report_Run14_v10.txt
40.4 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
1217
1218
1219
1220
1221
1222
1223
1224
1225
1226
1227
1228
1229
1230
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.04607823163068775, 'c2': 0.04048941023960249}
best CV score:0.8497587132907273
model size: 0.13M
Flat F1: 0.821195342443593
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.595 0.568 0.581 88
Anti 0.765 1.000 0.867 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.984 0.795 0.879 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.859 0.853 0.856 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.864 0.789 0.821 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.256027
Anti -> Anti 4.677461
OD -> OD 4.613703
Med -> Med 4.604734
Air -> Air 4.369764
Phase -> Phase 4.349931
Gtype -> Gtype 4.260383
Gversion -> Gversion 3.911257
Supp -> Supp 3.901244
pH -> pH 3.179228
O -> O 3.075320
Technique -> Technique 3.047814
Substrain -> Gtype 1.881322
Agit -> Agit 1.730924
Technique -> Air 1.444872
O -> Technique 0.780515
Air -> O 0.319418
O -> Gtype 0.297695
O -> Strain 0.234470
Temp -> O 0.149602
Gtype -> Supp 0.126848
Gtype -> pH 0.056858
O -> Temp 0.000005
O -> Substrain -0.000006
Med -> Gtype -0.000138
OD -> Technique -0.000175
Gversion -> Gtype -0.000504
O -> Supp -0.001681
Substrain -> Supp -0.002472
OD -> Gtype -0.002836
Anti -> O -0.003726
Air -> Temp -0.005599
O -> Agit -0.007540
Supp -> Gversion -0.008419
Med -> Technique -0.009139
Med -> Air -0.010687
Temp -> Air -0.036716
Technique -> Med -0.044860
Phase -> Air -0.053649
Supp -> Anti -0.058235
Phase -> Gtype -0.079346
Supp -> Temp -0.095447
Air -> OD -0.104962
Supp -> pH -0.147407
Air -> Phase -0.150266
O -> Phase -0.151040
Temp -> Supp -0.151660
Phase -> Technique -0.173608
Gtype -> Phase -0.193907
Gtype -> Gversion -0.200343
Air -> pH -0.201198
Phase -> Supp -0.215620
Med -> O -0.221966
O -> Gversion -0.231770
Technique -> OD -0.246712
Supp -> Phase -0.248414
OD -> O -0.276705
Gversion -> Supp -0.279035
O -> Anti -0.293449
Supp -> Air -0.306022
Supp -> Technique -0.311570
Air -> Med -0.326910
pH -> Supp -0.332063
Air -> Agit -0.352273
Gtype -> Anti -0.353631
Gversion -> O -0.360342
Air -> Gtype -0.363969
O -> OD -0.370008
Anti -> Gtype -0.373609
Supp -> OD -0.378337
OD -> Supp -0.401997
Gtype -> OD -0.403698
Anti -> Supp -0.418897
Supp -> O -0.445317
Technique -> O -0.476901
Phase -> Med -0.481198
Gtype -> Technique -0.523398
Technique -> Supp -0.528567
Phase -> OD -0.550289
Gtype -> Med -0.562686
OD -> Air -0.617427
Phase -> O -0.622309
Supp -> Gtype -0.623549
Agit -> Air -0.654811
Temp -> Med -0.674238
O -> Med -0.747399
Technique -> Gtype -0.755325
Supp -> Med -0.757676
Gtype -> Temp -0.882371
Air -> Supp -0.971443
Technique -> pH -1.256849
Gtype -> O -1.285624
O -> Air -1.296571
Substrain -> O -1.314303
Med -> Supp -1.832898
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.256027
Anti -> Anti 4.677461
OD -> OD 4.613703
Med -> Med 4.604734
Air -> Air 4.369764
Phase -> Phase 4.349931
Gtype -> Gtype 4.260383
Gversion -> Gversion 3.911257
Supp -> Supp 3.901244
pH -> pH 3.179228
O -> O 3.075320
Technique -> Technique 3.047814
Substrain -> Gtype 1.881322
Agit -> Agit 1.730924
Technique -> Air 1.444872
O -> Technique 0.780515
Air -> O 0.319418
O -> Gtype 0.297695
O -> Strain 0.234470
Temp -> O 0.149602
Gtype -> Supp 0.126848
Gtype -> pH 0.056858
O -> Temp 0.000005
O -> Substrain -0.000006
Med -> Gtype -0.000138
OD -> Technique -0.000175
Gversion -> Gtype -0.000504
O -> Supp -0.001681
Substrain -> Supp -0.002472
OD -> Gtype -0.002836
Anti -> O -0.003726
Air -> Temp -0.005599
O -> Agit -0.007540
Supp -> Gversion -0.008419
Med -> Technique -0.009139
Med -> Air -0.010687
Temp -> Air -0.036716
Technique -> Med -0.044860
Phase -> Air -0.053649
Supp -> Anti -0.058235
Phase -> Gtype -0.079346
Supp -> Temp -0.095447
Air -> OD -0.104962
Supp -> pH -0.147407
Air -> Phase -0.150266
O -> Phase -0.151040
Temp -> Supp -0.151660
Phase -> Technique -0.173608
Gtype -> Phase -0.193907
Gtype -> Gversion -0.200343
Air -> pH -0.201198
Phase -> Supp -0.215620
Med -> O -0.221966
O -> Gversion -0.231770
Technique -> OD -0.246712
Supp -> Phase -0.248414
OD -> O -0.276705
Gversion -> Supp -0.279035
O -> Anti -0.293449
Supp -> Air -0.306022
Supp -> Technique -0.311570
Air -> Med -0.326910
pH -> Supp -0.332063
Air -> Agit -0.352273
Gtype -> Anti -0.353631
Gversion -> O -0.360342
Air -> Gtype -0.363969
O -> OD -0.370008
Anti -> Gtype -0.373609
Supp -> OD -0.378337
OD -> Supp -0.401997
Gtype -> OD -0.403698
Anti -> Supp -0.418897
Supp -> O -0.445317
Technique -> O -0.476901
Phase -> Med -0.481198
Gtype -> Technique -0.523398
Technique -> Supp -0.528567
Phase -> OD -0.550289
Gtype -> Med -0.562686
OD -> Air -0.617427
Phase -> O -0.622309
Supp -> Gtype -0.623549
Agit -> Air -0.654811
Temp -> Med -0.674238
O -> Med -0.747399
Technique -> Gtype -0.755325
Supp -> Med -0.757676
Gtype -> Temp -0.882371
Air -> Supp -0.971443
Technique -> pH -1.256849
Gtype -> O -1.285624
O -> Air -1.296571
Substrain -> O -1.314303
Med -> Supp -1.832898
Top positive:
5.277927 O b'lemma:_'
4.826618 O b'-2:lemma:_'
4.779516 Anti b'-2:lemma:antibody'
4.526579 O b'lemma:1'
4.506885 Gtype b'lemma:wt'
4.186581 Supp b'lemma:no3'
4.156014 O b'lemma:2'
4.116634 Air b'lemma:anaerobic'
4.092344 Gtype b'hGreek'
4.059384 Phase b'lemma:mid-log'
3.981678 Supp b'lemma:pq'
3.955302 Technique b'lemma:chipseq'
3.681486 O b'lemma:-'
3.633336 Phase b'-2:lemma:phase'
3.462260 O b'lemma:3'
3.449845 Gtype b'lemma:type'
3.243937 O b'lemma:Cra'
3.222797 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.187755 Supp b'lemma:Iron'
3.187755 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.139684 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
