report_Run10_v13.txt 36.7 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.19241702388493934, 'c2': 0.003677792778055598}
best CV score:0.8342433957330186
model size: 0.06M

Flat F1: 0.8110741835587408
             precision    recall  f1-score   support

         OD      0.913     1.000     0.955        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      0.857     0.800     0.828        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      1.000     0.286     0.444         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.632     0.923     0.750        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.909     0.769     0.833        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.870     0.838     0.854       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.856     0.781     0.811       484


Top likely transitions:
Anti   -> Anti    6.522958
Temp   -> Temp    6.505702
Med    -> Med     6.108870
OD     -> OD      5.287599
Technique -> Technique 5.035948
Gversion -> Gversion 5.011032
Phase  -> Phase   4.597379
Gtype  -> Gtype   4.425380
pH     -> pH      4.143224
Air    -> Air     4.052705
Supp   -> Supp    3.875563
Agit   -> Agit    3.070874
O      -> O       3.062864
Technique -> Air     1.351702
Substrain -> Gtype   1.247908
Air    -> O       0.863503
O      -> Technique 0.725403
Anti   -> O       0.424346
Temp   -> O       0.295493
Gtype  -> Supp    0.118065
O      -> Strain  0.010891
O      -> Gtype   0.007408
Phase  -> Air     0.000033
Gtype  -> Temp    -0.010457
O      -> Phase   -0.012395
Phase  -> O       -0.029202
Med    -> O       -0.085590
O      -> Supp    -0.086795
OD     -> O       -0.145703
Supp   -> Air     -0.190638
O      -> Med     -0.215058
OD     -> Supp    -0.253215
O      -> Anti    -0.342804
Gtype  -> OD      -0.362421
Phase  -> OD      -0.559066
Supp   -> O       -0.586557
OD     -> Air     -0.634854
O      -> OD      -0.715707
Gtype  -> Anti    -0.737232
Supp   -> Med     -1.017321
Substrain -> O       -1.035968
Technique -> pH      -1.451563
Gtype  -> O       -1.601553
O      -> Air     -2.388618
Med    -> Supp    -2.580691


Top unlikely transitions:
Anti   -> Anti    6.522958
Temp   -> Temp    6.505702
Med    -> Med     6.108870
OD     -> OD      5.287599
Technique -> Technique 5.035948
Gversion -> Gversion 5.011032
Phase  -> Phase   4.597379
Gtype  -> Gtype   4.425380
pH     -> pH      4.143224
Air    -> Air     4.052705
Supp   -> Supp    3.875563
Agit   -> Agit    3.070874
O      -> O       3.062864
Technique -> Air     1.351702
Substrain -> Gtype   1.247908
Air    -> O       0.863503
O      -> Technique 0.725403
Anti   -> O       0.424346
Temp   -> O       0.295493
Gtype  -> Supp    0.118065
O      -> Strain  0.010891
O      -> Gtype   0.007408
Phase  -> Air     0.000033
Gtype  -> Temp    -0.010457
O      -> Phase   -0.012395
Phase  -> O       -0.029202
Med    -> O       -0.085590
O      -> Supp    -0.086795
OD     -> O       -0.145703
Supp   -> Air     -0.190638
O      -> Med     -0.215058
OD     -> Supp    -0.253215
O      -> Anti    -0.342804
Gtype  -> OD      -0.362421
Phase  -> OD      -0.559066
Supp   -> O       -0.586557
OD     -> Air     -0.634854
O      -> OD      -0.715707
Gtype  -> Anti    -0.737232
Supp   -> Med     -1.017321
Substrain -> O       -1.035968
Technique -> pH      -1.451563
Gtype  -> O       -1.601553
O      -> Air     -2.388618
Med    -> Supp    -2.580691


Top positive:
9.582455 O        b'lemma:_'
9.495232 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
8.138116 Supp     b'lemma:Iron'
7.688886 Gtype    b'lemma:wt'
7.175749 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
7.007557 Technique b'lemma:chipseq'
6.834769 Air      b'lemma:anaerobic'
6.713615 Gtype    b'+1:lemma:type'
6.402400 Air      b'lemma:aerobic'
6.315863 Gtype    b'lemma:type'
6.244761 O        b'lemma:-'
6.187051 Phase    b'lemma:mid-log'
6.148250 Med      b'lemma:MOPS'
5.996665 Supp     b'lemma:pq'
5.702318 Strain   b'lemma:k-12'
5.566697 Gtype    b'lemma:pk4854'
5.523398 O        b'lemma:b'
5.448927 Gversion b'lemma:asm584v2'
5.424268 Phase    b'lemma:stationary'
5.424268 Phase    b'lemma:exponential'
5.310428 Gtype    b'hGreek'
5.277973 Air      b'lemma:aerobically'
5.144409 Vess     b'lemma:flask'
5.144409 Vess     b'-1:lemma:warm'
5.115014 O        b'-1:lemma:tag'
5.110763 O        b'lemma:\xcf\x8332'
5.099901 Med      b'lemma:LB'
4.960583 Agit     b'+1:lemma:rpm'
4.931376 Supp     b'lemma:2h'
4.931376 Supp     b'-1:lemma:additional'
4.841581 O        b'lemma:Cra'
4.824588 Agit     b'lemma:rpm'
4.641033 OD       b'lemma:od450'
4.511728 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.503885 O        b'lemma:2'
4.346634 Supp     b'-1:lemma:Cra'
4.301773 Air      b'lemma:anaeroibc'
4.272306 Supp     b'-1:lemma:vol'
4.266243 Supp     b'lemma:iptg'
4.259652 O        b'lemma:1'
4.150896 Substrain b'lemma:mg1655'
4.112445 Supp     b'lemma:nh4cl'
4.091940 Air      b'postag:RB'
4.072659 Supp     b'lemma:no3'
4.040805 O        b'lemma:3'
4.031371 Supp     b'lemma:Fe'
4.021750 Air      b'-1:lemma:-'
4.007700 Supp     b'lemma:nacl'
3.966138 O        b'lemma:with'
3.960433 O        b'postag::'
3.956435 O        b'lemma:genotype/variation'
3.920100 Air      b'-1:lemma:co2'
3.896730 O        b'lemma:a'
3.860303 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.811594 Anti     b'+1:lemma:antibody'
