report_Run9_v10.txt
37.4 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.07373162431323503, 'c2': 6.022010399845652e-06}
best CV score:0.8189566663670631
model size: 0.07M
Flat F1: 0.8121784396734127
precision recall f1-score support
OD 0.913 1.000 0.955 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.804 0.891 56
Temp 0.857 0.800 0.828 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.590 0.557 0.573 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.877 0.821 0.848 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.864 0.838 0.851 136
Gversion 1.000 0.667 0.800 6
avg / total 0.843 0.787 0.812 484
Top likely transitions:
Anti -> Anti 7.049648
Temp -> Temp 6.253064
Med -> Med 5.773039
Phase -> Phase 5.455338
Supp -> Supp 5.445922
Gtype -> Gtype 5.280278
Air -> Air 5.241489
Gversion -> Gversion 4.849856
OD -> OD 4.638420
Technique -> Technique 4.282425
pH -> pH 3.661913
O -> O 3.512794
Agit -> Agit 2.597507
Substrain -> Gtype 1.789194
Technique -> Air 1.287937
Gtype -> Supp 1.081370
O -> Technique 0.524586
Air -> O 0.495973
Anti -> O 0.224321
Technique -> O 0.003972
Gtype -> pH 0.001422
Gtype -> Air 0.001369
O -> Substrain -0.000007
Phase -> Air -0.005628
Temp -> O -0.030324
O -> Gtype -0.109735
O -> Supp -0.150755
O -> Anti -0.174870
Phase -> O -0.217439
Supp -> O -0.233058
Temp -> Med -0.273365
O -> Temp -0.320957
Gtype -> Anti -0.358227
O -> Med -0.470668
O -> Phase -0.707125
Med -> O -0.866608
OD -> O -0.890798
O -> OD -0.959144
Technique -> pH -1.079166
Air -> Phase -1.152076
Gtype -> O -1.268811
Supp -> Med -1.563131
Technique -> Gtype -1.575628
OD -> Air -1.596555
Substrain -> O -2.278213
Phase -> OD -2.330790
O -> Air -2.597242
Med -> Supp -3.113613
Top unlikely transitions:
Anti -> Anti 7.049648
Temp -> Temp 6.253064
Med -> Med 5.773039
Phase -> Phase 5.455338
Supp -> Supp 5.445922
Gtype -> Gtype 5.280278
Air -> Air 5.241489
Gversion -> Gversion 4.849856
OD -> OD 4.638420
Technique -> Technique 4.282425
pH -> pH 3.661913
O -> O 3.512794
Agit -> Agit 2.597507
Substrain -> Gtype 1.789194
Technique -> Air 1.287937
Gtype -> Supp 1.081370
O -> Technique 0.524586
Air -> O 0.495973
Anti -> O 0.224321
Technique -> O 0.003972
Gtype -> pH 0.001422
Gtype -> Air 0.001369
O -> Substrain -0.000007
Phase -> Air -0.005628
Temp -> O -0.030324
O -> Gtype -0.109735
O -> Supp -0.150755
O -> Anti -0.174870
Phase -> O -0.217439
Supp -> O -0.233058
Temp -> Med -0.273365
O -> Temp -0.320957
Gtype -> Anti -0.358227
O -> Med -0.470668
O -> Phase -0.707125
Med -> O -0.866608
OD -> O -0.890798
O -> OD -0.959144
Technique -> pH -1.079166
Air -> Phase -1.152076
Gtype -> O -1.268811
Supp -> Med -1.563131
Technique -> Gtype -1.575628
OD -> Air -1.596555
Substrain -> O -2.278213
Phase -> OD -2.330790
O -> Air -2.597242
Med -> Supp -3.113613
Top positive:
12.695542 Supp b'lemma:Iron'
10.931807 O b'lemma:_'
9.744757 Med b'lemma:MOPS'
9.582794 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
9.527405 Technique b'lemma:chipseq'
8.842391 Air b'lemma:aerobically'
8.809763 Phase b'lemma:stationary'
8.809763 Phase b'lemma:exponential'
8.779194 O b'lemma:-'
8.594661 Supp b'lemma:pq'
7.958285 Air b'lemma:anaerobic'
7.754881 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
7.695360 Phase b'lemma:mid-log'
7.620292 Technique b'lemma:ChIP-exo'
7.614690 Air b'lemma:aerobic'
7.567065 O b'lemma:b'
7.521873 Strain b'lemma:k-12'
7.384214 O b'lemma:Cra'
7.286059 O b'-1:lemma:tag'
7.242984 Med b'lemma:LB'
7.206911 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
6.965286 Gtype b'lemma:wt'
6.963163 Gtype b'+1:lemma:type'
6.773032 O b'lemma:rpob'
6.626583 Gversion b'lemma:asm584v2'
6.581226 Gtype b'lemma:type'
6.515748 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
6.337646 Supp b'-1:lemma:Cra'
6.326289 Supp b'lemma:2h'
6.326289 Supp b'-1:lemma:additional'
6.086272 Substrain b'lemma:mg1655'
6.036346 Supp b'lemma:no3'
5.974010 Gtype b'lemma:arca8myc'
5.915109 O b'lemma:1'
5.817719 O b'lemma:at'
5.808354 O b'lemma:with'
5.707337 O b'-1:lemma:pq'
5.698253 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
5.603136 Supp b'lemma:iptg'
5.461367 Strain b'+1:lemma:substr'
5.416148 Supp b'lemma:nacl'
5.395392 Temp b'-1:lemma:sample'
