report_Run6_v13.txt 38.4 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 1141 1142 1143 1144 1145 1146 1147 1148 1149 1150 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.04040337116517548, 'c2': 0.0019871392632971135}
best CV score:0.8577895989909314
model size: 0.10M

Flat F1: 0.8139145759412987
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.937     0.756     0.837        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.864     0.838     0.851       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.861     0.777     0.814       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    7.192233
Med    -> Med     5.844921
Anti   -> Anti    5.663028
Supp   -> Supp    5.580135
Gversion -> Gversion 5.476031
Gtype  -> Gtype   5.351023
OD     -> OD      5.319429
Air    -> Air     4.087764
pH     -> pH      3.892224
Phase  -> Phase   3.780925
O      -> O       3.383635
Technique -> Technique 3.308413
Agit   -> Agit    3.175925
Substrain -> Gtype   2.402019
Gtype  -> Supp    0.385280
O      -> Technique 0.179286
Technique -> Air     0.169543
O      -> Gtype   0.051163
Temp   -> O       0.026710
Strain -> O       -0.004767
O      -> Strain  -0.048585
Med    -> O       -0.053655
pH     -> O       -0.057644
Air    -> Supp    -0.100050
Gtype  -> Med     -0.133670
Technique -> Gtype   -0.214788
Gtype  -> Technique -0.220532
Phase  -> Air     -0.228816
Gversion -> O       -0.230872
Anti   -> Supp    -0.260706
O      -> Temp    -0.285988
O      -> Gversion -0.302005
O      -> pH      -0.345616
Supp   -> Phase   -0.351130
Gtype  -> Phase   -0.371104
O      -> OD      -0.386381
Phase  -> OD      -0.393438
O      -> Supp    -0.426110
Air    -> Phase   -0.526114
Air    -> OD      -0.574572
Agit   -> Air     -0.616830
O      -> Anti    -0.641695
Anti   -> O       -0.646730
Air    -> O       -0.751769
OD     -> Air     -0.756494
O      -> Phase   -0.806157
Supp   -> O       -0.867214
Phase  -> O       -0.917180
Anti   -> Gtype   -1.023580
Supp   -> Med     -1.037544
Gtype  -> Temp    -1.167093
O      -> Med     -1.200609
Temp   -> Med     -1.324189
Technique -> O       -1.382429
OD     -> O       -1.403237
Gtype  -> O       -1.964415
Substrain -> O       -2.335998
Technique -> pH      -2.431722
O      -> Air     -2.519969
Med    -> Supp    -2.647949


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    7.192233
Med    -> Med     5.844921
Anti   -> Anti    5.663028
Supp   -> Supp    5.580135
Gversion -> Gversion 5.476031
Gtype  -> Gtype   5.351023
OD     -> OD      5.319429
Air    -> Air     4.087764
pH     -> pH      3.892224
Phase  -> Phase   3.780925
O      -> O       3.383635
Technique -> Technique 3.308413
Agit   -> Agit    3.175925
Substrain -> Gtype   2.402019
Gtype  -> Supp    0.385280
O      -> Technique 0.179286
Technique -> Air     0.169543
O      -> Gtype   0.051163
Temp   -> O       0.026710
Strain -> O       -0.004767
O      -> Strain  -0.048585
Med    -> O       -0.053655
pH     -> O       -0.057644
Air    -> Supp    -0.100050
Gtype  -> Med     -0.133670
Technique -> Gtype   -0.214788
Gtype  -> Technique -0.220532
Phase  -> Air     -0.228816
Gversion -> O       -0.230872
Anti   -> Supp    -0.260706
O      -> Temp    -0.285988
O      -> Gversion -0.302005
O      -> pH      -0.345616
Supp   -> Phase   -0.351130
Gtype  -> Phase   -0.371104
O      -> OD      -0.386381
Phase  -> OD      -0.393438
O      -> Supp    -0.426110
Air    -> Phase   -0.526114
Air    -> OD      -0.574572
Agit   -> Air     -0.616830
O      -> Anti    -0.641695
Anti   -> O       -0.646730
Air    -> O       -0.751769
OD     -> Air     -0.756494
O      -> Phase   -0.806157
Supp   -> O       -0.867214
Phase  -> O       -0.917180
Anti   -> Gtype   -1.023580
Supp   -> Med     -1.037544
Gtype  -> Temp    -1.167093
O      -> Med     -1.200609
Temp   -> Med     -1.324189
Technique -> O       -1.382429
OD     -> O       -1.403237
Gtype  -> O       -1.964415
Substrain -> O       -2.335998
Technique -> pH      -2.431722
O      -> Air     -2.519969
Med    -> Supp    -2.647949


Top positive:
10.071711 O        b'-2:lemma:_'
9.687056 Phase    b'-2:lemma:phase'
8.519482 Anti     b'-2:lemma:antibody'
8.280508 O        b'lemma:-'
8.150065 Supp     b'lemma:no3'
8.000690 Air      b'lemma:anaerobic'
7.944101 Supp     b'-2:lemma:shake'
7.491120 Gtype    b'lemma:type'
7.463359 O        b'lemma:1'
7.340191 O        b'lemma:_'
7.090340 Med      b'lemma:MOPS'
7.080554 Gtype    b'lemma:wt'
6.877952 Air      b'lemma:aerobic'
6.741586 O        b'lemma:2'
6.684707 Supp     b'lemma:pq'
6.623378 Technique b'lemma:chipseq'
6.423412 O        b'lemma:3'
6.186981 Gtype    b'+1:lemma:type'
6.110488 Gtype    b'hGreek'
5.964315 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
5.896855 O        b'-1:postag:NNS'
5.886828 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
5.820852 O        b'lemma:with'
5.776943 Supp     b'lemma:nh4cl'
5.697543 O        b'postag:VBG'
5.538554 Supp     b'lemma:acetate'
5.405845 Supp     b'lemma:Iron'
5.405845 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
5.396288 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
5.395870 Air      b'-2:lemma:IP'
5.275403 O        b'lemma:b'
5.110398 Supp     b'lemma:arginine'
5.089856 Supp     b'-1:lemma:+'
4.992810 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
4.862622 Supp     b'lemma:2h'
4.862622 Supp     b'-1:lemma:additional'
4.859641 Phase    b'lemma:mid-log'
4.745449 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
4.687533 OD       b'-2:lemma:od450'
4.687362 O        b'lemma:Cra'
4.602781 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
4.565248 Supp     b'-1:lemma:Cra'
4.559805 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
4.559564 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
4.550354 O        b'lemma:.'
4.550354 O        b'postag:.'
4.543905 O        b'+1:lemma:wt'
4.542465 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
4.505562 Gversion b'lemma:chip-seq'
4.396297 O        b'+2:lemma:crp'
4.393542 Med      b'lemma:LB'
4.389588 O        b'-1:lemma:0.3'
4.383928 Gtype    b'lemma:pk4854'
4.342282 Gtype    b'lemma:dfnr'
4.289948 Supp     b'+2:lemma:iptg'
4.288872 Med      b'+2:lemma:b2'
4.235089 Substrain b'-2:lemma:substr'
4.208516 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.194225 Supp     b'lemma:nacl'
4.159483 Supp     b'lemma:iptg'
4.147789 Supp     b'-2:lemma:purr'
4.126878 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
4.120599 Supp     b'lemma:glucose'
4.074905 O        b'-2:lemma:myc'
3.975380 O        b'lemma:rep2'
3.975380 O        b'lemma:rep1'
3.969746 Air      b'lemma:anaeroibc'
3.969406 O        b'-1:lemma:lb'
3.947295 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.866206 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
3.855798 O        b'lemma::'
3.853189 O        b'+1:lemma:od600'
3.852601 O        b'-1:lemma:tag'
3.851505 O        b'-1:lemma:type'
3.814836 Med      b'+2:lemma:b1'
3.776312 O        b'-1:lemma:glucose'
3.722393 O        b'lemma:for'
3.711203 Temp     b'lemma:43'
3.708255 Substrain b'lemma:mg1655'
3.680904 O        b'lemma:harbor'
3.622428 Phase    b'postag:NN'
3.595354 O        b'lemma:CEL'
3.566068 Air      b'-1:lemma:-'
3.526828 O        b'+1:postag:RB'
3.495178 Strain   b'lemma:k-12'
3.467019 Supp     b'+1:lemma:2'
3.462860 Supp     b'+2:lemma:feso4'
3.423444 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
3.419455 O        b'lemma:genotype/variation'
3.393043 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
3.391282 O        b'-1:lemma:anaerobic'
3.361978 Technique b'-1:lemma:input'
3.335942 O        b'+1:lemma:250'
3.318302 pH       b'lemma:ph5'
3.318302 pH       b'+1:lemma:.5'
3.288476 Air      b'-2:lemma:0.3'
3.265449 Supp     b'+1:lemma:1'
3.249308 Supp     b'-2:lemma:media'
3.225422 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
3.195449 pH       b'lemma:5.5'
3.191084 O        b'lemma:a'
3.185530 O        b'lemma:rpob'
3.172707 Temp     b'-1:lemma:sample'
3.157641 Gtype    b'-2:lemma:delta'
3.132664 Supp     b'lemma:Leu'
3.132664 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
3.130549 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
3.130549 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
3.128358 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.111730 Supp     b'lemma:Adenine'
3.064066 Air      b'lemma:aerobically'
3.061234 pH       b'+1:lemma:5.5'
3.047714 Med      b'-1:lemma:ml'
3.033694 Supp     b'lemma:fructose'
3.026987 Air      b'-2:lemma:fnr'
3.000690 O        b'-2:lemma:medium'
2.978771 Temp     b'-1:lemma:37'
2.965286 O        b'-2:lemma:fructose'
2.950315 Med      b'lemma:minimal'
2.947997 Technique b'-1:lemma:_'
2.914465 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.910000 O        b'-1:lemma:nitrate'
2.909729 Supp     b'-1:lemma:with'
2.891070 Air      b'postag:RB'
2.885583 O        b'lemma:chip'
2.885398 OD       b'lemma:od450'
2.859815 O        b'+1:lemma:rifampicin'
2.852630 O        b'+2:lemma:_'
2.847905 O        b'-1:lemma:mg1655'
2.841379 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.833744 O        b'lemma:soxr'
2.833744 O        b'lemma:soxs'
2.827057 O        b'+1:lemma:coli'
2.825461 O        b'postag:IN'
2.813711 O        b'postag::'
2.800978 Technique b'lemma:rnaseq'
2.797139 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
2.794415 O        b'lemma:trpr'
2.791729 O        b'lemma:\xcf\x8332'
2.790249 Supp     b'-2:lemma:agent'
2.778746 Substrain b'lemma:mg1655star'
2.713112 Supp     b'-1:lemma:_'
2.711692 Supp     b'-2:lemma:argr'
2.710989 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.707801 Temp     b'lemma:37'
2.682574 O        b'lemma:culture'
2.648397 O        b'lemma:gadx'
2.638869 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
2.638869 Gtype    b'-1:lemma:old'
2.638869 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
2.627050 O        b'lemma:ml'
2.602738 O        b'-1:lemma:medium'
2.594675 Technique b'lemma:rna-seq'
