report_Run14_v13.txt 37 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.23724446580655864, 'c2': 0.00765495768357585}
best CV score:0.8530997523170145
model size: 0.08M

Flat F1: 0.8145012586423507
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.897     0.398     0.551        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.968     0.782     0.865        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.864     0.838     0.851       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.922     0.752     0.815       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    6.728625
OD     -> OD      5.795467
Med    -> Med     5.380260
Anti   -> Anti    5.353202
Phase  -> Phase   4.913678
Supp   -> Supp    4.738591
Gversion -> Gversion 4.693714
Air    -> Air     4.399915
Gtype  -> Gtype   4.068167
pH     -> pH      3.878942
Technique -> Technique 3.809308
O      -> O       2.966317
Agit   -> Agit    2.014948
Substrain -> Gtype   1.351780
Technique -> Air     1.126979
Air    -> O       0.754250
O      -> Technique 0.438124
Temp   -> O       0.133770
Gtype  -> Supp    0.113969
O      -> Strain  0.087851
Supp   -> O       0.087274
O      -> Supp    0.053960
O      -> Gtype   0.033795
O      -> Phase   0.014290
O      -> Med     -0.000092
Supp   -> Med     -0.000559
Phase  -> OD      -0.001383
Gtype  -> Technique -0.020196
Phase  -> O       -0.041039
Anti   -> Gtype   -0.103106
Technique -> O       -0.114782
OD     -> O       -0.234336
OD     -> Air     -0.361724
O      -> OD      -0.379451
Technique -> pH      -0.844840
Substrain -> O       -1.003014
O      -> Air     -1.482470
Gtype  -> O       -1.607768
Med    -> Supp    -1.827367


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    6.728625
OD     -> OD      5.795467
Med    -> Med     5.380260
Anti   -> Anti    5.353202
Phase  -> Phase   4.913678
Supp   -> Supp    4.738591
Gversion -> Gversion 4.693714
Air    -> Air     4.399915
Gtype  -> Gtype   4.068167
pH     -> pH      3.878942
Technique -> Technique 3.809308
O      -> O       2.966317
Agit   -> Agit    2.014948
Substrain -> Gtype   1.351780
Technique -> Air     1.126979
Air    -> O       0.754250
O      -> Technique 0.438124
Temp   -> O       0.133770
Gtype  -> Supp    0.113969
O      -> Strain  0.087851
Supp   -> O       0.087274
O      -> Supp    0.053960
O      -> Gtype   0.033795
O      -> Phase   0.014290
O      -> Med     -0.000092
Supp   -> Med     -0.000559
Phase  -> OD      -0.001383
Gtype  -> Technique -0.020196
Phase  -> O       -0.041039
Anti   -> Gtype   -0.103106
Technique -> O       -0.114782
OD     -> O       -0.234336
OD     -> Air     -0.361724
O      -> OD      -0.379451
Technique -> pH      -0.844840
Substrain -> O       -1.003014
O      -> Air     -1.482470
Gtype  -> O       -1.607768
Med    -> Supp    -1.827367


Top positive:
7.178287 Gtype    b'lemma:type'
6.404998 Anti     b'-2:lemma:antibody'
6.397698 O        b'lemma:1'
6.339842 O        b'lemma:_'
5.989932 O        b'-2:lemma:_'
5.941370 O        b'lemma:2'
5.916327 Air      b'lemma:anaerobic'
5.571221 Gtype    b'lemma:wt'
5.302808 O        b'lemma:3'
5.292070 Gtype    b'hGreek'
5.234023 Phase    b'lemma:mid-log'
5.232973 Supp     b'lemma:no3'
5.010009 O        b'lemma:-'
4.984155 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
4.982983 Technique b'lemma:chipseq'
4.852852 Gtype    b'+1:lemma:type'
4.652536 Phase    b'-2:lemma:phase'
4.544310 Med      b'lemma:MOPS'
4.311827 Air      b'lemma:aerobic'
4.255761 Supp     b'lemma:pq'
4.193148 O        b'lemma:b'
3.952356 Supp     b'-2:lemma:shake'
3.911790 O        b'lemma:with'
3.904169 Supp     b'lemma:Iron'
3.904169 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.887434 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.847811 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
3.765810 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.757347 Gtype    b'lemma:dfnr'
3.722204 Supp     b'lemma:2h'
3.722204 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.687557 Supp     b'lemma:Adenine'
