report_Run5_v11.txt
37.7 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.11527309375814619, 'c2': 0.0007142903984410407}
best CV score:0.826756700790382
model size: 0.08M
Flat F1: 0.8183709699306458
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.595 0.568 0.581 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.925 0.795 0.855 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.864 0.838 0.851 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.860 0.785 0.818 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.779155
Med -> Med 5.771266
OD -> OD 5.482515
Gtype -> Gtype 5.482078
Anti -> Anti 5.472543
Supp -> Supp 5.143678
Gversion -> Gversion 4.690733
O -> O 4.664585
Air -> Air 4.369471
Phase -> Phase 4.148643
Agit -> Agit 4.085440
Technique -> Technique 3.804596
pH -> pH 2.781030
Substrain -> Gtype 2.045377
Gtype -> Supp 1.277260
O -> Gtype 0.981116
O -> Technique 0.840686
O -> Supp 0.652290
Technique -> Air 0.311671
Air -> O 0.246398
Med -> O 0.236063
Temp -> O 0.192609
O -> Med 0.042860
Anti -> O 0.021313
O -> pH 0.011135
O -> Agit 0.009892
O -> Gversion 0.004982
Phase -> Air 0.000420
O -> OD -0.002481
OD -> O -0.069161
Technique -> O -0.070663
Anti -> Supp -0.088861
Phase -> O -0.121606
Supp -> O -0.155840
O -> Phase -0.168448
Agit -> Air -0.201487
Temp -> Med -0.500580
Supp -> Med -0.549978
Gtype -> O -0.636834
Technique -> pH -0.661482
O -> Air -0.927249
Phase -> OD -1.432028
Technique -> Gtype -1.507254
Substrain -> O -1.646472
Med -> Supp -1.953657
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.779155
Med -> Med 5.771266
OD -> OD 5.482515
Gtype -> Gtype 5.482078
Anti -> Anti 5.472543
Supp -> Supp 5.143678
Gversion -> Gversion 4.690733
O -> O 4.664585
Air -> Air 4.369471
Phase -> Phase 4.148643
Agit -> Agit 4.085440
Technique -> Technique 3.804596
pH -> pH 2.781030
Substrain -> Gtype 2.045377
Gtype -> Supp 1.277260
O -> Gtype 0.981116
O -> Technique 0.840686
O -> Supp 0.652290
Technique -> Air 0.311671
Air -> O 0.246398
Med -> O 0.236063
Temp -> O 0.192609
O -> Med 0.042860
Anti -> O 0.021313
O -> pH 0.011135
O -> Agit 0.009892
O -> Gversion 0.004982
Phase -> Air 0.000420
O -> OD -0.002481
OD -> O -0.069161
Technique -> O -0.070663
Anti -> Supp -0.088861
Phase -> O -0.121606
Supp -> O -0.155840
O -> Phase -0.168448
Agit -> Air -0.201487
Temp -> Med -0.500580
Supp -> Med -0.549978
Gtype -> O -0.636834
Technique -> pH -0.661482
O -> Air -0.927249
Phase -> OD -1.432028
Technique -> Gtype -1.507254
Substrain -> O -1.646472
Med -> Supp -1.953657
Top positive:
8.618447 Supp b'-2:lemma:shake'
8.382862 Phase b'lemma:mid-log'
8.367079 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
8.199997 O b'lemma:1'
7.807935 Gtype b'lemma:type'
7.563209 Air b'lemma:anaerobic'
7.474993 O b'-2:lemma:_'
7.432784 O b'lemma:2'
7.145254 O b'lemma:_'
7.059441 Med b'lemma:MOPS'
7.022345 Gtype b'lemma:wt'
7.008471 O b'lemma:3'
6.916272 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
6.901693 Supp b'lemma:no3'
6.736617 Anti b'-2:lemma:antibody'
6.685447 Supp b'lemma:Iron'
6.685447 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
6.577181 O b'postag:VBG'
6.568883 Air b'lemma:aerobic'
6.545913 Supp b'lemma:pq'
6.468772 Technique b'lemma:chipseq'
6.445276 Phase b'-2:lemma:phase'
6.413269 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
6.213183 Technique b'+2:lemma:ph5'
6.144313 O b'lemma:-'
6.126521 Strain b'lemma:k-12'
5.984662 O b'lemma:b'
5.540207 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
5.242931 O b'lemma:with'
5.226969 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
5.223342 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
5.203264 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
5.199591 Gtype b'lemma:pk4854'
5.141858 Supp b'lemma:nh4cl'
5.140730 O b'lemma:rpob'
5.140182 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
5.122656 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
5.107390 Med b'lemma:LB'
4.922504 Supp b'lemma:acetate'
4.782329 O b'lemma:Cra'
4.772767 Supp b'lemma:glucose'
4.760930 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.703116 O b'+2:lemma:crp'