2.594624 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.558666 O        b'-2:lemma:overnight'
2.556760 Supp     b'-1:lemma:ompr'
2.520267 O        b'+2:lemma:allow'
2.504057 OD       b'-1:lemma:at'
2.479276 O        b'+1:lemma:0.2'
2.478810 Supp     b'-1:lemma:30'
2.450863 Gversion b'lemma:asm584v2'
2.439992 O        b'lemma:purr'
2.437941 Gtype    b'lemma:ptac'
2.429861 Med      b'lemma:medium'
2.429744 O        b'-1:lemma:wt'
2.426012 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.414730 Vess     b'lemma:flask'
2.414730 Vess     b'-1:lemma:warm'
2.414730 Vess     b'-2:lemma:pre'
2.414730 Vess     b'+2:lemma:43'
2.406323 Gtype    b'-1:lemma:wild'
2.404798 Med      b'lemma:media'
2.395850 O        b'lemma:argr'
2.392689 Med      b'+1:lemma:g/l'
2.369025 Technique b'hUpper'
2.341741 Gtype    b'lemma:arca8myc'
2.341741 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
2.327539 Med      b'-2:lemma:minimal'
2.302914 Med      b'-1:lemma:minimal'
2.301825 Temp     b'-2:lemma:keep'
2.298400 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.282334 O        b'postag:VBN'
2.270387 Agit     b'+1:lemma:rpm'
2.267832 Med      b'lemma:lb'
2.265490 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
2.259284 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.249430 Gversion b'lemma:.2'
2.249430 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.246324 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.235953 O        b'lemma:oxyr'
2.221128 Gversion b'lemma:u00096'
2.221128 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.215971 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
2.215436 Phase    b'+1:lemma:phase'
2.209470 Agit     b'lemma:rpm'
2.198634 Agit     b'-1:lemma:250'
2.195927 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.192533 Med      b'+2:lemma:+'
2.183571 Strain   b'-2:lemma:strain'
2.174082 O        b'+1:lemma:mid-log'
2.170257 O        b'+1:postag:NNP'
2.169918 Med      b'lemma:m63'
2.154939 Supp     b'-2:lemma:for'
2.152544 Supp     b'lemma:glutamine'
2.152544 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
2.143870 Air      b'postag:JJ'
2.142723 O        b'-2:lemma:~'
2.141487 O        b'-2:lemma:='
2.133107 O        b'-1:lemma:min'
2.118584 O        b'lemma:A'
2.117551 O        b'lemma:ompr'
2.115392 O        b'-1:lemma:-80'
2.107254 O        b'-1:lemma:into'
2.092310 Technique b'-2:lemma:wt'
2.090981 Temp     b'-1:lemma:43'
2.086480 O        b'lemma:growth'
2.084041 Med      b'+1:lemma:0.4'
2.082072 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.078422 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
2.070217 O        b'postag:VBD'
2.067431 O        b'lemma:affyexp'
2.033112 Agit     b'lemma:250'
2.031074 Supp     b'+2:lemma:A'
2.024541 O        b'-2:lemma:reach'
2.014234 O        b'-1:lemma:antibody'
2.006976 Gversion b'lemma:000913'
2.006976 Gversion b'-2:lemma:nc'
2.003607 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.984876 pH       b'lemma:.5'
1.984876 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.980281 Med      b'-2:lemma:fresh'
1.958343 O        b'+1:lemma:sparging'
1.956303 pH       b'+1:postag:CD'
1.951854 Air      b'-1:lemma:co2'
1.947393 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.941087 Phase    b'-2:lemma:until'
1.938844 Technique b'-1:lemma:IP'
1.931979 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.931900 Technique b'lemma:chip-seq'
1.922369 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.908250 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.905303 Med      b'postag:NNS'
1.899698 Gtype    b'-2:lemma:dna'
1.877057 Gversion b'-2:lemma:build'
1.865639 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.856964 O        b'lemma:input'
1.856964 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.855986 O        b'+1:lemma:20'
1.855407 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.855407 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.854590 O        b'lemma:at'
1.851033 O        b'postag:DT'
1.843213 O        b'lemma:chip-arca'
1.843213 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.827704 O        b'lemma:additional'
1.827704 O        b'+1:lemma:2h'
1.825743 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.808063 O        b'lemma:cra'
1.803217 Med      b'+2:postag:CC'
1.795116 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.793622 Supp     b'-1:lemma:potassium'
1.793622 Supp     b'-2:lemma:mmol'
1.760478 O        b'+1:lemma::'
1.758922 Gtype    b'+1:postag::'
1.753764 Supp     b'-2:lemma:trpr'
1.751706 OD       b'+1:lemma:of'
1.751047 O        b'+1:lemma:pq'
1.737807 O        b'lemma:chip-fnr'
1.737807 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
1.737667 Technique b'lemma:chip-exo'
1.737423 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.726057 OD       b'lemma:0.3'
1.705804 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
1.700120 OD       b'+1:postag:IN'
1.698334 O        b'symb'
1.693018 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.689723 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.685560 Gtype    b'postag:JJ'
1.684453 O        b'+2:postag:VB'
1.683121 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.681213 Air      b'-2:lemma:mid-log'
1.678501 Supp     b'+2:lemma:nh4cl'
1.669457 Air      b'-1:lemma:phase'
1.663174 Supp     b'-2:lemma:20'
1.650165 O        b'lemma:='
1.648351 O        b'-1:lemma:dpd'
1.645008 Supp     b'lemma:30'
1.641996 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.620773 O        b'-2:lemma:37'
1.611533 O        b'-1:lemma:0.35'
1.609434 Supp     b'-1:lemma:without'
1.607805 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.607327 O        b'lemma:fresh'
1.603487 O        b'-1:lemma:rpm'
1.597793 Phase    b'lemma:stationary'
1.597793 Phase    b'lemma:exponential'
1.593726 O        b'lemma:or'
1.589893 Supp     b'lemma:Fe'
1.588320 Supp     b'-2:lemma:10'
