report_Run10_v13.txt
36.7 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.19241702388493934, 'c2': 0.003677792778055598}
best CV score:0.8342433957330186
model size: 0.06M
Flat F1: 0.8110741835587408
precision recall f1-score support
OD 0.913 1.000 0.955 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 0.857 0.800 0.828 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 1.000 0.286 0.444 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.590 0.557 0.573 88
Anti 0.632 0.923 0.750 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.909 0.769 0.833 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.870 0.838 0.854 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.856 0.781 0.811 484
Top likely transitions:
Anti -> Anti 6.522958
Temp -> Temp 6.505702
Med -> Med 6.108870
OD -> OD 5.287599
Technique -> Technique 5.035948
Gversion -> Gversion 5.011032
Phase -> Phase 4.597379
Gtype -> Gtype 4.425380
pH -> pH 4.143224
Air -> Air 4.052705
Supp -> Supp 3.875563
Agit -> Agit 3.070874
O -> O 3.062864
Technique -> Air 1.351702
Substrain -> Gtype 1.247908
Air -> O 0.863503
O -> Technique 0.725403
Anti -> O 0.424346
Temp -> O 0.295493
Gtype -> Supp 0.118065
O -> Strain 0.010891
O -> Gtype 0.007408
Phase -> Air 0.000033
Gtype -> Temp -0.010457
O -> Phase -0.012395
Phase -> O -0.029202
Med -> O -0.085590
O -> Supp -0.086795
OD -> O -0.145703
Supp -> Air -0.190638
O -> Med -0.215058
OD -> Supp -0.253215
O -> Anti -0.342804
Gtype -> OD -0.362421
Phase -> OD -0.559066
Supp -> O -0.586557
OD -> Air -0.634854
O -> OD -0.715707
Gtype -> Anti -0.737232
Supp -> Med -1.017321
Substrain -> O -1.035968
Technique -> pH -1.451563
Gtype -> O -1.601553
O -> Air -2.388618
Med -> Supp -2.580691
Top unlikely transitions:
Anti -> Anti 6.522958
Temp -> Temp 6.505702
Med -> Med 6.108870
OD -> OD 5.287599
Technique -> Technique 5.035948
Gversion -> Gversion 5.011032
Phase -> Phase 4.597379
Gtype -> Gtype 4.425380
pH -> pH 4.143224
Air -> Air 4.052705
Supp -> Supp 3.875563
Agit -> Agit 3.070874
O -> O 3.062864
Technique -> Air 1.351702
Substrain -> Gtype 1.247908
Air -> O 0.863503
O -> Technique 0.725403
Anti -> O 0.424346
Temp -> O 0.295493
Gtype -> Supp 0.118065
O -> Strain 0.010891
O -> Gtype 0.007408
Phase -> Air 0.000033
Gtype -> Temp -0.010457
O -> Phase -0.012395
Phase -> O -0.029202
Med -> O -0.085590
O -> Supp -0.086795
OD -> O -0.145703
Supp -> Air -0.190638
O -> Med -0.215058
OD -> Supp -0.253215
O -> Anti -0.342804
Gtype -> OD -0.362421
Phase -> OD -0.559066
Supp -> O -0.586557
OD -> Air -0.634854
O -> OD -0.715707
Gtype -> Anti -0.737232
Supp -> Med -1.017321
Substrain -> O -1.035968
Technique -> pH -1.451563
Gtype -> O -1.601553
O -> Air -2.388618
Med -> Supp -2.580691
Top positive:
9.582455 O b'lemma:_'
9.495232 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
8.138116 Supp b'lemma:Iron'
7.688886 Gtype b'lemma:wt'
7.175749 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
7.007557 Technique b'lemma:chipseq'
6.834769 Air b'lemma:anaerobic'
6.713615 Gtype b'+1:lemma:type'
6.402400 Air b'lemma:aerobic'
6.315863 Gtype b'lemma:type'
6.244761 O b'lemma:-'
6.187051 Phase b'lemma:mid-log'
6.148250 Med b'lemma:MOPS'
5.996665 Supp b'lemma:pq'
5.702318 Strain b'lemma:k-12'
5.566697 Gtype b'lemma:pk4854'
5.523398 O b'lemma:b'
5.448927 Gversion b'lemma:asm584v2'
5.424268 Phase b'lemma:stationary'
5.424268 Phase b'lemma:exponential'
5.310428 Gtype b'hGreek'
5.277973 Air b'lemma:aerobically'
5.144409 Vess b'lemma:flask'
5.144409 Vess b'-1:lemma:warm'
5.115014 O b'-1:lemma:tag'
5.110763 O b'lemma:\xcf\x8332'
5.099901 Med b'lemma:LB'
4.960583 Agit b'+1:lemma:rpm'
4.931376 Supp b'lemma:2h'
4.931376 Supp b'-1:lemma:additional'
4.841581 O b'lemma:Cra'
4.824588 Agit b'lemma:rpm'
4.641033 OD b'lemma:od450'
4.511728 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.503885 O b'lemma:2'
4.346634 Supp b'-1:lemma:Cra'
4.301773 Air b'lemma:anaeroibc'
4.272306 Supp b'-1:lemma:vol'
4.266243 Supp b'lemma:iptg'
4.259652 O b'lemma:1'
4.150896 Substrain b'lemma:mg1655'
4.112445 Supp b'lemma:nh4cl'
4.091940 Air b'postag:RB'
4.072659 Supp b'lemma:no3'
4.040805 O b'lemma:3'
4.031371 Supp b'lemma:Fe'
4.021750 Air b'-1:lemma:-'
4.007700 Supp b'lemma:nacl'
3.966138 O b'lemma:with'
3.960433 O b'postag::'
3.956435 O b'lemma:genotype/variation'
3.920100 Air b'-1:lemma:co2'
3.896730 O b'lemma:a'
3.860303 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.811594 Anti b'+1:lemma:antibody'
