report_Run9_v13.txt
43.1 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
1217
1218
1219
1220
1221
1222
1223
1224
1225
1226
1227
1228
1229
1230
1231
1232
1233
1234
1235
1236
1237
1238
1239
1240
1241
1242
1243
1244
1245
1246
1247
1248
1249
1250
1251
1252
1253
1254
1255
1256
1257
1258
1259
1260
1261
1262
1263
1264
1265
1266
1267
1268
1269
1270
1271
1272
1273
1274
1275
1276
1277
1278
1279
1280
1281
1282
1283
1284
1285
1286
1287
1288
1289
1290
1291
1292
1293
1294
1295
1296
1297
1298
1299
1300
1301
1302
1303
1304
1305
1306
1307
1308
1309
1310
1311
1312
1313
1314
1315
1316
1317
1318
1319
1320
1321
1322
1323
1324
1325
1326
1327
1328
1329
1330
1331
1332
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.04108139617306734, 'c2': 0.08977662168776374}
best CV score:0.8163619170548052
model size: 0.10M
Flat F1: 0.8025473080699075
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.804 0.891 56
Temp 0.857 0.800 0.828 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.590 0.557 0.573 88
Anti 0.667 0.615 0.640 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.886 0.795 0.838 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.858 0.846 0.852 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.839 0.773 0.803 484
Top likely transitions:
Anti -> Anti 4.429431
Med -> Med 4.421689
Supp -> Supp 4.418095
Temp -> Temp 4.234402
OD -> OD 4.216995
Air -> Air 4.081416
Gversion -> Gversion 3.708232
Phase -> Phase 3.335044
Gtype -> Gtype 3.189384
Technique -> Technique 3.120050
pH -> pH 3.053534
O -> O 2.902240
Agit -> Agit 2.224544
Technique -> Air 1.625220
Substrain -> Gtype 1.424334
Gtype -> Supp 1.049488
Air -> O 0.876890
O -> Supp 0.621510
Gtype -> pH 0.599222
O -> Technique 0.473811
Strain -> O 0.254176
Supp -> O 0.233046
O -> Strain 0.168722
Anti -> O 0.117962
Phase -> Air 0.083425
O -> Gtype 0.078424
O -> Vess 0.062837
O -> pH 0.055837
pH -> O 0.027240
Gtype -> Air 0.024851
Temp -> O 0.002566
pH -> Gversion -0.000001
Air -> pH -0.000003
Med -> Anti -0.000123
Gversion -> OD -0.003986
Substrain -> pH -0.004238
Gtype -> Vess -0.012002
Air -> Anti -0.013551
Temp -> Anti -0.013886
Anti -> Phase -0.016600
Agit -> Technique -0.029280
Technique -> Anti -0.030187
Supp -> Agit -0.031936
Gversion -> pH -0.034761
O -> Temp -0.041361
Phase -> Temp -0.047595
Air -> Gversion -0.048466
Temp -> OD -0.056064
Phase -> pH -0.058424
Gtype -> Strain -0.067217
Technique -> Temp -0.069040
Technique -> O -0.069104
Phase -> Anti -0.071196
Anti -> pH -0.079546
Temp -> Technique -0.079577
Agit -> Gtype -0.081266
pH -> Air -0.083457
Strain -> Supp -0.090215
Med -> pH -0.093354
Anti -> Air -0.094992
Technique -> Med -0.099888
Air -> Med -0.101758
Med -> OD -0.104883
Gtype -> Substrain -0.116172
pH -> Temp -0.120130
O -> Agit -0.122451
Agit -> Supp -0.123114
pH -> Gtype -0.129843
Anti -> Temp -0.131261
O -> Phase -0.135361
Anti -> OD -0.139403
Technique -> Gversion -0.145975
Substrain -> Supp -0.148461
Anti -> Med -0.151369
OD -> Med -0.154019
Air -> Temp -0.159097
OD -> Technique -0.174107
Agit -> O -0.179401
Strain -> Gtype -0.179634
Gtype -> Agit -0.180985
Gversion -> Temp -0.189243
OD -> Gtype -0.208327
Agit -> Air -0.219134
Med -> Temp -0.220840
pH -> Supp -0.225809
Med -> Technique -0.249170
Air -> Phase -0.260245
Anti -> Technique -0.262968
Temp -> Supp -0.265547
Air -> OD -0.273895
Temp -> Air -0.275909
O -> Gversion -0.276366
Phase -> Med -0.278675
Gversion -> Air -0.279574
Gversion -> Technique -0.282883
Supp -> Air -0.287005
Med -> O -0.288443
Supp -> Phase -0.302106
Air -> Technique -0.302853
Anti -> Supp -0.307806
Temp -> Med -0.317546
Supp -> Anti -0.321195
Phase -> O -0.329418
Phase -> Gtype -0.344908
Med -> Air -0.356947
Gversion -> Supp -0.359834
Phase -> Supp -0.362580
O -> Med -0.367972
OD -> Temp -0.376190
Supp -> pH -0.379460
Temp -> Gtype -0.382674
Supp -> Gversion -0.385664
Gversion -> Gtype -0.401332
Supp -> OD -0.407119
Med -> Gtype -0.412218
Technique -> OD -0.429004
OD -> O -0.438951
Supp -> Temp -0.442714
Air -> Gtype -0.477810
Air -> Supp -0.489129
Air -> Agit -0.502039
Gtype -> Temp -0.514599
Phase -> Technique -0.517562
Gtype -> OD -0.527504
Technique -> Supp -0.532519
Anti -> Gtype -0.561997
Gtype -> Phase -0.584354
O -> OD -0.610440
OD -> Supp -0.612608
Supp -> Technique -0.667681
Gversion -> O -0.692133
Supp -> Gtype -0.696831
Supp -> Med -0.723503
Gtype -> Med -0.729062
O -> Anti -0.759181
Gtype -> Technique -0.822693
Phase -> OD -0.831939
Gtype -> Gversion -0.842257
Gtype -> Anti -0.913423
OD -> Air -1.045110
Gtype -> O -1.123288
Technique -> Gtype -1.126014
Substrain -> O -1.214928
O -> Air -1.259315
Technique -> pH -1.411335
Med -> Supp -1.589386
Top unlikely transitions:
Anti -> Anti 4.429431
Med -> Med 4.421689
Supp -> Supp 4.418095
Temp -> Temp 4.234402
OD -> OD 4.216995
Air -> Air 4.081416
Gversion -> Gversion 3.708232
Phase -> Phase 3.335044
Gtype -> Gtype 3.189384
Technique -> Technique 3.120050
pH -> pH 3.053534
O -> O 2.902240
