report_Run13_v12.txt 38 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.12085102452052962, 'c2': 0.029125817132466404}
best CV score:0.8317218364725953
model size: 0.10M

Flat F1: 0.8165354169753308
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.912     0.795     0.849        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.853     0.853     0.853       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.854     0.787     0.817       484


Top likely transitions:
OD     -> OD      5.365800
Supp   -> Supp    5.343237
Temp   -> Temp    5.287323
Med    -> Med     5.234489
Air    -> Air     5.114681
Anti   -> Anti    4.786896
Gtype  -> Gtype   4.275076
Phase  -> Phase   4.175218
Gversion -> Gversion 3.987383
Technique -> Technique 3.666524
pH     -> pH      3.245165
O      -> O       3.143716
Agit   -> Agit    1.809271
Substrain -> Gtype   1.650982
Technique -> Air     1.555581
Air    -> O       1.173691
Gtype  -> Supp    1.064689
O      -> Technique 0.793816
O      -> Supp    0.724723
O      -> Gtype   0.454981
Gtype  -> pH      0.238604
Supp   -> O       0.168107
Anti   -> O       0.057696
Temp   -> O       0.006139
Phase  -> Air     0.000989
Gtype  -> Air     0.000001
Med    -> O       -0.024700
Phase  -> O       -0.030099
O      -> Temp    -0.060013
O      -> Gversion -0.066934
O      -> Med     -0.079722
Supp   -> Med     -0.104049
Gtype  -> Med     -0.107935
OD     -> Air     -0.119417
Agit   -> Air     -0.130830
OD     -> O       -0.138394
O      -> Phase   -0.142670
Gtype  -> Technique -0.169850
O      -> OD      -0.180767
Gtype  -> Gversion -0.223380
Temp   -> Med     -0.315687
Gversion -> O       -0.454383
O      -> Anti    -0.712679
Technique -> pH      -0.799839
Phase  -> OD      -0.835240
O      -> Air     -1.107786
Technique -> Gtype   -1.196254
Gtype  -> O       -1.216017
Med    -> Supp    -1.468960
Substrain -> O       -1.469796


Top unlikely transitions:
OD     -> OD      5.365800
Supp   -> Supp    5.343237
Temp   -> Temp    5.287323
Med    -> Med     5.234489
Air    -> Air     5.114681
Anti   -> Anti    4.786896
Gtype  -> Gtype   4.275076
Phase  -> Phase   4.175218
Gversion -> Gversion 3.987383
Technique -> Technique 3.666524
pH     -> pH      3.245165
O      -> O       3.143716
Agit   -> Agit    1.809271
Substrain -> Gtype   1.650982
Technique -> Air     1.555581
Air    -> O       1.173691
Gtype  -> Supp    1.064689
O      -> Technique 0.793816
O      -> Supp    0.724723
O      -> Gtype   0.454981
Gtype  -> pH      0.238604
Supp   -> O       0.168107
Anti   -> O       0.057696
Temp   -> O       0.006139
Phase  -> Air     0.000989
Gtype  -> Air     0.000001
Med    -> O       -0.024700
Phase  -> O       -0.030099
O      -> Temp    -0.060013
O      -> Gversion -0.066934
O      -> Med     -0.079722
Supp   -> Med     -0.104049
Gtype  -> Med     -0.107935
OD     -> Air     -0.119417
Agit   -> Air     -0.130830
OD     -> O       -0.138394
O      -> Phase   -0.142670
Gtype  -> Technique -0.169850
O      -> OD      -0.180767
Gtype  -> Gversion -0.223380
Temp   -> Med     -0.315687
Gversion -> O       -0.454383
O      -> Anti    -0.712679
Technique -> pH      -0.799839
Phase  -> OD      -0.835240
O      -> Air     -1.107786
Technique -> Gtype   -1.196254
Gtype  -> O       -1.216017
Med    -> Supp    -1.468960
Substrain -> O       -1.469796


Top positive:
5.932496 O        b'lemma:_'
5.621950 O        b'lemma:1'
5.389912 O        b'lemma:2'
5.244684 Anti     b'-2:lemma:antibody'
5.104631 Supp     b'lemma:no3'
4.920756 Air      b'lemma:anaerobic'
4.844089 Phase    b'-2:lemma:phase'
4.680123 Phase    b'lemma:mid-log'
4.607582 Technique b'lemma:chipseq'
4.581691 O        b'lemma:3'
4.451164 O        b'-2:lemma:_'
4.446054 Gtype    b'lemma:wt'
4.273070 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
4.247605 Supp     b'lemma:pq'
4.150923 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
4.034262 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
3.998654 Strain   b'lemma:k-12'
3.637450 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.515672 O        b'postag:VBG'
3.510453 O        b'lemma:-'
3.465912 O        b'lemma:b'
3.460414 O        b'lemma:Cra'
3.424242 Supp     b'lemma:Iron'
3.424242 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.420837 Gtype    b'lemma:type'
3.406193 Supp     b'lemma:iptg'
3.350084 O        b'lemma:rpob'
3.332640 O        b'lemma:with'
3.325772 Technique b'lemma:rna-seq'
3.269128 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.251613 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.249499 O        b'postag::'
3.224193 Supp     b'lemma:2h'
3.224193 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.211646 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