5.348909 Gversion b'lemma:000913'
5.345729 Technique b'lemma:rna-seq'
5.312152 Vess b'lemma:flask'
5.312152 Vess b'-1:lemma:warm'
5.258371 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
5.243276 O b'-1:lemma:glucose'
5.214321 O b'+1:lemma:wt'
5.202703 Gversion b'lemma:nc'
5.164541 Supp b'lemma:dpd'
5.077420 Gtype b'lemma:dfnr'
5.054020 O b'lemma:3'
5.053522 Gtype b'lemma:delta-fnr'
5.046437 O b'lemma:a'
5.033844 O b'lemma:rep2'
5.033844 O b'lemma:rep1'
5.018361 Gtype b'lemma:pk4854'
5.014318 Temp b'-1:lemma:37'
4.975642 O b'lemma:2'
4.962146 Gtype b'-1:lemma:factor'
4.895653 Supp b'-1:lemma:vol'
4.888635 Technique b'lemma:rnaseq'
4.854787 OD b'lemma:od450'
4.793939 O b'-1:lemma:nacl'
4.791043 Supp b'+1:lemma:iptg'
4.778131 Gtype b'+1:lemma:ph5'
4.751928 Air b'lemma:anaeroibc'
4.722087 Med b'-1:lemma:ml'
4.716120 O b'-1:lemma:0.3'
4.677628 O b'-1:lemma:lb'
4.666211 O b'postag:VBG'
4.646623 Supp b'lemma:Leu'
4.645891 O b'lemma:purr'
4.555114 O b'-1:lemma:acetate'
4.527822 Supp b'lemma:nh4cl'
4.489928 O b'lemma:chip'
4.482316 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
4.479061 O b'lemma:trpr'
4.456509 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
4.451070 O b'lemma:\xcf\x8332'
4.433314 Air b'-1:lemma:co2'
4.430445 Supp b'lemma:Fe'
4.417801 O b'lemma:for'
4.414866 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
4.389434 Anti b'lemma:\xcf\x8332'
4.326667 Gtype b'lemma:delta-arca'
4.312773 O b'-1:postag:NNS'
4.306431 Gtype b'lemma:fnr8myc'
4.291196 Anti b'+1:lemma:antibody'
4.290609 Air b'-1:lemma:-'
4.289787 Anti b'lemma:none'
4.285638 O b'lemma:ompr'
4.281187 O b'lemma:gadx'
4.269164 O b'-1:lemma:fructose'
4.247504 Supp b'lemma:rifampicin'
4.242826 O b'-1:lemma:type'
4.229447 Med b'-1:lemma:fresh'
4.204570 Gtype b'lemma:WT'
4.200422 Med b'lemma:lb'
4.197349 Med b'+1:lemma:0.4'
4.191440 O b'+1:lemma:k-12'
4.159419 Agit b'lemma:rpm'
4.106271 Anti b'lemma:seqa'
4.075734 Technique b'lemma:chip-seq'
4.074011 O b'lemma:affyexp'
4.053239 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
4.015120 Agit b'+1:lemma:rpm'
3.993428 Gversion b'-1:lemma:nc'
3.993428 Gversion b'+1:lemma:000913'
3.935996 Agit b'-1:lemma:250'
3.929972 O b'lemma:.'
3.929972 O b'postag:.'
3.915403 O b'lemma:CEL'
3.906034 Med b'lemma:media'
3.896917 Supp b'lemma:Adenine'
3.892436 Supp b'-1:lemma:potassium'
3.885998 O b'lemma:argr'
3.868380 Technique b'-1:lemma:IP'
3.865807 Supp b'-1:lemma:+'
3.836351 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
3.835217 pH b'lemma:ph5'
3.835217 pH b'+1:lemma:.5'
3.832165 O b'lemma:soxr'
3.832165 O b'lemma:soxs'
3.812051 O b'+1:lemma:od600'
3.808842 pH b'lemma:5.5'
3.749813 Supp b'lemma:arginine'
3.740609 Substrain b'lemma:mg1655star'
3.729389 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.725591 O b'+1:lemma:pq'
3.683961 Gtype b'lemma:wild-type'
3.662774 Gtype b'-1:lemma:rpob'
3.642740 Gtype b'+1:lemma:pq'
3.612840 Gversion b'lemma:u00096'
3.612840 Gversion b'+1:lemma:.2'
3.583429 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
3.564316 Gversion b'lemma:.2'
3.564316 Gversion b'-1:lemma:u00096'
3.551838 Med b'lemma:m63'
3.549663 Gtype b'lemma:oxyr-8myc'
3.549663 Gtype b'lemma:soxr-8myc'
3.549663 Gtype b'lemma:soxs-8myc'
3.520794 O b'-1:lemma:into'
3.517363 Technique b'lemma:chip-exo'
3.485051 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
3.480812 O b'lemma:genotype/variation'
3.445139 Phase b'-1:lemma:until'
3.432735 O b'lemma:s'
3.416608 Technique b'+1:ner:TF'
3.380664 O b'lemma::'
3.370063 O b'lemma:chip-arca'
3.362577 OD b'-1:lemma:od450'
3.358577 Supp b'-1:ner:SUPP'
3.340572 Supp b'+1:lemma:1'
3.279773 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
3.279773 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
3.274136 O b'+1:lemma:43'
3.266113 Technique b'-1:lemma:input'
3.257451 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
3.254542 Gtype b'lemma:deltaseqa'
3.254542 Gtype b'-1:lemma:old'
3.239215 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
3.234873 O b'+1:lemma:wash'
3.196570 pH b'+1:postag:CD'
3.192056 O b'lemma:from'
3.173721 O b'+1:lemma:250'
3.148637 Med b'+1:lemma:2.0'
3.143350 O b'+1:lemma:20'
3.140446 Gtype b'-1:ner:GEN'
