report_Run9_v10.txt 37.4 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.07373162431323503, 'c2': 6.022010399845652e-06}
best CV score:0.8189566663670631
model size: 0.07M

Flat F1: 0.8121784396734127
             precision    recall  f1-score   support

         OD      0.913     1.000     0.955        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.804     0.891        56
       Temp      0.857     0.800     0.828        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.877     0.821     0.848        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.864     0.838     0.851       136
   Gversion      1.000     0.667     0.800         6

avg / total      0.843     0.787     0.812       484


Top likely transitions:
Anti   -> Anti    7.049648
Temp   -> Temp    6.253064
Med    -> Med     5.773039
Phase  -> Phase   5.455338
Supp   -> Supp    5.445922
Gtype  -> Gtype   5.280278
Air    -> Air     5.241489
Gversion -> Gversion 4.849856
OD     -> OD      4.638420
Technique -> Technique 4.282425
pH     -> pH      3.661913
O      -> O       3.512794
Agit   -> Agit    2.597507
Substrain -> Gtype   1.789194
Technique -> Air     1.287937
Gtype  -> Supp    1.081370
O      -> Technique 0.524586
Air    -> O       0.495973
Anti   -> O       0.224321
Technique -> O       0.003972
Gtype  -> pH      0.001422
Gtype  -> Air     0.001369
O      -> Substrain -0.000007
Phase  -> Air     -0.005628
Temp   -> O       -0.030324
O      -> Gtype   -0.109735
O      -> Supp    -0.150755
O      -> Anti    -0.174870
Phase  -> O       -0.217439
Supp   -> O       -0.233058
Temp   -> Med     -0.273365
O      -> Temp    -0.320957
Gtype  -> Anti    -0.358227
O      -> Med     -0.470668
O      -> Phase   -0.707125
Med    -> O       -0.866608
OD     -> O       -0.890798
O      -> OD      -0.959144
Technique -> pH      -1.079166
Air    -> Phase   -1.152076
Gtype  -> O       -1.268811
Supp   -> Med     -1.563131
Technique -> Gtype   -1.575628
OD     -> Air     -1.596555
Substrain -> O       -2.278213
Phase  -> OD      -2.330790
O      -> Air     -2.597242
Med    -> Supp    -3.113613


Top unlikely transitions:
Anti   -> Anti    7.049648
Temp   -> Temp    6.253064
Med    -> Med     5.773039
Phase  -> Phase   5.455338
Supp   -> Supp    5.445922
Gtype  -> Gtype   5.280278
Air    -> Air     5.241489
Gversion -> Gversion 4.849856
OD     -> OD      4.638420
Technique -> Technique 4.282425
pH     -> pH      3.661913
O      -> O       3.512794
Agit   -> Agit    2.597507
Substrain -> Gtype   1.789194
Technique -> Air     1.287937
Gtype  -> Supp    1.081370
O      -> Technique 0.524586
Air    -> O       0.495973
Anti   -> O       0.224321
Technique -> O       0.003972
Gtype  -> pH      0.001422
Gtype  -> Air     0.001369
O      -> Substrain -0.000007
Phase  -> Air     -0.005628
Temp   -> O       -0.030324
O      -> Gtype   -0.109735
O      -> Supp    -0.150755
O      -> Anti    -0.174870
Phase  -> O       -0.217439
Supp   -> O       -0.233058
Temp   -> Med     -0.273365
O      -> Temp    -0.320957
Gtype  -> Anti    -0.358227
O      -> Med     -0.470668
O      -> Phase   -0.707125
Med    -> O       -0.866608
OD     -> O       -0.890798
O      -> OD      -0.959144
Technique -> pH      -1.079166
Air    -> Phase   -1.152076
Gtype  -> O       -1.268811
Supp   -> Med     -1.563131
Technique -> Gtype   -1.575628
OD     -> Air     -1.596555
Substrain -> O       -2.278213
Phase  -> OD      -2.330790
O      -> Air     -2.597242
Med    -> Supp    -3.113613


Top positive:
12.695542 Supp     b'lemma:Iron'
10.931807 O        b'lemma:_'
9.744757 Med      b'lemma:MOPS'
9.582794 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
9.527405 Technique b'lemma:chipseq'
8.842391 Air      b'lemma:aerobically'
8.809763 Phase    b'lemma:stationary'
8.809763 Phase    b'lemma:exponential'
8.779194 O        b'lemma:-'
8.594661 Supp     b'lemma:pq'
7.958285 Air      b'lemma:anaerobic'
7.754881 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
7.695360 Phase    b'lemma:mid-log'
7.620292 Technique b'lemma:ChIP-exo'
7.614690 Air      b'lemma:aerobic'
7.567065 O        b'lemma:b'
7.521873 Strain   b'lemma:k-12'
7.384214 O        b'lemma:Cra'
7.286059 O        b'-1:lemma:tag'
7.242984 Med      b'lemma:LB'
7.206911 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
6.965286 Gtype    b'lemma:wt'
6.963163 Gtype    b'+1:lemma:type'
6.773032 O        b'lemma:rpob'
6.626583 Gversion b'lemma:asm584v2'
6.581226 Gtype    b'lemma:type'
6.515748 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
6.337646 Supp     b'-1:lemma:Cra'
6.326289 Supp     b'lemma:2h'
6.326289 Supp     b'-1:lemma:additional'
6.086272 Substrain b'lemma:mg1655'
6.036346 Supp     b'lemma:no3'
5.974010 Gtype    b'lemma:arca8myc'
5.915109 O        b'lemma:1'
5.817719 O        b'lemma:at'
5.808354 O        b'lemma:with'
5.707337 O        b'-1:lemma:pq'
5.698253 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
