report_Run14_v11.txt 36.6 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.3596656344885462, 'c2': 0.020798147571764843}
best CV score:0.8514572032055473
model size: 0.07M

Flat F1: 0.8199169662887013
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.857     0.923        21
        Air      0.595     0.568     0.581        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.899     0.795     0.844        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.870     0.838     0.854       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.857     0.789     0.820       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    5.983085
OD     -> OD      5.845496
Med    -> Med     5.546814
Anti   -> Anti    5.365172
Supp   -> Supp    4.620391
Technique -> Technique 4.487418
Gversion -> Gversion 4.459951
Gtype  -> Gtype   4.367392
Phase  -> Phase   4.071530
Air    -> Air     3.888677
pH     -> pH      3.728107
O      -> O       2.666457
Agit   -> Agit    2.247589
Substrain -> Gtype   1.772247
Technique -> Air     1.129038
Gtype  -> Supp    0.641898
O      -> Technique 0.578413
Air    -> O       0.530932
O      -> Gtype   0.293089
O      -> Supp    0.282262
Temp   -> O       0.237685
Med    -> O       0.208370
Supp   -> O       0.113302
OD     -> O       0.010944
Gtype  -> pH      0.001065
OD     -> Air     -0.000022
O      -> Med     -0.000296
O      -> Anti    -0.035621
Gtype  -> Temp    -0.068916
O      -> OD      -0.096778
Technique -> pH      -0.569658
Substrain -> O       -0.900357
Med    -> Supp    -1.000638
Gtype  -> O       -1.125650
O      -> Air     -1.310674


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    5.983085
OD     -> OD      5.845496
Med    -> Med     5.546814
Anti   -> Anti    5.365172
Supp   -> Supp    4.620391
Technique -> Technique 4.487418
Gversion -> Gversion 4.459951
Gtype  -> Gtype   4.367392
Phase  -> Phase   4.071530
Air    -> Air     3.888677
pH     -> pH      3.728107
O      -> O       2.666457
Agit   -> Agit    2.247589
Substrain -> Gtype   1.772247
Technique -> Air     1.129038
Gtype  -> Supp    0.641898
O      -> Technique 0.578413
Air    -> O       0.530932
O      -> Gtype   0.293089
O      -> Supp    0.282262
Temp   -> O       0.237685
Med    -> O       0.208370
Supp   -> O       0.113302
OD     -> O       0.010944
Gtype  -> pH      0.001065
OD     -> Air     -0.000022
O      -> Med     -0.000296
O      -> Anti    -0.035621
Gtype  -> Temp    -0.068916
O      -> OD      -0.096778
Technique -> pH      -0.569658
Substrain -> O       -0.900357
Med    -> Supp    -1.000638
Gtype  -> O       -1.125650
O      -> Air     -1.310674


Top positive:
5.900234 Anti     b'-2:lemma:antibody'
5.881729 O        b'lemma:_'
5.755569 Gtype    b'lemma:type'
5.308000 O        b'lemma:1'
5.207386 Gtype    b'lemma:wt'
5.060005 O        b'-2:lemma:_'
4.876408 O        b'lemma:2'
4.861996 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
4.822455 Air      b'lemma:anaerobic'
4.804082 Gtype    b'hGreek'
4.748296 Technique b'lemma:chipseq'
4.516413 Gtype    b'+1:lemma:type'
4.483510 Phase    b'-2:lemma:phase'
4.138475 O        b'lemma:3'
4.081383 O        b'lemma:-'
4.067203 Strain   b'lemma:k-12'
4.058453 Supp     b'lemma:no3'
4.019392 Phase    b'lemma:mid-log'
3.645004 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
3.630735 O        b'lemma:b'
3.569348 Air      b'lemma:aerobically'
3.514418 Supp     b'lemma:pq'
3.508888 Supp     b'lemma:Iron'
3.508888 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.496012 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.489452 Supp     b'-2:lemma:shake'
3.267464 O        b'postag:VBG'
3.257925 Med      b'lemma:MOPS'
3.243714 Supp     b'lemma:2h'
3.243714 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.242458 Air      b'lemma:aerobic'
