report_Run10_v11.txt
41.7 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
1217
1218
1219
1220
1221
1222
1223
1224
1225
1226
1227
1228
1229
1230
1231
1232
1233
1234
1235
1236
1237
1238
1239
1240
1241
1242
1243
1244
1245
1246
1247
1248
1249
1250
1251
1252
1253
1254
1255
1256
1257
1258
1259
1260
1261
1262
1263
1264
1265
1266
1267
1268
1269
1270
1271
1272
1273
1274
1275
1276
1277
1278
1279
1280
1281
1282
1283
1284
1285
1286
1287
1288
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.010465875252095174, 'c2': 0.007629920691847446}
best CV score:0.8375337951545059
model size: 0.10M
Flat F1: 0.8093965884561052
precision recall f1-score support
OD 0.913 1.000 0.955 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 0.857 0.800 0.828 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.590 0.557 0.573 88
Anti 0.765 1.000 0.867 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.967 0.756 0.849 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.864 0.838 0.851 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.853 0.777 0.809 484
Top likely transitions:
Anti -> Anti 6.358656
Phase -> Phase 6.347395
Med -> Med 5.517722
Gversion -> Gversion 5.350673
OD -> OD 5.294566
Gtype -> Gtype 5.145209
Temp -> Temp 5.037564
Technique -> Technique 4.419229
pH -> pH 4.319235
Supp -> Supp 3.991588
Agit -> Agit 3.873996
Air -> Air 3.489104
O -> O 3.373856
Substrain -> Gtype 1.754943
Technique -> Air 1.744718
Gtype -> pH 0.475572
O -> Technique 0.463868
O -> Strain 0.087931
O -> Vess 0.002669
O -> Agit 0.001369
Med -> pH -0.000077
Gtype -> Agit -0.000079
Substrain -> Med -0.000768
OD -> Technique -0.006598
pH -> OD -0.015397
Gtype -> Supp -0.026655
Air -> Gversion -0.029780
Temp -> O -0.035514
Agit -> Supp -0.040520
Supp -> Vess -0.059405
O -> Substrain -0.068730
Supp -> Agit -0.090578
Anti -> OD -0.094288
pH -> Temp -0.114788
Gversion -> Air -0.138632
O -> Gtype -0.150672
pH -> Air -0.152496
O -> pH -0.157584
Gtype -> Gversion -0.166460
Anti -> Med -0.179389
Temp -> Phase -0.184212
Gversion -> Med -0.188774
Technique -> Med -0.196139
Strain -> Gtype -0.200942
Med -> Phase -0.204513
Anti -> Air -0.205805
Substrain -> Supp -0.222262
Technique -> O -0.229401
O -> Gversion -0.231214
Air -> pH -0.234120
O -> Phase -0.241913
OD -> Gtype -0.256841
Anti -> Gtype -0.292307
Phase -> Temp -0.304182
Med -> Technique -0.317231
Med -> Gtype -0.318345
Supp -> Gversion -0.326695
OD -> Med -0.333399
Gversion -> O -0.336212
Gtype -> Technique -0.360426
Technique -> Supp -0.375713
Phase -> Air -0.382823
Gtype -> Air -0.392614
Supp -> pH -0.394983
Air -> Gtype -0.435431
Gtype -> OD -0.442096
Phase -> Med -0.452998
Anti -> Supp -0.456357
Anti -> Phase -0.461502
Phase -> O -0.501815
Gversion -> Supp -0.512804
Air -> Med -0.530468
Med -> Temp -0.531178
OD -> O -0.609293
Temp -> OD -0.644378
O -> Anti -0.654382
Air -> O -0.670873
Med -> OD -0.696726
Temp -> Gtype -0.701977
O -> Supp -0.707169
Supp -> Anti -0.725677
pH -> Supp -0.733166
Agit -> Air -0.794876
OD -> Supp -0.812700
Air -> Technique -0.841453
Gtype -> Med -0.845497
Phase -> Supp -0.863987
OD -> Temp -0.927770
Phase -> Gtype -0.937844
Med -> Air -0.942880
Technique -> OD -0.955941
Gtype -> Anti -0.956892
Supp -> Phase -1.004228
Temp -> Supp -1.063489
Supp -> Gtype -1.080500
Phase -> Technique -1.127070
Gtype -> Temp -1.177846
Temp -> Air -1.228350
Supp -> Temp -1.228750
Supp -> OD -1.273419
Technique -> Gtype -1.338454
Air -> OD -1.357774
Supp -> O -1.370964
Gtype -> Phase -1.372627
Gtype -> O -1.394148
Med -> O -1.460063
O -> Med -1.470437
Supp -> Technique -1.472701
Anti -> Temp -1.663806
Air -> Temp -1.721993
Temp -> Med -1.722970
Supp -> Air -1.724804
O -> OD -1.743961
Air -> Agit -1.818199
O -> Temp -1.849689
Air -> Supp -1.955773
OD -> Air -2.001321
Phase -> OD -2.018804
Substrain -> O -2.185804
Technique -> pH -2.370594
Air -> Phase -2.463932
O -> Air -3.086268
Supp -> Med -3.238929
Med -> Supp -3.671494
Top unlikely transitions:
Anti -> Anti 6.358656
Phase -> Phase 6.347395
Med -> Med 5.517722
Gversion -> Gversion 5.350673
OD -> OD 5.294566
Gtype -> Gtype 5.145209
Temp -> Temp 5.037564
Technique -> Technique 4.419229
pH -> pH 4.319235
Supp -> Supp 3.991588
Agit -> Agit 3.873996
Air -> Air 3.489104
O -> O 3.373856
Substrain -> Gtype 1.754943
Technique -> Air 1.744718
Gtype -> pH 0.475572
O -> Technique 0.463868
O -> Strain 0.087931
O -> Vess 0.002669
O -> Agit 0.001369
Med -> pH -0.000077
Gtype -> Agit -0.000079
Substrain -> Med -0.000768
OD -> Technique -0.006598
pH -> OD -0.015397
Gtype -> Supp -0.026655
Air -> Gversion -0.029780
Temp -> O -0.035514
Agit -> Supp -0.040520
Supp -> Vess -0.059405
O -> Substrain -0.068730
Supp -> Agit -0.090578
Anti -> OD -0.094288
pH -> Temp -0.114788
Gversion -> Air -0.138632
O -> Gtype -0.150672
pH -> Air -0.152496
O -> pH -0.157584
Gtype -> Gversion -0.166460