3.779967 Med      b'lemma:minimal'
3.767851 Gtype    b'-1:ner:GEN'
3.744296 Gversion b'lemma:nc'
3.713904 Med      b'-1:lemma:ml'
3.709922 O        b'lemma:at'
3.664056 Substrain b'lemma:mg1655star'
3.648537 O        b'postag:VBG'
3.639336 Gtype    b'lemma:dfnr'
3.611449 Supp     b'lemma:Leu'
3.595662 O        b'lemma:.'
3.595662 O        b'postag:.'
3.593419 O        b'-1:lemma:lb'
3.573830 Med      b'lemma:lb'
3.547475 Supp     b'-1:lemma:+'
3.510831 Strain   b'+1:lemma:substr'
3.494178 Supp     b'+1:lemma:iptg'
3.428144 O        b'lemma:rpob'
3.418379 Temp     b'-1:lemma:sample'
3.369855 O        b'lemma:chip-fnr'
3.354527 O        b'lemma:rep2'
3.354527 O        b'lemma:rep1'
3.347693 O        b'+1:lemma:pq'
3.343378 Supp     b'lemma:Adenine'
3.340728 Med      b'lemma:m63'
3.299878 Supp     b'-1:ner:SUPP'
3.290795 O        b'-1:lemma:0.3'
3.282578 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
3.281400 O        b'-1:lemma:glucose'
3.258287 Anti     b'lemma:\xcf\x8332'
3.251685 O        b'+1:lemma:wt'
3.189995 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.183828 O        b'lemma:chip'
3.154374 Gtype    b'lemma:arca8myc'
3.141749 Med      b'lemma:media'
3.118955 Med      b'+1:lemma:0.4'
3.104540 O        b'lemma:chip-arca'
3.087269 Supp     b'+1:lemma:hour'
3.049334 pH       b'lemma:ph5'
3.049334 pH       b'+1:lemma:.5'
3.039827 Med      b'lemma:medium'
3.033263 Gtype    b'lemma:WT'
3.023472 Gversion b'-1:lemma:nc'
3.023472 Gversion b'+1:lemma:000913'
3.000502 Supp     b'lemma:arginine'
2.999498 Med      b'+1:lemma:2.0'
2.955797 O        b'-1:lemma:type'
2.953846 O        b'-1:lemma:pq'
2.948831 Technique b'lemma:rnaseq'
2.939598 Gtype    b'+1:postag::'
2.930350 O        b'+1:lemma:coli'
2.920666 Anti     b'lemma:seqa'
2.886261 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.886261 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.859414 Supp     b'lemma:dpd'
2.846402 Supp     b'-1:lemma:with'
2.836077 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.820910 Gtype    b'-1:postag:VBG'
2.810715 O        b'+1:lemma:k-12'
2.772841 O        b'+1:lemma:od600'
2.710665 O        b'lemma::'
2.707076 Gversion b'lemma:000913'
2.705632 Phase    b'-1:lemma:until'
2.694159 Agit     b'-1:lemma:250'
2.686785 O        b'lemma:for'
2.616313 Gtype    b'lemma:ptac'
2.609079 Supp     b'+1:lemma:1'
2.607746 Anti     b'hGreek'
2.603905 Technique b'hUpper'
2.600586 Temp     b'-1:lemma:37'
2.575692 Gversion b'lemma:u00096'
2.575692 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.558406 O        b'lemma:ompr'
2.539207 Gtype    b'+1:lemma:cra'
2.538848 O        b'lemma:purr'
2.524346 Supp     b'-1:lemma:sodium'
2.515950 O        b'-1:postag:NNS'
2.484023 Supp     b'-1:lemma:1m'
2.475020 pH       b'+1:postag:CD'
2.462355 Technique b'-1:lemma:_'
2.427618 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
2.427618 Gtype    b'-1:lemma:old'
2.410012 Gtype    b'+1:lemma:the'
2.398727 O        b'lemma:CEL'
2.384637 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
2.381294 Temp     b'lemma:37'
2.341890 Gtype    b'+1:lemma:pq'
2.341221 O        b'-1:lemma:nacl'
2.337985 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.328906 Gversion b'lemma:.2'
2.328906 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.328184 O        b'+1:ner:MED'
2.323485 Gtype    b'+1:lemma:_'
2.314064 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.267786 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.234569 Anti     b'lemma:none'
2.233787 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
2.208308 O        b'-1:lemma:into'
2.207998 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.200859 O        b'+1:postag:RB'
2.173677 Supp     b'+1:lemma:2'
2.172388 O        b'-1:lemma:acetate'
2.171638 Temp     b'lemma:sample'
2.153540 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
2.128529 Temp     b'lemma:43'
2.120303 Gtype    b'lemma:nsrr'
2.114873 Gtype    b'lemma:wildtype'
2.106193 O        b'-2:ner:MED'
2.104293 Med      b'-1:lemma:fresh'
2.093893 Supp     b'lemma:fructose'
2.041985 Temp     b'-1:lemma:43'
2.036495 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.008762 Gtype    b'+2:ner:SUPP'
1.998017 O        b'+1:lemma:wash'
1.992180 Supp     b'lemma:Trp'
1.969090 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.957917 O        b'+1:lemma:20'
1.947230 Supp     b'lemma:glutamine'
1.947230 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
1.936175 O        b'postag:IN'
1.934664 Supp     b'lemma:final'
1.934260 pH       b'lemma:5.5'
1.917565 Technique b'lemma:rna-seq'
1.899733 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.883373 Gversion b'+1:lemma:genome'
1.873840 OD       b'lemma:0.3'
1.866099 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.859867 Technique b'-1:lemma:IP'
1.853660 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.851623 Supp     b'lemma:tryptophan'
1.851623 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
1.851388 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
1.850297 Supp     b'lemma:glucose'
1.843576 Agit     b'lemma:250'
1.839192 Supp     b'+1:lemma:min'
1.819174 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
1.812638 Gtype    b'-1:lemma:vector'
1.796652 O        b'+1:lemma:250'
1.788454 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.785490 O        b'lemma:trpr'
1.784961 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.779411 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.758434 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.733756 O        b'lemma:gadx'
1.731109 O        b'+1:lemma:0.2'
1.730467 O        b'lemma:soxr'
1.730467 O        b'lemma:soxs'
1.725905 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.725127 Gtype    b'hLower'
1.717975 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.697923 pH       b'+1:lemma:5.5'
