report_Run10_v12.txt
40.8 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
1217
1218
1219
1220
1221
1222
1223
1224
1225
1226
1227
1228
1229
1230
1231
1232
1233
1234
1235
1236
1237
1238
1239
1240
1241
1242
1243
1244
1245
1246
1247
1248
1249
1250
1251
1252
1253
1254
1255
1256
1257
1258
1259
1260
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.046049324715961445, 'c2': 0.03857656713719032}
best CV score:0.8344412009392327
model size: 0.09M
Flat F1: 0.8044678045348589
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 0.857 0.800 0.828 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.895 0.386 0.540 88
Anti 0.750 0.923 0.828 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.923 0.769 0.839 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.877 0.838 0.857 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.908 0.746 0.804 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.474152
Anti -> Anti 5.238963
Med -> Med 4.718743
Phase -> Phase 4.509848
Gversion -> Gversion 4.123465
Gtype -> Gtype 3.985334
Air -> Air 3.703515
OD -> OD 3.702751
Supp -> Supp 3.699873
pH -> pH 3.526315
Technique -> Technique 3.176047
O -> O 3.086819
Agit -> Agit 2.388290
Technique -> Air 1.622124
Substrain -> Gtype 1.489362
O -> Technique 0.439346
Air -> O 0.402229
Strain -> O 0.206449
O -> Strain 0.198411
Gtype -> pH 0.127762
Gtype -> Supp 0.063929
Gtype -> Air 0.019328
O -> pH 0.013299
Temp -> O 0.002853
O -> Gtype 0.000628
O -> Substrain 0.000144
Anti -> Air -0.000088
O -> Agit -0.001016
Agit -> O -0.001796
Gtype -> Agit -0.002070
Air -> pH -0.005344
OD -> Med -0.009026
pH -> Air -0.009282
Substrain -> Supp -0.010907
Phase -> Air -0.026970
Technique -> Med -0.027978
Phase -> Anti -0.033807
OD -> Temp -0.034002
Med -> Temp -0.053339
Temp -> Med -0.054831
O -> Phase -0.056015
O -> Temp -0.061797
Temp -> Supp -0.073486
O -> Supp -0.074984
Agit -> Supp -0.076379
Anti -> Med -0.080538
Gversion -> Gtype -0.097509
Supp -> Phase -0.117661
Air -> Technique -0.129568
Phase -> Med -0.150443
Phase -> Gtype -0.154168
Phase -> O -0.160173
Med -> OD -0.161020
Gversion -> Air -0.162527
Air -> Med -0.168607
O -> Gversion -0.177092
Temp -> Air -0.188233
OD -> Technique -0.209094
Med -> Gtype -0.218077
Med -> Technique -0.233666
Supp -> pH -0.248022
Agit -> Air -0.255021
Med -> Air -0.275965
O -> Anti -0.292458
Technique -> O -0.293639
Supp -> Anti -0.294284
Supp -> Gversion -0.295702
Gversion -> Supp -0.344056
pH -> Supp -0.348013
Gversion -> O -0.351733
OD -> O -0.362045
Supp -> O -0.384730
Supp -> Temp -0.385708
Supp -> Technique -0.388822
Air -> Gtype -0.392861
Gtype -> Phase -0.396896
Gtype -> Gversion -0.407187
Air -> Phase -0.426416
Anti -> Gtype -0.444621
Air -> Temp -0.466578
Air -> OD -0.484513
Phase -> Technique -0.509627
Phase -> OD -0.548871
Med -> O -0.560510
Phase -> Supp -0.591344
Anti -> Supp -0.604857
Supp -> Air -0.616809
Technique -> OD -0.637361
Technique -> Supp -0.642975
Gtype -> Technique -0.667169
Supp -> Gtype -0.673657
Anti -> Temp -0.675442
Gtype -> OD -0.697970
Gtype -> Med -0.735705
Technique -> Gtype -0.780302
Supp -> OD -0.783507
OD -> Supp -0.832983
O -> Med -0.840982
Gtype -> Anti -0.851176
Air -> Agit -0.858211
Air -> Supp -0.877665
OD -> Air -0.928085
Gtype -> Temp -0.973504
O -> OD -1.120168
Gtype -> O -1.236257
Supp -> Med -1.264173
Substrain -> O -1.431110
Technique -> pH -1.708678
O -> Air -1.924312
Med -> Supp -2.377259
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.474152
Anti -> Anti 5.238963
Med -> Med 4.718743
Phase -> Phase 4.509848
Gversion -> Gversion 4.123465
Gtype -> Gtype 3.985334
Air -> Air 3.703515
OD -> OD 3.702751
Supp -> Supp 3.699873
pH -> pH 3.526315
Technique -> Technique 3.176047
O -> O 3.086819
Agit -> Agit 2.388290
Technique -> Air 1.622124
Substrain -> Gtype 1.489362
O -> Technique 0.439346
Air -> O 0.402229
Strain -> O 0.206449
O -> Strain 0.198411
Gtype -> pH 0.127762
Gtype -> Supp 0.063929
Gtype -> Air 0.019328
O -> pH 0.013299
Temp -> O 0.002853
O -> Gtype 0.000628
O -> Substrain 0.000144
Anti -> Air -0.000088
O -> Agit -0.001016
Agit -> O -0.001796
Gtype -> Agit -0.002070
Air -> pH -0.005344
OD -> Med -0.009026
pH -> Air -0.009282
Substrain -> Supp -0.010907
Phase -> Air -0.026970
Technique -> Med -0.027978
Phase -> Anti -0.033807
OD -> Temp -0.034002
Med -> Temp -0.053339
Temp -> Med -0.054831
O -> Phase -0.056015
O -> Temp -0.061797
Temp -> Supp -0.073486
O -> Supp -0.074984
Agit -> Supp -0.076379
Anti -> Med -0.080538
Gversion -> Gtype -0.097509
Supp -> Phase -0.117661
Air -> Technique -0.129568
Phase -> Med -0.150443
Phase -> Gtype -0.154168
Phase -> O -0.160173
Med -> OD -0.161020
Gversion -> Air -0.162527
Air -> Med -0.168607
O -> Gversion -0.177092
