report_Run10_v10.txt
43 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
1217
1218
1219
1220
1221
1222
1223
1224
1225
1226
1227
1228
1229
1230
1231
1232
1233
1234
1235
1236
1237
1238
1239
1240
1241
1242
1243
1244
1245
1246
1247
1248
1249
1250
1251
1252
1253
1254
1255
1256
1257
1258
1259
1260
1261
1262
1263
1264
1265
1266
1267
1268
1269
1270
1271
1272
1273
1274
1275
1276
1277
1278
1279
1280
1281
1282
1283
1284
1285
1286
1287
1288
1289
1290
1291
1292
1293
1294
1295
1296
1297
1298
1299
1300
1301
1302
1303
1304
1305
1306
1307
1308
1309
1310
1311
1312
1313
1314
1315
1316
1317
1318
1319
1320
1321
1322
1323
1324
1325
1326
1327
1328
1329
1330
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.0039927826378942065, 'c2': 0.0057252978557247765}
best CV score:0.8426343854107191
model size: 0.10M
Flat F1: 0.8052111114657862
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 0.857 0.800 0.828 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.895 0.386 0.540 88
Anti 0.765 1.000 0.867 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.952 0.756 0.843 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.870 0.838 0.854 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.911 0.746 0.805 484
Top likely transitions:
Med -> Med 6.679867
Anti -> Anti 6.638995
Phase -> Phase 6.112447
OD -> OD 5.861219
Temp -> Temp 5.816166
Air -> Air 5.161167
Gversion -> Gversion 5.060793
Technique -> Technique 4.344454
Agit -> Agit 4.123869
Gtype -> Gtype 4.106305
Supp -> Supp 3.885420
pH -> pH 3.884231
O -> O 3.302821
Technique -> Air 2.441377
O -> Technique 0.664140
Substrain -> Gtype 0.615939
Gtype -> pH 0.503715
O -> Strain 0.432220
Gtype -> Air 0.214936
Strain -> O 0.162810
Air -> O 0.046615
Vess -> O 0.042271
O -> Vess 0.016108
Med -> Gversion -0.000001
pH -> Agit -0.000003
Air -> Gversion -0.000009
Agit -> Technique -0.000009
Technique -> Agit -0.000028
Gversion -> Temp -0.000033
Technique -> Temp -0.000095
Anti -> Air -0.001015
Strain -> Phase -0.012249
Gversion -> OD -0.012984
Anti -> O -0.013445
Temp -> Gversion -0.047343
Gversion -> Technique -0.048271
pH -> Temp -0.049118
Agit -> Gtype -0.057202
O -> Substrain -0.059805
Phase -> Anti -0.061005
pH -> Air -0.062619
Gtype -> Substrain -0.069494
Phase -> Med -0.088711
Gtype -> Vess -0.101765
OD -> pH -0.110916
pH -> O -0.115579
Med -> Phase -0.141109
Strain -> Supp -0.141713
OD -> Med -0.146576
O -> pH -0.171850
O -> Phase -0.172337
Temp -> O -0.176784
Med -> Agit -0.184926
Technique -> Substrain -0.185523
pH -> Gtype -0.195987
Agit -> O -0.198706
Air -> pH -0.207277
Technique -> Gversion -0.217438
Substrain -> pH -0.224900
Anti -> Technique -0.236622
Temp -> Supp -0.247769
Phase -> Temp -0.251361
O -> Anti -0.258950
Phase -> Air -0.296968
Gversion -> Phase -0.334163
Strain -> Gtype -0.354448
Temp -> OD -0.372115
Supp -> Vess -0.373822
Technique -> O -0.377944
Temp -> Air -0.387921
Gtype -> Agit -0.388068
Med -> pH -0.390898
OD -> Technique -0.403462
Gtype -> Supp -0.415976
Med -> OD -0.439448
Phase -> O -0.459489
Agit -> Supp -0.466273
Substrain -> Supp -0.476326
Air -> Technique -0.478926
Gversion -> Gtype -0.480550
Supp -> pH -0.493263
OD -> O -0.494322
Med -> Temp -0.526802
Med -> Technique -0.529043
Technique -> Anti -0.536434
Med -> Air -0.542044
Gversion -> Supp -0.560515
Gversion -> Air -0.563324
Temp -> Gtype -0.566514
OD -> Gtype -0.571467
Supp -> Agit -0.575072
O -> Gversion -0.584599
Gtype -> Med -0.600777
Air -> Gtype -0.601523
Air -> OD -0.625530
Supp -> Air -0.640408
O -> Med -0.645613
pH -> Supp -0.661105
Anti -> Supp -0.673850
Technique -> Supp -0.685779
Supp -> Anti -0.696157
O -> Gtype -0.697594
Med -> Gtype -0.698140
Gversion -> O -0.716276
Agit -> Air -0.719972
Anti -> Gtype -0.761133
O -> Supp -0.805926
O -> Agit -0.812881
Gtype -> Technique -0.821125
Supp -> Gversion -0.879150
Technique -> OD -0.898325
Phase -> Supp -0.899248
Gtype -> OD -0.917840
Gtype -> Anti -0.938982
Phase -> Gtype -0.970879
Gtype -> Gversion -0.991803
Phase -> Technique -0.994629
Supp -> Technique -1.066156
Gtype -> Phase -1.074053
Air -> Temp -1.097909
O -> Temp -1.112113
OD -> Temp -1.124209
O -> OD -1.148233
Temp -> Med -1.176157
Air -> Phase -1.194842
Supp -> OD -1.247221
Air -> Supp -1.332944
OD -> Supp -1.409920
Supp -> Temp -1.420710
Air -> Agit -1.458571
Gtype -> O -1.487012
Phase -> OD -1.509812
Gtype -> Temp -1.541750
Technique -> Gtype -1.610047
Supp -> Phase -1.618780
Supp -> O -1.661613
Med -> O -1.926399
Supp -> Gtype -2.118176
Anti -> Temp -2.341403
Substrain -> O -2.360090
Technique -> pH -2.401114
O -> Air -2.673016
OD -> Air -2.766781
Supp -> Med -2.772525
Med -> Supp -3.865295
Top unlikely transitions:
Med -> Med 6.679867
Anti -> Anti 6.638995
Phase -> Phase 6.112447
OD -> OD 5.861219
Temp -> Temp 5.816166
Air -> Air 5.161167
Gversion -> Gversion 5.060793
Technique -> Technique 4.344454
Agit -> Agit 4.123869
Gtype -> Gtype 4.106305
Supp -> Supp 3.885420
pH -> pH 3.884231
O -> O 3.302821
Technique -> Air 2.441377
O -> Technique 0.664140
Substrain -> Gtype 0.615939
Gtype -> pH 0.503715
