report_Run13_v10.txt
39.5 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.05318568891382186, 'c2': 0.019261443877852925}
best CV score:0.8308032444965605
model size: 0.12M
Flat F1: 0.8147298617165236
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.897 0.398 0.551 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.939 0.795 0.861 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.870 0.838 0.854 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.919 0.754 0.815 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.489225
Anti -> Anti 5.297971
Med -> Med 5.148930
OD -> OD 4.645401
Phase -> Phase 4.542102
Gversion -> Gversion 4.444580
Gtype -> Gtype 4.324517
Air -> Air 3.784889
Technique -> Technique 3.724670
Supp -> Supp 3.635437
pH -> pH 3.416002
O -> O 3.095640
Substrain -> Gtype 2.016562
Agit -> Agit 1.911782
Technique -> Air 1.244243
Gtype -> pH 0.736416
O -> Technique 0.588059
Gtype -> Supp 0.273996
Temp -> O 0.132989
Air -> O 0.115089
Anti -> O 0.093016
Technique -> O 0.001196
O -> pH -0.000005
Air -> OD -0.000011
Agit -> O -0.000323
O -> Agit -0.000940
pH -> O -0.002042
Supp -> Phase -0.002599
Med -> Air -0.003921
Gtype -> Gversion -0.004295
Anti -> Gtype -0.023408
Air -> Phase -0.025569
Supp -> OD -0.059551
O -> Phase -0.064351
Temp -> Supp -0.065372
Air -> pH -0.070714
Gtype -> OD -0.086087
O -> Temp -0.092185
Med -> O -0.101025
Gtype -> Air -0.102771
Phase -> Air -0.120426
Substrain -> Supp -0.145820
O -> Gversion -0.162454
O -> Gtype -0.204544
Gtype -> Anti -0.226935
Gtype -> Technique -0.286935
Phase -> O -0.294287
Supp -> Technique -0.312346
Anti -> Supp -0.325217
pH -> Supp -0.341687
Gversion -> O -0.385976
O -> Med -0.397296
Air -> Agit -0.459407
Gversion -> Supp -0.472034
Phase -> Supp -0.472605
Temp -> Med -0.474586
Gtype -> Med -0.517652
O -> Supp -0.579565
Agit -> Air -0.618609
Technique -> Supp -0.642296
Supp -> Air -0.649138
Supp -> O -0.661724
O -> OD -0.696781
O -> Anti -0.699286
Phase -> OD -0.702936
Air -> Gtype -0.711923
OD -> Supp -0.756635
Supp -> Gtype -0.915451
Technique -> pH -0.935979
OD -> O -0.964963
Supp -> Med -0.987075
OD -> Air -1.100976
Gtype -> O -1.127027
Air -> Supp -1.328089
Substrain -> O -1.672034
Technique -> Gtype -1.865587
Med -> Supp -1.983364
O -> Air -2.007487
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.489225
Anti -> Anti 5.297971
Med -> Med 5.148930
OD -> OD 4.645401
Phase -> Phase 4.542102
Gversion -> Gversion 4.444580
Gtype -> Gtype 4.324517
Air -> Air 3.784889
Technique -> Technique 3.724670
Supp -> Supp 3.635437
pH -> pH 3.416002
O -> O 3.095640
Substrain -> Gtype 2.016562
Agit -> Agit 1.911782
Technique -> Air 1.244243
Gtype -> pH 0.736416
O -> Technique 0.588059
Gtype -> Supp 0.273996
Temp -> O 0.132989
Air -> O 0.115089
Anti -> O 0.093016
Technique -> O 0.001196
O -> pH -0.000005
Air -> OD -0.000011
Agit -> O -0.000323
O -> Agit -0.000940
pH -> O -0.002042
Supp -> Phase -0.002599
Med -> Air -0.003921
Gtype -> Gversion -0.004295
Anti -> Gtype -0.023408
Air -> Phase -0.025569
Supp -> OD -0.059551
O -> Phase -0.064351
Temp -> Supp -0.065372
Air -> pH -0.070714
Gtype -> OD -0.086087
O -> Temp -0.092185
Med -> O -0.101025
Gtype -> Air -0.102771
Phase -> Air -0.120426
Substrain -> Supp -0.145820
O -> Gversion -0.162454
O -> Gtype -0.204544
Gtype -> Anti -0.226935
Gtype -> Technique -0.286935
Phase -> O -0.294287
Supp -> Technique -0.312346
Anti -> Supp -0.325217
pH -> Supp -0.341687
Gversion -> O -0.385976
O -> Med -0.397296
Air -> Agit -0.459407
Gversion -> Supp -0.472034
Phase -> Supp -0.472605
Temp -> Med -0.474586
Gtype -> Med -0.517652
O -> Supp -0.579565
Agit -> Air -0.618609
Technique -> Supp -0.642296
Supp -> Air -0.649138
Supp -> O -0.661724
O -> OD -0.696781
O -> Anti -0.699286
Phase -> OD -0.702936
Air -> Gtype -0.711923
OD -> Supp -0.756635
Supp -> Gtype -0.915451
Technique -> pH -0.935979
OD -> O -0.964963
Supp -> Med -0.987075
OD -> Air -1.100976
Gtype -> O -1.127027
Air -> Supp -1.328089
Substrain -> O -1.672034
Technique -> Gtype -1.865587
Med -> Supp -1.983364
O -> Air -2.007487
Top positive:
6.385584 O b'lemma:1'
5.899182 O b'lemma:2'
5.727502 O b'lemma:_'
5.567959 Anti b'-2:lemma:antibody'
5.531191 Supp b'lemma:no3'
5.495320 Supp b'lemma:pq'
5.306813 O b'-2:lemma:_'
5.134712 O b'lemma:3'
4.927917 Technique b'lemma:chipseq'
4.828703 Air b'lemma:anaerobic'
4.762831 Phase b'lemma:mid-log'
4.596033 Gtype b'lemma:wt'
4.488797 Phase b'-2:lemma:phase'
4.431758 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
4.423220 O b'lemma:-'
4.404715 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
4.282856 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
4.208822 Strain b'lemma:k-12'
4.067538 O b'lemma:with'
3.979239 Air b'lemma:aerobically'
3.948665 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.872418 Technique b'lemma:rna-seq'
3.871015 Supp b'lemma:Iron'
3.871015 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.859915 O b'lemma:Cra'