Temp -> Air -0.188233
OD -> Technique -0.209094
Med -> Gtype -0.218077
Med -> Technique -0.233666
Supp -> pH -0.248022
Agit -> Air -0.255021
Med -> Air -0.275965
O -> Anti -0.292458
Technique -> O -0.293639
Supp -> Anti -0.294284
Supp -> Gversion -0.295702
Gversion -> Supp -0.344056
pH -> Supp -0.348013
Gversion -> O -0.351733
OD -> O -0.362045
Supp -> O -0.384730
Supp -> Temp -0.385708
Supp -> Technique -0.388822
Air -> Gtype -0.392861
Gtype -> Phase -0.396896
Gtype -> Gversion -0.407187
Air -> Phase -0.426416
Anti -> Gtype -0.444621
Air -> Temp -0.466578
Air -> OD -0.484513
Phase -> Technique -0.509627
Phase -> OD -0.548871
Med -> O -0.560510
Phase -> Supp -0.591344
Anti -> Supp -0.604857
Supp -> Air -0.616809
Technique -> OD -0.637361
Technique -> Supp -0.642975
Gtype -> Technique -0.667169
Supp -> Gtype -0.673657
Anti -> Temp -0.675442
Gtype -> OD -0.697970
Gtype -> Med -0.735705
Technique -> Gtype -0.780302
Supp -> OD -0.783507
OD -> Supp -0.832983
O -> Med -0.840982
Gtype -> Anti -0.851176
Air -> Agit -0.858211
Air -> Supp -0.877665
OD -> Air -0.928085
Gtype -> Temp -0.973504
O -> OD -1.120168
Gtype -> O -1.236257
Supp -> Med -1.264173
Substrain -> O -1.431110
Technique -> pH -1.708678
O -> Air -1.924312
Med -> Supp -2.377259
Top positive:
7.616159 O b'lemma:_'
6.088642 Supp b'lemma:Iron'
5.247496 Technique b'lemma:chipseq'
5.245535 Gtype b'lemma:wt'
5.125747 Air b'lemma:anaerobic'
4.592323 Supp b'lemma:pq'
4.377665 Supp b'lemma:2h'
4.377665 Supp b'-1:lemma:additional'
4.369062 O b'lemma:-'
4.346863 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
4.265541 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
4.216303 O b'lemma:1'
4.212271 O b'lemma:Cra'
4.208809 Air b'lemma:aerobically'
4.158270 Gtype b'hGreek'
4.073247 Supp b'lemma:no3'
3.968210 O b'lemma:2'
3.913117 O b'lemma:b'
3.898341 O b'-1:lemma:tag'
3.885372 Gtype b'lemma:type'
3.875529 Gversion b'lemma:asm584v2'
3.741581 Strain b'lemma:k-12'
3.731128 Phase b'lemma:stationary'
3.731128 Phase b'lemma:exponential'
3.700628 Air b'lemma:aerobic'
3.622862 Phase b'lemma:mid-log'
3.547073 Gtype b'+1:lemma:type'
3.459055 O b'-1:lemma:glucose'
3.402862 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.395880 Supp b'lemma:nh4cl'
3.372292 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.316598 Air b'-1:lemma:-'
3.283338 Med b'lemma:LB'
3.282357 O b'lemma:\xcf\x8332'
3.245353 Supp b'lemma:iptg'
3.235746 Supp b'+1:lemma:Deficient'
3.227500 O b'lemma:3'
3.189107 O b'lemma:rpob'
3.162696 Gtype b'-1:ner:GEN'
3.144179 O b'lemma:chip-fnr'
3.104264 O b'lemma:rep2'
3.104264 O b'lemma:rep1'
3.101610 O b'-1:lemma:0.3'
3.099590 O b'postag::'
3.088191 Supp b'-1:lemma:Cra'
3.086999 Substrain b'lemma:mg1655'
3.075476 O b'lemma:chip-arca'
3.068794 Gtype b'lemma:dfnr'
3.067686 Vess b'lemma:flask'
3.067686 Vess b'-1:lemma:warm'
3.028399 O b'lemma:with'
3.022892 Med b'lemma:MOPS'
3.015092 Gtype b'lemma:WT'
3.004259 Med b'-1:lemma:ml'
2.977887 Med b'lemma:lb'
2.959660 O b'+1:lemma:pq'
2.954684 O b'lemma:.'
2.954684 O b'postag:.'
2.954595 Supp b'lemma:nacl'
2.926183 Air b'-1:lemma:co2'
2.917920 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.911638 Med b'lemma:m63'
2.883848 pH b'lemma:ph5'
2.883848 pH b'+1:lemma:.5'
2.875288 O b'postag:VBG'
2.861860 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.834395 O b'lemma:purr'
2.831270 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.826409 Supp b'lemma:Fe'
2.817312 O b'-1:lemma:pq'
2.798719 O b'lemma:CEL'
2.798438 Supp b'lemma:dpd'
2.791960 O b'lemma:genotype/variation'
2.777379 Agit b'+1:lemma:rpm'
2.764662 Substrain b'lemma:mg1655star'
2.744423 O b'-1:lemma:lb'
2.736010 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.727576 O b'+1:lemma:wt'
2.712761 Agit b'lemma:rpm'
2.693979 Gtype b'lemma:pk4854'
2.693315 O b'lemma:a'
2.689649 Anti b'lemma:none'
2.675548 Supp b'+1:lemma:iptg'
2.664337 Air b'lemma:anaeroibc'
2.652154 Gtype b'lemma:arca8myc'
2.631868 O b'+1:lemma:od600'
2.627387 Supp b'lemma:Adenine'
2.617961 Air b'postag:RB'
2.612960 Anti b'lemma:\xcf\x8332'
2.598835 Anti b'lemma:seqa'
2.583582 Med b'+1:lemma:0.4'
2.580278 Technique b'lemma:rnaseq'
2.552015 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.552015 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.526722 Strain b'+1:lemma:substr'
2.526507 Supp b'lemma:Leu'
2.525756 OD b'lemma:od450'
2.523720 Supp b'-1:lemma:+'
2.504135 Agit b'-1:lemma:250'
2.476898 O b'lemma::'
2.476385 Supp b'-1:lemma:with'
2.470714 Gversion b'lemma:nc'
2.445762 Supp b'+1:lemma:1'
2.441314 Supp b'lemma:arginine'
2.417015 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.411390 O b'lemma:trpr'
2.409997 O b'lemma:ompr'
2.408795 Gtype b'lemma:deltaseqa'
2.408795 Gtype b'-1:lemma:old'