3.121600 O b'lemma:b'
3.072721 O b'lemma:.'
3.072721 O b'postag:.'
3.019569 Supp b'lemma:2h'
3.019569 Supp b'-1:lemma:additional'
3.008980 O b'postag::'
3.002448 Gtype b'-1:ner:GEN'
2.935271 O b'lemma:rpob'
2.877270 Supp b'lemma:nh4cl'
2.841207 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
2.741935 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.739436 Strain b'lemma:k-12'
2.731575 Air b'lemma:aerobically'
2.694543 O b'lemma:with'
2.617186 Air b'-2:lemma:IP'
2.576516 Gtype b'-2:lemma:genotype'
2.546185 O b'lemma:CEL'
2.534805 Gtype b'+1:lemma:type'
2.528291 Air b'lemma:aerobic'
2.502095 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.489748 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.479083 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
2.464364 Supp b'lemma:nacl'
2.382963 O b'-1:lemma:tag'
2.379948 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.364178 O b'+1:lemma:pq'
2.359702 pH b'lemma:ph5'
2.359702 pH b'+1:lemma:.5'
2.357875 O b'lemma:a'
2.348861 Phase b'postag:NN'
2.336016 Substrain b'lemma:mg1655'
2.309098 Technique b'lemma:ChIP-exo'
2.306503 Supp b'lemma:acetate'
2.303729 O b'-2:lemma:myc'
2.302596 O b'lemma:purr'
2.295943 Med b'lemma:lb'
2.295848 Air b'lemma:anaeroibc'
2.287618 Supp b'lemma:iptg'
2.282334 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.278320 Technique b'hUpper'
2.268777 O b'postag:VBG'
2.251090 Technique b'-2:lemma:wt'
2.249499 Gtype b'lemma:dfnr'
2.234340 O b'-1:postag:NNS'
2.233245 O b'-2:lemma:flagtag'
2.231391 Med b'lemma:LB'
2.210499 Med b'lemma:m63'
2.188693 Supp b'+1:lemma:2'
2.187924 Supp b'-1:lemma:+'
2.181923 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.181508 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.178801 O b'-1:lemma:0.3'
2.178026 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.162158 Supp b'+1:lemma:1'
2.153426 Air b'postag:JJ'
2.135079 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.124652 pH b'+1:postag:CD'
2.099684 Air b'postag:RB'
2.095863 Supp b'-1:lemma:with'
2.093418 O b'lemma:\xcf\x8332'
2.086892 Supp b'lemma:Adenine'
2.083993 Med b'lemma:media'
2.082336 Air b'-1:lemma:-'
2.025473 O b'-1:lemma:glucose'
2.022132 O b'lemma:genotype/variation'
2.014571 Supp b'-2:lemma:shake'
2.009827 O b'lemma:rep2'
2.009827 O b'lemma:rep1'
1.986524 Supp b'-2:lemma:for'
1.979490 Med b'lemma:MOPS'
1.976562 Air b'-1:lemma:co2'
1.976020 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
1.973313 Supp b'lemma:fructose'
1.946098 Supp b'+1:lemma:_'
1.945416 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
1.937064 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
1.936205 Temp b'-1:lemma:37'
1.934883 O b'lemma:ompr'
1.934147 O b'lemma:argr'
1.929224 O b'-1:lemma:pq'
1.927834 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.924683 Technique b'-1:lemma:_'