3.779967 Med b'lemma:minimal'
3.767851 Gtype b'-1:ner:GEN'
3.744296 Gversion b'lemma:nc'
3.713904 Med b'-1:lemma:ml'
3.709922 O b'lemma:at'
3.664056 Substrain b'lemma:mg1655star'
3.648537 O b'postag:VBG'
3.639336 Gtype b'lemma:dfnr'
3.611449 Supp b'lemma:Leu'
3.595662 O b'lemma:.'
3.595662 O b'postag:.'
3.593419 O b'-1:lemma:lb'
3.573830 Med b'lemma:lb'
3.547475 Supp b'-1:lemma:+'
3.510831 Strain b'+1:lemma:substr'
3.494178 Supp b'+1:lemma:iptg'
3.428144 O b'lemma:rpob'
3.418379 Temp b'-1:lemma:sample'
3.369855 O b'lemma:chip-fnr'
3.354527 O b'lemma:rep2'
3.354527 O b'lemma:rep1'
3.347693 O b'+1:lemma:pq'
3.343378 Supp b'lemma:Adenine'
3.340728 Med b'lemma:m63'
3.299878 Supp b'-1:ner:SUPP'
3.290795 O b'-1:lemma:0.3'
3.282578 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
3.281400 O b'-1:lemma:glucose'
3.258287 Anti b'lemma:\xcf\x8332'
3.251685 O b'+1:lemma:wt'
3.189995 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.183828 O b'lemma:chip'
3.154374 Gtype b'lemma:arca8myc'
3.141749 Med b'lemma:media'
3.118955 Med b'+1:lemma:0.4'
3.104540 O b'lemma:chip-arca'
3.087269 Supp b'+1:lemma:hour'
3.049334 pH b'lemma:ph5'
3.049334 pH b'+1:lemma:.5'
3.039827 Med b'lemma:medium'
3.033263 Gtype b'lemma:WT'
3.023472 Gversion b'-1:lemma:nc'
3.023472 Gversion b'+1:lemma:000913'
3.000502 Supp b'lemma:arginine'
2.999498 Med b'+1:lemma:2.0'
2.955797 O b'-1:lemma:type'
2.953846 O b'-1:lemma:pq'
2.948831 Technique b'lemma:rnaseq'
2.939598 Gtype b'+1:postag::'
2.930350 O b'+1:lemma:coli'
2.920666 Anti b'lemma:seqa'
2.886261 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.886261 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.859414 Supp b'lemma:dpd'
2.846402 Supp b'-1:lemma:with'
2.836077 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.820910 Gtype b'-1:postag:VBG'
2.810715 O b'+1:lemma:k-12'
2.772841 O b'+1:lemma:od600'
2.710665 O b'lemma::'
2.707076 Gversion b'lemma:000913'
2.705632 Phase b'-1:lemma:until'
2.694159 Agit b'-1:lemma:250'
2.686785 O b'lemma:for'
2.616313 Gtype b'lemma:ptac'
2.609079 Supp b'+1:lemma:1'
2.607746 Anti b'hGreek'
2.603905 Technique b'hUpper'
2.600586 Temp b'-1:lemma:37'
2.575692 Gversion b'lemma:u00096'
2.575692 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.558406 O b'lemma:ompr'
2.539207 Gtype b'+1:lemma:cra'
2.538848 O b'lemma:purr'
2.524346 Supp b'-1:lemma:sodium'
2.515950 O b'-1:postag:NNS'
2.484023 Supp b'-1:lemma:1m'
2.475020 pH b'+1:postag:CD'
2.462355 Technique b'-1:lemma:_'
2.427618 Gtype b'lemma:deltaseqa'
2.427618 Gtype b'-1:lemma:old'
2.410012 Gtype b'+1:lemma:the'
2.398727 O b'lemma:CEL'
2.384637 Gtype b'lemma:fnr8myc'
2.381294 Temp b'lemma:37'
2.341890 Gtype b'+1:lemma:pq'
2.341221 O b'-1:lemma:nacl'
2.337985 Supp b'lemma:rifampicin'
2.328906 Gversion b'lemma:.2'
2.328906 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.328184 O b'+1:ner:MED'
2.323485 Gtype b'+1:lemma:_'
2.314064 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.267786 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.234569 Anti b'lemma:none'
2.233787 Gtype b'-1:lemma:rpob'
2.208308 O b'-1:lemma:into'
2.207998 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.200859 O b'+1:postag:RB'
2.173677 Supp b'+1:lemma:2'
2.172388 O b'-1:lemma:acetate'
2.171638 Temp b'lemma:sample'
2.153540 Supp b'+1:lemma:Deficient'
2.128529 Temp b'lemma:43'
2.120303 Gtype b'lemma:nsrr'
2.114873 Gtype b'lemma:wildtype'
2.106193 O b'-2:ner:MED'
2.104293 Med b'-1:lemma:fresh'
2.093893 Supp b'lemma:fructose'
2.041985 Temp b'-1:lemma:43'
2.036495 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.008762 Gtype b'+2:ner:SUPP'
1.998017 O b'+1:lemma:wash'
1.992180 Supp b'lemma:Trp'
1.969090 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.957917 O b'+1:lemma:20'
1.947230 Supp b'lemma:glutamine'
1.947230 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.936175 O b'postag:IN'
1.934664 Supp b'lemma:final'
1.934260 pH b'lemma:5.5'
1.917565 Technique b'lemma:rna-seq'
1.899733 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.883373 Gversion b'+1:lemma:genome'
1.873840 OD b'lemma:0.3'
1.866099 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.859867 Technique b'-1:lemma:IP'
1.853660 Med b'+1:lemma:minimal'
1.851623 Supp b'lemma:tryptophan'
1.851623 Supp b'-1:lemma:mg/l'
1.851388 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
1.850297 Supp b'lemma:glucose'
1.843576 Agit b'lemma:250'
1.839192 Supp b'+1:lemma:min'
1.819174 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
1.812638 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.796652 O b'+1:lemma:250'
1.788454 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.785490 O b'lemma:trpr'
1.784961 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.779411 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.758434 O b'+1:lemma:mid-log'
1.733756 O b'lemma:gadx'
1.731109 O b'+1:lemma:0.2'
1.730467 O b'lemma:soxr'
1.730467 O b'lemma:soxs'
1.725905 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.725127 Gtype b'hLower'
1.717975 Gtype b'-1:lemma:_'
1.697923 pH b'+1:lemma:5.5'