3.194498 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
3.088933 Air      b'lemma:aerobic'
3.033905 Med      b'lemma:lb'
3.028049 Supp     b'lemma:nh4cl'
2.960891 O        b'lemma:.'
2.960891 O        b'postag:.'
2.939549 Air      b'lemma:aerobically'
2.907732 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.902336 Supp     b'lemma:nacl'
2.858000 O        b'-2:lemma:myc'
2.855475 Technique b'lemma:chip-seq'
2.812354 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.772933 O        b'postag:IN'
2.764661 Air      b'-2:lemma:IP'
2.754879 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
2.751563 Substrain b'lemma:mg1655'
2.731842 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
2.731504 O        b'-1:lemma:type'
2.716148 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.696816 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.694856 Supp     b'-2:lemma:shake'
2.670960 O        b'-1:lemma:tag'
2.661885 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.655985 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
2.632267 Med      b'lemma:LB'
2.591961 Med      b'lemma:MOPS'
2.589768 pH       b'lemma:ph5'
2.589768 pH       b'+1:lemma:.5'
2.587620 Med      b'lemma:m63'
2.585904 Supp     b'lemma:acetate'
2.551737 O        b'+2:lemma:crp'
2.547610 O        b'-1:postag:NNS'
2.522211 Med      b'+2:lemma:b2'
2.520295 Gtype    b'lemma:dfnr'
2.512205 Gtype    b'+1:lemma:type'
2.496660 O        b'lemma:ompr'
2.486044 O        b'-1:lemma:glucose'
2.484534 O        b'lemma:rep2'
2.484534 O        b'lemma:rep1'
2.470380 O        b'lemma:affyexp'
2.469810 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.459417 O        b'lemma:CEL'
2.458315 Gtype    b'lemma:pk4854'
2.436003 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.410188 O        b'lemma:a'
2.401443 pH       b'+1:postag:CD'
2.398123 Air      b'-1:lemma:-'
2.361293 Supp     b'lemma:fructose'
2.354132 O        b'+1:lemma:wt'
2.336048 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.318857 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.298949 Supp     b'-1:ner:SUPP'
2.290294 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.289343 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.289335 Gtype    b'-1:ner:GEN'
2.276222 Technique b'-2:lemma:wt'
2.275441 O        b'lemma:purr'
2.269759 Air      b'lemma:anaeroibc'
2.253077 O        b'lemma:harbor'
2.235014 O        b'lemma:soxr'
2.235014 O        b'lemma:soxs'
2.224445 Technique b'lemma:chip-exo'
2.222619 O        b'-2:lemma:='
2.209422 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.208284 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.206608 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
2.198734 Temp     b'-1:lemma:37'
2.196420 Temp     b'-1:lemma:sample'
2.182308 Med      b'lemma:media'
2.156214 O        b'postag:VBN'
2.155271 Gtype    b'+1:lemma:with'
2.152340 Supp     b'lemma:Adenine'
2.147345 O        b'lemma:\xcf\x8332'
2.137573 Gversion b'lemma:.2'
2.137573 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.132932 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.122155 O        b'+1:lemma:pq'
2.114527 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.114527 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.091304 Supp     b'+1:lemma:2'
2.075513 Supp     b'-1:lemma:with'
2.067328 Med      b'+2:postag:CC'
2.060636 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.057153 Temp     b'lemma:37'
2.050334 O        b'lemma:trpr'
2.042988 Gtype    b'+1:lemma:pq'
2.041127 Med      b'+2:lemma:b1'
2.025814 Supp     b'+1:lemma:1'
2.011393 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.009309 Supp     b'lemma:glucose'
2.000279 Supp     b'-1:lemma:+'
1.985670 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.981086 Supp     b'lemma:arginine'
1.975350 O        b'lemma:chip'
1.961058 O        b'lemma:culture'
1.947409 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.936152 Air      b'postag:JJ'
1.907226 O        b'lemma:input'
1.907226 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.904057 O        b'-1:lemma:pq'
1.891647 O        b'lemma:argr'
1.885047 O        b'+1:lemma:od600'
1.884267 Gtype    b'lemma:ptac'
1.852503 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.852194 Supp     b'+2:lemma:feso4'
1.846869 Supp     b'-2:lemma:argr'
1.846531 O        b'-1:lemma:0.3'
1.840635 Supp     b'-1:lemma:Cra'
1.836503 Technique b'-1:lemma:IP'
1.833597 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.824271 Temp     b'lemma:43'
1.822795 O        b'lemma:gadx'
1.822781 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
1.820729 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
1.820729 Gtype    b'+2:lemma:.5'
1.819639 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.819639 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.807899 Vess     b'lemma:flask'
1.807899 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.807899 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.807899 Vess     b'+2:lemma:43'
1.805362 O        b'lemma:growth'
1.798609 Supp     b'-2:lemma:media'
1.790848 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.790175 Gversion b'lemma:u00096'
1.790175 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.786411 Supp     b'lemma:dpd'
1.774656 Supp     b'-1:lemma:_'
1.773207 Supp     b'-2:lemma:agent'
1.771080 Air      b'postag:RB'
1.770847 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.770150 O        b'-1:lemma:lb'
1.758089 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
1.756958 O        b'+1:lemma:coli'
1.756750 O        b'+1:postag:RB'
1.736067 O        b'-2:lemma:fructose'
1.729672 O        b'-1:lemma:min'
1.727709 Anti     b'+1:lemma:antibody'
1.720110 O        b'-1:lemma:wt'
1.713645 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.713020 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.706220 O        b'lemma:at'
1.695457 Phase    b'lemma:stationary'
1.695457 Phase    b'lemma:exponential'
1.693967 Temp     b'-1:lemma:43'
1.676000 O        b'lemma:genotype'
1.666240 Agit     b'lemma:rpm'
1.657742 Med      b'lemma:medium'
1.654269 Supp     b'-2:lemma:for'
1.649066 O        b'lemma:or'
1.638871 Agit     b'-1:lemma:250'
1.626882 O        b'lemma:oxyr'
1.626050 Air      b'-2:lemma:fnr'
1.613193 Med      b'+1:lemma:0.4'
1.609592 Gversion b'-2:lemma:build'
1.607838 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.607838 Strain   b'-2:lemma:str'
1.603936 O        b'lemma:genotype/variation'
1.594682 OD       b'lemma:0.3'