4.680769 Technique b'lemma:rna-seq'
4.568773 Supp b'lemma:2h'
4.568773 Supp b'-1:lemma:additional'
4.550188 O b'lemma:.'
4.550188 O b'postag:.'
4.520834 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
4.493398 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
4.394149 Gtype b'-2:lemma:genotype'
4.381664 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
4.346704 Supp b'lemma:iptg'
4.300045 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
4.287732 O b'-2:lemma:myc'
4.228000 Supp b'lemma:arginine'
4.189609 Gtype b'+1:lemma:type'
4.145376 O b'-1:lemma:tag'
4.104093 O b'postag:IN'
4.069385 Technique b'-2:lemma:Fur'
4.044774 Gtype b'lemma:dfnr'
4.034521 O b'-1:postag:NNS'
4.015135 Air b'lemma:aerobically'
3.994489 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
3.984542 Substrain b'lemma:mg1655'
3.973822 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
3.925159 O b'lemma:rep2'
3.925159 O b'lemma:rep1'
3.828333 O b'lemma:soxr'
3.828333 O b'lemma:soxs'
3.726180 Med b'+1:lemma:g/l'
3.698397 Supp b'+2:lemma:iptg'
3.688090 Supp b'lemma:nacl'
3.681447 O b'lemma:a'
3.672146 Temp b'-1:lemma:sample'
3.665427 Gtype b'-2:lemma:delta'
3.657065 Technique b'lemma:chip-seq'
3.655407 pH b'lemma:ph5'
3.655407 pH b'+1:lemma:.5'
3.646503 Supp b'-1:lemma:Cra'
3.620078 Technique b'lemma:chip-exo'
3.590886 O b'lemma:gadx'
3.574758 Med b'+2:lemma:b2'
3.545493 O b'-1:lemma:lb'
3.483014 O b'-1:lemma:type'
3.478535 Med b'lemma:lb'
3.453274 O b'+1:postag:RB'
3.400011 O b'-1:lemma:glucose'
3.396068 O b'postag:VBN'
3.378335 O b'+1:lemma:wt'
3.377441 O b'lemma:harbor'
3.350801 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.344331 Med b'lemma:media'
3.307336 Technique b'-1:lemma:input'
3.298680 O b'lemma:CEL'
3.264914 Air b'-2:lemma:IP'
3.232429 Air b'postag:RB'
3.209856 O b'postag::'
3.200655 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
3.174387 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
3.161378 O b'-1:lemma:0.3'
3.150753 Phase b'lemma:stationary'
3.150753 Phase b'lemma:exponential'
3.146015 Med b'+2:lemma:b1'
3.129615 O b'+1:lemma:250'
3.105860 Supp b'lemma:rifampicin'
3.102800 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.094456 O b'lemma:culture'
3.077441 Supp b'-1:lemma:with'
3.052353 Supp b'lemma:Adenine'
3.046727 O b'-2:lemma:flagtag'
3.039570 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.993703 Supp b'-2:lemma:purr'
2.965110 O b'+1:lemma:od600'
2.939598 O b'lemma:ompr'
2.922788 O b'lemma:at'
2.920260 Supp b'+1:lemma:1'
2.883064 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.847390 O b'lemma:oxyr'
2.814960 pH b'lemma:5.5'
2.806780 Temp b'lemma:43'
2.790017 OD b'lemma:od450'
2.758994 Supp b'+1:lemma:2'
2.724114 Supp b'lemma:fructose'
2.717357 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
2.709396 O b'lemma:for'
2.701587 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.699480 Temp b'lemma:37'
2.696838 Air b'-2:lemma:fnr'
2.690384 O b'lemma:chip'
2.686567 Supp b'-1:lemma:+'
2.685490 pH b'+1:lemma:5.5'
2.680393 Med b'lemma:m63'
2.657054 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.632891 O b'postag:VBD'
2.613922 Gtype b'+1:lemma:ph5'
2.613922 Gtype b'+2:lemma:.5'
2.599525 Supp b'-2:lemma:media'
2.585519 Temp b'-2:lemma:keep'
2.550906 Gtype b'lemma:ptac'
2.521680 Supp b'lemma:Leu'
2.521680 Supp b'-2:lemma:Lrp'
2.515782 Temp b'-1:lemma:37'
2.514683 O b'-1:lemma:min'
2.507659 O b'+1:lemma:rifampicin'
2.483656 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.452590 Gversion b'lemma:.2'
2.452590 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.449854 O b'lemma:ml'
2.447105 O b'-2:lemma:medium'
2.437943 Phase b'+2:lemma:o.d.'
2.426230 Air b'-1:lemma:-'
2.411129 O b'-1:lemma:into'
2.410447 O b'postag:CC'
2.387351 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.387213 O b'+1:lemma:20'
2.381414 O b'lemma::'
2.364451 O b'lemma:genotype/variation'
2.357225 Phase b'-2:lemma:until'
2.356204 Technique b'lemma:rnaseq'
2.356078 Air b'lemma:anaeroibc'
2.354445 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.337398 Supp b'-2:lemma:agent'
2.326070 Gversion b'lemma:asm584v2'
2.323300 O b'-2:lemma:overnight'
2.313673 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.313673 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.306576 Gtype b'lemma:wild-type'
2.294696 Gversion b'lemma:u00096'
2.294696 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.291093 O b'postag:DT'
2.278593 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.275176 Gversion b'-2:lemma:build'
2.269912 OD b'lemma:0.3'
2.224967 O b'+1:postag:NNP'
2.221841 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
2.207572 Vess b'lemma:flask'
2.207572 Vess b'-1:lemma:warm'
2.207572 Vess b'-2:lemma:pre'
2.207572 Vess b'+2:lemma:43'
2.187493 Med b'+2:postag:CC'
2.182718 Med b'+1:lemma:0.4'
2.173473 Supp b'-2:lemma:argr'
2.149014 O b'lemma:A'
2.126675 Anti b'+1:lemma:antibody'
2.052815 Agit b'lemma:rpm'
2.045246 Technique b'-2:lemma:Nac'
2.037611 Gtype b'lemma:deltaseqa'
2.037611 Gtype b'-1:lemma:old'
2.037611 Gtype b'-2:lemma:seqa'
2.035008 Gtype b'postag:JJ'
2.031939 pH b'+1:postag:CD'
2.031438 O b'postag:NNS'