3.106931 O b'lemma:Lrp'
3.103605 Temp b'-1:lemma:43'
3.087773 O b'lemma:oxyr'
3.082707 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
3.066936 Temp b'lemma:43'
3.026699 Supp b'+1:lemma:hour'
3.025005 Supp b'-1:lemma:with'
3.018641 Supp b'lemma:acetate'
3.016937 O b'+1:lemma:mid-log'
2.942030 O b'lemma:culture'
2.941677 O b'-1:lemma:Aerobic'
2.938625 Med b'lemma:medium'
2.919438 O b'-1:lemma:min'
2.892440 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.890484 O b'+1:lemma:coli'
2.862489 Gtype b'lemma:wildtype'
2.859547 Supp b'+1:lemma:Deficient'
2.847406 O b'lemma:chip-fnr'
2.842076 Air b'-1:lemma:cm20'
2.822898 O b'-1:lemma:medium'
2.813096 Gtype b'lemma:fnr-8myc'
2.803914 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.801366 Supp b'+1:lemma:2'
2.786379 O b'-2:ner:MED'
2.775655 O b'postag:CC'
2.732371 Agit b'lemma:250'
2.713499 Gtype b'+1:lemma:cra'
2.710768 Gtype b'lemma:flagtag'
2.648197 Gtype b'-1:postag:VBG'
2.637048 Anti b'lemma:anti-rpob'
2.627132 Air b'-1:lemma:_'
2.626645 Supp b'-1:lemma:final'
2.613537 OD b'-1:lemma:~'
2.601343 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.598858 O b'lemma:cra'
2.583918 Supp b'-1:lemma:without'
2.571868 pH b'+1:lemma:5.5'
2.558464 Anti b'lemma:anti-myc'
2.546992 Anti b'lemma:anti-rpos'
2.545995 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
2.545865 Supp b'+1:lemma:m'
2.532819 O b'-1:lemma:Anaerobic'
2.515797 O b'lemma:harbor'
2.504020 O b'postag::'
2.480975 OD b'lemma:od600'
2.480802 O b'+1:lemma:old'
2.480538 O b'-1:lemma:wt'
2.477719 O b'lemma:delta'
2.471387 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.467072 Gtype b'lemma:ptac'
2.462150 O b'lemma:input'
2.462150 O b'+1:lemma:chip-seq'
2.443379 Gtype b'+1:lemma:with'
2.436839 O b'lemma:c'
2.425786 Supp b'+1:lemma:min'
2.425105 Med b'-1:lemma:glucose'
2.421848 Supp b'lemma:sodium'
2.420367 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.418765 O b'-1:lemma:dpd'
2.406904 O b'lemma:pt7'
2.395829 O b'lemma:A'
2.394478 Supp b'lemma:glutamine'
2.394478 Supp b'-1:lemma:2g/l'
2.386884 O b'+1:ner:MED'
2.380912 Gtype b'+1:lemma:_'
2.335824 Gversion b'+1:lemma:genome'
2.323592 Supp b'lemma:glucose'
2.302890 Gtype b'-1:lemma:_'
2.302466 Supp b'-1:lemma:m'
2.294539 O b'lemma:growth'
2.292085 O b'-1:lemma:l1'
2.289800 pH b'-1:lemma:ph'
2.286150 O b'lemma:ntrc'
2.286150 O b'lemma:csir'
2.282696 O b'-1:lemma:nitrate'
2.270427 O b'+1:postag:RB'
2.265461 Gtype b'lemma:\xce\xb4arca'
2.247973 OD b'lemma:o.d.'
2.247973 OD b'+1:lemma:600nm'
2.246241 Supp b'-1:lemma:respiration'
2.246241 Supp b'+1:lemma:mmol'
2.244383 Med b'lemma:minimal'
2.238661 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.225320 Med b'-1:lemma:minimal'
2.219865 Gtype b'lemma:delta-soxr'
2.219865 Gtype b'lemma:delta-gadx'
2.219865 Gtype b'lemma:delta-gadw'
2.219865 Gtype b'lemma:delta-oxyr'
2.219865 Gtype b'lemma:delta-gade'
2.219865 Gtype b'lemma:delta-soxs'
2.219107 Supp b'lemma:tryptophan'
2.219107 Supp b'-1:lemma:mg/l'
2.219031 Gtype b'lemma:ompr-8myc'
2.215080 Supp b'-1:lemma:sodium'
2.214748 Gtype b'lemma:gade-8myc'
2.214748 Gtype b'lemma:\xce\xb4seqa'
2.203131 Supp b'lemma:fructose'
2.191560 O b'-1:lemma:.5'
2.142604 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.130826 O b'lemma:genotype'
2.124210 Gtype b'lemma:purr-8myc'
2.107698 Air b'postag:RB'
2.107612 Supp b'lemma:Trp'
2.104931 Supp b'+1:lemma:1m'
2.094124 Supp b'+1:lemma:_'
2.089817 O b'lemma:Nac'
2.077437 Supp b'lemma:150'
2.077437 Supp b'+1:lemma:mg/ml'
2.045177 O b'lemma:lrp'
2.037355 O b'-1:lemma:nh4cl'
2.036731 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
2.032682 O b'postag:IN'
2.030624 O b'+1:lemma:sparging'
2.022474 O b'lemma:treatment'
2.021840 OD b'lemma:0.3-0.35'
1.995383 Temp b'lemma:sample'
1.989122 O b'-1:lemma:grow'
1.977024 O b'lemma:ml'
1.977007 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.971683 O b'+1:lemma:30'
1.964952 Supp b'-1:lemma:_'
1.958162 Med b'+1:lemma:g/l'
1.949365 Supp b'lemma:cm20'
1.949365 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.936878 Med b'+1:lemma:+'
1.921536 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.912683 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.908498 OD b'lemma:0.3'
