report_Run14_v13.txt
37 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.23724446580655864, 'c2': 0.00765495768357585}
best CV score:0.8530997523170145
model size: 0.08M
Flat F1: 0.8145012586423507
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.897 0.398 0.551 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.968 0.782 0.865 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.864 0.838 0.851 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.922 0.752 0.815 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 6.728625
OD -> OD 5.795467
Med -> Med 5.380260
Anti -> Anti 5.353202
Phase -> Phase 4.913678
Supp -> Supp 4.738591
Gversion -> Gversion 4.693714
Air -> Air 4.399915
Gtype -> Gtype 4.068167
pH -> pH 3.878942
Technique -> Technique 3.809308
O -> O 2.966317
Agit -> Agit 2.014948
Substrain -> Gtype 1.351780
Technique -> Air 1.126979
Air -> O 0.754250
O -> Technique 0.438124
Temp -> O 0.133770
Gtype -> Supp 0.113969
O -> Strain 0.087851
Supp -> O 0.087274
O -> Supp 0.053960
O -> Gtype 0.033795
O -> Phase 0.014290
O -> Med -0.000092
Supp -> Med -0.000559
Phase -> OD -0.001383
Gtype -> Technique -0.020196
Phase -> O -0.041039
Anti -> Gtype -0.103106
Technique -> O -0.114782
OD -> O -0.234336
OD -> Air -0.361724
O -> OD -0.379451
Technique -> pH -0.844840
Substrain -> O -1.003014
O -> Air -1.482470
Gtype -> O -1.607768
Med -> Supp -1.827367
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 6.728625
OD -> OD 5.795467
Med -> Med 5.380260
Anti -> Anti 5.353202
Phase -> Phase 4.913678
Supp -> Supp 4.738591
Gversion -> Gversion 4.693714
Air -> Air 4.399915
Gtype -> Gtype 4.068167
pH -> pH 3.878942
Technique -> Technique 3.809308
O -> O 2.966317
Agit -> Agit 2.014948
Substrain -> Gtype 1.351780
Technique -> Air 1.126979
Air -> O 0.754250
O -> Technique 0.438124
Temp -> O 0.133770
Gtype -> Supp 0.113969
O -> Strain 0.087851
Supp -> O 0.087274
O -> Supp 0.053960
O -> Gtype 0.033795
O -> Phase 0.014290
O -> Med -0.000092
Supp -> Med -0.000559
Phase -> OD -0.001383
Gtype -> Technique -0.020196
Phase -> O -0.041039
Anti -> Gtype -0.103106
Technique -> O -0.114782
OD -> O -0.234336
OD -> Air -0.361724
O -> OD -0.379451
Technique -> pH -0.844840
Substrain -> O -1.003014
O -> Air -1.482470
Gtype -> O -1.607768
Med -> Supp -1.827367
Top positive:
7.178287 Gtype b'lemma:type'
6.404998 Anti b'-2:lemma:antibody'
6.397698 O b'lemma:1'
6.339842 O b'lemma:_'
5.989932 O b'-2:lemma:_'
5.941370 O b'lemma:2'
5.916327 Air b'lemma:anaerobic'
5.571221 Gtype b'lemma:wt'
5.302808 O b'lemma:3'
5.292070 Gtype b'hGreek'
5.234023 Phase b'lemma:mid-log'
5.232973 Supp b'lemma:no3'
5.010009 O b'lemma:-'
4.984155 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
4.982983 Technique b'lemma:chipseq'
4.852852 Gtype b'+1:lemma:type'
4.652536 Phase b'-2:lemma:phase'
4.544310 Med b'lemma:MOPS'
4.311827 Air b'lemma:aerobic'
4.255761 Supp b'lemma:pq'
4.193148 O b'lemma:b'
3.952356 Supp b'-2:lemma:shake'
3.911790 O b'lemma:with'
3.904169 Supp b'lemma:Iron'
3.904169 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.887434 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.847811 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
3.765810 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.757347 Gtype b'lemma:dfnr'
