report_Run14_v11.txt
36.6 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.3596656344885462, 'c2': 0.020798147571764843}
best CV score:0.8514572032055473
model size: 0.07M
Flat F1: 0.8199169662887013
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.857 0.923 21
Air 0.595 0.568 0.581 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.899 0.795 0.844 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.870 0.838 0.854 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.857 0.789 0.820 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.983085
OD -> OD 5.845496
Med -> Med 5.546814
Anti -> Anti 5.365172
Supp -> Supp 4.620391
Technique -> Technique 4.487418
Gversion -> Gversion 4.459951
Gtype -> Gtype 4.367392
Phase -> Phase 4.071530
Air -> Air 3.888677
pH -> pH 3.728107
O -> O 2.666457
Agit -> Agit 2.247589
Substrain -> Gtype 1.772247
Technique -> Air 1.129038
Gtype -> Supp 0.641898
O -> Technique 0.578413
Air -> O 0.530932
O -> Gtype 0.293089
O -> Supp 0.282262
Temp -> O 0.237685
Med -> O 0.208370
Supp -> O 0.113302
OD -> O 0.010944
Gtype -> pH 0.001065
OD -> Air -0.000022
O -> Med -0.000296
O -> Anti -0.035621
Gtype -> Temp -0.068916
O -> OD -0.096778
Technique -> pH -0.569658
Substrain -> O -0.900357
Med -> Supp -1.000638
Gtype -> O -1.125650
O -> Air -1.310674
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.983085
OD -> OD 5.845496
Med -> Med 5.546814
Anti -> Anti 5.365172
Supp -> Supp 4.620391
Technique -> Technique 4.487418
Gversion -> Gversion 4.459951
Gtype -> Gtype 4.367392
Phase -> Phase 4.071530
Air -> Air 3.888677
pH -> pH 3.728107
O -> O 2.666457
Agit -> Agit 2.247589
Substrain -> Gtype 1.772247
Technique -> Air 1.129038
Gtype -> Supp 0.641898
O -> Technique 0.578413
Air -> O 0.530932
O -> Gtype 0.293089
O -> Supp 0.282262
Temp -> O 0.237685
Med -> O 0.208370
Supp -> O 0.113302
OD -> O 0.010944
Gtype -> pH 0.001065
OD -> Air -0.000022
O -> Med -0.000296
O -> Anti -0.035621
Gtype -> Temp -0.068916
O -> OD -0.096778
Technique -> pH -0.569658
Substrain -> O -0.900357
Med -> Supp -1.000638
Gtype -> O -1.125650
O -> Air -1.310674
Top positive:
5.900234 Anti b'-2:lemma:antibody'
5.881729 O b'lemma:_'
5.755569 Gtype b'lemma:type'
5.308000 O b'lemma:1'
5.207386 Gtype b'lemma:wt'
5.060005 O b'-2:lemma:_'
4.876408 O b'lemma:2'
4.861996 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
4.822455 Air b'lemma:anaerobic'
4.804082 Gtype b'hGreek'
4.748296 Technique b'lemma:chipseq'
4.516413 Gtype b'+1:lemma:type'
4.483510 Phase b'-2:lemma:phase'
4.138475 O b'lemma:3'
4.081383 O b'lemma:-'
4.067203 Strain b'lemma:k-12'
4.058453 Supp b'lemma:no3'
4.019392 Phase b'lemma:mid-log'
3.645004 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
3.630735 O b'lemma:b'
3.569348 Air b'lemma:aerobically'
3.514418 Supp b'lemma:pq'
3.508888 Supp b'lemma:Iron'
3.508888 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.496012 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.489452 Supp b'-2:lemma:shake'
3.267464 O b'postag:VBG'
3.257925 Med b'lemma:MOPS'
3.243714 Supp b'lemma:2h'
3.243714 Supp b'-1:lemma:additional'
3.242458 Air b'lemma:aerobic'
3.094564 Air b'-1:lemma:-'
3.019519 Supp b'lemma:nh4cl'
3.011676 O b'postag::'
3.011253 Supp b'lemma:nacl'
2.957077 O b'postag:IN'
2.951518 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.949786 O b'lemma:.'
