report_Run13_v13.txt 37.6 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.17648634668672483, 'c2': 0.03607970199483428}
best CV score:0.8295597513348965
model size: 0.09M

Flat F1: 0.8165354169753308
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.912     0.795     0.849        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.853     0.853     0.853       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.854     0.787     0.817       484


Top likely transitions:
Med    -> Med     5.302753
Temp   -> Temp    5.286134
OD     -> OD      5.161295
Supp   -> Supp    5.044735
Air    -> Air     4.924694
Anti   -> Anti    4.660634
Gversion -> Gversion 4.248826
Phase  -> Phase   3.876386
Gtype  -> Gtype   3.693346
pH     -> pH      3.670925
Technique -> Technique 3.439048
O      -> O       3.023459
Agit   -> Agit    1.910875
Technique -> Air     1.462114
Substrain -> Gtype   1.280888
Air    -> O       1.094292
O      -> Supp    0.912111
O      -> Technique 0.721338
Gtype  -> Supp    0.691993
Gtype  -> pH      0.096946
O      -> Med     0.047580
O      -> Gtype   0.035857
Anti   -> O       0.033119
Gtype  -> Air     0.009628
Temp   -> O       0.001856
Phase  -> Air     0.000002
Gtype  -> Gversion -0.019699
Supp   -> O       -0.071842
Anti   -> Gtype   -0.099258
Gversion -> O       -0.103060
O      -> Phase   -0.202116
O      -> Anti    -0.248296
Gtype  -> Med     -0.310582
Gtype  -> Technique -0.317405
O      -> OD      -0.415119
OD     -> Air     -0.420154
Supp   -> Gtype   -0.437286
OD     -> O       -0.439517
Supp   -> Med     -0.639457
Technique -> pH      -0.783647
Phase  -> OD      -0.921815
O      -> Air     -1.015684
Technique -> Gtype   -1.047891
Gtype  -> O       -1.179437
Med    -> Supp    -1.314538
Substrain -> O       -1.413155


Top unlikely transitions:
Med    -> Med     5.302753
Temp   -> Temp    5.286134
OD     -> OD      5.161295
Supp   -> Supp    5.044735
Air    -> Air     4.924694
Anti   -> Anti    4.660634
Gversion -> Gversion 4.248826
Phase  -> Phase   3.876386
Gtype  -> Gtype   3.693346
pH     -> pH      3.670925
Technique -> Technique 3.439048
O      -> O       3.023459
Agit   -> Agit    1.910875
Technique -> Air     1.462114
Substrain -> Gtype   1.280888
Air    -> O       1.094292
O      -> Supp    0.912111
O      -> Technique 0.721338
Gtype  -> Supp    0.691993
Gtype  -> pH      0.096946
O      -> Med     0.047580
O      -> Gtype   0.035857
Anti   -> O       0.033119
Gtype  -> Air     0.009628
Temp   -> O       0.001856
Phase  -> Air     0.000002
Gtype  -> Gversion -0.019699
Supp   -> O       -0.071842
Anti   -> Gtype   -0.099258
Gversion -> O       -0.103060
O      -> Phase   -0.202116
O      -> Anti    -0.248296
Gtype  -> Med     -0.310582
Gtype  -> Technique -0.317405
O      -> OD      -0.415119
OD     -> Air     -0.420154
Supp   -> Gtype   -0.437286
OD     -> O       -0.439517
Supp   -> Med     -0.639457
Technique -> pH      -0.783647
Phase  -> OD      -0.921815
O      -> Air     -1.015684
Technique -> Gtype   -1.047891
Gtype  -> O       -1.179437
Med    -> Supp    -1.314538
Substrain -> O       -1.413155


Top positive:
5.876209 O        b'lemma:_'
5.791210 O        b'lemma:1'
5.345891 O        b'lemma:2'
5.135735 Anti     b'-2:lemma:antibody'
4.966278 Phase    b'lemma:mid-log'
4.756858 Air      b'lemma:anaerobic'
4.445739 Technique b'lemma:chipseq'
4.419499 Supp     b'lemma:no3'
4.397196 O        b'lemma:3'
4.363328 Gtype    b'lemma:wt'
4.049388 Supp     b'lemma:pq'
3.965771 Strain   b'lemma:k-12'
3.963259 O        b'-2:lemma:_'
3.956771 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
3.847291 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
3.788158 Gtype    b'lemma:type'
3.692954 Phase    b'-2:lemma:phase'
3.650988 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
3.618126 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.607264 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.593547 Supp     b'lemma:Iron'
3.593547 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.470992 O        b'lemma:Cra'
