report_Run14_v12.txt
36.8 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.26150615938542243, 'c2': 0.03027455131788803}
best CV score:0.8529397672009222
model size: 0.08M
Flat F1: 0.81840861471915
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.857 0.923 21
Air 0.590 0.557 0.573 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.899 0.795 0.844 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.870 0.838 0.854 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.856 0.787 0.818 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.851219
OD -> OD 5.262478
Med -> Med 5.185420
Anti -> Anti 5.156619
Supp -> Supp 4.871843
Air -> Air 4.359134
Gversion -> Gversion 4.351135
Gtype -> Gtype 4.108829
Phase -> Phase 3.991678
pH -> pH 3.764078
Technique -> Technique 3.695614
O -> O 2.683649
Agit -> Agit 2.499079
Substrain -> Gtype 1.812258
Technique -> Air 1.440183
Air -> O 0.574295
O -> Technique 0.533396
O -> Supp 0.314416
Supp -> O 0.270768
Gtype -> Supp 0.199083
O -> Gtype 0.164544
Med -> O 0.134157
Temp -> O 0.113880
O -> Anti -0.000714
O -> Med -0.001903
Phase -> O -0.008028
OD -> Air -0.010011
Gtype -> Med -0.027089
O -> OD -0.088974
OD -> O -0.095624
Technique -> O -0.217007
Gtype -> Temp -0.333287
Technique -> pH -0.727325
Med -> Supp -0.930662
O -> Air -0.936428
Substrain -> O -1.030149
Gtype -> O -1.358102
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.851219
OD -> OD 5.262478
Med -> Med 5.185420
Anti -> Anti 5.156619
Supp -> Supp 4.871843
Air -> Air 4.359134
Gversion -> Gversion 4.351135
Gtype -> Gtype 4.108829
Phase -> Phase 3.991678
pH -> pH 3.764078
Technique -> Technique 3.695614
O -> O 2.683649
Agit -> Agit 2.499079
Substrain -> Gtype 1.812258
Technique -> Air 1.440183
Air -> O 0.574295
O -> Technique 0.533396
O -> Supp 0.314416
Supp -> O 0.270768
Gtype -> Supp 0.199083
O -> Gtype 0.164544
Med -> O 0.134157
Temp -> O 0.113880
O -> Anti -0.000714
O -> Med -0.001903
Phase -> O -0.008028
OD -> Air -0.010011
Gtype -> Med -0.027089
O -> OD -0.088974
OD -> O -0.095624
Technique -> O -0.217007
Gtype -> Temp -0.333287
Technique -> pH -0.727325
Med -> Supp -0.930662
O -> Air -0.936428
Substrain -> O -1.030149
Gtype -> O -1.358102
Top positive:
5.751215 O b'lemma:_'
5.746754 Anti b'-2:lemma:antibody'
5.515625 Gtype b'lemma:type'
5.189280 O b'lemma:1'
5.136348 Air b'lemma:anaerobic'
5.064437 O b'-2:lemma:_'
4.994799 Gtype b'lemma:wt'
4.680063 Gtype b'hGreek'
4.569055 O b'lemma:2'
4.523464 Technique b'lemma:chipseq'
4.319988 Supp b'lemma:no3'
4.136724 Gtype b'+1:lemma:type'
3.970493 Supp b'lemma:pq'
3.930290 Strain b'lemma:k-12'
3.918648 O b'lemma:-'
3.918452 O b'lemma:3'
3.825013 Phase b'lemma:mid-log'
3.727272 Phase b'-2:lemma:phase'
3.558296 Med b'lemma:MOPS'
3.519419 Supp b'lemma:Iron'
3.519419 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.388708 Air b'lemma:aerobic'
3.359985 O b'lemma:b'
3.346878 Supp b'lemma:nh4cl'
3.326300 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
3.283776 O b'postag::'
3.254811 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.157492 Supp b'lemma:2h'
3.157492 Supp b'-1:lemma:additional'
3.154479 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.114892 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.023191 O b'lemma:.'
3.023191 O b'postag:.'
2.959336 Supp b'-2:lemma:shake'
2.930906 O b'lemma:rpob'
2.831223 O b'postag:VBG'
2.824658 Supp b'lemma:nacl'
2.814947 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.786121 Air b'-1:lemma:-'
2.732634 O b'lemma:with'
2.668254 Supp b'lemma:Adenine'
2.632238 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.627066 O b'postag:IN'
2.615166 Air b'-2:lemma:IP'
2.613314 Med b'lemma:LB'
2.611369 Gtype b'-2:lemma:genotype'
2.597643 Med b'lemma:lb'
2.571335 Gtype b'lemma:dfnr'
2.554220 Med b'lemma:media'
2.548691 O b'-1:postag:NNS'
2.540852 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.525275 Gtype b'lemma:pk4854'
2.524894 O b'lemma:Cra'
2.518847 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.498738 Supp b'lemma:iptg'
2.489135 Gtype b'-1:ner:GEN'
2.475532 Substrain b'lemma:mg1655'
2.468214 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.434573 O b'lemma:a'
2.425485 Supp b'+1:lemma:1'
2.380526 pH b'lemma:ph5'
2.380526 pH b'+1:lemma:.5'
2.323102 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.320034 Supp b'-1:lemma:+'
2.299012 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.254177 O b'-1:lemma:tag'
2.249873 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.223365 Technique b'+2:lemma:ph5'
2.212100 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
2.204500 pH b'+1:postag:CD'
2.180715 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
2.179980 Supp b'-1:lemma:with'
2.174037 Air b'-1:lemma:co2'
2.168851 Air b'postag:RB'
2.138787 Air b'lemma:aerobically'
2.133066 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.129416 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.113778 Med b'lemma:m63'
2.110846 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.110846 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.103855 O b'lemma:genotype/variation'