1.694163 Substrain b'-1:lemma:.'
1.694163 Substrain b'-1:postag:.'
1.688077 Gtype    b'-1:postag:VBP'
1.681475 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.669775 Supp     b'lemma:acetate'
1.666811 Technique b'-1:lemma:input'
1.664598 O        b'-1:lemma:-80'
1.656682 O        b'-1:lemma:grow'
1.656675 O        b'lemma:harbor'
1.654439 Supp     b'-1:lemma:m'
1.644331 O        b'-1:lemma:fructose'
1.625174 O        b'-1:lemma:anaerobic'
1.608750 Supp     b'-1:postag:CD'
1.602643 Supp     b'-1:lemma:potassium'
1.593341 Anti     b'-1:lemma:monoclonal'
1.583944 O        b'lemma:s'
1.581306 OD       b'lemma:od600'
1.577298 O        b'-1:lemma:Anaerobic'
1.565068 Supp     b'+1:lemma:be'
1.564516 Gversion b'+1:postag:CD'
1.563186 Supp     b'+1:lemma:mm'
1.563186 Supp     b'+1:ner:KWSUPP'
1.551742 O        b'-1:lemma:Aerobic'
1.545107 Supp     b'+1:lemma:1m'
1.544533 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.534679 O        b'-1:lemma:nh4cl'
1.521893 O        b'lemma:affyexp'
1.521160 Phase    b'postag:NN'
1.517322 Anti     b'+1:lemma:from'
1.517221 O        b'+1:lemma:sparging'
1.516034 O        b'lemma:culture'
1.497144 O        b'postag:CC'
1.476876 Supp     b'+1:lemma:_'
1.471124 Med      b'-1:lemma:glucose'
1.465046 Gtype    b'-1:lemma:phtpg'
1.449122 Supp     b'-1:lemma:without'
1.433286 O        b'lemma:input'
1.433286 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.429690 Supp     b'+1:lemma:m'
1.424641 OD       b'+1:lemma:of'
1.409652 O        b'lemma:treatment'
1.404503 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.400818 Anti     b'lemma:anti-rpob'
1.398847 O        b'-1:lemma:.5'
1.393235 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
1.386799 O        b'+1:lemma:dpd'
1.385735 Supp     b'+1:postag:VBD'
1.384869 OD       b'+1:postag:IN'
1.360376 O        b'lemma:or'
1.359183 Technique b'+1:ner:TF'
1.357566 O        b'-1:lemma:l1'
1.355951 Anti     b'+1:lemma:-lrb-'
1.354773 O        b'+1:lemma:43'
1.351002 pH       b'lemma:ph'
1.350722 Anti     b'lemma:anti-rpos'
1.345465 O        b'lemma:ml'
1.336186 O        b'-1:lemma:or'
1.327517 O        b'+1:postag:NNP'
1.323875 Anti     b'-1:lemma::'
1.321602 Gtype    b'hUpper'
1.316487 Anti     b'+1:postag:-LRB-'
1.314807 Air      b'+1:lemma:%'
1.310307 O        b'-1:lemma:min'
1.298308 Supp     b'lemma:30'
1.294342 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
1.274499 Supp     b'lemma:20'
1.274253 Air      b'lemma:co2'
1.273898 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.264873 Supp     b'+1:lemma:1/100'
1.255077 Air      b'postag:JJ'
1.253855 Air      b'+1:lemma:5'
1.252310 O        b'-1:lemma:medium'
1.248997 Phase    b'-1:lemma::'
1.246731 pH       b'-1:lemma:at'
1.240570 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.238709 Gversion b'lemma:_'
1.238447 Med      b'+1:lemma:+'
1.233220 Gtype    b'lemma:wild'
1.231765 Strain   b'-1:lemma:.'
1.231765 Strain   b'-1:postag:.'
1.227568 OD       b'-1:lemma:~'
1.223647 Med      b'-1:postag:JJ'
1.222766 O        b'lemma:-rrb-'
1.219403 O        b'postag:VBN'
1.214814 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.210195 Gtype    b'lemma:the'
1.207735 O        b'lemma:-lrb-'
1.206307 Supp     b'-1:lemma:mm'
1.206239 Anti     b'-1:lemma:polymerase'
1.196848 Med      b'postag:NNS'
1.194921 Supp     b'lemma:cm20'
1.194921 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.194165 Supp     b'-1:lemma:respiration'
1.194165 Supp     b'+1:lemma:mmol'
1.182770 Anti     b'-1:postag::'
1.175636 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
1.175539 Supp     b'-1:lemma:final'
1.169778 Supp     b'-1:lemma:ompr'
1.167537 O        b'lemma:cra'
1.165972 OD       b'lemma:o.d.'
1.165972 OD       b'+1:lemma:600nm'
1.152515 Supp     b'+1:lemma:anaerobically'
1.147985 OD       b'-1:lemma:od450'
1.147096 Supp     b'-1:lemma:0.3'
1.140420 Med      b'lemma:glucose'
1.132187 Air      b'-1:lemma:_'
1.131659 Supp     b'lemma:150'
1.131659 Supp     b'+1:lemma:mg/ml'
1.130213 O        b'lemma:k-12'
1.122008 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.121216 O        b'postag:-RRB-'
1.116943 Technique b'lemma:chip-exo'
1.114071 O        b'symb'
1.108511 O        b'-1:lemma:dpd'
1.107292 Air      b'-1:postag:CD'
1.104370 O        b'+1:lemma:ph5'
1.101260 Air      b'-1:lemma:%'
1.086520 O        b'lemma:~'
1.083670 O        b'lemma:genotype'
1.080280 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.079644 O        b'+1:lemma:o.d.'