Anti -> Med -0.179389
Temp -> Phase -0.184212
Gversion -> Med -0.188774
Technique -> Med -0.196139
Strain -> Gtype -0.200942
Med -> Phase -0.204513
Anti -> Air -0.205805
Substrain -> Supp -0.222262
Technique -> O -0.229401
O -> Gversion -0.231214
Air -> pH -0.234120
O -> Phase -0.241913
OD -> Gtype -0.256841
Anti -> Gtype -0.292307
Phase -> Temp -0.304182
Med -> Technique -0.317231
Med -> Gtype -0.318345
Supp -> Gversion -0.326695
OD -> Med -0.333399
Gversion -> O -0.336212
Gtype -> Technique -0.360426
Technique -> Supp -0.375713
Phase -> Air -0.382823
Gtype -> Air -0.392614
Supp -> pH -0.394983
Air -> Gtype -0.435431
Gtype -> OD -0.442096
Phase -> Med -0.452998
Anti -> Supp -0.456357
Anti -> Phase -0.461502
Phase -> O -0.501815
Gversion -> Supp -0.512804
Air -> Med -0.530468
Med -> Temp -0.531178
OD -> O -0.609293
Temp -> OD -0.644378
O -> Anti -0.654382
Air -> O -0.670873
Med -> OD -0.696726
Temp -> Gtype -0.701977
O -> Supp -0.707169
Supp -> Anti -0.725677
pH -> Supp -0.733166
Agit -> Air -0.794876
OD -> Supp -0.812700
Air -> Technique -0.841453
Gtype -> Med -0.845497
Phase -> Supp -0.863987
OD -> Temp -0.927770
Phase -> Gtype -0.937844
Med -> Air -0.942880
Technique -> OD -0.955941
Gtype -> Anti -0.956892
Supp -> Phase -1.004228
Temp -> Supp -1.063489
Supp -> Gtype -1.080500
Phase -> Technique -1.127070
Gtype -> Temp -1.177846
Temp -> Air -1.228350
Supp -> Temp -1.228750
Supp -> OD -1.273419
Technique -> Gtype -1.338454
Air -> OD -1.357774
Supp -> O -1.370964
Gtype -> Phase -1.372627
Gtype -> O -1.394148
Med -> O -1.460063
O -> Med -1.470437
Supp -> Technique -1.472701
Anti -> Temp -1.663806
Air -> Temp -1.721993
Temp -> Med -1.722970
Supp -> Air -1.724804
O -> OD -1.743961
Air -> Agit -1.818199
O -> Temp -1.849689
Air -> Supp -1.955773
OD -> Air -2.001321
Phase -> OD -2.018804
Substrain -> O -2.185804
Technique -> pH -2.370594
Air -> Phase -2.463932
O -> Air -3.086268
Supp -> Med -3.238929
Med -> Supp -3.671494
Top positive:
9.422189 O b'lemma:_'
9.100004 Supp b'lemma:Iron'
7.946201 Air b'lemma:aerobically'
7.323838 Technique b'lemma:chipseq'
6.533969 Air b'lemma:anaerobic'
6.423288 Gtype b'lemma:wt'
6.305102 O b'-1:lemma:glucose'
6.256597 Phase b'lemma:stationary'
6.256597 Phase b'lemma:exponential'
6.204382 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
6.146395 Supp b'lemma:2h'
6.146395 Supp b'-1:lemma:additional'
6.110691 Supp b'-1:lemma:Cra'
6.104716 Supp b'lemma:pq'
6.092997 O b'lemma:Cra'
5.983782 O b'lemma:-'
5.909590 O b'-1:lemma:tag'
5.791586 Med b'lemma:MOPS'
5.732246 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
5.638219 O b'-1:lemma:0.3'
5.608816 Strain b'lemma:k-12'
5.250328 O b'lemma:b'
5.213232 Technique b'lemma:ChIP-exo'
5.162232 O b'lemma:chip-fnr'
5.148653 Gtype b'hGreek'
5.121455 O b'lemma:\xcf\x8332'
5.036136 O b'lemma:purr'
5.023304 Gversion b'lemma:asm584v2'
5.012929 O b'lemma:1'
5.002786 O b'lemma:CEL'
4.961820 O b'+1:lemma:od600'
4.910166 Supp b'lemma:no3'
4.868737 O b'lemma:chip-arca'
4.861825 Gtype b'+1:lemma:type'
4.782878 Air b'-1:lemma:-'
4.767145 Air b'lemma:aerobic'
4.753869 O b'lemma:at'
4.751285 Med b'lemma:LB'
4.724266 Gtype b'lemma:WT'
4.664886 O b'-1:lemma:lb'
4.664125 Med b'lemma:media'
4.658729 O b'lemma:with'
4.640592 Med b'-1:lemma:ml'
4.610147 Gtype b'lemma:type'
4.585325 Phase b'lemma:mid-log'
4.570831 Supp b'lemma:iptg'
4.518999 Gtype b'lemma:dfnr'
4.501373 O b'-1:lemma:pq'
4.461402 O b'lemma:2'
4.425446 O b'lemma:trpr'
4.402994 Supp b'+1:lemma:Deficient'
4.400975 Anti b'lemma:seqa'
4.397212 Anti b'lemma:none'
4.396737 Supp b'-1:lemma:vol'
4.280827 O b'lemma::'
4.270182 Supp b'+1:lemma:iptg'
4.264989 Supp b'lemma:nh4cl'
4.255929 Vess b'lemma:flask'
4.255929 Vess b'-1:lemma:warm'
4.239221 O b'lemma:or'
4.236081 Supp b'lemma:Fe'
4.233496 Air b'lemma:anaeroibc'
4.207565 Gversion b'lemma:chip-seq'
4.202958 O b'-1:lemma:nacl'
4.173998 Med b'+1:lemma:0.4'
4.167682 O b'lemma:a'
4.148085 Gtype b'-1:ner:GEN'
4.109309 Supp b'-1:lemma:+'
4.096292 OD b'lemma:od450'
4.081865 Supp b'lemma:nacl'
4.052041 Supp b'+1:lemma:2'
3.969497 Anti b'lemma:\xcf\x8332'
3.969454 O b'lemma:3'
3.968786 O b'lemma:for'
3.964820 O b'lemma:affyexp'
3.948787 O b'postag:VBG'
3.941131 Gtype b'lemma:wildtype'
3.930196 Technique b'lemma:rnaseq'
3.918031 O b'lemma:rep2'
3.918031 O b'lemma:rep1'
3.895626 Temp b'-1:lemma:37'
3.885357 Gtype b'lemma:pk4854'
3.883701 Supp b'lemma:Leu'
3.883693 Agit b'+1:lemma:rpm'
3.869277 Substrain b'lemma:mg1655star'
3.866979 Substrain b'lemma:mg1655'
3.856183 O b'-1:lemma:acetate'
3.843593 O b'lemma:soxr'
3.843593 O b'lemma:soxs'
3.837892 O b'lemma:rpob'
3.793165 Gtype b'lemma:arca8myc'
3.778579 O b'-1:lemma:fructose'
3.776496 O b'lemma:argr'
3.762008 Gtype b'lemma:deltaseqa'
3.762008 Gtype b'-1:lemma:old'
3.733459 pH b'lemma:ph5'
3.733459 pH b'+1:lemma:.5'
