemma:20'
1.500844 Air      b'-1:lemma:co2'
1.500451 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.487497 Air      b'-2:lemma:cm20'
1.478580 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.472775 Supp     b'-1:postag:CD'
1.472044 Gtype    b'+1:postag::'
1.468871 Supp     b'lemma:Fe'
1.443106 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.434819 Med      b'lemma:medium'
1.433554 O        b'-1:lemma:dpd'
1.431699 O        b'+1:lemma:0.2'
1.427931 O        b'+1:lemma::'
1.417975 O        b'+2:lemma:_'
1.417901 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.415560 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.413184 Supp     b'+2:lemma:mid-log'
1.410465 Agit     b'lemma:250'
1.405255 O        b'-1:lemma:wt'
1.389827 Med      b'lemma:minimal'
1.381905 Supp     b'lemma:glutamine'
1.381905 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
1.381509 Supp     b'-2:lemma:for'
1.377090 Air      b'-2:postag:CD'
1.371215 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.369910 O        b'lemma:additional'
1.369910 O        b'+1:lemma:2h'
1.366373 Vess     b'+1:lemma:at'
1.361473 O        b'+2:postag:JJ'
1.354057 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.351146 Med      b'+1:lemma:+'
1.345562 Anti     b'-1:lemma:myc'
1.345562 Anti     b'-2:lemma:9e10'
1.340466 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.340466 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.333894 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.326133 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.317919 Supp     b'-1:lemma:30'
1.309876 Supp     b'lemma:20'
1.306181 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.295035 O        b'+1:lemma:pq'
1.288417 OD       b'-1:lemma:od450'
1.283374 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
1.281389 Technique b'-2:lemma:wt'
1.279922 Substrain b'-1:lemma:.'
1.279922 Substrain b'-1:postag:.'
1.279757 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.258342 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.254677 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.254612 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.249139 O        b'+1:lemma:k-12'
1.245899 Supp     b'+2:lemma:add'
1.240707 O        b'+2:lemma:fructose'
1.237492 O        b'+2:lemma:constant'
1.231776 O        b'lemma:old'
1.231776 O        b'-1:lemma:seqa'
1.231776 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
1.215317 Gversion b'lemma:nc'
1.215317 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.204821 Air      b'lemma:%'
1.204616 O        b'postag:-RRB-'
1.199483 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.190208 Supp     b'-1:postag:SYM'
1.161200 OD       b'-2:lemma:phase'
1.159211 O        b'-2:lemma:250'
1.156823 OD       b'lemma:od600'
1.154212 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.154212 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.150625 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.141781 O        b'lemma:be'
1.139077 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.139077 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.129474 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