1.897897 Supp b'+1:lemma:anaerobically'
1.897332 Substrain b'-1:lemma:.'
1.897332 Substrain b'-1:postag:.'
1.885114 O b'postag:VBN'
1.882500 O b'-1:lemma:concentration'
1.882500 O b'+1:lemma:150'
1.845449 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.826635 O b'+1:lemma:acetate'
1.817751 Gtype b'+1:lemma:the'
1.814387 O b'lemma:or'
1.812861 Supp b'lemma:30'
1.812421 Vess b'+1:lemma:at'
1.794853 O b'-1:lemma:arginine'
1.785644 Gtype b'lemma:fur-8myc'
1.785644 Gtype b'lemma:cra-8myc-tagged'
1.782237 Gtype b'lemma:lrp-8myc'
1.781679 Air b'postag:JJ'
1.779627 Temp b'+1:lemma:see'
1.778132 Gtype b'+2:ner:SUPP'
1.774727 Gtype b'lemma:_'
1.757470 O b'-1:lemma:0.3-0.35'
1.742716 Supp b'lemma:1m'
1.715402 Air b'-1:lemma:anerobically'
1.712550 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.704069 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
1.687275 Temp b'lemma:37'
1.669570 O b'+1:lemma:dpd'
1.658383 Technique b'-1:lemma:1'
1.653732 O b'postag:DT'
1.653166 Supp b'lemma:final'
1.649424 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
1.591133 O b'+1:postag:NNP'
1.582616 O b'+1:lemma:0.2'
1.574998 Gtype b'lemma:phtpg'
1.572125 pH b'lemma:.5'
1.572125 pH b'-1:lemma:ph5'
1.561376 OD b'-1:lemma:od600'
1.557474 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.554991 O b'-1:lemma:genotype'
1.552769 O b'lemma:additional'
1.552769 O b'+1:lemma:2h'
1.552404 O b'+2:ner:KWSUPP'
1.551932 O b'+1:lemma:minute'
1.551790 O b'lemma:rnase'
1.541514 Gtype b'lemma:ryhb'
1.538219 Supp b'lemma:2g/l'
1.538219 Supp b'+1:lemma:glutamine'
1.535076 Gtype b'+1:postag::'
1.531668 OD b'+1:postag:IN'
1.521356 Supp b'+1:lemma:mg/l'
1.515746 OD b'-1:lemma:600nm'
1.512051 Med b'+1:lemma:minimal'
1.490813 Gversion b'lemma:_'
1.479709 O b'+1:lemma:m9'
1.477021 Anti b'-1:lemma::'
1.476871 Vess b'-1:postag:VBN'
1.459351 Supp b'-1:postag:CD'
1.458056 OD b'lemma:600nm'
1.458056 OD b'-1:lemma:o.d.'
1.453576 Phase b'+1:lemma:culture'
1.440907 Supp b'lemma:m'
1.440706 O b'-1:lemma:crp'
1.415540 Supp b'+1:lemma:mm'
1.415540 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
1.407390 Air b'lemma:Anaerobic'
1.400840 Phase b'lemma:phase'
1.399252 O b'-1:lemma:after'
1.398710 O b'lemma:C'
1.390839 Air b'-1:postag:CD'
1.387058 Technique b'-2:ner:TF'
1.380807 Gtype b'postag:JJ'
1.378365 Anti b'-1:lemma:polymerase'
1.366280 O b'+1:lemma:o.d.'
1.359115 O b'lemma:tag'
1.357128 Air b'lemma:anerobically'
1.347386 O b'lemma:old'
1.347386 O b'-1:lemma:seqa'
1.347386 O b'+1:lemma:deltaseqa'
1.327960 O b'postag:NNS'
1.324921 Gversion b'-1:lemma:the'
1.316876 Supp b'-1:lemma:mm'
1.314196 Technique b'-1:lemma:_'
1.296294 Gtype b'-1:lemma::'
1.293462 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
1.284367 O b'+1:lemma:nacl'
1.278076 Gtype b'lemma:nsrr'
1.276584 Strain b'-1:lemma:.'
1.276584 Strain b'-1:postag:.'
1.272329 Supp b'lemma:of'
1.268236 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.254899 Air b'+1:lemma:at'
1.247160 Supp b'postag:NNP'
1.245126 Supp b'lemma:methanol'
1.244852 O b'lemma:induction'
1.242575 Gtype b'lemma:crp'
1.241640 Supp b'-1:lemma:1m'
1.239028 O b'+1:ner:_'
1.236778 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.227474 Supp b'-1:lemma::'
1.224092 Anti b'+1:lemma:from'
1.221758 Med b'+1:postag:CD'
1.220877 O b'+2:ner:_'
1.219806 Supp b'-1:postag:IN'
1.215559 OD b'-1:postag:IN'
1.211540 O b'-1:ner:_'
1.210643 O b'lemma:um'
1.210167 O b'-1:lemma:-80'
1.203822 OD b'lemma:0.35'
1.194362 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.192621 Air b'-1:postag::'
1.189461 O b'lemma:gadw'
1.184209 OD b'-1:lemma:at'
1.172933 Gtype b'lemma:the'
1.169616 O b'lemma:ecolus'
1.168181 O b'-1:lemma:anti-rpos'
1.168181 O b'+1:lemma:neoclone'
1.166472 Supp b'+1:lemma:1/100'
1.160136 OD b'-1:lemma:about'
1.156685 pH b'-1:lemma:at'
1.151184 Supp b'+1:lemma:phosphate'
1.147538 Air b'-1:lemma:%'
1.145406 Technique b'lemma:ChIPSeq'
1.143137 Gtype b'-1:postag::'
1.142697 Gtype b'-1:lemma:harbor'
1.139935 Air b'+1:lemma:%'
1.131569 Supp b'+1:postag:NNS'
1.129785 O b'+1:lemma:dfnr'
1.126180 O b'-1:lemma:0.15'
1.121156 Supp b'-2:ner:MED'
1.119841 O b'lemma:genome'
1.118501 O b'lemma:gade'
1.112123 O b'-1:lemma:no3'
1.104216 Med b'-1:lemma:in'
1.102115 O b'lemma:ip'
1.101796 O b'lemma:600'
1.101656 pH b'lemma:ph'
1.099344 Air b'lemma:%'
1.097518 Phase b'+1:lemma:phase'
1.093837 Med b'+1:lemma:supplement'
1.092717 Anti b'-1:postag::'
1.092217 Supp b'lemma:0.1'
1.085877 Temp b'-1:lemma:see'
1.084908 Gversion b'+1:postag:CD'
1.084400 O b'postag:VBD'
1.071804 Phase b'lemma:pahse'
1.070591 Phase b'+1:lemma:-lrb-'
1.070528 Supp b'lemma:1'
1.069476 O b'-1:lemma:mg1655'
1.069041 OD b'+1:lemma:0.3'
1.065994 Technique b'postag:NNP'
1.061950 Phase b'+1:postag:-LRB-'
1.058932 O b'lemma:Fur'
1.054199 O b'+1:lemma::'
1.044026 Anti b'+1:lemma:-lrb-'
1.042830 O b'lemma:fresh'
1.042789 Med b'+1:lemma:with'
1.039428 OD b'+1:lemma:of'
1.039395 Med b'postag:NNP'
1.036587 Temp b'+1:lemma:sample'
1.031144 Gtype b'lemma:wild'
1.029796 Anti b'+1:postag:-LRB-'
1.027091 O b'-1:lemma:.2'
1.022336 Supp b'lemma:0.2'
1.017085 Supp b'lemma:20'
1.014062 Temp b'+1:lemma:and'
1.006821 Phase b'-1:lemma:the'
1.004984 Temp b'+1:lemma:short'
0.992069 O b'-1:lemma:short'
0.987955 Technique b'lemma:-lrb-'
0.987916 Gtype b'+1:lemma:small'
0.985757 Med b'postag:NNS'
0.984529 Gtype b'-1:lemma:from'
0.981344 Gtype b'-1:lemma:delta'
0.979111 Technique b'postag:-LRB-'
0.975834 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.972834 Supp b'-1:lemma:dissolve'
0.972834 Supp b'+1:lemma:methanol'
0.971482 Temp b'-1:postag:VB'
0.968409 Temp b'-1:lemma:at'
0.965405 O b'+1:ner:SUPP'
0.961534 Air b'lemma:co2'
0.961107 Air b'-1:lemma:ryhb'
0.956400 Air b'+1:lemma:5'
0.954706 OD b'postag:IN'
0.952277 OD b'+1:lemma:,'
0.952277 OD b'+1:postag:,'
0.944354 Technique b'lemma:-rrb-'
0.934505 Agit b'-1:postag:-LRB-'
0.930480 O b'lemma:in'
0.930109 Agit b'-1:lemma:-lrb-'
0.927347 Temp b'-1:lemma:30'
0.925392 Air b'+1:lemma:co2'
0.924507 Anti b'-1:lemma:myc'
0.916139 Phase b'-1:lemma::'
0.909406 OD b'lemma:of'
0.907425 O b'-1:postag:NNP'
0.896528 Supp b'+1:lemma:with'
0.894677 OD b'postag:CD'
0.892392 Phase b'postag:NN'
0.870820 Air b'-1:lemma:n2'
0.869880 Phase b'+1:lemma:for'
0.868327 Supp b'lemma:7.6'
Top negative:
0.181115 Supp b'+1:lemma:%'
0.178950 O b'+1:postag:NN'
0.175360 Temp b'-2:ner:_'
0.173022 Phase b'+2:ner:_'
0.172486 Air b'-1:lemma:anaerobically'
0.168280 Air b'-1:lemma:95'
0.163119 O b'+1:lemma:respiration'
0.162007 Anti b'+1:postag:VBN'
0.161644 O b'+1:postag:CC'
0.160558 O b'-1:lemma:m63'
0.159182 Gtype b'postag:-LRB-'
0.157814 Gtype b'lemma:k12'
0.157814 Gtype b'-1:lemma:zupt'
0.156016 Technique b'postag:NN'
0.152996 O b'lemma:and'
0.149869 Agit b'-1:postag:CD'
0.149804 Med b'+2:ner:MED'
0.149797 Air b'+1:ner:_'
0.148431 OD b'lemma:~'
0.145788 O b'lemma:0.4'
0.145356 Anti b'-1:postag:JJ'
0.143938 O b'+1:lemma:source'
0.143569 O b'lemma:paraquat'
0.142833 O b'+1:lemma:glucose'
0.140673 Gtype b'-1:lemma:the'
0.139164 O b'lemma:contain'
0.138349 O b'postag:-LRB-'
0.134338 O b'-1:lemma:stpa'
0.134335 Temp b'+1:postag:NN'
0.133106 Supp b'+1:postag:IN'
0.132467 O b'-1:lemma:chip'
0.132323 Gtype b'+1:postag:FW'
0.129736 O b'lemma:~'
0.123783 Air b'+1:lemma:_'
0.123344 O b'+1:ner:GEN'
0.120824 OD b'-1:lemma:a'
0.120804 Air b'-1:postag:CC'
0.120782 Gtype b'lemma:small'
0.120243 Agit b'+2:ner:_'
0.119984 O b'-1:lemma:sodium'
0.119706 Air b'+2:ner:_'
0.114588 O b'lemma:carbon'
0.114346 Temp b'+1:postag:JJ'
0.109616 O b'-1:lemma:4'
0.109067 O b'+1:lemma:be'
0.105707 Gtype b'+1:lemma:control'
0.104668 O b'-1:lemma:dna'
0.102306 Phase b'-1:ner:_'
0.102008 Supp b'-2:ner:_'
0.101149 Air b'+1:postag:CD'
0.098391 Supp b'lemma:in'
0.095922 Gtype b'-1:lemma:k-12'
0.095333 O b'-2:ner:Organism'
0.093931 OD b'-1:postag:NN'
0.093408 Gtype b'-1:lemma:rpoh'
0.089470 Supp b'+1:ner:_'
0.088743 Air b'+1:postag:NN'
0.085910 O b'-2:ner:KWSUPP'
0.083365 O b'+1:lemma:and'
0.079780 Supp b'+1:lemma:of'
0.079486 O b'-1:ner:SUPP'
0.079068 Supp b'+1:postag:NN'
0.077859 Med b'+1:lemma:media'
0.077618 Temp b'+1:lemma:.'
0.077618 Temp b'+1:postag:.'
0.077081 OD b'+1:postag:CD'
0.074283 O b'-1:lemma:with'
0.072456 O b'lemma:phosphate'
0.068897 Supp b'+1:postag:CC'
0.068458 Supp b'-1:lemma:.'
0.068458 Supp b'-1:postag:.'
0.067937 OD b'-1:postag:JJ'
0.067426 Gtype b'lemma:ptrc'
0.067426 Gtype b'-1:lemma:inducible'
0.067322 Med b'-1:lemma:-rrb-'
0.064815 Med b'postag:NN'
0.064611 O b'lemma:2.0'
0.062881 Supp b'-1:lemma:of'
0.061064 Gtype b'postag:SYM'
0.061050 O b'-1:lemma:shake'
0.053091 Supp b'+1:lemma:nitrate'
0.051589 Med b'-1:postag:-RRB-'
0.050755 Gversion b'-2:ner:_'
0.050549 O b'+1:lemma:rnase'
0.050548 O b'lemma:short'
0.049046 O b'lemma:='
0.048528 Gtype b'-1:postag:DT'
0.047987 O b'-1:ner:Organism'
0.047392 pH b'postag:CD'
0.047046 O b'+1:lemma:\xcb\x9ac'
0.045917 O b'+1:lemma:fructose'
0.045821 Air b'lemma:-rrb-'
0.045510 O b'-1:lemma:wp002'
0.044584 O b'-1:lemma:genoype'
0.044262 Supp b'+1:lemma:glucose'
0.044173 O b'+1:lemma:u00096'
0.040820 O b'lemma:glucose'
0.040053 Supp b'-1:lemma:1'
0.039130 OD b'-1:postag:DT'
0.038639 O b'-1:lemma:rifampicin'
0.037947 Air b'postag:-RRB-'
0.037823 O b'+1:postag:FW'
0.037228 Supp b'-1:postag:CC'
0.036886 Supp b'-1:lemma:in'
0.036831 O b'-1:lemma:for'
0.036002 OD b'+1:lemma:for'
0.032192 Supp b'+1:lemma:10'
0.028343 Air b'+1:lemma:-rrb-'
0.027642 Air b'+1:postag:-RRB-'
0.027430 Anti b'postag:NN'
0.025555 Air b'-2:ner:GEN'
0.022661 O b'-1:lemma:,'
0.022661 O b'-1:postag:,'
0.019039 O b'+1:lemma:until'
0.018619 Air b'-1:postag:-LRB-'
0.018456 Gversion b'+2:ner:_'
0.017457 O b'-1:lemma:leucine'
0.017183 O b'lemma:dna'
0.016704 O b'postag:JJ'
0.016452 O b'lemma:300'
0.015971 Gtype b'lemma:-rrb-'
0.012580 Technique b'-1:postag:NN'
0.011792 O b'+1:lemma:medium'
0.011176 Gversion b'-1:lemma:_'
0.011144 O b'+1:lemma:tritonx-100'
0.008595 pH b'-1:ner:_'
0.008289 Temp b'-1:postag:CD'
0.008085 Supp b'postag:VBN'