1.694163 Substrain b'-1:lemma:.'
1.694163 Substrain b'-1:postag:.'
1.688077 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.681475 Med b'-1:lemma:minimal'
1.669775 Supp b'lemma:acetate'
1.666811 Technique b'-1:lemma:input'
1.664598 O b'-1:lemma:-80'
1.656682 O b'-1:lemma:grow'
1.656675 O b'lemma:harbor'
1.654439 Supp b'-1:lemma:m'
1.644331 O b'-1:lemma:fructose'
1.625174 O b'-1:lemma:anaerobic'
1.608750 Supp b'-1:postag:CD'
1.602643 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.593341 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
1.583944 O b'lemma:s'
1.581306 OD b'lemma:od600'
1.577298 O b'-1:lemma:Anaerobic'
1.565068 Supp b'+1:lemma:be'
1.564516 Gversion b'+1:postag:CD'
1.563186 Supp b'+1:lemma:mm'
1.563186 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
1.551742 O b'-1:lemma:Aerobic'
1.545107 Supp b'+1:lemma:1m'
1.544533 O b'-1:lemma:mg1655'
1.534679 O b'-1:lemma:nh4cl'
1.521893 O b'lemma:affyexp'
1.521160 Phase b'postag:NN'
1.517322 Anti b'+1:lemma:from'
1.517221 O b'+1:lemma:sparging'
1.516034 O b'lemma:culture'
1.497144 O b'postag:CC'
1.476876 Supp b'+1:lemma:_'
1.471124 Med b'-1:lemma:glucose'
1.465046 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
1.449122 Supp b'-1:lemma:without'
1.433286 O b'lemma:input'
1.433286 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.429690 Supp b'+1:lemma:m'
1.424641 OD b'+1:lemma:of'
1.409652 O b'lemma:treatment'
1.404503 Gtype b'lemma:phtpg'
1.400818 Anti b'lemma:anti-rpob'
1.398847 O b'-1:lemma:.5'
1.393235 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
1.386799 O b'+1:lemma:dpd'
1.385735 Supp b'+1:postag:VBD'
1.384869 OD b'+1:postag:IN'
1.360376 O b'lemma:or'
1.359183 Technique b'+1:ner:TF'
1.357566 O b'-1:lemma:l1'
1.355951 Anti b'+1:lemma:-lrb-'
1.354773 O b'+1:lemma:43'
1.351002 pH b'lemma:ph'
1.350722 Anti b'lemma:anti-rpos'
1.345465 O b'lemma:ml'
1.336186 O b'-1:lemma:or'
1.327517 O b'+1:postag:NNP'
1.323875 Anti b'-1:lemma::'
1.321602 Gtype b'hUpper'
1.316487 Anti b'+1:postag:-LRB-'
1.314807 Air b'+1:lemma:%'
1.310307 O b'-1:lemma:min'
1.298308 Supp b'lemma:30'
1.294342 Gtype b'lemma:delta-fnr'
1.274499 Supp b'lemma:20'
1.274253 Air b'lemma:co2'
1.273898 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.264873 Supp b'+1:lemma:1/100'
1.255077 Air b'postag:JJ'
1.253855 Air b'+1:lemma:5'
1.252310 O b'-1:lemma:medium'
1.248997 Phase b'-1:lemma::'
1.246731 pH b'-1:lemma:at'
1.240570 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.238709 Gversion b'lemma:_'
1.238447 Med b'+1:lemma:+'
1.233220 Gtype b'lemma:wild'
1.231765 Strain b'-1:lemma:.'
1.231765 Strain b'-1:postag:.'
1.227568 OD b'-1:lemma:~'
1.223647 Med b'-1:postag:JJ'
1.222766 O b'lemma:-rrb-'
1.219403 O b'postag:VBN'
1.214814 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.210195 Gtype b'lemma:the'
1.207735 O b'lemma:-lrb-'
1.206307 Supp b'-1:lemma:mm'
1.206239 Anti b'-1:lemma:polymerase'
1.196848 Med b'postag:NNS'
1.194921 Supp b'lemma:cm20'
1.194921 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.194165 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.194165 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.182770 Anti b'-1:postag::'
1.175636 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
1.175539 Supp b'-1:lemma:final'
1.169778 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.167537 O b'lemma:cra'