2.029540 Agit b'-1:lemma:250'
2.029113 Technique b'-1:lemma:IP'
2.026716 O b'-2:lemma:min'
2.021933 O b'lemma:input'
2.021933 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.980781 Gversion b'lemma:000913'
1.980781 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.980528 O b'-2:lemma:='
1.973081 O b'lemma:argr'
1.972224 O b'lemma:purr'
1.917539 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.898521 O b'-1:lemma:nacl'
1.890303 pH b'lemma:.5'
1.890303 pH b'-1:lemma:ph5'
1.887812 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.887812 Supp b'-2:lemma:mmol'
1.885728 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.885728 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.869599 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.851487 O b'lemma:affyexp'
1.846323 Strain b'+1:lemma:substr'
1.846323 Strain b'-2:lemma:str'
1.800325 Temp b'-1:lemma:43'
1.791142 O b'+1:lemma:acetate'
1.782421 Med b'-1:lemma:ml'
1.769469 OD b'+1:lemma:of'
1.758616 Supp b'-1:lemma:without'
1.754828 Supp b'+2:lemma:feso4'
1.744401 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.740676 O b'-1:lemma:antibody'
1.740541 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.739069 O b'lemma:trpr'
1.728134 O b'lemma:growth'
1.723115 O b'+1:lemma:coli'
1.718806 Air b'-2:lemma:%'
1.675699 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.670666 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.650164 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.646002 O b'+2:lemma:allow'
1.643221 O b'-2:lemma:fructose'
1.640594 O b'lemma:cra'
1.637914 OD b'-2:lemma:od450'
1.626990 Supp b'-1:lemma:final'
1.626045 O b'lemma:fresh'
1.617540 O b'-1:lemma:l1'
1.596443 Supp b'-1:lemma:_'
1.595242 O b'lemma:genotype'
1.594208 Air b'+2:lemma:37'
1.587783 Air b'postag:JJ'
1.587245 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.584948 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.584948 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.579055 Supp b'-2:lemma:10'
1.570313 Gtype b'+1:lemma:with'
1.569527 O b'lemma:from'
1.568014 Anti b'postag:JJ'
1.553773 O b'lemma:\xcf\x8332'
1.552760 Med b'+2:lemma:+'
1.552612 Gtype b'lemma:ryhb'
1.546244 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.519936 O b'-2:lemma:co2'
1.511248 Agit b'+2:lemma:at'
1.510774 O b'-2:lemma:~'
1.504627 Technique b'-1:lemma:_'
1.502858 Supp b'lemma:dpd'
1.502549 Supp b'+1:lemma:_'
1.502065 Supp b'-2:lemma:20'
1.500844 Air b'-1:lemma:co2'
1.500451 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.487497 Air b'-2:lemma:cm20'
1.478580 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.472775 Supp b'-1:postag:CD'
1.472044 Gtype b'+1:postag::'
1.468871 Supp b'lemma:Fe'
1.443106 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.434819 Med b'lemma:medium'
1.433554 O b'-1:lemma:dpd'
1.431699 O b'+1:lemma:0.2'
1.427931 O b'+1:lemma::'
1.417975 O b'+2:lemma:_'
1.417901 O b'+1:lemma:mid-log'
1.415560 Med b'+1:lemma:minimal'
1.413184 Supp b'+2:lemma:mid-log'
1.410465 Agit b'lemma:250'
1.405255 O b'-1:lemma:wt'
1.389827 Med b'lemma:minimal'
1.381905 Supp b'lemma:glutamine'
1.381905 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.381509 Supp b'-2:lemma:for'
1.377090 Air b'-2:postag:CD'
1.371215 O b'-1:lemma:mg1655'
1.369910 O b'lemma:additional'
1.369910 O b'+1:lemma:2h'
1.366373 Vess b'+1:lemma:at'
1.361473 O b'+2:postag:JJ'
1.354057 Med b'-1:lemma:minimal'
1.351146 Med b'+1:lemma:+'
1.345562 Anti b'-1:lemma:myc'
1.345562 Anti b'-2:lemma:9e10'
1.340466 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.340466 Gtype b'-2:lemma:transcription'
1.333894 Med b'+1:lemma:2.0'
1.326133 Gtype b'+1:lemma:_'
1.317919 Supp b'-1:lemma:30'
1.309876 Supp b'lemma:20'
1.306181 Supp b'-2:lemma:induce'
1.295035 O b'+1:lemma:pq'
1.288417 OD b'-1:lemma:od450'
1.283374 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
1.281389 Technique b'-2:lemma:wt'
1.279922 Substrain b'-1:lemma:.'
1.279922 Substrain b'-1:postag:.'
1.279757 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.258342 OD b'+2:lemma:0.3'
1.254677 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.254612 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.249139 O b'+1:lemma:k-12'
1.245899 Supp b'+2:lemma:add'
1.240707 O b'+2:lemma:fructose'
1.237492 O b'+2:lemma:constant'
1.231776 O b'lemma:old'
1.231776 O b'-1:lemma:seqa'
1.231776 O b'+1:lemma:deltaseqa'
1.215317 Gversion b'lemma:nc'
1.215317 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.204821 Air b'lemma:%'
1.204616 O b'postag:-RRB-'
1.199483 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.190208 Supp b'-1:postag:SYM'
1.161200 OD b'-2:lemma:phase'
1.159211 O b'-2:lemma:250'
1.156823 OD b'lemma:od600'
1.154212 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.154212 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.150625 Supp b'-2:postag:VBG'
1.141781 O b'lemma:be'
1.139077 Gtype b'lemma:nsrr'
1.139077 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.129474 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
1.128881 Air b'+1:lemma:b'
1.125846 O b'+2:lemma:wt'
1.121382 OD b'+2:lemma:culture'
1.121061 Supp b'+2:lemma:ph'