1.075736 O        b'lemma:-80'
1.064708 OD       b'-1:postag:IN'
1.058305 Air      b'+1:lemma:co2'
1.056410 Air      b'lemma:%'
1.043208 Supp     b'+1:lemma:deficient'
1.039691 Supp     b'postag:NNP'
1.034925 Supp     b'lemma:sodium'
1.030898 Anti     b'lemma:mab'
1.030898 Anti     b'-1:lemma:anti-flag'
1.030744 O        b'+1:lemma:acetate'
1.023556 Gtype    b'-1:lemma::'
1.019801 OD       b'postag:IN'
1.019357 Temp     b'+1:lemma:and'
1.011742 Anti     b'lemma:anti-flag'
1.011742 Anti     b'+1:lemma:mab'
1.011242 O        b'-1:lemma:0.3-0.35'
1.001061 O        b'lemma:argr'
0.994197 Air      b'+1:lemma:95'
0.992459 O        b'lemma:A'
0.983334 Supp     b'-1:lemma:2'
0.978234 O        b'lemma:oxyr'
0.971114 OD       b'lemma:of'
0.963504 O        b'-1:lemma:wt'
0.955956 Technique b'hLower'
0.955190 Med      b'postag:NNP'
0.946025 Gtype    b'lemma:flagtag'
0.939819 Supp     b'-1:lemma:dissolve'
0.939819 Supp     b'+1:lemma:methanol'
0.935806 O        b'+1:lemma::'
0.931190 Gtype    b'lemma:vector'
0.923633 Phase    b'lemma:phase'
0.923244 O        b'+1:lemma:rifampicin'
0.921787 pH       b'lemma:.5'
0.921787 pH       b'-1:lemma:ph5'
0.916273 Supp     b'+1:postag:NNS'
0.913312 Gversion b'-1:lemma:the'
0.909700 Gtype    b'-1:lemma:delta'
0.903115 Supp     b'lemma:methanol'
0.900896 O        b'lemma:0.4'
0.899801 Gtype    b'+1:lemma::'
0.898955 O        b'lemma:from'
0.895513 Supp     b'-1:lemma:0.2'
0.891349 Technique b'lemma:chip-seq'
0.886593 Phase    b'+1:lemma:culture'
0.880279 Supp     b'+1:lemma:phosphate'
0.877905 Supp     b'-1:postag:IN'
0.871327 O        b'+2:ner:_'
0.863744 Gtype    b'postag:JJ'
0.861027 pH       b'-1:lemma:ph'
0.857940 Med      b'+1:postag:CD'
0.857811 O        b'-1:ner:_'
0.844841 O        b'-1:postag:NNP'
0.844547 Technique b'postag:NNP'
0.842572 OD       b'lemma:0.3-0.35'
0.836619 Air      b'+1:lemma:at'
0.836533 Air      b'-1:lemma:n2'
0.835739 Supp     b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
0.832593 O        b'-1:lemma:.2'
0.820050 Vess     b'+1:lemma:at'
0.815155 pH       b'-1:postag:NN'
0.804321 Temp     b'-1:lemma:see'
0.802517 Supp     b'+2:ner:SUPP'
0.796266 Gtype    b'lemma:factor'
0.796266 Gtype    b'-1:lemma:transcription'
0.796266 Gtype    b'+1:lemma:Fur'
0.794458 Vess     b'-1:postag:VBN'
0.794284 O        b'+1:ner:SUPP'
0.793500 O        b'+1:postag:VBZ'
0.788602 Supp     b'lemma:1m'
0.775240 O        b'lemma:,'
0.775240 O        b'postag:,'
0.773919 O        b'hLower'
0.773567 Temp     b'+1:lemma:sample'
0.768416 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
0.761992 Supp     b'lemma:\xc2\xb5l'
0.761992 Supp     b'+1:lemma:cm20'
0.751207 O        b'+1:ner:_'
0.749634 OD       b'-1:lemma:od600'
0.746440 Air      b'lemma:5'
0.745278 Temp     b'lemma:see'
0.744901 Anti     b'+1:postag:NN'
0.738046 O        b'+2:ner:KWSUPP'
0.734876 O        b'lemma:C'
0.729132 OD       b'lemma:600nm'
0.729132 OD       b'-1:lemma:o.d.'
0.728313 Gtype    b'+1:lemma:ryhb'
0.727378 Supp     b'+1:lemma:mg/l'
0.726073 Temp     b'-1:postag:VB'
0.721870 O        b'+1:lemma:minute'
0.717043 Supp     b'lemma:2g/l'
0.717043 Supp     b'+1:lemma:glutamine'
0.707958 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
0.706868 Supp     b'lemma:1/100'
0.706868 Supp     b'+1:lemma:vol'
0.705784 Supp     b'-1:lemma:contain'
0.703723 Supp     b'lemma:of'
0.696458 Gtype    b'lemma:ryhb'
0.694666 Supp     b'-1:lemma:_'
0.693488 O        b'-1:lemma:phase'
0.693381 O        b'lemma:delta'
0.690643 Supp     b'-2:ner:MED'
0.688740 Supp     b'lemma:mg/ml'
0.688740 Supp     b'-1:lemma:150'
0.688015 O        b'lemma:600'
0.685412 Supp     b'-1:lemma:phosphate'
0.685386 Anti     b'postag:JJ'
0.679761 O        b'lemma:old'
0.679761 O        b'-1:lemma:seqa'
0.679761 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
0.675252 Temp     b'postag:VB'
0.671292 Air      b'lemma:n2'
0.662805 O        b'lemma:rnase'
0.658811 O        b'postag:NNS'
0.654267 OD       b'-1:lemma:600nm'
0.649795 Technique b'-2:ner:TF'
0.644949 O        b'+1:postag:VBD'
0.631702 Air      b'-1:postag:NN'
0.628934 O        b'-1:lemma:anti-rpos'
0.628934 O        b'+1:lemma:neoclone'
0.628180 Med      b'+1:lemma:contain'
0.619173 OD       b'-1:lemma:-lrb-'
0.617177 O        b'-1:lemma:4'
0.613911 O        b'lemma:c'
0.613850 Air      b'-1:lemma:o2'
0.613426 Med      b'-1:lemma:in'
0.605310 pH       b'+1:lemma:.'
0.605310 pH       b'+1:postag:.'