2.099527 O b'-1:lemma:0.3'
2.088978 Supp b'-2:lemma:media'
2.082862 Supp b'+1:lemma:2'
2.077075 O b'+1:lemma:wt'
2.048571 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.033796 Med b'+2:postag:CC'
2.019964 O b'-1:lemma:type'
2.013731 O b'-2:lemma:flagtag'
2.012122 O b'-1:lemma:lb'
2.011892 Temp b'-1:lemma:37'
2.010160 O b'lemma:rep2'
2.010160 O b'lemma:rep1'
2.009106 Supp b'lemma:fructose'
1.996340 Temp b'-1:lemma:sample'
1.995346 Technique b'lemma:ChIP-exo'
1.992135 Technique b'hUpper'
1.969319 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.967594 O b'-1:lemma:glucose'
1.955547 O b'lemma:CEL'
1.955199 O b'-2:lemma:myc'
1.924528 Med b'+2:lemma:b2'
1.916868 Phase b'postag:NN'
1.916101 Med b'lemma:minimal'
1.913068 Air b'lemma:anaeroibc'
1.905345 Gtype b'+1:postag::'
1.902791 O b'+1:lemma:coli'
1.899410 O b'+2:lemma:crp'
1.897739 O b'+1:lemma:pq'
1.896288 Technique b'-2:lemma:wt'
1.887679 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
1.877877 O b'lemma:\xcf\x8332'
1.789575 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.771760 OD b'lemma:od600'
1.760355 O b'lemma:harbor'
1.742145 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.734060 O b'postag:CC'
1.720857 Temp b'lemma:37'
1.713202 Technique b'-1:lemma:_'
1.711657 Agit b'lemma:rpm'
1.690307 Agit b'-1:lemma:250'
1.673683 Med b'-1:lemma:minimal'
1.670938 Air b'postag:JJ'
1.648365 Supp b'-2:lemma:for'
1.638096 Supp b'lemma:acetate'
1.619529 Temp b'lemma:43'
1.598864 O b'postag:VBN'
1.597990 Vess b'lemma:flask'
1.597990 Vess b'-1:lemma:warm'
1.597990 Vess b'-2:lemma:pre'
1.597990 Vess b'+2:lemma:43'
1.597286 Air b'+2:postag:CD'
1.550987 Supp b'lemma:Leu'
1.550987 Supp b'-2:lemma:Lrp'
1.538433 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.531479 Supp b'-2:postag:VBG'
1.531103 O b'+1:lemma:od600'
1.521458 O b'-1:lemma:pq'
1.507459 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.503826 O b'-1:lemma:mg1655'
1.503334 O b'lemma::'
1.497150 Med b'lemma:medium'
1.488341 Supp b'lemma:arginine'
1.487779 O b'lemma:culture'
1.474476 Supp b'+1:lemma:_'
1.459034 O b'-1:lemma:min'
1.451669 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.442945 Gversion b'lemma:u00096'
1.442945 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.441760 OD b'-1:postag:IN'
1.441239 Supp b'+2:lemma:feso4'
1.436630 Gversion b'lemma:.2'
1.436630 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.431847 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.431594 Med b'-2:postag:JJ'
1.428148 O b'postag:-RRB-'
1.425694 O b'+1:postag:RB'
1.420166 Technique b'hLower'
1.411182 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.406567 Technique b'-2:postag:NNP'
1.389801 O b'+1:lemma:0.2'
1.387977 O b'-1:lemma:wt'
1.386748 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
1.381948 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.379117 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.378811 Temp b'-1:lemma:43'
1.377562 Med b'+2:lemma:b1'
1.368495 Supp b'lemma:glucose'
1.367155 OD b'lemma:0.3'
1.361726 O b'-2:ner:MED'
1.345303 O b'symb'
1.331994 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.324500 O b'-2:lemma:medium'
1.323886 Supp b'-1:postag:CD'
1.309986 Gtype b'postag:JJ'
1.300618 O b'lemma:chip'
1.297682 O b'lemma:ompr'
1.287131 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.287131 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.286572 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.284096 O b'lemma:purr'
1.282939 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.282286 Gversion b'-2:lemma:build'
1.273933 Agit b'lemma:250'
1.264299 O b'-1:lemma:nacl'
1.264265 Med b'+1:lemma:minimal'
1.259991 O b'lemma:-lrb-'
1.248615 O b'-1:lemma:l1'
1.240978 O b'-1:lemma:-80'
1.218319 Med b'+1:lemma:0.4'
1.206210 O b'-1:lemma:aerobic'
1.198847 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.196064 Gtype b'+1:lemma:_'
1.188109 Supp b'-1:lemma:_'
1.187200 O b'-2:lemma:fructose'
1.184541 OD b'lemma:od450'
1.180029 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.177090 Air b'-2:lemma:fnr'
1.175354 Supp b'-2:lemma:20'
1.168675 Technique b'lemma:rnaseq'
1.154670 Med b'+1:lemma:g/l'
1.137719 O b'lemma:ml'
1.136522 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.131697 Technique b'lemma:rna-seq'
1.130850 O b'postag:-LRB-'
1.126934 Gversion b'-2:postag:VB'
1.118604 O b'-2:lemma:min'
1.112636 Technique b'-1:lemma:input'
1.112150 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
1.111806 Supp b'lemma:Fe'
1.107939 Gversion b'lemma:000913'
1.107939 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.104692 Supp b'-2:lemma:agent'
1.101427 O b'lemma:trpr'
1.100670 Med b'+2:lemma:+'
1.099971 Gversion b'lemma:nc'
1.099971 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.098783 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.097700 Air b'lemma:Anaerobic'
1.095428 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.093124 O b'-2:lemma:overnight'
