report_Run6_v12.txt 39.1 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 1141 1142 1143 1144 1145 1146 1147 1148 1149 1150 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160 1161 1162 1163 1164 1165 1166 1167 1168 1169 1170 1171 1172 1173 1174 1175 1176 1177 1178 1179 1180 1181 1182 1183 1184
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.04625567388660928, 'c2': 0.019278667317134065}
best CV score:0.8434032566660784
model size: 0.12M

Flat F1: 0.8147298617165236
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.897     0.398     0.551        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.939     0.795     0.861        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.870     0.838     0.854       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.919     0.754     0.815       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    5.900078
OD     -> OD      5.557386
Phase  -> Phase   5.277911
Med    -> Med     5.255962
Supp   -> Supp    5.109374
Anti   -> Anti    4.947923
Gversion -> Gversion 4.532525
Gtype  -> Gtype   4.450831
Air    -> Air     3.898850
pH     -> pH      3.518669
Technique -> Technique 3.277203
O      -> O       3.111901
Agit   -> Agit    2.517365
Substrain -> Gtype   1.797049
Technique -> Air     0.576458
Gtype  -> Supp    0.424836
O      -> Technique 0.389071
O      -> Supp    0.215861
Med    -> O       0.105317
Temp   -> O       0.086005
Air    -> O       0.045118
Gtype  -> pH      0.000875
pH     -> O       -0.003573
O      -> Substrain -0.004121
pH     -> Supp    -0.010581
O      -> Gtype   -0.015834
O      -> Temp    -0.026904
Air    -> Agit    -0.035332
Temp   -> Air     -0.036315
Gtype  -> Gversion -0.059235
Technique -> OD      -0.063946
Air    -> OD      -0.077646
O      -> pH      -0.097954
Supp   -> O       -0.126924
Air    -> Temp    -0.141335
Phase  -> Air     -0.147016
Phase  -> OD      -0.156231
Supp   -> Air     -0.184520
Phase  -> O       -0.212805
Gtype  -> Anti    -0.226839
Air    -> Med     -0.254780
Supp   -> Gtype   -0.260280
Technique -> Supp    -0.292512
Supp   -> Phase   -0.317290
Anti   -> Supp    -0.338344
O      -> OD      -0.355572
Air    -> Gtype   -0.373011
O      -> Gversion -0.376304
Gtype  -> Technique -0.382712
Anti   -> Gtype   -0.402741
OD     -> O       -0.409534
Air    -> Phase   -0.435729
Anti   -> O       -0.490995
Agit   -> Air     -0.498320
O      -> Phase   -0.532626
Gversion -> O       -0.536285
Air    -> Supp    -0.571992
Gtype  -> Med     -0.607023
Temp   -> Med     -0.656356
OD     -> Air     -0.705144
O      -> Anti    -0.762582
Gtype  -> Phase   -0.862953
O      -> Med     -0.904727
Technique -> Gtype   -0.918946
Supp   -> Med     -0.993797
Gtype  -> Temp    -1.015010
Technique -> O       -1.307542
Technique -> pH      -1.434405
Gtype  -> O       -1.557662
Substrain -> O       -1.653552
Med    -> Supp    -1.824683
O      -> Air     -2.193923


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    5.900078
OD     -> OD      5.557386
Phase  -> Phase   5.277911
Med    -> Med     5.255962
Supp   -> Supp    5.109374
Anti   -> Anti    4.947923
Gversion -> Gversion 4.532525
Gtype  -> Gtype   4.450831
Air    -> Air     3.898850
pH     -> pH      3.518669
Technique -> Technique 3.277203
O      -> O       3.111901
Agit   -> Agit    2.517365
Substrain -> Gtype   1.797049
Technique -> Air     0.576458
Gtype  -> Supp    0.424836
O      -> Technique 0.389071
O      -> Supp    0.215861
Med    -> O       0.105317
Temp   -> O       0.086005
Air    -> O       0.045118
Gtype  -> pH      0.000875
pH     -> O       -0.003573
O      -> Substrain -0.004121
pH     -> Supp    -0.010581
O      -> Gtype   -0.015834
O      -> Temp    -0.026904
Air    -> Agit    -0.035332
Temp   -> Air     -0.036315
Gtype  -> Gversion -0.059235
Technique -> OD      -0.063946
Air    -> OD      -0.077646
O      -> pH      -0.097954
Supp   -> O       -0.126924
Air    -> Temp    -0.141335
Phase  -> Air     -0.147016
Phase  -> OD      -0.156231
Supp   -> Air     -0.184520
Phase  -> O       -0.212805
Gtype  -> Anti    -0.226839
Air    -> Med     -0.254780
Supp   -> Gtype   -0.260280
Technique -> Supp    -0.292512
Supp   -> Phase   -0.317290
Anti   -> Supp    -0.338344
O      -> OD      -0.355572
Air    -> Gtype   -0.373011
O      -> Gversion -0.376304
Gtype  -> Technique -0.382712
Anti   -> Gtype   -0.402741
OD     -> O       -0.409534
Air    -> Phase   -0.435729
Anti   -> O       -0.490995
Agit   -> Air     -0.498320
O      -> Phase   -0.532626
Gversion -> O       -0.536285
Air    -> Supp    -0.571992
Gtype  -> Med     -0.607023
Temp   -> Med     -0.656356
OD     -> Air     -0.705144
O      -> Anti    -0.762582
Gtype  -> Phase   -0.862953
O      -> Med     -0.904727
Technique -> Gtype   -0.918946
Supp   -> Med     -0.993797
Gtype  -> Temp    -1.015010
Technique -> O       -1.307542
Technique -> pH      -1.434405
Gtype  -> O       -1.557662
Substrain -> O       -1.653552
Med    -> Supp    -1.824683
O      -> Air     -2.193923


Top positive:
