report_Run5_v10.txt 38.2 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 1141 1142 1143 1144 1145 1146 1147 1148
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.08551115880267557, 'c2': 0.002552786914346795}
best CV score:0.8315569437055503
model size: 0.09M

Flat F1: 0.814473145824424
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.595     0.568     0.581        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.922     0.756     0.831        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.864     0.838     0.851       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.859     0.779     0.814       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    6.025695
Med    -> Med     5.493977
Anti   -> Anti    5.409982
OD     -> OD      5.054824
Gtype  -> Gtype   5.017673
Gversion -> Gversion 4.957622
O      -> O       4.886872
Supp   -> Supp    4.420972
Phase  -> Phase   4.026690
Air    -> Air     3.988027
Technique -> Technique 3.316639
pH     -> pH      3.109627
Agit   -> Agit    2.971128
Substrain -> Gtype   1.769422
O      -> Technique 1.056390
Gtype  -> Supp    0.977534
O      -> Gtype   0.562126
Technique -> Air     0.549865
Air    -> O       0.344784
O      -> Supp    0.317093
Gtype  -> pH      0.304756
Med    -> O       0.235992
Temp   -> O       0.178431
O      -> Temp    0.102889
O      -> pH      0.031873
O      -> Med     0.024838
O      -> Gversion 0.015795
Supp   -> Air     -0.001248
O      -> OD      -0.018560
Technique -> O       -0.040642
Air    -> Agit    -0.059546
Phase  -> Air     -0.082895
Phase  -> O       -0.107597
Gtype  -> Med     -0.128052
pH     -> Supp    -0.138422
Gversion -> O       -0.165519
OD     -> Supp    -0.186906
Phase  -> Supp    -0.199535
Supp   -> O       -0.223729
Anti   -> Supp    -0.224729
OD     -> O       -0.261798
Air    -> Supp    -0.316382
Agit   -> Air     -0.450411
Temp   -> Med     -0.517538
O      -> Phase   -0.524869
Gtype  -> O       -0.659296
OD     -> Air     -0.705866
Supp   -> Med     -1.113498
Technique -> pH      -1.155140
Substrain -> O       -1.336019
O      -> Air     -1.348265
Phase  -> OD      -1.527916
Technique -> Gtype   -1.714558
Med    -> Supp    -2.266695


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    6.025695
Med    -> Med     5.493977
Anti   -> Anti    5.409982
OD     -> OD      5.054824
Gtype  -> Gtype   5.017673
Gversion -> Gversion 4.957622
O      -> O       4.886872
Supp   -> Supp    4.420972
Phase  -> Phase   4.026690
Air    -> Air     3.988027
Technique -> Technique 3.316639
pH     -> pH      3.109627
Agit   -> Agit    2.971128
Substrain -> Gtype   1.769422
O      -> Technique 1.056390
Gtype  -> Supp    0.977534
O      -> Gtype   0.562126
Technique -> Air     0.549865
Air    -> O       0.344784
O      -> Supp    0.317093
Gtype  -> pH      0.304756
Med    -> O       0.235992
Temp   -> O       0.178431
O      -> Temp    0.102889
O      -> pH      0.031873
O      -> Med     0.024838
O      -> Gversion 0.015795
Supp   -> Air     -0.001248
O      -> OD      -0.018560
Technique -> O       -0.040642
Air    -> Agit    -0.059546
Phase  -> Air     -0.082895
Phase  -> O       -0.107597
Gtype  -> Med     -0.128052
pH     -> Supp    -0.138422
Gversion -> O       -0.165519
OD     -> Supp    -0.186906
Phase  -> Supp    -0.199535
Supp   -> O       -0.223729
Anti   -> Supp    -0.224729
OD     -> O       -0.261798
Air    -> Supp    -0.316382
Agit   -> Air     -0.450411
Temp   -> Med     -0.517538
O      -> Phase   -0.524869
Gtype  -> O       -0.659296
OD     -> Air     -0.705866
Supp   -> Med     -1.113498
Technique -> pH      -1.155140
Substrain -> O       -1.336019
O      -> Air     -1.348265
Phase  -> OD      -1.527916
Technique -> Gtype   -1.714558
Med    -> Supp    -2.266695


Top positive:
7.966679 O        b'lemma:1'
7.590341 Supp     b'-2:lemma:shake'
7.485253 Gtype    b'lemma:type'
7.471831 O        b'lemma:2'
7.398807 Air      b'lemma:anaerobic'
7.220988 O        b'lemma:_'
7.205562 Supp     b'lemma:no3'
7.162754 Anti     b'-2:lemma:antibody'
7.081691 O        b'-2:lemma:_'
6.815524 Technique b'lemma:chipseq'
6.752400 Phase    b'lemma:mid-log'
6.582255 O        b'lemma:3'
6.449683 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
6.394435 Supp     b'lemma:pq'
6.367359 Phase    b'-2:lemma:phase'
6.291305 Med      b'lemma:MOPS'
6.257879 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
6.224282 Strain   b'lemma:k-12'
6.137538 O        b'postag:VBG'
5.796334 Technique b'+2:lemma:ph5'
5.785687 O        b'lemma:-'
5.765058 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
5.572718 Gtype    b'lemma:wt'
5.519100 Air      b'lemma:aerobic'
5.504358 O        b'lemma:b'
5.301297 O        b'lemma:with'
5.279043 O        b'lemma:Cra'
5.251722 Supp     b'lemma:arginine'
5.232760 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
5.227754 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
5.156354 Med      b'lemma:LB'
5.146601 Technique b'lemma:ChIP-exo'
5.004446 Supp     b'lemma:Iron'
5.004446 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
4.955529 O        b'lemma:rpob'
4.789653 Supp     b'lemma:glucose'
4.779883 Supp     b'lemma:nh4cl'
4.772690 Technique b'lemma:rna-seq'
4.760528 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
4.733200 O        b'+2:lemma:crp'
4.709402 Supp     b'lemma:2h'
4.709402 Supp     b'-1:lemma:additional'
4.685088 O        b'-1:lemma:type'
4.646836 Supp     b'lemma:acetate'
4.606077 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
4.542642 Gtype    b'+1:lemma:type'
4.499284 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
4.477333 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
4.473980 Supp     b'lemma:iptg'
4.442909 Gtype    b'lemma:pk4854'
4.396900 O        b'lemma:.'
4.396900 O        b'postag:.'
4.316468 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
4.314726 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
4.243345 Phase    b'lemma:stationary'
4.243345 Phase    b'lemma:exponential'
4.227779 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
4.194118 O        b'-2:lemma:myc'
4.146560 Temp     b'-1:lemma:sample'
4.094653 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
4.008296 O        b'-1:lemma:tag'
3.990360 O        b'-1:postag:NNS'
3.974544 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
3.937715 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
3.920552 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
3.908523 Supp     b'lemma:rifampicin'
3.897448 Gtype    b'lemma:dfnr'
3.877265 O        b'lemma:rep2'
3.877265 O        b'lemma:rep1'
3.873974 Med      b'lemma:m63'
3.847107 Substrain b'lemma:mg1655'
3.843603 Technique b'lemma:chip-seq'
3.756553 Med      b'+2:lemma:b2'
3.722683 Air      b'-2:lemma:IP'
3.696337 O        b'-2:lemma:flagtag'
3.636659 O        b'lemma:gadx'
3.627245 O        b'postag::'
3.608040 Supp     b'+2:lemma:iptg'
3.586507 O        b'postag:VBN'
3.580867 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.576214 Med      b'lemma:lb'
3.563252 O        b'lemma:CEL'
3.553265 Supp     b'-1:lemma:+'
3.538224 Air      b'lemma:anaeroibc'
3.524926 O        b'+1:lemma:wt'
3.505929 Supp     b'lemma:nacl'
3.485390 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.459427 O        b'lemma:soxr'
3.459427 O        b'lemma:soxs'
3.447970 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.442782 Supp     b'-1:lemma:Cra'
3.432182 O        b'postag:IN'
3.403077 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
3.366779 Temp     b'lemma:37'
3.362972 Supp     b'-2:lemma:media'
3.338474 pH       b'lemma:ph5'
3.338474 pH       b'+1:lemma:.5'
3.335767 Supp     b'+2:lemma:feso4'
3.310961 Technique b'-2:lemma:Fur'
3.306486 Med      b'lemma:media'
3.273162 O        b'lemma:ompr'
3.262727 Supp     b'-2:lemma:purr'
3.214430 O        b'-1:lemma:lb'
3.214208 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
3.214019 O        b'lemma:for'
3.206724 Air      b'postag:RB'
3.206420 Technique b'lemma:chip-exo'
3.204544 Air      b'lemma:aerobically'
3.192263 Gtype    b'-2:lemma:delta'
3.170944 OD       b'lemma:od450'
3.152916 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
3.138957 Technique b'-1:lemma:input'
3.058372 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.036034 O        b'lemma:a'
3.012789 O        b'lemma:culture'
3.002907 Temp     b'-1:lemma:37'
2.992181 Supp     b'+1:lemma:1'
2.980759 Med      b'+2:lemma:b1'
2.978626 O        b'lemma:harbor'
2.971287 O        b'lemma:argr'
2.965031 O        b'lemma:affyexp'
2.905021 O        b'-1:lemma:glucose'
2.885739 Supp     b'+1:lemma:2'
2.872720 O        b'-1:lemma:0.3'
2.869905 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.848566 Supp     b'-2:lemma:agent'
2.839966 Supp     b'lemma:fructose'
2.836284 O        b'lemma:at'
2.824853 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.822766 O        b'+1:postag:RB'
2.817316 Supp     b'-1:lemma:with'
2.802666 Agit     b'lemma:rpm'
2.800776 Technique b'-1:lemma:IP'
2.798372 O        b'+1:lemma:od600'
2.747664 Temp     b'lemma:43'
2.734426 Air      b'-1:lemma:-'
2.721281 O        b'postag:CC'
2.712489 O        b'lemma:oxyr'
2.705152 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.654997 Supp     b'lemma:Leu'
2.654997 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
2.649137 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
2.648451 O        b'-2:lemma:='
2.645037 Agit     b'-1:lemma:250'
2.642917 Supp     b'lemma:Adenine'
2.632248 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.624831 O        b'+1:lemma:250'
2.614235 Temp     b'-1:lemma:43'
2.605422 Gversion b'lemma:.2'
2.605422 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.593299 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.575861 pH       b'lemma:5.5'
2.575710 O        b'lemma:chip'
2.532384 O        b'+1:lemma:mid-log'
2.502759 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
2.498175 O        b'lemma:ml'
2.472106 O        b'-2:lemma:overnight'
2.468361 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.454253 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.428635 O        b'postag:DT'
2.421258 O        b'lemma:from'
2.404424 O        b'+2:lemma:allow'
2.384109 O        b'+1:lemma:20'
2.378921 OD       b'lemma:0.3'