1.128881 Air      b'+1:lemma:b'
1.125846 O        b'+2:lemma:wt'
1.121382 OD       b'+2:lemma:culture'
1.121061 Supp     b'+2:lemma:ph'
1.121045 Agit     b'-2:postag:RB'
1.119548 Supp     b'lemma:0.2'
1.117305 Gtype    b'+2:lemma:lacz'
1.107895 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.097447 O        b'postag:JJ'
1.091010 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.090102 O        b'+2:lemma:chipseq'
1.076701 O        b'+2:lemma:of'
1.074784 OD       b'postag:CD'
1.072522 pH       b'postag:CD'
1.071943 Supp     b'postag:NNP'
1.067519 O        b'-1:postag:NNP'
1.063665 O        b'+2:lemma:ml'
1.052351 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
1.048743 OD       b'+1:postag:IN'
1.048508 O        b'+1:lemma:43'
1.041640 Gtype    b'-2:lemma:the'
1.040684 O        b'+2:postag:NNP'
1.036173 Med      b'-1:postag:JJ'
1.033411 Phase    b'+1:lemma:phase'
1.031442 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.027937 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.027059 O        b'-2:lemma:in'
1.025048 Med      b'-2:lemma:fresh'
1.022712 Supp     b'+1:lemma:be'
1.018847 Gtype    b'+2:postag::'
1.012271 OD       b'-1:postag:IN'
1.007650 Supp     b'-2:lemma:condition'
1.007166 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.007058 Supp     b'-1:lemma:mm'
1.005349 Gversion b'postag:CD'
1.005304 O        b'lemma:rnase'
1.004568 O        b'lemma:or'
1.003561 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
1.001553 Supp     b'-1:lemma:sodium'
1.001553 Supp     b'+2:lemma:1/100'
0.997648 Supp     b'-2:lemma:pahse'
0.995514 pH       b'-2:lemma:at'
0.993411 Med      b'lemma:2'
0.989365 Med      b'+1:postag:-LRB-'
0.988189 Med      b'-2:postag:JJ'
0.986368 Substrain b'+2:lemma::'
0.985205 Air      b'+1:lemma:%'
0.983549 Supp     b'+2:postag:IN'
0.978231 Supp     b'-1:lemma:vol'
0.978231 Supp     b'-2:lemma:1/100'
0.978231 Supp     b'+2:lemma:1m'
0.977440 Gtype    b'-1:lemma:_'
0.977118 O        b'postag:-LRB-'
0.971311 Air      b'+2:lemma:%'
0.969900 O        b'lemma:chip-arca'
0.969900 O        b'+2:lemma:arca8myc'
0.966699 OD       b'lemma:of'
0.965851 pH       b'-1:lemma:ph'
0.964192 pH       b'lemma:ph'
0.960881 O        b'-1:lemma:aerobic'
0.956600 Air      b'+2:postag:CD'
0.955055 O        b'+1:postag::'
0.948787 Gtype    b'+2:postag:NN'
0.941518 O        b'-1:lemma:pq'
0.939570 Air      b'lemma:Anaerobic'
0.937488 O        b'+1:postag:NN'
0.936908 Med      b'postag:NNP'
0.926568 O        b'-1:lemma:genbank'
0.915753 Anti     b'lemma:antibody'
0.911031 O        b'+1:lemma:sparging'
0.909409 Technique b'-1:lemma:1'
0.904920 Gtype    b'-1:postag:VBP'
0.902759 O        b'+2:postag:VB'
0.902246 O        b'lemma:-rrb-'
0.897974 Supp     b'-1:lemma:respiration'
0.897974 Supp     b'+1:lemma:mmol'
0.897974 Supp     b'+2:lemma:potassium'
0.897614 Supp     b'lemma:of'
0.896850 Med      b'-2:lemma:minimal'
0.895125 Technique b'lemma:-rrb-'
0.891000 Air      b'-1:postag:CD'
0.889616 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.887600 OD       b'+2:postag:CD'