3.761349 O b'lemma:rpob'
3.686496 O b'lemma:b'
3.648189 O b'postag:VBG'
3.647240 Gtype b'lemma:type'
3.574913 Gtype b'-2:lemma:genotype'
3.538844 O b'lemma:.'
3.538844 O b'postag:.'
3.498055 Supp b'lemma:iptg'
3.488118 Technique b'lemma:chip-seq'
3.488032 Supp b'-2:lemma:shake'
3.447891 Supp b'lemma:nh4cl'
3.415893 Supp b'lemma:2h'
3.415893 Supp b'-1:lemma:additional'
3.362658 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.358306 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.342032 Supp b'lemma:acetate'
3.324441 Supp b'lemma:nacl'
3.307028 O b'-2:lemma:myc'
3.241376 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.234694 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.222827 Air b'-2:lemma:IP'
3.067702 Gtype b'+1:lemma:type'
3.064870 Substrain b'lemma:mg1655'
3.058259 Phase b'lemma:stationary'
3.058259 Phase b'lemma:exponential'
3.056062 O b'-1:lemma:tag'
3.006654 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
2.990859 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.979782 O b'-2:lemma:flagtag'
2.899379 Supp b'+1:lemma:1'
2.898512 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
2.894052 Air b'lemma:aerobic'
2.876292 O b'lemma:purr'
2.868795 O b'-1:postag:NNS'
2.853729 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.793057 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.792749 pH b'lemma:ph5'
2.792749 pH b'+1:lemma:.5'
2.789485 O b'lemma:CEL'
2.786967 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
2.782388 O b'postag:IN'
2.778987 Supp b'lemma:fructose'
2.772023 Med b'lemma:LB'
2.768148 Gtype b'lemma:dfnr'
2.767912 O b'lemma:trpr'
2.762728 Supp b'+1:lemma:2'
2.746821 Med b'lemma:MOPS'
2.732876 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.716209 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.705553 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.703283 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.697527 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.692276 O b'lemma:rep2'
2.692276 O b'lemma:rep1'
2.652180 Supp b'lemma:Adenine'
2.644801 O b'-1:lemma:0.3'
2.629909 O b'lemma:ompr'
2.625069 Med b'+2:lemma:b2'
2.615976 Phase b'+2:lemma:o.d.'
2.611242 O b'postag:VBN'
2.599645 Supp b'-2:lemma:media'
2.599307 Gtype b'-1:ner:GEN'
2.591378 O b'-1:lemma:glucose'
2.588408 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.578923 O b'+2:lemma:crp'
2.567810 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.565728 O b'+1:lemma:wt'
2.556113 O b'postag::'
2.549038 Supp b'lemma:arginine'
2.545162 Supp b'-1:lemma:+'
2.528926 Air b'-1:lemma:-'
2.526650 Med b'lemma:lb'
2.517170 Air b'lemma:anaeroibc'
2.505439 O b'-1:lemma:type'
2.500240 O b'lemma:soxr'
2.500240 O b'lemma:soxs'
2.476680 O b'-1:lemma:pq'
2.475989 Technique b'lemma:chip-exo'
2.468132 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.444119 Air b'postag:JJ'
2.419347 O b'-2:lemma:fructose'
2.410923 O b'lemma:culture'
2.396005 O b'lemma:at'
2.392538 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.373049 O b'-2:lemma:='
2.369038 O b'lemma:a'
2.364133 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.359088 Med b'+2:postag:CC'
2.353753 Temp b'-1:lemma:37'
2.338802 Technique b'-2:lemma:wt'
2.336047 Supp b'-2:lemma:argr'
2.332401 O b'+1:lemma:pq'
2.327200 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.326635 Supp b'lemma:glucose'
2.326389 O b'lemma:harbor'
2.290627 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.288124 O b'lemma:argr'
2.255732 Temp b'lemma:37'
2.251798 Gtype b'lemma:pk4854'
2.241629 pH b'+1:postag:CD'
2.232590 Gtype b'lemma:ptac'
2.223316 Temp b'lemma:43'
2.216488 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.208731 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
2.189466 Med b'lemma:m63'
2.185237 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.179407 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.179407 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.176805 Gversion b'lemma:.2'
2.176805 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.128602 Temp b'-1:lemma:sample'
2.124570 Supp b'lemma:dpd'
2.115060 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.113340 Gtype b'-1:lemma:rpob'
2.104651 Supp b'+2:lemma:feso4'
2.101808 O b'-1:lemma:media'
2.093870 O b'-1:lemma:nacl'
2.092974 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.083460 Supp b'-2:lemma:agent'
2.079844 O b'lemma::'
2.079796 O b'-1:lemma:lb'
2.076805 Supp b'+1:lemma:_'
2.076147 Air b'-2:lemma:fnr'
2.075745 O b'lemma:input'
2.075745 O b'+1:lemma:chip-seq'
2.057135 Med b'+1:lemma:0.4'
2.053039 O b'-1:lemma:wt'
2.033687 Air b'-1:lemma:co2'
