report_S1_False_S2_False_v2.txt 17.6 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70_v4.txt

best params:{'c1': 0.004866974423027767, 'c2': 0.056472219713063834}
best CV score:0.7979749356861161
model size: 0.13M

Flat F1: 0.788756583016598
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     0.405     0.577        37
         pH      1.000     1.000     1.000        12
  Technique      0.952     0.909     0.930        22
        Med      0.891     0.860     0.875        57
       Temp      0.818     1.000     0.900        18
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         0
      Phase      1.000     0.895     0.944        19
        Air      0.754     0.742     0.748        62
       Anti      1.000     0.444     0.615         9
     Strain      1.000     1.000     1.000         1
      Gtype      0.862     0.764     0.810       106
  Substrain      0.000     0.000     0.000         1
       Supp      0.865     0.662     0.750       136
   Gversion      0.000     0.000     0.000         0

avg / total      0.876     0.735     0.789       480


Top likely transitions:
OD     -> OD      5.351049
Med    -> Med     4.871670
Temp   -> Temp    4.705964
Air    -> Air     4.663634
Anti   -> Anti    4.552648
Agit   -> Agit    4.406608
O      -> O       4.159955
Gversion -> Gversion 4.029197
Phase  -> Phase   3.961410
Gtype  -> Gtype   3.736759
Supp   -> Supp    3.715319
Technique -> Technique 2.638663
pH     -> pH      2.247503
O      -> Supp    1.602461
Substrain -> Gtype   1.572374
Gtype  -> Supp    1.509554
Air    -> O       1.254615
Technique -> Air     1.032953
O      -> Gtype   1.031819
O      -> Technique 0.950111
Gtype  -> pH      0.787931
O      -> Temp    0.697463
O      -> Anti    0.689482
Gtype  -> Air     0.553152
Med    -> O       0.452122
O      -> Strain  0.249152
O      -> pH      0.230580
OD     -> Phase   0.217826
Phase  -> O       0.176822
O      -> Vess    0.163152
O      -> Gversion 0.124767
Supp   -> O       0.087651
Temp   -> O       0.034867
Strain -> Substrain -0.000001
Substrain -> Phase   -0.000221
Strain -> Gversion -0.003698
Vess   -> Technique -0.004821
Temp   -> Substrain -0.012876
Agit   -> Gversion -0.014323
Temp   -> Strain  -0.014360
Temp   -> Vess    -0.017410
Substrain -> Med     -0.018817
pH     -> Agit    -0.019211
Med    -> Agit    -0.020010
Gversion -> Agit    -0.021113
Phase  -> Vess    -0.022758
O      -> Phase   -0.024164
Med    -> Strain  -0.025997
pH     -> Phase   -0.028833
pH     -> Anti    -0.029581


Top unlikely transitions:
Technique -> Med     -0.461151
O      -> Agit    -0.476494
Gtype  -> Temp    -0.480794
Technique -> O       -0.518387
Gtype  -> Phase   -0.520282
Air    -> Temp    -0.525360
Gversion -> Technique -0.535188
Air    -> Gtype   -0.543291
Anti   -> Gtype   -0.553848
Technique -> Gversion -0.562140
OD     -> Anti    -0.571138
Gversion -> Air     -0.589331
OD     -> Temp    -0.589841
Anti   -> OD      -0.591125
Supp   -> pH      -0.600581
Supp   -> Phase   -0.607554
Med    -> Air     -0.627218
OD     -> Supp    -0.663510
Air    -> Supp    -0.665817
OD     -> Technique -0.667134
Air    -> Med     -0.686105
Gtype  -> Technique -0.710838
Air    -> OD      -0.743300
Technique -> Supp    -0.744356
Phase  -> Technique -0.789682
Temp   -> Med     -0.799451
Supp   -> Anti    -0.809910
Supp   -> Temp    -0.821276
OD     -> Med     -0.825536
Gtype  -> Gversion -0.857454
Supp   -> OD      -0.882092
Supp   -> Technique -0.895485
Supp   -> Air     -0.917425
O      -> Air     -0.919505
Supp   -> Gversion -0.925617
Gtype  -> Med     -0.929322
Supp   -> Gtype   -0.987028
OD     -> Gtype   -0.992669
Gtype  -> Anti    -1.017609
Agit   -> O       -1.031217
Gtype  -> OD      -1.100242
OD     -> O       -1.178810
Substrain -> O       -1.224261
OD     -> Air     -1.229479
Supp   -> Med     -1.270572
Technique -> OD      -1.299192
Technique -> Gtype   -1.368938
Technique -> pH      -1.381051
Med    -> Supp    -1.415487
Phase  -> OD      -1.647415


Top positive:
6.440045 O        b'lemma:_'
5.284742 O        b'lemma:1'
4.692157 Air      b'lemma:anaerobic'
4.658957 O        b'lemma:2'
4.619385 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.561015 Strain   b'lemma:k-12'
4.494705 Supp     b'lemma:Iron'
4.430737 Technique b'lemma:chipseq'
4.213284 O        b'lemma:rpob'
4.193080 Air      b'lemma:aerobic'
4.127725 Phase    b'lemma:stationary'