5.603136 Supp     b'lemma:iptg'
5.461367 Strain   b'+1:lemma:substr'
5.416148 Supp     b'lemma:nacl'
5.395392 Temp     b'-1:lemma:sample'
5.348909 Gversion b'lemma:000913'
5.345729 Technique b'lemma:rna-seq'
5.312152 Vess     b'lemma:flask'
5.312152 Vess     b'-1:lemma:warm'
5.258371 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
5.243276 O        b'-1:lemma:glucose'
5.214321 O        b'+1:lemma:wt'
5.202703 Gversion b'lemma:nc'
5.164541 Supp     b'lemma:dpd'
5.077420 Gtype    b'lemma:dfnr'
5.054020 O        b'lemma:3'
5.053522 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
5.046437 O        b'lemma:a'
5.033844 O        b'lemma:rep2'
5.033844 O        b'lemma:rep1'
5.018361 Gtype    b'lemma:pk4854'
5.014318 Temp     b'-1:lemma:37'
4.975642 O        b'lemma:2'
4.962146 Gtype    b'-1:lemma:factor'
4.895653 Supp     b'-1:lemma:vol'
4.888635 Technique b'lemma:rnaseq'
4.854787 OD       b'lemma:od450'
4.793939 O        b'-1:lemma:nacl'
4.791043 Supp     b'+1:lemma:iptg'
4.778131 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
4.751928 Air      b'lemma:anaeroibc'
4.722087 Med      b'-1:lemma:ml'
4.716120 O        b'-1:lemma:0.3'
4.677628 O        b'-1:lemma:lb'
4.666211 O        b'postag:VBG'
4.646623 Supp     b'lemma:Leu'
4.645891 O        b'lemma:purr'
4.555114 O        b'-1:lemma:acetate'
4.527822 Supp     b'lemma:nh4cl'
4.489928 O        b'lemma:chip'
4.482316 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
4.479061 O        b'lemma:trpr'
4.456509 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
4.451070 O        b'lemma:\xcf\x8332'
4.433314 Air      b'-1:lemma:co2'
4.430445 Supp     b'lemma:Fe'
4.417801 O        b'lemma:for'
4.414866 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
4.389434 Anti     b'lemma:\xcf\x8332'
4.326667 Gtype    b'lemma:delta-arca'
4.312773 O        b'-1:postag:NNS'
4.306431 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
4.291196 Anti     b'+1:lemma:antibody'
4.290609 Air      b'-1:lemma:-'
4.289787 Anti     b'lemma:none'
4.285638 O        b'lemma:ompr'
4.281187 O        b'lemma:gadx'
4.269164 O        b'-1:lemma:fructose'
4.247504 Supp     b'lemma:rifampicin'
4.242826 O        b'-1:lemma:type'
4.229447 Med      b'-1:lemma:fresh'
4.204570 Gtype    b'lemma:WT'
4.200422 Med      b'lemma:lb'
4.197349 Med      b'+1:lemma:0.4'
4.191440 O        b'+1:lemma:k-12'
4.159419 Agit     b'lemma:rpm'
4.106271 Anti     b'lemma:seqa'
4.075734 Technique b'lemma:chip-seq'
4.074011 O        b'lemma:affyexp'
4.053239 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
4.015120 Agit     b'+1:lemma:rpm'
3.993428 Gversion b'-1:lemma:nc'
3.993428 Gversion b'+1:lemma:000913'
3.935996 Agit     b'-1:lemma:250'
3.929972 O        b'lemma:.'
3.929972 O        b'postag:.'
3.915403 O        b'lemma:CEL'
3.906034 Med      b'lemma:media'
3.896917 Supp     b'lemma:Adenine'
3.892436 Supp     b'-1:lemma:potassium'
3.885998 O        b'lemma:argr'
3.868380 Technique b'-1:lemma:IP'
3.865807 Supp     b'-1:lemma:+'
3.836351 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
3.835217 pH       b'lemma:ph5'
3.835217 pH       b'+1:lemma:.5'
3.832165 O        b'lemma:soxr'
3.832165 O        b'lemma:soxs'
3.812051 O        b'+1:lemma:od600'
3.808842 pH       b'lemma:5.5'
3.749813 Supp     b'lemma:arginine'
3.740609 Substrain b'lemma:mg1655star'
3.729389 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.725591 O        b'+1:lemma:pq'
3.683961 Gtype    b'lemma:wild-type'
3.662774 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
3.642740 Gtype    b'+1:lemma:pq'
3.612840 Gversion b'lemma:u00096'
3.612840 Gversion b'+1:lemma:.2'
3.583429 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
3.564316 Gversion b'lemma:.2'
3.564316 Gversion b'-1:lemma:u00096'
3.551838 Med      b'lemma:m63'
3.549663 Gtype    b'lemma:oxyr-8myc'
3.549663 Gtype    b'lemma:soxr-8myc'
3.549663 Gtype    b'lemma:soxs-8myc'
3.520794 O        b'-1:lemma:into'
3.517363 Technique b'lemma:chip-exo'
3.485051 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
3.480812 O        b'lemma:genotype/variation'
3.445139 Phase    b'-1:lemma:until'
3.432735 O        b'lemma:s'
3.416608 Technique b'+1:ner:TF'
3.380664 O        b'lemma::'
3.370063 O        b'lemma:chip-arca'
3.362577 OD       b'-1:lemma:od450'
3.358577 Supp     b'-1:ner:SUPP'
3.340572 Supp     b'+1:lemma:1'
3.279773 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
3.279773 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
3.274136 O        b'+1:lemma:43'
3.266113 Technique b'-1:lemma:input'
3.257451 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
3.254542 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
3.254542 Gtype    b'-1:lemma:old'
3.239215 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
3.234873 O        b'+1:lemma:wash'
3.196570 pH       b'+1:postag:CD'
3.192056 O        b'lemma:from'
3.173721 O        b'+1:lemma:250'