2.949786 O b'postag:.'
2.940606 O b'lemma:rpob'
2.926291 O b'lemma:a'
2.920479 Med b'lemma:lb'
2.908965 Air b'-2:lemma:IP'
2.899587 Supp b'lemma:Adenine'
2.864784 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.861448 O b'lemma:with'
2.838797 Gtype b'-2:lemma:genotype'
2.808417 Gtype b'lemma:dfnr'
2.805829 Technique b'hUpper'
2.799652 Supp b'lemma:iptg'
2.788370 Substrain b'lemma:mg1655'
2.788354 Med b'lemma:LB'
2.783756 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.778751 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.751924 Gtype b'lemma:pk4854'
2.741660 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.658674 Med b'lemma:minimal'
2.619336 O b'-1:postag:NNS'
2.602261 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.573807 Med b'lemma:media'
2.501038 Gtype b'-1:ner:GEN'
2.474883 O b'lemma:genotype/variation'
2.473171 pH b'lemma:ph5'
2.473171 pH b'+1:lemma:.5'
2.472507 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.464037 Temp b'-1:lemma:sample'
2.428503 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.406785 Technique b'+2:lemma:ph5'
2.377194 Supp b'-2:lemma:media'
2.342073 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
2.308554 O b'-1:lemma:tag'
2.274968 O b'+1:lemma:coli'
2.251679 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.218566 Supp b'-1:lemma:with'
2.209448 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.178429 pH b'+1:postag:CD'
2.166529 Temp b'lemma:43'
2.160297 O b'-1:lemma:0.3'
2.156528 O b'lemma:Cra'
2.122432 O b'-2:lemma:flagtag'
2.120684 O b'+1:lemma:pq'
2.115945 O b'+1:lemma:wt'
2.108904 Med b'lemma:m63'
2.040209 Technique b'-1:lemma:_'
2.006347 OD b'+1:lemma:of'
2.000524 Supp b'+1:lemma:1'
1.980548 Agit b'lemma:rpm'
1.979613 Temp b'lemma:37'
1.977592 O b'-2:lemma:myc'
1.958900 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
1.957800 Agit b'-1:lemma:250'
1.956396 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.952391 O b'lemma:rep2'
1.952391 O b'lemma:rep1'
1.948796 O b'lemma:harbor'
1.932088 O b'-1:lemma:lb'
1.926418 Technique b'-2:lemma:wt'
1.913367 O b'-1:lemma:type'
1.903832 Med b'+2:lemma:b2'
1.900900 Supp b'-1:lemma:+'
1.897317 Med b'+2:postag:CC'
1.876888 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
1.876888 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
1.866347 Phase b'postag:NN'
1.863336 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
1.844902 Air b'postag:RB'
1.841777 O b'-1:lemma:glucose'
1.836809 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
1.816274 O b'postag:VBN'
1.812865 Supp b'+2:lemma:feso4'
1.733634 Supp b'+1:lemma:2'
1.732479 O b'lemma::'
1.712779 O b'lemma:chip'
1.705332 Air b'-1:lemma:co2'
1.699239 Air b'postag:JJ'
1.696238 Supp b'-1:lemma:Cra'
1.680226 O b'lemma:\xcf\x8332'
1.659737 O b'-2:ner:MED'
1.646725 Vess b'lemma:flask'
1.646725 Vess b'-1:lemma:warm'
1.646725 Vess b'-2:lemma:pre'
1.646725 Vess b'+2:lemma:43'
1.640070 O b'-1:lemma:anaerobic'
1.625211 O b'lemma:CEL'
1.609900 Supp b'lemma:fructose'
1.608333 O b'+1:lemma:od600'
1.600139 OD b'-1:postag:IN'
1.593811 OD b'lemma:od450'
1.593189 Technique b'lemma:ChIP-exo'
1.588705 O b'postag:CC'
1.569655 Air b'lemma:anaeroibc'
1.557546 Gversion b'lemma:.2'
1.557546 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.542818 Supp b'-2:lemma:20'
1.537280 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.534233 Gtype b'+1:postag::'
1.521578 O b'+2:lemma:crp'
1.518896 Air b'-2:postag:CD'
1.512592 Supp b'-2:lemma:for'
1.512556 Air b'-2:lemma:%'
1.511836 Supp b'lemma:Leu'
1.511836 Supp b'-2:lemma:Lrp'
1.488756 Temp b'-1:lemma:37'
1.488496 Gversion b'lemma:u00096'
1.488496 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.471559 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.466964 Technique b'-2:postag:NNP'
1.447948 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.433636 OD b'lemma:0.3'
1.413549 O b'+1:ner:MED'
1.403644 Med b'+2:lemma:b1'
1.392227 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.389012 O b'lemma:ompr'
1.388026 O b'postag:-RRB-'
1.387160 Supp b'lemma:arginine'
1.386971 Supp b'+1:lemma:_'
1.375234 O b'lemma:-lrb-'
1.368311 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.358697 OD b'+2:lemma:0.3'
1.352998 Supp b'lemma:acetate'
1.342022 O b'lemma:culture'
1.340995 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.337379 O b'-1:lemma:wt'
1.329238 O b'-1:lemma:pq'
1.309329 Gversion b'-2:lemma:build'
1.298725 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.293943 O b'-1:lemma:mg1655'
1.287238 Supp b'lemma:glucose'
1.285894 Med b'-1:lemma:minimal'
1.280549 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.271186 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.256305 O b'symb'
1.247658 Supp b'-1:postag:CD'
1.243099 Med b'+1:lemma:g/l'
1.214797 Gtype b'+1:lemma:_'
1.213497 Med b'+2:lemma:+'
1.210948 Temp b'-1:lemma:43'
1.207130 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.206470 Gtype b'hUpper'
1.202386 O b'postag:VBD'
1.201240 Technique b'lemma:rnaseq'
1.200927 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.198340 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.192012 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.190086 O b'-1:lemma:-80'
1.187732 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.186976 Supp b'+2:lemma:add'
1.183431 O b'lemma:purr'
1.180519 Med b'-2:lemma:minimal'
1.158842 Med b'+1:lemma:0.4'
1.158554 Gtype b'+2:lemma::'
1.154210 O b'-1:lemma:nacl'
1.153868 Phase b'-2:lemma:until'
1.152598 O b'+1:postag:RB'
1.150707 O b'-1:lemma:l1'
1.149332 Agit b'lemma:250'
1.140325 Supp b'lemma:20'
1.139722 Gtype b'postag:JJ'
1.126555 Gtype b'+1:lemma:the'
1.119776 O b'+1:lemma:0.2'
1.110828 O b'+1:postag:NNP'
1.101877 Technique b'hLower'
1.096148 O b'lemma:ml'
1.093303 O b'+1:lemma:250'
1.090560 Supp b'-1:lemma:_'
1.084580 Med b'lemma:medium'
1.077660 Supp b'lemma:Fe'
1.077578 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.076968 O b'-2:lemma:='
1.064746 O b'lemma:chip-fnr'
1.064746 O b'+2:lemma:fnr8myc'
1.061429 pH b'lemma:5.5'