2.031107 O b'lemma:oxyr'
2.025897 O b'+1:postag:RB'
2.002909 Gtype b'postag:JJ'
1.999818 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.996173 Med b'lemma:media'
1.994231 Supp b'lemma:Leu'
1.994231 Supp b'-2:lemma:Lrp'
1.992094 O b'postag:DT'
1.979827 Supp b'-1:lemma:with'
1.977919 O b'lemma:for'
1.972860 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.972860 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.967610 Med b'+2:lemma:b1'
1.962572 O b'postag:CC'
1.937214 O b'lemma:gadx'
1.935491 O b'lemma:growth'
1.921177 Supp b'+1:lemma:Deficient'
1.920133 Technique b'-1:lemma:input'
1.919402 Supp b'-2:lemma:induce'
1.919292 O b'lemma:\xcf\x8332'
1.917207 Gversion b'lemma:u00096'
1.917207 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.911055 OD b'lemma:0.3'
1.907400 Supp b'-2:postag:VBG'
1.902286 Agit b'lemma:rpm'
1.899308 O b'lemma:affyexp'
1.897476 O b'lemma:cra'
1.897227 Temp b'-1:lemma:43'
1.896945 Strain b'+1:lemma:substr'
1.896945 Strain b'-2:lemma:str'
1.893648 Supp b'-2:lemma:for'
1.890572 O b'lemma:chip'
1.889667 Gversion b'-2:lemma:build'
1.886231 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.870873 Agit b'-1:lemma:250'
1.866227 Vess b'lemma:flask'
1.866227 Vess b'-1:lemma:warm'
1.866227 Vess b'-2:lemma:pre'
1.866227 Vess b'+2:lemma:43'
1.861977 Gtype b'+1:lemma:ph5'
1.861977 Gtype b'+2:lemma:.5'
1.857342 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.843983 O b'-1:lemma:min'
1.842652 Supp b'-1:lemma:_'
1.829423 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.810797 Med b'lemma:minimal'
1.809027 O b'-2:lemma:medium'
1.807915 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.802284 Supp b'-2:lemma:purr'
1.799463 O b'+1:lemma:od600'
1.788108 O b'-1:lemma:aerobic'
1.785871 Supp b'lemma:Fe'
1.773921 Supp b'-2:lemma:10'
1.766465 Supp b'+2:lemma:A'
1.766433 Gtype b'+1:lemma:with'
1.762167 Technique b'lemma:rnaseq'
1.757652 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.757652 Gtype b'-1:lemma:old'
1.757652 Gtype b'-2:lemma:seqa'
1.735688 Med b'-1:lemma:in'
1.721936 O b'lemma:ml'
1.716573 Med b'+1:lemma:2.0'
1.711795 Supp b'-1:lemma:vol'
1.711795 Supp b'-2:lemma:1/100'
1.711795 Supp b'+2:lemma:1m'
1.709829 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.707965 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.704149 Air b'postag:RB'
1.694393 O b'+1:lemma:20'
1.690888 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.687680 O b'+1:lemma::'
1.672733 O b'+1:lemma:coli'
1.670404 Med b'-1:lemma:minimal'
1.659606 Phase b'+1:lemma:phase'
1.653462 O b'lemma:treatment'
1.650095 Air b'lemma:Anaerobic'
1.633632 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.621359 OD b'-1:lemma:at'
1.612906 Med b'-2:lemma:minimal'
1.611904 Strain b'-2:lemma:strain'
1.609565 pH b'lemma:.5'
1.609565 pH b'-1:lemma:ph5'
1.607521 O b'+1:lemma:250'
1.605187 O b'-2:lemma:overnight'
1.596899 Anti b'postag:JJ'
1.593321 Gtype b'lemma:wild-type'
1.588732 Technique b'-1:lemma:IP'
1.573005 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.563952 O b'lemma:genotype/variation'
1.562139 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.558183 OD b'+2:lemma:0.3'
1.553599 Temp b'-2:lemma:keep'
1.535885 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.532301 O b'-1:lemma:acetate'
1.527301 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.527301 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.526061 O b'+1:lemma:mid-log'
1.525145 Supp b'-1:lemma:final'
1.521242 Air b'-1:lemma:_'
1.518005 OD b'+1:lemma:of'
1.501760 Med b'+2:lemma:+'
1.485846 O b'-1:lemma:dpd'
1.473085 Supp b'+2:lemma:ph'
1.470154 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.468859 Med b'-2:lemma:medium'
1.467955 O b'+2:lemma:constant'
1.459868 O b'-1:lemma:l1'
1.457826 Gtype b'+1:lemma:_'
1.456746 Supp b'lemma:glutamine'
1.456746 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.449334 Gversion b'lemma:000913'
1.449334 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.446369 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.446158 Gversion b'lemma:nc'
1.446158 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.445214 Gtype b'+1:lemma:control'
1.443797 Vess b'-1:postag:VBN'
1.439455 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
1.432983 OD b'postag:CD'
1.427815 Air b'-1:postag::'
1.425374 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.420348 O b'postag:NNS'
1.418332 O b'+1:ner:MED'
1.416480 Air b'+2:postag:CD'
1.413255 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.410390 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.399087 O b'-1:ner:TF'
