report_Run5_v10.txt
38.2 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.08551115880267557, 'c2': 0.002552786914346795}
best CV score:0.8315569437055503
model size: 0.09M
Flat F1: 0.814473145824424
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.595 0.568 0.581 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.922 0.756 0.831 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.864 0.838 0.851 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.859 0.779 0.814 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 6.025695
Med -> Med 5.493977
Anti -> Anti 5.409982
OD -> OD 5.054824
Gtype -> Gtype 5.017673
Gversion -> Gversion 4.957622
O -> O 4.886872
Supp -> Supp 4.420972
Phase -> Phase 4.026690
Air -> Air 3.988027
Technique -> Technique 3.316639
pH -> pH 3.109627
Agit -> Agit 2.971128
Substrain -> Gtype 1.769422
O -> Technique 1.056390
Gtype -> Supp 0.977534
O -> Gtype 0.562126
Technique -> Air 0.549865
Air -> O 0.344784
O -> Supp 0.317093
Gtype -> pH 0.304756
Med -> O 0.235992
Temp -> O 0.178431
O -> Temp 0.102889
O -> pH 0.031873
O -> Med 0.024838
O -> Gversion 0.015795
Supp -> Air -0.001248
O -> OD -0.018560
Technique -> O -0.040642
Air -> Agit -0.059546
Phase -> Air -0.082895
Phase -> O -0.107597
Gtype -> Med -0.128052
pH -> Supp -0.138422
Gversion -> O -0.165519
OD -> Supp -0.186906
Phase -> Supp -0.199535
Supp -> O -0.223729
Anti -> Supp -0.224729
OD -> O -0.261798
Air -> Supp -0.316382
Agit -> Air -0.450411
Temp -> Med -0.517538
O -> Phase -0.524869
Gtype -> O -0.659296
OD -> Air -0.705866
Supp -> Med -1.113498
Technique -> pH -1.155140
Substrain -> O -1.336019
O -> Air -1.348265
Phase -> OD -1.527916
Technique -> Gtype -1.714558
Med -> Supp -2.266695
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 6.025695
Med -> Med 5.493977
Anti -> Anti 5.409982
OD -> OD 5.054824
Gtype -> Gtype 5.017673
Gversion -> Gversion 4.957622
O -> O 4.886872
Supp -> Supp 4.420972
Phase -> Phase 4.026690
Air -> Air 3.988027
Technique -> Technique 3.316639
pH -> pH 3.109627
Agit -> Agit 2.971128
Substrain -> Gtype 1.769422
O -> Technique 1.056390
Gtype -> Supp 0.977534
O -> Gtype 0.562126
Technique -> Air 0.549865
Air -> O 0.344784
O -> Supp 0.317093
Gtype -> pH 0.304756
Med -> O 0.235992
Temp -> O 0.178431
O -> Temp 0.102889
O -> pH 0.031873
O -> Med 0.024838
O -> Gversion 0.015795
Supp -> Air -0.001248
O -> OD -0.018560
Technique -> O -0.040642
Air -> Agit -0.059546
Phase -> Air -0.082895
Phase -> O -0.107597
Gtype -> Med -0.128052
pH -> Supp -0.138422
Gversion -> O -0.165519
OD -> Supp -0.186906
Phase -> Supp -0.199535
Supp -> O -0.223729
Anti -> Supp -0.224729
OD -> O -0.261798
Air -> Supp -0.316382
Agit -> Air -0.450411
Temp -> Med -0.517538
O -> Phase -0.524869
Gtype -> O -0.659296
OD -> Air -0.705866
Supp -> Med -1.113498
Technique -> pH -1.155140
Substrain -> O -1.336019
O -> Air -1.348265
Phase -> OD -1.527916
Technique -> Gtype -1.714558
Med -> Supp -2.266695
Top positive:
7.966679 O b'lemma:1'
7.590341 Supp b'-2:lemma:shake'
7.485253 Gtype b'lemma:type'
7.471831 O b'lemma:2'
7.398807 Air b'lemma:anaerobic'
7.220988 O b'lemma:_'
7.205562 Supp b'lemma:no3'
7.162754 Anti b'-2:lemma:antibody'
7.081691 O b'-2:lemma:_'
6.815524 Technique b'lemma:chipseq'
6.752400 Phase b'lemma:mid-log'
6.582255 O b'lemma:3'
6.449683 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
6.394435 Supp b'lemma:pq'
6.367359 Phase b'-2:lemma:phase'
6.291305 Med b'lemma:MOPS'
6.257879 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
6.224282 Strain b'lemma:k-12'
6.137538 O b'postag:VBG'
5.796334 Technique b'+2:lemma:ph5'
5.785687 O b'lemma:-'
5.765058 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
5.572718 Gtype b'lemma:wt'
5.519100 Air b'lemma:aerobic'
5.504358 O b'lemma:b'
5.301297 O b'lemma:with'
5.279043 O b'lemma:Cra'
5.251722 Supp b'lemma:arginine'
5.232760 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
5.227754 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
5.156354 Med b'lemma:LB'
5.146601 Technique b'lemma:ChIP-exo'
5.004446 Supp b'lemma:Iron'
5.004446 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
4.955529 O b'lemma:rpob'
4.789653 Supp b'lemma:glucose'
4.779883 Supp b'lemma:nh4cl'
4.772690 Technique b'lemma:rna-seq'
4.760528 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
4.733200 O b'+2:lemma:crp'
4.709402 Supp b'lemma:2h'
4.709402 Supp b'-1:lemma:additional'
4.685088 O b'-1:lemma:type'
4.646836 Supp b'lemma:acetate'
4.606077 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
4.542642 Gtype b'+1:lemma:type'
4.499284 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
4.477333 Gtype b'-2:lemma:genotype'
4.473980 Supp b'lemma:iptg'
4.442909 Gtype b'lemma:pk4854'
4.396900 O b'lemma:.'
4.396900 O b'postag:.'
4.316468 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
4.314726 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
4.243345 Phase b'lemma:stationary'
4.243345 Phase b'lemma:exponential'
4.227779 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
4.194118 O b'-2:lemma:myc'
4.146560 Temp b'-1:lemma:sample'
4.094653 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
4.008296 O b'-1:lemma:tag'
3.990360 O b'-1:postag:NNS'
3.974544 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
3.937715 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
3.920552 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
3.908523 Supp b'lemma:rifampicin'
3.897448 Gtype b'lemma:dfnr'
3.877265 O b'lemma:rep2'
3.877265 O b'lemma:rep1'
3.873974 Med b'lemma:m63'
3.847107 Substrain b'lemma:mg1655'
3.843603 Technique b'lemma:chip-seq'
3.756553 Med b'+2:lemma:b2'
3.722683 Air b'-2:lemma:IP'
3.696337 O b'-2:lemma:flagtag'
3.636659 O b'lemma:gadx'
3.627245 O b'postag::'
3.608040 Supp b'+2:lemma:iptg'
3.586507 O b'postag:VBN'
3.580867 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.576214 Med b'lemma:lb'
3.563252 O b'lemma:CEL'
3.553265 Supp b'-1:lemma:+'
3.538224 Air b'lemma:anaeroibc'
3.524926 O b'+1:lemma:wt'
3.505929 Supp b'lemma:nacl'
3.485390 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.459427 O b'lemma:soxr'
3.459427 O b'lemma:soxs'
3.447970 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.442782 Supp b'-1:lemma:Cra'
3.432182 O b'postag:IN'
3.403077 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
3.366779 Temp b'lemma:37'
3.362972 Supp b'-2:lemma:media'
3.338474 pH b'lemma:ph5'
3.338474 pH b'+1:lemma:.5'
3.335767 Supp b'+2:lemma:feso4'
3.310961 Technique b'-2:lemma:Fur'
3.306486 Med b'lemma:media'
3.273162 O b'lemma:ompr'
3.262727 Supp b'-2:lemma:purr'
3.214430 O b'-1:lemma:lb'
3.214208 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
3.214019 O b'lemma:for'
3.206724 Air b'postag:RB'
3.206420 Technique b'lemma:chip-exo'
3.204544 Air b'lemma:aerobically'
3.192263 Gtype b'-2:lemma:delta'
3.170944 OD b'lemma:od450'
3.152916 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
3.138957 Technique b'-1:lemma:input'
3.058372 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.036034 O b'lemma:a'
3.012789 O b'lemma:culture'
3.002907 Temp b'-1:lemma:37'
2.992181 Supp b'+1:lemma:1'
2.980759 Med b'+2:lemma:b1'
2.978626 O b'lemma:harbor'
2.971287 O b'lemma:argr'
2.965031 O b'lemma:affyexp'
2.905021 O b'-1:lemma:glucose'
2.885739 Supp b'+1:lemma:2'
2.872720 O b'-1:lemma:0.3'
2.869905 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.848566 Supp b'-2:lemma:agent'
2.839966 Supp b'lemma:fructose'
2.836284 O b'lemma:at'
2.824853 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.822766 O b'+1:postag:RB'
2.817316 Supp b'-1:lemma:with'
2.802666 Agit b'lemma:rpm'
2.800776 Technique b'-1:lemma:IP'
2.798372 O b'+1:lemma:od600'
2.747664 Temp b'lemma:43'
2.734426 Air b'-1:lemma:-'
2.721281 O b'postag:CC'
2.712489 O b'lemma:oxyr'
2.705152 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.654997 Supp b'lemma:Leu'
2.654997 Supp b'-2:lemma:Lrp'
2.649137 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
2.648451 O b'-2:lemma:='
2.645037 Agit b'-1:lemma:250'
2.642917 Supp b'lemma:Adenine'
2.632248 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.624831 O b'+1:lemma:250'
2.614235 Temp b'-1:lemma:43'
2.605422 Gversion b'lemma:.2'
2.605422 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.593299 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.575861 pH b'lemma:5.5'
