report_Run13_v10.txt 39.5 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 1141 1142 1143 1144 1145 1146 1147 1148 1149 1150 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160 1161 1162 1163 1164 1165 1166 1167 1168 1169 1170 1171 1172 1173 1174 1175 1176 1177 1178 1179 1180 1181 1182 1183 1184 1185 1186 1187 1188 1189 1190 1191 1192 1193 1194 1195 1196
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.05318568891382186, 'c2': 0.019261443877852925}
best CV score:0.8308032444965605
model size: 0.12M

Flat F1: 0.8147298617165236
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.897     0.398     0.551        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.939     0.795     0.861        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.870     0.838     0.854       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.919     0.754     0.815       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    5.489225
Anti   -> Anti    5.297971
Med    -> Med     5.148930
OD     -> OD      4.645401
Phase  -> Phase   4.542102
Gversion -> Gversion 4.444580
Gtype  -> Gtype   4.324517
Air    -> Air     3.784889
Technique -> Technique 3.724670
Supp   -> Supp    3.635437
pH     -> pH      3.416002
O      -> O       3.095640
Substrain -> Gtype   2.016562
Agit   -> Agit    1.911782
Technique -> Air     1.244243
Gtype  -> pH      0.736416
O      -> Technique 0.588059
Gtype  -> Supp    0.273996
Temp   -> O       0.132989
Air    -> O       0.115089
Anti   -> O       0.093016
Technique -> O       0.001196
O      -> pH      -0.000005
Air    -> OD      -0.000011
Agit   -> O       -0.000323
O      -> Agit    -0.000940
pH     -> O       -0.002042
Supp   -> Phase   -0.002599
Med    -> Air     -0.003921
Gtype  -> Gversion -0.004295
Anti   -> Gtype   -0.023408
Air    -> Phase   -0.025569
Supp   -> OD      -0.059551
O      -> Phase   -0.064351
Temp   -> Supp    -0.065372
Air    -> pH      -0.070714
Gtype  -> OD      -0.086087
O      -> Temp    -0.092185
Med    -> O       -0.101025
Gtype  -> Air     -0.102771
Phase  -> Air     -0.120426
Substrain -> Supp    -0.145820
O      -> Gversion -0.162454
O      -> Gtype   -0.204544
Gtype  -> Anti    -0.226935
Gtype  -> Technique -0.286935
Phase  -> O       -0.294287
Supp   -> Technique -0.312346
Anti   -> Supp    -0.325217
pH     -> Supp    -0.341687
Gversion -> O       -0.385976
O      -> Med     -0.397296
Air    -> Agit    -0.459407
Gversion -> Supp    -0.472034
Phase  -> Supp    -0.472605
Temp   -> Med     -0.474586
Gtype  -> Med     -0.517652
O      -> Supp    -0.579565
Agit   -> Air     -0.618609
Technique -> Supp    -0.642296
Supp   -> Air     -0.649138
Supp   -> O       -0.661724
O      -> OD      -0.696781
O      -> Anti    -0.699286
Phase  -> OD      -0.702936
Air    -> Gtype   -0.711923
OD     -> Supp    -0.756635
Supp   -> Gtype   -0.915451
Technique -> pH      -0.935979
OD     -> O       -0.964963
Supp   -> Med     -0.987075
OD     -> Air     -1.100976
Gtype  -> O       -1.127027
Air    -> Supp    -1.328089
Substrain -> O       -1.672034
Technique -> Gtype   -1.865587
Med    -> Supp    -1.983364
O      -> Air     -2.007487


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    5.489225
Anti   -> Anti    5.297971
Med    -> Med     5.148930
OD     -> OD      4.645401
Phase  -> Phase   4.542102
Gversion -> Gversion 4.444580
Gtype  -> Gtype   4.324517
Air    -> Air     3.784889
Technique -> Technique 3.724670
Supp   -> Supp    3.635437
pH     -> pH      3.416002
O      -> O       3.095640
Substrain -> Gtype   2.016562
Agit   -> Agit    1.911782
Technique -> Air     1.244243
Gtype  -> pH      0.736416
O      -> Technique 0.588059
Gtype  -> Supp    0.273996
Temp   -> O       0.132989
Air    -> O       0.115089
Anti   -> O       0.093016
Technique -> O       0.001196
O      -> pH      -0.000005
Air    -> OD      -0.000011
Agit   -> O       -0.000323
O      -> Agit    -0.000940
pH     -> O       -0.002042
Supp   -> Phase   -0.002599
Med    -> Air     -0.003921
Gtype  -> Gversion -0.004295
Anti   -> Gtype   -0.023408
Air    -> Phase   -0.025569
Supp   -> OD      -0.059551
O      -> Phase   -0.064351
Temp   -> Supp    -0.065372
Air    -> pH      -0.070714
Gtype  -> OD      -0.086087
O      -> Temp    -0.092185
Med    -> O       -0.101025
Gtype  -> Air     -0.102771
Phase  -> Air     -0.120426
Substrain -> Supp    -0.145820
O      -> Gversion -0.162454
O      -> Gtype   -0.204544
Gtype  -> Anti    -0.226935
Gtype  -> Technique -0.286935
Phase  -> O       -0.294287
Supp   -> Technique -0.312346
Anti   -> Supp    -0.325217
pH     -> Supp    -0.341687
Gversion -> O       -0.385976
O      -> Med     -0.397296
Air    -> Agit    -0.459407
Gversion -> Supp    -0.472034
Phase  -> Supp    -0.472605
Temp   -> Med     -0.474586
Gtype  -> Med     -0.517652
O      -> Supp    -0.579565
Agit   -> Air     -0.618609
Technique -> Supp    -0.642296
Supp   -> Air     -0.649138
Supp   -> O       -0.661724
O      -> OD      -0.696781
O      -> Anti    -0.699286
Phase  -> OD      -0.702936
Air    -> Gtype   -0.711923
OD     -> Supp    -0.756635
Supp   -> Gtype   -0.915451
Technique -> pH      -0.935979
OD     -> O       -0.964963
Supp   -> Med     -0.987075
OD     -> Air     -1.100976
Gtype  -> O       -1.127027
Air    -> Supp    -1.328089
Substrain -> O       -1.672034
Technique -> Gtype   -1.865587
Med    -> Supp    -1.983364
O      -> Air     -2.007487


Top positive:
6.385584 O        b'lemma:1'
5.899182 O        b'lemma:2'
5.727502 O        b'lemma:_'
5.567959 Anti     b'-2:lemma:antibody'
5.531191 Supp     b'lemma:no3'
5.495320 Supp     b'lemma:pq'
5.306813 O        b'-2:lemma:_'
5.134712 O        b'lemma:3'
4.927917 Technique b'lemma:chipseq'
4.828703 Air      b'lemma:anaerobic'
4.762831 Phase    b'lemma:mid-log'
4.596033 Gtype    b'lemma:wt'
4.488797 Phase    b'-2:lemma:phase'
4.431758 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
4.423220 O        b'lemma:-'
4.404715 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
4.282856 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
4.208822 Strain   b'lemma:k-12'
4.067538 O        b'lemma:with'
3.979239 Air      b'lemma:aerobically'
3.948665 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.872418 Technique b'lemma:rna-seq'
3.871015 Supp     b'lemma:Iron'
3.871015 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.859915 O        b'lemma:Cra'