2.369773 Vess     b'lemma:flask'
2.369773 Vess     b'-1:lemma:warm'
2.369773 Vess     b'-2:lemma:pre'
2.369773 Vess     b'+2:lemma:43'
2.369001 O        b'-2:lemma:min'
2.354242 Gtype    b'lemma:ptac'
2.345926 O        b'-2:lemma:medium'
2.316700 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
2.294894 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.294894 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.290749 pH       b'lemma:.5'
2.290749 pH       b'-1:lemma:ph5'
2.287477 Gversion b'lemma:u00096'
2.287477 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.267132 O        b'lemma:A'
2.259564 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.247741 Gtype    b'+1:lemma:with'
2.228101 O        b'-1:lemma:into'
2.217786 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
2.217786 Gtype    b'-1:lemma:old'
2.217786 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
2.198727 O        b'-1:lemma:min'
2.178781 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
2.178781 Gtype    b'+2:lemma:.5'
2.175872 O        b'lemma:input'
2.175872 O        b'+1:lemma:chip-seq'
2.135720 Temp     b'-2:lemma:keep'
2.134409 O        b'lemma:genotype/variation'
2.129267 O        b'+1:lemma:coli'
2.128512 O        b'postag:VBD'
2.127153 Phase    b'+2:lemma:follow'
2.118733 Gtype    b'lemma:arca8myc'
2.118733 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
2.117675 OD       b'-2:lemma:od450'
2.113003 Med      b'lemma:medium'
2.109049 Technique b'lemma:rnaseq'
2.096302 Technique b'-2:lemma:Nac'
2.070468 Med      b'-1:lemma:ml'
2.068401 OD       b'+1:lemma:of'
2.059857 Supp     b'lemma:glutamine'
2.059857 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
2.059083 Gtype    b'lemma:wild-type'
2.058254 pH       b'+1:postag:CD'
2.051496 Gversion b'lemma:asm584v2'
2.051454 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
2.049700 Gversion b'-2:lemma:build'
2.017957 Air      b'-2:lemma:cm20'
2.015976 Air      b'-1:lemma:co2'
2.012850 O        b'lemma:purr'
1.992094 O        b'lemma:cra'
1.979776 O        b'lemma:fresh'
1.946631 Phase    b'-2:lemma:until'
1.942950 Gtype    b'postag:JJ'
1.897517 Air      b'-2:lemma:%'
1.853395 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
1.840355 Supp     b'-1:lemma:ompr'
1.811776 Gversion b'lemma:000913'
1.811776 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.800486 OD       b'-2:lemma:phase'
1.800030 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.799542 Med      b'+2:postag:CC'
1.768632 O        b'+1:postag:NNP'
1.763776 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.763776 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.757016 Supp     b'-2:lemma:10'
1.756790 O        b'-1:lemma:antibody'
1.755127 Air      b'-2:lemma:fnr'
1.744972 O        b'lemma:\xcf\x8332'
1.743723 O        b'lemma::'
1.739781 O        b'lemma:growth'
1.737955 Technique b'-2:lemma:wt'
1.730473 O        b'-2:lemma:co2'
1.727738 Supp     b'-2:lemma:20'
1.727435 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.721250 Air      b'+2:lemma:37'
1.711978 Supp     b'-1:lemma:potassium'
1.711978 Supp     b'-2:lemma:mmol'
1.686667 O        b'lemma:trpr'
1.685781 O        b'+2:lemma:ml'
1.683647 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
1.674825 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.668100 O        b'lemma:genotype'
1.654506 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.646076 Supp     b'+2:lemma:A'
1.642237 O        b'-1:lemma:wt'
1.640800 O        b'+1:lemma:pq'
1.640548 Supp     b'-1:lemma:without'
1.623974 Supp     b'-1:postag:CD'
1.597418 Air      b'postag:JJ'
1.596309 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.594674 O        b'-1:lemma:l1'
1.590521 Med      b'+2:lemma:+'
1.590012 Anti     b'-1:lemma:myc'
1.590012 Anti     b'-2:lemma:9e10'
1.586516 Supp     b'-2:lemma:argr'
1.583655 Supp     b'+2:lemma:add'
1.575436 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.566573 O        b'-1:lemma:nacl'
1.566103 O        b'-1:lemma:rpm'
1.562117 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.562117 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.555691 O        b'-1:lemma:medium'
1.554366 Supp     b'+1:lemma:_'
1.542551 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.539758 Supp     b'lemma:0.2'
1.529346 Med      b'+1:lemma:0.4'
1.503742 Supp     b'-1:lemma:_'
1.502905 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.502905 Strain   b'-2:lemma:str'
1.490825 Gtype    b'-2:postag:NNS'
1.487786 Supp     b'lemma:30'
1.480784 O        b'+1:lemma:sparging'
1.470918 O        b'+2:lemma:wt'
1.460126 O        b'postag:NNS'
1.459825 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.459416 O        b'+1:lemma:k-12'
1.450534 Supp     b'-2:lemma:for'
1.446403 O        b'lemma:old'
1.446403 O        b'-1:lemma:seqa'
1.446403 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
1.445889 Agit     b'+2:lemma:at'
1.445078 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.444970 Gversion b'lemma:nc'
1.444970 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.442256 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.441892 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.438689 Agit     b'lemma:250'
1.431784 Supp     b'-1:lemma:final'
1.431199 Supp     b'lemma:20'
1.430584 O        b'+1:lemma:acetate'
1.419782 Vess     b'+1:lemma:at'
1.418383 Supp     b'-2:lemma:trpr'
1.409025 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.408685 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.408440 pH       b'+1:lemma:5.5'
1.407540 Temp     b'+1:lemma:see'
1.398566 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.392687 pH       b'-2:lemma:at'
1.383854 O        b'lemma:additional'
1.383854 O        b'+1:lemma:2h'
1.374693 O        b'-2:lemma:Leu'
1.373405 Technique b'-1:lemma:1'
1.370021 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.350695 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
1.340333 O        b'+2:postag:JJ'
1.331506 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.331278 Supp     b'+2:lemma:mid-log'
1.325641 O        b'+1:lemma:0.2'
1.325578 pH       b'-1:lemma:ph'
1.317902 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.317712 Gtype    b'+1:lemma:pq'
1.316010 Air      b'-2:postag:CD'
1.315065 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.305499 OD       b'postag:CD'
1.305407 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.301997 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