4.112519 Supp     b'lemma:pq'
4.107025 Supp     b'lemma:nh4cl'
4.068762 O        b'postag:IN'
3.990976 Supp     b'lemma:glucose'
3.981614 O        b'lemma:3'
3.895423 O        b'lemma:rep1'
3.893328 Gtype    b'lemma:arca8myc'
3.831178 Gtype    b'lemma:wt'
3.766316 Gtype    b'lemma:flag-tag'
3.766316 Gtype    b'-1:lemma:c-terminal'
3.741501 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
3.650417 Phase    b'lemma:mid-log'
3.632631 O        b'lemma:rep2'
3.630470 Substrain b'lemma:mg1655'
3.547965 Gversion b'lemma:asm584v2'
3.532543 Supp     b'lemma:acetate'
3.517907 O        b'lemma:Cra'
3.498084 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.480891 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
3.424575 Supp     b'lemma:no3'
3.422537 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.363386 Supp     b'lemma:nitrate'
3.346533 O        b'lemma:b'
3.329553 O        b'-1:lemma:tag'
3.312533 O        b'lemma:rep3'
3.288138 O        b'postag::'
3.274111 O        b'lemma:a'
3.231297 Technique b'lemma:rna-seq'
3.218715 O        b'lemma:.'
3.218715 O        b'postag:.'
3.215008 Gtype    b'lemma:delta-arca'
3.202775 Supp     b'lemma:Fe'
3.165237 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
3.155991 Air      b'lemma:Aerobic'
3.133804 Supp     b'lemma:dpd'
3.090343 Med      b'lemma:LB'
3.073422 Technique b'lemma:chip-seq'
3.060962 Med      b'lemma:lb'
3.050123 O        b'postag:VBN'
3.028391 Med      b'lemma:MOPS'
3.017487 O        b'+1:postag:RB'
2.979906 Anti     b'lemma:none'
2.978981 O        b'-1:lemma:Aerobic'
2.962117 Supp     b'lemma:fructose'
2.953345 O        b'lemma:\xcf\x8332'
2.890455 Anti     b'lemma:seqa'
2.860514 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.856286 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.827313 O        b'lemma:CEL'
2.783360 Technique b'lemma:rnaseq'
2.775420 Med      b'+1:lemma:0.4'
2.774305 OD       b'lemma:od600'
2.753373 O        b'lemma:-'
2.742915 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.675772 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
2.630113 Supp     b'+1:lemma:1'
2.629618 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
2.620392 Vess     b'lemma:flask'
2.620392 Vess     b'-1:lemma:warm'
2.618241 O        b'lemma:affyexp'
2.609048 pH       b'lemma:ph5'
2.609048 pH       b'+1:lemma:.5'
2.605367 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.605338 Gtype    b'+1:lemma:type'
2.604381 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
2.603271 Air      b'postag:RB'
2.594594 Gtype    b'+1:lemma:with'
2.582369 O        b'lemma:Custom'
2.567820 Gtype    b'lemma:type'
2.567689 Gversion b'lemma:nc'
2.557861 Supp     b'-1:lemma:Cra'
2.552038 OD       b'lemma:od450'
2.550932 Gtype    b'lemma:nsrr'
2.550177 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.524549 O        b'+1:lemma:od600'
2.502467 O        b'-1:lemma:glucose'
2.498403 Gtype    b'lemma:wild-type'
2.496663 Supp     b'lemma:arginine'
2.495738 Supp     b'+1:lemma:_'
2.483625 O        b'lemma:chip-arca'
2.479625 O        b'lemma:with'
2.455411 Supp     b'+1:lemma:2'
2.454463 Gtype    b'lemma:WT'
2.388316 O        b'-1:lemma:stpa'
2.376289 O        b'lemma:s'
2.368051 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.360684 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
2.349033 O        b'lemma:argr'
2.347947 Strain   b'+1:lemma:substr'
2.329446 O        b'lemma:oxyr'
2.326483 Gversion b'lemma:u00096'
2.326483 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.322186 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.319676 Anti     b'lemma:anti-myc'
2.310676 Gversion b'lemma:.2'
2.310676 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.309895 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.304666 O        b'-1:lemma:lb'
2.286012 Gversion b'-1:lemma:nc'
2.283995 Med      b'+1:lemma:2.0'
2.263722 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.251060 Technique b'-1:lemma:IP'
2.241105 O        b'postag:CC'
2.233213 O        b'postag:SYM'
2.228846 Air      b'lemma:Anaerobic'
2.221020 O        b'+1:lemma:pq'
2.217171 O        b'lemma:purr'
2.215541 Med      b'lemma:m63'
2.210660 Gversion b'lemma:000913'
2.208620 Phase    b'lemma:phase'
2.200256 Air      b'lemma:anaerobically'
2.160285 Supp     b'lemma:nacl'
2.159816 O        b'lemma:Lrp'
2.146260 O        b'+1:lemma:anti-fur'
2.142375 Gtype    b'+1:lemma:pq'