1.584236 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.584236 Strain   b'-2:lemma:str'
1.567137 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.563530 Air      b'-1:lemma:_'
1.562616 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.562202 Supp     b'-1:lemma:2'
1.559251 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.556324 Air      b'+2:lemma:37'
1.544439 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.544439 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.539452 Med      b'lemma:glucose'
1.539376 O        b'-2:lemma:min'
1.535970 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.533338 OD       b'lemma:od600'
1.516960 Gversion b'-2:postag:VB'
1.516756 O        b'+2:lemma:rpm'
1.514212 Vess     b'-2:postag:JJ'
1.510438 O        b'-1:lemma:nacl'
1.500237 O        b'-1:lemma:genbank'
1.499163 OD       b'-1:postag:IN'
1.495076 O        b'+1:postag:VBZ'
1.494964 O        b'+2:lemma:constant'
1.484823 Supp     b'+1:lemma:m'
1.483568 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.474867 Gtype    b'lemma:ryhb'
1.473586 O        b'lemma:treatment'
1.472117 Med      b'-1:lemma:fresh'
1.460840 O        b'-2:lemma:co2'
1.458948 O        b'+2:lemma:TEX'
1.458488 O        b'lemma:be'
1.455562 Supp     b'-2:lemma:condition'
1.442240 O        b'-1:postag:NNP'
1.438610 Phase    b'lemma:pahse'
1.416920 O        b'+2:postag:JJ'
1.408393 Supp     b'+2:lemma:leucine'
1.408283 Gversion b'lemma:nc'
1.408283 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.404585 Substrain b'+2:lemma::'
1.401219 OD       b'postag:CD'
1.395733 OD       b'postag:IN'
1.394349 Air      b'-2:lemma:cm20'
1.387675 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.377905 O        b'-1:lemma:induce'
1.368612 Anti     b'-1:lemma:myc'
1.368612 Anti     b'-2:lemma:9e10'
1.348630 O        b'+2:lemma:wt'
1.342213 Technique b'-2:postag:NNP'
1.340136 O        b'-1:lemma:4'
1.338369 O        b'-2:lemma:final'
1.335834 Supp     b'+1:lemma:_'
1.334304 O        b'+1:lemma:b1'
1.331299 Gtype    b'+1:lemma:the'
1.330313 O        b'-1:lemma:pq'
1.330212 O        b'lemma:-lrb-'
1.323426 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.323426 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.311722 Med      b'-2:lemma:medium'
1.309231 pH       b'-1:lemma:at'
1.309042 O        b'lemma:old'
1.309042 O        b'-1:lemma:seqa'
1.309042 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
1.301707 Air      b'-2:lemma:%'
1.301258 O        b'+2:lemma:of'
1.296277 Supp     b'lemma:0.2'
1.295133 Anti     b'postag:JJ'
1.292647 O        b'lemma:lrp'
1.289348 Med      b'+1:lemma:+'
1.285632 Gtype    b'-1:lemma:from'
1.272592 Med      b'-1:lemma:in'
1.270040 Agit     b'+2:lemma:at'
1.268254 Supp     b'+2:lemma:ph'
1.268179 O        b'postag:NNS'
1.265826 Air      b'+2:lemma:%'
1.259570 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.257913 O        b'-2:lemma:0.2'
1.254595 OD       b'lemma:of'
1.252810 Supp     b'+1:lemma:1m'
1.252810 Supp     b'-2:lemma:vol'
1.248623 Supp     b'lemma:dpd'
1.248298 O        b'postag:CC'
1.245172 Supp     b'-1:lemma:respiration'
1.245172 Supp     b'+1:lemma:mmol'
1.245172 Supp     b'+2:lemma:potassium'
1.241485 Air      b'+1:lemma:%'
1.239333 Med      b'-2:lemma:treatment'
1.232463 Air      b'lemma:%'
1.220202 Air      b'-2:postag:CD'
1.219431 Gtype    b'+2:postag::'
1.217182 Anti     b'-2:lemma:purify'
1.214732 O        b'lemma:-rrb-'
1.209541 Air      b'-1:lemma:%'
1.207303 O        b'lemma:+'
1.202958 O        b'+1:lemma:acetate'
1.200221 O        b'lemma:-80'
1.200221 O        b'-2:lemma:freeze'
1.197093 Supp     b'lemma:tryptophan'
1.197093 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
1.192622 Med      b'-1:lemma:LB'
1.192622 Med      b'+2:lemma:1mm'
1.186114 O        b'-1:lemma:0.3-0.35'
1.181116 O        b'+1:lemma:read'
1.172545 Technique b'+1:lemma:gadx'
1.172491 Gtype    b'lemma:crp'
1.171733 O        b'+2:lemma:w/v'
1.171177 OD       b'lemma:o.d.'
1.171177 OD       b'+1:lemma:600nm'
1.170988 Supp     b'-1:lemma:0.2'
1.165628 OD       b'-2:lemma:phase'
1.159605 O        b'-1:lemma:w0002'
1.153736 O        b'-1:lemma:trpr'
1.148198 Phase    b'-1:lemma:until'
1.142785 OD       b'-1:lemma:od450'
1.140281 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
1.137827 O        b'+2:lemma:ml'
1.137534 Med      b'+1:lemma:medium'
1.130738 Gtype    b'hUpper'
1.116695 Supp     b'-1:lemma::'
1.113363 Supp     b'+2:lemma:add'
1.112361 Med      b'postag:NNP'
1.109559 O        b'-2:lemma:Leu'
1.104524 O        b'+1:lemma:nacl'
1.102223 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
1.102118 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.095936 Substrain b'+2:postag::'
1.091160 Technique b'hLower'
1.090947 Air      b'+2:lemma:250'
1.085847 O        b'-1:lemma:shake'
1.084158 Gtype    b'+2:lemma:lacz'
1.080134 Phase    b'+2:lemma:follow'
1.077491 Gtype    b'+2:lemma:rep2'
1.077491 Gtype    b'+2:lemma:rep1'
1.076402 Temp     b'+2:lemma:short'
1.075351 O        b'lemma:~'
1.074500 O        b'-1:lemma:fructose'
1.072069 O        b'-1:postag:NN'
1.065097 Supp     b'lemma:Trp'
1.061163 Gtype    b'+1:lemma:pq'
1.059897 O        b'postag:SYM'
1.055422 Supp     b'-2:lemma:nitrate'
1.051085 Supp     b'lemma:leucine'
1.050009 OD       b'+1:lemma:-rrb-'
1.049484 O        b'+2:lemma:hour'
1.046764 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.046764 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.046533 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.045747 O        b'-1:lemma:l1'
1.041158 OD       b'+1:postag:-RRB-'
1.041055 Supp     b'+1:lemma:be'
1.040903 Supp     b'-2:lemma:pahse'
1.038863 pH       b'-2:lemma:at'
1.038386 O        b'-1:lemma:.2'
1.038386 O        b'-2:lemma:u00096'
1.030172 Med      b'+2:lemma:then'
1.029176 Supp     b'+1:lemma:iptg'
1.028661 OD       b'+2:postag:CD'
1.026357 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.024428 Supp     b'-1:lemma:sodium'