3.148637 Med      b'+1:lemma:2.0'
3.143350 O        b'+1:lemma:20'
3.140446 Gtype    b'-1:ner:GEN'
3.106931 O        b'lemma:Lrp'
3.103605 Temp     b'-1:lemma:43'
3.087773 O        b'lemma:oxyr'
3.082707 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
3.066936 Temp     b'lemma:43'
3.026699 Supp     b'+1:lemma:hour'
3.025005 Supp     b'-1:lemma:with'
3.018641 Supp     b'lemma:acetate'
3.016937 O        b'+1:lemma:mid-log'
2.942030 O        b'lemma:culture'
2.941677 O        b'-1:lemma:Aerobic'
2.938625 Med      b'lemma:medium'
2.919438 O        b'-1:lemma:min'
2.892440 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.890484 O        b'+1:lemma:coli'
2.862489 Gtype    b'lemma:wildtype'
2.859547 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
2.847406 O        b'lemma:chip-fnr'
2.842076 Air      b'-1:lemma:cm20'
2.822898 O        b'-1:lemma:medium'
2.813096 Gtype    b'lemma:fnr-8myc'
2.803914 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.801366 Supp     b'+1:lemma:2'
2.786379 O        b'-2:ner:MED'
2.775655 O        b'postag:CC'
2.732371 Agit     b'lemma:250'
2.713499 Gtype    b'+1:lemma:cra'
2.710768 Gtype    b'lemma:flagtag'
2.648197 Gtype    b'-1:postag:VBG'
2.637048 Anti     b'lemma:anti-rpob'
2.627132 Air      b'-1:lemma:_'
2.626645 Supp     b'-1:lemma:final'
2.613537 OD       b'-1:lemma:~'
2.601343 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.598858 O        b'lemma:cra'
2.583918 Supp     b'-1:lemma:without'
2.571868 pH       b'+1:lemma:5.5'
2.558464 Anti     b'lemma:anti-myc'
2.546992 Anti     b'lemma:anti-rpos'
2.545995 Anti     b'-1:lemma:monoclonal'
2.545865 Supp     b'+1:lemma:m'
2.532819 O        b'-1:lemma:Anaerobic'
2.515797 O        b'lemma:harbor'
2.504020 O        b'postag::'
2.480975 OD       b'lemma:od600'
2.480802 O        b'+1:lemma:old'
2.480538 O        b'-1:lemma:wt'
2.477719 O        b'lemma:delta'
2.471387 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.467072 Gtype    b'lemma:ptac'
2.462150 O        b'lemma:input'
2.462150 O        b'+1:lemma:chip-seq'
2.443379 Gtype    b'+1:lemma:with'
2.436839 O        b'lemma:c'
2.425786 Supp     b'+1:lemma:min'
2.425105 Med      b'-1:lemma:glucose'
2.421848 Supp     b'lemma:sodium'
2.420367 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.418765 O        b'-1:lemma:dpd'
2.406904 O        b'lemma:pt7'
2.395829 O        b'lemma:A'
2.394478 Supp     b'lemma:glutamine'
2.394478 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
2.386884 O        b'+1:ner:MED'
2.380912 Gtype    b'+1:lemma:_'
2.335824 Gversion b'+1:lemma:genome'
2.323592 Supp     b'lemma:glucose'
2.302890 Gtype    b'-1:lemma:_'
2.302466 Supp     b'-1:lemma:m'
2.294539 O        b'lemma:growth'
2.292085 O        b'-1:lemma:l1'
2.289800 pH       b'-1:lemma:ph'
2.286150 O        b'lemma:ntrc'
2.286150 O        b'lemma:csir'
2.282696 O        b'-1:lemma:nitrate'
2.270427 O        b'+1:postag:RB'
2.265461 Gtype    b'lemma:\xce\xb4arca'
2.247973 OD       b'lemma:o.d.'
2.247973 OD       b'+1:lemma:600nm'
2.246241 Supp     b'-1:lemma:respiration'
2.246241 Supp     b'+1:lemma:mmol'
2.244383 Med      b'lemma:minimal'
2.238661 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.225320 Med      b'-1:lemma:minimal'
2.219865 Gtype    b'lemma:delta-soxr'
2.219865 Gtype    b'lemma:delta-gadx'
2.219865 Gtype    b'lemma:delta-gadw'
2.219865 Gtype    b'lemma:delta-oxyr'
2.219865 Gtype    b'lemma:delta-gade'
2.219865 Gtype    b'lemma:delta-soxs'
2.219107 Supp     b'lemma:tryptophan'
2.219107 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
2.219031 Gtype    b'lemma:ompr-8myc'
2.215080 Supp     b'-1:lemma:sodium'
2.214748 Gtype    b'lemma:gade-8myc'
2.214748 Gtype    b'lemma:\xce\xb4seqa'
2.203131 Supp     b'lemma:fructose'
2.191560 O        b'-1:lemma:.5'
2.142604 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.130826 O        b'lemma:genotype'
2.124210 Gtype    b'lemma:purr-8myc'
2.107698 Air      b'postag:RB'
2.107612 Supp     b'lemma:Trp'
2.104931 Supp     b'+1:lemma:1m'
2.094124 Supp     b'+1:lemma:_'
2.089817 O        b'lemma:Nac'
2.077437 Supp     b'lemma:150'
2.077437 Supp     b'+1:lemma:mg/ml'
2.045177 O        b'lemma:lrp'
2.037355 O        b'-1:lemma:nh4cl'
2.036731 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
2.032682 O        b'postag:IN'
2.030624 O        b'+1:lemma:sparging'
2.022474 O        b'lemma:treatment'
2.021840 OD       b'lemma:0.3-0.35'
1.995383 Temp     b'lemma:sample'
1.989122 O        b'-1:lemma:grow'
1.977024 O        b'lemma:ml'
1.977007 Gtype    b'-1:postag:VBP'
1.971683 O        b'+1:lemma:30'
1.964952 Supp     b'-1:lemma:_'
1.958162 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.949365 Supp     b'lemma:cm20'
1.949365 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.936878 Med      b'+1:lemma:+'
1.921536 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.912683 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