2.575710 O b'lemma:chip'
2.532384 O b'+1:lemma:mid-log'
2.502759 Phase b'+2:lemma:o.d.'
2.498175 O b'lemma:ml'
2.472106 O b'-2:lemma:overnight'
2.468361 Anti b'+1:lemma:antibody'
2.454253 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.428635 O b'postag:DT'
2.421258 O b'lemma:from'
2.404424 O b'+2:lemma:allow'
2.384109 O b'+1:lemma:20'
2.378921 OD b'lemma:0.3'
2.369773 Vess b'lemma:flask'
2.369773 Vess b'-1:lemma:warm'
2.369773 Vess b'-2:lemma:pre'
2.369773 Vess b'+2:lemma:43'
2.369001 O b'-2:lemma:min'
2.354242 Gtype b'lemma:ptac'
2.345926 O b'-2:lemma:medium'
2.316700 Gtype b'-1:lemma:rpob'
2.294894 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.294894 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.290749 pH b'lemma:.5'
2.290749 pH b'-1:lemma:ph5'
2.287477 Gversion b'lemma:u00096'
2.287477 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.267132 O b'lemma:A'
2.259564 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.247741 Gtype b'+1:lemma:with'
2.228101 O b'-1:lemma:into'
2.217786 Gtype b'lemma:deltaseqa'
2.217786 Gtype b'-1:lemma:old'
2.217786 Gtype b'-2:lemma:seqa'
2.198727 O b'-1:lemma:min'
2.178781 Gtype b'+1:lemma:ph5'
2.178781 Gtype b'+2:lemma:.5'
2.175872 O b'lemma:input'
2.175872 O b'+1:lemma:chip-seq'
2.135720 Temp b'-2:lemma:keep'
2.134409 O b'lemma:genotype/variation'
2.129267 O b'+1:lemma:coli'
2.128512 O b'postag:VBD'
2.127153 Phase b'+2:lemma:follow'
2.118733 Gtype b'lemma:arca8myc'
2.118733 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
2.117675 OD b'-2:lemma:od450'
2.113003 Med b'lemma:medium'
2.109049 Technique b'lemma:rnaseq'
2.096302 Technique b'-2:lemma:Nac'
2.070468 Med b'-1:lemma:ml'
2.068401 OD b'+1:lemma:of'
2.059857 Supp b'lemma:glutamine'
2.059857 Supp b'-1:lemma:2g/l'
2.059083 Gtype b'lemma:wild-type'
2.058254 pH b'+1:postag:CD'
2.051496 Gversion b'lemma:asm584v2'
2.051454 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
2.049700 Gversion b'-2:lemma:build'
2.017957 Air b'-2:lemma:cm20'
2.015976 Air b'-1:lemma:co2'
2.012850 O b'lemma:purr'
1.992094 O b'lemma:cra'
1.979776 O b'lemma:fresh'
1.946631 Phase b'-2:lemma:until'
1.942950 Gtype b'postag:JJ'
1.897517 Air b'-2:lemma:%'
1.853395 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.840355 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.811776 Gversion b'lemma:000913'
1.811776 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.800486 OD b'-2:lemma:phase'
1.800030 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.799542 Med b'+2:postag:CC'
1.768632 O b'+1:postag:NNP'
1.763776 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.763776 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.757016 Supp b'-2:lemma:10'
1.756790 O b'-1:lemma:antibody'
1.755127 Air b'-2:lemma:fnr'
1.744972 O b'lemma:\xcf\x8332'
1.743723 O b'lemma::'
1.739781 O b'lemma:growth'
1.737955 Technique b'-2:lemma:wt'
1.730473 O b'-2:lemma:co2'
1.727738 Supp b'-2:lemma:20'
1.727435 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.721250 Air b'+2:lemma:37'
1.711978 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.711978 Supp b'-2:lemma:mmol'
1.686667 O b'lemma:trpr'
1.685781 O b'+2:lemma:ml'
1.683647 Supp b'+1:lemma:Deficient'
1.674825 Supp b'-2:lemma:induce'
1.668100 O b'lemma:genotype'
1.654506 Med b'+1:lemma:g/l'
1.646076 Supp b'+2:lemma:A'
1.642237 O b'-1:lemma:wt'
1.640800 O b'+1:lemma:pq'
1.640548 Supp b'-1:lemma:without'
1.623974 Supp b'-1:postag:CD'
1.597418 Air b'postag:JJ'
1.596309 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.594674 O b'-1:lemma:l1'
1.590521 Med b'+2:lemma:+'
1.590012 Anti b'-1:lemma:myc'
1.590012 Anti b'-2:lemma:9e10'
1.586516 Supp b'-2:lemma:argr'
1.583655 Supp b'+2:lemma:add'
1.575436 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.566573 O b'-1:lemma:nacl'
1.566103 O b'-1:lemma:rpm'
1.562117 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.562117 Gtype b'-2:lemma:transcription'
1.555691 O b'-1:lemma:medium'
1.554366 Supp b'+1:lemma:_'
1.542551 Supp b'-2:postag:VBG'
1.539758 Supp b'lemma:0.2'
1.529346 Med b'+1:lemma:0.4'
1.503742 Supp b'-1:lemma:_'
1.502905 Strain b'+1:lemma:substr'
1.502905 Strain b'-2:lemma:str'
1.490825 Gtype b'-2:postag:NNS'
1.487786 Supp b'lemma:30'
1.480784 O b'+1:lemma:sparging'
1.470918 O b'+2:lemma:wt'
1.460126 O b'postag:NNS'
1.459825 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.459416 O b'+1:lemma:k-12'
1.450534 Supp b'-2:lemma:for'
1.446403 O b'lemma:old'
1.446403 O b'-1:lemma:seqa'
1.446403 O b'+1:lemma:deltaseqa'
1.445889 Agit b'+2:lemma:at'
1.445078 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.444970 Gversion b'lemma:nc'
1.444970 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.442256 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.441892 Gtype b'+1:lemma:_'
1.438689 Agit b'lemma:250'
1.431784 Supp b'-1:lemma:final'
1.431199 Supp b'lemma:20'
1.430584 O b'+1:lemma:acetate'
1.419782 Vess b'+1:lemma:at'
1.418383 Supp b'-2:lemma:trpr'
1.409025 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.408685 Med b'+1:lemma:2.0'
1.408440 pH b'+1:lemma:5.5'
1.407540 Temp b'+1:lemma:see'
1.398566 O b'-1:lemma:mg1655'
1.392687 pH b'-2:lemma:at'
1.383854 O b'lemma:additional'
1.383854 O b'+1:lemma:2h'
1.374693 O b'-2:lemma:Leu'
1.373405 Technique b'-1:lemma:1'
1.370021 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.350695 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
1.340333 O b'+2:postag:JJ'
1.331506 OD b'+2:lemma:0.3'
1.331278 Supp b'+2:lemma:mid-log'
1.325641 O b'+1:lemma:0.2'
1.325578 pH b'-1:lemma:ph'
1.317902 Med b'+1:lemma:minimal'
1.317712 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.316010 Air b'-2:postag:CD'
1.315065 O b'-1:lemma:aerobic'
1.305499 OD b'postag:CD'
1.305407 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.301997 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.300329 Gtype b'lemma:ryhb'