1.906886 O b'lemma:trpr'
1.906464 Temp b'lemma:37'
1.905323 Supp b'+1:lemma:Deficient'
1.902435 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
1.892088 Technique b'+2:lemma:ph5'
1.876159 Med b'+2:postag:CC'
1.873260 O b'+1:lemma:wt'
1.865153 Supp b'+2:lemma:A'
1.857247 O b'-2:lemma:fructose'
1.855877 Gtype b'lemma:pk4854'
1.851466 Supp b'lemma:arginine'
1.845446 Supp b'-2:lemma:media'
1.840180 Phase b'lemma:stationary'
1.840180 Phase b'lemma:exponential'
1.838088 O b'postag:IN'
1.833527 Phase b'+2:lemma:o.d.'
1.828848 Med b'+2:lemma:b2'
1.826834 O b'-1:lemma:wt'
1.806298 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
1.806298 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
1.796903 Temp b'lemma:43'
1.795358 Supp b'-2:lemma:argr'
1.757619 O b'lemma::'
1.755713 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.755713 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.745625 O b'+2:lemma:crp'
1.738531 Gversion b'lemma:.2'
1.738531 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.725343 Supp b'lemma:Leu'
1.725343 Supp b'-2:lemma:Lrp'
1.704207 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.704207 Gtype b'-1:lemma:old'
1.704207 Gtype b'-2:lemma:seqa'
1.697422 Supp b'+2:lemma:feso4'
1.694596 Med b'-1:lemma:minimal'
1.689322 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.684208 O b'lemma:affyexp'
1.651888 O b'-1:lemma:lb'
1.644199 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
1.638841 O b'lemma:at'
1.636325 Supp b'-2:lemma:agent'
1.631483 Gversion b'-2:lemma:build'
1.629328 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.626909 O b'-1:lemma:type'
1.625781 O b'lemma:harbor'
1.624533 Air b'-2:lemma:fnr'
1.617259 Temp b'-1:lemma:43'
1.610690 O b'-2:lemma:='
1.603282 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.602968 Temp b'-1:lemma:sample'
1.600645 O b'+1:lemma:od600'
1.597882 Gversion b'lemma:u00096'
1.597882 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.591227 O b'+1:lemma:coli'
1.585766 O b'lemma:chip-arca'
1.585766 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.585063 O b'lemma:culture'
1.569897 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.555867 Med b'lemma:medium'
1.544562 Supp b'-1:lemma:final'
1.541054 O b'postag:VBN'
1.538163 Vess b'lemma:flask'
1.538163 Vess b'-1:lemma:warm'
1.538163 Vess b'-2:lemma:pre'
1.538163 Vess b'+2:lemma:43'
1.537246 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.534236 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.532323 Med b'+1:lemma:0.4'
1.527342 O b'lemma:chip-fnr'
1.527342 O b'+2:lemma:fnr8myc'
1.521803 O b'+1:postag:RB'
1.521726 Supp b'-1:lemma:_'
1.507443 Substrain b'-1:lemma:.'
1.507443 Substrain b'-1:postag:.'
1.505768 Supp b'-2:lemma:induce'
1.505638 O b'-1:lemma:nacl'
1.501778 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.496322 O b'-1:lemma:min'
1.463114 Gtype b'+1:lemma:control'
1.462694 O b'-2:lemma:medium'
1.461149 Vess b'-1:postag:VBN'
1.460992 Agit b'lemma:250'
1.457321 O b'lemma:soxr'
1.457321 O b'lemma:soxs'
1.456727 Supp b'lemma:glucose'
1.450989 Air b'-2:lemma:mid-log'
1.448734 Air b'-2:lemma:cm20'
1.443812 Air b'-1:lemma:phase'
1.443027 Air b'-1:lemma:_'
1.435977 Gversion b'-2:postag:VB'
1.431756 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.431160 O b'lemma:input'
1.431160 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.428014 Gtype b'+1:postag::'
1.427089 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.415709 Supp b'lemma:Fe'
1.411848 Med b'lemma:minimal'
1.410822 Med b'-1:lemma:in'
1.405390 Technique b'lemma:rna-seq'
1.400102 Supp b'-2:lemma:purr'
1.388535 Gtype b'+1:lemma:_'
1.382655 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.377952 O b'-1:lemma:aerobic'
1.376779 Technique b'lemma:rnaseq'
1.375898 Technique b'-1:lemma:input'
1.374873 O b'+1:lemma:43'
1.373835 Air b'-2:postag:CD'
1.365250 Air b'+2:postag:CD'
1.364688 Med b'-2:lemma:medium'
1.351072 OD b'lemma:od450'
1.344121 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.336359 Air b'lemma:Anaerobic'
1.334547 Med b'+1:lemma:2.0'
1.333308 Gtype b'postag:JJ'
1.330761 Med b'+2:lemma:b1'
1.328291 O b'+1:lemma:250'
1.328218 Agit b'lemma:rpm'
1.326863 Med b'-2:lemma:minimal'
1.326496 Strain b'+1:lemma:substr'
1.326496 Strain b'-2:lemma:str'
1.323782 Gtype b'-1:lemma:wild'
1.323141 Gtype b'lemma:ptac'
1.320712 pH b'lemma:.5'
1.320712 pH b'-1:lemma:ph5'
1.320312 OD b'+1:postag:IN'
1.320036 Technique b'hLower'
1.315818 Agit b'-1:lemma:250'
1.308232 O b'postag:CC'
1.306376 Gtype b'hUpper'
1.298617 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.297363 Supp b'lemma:dpd'
1.294834 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.290373 O b'+1:lemma:0.2'
1.288065 O b'-1:lemma:-80'
1.287189 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
1.282188 OD b'+1:lemma:of'
1.281747 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.279906 O b'-1:lemma:mg1655'
1.277566 O b'-1:lemma:into'
1.273525 O b'-1:lemma:induce'
1.273040 OD b'-1:lemma:at'
1.267477 Temp b'-2:lemma:keep'
1.263802 Gtype b'-2:lemma:dna'
1.259307 O b'-1:lemma:media'
1.256128 Agit b'+2:lemma:at'
1.255519 O b'-2:ner:MED'
1.254336 Gtype b'+1:lemma:with'
1.253340 Med b'+2:lemma:+'
1.246778 O b'+1:lemma:20'
1.245088 Supp b'-2:lemma:trpr'
1.244859 Supp b'lemma:glutamine'
1.244859 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.241578 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.240623 Vess b'-2:postag:JJ'
1.229560 O b'-2:lemma:overnight'
1.229473 O b'lemma:for'
1.228684 Med b'postag:NNP'
1.225420 Air b'-1:postag::'