1.061384 Substrain b'-1:lemma:.'
1.061384 Substrain b'-1:postag:.'
1.051938 Gversion b'lemma:000913'
1.051938 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.040534 Gtype b'+1:lemma:with'
1.029924 Supp b'-2:lemma:agent'
1.028568 Strain b'+1:lemma:substr'
1.028568 Strain b'-2:lemma:str'
1.028533 O b'-1:lemma:min'
1.023631 Supp b'-2:lemma:argr'
1.018751 Vess b'+1:lemma:at'
1.016127 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.016127 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.012402 O b'lemma:affyexp'
1.005261 O b'lemma:chip-arca'
1.005261 O b'+2:lemma:arca8myc'
0.999324 Gtype b'-1:lemma:_'
0.993370 O b'lemma:-rrb-'
0.984690 Gtype b'lemma:wild-type'
0.977577 Supp b'lemma:dpd'
0.973330 Supp b'-1:lemma:mm'
0.972606 O b'-1:lemma:nitrate'
0.968717 OD b'lemma:of'
0.964207 Gtype b'lemma:deltaseqa'
0.964207 Gtype b'-1:lemma:old'
0.964207 Gtype b'-2:lemma:seqa'
0.959995 Supp b'postag:NNP'
0.954928 O b'-2:lemma:min'
0.954090 OD b'lemma:od600'
0.952884 Med b'-2:postag:JJ'
0.951944 O b'+1:lemma:20'
0.942351 Gversion b'lemma:asm584v2'
0.940752 O b'lemma:,'
0.940752 O b'postag:,'
0.936243 Air b'+2:postag:CD'
0.931876 Med b'+1:lemma:-lrb-'
0.929942 O b'-2:lemma:overnight'
0.922164 Gversion b'-2:lemma:genome'
0.916666 Temp b'-2:lemma:keep'
0.910561 Supp b'lemma:rifampicin'
0.909619 O b'+1:ner:SUPP'
0.902719 Med b'+1:postag:-LRB-'
0.900546 Gversion b'-2:postag:VB'
0.889572 Supp b'-2:lemma:pahse'
0.888968 Gtype b'lemma:nsrr'
0.888968 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
0.887009 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
0.886520 Med b'+1:lemma:minimal'
0.885013 O b'postag:NNS'
0.884085 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.882489 Temp b'+2:postag:DT'
0.880155 O b'+1:lemma::'
0.875439 Med b'-1:postag:JJ'
0.872456 Temp b'-2:lemma:see'
0.868077 Air b'-2:lemma:fnr'
0.865556 Gtype b'hLower'
0.860587 O b'+2:postag:VBD'
0.860351 Supp b'+1:lemma:Deficient'
0.858609 Gtype b'-2:postag:JJ'
0.853281 Gtype b'+2:ner:SUPP'
0.844831 Temp b'lemma:sample'
0.836890 Agit b'-2:lemma:aerobically'
0.835272 Air b'-2:lemma:cm20'
0.831373 Gtype b'-2:lemma:delta'
0.830400 Gversion b'lemma:nc'
0.830400 Gversion b'+2:lemma:000913'
0.829751 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
0.829191 OD b'-2:lemma:phase'
0.826581 Technique b'-1:lemma:IP'
0.825734 Air b'+1:lemma:%'
0.820441 Supp b'lemma:glutamine'
0.820441 Supp b'-1:lemma:2g/l'
0.816686 Air b'+2:lemma:%'
0.810771 Supp b'+2:lemma:A'
0.806945 Supp b'+2:lemma:be'
0.805473 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.805473 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.803537 Supp b'+1:lemma:be'
0.802815 Gtype b'lemma:wild'
0.800366 Agit b'+2:lemma:at'
0.798006 Technique b'-2:lemma:Fur'
0.797582 Gtype b'+1:lemma:pq'
0.788988 O b'lemma:0.4'
0.787005 O b'lemma:trpr'
0.781869 O b'lemma:input'
0.781869 O b'+1:lemma:chip-seq'
0.778717 pH b'+1:lemma:5.5'
0.777920 Vess b'-1:postag:VBN'
0.772373 Med b'postag:NNP'
0.770987 Air b'lemma:%'
0.770262 Gtype b'lemma:the'
0.758460 O b'-2:lemma:fructose'
0.757053 OD b'+1:postag:IN'
0.756965 Supp b'+2:postag:VBD'
0.752037 O b'+2:postag:JJ'
0.751982 OD b'-2:lemma:od450'
0.742591 pH b'-1:lemma:ph'
0.739894 Gversion b'postag:NN'
0.739668 Supp b'-1:lemma:vol'
0.739668 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.739668 Supp b'+2:lemma:1m'
0.731013 Air b'-1:lemma:_'
0.730652 Temp b'-2:postag:VB'
0.729016 O b'+2:lemma:fructose'
0.728280 Gtype b'+1:lemma::'
0.727823 O b'+1:lemma:acetate'
0.726972 Supp b'+1:lemma:iptg'
0.723601 O b'postag:-LRB-'
0.721687 pH b'-1:postag:NN'
0.720329 pH b'lemma:ph'
0.719104 Technique b'-1:lemma:1'
0.718071 Supp b'+1:lemma:1m'
0.718071 Supp b'-2:lemma:vol'
0.717223 Gtype b'+2:postag::'
0.709889 Gversion b'+1:postag:CD'
0.709219 OD b'postag:IN'
0.695673 Substrain b'+2:lemma::'
0.694943 O b'+2:ner:_'
0.691602 O b'-2:lemma:~'
0.690193 Supp b'-1:postag:IN'
0.689428 O b'-2:lemma:anaerobic'
0.688544 O b'-1:lemma:acetate'
0.685063 Supp b'lemma:of'
0.681592 O b'+1:lemma:k-12'
0.679225 Supp b'+2:postag:-LRB-'
0.674518 O b'-1:lemma:4'
0.672813 O b'+1:lemma:ph5'
0.672813 O b'+2:lemma:.5'
0.671922 O b'lemma:additional'
0.671922 O b'+1:lemma:2h'
0.671573 Supp b'+2:postag:IN'