1.290954 O b'+2:lemma:rpm'
1.266899 O b'+1:lemma:43'
1.266263 Supp b'lemma:Fe'
1.265122 Supp b'-1:postag:SYM'
1.263299 Air b'-2:lemma:0.3'
1.262608 O b'+2:lemma:constant'
1.261760 Supp b'postag:NNP'
1.259634 O b'+1:lemma::'
1.259545 Supp b'-2:lemma:pahse'
1.254830 Supp b'lemma:0.1'
1.254532 OD b'lemma:od600'
1.238655 Phase b'lemma:phase'
1.238566 Supp b'+2:lemma:ph'
1.232043 Supp b'lemma:dpd'
1.226340 Med b'+1:lemma:+'
1.223976 Substrain b'-1:lemma:.'
1.223976 Substrain b'-1:postag:.'
1.223210 Agit b'-2:postag:RB'
1.215167 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.206122 Gtype b'+1:lemma:the'
1.206111 Gtype b'+1:postag::'
1.200987 OD b'+1:postag:IN'
1.198989 Gtype b'-2:lemma:mg1655'
1.195346 OD b'-1:lemma:od450'
1.193459 O b'lemma:rnase'
1.191233 O b'+2:lemma:chipseq'
1.190886 Phase b'-1:lemma:until'
1.189455 Med b'-1:lemma:in'
1.187761 Med b'-2:lemma:treatment'
1.177478 Air b'-1:postag:CD'
1.170258 Supp b'-1:lemma:mm'
1.169900 O b'+2:lemma:fructose'
1.168448 Med b'-2:lemma:fresh'
1.162696 Air b'+1:lemma:%'
1.161117 Air b'+2:lemma:%'
1.155312 Supp b'-1:lemma:30'
1.151809 Gtype b'lemma:phtpg'
1.147772 Gtype b'lemma:nsrr'
1.147772 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.143611 Med b'-1:lemma:minimal'
1.139915 Phase b'-2:postag:IN'
1.136515 Air b'+1:lemma:b'
1.132677 Air b'lemma:%'
1.127551 Technique b'-1:lemma:_'
1.127073 Substrain b'+2:lemma::'
1.125464 O b'-2:lemma:~'
1.121508 O b'lemma:chip-arca'
1.121508 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.116385 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.113894 Med b'-2:postag:JJ'
1.109990 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.109990 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.109990 Supp b'+2:lemma:potassium'
1.106778 O b'-1:lemma:-80'
1.102921 O b'lemma:chip-fnr'
1.102921 O b'+2:lemma:fnr8myc'
1.101868 Gtype b'-2:postag::'
1.101341 O b'-1:lemma:genbank'
1.098096 O b'-2:lemma:fructose'
1.086397 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.077654 Med b'postag:NNP'
1.073247 Gversion b'-2:postag:VB'
1.071666 pH b'lemma:ph'
1.071470 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.071470 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.063180 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.061742 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.059604 O b'lemma:lrp'
1.054251 Anti b'lemma:antibody'
1.053267 Phase b'+1:lemma:phase'
1.052893 O b'+2:lemma:of'
1.051090 Supp b'+2:postag:IN'
1.049900 Gtype b'-2:postag:JJ'
1.048643 Supp b'-2:lemma:nitrate'
1.046302 OD b'+2:lemma:culture'
1.042863 O b'postag:-LRB-'
1.041488 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
1.039752 O b'-1:lemma:dpd'
1.039631 Med b'lemma:minimal'
1.039081 Anti b'postag:JJ'
1.037203 Air b'-1:postag::'
1.035809 Supp b'-1:postag:CC'
1.034833 Gtype b'+2:postag:NN'
1.028150 Vess b'-1:postag:VBN'
1.024147 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.023059 Gtype b'-1:lemma:_'