3.723358 O b'lemma:.'
3.723358 O b'postag:.'
3.713728 O b'-1:lemma:into'
3.668937 Supp b'+1:lemma:deficient'
3.648137 Med b'+1:lemma:2.0'
3.598289 Supp b'lemma:arginine'
3.594926 O b'lemma:Genome'
3.589971 O b'-1:lemma:no3'
3.583823 Supp b'lemma:Trp'
3.575036 Gversion b'lemma:000913'
3.555999 Med b'lemma:lb'
3.547592 Supp b'lemma:dpd'
3.533166 Temp b'lemma:43'
3.532068 O b'lemma:cra'
3.519885 O b'lemma:Lrp'
3.486270 Supp b'lemma:acetate'
3.482909 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
3.481820 Anti b'lemma:anti-rpob'
3.457801 Agit b'lemma:rpm'
3.443599 Supp b'lemma:Adenine'
3.418927 Agit b'-1:lemma:250'
3.408158 Med b'lemma:minimal'
3.386664 O b'+1:lemma:pq'
3.384236 O b'lemma:ompr'
3.359751 Med b'lemma:m63'
3.347299 O b'-1:lemma:nh4cl'
3.345513 Air b'-1:lemma:ryhb'
3.344073 O b'+1:lemma:wt'
3.336057 O b'-1:lemma:arginine'
3.328266 Med b'lemma:medium'
3.325392 Temp b'-1:lemma:sample'
3.300161 O b'lemma:oxyr'
3.297130 Supp b'+1:lemma:1'
3.293448 Air b'lemma:Anaerobic'
3.244194 Supp b'-1:ner:SUPP'
3.236320 O b'-2:ner:MED'
3.233729 Anti b'lemma:anti-rpos'
3.228593 Gversion b'lemma:u00096'
3.228593 Gversion b'+1:lemma:.2'
3.220928 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
3.191133 Air b'postag:RB'
3.176920 O b'-1:lemma:mg1655'
3.167703 Strain b'+1:lemma:substr'
3.151944 O b'+1:lemma:250'
3.148574 O b'lemma:Nac'
3.100735 O b'lemma:chip'
3.085092 Gversion b'lemma:.2'
3.085092 Gversion b'-1:lemma:u00096'
3.061607 O b'+1:lemma:o.d.'
3.051216 O b'-1:lemma:Anaerobic'
3.049366 O b'lemma:genotype/variation'
3.047561 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.020586 Gversion b'-1:lemma:nc'
3.020586 Gversion b'+1:lemma:000913'
2.984149 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.984149 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.978223 O b'-1:lemma:type'
2.976245 Anti b'+1:lemma:antibody'
2.958927 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.957004 Gtype b'lemma:phtpg'
2.944667 Gtype b'-1:lemma:rpob'
2.933604 Gtype b'lemma:fnr8myc'
2.904382 Temp b'-1:lemma:43'
2.893312 O b'-1:postag:NNS'
2.891821 O b'+1:lemma:43'
2.884323 Gtype b'+2:ner:SUPP'
2.875993 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.872421 Phase b'-1:lemma:until'
2.869838 Supp b'+1:lemma:hour'
2.868700 O b'+1:lemma:mid-log'
2.848205 O b'-1:lemma:dpd'
2.845760 O b'lemma:harbor'
2.833760 O b'-1:lemma:min'
2.806382 O b'lemma:delta'
2.800765 Supp b'lemma:rifampicin'
2.793311 Technique b'-1:lemma:input'
2.787093 O b'+1:lemma:coli'
2.779145 Air b'-1:lemma:co2'
2.779073 O b'+1:lemma:k-12'
2.774281 O b'-1:lemma:0.3-0.35'
2.771554 O b'lemma:C'
2.742371 O b'lemma:pt7'
2.717606 Technique b'lemma:rna-seq'
2.706556 Med b'+1:lemma:+'
2.700996 Phase b'postag:NN'
2.687591 O b'-1:lemma:Aerobic'
2.681920 O b'-1:lemma:grow'
2.679245 Gtype b'lemma:flagtag'
2.678873 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
2.674490 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
2.673952 O b'lemma:2-3'
2.672483 O b'lemma:\xcb\x9ac'
2.661068 Anti b'lemma:anti-myc'
2.656757 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.656603 O b'lemma:lrp'
2.630382 Technique b'-1:lemma:_'
2.627582 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
2.627399 O b'lemma:ntrc'
2.627399 O b'lemma:csir'
2.611827 Gtype b'-1:lemma:_'
2.606163 Supp b'-1:lemma:contain'
2.596139 O b'-1:lemma:shake'
2.595682 O b'+1:lemma:minute'
2.582575 Gtype b'lemma:nsrr'
2.579938 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.574077 O b'+1:lemma:wash'
2.573433 O b'-1:lemma:medium'
2.554173 Med b'-1:lemma:fresh'
2.550364 Gtype b'-1:lemma:wild'
2.550128 O b'-1:lemma:induce'
2.540259 pH b'+1:postag:CD'
2.538906 Gtype b'-1:lemma:from'
2.536738 Gversion b'lemma:nc'
2.536635 O b'lemma:A'
2.516982 Supp b'-1:lemma:with'
2.516504 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
2.503672 O b'lemma:input'
2.503672 O b'+1:lemma:chip-seq'
2.497493 Med b'-1:lemma:minimal'
2.495435 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
2.490226 O b'lemma:culture'
2.486626 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.474899 Air b'-1:lemma:cm20'
2.468792 OD b'lemma:0.3-0.35'
2.463216 O b'lemma:gadx'
2.461075 O b'-1:lemma:-80'
2.449165 O b'lemma:treatment'
2.445027 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.436126 Gtype b'-1:lemma:factor'
2.433142 Supp b'lemma:tryptophan'
2.433142 Supp b'-1:lemma:mg/l'
2.432731 Anti b'hGreek'
2.427410 Gtype b'+1:lemma:the'
2.425328 Air b'-1:lemma:_'
2.424669 Anti b'-1:lemma:fnr'
2.421076 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.407085 Temp b'lemma:37'