3.761349 O        b'lemma:rpob'
3.686496 O        b'lemma:b'
3.648189 O        b'postag:VBG'
3.647240 Gtype    b'lemma:type'
3.574913 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
3.538844 O        b'lemma:.'
3.538844 O        b'postag:.'
3.498055 Supp     b'lemma:iptg'
3.488118 Technique b'lemma:chip-seq'
3.488032 Supp     b'-2:lemma:shake'
3.447891 Supp     b'lemma:nh4cl'
3.415893 Supp     b'lemma:2h'
3.415893 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.362658 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.358306 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.342032 Supp     b'lemma:acetate'
3.324441 Supp     b'lemma:nacl'
3.307028 O        b'-2:lemma:myc'
3.241376 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.234694 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.222827 Air      b'-2:lemma:IP'
3.067702 Gtype    b'+1:lemma:type'
3.064870 Substrain b'lemma:mg1655'
3.058259 Phase    b'lemma:stationary'
3.058259 Phase    b'lemma:exponential'
3.056062 O        b'-1:lemma:tag'
3.006654 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
2.990859 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.979782 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.899379 Supp     b'+1:lemma:1'
2.898512 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
2.894052 Air      b'lemma:aerobic'
2.876292 O        b'lemma:purr'
2.868795 O        b'-1:postag:NNS'
2.853729 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.793057 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.792749 pH       b'lemma:ph5'
2.792749 pH       b'+1:lemma:.5'
2.789485 O        b'lemma:CEL'
2.786967 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
2.782388 O        b'postag:IN'
2.778987 Supp     b'lemma:fructose'
2.772023 Med      b'lemma:LB'
2.768148 Gtype    b'lemma:dfnr'
2.767912 O        b'lemma:trpr'
2.762728 Supp     b'+1:lemma:2'
2.746821 Med      b'lemma:MOPS'
2.732876 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.716209 Supp     b'-1:ner:SUPP'
2.705553 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.703283 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.697527 Supp     b'-1:lemma:Cra'
2.692276 O        b'lemma:rep2'
2.692276 O        b'lemma:rep1'
2.652180 Supp     b'lemma:Adenine'
2.644801 O        b'-1:lemma:0.3'
2.629909 O        b'lemma:ompr'
2.625069 Med      b'+2:lemma:b2'
2.615976 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
2.611242 O        b'postag:VBN'
2.599645 Supp     b'-2:lemma:media'
2.599307 Gtype    b'-1:ner:GEN'
2.591378 O        b'-1:lemma:glucose'
2.588408 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.578923 O        b'+2:lemma:crp'
2.567810 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.565728 O        b'+1:lemma:wt'
2.556113 O        b'postag::'
2.549038 Supp     b'lemma:arginine'
2.545162 Supp     b'-1:lemma:+'
2.528926 Air      b'-1:lemma:-'
2.526650 Med      b'lemma:lb'
2.517170 Air      b'lemma:anaeroibc'
2.505439 O        b'-1:lemma:type'
2.500240 O        b'lemma:soxr'
2.500240 O        b'lemma:soxs'
2.476680 O        b'-1:lemma:pq'
2.475989 Technique b'lemma:chip-exo'
2.468132 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.444119 Air      b'postag:JJ'
2.419347 O        b'-2:lemma:fructose'
2.410923 O        b'lemma:culture'
2.396005 O        b'lemma:at'
2.392538 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.373049 O        b'-2:lemma:='
2.369038 O        b'lemma:a'
2.364133 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.359088 Med      b'+2:postag:CC'
2.353753 Temp     b'-1:lemma:37'
2.338802 Technique b'-2:lemma:wt'
2.336047 Supp     b'-2:lemma:argr'
2.332401 O        b'+1:lemma:pq'
2.327200 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.326635 Supp     b'lemma:glucose'
2.326389 O        b'lemma:harbor'
2.290627 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.288124 O        b'lemma:argr'
2.255732 Temp     b'lemma:37'
2.251798 Gtype    b'lemma:pk4854'
2.241629 pH       b'+1:postag:CD'
2.232590 Gtype    b'lemma:ptac'
2.223316 Temp     b'lemma:43'
2.216488 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.208731 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
2.189466 Med      b'lemma:m63'
2.185237 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.179407 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.179407 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.176805 Gversion b'lemma:.2'
2.176805 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.128602 Temp     b'-1:lemma:sample'
2.124570 Supp     b'lemma:dpd'
2.115060 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.113340 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
2.104651 Supp     b'+2:lemma:feso4'
2.101808 O        b'-1:lemma:media'
2.093870 O        b'-1:lemma:nacl'
2.092974 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.083460 Supp     b'-2:lemma:agent'
2.079844 O        b'lemma::'
2.079796 O        b'-1:lemma:lb'
2.076805 Supp     b'+1:lemma:_'
2.076147 Air      b'-2:lemma:fnr'
2.075745 O        b'lemma:input'
2.075745 O        b'+1:lemma:chip-seq'
2.057135 Med      b'+1:lemma:0.4'
2.053039 O        b'-1:lemma:wt'
2.033687 Air      b'-1:lemma:co2'
2.031107 O        b'lemma:oxyr'
2.025897 O        b'+1:postag:RB'
2.002909 Gtype    b'postag:JJ'
1.999818 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
1.996173 Med      b'lemma:media'