1.165972 OD b'lemma:o.d.'
1.165972 OD b'+1:lemma:600nm'
1.152515 Supp b'+1:lemma:anaerobically'
1.147985 OD b'-1:lemma:od450'
1.147096 Supp b'-1:lemma:0.3'
1.140420 Med b'lemma:glucose'
1.132187 Air b'-1:lemma:_'
1.131659 Supp b'lemma:150'
1.131659 Supp b'+1:lemma:mg/ml'
1.130213 O b'lemma:k-12'
1.122008 Gtype b'+1:lemma:with'
1.121216 O b'postag:-RRB-'
1.116943 Technique b'lemma:chip-exo'
1.114071 O b'symb'
1.108511 O b'-1:lemma:dpd'
1.107292 Air b'-1:postag:CD'
1.104370 O b'+1:lemma:ph5'
1.101260 Air b'-1:lemma:%'
1.086520 O b'lemma:~'
1.083670 O b'lemma:genotype'
1.080280 Med b'+1:lemma:g/l'
1.079644 O b'+1:lemma:o.d.'
1.075736 O b'lemma:-80'
1.064708 OD b'-1:postag:IN'
1.058305 Air b'+1:lemma:co2'
1.056410 Air b'lemma:%'
1.043208 Supp b'+1:lemma:deficient'
1.039691 Supp b'postag:NNP'
1.034925 Supp b'lemma:sodium'
1.030898 Anti b'lemma:mab'
1.030898 Anti b'-1:lemma:anti-flag'
1.030744 O b'+1:lemma:acetate'
1.023556 Gtype b'-1:lemma::'
1.019801 OD b'postag:IN'
1.019357 Temp b'+1:lemma:and'
1.011742 Anti b'lemma:anti-flag'
1.011742 Anti b'+1:lemma:mab'
1.011242 O b'-1:lemma:0.3-0.35'
1.001061 O b'lemma:argr'
0.994197 Air b'+1:lemma:95'
0.992459 O b'lemma:A'
0.983334 Supp b'-1:lemma:2'
0.978234 O b'lemma:oxyr'
0.971114 OD b'lemma:of'
0.963504 O b'-1:lemma:wt'
0.955956 Technique b'hLower'
0.955190 Med b'postag:NNP'
0.946025 Gtype b'lemma:flagtag'
0.939819 Supp b'-1:lemma:dissolve'
0.939819 Supp b'+1:lemma:methanol'
0.935806 O b'+1:lemma::'
0.931190 Gtype b'lemma:vector'
0.923633 Phase b'lemma:phase'
0.923244 O b'+1:lemma:rifampicin'
0.921787 pH b'lemma:.5'
0.921787 pH b'-1:lemma:ph5'
0.916273 Supp b'+1:postag:NNS'
0.913312 Gversion b'-1:lemma:the'
0.909700 Gtype b'-1:lemma:delta'
0.903115 Supp b'lemma:methanol'
0.900896 O b'lemma:0.4'
0.899801 Gtype b'+1:lemma::'
0.898955 O b'lemma:from'
0.895513 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.891349 Technique b'lemma:chip-seq'
0.886593 Phase b'+1:lemma:culture'
0.880279 Supp b'+1:lemma:phosphate'
0.877905 Supp b'-1:postag:IN'
0.871327 O b'+2:ner:_'
0.863744 Gtype b'postag:JJ'
0.861027 pH b'-1:lemma:ph'
0.857940 Med b'+1:postag:CD'
0.857811 O b'-1:ner:_'
0.844841 O b'-1:postag:NNP'
0.844547 Technique b'postag:NNP'
0.842572 OD b'lemma:0.3-0.35'
0.836619 Air b'+1:lemma:at'
0.836533 Air b'-1:lemma:n2'
0.835739 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
0.832593 O b'-1:lemma:.2'
0.820050 Vess b'+1:lemma:at'
0.815155 pH b'-1:postag:NN'
0.804321 Temp b'-1:lemma:see'
0.802517 Supp b'+2:ner:SUPP'
0.796266 Gtype b'lemma:factor'
0.796266 Gtype b'-1:lemma:transcription'
0.796266 Gtype b'+1:lemma:Fur'
0.794458 Vess b'-1:postag:VBN'
0.794284 O b'+1:ner:SUPP'
0.793500 O b'+1:postag:VBZ'
0.788602 Supp b'lemma:1m'
0.775240 O b'lemma:,'
0.775240 O b'postag:,'
0.773919 O b'hLower'
0.773567 Temp b'+1:lemma:sample'
0.768416 O b'-1:lemma:genotype/variation'
0.761992 Supp b'lemma:\xc2\xb5l'
0.761992 Supp b'+1:lemma:cm20'
0.751207 O b'+1:ner:_'
0.749634 OD b'-1:lemma:od600'
0.746440 Air b'lemma:5'
0.745278 Temp b'lemma:see'
0.744901 Anti b'+1:postag:NN'
0.738046 O b'+2:ner:KWSUPP'
0.734876 O b'lemma:C'
0.729132 OD b'lemma:600nm'
0.729132 OD b'-1:lemma:o.d.'
0.728313 Gtype b'+1:lemma:ryhb'
0.727378 Supp b'+1:lemma:mg/l'
0.726073 Temp b'-1:postag:VB'
0.721870 O b'+1:lemma:minute'
0.717043 Supp b'lemma:2g/l'
0.717043 Supp b'+1:lemma:glutamine'
0.707958 Gtype b'-1:lemma:ptac'
0.706868 Supp b'lemma:1/100'
0.706868 Supp b'+1:lemma:vol'
0.705784 Supp b'-1:lemma:contain'
0.703723 Supp b'lemma:of'
0.696458 Gtype b'lemma:ryhb'
0.694666 Supp b'-1:lemma:_'
0.693488 O b'-1:lemma:phase'
0.693381 O b'lemma:delta'
0.690643 Supp b'-2:ner:MED'
0.688740 Supp b'lemma:mg/ml'
0.688740 Supp b'-1:lemma:150'
0.688015 O b'lemma:600'
0.685412 Supp b'-1:lemma:phosphate'
0.685386 Anti b'postag:JJ'
0.679761 O b'lemma:old'
0.679761 O b'-1:lemma:seqa'
0.679761 O b'+1:lemma:deltaseqa'
0.675252 Temp b'postag:VB'
0.671292 Air b'lemma:n2'
0.662805 O b'lemma:rnase'
0.658811 O b'postag:NNS'
0.654267 OD b'-1:lemma:600nm'
0.649795 Technique b'-2:ner:TF'
0.644949 O b'+1:postag:VBD'
0.631702 Air b'-1:postag:NN'
0.628934 O b'-1:lemma:anti-rpos'
0.628934 O b'+1:lemma:neoclone'
0.628180 Med b'+1:lemma:contain'
0.619173 OD b'-1:lemma:-lrb-'
0.617177 O b'-1:lemma:4'
0.613911 O b'lemma:c'
0.613850 Air b'-1:lemma:o2'
0.613426 Med b'-1:lemma:in'
0.605310 pH b'+1:lemma:.'
0.605310 pH b'+1:postag:.'