6.485288 O        b'lemma:_'
6.051991 Anti     b'-2:lemma:antibody'
5.882689 O        b'-2:lemma:_'
5.316658 Air      b'lemma:anaerobic'
5.087995 Gtype    b'lemma:wt'
5.079428 Supp     b'lemma:pq'
4.866173 Supp     b'lemma:no3'
4.704895 O        b'lemma:-'
4.607307 Technique b'lemma:chipseq'
4.584288 O        b'lemma:1'
4.549518 Phase    b'-2:lemma:phase'
4.277503 Gtype    b'hGreek'
4.150352 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
4.087828 O        b'lemma:2'
4.085886 Gtype    b'lemma:type'
4.012723 O        b'lemma:.'
4.012723 O        b'postag:.'
3.970084 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.953831 O        b'postag::'
3.873082 Supp     b'lemma:glucose'
3.842894 Supp     b'lemma:Iron'
3.842894 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.807267 O        b'lemma:3'
3.786745 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.745414 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
3.677841 Supp     b'lemma:acetate'
3.634359 Supp     b'-1:lemma:Cra'
3.618323 Supp     b'lemma:nh4cl'
3.574073 O        b'lemma:with'
3.511956 Supp     b'lemma:2h'
3.511956 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.412882 Strain   b'lemma:k-12'
3.383112 O        b'lemma:Cra'
3.353708 Supp     b'-2:lemma:shake'
3.349227 O        b'lemma:b'
3.283790 Phase    b'lemma:mid-log'
3.282543 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.242763 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.148653 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
3.117015 O        b'+1:postag:RB'
3.090561 O        b'lemma:rpob'
3.030567 O        b'postag:VBG'
3.009391 Supp     b'lemma:arginine'
2.994619 Technique b'lemma:ChIP-exo'
2.993897 Air      b'-2:lemma:IP'
2.984891 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
2.976413 Substrain b'lemma:mg1655'
2.974367 Air      b'lemma:aerobically'
2.950554 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.938353 Air      b'-1:lemma:-'
2.936539 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.919585 Med      b'lemma:MOPS'
2.889154 Gtype    b'+1:lemma:type'
2.882007 Air      b'lemma:aerobic'
2.851511 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
2.828977 O        b'-1:postag:NNS'
2.806512 O        b'lemma:CEL'
2.787866 Med      b'+2:lemma:b2'
2.787598 O        b'lemma:genotype/variation'
2.742256 Phase    b'lemma:stationary'
2.742256 Phase    b'lemma:exponential'
2.719657 Supp     b'lemma:Adenine'
2.715331 O        b'-1:lemma:tag'
2.711078 Supp     b'lemma:iptg'
2.703278 Supp     b'+1:lemma:1'
2.672781 O        b'-1:lemma:0.3'
2.670727 Gtype    b'lemma:dfnr'
2.642499 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.639312 Supp     b'lemma:nacl'
2.637524 Technique b'-1:lemma:_'
2.617370 O        b'+1:lemma:wt'
2.589331 O        b'-2:lemma:myc'
2.584855 pH       b'lemma:ph5'
2.584855 pH       b'+1:lemma:.5'
2.580615 O        b'postag:VBN'
2.560656 Gtype    b'lemma:pk4854'
2.540717 O        b'lemma:rep2'
2.540717 O        b'lemma:rep1'
2.519463 Supp     b'+1:lemma:2'
2.504732 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.500025 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.474531 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.444132 Air      b'lemma:anaeroibc'
2.424569 Air      b'postag:RB'
2.415781 Air      b'-1:lemma:co2'
2.411364 O        b'lemma:harbor'
2.394569 Supp     b'-2:lemma:argr'
2.386473 Supp     b'-1:lemma:+'
2.384187 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.383369 Supp     b'-2:lemma:purr'
2.360147 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
2.356901 Med      b'lemma:LB'
2.350376 O        b'+2:lemma:crp'
2.345723 O        b'-1:lemma:glucose'
2.326737 O        b'postag:IN'
2.322822 O        b'lemma:\xcf\x8332'
2.307010 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
2.305027 Med      b'+2:lemma:b1'
2.304593 Med      b'lemma:minimal'
2.303292 pH       b'+1:postag:CD'
2.303094 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.298548 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.280768 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.275501 Technique b'hUpper'
2.244044 Technique b'-1:lemma:input'
2.223491 O        b'lemma:a'
2.221893 Supp     b'lemma:Leu'
2.221893 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
2.221670 O        b'lemma::'
2.220196 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.219724 O        b'-2:lemma:='
2.217754 Supp     b'lemma:fructose'
2.205918 Supp     b'-1:lemma:with'
2.174979 O        b'-2:lemma:medium'
2.174521 Phase    b'postag:NN'
2.167064 Supp     b'+2:lemma:feso4'
2.160766 Gtype    b'-2:lemma:delta'
2.156721 Temp     b'-1:lemma:37'
2.150422 Temp     b'lemma:37'
2.147441 O        b'-1:lemma:wt'
2.128147 Med      b'+1:lemma:0.4'
2.125293 O        b'lemma:culture'
2.101449 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
2.101449 Gtype    b'-1:lemma:old'
2.101449 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
2.100711 Supp     b'+1:lemma:_'
2.099645 Supp     b'-2:lemma:induce'
2.096572 O        b'lemma:ompr'
2.091773 Med      b'lemma:media'
2.083580 O        b'-1:lemma:lb'
2.075333 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.075333 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.066126 Substrain b'lemma:mg1655star'
2.053310 Technique b'-2:lemma:wt'
2.050894 OD       b'lemma:od450'
2.050728 Supp     b'-1:lemma:ompr'
2.045968 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.031489 Air      b'-2:lemma:fnr'
2.021941 O        b'-1:lemma:type'
1.986063 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.981859 Temp     b'lemma:43'
1.958766 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.957327 Med      b'lemma:lb'
1.939441 O        b'lemma:purr'
1.933151 Temp     b'-1:lemma:sample'
1.927792 O        b'+1:lemma:0.2'
1.922718 Med      b'+2:postag:CC'
1.904042 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
1.895923 Supp     b'lemma:Fe'
1.890065 O        b'lemma:argr'
1.873691 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.869457 O        b'lemma:for'
1.865277 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.854933 Air      b'postag:JJ'
1.853028 Med      b'lemma:m63'
1.841385 Technique b'lemma:rna-seq'
1.839201 Supp     b'-2:lemma:media'
1.829099 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
1.819678 O        b'lemma:soxr'
1.819678 O        b'lemma:soxs'