1.399006 Technique b'lemma:-lrb-'
1.398570 Substrain b'-1:lemma:.'
1.398570 Substrain b'-1:postag:.'
1.397149 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.393186 Agit b'lemma:250'
1.391315 Technique b'postag:-LRB-'
1.381996 O b'-2:lemma:Cra'
1.378305 Supp b'lemma:rifampicin'
1.372389 O b'postag:VBD'
1.366428 Med b'+1:lemma:+'
1.351180 Supp b'-2:lemma:20'
1.349635 Air b'-2:lemma:0.3'
1.340515 Supp b'+2:postag:-LRB-'
1.340434 Vess b'-2:postag:JJ'
1.337848 O b'lemma:additional'
1.337848 O b'+1:lemma:2h'
1.326042 Supp b'+1:lemma:iptg'
1.323321 Air b'-2:lemma:cm20'
1.321225 O b'-1:lemma:into'
1.318869 O b'lemma:A'
1.316484 Gtype b'-2:lemma:delta'
1.313435 O b'-2:lemma:min'
1.310805 Vess b'+1:lemma:at'
1.309780 Gversion b'-2:postag:VB'
1.306517 OD b'-1:postag:IN'
1.302940 O b'lemma:genotype'
1.301858 O b'+2:lemma:allow'
1.292379 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.291983 OD b'lemma:od450'
1.279481 Med b'postag:NNP'
1.277641 Technique b'+1:ner:TF'
1.277103 Gtype b'-2:lemma:dna'
1.275137 Med b'lemma:medium'
1.274232 Med b'+1:lemma:minimal'
1.271257 OD b'lemma:od600'
1.271091 Med b'-2:postag:JJ'
1.267602 Agit b'+2:lemma:at'
1.266031 O b'lemma:chip-arca'
1.266031 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.262375 OD b'+1:postag:IN'
1.261184 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.256387 Gtype b'lemma:phtpg'
1.250732 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.239887 Technique b'-1:lemma:1'
1.237931 Technique b'-1:lemma:_'
1.237846 Air b'-2:lemma:mid-log'
1.234675 Air b'-1:lemma:phase'
1.231930 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.228261 Med b'-1:lemma:ml'
1.226377 Supp b'postag:NNP'
1.224823 Gtype b'-2:postag:JJ'
1.224649 O b'+1:postag:NNP'
1.221435 O b'-1:lemma:fructose'
1.216847 Air b'-2:postag:CD'
1.216020 Gtype b'lemma:nsrr'
1.216020 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.215342 Substrain b'+2:lemma::'
1.213980 Supp b'+2:lemma:add'
1.212520 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.212520 Gtype b'-2:lemma:transcription'
1.210135 Temp b'+2:postag:DT'
1.209086 OD b'-2:lemma:od450'
1.206827 Gtype b'-1:lemma:wild'
1.203796 pH b'lemma:5.5'
1.203608 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.202341 Gtype b'-1:lemma:harbor'
1.200677 Supp b'lemma:0.2'
1.191743 O b'-2:ner:MED'
1.181977 O b'+2:lemma:rpm'
1.177498 Gtype b'+1:postag::'
1.171387 O b'+1:ner:SUPP'
1.162781 O b'+1:lemma:43'
1.161648 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.151230 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.148802 O b'lemma:rnase'
1.144371 pH b'-2:lemma:at'
1.141329 Supp b'-2:lemma:trpr'
1.138833 Gtype b'-1:lemma:from'
1.137193 Air b'-2:lemma:%'
1.135975 pH b'-1:lemma:ph'
1.133514 Supp b'-1:lemma:30'
1.132011 O b'+1:lemma:0.2'
1.131043 Anti b'+2:postag:NNP'
1.129538 OD b'-2:lemma:phase'
1.128634 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.128634 Supp b'+2:lemma:1/100'
1.123651 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.123651 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.123540 Strain b'+2:lemma:.'
1.123540 Strain b'+2:postag:.'
1.120456 Agit b'-2:postag:RB'
1.118789 OD b'lemma:o.d.'
1.118789 OD b'+1:lemma:600nm'
1.116309 O b'+1:lemma:acetate'
1.111632 O b'-1:lemma:nitrate'
1.111385 O b'lemma:s'
1.111385 O b'-2:lemma:parameter'
1.109672 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.109286 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
1.109239 Phase b'-2:lemma:until'
1.104651 Med b'+1:lemma:g/l'
1.096034 Supp b'+2:postag:IN'
1.094481 O b'-2:lemma:Wild'
1.093998 O b'+2:lemma:of'
1.092264 Gtype b'-2:postag:NNS'
1.090199 O b'lemma:old'
1.090199 O b'-1:lemma:seqa'
1.090199 O b'+1:lemma:deltaseqa'
1.088790 O b'-1:lemma:medium'
1.085986 Supp b'-1:postag:CD'
1.084059 O b'postag:FW'
1.082925 Technique b'-2:postag:NNP'
1.082103 Air b'-1:postag:CD'
1.075674 Med b'-2:lemma:g/l'
1.075203 O b'+2:lemma:fructose'
1.074626 Phase b'-1:lemma:until'
1.071565 Supp b'-1:lemma:0.2'
1.070595 Gtype b'-2:lemma:mg1655'
1.069584 O b'-2:lemma:ml'
1.059805 Technique b'postag:NNP'
1.054905 Air b'lemma:Aerobic'
1.052185 O b'+1:lemma:k-12'
1.051092 O b'lemma:Fur'
1.049624 Supp b'-1:lemma:mm'
1.049117 Air b'-2:postag:SYM'
1.048145 O b'-1:ner:_'
1.046333 O b'+1:lemma:nacl'
1.043477 O b'-1:lemma:genotype'
1.040675 Gtype b'+2:lemma:fnr'
1.039326 Air b'+1:lemma:%'
1.037714 Med b'postag:NNS'
1.034443 Temp b'-2:postag:VBD'
1.033301 O b'-1:lemma:shake'
1.032801 O b'+2:lemma:4'
1.031216 O b'-1:lemma:mg1655'
1.029885 O b'-1:lemma:induce'
1.029390 O b'-2:lemma:neg'
1.027498 Air b'-2:lemma:nh4cl'
1.023159 O b'lemma:from'
1.022983 Gtype b'-1:lemma:_'
1.019304 OD b'-1:lemma:od600'
1.019059 O b'+1:lemma:dpd'
1.017796 OD b'+2:lemma:~'
1.013412 Supp b'lemma:of'
1.010914 Gtype b'-2:lemma:ecolus'
1.009106 pH b'+1:lemma:5.5'
1.004977 Supp b'-2:lemma:condition'
1.002386 O b'+2:lemma:='
1.001955 O b'-1:lemma:-80'
0.999273 Technique b'-2:lemma:strategy'
0.995810 O b'+2:lemma:wt'
0.995630 Temp b'+1:lemma:see'
0.992457 Gtype b'lemma:wild'
0.992006 Anti b'+2:lemma:antibody'
0.985417 O b'+2:lemma:chipseq'
0.985409 O b'-1:lemma:w0002'
0.983530 O b'lemma:lrp'
0.982369 Supp b'+1:lemma:1m'
0.982369 Supp b'-2:lemma:vol'
0.978125 Supp b'-1:lemma:potassium'
0.978125 Supp b'-2:lemma:mmol'
0.976756 O b'lemma:or'
0.970022 Substrain b'+2:postag::'
0.964331 Supp b'-2:lemma:supplement'
0.960242 OD b'postag:IN'
0.959210 Med b'-1:lemma:g/l'
0.957994 O b'-2:lemma:genotype'
0.956668 Supp b'-1:lemma:contain'
0.954132 O b'lemma:chip-fnr'
0.954132 O b'+2:lemma:fnr8myc'
0.953536 Supp b'-2:ner:SUPP'
0.952045 Air b'+2:lemma:37'
0.951797 O b'+2:postag:JJ'
0.951414 Supp b'+1:lemma:hour'
0.949978 OD b'lemma:of'
0.948089 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
0.938236 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.937557 O b'lemma:be'