1.590455 O        b'-2:lemma:medium'
1.584827 O        b'postag:DT'
1.577534 Gtype    b'postag:JJ'
1.561024 Air      b'-1:lemma:co2'
1.559847 Supp     b'lemma:Leu'
1.559847 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
1.557013 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.549149 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.549149 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.549149 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
1.543642 O        b'-2:ner:MED'
1.539523 Gversion b'lemma:nc'
1.539523 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.520404 O        b'-1:lemma:nacl'
1.514785 OD       b'lemma:od450'
1.511813 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.505498 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.500333 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.496084 OD       b'-2:lemma:od450'
1.494533 O        b'lemma::'
1.481612 O        b'-2:lemma:min'
1.479410 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.478576 Technique b'-1:lemma:input'
1.472028 Technique b'lemma:rnaseq'
1.452585 Agit     b'+2:lemma:at'
1.451880 Air      b'-2:lemma:%'
1.447025 Gversion b'lemma:000913'
1.447025 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.440756 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
1.435416 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.434706 Supp     b'-2:lemma:purr'
1.433780 O        b'-1:lemma:l1'
1.429950 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.429609 O        b'lemma:treatment'
1.415653 O        b'-1:lemma:nitrate'
1.410518 O        b'lemma:A'
1.403420 Med      b'+1:lemma:+'
1.398181 Supp     b'+2:lemma:A'
1.386440 Med      b'-1:lemma:in'
1.384254 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.377813 Med      b'postag:NNP'
1.375634 Supp     b'-2:lemma:10'
1.371397 Phase    b'-1:lemma:until'
1.358944 Supp     b'lemma:0.2'
1.344350 Supp     b'-1:lemma:final'
1.343469 Med      b'lemma:minimal'
1.340582 O        b'+1:ner:MED'
1.335450 Air      b'-1:postag::'
1.326104 OD       b'+1:postag:IN'
1.325527 O        b'-1:lemma:into'
1.322426 Supp     b'+1:lemma:_'
1.318756 O        b'-2:lemma:overnight'
1.307069 OD       b'postag:CD'
1.306578 O        b'-1:ner:TF'
1.301024 O        b'lemma:ml'
1.299071 Gversion b'-2:postag:VB'
1.296201 Substrain b'-1:lemma:.'
1.296201 Substrain b'-1:postag:.'
1.295363 Supp     b'lemma:Fe'
1.293143 Med      b'+2:lemma:+'
1.288728 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.283831 Gtype    b'lemma:wild-type'
1.279152 OD       b'+1:lemma:of'
1.278121 Gtype    b'+1:lemma:control'
1.267818 O        b'lemma:cra'
1.266096 O        b'+2:postag:JJ'
1.265904 Supp     b'-1:postag:CD'
1.261301 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.244580 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.242028 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.242028 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.234926 O        b'postag:CC'
1.234227 Med      b'-1:lemma:ml'
1.233526 Supp     b'-2:lemma:20'
1.227064 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.222785 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.222123 Gtype    b'-1:lemma:phtpg'
1.216060 pH       b'lemma:5.5'
1.214578 Gtype    b'+1:postag::'
1.214150 Air      b'-2:lemma:0.3'
1.213807 pH       b'lemma:.5'
1.213807 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.213694 O        b'lemma:for'
1.213441 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
1.204551 Air      b'+1:lemma:%'
1.204137 Gtype    b'-1:lemma:wild'
1.203848 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
1.202675 Phase    b'-2:lemma:until'
1.201643 Air      b'-1:lemma:_'
1.200778 O        b'-1:lemma:acetate'
1.200552 O        b'lemma:additional'
1.200552 O        b'+1:lemma:2h'
1.190844 Technique b'lemma:-lrb-'
1.185651 Supp     b'lemma:rifampicin'
1.182494 Agit     b'lemma:250'
1.181511 Technique b'postag:-LRB-'
1.180409 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.179140 Med      b'postag:NNS'
1.172680 O        b'-1:lemma:media'
1.171147 Air      b'lemma:%'
1.166029 O        b'-1:lemma:medium'
1.164664 Air      b'-2:lemma:mid-log'
1.160736 Air      b'-1:lemma:phase'
1.158210 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.158181 Phase    b'lemma:phase'
1.157433 Strain   b'-2:lemma:strain'
1.153554 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.153554 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.149753 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.145713 O        b'postag:NNS'
1.142991 O        b'-2:lemma:ml'
1.136663 OD       b'lemma:od600'
1.136144 Med      b'-2:lemma:minimal'
1.131628 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.131628 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.121358 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.118777 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.117216 Air      b'-1:lemma:%'
1.115696 Air      b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
1.115341 Vess     b'+1:lemma:at'
1.110233 Gtype    b'-2:lemma:delta'
1.110041 Anti     b'-1:lemma::'
1.109791 Gtype    b'-2:postag:NNS'
1.108836 OD       b'-1:postag:IN'
1.104564 Gtype    b'-2:postag:JJ'
1.104482 Technique b'-1:lemma:_'
1.102252 O        b'postag:VBD'
1.101736 OD       b'+2:lemma:~'
1.101459 Supp     b'postag:NNP'
1.100296 O        b'-2:lemma:in'
1.097672 O        b'+1:lemma:43'
1.093119 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.091629 O        b'+1:lemma:250'
1.090802 O        b'+2:lemma:fructose'
1.089606 Supp     b'+2:lemma:add'
1.085294 Gtype    b'-1:lemma:Wild'
1.081203 O        b'postag:-RRB-'
1.073565 Air      b'+2:postag:CD'
1.072842 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.072541 O        b'+1:lemma:20'
1.069291 Phase    b'+1:lemma:phase'
1.069127 O        b'+1:lemma::'
1.064630 Air      b'+2:lemma:%'
1.061179 Technique b'+1:ner:TF'
1.059676 Gtype    b'-2:lemma:dna'
1.058537 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.054357 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.053013 O        b'+2:postag:VB'
1.052354 Substrain b'+2:lemma::'
1.044905 Technique b'-1:lemma:1'
1.040553 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.040462 Air      b'-2:lemma:cm20'
1.034397 O        b'lemma:chip-arca'
1.034397 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.031635 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.026999 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.025170 Anti     b'postag:JJ'