0.604485 Technique b'+1:lemma:gadx'
0.601284 Technique b'+1:postag:NN'
0.597539 Supp b'lemma:min'
0.592206 Supp b'lemma:potassium'
0.592206 Supp b'-1:lemma:mmol'
0.589478 O b'-1:lemma:no3'
0.584779 O b'-1:lemma:antibody'
0.583381 Supp b'-1:lemma:20'
0.581939 Gtype b'-1:ner:_'
0.578297 OD b'-1:lemma:of'
0.572034 Gtype b'lemma:crp'
0.571814 Med b'+1:postag:VBG'
0.571025 Phase b'lemma:pahse'
0.569129 O b'+1:postag::'
0.564840 Med b'-1:ner:SUPP'
0.564328 OD b'+1:ner:_'
0.558881 Air b'+1:lemma:n2'
0.557699 Air b'-1:postag::'
0.555601 Supp b'+1:lemma:nitrate'
0.551149 Phase b'+1:lemma:-lrb-'
0.549519 pH b'-2:ner:SUPP'
0.549229 Supp b'lemma:fecl2'
0.544283 O b'-1:lemma:after'
0.539301 Phase b'+1:postag:-LRB-'
0.537402 Supp b'+1:lemma:at'
0.536432 Air b'-1:lemma:,'
0.536432 Air b'-1:postag:,'
0.533380 Med b'+1:postag:VBN'
0.532929 Supp b'lemma:phosphate'
0.526911 O b'postag:-LRB-'
0.526621 Supp b'+1:lemma:300'
0.525429 Gtype b'+1:lemma:small'
0.521029 OD b'-1:postag:-LRB-'
0.505765 Gversion b'postag:NN'
0.504573 Phase b'+1:lemma:phase'
0.498456 O b'+1:lemma:old'
0.496502 O b'+1:lemma:b2'
0.494900 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
0.492783 O b'lemma:growth'
0.492156 Gtype b'lemma:wild-type'
0.490903 Gtype b'-1:postag::'
0.489047 Supp b'symb'
0.488759 Gtype b'-1:lemma:the'
0.486920 Supp b'+1:ner:_'
0.482180 O b'postag:DT'
0.480108 Supp b'-1:postag:SYM'
0.475903 O b'postag:CD'
Top negative:
0.276981 Supp b'-1:postag:JJ'
0.272863 Temp b'+1:postag:CC'
0.270106 O b'-1:lemma:at'
0.265995 Air b'-1:ner:_'
0.264437 Air b'+1:postag:CC'
0.261624 Gtype b'lemma:lack'
0.260132 Air b'+1:postag:-LRB-'
0.256741 Anti b'-1:postag:JJ'
0.255913 O b'-1:lemma:short'
0.255666 O b'-1:lemma:genbank'
0.255361 Substrain b'postag:NN'
0.255359 Anti b'-2:ner:_'
0.253819 Supp b'-1:postag:CC'
0.248431 Gtype b'postag:DT'
0.246727 Med b'hUpper'
0.244639 Supp b'+1:lemma:fecl2'
0.242287 O b'+1:lemma:tritonx-100'
0.241482 Gtype b'+1:lemma:control'
0.241165 O b'-1:postag:RB'
0.239570 Supp b'lemma:hour'
0.230338 Supp b'+1:lemma:7.6'
0.229551 Anti b'hLower'
0.229541 OD b'+1:postag:JJ'
0.229046 OD b'+1:lemma:a'
0.227163 Gtype b'+1:lemma:rna'
0.226544 Technique b'-1:ner:_'
0.222817 OD b'+1:lemma:-rrb-'
0.222054 Gtype b'+1:ner:GEN'
0.221583 Air b'lemma:o2'
0.216769 O b'+1:lemma:ml'
0.213792 O b'-2:ner:Organism'
0.212934 Agit b'+1:lemma:-rrb-'
0.210037 OD b'+1:postag:-RRB-'
0.209849 Air b'+1:lemma:o2'
0.208897 Gtype b'-2:ner:GEN'
0.208824 OD b'+1:lemma:0.3'
0.207206 Med b'+1:lemma:medium'
0.206466 O b'-1:lemma:and'
0.206287 Gtype b'lemma:mutant'
0.205813 Air b'-1:lemma:25'
0.202262 Anti b'+1:ner:TF'
0.199731 O b'lemma:tag'
0.196854 pH b'postag:CD'
0.193519 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
0.191748 Supp b'+1:postag:IN'
0.191199 O b'+1:lemma:um'
0.190830 Gtype b'+1:postag:DT'
0.189727 O b'lemma:um'
0.184532 O b'+1:lemma:-'
0.181847 Med b'+1:ner:_'
0.178353 O b'lemma:hs2'
0.177781 Supp b'-1:lemma:of'
0.175876 Phase b'-1:postag:DT'
0.175647 Supp b'+1:postag:JJ'
0.173119 O b'-1:lemma:arginine'
0.172654 O b'-1:postag:VBN'
0.172313 O b'postag:NNP'
0.171832 Gtype b'lemma::'
0.171387 Gtype b'+1:postag:NN'
0.170298 Vess b'+1:postag:IN'
0.169502 Air b'lemma:25'
0.166651 Air b'+1:lemma:-lrb-'
0.161695 Agit b'+1:postag:-RRB-'
0.157389 Air b'-1:postag:RB'
0.155704 Gtype b'-1:lemma:wild'
0.155177 Supp b'-2:ner:_'
0.154788 Air b'-1:lemma:-rrb-'
0.153776 OD b'-2:ner:_'
0.151655 O b'lemma:to'
0.151655 O b'postag:TO'
0.151102 Air b'+1:lemma:,'
0.151102 Air b'+1:postag:,'
0.150664 Air b'+1:postag:NN'
0.150200 O b'+1:lemma:,'
0.150200 O b'+1:postag:,'
0.150185 O b'-1:lemma:a'
0.150067 O b'lemma:%'
0.148821 Air b'postag:CD'
0.148543 Air b'+1:lemma:and'
0.148394 Air b'-1:postag:-RRB-'
0.145682 Air b'lemma:anerobically'
0.144568 Gtype b'lemma:delta-arca'
0.141903 Supp b'hLower'
0.138222 Gtype b'lemma:k12'
0.138222 Gtype b'-1:lemma:zupt'
0.137585 O b'lemma:10'
0.137166 OD b'-1:postag:NN'
0.136762 O b'+2:ner:GEN'
0.136573 Gtype b'postag:NN'
0.131566 Supp b'+1:postag:CC'
0.129490 Phase b'-1:lemma:the'