1.816865 O        b'lemma:chip-fnr'
1.816865 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
1.816746 Supp     b'-2:lemma:agent'
1.813591 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.807411 Med      b'-1:lemma:ml'
1.805575 O        b'-1:lemma:media'
1.800036 O        b'lemma:at'
1.799324 Temp     b'-2:lemma:keep'
1.796023 Med      b'-1:lemma:in'
1.794517 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.788601 Supp     b'+2:lemma:A'
1.787235 O        b'+1:lemma:coli'
1.777529 Gtype    b'+1:postag::'
1.772503 OD       b'+1:postag:IN'
1.771878 O        b'symb'
1.768257 O        b'+1:lemma:250'
1.765245 O        b'lemma:chip-arca'
1.765245 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.760152 O        b'-1:lemma:pq'
1.758555 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.752616 Gversion b'lemma:.2'
1.752616 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.752213 O        b'postag:CC'
1.750484 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.750484 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.741378 Vess     b'lemma:flask'
1.741378 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.741378 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.741378 Vess     b'+2:lemma:43'
1.737032 O        b'+1:postag:NNP'
1.731749 Gversion b'-2:lemma:build'
1.720940 Med      b'lemma:medium'
1.702190 O        b'-1:lemma:min'
1.700658 O        b'lemma:affyexp'
1.696931 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.696201 O        b'+1:lemma:od600'
1.692896 Supp     b'-2:lemma:for'
1.689341 Agit     b'lemma:rpm'
1.674502 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
1.647158 Supp     b'lemma:dpd'
1.646997 Technique b'lemma:rnaseq'
1.641714 Temp     b'-1:lemma:43'
1.640759 Gversion b'-2:postag:VB'
1.640735 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.637483 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.636655 O        b'-1:lemma:into'
1.633501 Gtype    b'-1:lemma:wild'
1.633188 O        b'-1:lemma:-80'
1.626143 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.624585 O        b'lemma:trpr'
1.600129 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.600129 Strain   b'-2:lemma:str'
1.589754 Agit     b'-1:lemma:250'
1.588821 pH       b'lemma:.5'
1.588821 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.584149 O        b'+1:lemma:pq'
1.584119 O        b'lemma:input'
1.584119 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.583891 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.580224 O        b'-2:lemma:overnight'
1.579859 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.578717 OD       b'-1:lemma:at'
1.578106 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.577268 Technique b'-1:lemma:IP'
1.575900 Gtype    b'lemma:crp'
1.573631 O        b'lemma:chip'
1.572875 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.567922 O        b'postag:DT'
1.564227 O        b'lemma:-rrb-'
1.562637 Gtype    b'+1:lemma:control'
1.560335 Anti     b'+1:lemma:antibody'
1.556866 O        b'-1:lemma:nitrate'
1.545166 OD       b'+1:lemma:of'
1.534502 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.527999 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.525805 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.520234 OD       b'-2:lemma:od450'
1.516893 Med      b'-2:lemma:medium'
1.516303 pH       b'lemma:5.5'
1.514733 Gversion b'lemma:u00096'
1.514733 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.508006 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.492265 Supp     b'-2:lemma:trpr'
1.490901 Gtype    b'lemma:ptac'
1.486095 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
1.478830 O        b'+2:lemma:_'
1.478045 Gtype    b'-1:lemma:Wild'
1.475116 O        b'-2:lemma:co2'
1.465370 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.465370 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.464924 Med      b'postag:NNS'
1.461924 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.461924 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.461085 Air      b'-2:lemma:0.3'
1.460939 Supp     b'-1:lemma:_'
1.449237 O        b'+2:lemma:constant'
1.430058 O        b'+1:lemma:ph5'
1.430058 O        b'+2:lemma:.5'
1.427153 O        b'lemma:A'
1.420736 Med      b'postag:NNP'
1.419606 Air      b'-2:lemma:nh4cl'
1.419526 Air      b'hLower'
1.414349 O        b'lemma:-lrb-'
1.413329 O        b'+2:lemma:rpm'
1.412651 O        b'-2:lemma:min'
1.412112 Substrain b'+2:lemma::'
1.411329 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.406247 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.405090 Technique b'hLower'
1.404069 O        b'-1:lemma:nacl'
1.399675 O        b'-2:lemma:od600'
1.392111 O        b'-2:lemma:fructose'
1.392011 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.382492 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.380082 OD       b'lemma:of'
1.376532 O        b'+1:lemma::'
1.375920 Vess     b'-2:postag:JJ'
1.374853 OD       b'lemma:0.3'
1.374294 Supp     b'lemma:30'
1.370748 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.367953 Gtype    b'postag:JJ'
1.364602 O        b'lemma:additional'
1.364602 O        b'+1:lemma:2h'
1.362560 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.361043 O        b'+2:postag:JJ'
1.360509 Gtype    b'hUpper'
1.360489 OD       b'lemma:od600'
1.349448 Phase    b'-2:lemma:until'
1.348925 O        b'+1:lemma:43'
1.347401 Air      b'-1:lemma:_'
1.345680 O        b'lemma:growth'
1.341790 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.340671 Air      b'-2:lemma:mid-log'
1.331359 Air      b'-1:lemma:phase'
1.328066 pH       b'+1:lemma:5.5'
1.322867 O        b'-1:lemma:acetate'
1.320724 Supp     b'lemma:Trp'
1.318654 Gversion b'postag:NN'
1.316491 Supp     b'+2:lemma:add'
1.313347 Phase    b'-1:lemma::'
1.307568 Agit     b'lemma:250'
1.305440 O        b'postag:-RRB-'
1.304101 Med      b'+1:lemma:+'
1.302223 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
1.293912 Supp     b'-1:lemma:30'
1.285554 O        b'lemma:gadx'
1.284368 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
1.280144 Med      b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.279371 Gversion b'lemma:000913'
1.279371 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.277718 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.276623 Air      b'+2:lemma:%'