1.092829 Substrain b'-1:lemma:.'
1.092829 Substrain b'-1:postag:.'
1.091995 Gtype b'hUpper'
1.089363 Supp b'+2:lemma:add'
1.089315 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.089315 Gtype b'-1:lemma:old'
1.089315 Gtype b'-2:lemma:seqa'
1.087991 Gtype b'lemma:ptac'
1.086713 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.082791 Gversion b'postag:NN'
1.080526 Med b'-2:lemma:minimal'
1.071289 O b'-1:lemma:nitrate'
1.063042 Supp b'lemma:dpd'
1.050973 Phase b'-2:lemma:until'
1.037535 O b'-2:lemma:='
1.036640 Supp b'-2:lemma:pahse'
1.036172 pH b'lemma:.5'
1.036172 pH b'-1:lemma:ph5'
1.031036 O b'lemma:-rrb-'
1.029510 OD b'+2:lemma:0.3'
1.025511 Supp b'-2:lemma:argr'
1.023240 OD b'+1:lemma:of'
1.022168 O b'lemma:,'
1.022168 O b'postag:,'
1.008923 O b'+1:postag:NNP'
1.007935 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.006589 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.006277 Gtype b'-1:lemma:_'
1.006021 O b'lemma:chip-arca'
1.006021 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.005139 OD b'lemma:of'
1.003687 Gtype b'+1:lemma:the'
1.001292 Agit b'+2:lemma:at'
1.000543 Vess b'+1:lemma:at'
0.999003 Air b'-2:lemma:%'
0.994539 Strain b'+1:lemma:substr'
0.994539 Strain b'-2:lemma:str'
0.984556 Gtype b'+1:lemma:pq'
0.977115 Gversion b'postag:CD'
0.969307 Supp b'lemma:glutamine'
0.969307 Supp b'-1:lemma:2g/l'
0.960352 Vess b'-1:postag:VBN'
0.959727 O b'+1:lemma::'
0.955098 Agit b'-2:postag:RB'
0.955087 Air b'-2:lemma:cm20'
0.951551 pH b'lemma:5.5'
0.947970 Air b'+1:lemma:%'
0.945025 O b'+1:lemma:250'
0.940086 Air b'+2:lemma:%'
0.930385 O b'lemma:chip-fnr'
0.930385 O b'+2:lemma:fnr8myc'
0.929362 Gtype b'lemma:nsrr'
0.929362 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
0.926955 O b'+2:postag:VBD'
0.926879 Substrain b'+2:lemma::'
0.926393 pH b'+1:lemma:5.5'
0.920582 Med b'+1:lemma:+'
0.920337 Gtype b'lemma:wild-type'
0.918742 O b'+1:postag:VBN'
0.916873 Supp b'lemma:rifampicin'
0.915162 O b'lemma:gadx'
0.912855 O b'lemma:input'
0.912855 O b'+1:lemma:chip-seq'
0.909743 Gtype b'hLower'
0.908210 O b'lemma:0.4'
0.907116 Supp b'-1:lemma:final'
0.905109 O b'lemma:for'
0.901995 O b'lemma:growth'
0.895113 O b'+1:ner:MED'
0.894791 Med b'+1:lemma:2.0'
0.892699 Gtype b'-2:postag:JJ'
0.891101 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
0.887670 Technique b'-1:lemma:IP'
0.887578 Supp b'+1:lemma:iptg'
0.883117 Technique b'-2:lemma:Fur'
0.877973 Gtype b'+1:lemma:control'
0.874633 Air b'lemma:%'
0.871131 Air b'-1:lemma:%'
0.869979 O b'+1:ner:SUPP'
0.866849 O b'lemma:argr'
0.863600 O b'+2:postag:JJ'
0.860491 O b'-1:lemma:acetate'
0.859915 Supp b'postag:NNP'
0.859626 Air b'-2:lemma:mid-log'
0.858808 Med b'-1:postag:JJ'
0.857267 O b'postag:DT'
0.856747 Supp b'lemma:20'
0.854495 Air b'-1:lemma:phase'
0.854119 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
0.850236 O b'-1:lemma:4'
0.846216 O b'+1:postag::'
0.845114 Supp b'-2:lemma:induce'
0.842460 Temp b'+2:postag:DT'
0.835646 O b'-2:lemma:od600'
0.835204 O b'-1:lemma:genotype/variation'
0.834537 Air b'-2:postag:CD'
0.827246 O b'+1:lemma:k-12'
0.827045 pH b'-1:postag:NN'
0.826820 Phase b'lemma:phase'
0.816229 pH b'lemma:ph'
0.813327 O b'+2:lemma:wt'
0.805229 Supp b'-1:lemma:vol'
0.805229 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.805229 Supp b'+2:lemma:1m'
0.801655 Temp b'-2:lemma:keep'
0.797305 Gtype b'+2:ner:SUPP'
0.792201 O b'+1:lemma:ph5'
0.792201 O b'+2:lemma:.5'
0.785038 O b'lemma:affyexp'
0.782843 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.782843 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.782567 Substrain b'+2:postag::'
0.781949 Temp b'-2:lemma:see'
0.781393 Supp b'lemma:0.2'
0.781112 O b'lemma:A'
0.780617 Gtype b'lemma:fnr8myc'
0.780617 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
0.777304 Supp b'+2:postag:-LRB-'
0.774743 O b'+2:lemma:_'
0.767743 Supp b'-1:lemma:ompr'
0.762362 Supp b'-1:postag:IN'
0.760991 Gtype b'-1:lemma:wild'
0.760537 Temp b'lemma:sample'
0.759668 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.759135 Supp b'+1:lemma:1m'
0.759135 Supp b'-2:lemma:vol'
0.757281 Med b'-1:lemma:glucose'
0.757082 O b'postag:VBD'
0.756863 Gtype b'lemma:the'
0.756525 O b'-1:lemma:media'
0.755743 O b'-1:lemma:antibody'