0.126151 Supp b'-1:lemma:ph'
0.125717 Air b'-1:lemma:and'
0.125194 Med b'+1:lemma:with'
0.124499 Phase b'-2:ner:_'
0.122339 Strain b'-1:postag::'
0.121828 Supp b'-2:ner:SUPP'
0.121184 Med b'postag:NN'
0.119495 Gtype b'lemma:_'
0.119233 O b'+1:postag:NN'
0.115177 Air b'lemma:Anaerobic'
0.113249 OD b'+1:lemma:='
0.109544 Gtype b'-1:postag:DT'
0.109479 OD b'+1:postag:DT'
0.106926 O b'+1:postag:CC'
0.102917 Supp b'lemma:in'
0.098661 O b'lemma:2.0'
0.097879 Air b'-1:lemma:cm20'
0.095965 O b'lemma:genome'
0.095152 O b'lemma:\xc2\xb0c'
0.094841 Gtype b'+1:lemma:ph5'
0.094670 Air b'+1:postag:CD'
0.092719 Strain b'-1:lemma::'
0.091901 Temp b'+1:postag:JJ'
0.090576 O b'-1:lemma:chip'
0.087040 O b'-1:lemma:,'
0.087040 O b'-1:postag:,'
0.084558 Air b'+1:lemma:25'
0.083859 Air b'symb'
0.081878 O b'lemma:Lrp'
0.073939 O b'+1:lemma:and'
0.070572 O b'lemma:agitation'
0.069745 Supp b'lemma:-rrb-'
0.068171 O b'+1:lemma:to'
0.068171 O b'+1:postag:TO'
0.066578 Temp b'-2:ner:_'
0.065928 Temp b'+1:lemma:.'
0.065928 Temp b'+1:postag:.'
0.063255 Gtype b'+1:postag:CD'
0.061985 Anti b'+1:lemma:purify'
0.059595 Supp b'+1:lemma:and'
0.059555 Gtype b'lemma:fur-8myc'
0.059555 Gtype b'lemma:cra-8myc-tagged'
0.059350 O b'lemma:and'
0.058275 O b'-1:lemma:n2'
0.056122 OD b'postag:NN'
0.053425 Temp b'+2:ner:_'
0.051732 OD b'-1:postag:JJ'
0.049472 Supp b'lemma:1'
0.048796 O b'+1:lemma:co2'
0.047956 Supp b'-1:lemma:for'
0.046647 O b'-1:lemma:5'
0.044467 Supp b'postag:-RRB-'
0.042420 Anti b'+1:postag:VBN'
0.041845 O b'postag:SYM'
0.040150 Med b'-2:ner:_'
0.039154 O b'-1:lemma:10'
0.038676 O b'+1:lemma:be'
0.037991 Air b'hUpper'
0.037625 O b'lemma:acetate'
0.034710 Supp b'hUpper'
0.032062 O b'lemma:7.6'
0.032062 O b'+1:lemma:;'
0.028672 O b'+1:lemma:genbank'
0.027250 O b'-1:lemma:0.2'
0.026820 Air b'+2:ner:_'
0.026322 Gtype b'-1:lemma:small'
0.025906 Air b'+1:lemma:or'
0.025376 Anti b'lemma:anti-myc'
0.024590 O b'-1:lemma:;'
0.021536 O b'+1:lemma:7.6'
0.021087 O b'-1:lemma:fnr'
0.020299 Phase b'+1:lemma:aerobically'
0.019434 Phase b'+1:postag:RB'
0.019059 O b'lemma:IP'
0.018646 O b'-1:lemma:to'
0.018646 O b'-1:postag:TO'
0.018394 O b'lemma:300'
0.013730 O b'-1:ner:SUPP'
0.012934 Gversion b'-2:ner:_'
0.012640 O b'postag:JJ'
0.012601 Air b'-1:lemma:-lrb-'
0.012084 O b'-1:lemma:2.5'
0.011907 O b'lemma:fresh'
0.010735 O b'-1:lemma:-'
0.010376 Supp b'lemma:0.1'
0.009922 O b'-1:ner:MED'
0.008710 Med b'-1:lemma:w2'
0.008508 Air b'-1:postag:-LRB-'
0.008120 O b'+1:lemma:or'
0.007884 O b'lemma:co2'
0.007827 O b'+1:lemma:read'
0.007594 Gtype b'-1:postag:IN'
0.006704 O b'+1:lemma:phase'
0.006211 Air b'+1:lemma:-rrb-'
0.006033 O b'lemma:0.2'
0.005083 Temp b'+1:lemma:see'
0.002329 O b'lemma:short'
0.002329 O b'+1:lemma:rnase'
0.002019 O b'+1:lemma:final'
0.001594 Air b'postag:-RRB-'
0.001478 Air b'+1:postag:-RRB-'
0.001340 O b'-1:lemma:od600'
0.001223 Supp b'-1:lemma:iptg'
0.001169 O b'lemma:gadw'
0.001163 O b'lemma:m9'
0.001074 Gversion b'+2:ner:_'
0.001022 Temp b'+1:lemma:to'
0.001022 Temp b'+1:postag:TO'
0.000906 Gtype b'lemma:delta'
0.000882 O b'lemma:cell'
0.000797 Supp b'+1:lemma:10'
0.000737 Phase b'-1:ner:_'
0.000528 Agit b'+2:ner:_'
0.000480 O b'lemma:be'
0.000470 O b'-1:lemma:='
0.000443 Gversion b'-1:postag:DT'
0.000430 O b'-1:lemma:aerobic'
0.000320 Med b'-1:ner:MED'
0.000319 pH b'+1:ner:_'
0.000263 O b'lemma:respiration'
0.000224 O b'lemma:2-3'
0.000172 OD b'-1:lemma:to'
0.000172 OD b'-1:postag:TO'
0.000148 O b'-1:lemma:with'
0.000141 O b'-2:ner:KWSUPP'
0.000137 Air b'-1:lemma:anerobically'
0.000130 Air b'-1:lemma:phase'
0.000127 Temp b'+1:postag:VB'
0.000108 O b'+1:lemma:for'
0.000101 O b'+1:lemma:fructose'
0.000087 Supp b'-1:postag:NN'
0.000078 Supp b'+1:postag:RB'
0.000062 Temp b'+1:postag:NN'
0.000050 O b'lemma:genbank'
0.000046 O b'+1:lemma:pahse'
0.000031 O b'+1:lemma:respiration'
0.000028 Supp b'+1:lemma:feso4'
0.000016 Supp b'-1:lemma:30'
0.000011 Temp b'+1:lemma:in'
0.000010 O b'-1:lemma:0.15'
0.000009 O b'+1:lemma:dna'
0.000005 Air b'+1:lemma:-'
0.000005 Gtype b'+1:lemma:mg1655'