1.024986 Strain   b'+2:lemma:.'
1.024986 Strain   b'+2:postag:.'
1.021563 Supp     b'lemma:glutamine'
1.021563 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
1.021145 pH       b'-1:lemma:ph'
1.016501 O        b'+1:postag:NNP'
1.012396 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
1.007296 Med      b'-2:lemma:medium'
1.006488 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.001517 O        b'lemma:Fur'
1.001085 Agit     b'-2:postag:RB'
0.998322 O        b'lemma:old'
0.998322 O        b'-1:lemma:seqa'
0.998322 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
0.997957 Gtype    b'lemma:wild'
0.993747 O        b'-1:lemma:genbank'
0.990822 Gtype    b'-1:lemma:_'
0.987892 Air      b'-2:postag:CD'
0.983246 Air      b'-2:postag:SYM'
0.976446 O        b'-1:lemma:genotype'
0.975328 O        b'+2:lemma:constant'
0.973143 O        b'+2:lemma:allow'
0.966212 pH       b'-2:lemma:at'
0.964616 Gtype    b'+2:lemma:lacz'
0.958749 Gtype    b'+1:ner:GEN'
0.957451 Temp     b'+1:lemma:see'
0.956475 Supp     b'lemma:20'
0.955285 Substrain b'+2:postag::'
0.949549 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.944918 O        b'+2:ner:_'