3.094564 Air      b'-1:lemma:-'
3.019519 Supp     b'lemma:nh4cl'
3.011676 O        b'postag::'
3.011253 Supp     b'lemma:nacl'
2.957077 O        b'postag:IN'
2.951518 Supp     b'-1:ner:SUPP'
2.949786 O        b'lemma:.'
2.949786 O        b'postag:.'
2.940606 O        b'lemma:rpob'
2.926291 O        b'lemma:a'
2.920479 Med      b'lemma:lb'
2.908965 Air      b'-2:lemma:IP'
2.899587 Supp     b'lemma:Adenine'
2.864784 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.861448 O        b'lemma:with'
2.838797 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
2.808417 Gtype    b'lemma:dfnr'
2.805829 Technique b'hUpper'
2.799652 Supp     b'lemma:iptg'
2.788370 Substrain b'lemma:mg1655'
2.788354 Med      b'lemma:LB'
2.783756 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.778751 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.751924 Gtype    b'lemma:pk4854'
2.741660 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.658674 Med      b'lemma:minimal'
2.619336 O        b'-1:postag:NNS'
2.602261 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.573807 Med      b'lemma:media'
2.501038 Gtype    b'-1:ner:GEN'
2.474883 O        b'lemma:genotype/variation'
2.473171 pH       b'lemma:ph5'
2.473171 pH       b'+1:lemma:.5'
2.472507 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.464037 Temp     b'-1:lemma:sample'
2.428503 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.406785 Technique b'+2:lemma:ph5'
2.377194 Supp     b'-2:lemma:media'
2.342073 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
2.308554 O        b'-1:lemma:tag'
2.274968 O        b'+1:lemma:coli'
2.251679 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.218566 Supp     b'-1:lemma:with'
2.209448 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.178429 pH       b'+1:postag:CD'
2.166529 Temp     b'lemma:43'
2.160297 O        b'-1:lemma:0.3'
2.156528 O        b'lemma:Cra'
2.122432 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.120684 O        b'+1:lemma:pq'
2.115945 O        b'+1:lemma:wt'
2.108904 Med      b'lemma:m63'
2.040209 Technique b'-1:lemma:_'
2.006347 OD       b'+1:lemma:of'
2.000524 Supp     b'+1:lemma:1'
1.980548 Agit     b'lemma:rpm'
1.979613 Temp     b'lemma:37'
1.977592 O        b'-2:lemma:myc'
1.958900 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
1.957800 Agit     b'-1:lemma:250'
1.956396 Anti     b'+1:lemma:antibody'
1.952391 O        b'lemma:rep2'
1.952391 O        b'lemma:rep1'
1.948796 O        b'lemma:harbor'
1.932088 O        b'-1:lemma:lb'
1.926418 Technique b'-2:lemma:wt'
1.913367 O        b'-1:lemma:type'
1.903832 Med      b'+2:lemma:b2'
1.900900 Supp     b'-1:lemma:+'
1.897317 Med      b'+2:postag:CC'
1.876888 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
1.876888 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
1.866347 Phase    b'postag:NN'
1.863336 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
1.844902 Air      b'postag:RB'
1.841777 O        b'-1:lemma:glucose'
1.836809 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
1.816274 O        b'postag:VBN'
1.812865 Supp     b'+2:lemma:feso4'
1.733634 Supp     b'+1:lemma:2'
1.732479 O        b'lemma::'
1.712779 O        b'lemma:chip'
1.705332 Air      b'-1:lemma:co2'
1.699239 Air      b'postag:JJ'
1.696238 Supp     b'-1:lemma:Cra'
1.680226 O        b'lemma:\xcf\x8332'
1.659737 O        b'-2:ner:MED'
1.646725 Vess     b'lemma:flask'
1.646725 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.646725 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.646725 Vess     b'+2:lemma:43'
1.640070 O        b'-1:lemma:anaerobic'
1.625211 O        b'lemma:CEL'
1.609900 Supp     b'lemma:fructose'
1.608333 O        b'+1:lemma:od600'
1.600139 OD       b'-1:postag:IN'
1.593811 OD       b'lemma:od450'
1.593189 Technique b'lemma:ChIP-exo'
1.588705 O        b'postag:CC'
1.569655 Air      b'lemma:anaeroibc'
1.557546 Gversion b'lemma:.2'
1.557546 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.542818 Supp     b'-2:lemma:20'
1.537280 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.534233 Gtype    b'+1:postag::'
1.521578 O        b'+2:lemma:crp'
1.518896 Air      b'-2:postag:CD'
1.512592 Supp     b'-2:lemma:for'
1.512556 Air      b'-2:lemma:%'
1.511836 Supp     b'lemma:Leu'
1.511836 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
1.488756 Temp     b'-1:lemma:37'
1.488496 Gversion b'lemma:u00096'
1.488496 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.471559 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.466964 Technique b'-2:postag:NNP'
1.447948 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.433636 OD       b'lemma:0.3'
1.413549 O        b'+1:ner:MED'
1.403644 Med      b'+2:lemma:b1'
1.392227 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.389012 O        b'lemma:ompr'
1.388026 O        b'postag:-RRB-'
1.387160 Supp     b'lemma:arginine'
1.386971 Supp     b'+1:lemma:_'
1.375234 O        b'lemma:-lrb-'
1.368311 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.358697 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.352998 Supp     b'lemma:acetate'
1.342022 O        b'lemma:culture'
1.340995 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.337379 O        b'-1:lemma:wt'
1.329238 O        b'-1:lemma:pq'
1.309329 Gversion b'-2:lemma:build'
1.298725 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.293943 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.287238 Supp     b'lemma:glucose'
1.285894 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.280549 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.271186 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.256305 O        b'symb'
1.247658 Supp     b'-1:postag:CD'
1.243099 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.214797 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.213497 Med      b'+2:lemma:+'
1.210948 Temp     b'-1:lemma:43'
1.207130 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.206470 Gtype    b'hUpper'
1.202386 O        b'postag:VBD'
1.201240 Technique b'lemma:rnaseq'
1.200927 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
1.198340 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.192012 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.190086 O        b'-1:lemma:-80'
1.187732 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.186976 Supp     b'+2:lemma:add'
1.183431 O        b'lemma:purr'
1.180519 Med      b'-2:lemma:minimal'
1.158842 Med      b'+1:lemma:0.4'
1.158554 Gtype    b'+2:lemma::'
1.154210 O        b'-1:lemma:nacl'
1.153868 Phase    b'-2:lemma:until'
1.152598 O        b'+1:postag:RB'
1.150707 O        b'-1:lemma:l1'
1.149332 Agit     b'lemma:250'
1.140325 Supp     b'lemma:20'
1.139722 Gtype    b'postag:JJ'
1.126555 Gtype    b'+1:lemma:the'
1.119776 O        b'+1:lemma:0.2'
1.110828 O        b'+1:postag:NNP'
1.101877 Technique b'hLower'
1.096148 O        b'lemma:ml'
1.093303 O        b'+1:lemma:250'
1.090560 Supp     b'-1:lemma:_'
1.084580 Med      b'lemma:medium'
1.077660 Supp     b'lemma:Fe'
1.077578 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.076968 O        b'-2:lemma:='
1.064746 O        b'lemma:chip-fnr'
1.064746 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
1.061429 pH       b'lemma:5.5'