0.008022 Supp b'-1:postag:SYM'
0.007946 Phase b'-1:postag::'
0.007801 Air b'postag:CD'
0.007073 O b'+1:lemma:pahse'
0.006279 O b'lemma:control'
0.005868 O b'-1:lemma:0.35'
0.005387 Air b'postag:-LRB-'
0.005353 Air b'-1:lemma:-lrb-'
0.005217 Gtype b'-1:postag:JJ'
0.005205 Supp b'+1:lemma:in'
0.004737 Supp b'+1:lemma:arginine'
0.004465 O b'lemma:vol'
0.004465 O b'-1:lemma:1/100'
0.003695 O b'+1:lemma:dna'
0.003276 O b'-1:postag:DT'
0.003233 Med b'-1:postag::'
0.002979 Temp b'+2:ner:_'
0.002808 Gtype b'-1:lemma:lacz'
0.002543 O b'-1:lemma:cra'
0.002382 O b'-1:lemma:fnr'
0.001717 Supp b'-1:postag:VBN'
0.001576 Anti b'lemma:\xce\xb2'
0.001576 Anti b'-1:lemma:subunit'
0.001340 Air b'+1:lemma:C'
0.001277 Anti b'lemma:affinity'
0.001238 Med b'-1:lemma::'
0.001124 Gtype b'-1:postag:IN'
0.000970 Air b'-1:postag:NNP'
0.000942 Gtype b'-1:postag:-LRB-'
0.000912 Gtype b'lemma:knock-out'
0.000865 Gtype b'+1:lemma:strain'
0.000686 Supp b'lemma:-rrb-'
0.000652 Supp b'postag:-RRB-'
0.000537 Anti b'+1:lemma:anti-fur'
0.000536 Anti b'-1:lemma:affinity'
0.000509 Agit b'+1:ner:_'
0.000496 Air b'+1:postag:NNP'
0.000496 Gtype b'lemma:\xce\xb4gadw'
0.000496 Gtype b'lemma:\xce\xb4gadx'
0.000493 Gtype b'lemma:\xce\xb4gade'
0.000421 Gtype b'lemma:strain'
0.000410 Gtype b'lemma:-lrb-'
0.000336 Air b'postag:NNP'
0.000319 Supp b'+1:postag:SYM'
0.000280 Temp b'lemma:-rrb-'
0.000265 Temp b'postag:-RRB-'
0.000239 O b'+2:ner:GEN'
0.000232 Med b'lemma:g/l'
0.000230 Gtype b'+1:lemma:delta'
0.000215 Temp b'+1:lemma:-rrb-'
0.000179 O b'lemma:\xc2\xb0c'
0.000176 O b'-1:lemma:-'
0.000175 Temp b'+1:postag:-RRB-'
0.000114 Med b'-1:lemma:-lrb-'
0.000110 Med b'-1:postag:-LRB-'
0.000107 O b'+1:lemma:final'
0.000089 Supp b'-2:ner:TF'
0.000085 Temp b'-1:postag:NN'
0.000071 Med b'-1:lemma:2'
0.000062 Supp b'lemma:ph'
0.000020 Air b'+1:lemma:a'
0.000019 O b'lemma:fnr'
0.000019 Air b'+1:postag:DT'
0.000014 pH b'-1:postag:IN'
0.000009 Med b'lemma:-rrb-'
0.000008 O b'+1:lemma:genbank'
0.000004 O b'-1:lemma:-rrb-'
0.000003 Anti b'lemma:subunit'
0.000003 Anti b'+1:lemma:\xce\xb2'
0.000003 O b'lemma:anaerobically'
0.000002 Gtype b'-1:lemma:dfnr'
0.000001 Anti b'+1:lemma:subunit'
0.000001 O b'-1:lemma:anti-rpob'
0.000001 O b'+1:lemma:Neoclone'
-0.000001 Gtype b'postag::'
-0.000001 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.000002 Supp b'lemma:paraquat'
-0.000005 Air b'-1:lemma:aerobically'
-0.000017 O b'-1:postag:SYM'
-0.000027 O b'+1:lemma:sample'
-0.000028 Technique b'-1:lemma::'
-0.000042 Substrain b'-2:ner:_'
-0.000084 O b'lemma:250'
-0.000092 Substrain b'-1:ner:_'
-0.000148 O b'lemma:nh4cl'
-0.000160 O b'lemma:m'
-0.000226 Gtype b'-1:postag:NNP'
-0.000245 O b'+1:lemma:the'
-0.000264 O b'lemma:sample'
-0.000315 O b'-1:lemma:5'
-0.000337 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.000359 O b'postag:NN'
-0.000626 O b'-1:lemma:g/l'
-0.000634 Anti b'postag:NNP'
-0.000980 O b'+1:postag:VBG'
-0.001042 Gtype b'lemma:control'
-0.001448 O b'-2:ner:GEN'
-0.004487 O b'+1:postag:JJ'
-0.004982 Phase b'-2:ner:SUPP'
-0.005547 Gversion b'+1:ner:_'
-0.005683 O b'-1:lemma:anaerobically'
-0.005757 Supp b'-1:lemma:Fe'
-0.005834 O b'-1:lemma:iptg'
-0.006329 Strain b'+2:ner:_'
-0.006401 O b'lemma:1/100'
-0.006401 O b'+1:lemma:vol'
-0.006470 Supp b'+1:lemma:final'
-0.006562 Gtype b'-1:lemma:-'
-0.006749 O b'-1:lemma:to'
-0.006749 O b'-1:postag:TO'
-0.007005 Gtype b'+1:postag:IN'
-0.007953 O b'+1:lemma:for'
-0.008729 Supp b'-1:lemma:the'
-0.008864 O b'-1:lemma:95'
-0.009134 O b'+1:lemma:genome'
-0.009475 OD b'-2:ner:_'
-0.010021 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.010695 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.011344 Supp b'lemma:.'