0.671018 Agit b'-2:postag:RB'
0.667351 Phase b'lemma:phase'
0.662863 O b'-1:ner:_'
0.660902 Gtype b'lemma:fnr8myc'
0.660902 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
0.660519 Gtype b'-1:postag:VBP'
0.658528 Med b'symb'
0.652998 OD b'-1:lemma:od600'
0.649285 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
0.637359 O b'+1:postag:VBN'
0.636876 Supp b'+1:lemma:mm'
0.636876 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
0.634904 Phase b'-2:postag:IN'
0.634850 Supp b'-1:lemma:1m'
0.634850 Supp b'+2:lemma:7.6'
0.634357 O b'-1:lemma:antibody'
0.632692 O b'+2:lemma:wt'
0.630500 O b'+2:lemma:aerobically'
0.629707 Air b'-1:lemma:%'
0.626548 Gtype b'+2:postag:NN'
0.624898 Supp b'postag:NN'
0.624034 pH b'lemma:.5'
0.624034 pH b'-1:lemma:ph5'
0.622074 Supp b'lemma:0.2'
0.617980 Gtype b'-2:lemma:the'
0.617095 OD b'-1:lemma:~'
0.615332 O b'lemma:-80'
0.615332 O b'-2:lemma:freeze'
0.614225 Phase b'+1:lemma:phase'
0.612581 O b'-2:lemma:medium'
0.606504 Med b'lemma:2'
0.605380 O b'lemma:growth'
0.597229 Supp b'-2:lemma:trpr'
0.595991 Technique b'-1:lemma:input'
0.594663 Supp b'-2:postag:VBG'
0.593021 Med b'-1:ner:MED'
0.584514 O b'-1:lemma:aerobic'
0.584215 Air b'-2:lemma:mid-log'
0.583285 Supp b'lemma:cm20'
0.583285 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
0.580343 Air b'-1:lemma:phase'
0.580121 pH b'-1:lemma:at'
0.577292 O b'postag:DT'
0.575941 Supp b'-2:lemma:induce'
0.573432 Med b'+2:lemma:with'
0.570788 Strain b'-1:lemma:.'
0.570788 Strain b'-1:postag:.'
0.567645 Med b'-2:lemma:fresh'
0.564040 O b'lemma:genotype'
0.561981 O b'-2:lemma:in'
0.561734 Vess b'-2:postag:JJ'
0.560845 O b'hLower'
0.558394 Gtype b'-1:lemma:vector'
0.557114 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
0.556990 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
0.556208 O b'-2:ner:_'
0.556098 O b'lemma:treatment'
0.554032 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.553059 Med b'-1:lemma:ml'
0.551283 Anti b'+2:postag:NNP'
0.546049 pH b'-2:lemma:at'
0.545153 O b'+2:lemma:TEX'
0.542171 Med b'+1:lemma:supplement'
0.536435 O b'+1:lemma:rifampicin'
0.533830 Supp b'-1:lemma:final'
0.533150 Strain b'+2:lemma:.'
0.533150 Strain b'+2:postag:.'
0.532475 Supp b'-1:lemma:sodium'
0.532475 Supp b'+2:lemma:1/100'
0.531732 Supp b'-1:postag:SYM'
0.529512 Air b'-1:postag:CD'
0.529255 Gtype b'-2:postag:NN'
0.529153 Supp b'symb'
0.525994 Air b'+2:lemma:co2'
0.521222 O b'-2:postag:FW'
0.520156 Technique b'+2:postag:-RRB-'
0.520129 O b'lemma:A'
0.516531 O b'lemma:gadx'
0.514710 O b'+1:postag::'
0.510240 O b'lemma:old'
0.510240 O b'-1:lemma:seqa'
0.510240 O b'+1:lemma:deltaseqa'
0.509823 Gtype b'-2:ner:_'
0.508342 O b'lemma:argr'
0.507980 O b'+1:ner:_'
0.507053 Anti b'-1:lemma::'
0.505732 O b'-1:postag:NN'
0.499638 Med b'-1:lemma:in'
0.497646 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.495639 Supp b'-1:ner:_'
0.495317 Phase b'-2:lemma:to'
0.495317 Phase b'-2:postag:TO'
0.491710 Med b'+1:lemma:2.0'
0.487863 OD b'+2:lemma:~'
0.487208 O b'-2:lemma:twice'
0.486935 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.486120 Air b'lemma:5'
0.481631 Agit b'+2:postag:-RRB-'
0.479863 Gtype b'+1:lemma:control'
0.477636 O b'+2:lemma:of'
0.472046 Agit b'+2:lemma:-rrb-'
0.470358 Supp b'-2:postag:CD'
0.468842 Air b'-1:postag::'
0.468337 O b'-1:postag:NNP'
0.467355 Gtype b'-2:postag:NNS'
0.467009 Gversion b'+1:lemma:genome'
0.463418 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.462905 Supp b'+1:postag:VBD'
0.462242 Med b'-1:lemma:glucose'
0.462100 Med b'+1:postag:CD'
0.456382 Agit b'-1:postag:-LRB-'
0.455437 OD b'+2:postag:CD'
0.451225 OD b'-1:lemma:od450'
0.450513 Gversion b'-2:ner:_'
0.450387 OD b'+2:lemma:culture'
0.448635 Gtype b'lemma:ptac'
0.446977 Agit b'-1:lemma:-lrb-'
0.439625 OD b'-1:lemma:at'
0.439384 Med b'+2:lemma:then'
0.431997 Med b'hUpper'
0.431232 Technique b'lemma:rna-seq'
0.428936 Gversion b'postag:CD'
0.427501 O b'lemma:s'
0.427501 O b'-2:lemma:parameter'
0.425741 Substrain b'+2:postag::'
0.424927 O b'-2:lemma:be'
0.421432 Agit b'+1:postag:-RRB-'
0.419102 O b'+1:lemma:aerobically'
0.418247 Supp b'+1:lemma:1/100'
0.418247 Supp b'-2:lemma:sodium'
0.418247 Supp b'+2:lemma:vol'
0.415927 Agit b'+1:lemma:-rrb-'
0.414616 pH b'+1:lemma:.'