3.722204 Supp b'lemma:2h'
3.722204 Supp b'-1:lemma:additional'
3.687557 Supp b'lemma:Adenine'
3.613466 O b'lemma:a'
3.603126 O b'-1:postag:NNS'
3.534695 Med b'lemma:LB'
3.515786 Gtype b'-1:ner:GEN'
3.503627 O b'postag:VBG'
3.492909 Supp b'lemma:nh4cl'
3.442817 Supp b'lemma:iptg'
3.440810 Air b'-1:lemma:-'
3.351016 O b'lemma:.'
3.351016 O b'postag:.'
3.300966 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.281006 Substrain b'lemma:mg1655'
3.251053 Supp b'lemma:nacl'
3.247079 O b'postag::'
3.246696 Air b'lemma:aerobically'
3.196899 O b'lemma:rpob'
3.166965 Strain b'lemma:k-12'
3.147423 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.140574 Air b'postag:RB'
3.008307 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.995627 O b'-1:lemma:lb'
2.982809 Gtype b'-2:lemma:genotype'
2.979636 O b'+1:lemma:wt'
2.949780 Gtype b'lemma:pk4854'
2.916277 pH b'lemma:ph5'
2.916277 pH b'+1:lemma:.5'
2.915036 O b'-1:lemma:tag'
2.895560 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.888085 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
2.884398 Med b'lemma:media'
2.875312 O b'lemma:\xcf\x8332'
2.846079 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.843083 O b'postag:IN'
2.782135 Med b'lemma:lb'
2.764130 Temp b'-1:lemma:sample'
2.744150 Technique b'+2:lemma:ph5'
2.737022 Air b'-2:lemma:IP'
2.724487 O b'lemma:rep2'
2.724487 O b'lemma:rep1'
2.717176 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.715777 O b'lemma:Cra'
2.629322 Med b'lemma:m63'
2.624086 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.589119 Med b'+2:lemma:b2'
2.523774 Supp b'-2:lemma:media'
2.517301 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.508910 O b'lemma:genotype/variation'
2.495832 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
2.427888 Technique b'lemma:ChIP-exo'
2.420246 O b'lemma::'
2.415375 O b'+1:lemma:coli'
2.411091 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.410682 Supp b'-1:lemma:+'
2.379083 Technique b'hUpper'
2.349071 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.344335 O b'-2:lemma:flagtag'
2.338027 Air b'-1:lemma:co2'
2.337485 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.336501 Air b'lemma:anaeroibc'
2.314859 Supp b'+1:lemma:1'
2.274986 O b'lemma:culture'
2.266099 Supp b'+1:lemma:2'
2.258789 Temp b'lemma:37'
2.240798 Supp b'-1:lemma:with'
2.222082 O b'-1:lemma:type'
2.182232 Med b'lemma:minimal'
2.180225 O b'+1:postag:RB'
2.164342 Supp b'lemma:Leu'
2.164342 Supp b'-2:lemma:Lrp'
2.157371 Technique b'-1:lemma:_'
2.154163 O b'-1:lemma:0.3'
2.147788 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.147788 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.139435 pH b'+1:postag:CD'
2.127143 Supp b'+2:lemma:feso4'
2.118828 Anti b'+1:lemma:antibody'
2.113182 O b'-1:lemma:glucose'
2.089432 Agit b'lemma:rpm'
2.087570 Supp b'lemma:acetate'
2.083599 Temp b'lemma:43'
2.069178 Agit b'-1:lemma:250'
2.057135 Phase b'-2:lemma:until'
1.992647 Supp b'lemma:arginine'
1.969059 O b'lemma:harbor'
1.965795 O b'-1:lemma:anaerobic'
1.932873 O b'-2:lemma:myc'
1.914780 Med b'+2:postag:CC'
1.911832 O b'lemma:chip'
1.907315 OD b'lemma:od600'
1.895522 Vess b'lemma:flask'
1.895522 Vess b'-1:lemma:warm'
1.895522 Vess b'-2:lemma:pre'
1.895522 Vess b'+2:lemma:43'
1.874367 O b'+1:lemma:0.2'
1.850911 O b'-2:lemma:overnight'
1.842417 O b'+2:lemma:crp'
1.831002 Air b'postag:JJ'
1.825690 O b'lemma:ompr'
1.822051 Gtype b'+1:postag::'
1.787796 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.760298 O b'lemma:for'
1.753657 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.752729 OD b'lemma:od450'
1.741166 O b'postag:CC'
1.740020 Supp b'-2:lemma:argr'
1.739139 Med b'-1:lemma:minimal'
1.734812 Med b'+1:lemma:g/l'
1.734685 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.728549 Temp b'-1:lemma:43'
1.726752 Med b'lemma:medium'
1.720448 O b'+1:lemma:od600'
1.711211 Temp b'-1:lemma:37'
1.684289 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.678280 Med b'+2:lemma:b1'
1.674697 Phase b'postag:NN'
1.667773 Gversion b'lemma:u00096'
1.667773 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.651198 Technique b'lemma:rnaseq'
1.648120 O b'+1:lemma:pq'
1.645149 Gversion b'lemma:.2'
1.645149 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.639167 O b'postag:VBN'
1.637631 O b'lemma:CEL'
1.633325 O b'-1:lemma:wt'
1.625775 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.615405 Supp b'-2:lemma:20'
1.612454 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.597998 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.595226 O b'-1:lemma:nitrate'
1.584008 O b'-2:lemma:='
1.570488 Med b'+1:lemma:0.4'
1.561917 O b'lemma:-lrb-'
1.543987 Strain b'+1:lemma:substr'
1.543987 Strain b'-2:lemma:str'
1.539131 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.521338 O b'lemma:ml'
1.519448 Technique b'-2:lemma:wt'
1.506520 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.494210 Gversion b'lemma:000913'
1.494210 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.481164 O b'-1:lemma:min'
1.474450 O b'lemma:at'
1.464759 pH b'lemma:5.5'
1.464225 Med b'+1:lemma:2.0'
1.458366 OD b'lemma:0.3'
1.450200 Supp b'lemma:fructose'
1.444161 Technique b'-2:postag:NNP'
1.438616 Med b'+2:lemma:+'
1.423732 Gversion b'-2:lemma:build'
1.417846 O b'-2:lemma:medium'
1.417522 Supp b'-2:lemma:agent'
1.412564 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.412492 Gtype b'postag:JJ'
1.410133 Supp b'-2:lemma:for'
1.406868 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.406858 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
1.406746 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.406746 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.406366 Gtype b'hUpper'
1.403911 Supp b'-1:postag:CD'
1.400250 O b'-1:lemma:mg1655'
1.398624 O b'-2:ner:MED'
1.395957 Med b'+1:lemma:minimal'
1.389576 Gtype b'+1:lemma:_'
1.388317 Supp b'lemma:glucose'
1.353659 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.353659 Gtype b'-1:lemma:old'
1.353659 Gtype b'-2:lemma:seqa'
1.349982 Gversion b'lemma:nc'
1.349982 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.336975 O b'-1:lemma:l1'
1.327674 Technique b'hLower'
1.327502 O b'postag:-RRB-'
1.323256 O b'symb'
1.317126 O b'-2:lemma:fructose'
1.311254 Supp b'-1:lemma:_'
1.309199 Air b'-2:lemma:fnr'
1.285636 O b'-1:lemma:-80'
1.274013 Supp b'+2:lemma:add'
1.259354 O b'postag:-LRB-'
1.250513 pH b'+1:lemma:5.5'
1.248197 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.245216 OD b'+1:lemma:of'
1.241284 O b'+1:lemma:mid-log'
1.225035 O b'lemma:purr'
1.223387 OD b'-1:postag:IN'
1.220592 Supp b'-2:lemma:pahse'
1.214962 Gtype b'+1:lemma:the'
1.212599 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.211173 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.200357 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.199217 O b'+1:lemma:acetate'
1.195421 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.184098 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.182109 Gtype b'+2:lemma::'
1.182065 O b'+1:postag:NNP'
1.180901 O b'+1:lemma:250'
1.177888 Technique b'-1:lemma:input'
1.176371 OD b'+2:lemma:0.3'
1.165554 Med b'-2:postag:JJ'
1.157431 Air b'+2:postag:CD'
1.153589 O b'postag:VBD'
1.153420 O b'lemma:argr'
1.152629 O b'lemma:chip-arca'
1.152629 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.151137 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.145589 O b'lemma:chip-fnr'
1.145589 O b'+2:lemma:fnr8myc'
1.135100 O b'-2:lemma:~'
1.135080 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.132231 OD b'lemma:of'