Agit -> Agit 2.224544
Technique -> Air 1.625220
Substrain -> Gtype 1.424334
Gtype -> Supp 1.049488
Air -> O 0.876890
O -> Supp 0.621510
Gtype -> pH 0.599222
O -> Technique 0.473811
Strain -> O 0.254176
Supp -> O 0.233046
O -> Strain 0.168722
Anti -> O 0.117962
Phase -> Air 0.083425
O -> Gtype 0.078424
O -> Vess 0.062837
O -> pH 0.055837
pH -> O 0.027240
Gtype -> Air 0.024851
Temp -> O 0.002566
pH -> Gversion -0.000001
Air -> pH -0.000003
Med -> Anti -0.000123
Gversion -> OD -0.003986
Substrain -> pH -0.004238
Gtype -> Vess -0.012002
Air -> Anti -0.013551
Temp -> Anti -0.013886
Anti -> Phase -0.016600
Agit -> Technique -0.029280
Technique -> Anti -0.030187
Supp -> Agit -0.031936
Gversion -> pH -0.034761
O -> Temp -0.041361
Phase -> Temp -0.047595
Air -> Gversion -0.048466
Temp -> OD -0.056064
Phase -> pH -0.058424
Gtype -> Strain -0.067217
Technique -> Temp -0.069040
Technique -> O -0.069104
Phase -> Anti -0.071196
Anti -> pH -0.079546
Temp -> Technique -0.079577
Agit -> Gtype -0.081266
pH -> Air -0.083457
Strain -> Supp -0.090215
Med -> pH -0.093354
Anti -> Air -0.094992
Technique -> Med -0.099888
Air -> Med -0.101758
Med -> OD -0.104883
Gtype -> Substrain -0.116172
pH -> Temp -0.120130
O -> Agit -0.122451
Agit -> Supp -0.123114
pH -> Gtype -0.129843
Anti -> Temp -0.131261
O -> Phase -0.135361
Anti -> OD -0.139403
Technique -> Gversion -0.145975
Substrain -> Supp -0.148461
Anti -> Med -0.151369
OD -> Med -0.154019
Air -> Temp -0.159097
OD -> Technique -0.174107
Agit -> O -0.179401
Strain -> Gtype -0.179634
Gtype -> Agit -0.180985
Gversion -> Temp -0.189243
OD -> Gtype -0.208327
Agit -> Air -0.219134
Med -> Temp -0.220840
pH -> Supp -0.225809
Med -> Technique -0.249170
Air -> Phase -0.260245
Anti -> Technique -0.262968
Temp -> Supp -0.265547
Air -> OD -0.273895
Temp -> Air -0.275909
O -> Gversion -0.276366
Phase -> Med -0.278675
Gversion -> Air -0.279574
Gversion -> Technique -0.282883
Supp -> Air -0.287005
Med -> O -0.288443
Supp -> Phase -0.302106
Air -> Technique -0.302853
Anti -> Supp -0.307806
Temp -> Med -0.317546
Supp -> Anti -0.321195
Phase -> O -0.329418
Phase -> Gtype -0.344908
Med -> Air -0.356947
Gversion -> Supp -0.359834
Phase -> Supp -0.362580
O -> Med -0.367972
OD -> Temp -0.376190
Supp -> pH -0.379460
Temp -> Gtype -0.382674
Supp -> Gversion -0.385664
Gversion -> Gtype -0.401332
Supp -> OD -0.407119
Med -> Gtype -0.412218
Technique -> OD -0.429004
OD -> O -0.438951
Supp -> Temp -0.442714
Air -> Gtype -0.477810
Air -> Supp -0.489129
Air -> Agit -0.502039
Gtype -> Temp -0.514599
Phase -> Technique -0.517562
Gtype -> OD -0.527504
Technique -> Supp -0.532519
Anti -> Gtype -0.561997
Gtype -> Phase -0.584354
O -> OD -0.610440
OD -> Supp -0.612608
Supp -> Technique -0.667681
Gversion -> O -0.692133
Supp -> Gtype -0.696831
Supp -> Med -0.723503
Gtype -> Med -0.729062
O -> Anti -0.759181
Gtype -> Technique -0.822693
Phase -> OD -0.831939
Gtype -> Gversion -0.842257
Gtype -> Anti -0.913423
OD -> Air -1.045110
Gtype -> O -1.123288
Technique -> Gtype -1.126014
Substrain -> O -1.214928
O -> Air -1.259315
Technique -> pH -1.411335
Med -> Supp -1.589386
Top positive:
6.188122 O b'lemma:_'
4.701661 Air b'lemma:anaerobic'
4.549166 Supp b'lemma:Iron'
4.491427 O b'lemma:1'
4.470134 Technique b'lemma:chipseq'
4.374055 Strain b'lemma:k-12'
4.208801 Phase b'lemma:mid-log'
4.162350 O b'lemma:2'
3.875889 Gtype b'lemma:wt'
3.670111 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.593505 Supp b'lemma:2h'
3.593505 Supp b'-1:lemma:additional'
3.590963 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.557053 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.533236 Supp b'lemma:pq'
3.463051 Supp b'lemma:no3'
3.412479 O b'lemma:b'
3.387359 O b'lemma:Cra'
3.333065 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
3.326798 O b'lemma:3'
3.247804 O b'lemma:rpob'
3.238607 Phase b'lemma:stationary'
3.238607 Phase b'lemma:exponential'
3.217808 O b'postag:IN'
3.213151 Air b'lemma:aerobically'
3.179034 O b'postag::'
3.171084 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
3.031755 O b'lemma:rep2'
3.031755 O b'lemma:rep1'
3.021228 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
3.005619 Med b'lemma:lb'
3.002407 O b'-1:lemma:tag'
2.976350 Substrain b'lemma:mg1655'
2.936845 Med b'lemma:LB'
2.936604 Gversion b'lemma:asm584v2'
2.909327 O b'lemma:CEL'
2.874389 Supp b'lemma:iptg'
2.843183 Air b'lemma:aerobic'
2.774475 Supp b'lemma:nh4cl'
2.773837 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.772226 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.755039 Gtype b'lemma:type'
2.746199 Supp b'lemma:dpd'
2.656298 Strain b'+1:lemma:substr'
2.656177 O b'+1:lemma:pq'
2.655274 O b'lemma:-'
2.644290 Gtype b'+1:lemma:type'
2.594776 Supp b'+1:lemma:Deficient'
2.592567 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.583681 O b'lemma:purr'
2.578648 O b'-1:lemma:0.3'
2.549228 Technique b'lemma:rna-seq'
2.524582 pH b'lemma:ph5'
2.524582 pH b'+1:lemma:.5'