0.930640 O b'-1:lemma:0.35'
0.926051 Gtype b'+2:lemma:lacz'
0.923744 Strain b'-1:lemma:.'
0.923744 Strain b'-1:postag:.'
0.923376 Phase b'postag:NN'
0.920234 O b'lemma:min'
0.917702 O b'-2:lemma:Leu'
0.917504 OD b'-2:lemma:at'
0.917140 Supp b'-1:postag:IN'
0.916632 Med b'-1:lemma:fresh'
0.916373 Temp b'-2:lemma:see'
0.915003 O b'-2:lemma:in'
0.913804 Gtype b'-1:lemma:vector'
0.913242 Supp b'lemma:2g/l'
0.913242 Supp b'+1:lemma:glutamine'
0.905918 Gtype b'-2:lemma:genoype'
0.905626 Air b'+1:lemma:until'
0.903497 Air b'+1:lemma:b'
0.901926 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
0.901926 Anti b'+2:lemma:NeoClone'
0.900924 Supp b'lemma:30'
0.900855 O b'+2:ner:_'
0.895883 OD b'-1:lemma:of'
0.895577 O b'-1:lemma:short'
0.894123 Gtype b'-1:lemma:pk4854'
0.892442 Technique b'+1:lemma:rpos'
0.891413 Supp b'lemma:Trp'
0.890675 pH b'-1:lemma:at'
0.889173 Anti b'-2:lemma:\xc3\x9f'
0.886618 Gtype b'lemma:\xce\xb4gadw'
0.886618 Gtype b'lemma:\xce\xb4gadx'
0.886360 O b'-1:lemma:Iron'
0.885559 Gtype b'lemma:\xce\xb4gade'
0.885163 Temp b'lemma:sample'
0.883510 Gtype b'lemma:fnr-8myc'
0.883243 Med b'+2:lemma:with'
0.882254 Supp b'-2:lemma:pahse'
0.881136 Supp b'-1:lemma:2'
0.878682 OD b'-1:lemma:od450'
0.877835 Med b'+1:postag:CD'
0.877606 O b'-1:lemma:rpm'
0.877498 O b'-1:lemma:genbank'
Top negative:
-0.000270 O b'+2:lemma:in'
-0.000279 Air b'-2:lemma:95'
-0.000320 Med b'postag:NN'
-0.000378 O b'+2:lemma:the'
-0.000411 Temp b'+2:postag:JJ'
-0.000428 Supp b'-2:lemma:0.2'
-0.000540 Med b'-2:postag:CC'
-0.000587 Air b'lemma:-rrb-'
-0.000605 Technique b'-1:postag::'
-0.000752 O b'lemma:phosphate'
-0.000853 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.000891 O b'+2:lemma:0.2'
-0.000908 Supp b'lemma:ph'
-0.000946 Gtype b'-1:postag:JJ'
-0.001085 O b'-2:lemma:phase'
-0.001125 Air b'-1:lemma:aerobically'
-0.001375 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.001635 O b'-2:lemma:10'
-0.001754 Gtype b'-2:lemma:fnr'
-0.001762 O b'lemma:phase'
-0.002406 Supp b'-2:postag:NN'
-0.002804 Supp b'-1:lemma:and'
-0.003168 O b'-2:lemma:ph'
-0.003460 O b'-1:lemma:to'
-0.003460 O b'-1:postag:TO'
-0.003743 Phase b'-1:ner:_'
-0.003806 O b'lemma:\xc2\xb0c'
-0.003946 O b'+2:ner:SUPP'
-0.004961 O b'+1:lemma:95'
-0.005179 Supp b'+2:lemma:mm'
-0.005179 Supp b'+2:ner:KWSUPP'
-0.005325 O b'-2:lemma:2'
-0.006308 O b'+1:lemma:_'
-0.007073 O b'-2:lemma:into'
-0.007235 O b'-2:lemma:-rrb-'
-0.007695 Air b'postag:-RRB-'
-0.008649 O b'lemma:5'
-0.008656 O b'-2:lemma:25'
-0.009138 Med b'+2:ner:SUPP'
-0.009261 O b'-2:lemma:mm'
-0.009261 O b'-2:ner:KWSUPP'
-0.009964 O b'-2:lemma:n2'
-0.010317 O b'+1:lemma:10'
-0.011826 O b'+1:lemma:mm'
-0.011826 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.012302 O b'+2:lemma:5'
-0.012326 OD b'+1:lemma:for'
-0.012409 O b'lemma:dpd'
-0.012995 Med b'+1:postag:IN'
-0.013765 Temp b'+2:postag:IN'
-0.013937 O b'+1:lemma:25'
-0.014301 O b'-2:lemma:nacl'
-0.014436 O b'+2:postag:CC'
-0.015086 OD b'+2:lemma:for'
-0.017011 Air b'-2:postag:VBD'
-0.017068 O b'-2:lemma:5'
-0.017601 OD b'+2:postag:JJ'
-0.018046 Agit b'+1:ner:_'
-0.018410 O b'+1:lemma:.'
-0.018410 O b'+1:postag:.'
-0.019222 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.020582 O b'+2:lemma:0.4'
-0.020939 OD b'+1:ner:_'
-0.021351 O b'lemma:1/100'
-0.021351 O b'+1:lemma:vol'
-0.021516 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.023086 Supp b'lemma:paraquat'
-0.023086 Supp b'-2:lemma:um'
-0.024237 Supp b'+2:lemma:final'
-0.024490 O b'+1:lemma:contain'
-0.024506 O b'+1:lemma:media'
-0.024933 Air b'+2:postag:JJ'
-0.025542 O b'-1:lemma:in'
-0.025848 Supp b'-1:postag:DT'
-0.026024 Air b'-1:postag:CC'
-0.027033 O b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.028794 Supp b'-1:lemma:10'
-0.029289 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.029802 Supp b'-2:lemma:.'