0.928916 O        b'-1:ner:_'
0.926804 Gtype    b'-1:lemma:vector'
0.923175 O        b'lemma:s'
0.923175 O        b'-2:lemma:parameter'
0.922559 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
0.916358 Supp     b'-1:postag:SYM'
0.907141 O        b'postag:FW'
0.906558 OD       b'+2:postag:CD'
0.904593 Gtype    b'lemma:nsrr'
0.904593 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
0.903906 O        b'+1:lemma:0.2'
0.903810 Supp     b'-2:lemma:pahse'
0.903528 Med      b'+1:lemma:supplement'
0.902618 Supp     b'-2:lemma:condition'
0.902337 OD       b'-2:lemma:phase'
0.901883 Supp     b'-1:lemma:vol'
0.901883 Supp     b'-2:lemma:1/100'
0.901883 Supp     b'+2:lemma:1m'
0.901486 Supp     b'-2:lemma:supplement'
0.896690 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
0.895963 Air      b'-2:lemma:nh4cl'
0.892690 O        b'-1:lemma:mg1655'
0.891520 O        b'+1:lemma:k-12'
0.890924 O        b'lemma:lrp'
0.890443 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
0.889880 Phase    b'-2:postag:IN'
0.886790 Supp     b'-1:lemma:contain'
0.884355 Med      b'-1:ner:MED'
0.882533 Supp     b'+2:lemma:ph'
0.881175 O        b'+1:lemma:acetate'
0.880526 O        b'lemma:chip-fnr'
0.880526 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
0.880271 Supp     b'-1:lemma:sodium'
0.880271 Supp     b'+2:lemma:1/100'
0.874294 Gtype    b'-1:lemma:from'
0.874037 Med      b'+1:postag:-LRB-'
0.871038 Gtype    b'lemma:phtpg'
0.869206 O        b'+1:lemma:ph5'
0.869206 O        b'+2:lemma:.5'
0.862870 Air      b'-1:lemma:cm20'
0.862870 Air      b'-2:lemma:\xc2\xb5l'
0.862693 Supp     b'-1:lemma:without'
0.861534 O        b'+1:ner:SUPP'
0.860237 Temp     b'+1:lemma:and'
0.858144 O        b'-1:lemma:w0002'
0.857774 O        b'+1:postag:VBN'
0.854093 Med      b'-2:postag:JJ'
0.852151 Technique b'postag:NNP'
0.852008 Supp     b'-2:lemma:trpr'
0.851525 O        b'-1:lemma:-80'
0.848867 Technique b'-2:ner:TF'
0.845325 Gtype    b'+1:lemma::'
0.844656 Supp     b'+1:lemma:iptg'
0.843514 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
0.842293 Air      b'-1:postag:CD'
0.835524 Air      b'+1:lemma:until'
0.833586 O        b'lemma:rnase'
0.831344 O        b'+2:lemma:chipseq'
0.830324 Strain   b'-1:lemma:.'
0.830324 Strain   b'-1:postag:.'
0.827875 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.827875 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.827001 Gtype    b'+2:lemma:control'
0.825050 Agit     b'+2:postag:IN'
0.824615 Gtype    b'-2:lemma:genoype'
0.820162 Supp     b'-1:lemma:potassium'
0.820162 Supp     b'-2:lemma:mmol'
0.818138 OD       b'-1:lemma:~'
0.816119 Supp     b'-1:postag:IN'
0.815205 O        b'-1:lemma:antibody'
0.810832 Air      b'+1:postag:IN'
0.808433 Gversion b'postag:CD'
0.807361 O        b'+1:postag::'
0.800718 Gtype    b'+2:ner:SUPP'
0.797908 Supp     b'-1:lemma:ompr'
0.796462 Med      b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
0.789674 O        b'lemma:fresh'
0.781666 Gtype    b'-2:lemma:ecolus'
0.780355 Gtype    b'-1:postag:VBP'
0.778305 O        b'-1:lemma:dpd'
0.777552 Supp     b'+2:postag:IN'
0.771386 Gversion b'lemma:_'
0.761726 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.760449 OD       b'-2:lemma:od600'
0.757150 Supp     b'-1:lemma:respiration'
0.757150 Supp     b'+1:lemma:mmol'
0.757150 Supp     b'+2:lemma:potassium'
0.756811 pH       b'+1:lemma:5.5'
0.756504 OD       b'lemma:of'
0.753437 Gtype    b'+2:postag::'
0.751800 Supp     b'lemma:30'
0.749606 Gtype    b'lemma:flagtag'
0.749606 Gtype    b'-2:lemma:nsrr'
0.748748 Gtype    b'lemma:Wild'
0.748310 Supp     b'lemma:tryptophan'
0.748310 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
0.748097 O        b'+1:lemma:30'
0.743090 O        b'-1:lemma:fructose'
0.740331 Temp     b'-2:lemma:see'
0.736725 Supp     b'+1:lemma:m'
0.735841 Vess     b'-2:postag:JJ'
0.731586 Gtype    b'+1:lemma:the'
0.731488 Phase    b'-1:lemma::'
0.729239 O        b'+1:lemma:dpd'
0.728010 OD       b'-1:lemma:at'
0.722722 O        b'-2:lemma:neg'
0.722113 Supp     b'-1:lemma:0.2'
0.718906 Temp     b'lemma:sample'
0.713875 Gtype    b'+2:lemma:rep2'
0.713875 Gtype    b'+2:lemma:rep1'
0.713028 Supp     b'+2:lemma:be'
0.712578 O        b'-2:lemma:Cra'
0.712062 O        b'+2:lemma:of'
0.711667 Technique b'lemma:-rrb-'
0.710351 Supp     b'lemma:0.1'
0.708713 Gversion b'+1:postag:CD'
0.708437 O        b'lemma:from'
0.707165 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.706812 Air      b'+2:lemma:37'


Top negative:
0.000083 Supp     b'-2:ner:MED'
0.000080 O        b'-2:ner:Organism'
0.000078 Technique b'-2:lemma:Fe'
0.000077 O        b'lemma:ntrc'
0.000077 O        b'lemma:csir'
0.000068 Supp     b'-2:lemma:iptg'
0.000064 Gtype    b'-2:lemma::'
0.000060 Technique b'+1:lemma:gadx'
0.000060 O        b'-2:lemma:1:100'
0.000059 Phase    b'+1:lemma:aerobically'
0.000047 Gversion b'+2:postag:NN'
0.000043 OD       b'-1:lemma:to'
0.000043 OD       b'-1:postag:TO'
0.000034 O        b'+1:lemma:glucose'
0.000029 Supp     b'+1:lemma:in'
0.000027 Temp     b'lemma:30'
0.000025 Temp     b'-1:postag:IN'
0.000022 Supp     b'lemma:mg/l'
0.000022 Supp     b'+1:lemma:tryptophan'
0.000020 Gtype    b'+2:lemma:-lrb-'
0.000017 Supp     b'+2:lemma:no3'
0.000016 Gtype    b'postag:NNP'
0.000013 Gtype    b'+1:lemma:carrying'
0.000013 Gtype    b'-2:lemma:lacx74/ptg2'
0.000013 Gtype    b'+2:lemma:inducible'
0.000012 O        b'+2:lemma:to'
0.000012 O        b'+2:postag:TO'
0.000011 O        b'-2:lemma:lb'
0.000008 Agit     b'postag:CD'
0.000008 O        b'lemma:ip'
0.000007 O        b'-2:ner:GEN'
0.000006 O        b'-1:lemma:2.5'
0.000005 Gtype    b'-2:lemma:lack'
0.000004 Gtype    b'+2:postag:JJ'
0.000004 Gtype    b'lemma:Fur'
0.000004 Air      b'-1:lemma:-rrb-'
0.000004 Air      b'-1:postag:-RRB-'
0.000004 Supp     b'lemma:min'
0.000004 OD       b'+2:lemma:about'
0.000003 Gtype    b'lemma:wildtype'
0.000002 O        b'-2:lemma:m63'
0.000002 O        b'lemma:Genome'
0.000002 O        b'+2:lemma:build'
0.000002 O        b'+1:lemma:anaeroibc'
0.000001 Supp     b'+1:lemma:with'
0.000001 Gtype    b'lemma:transcription'
0.000001 Gtype    b'+1:lemma:factor'
0.000001 Gtype    b'+2:lemma:Fur'
0.000001 Med      b'-1:lemma:w2'
0.000000 Supp     b'-2:lemma:\xce\xb4fur'
0.000000 Technique b'-1:postag:-LRB-'
-0.000000 O        b'+1:lemma:2.0'
0.000000 Supp     b'-2:lemma:MOPS'
-0.000001 O        b'+1:lemma:95'
-0.000004 O        b'-1:lemma:in'
-0.000005 Vess     b'+2:ner:_'
-0.000005 OD       b'+2:postag:RB'
-0.000005 Supp     b'lemma:250'
-0.000008 O        b'+2:lemma:37'
-0.000009 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.000014 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.000014 O        b'-2:lemma:nh4cl'
-0.000015 Supp     b'+1:postag:NNP'
-0.000018 OD       b'+1:lemma:.'