2.520698 O b'postag:VBG'
2.471630 Vess b'lemma:flask'
2.471630 Vess b'-1:lemma:warm'
2.448806 Med b'+1:lemma:0.4'
2.447882 O b'-1:lemma:glucose'
2.446986 O b'lemma:\xcf\x8332'
2.446602 Air b'-1:lemma:-'
2.427592 Gtype b'lemma:arca8myc'
2.421875 Gtype b'-1:ner:GEN'
2.421098 Med b'lemma:MOPS'
2.410100 Air b'postag:RB'
2.388187 O b'lemma:.'
2.388187 O b'postag:.'
2.370829 Air b'-1:lemma:co2'
2.360786 O b'lemma:a'
2.319564 Gtype b'+1:lemma:pq'
2.292308 Supp b'lemma:glucose'
2.290580 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.282016 Gtype b'lemma:dfnr'
2.257511 Gversion b'lemma:u00096'
2.257511 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.244632 O b'lemma:affyexp'
2.237762 Gversion b'lemma:.2'
2.237762 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.223341 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.223341 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.216099 Med b'-1:lemma:ml'
2.210589 Supp b'+1:lemma:iptg'
2.196605 Supp b'-1:lemma:with'
2.193505 Gversion b'lemma:nc'
2.186662 Technique b'lemma:rnaseq'
2.186369 Agit b'+1:lemma:rpm'
2.176490 Supp b'lemma:nacl'
2.172108 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.158215 Technique b'lemma:chip-seq'
2.152389 Gtype b'lemma:WT'
2.152206 Gtype b'+1:lemma:with'
2.137405 O b'+1:lemma:wt'
2.117852 Anti b'lemma:none'
2.116925 O b'+1:lemma:od600'
2.103466 Anti b'lemma:\xcf\x8332'
2.073006 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.070341 Air b'lemma:anaeroibc'
2.066565 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
2.066482 Supp b'lemma:Adenine'
2.063861 O b'+1:ner:MED'
2.057935 O b'-1:lemma:pq'
2.057469 Vess b'-1:postag:VBN'
2.050716 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.049967 Supp b'+1:lemma:1'
2.036742 O b'-1:lemma:lb'
2.031151 Med b'+1:lemma:2.0'
2.028795 Anti b'lemma:seqa'
2.027684 Supp b'lemma:Fe'
2.015199 Phase b'lemma:phase'
2.006320 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.005427 O b'lemma:ompr'
2.000153 pH b'+1:postag:CD'
1.998682 Med b'lemma:m63'
1.984309 Temp b'-1:lemma:37'
1.981387 Supp b'lemma:acetate'
1.980642 O b'-2:ner:MED'
1.980591 O b'-1:lemma:anaerobic'
1.970036 O b'lemma:soxr'
1.970036 O b'lemma:soxs'
1.962833 Gtype b'lemma:pk4854'
1.960323 O b'lemma:trpr'
1.949803 Agit b'lemma:rpm'
1.945080 O b'lemma:with'
1.941953 Technique b'lemma:chip-exo'
1.941445 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.929202 Supp b'-1:lemma:+'
1.922188 O b'+1:lemma:43'
1.921962 Air b'lemma:Anaerobic'
1.921214 O b'lemma:argr'
1.916270 Gtype b'lemma:wild-type'
1.915782 Gtype b'+2:ner:SUPP'
1.915229 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.908877 Gtype b'-1:lemma:_'
1.903970 Agit b'-1:lemma:250'
1.900419 O b'lemma:chip-arca'
1.890345 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
1.884692 O b'postag:CC'
1.883449 Supp b'+1:lemma:deficient'
1.879381 Med b'lemma:minimal'
1.868960 Supp b'+1:lemma:2'
1.868144 Supp b'-1:lemma:vol'
1.865157 Supp b'lemma:of'
1.860735 Supp b'lemma:Leu'
1.859371 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
1.856955 O b'postag:VBN'
1.854541 Agit b'lemma:250'
1.849849 O b'lemma:chip'
1.843922 O b'+1:lemma:k-12'
1.843776 O b'lemma:treatment'
1.833471 Supp b'lemma:arginine'
1.832058 Gtype b'+1:lemma:_'
1.817604 Gtype b'+1:lemma:ph5'
1.817135 Vess b'+1:lemma:at'
1.797845 Technique b'-1:lemma:IP'
1.790921 Gtype b'lemma:delta-fnr'
1.786662 O b'lemma:at'
1.785521 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.777008 Temp b'lemma:43'
1.776221 OD b'lemma:od450'
1.775310 O b'-1:lemma:type'
1.760829 Gversion b'lemma:000913'
1.760569 Temp b'-1:lemma:43'
1.755894 Gtype b'lemma:ptac'
1.747510 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.747510 Gtype b'-1:lemma:old'
1.746539 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.746539 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.739604 O b'lemma:genotype/variation'
1.734294 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.726156 Med b'lemma:media'
1.711018 O b'postag:DT'
1.702126 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.678472 O b'-1:postag:NNS'
1.677897 O b'lemma:gadx'
1.668438 Substrain b'-1:lemma:.'
1.668438 Substrain b'-1:postag:.'
1.665404 O b'-1:lemma:nacl'
1.662023 OD b'lemma:od600'
1.657990 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
1.653561 Med b'-1:lemma:minimal'
1.635691 OD b'-1:lemma:od450'
1.631730 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.621230 O b'lemma:input'
1.621230 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.620022 Anti b'-1:lemma::'
1.615490 Supp b'+1:lemma:_'
1.613622 Gversion b'lemma:_'
1.603714 Technique b'postag:NNP'
1.600143 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.592037 Med b'postag:NNP'
1.586307 Gtype b'lemma:phtpg'
1.578417 Gtype b'+1:postag::'
1.575968 Med b'-1:lemma:in'
1.575707 Temp b'lemma:37'
1.558826 Air b'-1:lemma:_'
1.556804 O b'-1:lemma:min'
1.554805 O b'lemma:s'
1.552388 Gtype b'lemma:delta-arca'
1.546336 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.544227 Technique b'+1:ner:TF'
1.540727 Gversion b'+1:lemma:genome'
1.538974 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.534362 Med b'-1:postag:JJ'
1.534198 Air b'-1:postag::'
1.533861 O b'lemma:chip-fnr'
1.523999 O b'+1:lemma:coli'
1.516921 O b'-1:lemma:acetate'
1.515189 Temp b'-1:lemma:sample'
1.507161 Supp b'lemma:rifampicin'
1.506675 O b'+1:postag:RB'
1.499129 O b'-1:lemma:l1'
1.498192 Supp b'+1:lemma:hour'
1.497258 Med b'+1:lemma:minimal'
1.496785 OD b'+1:lemma:of'
1.494736 Air b'postag:JJ'
1.494736 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.494048 OD b'lemma:0.3'
1.491981 O b'-1:lemma:wt'
1.488038 Technique b'lemma:-lrb-'
1.488022 O b'-1:lemma:stpa'
1.487797 Air b'-1:lemma:ryhb'
1.485648 Gtype b'lemma:nsrr'
1.474873 Technique b'postag:-LRB-'
1.469181 O b'lemma:A'
1.469012 Technique b'-1:lemma:1'
1.463138 O b'lemma:culture'
1.459313 Gtype b'lemma:wildtype'
1.453557 Med b'lemma:medium'
1.449611 Technique b'-1:lemma:_'
1.431782 O b'-1:lemma:into'
1.429788 Med b'+1:lemma:+'
1.429680 Gtype b'+1:lemma:control'
1.427604 O b'lemma:genotype'
1.424133 pH b'lemma:.5'
1.424133 pH b'-1:lemma:ph5'
1.414710 O b'-1:lemma:nh4cl'
1.411678 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.403557 O b'-1:lemma:.5'
1.398746 Supp b'+1:lemma:min'
1.394415 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.387914 O b'lemma:oxyr'
1.384364 Supp b'-1:lemma:final'
1.382806 O b'lemma:growth'
1.382488 Supp b'+1:lemma:mm'
1.382488 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
1.381281 Gtype b'lemma:flagtag'
1.378418 OD b'-1:lemma:at'
1.376697 O b'lemma:harbor'
1.375950 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.375839 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
1.374692 Gtype b'-1:lemma:wild'
1.373740 Supp b'lemma:fructose'
1.373325 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.369100 O b'-1:lemma:Anaerobic'
1.359102 O b'-1:lemma:aerobic'
1.354151 O b'lemma:Fur'
1.347449 OD b'-1:postag:IN'
1.345494 O b'-1:lemma:no3'
1.333089 O b'-1:lemma:Aerobic'
1.329164 Gtype b'lemma:wild'
1.325704 Supp b'-1:lemma:mm'
1.319932 Supp b'lemma:phosphate'
1.317960 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.315295 Supp b'-1:lemma:contain'
1.314910 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.309074 Anti b'+1:lemma:-lrb-'