1.121045 Agit b'-2:postag:RB'
1.119548 Supp b'lemma:0.2'
1.117305 Gtype b'+2:lemma:lacz'
1.107895 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.097447 O b'postag:JJ'
1.091010 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.090102 O b'+2:lemma:chipseq'
1.076701 O b'+2:lemma:of'
1.074784 OD b'postag:CD'
1.072522 pH b'postag:CD'
1.071943 Supp b'postag:NNP'
1.067519 O b'-1:postag:NNP'
1.063665 O b'+2:lemma:ml'
1.052351 Supp b'+2:postag:-LRB-'
1.048743 OD b'+1:postag:IN'
1.048508 O b'+1:lemma:43'
1.041640 Gtype b'-2:lemma:the'
1.040684 O b'+2:postag:NNP'
1.036173 Med b'-1:postag:JJ'
1.033411 Phase b'+1:lemma:phase'
1.031442 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.027937 Vess b'-1:postag:VBN'
1.027059 O b'-2:lemma:in'
1.025048 Med b'-2:lemma:fresh'
1.022712 Supp b'+1:lemma:be'
1.018847 Gtype b'+2:postag::'
1.012271 OD b'-1:postag:IN'
1.007650 Supp b'-2:lemma:condition'
1.007166 Gtype b'lemma:phtpg'
1.007058 Supp b'-1:lemma:mm'
1.005349 Gversion b'postag:CD'
1.005304 O b'lemma:rnase'
1.004568 O b'lemma:or'
1.003561 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
1.001553 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.001553 Supp b'+2:lemma:1/100'
0.997648 Supp b'-2:lemma:pahse'
0.995514 pH b'-2:lemma:at'
0.993411 Med b'lemma:2'
0.989365 Med b'+1:postag:-LRB-'
0.988189 Med b'-2:postag:JJ'
0.986368 Substrain b'+2:lemma::'
0.985205 Air b'+1:lemma:%'
0.983549 Supp b'+2:postag:IN'
0.978231 Supp b'-1:lemma:vol'
0.978231 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.978231 Supp b'+2:lemma:1m'
0.977440 Gtype b'-1:lemma:_'
0.977118 O b'postag:-LRB-'
0.971311 Air b'+2:lemma:%'
0.969900 O b'lemma:chip-arca'
0.969900 O b'+2:lemma:arca8myc'
0.966699 OD b'lemma:of'
0.965851 pH b'-1:lemma:ph'
0.964192 pH b'lemma:ph'
0.960881 O b'-1:lemma:aerobic'
0.956600 Air b'+2:postag:CD'
0.955055 O b'+1:postag::'
0.948787 Gtype b'+2:postag:NN'
0.941518 O b'-1:lemma:pq'
0.939570 Air b'lemma:Anaerobic'
0.937488 O b'+1:postag:NN'
0.936908 Med b'postag:NNP'
0.926568 O b'-1:lemma:genbank'
0.915753 Anti b'lemma:antibody'
0.911031 O b'+1:lemma:sparging'
0.909409 Technique b'-1:lemma:1'
0.904920 Gtype b'-1:postag:VBP'
0.902759 O b'+2:postag:VB'
0.902246 O b'lemma:-rrb-'
0.897974 Supp b'-1:lemma:respiration'
0.897974 Supp b'+1:lemma:mmol'
0.897974 Supp b'+2:lemma:potassium'
0.897614 Supp b'lemma:of'
0.896850 Med b'-2:lemma:minimal'
0.895125 Technique b'lemma:-rrb-'
0.891000 Air b'-1:postag:CD'
0.889616 Supp b'+1:lemma:mm'
0.887600 OD b'+2:postag:CD'
0.885408 Supp b'lemma:30'
0.883019 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.881818 Med b'-1:lemma:glucose'
0.881532 Temp b'+1:lemma:see'
0.881355 O b'lemma:s'
0.881355 O b'-2:lemma:parameter'
0.879125 Gtype b'postag:-RRB-'
0.878105 Supp b'lemma:0.1'
0.872816 O b'-1:lemma:genotype/variation'
0.871216 OD b'postag:IN'
0.870763 Supp b'+1:postag:VBD'
0.867719 Air b'-1:postag::'
0.863619 O b'postag:FW'
0.861630 Gversion b'+1:postag:CD'
0.861462 Supp b'+2:lemma:be'
0.856061 O b'+1:lemma:ph5'
0.856061 O b'+2:lemma:.5'
0.852776 Supp b'+1:lemma:1m'
0.852776 Supp b'-2:lemma:vol'
0.844836 Gtype b'lemma:wild'
0.844680 Phase b'-2:postag:IN'
0.843502 Phase b'postag:NN'
0.837479 Supp b'-2:lemma:trpr'
0.834488 Air b'-2:lemma:0.3'
0.828083 Med b'-1:lemma:in'
0.815194 O b'+1:postag:VBZ'
0.814099 OD b'+2:lemma:~'
0.812791 O b'+2:postag:NN'
0.810331 O b'-1:postag:JJ'
0.808035 O b'-1:lemma:rpm'
0.807670 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
0.799320 Supp b'-1:postag:CC'
0.799142 O b'+1:lemma:nacl'
0.799041 O b'-1:lemma:medium'
0.798167 Air b'-1:lemma:%'
0.794603 Phase b'lemma:phase'
0.792610 O b'+2:postag:VBD'
0.790081 O b'-1:postag:NN'
0.786031 Gtype b'lemma:the'
0.785709 Technique b'-2:postag:NNP'
0.783307 O b'lemma:treatment'
0.777138 OD b'-1:lemma:od600'
0.776915 Phase b'+2:lemma:follow'
0.775831 Med b'-1:lemma:LB'
0.775831 Med b'+2:lemma:1mm'
0.775337 O b'+1:postag:VBN'
0.771473 Substrain b'+2:postag::'
0.771233 Temp b'+2:postag:DT'
0.766762 pH b'-2:lemma:glucose'
0.763591 OD b'-2:lemma:od600'
0.746807 Air b'-2:postag:SYM'
0.746544 Gtype b'+1:lemma:the'
0.742512 O b'lemma:to'
0.742512 O b'postag:TO'
0.739285 Supp b'-2:lemma:nitrate'
0.738149 Technique b'lemma:-lrb-'
0.735480 O b'+1:lemma:dpd'
0.733878 O b'+2:lemma:rpm'
0.730052 Technique b'postag:-LRB-'
0.729278 O b'-1:lemma:aerobically'
0.727699 O b'+1:lemma:old'
0.727699 O b'+2:lemma:deltaseqa'
0.726420 Med b'+1:lemma:medium'
0.724592 O b'lemma:-lrb-'
0.719232 Supp b'-1:lemma:contain'
0.718417 O b'lemma:4'
0.718231 Air b'+1:lemma:until'
0.716544 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.715804 O b'-1:lemma:w0002'
0.715108 Supp b'+1:postag:NN'
0.713038 O b'-1:postag:RB'
0.712235 Supp b'-1:postag:IN'
0.708890 O b'-1:lemma:4'
0.707706 O b'-1:lemma:0.35'
0.705183 Gtype b'lemma:fnr-8myc'
0.702249 Phase b'-1:lemma:until'
0.701904 Gtype b'-2:postag:JJ'
0.700060 Gtype b'+2:postag:CD'
0.699264 Supp b'-2:postag:CD'
0.696834 Gtype b'-1:lemma:harbor'
0.694273 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.692803 Phase b'lemma:pahse'
0.690687 O b'-1:lemma:fructose'
0.689978 Gtype b'-2:postag::'
0.686836 O b'-2:lemma:twice'
Top negative:
0.071344 Anti b'-2:lemma::'
0.066628 O b'+1:lemma:phosphate'
0.066071 O b'lemma:n2'
0.064720 Phase b'+2:lemma:at'
0.062621 Supp b'+1:lemma:m'
0.062362 O b'lemma:10'
0.061805 O b'+2:lemma:='
0.061745 O b'-2:postag:JJ'
0.060923 O b'-1:lemma:m63'
0.059780 Phase b'+1:postag:RB'
0.058273 Phase b'-1:postag:IN'
0.058011 Med b'+2:lemma:2'
0.056927 Gtype b'+1:postag:CD'
0.056531 Anti b'-1:postag:JJ'
0.055624 O b'+1:lemma:0.4'
0.055275 O b'-2:lemma:sample'
0.053700 Air b'-2:lemma:n2'
0.053491 O b'+1:lemma:to'
0.053491 O b'+1:postag:TO'
0.051943 Gtype b'+2:postag:VBN'
0.050561 OD b'+1:postag:JJ'
0.050464 O b'+2:lemma:phase'
0.048451 O b'+1:lemma:lb'
0.048446 Air b'-1:lemma:o2'
0.045785 O b'-1:lemma:%'
0.044308 O b'-1:lemma:0.3-0.35'
0.044109 Air b'+1:lemma:and'
0.043096 O b'+2:lemma:a'
0.042017 Gtype b'+2:postag:NNP'
0.040999 O b'+1:lemma:culture'
0.040926 O b'-2:lemma:strain'
0.040762 O b'lemma:sodium'
0.039864 O b'lemma:induction'
0.039604 Temp b'+1:postag:JJ'
0.039535 O b'lemma:+'
0.039268 Phase b'+2:lemma:for'
0.038500 Gtype b'-2:postag:DT'
0.037304 O b'-1:lemma:;'
0.037304 O b'-2:lemma:7.6'
0.035667 O b'-2:lemma:genotype'
0.034180 O b'-2:lemma:0.2'
0.033703 O b'-1:lemma:n2'
0.033410 O b'+2:lemma:0.3'
0.030695 OD b'-1:postag:JJ'
0.030653 O b'+2:lemma:glucose'
0.030016 Air b'-2:lemma:grow'
0.029594 Phase b'+2:postag:IN'
0.029371 O b'-2:lemma:;'
0.028287 O b'+2:lemma:dpd'
0.028091 Air b'lemma:-lrb-'
0.028067 Supp b'lemma:%'
0.027560 Air b'-2:lemma:and'
0.025966 Strain b'-2:postag:NN'
0.025717 Air b'-1:lemma:,'
0.025717 Air b'-1:postag:,'
0.024658 O b'-2:lemma:or'
0.023156 O b'+2:lemma:or'
0.021942 Supp b'-2:lemma:of'
0.021866 O b'+2:lemma:with'
0.020581 Air b'-2:lemma:-lrb-'
0.019092 Med b'+2:postag:RB'
0.018966 Supp b'postag:-RRB-'
0.018876 Temp b'+1:lemma:in'
0.017926 O b'lemma:mm'
0.017101 Gtype b'lemma:-rrb-'
0.016886 Supp b'-1:postag::'
0.016524 Anti b'-1:lemma:fnr'
0.016044 O b'+2:postag:IN'
0.015080 O b'+1:lemma:1/100'
0.015080 O b'-2:lemma:sodium'
0.015080 O b'+2:lemma:vol'
0.014142 Air b'postag:-LRB-'
0.011879 Air b'+1:postag:CD'
0.011658 Agit b'-1:postag:CD'
0.010959 Air b'-2:postag:-LRB-'
0.010786 OD b'postag:NN'
0.010701 O b'+1:lemma:70'
0.010107 Air b'+1:postag:NNP'
0.009628 Anti b'-2:postag::'
0.007807 O b'+1:lemma:b1'
0.006826 Temp b'+2:lemma:in'
0.006769 O b'-1:lemma:phosphate'
0.005752 O b'+1:lemma:fructose'
0.005700 O b'lemma:phosphate'
0.005608 Gtype b'lemma::'
0.004838 O b'-1:lemma:with'
0.004667 OD b'-1:postag:NN'
0.004130 Supp b'+2:lemma:in'
0.003946 O b'-2:postag:RB'
0.003834 Gtype b'-2:lemma:mg1655'
0.003581 Temp b'+1:postag:CC'
0.003443 Supp b'postag::'
0.003344 O b'lemma:o2'
0.002775 O b'lemma:glucose'
0.002652 Gtype b'+2:lemma:chipseq'
0.002642 O b'+1:postag:NNS'
0.002167 Phase b'+2:postag:NN'
0.002071 Air b'postag:CD'
0.002004 Temp b'+2:postag:CC'
0.001806 Phase b'-1:postag::'
0.001529 O b'+2:lemma:anaerobic'
0.001413 O b'-2:lemma:mm'
0.001346 O b'+2:lemma:acetate'
0.001260 Agit b'-2:lemma:-lrb-'
0.001248 Agit b'-2:postag:-LRB-'
0.001185 O b'+2:lemma:TEX'
0.001136 Gtype b'-1:lemma:the'
0.000874 Anti b'+1:postag:NN'
0.000843 Air b'lemma:o2'
0.000747 Temp b'+2:lemma:m9'
0.000665 Supp b'lemma:.'
0.000665 Supp b'postag:.'
0.000646 Technique b'-1:postag:NN'
0.000639 O b'+2:lemma:cra'
0.000604 Supp b'+1:lemma:in'
0.000585 Gtype b'+2:lemma:1'
0.000481 Supp b'+1:postag:JJ'
0.000424 OD b'postag:JJ'
0.000294 O b'-1:postag:FW'
0.000285 Supp b'+1:lemma:%'
0.000260 OD b'+2:lemma:-rrb-'