-0.000018 OD       b'+1:postag:.'
-0.000021 O        b'+2:lemma:rnase'
-0.000022 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.000037 O        b'+2:ner:SUPP'
-0.000045 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.000065 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.000097 O        b'+2:lemma:pk4854'
-0.000114 O        b'lemma:5'
-0.000162 Gtype    b'+2:lemma:,'
-0.000162 Gtype    b'+2:postag:,'
-0.000172 OD       b'+2:postag:DT'
-0.000338 O        b'-2:lemma:stir'
-0.000705 O        b'+2:lemma:the'
-0.000889 Technique b'-1:postag::'
-0.000906 O        b'-2:lemma:2'
-0.001197 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.001197 O        b'+2:lemma:1/100'
-0.001307 Gtype    b'+2:ner:GEN'
-0.001480 O        b'lemma:phase'
-0.001805 Air      b'+1:lemma:70'
-0.001970 Gtype    b'-1:lemma:-'
-0.002202 Gtype    b'lemma:,'
-0.002202 Gtype    b'postag:,'
-0.002735 OD       b'-1:ner:_'
-0.003035 OD       b'+2:postag:JJ'
-0.003185 O        b'-1:lemma:;'
-0.003185 O        b'-2:lemma:7.6'
-0.003285 OD       b'-2:postag:VBN'
-0.003532 Air      b'lemma:-lrb-'
-0.003602 Med      b'-2:lemma:grow'
-0.003650 O        b'+1:lemma:n2'
-0.003878 O        b'+2:lemma:medium'
-0.004406 O        b'+1:lemma:300'
-0.004408 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.004408 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.004624 Med      b'-2:lemma:in'
-0.005320 O        b'-2:lemma:10'
-0.005503 Air      b'postag:CC'
-0.006605 Air      b'postag:-LRB-'
-0.007264 Air      b'+1:lemma:and'
-0.007267 Air      b'-1:lemma:aerobically'
-0.007450 O        b'+2:lemma:then'
-0.007544 Air      b'-2:postag:VBD'
-0.007945 Supp     b'+1:ner:SUPP'
-0.008164 O        b'+1:lemma:co2'
-0.008490 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.009001 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.010919 Med      b'+1:postag:IN'
-0.010993 O        b'+1:lemma:mg1655'
-0.011582 O        b'lemma:n2'
-0.011587 O        b'-1:lemma:at'
-0.012948 OD       b'lemma:='
-0.013235 O        b'+1:lemma:0.4'
-0.013647 Supp     b'postag::'
-0.014456 O        b'lemma:o2'
-0.014781 O        b'-2:lemma:at'
-0.014834 Supp     b'-2:postag:NNS'
-0.015992 O        b'+2:postag:IN'
-0.016109 O        b'+2:lemma:0.2'
-0.016425 O        b'+1:lemma:7.6'
-0.016425 O        b'-2:lemma:1m'
-0.016425 O        b'+2:lemma:;'
-0.017072 Anti     b'-1:ner:_'
-0.017590 Strain   b'-1:ner:_'
-0.017755 O        b'-1:lemma:o2'
-0.019489 O        b'-2:lemma:ph'
-0.020263 O        b'+2:lemma:250'
-0.020451 OD       b'+2:postag:NN'
-0.020576 O        b'-1:lemma:rna'
-0.022023 Vess     b'-2:ner:_'
-0.022682 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.022835 Gversion b'+1:ner:_'
-0.023856 O        b'+1:postag:VB'
-0.024152 Supp     b'lemma:vol'
-0.024152 Supp     b'-1:lemma:1/100'
-0.024341 Air      b'-2:lemma:aerobically'
-0.025481 O        b'lemma:final'
-0.026091 Med      b'-2:postag:IN'
-0.030093 Supp     b'-2:lemma:mm'
-0.030093 Supp     b'-2:ner:KWSUPP'
-0.030800 OD       b'-2:lemma:grow'
-0.030927 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.032174 O        b'+1:lemma:phase'
-0.032226 Supp     b'lemma:paraquat'
-0.032226 Supp     b'-2:lemma:um'
-0.033948 O        b'+2:postag:DT'
-0.034198 Gtype    b'lemma:ompr'
-0.034300 Gtype    b'-1:postag:JJ'
-0.034802 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.036075 O        b'-1:lemma:n2'
-0.036275 Substrain b'-1:ner:_'
-0.036314 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.036314 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.036314 O        b'+2:lemma:vol'
-0.036875 O        b'+2:lemma:5'
-0.037339 O        b'+2:lemma:in'
-0.039852 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.041180 O        b'lemma:mg/ml'
-0.041180 O        b'-1:lemma:150'
-0.043219 O        b'+1:lemma:10'
-0.045066 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.045689 O        b'lemma:1/100'
-0.045689 O        b'+1:lemma:vol'
-0.046056 Supp     b'lemma:um'
-0.046056 Supp     b'+2:lemma:paraquat'
-0.050072 O        b'-1:ner:GEN'
-0.050372 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.050680 O        b'+1:lemma:of'
-0.050730 Supp     b'lemma:ph'
-0.051232 Temp     b'-2:postag:NN'
-0.051473 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.051473 Supp     b'-1:postag:.'
-0.052959 O        b'+2:postag:CC'
-0.054137 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.054809 O        b'+1:lemma:contain'
-0.055581 Gtype    b'-2:postag:CC'
-0.055814 Supp     b'postag:CD'
-0.056923 O        b'-2:lemma:100'
-0.059253 Anti     b'+1:ner:_'
-0.059294 Gtype    b'lemma:control'
-0.059838 O        b'+1:lemma:5'
-0.060526 O        b'+1:lemma:mm'
-0.060526 O        b'+1:ner:KWSUPP'
-0.062165 O        b'-2:lemma:n2'
-0.062994 O        b'+2:lemma:sample'
-0.064112 Gtype    b'postag::'
-0.064152 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.065310 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.065430 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.067318 Air      b'-2:lemma:be'
-0.067945 O        b'lemma:%'
-0.069829 O        b'-2:lemma:%'
-0.073571 Supp     b'-2:lemma:.'