3.613466 O        b'lemma:a'
3.603126 O        b'-1:postag:NNS'
3.534695 Med      b'lemma:LB'
3.515786 Gtype    b'-1:ner:GEN'
3.503627 O        b'postag:VBG'
3.492909 Supp     b'lemma:nh4cl'
3.442817 Supp     b'lemma:iptg'
3.440810 Air      b'-1:lemma:-'
3.351016 O        b'lemma:.'
3.351016 O        b'postag:.'
3.300966 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.281006 Substrain b'lemma:mg1655'
3.251053 Supp     b'lemma:nacl'
3.247079 O        b'postag::'
3.246696 Air      b'lemma:aerobically'
3.196899 O        b'lemma:rpob'
3.166965 Strain   b'lemma:k-12'
3.147423 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.140574 Air      b'postag:RB'
3.008307 Supp     b'-1:ner:SUPP'
2.995627 O        b'-1:lemma:lb'
2.982809 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
2.979636 O        b'+1:lemma:wt'
2.949780 Gtype    b'lemma:pk4854'
2.916277 pH       b'lemma:ph5'
2.916277 pH       b'+1:lemma:.5'
2.915036 O        b'-1:lemma:tag'
2.895560 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.888085 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
2.884398 Med      b'lemma:media'
2.875312 O        b'lemma:\xcf\x8332'
2.846079 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.843083 O        b'postag:IN'
2.782135 Med      b'lemma:lb'
2.764130 Temp     b'-1:lemma:sample'
2.744150 Technique b'+2:lemma:ph5'
2.737022 Air      b'-2:lemma:IP'
2.724487 O        b'lemma:rep2'
2.724487 O        b'lemma:rep1'
2.717176 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.715777 O        b'lemma:Cra'
2.629322 Med      b'lemma:m63'
2.624086 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.589119 Med      b'+2:lemma:b2'
2.523774 Supp     b'-2:lemma:media'
2.517301 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.508910 O        b'lemma:genotype/variation'
2.495832 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
2.427888 Technique b'lemma:ChIP-exo'
2.420246 O        b'lemma::'
2.415375 O        b'+1:lemma:coli'
2.411091 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.410682 Supp     b'-1:lemma:+'
2.379083 Technique b'hUpper'
2.349071 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.344335 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.338027 Air      b'-1:lemma:co2'
2.337485 Supp     b'-1:lemma:Cra'
2.336501 Air      b'lemma:anaeroibc'
2.314859 Supp     b'+1:lemma:1'
2.274986 O        b'lemma:culture'
2.266099 Supp     b'+1:lemma:2'
2.258789 Temp     b'lemma:37'
2.240798 Supp     b'-1:lemma:with'
2.222082 O        b'-1:lemma:type'
2.182232 Med      b'lemma:minimal'
2.180225 O        b'+1:postag:RB'
2.164342 Supp     b'lemma:Leu'
2.164342 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
2.157371 Technique b'-1:lemma:_'
2.154163 O        b'-1:lemma:0.3'
2.147788 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.147788 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.139435 pH       b'+1:postag:CD'
2.127143 Supp     b'+2:lemma:feso4'
2.118828 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.113182 O        b'-1:lemma:glucose'
2.089432 Agit     b'lemma:rpm'
2.087570 Supp     b'lemma:acetate'
2.083599 Temp     b'lemma:43'
2.069178 Agit     b'-1:lemma:250'
2.057135 Phase    b'-2:lemma:until'
1.992647 Supp     b'lemma:arginine'
1.969059 O        b'lemma:harbor'
1.965795 O        b'-1:lemma:anaerobic'
1.932873 O        b'-2:lemma:myc'
1.914780 Med      b'+2:postag:CC'
1.911832 O        b'lemma:chip'
1.907315 OD       b'lemma:od600'
1.895522 Vess     b'lemma:flask'
1.895522 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.895522 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.895522 Vess     b'+2:lemma:43'
1.874367 O        b'+1:lemma:0.2'
1.850911 O        b'-2:lemma:overnight'
1.842417 O        b'+2:lemma:crp'
1.831002 Air      b'postag:JJ'
1.825690 O        b'lemma:ompr'
1.822051 Gtype    b'+1:postag::'
1.787796 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.760298 O        b'lemma:for'
1.753657 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.752729 OD       b'lemma:od450'
1.741166 O        b'postag:CC'
1.740020 Supp     b'-2:lemma:argr'
1.739139 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.734812 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.734685 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.728549 Temp     b'-1:lemma:43'
1.726752 Med      b'lemma:medium'
1.720448 O        b'+1:lemma:od600'
1.711211 Temp     b'-1:lemma:37'
1.684289 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.678280 Med      b'+2:lemma:b1'
1.674697 Phase    b'postag:NN'
1.667773 Gversion b'lemma:u00096'
1.667773 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.651198 Technique b'lemma:rnaseq'
1.648120 O        b'+1:lemma:pq'
1.645149 Gversion b'lemma:.2'
1.645149 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.639167 O        b'postag:VBN'
1.637631 O        b'lemma:CEL'
1.633325 O        b'-1:lemma:wt'
1.625775 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
1.615405 Supp     b'-2:lemma:20'
1.612454 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.597998 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.595226 O        b'-1:lemma:nitrate'
1.584008 O        b'-2:lemma:='
1.570488 Med      b'+1:lemma:0.4'
1.561917 O        b'lemma:-lrb-'
1.543987 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.543987 Strain   b'-2:lemma:str'
1.539131 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.521338 O        b'lemma:ml'
1.519448 Technique b'-2:lemma:wt'
1.506520 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.494210 Gversion b'lemma:000913'
1.494210 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.481164 O        b'-1:lemma:min'
1.474450 O        b'lemma:at'
1.464759 pH       b'lemma:5.5'
1.464225 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.458366 OD       b'lemma:0.3'
1.450200 Supp     b'lemma:fructose'
1.444161 Technique b'-2:postag:NNP'
1.438616 Med      b'+2:lemma:+'
1.423732 Gversion b'-2:lemma:build'
1.417846 O        b'-2:lemma:medium'
1.417522 Supp     b'-2:lemma:agent'
1.412564 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.412492 Gtype    b'postag:JJ'
1.410133 Supp     b'-2:lemma:for'
1.406868 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.406858 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
1.406746 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.406746 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.406366 Gtype    b'hUpper'
1.403911 Supp     b'-1:postag:CD'
1.400250 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.398624 O        b'-2:ner:MED'
1.395957 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.389576 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.388317 Supp     b'lemma:glucose'
1.353659 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.353659 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.353659 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
1.349982 Gversion b'lemma:nc'
1.349982 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.336975 O        b'-1:lemma:l1'
1.327674 Technique b'hLower'
1.327502 O        b'postag:-RRB-'
1.323256 O        b'symb'
1.317126 O        b'-2:lemma:fructose'
1.311254 Supp     b'-1:lemma:_'
1.309199 Air      b'-2:lemma:fnr'
1.285636 O        b'-1:lemma:-80'
1.274013 Supp     b'+2:lemma:add'
1.259354 O        b'postag:-LRB-'
1.250513 pH       b'+1:lemma:5.5'
1.248197 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.245216 OD       b'+1:lemma:of'
1.241284 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.225035 O        b'lemma:purr'
1.223387 OD       b'-1:postag:IN'
1.220592 Supp     b'-2:lemma:pahse'
1.214962 Gtype    b'+1:lemma:the'
1.212599 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.211173 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.200357 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
1.199217 O        b'+1:lemma:acetate'
1.195421 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.184098 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.182109 Gtype    b'+2:lemma::'
1.182065 O        b'+1:postag:NNP'
1.180901 O        b'+1:lemma:250'
1.177888 Technique b'-1:lemma:input'
1.176371 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.165554 Med      b'-2:postag:JJ'
1.157431 Air      b'+2:postag:CD'
1.153589 O        b'postag:VBD'
1.153420 O        b'lemma:argr'
1.152629 O        b'lemma:chip-arca'
1.152629 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.151137 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.145589 O        b'lemma:chip-fnr'
1.145589 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
1.135100 O        b'-2:lemma:~'
1.135080 Gtype    b'-1:lemma:vector'
1.132231 OD       b'lemma:of'
1.125312 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.122214 Substrain b'-1:lemma:.'