0.748840 O b'-2:ner:_'
0.748542 Anti b'hGreek'
0.738852 pH b'-1:lemma:ph'
0.730108 OD b'+1:postag:IN'
0.728605 Supp b'+2:lemma:A'
0.727744 O b'lemma:genotype'
0.725157 Gtype b'+1:lemma:with'
0.724209 O b'+1:lemma:43'
0.723242 Gtype b'-2:ner:_'
0.721818 Air b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.721664 Supp b'-1:lemma:mm'
0.721074 O b'+2:lemma:k-12'
0.720718 O b'lemma:soxr'
0.720718 O b'lemma:soxs'
0.714062 Phase b'+1:lemma:phase'
0.713848 Technique b'-1:lemma:1'
0.713627 Gtype b'+2:postag::'
0.713052 Gtype b'-1:lemma:ptac'
0.709662 O b'+1:lemma:20'
0.708505 Gtype b'+1:lemma::'
0.707976 Supp b'+1:lemma:Deficient'
0.707926 Supp b'+2:postag:IN'
0.707301 O b'+1:lemma:acetate'
0.705892 Med b'postag:NNP'
0.705818 pH b'-1:lemma:at'
0.703938 O b'hLower'
0.695590 Anti b'+2:postag:NNP'
0.689547 Supp b'-1:lemma:sodium'
0.689547 Supp b'+2:lemma:1/100'
0.688947 Supp b'-1:lemma:1m'
0.688947 Supp b'+2:lemma:7.6'
0.685794 Technique b'+2:postag:-RRB-'
0.685721 Med b'+2:lemma:with'
0.684837 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.683566 Technique b'lemma:chip-exo'
0.680893 Gtype b'lemma:wild'
0.680886 Strain b'-1:lemma:.'
0.680886 Strain b'-1:postag:.'
0.680796 Gtype b'-2:lemma:the'
0.680718 Air b'-1:postag:CD'
0.676635 Supp b'-2:lemma:10'
0.673394 Phase b'-1:lemma::'
0.673236 O b'-2:lemma:~'
0.672836 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.671581 Gversion b'+1:postag:CD'
0.669917 Vess b'-2:postag:JJ'
0.669187 O b'lemma:-80'
0.669187 O b'-2:lemma:freeze'
0.667634 Gtype b'+1:ner:GEN'
0.664459 Gtype b'-2:lemma:delta'
0.661437 O b'+2:ner:_'
0.660035 Air b'-2:postag:SYM'
0.658987 Supp b'symb'
0.657933 O b'-1:ner:_'
0.656894 Gtype b'-2:postag:NN'
0.655592 O b'-1:lemma:into'
0.654021 Supp b'+1:lemma:hour'
0.651846 Supp b'+2:lemma:be'
0.651136 OD b'+2:postag:CD'
0.650834 Supp b'+1:lemma:be'
0.648744 O b'lemma:additional'
0.648744 O b'+1:lemma:2h'
0.645892 Med b'+1:lemma:medium'
0.635263 Gtype b'+2:lemma:rep2'
0.635263 Gtype b'+2:lemma:rep1'
0.634634 OD b'postag:IN'
0.630392 Med b'+1:lemma:supplement'
0.628652 Supp b'lemma:30'
0.623567 OD b'-2:lemma:od450'
0.622821 Med b'-1:lemma:in'
0.622786 Supp b'+2:postag:VBD'
0.616633 O b'-1:lemma:genotype'
0.612867 Temp b'+1:lemma:and'
0.609947 O b'lemma:at'
0.609285 Med b'symb'
0.602721 Anti b'-1:lemma::'
0.600691 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
0.599568 Supp b'postag:NN'
0.592255 Gtype b'-1:postag:VBP'
0.590754 Strain b'+2:lemma:.'
0.590754 Strain b'+2:postag:.'
0.583525 Supp b'-1:lemma:,'
0.583525 Supp b'-1:postag:,'
0.583455 Gtype b'-2:lemma:dna'
0.576637 Gtype b'lemma:vector'
0.576501 Temp b'-2:postag:VB'
0.574934 OD b'+2:lemma:culture'
0.574874 Phase b'-1:lemma:until'
0.574559 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
0.573621 Temp b'-1:lemma:see'
0.572926 Med b'-1:lemma:ml'
0.572262 Med b'hUpper'
0.570880 Temp b'-2:postag:VBD'
0.569746 Supp b'-2:lemma:trpr'
0.567176 O b'+1:lemma:rifampicin'
0.556961 Supp b'-1:lemma:contain'
0.556453 O b'-2:lemma:250'
0.551689 Anti b'hLower'
0.548419 O b'+2:lemma:fructose'
0.547682 O b'lemma:~'
0.545826 Supp b'+1:lemma:mm'
0.545826 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
0.545154 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
0.544762 Temp b'+1:lemma:sample'
0.543101 Air b'+1:lemma:b'
0.542688 Supp b'+1:postag:VBD'
0.541198 Anti b'-2:ner:_'
0.540661 OD b'-1:lemma:od450'
0.539380 O b'lemma:s'
0.539380 O b'-2:lemma:parameter'
0.538026 Supp b'-1:postag:SYM'
0.536377 Gtype b'-2:postag:NNS'
0.535157 Air b'+2:lemma:37'
0.535077 Phase b'-2:lemma:to'
0.535077 Phase b'-2:postag:TO'
0.530387 O b'+1:lemma:mid-log'
0.527877 Temp b'+1:postag:JJ'
0.527778 O b'+2:lemma:of'
0.525807 Gtype b'+2:lemma::'
0.524506 Temp b'-1:postag:VB'
0.519870 OD b'+1:ner:_'
0.518748 O b'-2:lemma:in'
0.516564 OD b'-1:lemma:of'
0.515151 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
0.514350 Temp b'+1:ner:_'
0.513460 Air b'+1:lemma:until'
0.510245 Anti b'postag:JJ'
0.507690 Agit b'+2:postag:IN'
0.505589 Supp b'lemma:tryptophan'
0.505589 Supp b'-1:lemma:mg/l'
0.505120 Supp b'lemma:cm20'
0.505120 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
0.504734 Air b'-2:ner:_'
0.502277 pH b'+1:lemma:.'