2.399465 Med b'+1:lemma:2.0'
2.378264 O b'lemma:at'
2.377255 Med b'lemma:medium'
2.367514 Gtype b'lemma:wildtype'
2.362230 Gversion b'-1:lemma:nc'
2.362230 Gversion b'+1:lemma:000913'
2.358733 O b'+1:lemma:43'
2.342249 Med b'lemma:minimal'
2.330639 Technique b'-1:lemma:_'
2.320193 Gversion b'lemma:u00096'
2.320193 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.303461 Supp b'+1:lemma:deficient'
2.302129 Med b'lemma:media'
2.293093 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.287596 Gversion b'lemma:.2'
2.287596 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.274083 Agit b'lemma:250'
2.267228 O b'-1:lemma:acetate'
2.261991 Air b'lemma:Anaerobic'
2.253342 Technique b'hUpper'
2.251905 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.225472 Gversion b'lemma:000913'
2.217561 Gtype b'+2:ner:SUPP'
2.212760 O b'-1:lemma:nacl'
2.203413 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.196050 O b'-1:lemma:nh4cl'
2.191274 O b'lemma:chip'
2.187536 O b'+1:lemma:k-12'
2.183274 O b'+1:lemma:coli'
2.180321 Supp b'+1:lemma:2'
2.166288 O b'lemma:affyexp'
2.150452 Vess b'-1:postag:VBN'
2.146457 Gtype b'-1:lemma:_'
2.142042 O b'lemma:soxr'
2.142042 O b'lemma:soxs'
2.126629 O b'+1:postag:RB'
2.121135 OD b'-1:lemma:od450'
2.117215 Temp b'lemma:37'
2.103629 Supp b'lemma:acetate'
2.101699 OD b'-1:lemma:at'
2.098132 Supp b'lemma:Trp'
2.097746 pH b'+1:postag:CD'
2.073446 Supp b'-1:lemma:vol'
2.070333 OD b'+1:postag:IN'
2.066227 Gtype b'+1:postag::'
2.059308 Vess b'+1:lemma:at'
2.054374 Phase b'-1:lemma:until'
2.047033 Temp b'-1:lemma:37'
2.041269 O b'-2:ner:MED'
2.038332 O b'-1:postag:NNS'
2.026981 Air b'-1:lemma:ryhb'
2.018412 O b'-1:lemma:type'
2.015048 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.008669 O b'+1:ner:MED'
1.989760 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.988981 Temp b'lemma:43'
1.956157 O b'lemma:argr'
1.941947 OD b'lemma:0.3'
1.931987 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.925884 OD b'+1:lemma:of'
1.921492 Med b'-1:lemma:minimal'
1.920055 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.914130 Gtype b'lemma:nsrr'
1.908706 Temp b'-1:lemma:43'
1.899593 Gtype b'+1:lemma:the'
1.899111 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.893110 Supp b'+1:lemma:hour'
1.884331 Gtype b'-1:lemma:wild'
1.881724 Med b'-1:lemma:in'
1.870060 Gversion b'+1:lemma:genome'
1.869129 O b'postag:IN'
1.867164 O b'-1:lemma:fructose'
1.865288 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.865188 Gtype b'+1:lemma:with'
1.853369 Anti b'hGreek'
1.847021 Supp b'-1:lemma:1m'
1.843146 Supp b'lemma:fructose'
1.842582 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.837491 Gtype b'+1:lemma:control'
1.836750 Substrain b'-1:lemma:.'
1.836750 Substrain b'-1:postag:.'
1.817491 Gtype b'lemma:ptac'
1.815226 Temp b'-1:lemma:sample'
1.799351 Air b'-1:lemma:cm20'
1.798782 Supp b'lemma:rifampicin'
1.797586 O b'-1:lemma:Anaerobic'
1.796238 O b'lemma:s'
1.794770 O b'+1:lemma:0.2'
1.781393 Supp b'lemma:glucose'
1.778273 O b'+1:lemma:m9'
1.776466 Med b'-1:lemma:fresh'
1.770504 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.746283 Med b'-1:postag:JJ'
1.743409 Gtype b'lemma:phtpg'
1.735524 O b'lemma:culture'
1.726132 Gtype b'lemma:wild'
1.724900 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.716112 Phase b'lemma:phase'
1.709524 O b'-1:lemma:-80'
1.705422 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
1.701089 O b'+1:lemma:250'
1.697583 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
1.689275 O b'lemma:+'
1.688239 O b'lemma:for'
1.676163 Technique b'lemma:rna-seq'
1.673777 O b'-1:lemma:Aerobic'
1.671156 O b'lemma:gadx'
1.664788 Supp b'-1:lemma:final'
1.664727 Supp b'+1:lemma:mm'
1.664727 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
1.664174 O b'lemma:treatment'
1.657729 O b'+1:lemma:30'
1.657543 Gtype b'-1:lemma:from'
1.650065 O b'lemma:A'
1.648833 O b'lemma:input'
1.648833 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.648411 Gtype b'lemma:flagtag'
1.648020 OD b'lemma:od600'
1.642093 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.641160 Med b'+1:lemma:+'
1.630922 Med b'postag:NNP'
1.626821 O b'-1:lemma:into'
1.624897 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.614084 Technique b'-1:lemma:1'
1.613529 Anti b'lemma:anti-rpob'
1.613056 Gtype b'lemma:delta-fnr'
1.611350 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.603071 Anti b'lemma:anti-rpos'
1.599551 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.591650 Supp b'-1:lemma:contain'
1.587190 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.585171 O b'-1:lemma:aerobic'
1.583287 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.577548 O b'+1:lemma:mid-log'
