report_Run6_v13.txt
38.4 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.04040337116517548, 'c2': 0.0019871392632971135}
best CV score:0.8577895989909314
model size: 0.10M
Flat F1: 0.8139145759412987
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.590 0.557 0.573 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.937 0.756 0.837 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.864 0.838 0.851 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.861 0.777 0.814 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 7.192233
Med -> Med 5.844921
Anti -> Anti 5.663028
Supp -> Supp 5.580135
Gversion -> Gversion 5.476031
Gtype -> Gtype 5.351023
OD -> OD 5.319429
Air -> Air 4.087764
pH -> pH 3.892224
Phase -> Phase 3.780925
O -> O 3.383635
Technique -> Technique 3.308413
Agit -> Agit 3.175925
Substrain -> Gtype 2.402019
Gtype -> Supp 0.385280
O -> Technique 0.179286
Technique -> Air 0.169543
O -> Gtype 0.051163
Temp -> O 0.026710
Strain -> O -0.004767
O -> Strain -0.048585
Med -> O -0.053655
pH -> O -0.057644
Air -> Supp -0.100050
Gtype -> Med -0.133670
Technique -> Gtype -0.214788
Gtype -> Technique -0.220532
Phase -> Air -0.228816
Gversion -> O -0.230872
Anti -> Supp -0.260706
O -> Temp -0.285988
O -> Gversion -0.302005
O -> pH -0.345616
Supp -> Phase -0.351130
Gtype -> Phase -0.371104
O -> OD -0.386381
Phase -> OD -0.393438
O -> Supp -0.426110
Air -> Phase -0.526114
Air -> OD -0.574572
Agit -> Air -0.616830
O -> Anti -0.641695
Anti -> O -0.646730
Air -> O -0.751769
OD -> Air -0.756494
O -> Phase -0.806157
Supp -> O -0.867214
Phase -> O -0.917180
Anti -> Gtype -1.023580
Supp -> Med -1.037544
Gtype -> Temp -1.167093
O -> Med -1.200609
Temp -> Med -1.324189
Technique -> O -1.382429
OD -> O -1.403237
Gtype -> O -1.964415
Substrain -> O -2.335998
Technique -> pH -2.431722
O -> Air -2.519969
Med -> Supp -2.647949
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 7.192233
Med -> Med 5.844921
Anti -> Anti 5.663028
Supp -> Supp 5.580135
Gversion -> Gversion 5.476031
Gtype -> Gtype 5.351023
OD -> OD 5.319429
Air -> Air 4.087764
pH -> pH 3.892224
Phase -> Phase 3.780925
O -> O 3.383635
Technique -> Technique 3.308413
Agit -> Agit 3.175925
Substrain -> Gtype 2.402019
Gtype -> Supp 0.385280
O -> Technique 0.179286
Technique -> Air 0.169543
O -> Gtype 0.051163
Temp -> O 0.026710
Strain -> O -0.004767
O -> Strain -0.048585
Med -> O -0.053655
pH -> O -0.057644
Air -> Supp -0.100050
Gtype -> Med -0.133670
Technique -> Gtype -0.214788
Gtype -> Technique -0.220532
Phase -> Air -0.228816
Gversion -> O -0.230872
Anti -> Supp -0.260706
O -> Temp -0.285988
O -> Gversion -0.302005
O -> pH -0.345616
Supp -> Phase -0.351130
Gtype -> Phase -0.371104
O -> OD -0.386381
Phase -> OD -0.393438
O -> Supp -0.426110
Air -> Phase -0.526114
Air -> OD -0.574572
Agit -> Air -0.616830