0.885408 Supp     b'lemma:30'
0.883019 Supp     b'-1:lemma:0.2'
0.881818 Med      b'-1:lemma:glucose'
0.881532 Temp     b'+1:lemma:see'
0.881355 O        b'lemma:s'
0.881355 O        b'-2:lemma:parameter'
0.879125 Gtype    b'postag:-RRB-'
0.878105 Supp     b'lemma:0.1'
0.872816 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
0.871216 OD       b'postag:IN'
0.870763 Supp     b'+1:postag:VBD'
0.867719 Air      b'-1:postag::'
0.863619 O        b'postag:FW'
0.861630 Gversion b'+1:postag:CD'
0.861462 Supp     b'+2:lemma:be'
0.856061 O        b'+1:lemma:ph5'
0.856061 O        b'+2:lemma:.5'
0.852776 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.852776 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.844836 Gtype    b'lemma:wild'
0.844680 Phase    b'-2:postag:IN'
0.843502 Phase    b'postag:NN'
0.837479 Supp     b'-2:lemma:trpr'
0.834488 Air      b'-2:lemma:0.3'
0.828083 Med      b'-1:lemma:in'
0.815194 O        b'+1:postag:VBZ'
0.814099 OD       b'+2:lemma:~'
0.812791 O        b'+2:postag:NN'
0.810331 O        b'-1:postag:JJ'
0.808035 O        b'-1:lemma:rpm'
0.807670 Gtype    b'-1:lemma:phtpg'
0.799320 Supp     b'-1:postag:CC'
0.799142 O        b'+1:lemma:nacl'
0.799041 O        b'-1:lemma:medium'
0.798167 Air      b'-1:lemma:%'
0.794603 Phase    b'lemma:phase'
0.792610 O        b'+2:postag:VBD'
0.790081 O        b'-1:postag:NN'
0.786031 Gtype    b'lemma:the'
0.785709 Technique b'-2:postag:NNP'
0.783307 O        b'lemma:treatment'
0.777138 OD       b'-1:lemma:od600'
0.776915 Phase    b'+2:lemma:follow'
0.775831 Med      b'-1:lemma:LB'
0.775831 Med      b'+2:lemma:1mm'
0.775337 O        b'+1:postag:VBN'
0.771473 Substrain b'+2:postag::'
0.771233 Temp     b'+2:postag:DT'
0.766762 pH       b'-2:lemma:glucose'
0.763591 OD       b'-2:lemma:od600'
0.746807 Air      b'-2:postag:SYM'
0.746544 Gtype    b'+1:lemma:the'
0.742512 O        b'lemma:to'
0.742512 O        b'postag:TO'
0.739285 Supp     b'-2:lemma:nitrate'
0.738149 Technique b'lemma:-lrb-'
0.735480 O        b'+1:lemma:dpd'
0.733878 O        b'+2:lemma:rpm'
0.730052 Technique b'postag:-LRB-'
0.729278 O        b'-1:lemma:aerobically'
0.727699 O        b'+1:lemma:old'
0.727699 O        b'+2:lemma:deltaseqa'
0.726420 Med      b'+1:lemma:medium'
0.724592 O        b'lemma:-lrb-'
0.719232 Supp     b'-1:lemma:contain'
0.718417 O        b'lemma:4'
0.718231 Air      b'+1:lemma:until'
0.716544 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.715804 O        b'-1:lemma:w0002'
0.715108 Supp     b'+1:postag:NN'
0.713038 O        b'-1:postag:RB'
0.712235 Supp     b'-1:postag:IN'
0.708890 O        b'-1:lemma:4'
0.707706 O        b'-1:lemma:0.35'
0.705183 Gtype    b'lemma:fnr-8myc'
0.702249 Phase    b'-1:lemma:until'
0.701904 Gtype    b'-2:postag:JJ'
0.700060 Gtype    b'+2:postag:CD'
0.699264 Supp     b'-2:postag:CD'
0.696834 Gtype    b'-1:lemma:harbor'
0.694273 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.692803 Phase    b'lemma:pahse'
0.690687 O        b'-1:lemma:fructose'
0.689978 Gtype    b'-2:postag::'
0.686836 O        b'-2:lemma:twice'


Top negative:
0.071344 Anti     b'-2:lemma::'
0.066628 O        b'+1:lemma:phosphate'
0.066071 O        b'lemma:n2'
0.064720 Phase    b'+2:lemma:at'
0.062621 Supp     b'+1:lemma:m'
0.062362 O        b'lemma:10'
0.061805 O        b'+2:lemma:='
0.061745 O        b'-2:postag:JJ'
0.060923 O        b'-1:lemma:m63'
0.059780 Phase    b'+1:postag:RB'
0.058273 Phase    b'-1:postag:IN'
0.058011 Med      b'+2:lemma:2'
0.056927 Gtype    b'+1:postag:CD'
0.056531 Anti     b'-1:postag:JJ'
0.055624 O        b'+1:lemma:0.4'
0.055275 O        b'-2:lemma:sample'
0.053700 Air      b'-2:lemma:n2'
0.053491 O        b'+1:lemma:to'
0.053491 O        b'+1:postag:TO'
0.051943 Gtype    b'+2:postag:VBN'
0.050561 OD       b'+1:postag:JJ'
0.050464 O        b'+2:lemma:phase'
0.048451 O        b'+1:lemma:lb'
0.048446 Air      b'-1:lemma:o2'
0.045785 O        b'-1:lemma:%'
0.044308 O        b'-1:lemma:0.3-0.35'
0.044109 Air      b'+1:lemma:and'
0.043096 O        b'+2:lemma:a'
0.042017 Gtype    b'+2:postag:NNP'
0.040999 O        b'+1:lemma:culture'
0.040926 O        b'-2:lemma:strain'
0.040762 O        b'lemma:sodium'
0.039864 O        b'lemma:induction'
0.039604 Temp     b'+1:postag:JJ'
0.039535 O        b'lemma:+'
0.039268 Phase    b'+2:lemma:for'
0.038500 Gtype    b'-2:postag:DT'
0.037304 O        b'-1:lemma:;'
0.037304 O        b'-2:lemma:7.6'
0.035667 O        b'-2:lemma:genotype'
0.034180 O        b'-2:lemma:0.2'
0.033703 O        b'-1:lemma:n2'
0.033410 O        b'+2:lemma:0.3'
0.030695 OD       b'-1:postag:JJ'
0.030653 O        b'+2:lemma:glucose'
0.030016 Air      b'-2:lemma:grow'
0.029594 Phase    b'+2:postag:IN'
0.029371 O        b'-2:lemma:;'
0.028287 O        b'+2:lemma:dpd'
0.028091 Air      b'lemma:-lrb-'
0.028067 Supp     b'lemma:%'
0.027560 Air      b'-2:lemma:and'
0.025966 Strain   b'-2:postag:NN'
0.025717 Air      b'-1:lemma:,'
0.025717 Air      b'-1:postag:,'
0.024658 O        b'-2:lemma:or'
0.023156 O        b'+2:lemma:or'
0.021942 Supp     b'-2:lemma:of'
0.021866 O        b'+2:lemma:with'
0.020581 Air      b'-2:lemma:-lrb-'
0.019092 Med      b'+2:postag:RB'
0.018966 Supp     b'postag:-RRB-'
0.018876 Temp     b'+1:lemma:in'
0.017926 O        b'lemma:mm'
0.017101 Gtype    b'lemma:-rrb-'
0.016886 Supp     b'-1:postag::'
0.016524 Anti     b'-1:lemma:fnr'
0.016044 O        b'+2:postag:IN'
0.015080 O        b'+1:lemma:1/100'
0.015080 O        b'-2:lemma:sodium'
0.015080 O        b'+2:lemma:vol'
0.014142 Air      b'postag:-LRB-'
0.011879 Air      b'+1:postag:CD'
0.011658 Agit     b'-1:postag:CD'
0.010959 Air      b'-2:postag:-LRB-'
0.010786 OD       b'postag:NN'
0.010701 O        b'+1:lemma:70'
0.010107 Air      b'+1:postag:NNP'
0.009628 Anti     b'-2:postag::'
0.007807 O        b'+1:lemma:b1'
0.006826 Temp     b'+2:lemma:in'
0.006769 O        b'-1:lemma:phosphate'
0.005752 O        b'+1:lemma:fructose'
0.005700 O        b'lemma:phosphate'
0.005608 Gtype    b'lemma::'
0.004838 O        b'-1:lemma:with'
0.004667 OD       b'-1:postag:NN'
0.004130 Supp     b'+2:lemma:in'
0.003946 O        b'-2:postag:RB'
0.003834 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
0.003581 Temp     b'+1:postag:CC'
0.003443 Supp     b'postag::'
0.003344 O        b'lemma:o2'
0.002775 O        b'lemma:glucose'
0.002652 Gtype    b'+2:lemma:chipseq'