O -> Strain 0.432220
Gtype -> Air 0.214936
Strain -> O 0.162810
Air -> O 0.046615
Vess -> O 0.042271
O -> Vess 0.016108
Med -> Gversion -0.000001
pH -> Agit -0.000003
Air -> Gversion -0.000009
Agit -> Technique -0.000009
Technique -> Agit -0.000028
Gversion -> Temp -0.000033
Technique -> Temp -0.000095
Anti -> Air -0.001015
Strain -> Phase -0.012249
Gversion -> OD -0.012984
Anti -> O -0.013445
Temp -> Gversion -0.047343
Gversion -> Technique -0.048271
pH -> Temp -0.049118
Agit -> Gtype -0.057202
O -> Substrain -0.059805
Phase -> Anti -0.061005
pH -> Air -0.062619
Gtype -> Substrain -0.069494
Phase -> Med -0.088711
Gtype -> Vess -0.101765
OD -> pH -0.110916
pH -> O -0.115579
Med -> Phase -0.141109
Strain -> Supp -0.141713
OD -> Med -0.146576
O -> pH -0.171850
O -> Phase -0.172337
Temp -> O -0.176784
Med -> Agit -0.184926
Technique -> Substrain -0.185523
pH -> Gtype -0.195987
Agit -> O -0.198706
Air -> pH -0.207277
Technique -> Gversion -0.217438
Substrain -> pH -0.224900
Anti -> Technique -0.236622
Temp -> Supp -0.247769
Phase -> Temp -0.251361
O -> Anti -0.258950
Phase -> Air -0.296968
Gversion -> Phase -0.334163
Strain -> Gtype -0.354448
Temp -> OD -0.372115
Supp -> Vess -0.373822
Technique -> O -0.377944
Temp -> Air -0.387921
Gtype -> Agit -0.388068
Med -> pH -0.390898
OD -> Technique -0.403462
Gtype -> Supp -0.415976
Med -> OD -0.439448
Phase -> O -0.459489
Agit -> Supp -0.466273
Substrain -> Supp -0.476326
Air -> Technique -0.478926
Gversion -> Gtype -0.480550
Supp -> pH -0.493263
OD -> O -0.494322
Med -> Temp -0.526802
Med -> Technique -0.529043
Technique -> Anti -0.536434
Med -> Air -0.542044
Gversion -> Supp -0.560515
Gversion -> Air -0.563324
Temp -> Gtype -0.566514
OD -> Gtype -0.571467
Supp -> Agit -0.575072
O -> Gversion -0.584599
Gtype -> Med -0.600777
Air -> Gtype -0.601523
Air -> OD -0.625530
Supp -> Air -0.640408
O -> Med -0.645613
pH -> Supp -0.661105
Anti -> Supp -0.673850
Technique -> Supp -0.685779
Supp -> Anti -0.696157
O -> Gtype -0.697594
Med -> Gtype -0.698140
Gversion -> O -0.716276
Agit -> Air -0.719972
Anti -> Gtype -0.761133
O -> Supp -0.805926
O -> Agit -0.812881
Gtype -> Technique -0.821125
Supp -> Gversion -0.879150
Technique -> OD -0.898325
Phase -> Supp -0.899248
Gtype -> OD -0.917840
Gtype -> Anti -0.938982
Phase -> Gtype -0.970879
Gtype -> Gversion -0.991803
Phase -> Technique -0.994629
Supp -> Technique -1.066156
Gtype -> Phase -1.074053
Air -> Temp -1.097909
O -> Temp -1.112113
OD -> Temp -1.124209
O -> OD -1.148233
Temp -> Med -1.176157
Air -> Phase -1.194842
Supp -> OD -1.247221
Air -> Supp -1.332944
OD -> Supp -1.409920
Supp -> Temp -1.420710
Air -> Agit -1.458571
Gtype -> O -1.487012
Phase -> OD -1.509812
Gtype -> Temp -1.541750
Technique -> Gtype -1.610047
Supp -> Phase -1.618780
Supp -> O -1.661613
Med -> O -1.926399
Supp -> Gtype -2.118176
Anti -> Temp -2.341403
Substrain -> O -2.360090
Technique -> pH -2.401114
O -> Air -2.673016
OD -> Air -2.766781
Supp -> Med -2.772525
Med -> Supp -3.865295
Top positive:
9.197225 Supp b'lemma:Iron'
9.034176 O b'lemma:_'
8.305144 Technique b'lemma:chipseq'
7.337757 Air b'lemma:aerobically'
7.331237 Phase b'lemma:stationary'
7.331237 Phase b'lemma:exponential'
7.225530 Supp b'lemma:pq'
6.911129 Gtype b'lemma:wt'
6.692480 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
6.563046 Air b'lemma:anaerobic'
6.458916 Supp b'lemma:2h'
6.458916 Supp b'-1:lemma:additional'
6.396136 Med b'lemma:MOPS'
6.389452 Supp b'-1:lemma:Cra'
6.167483 O b'lemma:Cra'
6.059308 Gversion b'lemma:asm584v2'
5.956175 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
5.914855 O b'-1:lemma:lb'
5.868458 O b'lemma:-'
5.717808 Gversion b'lemma:chip-seq'
5.691785 O b'-1:lemma:tag'
5.475534 Supp b'lemma:no3'
5.410984 Gtype b'lemma:WT'
5.329692 Med b'+1:lemma:0.4'
5.328338 Air b'-1:lemma:-'
5.324832 O b'-1:lemma:glucose'
5.317319 Technique b'lemma:ChIP-exo'
5.268806 Phase b'lemma:mid-log'
5.232604 Supp b'lemma:iptg'
5.217053 O b'lemma:with'
5.208784 Med b'lemma:LB'
5.095453 O b'-1:lemma:pq'
5.084788 O b'lemma:b'
5.028535 Gtype b'lemma:dfnr'
5.010663 Air b'lemma:anaeroibc'
4.931250 Air b'lemma:aerobic'
4.915515 Gtype b'lemma:arca8myc'
4.859794 O b'lemma:chip-fnr'
4.846115 Gtype b'lemma:type'
4.836742 O b'-1:lemma:0.3'
4.815613 O b'lemma:purr'
4.801954 Gtype b'hGreek'
4.772296 O b'lemma:chip-arca'
4.725119 O b'lemma:2'
4.707255 Anti b'lemma:seqa'
4.662171 Gtype b'+1:lemma:type'
4.660936 Strain b'lemma:k-12'
4.659684 Supp b'lemma:Fe'
4.631078 O b'lemma:\xcf\x8332'
4.602460 Supp b'+1:lemma:Deficient'
4.588267 Anti b'lemma:none'
4.577102 O b'-1:lemma:into'
4.554537 Supp b'lemma:nh4cl'
4.471026 Anti b'lemma:\xcf\x8332'
4.469997 O b'-1:lemma:nacl'
4.469484 Med b'-1:lemma:minimal'
4.397962 Supp b'lemma:rifampicin'
4.397438 O b'lemma:1'
4.371110 O b'-1:lemma:acetate'
4.359008 O b'-1:lemma:nh4cl'
4.330306 O b'lemma:CEL'
4.329988 O b'lemma:3'
4.319549 Vess b'lemma:flask'
4.319549 Vess b'-1:lemma:warm'
4.310621 O b'lemma:trpr'
4.283441 Gtype b'-1:ner:GEN'
4.274237 pH b'lemma:ph5'
4.274237 pH b'+1:lemma:.5'