1.024428 Supp     b'+2:lemma:1/100'
1.019296 Gtype    b'-1:postag:VBP'
1.007655 Supp     b'-1:lemma:mm'
1.003034 Substrain b'-1:lemma:.'
1.003034 Substrain b'-1:postag:.'
1.002366 O        b'-2:lemma:sample'
1.002270 Supp     b'+1:lemma:min'
0.993124 Supp     b'-2:lemma::'
0.992321 O        b'lemma:\xce\xbcl'
0.990692 Supp     b'lemma:20'
0.988558 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.987726 Gtype    b'-2:postag::'
0.987674 Supp     b'+2:lemma:be'
0.985969 O        b'+1:lemma:30'
0.985940 O        b'lemma:genotype'
0.982778 Gversion b'postag:NN'
0.977969 Gtype    b'lemma:the'
0.977384 O        b'lemma:,'
0.977384 O        b'postag:,'
0.974349 Supp     b'+1:postag:VBD'
0.967356 Anti     b'hGreek'
0.959225 Gtype    b'hLower'
0.957117 Supp     b'-2:lemma:+'
0.956881 Supp     b'postag:NNP'
0.955575 O        b'-2:lemma:od600'
0.950577 Gtype    b'+2:postag:NN'
0.950166 Strain   b'-1:lemma:.'
0.950166 Strain   b'-1:postag:.'
0.949117 Phase    b'+2:lemma:od600'
0.948359 O        b'-2:postag:FW'
0.943210 Technique b'postag:NNP'
0.940155 Supp     b'-2:lemma:1'
0.934032 Supp     b'-2:postag:CD'
0.933941 O        b'+2:lemma:Cold'
0.930816 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
0.930422 OD       b'-1:lemma:od600'
0.924215 O        b'+1:lemma:o.d.'
0.924215 O        b'+2:lemma:600nm'
0.920886 Supp     b'lemma:nitrate'
0.918008 Med      b'+1:lemma:media'
0.914785 Temp     b'-2:lemma:see'
0.908294 Supp     b'-1:postag:CC'
0.903608 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
0.903589 Air      b'lemma:co2'


Top negative:
0.002031 Agit     b'-1:postag:-LRB-'
0.001999 O        b'lemma:25'
0.001992 Gtype    b'+1:lemma:knock-out'
0.001929 Phase    b'+2:postag:NN'
0.001835 Gtype    b'+2:lemma:strain'
0.001813 Anti     b'lemma:\xcf\x8332'
0.001812 O        b'+2:lemma:5'
0.001782 Substrain b'postag:NN'
0.001697 O        b'+2:lemma:min'
0.001661 O        b'+2:lemma:25'
0.001626 Temp     b'-2:lemma:culture'
0.001524 O        b'+1:lemma:add'
0.001172 O        b'-1:lemma:MOPS'
0.001159 O        b'lemma:dna'
0.001136 Temp     b'+2:lemma:m9'
0.001054 O        b'-2:lemma:;'
0.001049 O        b'-1:lemma:fnr'
0.001014 Gtype    b'+2:postag:DT'
0.000906 pH       b'+2:postag:CD'
0.000824 O        b'+2:lemma:nh4cl'
0.000612 Med      b'-1:lemma:g/l'
0.000565 O        b'-2:lemma:of'
0.000537 O        b'-1:postag:FW'
0.000467 Anti     b'-1:lemma:fnr'
0.000349 Supp     b'+1:lemma:phosphate'
0.000334 Technique b'+1:lemma:Anaerobic'
0.000321 Med      b'-2:lemma:2'
0.000310 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.000266 O        b'+2:lemma:grow'
0.000219 Temp     b'postag:VB'
0.000111 O        b'-2:lemma:wt'
0.000086 O        b'+2:lemma:wash'
0.000071 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
0.000069 O        b'-1:lemma:Aerobic'
0.000064 O        b'-2:lemma:use'
0.000062 O        b'lemma:hs2'
0.000061 Gtype    b'-1:lemma:k-12'
0.000038 O        b'+1:lemma:ml'
0.000027 Supp     b'-2:lemma:0.3'
0.000024 O        b'-2:lemma:2.5'
0.000023 Technique b'postag:NN'
0.000023 Med      b'-1:lemma:-rrb-'
0.000013 O        b'-1:lemma:at'
0.000012 Med      b'+2:lemma:10'
0.000008 Med      b'-1:postag:-RRB-'
0.000005 Technique b'+1:postag:NNP'
0.000004 O        b'+2:lemma:\xce\xb4arca'
0.000002 Supp     b'-2:lemma:m'
0.000001 O        b'-1:lemma:anti-myc'
0.000001 O        b'+1:lemma:Santa'
0.000001 O        b'+2:lemma:Cruz'
0.000001 O        b'+1:postag:VBP'
0.000000 Med      b'+2:lemma:0.2'
-0.000000 Gtype    b'lemma:-lrb-'
0.000000 O        b'-2:lemma:mutant'
0.000000 O        b'lemma:\xce\xb4fnr'
-0.000002 Temp     b'-1:lemma:at'
-0.000002 O        b'+1:postag:VBG'
-0.000002 O        b'-1:postag:VB'
-0.000002 O        b'-2:lemma:m'
-0.000006 Gtype    b'postag:-LRB-'
-0.000008 Temp     b'+2:lemma:.'