1.122214 Substrain b'-1:postag:.'
1.120873 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.120560 Med      b'+1:lemma:+'
1.106926 Gtype    b'lemma:wild-type'
1.106210 Med      b'-1:lemma:ml'
1.106078 Agit     b'lemma:250'
1.104735 O        b'lemma:-rrb-'
1.104198 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.097865 Supp     b'lemma:Fe'
1.096678 O        b'-1:lemma:nacl'
1.095678 Air      b'-2:lemma:cm20'
1.088705 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
1.087514 O        b'-1:lemma:pq'
1.086317 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.078000 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
1.074602 Supp     b'-1:lemma:sodium'
1.074602 Supp     b'+2:lemma:1/100'
1.065943 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.065943 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.065096 Supp     b'lemma:glutamine'
1.065096 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
1.062624 Med      b'-2:lemma:minimal'
1.058469 pH       b'lemma:ph'
1.045288 O        b'lemma:input'
1.045288 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.042180 Supp     b'+2:lemma:A'
1.024859 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.022299 Air      b'-2:lemma:%'
1.012830 O        b'lemma:soxr'
1.012830 O        b'lemma:soxs'
1.011966 Supp     b'-2:lemma:10'
1.009724 Gversion b'-2:postag:VB'
1.002142 Supp     b'-1:lemma:ompr'
0.988887 Vess     b'+1:lemma:at'
0.987620 Substrain b'+2:lemma::'
0.984797 Gtype    b'+1:lemma::'
0.981814 Technique b'lemma:rna-seq'
0.981127 Supp     b'lemma:rifampicin'
0.979963 Temp     b'-2:lemma:keep'
0.973161 O        b'+1:lemma::'
0.967629 Supp     b'-2:postag:VBG'
0.964962 O        b'lemma:,'
0.964962 O        b'postag:,'
0.963685 Med      b'+1:lemma:medium'
0.954752 Technique b'-1:lemma:IP'
0.951888 Air      b'+1:lemma:%'
0.951029 Air      b'+2:lemma:%'
0.944153 Gtype    b'+1:lemma:with'
0.940552 Supp     b'+1:lemma:_'
0.939019 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
0.929566 Air      b'-1:lemma:%'
0.929315 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
0.928036 Gtype    b'+2:postag::'
0.927135 OD       b'-2:lemma:od450'
0.924822 Air      b'lemma:%'
0.913444 Gtype    b'-2:postag:JJ'
0.913086 pH       b'-1:lemma:ph'
0.912684 Supp     b'-1:lemma:vol'
0.912684 Supp     b'-2:lemma:1/100'
0.912684 Supp     b'+2:lemma:1m'
0.910605 O        b'+2:postag:JJ'
0.910314 Gtype    b'hLower'
0.905789 O        b'lemma:~'
0.904945 Agit     b'+2:lemma:at'
0.904076 Technique b'-2:lemma:Fur'
0.902596 Med      b'+2:lemma:with'
0.900366 Supp     b'lemma:dpd'
0.897999 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.897999 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.897934 Med      b'lemma:2'
0.895023 Supp     b'+2:lemma:be'
0.892487 O        b'lemma:gadx'
0.884366 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
0.884088 Supp     b'postag:NNP'
0.876661 O        b'-2:lemma:min'
0.871888 Gtype    b'-2:lemma:dna'
0.867961 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
0.867304 O        b'-1:lemma:into'
0.863188 Air      b'-1:lemma:phase'
0.862471 O        b'lemma:trpr'
0.862298 Air      b'-2:lemma:0.3'
0.860761 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
0.858318 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.858318 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.857236 Supp     b'-1:lemma:1m'
0.857236 Supp     b'+2:lemma:7.6'
0.855511 O        b'lemma:A'
0.853714 Agit     b'-2:postag:RB'
0.852806 O        b'+1:postag:VBN'
0.840221 Air      b'-2:postag:CD'
0.836530 Supp     b'+1:lemma:hour'
0.831288 O        b'+1:ner:MED'
0.830137 Supp     b'lemma:20'
0.829222 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
0.829222 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
0.827266 O        b'-2:lemma:37'
0.824852 Substrain b'+2:postag::'
0.823945 Phase    b'-1:lemma::'
0.821753 Gtype    b'lemma:the'
0.819864 Med      b'-1:lemma:glucose'
0.817326 O        b'+2:lemma:fructose'
0.815047 Gversion b'postag:NN'
0.813335 Air      b'-2:lemma:mid-log'
0.809184 O        b'-2:ner:_'
0.805806 Vess     b'-1:postag:VBN'
0.803102 O        b'lemma:growth'
0.796537 Med      b'-2:lemma:fresh'