1.274239 Supp     b'-1:lemma:potassium'
1.274239 Supp     b'-2:lemma:mmol'
1.258088 O        b'lemma:lrp'
1.257535 O        b'lemma:ml'
1.254941 Med      b'lemma:glucose'
1.246954 Air      b'+1:lemma:%'
1.246863 O        b'-2:lemma:Leu'
1.246116 O        b'+2:lemma:allow'
1.242725 O        b'lemma:from'
1.242146 Med      b'+2:lemma:+'
1.241712 Air      b'lemma:%'
1.240443 Substrain b'+2:postag::'
1.239601 O        b'lemma:oxyr'
1.238940 Air      b'-2:lemma:cm20'
1.231995 Strain   b'-2:lemma:strain'
1.224954 Supp     b'-1:lemma:final'
1.224797 Supp     b'lemma:glutamine'
1.224797 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
1.222959 Technique b'+1:lemma:gadx'
1.222401 Supp     b'-2:lemma:+'
1.222220 Technique b'lemma:chip-seq'
1.221156 Gtype    b'lemma:wild'
1.217195 Substrain b'-1:lemma:.'
1.217195 Substrain b'-1:postag:.'
1.216243 Agit     b'+2:lemma:at'
1.205878 Gtype    b'-2:postag:JJ'
1.205666 Gtype    b'+1:lemma:the'
1.202773 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.200104 Air      b'+2:lemma:37'
1.193339 O        b'postag:-LRB-'
1.190130 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.187181 Supp     b'-1:lemma:respiration'
1.187181 Supp     b'+1:lemma:mmol'
1.187181 Supp     b'+2:lemma:potassium'
1.185569 Air      b'-2:lemma:%'
1.180965 Gtype    b'-1:lemma:from'
1.179497 O        b'lemma:-80'
1.179497 O        b'-2:lemma:freeze'
1.173662 Air      b'-2:postag:SYM'
1.172908 O        b'-1:lemma:0.35'
1.172672 Gtype    b'-2:lemma:dna'
1.170735 O        b'postag:NNS'
1.169617 O        b'+2:lemma:4'
1.161031 O        b'+1:postag:VBZ'
1.160204 OD       b'postag:IN'
1.155746 OD       b'-1:postag:IN'
1.155318 Supp     b'-1:lemma:without'
1.149768 O        b'-2:lemma:no3'
1.149271 O        b'-2:lemma:ml'
1.147391 Temp     b'-2:postag:VBD'
1.145862 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.144773 Supp     b'-2:lemma:10'
1.136240 OD       b'-1:lemma:od450'
1.134915 Gtype    b'-1:postag:VBP'
1.129872 Med      b'+1:lemma:medium'
1.126405 Air      b'-2:postag:CD'
1.126261 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
1.125470 Supp     b'-2:lemma:condition'
1.124708 O        b'+1:lemma:20'
1.119914 O        b'+2:lemma:of'
1.109214 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.107934 Supp     b'-2:lemma:pahse'
1.098419 O        b'-1:postag:NN'
1.096531 Supp     b'postag:NNP'
1.096388 Air      b'-1:lemma:%'
1.095235 Vess     b'+1:lemma:at'
1.091004 pH       b'lemma:ph'
1.090442 O        b'+2:lemma:k-12'
1.088828 Technique b'-2:postag:NNP'
1.084737 O        b'-1:lemma:l1'
1.081520 Technique b'lemma:chip-exo'
1.078661 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.078393 O        b'postag:VBD'
1.074152 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.071989 Supp     b'-1:lemma:mm'
1.070750 O        b'+2:postag:NNP'
1.069555 O        b'lemma:be'
1.067981 O        b'+1:lemma:sparging'
1.060256 Temp     b'+2:postag:DT'
1.058691 O        b'lemma:fresh'
1.054344 O        b'-1:lemma:fructose'
1.053455 O        b'-1:lemma:0.3-0.35'
1.052065 Gtype    b'+2:postag:NN'
1.051744 O        b'lemma:,'
1.051744 O        b'postag:,'
1.049151 Air      b'+1:lemma:b'
1.048654 Phase    b'-1:lemma:until'
1.044903 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.043537 Gversion b'lemma:nc'
1.043537 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.043245 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.043245 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.038119 pH       b'-1:lemma:at'
1.037799 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
1.037799 Gtype    b'+2:lemma:.5'
1.037022 Anti     b'-1:lemma:fnr'
1.032073 O        b'-1:lemma:antibody'
1.031982 O        b'-1:lemma:4'
1.031242 Anti     b'-1:lemma:myc'
1.031242 Anti     b'-2:lemma:9e10'
1.030978 O        b'-1:lemma:rpm'
1.028795 O        b'lemma:cra'
1.028313 O        b'-1:lemma:induce'
1.027501 Supp     b'lemma:0.2'
1.025621 Gtype    b'+2:postag::'
1.017243 Med      b'-1:lemma:fresh'
1.015188 pH       b'-1:lemma:ph'
1.012531 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.008071 Supp     b'lemma:tryptophan'
1.008071 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
1.007048 Gtype    b'hLower'
1.006869 O        b'-2:lemma:~'
1.001685 Supp     b'+1:lemma:1m'
1.001685 Supp     b'-2:lemma:vol'
1.000075 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
0.998251 Supp     b'-1:lemma:wt'
0.997982 O        b'lemma:~'
0.994676 Med      b'-2:lemma:minimal'
0.994162 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
0.991115 O        b'lemma:genotype'
0.989891 O        b'-2:lemma:37'
0.983229 O        b'-1:lemma:nh4cl'
0.982897 Anti     b'-1:lemma::'
0.981884 O        b'+1:lemma:read'
0.980606 Gtype    b'-2:postag:NNS'
0.980525 O        b'+2:lemma:wt'
0.978647 O        b'+1:lemma:k-12'
0.976203 O        b'+2:lemma:w/v'
0.976120 Phase    b'-1:postag::'
0.976088 Supp     b'-1:lemma:cra'
0.972137 O        b'lemma:s'
0.972137 O        b'-2:lemma:parameter'
0.970118 O        b'-1:postag:NNP'
0.969324 O        b'postag:CD'
0.966392 pH       b'-1:postag:NN'
0.963554 Supp     b'+1:lemma:iptg'
0.960361 O        b'+1:lemma:dpd'
0.953993 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.953928 O        b'-1:lemma:genbank'
0.953784 OD       b'+1:lemma:-rrb-'
0.953374 Med      b'-1:lemma:LB'
0.953374 Med      b'+2:lemma:1mm'