1.576045 O b'-1:lemma:no3'
1.568412 O b'postag:VBN'
1.562020 O b'+1:lemma:20'
1.559542 Strain b'-1:lemma:.'
1.559542 Strain b'-1:postag:.'
1.552623 Supp b'lemma:tryptophan'
1.552623 Supp b'-1:lemma:mg/l'
1.551870 Gtype b'+1:lemma:_'
1.551081 O b'-1:lemma:min'
1.536318 Anti b'+1:lemma:from'
1.534513 Med b'-1:lemma:glucose'
1.527058 O b'lemma:oxyr'
1.522758 O b'+1:lemma:ph5'
1.513309 O b'-1:lemma:mg1655'
1.510585 O b'lemma:-80'
1.500814 O b'postag:DT'
1.495137 O b'-1:lemma:stpa'
1.493049 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.492002 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.490968 Air b'-1:lemma:_'
1.485820 Supp b'lemma:glutamine'
1.485820 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.480275 Anti b'-1:lemma::'
1.476877 O b'lemma:harbor'
1.471497 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.471483 O b'-1:lemma:wt'
1.469946 O b'-1:lemma:l1'
1.469277 O b'lemma:C'
1.468277 pH b'+1:lemma:5.5'
1.467140 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.466661 O b'-1:lemma:phase'
1.466403 Technique b'-1:lemma:IP'
1.457426 O b'-1:lemma:.5'
1.449804 O b'lemma:cra'
1.445593 Technique b'-1:lemma:input'
1.442153 O b'+1:lemma:sparging'
1.433229 Vess b'+1:postag:IN'
1.420685 Supp b'lemma:30'
1.419755 Air b'postag:JJ'
1.414252 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
1.412803 O b'lemma:Lrp'
1.412295 Supp b'-1:lemma:30'
1.409672 Supp b'lemma:1m'
1.406747 Technique b'+1:postag:NN'
1.405751 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
1.396967 OD b'lemma:0.3-0.35'
1.396656 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.393049 OD b'-1:lemma:~'
1.388498 Med b'+1:postag:CD'
1.386582 Med b'+1:lemma:minimal'
1.385161 O b'lemma:or'
1.384102 Supp b'+1:lemma:_'
1.379036 Supp b'-1:lemma:m'
1.376126 Air b'lemma:Aerobic'
1.373492 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.372888 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.368408 pH b'lemma:ph'
1.366935 O b'lemma:c'
1.349291 Anti b'lemma:anti-myc'
1.343853 Supp b'+1:lemma:1/100'
1.342798 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.337316 Supp b'lemma:cm20'
1.337316 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.336736 Gtype b'+1:lemma::'
1.333926 Gtype b'hUpper'
1.327687 Phase b'-1:lemma::'
1.327126 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.326703 Supp b'postag:NNP'
1.326548 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.321946 Gtype b'+1:lemma:cra'
1.318544 O b'-1:lemma:arginine'
1.314780 Anti b'+1:postag:-LRB-'
1.313756 O b'postag:CC'
1.311542 Anti b'-1:lemma:fnr'
1.309529 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.308177 Phase b'postag:NN'
1.299288 Gtype b'lemma:crp'
1.298573 O b'+1:lemma:nacl'
1.297246 pH b'lemma:5.5'
1.296704 Gversion b'lemma:_'
1.296622 Supp b'+1:lemma:anaerobically'
1.296252 pH b'lemma:.5'
1.296252 pH b'-1:lemma:ph5'
1.295946 O b'+1:lemma:wash'
1.291157 Supp b'-1:lemma:without'
1.285255 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.285255 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.284087 OD b'-1:postag:IN'
1.281090 Anti b'+1:lemma:-lrb-'
1.276540 Med b'postag:NNS'
1.275501 Supp b'-1:postag:CD'
1.272818 Gversion b'postag:CD'
1.270549 Supp b'lemma:final'
1.269816 Air b'+1:lemma:b'
1.247120 Gtype b'lemma:wild-type'
1.244743 Supp b'-1:lemma:mm'
1.237918 pH b'-1:postag:NN'
1.224168 pH b'-1:lemma:at'
1.222346 Gtype b'lemma:delta-arca'
1.220826 Gtype b'lemma:the'
1.208667 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
1.205983 Air b'-1:lemma:phase'
1.200509 O b'+1:lemma:acetate'
1.193333 Air b'+1:lemma:at'
1.193212 O b'lemma:~'
1.192975 Temp b'lemma:sample'
1.191781 Technique b'lemma:chip-exo'
1.191170 O b'lemma:ml'
1.182952 Phase b'+1:lemma:culture'
1.178807 O b'lemma:delta'
1.177712 O b'-1:lemma:grow'
1.175915 Supp b'-1:lemma:phosphate'
1.174721 Supp b'-1:postag:IN'
1.168051 O b'lemma:600'
1.163096 Technique b'+1:ner:TF'
1.161051 Supp b'-1:lemma:0.2'
1.159288 Supp b'lemma:2g/l'
1.159288 Supp b'+1:lemma:glutamine'
1.156673 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.156248 Technique b'lemma:chip-seq'
1.148023 pH b'-1:lemma:ph'
1.147362 Supp b'+1:lemma:mg/l'
1.146487 Gversion b'postag:NN'
1.146072 Supp b'-1:lemma:2'
1.144144 Gtype b'lemma:Wild'
1.142356 OD b'+1:postag:JJ'
1.139323 Supp b'lemma:methanol'
1.137861 O b'-1:lemma:nitrate'
1.137561 Gtype b'hLower'
1.133638 Gtype b'lemma:vector'
1.123670 O b'-1:lemma:medium'
1.121180 Agit b'-1:lemma:-lrb-'
1.119452 Gtype b'+1:lemma:mg1655'
1.111372 Gtype b'lemma:fur-8myc'
1.111372 Gtype b'lemma:cra-8myc-tagged'
1.103488 O b'-1:lemma:or'
1.103093 O b'-1:lemma:media'
1.102029 Supp b'+1:lemma:min'
1.093641 Anti b'-1:postag::'
1.093292 Med b'+1:lemma:g/l'
1.088583 O b'lemma:growth'
1.088388 O b'lemma:genotype'
1.086079 Supp b'lemma:20'
1.076369 O b'+1:lemma:minute'
1.075833 Supp b'lemma:150'
1.075833 Supp b'+1:lemma:mg/ml'
1.075489 Supp b'lemma:of'
1.074867 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.073950 Temp b'+1:lemma:and'