1.221064 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.215437 O b'-1:lemma:acetate'
1.214637 Phase b'-2:lemma:until'
1.213978 Strain b'-2:lemma:strain'
1.213965 O b'lemma:chip'
1.210739 Gtype b'lemma:nsrr'
1.210739 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.206442 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.205532 Med b'-2:postag:JJ'
1.203089 Gversion b'lemma:000913'
1.203089 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.201638 O b'-1:lemma:nitrate'
1.201525 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.201525 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.200546 Gtype b'-2:postag:JJ'
1.199748 Air b'-2:lemma:%'
1.196636 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.196282 Supp b'-2:postag:VBG'
1.194651 O b'lemma:additional'
1.194651 O b'+1:lemma:2h'
1.194373 O b'lemma:A'
1.188512 Supp b'postag:NNP'
1.188426 O b'lemma:growth'
1.186378 O b'lemma:gadx'
1.185488 Med b'+1:lemma:+'
1.183851 OD b'lemma:od600'
1.178756 Substrain b'+2:lemma::'
1.175243 Supp b'lemma:30'
1.164550 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.162471 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.161509 Med b'+1:lemma:minimal'
1.158573 O b'lemma:ml'
1.158016 Supp b'+1:lemma:iptg'
1.148156 Vess b'+1:lemma:at'
1.147805 Gtype b'+1:lemma:mg1655'
1.141240 Technique b'-2:postag:NNP'
1.132825 O b'postag:-RRB-'
1.127522 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.126190 OD b'-2:lemma:od450'
1.121817 pH b'lemma:5.5'
1.119760 Supp b'lemma:0.2'
1.116870 O b'lemma:lrp'
1.116670 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.116234 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.115116 Gtype b'+1:lemma::'
1.112052 Technique b'-1:lemma:IP'
1.110688 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.109619 O b'-2:lemma:Leu'
1.105767 Air b'-2:lemma:0.3'
1.105766 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.098413 O b'+1:lemma:mid-log'
1.090747 OD b'lemma:0.3'
1.090005 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
1.088168 Substrain b'+2:postag::'
1.085982 Gtype b'+2:lemma::'
1.084242 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.083928 Supp b'-2:lemma:condition'
1.079384 O b'lemma:cra'
1.073025 Gtype b'lemma:wild'
1.072901 Gtype b'-1:lemma:from'
1.072632 O b'-2:lemma:no3'
1.071262 Phase b'-1:lemma::'
1.068316 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.067767 OD b'+2:lemma:0.3'
1.065794 Supp b'-2:lemma:10'
1.064926 O b'symb'
1.064396 O b'-2:lemma:co2'
1.063437 O b'-2:lemma:min'
1.061664 OD b'lemma:of'
1.060044 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.055425 Gtype b'-1:lemma:_'
1.052648 Gtype b'+2:ner:SUPP'
1.052628 Gtype b'+2:lemma:control'
1.052604 Supp b'-1:lemma:mm'
1.052243 Gversion b'postag:NN'
1.051794 Med b'-1:lemma:ml'
1.048952 O b'+1:lemma:acetate'
1.040905 O b'-2:lemma:Cra'
1.040859 O b'lemma:~'
1.036510 O b'postag:DT'
1.033511 Supp b'+2:postag:-LRB-'
1.032229 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.028329 pH b'-1:postag:NN'
1.025377 Supp b'-1:lemma:30'
1.024120 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
1.023104 Supp b'+2:lemma:add'
1.022547 O b'+2:lemma:k-12'
1.022506 pH b'+1:lemma:5.5'
1.021283 O b'+2:postag:JJ'
1.017989 O b'-1:lemma:l1'
1.016662 OD b'postag:IN'
1.015342 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.011083 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.009847 Gtype b'lemma:WT'
1.007582 Supp b'-1:postag:IN'
1.003175 Supp b'-1:postag:CD'
1.002882 O b'+2:lemma:constant'
1.001652 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.001652 Supp b'+2:lemma:1/100'
0.998541 O b'+2:lemma:chipseq'
0.993386 Supp b'lemma:rifampicin'
0.992329 Gversion b'lemma:nc'
0.992329 Gversion b'+2:lemma:000913'
0.992117 Gtype b'-2:lemma:ecolus'
0.990090 pH b'lemma:ph'
0.988233 O b'+1:ner:MED'
0.985841 Agit b'+1:lemma:rpm'
0.982783 O b'+1:postag:NNP'
0.982144 Air b'-2:postag:SYM'
0.978118 O b'+1:lemma::'
0.977296 O b'lemma:treatment'
0.976199 Air b'+2:lemma:%'
0.974170 Gtype b'+1:lemma:the'
0.973988 Air b'+1:lemma:%'
0.971231 Supp b'+2:lemma:ph'
0.969770 Supp b'+1:lemma:hour'
0.965649 Strain b'+2:lemma:.'
0.965649 Strain b'+2:postag:.'
0.965292 Phase b'lemma:phase'
0.964621 Gtype b'+2:postag::'
0.963918 Supp b'lemma:Trp'
0.961111 Anti b'-2:lemma:purify'
0.958833 Strain b'-1:lemma:.'
0.958833 Strain b'-1:postag:.'
0.955582 Gtype b'lemma:Wild'
0.952812 O b'lemma:-80'
0.952812 O b'-2:lemma:freeze'
0.951502 O b'lemma:s'
0.951502 O b'-2:lemma:parameter'
0.944056 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
0.943246 Air b'lemma:%'
0.943094 O b'-2:lemma:ml'
0.941566 Technique b'+1:postag:NN'
0.938606 Temp b'-2:postag:VBD'
0.938236 Med b'-1:postag:JJ'
0.937796 OD b'-1:lemma:od450'
0.932717 Supp b'lemma:tryptophan'
0.932717 Supp b'-1:lemma:mg/l'
0.930888 Agit b'-2:postag:RB'
0.925518 Supp b'-2:lemma:20'
0.925093 Phase b'-1:lemma:until'
0.923555 Med b'-1:lemma::'
0.920144 O b'lemma:-lrb-'
0.918492 Gtype b'-2:lemma:delta'
0.912590 Air b'+2:lemma:37'
0.911295 Supp b'+2:postag:IN'
0.911141 pH b'-2:lemma:at'
0.909627 Agit b'+2:postag:IN'
0.909291 O b'+1:lemma:ph5'
0.909291 O b'+2:lemma:.5'
0.907336 Supp b'-2:lemma:+'
0.906749 O b'+2:lemma:of'
0.906651 O b'lemma:+'
0.906223 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
0.903563 Gtype b'+1:ner:GEN'
0.903540 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.903540 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.898200 Supp b'-1:lemma:potassium'
0.898200 Supp b'-2:lemma:mmol'
0.897319 Supp b'-1:lemma:vol'
0.897319 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.897319 Supp b'+2:lemma:1m'