1.125312 Supp b'-2:lemma:induce'
1.122214 Substrain b'-1:lemma:.'
1.122214 Substrain b'-1:postag:.'
1.120873 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.120560 Med b'+1:lemma:+'
1.106926 Gtype b'lemma:wild-type'
1.106210 Med b'-1:lemma:ml'
1.106078 Agit b'lemma:250'
1.104735 O b'lemma:-rrb-'
1.104198 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.097865 Supp b'lemma:Fe'
1.096678 O b'-1:lemma:nacl'
1.095678 Air b'-2:lemma:cm20'
1.088705 Supp b'+1:lemma:Deficient'
1.087514 O b'-1:lemma:pq'
1.086317 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.078000 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.074602 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.074602 Supp b'+2:lemma:1/100'
1.065943 Gtype b'lemma:nsrr'
1.065943 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.065096 Supp b'lemma:glutamine'
1.065096 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.062624 Med b'-2:lemma:minimal'
1.058469 pH b'lemma:ph'
1.045288 O b'lemma:input'
1.045288 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.042180 Supp b'+2:lemma:A'
1.024859 Gtype b'-1:lemma:_'
1.022299 Air b'-2:lemma:%'
1.012830 O b'lemma:soxr'
1.012830 O b'lemma:soxs'
1.011966 Supp b'-2:lemma:10'
1.009724 Gversion b'-2:postag:VB'
1.002142 Supp b'-1:lemma:ompr'
0.988887 Vess b'+1:lemma:at'
0.987620 Substrain b'+2:lemma::'
0.984797 Gtype b'+1:lemma::'
0.981814 Technique b'lemma:rna-seq'
0.981127 Supp b'lemma:rifampicin'
0.979963 Temp b'-2:lemma:keep'
0.973161 O b'+1:lemma::'
0.967629 Supp b'-2:postag:VBG'
0.964962 O b'lemma:,'
0.964962 O b'postag:,'
0.963685 Med b'+1:lemma:medium'
0.954752 Technique b'-1:lemma:IP'
0.951888 Air b'+1:lemma:%'
0.951029 Air b'+2:lemma:%'
0.944153 Gtype b'+1:lemma:with'
0.940552 Supp b'+1:lemma:_'
0.939019 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
0.929566 Air b'-1:lemma:%'
0.929315 Agit b'-2:lemma:aerobically'
0.928036 Gtype b'+2:postag::'
0.927135 OD b'-2:lemma:od450'
0.924822 Air b'lemma:%'
0.913444 Gtype b'-2:postag:JJ'
0.913086 pH b'-1:lemma:ph'
0.912684 Supp b'-1:lemma:vol'
0.912684 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.912684 Supp b'+2:lemma:1m'
0.910605 O b'+2:postag:JJ'
0.910314 Gtype b'hLower'
0.905789 O b'lemma:~'
0.904945 Agit b'+2:lemma:at'
0.904076 Technique b'-2:lemma:Fur'
0.902596 Med b'+2:lemma:with'
0.900366 Supp b'lemma:dpd'
0.897999 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.897999 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.897934 Med b'lemma:2'
0.895023 Supp b'+2:lemma:be'
0.892487 O b'lemma:gadx'
0.884366 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
0.884088 Supp b'postag:NNP'
0.876661 O b'-2:lemma:min'
0.871888 Gtype b'-2:lemma:dna'
0.867961 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
0.867304 O b'-1:lemma:into'
0.863188 Air b'-1:lemma:phase'
0.862471 O b'lemma:trpr'
0.862298 Air b'-2:lemma:0.3'
0.860761 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
0.858318 Supp b'+1:lemma:1m'
0.858318 Supp b'-2:lemma:vol'
0.857236 Supp b'-1:lemma:1m'
0.857236 Supp b'+2:lemma:7.6'
0.855511 O b'lemma:A'
0.853714 Agit b'-2:postag:RB'
0.852806 O b'+1:postag:VBN'
0.840221 Air b'-2:postag:CD'
0.836530 Supp b'+1:lemma:hour'
0.831288 O b'+1:ner:MED'
0.830137 Supp b'lemma:20'
0.829222 Gtype b'lemma:fnr8myc'
0.829222 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
0.827266 O b'-2:lemma:37'
0.824852 Substrain b'+2:postag::'
0.823945 Phase b'-1:lemma::'
0.821753 Gtype b'lemma:the'
0.819864 Med b'-1:lemma:glucose'
0.817326 O b'+2:lemma:fructose'
0.815047 Gversion b'postag:NN'
0.813335 Air b'-2:lemma:mid-log'
0.809184 O b'-2:ner:_'
0.805806 Vess b'-1:postag:VBN'
0.803102 O b'lemma:growth'
0.796537 Med b'-2:lemma:fresh'
0.791723 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.791288 O b'+1:lemma:ph5'
0.791288 O b'+2:lemma:.5'
0.790188 O b'-1:lemma:aerobic'
0.786563 O b'lemma:additional'
0.786563 O b'+1:lemma:2h'
0.786312 O b'-2:postag:FW'
0.781153 Gtype b'-1:lemma:wild'
0.773044 Gtype b'-2:lemma:delta'
0.767844 Gtype b'-2:ner:_'
0.766307 Phase b'+1:lemma:phase'
0.760775 O b'-1:lemma:dpd'
0.757808 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
0.751781 O b'+2:lemma:_'
0.748871 Supp b'lemma:0.2'
0.747026 O b'+1:lemma:rifampicin'
0.746555 Med b'-1:lemma:fresh'
0.744867 Strain b'-2:lemma:strain'
0.741655 O b'-2:lemma:od600'
0.738559 Med b'+1:postag:CD'
0.737309 pH b'lemma:.5'
0.737309 pH b'-1:lemma:ph5'