1.300329 Gtype    b'lemma:ryhb'
1.290954 O        b'+2:lemma:rpm'
1.266899 O        b'+1:lemma:43'
1.266263 Supp     b'lemma:Fe'
1.265122 Supp     b'-1:postag:SYM'
1.263299 Air      b'-2:lemma:0.3'
1.262608 O        b'+2:lemma:constant'
1.261760 Supp     b'postag:NNP'
1.259634 O        b'+1:lemma::'
1.259545 Supp     b'-2:lemma:pahse'
1.254830 Supp     b'lemma:0.1'
1.254532 OD       b'lemma:od600'
1.238655 Phase    b'lemma:phase'
1.238566 Supp     b'+2:lemma:ph'
1.232043 Supp     b'lemma:dpd'
1.226340 Med      b'+1:lemma:+'
1.223976 Substrain b'-1:lemma:.'
1.223976 Substrain b'-1:postag:.'
1.223210 Agit     b'-2:postag:RB'
1.215167 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.206122 Gtype    b'+1:lemma:the'
1.206111 Gtype    b'+1:postag::'
1.200987 OD       b'+1:postag:IN'
1.198989 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
1.195346 OD       b'-1:lemma:od450'
1.193459 O        b'lemma:rnase'
1.191233 O        b'+2:lemma:chipseq'
1.190886 Phase    b'-1:lemma:until'
1.189455 Med      b'-1:lemma:in'
1.187761 Med      b'-2:lemma:treatment'
1.177478 Air      b'-1:postag:CD'
1.170258 Supp     b'-1:lemma:mm'
1.169900 O        b'+2:lemma:fructose'
1.168448 Med      b'-2:lemma:fresh'
1.162696 Air      b'+1:lemma:%'
1.161117 Air      b'+2:lemma:%'
1.155312 Supp     b'-1:lemma:30'
1.151809 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.147772 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.147772 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.143611 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.139915 Phase    b'-2:postag:IN'
1.136515 Air      b'+1:lemma:b'
1.132677 Air      b'lemma:%'
1.127551 Technique b'-1:lemma:_'
1.127073 Substrain b'+2:lemma::'
1.125464 O        b'-2:lemma:~'
1.121508 O        b'lemma:chip-arca'
1.121508 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.116385 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.113894 Med      b'-2:postag:JJ'
1.109990 Supp     b'-1:lemma:respiration'
1.109990 Supp     b'+1:lemma:mmol'
1.109990 Supp     b'+2:lemma:potassium'
1.106778 O        b'-1:lemma:-80'
1.102921 O        b'lemma:chip-fnr'
1.102921 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
1.101868 Gtype    b'-2:postag::'
1.101341 O        b'-1:lemma:genbank'
1.098096 O        b'-2:lemma:fructose'
1.086397 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.077654 Med      b'postag:NNP'
1.073247 Gversion b'-2:postag:VB'
1.071666 pH       b'lemma:ph'
1.071470 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.071470 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.063180 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.061742 Gtype    b'-1:lemma:vector'
1.059604 O        b'lemma:lrp'
1.054251 Anti     b'lemma:antibody'
1.053267 Phase    b'+1:lemma:phase'
1.052893 O        b'+2:lemma:of'
1.051090 Supp     b'+2:postag:IN'
1.049900 Gtype    b'-2:postag:JJ'
1.048643 Supp     b'-2:lemma:nitrate'
1.046302 OD       b'+2:lemma:culture'
1.042863 O        b'postag:-LRB-'
1.041488 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
1.039752 O        b'-1:lemma:dpd'
1.039631 Med      b'lemma:minimal'
1.039081 Anti     b'postag:JJ'
1.037203 Air      b'-1:postag::'
1.035809 Supp     b'-1:postag:CC'
1.034833 Gtype    b'+2:postag:NN'
1.028150 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.024147 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.023059 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.022322 Phase    b'postag:NN'
1.022193 Supp     b'+1:lemma:1m'
1.022193 Supp     b'-2:lemma:vol'
1.018007 Supp     b'-1:lemma:vol'
1.018007 Supp     b'-2:lemma:1/100'
1.018007 Supp     b'+2:lemma:1m'
1.016233 Med      b'lemma:glucose'
1.011537 O        b'lemma:be'
1.011213 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.009771 Gtype    b'+2:lemma:tag'