1.994231 Supp     b'lemma:Leu'
1.994231 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
1.992094 O        b'postag:DT'
1.979827 Supp     b'-1:lemma:with'
1.977919 O        b'lemma:for'
1.972860 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.972860 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.967610 Med      b'+2:lemma:b1'
1.962572 O        b'postag:CC'
1.937214 O        b'lemma:gadx'
1.935491 O        b'lemma:growth'
1.921177 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
1.920133 Technique b'-1:lemma:input'
1.919402 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.919292 O        b'lemma:\xcf\x8332'
1.917207 Gversion b'lemma:u00096'
1.917207 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.911055 OD       b'lemma:0.3'
1.907400 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.902286 Agit     b'lemma:rpm'
1.899308 O        b'lemma:affyexp'
1.897476 O        b'lemma:cra'
1.897227 Temp     b'-1:lemma:43'
1.896945 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.896945 Strain   b'-2:lemma:str'
1.893648 Supp     b'-2:lemma:for'
1.890572 O        b'lemma:chip'
1.889667 Gversion b'-2:lemma:build'
1.886231 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.870873 Agit     b'-1:lemma:250'
1.866227 Vess     b'lemma:flask'
1.866227 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.866227 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.866227 Vess     b'+2:lemma:43'
1.861977 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
1.861977 Gtype    b'+2:lemma:.5'
1.857342 Anti     b'+1:lemma:antibody'
1.843983 O        b'-1:lemma:min'
1.842652 Supp     b'-1:lemma:_'
1.829423 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.810797 Med      b'lemma:minimal'
1.809027 O        b'-2:lemma:medium'
1.807915 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.802284 Supp     b'-2:lemma:purr'
1.799463 O        b'+1:lemma:od600'
1.788108 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.785871 Supp     b'lemma:Fe'
1.773921 Supp     b'-2:lemma:10'
1.766465 Supp     b'+2:lemma:A'
1.766433 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.762167 Technique b'lemma:rnaseq'
1.757652 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.757652 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.757652 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
1.735688 Med      b'-1:lemma:in'
1.721936 O        b'lemma:ml'
1.716573 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.711795 Supp     b'-1:lemma:vol'
1.711795 Supp     b'-2:lemma:1/100'
1.711795 Supp     b'+2:lemma:1m'
1.709829 Gtype    b'+1:lemma:pq'
1.707965 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.704149 Air      b'postag:RB'
1.694393 O        b'+1:lemma:20'
1.690888 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.687680 O        b'+1:lemma::'
1.672733 O        b'+1:lemma:coli'
1.670404 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.659606 Phase    b'+1:lemma:phase'
1.653462 O        b'lemma:treatment'
1.650095 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.633632 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.621359 OD       b'-1:lemma:at'
1.612906 Med      b'-2:lemma:minimal'
1.611904 Strain   b'-2:lemma:strain'
1.609565 pH       b'lemma:.5'
1.609565 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.607521 O        b'+1:lemma:250'
1.605187 O        b'-2:lemma:overnight'
1.596899 Anti     b'postag:JJ'
1.593321 Gtype    b'lemma:wild-type'
1.588732 Technique b'-1:lemma:IP'
1.573005 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.563952 O        b'lemma:genotype/variation'
1.562139 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.558183 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.553599 Temp     b'-2:lemma:keep'
1.535885 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.532301 O        b'-1:lemma:acetate'
1.527301 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.527301 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.526061 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.525145 Supp     b'-1:lemma:final'
1.521242 Air      b'-1:lemma:_'
1.518005 OD       b'+1:lemma:of'
1.501760 Med      b'+2:lemma:+'
1.485846 O        b'-1:lemma:dpd'
1.473085 Supp     b'+2:lemma:ph'
1.470154 Med      b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.468859 Med      b'-2:lemma:medium'
1.467955 O        b'+2:lemma:constant'
1.459868 O        b'-1:lemma:l1'
1.457826 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.456746 Supp     b'lemma:glutamine'
1.456746 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
1.449334 Gversion b'lemma:000913'
1.449334 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.446369 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.446158 Gversion b'lemma:nc'
1.446158 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.445214 Gtype    b'+1:lemma:control'
1.443797 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.439455 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
1.432983 OD       b'postag:CD'
1.427815 Air      b'-1:postag::'
1.425374 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.420348 O        b'postag:NNS'
1.418332 O        b'+1:ner:MED'
1.416480 Air      b'+2:postag:CD'
1.413255 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.410390 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.399087 O        b'-1:ner:TF'