0.952330 Gtype    b'+1:lemma:pq'
0.946915 Supp     b'-1:lemma:vol'
0.946915 Supp     b'-2:lemma:1/100'
0.946915 Supp     b'+2:lemma:1m'
0.943867 OD       b'+1:postag:-RRB-'
0.941029 Gtype    b'lemma:WT'
0.939932 Phase    b'+1:lemma:phase'
0.938745 Technique b'postag:NNP'
0.938576 Med      b'-2:lemma:100'
0.938010 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
0.936301 O        b'lemma:='
0.932550 Temp     b'+1:postag:JJ'
0.929568 Gtype    b'-1:lemma:vector'
0.927418 Supp     b'-1:lemma:2'
0.925953 O        b'-2:lemma:reach'
0.924570 O        b'+2:postag:NN'
0.922661 OD       b'+2:lemma:0.3'
0.919092 Air      b'-1:postag::'
0.915154 O        b'lemma:k-12'
0.913916 Gtype    b'+1:lemma:mg1655'
0.913484 Supp     b'lemma:nitrate'
0.913153 O        b'-2:postag:FW'
0.912065 pH       b'-2:lemma:at'
0.910213 O        b'+2:lemma:chipseq'
0.909623 Med      b'-1:lemma:glucose'
0.907791 O        b'lemma:old'
0.907791 O        b'-1:lemma:seqa'
0.907791 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
0.906614 O        b'+1:postag:VBN'
0.903766 O        b'-1:lemma:shake'
0.901991 O        b'+2:postag:VB'
0.901807 O        b'+2:lemma:ml'
0.900808 O        b'+1:lemma:acetate'
0.900712 Supp     b'-2:lemma:nitrate'
0.899224 Med      b'+1:lemma:media'
0.898432 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
0.897657 O        b'hLower'
0.896911 Anti     b'postag:JJ'
0.895309 O        b'-1:postag:JJ'
0.888235 Anti     b'-1:lemma:monoclonal'
0.888235 Anti     b'+2:lemma:NeoClone'
0.888116 OD       b'+2:postag:CD'
0.886046 Supp     b'+2:lemma:mid-log'
0.884903 Gtype    b'-2:lemma:ecolus'
0.881469 Temp     b'-2:lemma:see'
0.879019 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'


Top negative:
0.000041 O        b'+2:lemma:paraquat'
0.000034 Gtype    b'-2:lemma:-lrb-'
0.000034 O        b'-1:postag:VBZ'
0.000026 Anti     b'-1:postag:VBN'
0.000023 OD       b'+2:lemma:0.35'
0.000010 pH       b'-2:postag:NNP'
0.000010 OD       b'+1:lemma:about'
0.000008 Gtype    b'-1:lemma:small'
0.000005 Gtype    b'lemma:Fur'
0.000005 Air      b'-1:postag:NNP'
0.000004 O        b'+1:lemma:='
0.000001 Temp     b'lemma:-lrb-'
0.000001 O        b'lemma:carbon'
0.000001 OD       b'lemma:0.15'
0.000000 Temp     b'postag:-LRB-'
0.000000 Gtype    b'+1:lemma:fnr'
-0.000000 Gtype    b'-1:lemma:-'
0.000000 O        b'+2:lemma:crosslink'
-0.000004 Gtype    b'+2:lemma:1'
-0.000010 Gtype    b'+1:postag:-LRB-'
-0.000011 O        b'+1:lemma:rna'
-0.000011 O        b'+2:lemma:use'
-0.000015 O        b'+2:lemma:the'
-0.000016 Gtype    b'+1:lemma:-lrb-'
-0.000026 O        b'+2:lemma:37'
-0.000028 O        b'+2:lemma:od600'
-0.000031 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.000087 O        b'+2:lemma:0.2'
-0.000113 O        b'-1:lemma:300'
-0.000190 Med      b'-1:lemma:MOPS'
-0.000229 O        b'+2:lemma:25'
-0.000250 O        b'+1:lemma:deletion'
-0.000292 O        b'+2:lemma:mutant'
-0.000365 O        b'lemma:mutant'
-0.000376 Supp     b'-1:lemma:20'
-0.000395 O        b'lemma:m'
-0.000420 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.000424 O        b'+2:lemma:in'
-0.000443 Supp     b'-1:lemma:the'
-0.000451 O        b'-2:lemma:control'
-0.000602 O        b'-2:postag:RB'
-0.000921 OD       b'+2:postag:IN'
-0.001428 O        b'+1:lemma:min'
-0.001535 Supp     b'+1:lemma:glucose'
-0.001552 Gtype    b'+2:lemma:_'
-0.001835 OD       b'+2:lemma:for'
-0.002085 O        b'+2:postag:RB'
-0.002186 Med      b'-2:postag:NNP'
-0.002361 Technique b'+2:postag:CD'
-0.003444 O        b'+1:lemma:95'
-0.003560 Gtype    b'lemma:_'
-0.003894 O        b'lemma:25'
-0.004153 O        b'-2:lemma:300'
-0.004510 Temp     b'+2:postag:JJ'
-0.005439 O        b'+1:lemma:antibody'
-0.005618 Phase    b'-1:lemma:at'
-0.006190 O        b'+1:lemma:phase'
-0.006983 O        b'-1:lemma:in'
-0.007110 O        b'+1:lemma:ph'
-0.007114 O        b'+1:lemma:anaerobically'
-0.007952 OD       b'-2:postag:VBN'
-0.008093 O        b'+2:lemma:dna'
-0.008130 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.008674 O        b'+2:lemma:5'
-0.009117 O        b'lemma:m9'
-0.009454 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.009679 Supp     b'+2:lemma:with'
-0.009768 Gtype    b'+1:lemma:-rrb-'
-0.010282 Supp     b'+2:lemma:mm'
-0.010482 O        b'+2:lemma:culture'
-0.010850 O        b'-2:lemma:m'
-0.011020 O        b'-1:lemma:deletion'
-0.011164 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.011382 O        b'lemma:phosphate'
-0.011997 Temp     b'-2:postag:IN'
-0.012231 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.012642 Gtype    b'-2:postag:CC'
-0.013430 O        b'+2:lemma:95'
-0.014479 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.015092 Supp     b'lemma:vol'
-0.015092 Supp     b'-1:lemma:1/100'
-0.015118 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.016602 O        b'+2:lemma:0.4'
-0.017233 Supp     b'-2:postag:VBD'
-0.017413 O        b'-1:postag:VB'
-0.018610 O        b'-2:postag:DT'
-0.018874 Vess     b'symb'
-0.019980 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.019992 Air      b'+2:postag:JJ'
-0.021963 Phase    b'+2:postag:NN'
-0.022307 Supp     b'+2:lemma:final'
-0.022880 Gtype    b'postag:NN'
-0.022918 O        b'lemma:fnr'
-0.023239 OD       b'+2:postag:DT'
-0.024802 Supp     b'-2:lemma:grow'
-0.024894 O        b'lemma:dpd'
-0.025140 O        b'-1:lemma:um'