0.604485 Technique b'+1:lemma:gadx'
0.601284 Technique b'+1:postag:NN'
0.597539 Supp     b'lemma:min'
0.592206 Supp     b'lemma:potassium'
0.592206 Supp     b'-1:lemma:mmol'
0.589478 O        b'-1:lemma:no3'
0.584779 O        b'-1:lemma:antibody'
0.583381 Supp     b'-1:lemma:20'
0.581939 Gtype    b'-1:ner:_'
0.578297 OD       b'-1:lemma:of'
0.572034 Gtype    b'lemma:crp'
0.571814 Med      b'+1:postag:VBG'
0.571025 Phase    b'lemma:pahse'
0.569129 O        b'+1:postag::'
0.564840 Med      b'-1:ner:SUPP'
0.564328 OD       b'+1:ner:_'
0.558881 Air      b'+1:lemma:n2'
0.557699 Air      b'-1:postag::'
0.555601 Supp     b'+1:lemma:nitrate'
0.551149 Phase    b'+1:lemma:-lrb-'
0.549519 pH       b'-2:ner:SUPP'
0.549229 Supp     b'lemma:fecl2'
0.544283 O        b'-1:lemma:after'
0.539301 Phase    b'+1:postag:-LRB-'
0.537402 Supp     b'+1:lemma:at'
0.536432 Air      b'-1:lemma:,'
0.536432 Air      b'-1:postag:,'
0.533380 Med      b'+1:postag:VBN'
0.532929 Supp     b'lemma:phosphate'
0.526911 O        b'postag:-LRB-'
0.526621 Supp     b'+1:lemma:300'
0.525429 Gtype    b'+1:lemma:small'
0.521029 OD       b'-1:postag:-LRB-'
0.505765 Gversion b'postag:NN'
0.504573 Phase    b'+1:lemma:phase'
0.498456 O        b'+1:lemma:old'
0.496502 O        b'+1:lemma:b2'
0.494900 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
0.492783 O        b'lemma:growth'
0.492156 Gtype    b'lemma:wild-type'
0.490903 Gtype    b'-1:postag::'
0.489047 Supp     b'symb'
0.488759 Gtype    b'-1:lemma:the'
0.486920 Supp     b'+1:ner:_'
0.482180 O        b'postag:DT'
0.480108 Supp     b'-1:postag:SYM'
0.475903 O        b'postag:CD'


Top negative:
0.276981 Supp     b'-1:postag:JJ'
0.272863 Temp     b'+1:postag:CC'
0.270106 O        b'-1:lemma:at'
0.265995 Air      b'-1:ner:_'
0.264437 Air      b'+1:postag:CC'
0.261624 Gtype    b'lemma:lack'
0.260132 Air      b'+1:postag:-LRB-'
0.256741 Anti     b'-1:postag:JJ'
0.255913 O        b'-1:lemma:short'
0.255666 O        b'-1:lemma:genbank'
0.255361 Substrain b'postag:NN'
0.255359 Anti     b'-2:ner:_'
0.253819 Supp     b'-1:postag:CC'
0.248431 Gtype    b'postag:DT'
0.246727 Med      b'hUpper'
0.244639 Supp     b'+1:lemma:fecl2'
0.242287 O        b'+1:lemma:tritonx-100'
0.241482 Gtype    b'+1:lemma:control'
0.241165 O        b'-1:postag:RB'
0.239570 Supp     b'lemma:hour'
0.230338 Supp     b'+1:lemma:7.6'
0.229551 Anti     b'hLower'
0.229541 OD       b'+1:postag:JJ'
0.229046 OD       b'+1:lemma:a'
0.227163 Gtype    b'+1:lemma:rna'
0.226544 Technique b'-1:ner:_'
0.222817 OD       b'+1:lemma:-rrb-'
0.222054 Gtype    b'+1:ner:GEN'
0.221583 Air      b'lemma:o2'
0.216769 O        b'+1:lemma:ml'
0.213792 O        b'-2:ner:Organism'
0.212934 Agit     b'+1:lemma:-rrb-'
0.210037 OD       b'+1:postag:-RRB-'
0.209849 Air      b'+1:lemma:o2'
0.208897 Gtype    b'-2:ner:GEN'
0.208824 OD       b'+1:lemma:0.3'
0.207206 Med      b'+1:lemma:medium'
0.206466 O        b'-1:lemma:and'
0.206287 Gtype    b'lemma:mutant'
0.205813 Air      b'-1:lemma:25'
0.202262 Anti     b'+1:ner:TF'
0.199731 O        b'lemma:tag'
0.196854 pH       b'postag:CD'
0.193519 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
0.191748 Supp     b'+1:postag:IN'
0.191199 O        b'+1:lemma:um'
0.190830 Gtype    b'+1:postag:DT'
0.189727 O        b'lemma:um'
0.184532 O        b'+1:lemma:-'
0.181847 Med      b'+1:ner:_'
0.178353 O        b'lemma:hs2'
0.177781 Supp     b'-1:lemma:of'
0.175876 Phase    b'-1:postag:DT'
0.175647 Supp     b'+1:postag:JJ'
0.173119 O        b'-1:lemma:arginine'
0.172654 O        b'-1:postag:VBN'
0.172313 O        b'postag:NNP'
0.171832 Gtype    b'lemma::'
0.171387 Gtype    b'+1:postag:NN'
0.170298 Vess     b'+1:postag:IN'
0.169502 Air      b'lemma:25'
0.166651 Air      b'+1:lemma:-lrb-'
0.161695 Agit     b'+1:postag:-RRB-'
0.157389 Air      b'-1:postag:RB'
0.155704 Gtype    b'-1:lemma:wild'
0.155177 Supp     b'-2:ner:_'
0.154788 Air      b'-1:lemma:-rrb-'
0.153776 OD       b'-2:ner:_'
0.151655 O        b'lemma:to'
0.151655 O        b'postag:TO'
0.151102 Air      b'+1:lemma:,'
0.151102 Air      b'+1:postag:,'
0.150664 Air      b'+1:postag:NN'
0.150200 O        b'+1:lemma:,'
0.150200 O        b'+1:postag:,'
0.150185 O        b'-1:lemma:a'
0.150067 O        b'lemma:%'
0.148821 Air      b'postag:CD'
0.148543 Air      b'+1:lemma:and'
0.148394 Air      b'-1:postag:-RRB-'
0.145682 Air      b'lemma:anerobically'
0.144568 Gtype    b'lemma:delta-arca'
0.141903 Supp     b'hLower'
0.138222 Gtype    b'lemma:k12'
0.138222 Gtype    b'-1:lemma:zupt'
0.137585 O        b'lemma:10'
0.137166 OD       b'-1:postag:NN'
0.136762 O        b'+2:ner:GEN'
0.136573 Gtype    b'postag:NN'
0.131566 Supp     b'+1:postag:CC'
0.129490 Phase    b'-1:lemma:the'
0.126151 Supp     b'-1:lemma:ph'