3.407316 O        b'postag::'
3.388150 O        b'lemma:-'
3.364484 O        b'lemma:b'
3.360536 O        b'postag:IN'
3.326638 O        b'lemma:.'
3.326638 O        b'postag:.'
3.309515 O        b'postag:VBG'
3.283229 Technique b'lemma:rna-seq'
3.280682 O        b'lemma:rpob'
3.255208 O        b'lemma:with'
3.145503 Supp     b'lemma:2h'
3.145503 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.115799 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
3.107602 Air      b'-2:lemma:IP'
3.083867 Air      b'lemma:aerobically'
2.998264 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.992863 Supp     b'-2:lemma:shake'
2.971329 Technique b'+2:lemma:ph5'
2.968986 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.967954 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
2.940772 Gtype    b'+1:lemma:type'
2.925086 Air      b'lemma:aerobic'
2.912095 Supp     b'lemma:iptg'
2.872123 Med      b'lemma:lb'
2.871107 Substrain b'lemma:mg1655'
2.806381 Supp     b'lemma:nh4cl'
2.789760 Med      b'lemma:LB'
2.679231 Supp     b'-1:ner:SUPP'
2.656518 Technique b'lemma:chip-seq'
2.634355 Supp     b'lemma:nacl'
2.590890 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.573133 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.570816 Gtype    b'lemma:dfnr'
2.546565 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
2.509766 O        b'postag:VBN'
2.481095 O        b'-1:lemma:type'
2.455819 O        b'-1:lemma:tag'
2.428384 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
2.422327 Med      b'lemma:m63'
2.413901 O        b'-2:lemma:myc'
2.401329 O        b'lemma:a'
2.390312 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.388884 Gtype    b'-1:ner:GEN'
2.363167 O        b'+1:lemma:wt'
2.352430 Gtype    b'lemma:pk4854'
2.350410 O        b'+2:lemma:crp'
2.343454 Supp     b'+1:lemma:1'
2.326555 Air      b'-1:lemma:-'
2.322535 O        b'-1:postag:NNS'
2.320519 Supp     b'lemma:Adenine'
2.317757 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.310130 Technique b'lemma:chip-exo'
2.309984 Med      b'+2:lemma:b2'
2.307580 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.268031 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.247152 O        b'lemma:purr'
2.244603 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.228179 Supp     b'lemma:acetate'
2.197815 pH       b'lemma:ph5'
2.197815 pH       b'+1:lemma:.5'
2.196389 O        b'lemma:rep2'
2.196389 O        b'lemma:rep1'
2.186023 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.178921 O        b'lemma:CEL'
2.176768 O        b'lemma:harbor'
2.152412 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.148245 O        b'lemma:affyexp'
2.146196 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.135580 Supp     b'-1:lemma:with'
2.134177 pH       b'+1:postag:CD'
2.133941 Supp     b'-2:lemma:media'
2.132276 Supp     b'+1:lemma:2'
2.126581 O        b'postag:CC'
2.125297 O        b'lemma:soxr'
2.125297 O        b'lemma:soxs'
2.098865 Gtype    b'+1:lemma:with'
2.082730 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.070923 O        b'-1:lemma:lb'
2.064367 Med      b'lemma:MOPS'
2.030502 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.027493 Temp     b'-1:lemma:37'
2.010535 Technique b'-2:lemma:wt'
2.009428 Technique b'-2:lemma:Fur'
2.008572 Gversion b'lemma:.2'
2.008572 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.997435 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.997389 Temp     b'lemma:37'
1.974979 Supp     b'lemma:fructose'
1.972725 Supp     b'+2:lemma:iptg'
1.965590 O        b'lemma:argr'
1.953568 O        b'-1:lemma:glucose'
1.951184 Gtype    b'+1:lemma:pq'
1.947971 Supp     b'-1:lemma:Cra'
1.934930 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
1.932801 Air      b'lemma:anaeroibc'
1.927548 O        b'lemma:ompr'
1.909841 O        b'-1:lemma:pq'
1.880233 Med      b'lemma:media'
1.868361 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.854599 O        b'lemma:chip'
1.851790 Gtype    b'lemma:ptac'
1.843716 O        b'+1:postag:RB'
1.843251 O        b'lemma:trpr'
1.842473 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
1.822561 O        b'-1:lemma:nacl'
1.818058 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.812137 Supp     b'-1:lemma:+'
1.808472 Temp     b'-1:lemma:sample'
1.803086 O        b'+1:lemma:pq'
1.801234 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
1.801234 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
1.800843 O        b'-1:lemma:0.3'
1.799161 O        b'lemma:culture'
1.785564 O        b'-2:lemma:='
1.752797 O        b'lemma:genotype/variation'
1.752287 O        b'+1:lemma:coli'
1.750543 Air      b'postag:JJ'
1.744023 OD       b'lemma:od600'
1.740940 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.740940 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.725892 Med      b'+2:postag:CC'
1.724939 O        b'lemma:treatment'
1.723726 Air      b'postag:RB'
1.718470 Temp     b'lemma:43'
1.718147 Gversion b'lemma:u00096'
1.718147 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.709267 Phase    b'lemma:stationary'
1.709267 Phase    b'lemma:exponential'
1.705518 Supp     b'lemma:arginine'
1.692582 O        b'lemma:growth'
1.691955 Supp     b'-1:lemma:_'
1.686787 Supp     b'-1:postag:CD'
1.676418 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
1.676418 Gtype    b'+2:lemma:.5'
1.666347 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.657187 O        b'lemma:\xcf\x8332'
1.655560 Air      b'-1:lemma:co2'
1.654962 O        b'lemma:input'
1.654962 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.653035 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.651880 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.649373 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.642637 O        b'-2:lemma:fructose'
1.633292 Vess     b'lemma:flask'
1.633292 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.633292 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.633292 Vess     b'+2:lemma:43'
1.617722 O        b'lemma:at'
1.616546 Temp     b'-1:lemma:43'
1.615697 OD       b'lemma:0.3'
1.612287 Agit     b'lemma:rpm'
1.612206 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
1.604214 O        b'postag:NNS'
1.601544 Med      b'+2:lemma:b1'
1.597839 Supp     b'-2:lemma:agent'
1.578305 O        b'lemma:gadx'
1.569251 Technique b'-1:lemma:IP'
1.562079 Agit     b'-1:lemma:250'
1.557544 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
1.551409 O        b'-2:ner:MED'
1.549350 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.548582 Supp     b'-2:lemma:for'
1.541612 Med      b'-1:lemma:in'
1.539347 Gtype    b'postag:JJ'
1.533964 Supp     b'+1:lemma:_'
1.532522 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.532409 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.532409 Strain   b'-2:lemma:str'