-0.025140 O        b'+1:lemma:paraquat'
-0.026646 OD       b'+1:lemma:for'
-0.026890 O        b'+1:lemma:n2'
-0.027210 O        b'lemma:95'
-0.027251 O        b'lemma:final'
-0.027507 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.028241 OD       b'+1:lemma:.'
-0.028241 OD       b'+1:postag:.'
-0.028995 O        b'+2:lemma:o2'
-0.029579 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.031875 Agit     b'hLower'
-0.032096 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.032401 O        b'-1:lemma:25'
-0.033164 OD       b'lemma:2.0'
-0.033738 O        b'-2:lemma:grow'
-0.033751 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.033794 O        b'-1:lemma:~'
-0.034327 Med      b'+2:lemma:contain'
-0.036746 O        b'-2:lemma:5'
-0.039730 O        b'-2:lemma:70'
-0.039832 Supp     b'lemma:%'
-0.040029 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.040307 O        b'+1:lemma:a'
-0.040446 Temp     b'hGreek'
-0.040690 O        b'-2:lemma:n2'
-0.041893 Supp     b'+1:lemma:with'
-0.043853 O        b'+2:lemma:pk4854'
-0.044001 pH       b'hUpper'
-0.044660 O        b'+1:lemma:medium'
-0.045428 O        b'-2:lemma:cell'
-0.046616 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.046847 O        b'-2:lemma:of'
-0.046924 O        b'-2:lemma:-rrb-'
-0.047387 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.048562 O        b'-2:lemma:%'
-0.048898 Temp     b'-1:postag:IN'
-0.050296 O        b'+2:lemma:total'
-0.050838 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.050904 OD       b'+2:lemma:and'
-0.053125 Technique b'-2:postag:NN'
-0.053249 O        b'lemma:paraquat'
-0.053249 O        b'-2:lemma:um'
-0.054946 O        b'+1:postag:CD'
-0.055485 O        b'-1:lemma:gadx'
-0.056561 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.056924 O        b'lemma:5'
-0.057126 Supp     b'postag:NNS'
-0.057342 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.058827 O        b'-1:postag:DT'
-0.061792 O        b'+2:lemma:media'
-0.061958 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.062252 Supp     b'lemma:.'
-0.062252 Supp     b'postag:.'
-0.062811 Supp     b'lemma:,'
-0.062811 Supp     b'postag:,'
-0.062879 Air      b'-1:postag:CC'
-0.063025 Med      b'+1:postag:IN'
-0.063198 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.063505 Supp     b'postag:CD'
-0.064690 O        b'-2:lemma:chip-exo'
-0.065209 OD       b'lemma:~'
-0.065384 Med      b'-2:lemma:m63'
-0.066002 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.067762 Air      b'-2:lemma:be'
-0.069323 Med      b'-1:postag:IN'
-0.069649 Agit     b'postag:NN'
-0.070236 Technique b'+1:lemma:-rrb-'
-0.070501 O        b'+1:lemma:contain'
-0.070528 OD       b'-2:lemma:a'
-0.071303 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.071616 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.073297 O        b'-1:lemma:at'
-0.076801 Supp     b'-1:postag:VBG'
-0.078646 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.078646 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.078646 O        b'+2:lemma:vol'
-0.079495 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.079974 Temp     b'+2:postag:IN'
-0.080207 O        b'+1:lemma:300'
-0.082317 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.082600 Technique b'+1:postag:-RRB-'
-0.083732 O        b'+1:lemma:o2'
-0.084589 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.084801 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.087259 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.089490 Supp     b'-1:lemma:in'
-0.090083 O        b'+2:lemma:~'
-0.090374 O        b'-1:lemma:m9'
-0.092437 OD       b'postag:NN'
-0.092641 O        b'+1:postag:NNS'
-0.093467 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.094323 Med      b'lemma:-lrb-'
-0.095044 O        b'lemma:0.1'
-0.095168 OD       b'+2:postag:CC'
-0.097132 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.097810 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.099113 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.099234 O        b'+1:lemma:~'
-0.100685 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.101745 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.103068 Supp     b'+1:postag:JJ'
-0.104481 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.105042 O        b'+1:lemma:b'
-0.105912 O        b'-1:lemma:o2'
-0.106004 Air      b'lemma:,'
-0.106004 Air      b'postag:,'
-0.108306 Temp     b'-2:postag:JJ'
-0.109079 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.109556 OD       b'-2:postag:DT'
-0.110428 O        b'+1:lemma:genome'
-0.111446 Air      b'-2:postag:VBD'
-0.111690 O        b'+2:lemma:rnase'
-0.112156 OD       b'+2:postag:RB'
-0.112561 O        b'-2:lemma:glucose'
-0.113158 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.113857 O        b'lemma:;'
-0.113857 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.114844 Substrain b'hLower'
-0.116301 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.116301 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.118114 Temp     b'-2:postag:NN'
-0.118575 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.119182 O        b'+2:lemma:rna'
-0.122399 O        b'-2:lemma:25'
-0.125524 Phase    b'+2:postag:IN'
-0.125803 OD       b'lemma:='
-0.127310 Gtype    b'postag:NNP'
-0.130042 O        b'lemma:hour'
-0.134415 O        b'+2:lemma:.'