1.061384 Substrain b'-1:lemma:.'
1.061384 Substrain b'-1:postag:.'
1.051938 Gversion b'lemma:000913'
1.051938 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.040534 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.029924 Supp     b'-2:lemma:agent'
1.028568 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.028568 Strain   b'-2:lemma:str'
1.028533 O        b'-1:lemma:min'
1.023631 Supp     b'-2:lemma:argr'
1.018751 Vess     b'+1:lemma:at'
1.016127 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.016127 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.012402 O        b'lemma:affyexp'
1.005261 O        b'lemma:chip-arca'
1.005261 O        b'+2:lemma:arca8myc'
0.999324 Gtype    b'-1:lemma:_'
0.993370 O        b'lemma:-rrb-'
0.984690 Gtype    b'lemma:wild-type'
0.977577 Supp     b'lemma:dpd'
0.973330 Supp     b'-1:lemma:mm'
0.972606 O        b'-1:lemma:nitrate'
0.968717 OD       b'lemma:of'
0.964207 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
0.964207 Gtype    b'-1:lemma:old'
0.964207 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
0.959995 Supp     b'postag:NNP'
0.954928 O        b'-2:lemma:min'
0.954090 OD       b'lemma:od600'
0.952884 Med      b'-2:postag:JJ'
0.951944 O        b'+1:lemma:20'
0.942351 Gversion b'lemma:asm584v2'
0.940752 O        b'lemma:,'
0.940752 O        b'postag:,'
0.936243 Air      b'+2:postag:CD'
0.931876 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
0.929942 O        b'-2:lemma:overnight'
0.922164 Gversion b'-2:lemma:genome'
0.916666 Temp     b'-2:lemma:keep'
0.910561 Supp     b'lemma:rifampicin'
0.909619 O        b'+1:ner:SUPP'
0.902719 Med      b'+1:postag:-LRB-'
0.900546 Gversion b'-2:postag:VB'
0.889572 Supp     b'-2:lemma:pahse'
0.888968 Gtype    b'lemma:nsrr'
0.888968 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
0.887009 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
0.886520 Med      b'+1:lemma:minimal'
0.885013 O        b'postag:NNS'
0.884085 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.882489 Temp     b'+2:postag:DT'
0.880155 O        b'+1:lemma::'
0.875439 Med      b'-1:postag:JJ'
0.872456 Temp     b'-2:lemma:see'
0.868077 Air      b'-2:lemma:fnr'
0.865556 Gtype    b'hLower'
0.860587 O        b'+2:postag:VBD'
0.860351 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
0.858609 Gtype    b'-2:postag:JJ'
0.853281 Gtype    b'+2:ner:SUPP'
0.844831 Temp     b'lemma:sample'
0.836890 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
0.835272 Air      b'-2:lemma:cm20'
0.831373 Gtype    b'-2:lemma:delta'
0.830400 Gversion b'lemma:nc'
0.830400 Gversion b'+2:lemma:000913'
0.829751 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
0.829191 OD       b'-2:lemma:phase'
0.826581 Technique b'-1:lemma:IP'
0.825734 Air      b'+1:lemma:%'
0.820441 Supp     b'lemma:glutamine'
0.820441 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
0.816686 Air      b'+2:lemma:%'
0.810771 Supp     b'+2:lemma:A'
0.806945 Supp     b'+2:lemma:be'
0.805473 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.805473 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.803537 Supp     b'+1:lemma:be'
0.802815 Gtype    b'lemma:wild'
0.800366 Agit     b'+2:lemma:at'
0.798006 Technique b'-2:lemma:Fur'
0.797582 Gtype    b'+1:lemma:pq'
0.788988 O        b'lemma:0.4'
0.787005 O        b'lemma:trpr'
0.781869 O        b'lemma:input'
0.781869 O        b'+1:lemma:chip-seq'
0.778717 pH       b'+1:lemma:5.5'
0.777920 Vess     b'-1:postag:VBN'
0.772373 Med      b'postag:NNP'
0.770987 Air      b'lemma:%'
0.770262 Gtype    b'lemma:the'
0.758460 O        b'-2:lemma:fructose'
0.757053 OD       b'+1:postag:IN'
0.756965 Supp     b'+2:postag:VBD'
0.752037 O        b'+2:postag:JJ'
0.751982 OD       b'-2:lemma:od450'
0.742591 pH       b'-1:lemma:ph'
0.739894 Gversion b'postag:NN'
0.739668 Supp     b'-1:lemma:vol'
0.739668 Supp     b'-2:lemma:1/100'
0.739668 Supp     b'+2:lemma:1m'
0.731013 Air      b'-1:lemma:_'
0.730652 Temp     b'-2:postag:VB'
0.729016 O        b'+2:lemma:fructose'
0.728280 Gtype    b'+1:lemma::'
0.727823 O        b'+1:lemma:acetate'
0.726972 Supp     b'+1:lemma:iptg'
0.723601 O        b'postag:-LRB-'
0.721687 pH       b'-1:postag:NN'
0.720329 pH       b'lemma:ph'
0.719104 Technique b'-1:lemma:1'
0.718071 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.718071 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.717223 Gtype    b'+2:postag::'
0.709889 Gversion b'+1:postag:CD'
0.709219 OD       b'postag:IN'
0.695673 Substrain b'+2:lemma::'
0.694943 O        b'+2:ner:_'
0.691602 O        b'-2:lemma:~'
0.690193 Supp     b'-1:postag:IN'
0.689428 O        b'-2:lemma:anaerobic'
0.688544 O        b'-1:lemma:acetate'
0.685063 Supp     b'lemma:of'
0.681592 O        b'+1:lemma:k-12'
0.679225 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
0.674518 O        b'-1:lemma:4'
0.672813 O        b'+1:lemma:ph5'
0.672813 O        b'+2:lemma:.5'
0.671922 O        b'lemma:additional'