4.270986 Supp b'lemma:nacl'
4.257365 Substrain b'lemma:mg1655star'
4.215884 O b'lemma:a'
4.173771 Med b'lemma:m63'
4.164324 O b'-1:lemma:no3'
4.146783 O b'lemma:ompr'
4.141997 OD b'lemma:od450'
4.088433 Med b'+1:lemma:2.0'
4.083964 O b'-1:lemma:arginine'
4.044714 Supp b'-1:lemma:+'
4.037873 Med b'lemma:lb'
4.033074 Supp b'lemma:arginine'
4.014995 Supp b'lemma:Leu'
3.992628 Temp b'-1:lemma:37'
3.932277 O b'-1:lemma:fructose'
3.928456 Supp b'lemma:Trp'
3.916143 O b'lemma:or'
3.890142 O b'lemma:argr'
3.887173 Supp b'-1:lemma:vol'
3.878037 Air b'-1:lemma:ryhb'
3.830177 Gtype b'lemma:wildtype'
3.815795 O b'lemma:affyexp'
3.790634 O b'lemma:rep2'
3.790634 O b'lemma:rep1'
3.770241 O b'lemma:for'
3.751405 Technique b'lemma:rnaseq'
3.741195 Substrain b'lemma:mg1655'
3.730388 O b'+1:lemma:pq'
3.729087 Gtype b'lemma:fnr8myc'
3.700698 Gtype b'lemma:deltaseqa'
3.700698 Gtype b'-1:lemma:old'
3.697617 O b'postag:VBG'
3.664287 Supp b'+1:lemma:2'
3.649876 O b'+1:lemma:wt'
3.649658 Agit b'+1:lemma:rpm'
3.636393 O b'+1:lemma:od600'
3.636335 Supp b'+1:lemma:iptg'
3.605002 O b'lemma:.'
3.605002 O b'postag:.'
3.604876 O b'lemma:at'
3.598396 Supp b'+1:lemma:1'
3.590778 Gtype b'lemma:pk4854'
3.584232 Supp b'lemma:Adenine'
3.550013 O b'lemma:rpob'
3.542507 O b'lemma::'
3.504932 Technique b'-1:lemma:_'
3.487386 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
3.448635 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.408543 O b'+1:lemma:250'
3.401562 Temp b'lemma:43'
3.400389 Supp b'-1:lemma:with'
3.400319 Med b'+1:lemma:+'
3.391405 Med b'lemma:media'
3.385280 O b'lemma:Lrp'
3.372195 Gversion b'lemma:u00096'
3.372195 Gversion b'+1:lemma:.2'
3.350355 O b'-1:lemma:anaerobic'
3.337604 O b'+1:lemma:k-12'
3.335517 Supp b'+1:lemma:deficient'
3.332694 O b'postag::'
3.319361 Med b'lemma:minimal'
3.308485 O b'lemma:soxr'
3.308485 O b'lemma:soxs'
3.301679 Temp b'-1:lemma:43'
3.275426 Air b'lemma:Anaerobic'
3.263935 Gversion b'lemma:nc'
3.259175 Gversion b'lemma:000913'
3.255934 Gtype b'lemma:ptac'
3.254377 Agit b'lemma:rpm'
3.248633 Med b'lemma:medium'
3.246814 Gtype b'-1:lemma:factor'
3.233064 Med b'-1:lemma:ml'
3.214364 O b'-1:lemma:Aerobic'
3.214261 Supp b'lemma:acetate'
3.207470 Agit b'-1:lemma:250'
3.193937 O b'lemma:genotype/variation'
3.189614 O b'+1:lemma:43'
3.186259 O b'lemma:culture'
3.160829 Air b'postag:RB'
3.159564 Strain b'+1:lemma:substr'
3.150662 Gtype b'+1:lemma:cra'
3.140916 OD b'lemma:od600'
3.129614 Anti b'lemma:anti-rpob'
3.122346 Air b'-1:lemma:cm20'
3.122113 O b'-1:lemma:-80'
3.109053 Phase b'-1:lemma:until'
3.103782 Med b'-1:lemma:fresh'
3.087700 O b'-1:lemma:min'
3.074369 O b'lemma:2-3'
3.063804 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
3.063804 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
3.059681 O b'+1:lemma:dpd'
3.056423 Air b'-1:lemma:co2'
3.042694 O b'-1:lemma:Anaerobic'
3.003752 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
3.002482 Gversion b'lemma:.2'
3.002482 Gversion b'-1:lemma:u00096'
3.001548 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.986541 O b'+1:lemma:0.2'
2.974765 Med b'+1:lemma:with'
2.956535 Supp b'-1:lemma:ompr'
2.937687 Gtype b'-1:lemma:rpob'
2.935905 Gtype b'lemma:nsrr'
2.935147 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
2.925162 Vess b'-1:postag:VBN'
2.923899 Gtype b'-1:postag:VBP'
2.923800 O b'lemma:Genome'
2.915149 O b'-1:lemma:leucine'
2.910501 O b'-1:lemma:medium'
2.897223 Air b'-1:lemma:_'
2.866720 Supp b'lemma:dpd'
2.860923 Supp b'lemma:glucose'
2.859682 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.853731 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.850547 O b'lemma:A'
2.850300 Technique b'lemma:rna-seq'
2.824281 O b'lemma:chip'
2.789666 O b'lemma:oxyr'
2.786591 O b'lemma:Nac'
2.786261 Supp b'+1:lemma:_'
2.783972 O b'-1:lemma:genotype/variation'
2.773731 Gtype b'+1:lemma:pq'
2.773226 Gtype b'lemma:delta-fnr'
2.771302 Gversion b'-1:lemma:nc'
2.771302 Gversion b'+1:lemma:000913'
2.724074 O b'-1:lemma:tryptophan'
2.723430 OD b'-1:lemma:od450'
2.710036 O b'-1:lemma:.5'
2.703226 O b'postag:SYM'
2.694403 Supp b'-1:lemma:30'
2.688719 Med b'+1:lemma:-lrb-'
2.681177 Gtype b'lemma:fur-8myc'
2.681177 Gtype b'lemma:cra-8myc-tagged'
2.679633 Gtype b'+1:lemma:control'
2.671287 O b'-1:lemma:wt'
2.667354 Gtype b'-1:lemma:wild'
2.653009 Gtype b'lemma:flagtag'
2.637711 O b'lemma:delta'
2.637431 Med b'+1:postag:-LRB-'
2.631752 Supp b'lemma:glutamine'
2.631752 Supp b'-1:lemma:2g/l'
2.623191 Gtype b'lemma:wild-type'
2.615871 O b'-1:lemma:type'
2.611348 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.605579 O b'-1:postag:NNS'