1.305691 Strain b'-1:lemma:.'
1.305691 Strain b'-1:postag:.'
1.301977 Med b'-1:lemma:fresh'
1.299427 O b'postag:NNS'
1.294784 Technique b'+1:postag:NN'
1.285407 Phase b'-1:lemma:until'
1.285236 Supp b'+1:lemma:1m'
1.278548 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.277503 Technique b'+1:lemma:rpos'
1.268130 Supp b'-1:lemma:1m'
1.266361 Supp b'-1:postag:CD'
1.264182 O b'lemma:ml'
1.253602 Supp b'lemma:tryptophan'
1.253602 Supp b'-1:lemma:mg/l'
1.250491 Gtype b'postag:JJ'
1.248111 Air b'lemma:Aerobic'
1.247293 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.244876 Technique b'lemma:-rrb-'
1.243224 O b'-1:lemma:phase'
1.242784 O b'lemma:Lrp'
1.242714 O b'lemma:cra'
1.236064 pH b'lemma:5.5'
1.235752 Gtype b'-1:lemma:from'
1.234401 pH b'+1:lemma:5.5'
1.232389 Gversion b'postag:CD'
1.227911 Vess b'+1:postag:IN'
1.227176 Supp b'lemma:glutamine'
1.227176 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.223164 Supp b'-1:lemma:_'
1.216053 pH b'-1:lemma:ph'
1.215619 Anti b'+1:postag:-LRB-'
1.211107 Gtype b'+1:lemma:the'
1.206498 Med b'+1:postag:CD'
1.204502 O b'lemma:acetate'
1.203939 Supp b'-1:lemma:m'
1.196661 Supp b'postag:NNP'
1.196049 Gtype b'-1:lemma::'
1.194465 O b'postag:SYM'
1.194217 O b'+2:ner:KWSUPP'
1.173769 Air b'-1:lemma:%'
1.171037 O b'lemma:C'
1.167156 Gversion b'-1:lemma:the'
1.166258 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
1.165988 O b'+1:lemma:sparging'
1.164050 Air b'-1:postag:CD'
1.158339 O b'lemma:Genome'
1.157762 O b'lemma:antibody'
1.154219 O b'lemma:agitation'
1.152201 Technique b'-1:lemma:2'
1.151541 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
1.145892 O b'+1:lemma:30'
1.145239 O b'lemma:delta'
1.143921 O b'+1:lemma:ph5'
1.142778 Supp b'lemma:1m'
1.140539 Anti b'-1:postag::'
1.139868 Supp b'+1:lemma:mg/l'
1.139351 Anti b'+1:lemma:from'
1.138722 O b'lemma:c'
1.138719 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.135574 O b'+1:lemma:acetate'
1.132513 Med b'-1:lemma:glucose'
1.131514 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.130400 pH b'lemma:ph'
1.129834 Supp b'lemma:Trp'
1.129511 O b'-1:lemma:-80'
1.129312 O b'-1:lemma:fructose'
1.127772 pH b'-1:postag:NN'
1.124464 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.121537 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.113526 pH b'-1:lemma:at'
1.109712 Technique b'-1:lemma:input'
1.109417 O b'-1:ner:TF'
1.108963 O b'+1:lemma:20'
1.107428 O b'-1:lemma:media'
1.106411 O b'-1:lemma:after'
1.106272 O b'-1:lemma:grow'
1.105129 O b'lemma:or'
1.103707 O b'lemma:induction'
1.099335 Anti b'lemma:anti-myc'
1.097168 OD b'+1:postag:IN'
1.089809 Gtype b'+1:lemma:fructose'
1.089635 Air b'+1:lemma:b'
1.088199 Anti b'-1:lemma:fnr'
1.086964 Gtype b'lemma:ryhb'
1.085834 Gversion b'+1:postag:CD'
1.082385 Gtype b'+1:ner:GEN'
1.080149 Air b'+1:lemma:at'
1.079893 Temp b'+1:lemma:and'
1.077879 Gtype b'lemma:oxyr-8myc'
1.077879 Gtype b'lemma:soxr-8myc'
1.077879 Gtype b'lemma:soxs-8myc'
1.076705 Supp b'lemma:final'
1.073933 Supp b'lemma:30'
1.072333 O b'lemma:for'
1.064524 Gtype b'lemma:Wild'
1.063613 Gtype b'lemma:delta-soxr'
1.063613 Gtype b'lemma:delta-gadx'
1.063613 Gtype b'lemma:delta-gadw'
1.063613 Gtype b'lemma:delta-oxyr'
1.063613 Gtype b'lemma:delta-gade'
1.063613 Gtype b'lemma:delta-soxs'
1.062953 Anti b'lemma:anti-rpos'
1.062308 Supp b'lemma:sodium'
1.062224 Gtype b'lemma:\xce\xb4arca'
1.060969 Gtype b'lemma:ompr-8myc'
1.059317 Gtype b'lemma:gade-8myc'
1.059317 Gtype b'lemma:\xce\xb4seqa'
1.059091 O b'lemma:um'
1.058572 Temp b'lemma:sample'
1.058022 O b'-1:lemma:or'
1.056106 O b'-1:ner:_'
1.050851 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
1.048088 OD b'-1:lemma:~'
1.044671 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.043523 O b'+1:lemma::'
1.043116 Phase b'+1:lemma:culture'
1.038957 Supp b'-1:postag:IN'
1.037324 O b'-1:lemma:arginine'
1.035700 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.024993 Supp b'+1:lemma:anaerobically'
1.024259 Phase b'lemma:pahse'
1.023735 Supp b'lemma:cm20'
1.023735 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.022798 O b'lemma:tag'
1.021481 Gtype b'lemma:crp'
1.018910 Technique b'-2:ner:TF'
1.017409 Agit b'-1:postag:CD'
1.016849 Gversion b'-1:postag:DT'
1.012681 O b'lemma::'
1.011347 Supp b'lemma:2g/l'
1.011347 Supp b'+1:lemma:glutamine'
1.010710 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.010710 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.007698 Anti b'lemma:anti-rpob'
1.005690 Gtype b'+1:lemma:nacl'
1.005032 Supp b'-1:lemma:without'
1.001943 O b'+1:lemma:250'
1.000951 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.999421 OD b'+1:lemma:~'