0.002642 O        b'+1:postag:NNS'
0.002167 Phase    b'+2:postag:NN'
0.002071 Air      b'postag:CD'
0.002004 Temp     b'+2:postag:CC'
0.001806 Phase    b'-1:postag::'
0.001529 O        b'+2:lemma:anaerobic'
0.001413 O        b'-2:lemma:mm'
0.001346 O        b'+2:lemma:acetate'
0.001260 Agit     b'-2:lemma:-lrb-'
0.001248 Agit     b'-2:postag:-LRB-'
0.001185 O        b'+2:lemma:TEX'
0.001136 Gtype    b'-1:lemma:the'
0.000874 Anti     b'+1:postag:NN'
0.000843 Air      b'lemma:o2'
0.000747 Temp     b'+2:lemma:m9'
0.000665 Supp     b'lemma:.'
0.000665 Supp     b'postag:.'
0.000646 Technique b'-1:postag:NN'
0.000639 O        b'+2:lemma:cra'
0.000604 Supp     b'+1:lemma:in'
0.000585 Gtype    b'+2:lemma:1'
0.000481 Supp     b'+1:postag:JJ'
0.000424 OD       b'postag:JJ'
0.000294 O        b'-1:postag:FW'
0.000285 Supp     b'+1:lemma:%'
0.000260 OD       b'+2:lemma:-rrb-'
0.000259 OD       b'+2:postag:-RRB-'
0.000243 Anti     b'-2:postag:VBN'
0.000238 O        b'+1:lemma:with'
0.000227 Supp     b'postag:VBN'
0.000204 O        b'-2:lemma:culture'
0.000163 Anti     b'-1:postag::'
0.000112 Temp     b'+2:postag:NN'
0.000075 O        b'-2:lemma:to'
0.000075 O        b'-2:postag:TO'
0.000067 OD       b'-2:lemma:-lrb-'
0.000067 OD       b'-2:postag:-LRB-'
0.000064 Temp     b'-2:lemma:flask'
0.000043 Gtype    b'+2:lemma:small'
0.000034 O        b'-1:lemma:genotype'
0.000033 O        b'+1:postag:SYM'
0.000028 Gtype    b'+1:lemma:small'
0.000025 Supp     b'+1:lemma:nitrate'
0.000025 Supp     b'lemma:potassium'
0.000025 Supp     b'-1:lemma:mmol'
0.000024 Gtype    b'-2:lemma:Fur'
0.000024 Gtype    b'-2:lemma:factor'
0.000023 Phase    b'+2:postag:VBN'
0.000019 Gtype    b'-1:lemma:Fur'
0.000010 O        b'lemma:2.0'
0.000008 Supp     b'-2:postag:CC'
0.000008 Gtype    b'+2:lemma:rna'
0.000007 Supp     b'-2:lemma::'
0.000006 Gtype    b'+1:postag:DT'
0.000002 OD       b'+2:lemma:,'
0.000002 OD       b'+2:postag:,'
0.000002 OD       b'+1:lemma:,'
0.000002 OD       b'+1:postag:,'
0.000000 O        b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.000024 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.000028 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.000034 O        b'+1:lemma:0.3'
-0.000046 O        b'lemma:nitrate'
-0.000047 Supp     b'lemma:,'
-0.000047 Supp     b'postag:,'
-0.000052 Gtype    b'-1:postag:JJ'
-0.000058 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.000075 O        b'+1:lemma:m'
-0.000114 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.000131 Med      b'+1:postag:IN'
-0.000170 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.000200 Air      b'-2:lemma:70'
-0.000255 O        b'+1:lemma:o2'
-0.000329 O        b'+2:lemma:o2'
-0.000611 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.000631 O        b'+2:lemma:0.4'
-0.000637 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.000855 O        b'lemma:lb'
-0.001045 O        b'-1:lemma:in'
-0.001183 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.001540 Supp     b'postag:CC'
-0.001622 Med      b'+1:lemma:glucose'
-0.001986 O        b'+2:lemma:final'
-0.002082 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.002552 O        b'-2:lemma:at'
-0.002887 Temp     b'+2:lemma:.'
-0.002887 Temp     b'+2:postag:.'