2.590152 Gtype b'-1:lemma:_'
2.573941 O b'-1:lemma:0.3-0.35'
2.566013 O b'-1:lemma:induce'
2.565847 Anti b'lemma:anti-rpos'
2.563713 Substrain b'-1:lemma:.'
2.563713 Substrain b'-1:postag:.'
2.553706 O b'+1:lemma:30'
2.545033 O b'-2:ner:MED'
2.541422 Gversion b'+1:lemma:genome'
2.538769 O b'lemma:cra'
2.536768 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.525657 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.512350 O b'lemma:s'
2.495005 Temp b'-1:lemma:sample'
2.490786 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
2.466259 Technique b'lemma:chip-seq'
2.450973 O b'lemma:additional'
2.450973 O b'+1:lemma:2h'
2.450570 Supp b'lemma:tryptophan'
2.450570 Supp b'-1:lemma:mg/l'
2.440051 Supp b'-1:lemma:sodium'
2.435663 OD b'lemma:0.3'
2.434780 pH b'+1:postag:CD'
2.432082 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
2.429231 Gtype b'lemma:phtpg'
2.428937 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
2.427167 Temp b'lemma:37'
2.426023 Gtype b'lemma:fnr-8myc'
2.426006 Technique b'-1:lemma:input'
2.420798 Anti b'-1:lemma:fnr'
2.418374 Anti b'hGreek'
2.407733 O b'lemma:gadx'
2.395096 Gtype b'lemma:wild'
2.393152 Gtype b'lemma:ompr-8myc'
2.378035 O b'-1:lemma:aerobic'
2.375112 O b'-1:lemma:dpd'
2.368498 pH b'+1:lemma:5.5'
2.364339 Gtype b'+2:ner:SUPP'
2.362528 Technique b'-1:lemma:1'
2.358483 Agit b'lemma:250'
2.357123 OD b'lemma:o.d.'
2.357123 OD b'+1:lemma:600nm'
2.357035 O b'lemma:ntrc'
2.357035 O b'lemma:csir'
2.349753 Supp b'+1:lemma:leucine'
2.344676 O b'lemma:treatment'
2.342404 O b'lemma:harbor'
2.339279 Supp b'-1:lemma:without'
2.330295 O b'lemma:\xcb\x9ac'
2.323284 O b'+1:lemma:minute'
2.320991 O b'+1:lemma:mid-log'
2.313137 O b'lemma:lrp'
2.308920 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
2.302274 O b'lemma:pt7'
2.300716 Technique b'-1:lemma:IP'
2.295712 O b'lemma:one'
2.294939 Supp b'lemma:fructose'
2.293874 Supp b'-1:lemma:contain'
2.289437 O b'+1:lemma:coli'
2.287289 Phase b'postag:NN'
2.286933 Supp b'+1:lemma:hour'
2.270402 Strain b'-1:lemma:.'
2.270402 Strain b'-1:postag:.'
2.267486 O b'lemma:C'
2.265971 Anti b'lemma:anti-myc'
2.261521 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
2.253844 OD b'lemma:0.3-0.35'
2.246225 Supp b'-1:lemma:wt'
2.240943 OD b'-1:lemma:at'
2.235552 Technique b'+1:ner:TF'
2.234494 O b'-1:lemma:shake'
2.228212 O b'-1:lemma:Leu'
2.221710 Technique b'hUpper'
2.220512 Gtype b'-1:lemma:from'
2.215954 Temp b'+1:lemma:short'
2.215843 O b'+1:lemma:b2'
2.207109 O b'postag:CC'
2.205871 O b'-1:lemma:nitrate'
2.201695 Gtype b'lemma:purr-8myc'
2.194862 Supp b'-1:lemma:respiration'
2.194862 Supp b'+1:lemma:mmol'
2.189908 Gtype b'+1:lemma:with'
2.185241 Gversion b'lemma:_'
2.184909 O b'-1:lemma:mg1655'
2.177786 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.174279 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.164358 O b'lemma:c'
2.136088 Supp b'lemma:leucine'
2.127914 Supp b'+1:lemma:mg/l'
2.115234 O b'lemma:+'
2.107688 Gtype b'+1:lemma:the'
2.098417 Vess b'+1:lemma:at'
2.097939 O b'+1:lemma:m9'
2.097256 O b'+1:lemma:od450'
2.096665 O b'-1:lemma:glutamine'
2.095928 Gtype b'+1:lemma::'
2.086731 Gtype b'+1:postag::'
2.078815 O b'-1:lemma:stpa'
2.077008 OD b'-1:lemma:600nm'
2.074122 O b'lemma:-80'
2.068984 O b'lemma:tag'
2.067407 Supp b'+1:lemma:min'
2.063822 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.043366 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.041798 Supp b'+1:lemma:mm'
2.041798 Supp b'+1:ner:KWSUPP'
2.033580 O b'+1:lemma:wash'
2.027392 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
2.025830 pH b'-1:lemma:at'
2.022842 OD b'lemma:600nm'
2.022842 OD b'-1:lemma:o.d.'
2.016225 pH b'lemma:ph'
2.006497 Anti b'+1:lemma:antibody'
2.003307 Med b'+1:lemma:minimal'
1.996309 O b'-1:lemma:media'
1.985345 O b'lemma:input'
1.985345 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.980234 pH b'lemma:5.5'
1.976037 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.975714 O b'-1:lemma:.2'
1.971086 Gtype b'lemma:delta-soxr'
1.971086 Gtype b'lemma:delta-gadx'
1.971086 Gtype b'lemma:delta-gadw'
1.971086 Gtype b'lemma:delta-oxyr'
1.971086 Gtype b'lemma:delta-gade'
1.971086 Gtype b'lemma:delta-soxs'
1.970510 Gtype b'lemma:gade-8myc'
1.965228 Supp b'-1:lemma:1m'
1.963142 Supp b'lemma:30'
1.944079 O b'lemma:600'
1.941965 Supp b'lemma:2g/l'
1.941965 Supp b'+1:lemma:glutamine'
1.940267 Gtype b'+1:lemma:chip'
1.935651 Supp b'-1:lemma:0.3'
1.917983 O b'+1:lemma:\xcb\x9ac'
1.914358 Anti b'+1:lemma:-lrb-'
1.911370 Med b'postag:NNP'
1.903451 O b'+1:lemma:tritonx-100'
1.899272 Gtype b'lemma::'
1.896149 O b'-1:lemma:Iron'
1.895834 Gtype b'lemma:delta-arca'
1.894702 O b'lemma:contain'
1.873149 Supp b'-1:lemma:final'