0.997784 O b'+2:ner:_'
0.995409 Med b'+1:lemma:-lrb-'
0.995258 Med b'lemma:2'
0.992450 Gtype b'lemma:purr-8myc'
0.989266 Phase b'+1:lemma:phase'
0.988621 OD b'+1:lemma:0.3'
0.984780 Technique b'postag:-RRB-'
0.984541 OD b'+1:lemma:,'
0.984541 OD b'+1:postag:,'
0.983626 O b'lemma:genbank'
0.980100 Air b'-1:lemma:phase'
0.978437 Gtype b'-1:postag::'
0.978186 Air b'+1:lemma:%'
0.977831 Med b'+1:postag:-LRB-'
0.976614 O b'lemma:contain'
0.976483 Gtype b'lemma:fnr-8myc'
0.967965 OD b'postag:CD'
0.965026 O b'lemma:to'
0.965026 O b'postag:TO'
0.964824 Med b'+1:lemma:supplement'
0.964774 OD b'lemma:o.d.'
0.964774 OD b'+1:lemma:600nm'
0.964444 Technique b'+1:lemma:Anaerobic'
0.962722 O b'+1:lemma:dpd'
0.959236 Gtype b'lemma:lrp-8myc'
0.955182 Gtype b'lemma:fur-8myc'
0.955182 Gtype b'lemma:cra-8myc-tagged'
0.954847 Supp b'+1:lemma:phosphate'
0.950337 Gtype b'-1:lemma:harbor'
0.950330 Air b'+1:lemma:95'
0.946063 O b'+1:lemma:od450'
0.941579 Supp b'+1:lemma:be'
0.940225 Phase b'-1:lemma::'
0.939160 Phase b'+1:lemma:for'
0.937071 Anti b'+1:postag:NN'
0.936117 O b'-1:lemma:0.3-0.35'
0.935326 Med b'+1:lemma:g/l'
0.931180 O b'lemma:lrp'
0.929547 Supp b'-1:lemma:ompr'
0.928731 O b'lemma:ntrc'
0.928731 O b'lemma:csir'
0.928476 OD b'lemma:0.3-0.35'
0.928056 Temp b'+1:postag:CC'
0.927740 pH b'+1:lemma:.'
0.927740 pH b'+1:postag:.'
0.927359 Gtype b'lemma:\xce\xb4gade'
0.927087 Med b'lemma:glucose'
0.925913 Gtype b'lemma:\xce\xb4gadw'
0.925913 Gtype b'lemma:\xce\xb4gadx'
0.924473 O b'+1:ner:_'
0.923047 O b'lemma:pt7'
0.920856 Supp b'+1:lemma:1/100'
0.913385 Air b'-1:lemma:cm20'
0.913344 Med b'-1:lemma:w2'
0.910135 O b'+1:lemma:wash'
0.910122 Gtype b'+1:lemma:cra'
0.907700 Air b'lemma:%'
0.905826 Supp b'+1:postag:VBD'
0.901108 O b'+1:lemma:nacl'
0.897897 O b'lemma:600'
0.896501 Phase b'-1:lemma:the'
0.890108 Supp b'lemma:20'
0.888898 Gtype b'postag:NN'
0.886556 O b'lemma:-80'
0.884504 O b'postag:-RRB-'
0.884240 Temp b'-1:postag:CD'
0.882906 O b'+1:lemma:minute'
0.882490 Anti b'-1:lemma:polymerase'
0.882042 Supp b'+1:lemma:m'
0.872023 Agit b'+1:lemma:-rrb-'
0.871535 O b'lemma:Nac'
0.871372 Agit b'+1:postag:-RRB-'
0.867352 Supp b'+1:postag:JJ'
0.861722 O b'+1:postag:NNP'
0.861375 OD b'+1:postag:JJ'
0.858664 O b'lemma:fresh'
0.856858 O b'+1:lemma:fructose'
0.856275 O b'-1:lemma:one'
0.854261 Supp b'-1:lemma:30'
0.853504 O b'+1:lemma:rifampicin'
0.852787 O b'-1:lemma:genotype'
0.851164 O b'lemma:hs2'
0.848443 O b'lemma:one'
0.847633 O b'lemma:rnase'
0.847594 O b'+1:lemma:mid-log'
0.847491 OD b'lemma:of'
0.844446 O b'-1:lemma:.2'
0.844369 Med b'postag:NNS'
0.842499 Technique b'postag:NN'
0.841210 O b'-1:lemma:nitrate'
0.839523 Agit b'-1:lemma:-lrb-'
0.836076 pH b'-2:ner:SUPP'
0.831334 O b'lemma:cell'
0.826623 O b'lemma:IP'
0.824290 Agit b'-1:postag:-LRB-'
Top negative:
0.075620 O b'+1:lemma:tag'
0.074960 Supp b'+1:lemma:10'
0.074780 O b'-1:lemma:cell'
0.074753 Supp b'-1:lemma:0.1'
0.074713 Phase b'+2:ner:_'
0.074616 Air b'+1:postag:CD'
0.073647 Med b'-1:lemma:-lrb-'
0.072346 Gtype b'lemma:-lrb-'
0.071287 Technique b'+2:ner:_'
0.071222 O b'-1:lemma:NeoClone'
0.071222 O b'+1:lemma:w0002'
0.071037 Supp b'lemma:-lrb-'
0.070057 O b'lemma:sc-28207'
0.069857 Air b'+1:lemma:-rrb-'
0.069520 Phase b'+1:postag:IN'
0.069099 O b'+1:lemma:licl'
0.068532 O b'-1:lemma:source'
0.067474 Air b'+1:postag:-RRB-'
0.067115 pH b'-2:ner:TF'
0.067003 Gtype b'+1:ner:SUPP'
0.066726 Med b'-1:postag:-LRB-'
0.064954 O b'+1:lemma:10'
0.061467 O b'+1:lemma:voluman'
0.060294 Supp b'lemma:mm'
0.060294 Supp b'-1:ner:KWSUPP'
0.058652 Supp b'lemma:and'
0.058193 O b'lemma:coli'
0.056311 Med b'+1:postag:NNS'
0.056170 Supp b'-1:lemma:of'
0.055547 O b'postag:VBZ'
0.054926 Gtype b'+1:lemma:lacx74/ptrc99a'
0.054074 O b'lemma:condition'
0.053594 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4soxr'
0.053035 Strain b'postag:NN'
0.052307 Med b'+1:postag:CC'
0.051766 O b'-1:lemma:95'