0.735344 Temp b'+2:postag:DT'
0.733069 Supp b'+2:postag:-LRB-'
0.732894 Anti b'hGreek'
0.732059 OD b'+1:postag:IN'
0.730036 Phase b'lemma:phase'
0.724916 Phase b'+2:lemma:o.d.'
0.721577 Supp b'-2:lemma:trpr'
0.720930 O b'+1:lemma:20'
0.718982 O b'+1:ner:SUPP'
0.714143 Air b'-1:postag:CD'
0.712823 O b'hLower'
0.705308 Supp b'-1:postag:IN'
0.702608 Med b'postag:NNP'
0.701732 O b'lemma:0.4'
0.697905 O b'+1:lemma:k-12'
0.696237 Supp b'symb'
0.696207 O b'+1:postag::'
0.694889 O b'+2:lemma:aerobically'
0.691444 O b'-2:lemma:be'
0.691307 pH b'-2:lemma:at'
0.688213 Supp b'-1:lemma:final'
0.687774 Temp b'-2:lemma:see'
0.683972 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.682716 O b'+1:lemma:and'
0.678213 Strain b'-1:lemma:.'
0.678213 Strain b'-1:postag:.'
0.676935 OD b'+2:postag:CD'
0.675127 OD b'postag:IN'
0.672770 Gtype b'+2:ner:SUPP'
0.672769 O b'+1:postag:VBZ'
0.670859 O b'-2:lemma:anaerobic'
0.669652 Strain b'+2:lemma:.'
0.669652 Strain b'+2:postag:.'
0.668505 O b'+2:lemma:wt'
0.668368 Temp b'lemma:sample'
0.667253 Air b'+1:lemma:until'
0.662176 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.659624 Technique b'lemma:chip-seq'
0.657946 pH b'-1:postag:NN'
0.653983 Gtype b'-2:postag:NN'
0.653929 O b'-1:lemma:antibody'
0.653512 Gtype b'lemma:flagtag'
0.653512 Gtype b'-2:lemma:nsrr'
0.649248 O b'-1:ner:_'
0.648249 Supp b'-1:lemma:mm'
0.645068 O b'lemma:affyexp'
0.643188 O b'lemma:-80'
0.643188 O b'-2:lemma:freeze'
0.641830 Supp b'+1:lemma:mm'
0.641830 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
0.641039 O b'+2:ner:_'
0.629144 Air b'lemma:Anaerobic'
0.625086 Gtype b'-1:postag:VBP'
0.624830 Supp b'-1:lemma:,'
0.624830 Supp b'-1:postag:,'
0.619146 Air b'+2:lemma:mid-log'
0.609124 Phase b'lemma:pahse'
0.607630 pH b'-1:lemma:at'
0.605160 Technique b'+2:postag:-RRB-'
0.604916 Gtype b'+1:ner:GEN'
0.602549 Phase b'-1:postag::'
0.597960 Med b'-2:ner:_'
0.596020 Vess b'-2:postag:JJ'
0.592960 Gtype b'lemma:vector'
0.591905 Med b'+2:lemma:then'
0.589749 Supp b'postag:NN'
0.585166 O b'-2:lemma:twice'
0.584665 Supp b'-1:postag:SYM'
0.579625 Med b'-1:lemma:in'
0.578893 OD b'+2:lemma:~'
0.577984 Gtype b'-2:postag:NNS'
0.576808 O b'-2:lemma:250'
0.573553 Supp b'+2:lemma:ph'
0.572545 Anti b'+2:postag:NNP'
0.569701 Technique b'lemma:chip-exo'
0.569392 O b'+2:postag:VBD'
0.568878 Gtype b'-2:lemma:the'
0.567443 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.565917 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
0.563802 Supp b'lemma:of'
0.563074 Agit b'+2:postag:-RRB-'
0.561821 Agit b'+2:lemma:-rrb-'
0.560066 Temp b'-2:postag:VB'
0.558020 Gtype b'+1:lemma:control'
0.557930 Supp b'+2:postag:VBD'
0.556811 OD b'+2:lemma:culture'
0.555446 Agit b'-1:postag:-LRB-'
0.553638 Anti b'-2:ner:_'
0.551226 Air b'-2:ner:_'
0.551007 Agit b'-1:lemma:-lrb-'
0.550736 Supp b'+1:lemma:be'
0.549777 Supp b'-1:lemma:without'
0.549589 OD b'+1:ner:_'
0.549416 pH b'+1:lemma:.'
0.549416 pH b'+1:postag:.'