1.865010 O b'-1:lemma:one'
1.853075 O b'+1:lemma:b1'
1.852985 Supp b'+1:lemma:m'
1.845500 O b'+1:lemma:20'
1.842014 O b'+1:lemma:anaeroibc'
1.840323 OD b'+1:postag:IN'
1.830070 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.826243 Air b'lemma:anerobically'
1.820915 Anti b'-1:lemma:myc'
1.817923 OD b'-1:lemma:about'
1.815106 O b'-1:lemma:Adenine'
1.801400 Air b'lemma:Aerobic'
1.789924 O b'-1:lemma:sc-28207'
1.789767 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.784058 Anti b'lemma:anti-flag'
1.784058 Anti b'+1:lemma:mab'
1.783196 Supp b'-1:lemma:soxr'
1.783196 Supp b'-1:lemma:soxs'
1.778751 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.772707 Supp b'lemma:1g/l'
1.771876 pH b'lemma:.5'
1.771876 pH b'-1:lemma:ph5'
1.768913 OD b'+1:lemma:,'
1.768913 OD b'+1:postag:,'
1.768730 Anti b'lemma:mab'
1.768730 Anti b'-1:lemma:anti-flag'
1.766921 O b'-1:lemma:rpm'
1.763302 Vess b'+1:postag:IN'
1.762769 Substrain b'postag:NN'
1.762661 Supp b'-1:lemma:oxyr'
1.756580 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
1.743104 O b'lemma:genotype'
1.741054 O b'lemma:EB'
1.740838 O b'postag:DT'
1.735492 Med b'+1:lemma:g/l'
1.719495 Air b'+1:lemma:b'
1.713207 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
1.710006 O b'+1:lemma:nh4cl'
1.708221 O b'-1:lemma:w0002'
1.703819 O b'-1:lemma:genbank'
1.703090 Air b'postag:JJ'
1.702943 Gtype b'lemma:the'
1.700794 Anti b'+1:lemma:from'
1.694616 O b'lemma:until'
1.686951 Gtype b'-1:lemma:Fur'
1.684466 Supp b'lemma:cm20'
1.684466 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.683704 Supp b'-1:lemma:2'
1.682601 Air b'lemma:co2'
1.682519 O b'-1:lemma:phase'
1.679926 Supp b'-1:lemma:cra'
1.678431 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.673398 O b'-1:lemma:concentration'
1.673398 O b'+1:lemma:150'
1.662366 O b'-1:lemma:l1'
1.659719 O b'+1:lemma:37'
1.659428 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
1.654375 O b'+1:lemma:respiration'
1.640048 Gtype b'lemma:oxyr-8myc'
1.640048 Gtype b'lemma:soxr-8myc'
1.640048 Gtype b'lemma:soxs-8myc'
1.636579 Supp b'+1:lemma:and'
1.626457 Supp b'+1:lemma:anaerobically'
1.620124 Gtype b'+1:postag:DT'
1.618841 Air b'+1:lemma:at'
1.613832 O b'lemma:growth'
1.609586 Supp b'lemma:1m'
1.609447 Supp b'-1:lemma:for'
1.602463 Supp b'lemma:150'
1.602463 Supp b'+1:lemma:mg/ml'
1.596210 Technique b'postag:NNP'
1.593105 Gtype b'lemma:crp'
1.587946 Supp b'-1:lemma:m'
1.577215 O b'lemma:respiration'
1.568347 OD b'lemma:0.35'
1.559280 O b'-1:lemma:genotype'
1.555610 Gtype b'lemma:Wild'
1.551783 Gtype b'-1:lemma:delta'
1.550271 Anti b'+1:postag:-LRB-'
1.548604 pH b'+1:lemma:.'
1.548604 pH b'+1:postag:.'
1.538039 Technique b'lemma:ChIPSeq'
1.537189 Air b'-1:lemma:%'
1.534460 OD b'-1:lemma:~'
1.533286 Gtype b'+1:lemma:mg1655'
1.531343 Temp b'+1:lemma:and'
1.530606 O b'lemma:ecolus'
1.530250 O b'+1:lemma:fructose'
1.518050 Supp b'-2:ner:MED'
1.518044 pH b'-1:lemma:ph'
1.515658 O b'lemma:10'
1.512836 O b'-1:lemma:or'
1.505243 O b'+1:lemma:sparging'
1.501298 O b'lemma:ml'
1.499367 Med b'-1:lemma:glucose'
1.493488 Phase b'+1:lemma:culture'
1.489122 Technique b'+1:postag:NN'
1.485763 Gtype b'+1:lemma:small'
1.484892 Air b'-1:postag:CD'
1.482241 Med b'+1:lemma:2'
1.482003 Supp b'-1:postag:SYM'
1.476300 Phase b'-1:postag::'
1.476254 Med b'+1:postag:CD'
1.475766 Phase b'-1:lemma::'
1.471132 Supp b'-1:postag:CD'
1.458296 Anti b'-1:postag:JJ'
1.457399 O b'-1:lemma:4'
1.456808 Gtype b'hUpper'
1.452170 Supp b'lemma:sodium'
1.447253 OD b'-1:postag:IN'
1.444839 Supp b'lemma:feso4'
1.439060 Med b'+1:lemma:supplement'
1.433818 Supp b'+1:lemma:1/100'
1.431143 Technique b'+1:lemma:rpos'
1.430254 Gtype b'hLower'
1.428904 pH b'-2:ner:SUPP'
1.425268 Supp b'-1:lemma:0.2'
1.423050 Technique b'lemma:chip-exo'
1.414716 O b'-1:lemma:wp002'
1.409208 O b'-1:lemma:wp009'
1.408065 Air b'+1:lemma:-'
1.404938 Gtype b'lemma:lack'
1.401465 Anti b'+1:postag:IN'
1.398861 O b'+1:ner:SUPP'
1.389508 Technique b'-1:lemma:2'
1.388815 Anti b'-1:lemma::'
1.386270 O b'-1:lemma:0.35'
1.382760 O b'lemma:agitation'
1.379413 O b'-1:lemma:coli'
1.379409 Temp b'-1:lemma:see'
1.375763 Phase b'+1:lemma:phase'
1.371035 O b'lemma:supplement'
1.357002 O b'+1:lemma:no3'
1.355097 Gtype b'+1:lemma:_'
1.354690 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.351256 Gtype b'-1:lemma:knock-out'
1.350371 Gtype b'-1:lemma:dfnr'
1.349822 O b'+1:lemma::'
1.346605 Anti b'-1:lemma:polymerase'
1.345223 Supp b'+1:lemma:be'
1.344063 O b'+1:lemma:anerobically'
1.340612 Med b'postag:NNS'
1.339783 OD b'postag:IN'
1.339720 O b'+1:postag:VBP'
Top negative:
0.033857 Temp b'-1:postag:-LRB-'
0.033831 O b'-1:lemma:Deficient'
0.033251 Supp b'lemma:8'
0.032213 OD b'lemma:='
0.030613 O b'-1:lemma:agitation'