0.125717 Air      b'-1:lemma:and'
0.125194 Med      b'+1:lemma:with'
0.124499 Phase    b'-2:ner:_'
0.122339 Strain   b'-1:postag::'
0.121828 Supp     b'-2:ner:SUPP'
0.121184 Med      b'postag:NN'
0.119495 Gtype    b'lemma:_'
0.119233 O        b'+1:postag:NN'
0.115177 Air      b'lemma:Anaerobic'
0.113249 OD       b'+1:lemma:='
0.109544 Gtype    b'-1:postag:DT'
0.109479 OD       b'+1:postag:DT'
0.106926 O        b'+1:postag:CC'
0.102917 Supp     b'lemma:in'
0.098661 O        b'lemma:2.0'
0.097879 Air      b'-1:lemma:cm20'
0.095965 O        b'lemma:genome'
0.095152 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
0.094841 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
0.094670 Air      b'+1:postag:CD'
0.092719 Strain   b'-1:lemma::'
0.091901 Temp     b'+1:postag:JJ'
0.090576 O        b'-1:lemma:chip'
0.087040 O        b'-1:lemma:,'
0.087040 O        b'-1:postag:,'
0.084558 Air      b'+1:lemma:25'
0.083859 Air      b'symb'
0.081878 O        b'lemma:Lrp'
0.073939 O        b'+1:lemma:and'
0.070572 O        b'lemma:agitation'
0.069745 Supp     b'lemma:-rrb-'
0.068171 O        b'+1:lemma:to'
0.068171 O        b'+1:postag:TO'
0.066578 Temp     b'-2:ner:_'
0.065928 Temp     b'+1:lemma:.'
0.065928 Temp     b'+1:postag:.'
0.063255 Gtype    b'+1:postag:CD'
0.061985 Anti     b'+1:lemma:purify'
0.059595 Supp     b'+1:lemma:and'
0.059555 Gtype    b'lemma:fur-8myc'
0.059555 Gtype    b'lemma:cra-8myc-tagged'
0.059350 O        b'lemma:and'
0.058275 O        b'-1:lemma:n2'
0.056122 OD       b'postag:NN'
0.053425 Temp     b'+2:ner:_'
0.051732 OD       b'-1:postag:JJ'
0.049472 Supp     b'lemma:1'
0.048796 O        b'+1:lemma:co2'
0.047956 Supp     b'-1:lemma:for'
0.046647 O        b'-1:lemma:5'
0.044467 Supp     b'postag:-RRB-'
0.042420 Anti     b'+1:postag:VBN'
0.041845 O        b'postag:SYM'
0.040150 Med      b'-2:ner:_'
0.039154 O        b'-1:lemma:10'
0.038676 O        b'+1:lemma:be'
0.037991 Air      b'hUpper'
0.037625 O        b'lemma:acetate'
0.034710 Supp     b'hUpper'
0.032062 O        b'lemma:7.6'
0.032062 O        b'+1:lemma:;'
0.028672 O        b'+1:lemma:genbank'
0.027250 O        b'-1:lemma:0.2'
0.026820 Air      b'+2:ner:_'
0.026322 Gtype    b'-1:lemma:small'
0.025906 Air      b'+1:lemma:or'
0.025376 Anti     b'lemma:anti-myc'
0.024590 O        b'-1:lemma:;'
0.021536 O        b'+1:lemma:7.6'
0.021087 O        b'-1:lemma:fnr'
0.020299 Phase    b'+1:lemma:aerobically'
0.019434 Phase    b'+1:postag:RB'
0.019059 O        b'lemma:IP'
0.018646 O        b'-1:lemma:to'
0.018646 O        b'-1:postag:TO'
0.018394 O        b'lemma:300'
0.013730 O        b'-1:ner:SUPP'
0.012934 Gversion b'-2:ner:_'
0.012640 O        b'postag:JJ'
0.012601 Air      b'-1:lemma:-lrb-'
0.012084 O        b'-1:lemma:2.5'
0.011907 O        b'lemma:fresh'
0.010735 O        b'-1:lemma:-'
0.010376 Supp     b'lemma:0.1'
0.009922 O        b'-1:ner:MED'
0.008710 Med      b'-1:lemma:w2'
0.008508 Air      b'-1:postag:-LRB-'
0.008120 O        b'+1:lemma:or'
0.007884 O        b'lemma:co2'
0.007827 O        b'+1:lemma:read'
0.007594 Gtype    b'-1:postag:IN'
0.006704 O        b'+1:lemma:phase'
0.006211 Air      b'+1:lemma:-rrb-'
0.006033 O        b'lemma:0.2'
0.005083 Temp     b'+1:lemma:see'
0.002329 O        b'lemma:short'
0.002329 O        b'+1:lemma:rnase'
0.002019 O        b'+1:lemma:final'
0.001594 Air      b'postag:-RRB-'
0.001478 Air      b'+1:postag:-RRB-'
0.001340 O        b'-1:lemma:od600'
0.001223 Supp     b'-1:lemma:iptg'
0.001169 O        b'lemma:gadw'
0.001163 O        b'lemma:m9'
0.001074 Gversion b'+2:ner:_'
0.001022 Temp     b'+1:lemma:to'
0.001022 Temp     b'+1:postag:TO'
0.000906 Gtype    b'lemma:delta'
0.000882 O        b'lemma:cell'
0.000797 Supp     b'+1:lemma:10'
0.000737 Phase    b'-1:ner:_'
0.000528 Agit     b'+2:ner:_'
0.000480 O        b'lemma:be'
0.000470 O        b'-1:lemma:='
0.000443 Gversion b'-1:postag:DT'
0.000430 O        b'-1:lemma:aerobic'
0.000320 Med      b'-1:ner:MED'
0.000319 pH       b'+1:ner:_'
0.000263 O        b'lemma:respiration'
0.000224 O        b'lemma:2-3'
0.000172 OD       b'-1:lemma:to'
0.000172 OD       b'-1:postag:TO'
0.000148 O        b'-1:lemma:with'
0.000141 O        b'-2:ner:KWSUPP'
0.000137 Air      b'-1:lemma:anerobically'
0.000130 Air      b'-1:lemma:phase'
0.000127 Temp     b'+1:postag:VB'
0.000108 O        b'+1:lemma:for'
0.000101 O        b'+1:lemma:fructose'
0.000087 Supp     b'-1:postag:NN'
0.000078 Supp     b'+1:postag:RB'
0.000062 Temp     b'+1:postag:NN'
0.000050 O        b'lemma:genbank'
0.000046 O        b'+1:lemma:pahse'
0.000031 O        b'+1:lemma:respiration'
0.000028 Supp     b'+1:lemma:feso4'
0.000016 Supp     b'-1:lemma:30'
0.000011 Temp     b'+1:lemma:in'
0.000010 O        b'-1:lemma:0.15'