-0.011344 Supp b'postag:.'
-0.011629 Supp b'-1:lemma:and'
-0.013770 Anti b'-1:ner:_'
-0.014970 Phase b'+1:postag:IN'
-0.018059 Supp b'postag:CD'
-0.018724 Phase b'-1:postag:IN'
-0.019979 Med b'-1:postag:NN'
-0.020511 Air b'-2:ner:_'
-0.022054 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.022140 O b'-1:lemma:='
-0.023937 Supp b'+2:ner:KWSUPP'
-0.026253 O b'+1:lemma:phase'
-0.027970 O b'-1:lemma:25'
-0.027983 O b'-1:lemma:0.1'
-0.028489 Strain b'postag:NN'
-0.028941 O b'lemma:final'
-0.032285 Supp b'-1:lemma:;'
-0.035128 OD b'postag:JJ'
-0.039791 Med b'-1:lemma:m63'
-0.041549 O b'lemma:;'
-0.041549 O b'-1:lemma:7.6'
-0.043319 O b'lemma:95'
-0.043669 O b'+1:lemma:1/100'
-0.043685 O b'+1:lemma:ph'
-0.044352 Gtype b'+1:ner:_'
-0.044423 Supp b'lemma:and'
-0.045059 O b'+1:postag:NNS'
-0.045634 Med b'-1:lemma:or'
-0.045983 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.046478 Anti b'-1:postag:NN'
-0.047331 Med b'+1:postag:NNS'
-0.050501 Supp b'postag:IN'
-0.050514 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.051618 O b'+1:lemma:min'
-0.057111 Med b'+2:ner:SUPP'
-0.057705 Air b'-1:ner:_'
-0.058534 O b'-1:lemma:m9'
-0.063578 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.063578 Gtype b'-1:postag:,'
-0.068635 O b'lemma:25'
-0.068958 O b'+1:lemma:of'
-0.069716 Supp b'+1:postag::'
-0.071020 O b'-1:lemma:the'
-0.072345 Vess b'postag:NN'
-0.074606 Phase b'+1:postag:NN'
-0.084543 Supp b'lemma:,'
-0.084543 Supp b'postag:,'
-0.086187 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.086833 O b'-1:lemma:70'
-0.087585 O b'lemma:0.2'
-0.095344 Supp b'-1:lemma:%'
-0.097342 Supp b'-1:postag:DT'
-0.097606 Supp b'-1:postag:NN'
-0.098152 O b'+1:lemma:70'
-0.098480 O b'+1:lemma:25'
-0.099881 Supp b'+2:ner:_'
-0.100091 O b'lemma:mg/ml'
-0.100091 O b'-1:lemma:150'
-0.108876 O b'+1:lemma:0.3'
-0.112783 O b'+1:lemma:7.6'
-0.113946 Med b'-1:ner:MED'
-0.115683 O b'lemma:70'
-0.115732 O b'lemma:5'
-0.118853 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.119888 Supp b'postag::'
-0.121467 Vess b'-1:ner:_'
-0.122246 Supp b'postag:-LRB-'
-0.123251 Anti b'+2:ner:_'
-0.125693 Gtype b'-1:postag:CD'
-0.126056 O b'+1:lemma:300'
-0.139229 O b'+1:lemma:o2'
-0.139542 O b'+1:lemma:95'
-0.140057 Supp b'postag:CC'
-0.141415 O b'-1:lemma:mm'
-0.142752 O b'-1:postag:VBG'
-0.147391 O b'+2:ner:SUPP'
-0.156472 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.157327 Phase b'-1:lemma:at'
-0.160348 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.165085 O b'lemma:150'
-0.165085 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.173565 OD b'lemma:='
-0.177153 Temp b'+1:postag:IN'
-0.179295 O b'+1:lemma:5'
-0.180326 O b'+1:lemma:at'
-0.181081 Supp b'+1:lemma:dissolve'
-0.184076 Med b'+1:ner:MED'
-0.189922 O b'+1:lemma:.'
-0.189922 O b'+1:postag:.'
-0.191318 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.192489 O b'+1:lemma:~'
-0.199374 Agit b'-2:ner:_'
-0.199655 O b'+1:postag:CD'
-0.203080 O b'lemma:rna'
-0.210323 O b'+1:lemma:a'
-0.210471 O b'lemma:m9'
-0.211488 O b'lemma:0.1'
-0.212524 Gtype b'+1:postag:NN'
-0.225078 Temp b'postag:JJ'
-0.226626 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.227567 O b'+1:lemma:n2'
-0.228293 O b'lemma:min'
-0.232630 O b'lemma:20'
-0.235933 O b'lemma:o2'
-0.238623 O b'+1:lemma:media'
-0.238731 O b'+1:lemma:co2'
-0.242711 O b'lemma:1m'
-0.245114 O b'+1:lemma:mm'
-0.245114 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.246281 O b'-1:lemma:of'
-0.246676 O b'lemma:%'
-0.248334 Agit b'-1:ner:_'
-0.249319 O b'-1:lemma:.'