1.908498 OD       b'lemma:0.3'
1.897897 Supp     b'+1:lemma:anaerobically'
1.897332 Substrain b'-1:lemma:.'
1.897332 Substrain b'-1:postag:.'
1.885114 O        b'postag:VBN'
1.882500 O        b'-1:lemma:concentration'
1.882500 O        b'+1:lemma:150'
1.845449 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.826635 O        b'+1:lemma:acetate'
1.817751 Gtype    b'+1:lemma:the'
1.814387 O        b'lemma:or'
1.812861 Supp     b'lemma:30'
1.812421 Vess     b'+1:lemma:at'
1.794853 O        b'-1:lemma:arginine'
1.785644 Gtype    b'lemma:fur-8myc'
1.785644 Gtype    b'lemma:cra-8myc-tagged'
1.782237 Gtype    b'lemma:lrp-8myc'
1.781679 Air      b'postag:JJ'
1.779627 Temp     b'+1:lemma:see'
1.778132 Gtype    b'+2:ner:SUPP'
1.774727 Gtype    b'lemma:_'
1.757470 O        b'-1:lemma:0.3-0.35'
1.742716 Supp     b'lemma:1m'
1.715402 Air      b'-1:lemma:anerobically'
1.712550 Gtype    b'-1:lemma:vector'
1.704069 Gtype    b'-1:lemma:phtpg'
1.687275 Temp     b'lemma:37'
1.669570 O        b'+1:lemma:dpd'
1.658383 Technique b'-1:lemma:1'
1.653732 O        b'postag:DT'
1.653166 Supp     b'lemma:final'
1.649424 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
1.591133 O        b'+1:postag:NNP'
1.582616 O        b'+1:lemma:0.2'
1.574998 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.572125 pH       b'lemma:.5'
1.572125 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.561376 OD       b'-1:lemma:od600'
1.557474 Supp     b'-1:lemma:ompr'
1.554991 O        b'-1:lemma:genotype'
1.552769 O        b'lemma:additional'
1.552769 O        b'+1:lemma:2h'
1.552404 O        b'+2:ner:KWSUPP'
1.551932 O        b'+1:lemma:minute'
1.551790 O        b'lemma:rnase'
1.541514 Gtype    b'lemma:ryhb'
1.538219 Supp     b'lemma:2g/l'
1.538219 Supp     b'+1:lemma:glutamine'
1.535076 Gtype    b'+1:postag::'
1.531668 OD       b'+1:postag:IN'
1.521356 Supp     b'+1:lemma:mg/l'
1.515746 OD       b'-1:lemma:600nm'
1.512051 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.490813 Gversion b'lemma:_'
1.479709 O        b'+1:lemma:m9'
1.477021 Anti     b'-1:lemma::'
1.476871 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.459351 Supp     b'-1:postag:CD'
1.458056 OD       b'lemma:600nm'
1.458056 OD       b'-1:lemma:o.d.'
1.453576 Phase    b'+1:lemma:culture'
1.440907 Supp     b'lemma:m'
1.440706 O        b'-1:lemma:crp'
1.415540 Supp     b'+1:lemma:mm'
1.415540 Supp     b'+1:ner:KWSUPP'
1.407390 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.400840 Phase    b'lemma:phase'
1.399252 O        b'-1:lemma:after'
1.398710 O        b'lemma:C'
1.390839 Air      b'-1:postag:CD'
1.387058 Technique b'-2:ner:TF'
1.380807 Gtype    b'postag:JJ'
1.378365 Anti     b'-1:lemma:polymerase'
1.366280 O        b'+1:lemma:o.d.'
1.359115 O        b'lemma:tag'
1.357128 Air      b'lemma:anerobically'
1.347386 O        b'lemma:old'
1.347386 O        b'-1:lemma:seqa'
1.347386 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
1.327960 O        b'postag:NNS'
1.324921 Gversion b'-1:lemma:the'
1.316876 Supp     b'-1:lemma:mm'
1.314196 Technique b'-1:lemma:_'
1.296294 Gtype    b'-1:lemma::'
1.293462 Supp     b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
1.284367 O        b'+1:lemma:nacl'
1.278076 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.276584 Strain   b'-1:lemma:.'
1.276584 Strain   b'-1:postag:.'
1.272329 Supp     b'lemma:of'
1.268236 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.254899 Air      b'+1:lemma:at'
1.247160 Supp     b'postag:NNP'
1.245126 Supp     b'lemma:methanol'
1.244852 O        b'lemma:induction'
1.242575 Gtype    b'lemma:crp'
1.241640 Supp     b'-1:lemma:1m'
1.239028 O        b'+1:ner:_'
1.236778 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.227474 Supp     b'-1:lemma::'
1.224092 Anti     b'+1:lemma:from'
1.221758 Med      b'+1:postag:CD'
1.220877 O        b'+2:ner:_'
1.219806 Supp     b'-1:postag:IN'
1.215559 OD       b'-1:postag:IN'
1.211540 O        b'-1:ner:_'
1.210643 O        b'lemma:um'
1.210167 O        b'-1:lemma:-80'
1.203822 OD       b'lemma:0.35'
1.194362 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.192621 Air      b'-1:postag::'
1.189461 O        b'lemma:gadw'
1.184209 OD       b'-1:lemma:at'
1.172933 Gtype    b'lemma:the'
1.169616 O        b'lemma:ecolus'
1.168181 O        b'-1:lemma:anti-rpos'
1.168181 O        b'+1:lemma:neoclone'
1.166472 Supp     b'+1:lemma:1/100'
1.160136 OD       b'-1:lemma:about'
1.156685 pH       b'-1:lemma:at'
1.151184 Supp     b'+1:lemma:phosphate'
1.147538 Air      b'-1:lemma:%'
1.145406 Technique b'lemma:ChIPSeq'
1.143137 Gtype    b'-1:postag::'
1.142697 Gtype    b'-1:lemma:harbor'
1.139935 Air      b'+1:lemma:%'
1.131569 Supp     b'+1:postag:NNS'
1.129785 O        b'+1:lemma:dfnr'
1.126180 O        b'-1:lemma:0.15'
1.121156 Supp     b'-2:ner:MED'
1.119841 O        b'lemma:genome'
1.118501 O        b'lemma:gade'
1.112123 O        b'-1:lemma:no3'
1.104216 Med      b'-1:lemma:in'
1.102115 O        b'lemma:ip'
1.101796 O        b'lemma:600'
1.101656 pH       b'lemma:ph'
1.099344 Air      b'lemma:%'
1.097518 Phase    b'+1:lemma:phase'
1.093837 Med      b'+1:lemma:supplement'
1.092717 Anti     b'-1:postag::'
1.092217 Supp     b'lemma:0.1'
1.085877 Temp     b'-1:lemma:see'
1.084908 Gversion b'+1:postag:CD'
1.084400 O        b'postag:VBD'
1.071804 Phase    b'lemma:pahse'
1.070591 Phase    b'+1:lemma:-lrb-'
1.070528 Supp     b'lemma:1'
1.069476 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.069041 OD       b'+1:lemma:0.3'
1.065994 Technique b'postag:NNP'
1.061950 Phase    b'+1:postag:-LRB-'
1.058932 O        b'lemma:Fur'
1.054199 O        b'+1:lemma::'
1.044026 Anti     b'+1:lemma:-lrb-'
1.042830 O        b'lemma:fresh'
1.042789 Med      b'+1:lemma:with'
1.039428 OD       b'+1:lemma:of'
1.039395 Med      b'postag:NNP'
1.036587 Temp     b'+1:lemma:sample'
1.031144 Gtype    b'lemma:wild'
1.029796 Anti     b'+1:postag:-LRB-'
1.027091 O        b'-1:lemma:.2'
1.022336 Supp     b'lemma:0.2'
1.017085 Supp     b'lemma:20'
1.014062 Temp     b'+1:lemma:and'
1.006821 Phase    b'-1:lemma:the'
1.004984 Temp     b'+1:lemma:short'
0.992069 O        b'-1:lemma:short'
0.987955 Technique b'lemma:-lrb-'
0.987916 Gtype    b'+1:lemma:small'
0.985757 Med      b'postag:NNS'
0.984529 Gtype    b'-1:lemma:from'
0.981344 Gtype    b'-1:lemma:delta'
0.979111 Technique b'postag:-LRB-'
0.975834 Supp     b'-1:lemma:0.2'
0.972834 Supp     b'-1:lemma:dissolve'
0.972834 Supp     b'+1:lemma:methanol'
0.971482 Temp     b'-1:postag:VB'
0.968409 Temp     b'-1:lemma:at'
0.965405 O        b'+1:ner:SUPP'
0.961534 Air      b'lemma:co2'
0.961107 Air      b'-1:lemma:ryhb'
0.956400 Air      b'+1:lemma:5'
0.954706 OD       b'postag:IN'
0.952277 OD       b'+1:lemma:,'
0.952277 OD       b'+1:postag:,'
0.944354 Technique b'lemma:-rrb-'
0.934505 Agit     b'-1:postag:-LRB-'
0.930480 O        b'lemma:in'
0.930109 Agit     b'-1:lemma:-lrb-'
0.927347 Temp     b'-1:lemma:30'
0.925392 Air      b'+1:lemma:co2'
0.924507 Anti     b'-1:lemma:myc'
0.916139 Phase    b'-1:lemma::'
0.909406 OD       b'lemma:of'
0.907425 O        b'-1:postag:NNP'
0.896528 Supp     b'+1:lemma:with'
0.894677 OD       b'postag:CD'
0.892392 Phase    b'postag:NN'
0.870820 Air      b'-1:lemma:n2'
0.869880 Phase    b'+1:lemma:for'
0.868327 Supp     b'lemma:7.6'


Top negative:
0.181115 Supp     b'+1:lemma:%'
0.178950 O        b'+1:postag:NN'
0.175360 Temp     b'-2:ner:_'
0.173022 Phase    b'+2:ner:_'
0.172486 Air      b'-1:lemma:anaerobically'
0.168280 Air      b'-1:lemma:95'
0.163119 O        b'+1:lemma:respiration'
0.162007 Anti     b'+1:postag:VBN'
0.161644 O        b'+1:postag:CC'
0.160558 O        b'-1:lemma:m63'
0.159182 Gtype    b'postag:-LRB-'
0.157814 Gtype    b'lemma:k12'
0.157814 Gtype    b'-1:lemma:zupt'
0.156016 Technique b'postag:NN'
0.152996 O        b'lemma:and'
0.149869 Agit     b'-1:postag:CD'
0.149804 Med      b'+2:ner:MED'
0.149797 Air      b'+1:ner:_'
0.148431 OD       b'lemma:~'
0.145788 O        b'lemma:0.4'
0.145356 Anti     b'-1:postag:JJ'
0.143938 O        b'+1:lemma:source'
0.143569 O        b'lemma:paraquat'
0.142833 O        b'+1:lemma:glucose'
0.140673 Gtype    b'-1:lemma:the'
0.139164 O        b'lemma:contain'
0.138349 O        b'postag:-LRB-'
0.134338 O        b'-1:lemma:stpa'
0.134335 Temp     b'+1:postag:NN'
0.133106 Supp     b'+1:postag:IN'
0.132467 O        b'-1:lemma:chip'
0.132323 Gtype    b'+1:postag:FW'
0.129736 O        b'lemma:~'
0.123783 Air      b'+1:lemma:_'
0.123344 O        b'+1:ner:GEN'
0.120824 OD       b'-1:lemma:a'
0.120804 Air      b'-1:postag:CC'
0.120782 Gtype    b'lemma:small'
0.120243 Agit     b'+2:ner:_'
0.119984 O        b'-1:lemma:sodium'
0.119706 Air      b'+2:ner:_'
0.114588 O        b'lemma:carbon'
0.114346 Temp     b'+1:postag:JJ'
0.109616 O        b'-1:lemma:4'
0.109067 O        b'+1:lemma:be'
0.105707 Gtype    b'+1:lemma:control'
0.104668 O        b'-1:lemma:dna'
0.102306 Phase    b'-1:ner:_'
0.102008 Supp     b'-2:ner:_'
0.101149 Air      b'+1:postag:CD'
0.098391 Supp     b'lemma:in'
0.095922 Gtype    b'-1:lemma:k-12'
0.095333 O        b'-2:ner:Organism'
0.093931 OD       b'-1:postag:NN'
0.093408 Gtype    b'-1:lemma:rpoh'
0.089470 Supp     b'+1:ner:_'
0.088743 Air      b'+1:postag:NN'
0.085910 O        b'-2:ner:KWSUPP'
0.083365 O        b'+1:lemma:and'
0.079780 Supp     b'+1:lemma:of'
0.079486 O        b'-1:ner:SUPP'
0.079068 Supp     b'+1:postag:NN'
0.077859 Med      b'+1:lemma:media'
0.077618 Temp     b'+1:lemma:.'
0.077618 Temp     b'+1:postag:.'
0.077081 OD       b'+1:postag:CD'
0.074283 O        b'-1:lemma:with'
0.072456 O        b'lemma:phosphate'
0.068897 Supp     b'+1:postag:CC'
0.068458 Supp     b'-1:lemma:.'
0.068458 Supp     b'-1:postag:.'
0.067937 OD       b'-1:postag:JJ'
0.067426 Gtype    b'lemma:ptrc'
0.067426 Gtype    b'-1:lemma:inducible'
0.067322 Med      b'-1:lemma:-rrb-'
0.064815 Med      b'postag:NN'
0.064611 O        b'lemma:2.0'
0.062881 Supp     b'-1:lemma:of'
0.061064 Gtype    b'postag:SYM'
0.061050 O        b'-1:lemma:shake'
0.053091 Supp     b'+1:lemma:nitrate'
0.051589 Med      b'-1:postag:-RRB-'
0.050755 Gversion b'-2:ner:_'
0.050549 O        b'+1:lemma:rnase'
0.050548 O        b'lemma:short'
0.049046 O        b'lemma:='
0.048528 Gtype    b'-1:postag:DT'
0.047987 O        b'-1:ner:Organism'
0.047392 pH       b'postag:CD'
0.047046 O        b'+1:lemma:\xcb\x9ac'
0.045917 O        b'+1:lemma:fructose'
0.045821 Air      b'lemma:-rrb-'
0.045510 O        b'-1:lemma:wp002'
0.044584 O        b'-1:lemma:genoype'
0.044262 Supp     b'+1:lemma:glucose'
0.044173 O        b'+1:lemma:u00096'
0.040820 O        b'lemma:glucose'
0.040053 Supp     b'-1:lemma:1'
0.039130 OD       b'-1:postag:DT'
0.038639 O        b'-1:lemma:rifampicin'
0.037947 Air      b'postag:-RRB-'
0.037823 O        b'+1:postag:FW'
0.037228 Supp     b'-1:postag:CC'
0.036886 Supp     b'-1:lemma:in'
0.036831 O        b'-1:lemma:for'
0.036002 OD       b'+1:lemma:for'
0.032192 Supp     b'+1:lemma:10'
0.028343 Air      b'+1:lemma:-rrb-'
0.027642 Air      b'+1:postag:-RRB-'
0.027430 Anti     b'postag:NN'
0.025555 Air      b'-2:ner:GEN'
0.022661 O        b'-1:lemma:,'
0.022661 O        b'-1:postag:,'
0.019039 O        b'+1:lemma:until'
0.018619 Air      b'-1:postag:-LRB-'
0.018456 Gversion b'+2:ner:_'
0.017457 O        b'-1:lemma:leucine'
0.017183 O        b'lemma:dna'
0.016704 O        b'postag:JJ'
0.016452 O        b'lemma:300'