1.527554 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.527330 Med      b'+2:lemma:+'
1.523255 Supp     b'lemma:Leu'
1.523255 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
1.515833 O        b'-1:lemma:min'
1.496992 Supp     b'+2:lemma:feso4'
1.491372 Air      b'-1:lemma:_'
1.488276 Med      b'+1:lemma:0.4'
1.484846 Gversion b'-2:lemma:build'
1.484227 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.482655 Supp     b'lemma:dpd'
1.474476 OD       b'lemma:od450'
1.473579 O        b'+1:lemma:od600'
1.468863 O        b'-1:lemma:wt'
1.454473 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.444880 Gversion b'lemma:000913'
1.444880 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.436993 O        b'lemma:ml'
1.416656 Air      b'-2:lemma:fnr'
1.381393 OD       b'-1:postag:IN'
1.363759 O        b'+1:postag:NNP'
1.362814 Air      b'-1:postag::'
1.358890 O        b'-1:lemma:l1'
1.358087 Technique b'lemma:rnaseq'
1.357699 O        b'postag:DT'
1.356696 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.356162 Supp     b'lemma:glucose'
1.355323 Supp     b'lemma:Fe'
1.348979 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.348979 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.348979 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
1.346486 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.328476 Technique b'-1:lemma:_'
1.325212 O        b'lemma:oxyr'
1.323329 Agit     b'+2:lemma:at'
1.314363 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.307709 O        b'lemma:for'
1.304776 O        b'-1:lemma:nitrate'
1.303752 Supp     b'-2:lemma:argr'
1.299330 OD       b'+1:lemma:of'
1.298101 Gtype    b'lemma:wild-type'
1.290615 Supp     b'-1:lemma:vol'
1.290615 Supp     b'-2:lemma:1/100'
1.290615 Supp     b'+2:lemma:1m'
1.280375 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.277223 Gversion b'lemma:nc'
1.277223 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.274058 Supp     b'-2:lemma:20'
1.268887 O        b'lemma:cra'
1.267372 Med      b'-1:lemma:ml'
1.266230 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.263184 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.261724 Technique b'-1:lemma:input'
1.250821 Substrain b'-1:lemma:.'
1.250821 Substrain b'-1:postag:.'
1.233987 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.230916 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.220887 Med      b'lemma:medium'
1.219970 Agit     b'lemma:250'
1.219812 Air      b'-2:lemma:%'
1.216943 Air      b'-2:lemma:cm20'
1.216157 O        b'lemma:genotype'
1.208834 Supp     b'+2:lemma:A'
1.203175 O        b'lemma:A'
1.201453 Gtype    b'+1:postag::'
1.197850 Med      b'+1:lemma:+'
1.197683 O        b'-2:lemma:min'
1.195275 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
1.188863 Air      b'-2:lemma:0.3'
1.177861 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.177861 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.177270 O        b'-1:lemma:acetate'
1.177066 O        b'+1:lemma:nacl'
1.171262 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.170820 Phase    b'-2:lemma:until'
1.168692 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.161136 Technique b'+1:ner:TF'
1.159474 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.157880 O        b'-2:lemma:medium'
1.155271 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.152475 Air      b'lemma:%'
1.148523 Gversion b'-2:postag:VB'
1.144879 O        b'+1:ner:MED'
1.143545 Air      b'+1:lemma:%'
1.139838 O        b'lemma::'
1.135532 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.129024 Med      b'postag:NNP'
1.122742 Gtype    b'-2:lemma:delta'
1.115454 O        b'+1:lemma:250'
1.114812 Gtype    b'-2:postag:NNS'
1.112746 O        b'-2:lemma:overnight'
1.107561 O        b'postag:-RRB-'
1.107476 O        b'-1:ner:TF'
1.107334 Vess     b'+1:lemma:at'
1.103257 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.103257 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.099313 pH       b'lemma:.5'
1.099313 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.087982 Air      b'-2:lemma:mid-log'
1.087587 Gtype    b'-1:lemma:wild'
1.084450 Air      b'-1:lemma:phase'
1.083369 Med      b'lemma:minimal'
1.082528 O        b'-1:lemma:into'
1.079467 Air      b'+2:lemma:%'
1.073842 Air      b'-1:lemma:%'
1.072879 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
1.070583 O        b'+1:lemma:acetate'
1.069133 Substrain b'+2:lemma::'
1.061937 Med      b'-2:postag:JJ'
1.061143 O        b'postag:VBD'
1.055198 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.052820 O        b'+1:lemma:20'
1.051672 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.051672 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.049435 Phase    b'lemma:phase'
1.048460 O        b'+1:lemma:43'
1.045423 Phase    b'-1:lemma:until'
1.043154 Supp     b'+2:lemma:add'
1.040548 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.038275 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.033644 Med      b'postag:NNS'
1.033280 Med      b'-2:lemma:minimal'
1.032737 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
1.026686 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.024411 OD       b'postag:CD'
1.020448 O        b'+2:lemma:constant'
1.012896 Supp     b'lemma:rifampicin'
1.011848 pH       b'-1:lemma:ph'
1.009534 O        b'+2:postag:JJ'
1.006097 OD       b'+1:postag:IN'
1.005836 O        b'lemma:chip-arca'
1.005836 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.003827 Gtype    b'+1:lemma:control'
0.999586 Supp     b'lemma:0.2'
0.998715 Air      b'+2:postag:CD'
0.998528 Med      b'+1:lemma:supplement'
0.998228 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
0.991891 Supp     b'postag:NNP'
0.985253 Substrain b'+2:postag::'
0.969958 O        b'-2:lemma:in'
0.967891 Gversion b'postag:CD'
0.967823 Supp     b'lemma:glutamine'
0.967823 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
0.967305 O        b'+1:lemma::'
0.967284 Technique b'lemma:-lrb-'
0.961437 Air      b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.958876 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
0.957872 Technique b'postag:-LRB-'
0.956772 Technique b'-2:ner:TF'
0.949188 O        b'+1:lemma:ph5'
0.949188 O        b'+2:lemma:.5'
0.942751 O        b'-1:lemma:-80'
0.936589 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
0.927544 Anti     b'+2:postag:NNP'
0.927468 Gtype    b'-1:lemma:vector'
0.925241 Air      b'-2:postag:CD'
0.924108 Supp     b'-1:lemma:mm'
0.922310 pH       b'+1:lemma:5.5'
0.920724 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
0.918890 Phase    b'+1:lemma:phase'
0.915835 Strain   b'-2:lemma:strain'
0.912787 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.912787 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.905382 O        b'lemma:additional'