2.137685 O        b'lemma:ompr'
2.137493 O        b'-1:lemma:0.3-0.35'
2.135033 pH       b'+1:postag:CD'
2.132965 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.132516 Air      b'-1:lemma:-'
2.129831 O        b'lemma:or'
2.127593 Air      b'-1:postag::'
2.100892 Technique b'postag:NNP'
2.095024 Air      b'-1:lemma:_'
2.079808 Gtype    b'lemma:ptac'
2.078817 Med      b'postag:NNP'
2.065995 Supp     b'lemma:Leu'
2.045237 O        b'lemma:chip'
2.027925 Temp     b'lemma:43'
2.022011 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
2.015716 Supp     b'-1:lemma:+'
2.010073 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.008340 Temp     b'-1:lemma:37'
2.004601 Temp     b'-1:lemma:43'
1.996465 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.996465 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.991818 Anti     b'+1:lemma:antibody'
1.986009 Gtype    b'lemma:pk4854'
1.981713 Technique b'-1:lemma:input'
1.981625 Med      b'+1:lemma:+'
1.979648 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.974870 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.973288 O        b'lemma:chip-fnr'
1.969889 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
1.968489 O        b'-1:lemma:type'
1.959681 Supp     b'lemma:iptg'
1.950150 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.947863 Supp     b'lemma:Adenine'
1.947687 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.941978 Anti     b'lemma:anti-rpos'
1.937288 Med      b'-1:lemma:ml'
1.924562 Gtype    b'+1:lemma:aerobic'
1.924487 Phase    b'+1:lemma:for'
1.922675 O        b'postag:DT'
1.914419 Supp     b'+1:lemma:hour'
1.913395 O        b'+1:lemma:43'
1.912727 O        b'lemma:Fur'
1.876476 O        b'lemma:genotype/variation'
1.869806 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.868961 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.867289 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.863790 Supp     b'lemma:methanol'
1.861757 Supp     b'lemma:20'
1.857902 Supp     b'-1:lemma:with'
1.856991 OD       b'+1:lemma:stationary'
1.852369 Temp     b'-1:lemma:sample'
1.848158 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.846987 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
1.845305 O        b'lemma:for'
1.843025 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.842623 O        b'postag:VBG'
1.827664 Gversion b'postag:CD'
1.820283 O        b'lemma:soxs'
1.820283 O        b'lemma:soxr'
1.820233 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
1.815561 Supp     b'+1:lemma:respiratory'
1.810671 O        b'lemma:culture'
1.809579 pH       b'lemma:.5'
1.809579 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.802708 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
1.802434 Temp     b'lemma:37'
1.802103 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.788823 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.787884 Supp     b'+1:lemma:deficient'
1.781577 O        b'lemma:at'
1.774963 O        b'lemma:pt7'
1.766232 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.758278 Gversion b'lemma:_'
1.754083 Supp     b'+1:lemma:and'


Top negative:
-0.165340 O        b'-1:lemma:with'
-0.170223 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.171143 Med      b'-1:lemma:MOPS'
-0.171691 O        b'lemma:co2'
-0.172496 O        b'+1:lemma:antibody'
-0.173573 O        b'-1:lemma:control'
-0.175923 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.178273 O        b'+1:lemma:purify'
-0.178964 Gtype    b'+1:lemma:1'
-0.179388 O        b'lemma:medium'
-0.190175 Gtype    b'+1:lemma:-lrb-'
-0.193476 Anti     b'+1:postag:JJ'
-0.194108 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.195669 O        b'lemma:n2'
-0.198645 O        b'-1:lemma:300'
-0.201659 O        b'-1:lemma:of'
-0.210827 O        b'lemma:aerobically'
-0.216287 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.216954 Gtype    b'+1:lemma:2'
-0.222719 Technique b'-1:lemma::'
-0.225921 Gtype    b'lemma:rna'
-0.227807 O        b'+1:lemma:sample'
-0.229277 Gtype    b'+1:postag:NNS'
-0.232261 O        b'-1:lemma:n2'
-0.233570 Gtype    b'-1:lemma:-'
-0.237526 OD       b'+1:lemma:in'
-0.240536 Gtype    b'lemma:control'
-0.242225 Phase    b'-1:postag:NN'
-0.252367 O        b'-1:lemma:delta'
-0.255317 O        b'-1:postag:VBP'
-0.255936 O        b'-1:lemma:rna'
-0.260735 Gtype    b'postag:NNS'
-0.263059 O        b'-1:lemma:e.'