1.008576 O        b'-1:postag:NNP'
1.007893 O        b'lemma:-rrb-'
1.002301 O        b'-1:lemma:media'
1.002043 O        b'-1:postag:JJ'
1.001340 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
0.991099 Air      b'+2:postag:CD'
0.977262 O        b'-2:lemma:in'
0.975603 O        b'-1:lemma:Iron'
0.973860 O        b'+1:postag::'
0.973043 Med      b'-1:postag:JJ'
0.967608 O        b'+2:lemma:dfnr'
0.964311 Supp     b'postag:NN'
0.959821 Gtype    b'lemma:fnr-8myc'
0.958932 Agit     b'+2:postag:IN'
0.958653 Supp     b'-2:postag::'
0.958494 Substrain b'+2:postag::'
0.952531 O        b'-1:postag:RB'
0.951363 Strain   b'-1:lemma:.'
0.951363 Strain   b'-1:postag:.'
0.951026 Gtype    b'-1:lemma:harbor'
0.950787 O        b'-1:lemma:0.35'
0.949588 O        b'+2:postag:VB'
0.947587 O        b'-1:lemma:pq'
0.946142 O        b'+2:postag:NNP'
0.944045 O        b'lemma:Fur'
0.940246 O        b'-1:lemma:Aerobic'
0.940003 OD       b'-1:postag:IN'
0.933681 Med      b'-1:lemma:glucose'
0.931279 Gtype    b'-2:lemma:dna'
0.930243 O        b'postag:-RRB-'
0.929999 OD       b'lemma:of'
0.928198 O        b'lemma:-lrb-'
0.912988 Strain   b'+2:lemma:.'
0.912988 Strain   b'+2:postag:.'
0.906407 Gtype    b'lemma:crp'
0.903304 Gtype    b'-2:lemma:the'
0.903217 O        b'+1:postag:VBZ'
0.899651 Gtype    b'lemma:the'
0.899407 Phase    b'lemma:pahse'
0.898338 Supp     b'+2:lemma:be'
0.898301 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.897275 Supp     b'-1:lemma:0.2'
0.894791 Technique b'-2:postag:NNP'
0.891806 OD       b'postag:IN'
0.891684 O        b'lemma:s'
0.891684 O        b'-2:lemma:parameter'
0.884913 OD       b'+1:lemma:-rrb-'
0.881788 O        b'+1:lemma:nacl'
0.878533 Med      b'-1:lemma:fresh'
0.875966 Supp     b'-1:lemma::'
0.875385 Air      b'-2:postag:SYM'
0.872201 OD       b'+1:postag:-RRB-'
0.867679 Gversion b'postag:NN'
0.865493 Supp     b'lemma:tryptophan'
0.865493 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
0.864714 OD       b'+2:lemma:~'
0.858579 O        b'lemma:to'
0.858579 O        b'postag:TO'
0.858299 pH       b'-2:lemma:glucose'
0.856722 Gtype    b'postag:-RRB-'
0.852791 Supp     b'lemma:7.6'
0.852791 Supp     b'+1:lemma:;'
0.851047 O        b'+1:postag:NN'
0.844299 O        b'+2:lemma:='
0.840317 Gversion b'+1:postag:CD'
0.838590 Gversion b'postag:CD'
0.838109 Med      b'-1:lemma:LB'
0.838109 Med      b'+2:lemma:1mm'
0.830747 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.828889 Supp     b'-2:lemma:condition'
0.817605 Supp     b'-1:postag:IN'
0.817082 Gtype    b'postag:NN'
0.806049 O        b'-1:postag:NN'
0.806049 Supp     b'-1:lemma:1m'
0.806049 Supp     b'+2:lemma:7.6'
0.805112 Technique b'+1:lemma:gadx'
0.800796 OD       b'-1:lemma:~'
0.800435 Air      b'+2:lemma:co2'
0.791121 Temp     b'-2:postag:VBD'
0.789942 Supp     b'lemma:of'
0.787024 Supp     b'+2:lemma:leucine'
0.786112 Supp     b'-1:lemma:sodium'
0.786112 Supp     b'+2:lemma:1/100'


Top negative:
0.027343 Supp     b'+2:lemma:b'
0.026569 O        b'-1:lemma:m63'
0.026523 Supp     b'-2:lemma:Fe'
0.025046 O        b'-1:lemma:chip-exo'
0.024334 Agit     b'+1:postag:-RRB-'
0.024282 O        b'-2:lemma:treat'
0.023243 O        b'-2:lemma:to'
0.023243 O        b'-2:postag:TO'
0.023010 Gtype    b'-2:lemma:Fur'
0.023009 O        b'+2:lemma:with'
0.022452 O        b'+2:lemma:a'
0.021290 Air      b'-1:lemma:95'
0.020983 Phase    b'+1:postag:IN'
0.020921 Med      b'-2:lemma:50'
0.020600 O        b'-2:lemma:m9'
0.020305 Med      b'+2:lemma:2'
0.020279 Temp     b'lemma:-lrb-'
0.019799 O        b'-2:lemma:culture'
0.019666 O        b'-1:lemma:induce'
0.018834 O        b'+1:postag:SYM'
0.018724 O        b'-1:lemma:;'
0.018724 O        b'-2:lemma:7.6'
0.017902 Phase    b'+1:lemma:aerobically'
0.017888 O        b'lemma:10'
0.017674 Supp     b'+1:lemma:leucine'
0.015355 O        b'lemma:k-12'
0.014044 O        b'lemma:1/100'
0.014044 O        b'+1:lemma:vol'
0.013406 Gtype    b'-2:postag:-RRB-'
0.013187 O        b'+1:lemma:or'
0.013098 O        b'+1:lemma:o2'
0.012749 Phase    b'-1:postag:DT'
0.012486 O        b'+1:postag:NNS'
0.012479 O        b'-2:lemma:.2'
0.011431 O        b'-1:lemma:in'
0.011307 O        b'-1:lemma:-'
0.011091 O        b'lemma:delta'
0.010934 O        b'+1:lemma:70'
0.010915 Air      b'lemma:70'
0.010582 O        b'-2:lemma:70'
0.010321 O        b'+1:lemma:co2'
0.010259 Gtype    b'-2:lemma:ecolus'
0.009931 O        b'+1:lemma:7.6'
0.009931 O        b'-2:lemma:1m'
0.009931 O        b'+2:lemma:;'
0.009846 Supp     b'-2:lemma:;'
0.009439 O        b'-2:lemma:0.2'
0.009289 O        b'+1:lemma:culture'
0.008987 Gtype    b'-1:lemma:the'
0.008717 O        b'-2:lemma:mm'
0.008569 O        b'+2:lemma:TEX'
0.008442 Supp     b'-1:lemma:contain'
0.008411 Technique b'-2:postag:CD'
0.007784 Technique b'-1:lemma:-lrb-'
0.007457 Technique b'-1:postag:-LRB-'
0.006611 O        b'-2:postag:RB'
0.006402 Supp     b'-2:lemma:the'
0.005443 Gtype    b'lemma:WT'
0.005377 OD       b'+2:postag:DT'
0.005141 Supp     b'+2:postag:NN'
0.005137 Phase    b'+2:lemma:at'
0.005085 Phase    b'+1:postag:RB'
0.004888 O        b'-1:lemma:70'
0.004813 Temp     b'+2:postag:CC'
0.004366 Technique b'+1:postag:NN'
0.004353 Supp     b'+1:lemma:hour'
0.003603 O        b'-2:lemma:2.5'
0.003137 OD       b'+2:lemma:a'
0.002916 O        b'lemma:mm'
0.002828 O        b'+2:lemma:0.4'
0.002445 O        b'-1:lemma:%'
0.002438 O        b'lemma:um'
0.002438 O        b'+2:lemma:paraquat'
0.002392 Supp     b'postag:VBN'
0.002380 O        b'-1:lemma:to'
0.002380 O        b'-1:postag:TO'
0.002346 Supp     b'+1:postag:NNS'
0.002272 O        b'lemma:genbank'
0.002262 O        b'-1:lemma:after'
0.002080 O        b'lemma:induction'
0.001740 Air      b'+2:postag:JJ'
0.001734 O        b'-2:lemma:use'
0.001730 Technique b'-1:postag:CD'
0.001674 O        b'-2:lemma:Wild'
0.001470 Gtype    b'+1:lemma:cra'
0.001391 O        b'+1:lemma:um'
0.001257 O        b'lemma:vol'
0.001257 O        b'-1:lemma:1/100'
0.001135 O        b'-1:postag:FW'
0.000924 Supp     b'lemma:.'
0.000924 Supp     b'postag:.'
0.000910 Gtype    b'postag::'
0.000898 Gtype    b'-2:lemma:small'
0.000770 Anti     b'-1:lemma:fnr'
0.000725 O        b'+2:lemma:wash'
0.000680 O        b'lemma:min'
0.000586 O        b'lemma:short'
0.000586 O        b'+1:lemma:rnase'
0.000566 Supp     b'-2:postag:NNP'
0.000466 Gtype    b'+2:lemma:chipseq'
0.000434 O        b'+1:lemma:.'
0.000434 O        b'+1:postag:.'
0.000394 Air      b'-1:lemma:fur'
0.000381 Anti     b'-1:postag:JJ'
0.000349 Agit     b'-2:lemma:-lrb-'
0.000344 Anti     b'-1:postag::'
0.000341 Agit     b'-2:postag:-LRB-'
0.000312 OD       b'+2:lemma:about'
0.000303 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.000287 Gtype    b'+2:lemma:rna'
0.000252 OD       b'+2:lemma:,'
0.000252 OD       b'+2:postag:,'
0.000241 O        b'+2:lemma:Cold'
0.000169 O        b'-2:lemma:continue'
0.000168 OD       b'postag:JJ'
0.000166 O        b'+1:lemma:min'
0.000150 Anti     b'lemma:mab'
0.000150 Anti     b'-1:lemma:anti-flag'
0.000139 Supp     b'+2:lemma:mm'
0.000135 OD       b'+2:postag:IN'
0.000092 Supp     b'-2:postag:NNS'
0.000047 OD       b'+2:lemma:-rrb-'
0.000046 OD       b'+2:postag:-RRB-'
0.000045 Med      b'-1:lemma:-rrb-'
0.000045 Med      b'-1:postag:-RRB-'
0.000039 O        b'lemma:build'
0.000039 O        b'-2:lemma:Genome'
0.000031 Gversion b'+1:lemma:_'
0.000030 OD       b'-1:lemma:about'
0.000019 Med      b'+2:lemma:medium'
0.000014 Supp     b'lemma:10'
0.000012 Supp     b'lemma:0.3'
0.000007 Gtype    b'+2:postag:NNP'
0.000007 Gtype    b'-2:lemma:factor'
0.000006 Technique b'lemma:ChIPSeq'
0.000005 O        b'-1:lemma:20'
0.000004 OD       b'+1:lemma:about'
0.000002 O        b'+1:lemma:buffer'
0.000001 Supp     b'+1:lemma:nitrate'
0.000001 Supp     b'lemma:potassium'
0.000001 Supp     b'-1:lemma:mmol'
0.000001 OD       b'lemma:0.15'
0.000000 Temp     b'lemma:30'
0.000000 O        b'lemma:glycine'
-0.000001 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.000005 O        b'-2:lemma:fnr'
-0.000010 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.000010 Gtype    b'+2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.000012 O        b'lemma:sample'
-0.000014 O        b'-2:lemma:;'
-0.000032 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.000047 Supp     b'+1:lemma:um'
-0.000053 O        b'lemma:lb'
-0.000058 O        b'-1:lemma:37'
-0.000087 Supp     b'lemma:250'
-0.000106 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.000125 OD       b'+2:postag:NN'
-0.000171 O        b'+2:lemma:final'
-0.000172 O        b'+2:lemma:0.3'
-0.000180 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.000371 Technique b'+2:postag:CD'
-0.000625 Med      b'postag:CD'
-0.000646 O        b'+2:lemma:od600'
-0.000756 O        b'-2:lemma:2'
-0.000906 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.001274 Med      b'+2:lemma:glucose'
-0.001428 Supp     b'-2:lemma:of'
-0.001438 Supp     b'lemma:um'
-0.001438 Supp     b'+2:lemma:paraquat'
-0.001736 Technique b'-1:postag::'
-0.001867 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.002172 O        b'+2:lemma:at'
-0.002623 Supp     b'postag:-RRB-'
-0.003218 O        b'+1:lemma:hour'
-0.003236 O        b'+2:lemma:medium'
-0.003491 O        b'+2:lemma:and'
-0.003643 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.004092 Supp     b'-1:lemma:the'
-0.004229 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.004399 Supp     b'lemma:vol'
-0.004399 Supp     b'-1:lemma:1/100'
-0.005369 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.005463 Supp     b'+2:lemma:final'
-0.006044 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.006570 O        b'lemma:phosphate'
-0.007197 O        b'-2:lemma:ph'
-0.007525 O        b'-1:postag:DT'
-0.007942 O        b'+2:lemma:the'
-0.007968 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.008043 O        b'+2:lemma:supplement'
-0.008273 O        b'-1:lemma:contain'
-0.009617 Phase    b'+2:postag:NN'
-0.010393 Air      b'-1:lemma:aerobically'
-0.011420 O        b'-2:postag:DT'
-0.012405 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.012405 Supp     b'-1:postag:.'