2.402467 Substrain b'-1:lemma:.'
2.402467 Substrain b'-1:postag:.'
2.401933 O b'lemma:s'
2.377466 O b'lemma:+'
2.362329 Gtype b'+1:lemma::'
2.359609 Supp b'-1:lemma:final'
2.357911 Gtype b'lemma:delta-soxr'
2.357911 Gtype b'lemma:delta-gadx'
2.357911 Gtype b'lemma:delta-gadw'
2.357911 Gtype b'lemma:delta-oxyr'
2.357911 Gtype b'lemma:delta-gade'
2.357911 Gtype b'lemma:delta-soxs'
2.356675 Gtype b'lemma:gade-8myc'
2.354545 Med b'+1:lemma:with'
2.343521 Air b'+1:lemma:b'
2.342733 Gtype b'lemma:ptac'
2.315032 Supp b'-1:lemma:potassium'
2.313859 O b'-1:lemma:stpa'
2.311262 O b'postag::'
2.309905 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.300893 Supp b'+1:lemma:_'
2.300052 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.294618 O b'lemma:~'
2.293819 O b'+1:lemma:0.2'
2.278952 Air b'postag:JJ'
2.258283 Gtype b'+1:postag::'
2.257161 O b'+1:lemma:sparging'
2.254138 Gtype b'+1:lemma:control'
2.253510 Gtype b'lemma:wild'
2.244502 OD b'lemma:0.3'
2.241691 Gtype b'+1:lemma:cra'
2.240886 Gtype b'lemma:fur-8myc'
2.240886 Gtype b'lemma:cra-8myc-tagged'
2.238962 Supp b'lemma:glutamine'
2.238962 Supp b'-1:lemma:2g/l'
2.234391 Gtype b'lemma:delta-fnr'
2.230098 pH b'+1:lemma:5.5'
2.229403 OD b'-1:lemma:od450'
2.225215 Gversion b'+1:lemma:genome'
2.221272 O b'lemma:growth'
2.211806 O b'lemma:ecolus'
2.204250 Gtype b'lemma:ompr-8myc'
2.198612 O b'-1:lemma:leucine'
2.186732 O b'+1:lemma:\xcb\x9ac'
2.150233 Gtype b'lemma:fnr-8myc'
2.145728 Vess b'+1:lemma:at'
2.141129 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
2.140071 O b'lemma:contain'
2.103585 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
2.097507 O b'+1:lemma:dpd'
2.091238 Gtype b'lemma:wild-type'
2.086135 Supp b'-1:lemma:1m'
2.082992 Supp b'lemma:final'
2.079469 Vess b'-1:postag:VBN'
2.078214 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
2.064246 O b'+1:postag:RB'
2.061765 O b'lemma:-80'
2.060433 Air b'lemma:Aerobic'
2.056303 Air b'+1:lemma:-'
2.054136 O b'-1:lemma:aerobic'
2.047344 Supp b'-1:lemma:without'
2.043575 Strain b'-1:lemma:.'
2.043575 Strain b'-1:postag:.'
2.041385 Gtype b'-1:postag:VBP'
2.036719 Med b'+1:postag:CD'
2.035584 Agit b'lemma:250'
2.034971 Gtype b'+1:lemma:pq'
2.027814 Anti b'+1:lemma:from'
2.017894 O b'+1:lemma::'
2.016942 Gtype b'+1:lemma:with'
2.013291 Gtype b'+1:lemma:mg1655'
2.011574 O b'postag:DT'
2.010188 O b'+1:lemma:20'
2.005844 O b'+1:lemma:30'
1.994949 Supp b'+1:lemma:mm'
1.994949 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
1.990124 O b'lemma:until'
1.976394 O b'lemma:one'
1.975615 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.968786 O b'+1:lemma:b2'
1.967377 O b'lemma:c'
1.966710 Med b'-1:lemma:glucose'
1.966499 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.966023 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.963665 Supp b'+1:lemma:mg/l'
1.958911 O b'-1:lemma:.5'
1.950558 Technique b'hUpper'
1.948251 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.948251 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.924929 Supp b'lemma:30'
1.924017 O b'-1:lemma:genbank'
1.920426 pH b'lemma:.5'
1.920426 pH b'-1:lemma:ph5'
1.919425 O b'lemma:tag'
1.915015 Supp b'-2:ner:MED'
1.911309 O b'-1:lemma:wt'
1.905176 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.903720 Supp b'+1:lemma:m'
1.882465 O b'+1:lemma:b1'
1.881462 Gtype b'lemma:purr-8myc'
1.879263 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.878994 O b'-1:lemma:rpm'
1.872253 pH b'-1:lemma:ph'
1.870618 pH b'lemma:5.5'
1.852696 O b'-1:lemma:l1'
1.845425 O b'lemma:600'
1.844672 Supp b'+1:lemma:min'
1.835211 pH b'-1:lemma:at'
1.831393 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.830209 OD b'lemma:o.d.'
1.830209 OD b'+1:lemma:600nm'
1.823902 OD b'-1:lemma:600nm'
1.820369 pH b'lemma:ph'
1.807453 Med b'+1:lemma:minimal'
1.806122 O b'-1:lemma:.2'
1.805962 Supp b'lemma:glucose'
1.795146 Technique b'-1:lemma:1'
1.794127 OD b'lemma:od600'
1.793320 Gtype b'lemma:delta-arca'
1.790424 Anti b'-1:lemma:myc'
1.782925 O b'lemma:additional'
1.782925 O b'+1:lemma:2h'
1.782404 Gtype b'postag:JJ'
1.781434 O b'+1:lemma:od450'
1.774756 Supp b'-1:lemma:30'
1.769636 Anti b'lemma:mab'
1.769636 Anti b'-1:lemma:anti-flag'
1.765066 Supp b'-1:lemma:0.3'
1.756816 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.755358 Gtype b'lemma:crp'
1.750779 Med b'+1:lemma:g/l'
1.742185 Technique b'+1:ner:TF'
1.735687 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.735671 O b'-1:lemma:0.35'
1.733317 O b'lemma:acetate'
1.730153 O b'postag:CC'
1.721076 Supp b'lemma:2g/l'
1.721076 Supp b'+1:lemma:glutamine'
1.713590 Air b'-1:lemma:fur'
1.705625 O b'-1:lemma:phase'
1.695672 Med b'postag:NNS'
1.694509 Supp b'lemma:fructose'
1.693844 Gversion b'lemma:_'
1.686978 O b'+1:lemma:ph5'
1.686382 Med b'-1:postag:JJ'
1.678106 Air b'+1:lemma:at'
1.676827 Med b'postag:NNP'
1.669797 O b'-1:lemma:media'
1.660133 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.656712 Supp b'lemma:m'