0.502277 pH b'+1:postag:.'
0.499040 Air b'-2:lemma:0.3'
0.498616 Gtype b'+2:postag:NN'
0.498463 Med b'+2:lemma:then'
0.497999 Agit b'-2:lemma:-lrb-'
0.496552 O b'-2:lemma:no3'
0.496548 Air b'-1:postag::'
0.496130 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.493959 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.492449 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
0.490520 O b'postag:NNS'
0.486536 Med b'+1:postag:CD'
0.482537 O b'-2:postag:FW'
0.482166 Supp b'+1:lemma:anaerobically'
Top negative:
0.046371 O b'+2:lemma:mmol'
0.045921 O b'lemma:E.'
0.045398 Gtype b'-1:lemma:Wild'
0.044132 O b'-1:lemma:with'
0.043527 Temp b'+2:postag:NN'
0.043479 O b'+2:lemma:%'
0.043464 O b'-1:lemma:for'
0.042833 O b'-2:postag:NN'
0.042583 O b'-1:lemma:%'
0.042193 Air b'symb'
0.040600 Technique b'lemma:-rrb-'
0.040564 O b'+2:lemma:min'
0.038828 O b'+1:lemma:be'
0.038275 Phase b'+2:postag:VBN'
0.037677 O b'-2:lemma:n2'
0.037489 Supp b'+2:lemma:of'
0.037465 O b'+2:lemma:20'
0.037439 Supp b'+1:lemma:of'
0.037321 Phase b'+1:lemma:aerobically'
0.036627 O b'-2:postag:VBP'
0.036247 Air b'-1:ner:_'
0.035053 Air b'+1:postag:CD'
0.033084 O b'+1:lemma:genbank'
0.032416 Med b'+2:postag:CD'
0.029392 Supp b'-2:lemma:of'
0.028464 Supp b'+1:lemma:m'
0.028296 OD b'-1:postag:NN'
0.028223 Supp b'-2:ner:SUPP'
0.027764 O b'-2:lemma:5'
0.027701 Phase b'+1:postag:NNS'
0.027357 O b'lemma:or'
0.027272 Phase b'-1:lemma:the'
0.027136 O b'+2:ner:SUPP'
0.025834 Technique b'+1:lemma:Anaerobic'
0.025762 Phase b'+1:postag:RB'
0.024667 Gtype b'+2:postag:VBN'
0.024354 O b'-1:lemma:grow'
0.022278 O b'lemma:co2'
0.021883 Supp b'-2:postag:IN'
0.021502 Med b'-2:lemma:fresh'
0.020122 Supp b'lemma:final'
0.019127 Air b'postag:CD'
0.019066 Supp b'hUpper'
0.018833 O b'lemma:od600'
0.018324 Supp b'+1:lemma:%'
0.016438 O b'-2:lemma:strain'
0.015039 O b'-1:postag:CD'
0.015001 O b'+1:lemma:to'
0.015001 O b'+1:postag:TO'
0.014272 Supp b'-1:lemma:0.1'
0.013705 O b'lemma:mm'
0.013705 O b'-1:ner:KWSUPP'
0.013675 Air b'+1:lemma:and'
0.012493 OD b'-2:lemma:at'
0.011634 O b'-2:lemma:%'
0.010173 O b'-2:postag:JJ'
0.009426 pH b'-2:ner:SUPP'
0.009361 Supp b'-2:lemma:rpob'
0.009327 Gtype b'+2:lemma:tag'
0.009264 Supp b'lemma:0.3'
0.008832 Technique b'+1:postag:NNP'
0.008144 O b'lemma:2.0'
0.007693 Gtype b'lemma:delta-fnr'
0.006698 Air b'+2:lemma:Iron'
0.006667 Temp b'+1:lemma:short'
0.006576 Supp b'-1:lemma:iptg'
0.006134 Temp b'+2:lemma:in'
0.005450 Anti b'-1:lemma:polymerase'
0.005389 O b'+2:lemma:ml'
0.005205 Gtype b'+1:lemma:small'
0.004909 O b'-1:lemma:n2'
0.004906 O b'+2:postag:CC'
0.004888 O b'-2:lemma:.2'
0.004673 Gtype b'lemma:ryhb'
0.004404 Anti b'-2:lemma:rna'
0.004255 Supp b'+1:lemma:at'
0.004017 O b'-1:lemma:short'
0.003948 O b'lemma:5'
0.003917 Med b'-2:ner:SUPP'
0.003713 O b'-2:lemma:at'
0.003481 O b'-1:lemma:Iron'
0.003226 Air b'-2:lemma:nh4cl'
0.003113 Phase b'+2:postag:IN'
0.002582 Med b'-2:lemma:medium'
0.002519 O b'-2:lemma:use'
0.002488 O b'-1:lemma:in'
0.002178 O b'lemma:\xc2\xb0c'
0.001901 O b'-1:lemma:5'
0.001735 OD b'-1:lemma:to'
0.001735 OD b'-1:postag:TO'
0.001662 Gtype b'+1:lemma:ryhb'
0.001569 Gtype b'-2:lemma:of'
0.001559 Air b'-2:lemma:and'
0.001495 Agit b'+2:ner:_'
0.001467 Supp b'+1:postag:RB'
0.001447 Supp b'-1:postag::'
0.001406 Temp b'+2:lemma:short'
0.001403 Gtype b'-2:lemma:factor'
0.001077 Supp b'-2:postag:CC'
0.001026 Air b'+2:postag:NNP'
0.000818 Air b'+2:lemma:250'
0.000749 Supp b'+2:lemma:,'
0.000749 Supp b'+2:postag:,'
0.000739 Anti b'-1:postag:NN'
0.000651 O b'-2:postag:NNS'
0.000602 Med b'+1:postag:VBG'
0.000590 Gversion b'+2:ner:_'
0.000567 Agit b'-1:postag:CD'
0.000465 Gtype b'+2:lemma:mg1655'
0.000427 Gversion b'-1:ner:_'
0.000426 O b'-1:lemma:.5'
0.000426 O b'-2:lemma:ph5'
0.000420 Gversion b'+2:postag:NN'
0.000402 Technique b'-2:postag:JJ'
0.000338 OD b'+2:lemma:total'
0.000313 Phase b'-1:postag:NN'
0.000305 O b'-1:lemma:induce'
0.000287 Supp b'+1:lemma:and'
0.000279 O b'+1:lemma:anerobically'
0.000279 O b'-2:lemma:600nm'
0.000278 O b'+2:lemma:glucose'
0.000264 Air b'lemma:n2'
0.000244 O b'-1:lemma:at'
0.000223 O b'+1:lemma:for'
0.000222 pH b'-1:postag:IN'
0.000204 Strain b'postag:NN'
0.000202 O b'-2:lemma:m63'
0.000170 Air b'-2:postag:NNP'
0.000157 Supp b'lemma:in'
0.000155 O b'-2:lemma:Iron'
0.000148 O b'-2:lemma:Wild'
0.000128 Gtype b'-2:lemma:culture'
0.000124 Gtype b'+2:postag:NNP'
0.000109 Med b'+2:lemma:10'
0.000107 Med b'+1:postag:NNS'
0.000107 Supp b'+1:postag:CC'
0.000105 Med b'+1:lemma:contain'
0.000103 Air b'-1:postag:NNP'
0.000101 O b'-1:lemma:stpa'
0.000100 O b'+1:lemma:minute'
0.000081 O b'+2:lemma:rpm'