0.791723 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.791288 O        b'+1:lemma:ph5'
0.791288 O        b'+2:lemma:.5'
0.790188 O        b'-1:lemma:aerobic'
0.786563 O        b'lemma:additional'
0.786563 O        b'+1:lemma:2h'
0.786312 O        b'-2:postag:FW'
0.781153 Gtype    b'-1:lemma:wild'
0.773044 Gtype    b'-2:lemma:delta'
0.767844 Gtype    b'-2:ner:_'
0.766307 Phase    b'+1:lemma:phase'
0.760775 O        b'-1:lemma:dpd'
0.757808 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
0.751781 O        b'+2:lemma:_'
0.748871 Supp     b'lemma:0.2'
0.747026 O        b'+1:lemma:rifampicin'
0.746555 Med      b'-1:lemma:fresh'
0.744867 Strain   b'-2:lemma:strain'
0.741655 O        b'-2:lemma:od600'
0.738559 Med      b'+1:postag:CD'
0.737309 pH       b'lemma:.5'
0.737309 pH       b'-1:lemma:ph5'
0.735344 Temp     b'+2:postag:DT'
0.733069 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
0.732894 Anti     b'hGreek'
0.732059 OD       b'+1:postag:IN'
0.730036 Phase    b'lemma:phase'
0.724916 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
0.721577 Supp     b'-2:lemma:trpr'
0.720930 O        b'+1:lemma:20'
0.718982 O        b'+1:ner:SUPP'
0.714143 Air      b'-1:postag:CD'
0.712823 O        b'hLower'
0.705308 Supp     b'-1:postag:IN'
0.702608 Med      b'postag:NNP'
0.701732 O        b'lemma:0.4'
0.697905 O        b'+1:lemma:k-12'
0.696237 Supp     b'symb'
0.696207 O        b'+1:postag::'
0.694889 O        b'+2:lemma:aerobically'
0.691444 O        b'-2:lemma:be'
0.691307 pH       b'-2:lemma:at'
0.688213 Supp     b'-1:lemma:final'
0.687774 Temp     b'-2:lemma:see'
0.683972 Supp     b'-1:lemma:0.2'
0.682716 O        b'+1:lemma:and'
0.678213 Strain   b'-1:lemma:.'
0.678213 Strain   b'-1:postag:.'
0.676935 OD       b'+2:postag:CD'
0.675127 OD       b'postag:IN'
0.672770 Gtype    b'+2:ner:SUPP'
0.672769 O        b'+1:postag:VBZ'
0.670859 O        b'-2:lemma:anaerobic'
0.669652 Strain   b'+2:lemma:.'
0.669652 Strain   b'+2:postag:.'
0.668505 O        b'+2:lemma:wt'
0.668368 Temp     b'lemma:sample'
0.667253 Air      b'+1:lemma:until'
0.662176 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.659624 Technique b'lemma:chip-seq'
0.657946 pH       b'-1:postag:NN'
0.653983 Gtype    b'-2:postag:NN'
0.653929 O        b'-1:lemma:antibody'
0.653512 Gtype    b'lemma:flagtag'
0.653512 Gtype    b'-2:lemma:nsrr'
0.649248 O        b'-1:ner:_'
0.648249 Supp     b'-1:lemma:mm'
0.645068 O        b'lemma:affyexp'
0.643188 O        b'lemma:-80'
0.643188 O        b'-2:lemma:freeze'
0.641830 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.641830 Supp     b'+1:ner:KWSUPP'
0.641039 O        b'+2:ner:_'
0.629144 Air      b'lemma:Anaerobic'
0.625086 Gtype    b'-1:postag:VBP'
0.624830 Supp     b'-1:lemma:,'
0.624830 Supp     b'-1:postag:,'
0.619146 Air      b'+2:lemma:mid-log'
0.609124 Phase    b'lemma:pahse'
0.607630 pH       b'-1:lemma:at'
0.605160 Technique b'+2:postag:-RRB-'
0.604916 Gtype    b'+1:ner:GEN'
0.602549 Phase    b'-1:postag::'
0.597960 Med      b'-2:ner:_'
0.596020 Vess     b'-2:postag:JJ'
0.592960 Gtype    b'lemma:vector'
0.591905 Med      b'+2:lemma:then'
0.589749 Supp     b'postag:NN'
0.585166 O        b'-2:lemma:twice'
0.584665 Supp     b'-1:postag:SYM'
0.579625 Med      b'-1:lemma:in'
0.578893 OD       b'+2:lemma:~'
0.577984 Gtype    b'-2:postag:NNS'
0.576808 O        b'-2:lemma:250'
0.573553 Supp     b'+2:lemma:ph'
0.572545 Anti     b'+2:postag:NNP'
0.569701 Technique b'lemma:chip-exo'
0.569392 O        b'+2:postag:VBD'
0.568878 Gtype    b'-2:lemma:the'
0.567443 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.565917 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
0.563802 Supp     b'lemma:of'
0.563074 Agit     b'+2:postag:-RRB-'
0.561821 Agit     b'+2:lemma:-rrb-'
0.560066 Temp     b'-2:postag:VB'
0.558020 Gtype    b'+1:lemma:control'
0.557930 Supp     b'+2:postag:VBD'
0.556811 OD       b'+2:lemma:culture'
0.555446 Agit     b'-1:postag:-LRB-'
0.553638 Anti     b'-2:ner:_'
0.551226 Air      b'-2:ner:_'
0.551007 Agit     b'-1:lemma:-lrb-'
0.550736 Supp     b'+1:lemma:be'
0.549777 Supp     b'-1:lemma:without'
0.549589 OD       b'+1:ner:_'
0.549416 pH       b'+1:lemma:.'