0.048692 Phase b'-1:postag:IN'
0.048640 Anti b'+1:lemma:polyclonal'
0.048588 Med b'-1:postag:CC'
0.047424 Air b'lemma:-rrb-'
0.046926 O b'-1:lemma:incubate'
0.046062 Supp b'+1:lemma:of'
0.045898 Supp b'postag:-RRB-'
0.045820 pH b'+1:lemma:1'
0.044596 O b'-1:lemma:Cold'
0.044376 O b'+1:lemma:culture'
0.044298 Anti b'lemma:ihf'
0.043800 O b'lemma:total'
0.041031 O b'lemma:95'
0.040471 Gtype b'+1:lemma:lacx74/ptg2'
0.039384 Technique b'-1:postag:CD'
0.038820 O b'lemma:per-gene'
0.036673 pH b'-1:ner:_'
0.036239 O b'-1:lemma:to'
0.036239 O b'-1:postag:TO'
0.035433 O b'-1:lemma:by'
0.035324 O b'-1:lemma:arca8myc'
0.032173 O b'-1:postag:-RRB-'
0.031792 Air b'lemma:-lrb-'
0.031161 Gtype b'lemma:hn'
0.031105 Gtype b'lemma:strain'
0.030208 O b'+1:lemma:chipseq'
0.030167 O b'lemma:NeoClone'
0.029505 O b'+1:lemma:pre-cleared'
0.029212 O b'lemma:read'
0.027003 O b'-1:lemma:delta-fnr'
0.025891 O b'lemma:two'
0.024790 O b'+1:lemma:ethanol'
0.024309 Anti b'+1:ner:_'
0.024195 Air b'postag:-LRB-'
0.024007 pH b'+1:lemma:2'
0.023974 Supp b'lemma:ph'
0.023235 O b'-1:lemma:Tris'
0.023198 O b'+1:lemma:wild-type'
0.022956 Med b'+1:lemma:-rrb-'
0.022348 Supp b'postag:CC'
0.021766 O b'+1:lemma:after'
0.020365 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4soxs'
0.020059 Anti b'-1:lemma:Affinity'
0.019458 Med b'+1:postag:-RRB-'
0.019090 Agit b'+1:ner:_'
0.018287 Supp b'postag:VBN'
0.017925 O b'lemma:grow'
0.017845 O b'lemma:crosslinking'
0.017390 O b'-1:lemma:20'
0.016678 O b'lemma:0.01'
0.015374 Air b'postag:NNP'
0.015065 Gtype b'+1:ner:TF'
0.013513 O b'+1:lemma:stop'
0.013455 Gtype b'+1:postag:NNP'
0.013136 Air b'+2:ner:_'
0.010579 O b'+1:lemma:LB'
0.010373 O b'-1:lemma:with'
0.009839 O b'-1:lemma:solution'
0.009113 O b'lemma:harvest'
0.008932 Gtype b'postag:CC'
0.008098 O b'-1:lemma:harvest'
0.008071 Air b'-1:lemma:-lrb-'
0.007937 O b'+1:lemma:delta-arca'
0.007629 Temp b'-1:lemma:-lrb-'
0.007363 Air b'postag:-RRB-'
0.007278 Supp b'postag:-LRB-'
0.007131 Anti b'lemma:polyclonal'
0.006949 Anti b'-1:lemma:ihf'
0.006827 O b'lemma:beginning'
0.006821 O b'-1:lemma:build'
0.006560 O b'lemma:nitrogen'
0.005531 Air b'-1:postag:-LRB-'
0.004843 Gtype b'+1:postag:IN'
0.004708 Temp b'-1:postag:-LRB-'
0.004028 O b'lemma:formaldehyde'
0.003615 Gversion b'-1:ner:_'
0.003560 Gtype b'-1:postag:NNP'
0.003435 O b'-1:lemma:anaerobically'
0.003384 O b'+1:lemma:aerobic'
0.002809 Supp b'-1:lemma:300'
0.002750 O b'-1:lemma:um'
0.002750 O b'+1:lemma:paraquat'
0.002137 Gtype b'-1:postag:-RRB-'
0.002117 O b'postag:VB'
0.001805 O b'lemma:the'
0.001433 Supp b'lemma:250'
0.001269 Gtype b'lemma:cra'
0.000979 Gtype b'lemma:,'
0.000979 Gtype b'postag:,'
0.000455 O b'-1:lemma:wild-type'
0.000339 O b'lemma:ihf'
0.000245 Supp b'postag:NNS'
0.000206 OD b'postag:JJ'
0.000171 O b'-1:lemma:MOPS'
0.000169 Gtype b'+1:postag:-RRB-'
0.000148 O b'+1:lemma:fnr'
0.000145 Gtype b'+1:lemma:deletion'
0.000102 Gversion b'-1:postag:CD'
0.000081 OD b'lemma:='
0.000047 O b'+1:lemma:follow'
0.000043 O b'-1:lemma:dilute'
0.000036 O b'+1:lemma:asm584v2'
0.000028 O b'-1:lemma:condition'
0.000022 O b'-1:lemma:escherichia'
0.000017 O b'+2:ner:Organism'
0.000011 O b'-1:lemma:volume'
0.000010 O b'-1:lemma:formaldehyde'
0.000003 O b'lemma:reference'
-0.000003 O b'+1:lemma:='
-0.000118 O b'-1:lemma:sodium'
-0.000172 Supp b'lemma:um'
-0.000928 O b'lemma:phase'
-0.001119 O b'-1:lemma:300'
-0.001127 O b'lemma:final'
-0.001212 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.003117 Air b'postag:CD'
-0.003805 Air b'+1:postag:NNS'
-0.004881 Anti b'-1:ner:_'
-0.005469 Technique b'-1:lemma::'
-0.005577 Phase b'-2:ner:SUPP'
-0.006001 Med b'-1:lemma:m63'
-0.006894 O b'+1:lemma:of'
-0.008209 Supp b'+1:lemma:final'
-0.009376 O b'lemma:and'
-0.010002 O b'+1:lemma:pk4854'
-0.010531 O b'+1:lemma:with'
-0.012052 Substrain b'+2:ner:_'
-0.012175 Supp b'-1:lemma:.'
-0.012175 Supp b'-1:postag:.'