1.648427 O b'-1:lemma:4'
1.646945 O b'postag:SYM'
1.625647 OD b'-1:lemma:at'
1.620226 Temp b'lemma:sample'
1.620111 Temp b'+1:lemma:short'
1.605899 Phase b'+1:lemma:culture'
1.604239 Technique b'lemma:chip-exo'
1.601164 Supp b'+1:lemma:1m'
1.594423 O b'-1:lemma:concentration'
1.594423 O b'+1:lemma:150'
1.594080 Gtype b'+1:lemma:small'
1.590743 Gversion b'+1:postag:CD'
1.590622 Vess b'+1:postag:IN'
1.580191 Technique b'+1:lemma:gadx'
1.572997 O b'+1:lemma:m9'
1.563499 O b'-1:lemma:fnr'
1.554952 Supp b'+1:lemma:and'
1.553773 OD b'lemma:600nm'
1.553773 OD b'-1:lemma:o.d.'
1.553731 O b'-1:lemma:w0002'
1.547767 O b'+1:lemma:old'
1.542256 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.542081 Supp b'lemma:cm20'
1.542081 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.538044 Supp b'+1:postag:NNS'
1.537541 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.537248 Technique b'-1:lemma:IP'
1.536877 O b'+1:lemma:acetate'
1.530023 Supp b'lemma:150'
1.530023 Supp b'+1:lemma:mg/ml'
1.523939 O b'+1:lemma:37'
1.520203 O b'lemma:EB'
1.516174 OD b'+1:lemma:of'
1.509148 Supp b'+1:lemma:anaerobically'
1.501677 O b'lemma:Fur'
1.492917 Air b'+1:lemma:%'
1.491829 O b'-1:lemma:Leu'
1.486989 O b'-1:lemma:genotype'
1.473001 Med b'-1:lemma:in'
1.470631 O b'lemma:ml'
1.470299 Temp b'lemma:see'
1.469511 Gtype b'lemma:Wild'
1.461797 Supp b'-1:lemma:_'
1.460647 Supp b'+1:lemma:1/100'
1.454285 Supp b'lemma:1m'
1.453546 O b'lemma:10'
1.452523 Gtype b'lemma:ryhb'
1.447104 Gtype b'lemma:the'
1.436921 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.436015 Technique b'hLower'
1.434117 OD b'lemma:0.35'
1.433577 OD b'+1:postag:IN'
1.429900 O b'-1:lemma:nitrate'
1.429367 O b'-1:lemma:one'
1.428911 Air b'+1:lemma:C'
1.428602 Gtype b'+1:lemma:_'
1.426237 O b'+1:lemma:respiration'
1.426170 Gtype b'lemma:lack'
1.425685 Supp b'lemma:sodium'
1.421054 Gtype b'-1:lemma:knock-out'
1.411350 O b'-1:lemma:glutamine'
1.401895 Technique b'lemma:chip-seq'
1.401871 OD b'+1:lemma:0.3-0.35'
1.398674 Anti b'+1:lemma:-lrb-'
1.396365 Gtype b'+1:lemma:chip'
1.395912 Gtype b'lemma:vector'
1.394603 O b'-1:lemma:Fe'
1.392642 Gtype b'hUpper'
1.390845 OD b'-1:lemma:about'
1.389526 O b'-1:lemma:Iron'
1.380444 Gtype b'+1:postag:FW'
1.370459 Temp b'postag:VB'
1.360231 OD b'+1:lemma:,'
1.360231 OD b'+1:postag:,'
1.350786 O b'-1:lemma:0.15'
1.348181 O b'lemma:genome'
1.347910 Anti b'lemma:anti-flag'
1.347910 Anti b'+1:lemma:mab'
1.346348 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
1.345557 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.344889 Supp b'lemma:1g/l'
1.343615 pH b'+1:lemma:.'
1.343615 pH b'+1:postag:.'
1.341950 Supp b'lemma:leucine'
1.341462 O b'-1:lemma:Adenine'
1.333262 O b'+1:lemma:treat'
1.330564 O b'+1:lemma:crp'
1.328513 Air b'lemma:co2'
1.313486 Agit b'-1:lemma:-lrb-'
1.309901 O b'lemma:concentration'
1.298020 Anti b'+1:postag:-LRB-'
1.295786 O b'-1:lemma:after'
1.294817 O b'-1:lemma:2.5'
1.292344 Supp b'-1:lemma:0.2'
1.291921 Air b'-1:lemma:phase'
1.290953 O b'-1:lemma:tryptophan'
1.289077 O b'-1:lemma:chipseq'
1.286000 Agit b'-1:postag:-LRB-'
1.284383 O b'postag:VBN'
1.281627 Supp b'+1:lemma:phosphate'
1.277166 O b'+1:lemma:nacl'
1.275998 O b'lemma:induction'
1.275962 Air b'+1:lemma:95'
1.266024 Gtype b'+1:lemma:ph5'
1.258603 Supp b'-1:lemma:phosphate'
1.255528 Technique b'+1:postag:NN'
1.255253 Anti b'-1:lemma::'
1.250025 OD b'-1:lemma:~'
1.249422 Supp b'+1:lemma:leucine'
1.249420 O b'lemma:agitation'
1.243880 O b'lemma:paraquat'
1.242035 Temp b'-1:lemma:see'
1.241346 O b'+1:lemma:tritonx-100'
1.239483 O b'+1:lemma:genbank'
1.239389 O b'-1:lemma:anti-rpos'
1.239389 O b'+1:lemma:neoclone'
Top negative:
0.016040 Supp b'lemma:4'
0.015481 Gtype b'-1:lemma:control'
0.015242 Air b'-1:postag:-LRB-'
0.014312 Anti b'-2:ner:TF'
0.013798 Air b'postag:NNP'
0.013027 O b'-1:lemma:edta'
0.011702 Med b'-1:postag:CC'
0.010704 O b'-1:lemma:two'
0.010297 O b'-1:lemma:cell'
0.010151 Gtype b'+1:lemma:carrying'
0.009920 Air b'-1:lemma:-lrb-'
0.009860 O b'+1:lemma:culture'
0.009796 Strain b'hUpper'
0.009775 Anti b'-1:lemma:pre-cleared'
0.008823 Agit b'symb'
0.008816 Phase b'+1:postag:NN'
0.007871 Substrain b'+1:postag:NN'
0.007779 O b'lemma:%'
0.007190 O b'-1:postag:VBZ'
0.007158 O b'lemma:phosphate'
0.006573 O b'+1:lemma:ompr'
0.006540 Phase b'+1:postag:IN'
0.005792 pH b'-1:ner:_'
0.005637 Air b'symb'
0.004920 Gtype b'+1:postag:NNP'
0.003666 Agit b'+1:ner:_'
0.003260 O b'+1:lemma:pk4854'
0.002892 O b'-1:lemma:po'
0.002345 O b'+1:lemma:be'
0.002274 Supp b'-1:lemma:-'
0.001774 Agit b'+1:postag:NN'
0.001388 Vess b'postag:NN'
0.001377 O b'lemma:build'
0.001340 O b'lemma:\xce\xbcm'
0.001337 O b'+1:lemma:gadw'
0.001212 Agit b'postag:CD'
0.000843 O b'+2:ner:Organism'
0.000812 O b'lemma:chip-exo'
0.000721 O b'+1:lemma:\xce\xbcl'
0.000655 Anti b'lemma:anti-fur'
0.000625 O b'-1:lemma:strain'
0.000513 Anti b'lemma:fnr'
0.000436 Gtype b'+1:lemma:lacx74/ptg2'
0.000425 O b'-1:lemma:FDR'
0.000425 O b'+1:lemma:0.01'
0.000418 O b'-1:lemma:chip-arca'
0.000418 O b'+1:lemma:arca8myc'
0.000359 Temp b'-1:lemma:-lrb-'
0.000356 Temp b'-1:postag:-LRB-'
0.000272 Anti b'+1:lemma:polyclonal'
0.000264 Anti b'lemma:ihf'
0.000254 O b'-1:lemma:build'