0.894638 Med b'postag:NNS'
0.893422 Supp b'+1:lemma:deficient'
0.892162 Supp b'-1:lemma:contain'
0.891478 Gtype b'+2:lemma:lacz'
0.886753 Gversion b'lemma:_'
0.885484 O b'-1:lemma:genbank'
0.885328 Gtype b'-2:postag:NNS'
0.882828 Supp b'-1:lemma:respiration'
0.882828 Supp b'+1:lemma:mmol'
0.882828 Supp b'+2:lemma:potassium'
0.882507 O b'-1:ner:TF'
0.877410 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
0.871253 Anti b'-1:lemma::'
0.870435 Anti b'-1:lemma:fnr'
0.868684 OD b'-1:postag:IN'
0.867431 O b'lemma:E.'
0.865560 Anti b'+2:postag:NNP'
0.865137 O b'+1:postag::'
0.863636 Gtype b'lemma:wild-type'
0.861653 Gtype b'-1:lemma:vector'
0.860990 O b'-2:lemma:mid-log'
0.860900 O b'-1:lemma:dpd'
0.859587 pH b'-1:lemma:ph'
0.855490 O b'postag:VBD'
0.855087 Technique b'lemma:chip-exo'
0.852533 O b'lemma:oxyr'
0.849874 Anti b'hGreek'
0.849572 Phase b'-1:postag::'
0.845725 O b'+1:lemma:nacl'
0.845505 Supp b'-2:lemma:pahse'
0.845326 O b'-1:lemma:4'
0.844332 O b'postag:-LRB-'
0.844257 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.844190 O b'+1:lemma:30'
0.842457 Supp b'lemma:2g/l'
0.842457 Supp b'+1:lemma:glutamine'
0.842323 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.840981 Air b'-2:lemma:nh4cl'
0.837743 Gtype b'lemma:phtpg'
0.837693 O b'-1:lemma:genotype'
0.834922 Air b'+1:lemma:b'
0.833740 Supp b'-1:lemma:soxr'
0.833740 Supp b'-1:lemma:soxs'
0.833221 O b'-1:lemma:fructose'
0.832583 Technique b'+2:postag:-RRB-'
0.831623 Temp b'+1:ner:_'
0.831533 O b'postag:NNS'
0.830377 O b'-1:ner:_'
0.827912 Technique b'+1:ner:TF'
0.827265 O b'+2:lemma:w/v'
0.822337 O b'+2:lemma:_'
0.819423 O b'-1:lemma:nh4cl'
0.819364 Med b'+1:lemma:medium'
0.818752 Supp b'+1:lemma:mm'
0.818752 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
0.818265 Supp b'+1:lemma:1m'
0.818265 Supp b'-2:lemma:vol'
0.816713 O b'+2:lemma:acetate'
0.815662 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.814591 Gtype b'-2:lemma:of'
0.814578 O b'-1:lemma:antibody'
0.814397 Anti b'-2:lemma:polymerase'
0.813374 Temp b'+1:postag:JJ'
0.807713 Supp b'+2:lemma:b'
0.804931 Med b'-1:ner:MED'
0.800285 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
0.800285 Anti b'+2:lemma:NeoClone'
0.800272 Gtype b'+2:lemma:tag'
0.799338 Gversion b'+1:lemma:genome'
0.799337 Gtype b'+2:lemma:rep2'
0.799337 Gtype b'+2:lemma:rep1'
0.797431 Gtype b'lemma:crp'
0.796966 Supp b'+1:lemma:mg/l'
0.796966 Supp b'+2:lemma:tryptophan'
0.796439 O b'lemma:-rrb-'
0.796338 Gtype b'hLower'
0.796273 O b'+2:lemma:aerobically'
Top negative:
-0.015381 OD b'-2:lemma:a'
-0.015817 Temp b'+2:postag:JJ'
-0.015905 O b'-2:lemma:into'
-0.016429 Med b'-2:lemma:m9'
-0.017127 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.017459 Air b'-2:postag:-LRB-'
-0.017930 O b'-1:lemma:70'
-0.018031 Supp b'lemma:.'
-0.018031 Supp b'postag:.'
-0.018430 O b'-2:lemma:95'
-0.019085 O b'lemma:purify'
-0.019523 O b'-2:postag:JJ'
-0.019928 Air b'-2:lemma:-lrb-'
-0.020252 O b'+2:lemma:0.4'
-0.020759 OD b'lemma:2.0'
-0.021426 Air b'-1:postag:CC'
-0.022114 Gversion b'+1:ner:_'
-0.023757 Supp b'postag:CD'
-0.023839 O b'-1:lemma:purify'
-0.024186 O b'hUpper'
-0.024246 OD b'+1:lemma:for'
-0.024779 Supp b'+2:lemma:mm'
-0.024779 Supp b'+2:ner:KWSUPP'
-0.025074 O b'+1:lemma:culture'
-0.025846 O b'+1:lemma:95'
-0.026111 Supp b'+2:lemma:with'
-0.026482 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.026511 O b'postag:VB'
-0.026809 O b'+2:lemma:medium'
-0.028894 O b'-2:lemma:-rrb-'
-0.029077 Supp b'-2:lemma:;'
-0.029171 O b'+2:lemma:mg1655'
-0.029514 O b'-2:lemma:purify'
-0.030391 O b'+2:lemma:-lrb-'
-0.031394 Gtype b'lemma:-lrb-'
-0.032214 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.033420 O b'lemma:mg/ml'
-0.033420 O b'-1:lemma:150'
-0.035161 Gtype b'postag:NNP'
-0.035708 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.036462 Air b'lemma:anaerobically'
-0.037388 O b'-2:lemma:ph'
-0.038301 Phase b'+1:postag:NN'
-0.038538 Supp b'+2:lemma:final'
-0.038550 Supp b'postag:IN'
-0.039230 O b'+1:lemma:mm'
-0.039230 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.039871 Supp b'-1:lemma:.'
-0.039871 Supp b'-1:postag:.'