0.000259 OD b'+2:postag:-RRB-'
0.000243 Anti b'-2:postag:VBN'
0.000238 O b'+1:lemma:with'
0.000227 Supp b'postag:VBN'
0.000204 O b'-2:lemma:culture'
0.000163 Anti b'-1:postag::'
0.000112 Temp b'+2:postag:NN'
0.000075 O b'-2:lemma:to'
0.000075 O b'-2:postag:TO'
0.000067 OD b'-2:lemma:-lrb-'
0.000067 OD b'-2:postag:-LRB-'
0.000064 Temp b'-2:lemma:flask'
0.000043 Gtype b'+2:lemma:small'
0.000034 O b'-1:lemma:genotype'
0.000033 O b'+1:postag:SYM'
0.000028 Gtype b'+1:lemma:small'
0.000025 Supp b'+1:lemma:nitrate'
0.000025 Supp b'lemma:potassium'
0.000025 Supp b'-1:lemma:mmol'
0.000024 Gtype b'-2:lemma:Fur'
0.000024 Gtype b'-2:lemma:factor'
0.000023 Phase b'+2:postag:VBN'
0.000019 Gtype b'-1:lemma:Fur'
0.000010 O b'lemma:2.0'
0.000008 Supp b'-2:postag:CC'
0.000008 Gtype b'+2:lemma:rna'
0.000007 Supp b'-2:lemma::'
0.000006 Gtype b'+1:postag:DT'
0.000002 OD b'+2:lemma:,'
0.000002 OD b'+2:postag:,'
0.000002 OD b'+1:lemma:,'
0.000002 OD b'+1:postag:,'
0.000000 O b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.000024 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.000028 Supp b'-1:lemma:%'
-0.000034 O b'+1:lemma:0.3'
-0.000046 O b'lemma:nitrate'
-0.000047 Supp b'lemma:,'
-0.000047 Supp b'postag:,'
-0.000052 Gtype b'-1:postag:JJ'
-0.000058 Med b'-2:lemma:m9'
-0.000075 O b'+1:lemma:m'
-0.000114 Air b'-1:postag:VBN'
-0.000131 Med b'+1:postag:IN'
-0.000170 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.000200 Air b'-2:lemma:70'
-0.000255 O b'+1:lemma:o2'
-0.000329 O b'+2:lemma:o2'
-0.000611 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.000631 O b'+2:lemma:0.4'
-0.000637 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.000855 O b'lemma:lb'
-0.001045 O b'-1:lemma:in'
-0.001183 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.001540 Supp b'postag:CC'
-0.001622 Med b'+1:lemma:glucose'
-0.001986 O b'+2:lemma:final'
-0.002082 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.002552 O b'-2:lemma:at'
-0.002887 Temp b'+2:lemma:.'
-0.002887 Temp b'+2:postag:.'
-0.003199 OD b'+2:postag:JJ'
-0.003535 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.004022 O b'+2:lemma:then'
-0.004099 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.004128 O b'-1:lemma:at'
-0.004236 O b'+2:lemma:antibody'
-0.004391 Temp b'postag:CD'
-0.004526 Air b'+2:lemma:o2'
-0.004670 Med b'-2:postag:IN'
-0.005685 Supp b'lemma:um'
-0.005685 Supp b'+2:lemma:paraquat'
-0.005726 Air b'postag:CC'
-0.006355 O b'-1:lemma:37'
-0.006654 Technique b'-2:postag:NN'
-0.007115 O b'+2:lemma:5'
-0.007168 O b'-2:lemma:%'
-0.007828 O b'+1:lemma:supplement'
-0.008280 Air b'+1:lemma:-rrb-'
-0.008442 O b'-2:postag:DT'
-0.009848 Med b'+2:lemma:glucose'
-0.010012 O b'lemma:ph'
-0.011029 Temp b'+1:lemma:.'
-0.011029 Temp b'+1:postag:.'
-0.012078 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.012116 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.012526 O b'+1:lemma:5'
-0.012608 Air b'-2:postag:VBD'
-0.012681 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.014071 OD b'-2:lemma:grow'
-0.015999 Air b'+1:postag:-RRB-'
-0.017298 O b'+1:lemma:2.0'
-0.017317 Air b'+1:lemma:70'
-0.018023 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.018067 Supp b'lemma:ph'
-0.018184 Air b'+2:lemma:70'
-0.018886 Temp b'-2:postag:NN'
-0.019235 OD b'+2:postag:NN'
-0.019823 Air b'lemma:70'
-0.019977 Phase b'+2:lemma:aerobically'
-0.020274 Air b'+2:lemma:25'
-0.020318 O b'-2:lemma:ph'
-0.021012 Supp b'-1:lemma:.'