1.022322 Phase b'postag:NN'
1.022193 Supp b'+1:lemma:1m'
1.022193 Supp b'-2:lemma:vol'
1.018007 Supp b'-1:lemma:vol'
1.018007 Supp b'-2:lemma:1/100'
1.018007 Supp b'+2:lemma:1m'
1.016233 Med b'lemma:glucose'
1.011537 O b'lemma:be'
1.011213 Air b'lemma:Anaerobic'
1.009771 Gtype b'+2:lemma:tag'
1.008576 O b'-1:postag:NNP'
1.007893 O b'lemma:-rrb-'
1.002301 O b'-1:lemma:media'
1.002043 O b'-1:postag:JJ'
1.001340 Supp b'+2:postag:-LRB-'
0.991099 Air b'+2:postag:CD'
0.977262 O b'-2:lemma:in'
0.975603 O b'-1:lemma:Iron'
0.973860 O b'+1:postag::'
0.973043 Med b'-1:postag:JJ'
0.967608 O b'+2:lemma:dfnr'
0.964311 Supp b'postag:NN'
0.959821 Gtype b'lemma:fnr-8myc'
0.958932 Agit b'+2:postag:IN'
0.958653 Supp b'-2:postag::'
0.958494 Substrain b'+2:postag::'
0.952531 O b'-1:postag:RB'
0.951363 Strain b'-1:lemma:.'
0.951363 Strain b'-1:postag:.'
0.951026 Gtype b'-1:lemma:harbor'
0.950787 O b'-1:lemma:0.35'
0.949588 O b'+2:postag:VB'
0.947587 O b'-1:lemma:pq'
0.946142 O b'+2:postag:NNP'
0.944045 O b'lemma:Fur'
0.940246 O b'-1:lemma:Aerobic'
0.940003 OD b'-1:postag:IN'
0.933681 Med b'-1:lemma:glucose'
0.931279 Gtype b'-2:lemma:dna'
0.930243 O b'postag:-RRB-'
0.929999 OD b'lemma:of'
0.928198 O b'lemma:-lrb-'
0.912988 Strain b'+2:lemma:.'
0.912988 Strain b'+2:postag:.'
0.906407 Gtype b'lemma:crp'
0.903304 Gtype b'-2:lemma:the'
0.903217 O b'+1:postag:VBZ'
0.899651 Gtype b'lemma:the'
0.899407 Phase b'lemma:pahse'
0.898338 Supp b'+2:lemma:be'
0.898301 Supp b'+1:lemma:mm'
0.897275 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.894791 Technique b'-2:postag:NNP'
0.891806 OD b'postag:IN'
0.891684 O b'lemma:s'
0.891684 O b'-2:lemma:parameter'
0.884913 OD b'+1:lemma:-rrb-'
0.881788 O b'+1:lemma:nacl'
0.878533 Med b'-1:lemma:fresh'
0.875966 Supp b'-1:lemma::'
0.875385 Air b'-2:postag:SYM'
0.872201 OD b'+1:postag:-RRB-'
0.867679 Gversion b'postag:NN'
0.865493 Supp b'lemma:tryptophan'
0.865493 Supp b'-1:lemma:mg/l'
0.864714 OD b'+2:lemma:~'
0.858579 O b'lemma:to'
0.858579 O b'postag:TO'
0.858299 pH b'-2:lemma:glucose'
0.856722 Gtype b'postag:-RRB-'
0.852791 Supp b'lemma:7.6'
0.852791 Supp b'+1:lemma:;'
0.851047 O b'+1:postag:NN'
0.844299 O b'+2:lemma:='
0.840317 Gversion b'+1:postag:CD'
0.838590 Gversion b'postag:CD'
0.838109 Med b'-1:lemma:LB'
0.838109 Med b'+2:lemma:1mm'
0.830747 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.828889 Supp b'-2:lemma:condition'
0.817605 Supp b'-1:postag:IN'
0.817082 Gtype b'postag:NN'
0.806049 O b'-1:postag:NN'
0.806049 Supp b'-1:lemma:1m'
0.806049 Supp b'+2:lemma:7.6'
0.805112 Technique b'+1:lemma:gadx'
0.800796 OD b'-1:lemma:~'
0.800435 Air b'+2:lemma:co2'
0.791121 Temp b'-2:postag:VBD'
0.789942 Supp b'lemma:of'
0.787024 Supp b'+2:lemma:leucine'
0.786112 Supp b'-1:lemma:sodium'
0.786112 Supp b'+2:lemma:1/100'
Top negative:
0.027343 Supp b'+2:lemma:b'
0.026569 O b'-1:lemma:m63'
0.026523 Supp b'-2:lemma:Fe'
0.025046 O b'-1:lemma:chip-exo'
0.024334 Agit b'+1:postag:-RRB-'
0.024282 O b'-2:lemma:treat'
0.023243 O b'-2:lemma:to'
0.023243 O b'-2:postag:TO'
0.023010 Gtype b'-2:lemma:Fur'
0.023009 O b'+2:lemma:with'
0.022452 O b'+2:lemma:a'
0.021290 Air b'-1:lemma:95'
0.020983 Phase b'+1:postag:IN'
0.020921 Med b'-2:lemma:50'
0.020600 O b'-2:lemma:m9'
0.020305 Med b'+2:lemma:2'
0.020279 Temp b'lemma:-lrb-'
0.019799 O b'-2:lemma:culture'
0.019666 O b'-1:lemma:induce'
0.018834 O b'+1:postag:SYM'
0.018724 O b'-1:lemma:;'
0.018724 O b'-2:lemma:7.6'
0.017902 Phase b'+1:lemma:aerobically'
0.017888 O b'lemma:10'
0.017674 Supp b'+1:lemma:leucine'
0.015355 O b'lemma:k-12'
0.014044 O b'lemma:1/100'
0.014044 O b'+1:lemma:vol'
0.013406 Gtype b'-2:postag:-RRB-'
0.013187 O b'+1:lemma:or'
0.013098 O b'+1:lemma:o2'
0.012749 Phase b'-1:postag:DT'
0.012486 O b'+1:postag:NNS'
0.012479 O b'-2:lemma:.2'
0.011431 O b'-1:lemma:in'
0.011307 O b'-1:lemma:-'
0.011091 O b'lemma:delta'
0.010934 O b'+1:lemma:70'
0.010915 Air b'lemma:70'
0.010582 O b'-2:lemma:70'
0.010321 O b'+1:lemma:co2'
0.010259 Gtype b'-2:lemma:ecolus'
0.009931 O b'+1:lemma:7.6'
0.009931 O b'-2:lemma:1m'
0.009931 O b'+2:lemma:;'
0.009846 Supp b'-2:lemma:;'
0.009439 O b'-2:lemma:0.2'
0.009289 O b'+1:lemma:culture'
0.008987 Gtype b'-1:lemma:the'
0.008717 O b'-2:lemma:mm'
0.008569 O b'+2:lemma:TEX'
0.008442 Supp b'-1:lemma:contain'
0.008411 Technique b'-2:postag:CD'
0.007784 Technique b'-1:lemma:-lrb-'
0.007457 Technique b'-1:postag:-LRB-'
0.006611 O b'-2:postag:RB'
0.006402 Supp b'-2:lemma:the'
0.005443 Gtype b'lemma:WT'
0.005377 OD b'+2:postag:DT'
0.005141 Supp b'+2:postag:NN'
0.005137 Phase b'+2:lemma:at'
0.005085 Phase b'+1:postag:RB'
0.004888 O b'-1:lemma:70'
0.004813 Temp b'+2:postag:CC'
0.004366 Technique b'+1:postag:NN'
0.004353 Supp b'+1:lemma:hour'
0.003603 O b'-2:lemma:2.5'
0.003137 OD b'+2:lemma:a'
0.002916 O b'lemma:mm'
0.002828 O b'+2:lemma:0.4'
0.002445 O b'-1:lemma:%'
0.002438 O b'lemma:um'
0.002438 O b'+2:lemma:paraquat'
0.002392 Supp b'postag:VBN'
0.002380 O b'-1:lemma:to'
0.002380 O b'-1:postag:TO'
0.002346 Supp b'+1:postag:NNS'
0.002272 O b'lemma:genbank'
0.002262 O b'-1:lemma:after'
0.002080 O b'lemma:induction'
0.001740 Air b'+2:postag:JJ'
0.001734 O b'-2:lemma:use'
0.001730 Technique b'-1:postag:CD'
0.001674 O b'-2:lemma:Wild'
0.001470 Gtype b'+1:lemma:cra'
0.001391 O b'+1:lemma:um'
0.001257 O b'lemma:vol'
0.001257 O b'-1:lemma:1/100'
0.001135 O b'-1:postag:FW'
0.000924 Supp b'lemma:.'
0.000924 Supp b'postag:.'
0.000910 Gtype b'postag::'
0.000898 Gtype b'-2:lemma:small'
0.000770 Anti b'-1:lemma:fnr'
0.000725 O b'+2:lemma:wash'
0.000680 O b'lemma:min'
0.000586 O b'lemma:short'
0.000586 O b'+1:lemma:rnase'
0.000566 Supp b'-2:postag:NNP'
0.000466 Gtype b'+2:lemma:chipseq'
0.000434 O b'+1:lemma:.'
0.000434 O b'+1:postag:.'
0.000394 Air b'-1:lemma:fur'
0.000381 Anti b'-1:postag:JJ'
0.000349 Agit b'-2:lemma:-lrb-'
0.000344 Anti b'-1:postag::'
0.000341 Agit b'-2:postag:-LRB-'
0.000312 OD b'+2:lemma:about'
0.000303 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.000287 Gtype b'+2:lemma:rna'
0.000252 OD b'+2:lemma:,'
0.000252 OD b'+2:postag:,'
0.000241 O b'+2:lemma:Cold'
0.000169 O b'-2:lemma:continue'
0.000168 OD b'postag:JJ'
0.000166 O b'+1:lemma:min'
0.000150 Anti b'lemma:mab'
0.000150 Anti b'-1:lemma:anti-flag'
0.000139 Supp b'+2:lemma:mm'
0.000135 OD b'+2:postag:IN'
0.000092 Supp b'-2:postag:NNS'
0.000047 OD b'+2:lemma:-rrb-'
0.000046 OD b'+2:postag:-RRB-'
0.000045 Med b'-1:lemma:-rrb-'
0.000045 Med b'-1:postag:-RRB-'
0.000039 O b'lemma:build'
0.000039 O b'-2:lemma:Genome'
0.000031 Gversion b'+1:lemma:_'
0.000030 OD b'-1:lemma:about'
0.000019 Med b'+2:lemma:medium'
0.000014 Supp b'lemma:10'
0.000012 Supp b'lemma:0.3'
0.000007 Gtype b'+2:postag:NNP'
0.000007 Gtype b'-2:lemma:factor'
0.000006 Technique b'lemma:ChIPSeq'
0.000005 O b'-1:lemma:20'
0.000004 OD b'+1:lemma:about'
0.000002 O b'+1:lemma:buffer'
0.000001 Supp b'+1:lemma:nitrate'
0.000001 Supp b'lemma:potassium'
0.000001 Supp b'-1:lemma:mmol'
0.000001 OD b'lemma:0.15'
0.000000 Temp b'lemma:30'
0.000000 O b'lemma:glycine'
-0.000001 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.000005 O b'-2:lemma:fnr'
-0.000010 O b'-2:lemma:g/l'
-0.000010 Gtype b'+2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.000012 O b'lemma:sample'
-0.000014 O b'-2:lemma:;'
-0.000032 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.000047 Supp b'+1:lemma:um'
-0.000053 O b'lemma:lb'
-0.000058 O b'-1:lemma:37'
-0.000087 Supp b'lemma:250'
-0.000106 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.000125 OD b'+2:postag:NN'
-0.000171 O b'+2:lemma:final'
-0.000172 O b'+2:lemma:0.3'
-0.000180 Air b'-1:postag:VBN'
-0.000371 Technique b'+2:postag:CD'
-0.000625 Med b'postag:CD'
-0.000646 O b'+2:lemma:od600'
-0.000756 O b'-2:lemma:2'
-0.000906 Supp b'-1:postag:DT'
-0.001274 Med b'+2:lemma:glucose'
-0.001428 Supp b'-2:lemma:of'
-0.001438 Supp b'lemma:um'
-0.001438 Supp b'+2:lemma:paraquat'
-0.001736 Technique b'-1:postag::'
-0.001867 Supp b'-1:lemma:250'
-0.002172 O b'+2:lemma:at'
-0.002623 Supp b'postag:-RRB-'
-0.003218 O b'+1:lemma:hour'
-0.003236 O b'+2:lemma:medium'
-0.003491 O b'+2:lemma:and'
-0.003643 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.004092 Supp b'-1:lemma:the'
-0.004229 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.004399 Supp b'lemma:vol'
-0.004399 Supp b'-1:lemma:1/100'
-0.005369 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.005463 Supp b'+2:lemma:final'
-0.006044 Supp b'-2:postag:NN'
-0.006570 O b'lemma:phosphate'
-0.007197 O b'-2:lemma:ph'
-0.007525 O b'-1:postag:DT'
-0.007942 O b'+2:lemma:the'
-0.007968 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.008043 O b'+2:lemma:supplement'
-0.008273 O b'-1:lemma:contain'
-0.009617 Phase b'+2:postag:NN'
-0.010393 Air b'-1:lemma:aerobically'
-0.011420 O b'-2:postag:DT'
-0.012405 Supp b'-1:lemma:.'
-0.012405 Supp b'-1:postag:.'