0.905382 O        b'+1:lemma:2h'
0.903314 Air      b'lemma:Anaerobic'
0.899781 Air      b'-2:lemma:nh4cl'
0.899379 Strain   b'+2:lemma:.'
0.899379 Strain   b'+2:postag:.'
0.899159 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
0.898235 Supp     b'-1:postag:SYM'
0.894338 Gtype    b'-1:postag:VBG'
0.889645 O        b'-1:ner:_'
0.889103 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.889103 Supp     b'+1:ner:KWSUPP'
0.888437 Gtype    b'-2:lemma:dna'
0.885363 Anti     b'postag:JJ'
0.884231 O        b'+2:ner:_'
0.882600 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
0.879019 pH       b'-2:lemma:at'
0.877933 O        b'-1:lemma:media'
0.874883 Anti     b'-1:lemma::'
0.873662 Technique b'postag:NNP'
0.868971 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
0.864066 Supp     b'lemma:20'
0.861063 pH       b'lemma:5.5'
0.857430 O        b'+2:lemma:fructose'
0.854905 Supp     b'+2:postag:IN'
0.853620 Strain   b'-1:lemma:.'
0.853620 Strain   b'-1:postag:.'
0.845133 O        b'-2:lemma:ml'
0.842189 Supp     b'-2:lemma:pahse'
0.841174 Gtype    b'-1:lemma:Wild'
0.838673 Gtype    b'-2:postag:JJ'
0.836798 O        b'postag:FW'
0.834236 O        b'lemma:rnase'
0.833005 OD       b'-1:lemma:~'
0.831307 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
0.830772 Gtype    b'+2:ner:SUPP'
0.830239 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.830239 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.829785 Phase    b'-1:lemma::'
0.827002 O        b'+1:lemma:mid-log'
0.823695 Temp     b'+2:postag:DT'
0.819629 O        b'lemma:s'
0.819629 O        b'-2:lemma:parameter'
0.818914 OD       b'-1:lemma:od450'
0.817040 O        b'-1:lemma:dpd'
0.816576 Med      b'+1:postag:-LRB-'
0.813463 O        b'-1:lemma:mg1655'
0.813283 Technique b'-1:lemma:1'
0.813278 Supp     b'-2:lemma:purr'
0.811236 Temp     b'-2:lemma:keep'
0.809809 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.808560 Agit     b'-2:postag:RB'
0.807832 Vess     b'-2:postag:JJ'
0.807583 Supp     b'-1:postag:IN'
0.802898 Air      b'-1:postag:CD'
0.802019 Supp     b'-2:lemma:10'
0.801770 Phase    b'-2:postag:IN'
0.800455 O        b'-1:lemma:genbank'
0.792777 O        b'lemma:fresh'
0.786210 OD       b'postag:IN'
0.784891 Supp     b'lemma:30'
0.783505 Gtype    b'lemma:ryhb'
0.781278 Gtype    b'+2:lemma:lacz'
0.780666 O        b'+2:lemma:chipseq'
0.775958 Supp     b'+1:lemma:be'
0.774881 Med      b'+1:lemma:minimal'
0.774507 Temp     b'-2:lemma:see'
0.769847 Gtype    b'-1:postag:VBP'
0.769735 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.764925 pH       b'-1:lemma:at'