-0.003199 OD       b'+2:postag:JJ'
-0.003535 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.004022 O        b'+2:lemma:then'
-0.004099 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.004128 O        b'-1:lemma:at'
-0.004236 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.004391 Temp     b'postag:CD'
-0.004526 Air      b'+2:lemma:o2'
-0.004670 Med      b'-2:postag:IN'
-0.005685 Supp     b'lemma:um'
-0.005685 Supp     b'+2:lemma:paraquat'
-0.005726 Air      b'postag:CC'
-0.006355 O        b'-1:lemma:37'
-0.006654 Technique b'-2:postag:NN'
-0.007115 O        b'+2:lemma:5'
-0.007168 O        b'-2:lemma:%'
-0.007828 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.008280 Air      b'+1:lemma:-rrb-'
-0.008442 O        b'-2:postag:DT'
-0.009848 Med      b'+2:lemma:glucose'
-0.010012 O        b'lemma:ph'
-0.011029 Temp     b'+1:lemma:.'
-0.011029 Temp     b'+1:postag:.'
-0.012078 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.012116 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.012526 O        b'+1:lemma:5'
-0.012608 Air      b'-2:postag:VBD'
-0.012681 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.014071 OD       b'-2:lemma:grow'
-0.015999 Air      b'+1:postag:-RRB-'
-0.017298 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.017317 Air      b'+1:lemma:70'
-0.018023 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.018067 Supp     b'lemma:ph'
-0.018184 Air      b'+2:lemma:70'
-0.018886 Temp     b'-2:postag:NN'
-0.019235 OD       b'+2:postag:NN'
-0.019823 Air      b'lemma:70'
-0.019977 Phase    b'+2:lemma:aerobically'
-0.020274 Air      b'+2:lemma:25'
-0.020318 O        b'-2:lemma:ph'
-0.021012 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.021012 Supp     b'-1:postag:.'
-0.022178 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.022805 Air      b'-1:postag:CC'
-0.024246 Gtype    b'lemma:delta'
-0.025351 O        b'-1:lemma:od600'
-0.026211 Supp     b'lemma:10'
-0.026239 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.027353 OD       b'+2:lemma:0.4'
-0.027574 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.028709 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.028927 O        b'+2:lemma:at'
-0.029712 Supp     b'-2:lemma:,'
-0.029712 Supp     b'-2:postag:,'
-0.033127 Air      b'+1:lemma:or'
-0.033557 Supp     b'postag:IN'
-0.034060 O        b'+1:lemma:co2'
-0.034418 Air      b'+2:postag:-RRB-'
-0.035059 Supp     b'-2:lemma:phosphate'
-0.036713 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.036752 Technique b'+2:postag:CD'
-0.037294 O        b'+1:lemma:ph'
-0.038195 Supp     b'-1:lemma:;'
-0.038195 Supp     b'-2:lemma:7.6'
-0.038664 Air      b'lemma:-rrb-'
-0.038750 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.039476 Air      b'lemma:,'
-0.039476 Air      b'postag:,'
-0.040154 O        b'+1:lemma:.'
-0.040154 O        b'+1:postag:.'
-0.043897 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.044856 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.045983 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.046961 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.047439 Air      b'postag:-RRB-'
-0.047534 O        b'-1:postag:DT'
-0.048337 Air      b'-2:postag:CC'
-0.048344 OD       b'+2:postag:DT'
-0.049136 O        b'-2:lemma:cell'
-0.050005 Temp     b'-2:postag:IN'
-0.053014 Air      b'+1:lemma:-lrb-'
-0.054091 O        b'+2:lemma:media'
-0.055774 O        b'lemma:co2'
-0.059942 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.061168 O        b'lemma:150'
-0.061168 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.061168 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.062750 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.064560 O        b'+1:lemma:n2'
-0.065570 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.068408 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.071590 OD       b'lemma:~'
-0.071694 O        b'+1:lemma:contain'
-0.072413 O        b'-1:postag:VBG'
-0.072759 O        b'+2:lemma:total'
-0.072927 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.073071 Air      b'+2:lemma:,'
-0.073071 Air      b'+2:postag:,'
-0.074593 Air      b'-2:lemma:aerobically'
-0.075214 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.075735 O        b'+1:lemma:a'
-0.076359 O        b'+2:lemma:m9'
-0.076543 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.077884 Supp     b'+2:postag::'
-0.079228 O        b'+1:lemma:medium'
-0.080033 Supp     b'-2:lemma:.'