-0.021012 Supp b'-1:postag:.'
-0.022178 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.022805 Air b'-1:postag:CC'
-0.024246 Gtype b'lemma:delta'
-0.025351 O b'-1:lemma:od600'
-0.026211 Supp b'lemma:10'
-0.026239 Med b'-1:lemma:m63'
-0.027353 OD b'+2:lemma:0.4'
-0.027574 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.028709 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.028927 O b'+2:lemma:at'
-0.029712 Supp b'-2:lemma:,'
-0.029712 Supp b'-2:postag:,'
-0.033127 Air b'+1:lemma:or'
-0.033557 Supp b'postag:IN'
-0.034060 O b'+1:lemma:co2'
-0.034418 Air b'+2:postag:-RRB-'
-0.035059 Supp b'-2:lemma:phosphate'
-0.036713 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.036752 Technique b'+2:postag:CD'
-0.037294 O b'+1:lemma:ph'
-0.038195 Supp b'-1:lemma:;'
-0.038195 Supp b'-2:lemma:7.6'
-0.038664 Air b'lemma:-rrb-'
-0.038750 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.039476 Air b'lemma:,'
-0.039476 Air b'postag:,'
-0.040154 O b'+1:lemma:.'
-0.040154 O b'+1:postag:.'
-0.043897 Supp b'+2:postag:NN'
-0.044856 Supp b'+2:lemma:and'
-0.045983 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.046961 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.047439 Air b'postag:-RRB-'
-0.047534 O b'-1:postag:DT'
-0.048337 Air b'-2:postag:CC'
-0.048344 OD b'+2:postag:DT'
-0.049136 O b'-2:lemma:cell'
-0.050005 Temp b'-2:postag:IN'
-0.053014 Air b'+1:lemma:-lrb-'
-0.054091 O b'+2:lemma:media'
-0.055774 O b'lemma:co2'
-0.059942 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.061168 O b'lemma:150'
-0.061168 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.061168 O b'-2:lemma:concentration'
-0.062750 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.064560 O b'+1:lemma:n2'
-0.065570 O b'-2:lemma:minimal'
-0.068408 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.071590 OD b'lemma:~'
-0.071694 O b'+1:lemma:contain'
-0.072413 O b'-1:postag:VBG'
-0.072759 O b'+2:lemma:total'
-0.072927 O b'-1:lemma:0.1'
-0.073071 Air b'+2:lemma:,'
-0.073071 Air b'+2:postag:,'
-0.074593 Air b'-2:lemma:aerobically'
-0.075214 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.075735 O b'+1:lemma:a'
-0.076359 O b'+2:lemma:m9'
-0.076543 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.077884 Supp b'+2:postag::'
-0.079228 O b'+1:lemma:medium'
-0.080033 Supp b'-2:lemma:.'
-0.080033 Supp b'-2:postag:.'
-0.080747 O b'-2:lemma:10'
-0.080937 O b'-1:lemma:final'
-0.081486 Phase b'+2:postag:RB'
-0.082495 Air b'+2:lemma:or'
-0.083670 O b'+1:postag:CD'
-0.085270 O b'-2:postag::'
-0.087011 O b'+2:lemma:n2'
-0.090229 Air b'+2:lemma:-rrb-'
-0.090251 Supp b'lemma:vol'
-0.090251 Supp b'-1:lemma:1/100'
-0.094427 O b'+2:lemma:reference'
-0.097725 O b'+1:lemma:for'
-0.097838 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.102809 Supp b'-1:lemma:10'
-0.103767 Supp b'-2:lemma:;'
-0.104624 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.108160 O b'+2:lemma:in'
-0.111313 Supp b'-2:postag:NN'
-0.113862 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.115250 O b'+1:lemma:of'
-0.115446 Air b'-2:lemma:be'
-0.116502 O b'+1:lemma:media'
-0.118569 O b'+1:lemma:10'
-0.123092 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.123408 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.125414 O b'-2:lemma:o2'
-0.128165 O b'-1:lemma:fresh'
-0.129202 O b'+2:postag:RB'
-0.130740 Med b'postag:CD'
-0.131084 O b'lemma:m63'
-0.132879 O b'lemma:methanol'
-0.132879 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.135214 O b'-2:lemma:0.1'
-0.135344 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.140060 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.142113 Med b'-1:postag:IN'
-0.143089 Supp b'+1:lemma:final'
-0.143240 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.144530 O b'-2:postag:VBG'
-0.147078 Supp b'+2:lemma:final'
-0.148671 O b'+1:lemma:%'
-0.151304 O b'+1:lemma:mm'
-0.153241 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.154381 Med b'-2:lemma:in'
-0.154541 OD b'+2:lemma:a'
-0.157609 O b'-1:lemma:0.2'
-0.160720 O b'+2:lemma:fnr'
-0.161529 O b'lemma:;'
-0.161529 O b'-1:lemma:7.6'
-0.164513 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.165051 Supp b'+2:postag:CC'
-0.168267 O b'lemma:0.1'
-0.170186 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.170474 O b'-2:lemma:20'
-0.171305 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.172211 Supp b'-2:lemma:0.2'
-0.172545 O b'-1:lemma:of'
-0.173144 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.173295 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.173296 O b'-2:lemma:glucose'
-0.179340 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.180122 Supp b'+1:lemma:phosphate'
-0.182987 O b'+1:lemma:until'
-0.192599 O b'lemma:fecl2'
-0.193610 O b'-2:lemma:grow'
-0.193742 Supp b'postag:-LRB-'
-0.196106 O b'+1:lemma:~'
-0.196776 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.201391 O b'+2:lemma:ph'
-0.202573 O b'+1:lemma:g/l'
-0.205476 O b'+2:lemma:co2'
-0.211690 Phase b'+2:postag:CD'
-0.213932 Supp b'lemma:sodium'
-0.214042 O b'-1:lemma:mm'
-0.216095 O b'+1:lemma:phase'
-0.218378 O b'lemma:wt'
-0.219681 O b'-1:lemma:~'
-0.220552 Phase b'+1:postag:NN'
-0.223081 O b'lemma:dissolve'
-0.223081 O b'+2:lemma:methanol'
-0.224583 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.231240 O b'lemma:7.6'
-0.231240 O b'+1:lemma:;'
-0.233900 O b'+2:lemma:10'
-0.233906 O b'-2:lemma:iptg'
-0.234316 Temp b'-1:lemma:at'
-0.237235 O b'-1:lemma:contain'
-0.240652 pH b'postag:NN'
-0.255317 O b'lemma:pahse'
-0.256570 O b'lemma:20'
-0.264641 O b'-1:lemma:1m'
-0.264641 O b'+2:lemma:7.6'
-0.265077 O b'lemma:1m'
-0.265180 O b'+2:lemma:tag'
-0.265329 Temp b'+2:lemma:with'
-0.267457 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.267457 O b'+1:lemma:methanol'
-0.267876 O b'+2:lemma:~'
-0.270715 O b'-1:lemma:until'
-0.274624 O b'+2:lemma:genome'
-0.275065 Supp b'-2:lemma:with'
-0.276269 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.283531 O b'-1:lemma:the'
-0.285473 Temp b'+1:lemma:with'
-0.288590 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.291885 Supp b'lemma:2'
-0.294654 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.297130 Air b'-1:lemma:grow'
-0.299018 O b'-2:lemma:of'
-0.311415 O b'-1:lemma:.'