-0.012826 O        b'+2:lemma:5'
-0.013218 OD       b'-1:postag:NN'
-0.013736 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.013813 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.014066 Supp     b'+1:lemma:final'
-0.015050 Air      b'-2:lemma:aerobically'
-0.015296 Med      b'-2:postag:IN'
-0.015323 OD       b'-1:lemma:to'
-0.015323 OD       b'-1:postag:TO'
-0.015465 O        b'lemma:ph'
-0.015872 OD       b'lemma:~'
-0.017815 OD       b'+2:lemma:for'
-0.017899 O        b'+1:lemma:b'
-0.018546 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.019460 Air      b'+1:postag:-RRB-'
-0.019983 O        b'+1:lemma:phase'
-0.020328 Supp     b'postag::'
-0.021091 O        b'lemma:methanol'
-0.021091 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.021398 O        b'+1:lemma:95'
-0.021950 Air      b'-2:postag:CC'
-0.022439 Air      b'-2:postag:VBD'
-0.025030 O        b'-1:lemma:at'
-0.025223 Air      b'-1:postag:CC'
-0.027392 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.028212 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.029734 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.030622 O        b'lemma:o2'
-0.030743 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.031227 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.031814 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.033389 O        b'+1:lemma:10'
-0.033441 O        b'+1:lemma:of'
-0.033566 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.034135 OD       b'-2:postag:DT'
-0.037390 O        b'+1:lemma:ph'
-0.039456 O        b'+2:lemma:media'
-0.040004 O        b'lemma:n2'
-0.040159 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.040223 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.041367 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.041436 Air      b'postag:-RRB-'
-0.042118 Supp     b'lemma:2'
-0.042257 O        b'-1:lemma:harbor'
-0.042293 Air      b'lemma:-rrb-'
-0.043220 O        b'lemma:m63'
-0.043493 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.043986 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.045444 Air      b'+2:lemma:,'
-0.045444 Air      b'+2:postag:,'
-0.046614 Med      b'-1:postag:IN'
-0.046825 Supp     b'-2:lemma:,'
-0.046825 Supp     b'-2:postag:,'
-0.047104 O        b'-1:lemma:with'
-0.048601 OD       b'postag:NN'
-0.050624 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.051866 Air      b'lemma:,'
-0.051866 Air      b'postag:,'
-0.051998 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.052584 Air      b'+1:lemma:-rrb-'
-0.053083 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.053621 Air      b'+2:postag:-RRB-'
-0.054931 Supp     b'lemma:,'
-0.054931 Supp     b'postag:,'
-0.055898 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.057453 OD       b'-2:postag:VBN'
-0.057625 O        b'+1:lemma:contain'
-0.061265 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.064342 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.067036 O        b'+2:lemma:total'
-0.068737 Phase    b'-1:postag:NN'
-0.070940 O        b'-1:postag:VBG'
-0.071997 Supp     b'-2:lemma:with'
-0.072230 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.075733 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.077021 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.078084 O        b'-1:lemma:n2'
-0.079961 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.080240 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.080658 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.083058 O        b'+1:lemma:%'
-0.085553 O        b'+1:lemma:5'
-0.086830 O        b'-2:lemma:at'
-0.087364 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.087364 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.087364 O        b'+2:lemma:vol'
-0.087718 Gtype    b'postag:VBG'
-0.089384 O        b'+2:lemma:m9'
-0.090070 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.091989 O        b'+1:lemma:0.3'
-0.092402 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.093735 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.093849 O        b'+1:lemma:n2'
-0.096258 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.097916 O        b'-2:lemma:cell'
-0.097990 Air      b'+2:lemma:-rrb-'
-0.099655 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.100175 Supp     b'+2:postag:NNS'
-0.100247 O        b'lemma:150'
-0.100247 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.100247 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.102679 O        b'-1:lemma:m9'
-0.105325 O        b'lemma:nacl'
-0.105343 Air      b'+2:lemma:70'
-0.105983 O        b'-1:lemma:of'
-0.106786 Air      b'-2:lemma:be'
-0.108939 O        b'+1:lemma:glucose'
-0.109537 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.115133 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.115479 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.118791 O        b'+1:lemma:medium'
-0.120033 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.120211 Supp     b'+1:postag:JJ'
-0.120633 O        b'-2:lemma:10'
-0.122153 Supp     b'postag:IN'
-0.123187 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.129637 O        b'lemma:anaerobic'
-0.130588 O        b'+1:postag:CD'
-0.131139 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.132327 O        b'+1:lemma:media'
-0.133705 O        b'+1:lemma:for'
-0.134994 OD       b'-2:lemma:a'
-0.136424 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.140943 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.142127 O        b'lemma:37'
-0.144979 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.145801 O        b'+2:postag:RB'
-0.146831 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.150300 O        b'lemma:m9'
-0.150834 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.156050 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.156569 O        b'-1:lemma:od600'
-0.157210 O        b'+2:lemma:n2'
-0.158883 Air      b'+2:lemma:or'
-0.162489 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.169357 Gtype    b'-2:postag:CD'
-0.173551 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.174482 O        b'+1:lemma:_'
-0.174961 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.176835 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.180049 O        b'-2:postag::'
-0.184203 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.185571 O        b'+1:lemma:~'
-0.188399 O        b'-2:lemma:-rrb-'
-0.191681 pH       b'postag:NN'
-0.195120 O        b'+2:lemma:ph'
-0.196905 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.202382 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.205399 O        b'+2:lemma:co2'