0.414616 pH b'+1:postag:.'
0.414146 Supp b'+1:ner:_'
0.413845 Gtype b'-1:lemma:wild'
0.411643 O b'-2:lemma:od600'
0.408913 Gtype b'-2:lemma:dna'
0.408216 O b'+2:lemma:anaerobic'
0.405239 Supp b'+1:lemma:.'
0.405239 Supp b'+1:postag:.'
0.403638 O b'-2:lemma:,'
0.403638 O b'-2:postag:,'
0.402352 Gtype b'+2:lemma:rep2'
0.402352 Gtype b'+2:lemma:rep1'
0.399526 Supp b'lemma:7.6'
0.399526 Supp b'+1:lemma:;'
0.399340 Technique b'lemma:-lrb-'
0.399244 Supp b'-1:lemma:,'
0.399244 Supp b'-1:postag:,'
0.398918 pH b'postag:CD'
0.396652 Agit b'-2:postag:-LRB-'
0.395759 O b'+2:postag:NNP'
0.394353 Anti b'hLower'
0.393472 Gtype b'lemma:flagtag'
0.393472 Gtype b'-2:lemma:nsrr'
0.392241 OD b'postag:CD'
Top negative:
0.154048 Supp b'-1:lemma:150'
0.153355 O b'+2:lemma:be'
0.152442 Supp b'-2:postag:VBN'
0.150686 Supp b'lemma:0.1'
0.148946 Phase b'lemma:pahse'
0.148735 Phase b'hLower'
0.148302 O b'-1:ner:TF'
0.148173 Gtype b'lemma:crp'
0.146797 Med b'postag:NN'
0.146590 Med b'-2:lemma:2'
0.145243 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
0.144378 Gtype b'-1:lemma:from'
0.143412 Supp b'+2:lemma:10'
0.142876 O b'+2:lemma:and'
0.141448 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
0.139799 Supp b'+1:postag:IN'
0.139711 O b'+1:lemma:and'
0.136373 Technique b'lemma:chip-exo'
0.135955 Gversion b'-1:postag:DT'
0.135574 Gtype b'+1:postag:DT'
0.135495 Air b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.135457 O b'lemma:cell'
0.132662 OD b'-2:postag:NN'
0.132265 Anti b'-1:postag:JJ'
0.129022 Gtype b'-2:ner:GEN'
0.128311 O b'-2:lemma:with'
0.128249 Supp b'+2:lemma:mid-log'
0.127628 Technique b'+1:postag:NN'
0.127081 Temp b'+2:lemma:in'
0.126267 Supp b'-2:lemma:rifampicin'
0.124959 Gtype b'+1:postag:NN'
0.124524 O b'+1:postag:CC'
0.121512 Supp b'+2:lemma:ph'
0.121136 OD b'+1:postag:JJ'
0.116585 Air b'+1:postag:CC'
0.114015 Supp b'lemma:phosphate'
0.113291 Air b'+1:lemma:b'
0.112643 O b'+1:lemma:dpd'
0.109984 O b'+1:postag:JJ'
0.105392 Supp b'+2:lemma:treat'
0.102534 Temp b'+2:postag:NN'
0.102201 Gtype b'+1:lemma:ph5'
0.102201 Gtype b'+2:lemma:.5'
0.101898 Gtype b'-1:postag:IN'
0.101567 O b'+2:lemma:for'
0.101130 O b'-2:postag:IN'
0.100830 Supp b'-1:lemma:of'
0.100724 Gtype b'+2:postag:VBN'
0.100672 Gtype b'-2:postag::'
0.100416 O b'-2:postag:VBN'
0.097618 O b'+2:postag:NNS'
0.095178 Med b'+2:postag:NN'
0.094912 Med b'+1:postag:JJ'
0.092101 Supp b'+2:lemma:at'
0.091932 Supp b'+1:lemma:min'
0.091015 Supp b'-2:lemma:iptg'
0.090223 Supp b'+2:lemma:fecl2'
0.090118 O b'lemma:k-12'
0.088822 Air b'+1:postag:-LRB-'
0.088562 O b'lemma:mg1655'
0.087020 O b'-1:lemma:and'
0.086653 Supp b'-1:lemma:iptg'
0.086630 Air b'+1:lemma:95'
0.086475 Gtype b'lemma:ryhb'
0.086225 Air b'+2:postag:CC'
0.086109 Med b'-1:ner:SUPP'
0.084782 Substrain b'postag:NN'
0.083477 Supp b'+1:lemma:300'
0.079617 Supp b'+1:lemma:of'
0.077166 Air b'-2:lemma:,'
0.077166 Air b'-2:postag:,'
0.073796 Air b'hLower'
0.073084 Air b'lemma:95'
0.072616 O b'postag:NNP'
0.071399 Technique b'-1:postag:NN'
0.070586 O b'-1:lemma:10'
0.069268 O b'-2:lemma:co2'
0.069078 Supp b'+1:postag:JJ'
0.067151 OD b'-1:ner:_'
0.065390 Air b'lemma:and'
0.063111 O b'+2:lemma:mm'
0.063111 O b'+2:ner:KWSUPP'
0.062988 Supp b'-1:lemma:0.1'
0.061243 O b'+2:postag:VBN'
0.060906 Air b'+2:lemma:95'
0.060632 OD b'+1:lemma:~'
0.059569 Supp b'+1:lemma:ph'
0.058195 Supp b'lemma:dissolve'
0.058195 Supp b'+2:lemma:methanol'
0.057790 OD b'-2:lemma:at'
0.057668 Supp b'-2:lemma:condition'
0.057271 Temp b'+2:lemma:and'
0.056134 OD b'lemma:600nm'
0.056134 OD b'-1:lemma:o.d.'
0.055578 O b'-1:postag:CD'
0.055467 O b'+1:lemma:ml'
0.054954 Temp b'+2:ner:_'
0.054607 Temp b'-1:ner:_'
0.052312 Gtype b'postag:-RRB-'
0.050298 Supp b'+2:postag:VBN'
0.049190 O b'lemma:%'
0.045575 O b'+2:lemma:allow'
0.045016 Supp b'-1:lemma::'
0.043208 Gversion b'+1:lemma:_'
0.043201 pH b'-2:postag:IN'
0.042586 Supp b'+1:lemma:at'
0.042315 Supp b'lemma:;'
0.042315 Supp b'-1:lemma:7.6'
0.040479 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
0.040479 Supp b'+2:lemma:cm20'
0.037636 Phase b'-1:ner:_'
0.037294 Med b'-2:lemma:-rrb-'
0.036391 O b'+2:lemma:wash'
0.036137 O b'lemma:paraquat'
0.036137 O b'-2:lemma:um'
0.034301 O b'-1:lemma:m63'