0.000074 Supp b'+1:lemma:7.6'
0.000074 Supp b'-2:lemma:1m'
0.000074 Supp b'+2:lemma:;'
0.000069 OD b'+1:lemma:0.3'
0.000064 Phase b'+2:lemma:30'
0.000053 Temp b'lemma:-rrb-'
0.000049 OD b'+2:lemma:,'
0.000049 OD b'+2:postag:,'
0.000046 O b'-1:lemma:2.5'
0.000045 Med b'+2:lemma:media'
0.000040 O b'+1:lemma:tritonx-100'
0.000015 Technique b'postag:-RRB-'
0.000011 O b'+2:postag:-LRB-'
0.000011 OD b'-2:lemma:-lrb-'
0.000011 OD b'-2:postag:-LRB-'
0.000010 O b'+2:lemma:-lrb-'
0.000009 Supp b'lemma:ph'
0.000007 O b'-2:lemma:mg/ml'
0.000006 OD b'-1:postag:JJ'
0.000006 O b'lemma:um'
0.000006 O b'+2:lemma:paraquat'
0.000002 Temp b'-1:postag:NN'
0.000001 Temp b'+1:postag:NN'
0.000001 O b'+2:lemma:4'
0.000001 Temp b'-2:lemma:grow'
0.000001 O b'lemma:IP'
0.000001 O b'+2:lemma:stop'
0.000001 Supp b'lemma:\xc2\xb5l'
0.000001 Supp b'+1:lemma:cm20'
-0.000000 Air b'+2:postag:RB'
-0.000005 O b'+1:lemma:7.6'
-0.000005 O b'-2:lemma:1m'
-0.000005 O b'+2:lemma:;'
-0.000007 O b'+2:lemma:media'
-0.000008 O b'lemma:7.6'
-0.000008 O b'+1:lemma:;'
-0.000012 O b'+1:lemma:95'
-0.000013 Supp b'-1:lemma:250'
-0.000014 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.000026 O b'+2:lemma:ph'
-0.000053 Med b'-1:lemma:m63'
-0.000053 O b'+2:lemma:reference'
-0.000064 Supp b'postag:NNS'
-0.000135 Med b'+1:postag:IN'
-0.000140 OD b'+2:postag:CC'
-0.000155 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.000196 O b'+2:postag::'
-0.000233 O b'+2:lemma:total'
-0.000302 O b'+1:lemma:contain'
-0.000323 O b'-2:lemma:10'
-0.000324 OD b'+2:postag:NN'
-0.000399 O b'+1:postag:NNS'
-0.000412 O b'lemma:anaerobic'
-0.000764 Air b'lemma:-lrb-'
-0.000764 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.000861 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.000889 Air b'hUpper'
-0.000994 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.001034 Med b'-2:postag:NN'
-0.001150 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.001322 Air b'+1:postag:NN'
-0.001420 OD b'-2:lemma:od600'
-0.001563 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.001661 O b'-2:lemma:mm'
-0.001661 O b'-2:ner:KWSUPP'
-0.001815 O b'-2:lemma:nh4cl'
-0.002128 Supp b'+1:postag:NNP'
-0.002218 Air b'+2:lemma:and'
-0.002425 Med b'-2:postag:VBN'
-0.002962 OD b'symb'
-0.003238 O b'+1:lemma:mm'
-0.003238 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.003398 Supp b'-1:lemma:%'
-0.003720 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.003814 O b'+2:lemma:tag'
-0.004050 O b'lemma:150'
-0.004050 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.004050 O b'-2:lemma:concentration'
-0.004877 O b'+1:lemma:ph'
-0.005010 Air b'postag:-LRB-'
-0.005049 Air b'-1:lemma:-lrb-'
-0.005463 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.005677 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.005771 Air b'+2:ner:_'
-0.005866 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.005866 Gtype b'-1:postag:,'
-0.006080 O b'+1:lemma:300'
-0.006504 Gtype b'postag::'
-0.006575 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.007875 O b'lemma:n2'
-0.008258 Supp b'-2:lemma:mm'
-0.008258 Supp b'-2:ner:KWSUPP'
-0.010019 Supp b'lemma:1'
-0.010051 Phase b'-2:postag:NN'
-0.010267 Air b'-1:postag:-LRB-'
-0.010947 O b'-1:lemma:iptg'
-0.011896 Supp b'postag:IN'
-0.012012 Gtype b'-1:postag::'
-0.013691 Air b'+2:postag:-RRB-'
-0.014767 Supp b'-1:postag:NN'
-0.020543 O b'+2:lemma:~'
-0.021003 Supp b'-1:lemma:10'
-0.021178 Med b'-1:postag:IN'
-0.022191 O b'-1:ner:MED'
-0.023424 Supp b'postag:CD'
-0.023576 O b'hUpper'
-0.023888 O b'lemma:dissolve'
-0.023888 O b'+2:lemma:methanol'
-0.025038 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.025660 Supp b'-2:postag:NNS'
-0.028205 O b'+1:lemma:_'
-0.028895 Supp b'hLower'
-0.033316 O b'lemma:1m'
-0.033557 Air b'+2:postag:IN'
-0.034109 Air b'-1:postag:VBN'
-0.034377 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.034993 Air b'+1:lemma:-rrb-'
-0.035357 Med b'-2:ner:MED'
-0.035645 Med b'+1:ner:MED'
-0.036073 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.037600 O b'-1:lemma:final'
-0.038935 O b'postag:NN'
-0.040158 Supp b'lemma:mm'
-0.040158 Supp b'-1:ner:KWSUPP'
-0.043752 O b'+2:postag:DT'
-0.044880 Technique b'-2:ner:_'
-0.045431 Air b'-1:postag:CC'
-0.045531 Air b'+1:postag:-RRB-'
-0.045934 Temp b'postag:NN'
-0.047756 O b'+1:lemma:.'
-0.047756 O b'+1:postag:.'
-0.049538 Supp b'+2:ner:_'
-0.051564 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.053068 Anti b'-1:ner:_'
-0.056901 O b'-2:lemma:1'
-0.059515 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.060946 Gtype b'-1:ner:_'
-0.061465 O b'lemma:methanol'