0.548836 Gtype b'-1:lemma:from'
0.545037 Agit b'+1:lemma:-rrb-'
0.542197 Supp b'+2:postag:IN'
0.540468 Med b'+1:lemma:supplement'
0.539808 O b'+2:lemma:of'
0.533151 Temp b'+1:postag:CC'
0.529984 O b'lemma:genotype'
0.528697 Supp b'+1:postag:VBD'
0.526187 Agit b'-2:postag:-LRB-'
0.523697 Supp b'-2:postag:CD'
0.523546 Gversion b'+1:postag:CD'
0.522000 Anti b'hLower'
0.521975 Gtype b'+2:postag:NN'
0.520811 Supp b'-1:lemma:potassium'
0.520811 Supp b'-2:lemma:mmol'
0.519628 O b'-1:lemma:4'
0.518519 OD b'-1:lemma:of'
0.517908 pH b'-2:lemma:glucose'
0.515925 Agit b'+1:postag:-RRB-'
0.514372 Supp b'lemma:cm20'
0.514372 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
0.507754 Anti b'-1:lemma::'
0.507687 Agit b'-2:lemma:-lrb-'
0.507392 O b'-1:lemma:medium'
0.504600 Supp b'lemma:7.6'
0.504600 Supp b'+1:lemma:;'
0.499335 Med b'-1:postag:JJ'
0.495360 O b'postag:NNS'
0.493365 Air b'-1:postag::'
0.491300 Strain b'-2:postag:NN'
0.491233 pH b'+2:lemma:.'
Top negative:
0.044624 O b'+1:lemma:minute'
0.043542 Technique b'-1:postag:NN'
0.042770 Gtype b'+1:lemma:ph5'
0.042770 Gtype b'+2:lemma:.5'
0.040930 Gtype b'postag:-RRB-'
0.040647 Supp b'-2:lemma:iptg'
0.038250 O b'+1:lemma:to'
0.038250 O b'+1:postag:TO'
0.037280 Air b'symb'
0.035870 O b'+2:lemma:for'
0.034996 Supp b'+2:lemma:for'
0.033150 Med b'-2:postag:NN'
0.032073 Gtype b'+1:postag:CD'
0.031635 O b'-1:lemma:phase'
0.030416 Temp b'-2:lemma:flask'
0.030402 Air b'postag:CD'
0.030072 Temp b'+2:postag:CC'
0.028121 Air b'+1:postag:CD'
0.027793 Air b'+2:ner:_'
0.026917 O b'-1:lemma:grow'
0.023195 O b'postag:NNP'
0.020411 O b'-2:lemma:at'
0.020155 O b'-2:lemma:no3'
0.020001 Temp b'+1:lemma:short'
0.019218 Air b'+1:postag:NN'
0.019162 O b'-1:lemma:for'
0.018173 Air b'-2:lemma:and'
0.015606 O b'+2:lemma:to'
0.015606 O b'+2:postag:TO'
0.015468 Supp b'-1:lemma:.'
0.015468 Supp b'-1:postag:.'
0.014778 O b'+1:lemma:7.6'
0.014778 O b'-2:lemma:1m'
0.014778 O b'+2:lemma:;'
0.013913 O b'-2:lemma:n2'
0.013345 Temp b'+2:lemma:the'
0.009661 O b'lemma:\xc2\xb0c'
0.009541 O b'+2:lemma:-lrb-'
0.009408 O b'+1:lemma:dfnr'
0.009291 O b'-1:lemma:at'
0.009280 O b'+2:lemma:a'
0.009196 Gtype b'lemma:crp'
0.008947 O b'-2:lemma:strain'
0.008587 O b'-1:lemma:anti-rpos'
0.008587 O b'+1:lemma:neoclone'
0.008288 Gtype b'-2:lemma:small'
0.007971 Temp b'-1:postag:NN'
0.007110 O b'+1:lemma:tritonx-100'
0.006692 Technique b'-1:lemma:1'
0.006375 Med b'+2:lemma:-rrb-'
0.006167 Gtype b'-1:postag:IN'
0.005921 Gversion b'+2:ner:_'
0.005789 O b'hUpper'
0.005705 O b'-1:lemma:n2'
0.005565 Air b'+1:lemma:at'
0.005340 O b'-2:lemma:;'
0.004804 O b'-1:lemma:fructose'
0.004748 Supp b'-1:lemma:20'
0.004578 O b'lemma:5'
0.004520 O b'lemma:2.0'
0.004501 OD b'lemma:0.4'
0.004441 O b'+2:lemma:wash'
0.004400 Supp b'lemma:ph'
0.004367 Supp b'+1:postag:JJ'
0.004251 Supp b'-2:lemma:of'
0.003775 Med b'+2:lemma:without'
0.003116 O b'-2:lemma:culture'
0.003075 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.002974 O b'+2:ner:GEN'
0.002902 O b'+1:lemma:-'
0.002720 O b'-1:lemma:2.5'
0.002379 Supp b'-2:lemma:rpob'
0.002316 OD b'+2:lemma:0.4'
0.002307 O b'+1:lemma:genbank'
0.002120 O b'-1:lemma:5'
0.002067 O b'-1:lemma:Iron'
0.001736 Temp b'lemma:-rrb-'
0.001699 Supp b'-1:postag:JJ'
0.001679 O b'+1:lemma:culture'
0.001532 Temp b'postag:-RRB-'
0.001226 Gtype b'+2:lemma:fnr'
0.000842 Anti b'-2:postag::'
0.000824 O b'lemma:10'
0.000743 O b'-2:lemma:.2'
0.000731 Gtype b'+1:postag:NN'
0.000726 O b'lemma:genbank'
0.000661 O b'-2:lemma:sample'