-0.000008 Temp     b'+2:postag:.'
-0.000014 O        b'+1:postag:VB'
-0.000020 Supp     b'postag:NNS'
-0.000027 Temp     b'postag:CD'
-0.000039 Gtype    b'+1:postag:-LRB-'
-0.000134 Gtype    b'postag:NNP'
-0.000165 O        b'+1:lemma:antibody'
-0.000194 O        b'lemma:sample'
-0.000205 Med      b'-1:postag:IN'
-0.000220 O        b'-2:lemma:-rrb-'
-0.000316 Supp     b'-1:lemma:the'
-0.000353 pH       b'-2:postag:NN'
-0.000361 Gversion b'symb'
-0.000498 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.000568 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.000814 O        b'lemma:95'
-0.000915 Med      b'+1:postag:IN'
-0.001080 O        b'lemma:mm'
-0.001180 Gtype    b'lemma:delta'
-0.001212 O        b'-2:lemma:1'
-0.001290 O        b'-1:lemma:cra'
-0.001528 Med      b'-2:postag:CC'
-0.002095 Anti     b'-2:postag:JJ'
-0.002794 OD       b'+2:lemma:for'
-0.002951 O        b'+1:lemma:95'
-0.003012 O        b'lemma:phosphate'
-0.003075 O        b'+1:lemma:.'
-0.003075 O        b'+1:postag:.'
-0.003135 Technique b'+2:postag:CD'
-0.003438 O        b'-1:lemma:25'
-0.003455 Med      b'-1:postag:CD'
-0.003532 Supp     b'+2:lemma:final'
-0.003951 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.003951 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.004057 OD       b'+1:lemma:for'
-0.004373 O        b'+1:lemma:7.6'
-0.004373 O        b'-2:lemma:1m'
-0.004373 O        b'+2:lemma:;'
-0.005112 O        b'+2:lemma:0.4'
-0.005181 O        b'-1:lemma:~'
-0.005325 Supp     b'-1:postag::'
-0.006561 O        b'-2:lemma:100'
-0.006874 O        b'+2:lemma:sample'
-0.006896 O        b'+2:lemma:the'
-0.007526 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.007788 Supp     b'-2:postag:VBD'
-0.008428 Supp     b'postag:VBN'
-0.009168 O        b'+1:lemma:medium'
-0.009769 O        b'+1:lemma:b'
-0.010004 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.010675 O        b'-2:lemma:50'
-0.011422 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.011425 pH       b'postag:NN'
-0.012502 Supp     b'+2:lemma:mm'
-0.012561 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.012928 Temp     b'-2:lemma:at'
-0.014604 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.014972 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.015512 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.015940 O        b'+1:lemma:25'
-0.016001 O        b'+2:postag:RB'
-0.017416 Air      b'-2:lemma:be'
-0.017693 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.017896 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.018028 OD       b'-2:postag:VBN'
-0.019783 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.022148 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.022430 Temp     b'-1:postag:CD'
-0.023156 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.023530 O        b'+1:lemma:a'
-0.024535 Supp     b'postag::'
-0.025597 Gtype    b'+1:postag:NN'
-0.026818 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.028679 O        b'lemma:lb'
-0.031688 O        b'+1:lemma:co2'
-0.031847 O        b'-2:lemma:grow'
-0.032925 O        b'-2:postag:DT'
-0.033637 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.034686 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.034732 Gtype    b'+1:postag:CD'
-0.035413 Temp     b'-2:postag:IN'
-0.036801 Supp     b'lemma:vol'
-0.036801 Supp     b'-1:lemma:1/100'
-0.036959 OD       b'+2:postag:DT'
-0.037490 OD       b'+2:postag:CC'
-0.037647 O        b'+2:lemma:total'
-0.037802 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.037881 Vess     b'symb'
-0.037919 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.038014 O        b'-2:lemma:ph'
-0.040451 O        b'+1:lemma:ph'
-0.040900 pH       b'hUpper'
-0.042386 Med      b'-2:lemma:in'
-0.042549 O        b'-2:lemma:%'
-0.042677 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.042723 O        b'+2:lemma:then'
-0.043993 O        b'-1:lemma:%'
-0.044540 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.044618 O        b'-2:lemma:stir'
-0.044700 Air      b'-1:postag:CC'
-0.045990 OD       b'+2:postag:IN'
-0.049780 O        b'-1:lemma:in'
-0.049859 O        b'-2:lemma:at'
-0.049886 O        b'lemma:5'
-0.050539 Phase    b'+2:postag:IN'
-0.050797 O        b'+1:lemma:o2'
-0.052046 O        b'+2:lemma:media'
-0.052515 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.054208 O        b'+2:lemma:0.3'
-0.055240 O        b'-1:postag:DT'
-0.055352 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.055352 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.055352 O        b'+2:lemma:vol'
-0.057897 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.058976 O        b'+2:lemma:m9'
-0.059558 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.059617 Supp     b'lemma:,'
-0.059617 Supp     b'postag:,'
-0.059906 Supp     b'-2:lemma:of'
-0.060495 O        b'+2:lemma:od600'
-0.060772 Temp     b'-2:postag:JJ'
-0.061229 O        b'lemma:m9'
-0.061347 OD       b'+1:lemma:0.3'
-0.061390 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.061603 O        b'-1:lemma:contain'
-0.061772 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.062124 Supp     b'lemma:.'
-0.062124 Supp     b'postag:.'