0.033492 O b'+2:postag:-LRB-'
0.032173 Supp b'lemma:mmol'
0.032173 Supp b'+1:lemma:potassium'
0.032173 Supp b'-2:lemma:respiration'
0.031890 O b'-1:lemma:or'
0.031008 Air b'+1:postag:NN'
0.029977 O b'-2:lemma:a'
0.028716 Supp b'+2:lemma:nitrate'
0.026596 Air b'hUpper'
0.026569 O b'+2:lemma:-lrb-'
0.024835 OD b'-1:postag:NN'
0.024643 Med b'+2:postag:CD'
0.023839 Gtype b'+2:lemma:fnr'
0.023501 O b'-1:lemma:5'
0.023087 O b'-1:lemma:for'
0.022476 OD b'-2:postag:IN'
0.021682 Air b'+2:postag:NN'
0.021171 Anti b'-2:lemma::'
0.020373 O b'-1:lemma:grow'
0.020009 O b'-1:lemma:%'
0.019670 O b'-2:lemma:%'
0.019482 Gversion b'+2:postag:NN'
0.018947 O b'lemma:2.0'
0.017859 O b'+2:lemma:ml'
0.016865 Air b'+2:lemma:mid-log'
0.016824 Technique b'-2:lemma:-lrb-'
0.016370 O b'postag:JJ'
0.014712 O b'+1:lemma:final'
0.014707 Gversion b'+2:ner:_'
0.013720 O b'+1:lemma:43'
0.012163 O b'lemma:be'
0.011039 Temp b'+1:lemma:in'
0.010996 O b'lemma:respiration'
0.010996 O b'+2:lemma:mmol'
0.009813 O b'lemma:and'
0.008647 Air b'symb'
0.008387 Gtype b'+1:postag:CD'
0.008183 Supp b'+2:postag:JJ'
0.007308 OD b'+1:postag:DT'
0.007295 O b'+2:postag:IN'
0.005879 Gtype b'+2:lemma:small'
0.005679 Supp b'+2:lemma:.'
0.005679 Supp b'+2:postag:.'
0.005656 Supp b'-2:lemma:rpob'
0.004733 O b'+1:lemma:with'
0.004422 Technique b'+1:ner:TF'
0.004125 Technique b'+1:postag:NNP'
0.004078 O b'-1:lemma:,'
0.004078 O b'-1:postag:,'
0.003795 pH b'-1:ner:_'
0.003376 Supp b'postag:IN'
0.003354 pH b'+1:ner:_'
0.003320 O b'+1:lemma:sparging'
0.002955 Gtype b'+2:postag:CD'
0.002757 O b'lemma:for'
0.002687 O b'-1:lemma:with'
0.001616 Gversion b'-1:ner:_'
0.001467 O b'-2:lemma:and'
0.001436 Med b'-1:lemma:fresh'
0.001342 Med b'-2:lemma:glucose'
0.001300 Supp b'lemma:in'
0.001271 Supp b'lemma:30'
0.001113 O b'+2:postag:CC'
0.001101 Supp b'-2:ner:SUPP'
0.001083 O b'lemma:\xc2\xb0c'
0.001067 O b'-2:postag:JJ'
0.000867 Technique b'-1:postag:NNP'
0.000863 Gversion b'-1:lemma:_'
0.000818 Supp b'lemma:methanol'
0.000818 Supp b'-2:lemma:dissolve'
0.000756 O b'+2:lemma:glucose'
0.000471 O b'-1:lemma:genotype'
0.000457 Air b'postag:CD'
0.000310 O b'-2:postag:NN'
0.000243 Supp b'-1:postag::'
0.000194 Supp b'-1:postag:JJ'
0.000173 O b'-2:lemma:reach'
0.000170 Air b'+1:postag:CD'
0.000159 O b'+2:lemma:acetate'
0.000141 O b'lemma:cra'
0.000132 Supp b'-1:lemma:rifampicin'
0.000118 O b'-2:lemma:strain'
0.000073 Gtype b'-2:postag:-RRB-'
0.000068 Phase b'-1:postag:NN'
0.000066 OD b'-1:lemma:to'
0.000066 OD b'-1:postag:TO'
0.000065 pH b'-1:postag:IN'
0.000062 Med b'+2:lemma:without'
0.000045 O b'-1:lemma:0.4'
0.000039 Air b'-2:lemma:0.3'
0.000031 O b'-2:lemma:mm'
0.000031 O b'-2:ner:KWSUPP'
0.000030 O b'-2:lemma:or'
0.000028 OD b'-2:lemma:grow'
0.000018 O b'+2:ner:SUPP'
0.000016 Phase b'+2:lemma:30'
0.000014 Med b'-2:postag:-RRB-'
0.000012 Supp b'-2:lemma:of'
0.000006 O b'-2:lemma:at'
0.000002 Temp b'+2:lemma:short'
0.000000 Med b'-1:lemma:-rrb-'
0.000000 O b'-2:lemma:mid-log'
0.000000 O b'lemma:hs2'
-0.000000 O b'+1:lemma:300'
0.000000 O b'-1:lemma:induce'
-0.000001 O b'+2:lemma:ph'
-0.000004 O b'-1:lemma:iptg'
-0.000007 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.000017 Temp b'-2:postag:CD'
-0.000025 O b'-2:lemma:grow'
-0.000028 OD b'+2:postag:CC'
-0.000029 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.000031 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.000031 O b'lemma:dissolve'
-0.000031 O b'+2:lemma:methanol'
-0.000041 Gversion b'symb'
-0.000069 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.000080 O b'+2:lemma:total'
-0.000107 O b'-2:lemma:nh4cl'
-0.000216 O b'-1:lemma:in'
-0.000246 Strain b'hLower'
-0.000256 O b'+1:lemma:a'
-0.000333 Gversion b'+1:ner:_'
-0.000336 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.000419 O b'hUpper'
-0.000578 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.000578 Gtype b'-1:postag:,'
-0.000695 O b'lemma:methanol'
-0.000695 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.000780 O b'-1:lemma:fresh'
-0.000970 Supp b'lemma:paraquat'
-0.000970 Supp b'-2:lemma:um'
-0.001397 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.001417 Gtype b'-1:lemma::'
-0.001528 O b'+2:lemma:reference'
-0.001652 O b'lemma:150'