0.029489 Gtype b'+1:ner:_'
0.027472 Air b'postag:-LRB-'
0.026417 Supp b'lemma:-rrb-'
0.026169 O b'lemma:vol'
0.026169 O b'-1:lemma:1/100'
0.024441 Temp b'-1:lemma:-lrb-'
0.022284 Air b'-1:lemma:-lrb-'
0.020373 Gtype b'+1:postag:NNP'
0.019910 Air b'-1:postag:-LRB-'
0.019793 O b'-1:postag:DT'
0.015413 Gtype b'+1:ner:SUPP'
0.015363 Gtype b'lemma:_'
0.013669 Air b'+1:postag:NNS'
0.012323 O b'+1:lemma:cacl2'
0.011480 O b'-1:lemma:methanol'
0.011374 O b'lemma:ompr-8myc'
0.010511 Anti b'-1:lemma:pre-cleared'
0.010417 pH b'-1:ner:_'
0.009071 O b'lemma:ihf'
0.008894 Gtype b'lemma:,'
0.008894 Gtype b'postag:,'
0.007747 Med b'+1:ner:SUPP'
0.005409 O b'-1:lemma:flagtag'
0.004262 O b'-1:lemma:MOPS'
0.004076 O b'lemma:final'
0.003920 O b'+1:lemma:wild-type'
0.003514 O b'+1:lemma:harvest'
0.003367 Supp b'+1:lemma:in'
0.003335 Supp b'postag:IN'
0.002448 Supp b'+1:lemma:dissolve'
0.002180 pH b'-2:ner:TF'
0.001559 Substrain b'+1:ner:_'
0.001464 Anti b'lemma:ihf'
0.001129 O b'-1:lemma:formaldehyde'
0.000796 OD b'+1:lemma:in'
0.000768 O b'+1:lemma:gadw'
0.000756 OD b'+1:lemma:2.0'
0.000725 O b'lemma:l1'
0.000409 Supp b'postag:-RRB-'
0.000370 O b'lemma:-lsb-'
0.000365 O b'-1:lemma:subsequently'
0.000358 O b'+1:lemma:condition'
0.000339 Technique b'-1:postag:SYM'
0.000320 O b'+1:lemma:lack'
0.000314 Anti b'lemma:polyclonal'
0.000314 Anti b'-1:lemma:ihf'
0.000239 O b'lemma:b2'
0.000176 O b'-1:lemma:neg'
0.000173 O b'-1:lemma:per-gene'
0.000150 Technique b'-2:ner:TF'
0.000150 Gtype b'-1:lemma:-rcb-'
0.000138 Anti b'+1:lemma:subunit'
0.000083 O b'+1:lemma:0.1'
0.000065 Air b'+1:postag:-RRB-'
0.000036 Anti b'-1:postag:VBN'
0.000032 O b'+1:lemma:NeoClone'
0.000017 O b'lemma:repeatedly'
0.000013 O b'lemma:TEX'
0.000009 O b'-1:lemma:buffer'
0.000006 O b'+1:lemma:beginning'
-0.000000 Gversion b'-1:postag:CD'
0.000000 O b'-1:lemma:paraquat'
0.000000 O b'lemma:wp009'
0.000000 O b'lemma:wp002'
-0.000007 Temp b'-1:postag:JJ'
-0.000020 Gtype b'-1:postag:NNS'
-0.000131 O b'+1:lemma:rep2'
-0.000131 O b'+1:lemma:rep1'
-0.000138 Gversion b'hGreek'
-0.000279 pH b'hGreek'
-0.000422 Air b'lemma:-rrb-'
-0.001047 Supp b'lemma:250'
-0.001843 Gtype b'+1:postag:IN'
-0.001990 O b'lemma:95'
-0.002139 O b'lemma:nitrate'
-0.002368 O b'+1:postag:FW'
-0.003423 Med b'-1:lemma:MOPS'
-0.003776 O b'-2:ner:SUPP'
-0.005332 Med b'-1:postag:CC'
-0.005952 O b'lemma:8'
-0.007471 Gtype b'lemma:-lrb-'
-0.008531 Air b'-1:lemma:aerobically'
-0.008872 O b'+1:lemma:strain'
-0.009329 Supp b'+1:postag:SYM'
-0.012147 O b'lemma:chip-exo'
-0.014053 O b'+1:lemma:delta'
-0.014562 Gtype b'postag:NNS'
-0.014656 O b'lemma:pahse'
-0.014957 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.016888 Agit b'-2:ner:_'
-0.018188 O b'lemma:glucose'
-0.018939 O b'-1:lemma:25'
-0.019427 Technique b'+1:postag:-RRB-'
-0.019685 Technique b'+1:lemma:-rrb-'
-0.020451 Phase b'+1:lemma:aerobically'
-0.021578 Supp b'-1:lemma:Fe'
-0.022140 Vess b'symb'
-0.022417 O b'+1:lemma:='
-0.022616 Strain b'-1:ner:_'
-0.024502 Temp b'-1:postag:NN'
-0.024909 O b'-1:lemma:='
-0.025764 Med b'-2:ner:_'
-0.027230 Supp b'-1:lemma:250'
-0.028476 O b'-1:lemma:to'
-0.028476 O b'-1:postag:TO'
-0.029278 Vess b'+2:ner:_'
-0.029644 O b'-1:postag:VBG'
-0.029741 Phase b'+1:postag:RB'
-0.030797 OD b'-2:ner:_'
-0.030809 Air b'lemma:anaerobically'
-0.032572 Supp b'lemma:,'
-0.032572 Supp b'postag:,'
-0.033905 Vess b'+1:ner:_'
-0.034371 Gversion b'symb'
-0.034773 Agit b'postag:CD'
-0.036037 O b'+1:lemma:culture'
-0.037297 Anti b'+2:ner:GEN'
-0.039025 O b'-1:postag:VBN'
-0.039100 Supp b'+2:ner:KWSUPP'
-0.040885 Supp b'-1:lemma:;'
-0.043915 Gtype b'lemma:-rrb-'
-0.044329 O b'lemma:min'
-0.047122 O b'lemma:phosphate'
-0.047557 O b'-1:lemma:um'
-0.047557 O b'+1:lemma:paraquat'
-0.048206 Gtype b'-1:postag:CD'
-0.050865 O b'lemma:1/100'
-0.050865 O b'+1:lemma:vol'
-0.051892 O b'+1:lemma:25'
-0.052369 O b'+1:lemma:mm'
-0.052369 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.053294 Gtype b'postag:FW'
-0.053896 O b'-1:lemma:0.1'
-0.054363 O b'+1:lemma:a'
-0.057068 O b'-1:lemma:gade'
-0.057454 O b'-1:lemma:mm'
-0.058713 O b'lemma:hour'
-0.058965 O b'-1:lemma:20'
-0.059264 O b'lemma:5'
-0.060460 O b'+1:lemma:95'
-0.060674 O b'-1:lemma:with'
-0.063266 O b'+1:lemma:pahse'
-0.063405 O b'-1:lemma:for'
-0.063759 O b'lemma:0.1'
-0.064498 O b'-1:lemma:gadw'
-0.064577 Air b'postag:-RRB-'
-0.064947 Anti b'-1:ner:_'
-0.065601 O b'lemma:affinity'
-0.066559 O b'-1:lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.067943 Gtype b'+1:lemma:glucose'
-0.068968 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.069183 O b'lemma:25'
-0.069509 Phase b'hGreek'
-0.070310 Agit b'postag:NN'
-0.071560 O b'+1:lemma:.'
-0.071560 O b'+1:postag:.'