-0.062645 O        b'-1:lemma:final'
-0.064570 Med      b'-2:postag:IN'
-0.066250 O        b'+1:lemma:sample'
-0.066279 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.067193 O        b'+2:lemma:o2'
-0.068790 Gtype    b'-2:lemma:,'
-0.068790 Gtype    b'-2:postag:,'
-0.069326 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.069350 O        b'-1:lemma:the'
-0.069661 pH       b'hLower'
-0.069862 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.070237 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.070782 O        b'+2:lemma:rnase'
-0.071966 Supp     b'-1:lemma:in'
-0.073795 O        b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.074003 O        b'-2:lemma:70'
-0.074961 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.075310 O        b'+1:lemma:n2'
-0.077077 O        b'+1:lemma:contain'
-0.078614 O        b'+1:lemma:~'
-0.082462 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.082517 Temp     b'-2:postag:NN'
-0.083845 Supp     b'-2:postag:DT'
-0.086058 O        b'-1:lemma:m9'
-0.087457 O        b'-1:lemma:='
-0.087729 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.088009 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.088085 O        b'lemma:;'
-0.088085 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.091611 OD       b'lemma:~'
-0.092521 Med      b'+1:postag:CC'
-0.093891 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.096891 O        b'-2:lemma:cell'
-0.098335 O        b'-2:lemma:25'
-0.098592 OD       b'postag:NN'
-0.103477 O        b'-1:lemma:o2'
-0.104706 Supp     b'postag:CD'
-0.104993 O        b'+2:lemma:~'
-0.107027 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.107330 O        b'-2:lemma:n2'
-0.108062 Temp     b'+1:postag:NN'
-0.115268 Air      b'+2:lemma:70'
-0.115468 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.117248 O        b'+1:lemma:m'
-0.117648 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.117648 Supp     b'-1:postag:.'
-0.122943 O        b'lemma:o2'
-0.123748 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.124311 O        b'+2:lemma:reference'
-0.125802 Temp     b'+2:postag:IN'
-0.126522 O        b'+1:lemma:mm'
-0.129682 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.140157 Supp     b'postag:IN'
-0.140332 Gversion b'hLower'
-0.140386 Med      b'+2:lemma:contain'
-0.140599 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.141680 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.142873 Temp     b'symb'
-0.156813 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.158180 O        b'-1:lemma:of'
-0.158601 OD       b'symb'
-0.161578 O        b'-1:lemma:1'
-0.161707 O        b'lemma:7.6'
-0.161707 O        b'+1:lemma:;'
-0.163390 O        b'-2:lemma:glucose'
-0.168116 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.168988 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.168988 O        b'+2:lemma:1/100'
-0.169396 O        b'lemma:0.1'
-0.171177 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.171469 Med      b'+2:postag:VBG'
-0.172137 Gtype    b'symb'
-0.172433 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.173380 O        b'+2:lemma:follow'
-0.177499 OD       b'postag:JJ'
-0.180841 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.181301 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.183018 O        b'-2:lemma:20'
-0.184157 O        b'+1:postag:IN'
-0.185687 O        b'+1:lemma:phase'
-0.187760 Supp     b'lemma:-rrb-'
-0.188439 Med      b'+2:lemma:supplement'
-0.190004 OD       b'+2:postag:NN'
-0.190174 O        b'-2:lemma:o2'
-0.190477 O        b'lemma:min'
-0.195599 O        b'+2:lemma:genome'
-0.195995 O        b'lemma:methanol'
-0.195995 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.196788 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.198975 O        b'lemma:fructose'
-0.200108 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.202097 Supp     b'+2:lemma:with'
-0.203224 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.203626 O        b'-1:lemma:1m'
-0.203626 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.204615 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.206794 O        b'+1:lemma:5'
-0.211369 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.217346 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.217346 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.220030 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.221261 O        b'+2:lemma:10'
-0.223144 O        b'lemma:nh4cl'
-0.223525 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.227961 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.230698 O        b'-1:lemma:.'
-0.230698 O        b'-1:postag:.'
-0.231209 O        b'lemma:anaerobic'
-0.234975 Temp     b'postag:NN'
-0.235459 Gtype    b'postag:VBG'
-0.236628 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.237252 O        b'+1:lemma:%'
-0.237525 Gtype    b'-1:lemma:and'
-0.237923 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.239184 O        b'lemma:medium'
-0.240615 O        b'-2:lemma:phase'
-0.242760 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.245101 O        b'lemma:m63'
-0.247264 O        b'+2:lemma:n2'
-0.251871 O        b'+2:lemma:250'
-0.253731 O        b'+1:lemma:of'
-0.254242 O        b'+2:lemma:ph'
-0.255736 O        b'lemma:mid-log'
-0.258743 O        b'+1:lemma:media'
-0.259450 O        b'lemma:0.2'
-0.259681 O        b'lemma:150'
-0.259681 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.259681 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.262765 Technique b'-2:postag:NN'
-0.262765 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.263479 Supp     b'-1:postag:VBG'
-0.265789 O        b'+1:lemma:min'
-0.266529 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.266600 O        b'lemma:ph'
-0.269280 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.269564 O        b'-1:lemma:37'
-0.269779 O        b'lemma:n2'
-0.271034 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.273812 Gtype    b'postag:NN'
-0.274620 O        b'-2:postag::'
-0.279264 Supp     b'postag:-RRB-'
-0.283425 O        b'lemma:250'
-0.285849 O        b'-1:lemma:n2'
-0.291783 O        b'lemma:dissolve'
-0.291783 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.291865 Gtype    b'postag::'
-0.295707 O        b'-2:lemma:10'
-0.301731 O        b'+1:lemma:until'
-0.303509 Air      b'-2:lemma:95'
-0.307011 Air      b'+2:postag:IN'
-0.307489 O        b'lemma:the'
-0.307682 O        b'-1:lemma:mm'
-0.313126 pH       b'symb'
-0.314740 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.314740 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.316070 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.317694 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.321416 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.324579 O        b'hGreek'
-0.324815 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.325598 O        b'-1:lemma:with'
-0.327555 Med      b'-1:postag:NN'
-0.330264 O        b'+1:postag:DT'
-0.333215 O        b'+2:lemma:at'
-0.334740 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.337529 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.344026 O        b'+2:lemma:co2'
-0.346823 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.347610 O        b'+2:lemma:tag'
-0.349022 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.357330 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.357874 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.358955 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.359551 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.361850 O        b'lemma:co2'
-0.362747 O        b'-1:lemma:rna'
-0.367883 O        b'+2:lemma:.'