-0.040262 Med b'-1:lemma:m63'
-0.041458 Air b'-1:lemma:anaerobically'
-0.042236 Gtype b'-1:ner:_'
-0.042758 Air b'-2:postag:VBD'
-0.043037 O b'+2:lemma:o2'
-0.043324 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.044535 O b'+2:lemma:then'
-0.045014 O b'+2:lemma:95'
-0.045147 O b'-2:lemma:5'
-0.045320 O b'-1:lemma:250'
-0.045365 Supp b'+2:postag::'
-0.045502 Air b'-2:ner:TF'
-0.046123 O b'-2:lemma:70'
-0.048528 O b'lemma:final'
-0.050351 OD b'-2:postag:DT'
-0.051213 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.051533 Gversion b'-1:ner:_'
-0.051566 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.052785 OD b'+2:lemma:a'
-0.055516 O b'+1:lemma:anaerobically'
-0.055876 O b'+1:lemma:25'
-0.057151 Supp b'-1:lemma:10'
-0.057474 O b'-1:lemma:with'
-0.059912 O b'-1:lemma:0.1'
-0.060117 O b'-2:lemma:stir'
-0.060198 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.061051 Air b'-1:postag:VBN'
-0.061912 O b'lemma:\xc3\x9f'
-0.062386 O b'lemma:phase'
-0.064190 O b'+2:postag:IN'
-0.066154 O b'+2:ner:SUPP'
-0.066796 O b'+1:lemma:7.6'
-0.066796 O b'-2:lemma:1m'
-0.066796 O b'+2:lemma:;'
-0.067576 Gtype b'-1:postag::'
-0.067583 Substrain b'-2:ner:_'
-0.071219 O b'+2:lemma:media'
-0.071498 OD b'+2:postag:RB'
-0.071726 Supp b'-2:lemma:.'
-0.071726 Supp b'-2:postag:.'
-0.072417 O b'+1:lemma:contain'
-0.074087 O b'-2:lemma:grow'
-0.074686 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.076979 O b'+1:lemma:from'
-0.077264 O b'-1:lemma:in'
-0.077416 O b'postag:NN'
-0.078214 O b'-2:lemma:25'
-0.078307 O b'-2:lemma:%'
-0.078327 O b'lemma:hour'
-0.079234 Supp b'-1:lemma:20'
-0.081168 Gtype b'+2:lemma:cra'
-0.081907 O b'+1:lemma:70'
-0.082160 O b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.083263 O b'+1:lemma:the'
-0.083827 O b'+1:lemma:o2'
-0.083854 O b'-2:lemma:1'
-0.084391 O b'+1:lemma:min'
-0.085579 Supp b'-2:postag:NNS'
-0.085636 O b'+1:lemma:ph'
-0.086173 O b'-2:postag:VB'
-0.087087 O b'-2:lemma:control'
-0.088418 O b'+1:lemma:a'
-0.089060 Vess b'-1:ner:_'
-0.090695 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.091111 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.092701 Supp b'hLower'
-0.094541 O b'lemma:dpd'
-0.094957 O b'+2:lemma:ph'
-0.095842 Med b'-2:lemma:grow'
-0.095897 Med b'-2:ner:MED'
-0.096038 Air b'symb'
-0.096391 O b'-1:lemma:o2'
-0.096592 Gtype b'postag::'
-0.097814 O b'+1:lemma:co2'
-0.098788 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.100464 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.100519 O b'-1:lemma:~'
-0.100941 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.102084 Med b'lemma:-lrb-'
-0.102219 Air b'-1:lemma::'
-0.102270 Supp b'-1:postag:DT'
-0.102646 O b'+1:lemma:.'
-0.102646 O b'+1:postag:.'
-0.104320 O b'+1:lemma:1/100'
-0.104320 O b'-2:lemma:sodium'
-0.104320 O b'+2:lemma:vol'
-0.104527 O b'-2:lemma:10'
-0.104887 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.105092 O b'-2:lemma:to'
-0.105092 O b'-2:postag:TO'
-0.105608 Air b'-2:lemma:be'
-0.106308 Strain b'+1:ner:_'
-0.107848 O b'+2:lemma:total'
-0.108192 Med b'+2:ner:MED'
-0.110872 O b'+1:lemma:10'
-0.111297 O b'lemma:o2'
-0.111411 O b'lemma:5'
-0.113209 O b'+1:lemma:gadx'
-0.113583 Med b'+2:postag:VBG'
-0.113714 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.115783 Gversion b'symb'
-0.116483 O b'-1:lemma:%'
-0.116746 O b'+1:lemma:5'
-0.117633 O b'+1:lemma:2.0'
-0.117715 O b'+2:lemma:before'
-0.118644 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.120484 O b'-2:lemma:o2'
-0.120561 Temp b'-2:postag:NN'
-0.121330 Technique b'-2:postag:NN'
-0.121408 O b'+2:lemma:in'
-0.121607 pH b'hUpper'
-0.124125 O b'-1:lemma:gadx'
-0.124357 O b'+2:lemma:~'
-0.125465 Med b'-1:postag:IN'
-0.126380 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.126936 Anti b'postag:CD'
-0.127052 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.127317 O b'lemma:phosphate'
-0.127597 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.128373 Supp b'postag:CC'
-0.128700 O b'lemma:m'
-0.129427 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.130291 Air b'+2:ner:_'
-0.130424 O b'+2:lemma:use'
-0.137171 O b'-1:postag:VBG'
-0.137784 Supp b'lemma:paraquat'
-0.137784 Supp b'-2:lemma:um'
-0.138517 O b'-2:lemma:0.1'
-0.139132 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.145195 O b'-1:lemma:iptg'
-0.145710 O b'-2:lemma:rna'
-0.145972 O b'+1:lemma:b'
-0.146572 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.147871 O b'-1:postag:VB'
-0.147983 Supp b'-2:postag:NN'
-0.148850 O b'+2:lemma:rna'
-0.150970 O b'lemma:nitrate'
-0.154049 Supp b'-2:lemma:glucose'
-0.155153 Temp b'-1:postag:IN'
-0.155565 Vess b'symb'
-0.156356 OD b'lemma:='
-0.162954 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.163434 O b'-1:lemma:control'
-0.164070 Technique b'+2:ner:_'
-0.166437 Air b'-2:postag:CC'