-0.311415 O b'-1:postag:.'
-0.317235 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.319988 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.322433 Supp b'+1:postag::'
-0.333023 O b'lemma:37'
-0.335710 O b'lemma:od600'
-0.344351 O b'lemma:of'
-0.351924 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.354263 Phase b'-2:postag:NN'
-0.364876 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.370313 O b'lemma:medium'
-0.371699 O b'+1:lemma:_'
-0.397734 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.403667 Med b'-1:postag:NN'
-0.405253 Air b'+2:postag:IN'
-0.408855 Gtype b'-2:postag:CD'
-0.410651 O b'+1:postag:IN'
-0.415351 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.430773 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.434980 O b'+2:lemma:.'
-0.434980 O b'+2:postag:.'
-0.436405 O b'-2:lemma:genome'
-0.441919 O b'-1:postag:IN'
-0.465961 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.470975 Med b'+1:postag:NN'
-0.482102 O b'+1:lemma:1m'
-0.482102 O b'-2:lemma:vol'
-0.497084 O b'+1:lemma:at'
-0.498611 O b'+1:lemma:minimal'
-0.501328 Supp b'+1:lemma:,'
-0.501328 Supp b'+1:postag:,'
-0.501462 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.504725 O b'-2:lemma:IP'
-0.523069 O b'-1:lemma:ml'
-0.528768 O b'lemma:0.2'
-0.532882 O b'+2:lemma:add'
-0.556683 O b'-2:lemma:pahse'
-0.559209 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.571611 O b'-1:lemma:rpob'
-0.576624 O b'lemma:aerobic'
-0.587203 O b'-1:postag::'
-0.590039 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.593007 Temp b'postag:NN'
-0.602854 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.602856 O b'-2:lemma:dpd'
-0.608504 O b'-2:lemma:supplement'
-0.629988 O b'+1:lemma:+'
-0.640711 O b'-1:lemma:vol'
-0.640711 O b'-2:lemma:1/100'
-0.640711 O b'+2:lemma:1m'
-0.642949 O b'-2:lemma:rpob'
-0.652642 Med b'+2:postag:VBN'
-0.671214 O b'+2:lemma:b'
-0.683157 O b'-2:lemma:fresh'
-0.689149 O b'-2:lemma::'
-0.711533 O b'-2:lemma:media'
-0.716698 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.717271 O b'+1:postag:DT'
-0.731292 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.732700 Temp b'-2:lemma:at'
-0.754795 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.788874 Air b'postag:NN'
-0.808410 O b'lemma:minimal'
-0.809907 O b'-1:lemma:ph'
-0.823517 O b'-2:lemma:until'
-0.844065 Anti b'postag:NNP'
-0.845254 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.861635 O b'-1:lemma:minimal'
-0.862114 O b'lemma:mid-log'
-0.904229 O b'lemma:rifampicin'
-0.911487 OD b'+1:postag:NN'
-0.976731 O b'+2:lemma:mid-log'
-1.038869 O b'+1:lemma:in'
-1.065981 O b'-1:lemma:30'
-1.137083 O b'lemma:30'
-1.145626 O b'+2:lemma:+'
-1.164592 O b'-2:lemma:aerobically'
-1.173754 O b'-2:postag:SYM'
-1.198214 O b'-1:lemma:co2'
-1.287535 O b'-2:lemma:the'
-1.318615 Supp b'+2:postag:CD'
-1.326351 O b'-1:lemma:1'
-1.369031 Supp b'postag:JJ'
-1.469773 O b'lemma:media'
-1.477832 O b'+2:lemma:anaerobically'
-1.586238 O b'lemma:aerobically'
-1.792655 Supp b'+2:lemma:1'
-1.809951 Supp b'+2:lemma:2'
-1.912439 O b'-1:lemma:sample'
-1.956905 O b'-2:lemma:0.3'
-2.219240 O b'+2:lemma:rifampicin'
-2.240126 O b'lemma:0.3'
-2.544063 O b'+1:lemma:2'
-2.755949 O b'-1:lemma:2'
-2.800111 O b'+2:lemma:iptg'
-2.980558 Phase b'postag:JJ'
-3.008031 O b'+1:lemma:1'
-3.280615 OD b'+2:lemma:aerobically'
-4.718068 O b'-1:lemma::'
-5.535839 O b'-1:lemma:_'