0.671922 O        b'+1:lemma:2h'
0.671573 Supp     b'+2:postag:IN'
0.671018 Agit     b'-2:postag:RB'
0.667351 Phase    b'lemma:phase'
0.662863 O        b'-1:ner:_'
0.660902 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
0.660902 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
0.660519 Gtype    b'-1:postag:VBP'
0.658528 Med      b'symb'
0.652998 OD       b'-1:lemma:od600'
0.649285 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
0.637359 O        b'+1:postag:VBN'
0.636876 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.636876 Supp     b'+1:ner:KWSUPP'
0.634904 Phase    b'-2:postag:IN'
0.634850 Supp     b'-1:lemma:1m'
0.634850 Supp     b'+2:lemma:7.6'
0.634357 O        b'-1:lemma:antibody'
0.632692 O        b'+2:lemma:wt'
0.630500 O        b'+2:lemma:aerobically'
0.629707 Air      b'-1:lemma:%'
0.626548 Gtype    b'+2:postag:NN'
0.624898 Supp     b'postag:NN'
0.624034 pH       b'lemma:.5'
0.624034 pH       b'-1:lemma:ph5'
0.622074 Supp     b'lemma:0.2'
0.617980 Gtype    b'-2:lemma:the'
0.617095 OD       b'-1:lemma:~'
0.615332 O        b'lemma:-80'
0.615332 O        b'-2:lemma:freeze'
0.614225 Phase    b'+1:lemma:phase'
0.612581 O        b'-2:lemma:medium'
0.606504 Med      b'lemma:2'
0.605380 O        b'lemma:growth'
0.597229 Supp     b'-2:lemma:trpr'
0.595991 Technique b'-1:lemma:input'
0.594663 Supp     b'-2:postag:VBG'
0.593021 Med      b'-1:ner:MED'
0.584514 O        b'-1:lemma:aerobic'
0.584215 Air      b'-2:lemma:mid-log'
0.583285 Supp     b'lemma:cm20'
0.583285 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
0.580343 Air      b'-1:lemma:phase'
0.580121 pH       b'-1:lemma:at'
0.577292 O        b'postag:DT'
0.575941 Supp     b'-2:lemma:induce'
0.573432 Med      b'+2:lemma:with'
0.570788 Strain   b'-1:lemma:.'
0.570788 Strain   b'-1:postag:.'
0.567645 Med      b'-2:lemma:fresh'
0.564040 O        b'lemma:genotype'
0.561981 O        b'-2:lemma:in'
0.561734 Vess     b'-2:postag:JJ'
0.560845 O        b'hLower'
0.558394 Gtype    b'-1:lemma:vector'
0.557114 Med      b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
0.556990 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
0.556208 O        b'-2:ner:_'
0.556098 O        b'lemma:treatment'
0.554032 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.553059 Med      b'-1:lemma:ml'
0.551283 Anti     b'+2:postag:NNP'
0.546049 pH       b'-2:lemma:at'
0.545153 O        b'+2:lemma:TEX'
0.542171 Med      b'+1:lemma:supplement'
0.536435 O        b'+1:lemma:rifampicin'
0.533830 Supp     b'-1:lemma:final'
0.533150 Strain   b'+2:lemma:.'
0.533150 Strain   b'+2:postag:.'
0.532475 Supp     b'-1:lemma:sodium'
0.532475 Supp     b'+2:lemma:1/100'
0.531732 Supp     b'-1:postag:SYM'
0.529512 Air      b'-1:postag:CD'
0.529255 Gtype    b'-2:postag:NN'
0.529153 Supp     b'symb'
0.525994 Air      b'+2:lemma:co2'
0.521222 O        b'-2:postag:FW'
0.520156 Technique b'+2:postag:-RRB-'
0.520129 O        b'lemma:A'
0.516531 O        b'lemma:gadx'
0.514710 O        b'+1:postag::'
0.510240 O        b'lemma:old'
0.510240 O        b'-1:lemma:seqa'
0.510240 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
0.509823 Gtype    b'-2:ner:_'
0.508342 O        b'lemma:argr'
0.507980 O        b'+1:ner:_'
0.507053 Anti     b'-1:lemma::'
0.505732 O        b'-1:postag:NN'
0.499638 Med      b'-1:lemma:in'
0.497646 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.495639 Supp     b'-1:ner:_'
0.495317 Phase    b'-2:lemma:to'
0.495317 Phase    b'-2:postag:TO'
0.491710 Med      b'+1:lemma:2.0'
0.487863 OD       b'+2:lemma:~'
0.487208 O        b'-2:lemma:twice'
0.486935 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.486120 Air      b'lemma:5'
0.481631 Agit     b'+2:postag:-RRB-'
0.479863 Gtype    b'+1:lemma:control'
0.477636 O        b'+2:lemma:of'
0.472046 Agit     b'+2:lemma:-rrb-'
0.470358 Supp     b'-2:postag:CD'
0.468842 Air      b'-1:postag::'
0.468337 O        b'-1:postag:NNP'
0.467355 Gtype    b'-2:postag:NNS'
0.467009 Gversion b'+1:lemma:genome'
0.463418 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.462905 Supp     b'+1:postag:VBD'
0.462242 Med      b'-1:lemma:glucose'
0.462100 Med      b'+1:postag:CD'
0.456382 Agit     b'-1:postag:-LRB-'
0.455437 OD       b'+2:postag:CD'
0.451225 OD       b'-1:lemma:od450'
0.450513 Gversion b'-2:ner:_'
0.450387 OD       b'+2:lemma:culture'
0.448635 Gtype    b'lemma:ptac'
0.446977 Agit     b'-1:lemma:-lrb-'
0.439625 OD       b'-1:lemma:at'
0.439384 Med      b'+2:lemma:then'
0.431997 Med      b'hUpper'
0.431232 Technique b'lemma:rna-seq'
0.428936 Gversion b'postag:CD'
0.427501 O        b'lemma:s'
0.427501 O        b'-2:lemma:parameter'
0.425741 Substrain b'+2:postag::'
0.424927 O        b'-2:lemma:be'
0.421432 Agit     b'+1:postag:-RRB-'
0.419102 O        b'+1:lemma:aerobically'
0.418247 Supp     b'+1:lemma:1/100'
0.418247 Supp     b'-2:lemma:sodium'
0.418247 Supp     b'+2:lemma:vol'
0.415927 Agit     b'+1:lemma:-rrb-'
0.414616 pH       b'+1:lemma:.'