0.000009 O        b'+1:lemma:dna'
0.000005 Air      b'+1:lemma:-'
0.000005 Gtype    b'+1:lemma:mg1655'
0.000004 Supp     b'+1:lemma:in'
0.000004 Technique b'-1:postag:CD'
0.000003 O        b'-1:lemma:genotype'
0.000003 Supp     b'-1:lemma:and'
0.000002 Gtype    b'-1:lemma:ompr'
0.000001 Agit     b'+1:ner:_'
0.000001 Supp     b'lemma:\xc2\xb5m'
0.000000 O        b'-1:lemma:coli'
-0.000001 OD       b'lemma:='
-0.000004 O        b'+1:lemma:genome'
-0.000012 Gtype    b'lemma:-rrb-'
-0.000063 Gtype    b'lemma:,'
-0.000063 Gtype    b'postag:,'
-0.000071 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.000082 Phase    b'-2:ner:SUPP'
-0.000091 Gtype    b'postag:-RRB-'
-0.000102 O        b'hUpper'
-0.000110 O        b'lemma:rna'
-0.000151 O        b'lemma:phase'
-0.000266 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.000320 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.000344 Gtype    b'+1:postag:-RRB-'
-0.000639 O        b'+1:lemma:300'
-0.000656 Supp     b'lemma:,'
-0.000656 Supp     b'postag:,'
-0.000694 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.001411 Temp     b'postag:NN'
-0.001815 Supp     b'lemma:vol'
-0.001815 Supp     b'-1:lemma:1/100'
-0.002109 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.002131 Technique b'postag:NN'
-0.002141 Gtype    b'+1:postag:-LRB-'
-0.002298 Air      b'hLower'
-0.002640 Supp     b'+1:postag::'
-0.002743 Supp     b'lemma:ph'
-0.003393 Med      b'-1:lemma:m9'
-0.003482 Phase    b'-1:postag:IN'
-0.003483 Anti     b'symb'
-0.004009 O        b'-1:postag:JJ'
-0.004860 Air      b'lemma:-lrb-'
-0.005173 Temp     b'-1:ner:_'
-0.005338 Supp     b'lemma:paraquat'
-0.006397 Anti     b'-1:ner:_'
-0.006812 O        b'-1:lemma:delta'
-0.007456 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.008051 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.008379 Med      b'+1:postag:CC'
-0.008474 Gtype    b'postag:NNP'
-0.008531 Gversion b'symb'
-0.008541 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.009660 Supp     b'+2:ner:_'
-0.009883 O        b'hGreek'
-0.010269 Technique b'+2:ner:_'
-0.011492 O        b'lemma:lb'
-0.013055 Supp     b'postag:CD'
-0.013409 O        b'+1:lemma:sample'
-0.014161 O        b'+1:lemma:mm'
-0.014161 O        b'+1:ner:KWSUPP'
-0.014206 Gtype    b'+1:postag:CC'
-0.014389 Supp     b'postag:CC'
-0.015327 O        b'lemma:final'
-0.015973 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.016024 O        b'+1:lemma:of'
-0.016034 Vess     b'symb'
-0.018617 Supp     b'postag:IN'
-0.020724 O        b'-1:lemma:for'
-0.022630 O        b'lemma:fructose'
-0.024133 Supp     b'lemma:%'
-0.024485 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.024659 Air      b'+1:lemma:70'
-0.024814 Air      b'lemma:70'
-0.025045 Air      b'lemma:,'
-0.025045 Air      b'postag:,'
-0.026947 O        b'-1:lemma:contain'
-0.027843 Supp     b'lemma:mm'
-0.027843 Supp     b'-1:ner:KWSUPP'
-0.029059 O        b'+1:lemma:the'
-0.029357 OD       b'lemma:0.4'
-0.030029 O        b'-1:lemma:mm'
-0.031015 Phase    b'-1:lemma:at'
-0.031707 Gtype    b'postag::'
-0.034777 Supp     b'+1:ner:SUPP'
-0.035747 Air      b'postag:CC'
-0.036867 Air      b'-1:postag:CC'
-0.038885 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.039188 O        b'+1:postag:VBG'
-0.042638 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.042638 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.045184 O        b'lemma:min'
-0.047738 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.048003 Supp     b'+1:lemma:of'
-0.049689 Med      b'postag:JJ'
-0.053180 Med      b'+1:ner:MED'
-0.056112 Supp     b'lemma:.'
-0.056112 Supp     b'postag:.'
-0.056897 OD       b'+1:postag:CD'
-0.066934 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.067018 Med      b'-1:postag:IN'
-0.068563 O        b'-1:postag:CD'
-0.069450 O        b'+1:lemma:min'
-0.072401 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.072625 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.074578 O        b'-1:postag:DT'
-0.078358 Supp     b'-1:postag::'
-0.080224 O        b'lemma:m63'
-0.080510 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.087305 O        b'+1:postag:NNS'
-0.088716 O        b'-1:lemma:in'
-0.089748 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.089918 Supp     b'+1:lemma:final'
-0.090786 O        b'+1:lemma:5'
-0.090864 O        b'+2:ner:SUPP'
-0.095191 O        b'+1:lemma:~'
-0.097741 OD       b'lemma:2.0'
-0.102517 O        b'lemma:o2'
-0.110243 Anti     b'-1:postag:NN'
-0.113780 Gtype    b'+1:lemma:and'
-0.116872 O        b'+1:lemma:+'
-0.117431 O        b'+1:lemma:m'
-0.123779 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.130589 Technique b'-2:ner:_'
-0.131696 O        b'-1:lemma:.'