0.764901 Supp     b'+2:lemma:be'
0.757068 O        b'-1:lemma:fructose'
0.755334 Gtype    b'-2:ner:GEN'
0.753802 O        b'+1:postag::'
0.753561 O        b'+1:postag:VBN'
0.751188 Temp     b'lemma:sample'
0.750523 Gversion b'+1:postag:CD'
0.744866 OD       b'lemma:of'
0.743398 O        b'lemma:old'
0.743398 O        b'-1:lemma:seqa'
0.743398 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
0.742746 Gtype    b'+2:lemma:control'
0.742596 Technique b'-2:postag:NNP'
0.737152 O        b'-1:lemma:genotype'
0.736402 Gtype    b'+1:lemma::'
0.736267 Gtype    b'+2:postag::'
0.734423 OD       b'+2:postag:CD'
0.732044 O        b'lemma:chip-fnr'
0.732044 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
0.730940 OD       b'lemma:o.d.'
0.730940 OD       b'+1:lemma:600nm'
0.728517 O        b'-2:lemma:250'
0.728020 Phase    b'lemma:pahse'
0.727854 Gtype    b'postag:-RRB-'
0.726871 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.725884 Med      b'-1:ner:MED'
0.724852 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.724402 O        b'+2:lemma:of'
0.723498 O        b'-2:lemma:Cra'
0.722720 Air      b'+2:lemma:37'
0.722095 O        b'-2:lemma:Wild'
0.721966 Phase    b'postag:NN'
0.720943 Phase    b'-2:lemma:to'
0.720943 Phase    b'-2:postag:TO'
0.716606 Gtype    b'-1:lemma::'
0.714363 Supp     b'-1:lemma:0.2'
0.714363 Supp     b'+2:lemma:ph'
0.711241 Gversion b'lemma:_'
0.710775 Gtype    b'lemma:fnr-8myc'
0.710324 O        b'+1:lemma:k-12'
0.708836 Gtype    b'lemma:wild'
0.705222 Temp     b'+1:lemma:see'
0.704240 Med      b'-2:lemma:medium'
0.704121 Gtype    b'+1:lemma:nacl'
0.703400 pH       b'-1:postag:NN'
0.702160 O        b'+1:ner:SUPP'
0.701554 O        b'-1:lemma:w0002'
0.700211 O        b'+1:ner:_'
0.699137 Gtype    b'lemma:flagtag'
0.699137 Gtype    b'-2:lemma:nsrr'
0.697544 O        b'lemma:Fur'
0.696336 Supp     b'-1:lemma:contain'
0.696145 Gtype    b'-1:lemma:harbor'
0.694787 Temp     b'-2:postag:VBD'
0.694566 O        b'lemma:be'
0.689996 Supp     b'-2:lemma:trpr'
0.687779 O        b'+2:lemma:wt'
0.685404 Technique b'+1:postag:NN'
0.685330 O        b'-2:lemma:mid-log'
0.681884 Technique b'lemma:-rrb-'
0.676820 Gtype    b'+1:lemma:the'
0.676285 Med      b'+2:lemma:then'
0.673469 pH       b'lemma:ph'
0.672516 O        b'+2:lemma:allow'
0.672484 Gtype    b'-1:lemma:from'
0.672139 OD       b'+2:lemma:~'
0.672068 OD       b'-2:lemma:od600'
0.670144 O        b'lemma:-rrb-'
0.669763 Supp     b'+1:lemma:hour'
0.666014 O        b'-2:lemma:~'
0.665117 Gtype    b'+2:postag:NN'
0.662803 O        b'-1:lemma:short'
0.661280 Med      b'-1:postag:JJ'
0.659982 OD       b'-1:lemma:of'
0.657364 Gtype    b'-1:lemma:phtpg'
0.655082 Technique b'+2:lemma:-rrb-'


Top negative:
0.005710 Supp     b'-2:postag:CC'
0.005589 O        b'-1:postag:CD'
0.005509 Strain   b'-1:lemma::'
0.005249 O        b'-2:lemma:culture'
0.005218 O        b'-1:lemma:one'
0.004899 O        b'-1:lemma:;'
0.004899 O        b'-2:lemma:7.6'
0.004806 O        b'-2:ner:Organism'
0.004804 O        b'+1:postag:SYM'
0.004706 Technique b'-2:postag:JJ'
0.004536 O        b'-1:lemma:95'
0.004332 O        b'lemma:mg1655'
0.004270 O        b'+1:lemma:um'
0.004213 O        b'lemma:5'
0.004188 O        b'-2:ner:GEN'
0.003706 Gtype    b'-2:lemma:-lrb-'
0.003535 pH       b'-1:ner:_'