-0.367883 O        b'+2:postag:.'
-0.371268 O        b'lemma:fecl2'
-0.371783 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.376502 O        b'lemma:acetate'
-0.376596 O        b'-1:lemma:until'
-0.378510 Anti     b'postag:NNP'
-0.392168 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.400852 O        b'lemma:nacl'
-0.401178 Technique b'-1:lemma::'
-0.401821 O        b'+2:lemma:add'
-0.402189 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.403647 Supp     b'+1:postag:JJ'
-0.414375 O        b'+1:lemma:gadx'
-0.424961 O        b'+1:lemma:+'
-0.426758 OD       b'+2:postag:RB'
-0.428607 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.438879 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.449284 O        b'lemma:20'
-0.449481 O        b'lemma:minimal'
-0.453046 O        b'-1:lemma:ml'
-0.454600 Gtype    b'+1:lemma:and'
-0.456150 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.459018 O        b'-1:lemma:ph'
-0.464662 O        b'-2:lemma:genome'
-0.466198 O        b'lemma:1m'
-0.470903 O        b'-2:lemma:dna'
-0.480405 Supp     b'postag:CC'
-0.485152 O        b'lemma:dpd'
-0.498015 O        b'lemma:of'
-0.501781 OD       b'hUpper'
-0.502264 Supp     b'hGreek'
-0.505618 Supp     b'+1:postag::'
-0.508749 O        b'-1:lemma:vol'
-0.508749 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.508749 O        b'+2:lemma:1m'
-0.510003 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.527489 Technique b'-1:postag::'
-0.535066 O        b'-2:lemma:the'
-0.537219 OD       b'hLower'
-0.542147 Gtype    b'+1:postag:CC'
-0.549305 Supp     b'+2:postag:NNS'
-0.553237 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.566249 Supp     b'+2:postag::'
-0.580757 O        b'postag:RB'
-0.581512 Med      b'postag:CD'
-0.593577 O        b'+1:lemma:in'
-0.602888 O        b'-1:lemma:IP'
-0.610669 O        b'-2:postag:SYM'
-0.629664 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.634585 Gtype    b'-1:postag:CC'
-0.641053 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.644272 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.652711 Med      b'-2:lemma:grow'
-0.661210 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.661210 Supp     b'+1:postag:,'
-0.670086 O        b'lemma:aerobic'
-0.679933 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.692915 O        b'lemma:37'
-0.701136 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.710442 Supp     b'lemma:2'
-0.720557 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.728557 O        b'lemma:glucose'
-0.738561 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.742157 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.752209 O        b'-2:lemma::'
-0.754302 OD       b'lemma:='
-0.762837 O        b'lemma:od600'
-0.780889 O        b'-1:lemma:30'
-0.792010 O        b'lemma:nitrate'
-0.799589 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.824543 Strain   b'hLower'
-0.832002 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.840707 O        b'+1:lemma:1m'
-0.840707 O        b'-2:lemma:vol'
-0.860461 Strain   b'symb'
-0.865850 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.884431 O        b'+1:lemma:_'
-0.920953 Vess     b'hUpper'
-0.922493 O        b'+2:lemma:in'
-0.927684 O        b'lemma:pahse'
-0.947164 Temp     b'hLower'
-0.984540 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.992974 Supp     b'+2:postag:CC'
-1.034263 Med      b'+2:postag:VBN'
-1.039912 Anti     b'hUpper'
-1.051185 Agit     b'hUpper'
-1.060403 O        b'-1:lemma:co2'
-1.070889 O        b'lemma:30'
-1.078767 O        b'-2:postag:VBG'
-1.083382 Med      b'hLower'
-1.090923 Gtype    b'-2:postag:CD'
-1.136530 O        b'-1:lemma:2'
-1.142652 O        b'lemma:rifampicin'
-1.174546 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.206069 Med      b'+1:postag:NN'
-1.255067 O        b'-1:postag::'
-1.279198 O        b'-2:lemma:IP'
-1.283081 O        b'-2:lemma:aerobically'
-1.296863 O        b'-2:lemma:rpob'
-1.310565 O        b'+1:lemma:g/l'
-1.317980 O        b'-2:lemma:until'
-1.319865 Air      b'postag:NN'
-1.391245 O        b'-2:lemma:fresh'
-1.417281 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-1.434490 O        b'-2:lemma:dpd'
-1.435304 O        b'+2:lemma:+'
-1.451200 O        b'+1:lemma:at'
-1.489702 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.491003 O        b'-2:lemma:media'
-1.541259 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.684006 O        b'-2:lemma:0.3'
-1.709961 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.712083 O        b'-1:lemma:sample'
-1.743261 OD       b'+1:postag:NN'
-1.799976 O        b'lemma:wt'
-1.885455 Supp     b'postag:JJ'
-1.919294 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.948739 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.958698 O        b'lemma:media'
-2.090484 O        b'+2:lemma:b'
-2.147413 O        b'lemma:0.3'
-2.464729 O        b'lemma:aerobically'
-2.532850 Phase    b'symb'
-2.910084 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-3.011487 Technique b'symb'
-3.103589 O        b'+1:lemma:2'
-3.124196 Phase    b'postag:JJ'
-3.226049 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-3.307945 O        b'+2:lemma:iptg'
-3.806485 O        b'+1:lemma:1'
-4.115131 O        b'-1:lemma::'
-4.311667 Phase    b'hUpper'
-5.314634 O        b'-1:lemma:_'