-0.012826 O b'+2:lemma:5'
-0.013218 OD b'-1:postag:NN'
-0.013736 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.013813 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.014066 Supp b'+1:lemma:final'
-0.015050 Air b'-2:lemma:aerobically'
-0.015296 Med b'-2:postag:IN'
-0.015323 OD b'-1:lemma:to'
-0.015323 OD b'-1:postag:TO'
-0.015465 O b'lemma:ph'
-0.015872 OD b'lemma:~'
-0.017815 OD b'+2:lemma:for'
-0.017899 O b'+1:lemma:b'
-0.018546 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.019460 Air b'+1:postag:-RRB-'
-0.019983 O b'+1:lemma:phase'
-0.020328 Supp b'postag::'
-0.021091 O b'lemma:methanol'
-0.021091 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.021398 O b'+1:lemma:95'
-0.021950 Air b'-2:postag:CC'
-0.022439 Air b'-2:postag:VBD'
-0.025030 O b'-1:lemma:at'
-0.025223 Air b'-1:postag:CC'
-0.027392 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.028212 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.029734 Supp b'+2:lemma:and'
-0.030622 O b'lemma:o2'
-0.030743 O b'-1:lemma:0.1'
-0.031227 Phase b'-2:postag:NN'
-0.031814 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.033389 O b'+1:lemma:10'
-0.033441 O b'+1:lemma:of'
-0.033566 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.034135 OD b'-2:postag:DT'
-0.037390 O b'+1:lemma:ph'
-0.039456 O b'+2:lemma:media'
-0.040004 O b'lemma:n2'
-0.040159 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.040223 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.041367 O b'-1:lemma:g/l'
-0.041436 Air b'postag:-RRB-'
-0.042118 Supp b'lemma:2'
-0.042257 O b'-1:lemma:harbor'
-0.042293 Air b'lemma:-rrb-'
-0.043220 O b'lemma:m63'
-0.043493 Med b'-2:postag:VBN'
-0.043986 O b'+1:lemma:pahse'
-0.045444 Air b'+2:lemma:,'
-0.045444 Air b'+2:postag:,'
-0.046614 Med b'-1:postag:IN'
-0.046825 Supp b'-2:lemma:,'
-0.046825 Supp b'-2:postag:,'
-0.047104 O b'-1:lemma:with'
-0.048601 OD b'postag:NN'
-0.050624 Med b'-2:lemma:m9'
-0.051866 Air b'lemma:,'
-0.051866 Air b'postag:,'
-0.051998 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.052584 Air b'+1:lemma:-rrb-'
-0.053083 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.053621 Air b'+2:postag:-RRB-'
-0.054931 Supp b'lemma:,'
-0.054931 Supp b'postag:,'
-0.055898 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.057453 OD b'-2:postag:VBN'
-0.057625 O b'+1:lemma:contain'
-0.061265 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.064342 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.067036 O b'+2:lemma:total'
-0.068737 Phase b'-1:postag:NN'
-0.070940 O b'-1:postag:VBG'
-0.071997 Supp b'-2:lemma:with'
-0.072230 Supp b'-1:lemma:10'
-0.075733 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.077021 O b'+1:lemma:supplement'
-0.078084 O b'-1:lemma:n2'
-0.079961 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.080240 O b'-2:lemma:0.1'
-0.080658 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.083058 O b'+1:lemma:%'
-0.085553 O b'+1:lemma:5'
-0.086830 O b'-2:lemma:at'
-0.087364 O b'+1:lemma:1/100'
-0.087364 O b'-2:lemma:sodium'
-0.087364 O b'+2:lemma:vol'
-0.087718 Gtype b'postag:VBG'
-0.089384 O b'+2:lemma:m9'
-0.090070 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.091989 O b'+1:lemma:0.3'
-0.092402 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.093735 Med b'-1:lemma:m63'
-0.093849 O b'+1:lemma:n2'
-0.096258 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.097916 O b'-2:lemma:cell'
-0.097990 Air b'+2:lemma:-rrb-'
-0.099655 Air b'-1:lemma:grow'
-0.100175 Supp b'+2:postag:NNS'
-0.100247 O b'lemma:150'
-0.100247 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.100247 O b'-2:lemma:concentration'
-0.102679 O b'-1:lemma:m9'
-0.105325 O b'lemma:nacl'
-0.105343 Air b'+2:lemma:70'
-0.105983 O b'-1:lemma:of'
-0.106786 Air b'-2:lemma:be'
-0.108939 O b'+1:lemma:glucose'
-0.109537 O b'+1:lemma:2.0'
-0.115133 O b'-1:lemma:0.2'
-0.115479 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.118791 O b'+1:lemma:medium'
-0.120033 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.120211 Supp b'+1:postag:JJ'
-0.120633 O b'-2:lemma:10'
-0.122153 Supp b'postag:IN'
-0.123187 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.129637 O b'lemma:anaerobic'
-0.130588 O b'+1:postag:CD'
-0.131139 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.132327 O b'+1:lemma:media'
-0.133705 O b'+1:lemma:for'
-0.134994 OD b'-2:lemma:a'
-0.136424 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.140943 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.142127 O b'lemma:37'
-0.144979 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.145801 O b'+2:postag:RB'
-0.146831 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.150300 O b'lemma:m9'
-0.150834 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.156050 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.156569 O b'-1:lemma:od600'
-0.157210 O b'+2:lemma:n2'
-0.158883 Air b'+2:lemma:or'
-0.162489 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.169357 Gtype b'-2:postag:CD'
-0.173551 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.174482 O b'+1:lemma:_'
-0.174961 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.176835 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.180049 O b'-2:postag::'
-0.184203 O b'-2:lemma:minimal'
-0.185571 O b'+1:lemma:~'
-0.188399 O b'-2:lemma:-rrb-'
-0.191681 pH b'postag:NN'
-0.195120 O b'+2:lemma:ph'
-0.196905 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.202382 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.205399 O b'+2:lemma:co2'
-0.211036 O b'+2:lemma:in'
-0.212453 O b'lemma:;'
-0.212453 O b'-1:lemma:7.6'
-0.213534 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.217019 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.217895 O b'+1:lemma:a'
-0.220197 O b'+1:lemma:mm'
-0.221245 O b'-2:lemma:20'
-0.222154 Supp b'+2:postag::'
-0.226959 O b'lemma:7.6'
-0.226959 O b'+1:lemma:;'
-0.227173 O b'lemma:20'
-0.231173 Supp b'-2:lemma:0.2'
-0.234756 O b'-2:lemma:grow'
-0.238500 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.240063 OD b'+2:postag:RB'
-0.244565 Supp b'postag:-LRB-'
-0.246457 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.252459 O b'+2:lemma:10'
-0.252688 O b'lemma:fecl2'
-0.255615 O b'lemma:co2'
-0.261347 O b'-2:lemma:rpob'
-0.261667 O b'+1:lemma:m'
-0.262125 O b'lemma:1m'
-0.266716 O b'postag:RB'
-0.279248 O b'-2:lemma:glucose'
-0.284922 Temp b'+2:lemma:with'
-0.285147 O b'lemma:dissolve'
-0.285147 O b'+2:lemma:methanol'
-0.288492 O b'-1:lemma:~'
-0.289780 Supp b'+1:postag::'
-0.292497 O b'+2:lemma:~'
-0.292599 O b'+1:lemma:until'
-0.297574 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.298454 O b'+2:lemma:genome'
-0.299532 O b'-2:lemma:o2'
-0.311251 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.312110 O b'lemma:of'
-0.312825 O b'-1:lemma:mm'
-0.313523 O b'lemma:nitrate'
-0.314922 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.314922 O b'+1:lemma:methanol'
-0.315521 O b'-1:lemma:until'
-0.315621 Temp b'+1:lemma:with'
-0.317949 O b'-1:lemma:IP'
-0.322526 O b'lemma:medium'
-0.332998 O b'lemma:od600'
-0.334178 O b'+1:postag:IN'
-0.338873 O b'-1:lemma:1m'
-0.338873 O b'+2:lemma:7.6'
-0.340477 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.350226 O b'-1:lemma:.'