0.414616 pH       b'+1:postag:.'
0.414146 Supp     b'+1:ner:_'
0.413845 Gtype    b'-1:lemma:wild'
0.411643 O        b'-2:lemma:od600'
0.408913 Gtype    b'-2:lemma:dna'
0.408216 O        b'+2:lemma:anaerobic'
0.405239 Supp     b'+1:lemma:.'
0.405239 Supp     b'+1:postag:.'
0.403638 O        b'-2:lemma:,'
0.403638 O        b'-2:postag:,'
0.402352 Gtype    b'+2:lemma:rep2'
0.402352 Gtype    b'+2:lemma:rep1'
0.399526 Supp     b'lemma:7.6'
0.399526 Supp     b'+1:lemma:;'
0.399340 Technique b'lemma:-lrb-'
0.399244 Supp     b'-1:lemma:,'
0.399244 Supp     b'-1:postag:,'
0.398918 pH       b'postag:CD'
0.396652 Agit     b'-2:postag:-LRB-'
0.395759 O        b'+2:postag:NNP'
0.394353 Anti     b'hLower'
0.393472 Gtype    b'lemma:flagtag'
0.393472 Gtype    b'-2:lemma:nsrr'
0.392241 OD       b'postag:CD'


Top negative:
0.154048 Supp     b'-1:lemma:150'
0.153355 O        b'+2:lemma:be'
0.152442 Supp     b'-2:postag:VBN'
0.150686 Supp     b'lemma:0.1'
0.148946 Phase    b'lemma:pahse'
0.148735 Phase    b'hLower'
0.148302 O        b'-1:ner:TF'
0.148173 Gtype    b'lemma:crp'
0.146797 Med      b'postag:NN'
0.146590 Med      b'-2:lemma:2'
0.145243 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
0.144378 Gtype    b'-1:lemma:from'
0.143412 Supp     b'+2:lemma:10'
0.142876 O        b'+2:lemma:and'
0.141448 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
0.139799 Supp     b'+1:postag:IN'
0.139711 O        b'+1:lemma:and'
0.136373 Technique b'lemma:chip-exo'
0.135955 Gversion b'-1:postag:DT'
0.135574 Gtype    b'+1:postag:DT'
0.135495 Air      b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.135457 O        b'lemma:cell'
0.132662 OD       b'-2:postag:NN'
0.132265 Anti     b'-1:postag:JJ'
0.129022 Gtype    b'-2:ner:GEN'
0.128311 O        b'-2:lemma:with'
0.128249 Supp     b'+2:lemma:mid-log'
0.127628 Technique b'+1:postag:NN'
0.127081 Temp     b'+2:lemma:in'
0.126267 Supp     b'-2:lemma:rifampicin'
0.124959 Gtype    b'+1:postag:NN'
0.124524 O        b'+1:postag:CC'
0.121512 Supp     b'+2:lemma:ph'
0.121136 OD       b'+1:postag:JJ'
0.116585 Air      b'+1:postag:CC'
0.114015 Supp     b'lemma:phosphate'
0.113291 Air      b'+1:lemma:b'
0.112643 O        b'+1:lemma:dpd'
0.109984 O        b'+1:postag:JJ'
0.105392 Supp     b'+2:lemma:treat'
0.102534 Temp     b'+2:postag:NN'
0.102201 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
0.102201 Gtype    b'+2:lemma:.5'
0.101898 Gtype    b'-1:postag:IN'
0.101567 O        b'+2:lemma:for'
0.101130 O        b'-2:postag:IN'
0.100830 Supp     b'-1:lemma:of'
0.100724 Gtype    b'+2:postag:VBN'
0.100672 Gtype    b'-2:postag::'
0.100416 O        b'-2:postag:VBN'
0.097618 O        b'+2:postag:NNS'
0.095178 Med      b'+2:postag:NN'
0.094912 Med      b'+1:postag:JJ'
0.092101 Supp     b'+2:lemma:at'
0.091932 Supp     b'+1:lemma:min'
0.091015 Supp     b'-2:lemma:iptg'
0.090223 Supp     b'+2:lemma:fecl2'
0.090118 O        b'lemma:k-12'
0.088822 Air      b'+1:postag:-LRB-'
0.088562 O        b'lemma:mg1655'
0.087020 O        b'-1:lemma:and'
0.086653 Supp     b'-1:lemma:iptg'
0.086630 Air      b'+1:lemma:95'
0.086475 Gtype    b'lemma:ryhb'
0.086225 Air      b'+2:postag:CC'
0.086109 Med      b'-1:ner:SUPP'
0.084782 Substrain b'postag:NN'
0.083477 Supp     b'+1:lemma:300'
0.079617 Supp     b'+1:lemma:of'
0.077166 Air      b'-2:lemma:,'
0.077166 Air      b'-2:postag:,'
0.073796 Air      b'hLower'
0.073084 Air      b'lemma:95'
0.072616 O        b'postag:NNP'
0.071399 Technique b'-1:postag:NN'
0.070586 O        b'-1:lemma:10'
0.069268 O        b'-2:lemma:co2'
0.069078 Supp     b'+1:postag:JJ'
0.067151 OD       b'-1:ner:_'
0.065390 Air      b'lemma:and'
0.063111 O        b'+2:lemma:mm'
0.063111 O        b'+2:ner:KWSUPP'
0.062988 Supp     b'-1:lemma:0.1'
0.061243 O        b'+2:postag:VBN'
0.060906 Air      b'+2:lemma:95'
0.060632 OD       b'+1:lemma:~'
0.059569 Supp     b'+1:lemma:ph'
0.058195 Supp     b'lemma:dissolve'