0.003290 OD       b'lemma:0.3-0.35'
0.002753 O        b'+2:lemma:or'
0.002561 Med      b'-2:lemma:glucose'
0.002523 Air      b'lemma:and'
0.002346 O        b'+2:lemma:with'
0.002263 O        b'-2:postag:NNS'
0.002171 Air      b'-2:lemma:-lrb-'
0.002089 O        b'+2:postag:CD'
0.002083 O        b'-1:lemma:%'
0.002015 Supp     b'-2:lemma:stir'
0.001989 Anti     b'postag:NN'
0.001953 Gversion b'-1:ner:_'
0.001803 Gtype    b'lemma:Fur'
0.001792 O        b'-1:ner:Organism'
0.001452 Supp     b'+2:lemma:final'
0.001187 O        b'-2:lemma:;'
0.001153 Substrain b'postag:NN'
0.001104 O        b'+1:lemma:glucose'
0.000844 Air      b'lemma:-lrb-'
0.000822 O        b'-2:lemma:mg/ml'
0.000570 Air      b'postag:CC'
0.000516 Gversion b'-1:lemma::'
0.000462 O        b'+2:lemma:glucose'
0.000414 Med      b'lemma:-rrb-'
0.000367 Supp     b'+1:lemma:and'
0.000362 Gtype    b'+1:lemma:acetate'
0.000333 O        b'-2:lemma:10'
0.000260 Gtype    b'+1:lemma:1'
0.000254 Temp     b'+2:lemma:the'
0.000252 Supp     b'+1:postag:CC'
0.000227 Air      b'postag:-LRB-'
0.000213 Phase    b'-2:lemma:nacl'
0.000200 Med      b'postag:-RRB-'
0.000193 Phase    b'+2:postag:IN'
0.000158 Air      b'postag:-RRB-'
0.000134 OD       b'-1:lemma:to'
0.000134 OD       b'-1:postag:TO'
0.000132 Supp     b'-1:lemma:m'
0.000124 Med      b'-1:lemma:2'
0.000116 O        b'+1:lemma:-'
0.000113 Temp     b'-2:lemma:flask'
0.000112 OD       b'-2:lemma:grow'
0.000089 Gtype    b'-1:postag:IN'
0.000083 Agit     b'postag:CD'
0.000077 O        b'lemma:2.0'
0.000076 O        b'-2:lemma:2.5'
0.000063 Gtype    b'+2:postag:-LRB-'
0.000059 Air      b'+2:lemma:250'
0.000058 O        b'-2:lemma:fur'
0.000056 Technique b'-2:lemma:1'
0.000055 O        b'-2:lemma:type'
0.000054 Med      b'-2:lemma:into'
0.000052 O        b'+1:lemma:tritonx-100'
0.000050 OD       b'+2:lemma:a'
0.000044 O        b'lemma:control'
0.000038 Gtype    b'postag:CD'
0.000037 OD       b'+2:postag:DT'
0.000018 O        b'-2:lemma:glucose'
0.000017 Supp     b'+2:lemma:.'
0.000017 Supp     b'+2:postag:.'
0.000015 Supp     b'-1:lemma:\xce\xb4ompr'
0.000014 Med      b'-2:postag:IN'
0.000013 O        b'+1:lemma:b1'
0.000012 O        b'-2:lemma:control'
0.000009 O        b'+2:lemma:to'
0.000009 O        b'+2:postag:TO'
0.000009 Air      b'+2:lemma:95'
0.000007 Anti     b'-2:postag::'
0.000007 Anti     b'-1:lemma:rna'
0.000006 OD       b'-2:postag:VBN'
0.000003 Med      b'-2:ner:SUPP'
0.000002 Anti     b'-1:postag:NN'
0.000002 O        b'+1:lemma:with'
0.000002 O        b'+2:lemma:stop'
0.000002 O        b'lemma:w0002'
0.000002 O        b'-2:lemma:NeoClone'
0.000001 Supp     b'lemma:ph'
0.000000 Supp     b'-2:lemma:without'
-0.000008 O        b'-2:lemma:ph'
-0.000013 Supp     b'+1:lemma:um'
-0.000014 O        b'+2:lemma:1'
-0.000015 O        b'-2:lemma:into'
-0.000026 Technique b'-1:postag::'
-0.000062 Supp     b'lemma:%'
-0.000077 Gtype    b'lemma:control'
-0.000108 O        b'+2:lemma:0.4'
-0.000122 Supp     b'lemma:250'
-0.000138 O        b'-2:postag:JJ'
-0.000138 O        b'+2:lemma:37'
-0.000155 Supp     b'+2:lemma:mm'
-0.000155 Supp     b'+2:ner:KWSUPP'
-0.000233 O        b'+2:postag:IN'
-0.000250 O        b'lemma:ph'
-0.000257 Supp     b'+1:ner:SUPP'
-0.000388 Technique b'+2:ner:_'
-0.000417 O        b'+2:lemma:follow'
-0.000543 O        b'+1:lemma:0.4'
-0.000578 Med      b'-2:ner:MED'
-0.000646 O        b'+1:lemma:mm'
-0.000646 O        b'+1:ner:KWSUPP'
-0.000648 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.000701 O        b'lemma:phase'
-0.000762 Air      b'+2:ner:_'
-0.000826 O        b'lemma:%'
-0.000979 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.001077 O        b'-2:lemma:stir'
-0.001172 O        b'+2:lemma:the'
-0.001210 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.001210 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.001947 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.002594 Supp     b'-2:lemma:of'
-0.002840 O        b'+1:lemma:300'
-0.003056 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.003081 O        b'+2:lemma:5'
-0.003290 O        b'-2:lemma:%'
-0.003686 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.003928 Supp     b'-1:lemma:;'
-0.003928 Supp     b'-2:lemma:7.6'
-0.004751 Supp     b'lemma:1'
-0.004971 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.005077 Vess     b'-2:ner:_'
-0.005194 O        b'-2:lemma:1'
-0.006045 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.006045 O        b'+2:lemma:1/100'
-0.006730 Air      b'-2:lemma:be'
-0.007765 O        b'-2:lemma:70'
-0.007900 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.008227 Air      b'+2:postag:JJ'
-0.009503 Supp     b'lemma:um'
-0.009503 Supp     b'+2:lemma:paraquat'
-0.009554 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.012503 O        b'+2:postag:DT'
-0.014742 O        b'+1:lemma:contain'
-0.016101 Supp     b'-2:lemma:;'
-0.017229 O        b'-1:lemma:in'
-0.017807 Vess     b'+2:ner:_'
-0.017821 O        b'lemma:mg/ml'
-0.017821 O        b'-1:lemma:150'
-0.018163 O        b'+1:lemma:7.6'
-0.018163 O        b'-2:lemma:1m'
-0.018163 O        b'+2:lemma:;'
-0.019533 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.020859 O        b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.022300 Air      b'+1:postag:CD'
-0.023946 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.024150 OD       b'+2:lemma:0.4'
-0.024920 Supp     b'-2:lemma:.'
-0.024920 Supp     b'-2:postag:.'
-0.025768 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.026510 Supp     b'postag::'
-0.028020 O        b'+1:lemma:.'
-0.028020 O        b'+1:postag:.'
-0.028141 Supp     b'postag:IN'
-0.028191 pH       b'-2:ner:_'
-0.028965 Gversion b'+1:ner:_'
-0.030221 Air      b'+1:postag:NN'
-0.031528 O        b'+1:lemma:of'
-0.033062 O        b'+1:lemma:5'
-0.033134 Med      b'-1:postag:IN'
-0.034123 Air      b'+2:lemma:until'
-0.034848 Supp     b'-2:lemma:,'
-0.034848 Supp     b'-2:postag:,'
-0.035518 O        b'+1:lemma:phase'
-0.035703 O        b'+1:lemma:a'
-0.036013 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.036013 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.036013 O        b'+2:lemma:vol'
-0.036493 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.036785 Gtype    b'lemma:ompr'
-0.037867 O        b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.038239 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.038370 OD       b'-2:ner:_'
-0.039313 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.041933 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.041950 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.042659 O        b'+2:lemma:agitation'
-0.043304 O        b'-2:lemma:2'
-0.044357 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.044997 Gtype    b'postag::'
-0.045912 O        b'-2:lemma:nh4cl'
-0.046126 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.048403 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.048403 Supp     b'-1:postag:.'