1.071659 Technique b'hLower'
1.060865 O b'-1:lemma:4'
1.059325 Gtype b'-1:lemma::'
1.058374 OD b'postag:IN'
1.056040 O b'symb'
1.055317 O b'lemma:agitation'
1.052072 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
1.050867 O b'+1:lemma:dpd'
1.048977 Agit b'-1:postag:-LRB-'
1.048948 Gtype b'postag:JJ'
1.046849 Supp b'+1:lemma:300'
1.043909 O b'postag:SYM'
1.040253 Air b'+1:lemma:-'
1.039634 O b'-1:lemma:concentration'
1.039634 O b'+1:lemma:150'
1.033882 O b'-1:lemma:dpd'
1.024270 O b'lemma:EB'
1.021800 Anti b'lemma:mab'
1.021800 Anti b'-1:lemma:anti-flag'
1.019556 Air b'+1:lemma:%'
1.013461 Gtype b'postag:DT'
1.013245 Gversion b'-1:lemma:the'
1.012374 O b'lemma:additional'
1.012374 O b'+1:lemma:2h'
1.011761 OD b'lemma:o.d.'
1.011761 OD b'+1:lemma:600nm'
1.008370 Supp b'lemma:phosphate'
1.007775 Supp b'-1:lemma:_'
1.006420 O b'postag:-RRB-'
1.002546 Technique b'postag:NNP'
1.002355 O b'lemma:Fur'
1.000139 O b'lemma:tag'
0.999827 O b'lemma:E.'
0.995957 Supp b'-1:lemma:soxr'
0.995957 Supp b'-1:lemma:soxs'
0.995693 Supp b'+1:lemma:be'
0.992517 O b'+1:lemma::'
0.991112 OD b'lemma:of'
0.991077 OD b'-1:lemma:600nm'
0.989445 Air b'-1:lemma:%'
0.988266 O b'lemma:-rrb-'
0.987549 Gtype b'-1:lemma:k-12'
0.986808 Supp b'-1:lemma:dissolve'
0.986808 Supp b'+1:lemma:methanol'
0.984240 O b'lemma:2-3'
0.983312 O b'lemma:contain'
0.981321 Gtype b'+1:lemma:ph5'
0.978949 Med b'-1:lemma:w2'
0.978018 Temp b'-1:lemma:see'
0.970513 Phase b'lemma:pahse'
0.970080 Med b'+1:lemma:supplement'
0.968143 O b'-1:lemma:shake'
0.967118 Temp b'+1:lemma:sample'
0.964819 Agit b'+1:postag:-RRB-'
0.964570 pH b'+1:lemma:.'
0.964570 pH b'+1:postag:.'
0.961234 O b'lemma:Genome'
0.956230 Supp b'+1:postag:NNS'
0.955870 Air b'-1:postag:CD'
0.952245 Med b'lemma:glucose'
0.949224 Anti b'lemma:anti-flag'
0.949224 Anti b'+1:lemma:mab'
0.949061 Med b'lemma:2'
0.947644 Air b'lemma:co2'
0.945307 Anti b'+1:postag:NN'
0.942810 O b'lemma:induction'
0.938517 Technique b'+1:lemma:gadx'
0.932151 Temp b'-1:postag:VB'
0.930824 Supp b'-1:lemma:0.3'
0.929019 Gtype b'lemma:ompr-8myc'
0.926273 OD b'lemma:600nm'
0.926273 OD b'-1:lemma:o.d.'
0.921822 Air b'lemma:%'
0.919427 Med b'+1:lemma:with'
0.918788 Supp b'lemma:sodium'
0.918394 Supp b'+1:postag:VBD'
0.917323 Gtype b'+1:lemma:small'
0.913371 O b'lemma:pt7'
0.913117 O b'+1:postag:NNP'
0.909168 O b'lemma:Nac'
0.908858 O b'lemma:lrp'
0.908670 O b'+1:lemma:respiration'
0.906818 O b'lemma:one'
0.905426 Air b'-1:lemma:anerobically'
0.904258 O b'lemma:ntrc'
0.904258 O b'lemma:csir'
0.901828 Gtype b'postag:SYM'
0.900891 Anti b'-1:postag:JJ'
0.898300 OD b'+1:lemma:,'
0.898300 OD b'+1:postag:,'
0.892008 O b'-1:ner:_'
0.889633 Supp b'lemma:feso4'
0.886213 Supp b'-2:ner:MED'
0.885894 Med b'+1:lemma:contain'
0.884031 Supp b'+1:lemma:ph'
0.878939 O b'lemma:-lrb-'
0.878774 O b'-1:lemma:aerobically'
0.877418 Supp b'lemma:potassium'
0.877418 Supp b'-1:lemma:mmol'
0.871904 Supp b'+1:lemma:phosphate'
0.868524 Air b'-1:postag::'
0.864924 Supp b'lemma:0.2'
0.864694 Gtype b'lemma:factor'
0.864694 Gtype b'-1:lemma:transcription'
0.864694 Gtype b'+1:lemma:Fur'
0.862732 Supp b'+1:lemma:1m'
0.862302 Supp b'-1:postag:SYM'
0.857375 Temp b'postag:VB'
Top negative:
0.045540 Gtype b'-1:postag:NNP'
0.043083 O b'-2:ner:KWSUPP'
0.042774 Gversion b'-1:postag::'
0.042152 Supp b'lemma:mm'
0.042152 Supp b'-1:ner:KWSUPP'
0.041086 OD b'+1:lemma:for'
0.040960 O b'+1:lemma:condition'
0.040953 Anti b'+1:lemma:ihf'
0.040732 Air b'+1:lemma:culture'
0.040686 O b'+1:postag:JJ'
0.040672 Air b'-1:postag:-LRB-'
0.037503 Temp b'lemma:control'
0.035823 O b'+1:lemma:phase'
0.035537 Supp b'lemma:-lrb-'
0.034936 Supp b'+1:lemma:10'
0.034847 Air b'+1:postag:CD'
0.034597 Supp b'hLower'
0.034549 Temp b'-1:lemma:-lrb-'
0.032962 Air b'-1:lemma:-lrb-'
0.032653 Anti b'-1:lemma:polyclonal'
0.031090 O b'-1:postag:FW'
0.030867 Supp b'-1:lemma:um'
0.030867 Supp b'+1:lemma:paraquat'
0.030514 O b'+1:lemma:culture'
0.029095 Supp b'lemma:%'