-0.061465 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.062569 O b'-2:lemma:0.1'
-0.065891 O b'+2:postag:IN'
-0.066622 Temp b'-2:postag:CD'
-0.067267 O b'-2:postag:DT'
-0.070220 O b'lemma:;'
-0.070220 O b'-1:lemma:7.6'
-0.070644 O b'-2:lemma:o2'
-0.073936 O b'-2:lemma:to'
-0.073936 O b'-2:postag:TO'
-0.077135 O b'-1:lemma:~'
-0.077319 pH b'+2:ner:_'
-0.078405 O b'+1:lemma:media'
-0.079539 O b'+2:lemma:sample'
-0.079982 O b'+1:lemma:~'
-0.081848 Supp b'+1:postag:CD'
-0.083468 O b'-1:lemma:.'
-0.083468 O b'-1:postag:.'
-0.086122 Air b'-2:postag:CC'
-0.088391 Anti b'+1:ner:_'
-0.091946 O b'-2:postag::'
-0.092353 O b'lemma:37'
-0.096366 Gtype b'postag:VBG'
-0.099413 Technique b'-2:postag:NN'
-0.101741 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.103928 O b'+1:lemma:sample'
-0.104784 O b'-1:ner:SUPP'
-0.108321 Gtype b'postag:NN'
-0.112957 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.114867 O b'+2:lemma:in'
-0.117150 O b'-1:lemma:g/l'
-0.118196 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.118789 O b'+1:lemma:5'
-0.118941 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.118970 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.119060 O b'-1:ner:GEN'
-0.119917 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.119917 O b'+1:lemma:methanol'
-0.120327 Phase b'+1:ner:_'
-0.122766 O b'-1:postag:DT'
-0.125711 O b'+1:lemma:of'
-0.126716 O b'lemma:ph'
-0.130686 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.132768 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.135402 O b'lemma:fecl2'
-0.136313 O b'-2:postag:SYM'
-0.139279 O b'-2:lemma:genome'
-0.141319 O b'-2:lemma:grow'
-0.143797 Supp b'-2:postag:NN'
-0.144039 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.144522 O b'+1:lemma:hour'
-0.145800 O b'-1:lemma:mm'
-0.148596 Phase b'postag:JJ'
-0.149456 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.149765 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.150050 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.153944 O b'-1:lemma:until'
-0.155255 Med b'-2:lemma:m9'
-0.155662 Phase b'+2:ner:_'
-0.160548 O b'+2:lemma:genome'
-0.161250 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.163241 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.164581 O b'-1:lemma:fresh'
-0.172562 OD b'-2:ner:_'
-0.175968 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.181806 Supp b'+2:lemma:and'
-0.182621 O b'+2:lemma:at'
-0.191659 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.199738 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.202770 O b'+1:lemma:%'
-0.203438 O b'-2:lemma:g/l'
-0.205010 O b'-2:lemma:of'
-0.205156 O b'lemma:medium'
-0.215652 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.220765 O b'+2:lemma:m9'
-0.223855 O b'-1:lemma:contain'
-0.225771 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.226137 O b'hGreek'
-0.227513 O b'-1:lemma:IP'
-0.227524 O b'-1:lemma:minimal'
-0.229067 Gtype b'symb'
-0.231392 Temp b'+1:lemma:with'
-0.232339 O b'-2:lemma:minimal'
-0.246679 O b'+2:lemma:10'
-0.246809 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.248746 Supp b'-2:lemma:glucose'
-0.268028 Temp b'+2:lemma:with'
-0.269304 Supp b'+2:postag:NN'
-0.269690 O b'+2:lemma:co2'
-0.270147 O b'lemma:nacl'
-0.271090 O b'-1:lemma:rna'
-0.272938 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.275514 O b'+2:lemma:fnr'
-0.278732 Strain b'hLower'
-0.278946 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.281731 Med b'postag:CD'
-0.282742 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.282742 Gtype b'+1:postag:,'
-0.284071 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.285204 O b'+1:postag:CD'
-0.286535 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.287105 O b'lemma:sample'
-0.290722 O b'-1:lemma:1'
-0.296729 O b'-1:lemma:rpob'
-0.299296 O b'-1:lemma:1m'
-0.299296 O b'+2:lemma:7.6'
-0.299591 Technique b'-1:lemma::'
-0.308180 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.316276 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.317962 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.321118 Gtype b'+1:ner:_'
-0.323422 O b'-1:lemma:of'
-0.323659 O b'-2:lemma:fresh'
-0.327501 Med b'+1:postag:NN'
-0.329625 O b'lemma:20'
-0.329856 O b'+1:lemma:+'
-0.333376 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.360285 O b'-2:lemma:20'
-0.368079 O b'-2:lemma:until'
-0.369702 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.373105 O b'+2:postag:RB'
-0.375647 Supp b'hGreek'
-0.383010 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.388869 O b'-1:postag:IN'
-0.404152 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.404425 O b'+2:lemma:.'