-0.265319 O        b'+1:lemma:from'
-0.273429 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.276572 O        b'lemma:e.'
-0.276704 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.276704 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.279370 O        b'postag:RB'
-0.280295 O        b'-1:lemma:grow'
-0.282926 O        b'+1:lemma:mg1655'
-0.288333 O        b'lemma:10'
-0.289288 O        b'lemma:pahse'
-0.291441 Gtype    b'+1:lemma:cra'
-0.295834 Air      b'postag:CD'
-0.300317 O        b'lemma:nacl'
-0.302273 Supp     b'+1:postag:IN'
-0.304479 O        b'lemma:30'
-0.305051 O        b'-1:lemma:purify'
-0.306221 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.306561 OD       b'+1:lemma:and'
-0.315073 Supp     b'lemma:and'
-0.317269 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.320606 O        b'+1:lemma:delta'
-0.324445 O        b'+1:lemma:%'
-0.328680 O        b'+1:lemma:or'
-0.335995 Gtype    b'lemma:ompr'
-0.337994 Med      b'postag:CD'
-0.339794 O        b'+1:lemma:-lcb-'
-0.341876 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.348075 OD       b'+1:postag:CC'
-0.350623 O        b'+1:lemma:strain'
-0.351953 O        b'-1:lemma:mm'
-0.354366 Med      b'+1:postag:NN'
-0.359119 Gtype    b'+1:lemma:a'
-0.368580 Med      b'-1:postag:CD'
-0.369042 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.369832 O        b'+1:lemma:phase'
-0.374612 O        b'-1:lemma:um'
-0.374612 O        b'+1:lemma:paraquat'
-0.378047 Gtype    b'-1:postag:CD'
-0.378990 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
-0.382063 O        b'+1:lemma:cell'
-0.383941 O        b'lemma:minimal'
-0.383980 Temp     b'postag:JJ'
-0.384553 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.390868 O        b'+1:lemma:until'
-0.397770 Technique b'-1:postag::'
-0.403782 O        b'+1:postag:IN'
-0.420663 Supp     b'+1:lemma:glucose'
-0.421882 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.423208 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.425203 O        b'lemma:8'
-0.425322 O        b'lemma:phase'
-0.426379 Gtype    b'+1:lemma:b'
-0.436102 O        b'+1:lemma:shake'
-0.441221 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.444583 Air      b'-1:lemma:or'
-0.447161 Supp     b'-1:postag:VBG'
-0.448411 Med      b'+1:postag:NNS'
-0.460422 O        b'-1:lemma:affinity'
-0.461216 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.467958 O        b'-1:lemma:cra'
-0.469465 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.469624 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.477155 O        b'-1:lemma:20'
-0.479874 O        b'lemma:of'
-0.505244 O        b'lemma:glucose'
-0.508080 O        b'-1:lemma:from'
-0.508329 Phase    b'postag:JJ'
-0.519825 O        b'lemma:mg1655'
-0.520316 O        b'+1:lemma:0.4'
-0.531961 Gtype    b'lemma:_'
-0.540846 O        b'lemma:dissolve'
-0.541927 Temp     b'+1:lemma:to'
-0.541927 Temp     b'+1:postag:TO'
-0.543538 OD       b'+1:lemma:mid-log'
-0.554268 Phase    b'-1:lemma:at'
-0.567076 O        b'lemma:150'
-0.567076 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.586115 O        b'+1:lemma:Aerobic'
-0.590065 OD       b'+1:postag:NN'
-0.591060 O        b'+1:lemma:b'
-0.601984 OD       b'lemma:-lrb-'
-0.602651 O        b'-1:lemma:30'