-0.080033 Supp     b'-2:postag:.'
-0.080747 O        b'-2:lemma:10'
-0.080937 O        b'-1:lemma:final'
-0.081486 Phase    b'+2:postag:RB'
-0.082495 Air      b'+2:lemma:or'
-0.083670 O        b'+1:postag:CD'
-0.085270 O        b'-2:postag::'
-0.087011 O        b'+2:lemma:n2'
-0.090229 Air      b'+2:lemma:-rrb-'
-0.090251 Supp     b'lemma:vol'
-0.090251 Supp     b'-1:lemma:1/100'
-0.094427 O        b'+2:lemma:reference'
-0.097725 O        b'+1:lemma:for'
-0.097838 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.102809 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.103767 Supp     b'-2:lemma:;'
-0.104624 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.108160 O        b'+2:lemma:in'
-0.111313 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.113862 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.115250 O        b'+1:lemma:of'
-0.115446 Air      b'-2:lemma:be'
-0.116502 O        b'+1:lemma:media'
-0.118569 O        b'+1:lemma:10'
-0.123092 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.123408 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.125414 O        b'-2:lemma:o2'
-0.128165 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.129202 O        b'+2:postag:RB'
-0.130740 Med      b'postag:CD'
-0.131084 O        b'lemma:m63'
-0.132879 O        b'lemma:methanol'
-0.132879 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.135214 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.135344 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.140060 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.142113 Med      b'-1:postag:IN'
-0.143089 Supp     b'+1:lemma:final'
-0.143240 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.144530 O        b'-2:postag:VBG'
-0.147078 Supp     b'+2:lemma:final'
-0.148671 O        b'+1:lemma:%'
-0.151304 O        b'+1:lemma:mm'
-0.153241 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.154381 Med      b'-2:lemma:in'
-0.154541 OD       b'+2:lemma:a'
-0.157609 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.160720 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.161529 O        b'lemma:;'
-0.161529 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.164513 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.165051 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.168267 O        b'lemma:0.1'
-0.170186 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.170474 O        b'-2:lemma:20'
-0.171305 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.172211 Supp     b'-2:lemma:0.2'
-0.172545 O        b'-1:lemma:of'
-0.173144 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.173295 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.173296 O        b'-2:lemma:glucose'
-0.179340 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.180122 Supp     b'+1:lemma:phosphate'
-0.182987 O        b'+1:lemma:until'
-0.192599 O        b'lemma:fecl2'
-0.193610 O        b'-2:lemma:grow'
-0.193742 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.196106 O        b'+1:lemma:~'
-0.196776 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.201391 O        b'+2:lemma:ph'
-0.202573 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.205476 O        b'+2:lemma:co2'
-0.211690 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.213932 Supp     b'lemma:sodium'
-0.214042 O        b'-1:lemma:mm'
-0.216095 O        b'+1:lemma:phase'
-0.218378 O        b'lemma:wt'
-0.219681 O        b'-1:lemma:~'
-0.220552 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.223081 O        b'lemma:dissolve'
-0.223081 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.224583 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.231240 O        b'lemma:7.6'
-0.231240 O        b'+1:lemma:;'
-0.233900 O        b'+2:lemma:10'
-0.233906 O        b'-2:lemma:iptg'
-0.234316 Temp     b'-1:lemma:at'
-0.237235 O        b'-1:lemma:contain'
-0.240652 pH       b'postag:NN'
-0.255317 O        b'lemma:pahse'
-0.256570 O        b'lemma:20'
-0.264641 O        b'-1:lemma:1m'
-0.264641 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.265077 O        b'lemma:1m'
-0.265180 O        b'+2:lemma:tag'
-0.265329 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.267457 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.267457 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.267876 O        b'+2:lemma:~'
-0.270715 O        b'-1:lemma:until'
-0.274624 O        b'+2:lemma:genome'
-0.275065 Supp     b'-2:lemma:with'
-0.276269 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.283531 O        b'-1:lemma:the'
-0.285473 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.288590 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.291885 Supp     b'lemma:2'
-0.294654 O        b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.297130 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.299018 O        b'-2:lemma:of'
-0.311415 O        b'-1:lemma:.'