0.058195 Supp     b'+2:lemma:methanol'
0.057790 OD       b'-2:lemma:at'
0.057668 Supp     b'-2:lemma:condition'
0.057271 Temp     b'+2:lemma:and'
0.056134 OD       b'lemma:600nm'
0.056134 OD       b'-1:lemma:o.d.'
0.055578 O        b'-1:postag:CD'
0.055467 O        b'+1:lemma:ml'
0.054954 Temp     b'+2:ner:_'
0.054607 Temp     b'-1:ner:_'
0.052312 Gtype    b'postag:-RRB-'
0.050298 Supp     b'+2:postag:VBN'
0.049190 O        b'lemma:%'
0.045575 O        b'+2:lemma:allow'
0.045016 Supp     b'-1:lemma::'
0.043208 Gversion b'+1:lemma:_'
0.043201 pH       b'-2:postag:IN'
0.042586 Supp     b'+1:lemma:at'
0.042315 Supp     b'lemma:;'
0.042315 Supp     b'-1:lemma:7.6'
0.040479 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
0.040479 Supp     b'+2:lemma:cm20'
0.037636 Phase    b'-1:ner:_'
0.037294 Med      b'-2:lemma:-rrb-'
0.036391 O        b'+2:lemma:wash'
0.036137 O        b'lemma:paraquat'
0.036137 O        b'-2:lemma:um'
0.034301 O        b'-1:lemma:m63'
0.033492 O        b'+2:postag:-LRB-'
0.032173 Supp     b'lemma:mmol'
0.032173 Supp     b'+1:lemma:potassium'
0.032173 Supp     b'-2:lemma:respiration'
0.031890 O        b'-1:lemma:or'
0.031008 Air      b'+1:postag:NN'
0.029977 O        b'-2:lemma:a'
0.028716 Supp     b'+2:lemma:nitrate'
0.026596 Air      b'hUpper'
0.026569 O        b'+2:lemma:-lrb-'
0.024835 OD       b'-1:postag:NN'
0.024643 Med      b'+2:postag:CD'
0.023839 Gtype    b'+2:lemma:fnr'
0.023501 O        b'-1:lemma:5'
0.023087 O        b'-1:lemma:for'
0.022476 OD       b'-2:postag:IN'
0.021682 Air      b'+2:postag:NN'
0.021171 Anti     b'-2:lemma::'
0.020373 O        b'-1:lemma:grow'
0.020009 O        b'-1:lemma:%'
0.019670 O        b'-2:lemma:%'
0.019482 Gversion b'+2:postag:NN'
0.018947 O        b'lemma:2.0'
0.017859 O        b'+2:lemma:ml'
0.016865 Air      b'+2:lemma:mid-log'
0.016824 Technique b'-2:lemma:-lrb-'
0.016370 O        b'postag:JJ'
0.014712 O        b'+1:lemma:final'
0.014707 Gversion b'+2:ner:_'
0.013720 O        b'+1:lemma:43'
0.012163 O        b'lemma:be'
0.011039 Temp     b'+1:lemma:in'
0.010996 O        b'lemma:respiration'
0.010996 O        b'+2:lemma:mmol'
0.009813 O        b'lemma:and'
0.008647 Air      b'symb'
0.008387 Gtype    b'+1:postag:CD'
0.008183 Supp     b'+2:postag:JJ'
0.007308 OD       b'+1:postag:DT'
0.007295 O        b'+2:postag:IN'
0.005879 Gtype    b'+2:lemma:small'
0.005679 Supp     b'+2:lemma:.'
0.005679 Supp     b'+2:postag:.'
0.005656 Supp     b'-2:lemma:rpob'
0.004733 O        b'+1:lemma:with'
0.004422 Technique b'+1:ner:TF'
0.004125 Technique b'+1:postag:NNP'
0.004078 O        b'-1:lemma:,'
0.004078 O        b'-1:postag:,'
0.003795 pH       b'-1:ner:_'
0.003376 Supp     b'postag:IN'
0.003354 pH       b'+1:ner:_'
0.003320 O        b'+1:lemma:sparging'
0.002955 Gtype    b'+2:postag:CD'
0.002757 O        b'lemma:for'
0.002687 O        b'-1:lemma:with'
0.001616 Gversion b'-1:ner:_'
0.001467 O        b'-2:lemma:and'
0.001436 Med      b'-1:lemma:fresh'
0.001342 Med      b'-2:lemma:glucose'
0.001300 Supp     b'lemma:in'
0.001271 Supp     b'lemma:30'
0.001113 O        b'+2:postag:CC'
0.001101 Supp     b'-2:ner:SUPP'
0.001083 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
0.001067 O        b'-2:postag:JJ'
0.000867 Technique b'-1:postag:NNP'
0.000863 Gversion b'-1:lemma:_'
0.000818 Supp     b'lemma:methanol'
0.000818 Supp     b'-2:lemma:dissolve'
0.000756 O        b'+2:lemma:glucose'
0.000471 O        b'-1:lemma:genotype'
0.000457 Air      b'postag:CD'
0.000310 O        b'-2:postag:NN'
0.000243 Supp     b'-1:postag::'
0.000194 Supp     b'-1:postag:JJ'
0.000173 O        b'-2:lemma:reach'
0.000170 Air      b'+1:postag:CD'
0.000159 O        b'+2:lemma:acetate'
0.000141 O        b'lemma:cra'
0.000132 Supp     b'-1:lemma:rifampicin'
0.000118 O        b'-2:lemma:strain'
0.000073 Gtype    b'-2:postag:-RRB-'
0.000068 Phase    b'-1:postag:NN'
0.000066 OD       b'-1:lemma:to'