-0.131696 O        b'-1:postag:.'
-0.131830 O        b'-1:lemma:%'
-0.132430 Supp     b'lemma:10'
-0.135572 pH       b'+2:ner:_'
-0.135906 O        b'-1:lemma:~'
-0.137473 Supp     b'lemma:300'
-0.144674 O        b'lemma:m'
-0.146737 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.157889 Temp     b'symb'
-0.159003 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.159757 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.160814 O        b'lemma:150'
-0.160814 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.160960 O        b'-1:lemma:until'
-0.169235 O        b'+1:lemma:media'
-0.172509 Phase    b'+1:ner:_'
-0.173486 OD       b'symb'
-0.183581 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.187277 Phase    b'+2:ner:_'
-0.193476 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.193968 O        b'lemma:anaerobic'
-0.197319 O        b'+1:postag:CD'
-0.198976 O        b'+1:postag:JJ'
-0.207878 OD       b'lemma:~'
-0.212314 O        b'lemma:1m'
-0.220801 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.222206 O        b'lemma:fecl2'
-0.224844 O        b'postag:NN'
-0.226204 O        b'-1:lemma:of'
-0.234826 Med      b'-1:postag:NN'
-0.248919 O        b'+1:lemma:.'
-0.248919 O        b'+1:postag:.'
-0.252706 Anti     b'+1:ner:_'
-0.254664 O        b'-1:lemma:o2'
-0.257476 O        b'+1:lemma:ph'
-0.258636 O        b'-1:lemma:ml'
-0.262522 O        b'-1:lemma:final'
-0.277434 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.304901 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.325095 O        b'lemma:nacl'
-0.327156 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.330124 O        b'lemma:sample'
-0.331051 O        b'lemma:20'
-0.340178 O        b'+1:lemma:at'
-0.347660 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.349387 Substrain b'-1:ner:_'
-0.352498 O        b'-1:lemma:m'
-0.369100 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.374400 O        b'-1:postag:VBG'
-0.375645 O        b'lemma:minimal'
-0.386096 O        b'+1:lemma:%'
-0.393747 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.393747 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.396048 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.398000 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.400330 Anti     b'hUpper'
-0.406858 O        b'-1:lemma:the'
-0.408410 Gtype    b'+1:lemma:-rrb-'
-0.414041 O        b'+1:lemma:_'
-0.420334 O        b'lemma:medium'
-0.426659 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.442825 O        b'-1:lemma:IP'
-0.466818 Med      b'-1:ner:_'
-0.467218 O        b'+1:lemma:contain'
-0.493986 O        b'lemma:mid-log'
-0.501934 O        b'lemma:od600'
-0.505418 O        b'lemma:ph'
-0.509897 O        b'lemma:wt'
-0.519621 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.526352 O        b'lemma:methanol'
-0.530833 O        b'lemma:rifampicin'
-0.531287 Gversion b'hLower'
-0.558364 Strain   b'hLower'
-0.564678 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.576263 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.592786 Med      b'hLower'
-0.595472 Med      b'-2:ner:MED'
-0.598671 O        b'lemma:37'
-0.601096 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.601096 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.613364 OD       b'hLower'
-0.631214 Med      b'postag:CD'
-0.637265 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.656417 O        b'-1:postag:IN'
-0.664571 O        b'-1:lemma:1m'
-0.666526 Phase    b'symb'
-0.669458 O        b'-1:lemma:rna'
-0.681451 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.695425 O        b'+1:lemma:1m'
-0.707439 Vess     b'hUpper'
-0.715081 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.737900 Technique b'-1:lemma::'
-0.739964 O        b'-1:lemma:1'
-0.749025 O        b'+1:postag:IN'
-0.755808 Anti     b'+2:ner:_'
-0.758231 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.783159 O        b'postag:RB'
-0.807594 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.830328 O        b'+1:lemma:hour'
-0.846466 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.848008 O        b'-1:lemma:co2'
-0.938043 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.945503 O        b'-1:lemma:ph'
-0.965106 O        b'lemma:of'
-0.981820 O        b'+1:postag:DT'
-1.000924 Gtype    b'+1:lemma:-lrb-'
-1.006415 pH       b'symb'
-1.059240 Supp     b'hGreek'
-1.085228 O        b'-1:lemma:sample'
-1.101806 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.107359 Med      b'+1:postag:NN'
-1.112508 Strain   b'symb'
-1.122033 O        b'lemma:media'
-1.169172 Air      b'postag:NN'
-1.219178 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-1.231933 Technique b'+1:ner:_'
-1.242256 Phase    b'postag:JJ'
-1.243087 Agit     b'hUpper'
-1.248287 Supp     b'postag:JJ'
-1.321866 Temp     b'+1:lemma:with'
-1.324752 O        b'+1:lemma:in'
-1.330165 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-1.355798 O        b'lemma:aerobically'
-1.357350 Temp     b'hLower'
-1.364332 O        b'-1:postag::'
-1.370910 OD       b'hUpper'
-1.396852 Supp     b'+1:lemma:,'
-1.396852 Supp     b'+1:postag:,'
-1.421720 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-1.491056 O        b'lemma:0.3'
-1.507320 Technique b'-1:postag::'
-1.595058 O        b'-2:ner:TF'
-1.622789 O        b'+1:lemma:1'
-1.627062 O        b'-1:lemma:30'
-1.651929 OD       b'+1:postag:NN'
-1.722422 O        b'-1:lemma:2'
-1.970378 O        b'lemma:30'
-2.000870 O        b'+1:lemma:2'
-2.003671 Gtype    b'symb'
-2.712955 O        b'-1:lemma:vol'
-2.911235 Phase    b'hUpper'
-3.593291 Technique b'symb'
-3.652896 O        b'-1:lemma:_'
-4.507045 O        b'-1:lemma::'