-0.211036 O        b'+2:lemma:in'
-0.212453 O        b'lemma:;'
-0.212453 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.213534 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.217019 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.217895 O        b'+1:lemma:a'
-0.220197 O        b'+1:lemma:mm'
-0.221245 O        b'-2:lemma:20'
-0.222154 Supp     b'+2:postag::'
-0.226959 O        b'lemma:7.6'
-0.226959 O        b'+1:lemma:;'
-0.227173 O        b'lemma:20'
-0.231173 Supp     b'-2:lemma:0.2'
-0.234756 O        b'-2:lemma:grow'
-0.238500 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.240063 OD       b'+2:postag:RB'
-0.244565 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.246457 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.252459 O        b'+2:lemma:10'
-0.252688 O        b'lemma:fecl2'
-0.255615 O        b'lemma:co2'
-0.261347 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.261667 O        b'+1:lemma:m'
-0.262125 O        b'lemma:1m'
-0.266716 O        b'postag:RB'
-0.279248 O        b'-2:lemma:glucose'
-0.284922 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.285147 O        b'lemma:dissolve'
-0.285147 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.288492 O        b'-1:lemma:~'
-0.289780 Supp     b'+1:postag::'
-0.292497 O        b'+2:lemma:~'
-0.292599 O        b'+1:lemma:until'
-0.297574 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.298454 O        b'+2:lemma:genome'
-0.299532 O        b'-2:lemma:o2'
-0.311251 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.312110 O        b'lemma:of'
-0.312825 O        b'-1:lemma:mm'
-0.313523 O        b'lemma:nitrate'
-0.314922 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.314922 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.315521 O        b'-1:lemma:until'
-0.315621 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.317949 O        b'-1:lemma:IP'
-0.322526 O        b'lemma:medium'
-0.332998 O        b'lemma:od600'
-0.334178 O        b'+1:postag:IN'
-0.338873 O        b'-1:lemma:1m'
-0.338873 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.340477 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.350226 O        b'-1:lemma:.'
-0.350226 O        b'-1:postag:.'
-0.363247 O        b'lemma:pahse'
-0.363600 O        b'-1:lemma:final'
-0.374191 O        b'-1:lemma:the'
-0.374241 O        b'lemma:glucose'
-0.394101 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.409639 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.410814 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.412351 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.416971 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.421463 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.449349 O        b'-2:lemma:of'
-0.462184 Med      b'-1:postag:NN'
-0.468545 Med      b'+1:postag:NN'
-0.473496 O        b'+2:lemma:.'
-0.473496 O        b'+2:postag:.'
-0.474910 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.486750 O        b'-2:lemma:genome'
-0.497275 O        b'-1:postag:IN'
-0.503138 O        b'-2:lemma:IP'
-0.528883 Air      b'+2:postag:IN'
-0.539009 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.545687 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.545687 Supp     b'+1:postag:,'
-0.568957 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.593212 O        b'+1:lemma:1m'
-0.593212 O        b'-2:lemma:vol'
-0.597590 O        b'+1:lemma:+'
-0.599354 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.603974 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.604069 O        b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.628653 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.633314 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.635154 O        b'lemma:aerobic'
-0.636040 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.645418 O        b'+2:lemma:tag'
-0.647957 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.648620 Temp     b'postag:NN'
-0.675177 O        b'-1:lemma:vol'
-0.675177 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.675177 O        b'+2:lemma:1m'
-0.676552 O        b'+2:lemma:add'
-0.682008 Med      b'-2:lemma:grow'
-0.682135 O        b'lemma:minimal'
-0.688502 O        b'lemma:0.1'
-0.696332 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.700781 O        b'-2:lemma::'
-0.720533 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.721753 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.729211 O        b'-2:lemma:until'
-0.744102 Air      b'postag:NN'
-0.747837 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.753222 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.758537 O        b'+1:postag:DT'
-0.763381 Supp     b'-1:postag:NNP'
-0.765616 O        b'lemma:nh4cl'
-0.772606 O        b'-2:lemma:media'
-0.802888 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.805282 O        b'-1:lemma:ph'
-0.816589 O        b'-1:postag::'
-0.817002 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.853957 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.865307 O        b'-2:postag:VBG'
-0.885084 O        b'lemma:0.2'
-0.937083 Anti     b'postag:NNP'
-0.980157 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.985943 O        b'lemma:rifampicin'
-1.049780 O        b'-1:lemma:30'
-1.053620 O        b'+1:lemma:at'
-1.055685 O        b'+1:lemma:g/l'
-1.070601 O        b'+2:lemma:+'
-1.072912 O        b'-1:lemma:ml'
-1.094102 O        b'+1:lemma:in'
-1.101793 OD       b'+1:postag:NN'
-1.116046 O        b'lemma:30'
-1.123838 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.157127 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.167377 O        b'lemma:wt'
-1.170205 O        b'-2:lemma:the'
-1.323444 O        b'lemma:mid-log'
-1.359946 O        b'-2:lemma:aerobically'
-1.435169 O        b'lemma:media'
-1.447264 O        b'-1:lemma:co2'
-1.450077 O        b'-2:postag:SYM'
-1.634677 Supp     b'postag:JJ'
-1.650408 O        b'-1:lemma:1'
-1.936344 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.938922 O        b'-2:lemma:0.3'
-2.038898 O        b'-1:lemma:sample'
-2.054502 Supp     b'+2:lemma:1'
-2.066191 Supp     b'+2:lemma:2'
-2.073937 O        b'+2:lemma:b'
-2.272243 O        b'lemma:aerobically'
-2.344432 O        b'lemma:0.3'
-2.754426 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-2.804220 O        b'+2:lemma:iptg'
-3.038041 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-3.073897 O        b'+1:lemma:2'
-3.128125 O        b'-1:lemma:2'
-3.469606 O        b'+1:lemma:1'
-3.804597 Phase    b'postag:JJ'
-4.488134 O        b'-1:lemma::'
-5.757935 O        b'-1:lemma:_'