0.000004 Supp b'+1:lemma:in'
0.000004 Technique b'-1:postag:CD'
0.000003 O b'-1:lemma:genotype'
0.000003 Supp b'-1:lemma:and'
0.000002 Gtype b'-1:lemma:ompr'
0.000001 Agit b'+1:ner:_'
0.000001 Supp b'lemma:\xc2\xb5m'
0.000000 O b'-1:lemma:coli'
-0.000001 OD b'lemma:='
-0.000004 O b'+1:lemma:genome'
-0.000012 Gtype b'lemma:-rrb-'
-0.000063 Gtype b'lemma:,'
-0.000063 Gtype b'postag:,'
-0.000071 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.000082 Phase b'-2:ner:SUPP'
-0.000091 Gtype b'postag:-RRB-'
-0.000102 O b'hUpper'
-0.000110 O b'lemma:rna'
-0.000151 O b'lemma:phase'
-0.000266 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.000320 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.000344 Gtype b'+1:postag:-RRB-'
-0.000639 O b'+1:lemma:300'
-0.000656 Supp b'lemma:,'
-0.000656 Supp b'postag:,'
-0.000694 O b'-1:lemma:iptg'
-0.001411 Temp b'postag:NN'
-0.001815 Supp b'lemma:vol'
-0.001815 Supp b'-1:lemma:1/100'
-0.002109 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.002131 Technique b'postag:NN'
-0.002141 Gtype b'+1:postag:-LRB-'
-0.002298 Air b'hLower'
-0.002640 Supp b'+1:postag::'
-0.002743 Supp b'lemma:ph'
-0.003393 Med b'-1:lemma:m9'
-0.003482 Phase b'-1:postag:IN'
-0.003483 Anti b'symb'
-0.004009 O b'-1:postag:JJ'
-0.004860 Air b'lemma:-lrb-'
-0.005173 Temp b'-1:ner:_'
-0.005338 Supp b'lemma:paraquat'
-0.006397 Anti b'-1:ner:_'
-0.006812 O b'-1:lemma:delta'
-0.007456 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.008051 Gtype b'+1:ner:_'
-0.008379 Med b'+1:postag:CC'
-0.008474 Gtype b'postag:NNP'
-0.008531 Gversion b'symb'
-0.008541 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.009660 Supp b'+2:ner:_'
-0.009883 O b'hGreek'
-0.010269 Technique b'+2:ner:_'
-0.011492 O b'lemma:lb'
-0.013055 Supp b'postag:CD'
-0.013409 O b'+1:lemma:sample'
-0.014161 O b'+1:lemma:mm'
-0.014161 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.014206 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.014389 Supp b'postag:CC'
-0.015327 O b'lemma:final'
-0.015973 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.016024 O b'+1:lemma:of'
-0.016034 Vess b'symb'
-0.018617 Supp b'postag:IN'
-0.020724 O b'-1:lemma:for'
-0.022630 O b'lemma:fructose'
-0.024133 Supp b'lemma:%'
-0.024485 Supp b'-1:lemma:10'
-0.024659 Air b'+1:lemma:70'
-0.024814 Air b'lemma:70'
-0.025045 Air b'lemma:,'
-0.025045 Air b'postag:,'
-0.026947 O b'-1:lemma:contain'
-0.027843 Supp b'lemma:mm'
-0.027843 Supp b'-1:ner:KWSUPP'
-0.029059 O b'+1:lemma:the'
-0.029357 OD b'lemma:0.4'
-0.030029 O b'-1:lemma:mm'
-0.031015 Phase b'-1:lemma:at'
-0.031707 Gtype b'postag::'
-0.034777 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.035747 Air b'postag:CC'
-0.036867 Air b'-1:postag:CC'
-0.038885 Phase b'+1:postag:NN'
-0.039188 O b'+1:postag:VBG'
-0.042638 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.042638 Gtype b'-1:postag:,'
-0.045184 O b'lemma:min'
-0.047738 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.048003 Supp b'+1:lemma:of'
-0.049689 Med b'postag:JJ'
-0.053180 Med b'+1:ner:MED'
-0.056112 Supp b'lemma:.'
-0.056112 Supp b'postag:.'
-0.056897 OD b'+1:postag:CD'
-0.066934 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.067018 Med b'-1:postag:IN'
-0.068563 O b'-1:postag:CD'
-0.069450 O b'+1:lemma:min'
-0.072401 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.072625 Med b'-1:lemma:m63'
-0.074578 O b'-1:postag:DT'
-0.078358 Supp b'-1:postag::'
-0.080224 O b'lemma:m63'
-0.080510 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.087305 O b'+1:postag:NNS'
-0.088716 O b'-1:lemma:in'
-0.089748 O b'+1:lemma:minimal'
-0.089918 Supp b'+1:lemma:final'
-0.090786 O b'+1:lemma:5'
-0.090864 O b'+2:ner:SUPP'
-0.095191 O b'+1:lemma:~'
-0.097741 OD b'lemma:2.0'
-0.102517 O b'lemma:o2'
-0.110243 Anti b'-1:postag:NN'
-0.113780 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.116872 O b'+1:lemma:+'
-0.117431 O b'+1:lemma:m'
-0.123779 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.130589 Technique b'-2:ner:_'
-0.131696 O b'-1:lemma:.'