1.399006 Technique b'lemma:-lrb-'
1.398570 Substrain b'-1:lemma:.'
1.398570 Substrain b'-1:postag:.'
1.397149 Supp     b'-1:lemma:ompr'
1.393186 Agit     b'lemma:250'
1.391315 Technique b'postag:-LRB-'
1.381996 O        b'-2:lemma:Cra'
1.378305 Supp     b'lemma:rifampicin'
1.372389 O        b'postag:VBD'
1.366428 Med      b'+1:lemma:+'
1.351180 Supp     b'-2:lemma:20'
1.349635 Air      b'-2:lemma:0.3'
1.340515 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
1.340434 Vess     b'-2:postag:JJ'
1.337848 O        b'lemma:additional'
1.337848 O        b'+1:lemma:2h'
1.326042 Supp     b'+1:lemma:iptg'
1.323321 Air      b'-2:lemma:cm20'
1.321225 O        b'-1:lemma:into'
1.318869 O        b'lemma:A'
1.316484 Gtype    b'-2:lemma:delta'
1.313435 O        b'-2:lemma:min'
1.310805 Vess     b'+1:lemma:at'
1.309780 Gversion b'-2:postag:VB'
1.306517 OD       b'-1:postag:IN'
1.302940 O        b'lemma:genotype'
1.301858 O        b'+2:lemma:allow'
1.292379 Gtype    b'-1:lemma:Wild'
1.291983 OD       b'lemma:od450'
1.279481 Med      b'postag:NNP'
1.277641 Technique b'+1:ner:TF'
1.277103 Gtype    b'-2:lemma:dna'
1.275137 Med      b'lemma:medium'
1.274232 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.271257 OD       b'lemma:od600'
1.271091 Med      b'-2:postag:JJ'
1.267602 Agit     b'+2:lemma:at'
1.266031 O        b'lemma:chip-arca'
1.266031 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.262375 OD       b'+1:postag:IN'
1.261184 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
1.256387 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.250732 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.239887 Technique b'-1:lemma:1'
1.237931 Technique b'-1:lemma:_'
1.237846 Air      b'-2:lemma:mid-log'
1.234675 Air      b'-1:lemma:phase'
1.231930 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.228261 Med      b'-1:lemma:ml'
1.226377 Supp     b'postag:NNP'
1.224823 Gtype    b'-2:postag:JJ'
1.224649 O        b'+1:postag:NNP'
1.221435 O        b'-1:lemma:fructose'
1.216847 Air      b'-2:postag:CD'
1.216020 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.216020 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.215342 Substrain b'+2:lemma::'
1.213980 Supp     b'+2:lemma:add'
1.212520 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.212520 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.210135 Temp     b'+2:postag:DT'
1.209086 OD       b'-2:lemma:od450'
1.206827 Gtype    b'-1:lemma:wild'
1.203796 pH       b'lemma:5.5'
1.203608 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.202341 Gtype    b'-1:lemma:harbor'
1.200677 Supp     b'lemma:0.2'
1.191743 O        b'-2:ner:MED'
1.181977 O        b'+2:lemma:rpm'
1.177498 Gtype    b'+1:postag::'
1.171387 O        b'+1:ner:SUPP'
1.162781 O        b'+1:lemma:43'
1.161648 Gtype    b'-1:postag:VBP'
1.151230 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.148802 O        b'lemma:rnase'
1.144371 pH       b'-2:lemma:at'
1.141329 Supp     b'-2:lemma:trpr'
1.138833 Gtype    b'-1:lemma:from'
1.137193 Air      b'-2:lemma:%'
1.135975 pH       b'-1:lemma:ph'
1.133514 Supp     b'-1:lemma:30'
1.132011 O        b'+1:lemma:0.2'
1.131043 Anti     b'+2:postag:NNP'
1.129538 OD       b'-2:lemma:phase'
1.128634 Supp     b'-1:lemma:sodium'
1.128634 Supp     b'+2:lemma:1/100'
1.123651 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.123651 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.123540 Strain   b'+2:lemma:.'
1.123540 Strain   b'+2:postag:.'
1.120456 Agit     b'-2:postag:RB'
1.118789 OD       b'lemma:o.d.'
1.118789 OD       b'+1:lemma:600nm'
1.116309 O        b'+1:lemma:acetate'
1.111632 O        b'-1:lemma:nitrate'
1.111385 O        b'lemma:s'
1.111385 O        b'-2:lemma:parameter'
1.109672 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.109286 Gtype    b'-1:lemma:phtpg'
1.109239 Phase    b'-2:lemma:until'
1.104651 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.096034 Supp     b'+2:postag:IN'
1.094481 O        b'-2:lemma:Wild'
1.093998 O        b'+2:lemma:of'
1.092264 Gtype    b'-2:postag:NNS'
1.090199 O        b'lemma:old'
1.090199 O        b'-1:lemma:seqa'
1.090199 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
1.088790 O        b'-1:lemma:medium'
1.085986 Supp     b'-1:postag:CD'
1.084059 O        b'postag:FW'
1.082925 Technique b'-2:postag:NNP'
1.082103 Air      b'-1:postag:CD'
1.075674 Med      b'-2:lemma:g/l'
1.075203 O        b'+2:lemma:fructose'
1.074626 Phase    b'-1:lemma:until'
1.071565 Supp     b'-1:lemma:0.2'
1.070595 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
1.069584 O        b'-2:lemma:ml'
1.059805 Technique b'postag:NNP'
1.054905 Air      b'lemma:Aerobic'
1.052185 O        b'+1:lemma:k-12'
1.051092 O        b'lemma:Fur'
1.049624 Supp     b'-1:lemma:mm'
1.049117 Air      b'-2:postag:SYM'
1.048145 O        b'-1:ner:_'
1.046333 O        b'+1:lemma:nacl'
1.043477 O        b'-1:lemma:genotype'
1.040675 Gtype    b'+2:lemma:fnr'
1.039326 Air      b'+1:lemma:%'
1.037714 Med      b'postag:NNS'
1.034443 Temp     b'-2:postag:VBD'
1.033301 O        b'-1:lemma:shake'
1.032801 O        b'+2:lemma:4'
1.031216 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.029885 O        b'-1:lemma:induce'
1.029390 O        b'-2:lemma:neg'
1.027498 Air      b'-2:lemma:nh4cl'
1.023159 O        b'lemma:from'
1.022983 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.019304 OD       b'-1:lemma:od600'
1.019059 O        b'+1:lemma:dpd'
1.017796 OD       b'+2:lemma:~'
1.013412 Supp     b'lemma:of'
1.010914 Gtype    b'-2:lemma:ecolus'
1.009106 pH       b'+1:lemma:5.5'
1.004977 Supp     b'-2:lemma:condition'
1.002386 O        b'+2:lemma:='
1.001955 O        b'-1:lemma:-80'
0.999273 Technique b'-2:lemma:strategy'
0.995810 O        b'+2:lemma:wt'
0.995630 Temp     b'+1:lemma:see'
0.992457 Gtype    b'lemma:wild'
0.992006 Anti     b'+2:lemma:antibody'
0.985417 O        b'+2:lemma:chipseq'
0.985409 O        b'-1:lemma:w0002'
0.983530 O        b'lemma:lrp'
0.982369 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.982369 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.978125 Supp     b'-1:lemma:potassium'
0.978125 Supp     b'-2:lemma:mmol'
0.976756 O        b'lemma:or'
0.970022 Substrain b'+2:postag::'
0.964331 Supp     b'-2:lemma:supplement'
0.960242 OD       b'postag:IN'
0.959210 Med      b'-1:lemma:g/l'
0.957994 O        b'-2:lemma:genotype'
0.956668 Supp     b'-1:lemma:contain'
0.954132 O        b'lemma:chip-fnr'
0.954132 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
0.953536 Supp     b'-2:ner:SUPP'
0.952045 Air      b'+2:lemma:37'
0.951797 O        b'+2:postag:JJ'
0.951414 Supp     b'+1:lemma:hour'
0.949978 OD       b'lemma:of'
0.948089 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
0.938236 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.937557 O        b'lemma:be'