O -> Anti -0.641695
Anti -> O -0.646730
Air -> O -0.751769
OD -> Air -0.756494
O -> Phase -0.806157
Supp -> O -0.867214
Phase -> O -0.917180
Anti -> Gtype -1.023580
Supp -> Med -1.037544
Gtype -> Temp -1.167093
O -> Med -1.200609
Temp -> Med -1.324189
Technique -> O -1.382429
OD -> O -1.403237
Gtype -> O -1.964415
Substrain -> O -2.335998
Technique -> pH -2.431722
O -> Air -2.519969
Med -> Supp -2.647949
Top positive:
10.071711 O b'-2:lemma:_'
9.687056 Phase b'-2:lemma:phase'
8.519482 Anti b'-2:lemma:antibody'
8.280508 O b'lemma:-'
8.150065 Supp b'lemma:no3'
8.000690 Air b'lemma:anaerobic'
7.944101 Supp b'-2:lemma:shake'
7.491120 Gtype b'lemma:type'
7.463359 O b'lemma:1'
7.340191 O b'lemma:_'
7.090340 Med b'lemma:MOPS'
7.080554 Gtype b'lemma:wt'
6.877952 Air b'lemma:aerobic'
6.741586 O b'lemma:2'
6.684707 Supp b'lemma:pq'
6.623378 Technique b'lemma:chipseq'
6.423412 O b'lemma:3'
6.186981 Gtype b'+1:lemma:type'
6.110488 Gtype b'hGreek'
5.964315 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
5.896855 O b'-1:postag:NNS'
5.886828 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
5.820852 O b'lemma:with'
5.776943 Supp b'lemma:nh4cl'
5.697543 O b'postag:VBG'
5.538554 Supp b'lemma:acetate'
5.405845 Supp b'lemma:Iron'
5.405845 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
5.396288 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
5.395870 Air b'-2:lemma:IP'
5.275403 O b'lemma:b'
5.110398 Supp b'lemma:arginine'
5.089856 Supp b'-1:lemma:+'
4.992810 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
4.862622 Supp b'lemma:2h'
4.862622 Supp b'-1:lemma:additional'
4.859641 Phase b'lemma:mid-log'
4.745449 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
4.687533 OD b'-2:lemma:od450'
4.687362 O b'lemma:Cra'
4.602781 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
4.565248 Supp b'-1:lemma:Cra'
4.559805 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
4.559564 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
4.550354 O b'lemma:.'
4.550354 O b'postag:.'
4.543905 O b'+1:lemma:wt'
4.542465 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
4.505562 Gversion b'lemma:chip-seq'
4.396297 O b'+2:lemma:crp'
4.393542 Med b'lemma:LB'
4.389588 O b'-1:lemma:0.3'
4.383928 Gtype b'lemma:pk4854'
4.342282 Gtype b'lemma:dfnr'
4.289948 Supp b'+2:lemma:iptg'
4.288872 Med b'+2:lemma:b2'
4.235089 Substrain b'-2:lemma:substr'
4.208516 Technique b'lemma:ChIP-exo'
4.194225 Supp b'lemma:nacl'
4.159483 Supp b'lemma:iptg'
4.147789 Supp b'-2:lemma:purr'
4.126878 Gtype b'-2:lemma:genotype'
4.120599 Supp b'lemma:glucose'
4.074905 O b'-2:lemma:myc'
3.975380 O b'lemma:rep2'
3.975380 O b'lemma:rep1'
3.969746 Air b'lemma:anaeroibc'
3.969406 O b'-1:lemma:lb'
3.947295 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.866206 Phase b'+2:lemma:o.d.'