-0.048658 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.048688 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.048743 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.049736 O        b'-2:postag:DT'
-0.049888 O        b'+2:postag:CC'
-0.050056 Supp     b'lemma:paraquat'
-0.050056 Supp     b'-2:lemma:um'
-0.050254 O        b'+2:lemma:rnase'
-0.050519 OD       b'+2:postag:NN'
-0.050635 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.051188 O        b'lemma:lb'
-0.051576 O        b'+2:lemma:media'
-0.051915 O        b'-2:lemma:grow'
-0.053865 Anti     b'-1:ner:_'
-0.054574 O        b'+1:lemma:sample'
-0.055756 O        b'-2:lemma:phase'
-0.058419 Med      b'postag:NN'
-0.058756 Supp     b'+2:lemma:,'
-0.058756 Supp     b'+2:postag:,'
-0.059155 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.059700 Air      b'lemma:,'
-0.059700 Air      b'postag:,'
-0.059852 O        b'-2:lemma:to'
-0.059852 O        b'-2:postag:TO'
-0.061204 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.063350 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.065078 Supp     b'-1:postag:NN'
-0.069576 Supp     b'lemma:,'
-0.069576 Supp     b'postag:,'
-0.069921 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.071117 Air      b'+2:postag:IN'
-0.071665 Med      b'+1:postag:IN'
-0.071782 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.071788 Supp     b'+2:ner:SUPP'
-0.073531 O        b'-1:lemma:at'
-0.074237 Supp     b'postag:CD'
-0.076129 Gtype    b'-2:postag:CC'
-0.077870 O        b'+1:lemma:ph'
-0.079750 O        b'+2:lemma:sample'
-0.082669 Agit     b'-1:ner:_'
-0.082953 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.083279 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.083844 Air      b'+2:postag:NN'
-0.084412 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.084723 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.093176 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.097027 O        b'-2:lemma:at'
-0.097997 Strain   b'-1:ner:_'
-0.098033 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.098173 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.099200 O        b'-1:lemma:final'
-0.099278 O        b'lemma:0.1'
-0.099596 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.101395 O        b'-1:lemma:~'
-0.102388 O        b'+2:lemma:n2'
-0.102768 Supp     b'-2:lemma:glucose'
-0.102786 O        b'-2:lemma:m'
-0.103480 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.108320 O        b'lemma:methanol'
-0.108320 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.110189 O        b'+2:lemma:~'
-0.110912 Substrain b'-1:ner:_'
-0.111176 O        b'+1:lemma:~'
-0.111407 O        b'lemma:od600'
-0.113497 O        b'+2:lemma:ph'
-0.113728 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.118636 O        b'+1:lemma:n2'
-0.119880 O        b'-2:lemma:o2'
-0.119953 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.120083 O        b'-1:lemma:.'
-0.120083 O        b'-1:postag:.'
-0.120095 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.122161 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.123643 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.124993 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.126661 O        b'lemma:dissolve'
-0.126661 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.128460 Supp     b'postag:-RRB-'
-0.129044 Vess     b'+1:ner:_'
-0.130886 O        b'lemma:;'
-0.130886 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.131071 O        b'+2:lemma:at'
-0.134441 Air      b'-2:postag:CC'
-0.134931 O        b'+1:postag:NNS'
-0.135375 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.136230 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.139694 O        b'-2:lemma:dna'
-0.139814 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.140225 Phase    b'+2:ner:_'
-0.144292 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.145516 O        b'postag:RB'
-0.145713 O        b'-1:postag:VBG'
-0.147480 Air      b'-1:postag:CC'
-0.156809 O        b'+1:lemma:media'
-0.156961 O        b'lemma:fecl2'
-0.159425 Air      b'postag:CD'
-0.164756 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.165011 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.166458 Temp     b'postag:JJ'
-0.167040 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.173605 O        b'lemma:1m'
-0.174416 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.175268 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.180721 O        b'lemma:pahse'
-0.181207 Med      b'postag:CD'
-0.183511 Vess     b'postag:NN'
-0.184537 O        b'+2:lemma:in'
-0.185675 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.189198 O        b'lemma:co2'
-0.190859 OD       b'postag:NN'
-0.191978 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.192267 Med      b'+1:postag:NN'
-0.193722 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.193808 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.193808 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.194839 OD       b'lemma:~'
-0.197595 O        b'lemma:m63'
-0.197895 Supp     b'lemma:vol'
-0.197895 Supp     b'-1:lemma:1/100'
-0.199136 O        b'-1:postag:DT'
-0.200476 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.200948 O        b'+1:lemma:hour'
-0.200987 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.202044 Supp     b'-2:lemma:0.2'
-0.202497 Supp     b'lemma:.'
-0.202497 Supp     b'postag:.'