-0.071937 O b'-1:lemma:70'
-0.074847 O b'-1:lemma:anaerobically'
-0.075577 Temp b'+2:ner:MED'
-0.076200 pH b'+2:ner:_'
-0.076242 Supp b'postag:CD'
-0.077892 pH b'hUpper'
-0.081358 Phase b'+1:ner:_'
-0.082414 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.089368 pH b'hLower'
-0.089498 Strain b'+2:ner:_'
-0.089671 Supp b'-1:lemma:8'
-0.091299 O b'postag:NN'
-0.092330 Air b'postag:CD'
-0.094801 O b'+1:lemma:70'
-0.097201 O b'+1:lemma:1/100'
-0.098327 O b'-1:lemma:\xce\xb4ompr'
-0.098419 Supp b'-1:postag:NN'
-0.098928 O b'lemma:sodium'
-0.101615 Supp b'-1:lemma:and'
-0.101905 O b'lemma:70'
-0.102535 O b'lemma:;'
-0.102535 O b'-1:lemma:7.6'
-0.103690 O b'lemma:0.2'
-0.104272 O b'-1:lemma:harbor'
-0.104979 Med b'-1:postag:NN'
-0.106404 Med b'-1:postag:NNP'
-0.110731 Gtype b'postag:-LRB-'
-0.115577 Technique b'-2:ner:_'
-0.115923 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.120251 O b'+1:lemma:phosphate'
-0.121124 O b'+1:lemma:minimal'
-0.121861 O b'+1:lemma:o2'
-0.122395 O b'+1:lemma:-lcb-'
-0.122409 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.122627 Anti b'+1:ner:_'
-0.123483 O b'+1:lemma:min'
-0.123897 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.124703 Gtype b'+1:lemma:b'
-0.128544 O b'+1:lemma:be'
-0.129540 Vess b'-2:ner:_'
-0.132982 Med b'-1:lemma:m9'
-0.133869 OD b'postag:JJ'
-0.136864 O b'+1:postag:NNS'
-0.139591 Supp b'lemma:and'
-0.140785 O b'lemma:purify'
-0.140834 O b'lemma:7.6'
-0.140834 O b'+1:lemma:;'
-0.143070 pH b'postag:NN'
-0.143799 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.144794 OD b'+1:lemma:.'
-0.144794 OD b'+1:postag:.'
-0.145656 O b'-1:lemma:in'
-0.148053 Anti b'postag:NNP'
-0.148695 Supp b'lemma:paraquat'
-0.151477 O b'-1:lemma:-'
-0.154593 Supp b'hUpper'
-0.155557 Gtype b'+1:lemma:pk4854'
-0.158077 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.158474 O b'+1:lemma:phase'
-0.159734 O b'+1:lemma:gadx'
-0.160930 O b'-1:lemma:the'
-0.162088 O b'-1:lemma:k-12'
-0.162925 O b'+1:lemma:0.3'
-0.164704 Air b'+1:postag:NN'
-0.165512 O b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.168722 Supp b'-1:lemma:%'
-0.172430 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.172450 O b'+1:lemma:n2'
-0.175459 O b'-1:lemma:minimal'
-0.176708 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.178940 O b'+1:lemma:7.6'
-0.180698 O b'+1:lemma:fnr'
-0.181900 O b'+1:lemma:until'
-0.182685 Anti b'-1:postag:NN'
-0.184679 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.185307 O b'+1:lemma:A'
-0.186709 O b'lemma:mg/ml'
-0.186709 O b'-1:lemma:150'
-0.186957 O b'lemma:\xc3\x9f'
-0.187575 O b'-1:lemma:of'
-0.187612 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.191660 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.191956 O b'postag:VB'
-0.198091 O b'+1:lemma:media'
-0.198384 Supp b'lemma:10'
-0.200008 Anti b'-1:postag:CD'
-0.200567 O b'-1:lemma:gadx'
-0.200770 Gtype b'+1:postag:NNS'
-0.203448 Temp b'symb'
-0.204265 O b'+1:lemma:~'
-0.208016 Technique b'+2:ner:_'
-0.208578 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.211105 O b'-1:postag:CD'
-0.212224 O b'+1:lemma:ph'
-0.226431 Med b'-1:ner:MED'
-0.226884 Supp b'lemma:2'
-0.227840 Technique b'-1:postag:CD'
-0.239456 O b'lemma:minimal'
-0.241498 O b'+1:lemma:arginine'
-0.244473 O b'+1:postag:DT'
-0.247086 O b'-1:lemma:affinity'
-0.250030 Substrain b'+2:ner:_'
-0.252051 O b'+1:lemma:pk4854'
-0.255164 O b'lemma:o2'
-0.256726 O b'+1:postag:CD'
-0.258006 Gtype b'lemma:control'
-0.258971 O b'lemma:fecl2'
-0.259294 O b'lemma:1m'
-0.259356 Med b'-1:postag:IN'
-0.259766 O b'-1:lemma:Fur'
-0.260438 O b'lemma:lb'
-0.260777 O b'-1:lemma:250'
-0.263221 Supp b'+1:postag::'
-0.266167 O b'+1:lemma:purify'
-0.266259 O b'-1:lemma:control'
-0.270972 O b'+1:lemma:sample'
-0.272911 OD b'postag:NN'
-0.276664 Temp b'postag:JJ'
-0.282397 Gtype b'lemma:fnr'
-0.286932 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.290582 Anti b'symb'
-0.291397 Supp b'postag:CC'
-0.293788 O b'lemma:m63'
-0.294303 O b'-1:lemma:sodium'
-0.298884 O b'+1:lemma:co2'
-0.302480 Substrain b'symb'
-0.303637 Strain b'+1:ner:_'
-0.305017 O b'-1:lemma:0.2'
-0.305364 Supp b'-1:postag:VBG'
-0.305505 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.306196 O b'lemma:20'
-0.311306 O b'-1:lemma:g/l'
-0.312216 O b'lemma:dissolve'
-0.313151 O b'postag:JJ'
-0.313724 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.316370 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.321921 O b'-2:ner:GEN'
-0.324038 Gtype b'+1:lemma:fnr'
-0.326874 O b'lemma:n2'
-0.333198 O b'+1:lemma:5'
-0.334362 O b'lemma:phase'
-0.337284 Substrain b'-2:ner:_'
-0.339722 Med b'+1:postag:IN'
-0.346948 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.348361 Med b'-1:ner:_'
-0.356514 Temp b'hGreek'
-0.362400 O b'+1:lemma:the'
-0.363411 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.364545 Phase b'-1:lemma:at'
-0.365285 O b'-1:ner:SUPP'
-0.377145 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.377145 Gtype b'-1:postag:,'
-0.385566 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.392027 Gtype b'+1:postag:-LRB-'
-0.394728 Vess b'-1:ner:_'
-0.395368 O b'lemma:ph'
-0.396150 Gtype b'-1:lemma:crp'
-0.396659 O b'lemma:250'
-0.397489 Supp b'postag:-LRB-'
-0.400398 O b'lemma:sample'
-0.401764 O b'-1:lemma:delta'
-0.403714 O b'lemma:co2'
-0.405788 O b'-1:lemma:~'
-0.407072 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.416810 O b'-1:lemma:o2'
-0.417559 OD b'symb'
-0.426905 O b'lemma:rna'
-0.429879 O b'lemma:150'
-0.429879 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.443591 O b'+2:ner:SUPP'
-0.450747 Gversion b'hLower'
-0.452870 O b'-1:postag:VB'
-0.457975 OD b'hUpper'
-0.461263 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.461263 O b'+1:lemma:methanol'
-0.463340 Anti b'+2:ner:_'
-0.464214 Air b'postag:NNP'
-0.468684 pH b'-2:ner:_'
-0.480272 Supp b'+1:postag:NNP'
-0.481051 O b'+1:postag:VBG'
-0.482341 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.484117 Supp b'-1:lemma:the'
-0.484334 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.491599 Phase b'-2:ner:SUPP'
-0.495615 O b'-1:lemma:1m'
-0.502371 Temp b'postag:NN'
-0.513072 O b'+1:lemma:1m'
-0.513445 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.516859 Gtype b'postag:-RRB-'
-0.519909 Med b'+1:lemma:m9'
-0.521943 O b'-1:lemma:purify'
-0.525783 OD b'hLower'
-0.529466 Anti b'hUpper'
-0.531537 O b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.531575 O b'+1:postag:IN'
-0.534393 O b'+1:lemma:2.0'
-0.537134 O b'-1:lemma:od600'
-0.541351 Med b'+1:ner:MED'
-0.542372 Gtype b'postag:CD'
-0.543838 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.550532 O b'lemma:fructose'
-0.553597 O b'+1:lemma:%'
-0.556452 O b'lemma:methanol'
-0.557787 O b'-1:postag:IN'
-0.559160 O b'-1:lemma:%'
-0.561233 Supp b'lemma:300'
-0.579821 O b'-1:lemma:.'