3.855798 O b'lemma::'
3.853189 O b'+1:lemma:od600'
3.852601 O b'-1:lemma:tag'
3.851505 O b'-1:lemma:type'
3.814836 Med b'+2:lemma:b1'
3.776312 O b'-1:lemma:glucose'
3.722393 O b'lemma:for'
3.711203 Temp b'lemma:43'
3.708255 Substrain b'lemma:mg1655'
3.680904 O b'lemma:harbor'
3.622428 Phase b'postag:NN'
3.595354 O b'lemma:CEL'
3.566068 Air b'-1:lemma:-'
3.526828 O b'+1:postag:RB'
3.495178 Strain b'lemma:k-12'
3.467019 Supp b'+1:lemma:2'
3.462860 Supp b'+2:lemma:feso4'
3.423444 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
3.419455 O b'lemma:genotype/variation'
3.393043 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
3.391282 O b'-1:lemma:anaerobic'
3.361978 Technique b'-1:lemma:input'
3.335942 O b'+1:lemma:250'
3.318302 pH b'lemma:ph5'
3.318302 pH b'+1:lemma:.5'
3.288476 Air b'-2:lemma:0.3'
3.265449 Supp b'+1:lemma:1'
3.249308 Supp b'-2:lemma:media'
3.225422 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
3.195449 pH b'lemma:5.5'
3.191084 O b'lemma:a'
3.185530 O b'lemma:rpob'
3.172707 Temp b'-1:lemma:sample'
3.157641 Gtype b'-2:lemma:delta'
3.132664 Supp b'lemma:Leu'
3.132664 Supp b'-2:lemma:Lrp'
3.130549 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
3.130549 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
3.128358 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.111730 Supp b'lemma:Adenine'
3.064066 Air b'lemma:aerobically'
3.061234 pH b'+1:lemma:5.5'
3.047714 Med b'-1:lemma:ml'
3.033694 Supp b'lemma:fructose'
3.026987 Air b'-2:lemma:fnr'
3.000690 O b'-2:lemma:medium'
2.978771 Temp b'-1:lemma:37'
2.965286 O b'-2:lemma:fructose'
2.950315 Med b'lemma:minimal'
2.947997 Technique b'-1:lemma:_'
2.914465 Supp b'lemma:rifampicin'
2.910000 O b'-1:lemma:nitrate'
2.909729 Supp b'-1:lemma:with'
2.891070 Air b'postag:RB'
2.885583 O b'lemma:chip'
2.885398 OD b'lemma:od450'
2.859815 O b'+1:lemma:rifampicin'
2.852630 O b'+2:lemma:_'
2.847905 O b'-1:lemma:mg1655'
2.841379 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.833744 O b'lemma:soxr'
2.833744 O b'lemma:soxs'
2.827057 O b'+1:lemma:coli'
2.825461 O b'postag:IN'
2.813711 O b'postag::'
2.800978 Technique b'lemma:rnaseq'
2.797139 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
2.794415 O b'lemma:trpr'
2.791729 O b'lemma:\xcf\x8332'
2.790249 Supp b'-2:lemma:agent'
2.778746 Substrain b'lemma:mg1655star'
2.713112 Supp b'-1:lemma:_'
2.711692 Supp b'-2:lemma:argr'
2.710989 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.707801 Temp b'lemma:37'
2.682574 O b'lemma:culture'
2.648397 O b'lemma:gadx'
2.638869 Gtype b'lemma:deltaseqa'
2.638869 Gtype b'-1:lemma:old'
2.638869 Gtype b'-2:lemma:seqa'
2.627050 O b'lemma:ml'
2.602738 O b'-1:lemma:medium'
2.594675 Technique b'lemma:rna-seq'
2.594624 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.558666 O b'-2:lemma:overnight'
2.556760 Supp b'-1:lemma:ompr'
2.520267 O b'+2:lemma:allow'
2.504057 OD b'-1:lemma:at'
2.479276 O b'+1:lemma:0.2'
2.478810 Supp b'-1:lemma:30'
2.450863 Gversion b'lemma:asm584v2'
2.439992 O b'lemma:purr'
2.437941 Gtype b'lemma:ptac'
2.429861 Med b'lemma:medium'
2.429744 O b'-1:lemma:wt'
2.426012 O b'-2:lemma:flagtag'
2.414730 Vess b'lemma:flask'
2.414730 Vess b'-1:lemma:warm'
2.414730 Vess b'-2:lemma:pre'
2.414730 Vess b'+2:lemma:43'
2.406323 Gtype b'-1:lemma:wild'