0.000449 O b'-2:lemma:2.5'
0.000439 O b'+1:lemma:final'
0.000401 Med b'+2:postag:-RRB-'
0.000341 O b'+1:lemma:be'
0.000264 O b'+1:lemma:ml'
0.000224 Gversion b'+2:postag:NN'
0.000149 O b'+1:lemma:anerobically'
0.000149 O b'-2:lemma:600nm'
0.000145 Supp b'lemma:in'
0.000144 Gtype b'+2:lemma:rep2'
0.000144 Gtype b'+2:lemma:rep1'
0.000133 Supp b'lemma:sodium'
0.000133 Supp b'+1:lemma:phosphate'
0.000119 Anti b'-2:lemma:rna'
0.000119 Anti b'-1:lemma:polymerase'
0.000105 Gtype b'+2:postag:VBN'
0.000076 O b'-1:lemma:fnr'
0.000058 O b'+1:lemma:read'
0.000041 Technique b'-1:postag:NNP'
0.000039 Gversion b'-1:ner:_'
0.000025 Supp b'-1:lemma:iptg'
0.000025 Technique b'+1:lemma:Anaerobic'
0.000022 Supp b'+1:lemma:300'
0.000021 Technique b'-2:ner:TF'
0.000014 Anti b'+1:postag:IN'
0.000012 Supp b'+1:lemma:and'
0.000011 Temp b'lemma:30'
0.000010 Substrain b'hUpper'
0.000009 Gtype b'lemma:transcription'
0.000009 Gtype b'+1:lemma:factor'
0.000009 Gtype b'+2:lemma:Fur'
0.000008 O b'+2:lemma:1'
0.000008 Gtype b'+2:ner:TF'
0.000005 O b'-2:postag:NNS'
0.000005 O b'lemma:mm'
0.000005 O b'-1:ner:KWSUPP'
0.000005 Supp b'+1:postag:RB'
0.000005 O b'lemma:Deficient'
0.000003 Air b'-2:postag:NNP'
0.000003 O b'lemma:glycine'
0.000002 Air b'-1:lemma:o2'
0.000001 Supp b'+1:postag:CC'
0.000001 Phase b'+1:lemma:for'
0.000001 O b'-1:lemma:0.4'
0.000001 O b'+1:lemma:glycine'
0.000001 O b'-2:lemma:Cold'
-0.000000 Gtype b'lemma:-lrb-'
-0.000000 Gtype b'+1:postag:-RRB-'
-0.000000 Gtype b'postag:NNP'
0.000000 Gtype b'-2:postag:VBG'
-0.000001 O b'-1:lemma:o2'
-0.000002 O b'+1:lemma:antibody'
-0.000006 Supp b'postag:NNS'
-0.000008 Supp b'-1:lemma:10'
-0.000010 Med b'-2:lemma:m9'
-0.000012 Gtype b'-1:postag:-LRB-'
-0.000016 O b'lemma:dissolve'
-0.000016 O b'+2:lemma:methanol'
-0.000018 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.000025 O b'lemma:pahse'
-0.000041 Gtype b'+2:lemma:-rrb-'
-0.000048 O b'lemma:methanol'
-0.000048 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.000076 O b'+2:lemma:in'
-0.000117 O b'lemma:m63'
-0.000119 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.000132 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.000137 O b'lemma:phosphate'
-0.000156 Supp b'lemma:%'
-0.000197 Supp b'-2:lemma:0.2'
-0.000239 O b'lemma:0.1'
-0.000240 pH b'hUpper'
-0.000251 O b'+2:lemma:media'
-0.000306 Technique b'-2:ner:_'
-0.000309 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.000331 pH b'hLower'
-0.000338 O b'-1:lemma:.'
-0.000338 O b'-1:postag:.'
-0.000338 O b'-1:lemma:sodium'
-0.000338 O b'+2:lemma:1/100'
-0.000394 Supp b'+1:postag:NNP'
-0.000396 Technique b'postag:NN'
-0.000475 Phase b'-2:postag:NN'
-0.000486 Med b'-1:postag:IN'
-0.000506 pH b'postag:NN'
-0.000671 Air b'postag:-RRB-'
-0.000729 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.001041 OD b'-1:postag:NN'
-0.001083 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.001118 Air b'+2:lemma:-rrb-'
-0.001179 O b'-2:lemma:phase'
-0.001194 O b'+1:lemma:1/100'
-0.001194 O b'-2:lemma:sodium'
-0.001194 O b'+2:lemma:vol'
-0.001282 OD b'lemma:2.0'
-0.001382 Supp b'lemma:,'
-0.001382 Supp b'postag:,'
-0.001513 O b'-1:lemma:,'
-0.001513 O b'-1:postag:,'
-0.001647 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.001793 O b'-2:lemma:1'
-0.001997 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.002144 Temp b'-2:postag:IN'
-0.002388 O b'+2:ner:SUPP'
-0.002463 O b'+2:postag:-LRB-'
-0.002463 O b'+1:lemma:.'
-0.002463 O b'+1:postag:.'