-0.610779 Gtype    b'-1:postag:SYM'
-0.611922 O        b'-1:lemma:chip-exo'
-0.624890 pH       b'postag:NN'
-0.628877 Supp     b'postag:CC'
-0.642872 O        b'lemma:lb'
-0.645246 O        b'+1:lemma:rep1'
-0.646910 O        b'+1:postag:NNS'
-0.648451 Gtype    b'-1:postag:DT'
-0.656497 O        b'+1:lemma:c'
-0.671297 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.672555 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.675146 Med      b'+1:postag:IN'
-0.684210 OD       b'postag:-LRB-'
-0.690268 O        b'lemma:m63'
-0.692418 O        b'lemma:purify'
-0.711910 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.714120 O        b'+1:lemma:300'
-0.719637 O        b'+1:lemma:arginine'
-0.720246 Temp     b'postag:NN'
-0.723885 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.729214 O        b'-1:lemma:until'
-0.731048 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.733838 O        b'-1:lemma:1'
-0.754956 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.760036 O        b'-1:lemma:od600'
-0.785671 Anti     b'+1:lemma:anti-fur'
-0.789666 OD       b'postag:JJ'
-0.822362 O        b'lemma:dpd'
-0.825176 O        b'-1:lemma:o2'
-0.856382 O        b'-1:lemma:~'
-0.858874 O        b'lemma:od600'
-0.861229 O        b'+1:lemma:0.3'
-0.867648 O        b'lemma:media'
-0.877526 O        b'+1:lemma:in'
-0.899345 O        b'+1:lemma:at'
-0.903562 Gtype    b'lemma:delta'
-0.909951 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.924018 O        b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.936952 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.937687 O        b'lemma:anaerobically'
-0.958929 O        b'lemma:0.3'
-0.977286 Air      b'-1:postag:JJ'
-0.979403 O        b'lemma:20'
-0.989887 O        b'lemma:0.1'
-1.003141 O        b'lemma:mid-log'
-1.016700 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-1.042214 O        b'lemma:2h'
-1.042214 O        b'-1:lemma:additional'
-1.072377 O        b'+1:postag:VBG'
-1.075398 O        b'-1:lemma:dissolve'
-1.075398 O        b'+1:lemma:methanol'
-1.082645 O        b'+1:lemma:g/l'
-1.096557 O        b'lemma:anaerobic'
-1.126451 O        b'lemma:0.2'
-1.166660 O        b'lemma:\xe2\x88\x86'
-1.172209 O        b'lemma:fecl2'
-1.173636 O        b'+1:lemma:supplement'
-1.193870 O        b'-1:postag:VBG'
-1.194541 O        b'-1:lemma:ompr'
-1.232022 O        b'lemma:k-12'
-1.253980 O        b'lemma:\xce\xb4fur'
-1.288532 O        b'-1:lemma:ml'
-1.301101 O        b'postag:VBP'
-1.312157 O        b'-1:lemma:co2'
-1.347620 O        b'-1:lemma:rpob'
-1.379029 O        b'-1:postag::'
-1.416689 Supp     b'postag:JJ'
-1.422574 O        b'-1:lemma:37'
-1.454115 O        b'-1:lemma:sample'
-1.461328 O        b'lemma:37'
-1.464702 Anti     b'postag:NNP'
-1.488429 Air      b'+1:postag:JJ'
-1.542774 O        b'lemma:rifampicin'
-1.620387 O        b'-1:lemma:2'
-1.621084 O        b'lemma:wt'
-1.634867 Air      b'postag:NN'
-1.635440 O        b'-1:lemma:IP'
-1.705295 O        b'lemma:methanol'
-1.742392 O        b'+1:lemma:+'
-1.747036 O        b'-1:lemma:nsrr'
-1.856713 O        b'+1:lemma:hour'
-1.966783 O        b'+1:lemma:2'
-2.387888 O        b'+1:lemma:1'
-2.893303 O        b'-1:lemma::'
-2.945684 O        b'-1:lemma:_'