0.028898 Gtype b'-1:lemma:lacx74/ptg2'
0.028407 O b'-2:ner:GEN'
0.027566 Vess b'postag:NN'
0.027543 OD b'-1:postag:DT'
0.027396 O b'-1:lemma:culture'
0.026581 Air b'+1:postag:-RRB-'
0.024569 O b'-1:lemma:50'
0.023330 O b'lemma:overnight'
0.022607 O b'-1:postag:-RRB-'
0.022368 O b'-1:lemma:5'
0.021384 Air b'+2:ner:_'
0.020886 Med b'+1:lemma:and'
0.019972 O b'lemma:rpos'
0.019953 O b'+1:lemma:dissolve'
0.019307 Temp b'lemma:-lrb-'
0.018280 Med b'+1:lemma:-rrb-'
0.017523 pH b'-1:lemma:gadx'
0.016943 O b'-1:lemma:flagtag'
0.015688 Gversion b'-1:lemma:version'
0.015301 O b'+1:lemma:be'
0.014279 Agit b'+1:postag:NN'
0.014193 Med b'-1:postag:CC'
0.012939 Gversion b'-1:ner:_'
0.012633 O b'+1:postag:SYM'
0.012362 Med b'+1:postag:-RRB-'
0.012252 Supp b'lemma:4'
0.011660 O b'+1:lemma:w/v'
0.009669 O b'-1:postag:DT'
0.009359 O b'+1:lemma:-'
0.008982 Supp b'lemma:250'
0.008123 Air b'-1:lemma:aerobically'
0.007956 Supp b'+1:ner:SUPP'
0.007806 Supp b'lemma:nitrate'
0.007218 O b'-1:lemma:pahse'
0.007024 Supp b'lemma:and'
0.006648 Temp b'-1:postag:IN'
0.006504 Agit b'symb'
0.006121 Anti b'lemma:subunit'
0.006121 Anti b'+1:lemma:\xce\xb2'
0.006119 O b'-1:lemma:,'
0.006119 O b'-1:postag:,'
0.005105 O b'+1:lemma:nc'
0.004749 O b'+1:lemma:pahse'
0.004370 O b'+1:lemma:2.5'
0.003705 O b'-1:lemma:for'
0.003508 O b'+1:lemma:follow'
0.003432 O b'+1:lemma:solution'
0.003306 Supp b'-1:lemma:-'
0.003197 Agit b'postag:CD'
0.002823 O b'-1:postag:VBD'
0.002476 pH b'-1:ner:_'
0.002403 Air b'+1:postag:NN'
0.002293 O b'-1:lemma:arca8myc'
0.001569 Gtype b'lemma:delta'
0.001452 Supp b'+1:lemma:in'
0.001324 O b'-1:postag:VBZ'
0.001285 O b'+1:lemma:phosphate'
0.001123 Gtype b'+1:postag:-RRB-'
0.001072 O b'-1:lemma:po'
0.001012 O b'-1:lemma:100'
0.000811 Agit b'+1:ner:_'
0.000761 Anti b'lemma:anti-fur'
0.000738 Temp b'-1:postag:-LRB-'
0.000515 O b'-1:lemma:total'
0.000457 Anti b'-1:lemma:pre-cleared'
0.000259 O b'lemma:Tris'
0.000242 Temp b'postag:CD'
0.000242 Temp b'+1:lemma:rep2'
0.000242 Temp b'+1:lemma:rep1'
0.000229 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
0.000226 Gtype b'+1:postag:NNP'
0.000173 O b'+1:lemma:stop'
0.000159 Gtype b'postag:-RRB-'
0.000130 Supp b'lemma:16'
0.000119 O b'lemma:sc-28207'
0.000116 Temp b'-1:postag:JJ'
0.000106 Supp b'lemma:8'
0.000096 Supp b'+1:postag:NNP'
0.000087 Gtype b'+1:lemma:anaerobic'
0.000086 O b'-1:lemma:25'
0.000051 Anti b'-2:ner:TF'
0.000050 Gtype b'lemma:rna'
0.000038 O b'-1:lemma:glutamine'
0.000030 Temp b'postag:-LRB-'
0.000016 Substrain b'+1:postag:NN'
0.000010 O b'lemma:\xce\xbcm'
0.000008 O b'-1:lemma:8'
0.000006 Gtype b'+1:lemma:strain'
0.000004 Gtype b'lemma:knock-out'
0.000002 O b'+1:lemma:ompr'
0.000002 O b'-1:lemma:chip-arca'
0.000002 O b'+1:lemma:arca8myc'
0.000001 Gtype b'+1:lemma:aerobic'
0.000001 O b'lemma:volume'
-0.000000 Supp b'-1:lemma:250'
-0.000001 Gtype b'lemma:,'
-0.000001 Gtype b'postag:,'
-0.000007 Med b'-1:postag:NNP'
-0.000007 O b'lemma:affinity'
-0.000050 O b'+1:lemma:until'
-0.000053 O b'-1:lemma:gadx'
-0.000063 O b'lemma:sodium'
-0.000284 O b'lemma:dpd'
-0.000386 Supp b'-1:lemma:in'
-0.000698 O b'-1:lemma:0.1'
-0.001091 O b'lemma:95'
-0.001333 Supp b'lemma:.'
-0.001333 Supp b'postag:.'
-0.001362 Phase b'-2:ner:SUPP'
-0.001573 Supp b'-1:lemma:the'
-0.001665 Phase b'+1:postag:IN'
-0.003466 O b'lemma:phosphate'
-0.003600 Supp b'hUpper'
-0.003811 O b'lemma:the'
-0.004326 O b'lemma:m9'
-0.005663 Agit b'postag:NN'
-0.005733 O b'-1:lemma:k-12'
-0.005819 Supp b'+1:lemma:dissolve'
-0.006437 Supp b'lemma:,'
-0.006437 Supp b'postag:,'
-0.006602 Anti b'-1:postag:CD'
-0.007660 O b'+1:lemma:with'
-0.007950 Gtype b'+1:postag:NNS'
-0.008593 O b'-1:lemma:20'
-0.009894 Gversion b'+1:ner:_'
-0.010847 O b'-1:lemma:um'
-0.010847 O b'+1:lemma:paraquat'
-0.011467 O b'lemma:;'
-0.011467 O b'-1:lemma:7.6'
-0.011581 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.012493 Gtype b'lemma:-rrb-'
-0.013285 Supp b'-1:lemma:.'
-0.013285 Supp b'-1:postag:.'