-0.002483 Supp b'-2:postag:NNS'
-0.002831 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.002873 O b'-2:lemma:nh4cl'
-0.002922 O b'lemma:od600'
-0.003746 Temp b'-2:lemma:at'
-0.003780 O b'lemma:7.6'
-0.003780 O b'+1:lemma:;'
-0.003803 O b'-1:lemma:to'
-0.003803 O b'-1:postag:TO'
-0.004146 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.004231 Med b'-2:postag:VBN'
-0.004583 Anti b'postag:NNP'
-0.004659 Temp b'+1:postag:NN'
-0.004942 Temp b'+1:postag:IN'
-0.005096 OD b'symb'
-0.005177 Supp b'-1:lemma:;'
-0.005177 Supp b'-2:lemma:7.6'
-0.005855 O b'-1:lemma:~'
-0.005935 Air b'+2:postag:-RRB-'
-0.006154 Anti b'symb'
-0.006806 O b'+1:lemma:a'
-0.006985 Supp b'-1:lemma:%'
-0.007524 Gtype b'-1:lemma::'
-0.007682 O b'+1:lemma:0.4'
-0.008066 Supp b'postag:CD'
-0.008628 Supp b'-2:lemma:mm'
-0.008628 Supp b'-2:ner:KWSUPP'
-0.008739 Med b'+1:postag:IN'
-0.008827 O b'+1:lemma:300'
-0.009922 Temp b'-2:postag:CD'
-0.009960 Air b'postag:CC'
-0.010030 Supp b'postag:IN'
-0.010068 Air b'+2:lemma:until'
-0.011366 O b'+2:lemma:antibody'
-0.012537 Supp b'-1:postag:NN'
-0.013330 O b'+1:lemma:minimal'
-0.014275 Air b'+1:lemma:-rrb-'
-0.014334 Air b'-1:postag:CC'
-0.014714 O b'-2:lemma:%'
-0.015463 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.016033 Air b'+2:postag:IN'
-0.016120 O b'-1:lemma:iptg'
-0.017086 O b'-1:ner:GEN'
-0.017253 Phase b'+2:postag:IN'
-0.017687 Air b'+1:postag:-RRB-'
-0.017911 Temp b'-2:ner:_'
-0.019461 Supp b'+2:lemma:and'
-0.022107 O b'-1:lemma:final'
-0.022140 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.022411 Anti b'-1:ner:_'
-0.022497 Supp b'hLower'
-0.022751 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.022751 Gtype b'-1:postag:,'
-0.023833 O b'+1:lemma:mm'
-0.023833 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.024249 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.024620 OD b'lemma:~'
-0.026526 Med b'+1:ner:MED'
-0.027171 O b'+2:lemma:the'
-0.027731 Gtype b'+2:ner:GEN'
-0.029895 Supp b'-2:lemma:,'
-0.029895 Supp b'-2:postag:,'
-0.030426 Gtype b'postag:VBG'
-0.030599 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.032536 Temp b'-1:ner:_'
-0.033050 O b'-1:lemma:%'
-0.034169 Anti b'+1:ner:_'
-0.034605 O b'-2:postag:RB'
-0.036423 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.037163 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.039070 O b'+2:postag:CC'
-0.039217 O b'+2:lemma:tag'
-0.039807 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.041773 Air b'lemma:,'
-0.041773 Air b'postag:,'
-0.045384 Air b'-2:postag:CC'
-0.046106 Supp b'hUpper'
-0.046201 Temp b'postag:NN'
-0.049106 Supp b'+1:postag::'
-0.049722 Air b'+2:lemma:,'
-0.049722 Air b'+2:postag:,'
-0.049723 Supp b'lemma:2'
-0.051780 Temp b'-1:postag:IN'
-0.052863 Supp b'-2:lemma:;'
-0.052889 Phase b'+2:ner:_'
-0.054245 Supp b'+2:ner:_'
-0.054917 O b'+2:lemma:at'
-0.055630 O b'+2:lemma:ph'
-0.058078 O b'+1:lemma:media'
-0.060543 O b'lemma:150'
-0.060543 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.060543 O b'-2:lemma:concentration'
-0.061181 O b'+2:lemma:~'
-0.063040 O b'+2:postag:IN'
-0.063757 Supp b'-2:postag:NN'
-0.064262 O b'+2:lemma:sample'
-0.064567 O b'+2:lemma:fnr'
-0.065230 O b'-1:postag:VBN'
-0.066797 O b'+1:lemma:sample'
-0.067280 O b'-2:lemma:to'
-0.067280 O b'-2:postag:TO'
-0.070107 O b'postag:NN'
-0.074212 O b'-2:lemma:o2'
-0.074510 Gtype b'-1:postag::'
-0.074641 O b'lemma:co2'
-0.079076 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.083167 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.084690 OD b'postag:NN'
-0.085764 O b'+2:postag:DT'
-0.088286 O b'+1:lemma:~'
-0.089422 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.090022 pH b'+2:ner:_'
-0.091222 O b'-2:lemma:0.1'
-0.096436 O b'-2:lemma:for'
-0.098975 O b'lemma:1m'
-0.099762 Supp b'+1:lemma:final'
-0.100597 O b'-1:lemma:mm'
-0.101584 Supp b'-2:lemma:glucose'
-0.102311 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.102935 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.109532 O b'lemma:;'
-0.109532 O b'-1:lemma:7.6'
-0.110438 O b'+2:lemma:supplement'
-0.111111 O b'-1:ner:SUPP'
-0.111395 O b'+1:lemma:of'
-0.117808 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.118464 O b'-1:ner:MED'
-0.119752 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.120620 Supp b'lemma:mm'
-0.120620 Supp b'-1:ner:KWSUPP'
-0.120674 O b'-2:lemma:grow'
-0.126088 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.128591 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.131882 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.131882 O b'+1:lemma:methanol'
-0.132466 O b'+1:lemma:5'
-0.134333 O b'-2:postag:DT'
-0.138467 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.142161 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.145894 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.149730 O b'-1:lemma:until'
-0.154729 O b'+1:postag:NNS'
-0.156653 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.158296 O b'-2:lemma:fresh'
-0.160966 Phase b'+1:postag:NN'
-0.165556 O b'-1:lemma:g/l'
-0.166588 Gtype b'+1:ner:_'
-0.168879 O b'lemma:phase'
-0.173355 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.175074 O b'-1:postag:DT'
-0.175208 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.176124 O b'-2:lemma:minimal'
-0.176407 Technique b'-1:lemma::'
-0.180425 O b'lemma:fecl2'
-0.180784 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.181229 O b'-1:lemma:minimal'
-0.183847 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.187558 O b'+2:lemma:genome'
-0.189092 Phase b'+1:ner:_'
-0.189962 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.191802 Gtype b'postag:NN'
-0.195074 O b'-1:lemma:1m'
-0.195074 O b'+2:lemma:7.6'
-0.197116 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.202064 Temp b'+2:lemma:with'
-0.202196 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.207956 O b'+1:lemma:%'
-0.210827 O b'lemma:ph'
-0.218731 O b'-2:lemma:20'
-0.219701 O b'-1:lemma:of'
-0.220200 Supp b'+2:postag:NN'
-0.220691 O b'lemma:sample'
-0.221311 O b'+1:lemma:+'
-0.222869 O b'-1:lemma:contain'
-0.224503 O b'-2:lemma:g/l'
-0.224580 Med b'postag:CD'
-0.225817 O b'+1:lemma:until'
-0.230476 O b'-1:lemma:rna'
-0.231101 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.231685 Temp b'+1:lemma:with'
-0.242689 Med b'-1:postag:NN'
-0.260463 Supp b'hGreek'
-0.271639 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.273999 O b'+2:lemma:co2'
-0.293745 O b'lemma:medium'
-0.294026 Supp b'lemma:10'
-0.303535 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.306825 O b'-2:lemma:of'
-0.308023 O b'+1:postag:CD'
-0.308424 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.308424 Gtype b'+1:postag:,'
-0.309132 Phase b'symb'
-0.310316 Strain b'hLower'
-0.320332 O b'-1:lemma:IP'
-0.320928 O b'lemma:20'
-0.325493 O b'+2:lemma:m9'
-0.331411 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.337071 O b'+1:lemma:g/l'
-0.347793 O b'+2:lemma:.'