-0.029802 Supp b'-2:postag:.'
-0.031033 Med b'-1:lemma:m63'
-0.033196 OD b'+2:lemma:a'
-0.034962 O b'-2:lemma:to'
-0.034962 O b'-2:postag:TO'
-0.035294 O b'lemma:o2'
-0.035496 O b'-1:lemma:o2'
-0.037169 Temp b'postag:JJ'
-0.037188 O b'+1:lemma:medium'
-0.037374 Gtype b'-1:lemma:-'
-0.037416 O b'lemma:70'
-0.037677 O b'+2:lemma:od600'
-0.037730 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.037753 O b'-1:postag:CD'
-0.040068 O b'+1:lemma:o2'
-0.040852 OD b'+2:postag:DT'
-0.045016 Supp b'+2:postag:NN'
-0.045545 Med b'-2:lemma:m9'
-0.046316 Supp b'postag:IN'
-0.046950 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.046957 Air b'postag:CD'
-0.047165 Supp b'lemma:10'
-0.048803 O b'+2:lemma:supplement'
-0.049387 O b'lemma:final'
-0.049554 O b'-2:lemma:70'
-0.049707 O b'-1:lemma:m9'
-0.050108 O b'+1:lemma:7.6'
-0.050108 O b'-2:lemma:1m'
-0.050108 O b'+2:lemma:;'
-0.050896 O b'-1:ner:GEN'
-0.054057 O b'+1:lemma:1/100'
-0.054057 O b'-2:lemma:sodium'
-0.054057 O b'+2:lemma:vol'
-0.054114 Supp b'lemma:,'
-0.054114 Supp b'postag:,'
-0.055075 O b'-1:lemma:sodium'
-0.055075 O b'+2:lemma:1/100'
-0.055218 Temp b'-2:lemma:43'
-0.055687 Supp b'-1:lemma:.'
-0.055687 Supp b'-1:postag:.'
-0.055702 O b'+2:lemma:total'
-0.055972 O b'+2:lemma:at'
-0.056317 Strain b'postag:NN'
-0.057037 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.059537 O b'lemma:mg/ml'
-0.059537 O b'-1:lemma:150'
-0.059849 O b'-1:postag:VBG'
-0.060958 O b'+1:lemma:ph'
-0.060974 O b'-1:lemma:70'
-0.060994 Supp b'+2:postag::'
-0.061458 O b'-2:lemma:fnr'
-0.061623 O b'-1:postag:DT'
-0.061760 O b'+1:lemma:of'
-0.061922 OD b'lemma:2.0'
-0.062423 O b'lemma:m9'
-0.063711 Phase b'+2:postag:NN'
-0.064320 O b'+1:lemma:70'
-0.064476 O b'+1:postag:VB'
-0.065646 Vess b'-2:ner:_'
-0.065646 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.066472 O b'+2:lemma:agitation'
-0.066950 OD b'-2:ner:_'
-0.067448 O b'+1:lemma:sample'
-0.067939 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.069291 O b'postag:NN'
-0.070835 O b'lemma:250'
-0.072002 O b'+2:lemma:media'
-0.072478 Gtype b'-2:lemma:and'
-0.072881 O b'-1:lemma:0.1'
-0.074507 OD b'-1:ner:_'
-0.075230 Air b'-2:lemma:be'
-0.075673 O b'lemma:m'
-0.076144 Supp b'lemma:-rrb-'
-0.076872 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.078698 O b'-2:postag:RB'
-0.080185 Phase b'+2:postag:IN'
-0.083312 O b'+2:lemma:250'
-0.083542 OD b'+2:postag:RB'
-0.084347 O b'+1:lemma:300'
-0.086776 Med b'-2:lemma:grow'
-0.086953 O b'+2:lemma:then'
-0.087010 Gtype b'-1:postag:CD'
-0.087655 Air b'-1:postag:VBN'
-0.087786 O b'-2:lemma:at'
-0.089118 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.091271 Phase b'+2:ner:_'
-0.091763 O b'-2:lemma:1'
-0.093414 O b'-2:lemma:cell'
-0.094657 Med b'-2:lemma:m63'
-0.095386 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.096968 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.097357 O b'+2:lemma:ph'
-0.097489 O b'-1:lemma:iptg'
-0.099225 O b'-2:lemma:0.1'
-0.100257 O b'-1:lemma:at'
-0.101781 O b'lemma:;'
-0.101781 O b'-1:lemma:7.6'
-0.102981 Supp b'postag:-RRB-'
-0.103638 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.104334 Substrain b'+2:ner:_'
-0.104405 O b'-2:postag:DT'
-0.104448 Phase b'-2:ner:_'
-0.106588 Med b'-2:postag:IN'
-0.109245 O b'+2:lemma:sample'
-0.116608 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.117647 O b'-2:lemma:m'
-0.118435 O b'-2:lemma:o2'
-0.118573 O b'+1:lemma:5'
-0.119205 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.119851 Gtype b'postag::'
-0.121422 O b'+1:lemma:pahse'
-0.122834 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.124297 O b'-1:lemma:.'
-0.124297 O b'-1:postag:.'