-0.001652 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.001652 O b'-2:lemma:concentration'
-0.001683 Med b'-2:ner:MED'
-0.001980 Supp b'hGreek'
-0.002650 Supp b'-1:postag:DT'
-0.003282 O b'+1:lemma:_'
-0.004823 O b'+2:lemma:in'
-0.005195 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.005207 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.005375 O b'+2:lemma:%'
-0.007534 O b'+1:lemma:0.4'
-0.007780 Air b'-1:lemma:and'
-0.008461 Air b'+2:lemma:,'
-0.008461 Air b'+2:postag:,'
-0.008517 Air b'-2:postag:CC'
-0.008900 O b'+2:lemma:media'
-0.008983 Supp b'-1:postag:NN'
-0.009769 Air b'+2:ner:_'
-0.010271 O b'+1:lemma:5'
-0.010446 Med b'-2:postag:NN'
-0.010677 O b'+1:lemma:.'
-0.010677 O b'+1:postag:.'
-0.012344 O b'-1:lemma:contain'
-0.012717 Supp b'-2:lemma:glucose'
-0.013678 OD b'-2:lemma:od600'
-0.013784 Med b'-2:postag:VBN'
-0.020188 Temp b'symb'
-0.023738 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.023827 Gtype b'postag:NNP'
-0.023928 Supp b'hUpper'
-0.025625 O b'-1:lemma:ml'
-0.027014 O b'-2:lemma:g/l'
-0.027043 Anti b'-1:ner:_'
-0.028294 Phase b'-2:postag:NN'
-0.029578 O b'-2:lemma:1'
-0.030338 Gtype b'-1:ner:_'
-0.031547 Med b'-2:lemma:m9'
-0.031553 Phase b'+1:ner:_'
-0.032436 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.032953 Med b'+1:ner:MED'
-0.034496 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.035090 Gtype b'-1:postag::'
-0.035124 O b'-1:lemma:.'
-0.035124 O b'-1:postag:.'
-0.035278 O b'-1:lemma:g/l'
-0.035819 Temp b'postag:NN'
-0.036435 Med b'+1:postag:IN'
-0.038235 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.039064 O b'+2:lemma:fnr'
-0.039656 O b'+1:lemma:sample'
-0.041364 OD b'symb'
-0.042273 Supp b'+1:postag:CD'
-0.043007 OD b'+1:postag:CD'
-0.043248 O b'+1:lemma:hour'
-0.045607 O b'-2:lemma:0.1'
-0.051051 O b'+2:lemma:sample'
-0.051682 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.051902 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.053533 O b'-1:lemma:rpob'
-0.055388 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.057379 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.059802 Temp b'+2:lemma:with'
-0.061849 O b'postag:NN'
-0.065151 Phase b'postag:JJ'
-0.066676 Air b'+2:postag:IN'
-0.068364 O b'-1:lemma:until'
-0.071737 Phase b'+2:ner:_'
-0.082318 Anti b'+1:ner:_'
-0.083635 O b'+1:lemma:media'
-0.088338 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.088495 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.088573 Supp b'+2:ner:_'
-0.088742 Technique b'-2:postag:NN'
-0.091703 O b'-1:postag:DT'
-0.092197 OD b'-2:ner:_'
-0.094445 Supp b'postag:CD'
-0.097216 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.097216 O b'+1:lemma:methanol'
-0.098239 O b'+2:lemma:agitation'
-0.098288 O b'-2:lemma:genome'
-0.098778 Supp b'lemma:mm'
-0.098778 Supp b'-1:ner:KWSUPP'
-0.101419 O b'+2:lemma:co2'
-0.104431 O b'+2:postag:CD'
-0.107406 O b'lemma:fecl2'
-0.110489 Supp b'-2:postag:NN'
-0.110636 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.110636 Gtype b'+1:postag:,'
-0.111258 O b'lemma:1m'
-0.112887 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.113818 O b'-2:lemma:fresh'
-0.124435 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.124496 O b'-1:lemma:mm'
-0.129139 O b'+2:lemma:at'
-0.131737 pH b'+2:ner:_'
-0.133655 Gtype b'postag:NN'
-0.134400 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.140726 O b'+2:lemma:genome'
-0.144631 Supp b'-2:ner:_'
-0.148372 O b'-2:postag:SYM'
-0.148422 O b'-2:lemma:to'
-0.148422 O b'-2:postag:TO'
-0.150441 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.156730 O b'-2:lemma:minimal'
-0.156843 Supp b'hLower'
-0.158362 Supp b'+2:postag:NN'
-0.162018 O b'-1:lemma:of'
-0.171581 O b'lemma:rifampicin'
-0.181562 O b'+2:lemma:antibody'
-0.184182 O b'+2:lemma:m9'
-0.192591 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.194188 OD b'+2:postag:NN'
-0.197204 O b'+1:lemma:g/l'
-0.198124 O b'+1:lemma:%'
-0.198886 Supp b'+2:lemma:and'
-0.201950 O b'-2:lemma:20'
-0.205504 O b'lemma:medium'
-0.207055 O b'-1:ner:GEN'
-0.216015 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.218723 O b'-1:lemma:1m'
-0.218723 O b'+2:lemma:7.6'
-0.222865 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.227164 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.229542 Med b'-1:postag:NN'