0.000066 OD       b'-1:postag:TO'
0.000065 pH       b'-1:postag:IN'
0.000062 Med      b'+2:lemma:without'
0.000045 O        b'-1:lemma:0.4'
0.000039 Air      b'-2:lemma:0.3'
0.000031 O        b'-2:lemma:mm'
0.000031 O        b'-2:ner:KWSUPP'
0.000030 O        b'-2:lemma:or'
0.000028 OD       b'-2:lemma:grow'
0.000018 O        b'+2:ner:SUPP'
0.000016 Phase    b'+2:lemma:30'
0.000014 Med      b'-2:postag:-RRB-'
0.000012 Supp     b'-2:lemma:of'
0.000006 O        b'-2:lemma:at'
0.000002 Temp     b'+2:lemma:short'
0.000000 Med      b'-1:lemma:-rrb-'
0.000000 O        b'-2:lemma:mid-log'
0.000000 O        b'lemma:hs2'
-0.000000 O        b'+1:lemma:300'
0.000000 O        b'-1:lemma:induce'
-0.000001 O        b'+2:lemma:ph'
-0.000004 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.000007 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.000017 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.000025 O        b'-2:lemma:grow'
-0.000028 OD       b'+2:postag:CC'
-0.000029 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.000031 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.000031 O        b'lemma:dissolve'
-0.000031 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.000041 Gversion b'symb'
-0.000069 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.000080 O        b'+2:lemma:total'
-0.000107 O        b'-2:lemma:nh4cl'
-0.000216 O        b'-1:lemma:in'
-0.000246 Strain   b'hLower'
-0.000256 O        b'+1:lemma:a'
-0.000333 Gversion b'+1:ner:_'
-0.000336 Supp     b'+1:ner:SUPP'
-0.000419 O        b'hUpper'
-0.000578 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.000578 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.000695 O        b'lemma:methanol'
-0.000695 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.000780 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.000970 Supp     b'lemma:paraquat'
-0.000970 Supp     b'-2:lemma:um'
-0.001397 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.001417 Gtype    b'-1:lemma::'
-0.001528 O        b'+2:lemma:reference'
-0.001652 O        b'lemma:150'
-0.001652 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.001652 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.001683 Med      b'-2:ner:MED'
-0.001980 Supp     b'hGreek'
-0.002650 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.003282 O        b'+1:lemma:_'
-0.004823 O        b'+2:lemma:in'
-0.005195 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.005207 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.005375 O        b'+2:lemma:%'
-0.007534 O        b'+1:lemma:0.4'
-0.007780 Air      b'-1:lemma:and'
-0.008461 Air      b'+2:lemma:,'
-0.008461 Air      b'+2:postag:,'
-0.008517 Air      b'-2:postag:CC'
-0.008900 O        b'+2:lemma:media'
-0.008983 Supp     b'-1:postag:NN'
-0.009769 Air      b'+2:ner:_'
-0.010271 O        b'+1:lemma:5'
-0.010446 Med      b'-2:postag:NN'
-0.010677 O        b'+1:lemma:.'
-0.010677 O        b'+1:postag:.'
-0.012344 O        b'-1:lemma:contain'
-0.012717 Supp     b'-2:lemma:glucose'
-0.013678 OD       b'-2:lemma:od600'
-0.013784 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.020188 Temp     b'symb'
-0.023738 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.023827 Gtype    b'postag:NNP'
-0.023928 Supp     b'hUpper'
-0.025625 O        b'-1:lemma:ml'
-0.027014 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.027043 Anti     b'-1:ner:_'
-0.028294 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.029578 O        b'-2:lemma:1'
-0.030338 Gtype    b'-1:ner:_'
-0.031547 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.031553 Phase    b'+1:ner:_'
-0.032436 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.032953 Med      b'+1:ner:MED'
-0.034496 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.035090 Gtype    b'-1:postag::'
-0.035124 O        b'-1:lemma:.'
-0.035124 O        b'-1:postag:.'