-0.134415 O        b'+2:postag:.'
-0.139511 O        b'+2:lemma:follow'
-0.141736 O        b'-2:lemma:for'
-0.142534 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.142672 O        b'lemma:o2'
-0.143627 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.143627 Supp     b'-1:postag:.'
-0.146916 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.153793 O        b'lemma:150'
-0.153793 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.153793 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.157162 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.160151 O        b'+2:lemma:n2'
-0.160688 Air      b'-2:postag:CC'
-0.162339 Med      b'+2:postag:VBG'
-0.162925 O        b'+1:postag:IN'
-0.165305 O        b'-1:lemma:of'
-0.165837 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.166871 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.167275 Air      b'+2:lemma:70'
-0.167765 O        b'+1:lemma:5'
-0.169392 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.170129 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.171178 Supp     b'postag:IN'
-0.172321 O        b'lemma:ph'
-0.173550 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.174871 O        b'-1:lemma:.'
-0.174871 O        b'-1:postag:.'
-0.175012 O        b'+2:lemma:0.3'
-0.175483 O        b'lemma:methanol'
-0.175483 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.177195 O        b'lemma:lb'
-0.177405 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.177744 Supp     b'+1:postag::'
-0.178142 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.178142 O        b'+2:lemma:1/100'
-0.178392 O        b'-2:lemma:10'
-0.182196 O        b'lemma:n2'
-0.187431 O        b'-1:lemma:the'
-0.192296 OD       b'symb'
-0.197164 O        b'+1:lemma:mm'
-0.197962 Air      b'-2:lemma:95'
-0.199296 O        b'+1:lemma:10'
-0.200108 O        b'-1:lemma:cra'
-0.200714 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.203869 Gtype    b'-1:lemma:and'
-0.208281 O        b'+2:lemma:at'
-0.209212 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.209486 O        b'lemma:7.6'
-0.209486 O        b'+1:lemma:;'
-0.211947 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.212078 O        b'-1:lemma:od600'
-0.214480 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.214946 O        b'-1:lemma:1m'
-0.214946 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.217004 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.219438 Anti     b'postag:NNP'
-0.220436 O        b'+1:lemma:mg1655'
-0.230501 Gtype    b'postag::'
-0.230662 O        b'-1:lemma:n2'
-0.232983 O        b'lemma:1m'
-0.233557 O        b'+1:lemma:%'
-0.233672 O        b'+2:lemma:tag'
-0.238791 O        b'-2:lemma:o2'
-0.240566 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.250116 Gtype    b'symb'
-0.252235 O        b'+2:lemma:ph'
-0.258280 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.264655 O        b'-1:lemma:final'
-0.268417 O        b'-2:lemma:phase'
-0.269534 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.269714 O        b'-1:lemma:250'
-0.277552 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.277552 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.279864 O        b'+2:lemma:m9'
-0.281546 O        b'lemma:dissolve'
-0.281546 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.281818 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.282291 O        b'-2:lemma:fnr'
-0.286978 O        b'+2:lemma:10'
-0.287245 O        b'+1:lemma:of'
-0.288513 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.293811 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.293811 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.294368 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.297335 Gtype    b'lemma:-lrb-'
-0.302280 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.306836 Med      b'+2:lemma:supplement'
-0.307109 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.307735 O        b'-2:lemma:stir'
-0.308013 O        b'+1:lemma:sample'
-0.310535 O        b'lemma:0.2'
-0.311219 O        b'+1:lemma:hour'
-0.311860 O        b'-1:lemma:mm'
-0.315115 O        b'+1:lemma:media'
-0.316236 O        b'-2:postag::'
-0.326536 O        b'-1:lemma:rna'
-0.328857 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.331325 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.331503 O        b'+2:lemma:co2'
-0.336700 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.337442 O        b'+1:lemma:until'
-0.342383 O        b'lemma:m63'
-0.342589 Temp     b'postag:NN'
-0.343092 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.347073 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.347102 Supp     b'lemma:1'
-0.351791 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.355797 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.357946 O        b'lemma:20'
-0.358834 O        b'lemma:co2'
-0.362547 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.362815 O        b'-2:lemma:100'
-0.368096 O        b'-1:lemma:contain'
-0.369650 O        b'-1:lemma:37'
-0.376665 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.377111 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.377116 O        b'lemma:of'
-0.377314 Supp     b'+2:postag::'
-0.381002 Air      b'+2:postag:IN'
-0.383105 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.386014 Med      b'postag:CD'
-0.388946 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.390992 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.393601 O        b'+2:lemma:genome'
-0.395571 O        b'+1:lemma:m'
-0.398867 O        b'+2:lemma:250'
-0.403216 Gtype    b'+1:lemma:and'
-0.404602 Supp     b'+2:postag:NNS'
-0.405229 Med      b'postag:-LRB-'
-0.418967 O        b'-2:postag:SYM'
-0.420845 O        b'lemma:od600'
-0.421475 O        b'+2:lemma:sample'
-0.422887 O        b'-1:lemma:with'