-0.015279 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.015787 Phase b'+2:ner:_'
-0.016215 O b'lemma:vol'
-0.016215 O b'-1:lemma:1/100'
-0.016222 O b'lemma:0.1'
-0.016537 O b'-1:lemma:70'
-0.016614 Agit b'-2:ner:_'
-0.018746 O b'-1:lemma:control'
-0.019700 Anti b'-1:postag:NN'
-0.019876 O b'-1:postag:VB'
-0.020421 O b'lemma:25'
-0.022925 O b'+1:lemma:o2'
-0.023379 Vess b'+1:ner:_'
-0.023739 O b'lemma:min'
-0.024367 Gtype b'postag:VBG'
-0.024819 Anti b'postag:NN'
-0.026460 Gtype b'+1:postag:IN'
-0.026771 Air b'+1:postag:NNS'
-0.027467 O b'+1:lemma:of'
-0.028339 Med b'+1:lemma:m9'
-0.028908 O b'+1:lemma:0.3'
-0.029348 O b'lemma:1/100'
-0.029348 O b'+1:lemma:vol'
-0.031384 Gtype b'lemma:-lrb-'
-0.032133 O b'+1:postag:FW'
-0.032928 Strain b'+1:ner:_'
-0.033786 OD b'lemma:2.0'
-0.034222 Med b'-1:lemma:m63'
-0.037234 O b'lemma:5'
-0.037916 Substrain b'+1:ner:_'
-0.038802 O b'+1:lemma:70'
-0.038807 Agit b'-1:ner:_'
-0.039545 O b'hUpper'
-0.040410 O b'lemma:70'
-0.041240 Supp b'-1:postag:NN'
-0.041280 O b'+1:lemma:95'
-0.041831 Substrain b'+2:ner:_'
-0.042244 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.042275 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.042891 Supp b'+2:ner:KWSUPP'
-0.047199 O b'+1:lemma:25'
-0.050212 O b'+1:lemma:1/100'
-0.051610 Gtype b'+1:ner:_'
-0.053782 Gtype b'+1:lemma:glucose'
-0.053936 O b'+1:lemma:a'
-0.054106 O b'lemma:mg/ml'
-0.054106 O b'-1:lemma:150'
-0.058268 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.059699 O b'+1:lemma:b'
-0.063236 O b'-1:lemma:m9'
-0.065673 O b'lemma:glucose'
-0.068280 Supp b'-1:lemma:%'
-0.069446 Anti b'+1:ner:_'
-0.069699 O b'-1:lemma:with'
-0.070020 Phase b'-1:lemma:at'
-0.072293 O b'+1:lemma:mm'
-0.072293 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.074850 O b'-1:lemma:in'
-0.077620 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.079062 Supp b'+1:lemma:glucose'
-0.079106 Air b'-1:lemma::'
-0.079659 OD b'postag:NN'
-0.081487 O b'+1:lemma:0.4'
-0.081967 Vess b'hLower'
-0.082229 O b'lemma:nitrate'
-0.084402 Air b'postag:CD'
-0.085706 Air b'-1:postag:CC'
-0.088318 O b'+1:lemma:='
-0.088519 O b'-1:postag:CD'
-0.089010 Phase b'+1:postag:NN'
-0.090934 Air b'lemma:anaerobically'
-0.092776 Strain b'+2:ner:_'
-0.093009 O b'-1:ner:SUPP'
-0.097006 O b'postag:JJ'
-0.100058 Vess b'-1:ner:_'
-0.100385 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.102893 O b'+1:postag:NNS'
-0.103668 O b'lemma:hour'
-0.103694 O b'-1:lemma:delta'
-0.105181 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.105792 Supp b'postag:IN'
-0.106414 Supp b'postag:CC'
-0.108080 Supp b'+2:ner:_'
-0.113672 O b'-1:lemma:of'
-0.114294 Vess b'-2:ner:_'
-0.116591 Anti b'symb'
-0.117417 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.118393 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.118411 O b'+1:lemma:7.6'
-0.126486 Anti b'hUpper'
-0.127435 O b'+1:lemma:purify'
-0.129359 Gtype b'+1:postag:-LRB-'
-0.130620 O b'lemma:\xc3\x9f'
-0.133408 Supp b'-1:lemma:;'
-0.137802 Anti b'postag:CD'
-0.138280 O b'-1:lemma:affinity'
-0.140840 O b'-1:lemma:0.2'
-0.141917 O b'+1:lemma:arginine'
-0.142276 O b'+1:lemma:.'
-0.142276 O b'+1:postag:.'
-0.142480 O b'-1:lemma:purify'
-0.143268 Supp b'lemma:10'
-0.144401 O b'+1:lemma:gadx'
-0.145424 Temp b'+2:ner:_'
-0.147951 O b'-1:lemma:sodium'
-0.148938 O b'-1:lemma:od600'
-0.151045 O b'lemma:7.6'
-0.151045 O b'+1:lemma:;'
-0.151429 O b'-1:lemma:250'
-0.153638 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.155858 O b'+1:lemma:rna'
-0.156589 O b'+1:lemma:from'
-0.160867 O b'-1:lemma:minimal'
-0.166683 O b'+1:lemma:2.0'
-0.167268 O b'+1:postag:VBG'
-0.169802 O b'lemma:lb'
-0.170460 O b'+1:lemma:~'
-0.170478 Supp b'lemma:paraquat'
-0.173516 OD b'lemma:='
-0.175681 Anti b'-1:ner:_'
-0.175859 Temp b'postag:NN'
-0.176794 Supp b'postag:CD'
-0.177003 Temp b'symb'
-0.178328 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.179464 O b'+1:lemma:co2'
-0.181168 Supp b'-1:postag:DT'
-0.182278 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.182752 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.186545 O b'+1:lemma:min'
-0.187125 Gtype b'-1:postag:SYM'
-0.190485 O b'+1:lemma:media'
-0.190945 Phase b'+1:ner:_'
-0.191861 Med b'-1:postag:CD'
-0.196045 Technique b'-2:ner:_'
-0.201321 O b'+1:lemma:5'
-0.203155 O b'+1:postag:VB'
-0.203198 O b'lemma:phase'
-0.207890 O b'-1:lemma:~'
-0.209327 Gtype b'-1:postag:CD'
-0.209553 Med b'-1:postag:NN'
-0.209684 O b'-1:lemma:iptg'
-0.213848 O b'lemma:final'
-0.216083 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.218208 O b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.219742 O b'-1:lemma:the'
-0.222220 O b'postag:NN'
-0.229340 O b'lemma:o2'
-0.229535 O b'lemma:n2'
-0.236839 Technique b'+2:ner:_'
-0.237865 O b'lemma:1m'
-0.240400 Med b'lemma:-lrb-'
-0.241722 O b'-1:lemma:g/l'
-0.242226 Strain b'-1:ner:_'
-0.242915 OD b'symb'
-0.244978 O b'lemma:m63'
-0.245060 Gtype b'-1:lemma:-'
-0.247190 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.251063 Med b'+1:postag:IN'
-0.255741 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.255792 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.255792 Gtype b'-1:postag:,'
-0.268838 O b'lemma:fecl2'
-0.274710 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.274737 Vess b'symb'
-0.276023 O b'-1:lemma:from'
-0.281359 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.282331 Supp b'lemma:300'
-0.283257 O b'-1:lemma:.'
-0.283257 O b'-1:postag:.'