0.015971 Gtype    b'lemma:-rrb-'
0.012580 Technique b'-1:postag:NN'
0.011792 O        b'+1:lemma:medium'
0.011176 Gversion b'-1:lemma:_'
0.011144 O        b'+1:lemma:tritonx-100'
0.008595 pH       b'-1:ner:_'
0.008289 Temp     b'-1:postag:CD'
0.008085 Supp     b'postag:VBN'
0.008022 Supp     b'-1:postag:SYM'
0.007946 Phase    b'-1:postag::'
0.007801 Air      b'postag:CD'
0.007073 O        b'+1:lemma:pahse'
0.006279 O        b'lemma:control'
0.005868 O        b'-1:lemma:0.35'
0.005387 Air      b'postag:-LRB-'
0.005353 Air      b'-1:lemma:-lrb-'
0.005217 Gtype    b'-1:postag:JJ'
0.005205 Supp     b'+1:lemma:in'
0.004737 Supp     b'+1:lemma:arginine'
0.004465 O        b'lemma:vol'
0.004465 O        b'-1:lemma:1/100'
0.003695 O        b'+1:lemma:dna'
0.003276 O        b'-1:postag:DT'
0.003233 Med      b'-1:postag::'
0.002979 Temp     b'+2:ner:_'
0.002808 Gtype    b'-1:lemma:lacz'
0.002543 O        b'-1:lemma:cra'
0.002382 O        b'-1:lemma:fnr'
0.001717 Supp     b'-1:postag:VBN'
0.001576 Anti     b'lemma:\xce\xb2'
0.001576 Anti     b'-1:lemma:subunit'
0.001340 Air      b'+1:lemma:C'
0.001277 Anti     b'lemma:affinity'
0.001238 Med      b'-1:lemma::'
0.001124 Gtype    b'-1:postag:IN'
0.000970 Air      b'-1:postag:NNP'
0.000942 Gtype    b'-1:postag:-LRB-'
0.000912 Gtype    b'lemma:knock-out'
0.000865 Gtype    b'+1:lemma:strain'
0.000686 Supp     b'lemma:-rrb-'
0.000652 Supp     b'postag:-RRB-'
0.000537 Anti     b'+1:lemma:anti-fur'
0.000536 Anti     b'-1:lemma:affinity'
0.000509 Agit     b'+1:ner:_'
0.000496 Air      b'+1:postag:NNP'
0.000496 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gadw'
0.000496 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gadx'
0.000493 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gade'
0.000421 Gtype    b'lemma:strain'
0.000410 Gtype    b'lemma:-lrb-'
0.000336 Air      b'postag:NNP'
0.000319 Supp     b'+1:postag:SYM'
0.000280 Temp     b'lemma:-rrb-'
0.000265 Temp     b'postag:-RRB-'
0.000239 O        b'+2:ner:GEN'
0.000232 Med      b'lemma:g/l'
0.000230 Gtype    b'+1:lemma:delta'
0.000215 Temp     b'+1:lemma:-rrb-'
0.000179 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
0.000176 O        b'-1:lemma:-'
0.000175 Temp     b'+1:postag:-RRB-'
0.000114 Med      b'-1:lemma:-lrb-'
0.000110 Med      b'-1:postag:-LRB-'
0.000107 O        b'+1:lemma:final'
0.000089 Supp     b'-2:ner:TF'
0.000085 Temp     b'-1:postag:NN'
0.000071 Med      b'-1:lemma:2'
0.000062 Supp     b'lemma:ph'
0.000020 Air      b'+1:lemma:a'
0.000019 O        b'lemma:fnr'
0.000019 Air      b'+1:postag:DT'
0.000014 pH       b'-1:postag:IN'
0.000009 Med      b'lemma:-rrb-'
0.000008 O        b'+1:lemma:genbank'
0.000004 O        b'-1:lemma:-rrb-'
0.000003 Anti     b'lemma:subunit'
0.000003 Anti     b'+1:lemma:\xce\xb2'
0.000003 O        b'lemma:anaerobically'
0.000002 Gtype    b'-1:lemma:dfnr'
0.000001 Anti     b'+1:lemma:subunit'
0.000001 O        b'-1:lemma:anti-rpob'
0.000001 O        b'+1:lemma:Neoclone'
-0.000001 Gtype    b'postag::'
-0.000001 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.000002 Supp     b'lemma:paraquat'
-0.000005 Air      b'-1:lemma:aerobically'
-0.000017 O        b'-1:postag:SYM'
-0.000027 O        b'+1:lemma:sample'
-0.000028 Technique b'-1:lemma::'
-0.000042 Substrain b'-2:ner:_'
-0.000084 O        b'lemma:250'
-0.000092 Substrain b'-1:ner:_'
-0.000148 O        b'lemma:nh4cl'
-0.000160 O        b'lemma:m'
-0.000226 Gtype    b'-1:postag:NNP'
-0.000245 O        b'+1:lemma:the'
-0.000264 O        b'lemma:sample'
-0.000315 O        b'-1:lemma:5'
-0.000337 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.000359 O        b'postag:NN'
-0.000626 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.000634 Anti     b'postag:NNP'
-0.000980 O        b'+1:postag:VBG'
-0.001042 Gtype    b'lemma:control'
-0.001448 O        b'-2:ner:GEN'
-0.004487 O        b'+1:postag:JJ'
-0.004982 Phase    b'-2:ner:SUPP'
-0.005547 Gversion b'+1:ner:_'
-0.005683 O        b'-1:lemma:anaerobically'
-0.005757 Supp     b'-1:lemma:Fe'