0.000236 O b'-1:lemma:licl'
0.000204 Temp b'-1:postag:JJ'
0.000177 Gversion b'-1:postag::'
0.000132 O b'+1:lemma:aerobic'
0.000102 OD b'+1:lemma:in'
0.000101 pH b'+1:ner:_'
0.000081 OD b'+1:lemma:0.15'
0.000080 O b'lemma:acid'
0.000080 O b'+1:lemma:phenol'
0.000059 O b'+1:lemma:TEX'
0.000058 Supp b'+1:postag:NNP'
0.000051 O b'-1:lemma:Deficient'
0.000042 O b'lemma:FDR'
0.000025 Supp b'lemma:8'
0.000025 Supp b'lemma:16'
0.000025 O b'+1:lemma:NeoClone'
0.000023 Gtype b'lemma:-lcb-'
0.000013 Gtype b'-1:lemma:lacx74/ptg2'
0.000013 O b'lemma:neoclone'
0.000011 Gtype b'+1:lemma:delta'
0.000004 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4oxyr'
0.000002 Gtype b'lemma:lacx74/ptg2'
0.000002 O b'-1:lemma:flagtag'
0.000001 O b'lemma:50'
0.000001 Gversion b'-1:lemma:version'
-0.000002 O b'+1:lemma:A'
-0.000004 pH b'hGreek'
-0.000014 Gtype b'lemma:fnr'
-0.000018 Gversion b'-1:postag:CD'
-0.000053 Med b'-1:lemma:MOPS'
-0.000115 Gtype b'-1:lemma:crp'
-0.000180 O b'lemma:deletion'
-0.000354 Gtype b'+1:lemma:b'
-0.000428 O b'+1:lemma:mutant'
-0.000624 Gtype b'postag:FW'
-0.000986 O b'lemma:vol'
-0.000986 O b'-1:lemma:1/100'
-0.001985 Supp b'lemma:250'
-0.002074 O b'lemma:95'
-0.002649 Gtype b'+1:lemma:pk4854'
-0.003313 O b'lemma:mutant'
-0.003480 O b'-1:lemma:deletion'
-0.003991 Anti b'+1:ner:_'
-0.004490 O b'+1:lemma:='
-0.004654 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.004853 Med b'hGreek'
-0.004878 O b'-2:ner:GEN'
-0.005438 Temp b'+2:ner:_'
-0.006429 Gtype b'lemma:-rrb-'
-0.006736 O b'+1:lemma:0.4'
-0.008339 Temp b'postag:NN'
-0.009421 Med b'-1:postag:NNP'
-0.009722 O b'-1:lemma:25'
-0.010357 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.012076 O b'+1:lemma:of'
-0.012288 O b'-1:lemma:k-12'
-0.012996 Air b'+1:postag:NN'
-0.014738 Air b'postag:-LRB-'
-0.015582 Gtype b'+1:postag:-RRB-'
-0.016828 O b'-1:lemma:anaerobically'
-0.018965 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.019468 O b'-1:lemma:affinity'
-0.021179 Air b'lemma:-lrb-'
-0.022224 O b'+1:postag:NNS'
-0.023271 Supp b'-1:lemma:250'
-0.024900 O b'-1:lemma:control'
-0.025492 O b'-1:lemma:0.1'
-0.025898 Gtype b'postag:NNP'
-0.027062 O b'+1:lemma:phosphate'
-0.028382 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.029040 Supp b'-1:lemma:;'
-0.029050 Temp b'hGreek'
-0.029491 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.030879 O b'-1:lemma:m9'
-0.031369 O b'lemma:lb'
-0.031957 O b'-1:lemma:um'
-0.031957 O b'+1:lemma:paraquat'
-0.032120 O b'postag:VB'
-0.032540 O b'-1:lemma:20'
-0.032903 Substrain b'+2:ner:_'
-0.033007 Technique b'-2:ner:_'
-0.033933 O b'+1:lemma:.'
-0.033933 O b'+1:postag:.'
-0.034206 Phase b'-2:ner:_'
-0.034336 O b'lemma:sodium'
-0.034577 Air b'postag:CD'
-0.036158 Gtype b'-1:postag:SYM'
-0.036238 O b'-1:lemma:70'
-0.037842 O b'lemma:1/100'
-0.037842 O b'+1:lemma:vol'
-0.040259 Temp b'+1:postag:-LRB-'
-0.040671 O b'+1:lemma:0.3'
-0.041843 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.043283 Gtype b'+1:postag:IN'
-0.044354 Supp b'+1:lemma:in'
-0.044992 O b'+1:lemma:fnr'
-0.045588 O b'lemma:\xc3\x9f'
-0.045602 O b'+1:lemma:rna'
-0.046664 O b'+1:lemma:25'
-0.046854 O b'lemma:25'
-0.050681 O b'+1:lemma:a'
-0.050925 Temp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.051240 Supp b'-1:lemma:%'
-0.052441 Gversion b'-1:ner:_'
-0.053733 O b'-1:lemma:of'
-0.053891 O b'-1:lemma:for'
-0.057308 Gtype b'postag:VBG'
-0.058574 O b'lemma:5'
-0.059450 O b'lemma:final'
-0.059601 Supp b'postag:IN'
-0.060475 O b'+1:lemma:70'
-0.060770 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.060910 OD b'lemma:='
-0.061471 O b'-1:lemma:mm'
-0.062268 Supp b'lemma:,'
-0.062268 Supp b'postag:,'
-0.063231 Strain b'-1:ner:_'
-0.063756 O b'-1:lemma:harbor'
-0.063804 O b'lemma:70'
-0.063935 O b'lemma:;'
-0.063935 O b'-1:lemma:7.6'
-0.064736 O b'+1:lemma:pahse'
-0.065275 Med b'-1:ner:MED'
-0.067315 Supp b'+2:ner:KWSUPP'
-0.068862 Technique b'-1:postag:SYM'
-0.069961 O b'lemma:nitrate'
-0.070651 OD b'postag:JJ'
-0.072225 Gtype b'lemma:,'
-0.072225 Gtype b'postag:,'
-0.072341 Anti b'-1:ner:_'
-0.078518 Phase b'+2:ner:_'
-0.078535 O b'+1:lemma:o2'
-0.080478 O b'+1:lemma:n2'
-0.083059 Supp b'hUpper'
-0.083063 O b'lemma:0.2'
-0.084445 Phase b'-1:lemma:at'
-0.085105 O b'-1:lemma:gadw'
-0.085171 Substrain b'+1:ner:_'
-0.087430 Anti b'-1:postag:CD'
-0.087558 Technique b'postag:-RRB-'
-0.088349 O b'+1:lemma:95'
-0.088922 Air b'hLower'
-0.091176 O b'-1:lemma:to'
-0.091176 O b'-1:postag:TO'
-0.092224 O b'lemma:250'
-0.093993 OD b'lemma:2.0'
-0.094134 O b'+1:lemma:antibody'
-0.094334 O b'-1:lemma:purify'
-0.096526 O b'+1:lemma:purify'
-0.097513 O b'-1:postag:VBG'
-0.097962 O b'+1:lemma:mm'
-0.097962 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.099771 Supp b'postag:NNS'
-0.100100 O b'+1:lemma:b'
-0.100339 O b'-1:lemma:250'
-0.100622 O b'+1:lemma:co2'
-0.102633 O b'lemma:hour'
-0.104237 O b'-1:lemma:Fur'
-0.107854 Med b'+1:postag:NNS'
-0.110818 Supp b'+1:postag:SYM'
-0.114225 O b'lemma:0.1'
-0.116885 Gtype b'lemma:-lrb-'
-0.116886 O b'+1:lemma:arginine'
-0.117165 O b'-1:lemma:gadx'
-0.119130 O b'lemma:1m'
-0.119925 Gtype b'+1:postag:NNS'
-0.123142 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.125069 O b'hUpper'