-0.286268 O b'lemma:co2'
-0.286693 Gtype b'+1:lemma:crp'
-0.288247 O b'lemma:ph'
-0.290510 O b'+2:ner:TF'
-0.291806 O b'lemma:150'
-0.291806 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.301179 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.302097 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.302811 Med b'+1:postag:CC'
-0.306426 O b'lemma:rna'
-0.308054 Gtype b'postag:CD'
-0.308745 O b'+1:lemma:minimal'
-0.312467 O b'-1:lemma:mm'
-0.314485 O b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.321487 O b'lemma:20'
-0.322758 Med b'+1:ner:MED'
-0.325411 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.328783 Med b'-1:postag:IN'
-0.330562 O b'+1:postag:CD'
-0.332000 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.332000 Gtype b'+1:postag:,'
-0.333019 pH b'+2:ner:_'
-0.335716 O b'-1:postag:VBG'
-0.335788 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.344336 Supp b'+1:postag::'
-0.346348 Gtype b'-1:lemma:fur'
-0.348757 O b'-2:ner:SUPP'
-0.354716 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.357989 Substrain b'-2:ner:_'
-0.373655 O b'+2:ner:SUPP'
-0.375902 O b'-1:lemma:%'
-0.378417 Temp b'-1:ner:_'
-0.379009 Gversion b'symb'
-0.381328 O b'+1:lemma:the'
-0.385713 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.392504 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.394669 O b'+1:lemma:ph'
-0.398309 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.407086 O b'lemma:fructose'
-0.408327 Supp b'-1:lemma:and'
-0.431028 Med b'-1:ner:_'
-0.435199 O b'lemma:dissolve'
-0.435627 Agit b'hLower'
-0.436335 O b'lemma:250'
-0.449857 Anti b'+2:ner:_'
-0.450392 O b'+1:lemma:%'
-0.458632 O b'+1:lemma:1m'
-0.469800 O b'+1:lemma:m'
-0.473412 O b'lemma:purify'
-0.486211 O b'-1:lemma:n2'
-0.487888 O b'lemma:m'
-0.490951 O b'-1:lemma:o2'
-0.493061 Med b'postag:-LRB-'
-0.493794 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.505744 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.519613 O b'-1:lemma:37'
-0.522768 pH b'-2:ner:_'
-0.522775 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.528278 Substrain b'hLower'
-0.529876 O b'lemma:pahse'
-0.534522 Supp b'lemma:2'
-0.535401 O b'lemma:od600'
-0.537414 O b'hGreek'
-0.548298 Anti b'postag:NNP'
-0.551420 Temp b'hGreek'
-0.559293 O b'-1:ner:GEN'
-0.562105 O b'-1:postag:IN'
-0.567496 O b'+1:postag:IN'
-0.588828 O b'+1:lemma:antibody'
-0.589177 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.595327 Air b'-1:lemma:grow'
-0.604211 O b'lemma:mid-log'
-0.623848 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.625364 O b'+1:lemma:sample'
-0.629712 O b'+1:postag:DT'
-0.640747 Gversion b'hLower'
-0.640815 O b'+1:lemma:at'
-0.641205 O b'-1:lemma:1m'
-0.645904 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.646213 OD b'hLower'
-0.656431 O b'+1:lemma:supplement'
-0.658083 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.658083 O b'+1:lemma:methanol'
-0.659722 O b'-1:lemma:final'
-0.680992 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.688996 Substrain b'-1:ner:_'
-0.697256 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.697840 Med b'hLower'
-0.703879 O b'+1:lemma:genome'
-0.706535 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.708264 O b'+1:lemma:300'
-0.724910 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.726879 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.733456 O b'lemma:aerobic'
-0.743960 O b'-1:lemma:rna'
-0.756748 O b'+1:lemma:_'
-0.762977 Temp b'+1:postag:IN'
-0.769282 Technique b'-1:lemma::'
-0.773563 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-0.779385 O b'+1:lemma:contain'
-0.779691 O b'lemma:methanol'
-0.811518 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.821901 O b'lemma:sample'
-0.830162 O b'-1:lemma:1'
-0.846046 Med b'+1:postag:NN'
-0.846726 Med b'postag:CD'
-0.854170 O b'lemma:of'
-0.862709 Gtype b'postag::'
-0.873246 O b'-1:lemma:m'
-0.916603 Med b'-2:ner:MED'
-0.918258 Phase b'symb'
-0.928285 O b'lemma:37'
-0.931087 O b'-1:lemma:30'
-0.954447 O b'+1:lemma:in'
-0.962479 O b'postag:RB'
-0.989905 O b'+1:lemma:g/l'
-0.999458 O b'lemma:medium'
-0.999711 Air b'postag:NN'
-1.004139 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.006588 Technique b'-1:postag::'
-1.019780 pH b'symb'
-1.027916 O b'lemma:anaerobic'
-1.033545 Supp b'+1:lemma:nacl'
-1.071661 O b'lemma:nacl'
-1.075829 Vess b'hUpper'
-1.095636 Air b'-1:postag:VBN'
-1.100224 O b'lemma:nh4cl'
-1.144836 Agit b'hUpper'
-1.158191 OD b'hUpper'
-1.178379 O b'-1:lemma:IP'
-1.191967 O b'lemma:30'
-1.244832 O b'-1:lemma:rpob'
-1.262803 O b'-1:lemma:fresh'
-1.264184 Temp b'hLower'
-1.269773 O b'-2:ner:TF'
-1.283497 Supp b'+1:lemma:,'
-1.283497 Supp b'+1:postag:,'
-1.314582 O b'-1:lemma:ph'
-1.323995 Technique b'+1:ner:_'
-1.339405 Strain b'hLower'
-1.381358 Phase b'postag:JJ'
-1.384024 Supp b'+1:lemma:acetate'
-1.392452 O b'lemma:rifampicin'
-1.404435 OD b'+1:postag:NN'
-1.437262 O b'-1:lemma:until'
-1.466909 O b'lemma:0.3'
-1.470435 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.501887 Gtype b'symb'
-1.533178 Supp b'hGreek'
-1.546417 O b'-1:lemma:sample'
-1.550407 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-1.607682 O b'+1:lemma:+'
-1.619840 O b'+1:lemma:2'
-1.631929 O b'-1:lemma:contain'
-1.632326 O b'+1:lemma:hour'
-1.637156 Strain b'symb'
-1.660332 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-1.688702 O b'-1:postag::'
-1.691722 Supp b'postag:JJ'
-1.726059 O b'lemma:minimal'
-1.732528 O b'-1:lemma:2'
-1.739506 O b'+1:lemma:1'
-1.787187 O b'lemma:wt'
-1.791222 O b'-1:lemma:ml'
-1.849191 Temp b'+1:lemma:with'
-1.886035 O b'lemma:media'
-1.962543 O b'-1:lemma:co2'
-2.598473 O b'lemma:aerobically'
-2.671742 O b'-1:lemma:vol'
-2.695727 Technique b'symb'
-2.731810 Phase b'hUpper'
-2.926159 O b'-1:lemma:_'
-3.656617 O b'-1:lemma::'