-0.073571 Supp     b'-2:postag:.'
-0.074914 Strain   b'+2:ner:_'
-0.075674 Supp     b'lemma:.'
-0.075674 Supp     b'postag:.'
-0.075877 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.076960 Supp     b'lemma:,'
-0.076960 Supp     b'postag:,'
-0.077471 Air      b'+2:postag:IN'
-0.078206 Supp     b'postag:CC'
-0.081422 O        b'+2:lemma:ph'
-0.082891 Med      b'-2:ner:MED'
-0.083106 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.083435 O        b'-1:ner:MED'
-0.084660 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.086443 O        b'+1:lemma:ph'
-0.088442 O        b'-2:lemma:1'
-0.089061 pH       b'-2:ner:_'
-0.089516 O        b'+1:lemma:.'
-0.089516 O        b'+1:postag:.'
-0.090143 Air      b'+1:ner:_'
-0.091059 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.091128 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.092593 Supp     b'postag:IN'
-0.092751 O        b'-1:lemma:harbor'
-0.093811 O        b'+1:lemma:~'
-0.093879 O        b'+2:lemma:media'
-0.096004 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.096036 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.096156 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.099289 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.104949 Agit     b'-1:ner:_'
-0.105341 Med      b'-1:postag:IN'
-0.108701 O        b'-2:lemma:50'
-0.109166 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.109859 O        b'lemma:ph'
-0.112597 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.114147 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.114147 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.114789 Supp     b'-2:ner:_'
-0.114898 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.116395 Supp     b'-2:lemma:;'
-0.117118 O        b'-2:lemma:to'
-0.117118 O        b'-2:postag:TO'
-0.117329 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.119074 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.120145 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.120238 O        b'+2:lemma:~'
-0.122795 O        b'+1:lemma:a'
-0.123732 O        b'+2:lemma:agitation'
-0.125600 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.126318 Air      b'+2:lemma:70'
-0.128030 O        b'-1:lemma:.'
-0.128030 O        b'-1:postag:.'
-0.129051 Supp     b'-2:lemma:glucose'
-0.129653 Air      b'+2:ner:_'
-0.131530 O        b'-1:postag:VBG'
-0.133965 Supp     b'+2:ner:SUPP'
-0.134897 Air      b'-1:postag:CC'
-0.135425 O        b'-1:lemma:mm'
-0.135805 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.136943 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.137543 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.137750 O        b'lemma:150'
-0.137750 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.137750 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.139450 O        b'+1:lemma:media'
-0.143171 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.145033 O        b'lemma:dpd'
-0.145499 Air      b'+2:lemma:or'
-0.145919 O        b'lemma:medium'
-0.148137 Phase    b'+2:ner:_'
-0.148143 OD       b'-2:ner:_'
-0.149191 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.149695 O        b'-1:lemma:~'
-0.151183 O        b'+2:lemma:0.3'
-0.151269 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.153395 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.155847 O        b'lemma:methanol'
-0.155847 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.158936 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.159581 O        b'-2:postag:DT'
-0.161808 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.162060 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.163071 O        b'+1:lemma:%'
-0.166931 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.168650 Med      b'+1:postag:NN'
-0.168670 O        b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.171437 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.172845 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.173187 O        b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.174192 Supp     b'+1:lemma:final'
-0.176044 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.179255 O        b'+2:lemma:n2'
-0.180614 O        b'lemma:20'
-0.180732 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.182500 O        b'postag:NN'
-0.183984 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.184529 O        b'-2:postag::'
-0.186395 Air      b'-2:postag:CC'
-0.189252 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.190233 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.190233 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.190865 O        b'-2:lemma:grow'
-0.196237 Supp     b'lemma:1'
-0.197907 O        b'lemma:;'
-0.197907 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.198026 O        b'lemma:sample'
-0.199352 O        b'lemma:dissolve'
-0.199352 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.199826 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.201372 Med      b'postag:CD'
-0.201729 Supp     b'-1:postag:NN'
-0.202153 Vess     b'postag:NN'
-0.203069 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.204688 Air      b'postag:CD'
-0.205931 O        b'lemma:fecl2'
-0.209751 O        b'-2:lemma:m'
-0.211554 O        b'-1:lemma:with'
-0.212745 O        b'-1:postag:DT'
-0.214097 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.215668 Vess     b'+1:ner:_'
-0.216153 Temp     b'postag:JJ'
-0.216671 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.216744 O        b'-2:lemma:20'
-0.216853 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.219366 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.219466 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.219872 Vess     b'-1:ner:_'
-0.220323 Supp     b'+2:postag::'
-0.225224 O        b'-2:lemma:o2'
-0.225688 O        b'+1:postag:NNS'
-0.226565 O        b'lemma:lb'
-0.231746 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.233435 O        b'-1:lemma:1m'
-0.233435 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.236966 O        b'-2:lemma:antibody'
-0.239511 O        b'-2:lemma:of'
-0.239664 Supp     b'+2:ner:_'
-0.240962 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.242378 Technique b'-2:ner:_'
-0.247060 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.256545 O        b'lemma:1m'
-0.257438 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.263310 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.263656 O        b'-1:lemma:final'
-0.264656 O        b'lemma:7.6'
-0.264656 O        b'+1:lemma:;'
-0.266859 OD       b'postag:NN'
-0.266916 Supp     b'lemma:10'
-0.282137 O        b'lemma:m63'
-0.285097 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.290616 O        b'lemma:pahse'
-0.294814 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.297200 Anti     b'+2:ner:_'
-0.298486 Strain   b'+1:ner:_'
-0.299122 O        b'+2:lemma:follow'
-0.300114 Technique b'-2:postag:NN'
-0.301347 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.302283 O        b'+2:lemma:m9'
-0.307840 O        b'lemma:nacl'
-0.313866 O        b'-1:postag:IN'
-0.317754 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.321915 O        b'-2:lemma:dna'
-0.330214 O        b'-1:lemma:ml'
-0.333803 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.334436 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.338088 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.340953 O        b'+1:lemma:1m'
-0.340953 O        b'-2:lemma:vol'
-0.342216 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.342827 Med      b'-1:ner:_'
-0.343015 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.344654 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.346644 Air      b'-1:ner:_'
-0.346912 O        b'+2:lemma:co2'
-0.348612 O        b'-1:lemma:the'
-0.348698 O        b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.350624 O        b'lemma:co2'
-0.351716 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.364404 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.364918 Supp     b'lemma:2'
-0.372542 O        b'+2:lemma:reference'
-0.378139 O        b'+2:lemma:.'