0.930640 O        b'-1:lemma:0.35'
0.926051 Gtype    b'+2:lemma:lacz'
0.923744 Strain   b'-1:lemma:.'
0.923744 Strain   b'-1:postag:.'
0.923376 Phase    b'postag:NN'
0.920234 O        b'lemma:min'
0.917702 O        b'-2:lemma:Leu'
0.917504 OD       b'-2:lemma:at'
0.917140 Supp     b'-1:postag:IN'
0.916632 Med      b'-1:lemma:fresh'
0.916373 Temp     b'-2:lemma:see'
0.915003 O        b'-2:lemma:in'
0.913804 Gtype    b'-1:lemma:vector'
0.913242 Supp     b'lemma:2g/l'
0.913242 Supp     b'+1:lemma:glutamine'
0.905918 Gtype    b'-2:lemma:genoype'
0.905626 Air      b'+1:lemma:until'
0.903497 Air      b'+1:lemma:b'
0.901926 Anti     b'-1:lemma:monoclonal'
0.901926 Anti     b'+2:lemma:NeoClone'
0.900924 Supp     b'lemma:30'
0.900855 O        b'+2:ner:_'
0.895883 OD       b'-1:lemma:of'
0.895577 O        b'-1:lemma:short'
0.894123 Gtype    b'-1:lemma:pk4854'
0.892442 Technique b'+1:lemma:rpos'
0.891413 Supp     b'lemma:Trp'
0.890675 pH       b'-1:lemma:at'
0.889173 Anti     b'-2:lemma:\xc3\x9f'
0.886618 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gadw'
0.886618 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gadx'
0.886360 O        b'-1:lemma:Iron'
0.885559 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gade'
0.885163 Temp     b'lemma:sample'
0.883510 Gtype    b'lemma:fnr-8myc'
0.883243 Med      b'+2:lemma:with'
0.882254 Supp     b'-2:lemma:pahse'
0.881136 Supp     b'-1:lemma:2'
0.878682 OD       b'-1:lemma:od450'
0.877835 Med      b'+1:postag:CD'
0.877606 O        b'-1:lemma:rpm'
0.877498 O        b'-1:lemma:genbank'


Top negative:
-0.000270 O        b'+2:lemma:in'
-0.000279 Air      b'-2:lemma:95'
-0.000320 Med      b'postag:NN'
-0.000378 O        b'+2:lemma:the'
-0.000411 Temp     b'+2:postag:JJ'
-0.000428 Supp     b'-2:lemma:0.2'
-0.000540 Med      b'-2:postag:CC'
-0.000587 Air      b'lemma:-rrb-'
-0.000605 Technique b'-1:postag::'
-0.000752 O        b'lemma:phosphate'
-0.000853 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.000891 O        b'+2:lemma:0.2'
-0.000908 Supp     b'lemma:ph'
-0.000946 Gtype    b'-1:postag:JJ'
-0.001085 O        b'-2:lemma:phase'
-0.001125 Air      b'-1:lemma:aerobically'
-0.001375 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.001635 O        b'-2:lemma:10'
-0.001754 Gtype    b'-2:lemma:fnr'
-0.001762 O        b'lemma:phase'
-0.002406 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.002804 Supp     b'-1:lemma:and'
-0.003168 O        b'-2:lemma:ph'
-0.003460 O        b'-1:lemma:to'
-0.003460 O        b'-1:postag:TO'
-0.003743 Phase    b'-1:ner:_'
-0.003806 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
-0.003946 O        b'+2:ner:SUPP'
-0.004961 O        b'+1:lemma:95'
-0.005179 Supp     b'+2:lemma:mm'
-0.005179 Supp     b'+2:ner:KWSUPP'
-0.005325 O        b'-2:lemma:2'
-0.006308 O        b'+1:lemma:_'
-0.007073 O        b'-2:lemma:into'
-0.007235 O        b'-2:lemma:-rrb-'
-0.007695 Air      b'postag:-RRB-'
-0.008649 O        b'lemma:5'
-0.008656 O        b'-2:lemma:25'
-0.009138 Med      b'+2:ner:SUPP'
-0.009261 O        b'-2:lemma:mm'
-0.009261 O        b'-2:ner:KWSUPP'
-0.009964 O        b'-2:lemma:n2'
-0.010317 O        b'+1:lemma:10'
-0.011826 O        b'+1:lemma:mm'
-0.011826 O        b'+1:ner:KWSUPP'
-0.012302 O        b'+2:lemma:5'
-0.012326 OD       b'+1:lemma:for'
-0.012409 O        b'lemma:dpd'
-0.012995 Med      b'+1:postag:IN'
-0.013765 Temp     b'+2:postag:IN'
-0.013937 O        b'+1:lemma:25'
-0.014301 O        b'-2:lemma:nacl'
-0.014436 O        b'+2:postag:CC'
-0.015086 OD       b'+2:lemma:for'
-0.017011 Air      b'-2:postag:VBD'
-0.017068 O        b'-2:lemma:5'
-0.017601 OD       b'+2:postag:JJ'
-0.018046 Agit     b'+1:ner:_'
-0.018410 O        b'+1:lemma:.'