-0.131696 O b'-1:postag:.'
-0.131830 O b'-1:lemma:%'
-0.132430 Supp b'lemma:10'
-0.135572 pH b'+2:ner:_'
-0.135906 O b'-1:lemma:~'
-0.137473 Supp b'lemma:300'
-0.144674 O b'lemma:m'
-0.146737 O b'-1:lemma:minimal'
-0.157889 Temp b'symb'
-0.159003 O b'-1:lemma:rpob'
-0.159757 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.160814 O b'lemma:150'
-0.160814 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.160960 O b'-1:lemma:until'
-0.169235 O b'+1:lemma:media'
-0.172509 Phase b'+1:ner:_'
-0.173486 OD b'symb'
-0.183581 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.187277 Phase b'+2:ner:_'
-0.193476 Air b'-1:lemma:grow'
-0.193968 O b'lemma:anaerobic'
-0.197319 O b'+1:postag:CD'
-0.198976 O b'+1:postag:JJ'
-0.207878 OD b'lemma:~'
-0.212314 O b'lemma:1m'
-0.220801 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.222206 O b'lemma:fecl2'
-0.224844 O b'postag:NN'
-0.226204 O b'-1:lemma:of'
-0.234826 Med b'-1:postag:NN'
-0.248919 O b'+1:lemma:.'
-0.248919 O b'+1:postag:.'
-0.252706 Anti b'+1:ner:_'
-0.254664 O b'-1:lemma:o2'
-0.257476 O b'+1:lemma:ph'
-0.258636 O b'-1:lemma:ml'
-0.262522 O b'-1:lemma:final'
-0.277434 O b'+1:lemma:g/l'
-0.304901 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.325095 O b'lemma:nacl'
-0.327156 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.330124 O b'lemma:sample'
-0.331051 O b'lemma:20'
-0.340178 O b'+1:lemma:at'
-0.347660 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.349387 Substrain b'-1:ner:_'
-0.352498 O b'-1:lemma:m'
-0.369100 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.374400 O b'-1:postag:VBG'
-0.375645 O b'lemma:minimal'
-0.386096 O b'+1:lemma:%'
-0.393747 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.393747 Gtype b'+1:postag:,'
-0.396048 O b'-1:lemma:fresh'
-0.398000 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.400330 Anti b'hUpper'
-0.406858 O b'-1:lemma:the'
-0.408410 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.414041 O b'+1:lemma:_'
-0.420334 O b'lemma:medium'
-0.426659 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.442825 O b'-1:lemma:IP'
-0.466818 Med b'-1:ner:_'
-0.467218 O b'+1:lemma:contain'
-0.493986 O b'lemma:mid-log'
-0.501934 O b'lemma:od600'
-0.505418 O b'lemma:ph'
-0.509897 O b'lemma:wt'
-0.519621 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.526352 O b'lemma:methanol'
-0.530833 O b'lemma:rifampicin'
-0.531287 Gversion b'hLower'
-0.558364 Strain b'hLower'
-0.564678 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.576263 O b'-2:ner:SUPP'
-0.592786 Med b'hLower'
-0.595472 Med b'-2:ner:MED'
-0.598671 O b'lemma:37'
-0.601096 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.601096 O b'+1:lemma:methanol'
-0.613364 OD b'hLower'
-0.631214 Med b'postag:CD'
-0.637265 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.656417 O b'-1:postag:IN'
-0.664571 O b'-1:lemma:1m'
-0.666526 Phase b'symb'
-0.669458 O b'-1:lemma:rna'
-0.681451 Temp b'+1:postag:IN'
-0.695425 O b'+1:lemma:1m'
-0.707439 Vess b'hUpper'
-0.715081 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.737900 Technique b'-1:lemma::'
-0.739964 O b'-1:lemma:1'
-0.749025 O b'+1:postag:IN'
-0.755808 Anti b'+2:ner:_'
-0.758231 O b'+1:lemma:supplement'
-0.783159 O b'postag:RB'
-0.807594 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.830328 O b'+1:lemma:hour'
-0.846466 Air b'-1:postag:VBN'
-0.848008 O b'-1:lemma:co2'
-0.938043 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.945503 O b'-1:lemma:ph'
-0.965106 O b'lemma:of'
-0.981820 O b'+1:postag:DT'
-1.000924 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-1.006415 pH b'symb'
-1.059240 Supp b'hGreek'
-1.085228 O b'-1:lemma:sample'
-1.101806 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.107359 Med b'+1:postag:NN'
-1.112508 Strain b'symb'
-1.122033 O b'lemma:media'
-1.169172 Air b'postag:NN'
-1.219178 Supp b'+1:lemma:nacl'
-1.231933 Technique b'+1:ner:_'
-1.242256 Phase b'postag:JJ'
-1.243087 Agit b'hUpper'
-1.248287 Supp b'postag:JJ'
-1.321866 Temp b'+1:lemma:with'
-1.324752 O b'+1:lemma:in'
-1.330165 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-1.355798 O b'lemma:aerobically'
-1.357350 Temp b'hLower'
-1.364332 O b'-1:postag::'
-1.370910 OD b'hUpper'
-1.396852 Supp b'+1:lemma:,'
-1.396852 Supp b'+1:postag:,'
-1.421720 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-1.491056 O b'lemma:0.3'
-1.507320 Technique b'-1:postag::'
-1.595058 O b'-2:ner:TF'
-1.622789 O b'+1:lemma:1'
-1.627062 O b'-1:lemma:30'
-1.651929 OD b'+1:postag:NN'
-1.722422 O b'-1:lemma:2'
-1.970378 O b'lemma:30'
-2.000870 O b'+1:lemma:2'
-2.003671 Gtype b'symb'
-2.712955 O b'-1:lemma:vol'
-2.911235 Phase b'hUpper'
-3.593291 Technique b'symb'
-3.652896 O b'-1:lemma:_'
-4.507045 O b'-1:lemma::'