-0.347793 O b'+2:postag:.'
-0.350207 O b'+1:lemma:supplement'
-0.355707 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.365704 O b'lemma:37'
-0.380882 Med b'-1:ner:_'
-0.393582 Anti b'+2:ner:_'
-0.396347 O b'postag:RB'
-0.403052 OD b'+2:postag:NN'
-0.404682 O b'lemma:rifampicin'
-0.405132 O b'-2:postag:SYM'
-0.405451 pH b'symb'
-0.405624 O b'-1:postag:IN'
-0.411850 O b'-2:lemma:dpd'
-0.413529 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.416768 O b'-2:ner:SUPP'
-0.421140 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.433860 O b'+2:lemma:10'
-0.437792 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.442621 OD b'hLower'
-0.447482 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.452514 O b'-2:lemma:supplement'
-0.456370 Med b'hLower'
-0.459623 Supp b'+1:lemma:,'
-0.459623 Supp b'+1:postag:,'
-0.461593 O b'+2:postag:RB'
-0.462867 O b'+1:lemma:1m'
-0.462867 O b'-2:lemma:vol'
-0.479012 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.481345 Gversion b'hLower'
-0.489010 O b'-2:postag::'
-0.489710 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.495814 O b'-2:lemma:until'
-0.500124 Med b'+1:postag:NN'
-0.500480 Vess b'hUpper'
-0.512733 Supp b'+2:postag:CC'
-0.514299 Gtype b'symb'
-0.527777 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.543875 O b'lemma:wt'
-0.551425 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.553673 O b'-2:lemma::'
-0.578601 O b'lemma:mid-log'
-0.583834 O b'+2:lemma:add'
-0.588524 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.616521 O b'-1:lemma:the'
-0.636144 O b'-1:lemma:vol'
-0.636144 O b'-2:lemma:1/100'
-0.636144 O b'+2:lemma:1m'
-0.667349 O b'+1:postag:DT'
-0.673656 Anti b'hUpper'
-0.676892 O b'lemma:minimal'
-0.684515 O b'-1:lemma:co2'
-0.689511 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.718278 O b'+1:postag:IN'
-0.725986 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.736153 Agit b'hUpper'
-0.739611 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.787009 O b'-1:lemma:ph'
-0.826153 Air b'postag:NN'
-0.830252 O b'lemma:of'
-0.837608 O b'-2:lemma:IP'
-0.839026 O b'-2:lemma:pahse'
-0.870535 O b'lemma:aerobic'
-0.904879 Technique b'-1:postag::'
-0.914762 Med b'+2:postag:VBN'
-0.917941 O b'-1:lemma:1'
-0.923745 O b'-2:lemma:media'
-0.926660 O b'-1:postag::'
-0.944444 Gtype b'-2:postag:CD'
-0.950224 O b'-1:lemma:30'
-0.957007 O b'+1:lemma:in'
-0.972327 O b'+1:lemma:at'
-1.006422 Strain b'symb'
-1.018773 O b'-2:postag:VBG'
-1.039726 O b'+2:lemma:anaerobically'
-1.046598 O b'-1:lemma:sample'
-1.060340 O b'+2:lemma:+'
-1.062926 OD b'hUpper'
-1.065423 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.104955 Temp b'hLower'
-1.126074 Technique b'+1:ner:_'
-1.171307 O b'lemma:media'
-1.208478 Supp b'+2:postag:CD'
-1.253311 O b'+2:lemma:rifampicin'
-1.263485 O b'lemma:30'
-1.274637 OD b'+1:postag:NN'
-1.290728 Phase b'postag:JJ'
-1.306411 O b'lemma:0.3'
-1.325609 O b'lemma:aerobically'
-1.370852 Supp b'+2:lemma:2'
-1.376819 Supp b'+2:lemma:1'
-1.377442 Supp b'postag:JJ'
-1.385461 O b'-1:lemma:2'
-1.422242 O b'-2:lemma:rpob'
-1.446351 O b'-2:ner:TF'
-1.614310 O b'-2:lemma:iptg'
-1.676687 O b'+2:lemma:b'
-1.707795 O b'-2:lemma:the'
-1.798170 OD b'+2:lemma:aerobically'
-1.905760 O b'-2:lemma:0.3'
-2.139720 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-2.393819 O b'+1:lemma:2'
-2.425325 O b'+1:lemma:1'
-2.511582 Phase b'hUpper'
-2.615968 O b'+2:lemma:iptg'
-2.743169 Technique b'symb'
-3.744367 O b'-1:lemma::'
-4.982179 O b'-1:lemma:_'