-0.127281 Supp b'+2:ner:_'
-0.130039 pH b'hUpper'
-0.130781 O b'+1:lemma:1/100'
-0.131926 O b'lemma:m9'
-0.132159 O b'-1:lemma:='
-0.133456 O b'+1:lemma:the'
-0.134447 O b'+1:postag:FW'
-0.140915 Technique b'+1:postag:-RRB-'
-0.143211 O b'+1:lemma:minimal'
-0.144203 Technique b'+1:lemma:-rrb-'
-0.152000 O b'+1:lemma:ph'
-0.159173 O b'lemma:mg/ml'
-0.159173 O b'-1:lemma:150'
-0.159693 O b'-2:ner:SUPP'
-0.159938 O b'lemma:7.6'
-0.159938 O b'+1:lemma:;'
-0.162186 O b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.162363 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.163174 pH b'hLower'
-0.164422 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.164899 Phase b'hGreek'
-0.166464 Supp b'-1:lemma:Fe'
-0.167155 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.167918 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.171171 O b'lemma:phase'
-0.171333 O b'+1:postag:VBG'
-0.174047 O b'-1:postag:CD'
-0.174237 OD b'postag:NN'
-0.174565 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.175901 O b'+1:lemma:2.0'
-0.176667 Strain b'+2:ner:_'
-0.177493 O b'-1:lemma:sodium'
-0.177639 O b'+1:lemma:~'
-0.179857 Anti b'-1:postag:NN'
-0.182632 O b'lemma:n2'
-0.185377 O b'-1:lemma:minimal'
-0.185759 O b'+1:lemma:media'
-0.185836 Supp b'-1:postag:VBG'
-0.187828 O b'postag:NN'
-0.188556 Agit b'postag:NN'
-0.189237 Agit b'-1:ner:_'
-0.189890 Gtype b'-1:postag:CD'
-0.191979 Med b'-1:postag:NN'
-0.194942 Agit b'-2:ner:_'
-0.197775 Phase b'-1:postag:IN'
-0.200638 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.202857 O b'+1:lemma:7.6'
-0.204778 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.211827 Temp b'symb'
-0.219283 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.220457 O b'-1:lemma:the'
-0.220585 O b'-1:lemma:from'
-0.220899 O b'-1:lemma:in'
-0.225626 Med b'+1:lemma:m9'
-0.227584 Phase b'+1:ner:_'
-0.227622 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.228061 O b'+1:postag:VB'
-0.228781 O b'lemma:o2'
-0.229310 Anti b'symb'
-0.233487 O b'+1:lemma:sample'
-0.234392 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.235655 Air b'-2:ner:TF'
-0.236425 pH b'postag:NN'
-0.236995 O b'+1:lemma:5'
-0.238439 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.241112 Supp b'-1:postag:NN'
-0.252779 O b'-1:lemma:~'
-0.256469 Gversion b'hLower'
-0.256685 Supp b'-1:lemma:the'
-0.259191 Supp b'-1:postag:DT'
-0.259434 O b'-1:lemma:0.2'
-0.261234 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.263136 O b'+2:ner:MED'
-0.266318 O b'lemma:20'
-0.275824 O b'lemma:dpd'
-0.278079 Vess b'-2:ner:_'
-0.278501 Supp b'postag:-LRB-'
-0.278591 O b'-1:lemma:g/l'
-0.280873 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.280938 Air b'lemma:anaerobically'
-0.282983 O b'lemma:fecl2'
-0.289596 Supp b'lemma:and'
-0.295885 OD b'+1:lemma:.'
-0.295885 OD b'+1:postag:.'
-0.296223 Supp b'postag:CC'
-0.300555 O b'lemma:min'
-0.301515 O b'-1:lemma:iptg'
-0.302791 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.303240 O b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.308711 OD b'symb'
-0.311553 Strain b'+1:ner:_'
-0.311763 Anti b'postag:NNP'
-0.323322 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.326300 O b'-1:lemma:delta'
-0.336015 O b'lemma:co2'
-0.342756 Gtype b'postag:-RRB-'
-0.342929 O b'+2:ner:TF'
-0.344771 O b'lemma:fructose'
-0.346752 O b'-1:postag:VB'
-0.347366 O b'+1:lemma:until'
-0.351279 O b'lemma:m63'
-0.356401 Vess b'-1:ner:_'
-0.359498 O b'lemma:rna'
-0.360575 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.364604 O b'-1:lemma:%'
-0.368676 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.371920 O b'+1:lemma:min'
-0.372841 Anti b'postag:CD'
-0.373371 pH b'+2:ner:_'
-0.388366 Med b'-1:ner:_'
-0.392939 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.416056 Supp b'lemma:paraquat'
-0.417887 Technique b'+2:ner:_'
-0.418000 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.430066 O b'lemma:dissolve'
-0.438010 Gversion b'symb'
-0.443402 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.448121 O b'lemma:sample'
-0.453576 O b'+1:lemma:1m'
-0.454306 O b'+1:lemma:%'
-0.454336 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.454336 O b'+1:lemma:methanol'
-0.462252 Technique b'-1:postag:CD'
-0.470165 O b'lemma:ph'
-0.471181 O b'+1:lemma:supplement'
-0.478623 Gtype b'+1:postag:-LRB-'
-0.481661 Med b'-1:postag:IN'
-0.494226 Supp b'+1:postag::'
-0.495161 O b'+1:lemma:300'
-0.502392 O b'-1:lemma:o2'
-0.505344 Supp b'lemma:300'
-0.507603 O b'-1:lemma:od600'
-0.511172 Vess b'symb'
-0.513597 O b'-1:ner:SUPP'
-0.514642 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.515145 Med b'+1:ner:MED'
-0.522333 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.528059 O b'+1:postag:IN'
-0.528550 O b'-1:lemma:n2'
-0.528993 Substrain b'-2:ner:_'
-0.529011 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.529011 Gtype b'-1:postag:,'
-0.529943 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.540267 Gversion b'+1:ner:_'
-0.540469 O b'lemma:minimal'
-0.544244 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.557222 Phase b'-2:ner:SUPP'
-0.566972 pH b'-2:ner:_'
-0.573824 O b'-1:lemma:.'