-0.126462 O b'-1:ner:MED'
-0.127197 Strain b'-2:ner:_'
-0.127885 O b'+1:lemma:phase'
-0.128938 Substrain b'+1:ner:_'
-0.129213 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.129674 Anti b'-1:ner:_'
-0.131835 Supp b'-2:lemma:glucose'
-0.132248 Anti b'+1:ner:_'
-0.132456 Supp b'lemma:um'
-0.132456 Supp b'+2:lemma:paraquat'
-0.132572 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.135212 Supp b'-1:lemma:250'
-0.136000 O b'+1:lemma:b'
-0.137272 Med b'-2:postag:VBN'
-0.138009 O b'+1:lemma:n2'
-0.138534 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.143095 O b'-1:lemma:mm'
-0.143371 O b'+2:lemma:pk4854'
-0.146362 O b'lemma:%'
-0.146938 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.150030 Med b'-1:postag:IN'
-0.150455 O b'+1:lemma:genome'
-0.151195 O b'+1:lemma:co2'
-0.154790 O b'+1:postag:NNS'
-0.158640 Supp b'+2:postag:NNS'
-0.159647 O b'-2:postag:IN'
-0.159849 Med b'+1:postag:NN'
-0.160364 Substrain b'-2:ner:_'
-0.161586 O b'+2:lemma:use'
-0.163321 O b'+1:lemma:2.0'
-0.164537 Temp b'-2:postag:JJ'
-0.166982 O b'+1:lemma:~'
-0.168650 Temp b'+1:postag:IN'
-0.168854 Technique b'+2:ner:_'
-0.169696 O b'+1:lemma:minimal'
-0.171696 Vess b'+1:ner:_'
-0.174292 Phase b'-1:postag:NN'
-0.174556 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.174749 Gtype b'+1:ner:_'
-0.175420 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.179442 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.180294 Phase b'+1:postag:NN'
-0.180968 Med b'+2:ner:MED'
-0.181803 O b'-2:lemma:grow'
-0.183097 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.188031 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.188991 Supp b'+2:ner:_'
-0.191284 O b'+1:lemma:culture'
-0.191688 O b'lemma:ph'
-0.194055 Gtype b'+1:lemma:crp'
-0.195220 O b'-2:lemma:stir'
-0.195241 O b'lemma:n2'
-0.195854 O b'+2:lemma:n2'
-0.197711 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.198743 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.199347 O b'-1:lemma:with'
-0.200505 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.200516 O b'lemma:20'
-0.201056 O b'lemma:sample'
-0.201540 O b'-1:lemma:1m'
-0.201540 O b'+2:lemma:7.6'
-0.203180 O b'-1:lemma:n2'
-0.205369 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.206106 Air b'+2:postag:IN'
-0.207151 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.208807 O b'+1:lemma:a'
-0.209161 O b'lemma:150'
-0.209161 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.209161 O b'-2:lemma:concentration'
-0.209255 Temp b'+2:ner:_'
-0.215225 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.215225 Gtype b'-1:postag:,'
-0.222948 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.224052 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.225073 O b'+2:lemma:0.3'
-0.225201 Supp b'lemma:.'
-0.225201 Supp b'postag:.'
-0.226554 Med b'+1:ner:MED'
-0.227327 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.228354 Phase b'-2:postag:NN'
-0.233205 Gversion b'+1:ner:_'
-0.236687 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.238720 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.239517 O b'-1:postag:IN'
-0.239854 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.242985 O b'-1:lemma:%'
-0.243182 O b'-1:lemma:~'
-0.243421 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.243990 O b'lemma:pahse'
-0.246552 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.247286 OD b'postag:NN'
-0.248830 O b'+2:lemma:37'
-0.249705 O b'lemma:7.6'
-0.249705 O b'+1:lemma:;'
-0.249724 Med b'-2:ner:MED'
-0.253447 O b'lemma:methanol'
-0.253447 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.262815 O b'lemma:dissolve'
-0.262815 O b'+2:lemma:methanol'
-0.263797 Gtype b'lemma:ompr'
-0.268086 Supp b'lemma:1'
-0.271175 Air b'-1:lemma:grow'
-0.281637 O b'-1:lemma:of'
-0.282864 O b'-1:lemma:rna'
-0.284680 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.287845 O b'lemma:1m'
-0.289508 O b'-1:lemma:g/l'
-0.291631 O b'lemma:medium'
-0.295596 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.297740 Agit b'-1:ner:_'
-0.303745 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.305657 O b'+2:lemma:co2'
-0.306962 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.306962 O b'+1:lemma:methanol'
-0.310959 O b'-2:postag::'
-0.311668 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.316618 O b'+2:lemma:~'
-0.317990 O b'+2:lemma:rnase'
-0.318486 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.319529 O b'lemma:co2'
-0.321598 Supp b'postag:-LRB-'
-0.323394 O b'+1:lemma:supplement'
-0.329511 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.332455 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.337002 Supp b'postag:CC'
-0.339467 O b'lemma:fecl2'
-0.339519 O b'-1:lemma:minimal'
-0.339667 O b'-2:lemma:supplement'
-0.341207 Air b'+2:lemma:70'
-0.348856 Technique b'-2:postag:NN'
-0.349554 Vess b'+2:ner:_'
-0.357142 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.358437 O b'+2:lemma:add'
-0.360047 Strain b'-1:ner:_'
-0.366285 O b'-1:lemma:0.2'
-0.367820 Med b'-1:postag:CD'
-0.369464 O b'+2:lemma:genome'
-0.371681 Technique b'-2:ner:_'
-0.372083 O b'+1:lemma:%'
-0.372525 pH b'-2:ner:_'
-0.374795 O b'+1:postag:CD'
-0.379620 Temp b'-2:postag:CD'
-0.380183 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.380776 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.381674 O b'-1:lemma:the'
-0.382660 O b'-1:lemma:harbor'
-0.382890 O b'lemma:0.1'
-0.383043 O b'-2:lemma:50'
-0.393806 O b'lemma:rifampicin'
-0.394264 O b'-2:lemma:100'
-0.395457 O b'-2:lemma:g/l'
-0.397509 Strain b'+2:ner:_'
-0.398842 O b'-1:lemma:od600'
-0.399419 Phase b'+1:ner:_'
-0.402117 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.402997 Temp b'+1:lemma:with'
-0.403367 Substrain b'-1:ner:_'
-0.403488 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.406617 Gtype b'lemma:control'
-0.407102 O b'+2:lemma:m9'
-0.408758 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.410617 O b'-2:lemma:antibody'
-0.413911 O b'lemma:minimal'
-0.419878 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.420560 Vess b'postag:NN'
-0.423596 O b'+2:postag:RB'
-0.427962 O b'-1:lemma:final'
-0.433705 O b'-1:lemma:fresh'
-0.433931 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.435407 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.435407 Gtype b'+1:postag:,'
-0.443082 O b'-2:lemma:of'
-0.443563 Med b'postag:CD'
-0.443733 Temp b'+2:lemma:with'
-0.446646 O b'+1:lemma:1m'
-0.446646 O b'-2:lemma:vol'
-0.451913 O b'+1:lemma:until'
-0.453469 Supp b'+2:lemma:and'
-0.453541 O b'lemma:lb'
-0.460574 Phase b'+2:postag:CD'
-0.462120 O b'+2:lemma:.'