-0.311415 O        b'-1:postag:.'
-0.317235 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.319988 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.322433 Supp     b'+1:postag::'
-0.333023 O        b'lemma:37'
-0.335710 O        b'lemma:od600'
-0.344351 O        b'lemma:of'
-0.351924 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.354263 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.364876 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.370313 O        b'lemma:medium'
-0.371699 O        b'+1:lemma:_'
-0.397734 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.403667 Med      b'-1:postag:NN'
-0.405253 Air      b'+2:postag:IN'
-0.408855 Gtype    b'-2:postag:CD'
-0.410651 O        b'+1:postag:IN'
-0.415351 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.430773 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.434980 O        b'+2:lemma:.'
-0.434980 O        b'+2:postag:.'
-0.436405 O        b'-2:lemma:genome'
-0.441919 O        b'-1:postag:IN'
-0.465961 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.470975 Med      b'+1:postag:NN'
-0.482102 O        b'+1:lemma:1m'
-0.482102 O        b'-2:lemma:vol'
-0.497084 O        b'+1:lemma:at'
-0.498611 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.501328 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.501328 Supp     b'+1:postag:,'
-0.501462 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.504725 O        b'-2:lemma:IP'
-0.523069 O        b'-1:lemma:ml'
-0.528768 O        b'lemma:0.2'
-0.532882 O        b'+2:lemma:add'
-0.556683 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.559209 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.571611 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.576624 O        b'lemma:aerobic'
-0.587203 O        b'-1:postag::'
-0.590039 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.593007 Temp     b'postag:NN'
-0.602854 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.602856 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.608504 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.629988 O        b'+1:lemma:+'
-0.640711 O        b'-1:lemma:vol'
-0.640711 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.640711 O        b'+2:lemma:1m'
-0.642949 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.652642 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.671214 O        b'+2:lemma:b'
-0.683157 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.689149 O        b'-2:lemma::'
-0.711533 O        b'-2:lemma:media'
-0.716698 Supp     b'-1:postag:NNP'
-0.717271 O        b'+1:postag:DT'
-0.731292 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.732700 Temp     b'-2:lemma:at'
-0.754795 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.788874 Air      b'postag:NN'
-0.808410 O        b'lemma:minimal'
-0.809907 O        b'-1:lemma:ph'
-0.823517 O        b'-2:lemma:until'
-0.844065 Anti     b'postag:NNP'
-0.845254 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.861635 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.862114 O        b'lemma:mid-log'
-0.904229 O        b'lemma:rifampicin'
-0.911487 OD       b'+1:postag:NN'
-0.976731 O        b'+2:lemma:mid-log'
-1.038869 O        b'+1:lemma:in'
-1.065981 O        b'-1:lemma:30'
-1.137083 O        b'lemma:30'
-1.145626 O        b'+2:lemma:+'
-1.164592 O        b'-2:lemma:aerobically'
-1.173754 O        b'-2:postag:SYM'
-1.198214 O        b'-1:lemma:co2'
-1.287535 O        b'-2:lemma:the'
-1.318615 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.326351 O        b'-1:lemma:1'
-1.369031 Supp     b'postag:JJ'
-1.469773 O        b'lemma:media'
-1.477832 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-1.586238 O        b'lemma:aerobically'
-1.792655 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.809951 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.912439 O        b'-1:lemma:sample'
-1.956905 O        b'-2:lemma:0.3'
-2.219240 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-2.240126 O        b'lemma:0.3'
-2.544063 O        b'+1:lemma:2'
-2.755949 O        b'-1:lemma:2'
-2.800111 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.980558 Phase    b'postag:JJ'
-3.008031 O        b'+1:lemma:1'
-3.280615 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-4.718068 O        b'-1:lemma::'
-5.535839 O        b'-1:lemma:_'