-0.249319 O b'-1:postag:.'
-0.255855 O b'-1:lemma:0.2'
-0.255919 O b'-1:postag:CD'
-0.257685 O b'lemma:dissolve'
-0.260556 O b'-1:lemma:in'
-0.269179 O b'lemma:7.6'
-0.269179 O b'+1:lemma:;'
-0.269724 O b'-2:ner:SUPP'
-0.278033 O b'-1:lemma:o2'
-0.284888 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.288796 O b'lemma:phase'
-0.291922 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.294775 O b'+1:lemma:minimal'
-0.304359 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.313836 Supp b'lemma:300'
-0.323198 Technique b'-1:postag::'
-0.323525 O b'lemma:nacl'
-0.336307 O b'lemma:medium'
-0.340551 Med b'+1:lemma:m9'
-0.342475 Med b'+1:postag:IN'
-0.345088 O b'lemma:ph'
-0.345295 O b'+1:lemma:hour'
-0.345393 O b'lemma:n2'
-0.356496 O b'+1:lemma:+'
-0.358289 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.358289 Gtype b'+1:postag:,'
-0.359044 O b'-1:lemma:delta'
-0.366166 Med b'-1:postag:IN'
-0.367255 Strain b'-1:ner:_'
-0.373435 O b'-1:lemma:1m'
-0.375098 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.377124 pH b'+2:ner:_'
-0.385526 Temp b'-1:ner:_'
-0.386400 O b'lemma:co2'
-0.387337 O b'-1:lemma:~'
-0.395847 O b'+1:lemma:g/l'
-0.397844 O b'lemma:m63'
-0.408132 O b'lemma:fecl2'
-0.412735 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.413683 O b'lemma:lb'
-0.422995 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.427524 Supp b'lemma:10'
-0.431060 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.434353 O b'+2:ner:MED'
-0.444384 O b'-1:lemma:minimal'
-0.450245 O b'lemma:of'
-0.463410 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.466227 O b'+1:lemma:supplement'
-0.469060 O b'lemma:anaerobic'
-0.478296 O b'-1:lemma:final'
-0.486229 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.487958 Med b'-1:postag:CD'
-0.490832 Agit b'postag:NN'
-0.492668 O b'-1:lemma:%'
-0.493407 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.495473 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.496415 Med b'-1:ner:_'
-0.509470 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.509506 O b'-1:lemma:od600'
-0.513168 O b'lemma:wt'
-0.516157 O b'-1:lemma:37'
-0.522449 OD b'postag:NN'
-0.528176 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.532100 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.532100 O b'+1:lemma:methanol'
-0.536173 O b'+1:lemma:contain'
-0.560412 O b'+1:postag:IN'
-0.574497 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.586460 O b'+1:postag:DT'
-0.590988 O b'-1:lemma:IP'
-0.592468 O b'lemma:pahse'
-0.592960 O b'+1:lemma:%'
-0.599880 O b'-1:lemma:fresh'
-0.602522 O b'postag:RB'
-0.617066 O b'-1:lemma:m'
-0.631385 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-0.637868 Med b'-2:ner:MED'
-0.663199 Strain b'+1:ner:_'
-0.670387 O b'-1:lemma:rpob'
-0.687213 O b'lemma:od600'
-0.692505 O b'-1:lemma:n2'
-0.699045 O b'+1:lemma:1m'
-0.700876 Phase b'-1:postag:NN'
-0.709934 Med b'postag:CD'
-0.712558 O b'lemma:methanol'
-0.715079 O b'-1:lemma:ph'
-0.725669 O b'-1:postag:IN'
-0.735544 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.741708 O b'lemma:37'
-0.798428 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.809468 O b'lemma:rifampicin'
-0.834371 O b'+1:lemma:m'
-0.838176 O b'-1:lemma:ml'
-0.857617 Technique b'+1:ner:_'
-0.896654 Air b'-1:lemma:grow'
-0.896865 O b'lemma:mid-log'
-0.898657 Anti b'+1:ner:_'
-0.900829 O b'-1:lemma:until'
-0.902859 O b'-1:lemma:1'
-0.907888 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.927591 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.963532 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.968995 pH b'postag:NN'
-0.974785 Air b'postag:NN'
-1.054269 Gtype b'postag:CD'
-1.079963 O b'lemma:minimal'
-1.112187 Temp b'postag:NN'
-1.135854 O b'+1:lemma:_'
-1.194638 Med b'+1:postag:CC'
-1.337213 Med b'+1:postag:NN'
-1.394403 Supp b'postag:JJ'
-1.422931 O b'lemma:media'
-1.459846 O b'-1:lemma:sample'
-1.461229 Gtype b'postag:VBG'
-1.462704 O b'lemma:0.3'
-1.502406 O b'-2:ner:TF'
-1.605291 O b'-1:lemma:contain'
-1.632894 O b'lemma:30'
-1.633349 Air b'-1:postag:VBN'
-1.635013 O b'-1:postag::'
-1.687840 O b'+1:lemma:1'
-1.701388 Phase b'-1:postag:JJ'
-1.706560 O b'+1:lemma:in'
-1.716924 O b'-1:lemma:30'
-1.719059 Supp b'+1:lemma:acetate'
-1.817231 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-1.869324 OD b'+1:postag:NN'
-1.910636 O b'lemma:aerobically'
-1.924693 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-1.988331 Supp b'-1:postag:NNP'
-2.048344 Supp b'+1:lemma:,'
-2.048344 Supp b'+1:postag:,'
-2.061753 O b'+1:lemma:2'
-2.076332 O b'-1:lemma:vol'
-2.438299 O b'-1:lemma:co2'
-2.448600 O b'-1:lemma:_'
-3.129777 O b'-1:lemma:2'
-3.150736 Phase b'postag:JJ'
-3.729116 Temp b'+1:lemma:with'
-4.998094 O b'-1:lemma::'