2.404798 Med b'lemma:media'
2.395850 O b'lemma:argr'
2.392689 Med b'+1:lemma:g/l'
2.369025 Technique b'hUpper'
2.341741 Gtype b'lemma:arca8myc'
2.341741 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
2.327539 Med b'-2:lemma:minimal'
2.302914 Med b'-1:lemma:minimal'
2.301825 Temp b'-2:lemma:keep'
2.298400 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.282334 O b'postag:VBN'
2.270387 Agit b'+1:lemma:rpm'
2.267832 Med b'lemma:lb'
2.265490 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
2.259284 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.249430 Gversion b'lemma:.2'
2.249430 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.246324 Anti b'+1:lemma:antibody'
2.235953 O b'lemma:oxyr'
2.221128 Gversion b'lemma:u00096'
2.221128 Gversion b'+1:lemma:.2'
2.215971 Gtype b'+2:lemma:glucose'
2.215436 Phase b'+1:lemma:phase'
2.209470 Agit b'lemma:rpm'
2.198634 Agit b'-1:lemma:250'
2.195927 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.192533 Med b'+2:lemma:+'
2.183571 Strain b'-2:lemma:strain'
2.174082 O b'+1:lemma:mid-log'
2.170257 O b'+1:postag:NNP'
2.169918 Med b'lemma:m63'
2.154939 Supp b'-2:lemma:for'
2.152544 Supp b'lemma:glutamine'
2.152544 Supp b'-1:lemma:2g/l'
2.143870 Air b'postag:JJ'
2.142723 O b'-2:lemma:~'
2.141487 O b'-2:lemma:='
2.133107 O b'-1:lemma:min'
2.118584 O b'lemma:A'
2.117551 O b'lemma:ompr'
2.115392 O b'-1:lemma:-80'
2.107254 O b'-1:lemma:into'
2.092310 Technique b'-2:lemma:wt'
2.090981 Temp b'-1:lemma:43'
2.086480 O b'lemma:growth'
2.084041 Med b'+1:lemma:0.4'
2.082072 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.078422 Supp b'+1:lemma:Deficient'
2.070217 O b'postag:VBD'
2.067431 O b'lemma:affyexp'
2.033112 Agit b'lemma:250'
2.031074 Supp b'+2:lemma:A'
2.024541 O b'-2:lemma:reach'
2.014234 O b'-1:lemma:antibody'
2.006976 Gversion b'lemma:000913'
2.006976 Gversion b'-2:lemma:nc'
2.003607 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.984876 pH b'lemma:.5'
1.984876 pH b'-1:lemma:ph5'
1.980281 Med b'-2:lemma:fresh'
1.958343 O b'+1:lemma:sparging'
1.956303 pH b'+1:postag:CD'
1.951854 Air b'-1:lemma:co2'
1.947393 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.941087 Phase b'-2:lemma:until'
1.938844 Technique b'-1:lemma:IP'
1.931979 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.931900 Technique b'lemma:chip-seq'
1.922369 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.908250 Supp b'-2:postag:VBG'
1.905303 Med b'postag:NNS'
1.899698 Gtype b'-2:lemma:dna'
1.877057 Gversion b'-2:lemma:build'
1.865639 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.856964 O b'lemma:input'
1.856964 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.855986 O b'+1:lemma:20'
1.855407 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.855407 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.854590 O b'lemma:at'
1.851033 O b'postag:DT'
1.843213 O b'lemma:chip-arca'
1.843213 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.827704 O b'lemma:additional'
1.827704 O b'+1:lemma:2h'
1.825743 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.808063 O b'lemma:cra'
1.803217 Med b'+2:postag:CC'
1.795116 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.793622 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.793622 Supp b'-2:lemma:mmol'