0.549416 pH       b'+1:postag:.'
0.548836 Gtype    b'-1:lemma:from'
0.545037 Agit     b'+1:lemma:-rrb-'
0.542197 Supp     b'+2:postag:IN'
0.540468 Med      b'+1:lemma:supplement'
0.539808 O        b'+2:lemma:of'
0.533151 Temp     b'+1:postag:CC'
0.529984 O        b'lemma:genotype'
0.528697 Supp     b'+1:postag:VBD'
0.526187 Agit     b'-2:postag:-LRB-'
0.523697 Supp     b'-2:postag:CD'
0.523546 Gversion b'+1:postag:CD'
0.522000 Anti     b'hLower'
0.521975 Gtype    b'+2:postag:NN'
0.520811 Supp     b'-1:lemma:potassium'
0.520811 Supp     b'-2:lemma:mmol'
0.519628 O        b'-1:lemma:4'
0.518519 OD       b'-1:lemma:of'
0.517908 pH       b'-2:lemma:glucose'
0.515925 Agit     b'+1:postag:-RRB-'
0.514372 Supp     b'lemma:cm20'
0.514372 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
0.507754 Anti     b'-1:lemma::'
0.507687 Agit     b'-2:lemma:-lrb-'
0.507392 O        b'-1:lemma:medium'
0.504600 Supp     b'lemma:7.6'
0.504600 Supp     b'+1:lemma:;'
0.499335 Med      b'-1:postag:JJ'
0.495360 O        b'postag:NNS'
0.493365 Air      b'-1:postag::'
0.491300 Strain   b'-2:postag:NN'
0.491233 pH       b'+2:lemma:.'


Top negative:
0.044624 O        b'+1:lemma:minute'
0.043542 Technique b'-1:postag:NN'
0.042770 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
0.042770 Gtype    b'+2:lemma:.5'
0.040930 Gtype    b'postag:-RRB-'
0.040647 Supp     b'-2:lemma:iptg'
0.038250 O        b'+1:lemma:to'
0.038250 O        b'+1:postag:TO'
0.037280 Air      b'symb'
0.035870 O        b'+2:lemma:for'
0.034996 Supp     b'+2:lemma:for'
0.033150 Med      b'-2:postag:NN'
0.032073 Gtype    b'+1:postag:CD'
0.031635 O        b'-1:lemma:phase'
0.030416 Temp     b'-2:lemma:flask'
0.030402 Air      b'postag:CD'
0.030072 Temp     b'+2:postag:CC'
0.028121 Air      b'+1:postag:CD'
0.027793 Air      b'+2:ner:_'
0.026917 O        b'-1:lemma:grow'
0.023195 O        b'postag:NNP'
0.020411 O        b'-2:lemma:at'
0.020155 O        b'-2:lemma:no3'
0.020001 Temp     b'+1:lemma:short'
0.019218 Air      b'+1:postag:NN'
0.019162 O        b'-1:lemma:for'
0.018173 Air      b'-2:lemma:and'
0.015606 O        b'+2:lemma:to'
0.015606 O        b'+2:postag:TO'
0.015468 Supp     b'-1:lemma:.'
0.015468 Supp     b'-1:postag:.'
0.014778 O        b'+1:lemma:7.6'
0.014778 O        b'-2:lemma:1m'
0.014778 O        b'+2:lemma:;'
0.013913 O        b'-2:lemma:n2'
0.013345 Temp     b'+2:lemma:the'
0.009661 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
0.009541 O        b'+2:lemma:-lrb-'
0.009408 O        b'+1:lemma:dfnr'
0.009291 O        b'-1:lemma:at'
0.009280 O        b'+2:lemma:a'
0.009196 Gtype    b'lemma:crp'
0.008947 O        b'-2:lemma:strain'
0.008587 O        b'-1:lemma:anti-rpos'
0.008587 O        b'+1:lemma:neoclone'
0.008288 Gtype    b'-2:lemma:small'
0.007971 Temp     b'-1:postag:NN'
0.007110 O        b'+1:lemma:tritonx-100'
0.006692 Technique b'-1:lemma:1'
0.006375 Med      b'+2:lemma:-rrb-'
0.006167 Gtype    b'-1:postag:IN'
0.005921 Gversion b'+2:ner:_'
0.005789 O        b'hUpper'
0.005705 O        b'-1:lemma:n2'
0.005565 Air      b'+1:lemma:at'
0.005340 O        b'-2:lemma:;'
0.004804 O        b'-1:lemma:fructose'
0.004748 Supp     b'-1:lemma:20'
0.004578 O        b'lemma:5'
0.004520 O        b'lemma:2.0'
0.004501 OD       b'lemma:0.4'
0.004441 O        b'+2:lemma:wash'
0.004400 Supp     b'lemma:ph'
0.004367 Supp     b'+1:postag:JJ'
0.004251 Supp     b'-2:lemma:of'
0.003775 Med      b'+2:lemma:without'
0.003116 O        b'-2:lemma:culture'
0.003075 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.002974 O        b'+2:ner:GEN'
0.002902 O        b'+1:lemma:-'
0.002720 O        b'-1:lemma:2.5'
0.002379 Supp     b'-2:lemma:rpob'
0.002316 OD       b'+2:lemma:0.4'
0.002307 O        b'+1:lemma:genbank'
0.002120 O        b'-1:lemma:5'
0.002067 O        b'-1:lemma:Iron'
0.001736 Temp     b'lemma:-rrb-'
0.001699 Supp     b'-1:postag:JJ'
0.001679 O        b'+1:lemma:culture'
0.001532 Temp     b'postag:-RRB-'
0.001226 Gtype    b'+2:lemma:fnr'
0.000842 Anti     b'-2:postag::'
0.000824 O        b'lemma:10'
0.000743 O        b'-2:lemma:.2'
0.000731 Gtype    b'+1:postag:NN'
0.000726 O        b'lemma:genbank'