-0.167034 OD b'+2:postag:NN'
-0.168335 O b'+1:lemma:minimal'
-0.169937 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.172144 O b'+1:lemma:of'
-0.173289 Air b'-1:lemma:grow'
-0.174296 O b'lemma:glucose'
-0.174832 Gtype b'-1:lemma:-'
-0.176015 Med b'+2:lemma:supplement'
-0.176574 Med b'postag:-LRB-'
-0.177331 O b'-2:lemma:chip-exo'
-0.177599 O b'-1:postag:DT'
-0.178063 O b'lemma:co2'
-0.181823 O b'-2:lemma:for'
-0.182290 O b'+2:lemma:the'
-0.182595 O b'+2:lemma:follow'
-0.186667 O b'+2:lemma:n2'
-0.186822 O b'lemma:0.1'
-0.188077 Gtype b'+1:lemma:crp'
-0.189970 O b'+2:lemma:37'
-0.191863 Med b'+1:ner:MED'
-0.192601 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.194138 O b'lemma:150'
-0.194138 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.194138 O b'-2:lemma:concentration'
-0.195052 O b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.195061 Supp b'-2:postag:VBD'
-0.195726 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.196588 O b'-2:postag:RB'
-0.196659 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.197705 O b'-1:lemma:of'
-0.200230 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.200247 O b'+1:lemma:~'
-0.200544 Supp b'+2:postag:NN'
-0.201268 O b'-2:lemma:fnr'
-0.201299 O b'-2:lemma:phase'
-0.202985 O b'+2:lemma:agitation'
-0.203362 Temp b'-2:postag:JJ'
-0.203689 Med b'-2:postag:VBN'
-0.205889 Supp b'lemma:um'
-0.205889 Supp b'+2:lemma:paraquat'
-0.208379 Agit b'hLower'
-0.209845 O b'lemma:;'
-0.209845 O b'-1:lemma:7.6'
-0.216076 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.221206 Med b'+2:lemma:contain'
-0.221227 O b'-1:lemma:the'
-0.224664 O b'+2:lemma:pk4854'
-0.225091 O b'-2:postag:DT'
-0.226094 Med b'-2:lemma:m63'
-0.226950 pH b'-2:ner:_'
-0.227258 O b'lemma:20'
-0.228168 O b'lemma:dissolve'
-0.228168 O b'+2:lemma:methanol'
-0.228260 O b'-1:lemma:m'
-0.228957 O b'postag:JJ'
-0.230494 O b'lemma:methanol'
-0.230494 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.231558 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.232217 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.233292 O b'+2:lemma:rnase'
-0.233810 O b'lemma:ph'
-0.236721 O b'-1:postag:IN'
-0.236795 O b'-2:lemma:n2'
-0.238209 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.242999 O b'-2:lemma:antibody'
-0.245023 O b'+1:lemma:genome'
-0.247707 O b'lemma:1m'
-0.249098 O b'+1:lemma:media'
-0.252343 Med b'+1:postag:IN'
-0.256716 O b'+1:postag:NNS'
-0.259403 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.262232 Med b'+1:postag:NN'
-0.263013 O b'lemma:fecl2'
-0.268134 Temp b'+1:postag:IN'
-0.269106 Air b'lemma:n2'
-0.271219 Med b'postag:CD'
-0.272683 Supp b'-1:lemma:250'
-0.273827 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.275423 Supp b'-2:lemma:grow'
-0.275494 O b'+2:lemma:0.3'
-0.276501 O b'lemma:7.6'
-0.276501 O b'+1:lemma:;'
-0.277850 O b'-1:lemma:n2'
-0.279486 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.281379 Anti b'postag:NNP'
-0.288042 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.289655 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.290705 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.290705 Gtype b'+1:postag:,'
-0.291852 O b'+1:lemma:_'
-0.293692 O b'-1:lemma:sodium'
-0.293692 O b'+2:lemma:1/100'
-0.297437 O b'-2:lemma:genotype/variation'
-0.303605 O b'-1:lemma:g/l'
-0.305756 Temp b'+2:postag:IN'
-0.307623 Air b'+2:lemma:70'
-0.314284 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.314585 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.316131 Supp b'+2:ner:_'
-0.316466 O b'+2:lemma:at'
-0.320010 O b'-1:lemma:0.2'
-0.321672 O b'-1:lemma:.'
-0.321672 O b'-1:postag:.'
-0.322847 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.323396 pH b'+2:ner:_'
-0.328390 O b'-1:lemma:1m'
-0.328390 O b'+2:lemma:7.6'
-0.329180 O b'-2:lemma:supplement'
-0.335885 O b'+2:lemma:co2'
-0.340366 O b'+1:postag:VB'
-0.341554 O b'+1:lemma:%'
-0.344236 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.344236 O b'+1:lemma:methanol'
-0.345428 O b'+2:lemma:add'
-0.345533 O b'-2:lemma:m'
-0.347658 Gversion b'hLower'
-0.348790 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.349938 O b'-1:lemma:mm'
-0.353344 O b'-2:lemma:minimal'
-0.357095 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.360703 O b'lemma:pahse'
-0.361641 O b'+1:lemma:supplement'
-0.366689 Supp b'+2:lemma:and'
-0.372327 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.374699 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.376816 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.378345 O b'-2:lemma:of'
-0.379964 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.379964 Gtype b'-1:postag:,'
-0.382326 O b'+1:lemma:300'
-0.393813 O b'+2:lemma:m9'
-0.399006 O b'+1:lemma:until'
-0.402736 O b'-2:lemma::'
-0.405029 O b'-1:lemma:minimal'
-0.406241 O b'+2:lemma:.'
-0.406241 O b'+2:postag:.'