-0.018410 O        b'+1:postag:.'
-0.019222 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.020582 O        b'+2:lemma:0.4'
-0.020939 OD       b'+1:ner:_'
-0.021351 O        b'lemma:1/100'
-0.021351 O        b'+1:lemma:vol'
-0.021516 Gtype    b'+1:lemma:and'
-0.023086 Supp     b'lemma:paraquat'
-0.023086 Supp     b'-2:lemma:um'
-0.024237 Supp     b'+2:lemma:final'
-0.024490 O        b'+1:lemma:contain'
-0.024506 O        b'+1:lemma:media'
-0.024933 Air      b'+2:postag:JJ'
-0.025542 O        b'-1:lemma:in'
-0.025848 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.026024 Air      b'-1:postag:CC'
-0.027033 O        b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.028794 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.029289 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.029802 Supp     b'-2:lemma:.'
-0.029802 Supp     b'-2:postag:.'
-0.031033 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.033196 OD       b'+2:lemma:a'
-0.034962 O        b'-2:lemma:to'
-0.034962 O        b'-2:postag:TO'
-0.035294 O        b'lemma:o2'
-0.035496 O        b'-1:lemma:o2'
-0.037169 Temp     b'postag:JJ'
-0.037188 O        b'+1:lemma:medium'
-0.037374 Gtype    b'-1:lemma:-'
-0.037416 O        b'lemma:70'
-0.037677 O        b'+2:lemma:od600'
-0.037730 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.037753 O        b'-1:postag:CD'
-0.040068 O        b'+1:lemma:o2'
-0.040852 OD       b'+2:postag:DT'
-0.045016 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.045545 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.046316 Supp     b'postag:IN'
-0.046950 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.046957 Air      b'postag:CD'
-0.047165 Supp     b'lemma:10'
-0.048803 O        b'+2:lemma:supplement'
-0.049387 O        b'lemma:final'
-0.049554 O        b'-2:lemma:70'
-0.049707 O        b'-1:lemma:m9'
-0.050108 O        b'+1:lemma:7.6'
-0.050108 O        b'-2:lemma:1m'
-0.050108 O        b'+2:lemma:;'
-0.050896 O        b'-1:ner:GEN'
-0.054057 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.054057 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.054057 O        b'+2:lemma:vol'
-0.054114 Supp     b'lemma:,'
-0.054114 Supp     b'postag:,'
-0.055075 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.055075 O        b'+2:lemma:1/100'
-0.055218 Temp     b'-2:lemma:43'
-0.055687 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.055687 Supp     b'-1:postag:.'
-0.055702 O        b'+2:lemma:total'
-0.055972 O        b'+2:lemma:at'
-0.056317 Strain   b'postag:NN'
-0.057037 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.059537 O        b'lemma:mg/ml'
-0.059537 O        b'-1:lemma:150'
-0.059849 O        b'-1:postag:VBG'
-0.060958 O        b'+1:lemma:ph'
-0.060974 O        b'-1:lemma:70'
-0.060994 Supp     b'+2:postag::'
-0.061458 O        b'-2:lemma:fnr'
-0.061623 O        b'-1:postag:DT'
-0.061760 O        b'+1:lemma:of'
-0.061922 OD       b'lemma:2.0'
-0.062423 O        b'lemma:m9'
-0.063711 Phase    b'+2:postag:NN'
-0.064320 O        b'+1:lemma:70'
-0.064476 O        b'+1:postag:VB'
-0.065646 Vess     b'-2:ner:_'
-0.065646 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.066472 O        b'+2:lemma:agitation'
-0.066950 OD       b'-2:ner:_'
-0.067448 O        b'+1:lemma:sample'
-0.067939 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.069291 O        b'postag:NN'
-0.070835 O        b'lemma:250'
-0.072002 O        b'+2:lemma:media'
-0.072478 Gtype    b'-2:lemma:and'
-0.072881 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.074507 OD       b'-1:ner:_'
-0.075230 Air      b'-2:lemma:be'
-0.075673 O        b'lemma:m'
-0.076144 Supp     b'lemma:-rrb-'
-0.076872 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.078698 O        b'-2:postag:RB'
-0.080185 Phase    b'+2:postag:IN'
-0.083312 O        b'+2:lemma:250'
-0.083542 OD       b'+2:postag:RB'
-0.084347 O        b'+1:lemma:300'
-0.086776 Med      b'-2:lemma:grow'
-0.086953 O        b'+2:lemma:then'
-0.087010 Gtype    b'-1:postag:CD'
-0.087655 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.087786 O        b'-2:lemma:at'
-0.089118 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.091271 Phase    b'+2:ner:_'
-0.091763 O        b'-2:lemma:1'
-0.093414 O        b'-2:lemma:cell'
-0.094657 Med      b'-2:lemma:m63'
-0.095386 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.096968 O        b'+1:lemma:mg1655'
-0.097357 O        b'+2:lemma:ph'
-0.097489 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.099225 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.100257 O        b'-1:lemma:at'
-0.101781 O        b'lemma:;'
-0.101781 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.102981 Supp     b'postag:-RRB-'
-0.103638 Gtype    b'+1:postag:CC'
-0.104334 Substrain b'+2:ner:_'
-0.104405 O        b'-2:postag:DT'
-0.104448 Phase    b'-2:ner:_'
-0.106588 Med      b'-2:postag:IN'
-0.109245 O        b'+2:lemma:sample'
-0.116608 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.117647 O        b'-2:lemma:m'
-0.118435 O        b'-2:lemma:o2'
-0.118573 O        b'+1:lemma:5'
-0.119205 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.119851 Gtype    b'postag::'
-0.121422 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.122834 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.124297 O        b'-1:lemma:.'