-0.579821 O b'-1:postag:.'
-0.581263 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.595641 O b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.604061 O b'+2:ner:TF'
-0.610940 Anti b'postag:CD'
-0.615078 Gtype b'-1:postag:SYM'
-0.615373 Air b'-1:lemma:grow'
-0.619167 O b'+1:postag:VB'
-0.628743 Vess b'hLower'
-0.630944 O b'lemma:m'
-0.631868 O b'-1:lemma:ph'
-0.636973 O b'-1:lemma:final'
-0.687139 O b'lemma:0.3'
-0.699427 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.705960 O b'lemma:mid-log'
-0.708109 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.708109 Gtype b'+1:postag:,'
-0.710161 O b'lemma:aerobic'
-0.716374 O b'+1:lemma:rna'
-0.725076 O b'-1:lemma:n2'
-0.741719 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.744719 O b'-2:ner:TF'
-0.753470 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.756994 O b'lemma:od600'
-0.758976 Med b'-1:postag:CD'
-0.767954 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.780431 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.794708 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.808666 Supp b'postag:NNS'
-0.817224 O b'+1:lemma:from'
-0.822411 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.830587 Gtype b'-1:lemma:fur'
-0.835584 Agit b'hLower'
-0.840643 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.850996 Temp b'+1:postag:IN'
-0.852792 O b'lemma:of'
-0.866778 Substrain b'hLower'
-0.874225 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.885545 O b'+1:lemma:g/l'
-0.893126 O b'+1:lemma:b'
-0.902590 Med b'hLower'
-0.909073 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.926144 O b'-1:lemma:1'
-0.959419 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.967037 Med b'+1:postag:NN'
-0.976355 O b'lemma:medium'
-0.978259 O b'+1:lemma:300'
-0.979501 Supp b'-1:postag:DT'
-0.981415 O b'hGreek'
-0.994326 Gtype b'+1:postag:CC'
-1.010598 O b'+1:lemma:supplement'
-1.026714 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-1.035877 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-1.058337 O b'-1:lemma:rna'
-1.093134 O b'+1:lemma:at'
-1.106749 O b'+1:lemma:contain'
-1.106798 Technique b'-1:lemma::'
-1.130978 Gtype b'-1:postag:CC'
-1.149559 O b'-1:lemma:30'
-1.157867 Substrain b'-1:ner:_'
-1.172672 O b'-1:lemma:m'
-1.175901 O b'lemma:dpd'
-1.178680 Med b'postag:-LRB-'
-1.192666 O b'-1:lemma:37'
-1.195988 Med b'lemma:-lrb-'
-1.214437 O b'lemma:30'
-1.215118 pH b'symb'
-1.237382 O b'lemma:37'
-1.241084 O b'-1:ner:GEN'
-1.244091 O b'lemma:anaerobic'
-1.251525 O b'-1:postag::'
-1.272881 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-1.275044 Med b'+1:postag:CC'
-1.287344 Vess b'hUpper'
-1.334750 O b'+1:lemma:2'
-1.350303 Temp b'hLower'
-1.354464 O b'+1:lemma:antibody'
-1.380558 Gtype b'postag::'
-1.408959 O b'-1:lemma:IP'
-1.429689 OD b'+1:postag:NN'
-1.439956 O b'postag:RB'
-1.446129 Technique b'-1:postag::'
-1.460449 O b'-1:lemma:from'
-1.521708 O b'-1:lemma:co2'
-1.543387 Supp b'postag:JJ'
-1.550906 Supp b'+1:lemma:nacl'
-1.563578 O b'+1:lemma:genome'
-1.578890 O b'+1:lemma:in'
-1.584011 O b'+1:lemma:m'
-1.595135 O b'lemma:media'
-1.623656 O b'lemma:nacl'
-1.747411 O b'-1:lemma:sample'
-1.759842 Technique b'+1:ner:_'
-1.781767 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.788404 Supp b'+1:lemma:acetate'
-1.791013 Agit b'hUpper'
-1.793786 Strain b'hLower'
-1.827667 O b'-1:lemma:ml'
-1.833820 O b'lemma:nh4cl'
-1.879293 O b'-1:lemma:rpob'
-1.907628 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-1.926563 Gtype b'+1:lemma:crp'
-1.955936 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.957770 Med b'postag:CD'
-1.972487 Air b'postag:NN'
-2.027174 Supp b'+1:lemma:,'
-2.027174 Supp b'+1:postag:,'
-2.029621 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-2.037273 O b'-1:lemma:vol'
-2.089901 O b'+1:lemma:1'
-2.110226 Supp b'hGreek'
-2.133396 O b'-1:lemma:until'
-2.143943 O b'-1:lemma:contain'
-2.149027 Gtype b'symb'
-2.157541 O b'+1:lemma:_'
-2.184464 O b'-1:lemma:2'
-2.191425 O b'lemma:aerobically'
-2.253846 Strain b'symb'
-2.357278 O b'lemma:rifampicin'
-2.376772 O b'lemma:wt'
-2.475144 Phase b'symb'
-2.476390 Med b'-2:ner:MED'
-2.527705 Air b'-1:postag:VBN'
-2.536453 O b'+1:lemma:hour'
-2.544166 O b'-1:lemma:_'
-3.156802 Temp b'+1:lemma:with'
-3.206148 Phase b'postag:JJ'
-3.331800 O b'-1:lemma:fresh'
-3.372381 Technique b'symb'
-3.418455 O b'+1:lemma:+'
-3.613757 Phase b'hUpper'
-6.511016 O b'-1:lemma::'