-0.411301 O b'+2:lemma:250'
-0.417494 Supp b'+2:postag:CC'
-0.420706 Temp b'+1:lemma:with'
-0.425046 Gtype b'+1:ner:_'
-0.431806 O b'+1:lemma:1m'
-0.431806 O b'-2:lemma:vol'
-0.432010 Temp b'postag:NN'
-0.432372 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.434741 O b'+1:postag:CD'
-0.435858 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.437282 O b'-2:lemma:g/l'
-0.444347 Technique b'-2:ner:_'
-0.444405 O b'-1:lemma:until'
-0.444797 O b'+2:postag:RB'
-0.453211 Temp b'-2:postag:CD'
-0.453871 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.458460 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.465187 O b'-2:ner:SUPP'
-0.466821 O b'+1:lemma:sample'
-0.475059 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.475719 O b'+2:lemma:reference'
-0.475815 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.476952 Temp b'hGreek'
-0.480754 O b'lemma:od600'
-0.481572 Substrain b'-1:ner:_'
-0.483040 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.487295 Temp b'+2:lemma:with'
-0.493877 Substrain b'hLower'
-0.494919 O b'-1:ner:SUPP'
-0.502653 Med b'-1:ner:_'
-0.510708 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.511561 Technique b'-1:lemma::'
-0.512363 O b'lemma:rifampicin'
-0.514245 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.519296 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.524169 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.525731 O b'lemma:0.2'
-0.527697 O b'lemma:lb'
-0.532014 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.532818 O b'-1:lemma:fresh'
-0.533994 O b'-2:lemma:100'
-0.535999 O b'-2:lemma:20'
-0.540987 O b'-1:ner:GEN'
-0.546756 O b'-2:postag:SYM'
-0.550714 O b'lemma:medium'
-0.551452 O b'+2:lemma:sample'
-0.551596 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.553001 O b'-1:lemma:rna'
-0.569529 O b'-2:postag::'
-0.570722 Air b'+2:postag:IN'
-0.575880 O b'+1:lemma:at'
-0.580363 Air b'postag:NN'
-0.580982 O b'+2:lemma:antibody'
-0.583644 O b'-2:lemma:fresh'
-0.590020 Gtype b'symb'
-0.594519 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.606357 Technique b'-1:postag::'
-0.609061 O b'-2:lemma:dna'
-0.609381 Anti b'hUpper'
-0.610204 O b'postag:RB'
-0.617971 O b'lemma:m63'
-0.629892 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.637235 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.649357 Med b'hLower'
-0.649761 O b'+2:lemma:tag'
-0.650154 O b'+1:lemma:m'
-0.650802 O b'-2:lemma:50'
-0.659813 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.660185 O b'-1:lemma:IP'
-0.660682 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.670618 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.671415 O b'-1:lemma:ml'
-0.677360 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.677819 O b'lemma:mid-log'
-0.678123 O b'-2:lemma:rpob'
-0.678812 O b'-2:lemma:pahse'
-0.685283 O b'-1:lemma:1'
-0.688168 Med b'-1:postag:NN'
-0.690057 Anti b'+2:ner:_'
-0.691228 O b'+2:lemma:genome'
-0.691879 O b'+1:lemma:in'
-0.702260 O b'-1:lemma:vol'
-0.702260 O b'-2:lemma:1/100'
-0.702260 O b'+2:lemma:1m'
-0.719857 Supp b'lemma:1'
-0.726039 O b'lemma:sample'
-0.727234 O b'-1:lemma:rpob'
-0.733013 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.735684 O b'lemma:250'
-0.738650 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.740368 O b'+2:lemma:fnr'
-0.752878 O b'-1:lemma:37'
-0.767809 Supp b'+1:lemma:,'
-0.767809 Supp b'+1:postag:,'
-0.768737 O b'-1:lemma:30'
-0.782174 OD b'hLower'
-0.802103 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.806700 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.832528 OD b'+1:postag:NN'
-0.839734 Phase b'symb'
-0.839857 O b'-2:lemma:until'
-0.840069 O b'+1:lemma:g/l'
-0.841747 O b'lemma:fructose'
-0.851736 Supp b'+2:lemma:2'
-0.859227 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.859502 O b'+1:lemma:hour'
-0.881726 Supp b'+2:postag:CD'
-0.882184 pH b'symb'
-0.888518 O b'lemma:of'
-0.902331 O b'+1:lemma:+'
-0.904086 O b'lemma:37'
-0.920204 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.923699 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.926893 O b'-2:lemma:genome'
-0.936529 O b'-2:lemma:the'
-0.936969 O b'-1:lemma:contain'
-0.954686 O b'-1:lemma:final'
-0.961056 O b'lemma:minimal'
-0.963856 Vess b'hUpper'
-0.964145 Phase b'postag:JJ'
-0.978565 O b'+1:postag:IN'
-0.993759 OD b'hUpper'
-0.996016 O b'-2:lemma:iptg'
-0.996550 Strain b'hLower'
-1.013899 Agit b'hUpper'
-1.022818 O b'-1:lemma:co2'
-1.023274 O b'hGreek'
-1.049586 O b'-2:lemma:dpd'
-1.072527 O b'+2:lemma:10'
-1.073555 O b'lemma:anaerobic'
-1.111303 O b'lemma:nh4cl'
-1.122386 Temp b'hLower'
-1.132294 Strain b'symb'
-1.139266 O b'+2:lemma:+'
-1.150847 Supp b'hGreek'
-1.160953 O b'-2:ner:TF'
-1.164299 Supp b'lemma:2'
-1.177991 Supp b'+2:lemma:1'
-1.180190 Technique b'+1:ner:_'
-1.209107 O b'-1:lemma:2'
-1.211779 O b'+1:postag:DT'
-1.231918 O b'-2:postag:VBG'
-1.234151 O b'-1:lemma:ph'
-1.238025 O b'lemma:30'
-1.247647 O b'-1:postag::'
-1.342117 O b'-2:lemma:media'
-1.352974 O b'-1:lemma:sample'
-1.358566 O b'lemma:nacl'
-1.369382 O b'lemma:aerobic'
-1.416429 O b'+2:lemma:rifampicin'
-1.423714 Gtype b'postag:VBG'
-1.442559 O b'lemma:media'
-1.447086 Med b'+2:postag:VBN'
-1.501436 Gtype b'-2:postag:CD'
-1.547789 O b'-2:lemma:0.3'
-1.556949 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.607478 Supp b'postag:JJ'
-1.659050 O b'-2:lemma:IP'
-1.686327 O b'lemma:wt'
-1.750533 O b'+2:lemma:b'
-1.763896 O b'lemma:0.3'
-1.874895 O b'+1:lemma:2'
-1.975252 OD b'+2:lemma:aerobically'
-2.066175 O b'+2:lemma:iptg'
-2.105793 O b'lemma:aerobically'
-2.223715 O b'+1:lemma:1'
-2.500727 Phase b'hUpper'
-2.682007 Technique b'symb'
-2.978275 O b'-1:lemma::'
-3.749103 O b'-1:lemma:_'