0.000661 O        b'-2:lemma:sample'
0.000449 O        b'-2:lemma:2.5'
0.000439 O        b'+1:lemma:final'
0.000401 Med      b'+2:postag:-RRB-'
0.000341 O        b'+1:lemma:be'
0.000264 O        b'+1:lemma:ml'
0.000224 Gversion b'+2:postag:NN'
0.000149 O        b'+1:lemma:anerobically'
0.000149 O        b'-2:lemma:600nm'
0.000145 Supp     b'lemma:in'
0.000144 Gtype    b'+2:lemma:rep2'
0.000144 Gtype    b'+2:lemma:rep1'
0.000133 Supp     b'lemma:sodium'
0.000133 Supp     b'+1:lemma:phosphate'
0.000119 Anti     b'-2:lemma:rna'
0.000119 Anti     b'-1:lemma:polymerase'
0.000105 Gtype    b'+2:postag:VBN'
0.000076 O        b'-1:lemma:fnr'
0.000058 O        b'+1:lemma:read'
0.000041 Technique b'-1:postag:NNP'
0.000039 Gversion b'-1:ner:_'
0.000025 Supp     b'-1:lemma:iptg'
0.000025 Technique b'+1:lemma:Anaerobic'
0.000022 Supp     b'+1:lemma:300'
0.000021 Technique b'-2:ner:TF'
0.000014 Anti     b'+1:postag:IN'
0.000012 Supp     b'+1:lemma:and'
0.000011 Temp     b'lemma:30'
0.000010 Substrain b'hUpper'
0.000009 Gtype    b'lemma:transcription'
0.000009 Gtype    b'+1:lemma:factor'
0.000009 Gtype    b'+2:lemma:Fur'
0.000008 O        b'+2:lemma:1'
0.000008 Gtype    b'+2:ner:TF'
0.000005 O        b'-2:postag:NNS'
0.000005 O        b'lemma:mm'
0.000005 O        b'-1:ner:KWSUPP'
0.000005 Supp     b'+1:postag:RB'
0.000005 O        b'lemma:Deficient'
0.000003 Air      b'-2:postag:NNP'
0.000003 O        b'lemma:glycine'
0.000002 Air      b'-1:lemma:o2'
0.000001 Supp     b'+1:postag:CC'
0.000001 Phase    b'+1:lemma:for'
0.000001 O        b'-1:lemma:0.4'
0.000001 O        b'+1:lemma:glycine'
0.000001 O        b'-2:lemma:Cold'
-0.000000 Gtype    b'lemma:-lrb-'
-0.000000 Gtype    b'+1:postag:-RRB-'
-0.000000 Gtype    b'postag:NNP'
0.000000 Gtype    b'-2:postag:VBG'
-0.000001 O        b'-1:lemma:o2'
-0.000002 O        b'+1:lemma:antibody'
-0.000006 Supp     b'postag:NNS'
-0.000008 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.000010 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.000012 Gtype    b'-1:postag:-LRB-'
-0.000016 O        b'lemma:dissolve'
-0.000016 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.000018 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.000025 O        b'lemma:pahse'
-0.000041 Gtype    b'+2:lemma:-rrb-'
-0.000048 O        b'lemma:methanol'
-0.000048 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.000076 O        b'+2:lemma:in'
-0.000117 O        b'lemma:m63'
-0.000119 Gtype    b'+1:lemma:-rrb-'
-0.000132 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.000137 O        b'lemma:phosphate'
-0.000156 Supp     b'lemma:%'
-0.000197 Supp     b'-2:lemma:0.2'
-0.000239 O        b'lemma:0.1'
-0.000240 pH       b'hUpper'
-0.000251 O        b'+2:lemma:media'
-0.000306 Technique b'-2:ner:_'
-0.000309 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.000331 pH       b'hLower'
-0.000338 O        b'-1:lemma:.'
-0.000338 O        b'-1:postag:.'
-0.000338 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.000338 O        b'+2:lemma:1/100'
-0.000394 Supp     b'+1:postag:NNP'
-0.000396 Technique b'postag:NN'
-0.000475 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.000486 Med      b'-1:postag:IN'
-0.000506 pH       b'postag:NN'
-0.000671 Air      b'postag:-RRB-'
-0.000729 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.001041 OD       b'-1:postag:NN'
-0.001083 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.001118 Air      b'+2:lemma:-rrb-'
-0.001179 O        b'-2:lemma:phase'
-0.001194 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.001194 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.001194 O        b'+2:lemma:vol'
-0.001282 OD       b'lemma:2.0'
-0.001382 Supp     b'lemma:,'
-0.001382 Supp     b'postag:,'
-0.001513 O        b'-1:lemma:,'
-0.001513 O        b'-1:postag:,'
-0.001647 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.001793 O        b'-2:lemma:1'
-0.001997 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.002144 Temp     b'-2:postag:IN'
-0.002388 O        b'+2:ner:SUPP'
-0.002463 O        b'+2:postag:-LRB-'
-0.002463 O        b'+1:lemma:.'
-0.002463 O        b'+1:postag:.'