-0.203105 O        b'-1:ner:MED'
-0.207780 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.207780 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.208167 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.212163 Supp     b'lemma:2'
-0.216083 O        b'lemma:sample'
-0.216166 Supp     b'lemma:mm'
-0.216166 Supp     b'-1:ner:KWSUPP'
-0.217109 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.217310 O        b'-2:lemma:20'
-0.218073 O        b'-1:lemma:with'
-0.218181 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.219761 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.220072 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.223491 O        b'+2:lemma:reference'
-0.224013 O        b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.226104 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.226703 O        b'-1:postag:IN'
-0.228938 Air      b'-1:ner:_'
-0.230630 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.231299 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.232495 O        b'-1:lemma:mm'
-0.235141 O        b'lemma:7.6'
-0.235141 O        b'+1:lemma:;'
-0.240476 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.240704 Vess     b'-1:ner:_'
-0.243162 Supp     b'-2:ner:_'
-0.245025 Technique b'-2:ner:_'
-0.248005 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.251934 O        b'-1:lemma:37'
-0.263601 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.264128 O        b'-1:lemma:until'
-0.264206 O        b'-1:lemma:1m'
-0.264206 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.265802 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.269037 O        b'lemma:20'
-0.269462 O        b'-1:lemma:the'
-0.269876 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.272055 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.273798 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.280609 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.282779 O        b'-2:lemma:of'
-0.285765 Supp     b'+2:ner:_'
-0.295473 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.296876 O        b'-2:postag::'
-0.300178 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.306160 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.314146 O        b'lemma:rifampicin'
-0.314354 O        b'+2:lemma:co2'
-0.326948 O        b'+1:lemma:until'
-0.337457 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.338060 O        b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.339631 Technique b'-2:postag:NN'
-0.344103 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.346682 Anti     b'+2:ner:_'
-0.352393 Phase    b'+1:ner:_'
-0.356626 O        b'+2:lemma:add'
-0.366822 O        b'lemma:nacl'
-0.369075 Strain   b'+1:ner:_'
-0.375841 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.377042 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.378678 O        b'+2:lemma:m9'
-0.379773 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.381172 O        b'-2:lemma:antibody'
-0.387221 Agit     b'postag:NN'
-0.391870 Anti     b'postag:NNP'
-0.398832 O        b'lemma:37'
-0.399684 O        b'lemma:0.2'
-0.405745 O        b'+2:lemma:.'
-0.405745 O        b'+2:postag:.'
-0.406589 O        b'+2:lemma:10'
-0.420521 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.423509 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.423709 O        b'+2:lemma:genome'
-0.423966 pH       b'+2:ner:_'
-0.424284 O        b'lemma:minimal'
-0.431744 O        b'-1:lemma:contain'
-0.435855 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.443723 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.453841 O        b'+2:postag:RB'
-0.458579 O        b'-2:postag:SYM'
-0.459411 O        b'-1:lemma:ml'
-0.482381 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.490802 O        b'+1:lemma:%'
-0.490882 O        b'+1:lemma:m'
-0.498402 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.499161 Supp     b'lemma:10'
-0.499658 O        b'+1:postag:CD'
-0.501527 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.514983 pH       b'postag:NN'
-0.515471 Med      b'-1:ner:_'
-0.516445 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.517651 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.517651 Supp     b'+1:postag:,'
-0.524053 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.524684 O        b'-2:lemma:until'
-0.530977 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.533552 Med      b'-1:postag:NN'
-0.536509 O        b'-1:lemma:IP'
-0.541563 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.546695 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.550001 O        b'-1:lemma:of'
-0.567470 O        b'-2:lemma:genome'
-0.572999 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.581799 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.609358 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.618842 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.619269 Gtype    b'postag:VBG'
-0.622648 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.638879 O        b'+1:lemma:1m'
-0.638879 O        b'-2:lemma:vol'
-0.638978 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.655083 O        b'+1:postag:IN'
-0.663871 O        b'-1:lemma:ph'
-0.670124 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.696531 O        b'+1:lemma:at'
-0.698681 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.701729 O        b'-2:lemma::'
-0.709349 Med      b'+1:ner:MED'
-0.736995 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.738681 O        b'lemma:wt'
-0.747931 O        b'lemma:nh4cl'
-0.755840 O        b'-2:postag:VBG'
-0.759021 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.766617 O        b'lemma:of'
-0.783198 O        b'+1:lemma:in'
-0.798066 O        b'+1:postag:DT'
-0.836300 Technique b'+1:ner:_'
-0.848257 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.849692 Supp     b'-1:postag:NNP'
-0.851265 O        b'+2:lemma:tag'
-0.853315 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.855830 O        b'-1:lemma:30'
-0.898307 Gtype    b'-2:postag:CD'
-0.901798 O        b'-1:lemma:1'
-0.915467 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.920666 O        b'-2:lemma:IP'
-0.968469 O        b'-1:lemma:vol'
-0.968469 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.968469 O        b'+2:lemma:1m'
-0.975130 Supp     b'+2:postag:CD'
-0.984655 OD       b'+1:postag:NN'
-0.989041 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.012758 O        b'-2:lemma:media'
-1.013881 O        b'+1:lemma:+'
-1.040581 O        b'-1:postag::'
-1.051674 Phase    b'postag:JJ'
-1.072354 O        b'lemma:media'
-1.105024 Temp     b'postag:NN'
-1.127123 O        b'lemma:mid-log'
-1.130314 O        b'lemma:30'
-1.132812 O        b'-2:lemma:the'
-1.202109 Air      b'postag:NN'
-1.203182 O        b'lemma:aerobically'
-1.211621 O        b'-1:lemma:co2'
-1.282822 O        b'lemma:aerobic'
-1.326206 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.337720 Supp     b'postag:JJ'
-1.342726 O        b'-2:ner:TF'
-1.343864 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.387315 O        b'+2:lemma:+'
-1.496760 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.539587 O        b'+1:lemma:1'
-1.551898 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-1.585122 O        b'+1:lemma:2'
-1.686582 O        b'-2:lemma:0.3'
-1.698196 O        b'+2:lemma:b'
-1.716950 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-1.774274 O        b'-1:lemma:sample'
-1.875453 O        b'+2:lemma:iptg'
-1.951529 O        b'-1:lemma:2'
-1.978337 O        b'lemma:0.3'
-2.782865 O        b'-1:lemma::'
-3.276854 O        b'-1:lemma:_'