1.760478 O b'+1:lemma::'
1.758922 Gtype b'+1:postag::'
1.753764 Supp b'-2:lemma:trpr'
1.751706 OD b'+1:lemma:of'
1.751047 O b'+1:lemma:pq'
1.737807 O b'lemma:chip-fnr'
1.737807 O b'+2:lemma:fnr8myc'
1.737667 Technique b'lemma:chip-exo'
1.737423 Gtype b'+1:lemma:with'
1.726057 OD b'lemma:0.3'
1.705804 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.700120 OD b'+1:postag:IN'
1.698334 O b'symb'
1.693018 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.689723 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.685560 Gtype b'postag:JJ'
1.684453 O b'+2:postag:VB'
1.683121 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.681213 Air b'-2:lemma:mid-log'
1.678501 Supp b'+2:lemma:nh4cl'
1.669457 Air b'-1:lemma:phase'
1.663174 Supp b'-2:lemma:20'
1.650165 O b'lemma:='
1.648351 O b'-1:lemma:dpd'
1.645008 Supp b'lemma:30'
1.641996 Med b'+1:lemma:2.0'
1.620773 O b'-2:lemma:37'
1.611533 O b'-1:lemma:0.35'
1.609434 Supp b'-1:lemma:without'
1.607805 Gtype b'+1:lemma:_'
1.607327 O b'lemma:fresh'
1.603487 O b'-1:lemma:rpm'
1.597793 Phase b'lemma:stationary'
1.597793 Phase b'lemma:exponential'
1.593726 O b'lemma:or'
1.589893 Supp b'lemma:Fe'
1.588320 Supp b'-2:lemma:10'
1.584236 Strain b'+1:lemma:substr'
1.584236 Strain b'-2:lemma:str'
1.567137 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.563530 Air b'-1:lemma:_'
1.562616 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.562202 Supp b'-1:lemma:2'
1.559251 Med b'+1:lemma:minimal'
1.556324 Air b'+2:lemma:37'
1.544439 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.544439 Gtype b'-2:lemma:transcription'
1.539452 Med b'lemma:glucose'
1.539376 O b'-2:lemma:min'
1.535970 O b'-1:lemma:aerobic'
1.533338 OD b'lemma:od600'
1.516960 Gversion b'-2:postag:VB'
1.516756 O b'+2:lemma:rpm'
1.514212 Vess b'-2:postag:JJ'
1.510438 O b'-1:lemma:nacl'
1.500237 O b'-1:lemma:genbank'
1.499163 OD b'-1:postag:IN'
1.495076 O b'+1:postag:VBZ'
1.494964 O b'+2:lemma:constant'
1.484823 Supp b'+1:lemma:m'
1.483568 Supp b'-2:lemma:induce'
1.474867 Gtype b'lemma:ryhb'
1.473586 O b'lemma:treatment'
1.472117 Med b'-1:lemma:fresh'
1.460840 O b'-2:lemma:co2'
1.458948 O b'+2:lemma:TEX'
1.458488 O b'lemma:be'
1.455562 Supp b'-2:lemma:condition'
1.442240 O b'-1:postag:NNP'
1.438610 Phase b'lemma:pahse'
1.416920 O b'+2:postag:JJ'
1.408393 Supp b'+2:lemma:leucine'
1.408283 Gversion b'lemma:nc'
1.408283 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.404585 Substrain b'+2:lemma::'
1.401219 OD b'postag:CD'
1.395733 OD b'postag:IN'
1.394349 Air b'-2:lemma:cm20'
1.387675 Gtype b'-1:lemma:_'
1.377905 O b'-1:lemma:induce'
1.368612 Anti b'-1:lemma:myc'
1.368612 Anti b'-2:lemma:9e10'
1.348630 O b'+2:lemma:wt'
1.342213 Technique b'-2:postag:NNP'
1.340136 O b'-1:lemma:4'
1.338369 O b'-2:lemma:final'
1.335834 Supp b'+1:lemma:_'
1.334304 O b'+1:lemma:b1'
1.331299 Gtype b'+1:lemma:the'
1.330313 O b'-1:lemma:pq'
1.330212 O b'lemma:-lrb-'
1.323426 Gtype b'lemma:nsrr'
1.323426 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.311722 Med b'-2:lemma:medium'
1.309231 pH b'-1:lemma:at'
1.309042 O b'lemma:old'
1.309042 O b'-1:lemma:seqa'
1.309042 O b'+1:lemma:deltaseqa'
1.301707 Air b'-2:lemma:%'
1.301258 O b'+2:lemma:of'
1.296277 Supp b'lemma:0.2'
1.295133 Anti b'postag:JJ'