-0.035278 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.035819 Temp     b'postag:NN'
-0.036435 Med      b'+1:postag:IN'
-0.038235 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.039064 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.039656 O        b'+1:lemma:sample'
-0.041364 OD       b'symb'
-0.042273 Supp     b'+1:postag:CD'
-0.043007 OD       b'+1:postag:CD'
-0.043248 O        b'+1:lemma:hour'
-0.045607 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.051051 O        b'+2:lemma:sample'
-0.051682 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.051902 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.053533 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.055388 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.057379 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.059802 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.061849 O        b'postag:NN'
-0.065151 Phase    b'postag:JJ'
-0.066676 Air      b'+2:postag:IN'
-0.068364 O        b'-1:lemma:until'
-0.071737 Phase    b'+2:ner:_'
-0.082318 Anti     b'+1:ner:_'
-0.083635 O        b'+1:lemma:media'
-0.088338 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.088495 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.088573 Supp     b'+2:ner:_'
-0.088742 Technique b'-2:postag:NN'
-0.091703 O        b'-1:postag:DT'
-0.092197 OD       b'-2:ner:_'
-0.094445 Supp     b'postag:CD'
-0.097216 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.097216 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.098239 O        b'+2:lemma:agitation'
-0.098288 O        b'-2:lemma:genome'
-0.098778 Supp     b'lemma:mm'
-0.098778 Supp     b'-1:ner:KWSUPP'
-0.101419 O        b'+2:lemma:co2'
-0.104431 O        b'+2:postag:CD'
-0.107406 O        b'lemma:fecl2'
-0.110489 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.110636 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.110636 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.111258 O        b'lemma:1m'
-0.112887 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.113818 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.124435 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.124496 O        b'-1:lemma:mm'
-0.129139 O        b'+2:lemma:at'
-0.131737 pH       b'+2:ner:_'
-0.133655 Gtype    b'postag:NN'
-0.134400 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.140726 O        b'+2:lemma:genome'
-0.144631 Supp     b'-2:ner:_'
-0.148372 O        b'-2:postag:SYM'
-0.148422 O        b'-2:lemma:to'
-0.148422 O        b'-2:postag:TO'
-0.150441 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.156730 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.156843 Supp     b'hLower'
-0.158362 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.162018 O        b'-1:lemma:of'
-0.171581 O        b'lemma:rifampicin'
-0.181562 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.184182 O        b'+2:lemma:m9'
-0.192591 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.194188 OD       b'+2:postag:NN'
-0.197204 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.198124 O        b'+1:lemma:%'
-0.198886 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.201950 O        b'-2:lemma:20'
-0.205504 O        b'lemma:medium'
-0.207055 O        b'-1:ner:GEN'
-0.216015 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.218723 O        b'-1:lemma:1m'
-0.218723 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.222865 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.227164 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.229542 Med      b'-1:postag:NN'
-0.234189 O        b'-1:postag:IN'
-0.235790 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.237485 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.241239 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.251965 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.253270 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.261744 O        b'lemma:20'
-0.266456 O        b'postag:RB'
-0.272505 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.272663 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.272993 O        b'lemma:ph'
-0.274133 O        b'-1:lemma:rna'
-0.281706 O        b'-1:lemma:IP'
-0.281731 Technique b'-2:ner:_'
-0.282001 O        b'lemma:sample'
-0.286669 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.289130 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.301765 O        b'+1:lemma:1m'
-0.301765 O        b'-2:lemma:vol'
-0.304234 Technique b'-1:lemma::'
-0.312099 O        b'+1:postag:CD'
-0.313803 O        b'lemma:37'
-0.315925 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.324405 O        b'-2:postag::'
-0.327224 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.334266 O        b'-2:lemma:until'
-0.337084 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.337101 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.337101 Supp     b'+1:postag:,'
-0.343415 Med      b'+1:postag:NN'
-0.347635 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.348784 Supp     b'lemma:2'
-0.353848 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.378561 O        b'lemma:mid-log'
-0.385817 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.393416 O        b'+2:postag:RB'
-0.393770 Gtype    b'symb'
-0.393973 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.395019 O        b'lemma:wt'
-0.398040 Anti     b'+2:ner:_'
-0.401454 O        b'-2:lemma:of'
-0.414355 OD       b'hLower'
-0.423300 O        b'+2:lemma:10'
-0.423410 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.429847 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.438407 O        b'+2:lemma:.'
-0.438407 O        b'+2:postag:.'
-0.453771 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.457500 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.462639 O        b'-1:lemma:1'
-0.463863 O        b'+2:lemma:add'
-0.499984 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.502865 Vess     b'hUpper'
-0.511572 O        b'-1:lemma:vol'
-0.511572 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.511572 O        b'+2:lemma:1m'
-0.518358 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.529838 O        b'-2:lemma::'
-0.530953 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.541644 Anti     b'hUpper'
-0.544676 O        b'-2:lemma:media'
-0.547904 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.557173 Med      b'postag:CD'
-0.562926 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.575092 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.578646 Gversion b'hLower'
-0.600263 Agit     b'hUpper'
-0.613852 O        b'+1:postag:DT'
-0.626664 O        b'lemma:aerobic'
-0.657445 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.679150 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.686464 O        b'-2:lemma:IP'
-0.713921 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.723411 O        b'lemma:minimal'
-0.725237 Air      b'postag:NN'
-0.726456 O        b'+1:lemma:at'
-0.739787 Med      b'-1:ner:_'
-0.744946 pH       b'symb'
-0.763443 Phase    b'symb'
-0.769043 O        b'+1:postag:IN'
-0.773966 Technique b'-1:postag::'
-0.777942 Supp     b'postag:JJ'
-0.788513 O        b'-1:lemma:30'
-0.810289 Strain   b'symb'
-0.845945 Med      b'hLower'
-0.853641 O        b'-1:lemma:the'
-0.864246 O        b'+2:lemma:+'
-0.870891 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.897988 Supp     b'+2:postag:CD'
-0.908386 Supp     b'-1:postag:NNP'
-0.924313 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.928519 O        b'-1:lemma:ph'
-0.947432 O        b'+1:lemma:in'
-0.984678 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-0.991343 O        b'lemma:aerobically'
-1.021346 OD       b'hUpper'
-1.022517 O        b'-1:postag::'
-1.024764 Temp     b'hLower'
-1.080097 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-1.085591 O        b'-1:lemma:sample'
-1.089732 O        b'-1:lemma:co2'
-1.115735 O        b'+2:lemma:b'
-1.159564 O        b'-1:lemma:2'
-1.162296 O        b'-2:postag:VBG'
-1.200888 O        b'-2:ner:TF'
-1.220306 O        b'lemma:30'
-1.283053 O        b'lemma:0.3'
-1.297084 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.350784 O        b'lemma:media'
-1.361863 Technique b'+1:ner:_'
-1.383252 OD       b'+1:postag:NN'
-1.403299 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.452410 O        b'lemma:of'
-1.461784 O        b'-2:lemma:the'
-1.504449 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.512505 Gtype    b'-2:postag:CD'
-1.619190 O        b'-2:lemma:0.3'
-1.841605 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.129607 Phase    b'hUpper'
-2.284571 O        b'+1:lemma:2'
-2.304320 O        b'+1:lemma:1'
-3.151531 O        b'-1:lemma::'
-3.399703 Technique b'symb'
-4.134545 O        b'-1:lemma:_'