-0.005834 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.006329 Strain   b'+2:ner:_'
-0.006401 O        b'lemma:1/100'
-0.006401 O        b'+1:lemma:vol'
-0.006470 Supp     b'+1:lemma:final'
-0.006562 Gtype    b'-1:lemma:-'
-0.006749 O        b'-1:lemma:to'
-0.006749 O        b'-1:postag:TO'
-0.007005 Gtype    b'+1:postag:IN'
-0.007953 O        b'+1:lemma:for'
-0.008729 Supp     b'-1:lemma:the'
-0.008864 O        b'-1:lemma:95'
-0.009134 O        b'+1:lemma:genome'
-0.009475 OD       b'-2:ner:_'
-0.010021 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.010695 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.011344 Supp     b'lemma:.'
-0.011344 Supp     b'postag:.'
-0.011629 Supp     b'-1:lemma:and'
-0.013770 Anti     b'-1:ner:_'
-0.014970 Phase    b'+1:postag:IN'
-0.018059 Supp     b'postag:CD'
-0.018724 Phase    b'-1:postag:IN'
-0.019979 Med      b'-1:postag:NN'
-0.020511 Air      b'-2:ner:_'
-0.022054 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.022140 O        b'-1:lemma:='
-0.023937 Supp     b'+2:ner:KWSUPP'
-0.026253 O        b'+1:lemma:phase'
-0.027970 O        b'-1:lemma:25'
-0.027983 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.028489 Strain   b'postag:NN'
-0.028941 O        b'lemma:final'
-0.032285 Supp     b'-1:lemma:;'
-0.035128 OD       b'postag:JJ'
-0.039791 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.041549 O        b'lemma:;'
-0.041549 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.043319 O        b'lemma:95'
-0.043669 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.043685 O        b'+1:lemma:ph'
-0.044352 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.044423 Supp     b'lemma:and'
-0.045059 O        b'+1:postag:NNS'
-0.045634 Med      b'-1:lemma:or'
-0.045983 Supp     b'+1:ner:SUPP'
-0.046478 Anti     b'-1:postag:NN'
-0.047331 Med      b'+1:postag:NNS'
-0.050501 Supp     b'postag:IN'
-0.050514 Gtype    b'+1:lemma:-rrb-'
-0.051618 O        b'+1:lemma:min'
-0.057111 Med      b'+2:ner:SUPP'
-0.057705 Air      b'-1:ner:_'
-0.058534 O        b'-1:lemma:m9'
-0.063578 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.063578 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.068635 O        b'lemma:25'
-0.068958 O        b'+1:lemma:of'
-0.069716 Supp     b'+1:postag::'
-0.071020 O        b'-1:lemma:the'
-0.072345 Vess     b'postag:NN'
-0.074606 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.084543 Supp     b'lemma:,'
-0.084543 Supp     b'postag:,'
-0.086187 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.086833 O        b'-1:lemma:70'
-0.087585 O        b'lemma:0.2'
-0.095344 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.097342 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.097606 Supp     b'-1:postag:NN'
-0.098152 O        b'+1:lemma:70'
-0.098480 O        b'+1:lemma:25'
-0.099881 Supp     b'+2:ner:_'
-0.100091 O        b'lemma:mg/ml'
-0.100091 O        b'-1:lemma:150'
-0.108876 O        b'+1:lemma:0.3'
-0.112783 O        b'+1:lemma:7.6'
-0.113946 Med      b'-1:ner:MED'
-0.115683 O        b'lemma:70'
-0.115732 O        b'lemma:5'
-0.118853 Gtype    b'-1:lemma:and'
-0.119888 Supp     b'postag::'
-0.121467 Vess     b'-1:ner:_'
-0.122246 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.123251 Anti     b'+2:ner:_'
-0.125693 Gtype    b'-1:postag:CD'
-0.126056 O        b'+1:lemma:300'
-0.139229 O        b'+1:lemma:o2'
-0.139542 O        b'+1:lemma:95'
-0.140057 Supp     b'postag:CC'
-0.141415 O        b'-1:lemma:mm'
-0.142752 O        b'-1:postag:VBG'
-0.147391 O        b'+2:ner:SUPP'
-0.156472 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.157327 Phase    b'-1:lemma:at'
-0.160348 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.165085 O        b'lemma:150'
-0.165085 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.173565 OD       b'lemma:='
-0.177153 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.179295 O        b'+1:lemma:5'
-0.180326 O        b'+1:lemma:at'
-0.181081 Supp     b'+1:lemma:dissolve'
-0.184076 Med      b'+1:ner:MED'
-0.189922 O        b'+1:lemma:.'
-0.189922 O        b'+1:postag:.'