-0.350226 O b'-1:postag:.'
-0.363247 O b'lemma:pahse'
-0.363600 O b'-1:lemma:final'
-0.374191 O b'-1:lemma:the'
-0.374241 O b'lemma:glucose'
-0.394101 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.409639 O b'+2:lemma:fnr'
-0.410814 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.412351 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.416971 O b'-1:lemma:fresh'
-0.421463 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.449349 O b'-2:lemma:of'
-0.462184 Med b'-1:postag:NN'
-0.468545 Med b'+1:postag:NN'
-0.473496 O b'+2:lemma:.'
-0.473496 O b'+2:postag:.'
-0.474910 O b'+1:lemma:minimal'
-0.486750 O b'-2:lemma:genome'
-0.497275 O b'-1:postag:IN'
-0.503138 O b'-2:lemma:IP'
-0.528883 Air b'+2:postag:IN'
-0.539009 Supp b'+2:postag:CC'
-0.545687 Supp b'+1:lemma:,'
-0.545687 Supp b'+1:postag:,'
-0.568957 Phase b'+2:postag:CD'
-0.593212 O b'+1:lemma:1m'
-0.593212 O b'-2:lemma:vol'
-0.597590 O b'+1:lemma:+'
-0.599354 O b'-2:lemma:supplement'
-0.603974 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.604069 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.628653 O b'-2:lemma:pahse'
-0.633314 O b'-1:lemma:minimal'
-0.635154 O b'lemma:aerobic'
-0.636040 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.645418 O b'+2:lemma:tag'
-0.647957 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.648620 Temp b'postag:NN'
-0.675177 O b'-1:lemma:vol'
-0.675177 O b'-2:lemma:1/100'
-0.675177 O b'+2:lemma:1m'
-0.676552 O b'+2:lemma:add'
-0.682008 Med b'-2:lemma:grow'
-0.682135 O b'lemma:minimal'
-0.688502 O b'lemma:0.1'
-0.696332 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.700781 O b'-2:lemma::'
-0.720533 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.721753 Med b'+2:postag:VBN'
-0.729211 O b'-2:lemma:until'
-0.744102 Air b'postag:NN'
-0.747837 O b'-2:lemma:fresh'
-0.753222 O b'-1:lemma:rpob'
-0.758537 O b'+1:postag:DT'
-0.763381 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.765616 O b'lemma:nh4cl'
-0.772606 O b'-2:lemma:media'
-0.802888 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.805282 O b'-1:lemma:ph'
-0.816589 O b'-1:postag::'
-0.817002 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.853957 O b'-2:lemma:dpd'
-0.865307 O b'-2:postag:VBG'
-0.885084 O b'lemma:0.2'
-0.937083 Anti b'postag:NNP'
-0.980157 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.985943 O b'lemma:rifampicin'
-1.049780 O b'-1:lemma:30'
-1.053620 O b'+1:lemma:at'
-1.055685 O b'+1:lemma:g/l'
-1.070601 O b'+2:lemma:+'
-1.072912 O b'-1:lemma:ml'
-1.094102 O b'+1:lemma:in'
-1.101793 OD b'+1:postag:NN'
-1.116046 O b'lemma:30'
-1.123838 Supp b'+2:postag:CD'
-1.157127 O b'-2:lemma:iptg'
-1.167377 O b'lemma:wt'
-1.170205 O b'-2:lemma:the'
-1.323444 O b'lemma:mid-log'
-1.359946 O b'-2:lemma:aerobically'
-1.435169 O b'lemma:media'
-1.447264 O b'-1:lemma:co2'
-1.450077 O b'-2:postag:SYM'
-1.634677 Supp b'postag:JJ'
-1.650408 O b'-1:lemma:1'
-1.936344 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.938922 O b'-2:lemma:0.3'
-2.038898 O b'-1:lemma:sample'
-2.054502 Supp b'+2:lemma:1'
-2.066191 Supp b'+2:lemma:2'
-2.073937 O b'+2:lemma:b'
-2.272243 O b'lemma:aerobically'
-2.344432 O b'lemma:0.3'
-2.754426 O b'+2:lemma:rifampicin'
-2.804220 O b'+2:lemma:iptg'
-3.038041 OD b'+2:lemma:aerobically'
-3.073897 O b'+1:lemma:2'
-3.128125 O b'-1:lemma:2'
-3.469606 O b'+1:lemma:1'
-3.804597 Phase b'postag:JJ'
-4.488134 O b'-1:lemma::'
-5.757935 O b'-1:lemma:_'