-0.234189 O b'-1:postag:IN'
-0.235790 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.237485 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.241239 Temp b'+1:lemma:with'
-0.251965 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.253270 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.261744 O b'lemma:20'
-0.266456 O b'postag:RB'
-0.272505 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.272663 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.272993 O b'lemma:ph'
-0.274133 O b'-1:lemma:rna'
-0.281706 O b'-1:lemma:IP'
-0.281731 Technique b'-2:ner:_'
-0.282001 O b'lemma:sample'
-0.286669 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.289130 O b'-2:lemma:dpd'
-0.301765 O b'+1:lemma:1m'
-0.301765 O b'-2:lemma:vol'
-0.304234 Technique b'-1:lemma::'
-0.312099 O b'+1:postag:CD'
-0.313803 O b'lemma:37'
-0.315925 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.324405 O b'-2:postag::'
-0.327224 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.334266 O b'-2:lemma:until'
-0.337084 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.337101 Supp b'+1:lemma:,'
-0.337101 Supp b'+1:postag:,'
-0.343415 Med b'+1:postag:NN'
-0.347635 O b'+1:lemma:supplement'
-0.348784 Supp b'lemma:2'
-0.353848 O b'-2:lemma:supplement'
-0.378561 O b'lemma:mid-log'
-0.385817 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.393416 O b'+2:postag:RB'
-0.393770 Gtype b'symb'
-0.393973 O b'-1:lemma:minimal'
-0.395019 O b'lemma:wt'
-0.398040 Anti b'+2:ner:_'
-0.401454 O b'-2:lemma:of'
-0.414355 OD b'hLower'
-0.423300 O b'+2:lemma:10'
-0.423410 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.429847 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.438407 O b'+2:lemma:.'
-0.438407 O b'+2:postag:.'
-0.453771 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.457500 Supp b'+2:postag:CC'
-0.462639 O b'-1:lemma:1'
-0.463863 O b'+2:lemma:add'
-0.499984 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.502865 Vess b'hUpper'
-0.511572 O b'-1:lemma:vol'
-0.511572 O b'-2:lemma:1/100'
-0.511572 O b'+2:lemma:1m'
-0.518358 O b'-2:lemma:rpob'
-0.529838 O b'-2:lemma::'
-0.530953 Med b'+2:postag:VBN'
-0.541644 Anti b'hUpper'
-0.544676 O b'-2:lemma:media'
-0.547904 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.557173 Med b'postag:CD'
-0.562926 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.575092 Gtype b'+1:ner:_'
-0.578646 Gversion b'hLower'
-0.600263 Agit b'hUpper'
-0.613852 O b'+1:postag:DT'
-0.626664 O b'lemma:aerobic'
-0.657445 O b'-2:lemma:pahse'
-0.679150 O b'-2:ner:SUPP'
-0.686464 O b'-2:lemma:IP'
-0.713921 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.723411 O b'lemma:minimal'
-0.725237 Air b'postag:NN'
-0.726456 O b'+1:lemma:at'
-0.739787 Med b'-1:ner:_'
-0.744946 pH b'symb'
-0.763443 Phase b'symb'
-0.769043 O b'+1:postag:IN'
-0.773966 Technique b'-1:postag::'
-0.777942 Supp b'postag:JJ'
-0.788513 O b'-1:lemma:30'
-0.810289 Strain b'symb'
-0.845945 Med b'hLower'
-0.853641 O b'-1:lemma:the'
-0.864246 O b'+2:lemma:+'
-0.870891 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.897988 Supp b'+2:postag:CD'
-0.908386 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.924313 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.928519 O b'-1:lemma:ph'
-0.947432 O b'+1:lemma:in'
-0.984678 O b'+2:lemma:rifampicin'
-0.991343 O b'lemma:aerobically'
-1.021346 OD b'hUpper'
-1.022517 O b'-1:postag::'
-1.024764 Temp b'hLower'
-1.080097 OD b'+2:lemma:aerobically'
-1.085591 O b'-1:lemma:sample'
-1.089732 O b'-1:lemma:co2'
-1.115735 O b'+2:lemma:b'
-1.159564 O b'-1:lemma:2'
-1.162296 O b'-2:postag:VBG'
-1.200888 O b'-2:ner:TF'
-1.220306 O b'lemma:30'
-1.283053 O b'lemma:0.3'
-1.297084 O b'-2:lemma:iptg'
-1.350784 O b'lemma:media'
-1.361863 Technique b'+1:ner:_'
-1.383252 OD b'+1:postag:NN'
-1.403299 Supp b'+2:lemma:1'
-1.452410 O b'lemma:of'
-1.461784 O b'-2:lemma:the'
-1.504449 Supp b'+2:lemma:2'
-1.512505 Gtype b'-2:postag:CD'
-1.619190 O b'-2:lemma:0.3'
-1.841605 O b'+2:lemma:iptg'
-2.129607 Phase b'hUpper'
-2.284571 O b'+1:lemma:2'
-2.304320 O b'+1:lemma:1'
-3.151531 O b'-1:lemma::'
-3.399703 Technique b'symb'
-4.134545 O b'-1:lemma:_'