-0.462120 O b'+2:postag:.'
-0.462363 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.463190 Med b'-1:ner:_'
-0.465047 O b'postag:RB'
-0.470941 O b'+2:lemma:reference'
-0.477611 O b'lemma:0.2'
-0.478517 O b'lemma:of'
-0.480364 Vess b'-1:ner:_'
-0.482259 O b'+2:lemma:follow'
-0.488187 Strain b'+1:ner:_'
-0.488915 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.490325 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.493349 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.494843 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.495397 O b'lemma:anaerobic'
-0.504390 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.509506 O b'lemma:m63'
-0.512599 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.513238 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.515671 O b'-2:lemma:rpob'
-0.518056 O b'-2:lemma:fresh'
-0.519309 O b'lemma:fructose'
-0.551748 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.566722 Gtype b'-2:postag:CC'
-0.569144 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.575774 O b'-2:lemma:20'
-0.588569 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.590478 O b'-1:postag::'
-0.596092 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.596545 O b'-1:lemma:until'
-0.597598 Med b'-1:postag:NN'
-0.597948 O b'-2:lemma::'
-0.604690 O b'lemma:od600'
-0.607907 O b'-2:lemma:dna'
-0.610438 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.612341 pH b'+2:ner:_'
-0.616984 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.640736 O b'-1:lemma:vol'
-0.640736 O b'-2:lemma:1/100'
-0.640736 O b'+2:lemma:1m'
-0.642309 O b'+1:lemma:hour'
-0.646085 O b'-2:lemma:pahse'
-0.649680 Supp b'lemma:2'
-0.661665 O b'+2:lemma:10'
-0.667273 Supp b'+2:postag:CC'
-0.667662 O b'-1:lemma:37'
-0.676041 OD b'+2:postag:NN'
-0.679329 O b'-1:lemma:1'
-0.689900 Anti b'postag:NNP'
-0.693949 O b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.699203 O b'+1:lemma:at'
-0.707027 O b'-2:ner:SUPP'
-0.725714 O b'-2:postag:VBG'
-0.727798 pH b'postag:NN'
-0.729650 O b'+1:postag:DT'
-0.774036 O b'+1:lemma:m'
-0.805883 O b'+1:postag:IN'
-0.816622 O b'+2:lemma:fnr'
-0.817401 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.818861 O b'-1:lemma:ml'
-0.821623 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.849146 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.850350 O b'-2:lemma:minimal'
-0.857624 O b'-2:lemma:until'
-0.860173 O b'lemma:nh4cl'
-0.871019 O b'-1:lemma:contain'
-0.873742 Supp b'+1:lemma:,'
-0.873742 Supp b'+1:postag:,'
-0.887742 O b'-1:lemma:IP'
-0.908932 O b'+1:lemma:in'
-0.909654 O b'-2:lemma:the'
-0.910000 Agit b'postag:NN'
-0.923583 O b'+2:lemma:antibody'
-0.929772 O b'-2:postag:SYM'
-0.955399 Gtype b'-2:postag:CD'
-0.994530 Anti b'+2:ner:_'
-0.996941 O b'-2:lemma:genome'
-0.999469 O b'-2:lemma:IP'
-1.000332 O b'lemma:37'
-1.011922 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.014380 O b'lemma:mid-log'
-1.023181 O b'-2:lemma:media'
-1.027899 O b'-2:lemma:dpd'
-1.059419 O b'-2:lemma:iptg'
-1.077105 Supp b'+2:postag:CD'
-1.085827 Gtype b'+1:postag:JJ'
-1.098319 Phase b'-1:postag:JJ'
-1.100969 O b'lemma:nacl'
-1.116489 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.117517 O b'-1:lemma:co2'
-1.125126 Technique b'+1:ner:_'
-1.178666 Air b'postag:NN'
-1.197302 O b'+1:lemma:+'
-1.220288 Supp b'+2:lemma:2'
-1.244020 O b'-1:lemma:2'
-1.273797 Supp b'postag:JJ'
-1.273831 O b'-1:lemma:30'
-1.280673 Supp b'+2:lemma:1'
-1.282794 O b'-1:lemma:ph'
-1.317680 O b'-1:lemma:rpob'
-1.370781 Temp b'postag:NN'
-1.370962 O b'+2:lemma:tag'
-1.377364 O b'lemma:media'
-1.378845 O b'+2:lemma:+'
-1.413922 O b'lemma:aerobically'
-1.444257 OD b'+1:postag:NN'
-1.514753 Med b'+2:postag:VBN'
-1.560867 Gtype b'postag:VBG'
-1.597593 O b'+1:lemma:g/l'
-1.604403 O b'lemma:30'
-1.611524 O b'-2:lemma:0.3'
-1.629708 O b'-1:lemma:sample'
-1.653860 O b'lemma:aerobic'
-1.681766 Phase b'postag:JJ'
-1.685671 O b'lemma:wt'
-1.719667 O b'+1:lemma:2'
-1.742635 O b'-2:ner:TF'
-1.911757 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.940643 O b'+1:lemma:1'
-1.962876 O b'+2:lemma:rifampicin'
-2.152097 O b'+2:lemma:b'
-2.332217 O b'lemma:0.3'
-2.515225 O b'+2:lemma:iptg'
-2.651538 OD b'+2:lemma:aerobically'
-3.675282 O b'-1:lemma::'
-3.776769 O b'-1:lemma:_'