-0.573824 O b'-1:postag:.'
-0.575371 O b'-1:lemma:with'
-0.575485 O b'+2:ner:SUPP'
-0.579567 Supp b'lemma:10'
-0.582898 O b'lemma:od600'
-0.597428 O b'lemma:mid-log'
-0.598353 Med b'+1:postag:NN'
-0.608353 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.609535 Med b'hLower'
-0.611985 O b'hGreek'
-0.618631 O b'lemma:150'
-0.618631 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.618912 O b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.622645 OD b'hUpper'
-0.633060 O b'-1:lemma:1m'
-0.637565 O b'lemma:methanol'
-0.647853 O b'+1:lemma:gadx'
-0.650571 O b'+1:postag:DT'
-0.654852 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.659097 Anti b'hUpper'
-0.661457 Med b'+1:postag:CC'
-0.666686 O b'lemma:pahse'
-0.669887 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.669887 Gtype b'+1:postag:,'
-0.670109 O b'lemma:purify'
-0.673725 O b'-1:postag:IN'
-0.675651 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.687151 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.692697 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.696990 OD b'hLower'
-0.700033 O b'+1:lemma:from'
-0.700088 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.712250 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.724052 Air b'-1:lemma:grow'
-0.727180 O b'-1:lemma:ph'
-0.759485 O b'-1:lemma:1'
-0.761472 Gtype b'postag:CD'
-0.769904 O b'+1:lemma:g/l'
-0.779492 pH b'symb'
-0.779681 Gtype b'-1:lemma:fur'
-0.797342 O b'lemma:aerobic'
-0.829029 Anti b'+2:ner:_'
-0.847548 O b'lemma:of'
-0.871514 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.874045 O b'-1:lemma:37'
-0.879456 O b'-1:lemma:IP'
-0.884807 Agit b'hLower'
-0.895980 Substrain b'hLower'
-0.967151 O b'postag:RB'
-0.973312 Temp b'+1:postag:IN'
-0.976370 O b'+1:lemma:at'
-0.986881 Substrain b'-1:ner:_'
-0.993075 O b'lemma:m'
-0.997570 Supp b'lemma:2'
-1.001665 O b'-1:ner:GEN'
-1.007787 O b'+1:postag:-LRB-'
-1.023624 Technique b'-1:lemma::'
-1.033250 O b'-1:lemma:final'
-1.056214 Gtype b'+1:lemma:crp'
-1.062487 Med b'-1:postag:CD'
-1.062521 Gtype b'+1:postag:JJ'
-1.071057 Vess b'hUpper'
-1.079400 O b'+1:lemma:contain'
-1.083208 Air b'postag:NN'
-1.102871 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-1.114242 Med b'+1:postag:IN'
-1.115963 O b'-1:lemma:rna'
-1.136821 Med b'postag:CD'
-1.143591 Med b'lemma:-lrb-'
-1.170657 Supp b'postag:JJ'
-1.184854 O b'-1:lemma:m'
-1.205750 Phase b'symb'
-1.231311 O b'lemma:medium'
-1.236229 O b'+1:lemma:m'
-1.239932 O b'lemma:rifampicin'
-1.257399 Med b'postag:-LRB-'
-1.265540 Air b'-1:postag:VBN'
-1.290995 O b'lemma:anaerobic'
-1.298223 O b'lemma:0.3'
-1.335612 Technique b'-1:postag::'
-1.381610 Phase b'postag:JJ'
-1.404670 O b'-1:lemma:rpob'
-1.416409 O b'lemma:aerobically'
-1.418184 Gtype b'-1:postag:CC'
-1.418858 Gtype b'postag::'
-1.424312 Med b'-2:ner:MED'
-1.447484 O b'lemma:nh4cl'
-1.465927 O b'-1:postag::'
-1.489320 O b'lemma:37'
-1.492838 Temp b'hLower'
-1.493480 O b'-2:ner:TF'
-1.496599 Supp b'+1:lemma:acetate'
-1.500257 O b'-1:lemma:co2'
-1.506601 O b'+1:lemma:in'
-1.527686 O b'-1:lemma:30'
-1.549243 O b'lemma:30'
-1.565101 Technique b'+1:ner:_'
-1.623660 Agit b'hUpper'
-1.626987 Strain b'symb'
-1.679073 O b'-1:lemma:ml'
-1.689936 O b'lemma:nacl'
-1.702622 Supp b'+1:lemma:nacl'
-1.721335 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-1.744902 OD b'+1:postag:NN'
-1.769507 O b'+1:lemma:genome'
-1.799622 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-1.802724 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.806385 O b'-1:lemma:contain'
-1.835684 Supp b'+1:lemma:,'
-1.835684 Supp b'+1:postag:,'
-1.855386 Strain b'hLower'
-1.912011 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.912380 O b'-1:lemma:2'
-1.924347 Supp b'hGreek'
-1.972564 O b'-1:lemma:until'
-1.973213 Gtype b'symb'
-2.041412 O b'+1:lemma:2'
-2.071938 O b'lemma:wt'
-2.089763 O b'lemma:media'
-2.152509 O b'-1:lemma:fresh'
-2.300475 O b'+1:lemma:+'
-2.302993 O b'-1:lemma:vol'
-2.372929 O b'-1:lemma:sample'
-2.437846 O b'+1:lemma:_'
-2.473980 O b'+1:lemma:hour'
-2.665268 O b'-1:lemma:_'
-2.762336 O b'+1:lemma:1'
-2.891788 Technique b'symb'
-3.387512 Temp b'+1:lemma:with'
-4.032646 Phase b'hUpper'
-6.113182 O b'-1:lemma::'