-0.428637 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.432717 Anti     b'hUpper'
-0.436304 Gversion b'hLower'
-0.440294 O        b'postag:RB'
-0.448243 O        b'-1:lemma:1'
-0.450431 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.452587 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.455998 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.460673 O        b'-2:lemma:20'
-0.462201 Gtype    b'+1:postag:CC'
-0.468456 Med      b'-1:postag:CD'
-0.470447 Gtype    b'-1:postag:CC'
-0.474458 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.484042 O        b'+2:lemma:reference'
-0.485949 O        b'lemma:fecl2'
-0.493920 O        b'lemma:mid-log'
-0.495714 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.495715 O        b'+2:lemma:add'
-0.498337 O        b'+1:lemma:_'
-0.501227 O        b'lemma:250'
-0.504581 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.514040 O        b'-1:lemma:ph'
-0.514566 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.518292 Med      b'-2:lemma:grow'
-0.525481 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.536919 O        b'-1:lemma:until'
-0.538626 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.543301 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.551805 O        b'-1:lemma:30'
-0.558400 O        b'lemma:pahse'
-0.558814 Technique b'-1:lemma::'
-0.568119 O        b'+1:lemma:gadx'
-0.573548 O        b'lemma:acetate'
-0.576531 O        b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.578812 OD       b'hLower'
-0.579809 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.582982 O        b'-2:lemma:dna'
-0.589477 O        b'-2:lemma::'
-0.592129 O        b'-2:lemma:50'
-0.606021 O        b'lemma:anaerobic'
-0.611479 O        b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.626598 O        b'lemma:sample'
-0.626851 O        b'+1:lemma:in'
-0.628904 O        b'-2:lemma:genome'
-0.638018 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.645790 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.648194 O        b'-2:postag:VBG'
-0.649731 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.652133 Med      b'-1:postag:NN'
-0.655477 pH       b'symb'
-0.659436 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.659436 Supp     b'+1:postag:,'
-0.665594 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.679640 O        b'+1:lemma:1m'
-0.679640 O        b'-2:lemma:vol'
-0.680381 O        b'lemma:minimal'
-0.703826 Technique b'-1:postag::'
-0.719552 OD       b'hUpper'
-0.720129 Strain   b'hLower'
-0.754975 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.761411 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.768517 Med      b'hLower'
-0.769231 O        b'-1:lemma:co2'
-0.771571 O        b'lemma:fructose'
-0.773680 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.774569 O        b'lemma:medium'
-0.795507 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.796896 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.798340 O        b'lemma:nitrate'
-0.798473 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.800463 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.825854 Supp     b'lemma:2'
-0.848056 O        b'-2:lemma:the'
-0.848574 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.868110 Vess     b'hUpper'
-0.869965 O        b'lemma:glucose'
-0.872473 Temp     b'hLower'
-0.874492 O        b'+1:postag:DT'
-0.899757 O        b'+1:lemma:at'
-0.934026 Strain   b'symb'
-0.944479 O        b'-1:lemma:vol'
-0.944479 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.944479 O        b'+2:lemma:1m'
-0.957118 O        b'lemma:nacl'
-0.966640 O        b'+2:lemma:+'
-0.967990 O        b'-1:lemma:2'
-0.968083 O        b'lemma:30'
-0.990011 O        b'-1:lemma:ml'
-1.003137 O        b'-2:lemma:until'
-1.008665 Air      b'postag:NN'
-1.039141 O        b'lemma:37'
-1.044503 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-1.045684 Med      b'+1:postag:NN'
-1.060243 O        b'+2:lemma:fnr'
-1.075222 Agit     b'hUpper'
-1.094624 O        b'hGreek'
-1.097883 O        b'-1:lemma:rpob'
-1.098835 O        b'-1:lemma:IP'
-1.100754 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.112027 O        b'+1:lemma:g/l'
-1.117149 O        b'-2:lemma:dpd'
-1.147369 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-1.175601 O        b'lemma:nh4cl'
-1.176310 Supp     b'hGreek'
-1.182777 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.186655 O        b'+1:lemma:+'
-1.196645 O        b'-2:lemma:pahse'
-1.228938 O        b'-1:postag::'
-1.243036 Phase    b'symb'
-1.257345 Gtype    b'-2:postag:CD'
-1.262437 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.278069 O        b'-2:lemma:0.3'
-1.312742 O        b'-2:lemma:media'
-1.373616 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.483607 Supp     b'postag:JJ'
-1.502147 Med      b'+2:postag:VBN'
-1.511803 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.542971 O        b'-2:lemma:IP'
-1.561893 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.568270 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.600096 OD       b'+1:postag:NN'
-1.669060 O        b'lemma:aerobic'
-1.669617 O        b'-1:lemma:sample'
-1.684052 O        b'+2:lemma:b'
-1.763602 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-1.775767 O        b'lemma:rifampicin'
-1.781239 O        b'lemma:media'
-1.908594 Gtype    b'postag:VBG'
-1.910272 O        b'lemma:wt'
-1.915395 O        b'lemma:0.3'
-2.095031 Phase    b'postag:JJ'
-2.102453 O        b'+1:lemma:2'
-2.141688 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.225739 O        b'+1:lemma:1'
-2.288107 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-2.383893 O        b'lemma:aerobically'
-2.592125 Phase    b'hUpper'
-2.820800 Technique b'symb'
-3.166146 O        b'-1:lemma::'
-4.226040 O        b'-1:lemma:_'