-0.002483 Supp     b'-2:postag:NNS'
-0.002831 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.002873 O        b'-2:lemma:nh4cl'
-0.002922 O        b'lemma:od600'
-0.003746 Temp     b'-2:lemma:at'
-0.003780 O        b'lemma:7.6'
-0.003780 O        b'+1:lemma:;'
-0.003803 O        b'-1:lemma:to'
-0.003803 O        b'-1:postag:TO'
-0.004146 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.004231 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.004583 Anti     b'postag:NNP'
-0.004659 Temp     b'+1:postag:NN'
-0.004942 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.005096 OD       b'symb'
-0.005177 Supp     b'-1:lemma:;'
-0.005177 Supp     b'-2:lemma:7.6'
-0.005855 O        b'-1:lemma:~'
-0.005935 Air      b'+2:postag:-RRB-'
-0.006154 Anti     b'symb'
-0.006806 O        b'+1:lemma:a'
-0.006985 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.007524 Gtype    b'-1:lemma::'
-0.007682 O        b'+1:lemma:0.4'
-0.008066 Supp     b'postag:CD'
-0.008628 Supp     b'-2:lemma:mm'
-0.008628 Supp     b'-2:ner:KWSUPP'
-0.008739 Med      b'+1:postag:IN'
-0.008827 O        b'+1:lemma:300'
-0.009922 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.009960 Air      b'postag:CC'
-0.010030 Supp     b'postag:IN'
-0.010068 Air      b'+2:lemma:until'
-0.011366 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.012537 Supp     b'-1:postag:NN'
-0.013330 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.014275 Air      b'+1:lemma:-rrb-'
-0.014334 Air      b'-1:postag:CC'
-0.014714 O        b'-2:lemma:%'
-0.015463 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.016033 Air      b'+2:postag:IN'
-0.016120 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.017086 O        b'-1:ner:GEN'
-0.017253 Phase    b'+2:postag:IN'
-0.017687 Air      b'+1:postag:-RRB-'
-0.017911 Temp     b'-2:ner:_'
-0.019461 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.022107 O        b'-1:lemma:final'
-0.022140 Supp     b'+1:ner:SUPP'
-0.022411 Anti     b'-1:ner:_'
-0.022497 Supp     b'hLower'
-0.022751 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.022751 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.023833 O        b'+1:lemma:mm'
-0.023833 O        b'+1:ner:KWSUPP'
-0.024249 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.024620 OD       b'lemma:~'
-0.026526 Med      b'+1:ner:MED'
-0.027171 O        b'+2:lemma:the'
-0.027731 Gtype    b'+2:ner:GEN'
-0.029895 Supp     b'-2:lemma:,'
-0.029895 Supp     b'-2:postag:,'
-0.030426 Gtype    b'postag:VBG'
-0.030599 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.032536 Temp     b'-1:ner:_'
-0.033050 O        b'-1:lemma:%'
-0.034169 Anti     b'+1:ner:_'
-0.034605 O        b'-2:postag:RB'
-0.036423 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.037163 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.039070 O        b'+2:postag:CC'
-0.039217 O        b'+2:lemma:tag'
-0.039807 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.041773 Air      b'lemma:,'
-0.041773 Air      b'postag:,'
-0.045384 Air      b'-2:postag:CC'
-0.046106 Supp     b'hUpper'
-0.046201 Temp     b'postag:NN'
-0.049106 Supp     b'+1:postag::'
-0.049722 Air      b'+2:lemma:,'
-0.049722 Air      b'+2:postag:,'
-0.049723 Supp     b'lemma:2'
-0.051780 Temp     b'-1:postag:IN'
-0.052863 Supp     b'-2:lemma:;'
-0.052889 Phase    b'+2:ner:_'
-0.054245 Supp     b'+2:ner:_'
-0.054917 O        b'+2:lemma:at'
-0.055630 O        b'+2:lemma:ph'
-0.058078 O        b'+1:lemma:media'
-0.060543 O        b'lemma:150'
-0.060543 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.060543 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.061181 O        b'+2:lemma:~'
-0.063040 O        b'+2:postag:IN'
-0.063757 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.064262 O        b'+2:lemma:sample'
-0.064567 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.065230 O        b'-1:postag:VBN'
-0.066797 O        b'+1:lemma:sample'
-0.067280 O        b'-2:lemma:to'
-0.067280 O        b'-2:postag:TO'
-0.070107 O        b'postag:NN'
-0.074212 O        b'-2:lemma:o2'
-0.074510 Gtype    b'-1:postag::'
-0.074641 O        b'lemma:co2'
-0.079076 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.083167 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.084690 OD       b'postag:NN'
-0.085764 O        b'+2:postag:DT'
-0.088286 O        b'+1:lemma:~'
-0.089422 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.090022 pH       b'+2:ner:_'
-0.091222 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.096436 O        b'-2:lemma:for'
-0.098975 O        b'lemma:1m'
-0.099762 Supp     b'+1:lemma:final'
-0.100597 O        b'-1:lemma:mm'
-0.101584 Supp     b'-2:lemma:glucose'
-0.102311 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.102935 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.109532 O        b'lemma:;'
-0.109532 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.110438 O        b'+2:lemma:supplement'
-0.111111 O        b'-1:ner:SUPP'
-0.111395 O        b'+1:lemma:of'
-0.117808 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.118464 O        b'-1:ner:MED'
-0.119752 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.120620 Supp     b'lemma:mm'
-0.120620 Supp     b'-1:ner:KWSUPP'
-0.120674 O        b'-2:lemma:grow'
-0.126088 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.128591 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.131882 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.131882 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.132466 O        b'+1:lemma:5'
-0.134333 O        b'-2:postag:DT'
-0.138467 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.142161 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.145894 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.149730 O        b'-1:lemma:until'
-0.154729 O        b'+1:postag:NNS'
-0.156653 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.158296 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.160966 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.165556 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.166588 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.168879 O        b'lemma:phase'
-0.173355 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.175074 O        b'-1:postag:DT'
-0.175208 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.176124 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.176407 Technique b'-1:lemma::'
-0.180425 O        b'lemma:fecl2'
-0.180784 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.181229 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.183847 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.187558 O        b'+2:lemma:genome'
-0.189092 Phase    b'+1:ner:_'
-0.189962 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.191802 Gtype    b'postag:NN'
-0.195074 O        b'-1:lemma:1m'
-0.195074 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.197116 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.202064 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.202196 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.207956 O        b'+1:lemma:%'
-0.210827 O        b'lemma:ph'
-0.218731 O        b'-2:lemma:20'
-0.219701 O        b'-1:lemma:of'
-0.220200 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.220691 O        b'lemma:sample'
-0.221311 O        b'+1:lemma:+'
-0.222869 O        b'-1:lemma:contain'
-0.224503 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.224580 Med      b'postag:CD'
-0.225817 O        b'+1:lemma:until'
-0.230476 O        b'-1:lemma:rna'
-0.231101 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.231685 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.242689 Med      b'-1:postag:NN'
-0.260463 Supp     b'hGreek'
-0.271639 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.273999 O        b'+2:lemma:co2'
-0.293745 O        b'lemma:medium'
-0.294026 Supp     b'lemma:10'
-0.303535 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.306825 O        b'-2:lemma:of'
-0.308023 O        b'+1:postag:CD'
-0.308424 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.308424 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.309132 Phase    b'symb'
-0.310316 Strain   b'hLower'
-0.320332 O        b'-1:lemma:IP'
-0.320928 O        b'lemma:20'
-0.325493 O        b'+2:lemma:m9'
-0.331411 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.337071 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.347793 O        b'+2:lemma:.'