-0.378139 O        b'+2:postag:.'
-0.378401 O        b'-1:lemma:until'
-0.379516 O        b'lemma:0.2'
-0.381123 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.381129 O        b'+1:postag:CD'
-0.385058 O        b'+2:lemma:genome'
-0.385937 O        b'+2:lemma:add'
-0.387726 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.391882 O        b'-1:lemma:37'
-0.397178 O        b'lemma:od600'
-0.404188 O        b'lemma:minimal'
-0.408497 O        b'-1:lemma:IP'
-0.414456 Med      b'-1:postag:NN'
-0.442210 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.451695 O        b'lemma:37'
-0.451799 O        b'lemma:rifampicin'
-0.454489 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.454489 Supp     b'+1:postag:,'
-0.455847 O        b'-1:lemma:of'
-0.458035 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.460779 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.471075 O        b'+1:lemma:until'
-0.473737 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.473915 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.480471 O        b'lemma:0.1'
-0.484585 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.485971 O        b'lemma:nh4cl'
-0.492206 O        b'+1:postag:IN'
-0.503443 Phase    b'+1:ner:_'
-0.516764 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.529169 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.534813 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.538314 O        b'-2:lemma::'
-0.542729 Agit     b'postag:NN'
-0.543006 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.543463 pH       b'+2:ner:_'
-0.545395 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.546989 O        b'+2:postag:RB'
-0.558514 O        b'+1:lemma:+'
-0.560982 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.567115 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.571934 O        b'-2:postag:SYM'
-0.580905 O        b'+1:lemma:m'
-0.585029 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.609732 O        b'postag:RB'
-0.610050 O        b'+1:postag:DT'
-0.610170 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.619077 O        b'+2:lemma:10'
-0.619388 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.635101 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.639230 O        b'+1:lemma:hour'
-0.642311 Med      b'+1:ner:MED'
-0.653871 O        b'-1:lemma:vol'
-0.653871 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.653871 O        b'+2:lemma:1m'
-0.674674 O        b'+1:lemma:in'
-0.675519 Anti     b'postag:NNP'
-0.675687 O        b'-1:postag::'
-0.678026 pH       b'postag:NN'
-0.690342 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.694519 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.701378 O        b'+1:lemma:at'
-0.701545 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.709519 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.730430 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.741564 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.777680 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.779298 O        b'-1:lemma:1'
-0.780884 O        b'-2:lemma:genome'
-0.784520 Gtype    b'-2:postag:CD'
-0.788682 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.792492 O        b'-1:lemma:contain'
-0.798574 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.801139 Gtype    b'postag:VBG'
-0.821061 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.863523 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.868993 O        b'-2:postag:VBG'
-0.872831 O        b'-2:lemma:until'
-0.884812 O        b'-1:lemma:co2'
-0.933538 O        b'-2:lemma:IP'
-0.962720 O        b'+2:lemma:tag'
-1.024907 O        b'lemma:mid-log'
-1.027393 O        b'-2:lemma:the'
-1.027880 O        b'lemma:of'
-1.055919 Technique b'+1:ner:_'
-1.060967 O        b'-2:lemma:media'
-1.067125 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-1.081127 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.120519 O        b'-2:lemma:aerobically'
-1.184531 O        b'lemma:wt'
-1.201976 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.237296 O        b'lemma:aerobic'
-1.238818 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.252120 Temp     b'postag:NN'
-1.253815 Air      b'postag:NN'
-1.256772 O        b'lemma:media'
-1.319701 O        b'-2:ner:TF'
-1.333714 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-1.356232 Supp     b'postag:JJ'
-1.375562 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.376970 O        b'-1:lemma:30'
-1.409074 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-1.421350 OD       b'+1:postag:NN'
-1.443437 O        b'lemma:aerobically'
-1.446140 O        b'lemma:30'
-1.534097 O        b'+2:lemma:+'
-1.542772 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.566268 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.797619 O        b'-1:lemma:ph'
-1.813666 O        b'+1:lemma:2'
-1.818182 O        b'+2:lemma:b'
-1.835494 O        b'lemma:0.3'
-1.836499 O        b'-1:lemma:2'
-1.989599 Phase    b'postag:JJ'
-2.031641 O        b'-2:lemma:0.3'
-2.084306 O        b'-1:lemma:sample'
-2.126589 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.138431 O        b'+1:lemma:1'
-3.489346 O        b'-1:lemma::'
-3.797900 O        b'-1:lemma:_'