-0.124297 O        b'-1:postag:.'
-0.126462 O        b'-1:ner:MED'
-0.127197 Strain   b'-2:ner:_'
-0.127885 O        b'+1:lemma:phase'
-0.128938 Substrain b'+1:ner:_'
-0.129213 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.129674 Anti     b'-1:ner:_'
-0.131835 Supp     b'-2:lemma:glucose'
-0.132248 Anti     b'+1:ner:_'
-0.132456 Supp     b'lemma:um'
-0.132456 Supp     b'+2:lemma:paraquat'
-0.132572 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.135212 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.136000 O        b'+1:lemma:b'
-0.137272 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.138009 O        b'+1:lemma:n2'
-0.138534 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.143095 O        b'-1:lemma:mm'
-0.143371 O        b'+2:lemma:pk4854'
-0.146362 O        b'lemma:%'
-0.146938 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.150030 Med      b'-1:postag:IN'
-0.150455 O        b'+1:lemma:genome'
-0.151195 O        b'+1:lemma:co2'
-0.154790 O        b'+1:postag:NNS'
-0.158640 Supp     b'+2:postag:NNS'
-0.159647 O        b'-2:postag:IN'
-0.159849 Med      b'+1:postag:NN'
-0.160364 Substrain b'-2:ner:_'
-0.161586 O        b'+2:lemma:use'
-0.163321 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.164537 Temp     b'-2:postag:JJ'
-0.166982 O        b'+1:lemma:~'
-0.168650 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.168854 Technique b'+2:ner:_'
-0.169696 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.171696 Vess     b'+1:ner:_'
-0.174292 Phase    b'-1:postag:NN'
-0.174556 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.174749 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.175420 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.179442 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.180294 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.180968 Med      b'+2:ner:MED'
-0.181803 O        b'-2:lemma:grow'
-0.183097 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.188031 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.188991 Supp     b'+2:ner:_'
-0.191284 O        b'+1:lemma:culture'
-0.191688 O        b'lemma:ph'
-0.194055 Gtype    b'+1:lemma:crp'
-0.195220 O        b'-2:lemma:stir'
-0.195241 O        b'lemma:n2'
-0.195854 O        b'+2:lemma:n2'
-0.197711 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.198743 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.199347 O        b'-1:lemma:with'
-0.200505 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.200516 O        b'lemma:20'
-0.201056 O        b'lemma:sample'
-0.201540 O        b'-1:lemma:1m'
-0.201540 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.203180 O        b'-1:lemma:n2'
-0.205369 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.206106 Air      b'+2:postag:IN'
-0.207151 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.208807 O        b'+1:lemma:a'
-0.209161 O        b'lemma:150'
-0.209161 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.209161 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.209255 Temp     b'+2:ner:_'
-0.215225 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.215225 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.222948 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.224052 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.225073 O        b'+2:lemma:0.3'
-0.225201 Supp     b'lemma:.'
-0.225201 Supp     b'postag:.'
-0.226554 Med      b'+1:ner:MED'
-0.227327 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.228354 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.233205 Gversion b'+1:ner:_'
-0.236687 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.238720 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.239517 O        b'-1:postag:IN'
-0.239854 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.242985 O        b'-1:lemma:%'
-0.243182 O        b'-1:lemma:~'
-0.243421 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.243990 O        b'lemma:pahse'
-0.246552 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.247286 OD       b'postag:NN'
-0.248830 O        b'+2:lemma:37'
-0.249705 O        b'lemma:7.6'
-0.249705 O        b'+1:lemma:;'
-0.249724 Med      b'-2:ner:MED'
-0.253447 O        b'lemma:methanol'
-0.253447 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.262815 O        b'lemma:dissolve'
-0.262815 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.263797 Gtype    b'lemma:ompr'
-0.268086 Supp     b'lemma:1'
-0.271175 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.281637 O        b'-1:lemma:of'
-0.282864 O        b'-1:lemma:rna'
-0.284680 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.287845 O        b'lemma:1m'
-0.289508 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.291631 O        b'lemma:medium'
-0.295596 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.297740 Agit     b'-1:ner:_'
-0.303745 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.305657 O        b'+2:lemma:co2'
-0.306962 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.306962 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.310959 O        b'-2:postag::'
-0.311668 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.316618 O        b'+2:lemma:~'
-0.317990 O        b'+2:lemma:rnase'
-0.318486 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.319529 O        b'lemma:co2'
-0.321598 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.323394 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.329511 Gtype    b'-1:postag:CC'
-0.332455 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.337002 Supp     b'postag:CC'
-0.339467 O        b'lemma:fecl2'
-0.339519 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.339667 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.341207 Air      b'+2:lemma:70'
-0.348856 Technique b'-2:postag:NN'
-0.349554 Vess     b'+2:ner:_'
-0.357142 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.358437 O        b'+2:lemma:add'
-0.360047 Strain   b'-1:ner:_'
-0.366285 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.367820 Med      b'-1:postag:CD'
-0.369464 O        b'+2:lemma:genome'
-0.371681 Technique b'-2:ner:_'
-0.372083 O        b'+1:lemma:%'
-0.372525 pH       b'-2:ner:_'
-0.374795 O        b'+1:postag:CD'
-0.379620 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.380183 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.380776 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.381674 O        b'-1:lemma:the'
-0.382660 O        b'-1:lemma:harbor'
-0.382890 O        b'lemma:0.1'
-0.383043 O        b'-2:lemma:50'
-0.393806 O        b'lemma:rifampicin'
-0.394264 O        b'-2:lemma:100'
-0.395457 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.397509 Strain   b'+2:ner:_'
-0.398842 O        b'-1:lemma:od600'
-0.399419 Phase    b'+1:ner:_'
-0.402117 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.402997 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.403367 Substrain b'-1:ner:_'
-0.403488 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.406617 Gtype    b'lemma:control'
-0.407102 O        b'+2:lemma:m9'
-0.408758 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.410617 O        b'-2:lemma:antibody'
-0.413911 O        b'lemma:minimal'
-0.419878 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.420560 Vess     b'postag:NN'
-0.423596 O        b'+2:postag:RB'
-0.427962 O        b'-1:lemma:final'
-0.433705 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.433931 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.435407 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.435407 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.443082 O        b'-2:lemma:of'
-0.443563 Med      b'postag:CD'
-0.443733 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.446646 O        b'+1:lemma:1m'
-0.446646 O        b'-2:lemma:vol'
-0.451913 O        b'+1:lemma:until'
-0.453469 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.453541 O        b'lemma:lb'
-0.460574 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.462120 O        b'+2:lemma:.'