-0.191318 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.192489 O        b'+1:lemma:~'
-0.199374 Agit     b'-2:ner:_'
-0.199655 O        b'+1:postag:CD'
-0.203080 O        b'lemma:rna'
-0.210323 O        b'+1:lemma:a'
-0.210471 O        b'lemma:m9'
-0.211488 O        b'lemma:0.1'
-0.212524 Gtype    b'+1:postag:NN'
-0.225078 Temp     b'postag:JJ'
-0.226626 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.227567 O        b'+1:lemma:n2'
-0.228293 O        b'lemma:min'
-0.232630 O        b'lemma:20'
-0.235933 O        b'lemma:o2'
-0.238623 O        b'+1:lemma:media'
-0.238731 O        b'+1:lemma:co2'
-0.242711 O        b'lemma:1m'
-0.245114 O        b'+1:lemma:mm'
-0.245114 O        b'+1:ner:KWSUPP'
-0.246281 O        b'-1:lemma:of'
-0.246676 O        b'lemma:%'
-0.248334 Agit     b'-1:ner:_'
-0.249319 O        b'-1:lemma:.'
-0.249319 O        b'-1:postag:.'
-0.255855 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.255919 O        b'-1:postag:CD'
-0.257685 O        b'lemma:dissolve'
-0.260556 O        b'-1:lemma:in'
-0.269179 O        b'lemma:7.6'
-0.269179 O        b'+1:lemma:;'
-0.269724 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.278033 O        b'-1:lemma:o2'
-0.284888 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.288796 O        b'lemma:phase'
-0.291922 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.294775 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.304359 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.313836 Supp     b'lemma:300'
-0.323198 Technique b'-1:postag::'
-0.323525 O        b'lemma:nacl'
-0.336307 O        b'lemma:medium'
-0.340551 Med      b'+1:lemma:m9'
-0.342475 Med      b'+1:postag:IN'
-0.345088 O        b'lemma:ph'
-0.345295 O        b'+1:lemma:hour'
-0.345393 O        b'lemma:n2'
-0.356496 O        b'+1:lemma:+'
-0.358289 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.358289 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.359044 O        b'-1:lemma:delta'
-0.366166 Med      b'-1:postag:IN'
-0.367255 Strain   b'-1:ner:_'
-0.373435 O        b'-1:lemma:1m'
-0.375098 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.377124 pH       b'+2:ner:_'
-0.385526 Temp     b'-1:ner:_'
-0.386400 O        b'lemma:co2'
-0.387337 O        b'-1:lemma:~'
-0.395847 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.397844 O        b'lemma:m63'
-0.408132 O        b'lemma:fecl2'
-0.412735 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.413683 O        b'lemma:lb'
-0.422995 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.427524 Supp     b'lemma:10'
-0.431060 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.434353 O        b'+2:ner:MED'
-0.444384 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.450245 O        b'lemma:of'
-0.463410 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.466227 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.469060 O        b'lemma:anaerobic'
-0.478296 O        b'-1:lemma:final'
-0.486229 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.487958 Med      b'-1:postag:CD'
-0.490832 Agit     b'postag:NN'
-0.492668 O        b'-1:lemma:%'
-0.493407 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.495473 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.496415 Med      b'-1:ner:_'
-0.509470 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.509506 O        b'-1:lemma:od600'
-0.513168 O        b'lemma:wt'
-0.516157 O        b'-1:lemma:37'
-0.522449 OD       b'postag:NN'
-0.528176 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.532100 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.532100 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.536173 O        b'+1:lemma:contain'
-0.560412 O        b'+1:postag:IN'
-0.574497 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.586460 O        b'+1:postag:DT'
-0.590988 O        b'-1:lemma:IP'
-0.592468 O        b'lemma:pahse'
-0.592960 O        b'+1:lemma:%'
-0.599880 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.602522 O        b'postag:RB'
-0.617066 O        b'-1:lemma:m'
-0.631385 Gtype    b'+1:lemma:-lrb-'
-0.637868 Med      b'-2:ner:MED'
-0.663199 Strain   b'+1:ner:_'
-0.670387 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.687213 O        b'lemma:od600'
-0.692505 O        b'-1:lemma:n2'
-0.699045 O        b'+1:lemma:1m'
-0.700876 Phase    b'-1:postag:NN'
-0.709934 Med      b'postag:CD'
-0.712558 O        b'lemma:methanol'
-0.715079 O        b'-1:lemma:ph'
-0.725669 O        b'-1:postag:IN'
-0.735544 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.741708 O        b'lemma:37'
-0.798428 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.809468 O        b'lemma:rifampicin'
-0.834371 O        b'+1:lemma:m'
-0.838176 O        b'-1:lemma:ml'
-0.857617 Technique b'+1:ner:_'
-0.896654 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.896865 O        b'lemma:mid-log'
-0.898657 Anti     b'+1:ner:_'
-0.900829 O        b'-1:lemma:until'
-0.902859 O        b'-1:lemma:1'
-0.907888 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.927591 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.963532 Gtype    b'-1:postag:CC'
-0.968995 pH       b'postag:NN'
-0.974785 Air      b'postag:NN'
-1.054269 Gtype    b'postag:CD'
-1.079963 O        b'lemma:minimal'
-1.112187 Temp     b'postag:NN'
-1.135854 O        b'+1:lemma:_'
-1.194638 Med      b'+1:postag:CC'
-1.337213 Med      b'+1:postag:NN'
-1.394403 Supp     b'postag:JJ'
-1.422931 O        b'lemma:media'
-1.459846 O        b'-1:lemma:sample'
-1.461229 Gtype    b'postag:VBG'
-1.462704 O        b'lemma:0.3'
-1.502406 O        b'-2:ner:TF'
-1.605291 O        b'-1:lemma:contain'
-1.632894 O        b'lemma:30'
-1.633349 Air      b'-1:postag:VBN'
-1.635013 O        b'-1:postag::'
-1.687840 O        b'+1:lemma:1'
-1.701388 Phase    b'-1:postag:JJ'
-1.706560 O        b'+1:lemma:in'
-1.716924 O        b'-1:lemma:30'
-1.719059 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-1.817231 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-1.869324 OD       b'+1:postag:NN'
-1.910636 O        b'lemma:aerobically'
-1.924693 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-1.988331 Supp     b'-1:postag:NNP'
-2.048344 Supp     b'+1:lemma:,'
-2.048344 Supp     b'+1:postag:,'
-2.061753 O        b'+1:lemma:2'
-2.076332 O        b'-1:lemma:vol'
-2.438299 O        b'-1:lemma:co2'
-2.448600 O        b'-1:lemma:_'
-3.129777 O        b'-1:lemma:2'
-3.150736 Phase    b'postag:JJ'
-3.729116 Temp     b'+1:lemma:with'
-4.998094 O        b'-1:lemma::'