-0.347793 O        b'+2:postag:.'
-0.350207 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.355707 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.365704 O        b'lemma:37'
-0.380882 Med      b'-1:ner:_'
-0.393582 Anti     b'+2:ner:_'
-0.396347 O        b'postag:RB'
-0.403052 OD       b'+2:postag:NN'
-0.404682 O        b'lemma:rifampicin'
-0.405132 O        b'-2:postag:SYM'
-0.405451 pH       b'symb'
-0.405624 O        b'-1:postag:IN'
-0.411850 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.413529 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.416768 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.421140 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.433860 O        b'+2:lemma:10'
-0.437792 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.442621 OD       b'hLower'
-0.447482 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.452514 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.456370 Med      b'hLower'
-0.459623 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.459623 Supp     b'+1:postag:,'
-0.461593 O        b'+2:postag:RB'
-0.462867 O        b'+1:lemma:1m'
-0.462867 O        b'-2:lemma:vol'
-0.479012 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.481345 Gversion b'hLower'
-0.489010 O        b'-2:postag::'
-0.489710 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.495814 O        b'-2:lemma:until'
-0.500124 Med      b'+1:postag:NN'
-0.500480 Vess     b'hUpper'
-0.512733 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.514299 Gtype    b'symb'
-0.527777 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.543875 O        b'lemma:wt'
-0.551425 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.553673 O        b'-2:lemma::'
-0.578601 O        b'lemma:mid-log'
-0.583834 O        b'+2:lemma:add'
-0.588524 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.616521 O        b'-1:lemma:the'
-0.636144 O        b'-1:lemma:vol'
-0.636144 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.636144 O        b'+2:lemma:1m'
-0.667349 O        b'+1:postag:DT'
-0.673656 Anti     b'hUpper'
-0.676892 O        b'lemma:minimal'
-0.684515 O        b'-1:lemma:co2'
-0.689511 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.718278 O        b'+1:postag:IN'
-0.725986 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.736153 Agit     b'hUpper'
-0.739611 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.787009 O        b'-1:lemma:ph'
-0.826153 Air      b'postag:NN'
-0.830252 O        b'lemma:of'
-0.837608 O        b'-2:lemma:IP'
-0.839026 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.870535 O        b'lemma:aerobic'
-0.904879 Technique b'-1:postag::'
-0.914762 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.917941 O        b'-1:lemma:1'
-0.923745 O        b'-2:lemma:media'
-0.926660 O        b'-1:postag::'
-0.944444 Gtype    b'-2:postag:CD'
-0.950224 O        b'-1:lemma:30'
-0.957007 O        b'+1:lemma:in'
-0.972327 O        b'+1:lemma:at'
-1.006422 Strain   b'symb'
-1.018773 O        b'-2:postag:VBG'
-1.039726 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-1.046598 O        b'-1:lemma:sample'
-1.060340 O        b'+2:lemma:+'
-1.062926 OD       b'hUpper'
-1.065423 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.104955 Temp     b'hLower'
-1.126074 Technique b'+1:ner:_'
-1.171307 O        b'lemma:media'
-1.208478 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.253311 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-1.263485 O        b'lemma:30'
-1.274637 OD       b'+1:postag:NN'
-1.290728 Phase    b'postag:JJ'
-1.306411 O        b'lemma:0.3'
-1.325609 O        b'lemma:aerobically'
-1.370852 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.376819 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.377442 Supp     b'postag:JJ'
-1.385461 O        b'-1:lemma:2'
-1.422242 O        b'-2:lemma:rpob'
-1.446351 O        b'-2:ner:TF'
-1.614310 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.676687 O        b'+2:lemma:b'
-1.707795 O        b'-2:lemma:the'
-1.798170 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-1.905760 O        b'-2:lemma:0.3'
-2.139720 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-2.393819 O        b'+1:lemma:2'
-2.425325 O        b'+1:lemma:1'
-2.511582 Phase    b'hUpper'
-2.615968 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.743169 Technique b'symb'
-3.744367 O        b'-1:lemma::'
-4.982179 O        b'-1:lemma:_'