-0.013505 Agit b'-2:ner:_'
-0.014411 OD b'lemma:2.0'
-0.016692 Anti b'-1:postag:NN'
-0.017973 Vess b'+2:ner:_'
-0.018286 O b'-1:lemma:25'
-0.019653 O b'+2:ner:MED'
-0.023454 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.023815 O b'+1:lemma:strain'
-0.024748 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.025086 O b'lemma:8'
-0.025464 O b'lemma:affinity'
-0.026859 O b'lemma:0.1'
-0.027530 Supp b'-1:lemma:the'
-0.031502 O b'+1:lemma:pahse'
-0.034287 Substrain b'+1:ner:_'
-0.034384 Med b'+1:lemma:m9'
-0.036857 O b'lemma:vol'
-0.036857 O b'-1:lemma:1/100'
-0.044842 O b'-1:lemma:gade'
-0.047738 O b'lemma:1/100'
-0.047738 O b'+1:lemma:vol'
-0.050649 O b'+1:lemma:-lcb-'
-0.051181 O b'lemma:mg/ml'
-0.051181 O b'-1:lemma:150'
-0.051425 Supp b'-1:lemma:8'
-0.052457 Temp b'+2:ner:_'
-0.054659 O b'lemma:25'
-0.056922 Phase b'+1:ner:_'
-0.058719 Air b'-1:postag:CC'
-0.060608 O b'+1:lemma:-'
-0.062570 O b'+1:lemma:min'
-0.063044 Air b'-1:lemma:aerobically'
-0.063553 Supp b'-1:postag:NN'
-0.064162 O b'-1:lemma:in'
-0.065045 Vess b'postag:NN'
-0.066125 O b'+1:lemma:anaerobically'
-0.067255 OD b'+1:lemma:.'
-0.067255 OD b'+1:postag:.'
-0.067385 O b'+1:lemma:70'
-0.070908 O b'-1:lemma:70'
-0.071938 O b'lemma:70'
-0.073353 Anti b'-1:postag:CD'
-0.073448 O b'+1:postag:VB'
-0.075774 Supp b'postag::'
-0.076474 Supp b'lemma:.'
-0.076474 Supp b'postag:.'
-0.077650 O b'+1:lemma:25'
-0.079275 O b'-1:lemma:gadw'
-0.081662 O b'+2:ner:SUPP'
-0.083885 O b'+1:postag:NNS'
-0.084340 O b'lemma:m9'
-0.086026 O b'+1:lemma:rna'
-0.086099 O b'-1:postag:VB'
-0.086312 Phase b'-1:lemma:at'
-0.087537 O b'+1:lemma:a'
-0.089533 O b'-1:lemma:from'
-0.089735 Supp b'-1:lemma:250'
-0.090036 O b'lemma:5'
-0.096918 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.096996 Supp b'-1:lemma:in'
-0.097981 Supp b'-2:ner:KWSUPP'
-0.098352 Med b'-1:postag:NN'
-0.099725 O b'-2:ner:SUPP'
-0.102318 Supp b'postag:IN'
-0.102603 O b'+1:lemma:ph'
-0.104044 O b'+1:lemma:95'
-0.106289 Gtype b'+1:postag:-LRB-'
-0.107990 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.107990 Gtype b'-1:postag:,'
-0.108591 O b'lemma:fecl2'
-0.110567 O b'+1:lemma:n2'
-0.112472 O b'+1:lemma:o2'
-0.113621 O b'-1:postag:VBN'
-0.114785 Phase b'+1:postag:NN'
-0.115530 Med b'-1:postag:CD'
-0.115637 O b'lemma:fructose'
-0.121846 Supp b'-2:ner:_'
-0.122889 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.123902 O b'-1:postag:DT'
-0.129015 O b'+2:ner:TF'
-0.130292 O b'lemma:;'
-0.130292 O b'-1:lemma:7.6'
-0.133202 O b'-1:lemma:m9'
-0.133501 O b'lemma:nitrate'
-0.139781 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.142265 Supp b'-1:lemma:;'
-0.144592 Supp b'-1:postag:DT'
-0.145406 Supp b'+2:ner:_'
-0.145644 O b'+1:lemma:purify'
-0.146446 O b'+1:lemma:delta'
-0.150530 Med b'postag:JJ'
-0.151629 Supp b'lemma:,'
-0.151629 Supp b'postag:,'
-0.151858 O b'+1:lemma:5'
-0.152185 Vess b'-2:ner:_'
-0.152477 O b'lemma:%'
-0.152513 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.152968 O b'+1:lemma:1/100'
-0.153165 Gtype b'+1:lemma:b'
-0.153754 O b'+1:lemma:_'
-0.153972 Supp b'-1:lemma:and'
-0.155016 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.156924 Agit b'-1:ner:_'
-0.158301 O b'lemma:dpd'
-0.159084 Supp b'+2:ner:KWSUPP'
-0.160252 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.160747 O b'-1:lemma:gadx'
-0.162773 O b'+1:lemma:7.6'
-0.164959 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.165907 O b'+1:postag:CD'
-0.166889 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.169446 Supp b'+1:lemma:glucose'
-0.176593 Air b'lemma:anaerobically'
-0.180478 Gtype b'lemma:fnr'
-0.181555 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.186910 O b'-1:lemma:affinity'
-0.190044 O b'+1:lemma:0.4'
-0.194318 Supp b'postag:CD'
-0.195107 Substrain b'-2:ner:_'
-0.195613 O b'+1:lemma:until'
-0.198235 O b'-1:lemma:of'
-0.199022 O b'-1:postag:CD'
-0.199089 Gtype b'-1:postag:SYM'
-0.202002 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.205722 O b'+1:lemma:.'
-0.205722 O b'+1:postag:.'
-0.216307 O b'-1:lemma:k-12'
-0.216945 O b'lemma:o2'
-0.217003 O b'lemma:150'
-0.217003 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.218075 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.218075 Gtype b'+1:postag:,'
-0.221145 O b'lemma:rna'
-0.223229 O b'lemma:chip-exo'
-0.225131 Anti b'postag:CD'
-0.227706 O b'+1:lemma:mm'
-0.227706 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.231270 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.233867 Strain b'+2:ner:_'
-0.246096 Temp b'-1:postag:IN'
-0.251497 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.252997 Vess b'+1:ner:_'
-0.253651 O b'lemma:0.2'
-0.260163 Strain b'+1:ner:_'
-0.263511 O b'+1:lemma:co2'
-0.264395 Technique b'-2:ner:_'
-0.268515 O b'lemma:n2'
-0.269039 O b'+1:lemma:b'
-0.275669 Vess b'-1:ner:_'
-0.278234 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.278953 Temp b'postag:JJ'
-0.279029 Med b'postag:CD'
-0.280385 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.280713 Strain b'-1:ner:_'
-0.282931 Med b'lemma:-lrb-'
-0.284230 O b'+1:lemma:0.3'
-0.284388 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.285435 O b'+1:lemma:gadx'
-0.286402 O b'-1:lemma:delta'
-0.290836 Supp b'lemma:10'
-0.295768 O b'-1:lemma:0.2'
-0.301118 O b'+1:lemma:arginine'
-0.302775 Gtype b'postag:VBG'
-0.310347 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.312919 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.319713 O b'+1:lemma:minimal'
-0.323266 O b'+1:lemma:~'
-0.327074 O b'+1:postag:VBG'
-0.327121 O b'lemma:7.6'
-0.327121 O b'+1:lemma:;'
-0.327442 O b'lemma:co2'
-0.332428 Supp b'lemma:paraquat'
-0.333237 O b'lemma:dissolve'
-0.334151 Supp b'lemma:300'
-0.335147 Anti b'+2:ner:_'
-0.343571 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.343673 pH b'+2:ner:_'
-0.345645 O b'+1:lemma:the'
-0.347631 O b'lemma:purify'
-0.351112 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.353869 Gtype b'-1:lemma:fur'
-0.354616 Substrain b'-1:ner:_'
-0.355411 O b'lemma:20'
-0.356304 O b'lemma:1m'
-0.366220 O b'-1:lemma:%'
-0.378656 O b'-1:lemma:od600'
-0.380532 O b'-1:ner:GEN'
-0.381058 Med b'postag:-LRB-'
-0.381984 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.385385 O b'+1:lemma:sample'
-0.387663 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.388902 Gtype b'postag::'
-0.391014 O b'-1:lemma:o2'
-0.395841 O b'-1:lemma:purify'
-0.408659 O b'+1:lemma:2.0'
-0.414384 O b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.416377 O b'lemma:ph'
-0.417438 Phase b'postag:JJ'
-0.419457 O b'-1:lemma:iptg'
-0.420640 O b'-1:lemma:.'