-0.404425 O b'+2:postag:.'
-0.405533 O b'+1:lemma:1m'
-0.405533 O b'-2:lemma:vol'
-0.408509 Med b'-1:postag:NN'
-0.413461 O b'+1:lemma:supplement'
-0.427280 O b'+2:lemma:add'
-0.453286 O b'postag:RB'
-0.458472 O b'lemma:rifampicin'
-0.463524 Anti b'+2:ner:_'
-0.477330 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.477953 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.482123 Supp b'+1:lemma:,'
-0.482123 Supp b'+1:postag:,'
-0.489447 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.489622 O b'-2:postag:VBG'
-0.494280 O b'-2:lemma:dpd'
-0.495796 O b'+1:lemma:g/l'
-0.504562 O b'-2:lemma:supplement'
-0.507100 O b'-1:lemma:the'
-0.510637 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.529409 O b'-2:ner:SUPP'
-0.532411 O b'+2:lemma:antibody'
-0.537226 O b'lemma:mid-log'
-0.537420 Supp b'+2:postag:CC'
-0.538626 Phase b'symb'
-0.543501 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.549775 Vess b'hUpper'
-0.552198 pH b'symb'
-0.561249 O b'-1:lemma:vol'
-0.561249 O b'-2:lemma:1/100'
-0.561249 O b'+2:lemma:1m'
-0.573342 Gversion b'hLower'
-0.590145 OD b'hLower'
-0.610654 Med b'-1:ner:_'
-0.628555 Supp b'lemma:2'
-0.672929 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.684880 O b'+1:lemma:at'
-0.686652 Anti b'hUpper'
-0.689695 O b'-1:lemma:30'
-0.702884 Med b'+2:postag:VBN'
-0.707589 Strain b'symb'
-0.723647 Agit b'hUpper'
-0.734690 O b'-2:lemma:pahse'
-0.752815 O b'-2:lemma:rpob'
-0.757343 O b'-2:lemma::'
-0.770545 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.786971 O b'lemma:30'
-0.798926 O b'+1:postag:IN'
-0.800735 O b'lemma:aerobic'
-0.824869 Air b'postag:NN'
-0.835701 O b'lemma:wt'
-0.837175 Technique b'-1:postag::'
-0.859451 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.859865 O b'+2:lemma:+'
-0.923240 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.955219 O b'-1:lemma:co2'
-0.967632 Supp b'+2:postag:CD'
-0.977353 O b'-1:postag::'
-0.983071 Med b'hLower'
-0.989844 O b'-2:lemma:iptg'
-1.017693 O b'+1:lemma:in'
-1.051560 O b'-2:lemma:media'
-1.065680 O b'lemma:of'
-1.067697 OD b'hUpper'
-1.101722 Supp b'postag:JJ'
-1.116016 O b'+2:lemma:rifampicin'
-1.157581 O b'-1:lemma:ph'
-1.163741 Technique b'+1:ner:_'
-1.167152 Supp b'+2:lemma:1'
-1.169094 O b'+1:postag:DT'
-1.180898 Temp b'hLower'
-1.188414 O b'-1:lemma:2'
-1.218923 O b'-2:lemma:the'
-1.239845 Gtype b'-2:postag:CD'
-1.244127 O b'+2:lemma:anaerobically'
-1.250755 O b'lemma:media'
-1.301164 OD b'+1:postag:NN'
-1.305536 O b'-2:ner:TF'
-1.306445 O b'lemma:0.3'
-1.309721 OD b'+2:lemma:aerobically'
-1.314088 O b'-2:lemma:IP'
-1.387428 O b'lemma:minimal'
-1.398926 Supp b'+2:lemma:2'
-1.477614 O b'+2:lemma:b'
-1.482976 O b'lemma:aerobically'
-1.560677 O b'-1:lemma:sample'
-1.580092 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.647686 O b'+1:lemma:1'
-2.001406 O b'+1:lemma:2'
-2.010765 O b'+2:lemma:iptg'
-2.030388 O b'-2:lemma:0.3'
-2.324962 Phase b'hUpper'
-2.572423 Technique b'symb'
-3.357992 O b'-1:lemma::'
-4.081981 O b'-1:lemma:_'