-0.462120 O        b'+2:postag:.'
-0.462363 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.463190 Med      b'-1:ner:_'
-0.465047 O        b'postag:RB'
-0.470941 O        b'+2:lemma:reference'
-0.477611 O        b'lemma:0.2'
-0.478517 O        b'lemma:of'
-0.480364 Vess     b'-1:ner:_'
-0.482259 O        b'+2:lemma:follow'
-0.488187 Strain   b'+1:ner:_'
-0.488915 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.490325 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.493349 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.494843 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.495397 O        b'lemma:anaerobic'
-0.504390 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.509506 O        b'lemma:m63'
-0.512599 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.513238 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.515671 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.518056 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.519309 O        b'lemma:fructose'
-0.551748 O        b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.566722 Gtype    b'-2:postag:CC'
-0.569144 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.575774 O        b'-2:lemma:20'
-0.588569 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.590478 O        b'-1:postag::'
-0.596092 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.596545 O        b'-1:lemma:until'
-0.597598 Med      b'-1:postag:NN'
-0.597948 O        b'-2:lemma::'
-0.604690 O        b'lemma:od600'
-0.607907 O        b'-2:lemma:dna'
-0.610438 O        b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.612341 pH       b'+2:ner:_'
-0.616984 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.640736 O        b'-1:lemma:vol'
-0.640736 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.640736 O        b'+2:lemma:1m'
-0.642309 O        b'+1:lemma:hour'
-0.646085 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.649680 Supp     b'lemma:2'
-0.661665 O        b'+2:lemma:10'
-0.667273 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.667662 O        b'-1:lemma:37'
-0.676041 OD       b'+2:postag:NN'
-0.679329 O        b'-1:lemma:1'
-0.689900 Anti     b'postag:NNP'
-0.693949 O        b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.699203 O        b'+1:lemma:at'
-0.707027 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.725714 O        b'-2:postag:VBG'
-0.727798 pH       b'postag:NN'
-0.729650 O        b'+1:postag:DT'
-0.774036 O        b'+1:lemma:m'
-0.805883 O        b'+1:postag:IN'
-0.816622 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.817401 O        b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.818861 O        b'-1:lemma:ml'
-0.821623 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.849146 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.850350 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.857624 O        b'-2:lemma:until'
-0.860173 O        b'lemma:nh4cl'
-0.871019 O        b'-1:lemma:contain'
-0.873742 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.873742 Supp     b'+1:postag:,'
-0.887742 O        b'-1:lemma:IP'
-0.908932 O        b'+1:lemma:in'
-0.909654 O        b'-2:lemma:the'
-0.910000 Agit     b'postag:NN'
-0.923583 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.929772 O        b'-2:postag:SYM'
-0.955399 Gtype    b'-2:postag:CD'
-0.994530 Anti     b'+2:ner:_'
-0.996941 O        b'-2:lemma:genome'
-0.999469 O        b'-2:lemma:IP'
-1.000332 O        b'lemma:37'
-1.011922 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.014380 O        b'lemma:mid-log'
-1.023181 O        b'-2:lemma:media'
-1.027899 O        b'-2:lemma:dpd'
-1.059419 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.077105 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.085827 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-1.098319 Phase    b'-1:postag:JJ'
-1.100969 O        b'lemma:nacl'
-1.116489 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.117517 O        b'-1:lemma:co2'
-1.125126 Technique b'+1:ner:_'
-1.178666 Air      b'postag:NN'
-1.197302 O        b'+1:lemma:+'
-1.220288 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.244020 O        b'-1:lemma:2'
-1.273797 Supp     b'postag:JJ'
-1.273831 O        b'-1:lemma:30'
-1.280673 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.282794 O        b'-1:lemma:ph'
-1.317680 O        b'-1:lemma:rpob'
-1.370781 Temp     b'postag:NN'
-1.370962 O        b'+2:lemma:tag'
-1.377364 O        b'lemma:media'
-1.378845 O        b'+2:lemma:+'
-1.413922 O        b'lemma:aerobically'
-1.444257 OD       b'+1:postag:NN'
-1.514753 Med      b'+2:postag:VBN'
-1.560867 Gtype    b'postag:VBG'
-1.597593 O        b'+1:lemma:g/l'
-1.604403 O        b'lemma:30'
-1.611524 O        b'-2:lemma:0.3'
-1.629708 O        b'-1:lemma:sample'
-1.653860 O        b'lemma:aerobic'
-1.681766 Phase    b'postag:JJ'
-1.685671 O        b'lemma:wt'
-1.719667 O        b'+1:lemma:2'
-1.742635 O        b'-2:ner:TF'
-1.911757 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.940643 O        b'+1:lemma:1'
-1.962876 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-2.152097 O        b'+2:lemma:b'
-2.332217 O        b'lemma:0.3'
-2.515225 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.651538 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-3.675282 O        b'-1:lemma::'
-3.776769 O        b'-1:lemma:_'