-0.420640 O b'-1:postag:.'
-0.423669 OD b'postag:NN'
-0.423873 Gtype b'lemma:delta'
-0.424692 O b'-1:lemma:minimal'
-0.427179 Technique b'-1:postag::'
-0.428967 Med b'+1:postag:IN'
-0.433477 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.440687 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.443210 O b'-1:lemma:the'
-0.444493 Med b'-1:ner:_'
-0.451953 O b'lemma:lb'
-0.452809 Air b'-1:lemma:grow'
-0.458714 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.462476 O b'-1:lemma:mm'
-0.465886 Supp b'lemma:2'
-0.466572 O b'-1:lemma:rna'
-0.478015 Temp b'+1:postag:IN'
-0.485129 Gtype b'lemma:control'
-0.487492 pH b'-2:ner:_'
-0.487970 O b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.488593 O b'-1:lemma:harbor'
-0.493172 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.495681 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.495870 O b'-1:lemma:g/l'
-0.496014 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-0.498335 Med b'-1:postag:IN'
-0.500480 Gtype b'lemma:ompr'
-0.510704 O b'-1:lemma:n2'
-0.513069 O b'+1:lemma:%'
-0.516207 O b'lemma:medium'
-0.518565 O b'-1:lemma:1m'
-0.519833 O b'+1:postag:IN'
-0.524765 Gtype b'-1:postag:CD'
-0.525178 Air b'-1:lemma::'
-0.531101 O b'-1:lemma:final'
-0.532125 O b'lemma:m'
-0.535682 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.545561 O b'+1:lemma:from'
-0.545825 O b'+1:lemma:1m'
-0.547142 O b'lemma:od600'
-0.551893 O b'-1:lemma:250'
-0.552282 O b'postag:RB'
-0.555650 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.555650 O b'+1:lemma:methanol'
-0.557944 O b'lemma:250'
-0.568718 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.573142 Med b'+1:ner:MED'
-0.575961 Anti b'postag:NNP'
-0.585111 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.588491 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.591393 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.595235 Gtype b'postag:CD'
-0.596856 O b'lemma:pahse'
-0.598826 O b'+1:lemma:300'
-0.605539 O b'lemma:methanol'
-0.611213 Gtype b'-1:lemma:-'
-0.614258 O b'+1:postag:DT'
-0.617011 Gtype b'+1:lemma:crp'
-0.622446 O b'+1:lemma:supplement'
-0.630749 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.631332 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.640282 Agit b'postag:NN'
-0.647292 O b'-1:postag:IN'
-0.651749 Med b'+1:postag:NN'
-0.658847 pH b'postag:NN'
-0.671838 Air b'-1:postag:VBN'
-0.680256 Med b'-2:ner:MED'
-0.680669 O b'+1:lemma:contain'
-0.687430 O b'+1:lemma:m'
-0.689489 O b'lemma:sample'
-0.701782 O b'+1:lemma:media'
-0.705819 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.718924 O b'-1:postag:VBG'
-0.727588 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.733341 O b'lemma:anaerobic'
-0.734295 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.760470 O b'+1:lemma:at'
-0.777924 O b'-1:lemma:~'
-0.780256 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.793827 O b'lemma:37'
-0.805862 O b'lemma:nh4cl'
-0.810630 O b'lemma:m63'
-0.820599 O b'+1:lemma:genome'
-0.821143 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.826736 O b'-1:lemma:fresh'
-0.862593 O b'-1:lemma:ph'
-0.863490 O b'lemma:aerobic'
-0.863724 O b'-1:lemma:37'
-0.883961 O b'lemma:minimal'
-0.894908 O b'lemma:nacl'
-0.908766 O b'lemma:mid-log'
-0.971877 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.973705 O b'lemma:rifampicin'
-0.976341 O b'lemma:30'
-0.978127 O b'+1:lemma:in'
-0.982598 O b'-2:ner:TF'
-1.038157 O b'-1:lemma:rpob'
-1.050405 O b'lemma:of'
-1.050833 O b'-1:lemma:m'
-1.068094 O b'+1:lemma:g/l'
-1.080400 Temp b'postag:NN'
-1.103589 Phase b'-1:postag:JJ'
-1.107359 O b'-1:lemma:until'
-1.113429 Supp b'+1:lemma:acetate'
-1.121731 O b'+1:lemma:+'
-1.127210 Air b'postag:NN'
-1.130199 Supp b'+1:lemma:,'
-1.130199 Supp b'+1:postag:,'
-1.139062 O b'-1:lemma:30'
-1.140385 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.149334 O b'-1:lemma:1'
-1.175681 O b'-1:postag::'
-1.206043 Technique b'+1:ner:_'
-1.216406 Temp b'+1:lemma:with'
-1.217345 O b'lemma:wt'
-1.222141 O b'lemma:media'
-1.245225 O b'lemma:0.3'
-1.283767 O b'-1:lemma:contain'
-1.291456 Supp b'+1:lemma:nacl'
-1.315586 Supp b'postag:JJ'
-1.388701 O b'-1:lemma:co2'
-1.399530 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-1.445341 O b'-1:lemma:ml'
-1.451028 O b'+1:lemma:hour'
-1.460605 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-1.492055 O b'-1:lemma:IP'
-1.537566 O b'-1:lemma:2'
-1.566824 O b'+1:lemma:1'
-1.580796 OD b'+1:postag:NN'
-1.601406 O b'-1:lemma:sample'
-1.614506 O b'+1:lemma:2'
-2.068226 O b'-1:lemma:vol'
-2.092821 O b'lemma:aerobically'
-2.450935 O b'-1:lemma:_'
-3.186662 O b'-1:lemma::'