1.292647 O b'lemma:lrp'
1.289348 Med b'+1:lemma:+'
1.285632 Gtype b'-1:lemma:from'
1.272592 Med b'-1:lemma:in'
1.270040 Agit b'+2:lemma:at'
1.268254 Supp b'+2:lemma:ph'
1.268179 O b'postag:NNS'
1.265826 Air b'+2:lemma:%'
1.259570 Gtype b'lemma:phtpg'
1.257913 O b'-2:lemma:0.2'
1.254595 OD b'lemma:of'
1.252810 Supp b'+1:lemma:1m'
1.252810 Supp b'-2:lemma:vol'
1.248623 Supp b'lemma:dpd'
1.248298 O b'postag:CC'
1.245172 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.245172 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.245172 Supp b'+2:lemma:potassium'
1.241485 Air b'+1:lemma:%'
1.239333 Med b'-2:lemma:treatment'
1.232463 Air b'lemma:%'
1.220202 Air b'-2:postag:CD'
1.219431 Gtype b'+2:postag::'
1.217182 Anti b'-2:lemma:purify'
1.214732 O b'lemma:-rrb-'
1.209541 Air b'-1:lemma:%'
1.207303 O b'lemma:+'
1.202958 O b'+1:lemma:acetate'
1.200221 O b'lemma:-80'
1.200221 O b'-2:lemma:freeze'
1.197093 Supp b'lemma:tryptophan'
1.197093 Supp b'-1:lemma:mg/l'
1.192622 Med b'-1:lemma:LB'
1.192622 Med b'+2:lemma:1mm'
1.186114 O b'-1:lemma:0.3-0.35'
1.181116 O b'+1:lemma:read'
1.172545 Technique b'+1:lemma:gadx'
1.172491 Gtype b'lemma:crp'
1.171733 O b'+2:lemma:w/v'
1.171177 OD b'lemma:o.d.'
1.171177 OD b'+1:lemma:600nm'
1.170988 Supp b'-1:lemma:0.2'
1.165628 OD b'-2:lemma:phase'
1.159605 O b'-1:lemma:w0002'
1.153736 O b'-1:lemma:trpr'
1.148198 Phase b'-1:lemma:until'
1.142785 OD b'-1:lemma:od450'
1.140281 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
1.137827 O b'+2:lemma:ml'
1.137534 Med b'+1:lemma:medium'
1.130738 Gtype b'hUpper'
1.116695 Supp b'-1:lemma::'
1.113363 Supp b'+2:lemma:add'
1.112361 Med b'postag:NNP'
1.109559 O b'-2:lemma:Leu'
1.104524 O b'+1:lemma:nacl'
1.102223 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
1.102118 Air b'lemma:Anaerobic'
1.095936 Substrain b'+2:postag::'
1.091160 Technique b'hLower'
1.090947 Air b'+2:lemma:250'
1.085847 O b'-1:lemma:shake'
1.084158 Gtype b'+2:lemma:lacz'
1.080134 Phase b'+2:lemma:follow'
1.077491 Gtype b'+2:lemma:rep2'
1.077491 Gtype b'+2:lemma:rep1'
1.076402 Temp b'+2:lemma:short'
1.075351 O b'lemma:~'
1.074500 O b'-1:lemma:fructose'
1.072069 O b'-1:postag:NN'
1.065097 Supp b'lemma:Trp'
1.061163 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.059897 O b'postag:SYM'
1.055422 Supp b'-2:lemma:nitrate'
1.051085 Supp b'lemma:leucine'
1.050009 OD b'+1:lemma:-rrb-'
1.049484 O b'+2:lemma:hour'
1.046764 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.046764 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.046533 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.045747 O b'-1:lemma:l1'
1.041158 OD b'+1:postag:-RRB-'
1.041055 Supp b'+1:lemma:be'
1.040903 Supp b'-2:lemma:pahse'
1.038863 pH b'-2:lemma:at'
1.038386 O b'-1:lemma:.2'
1.038386 O b'-2:lemma:u00096'
1.030172 Med b'+2:lemma:then'
1.029176 Supp b'+1:lemma:iptg'
1.028661 OD b'+2:postag:CD'
1.026357 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.024428 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.024428 Supp b'+2:lemma:1/100'
1.019296 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.007655 Supp b'-1:lemma:mm'
1.003034 Substrain b'-1:lemma:.'
1.003034 Substrain b'-1:postag:.'
1.002366 O b'-2:lemma:sample'
1.002270 Supp b'+1:lemma:min'
0.993124 Supp b'-2:lemma::'
0.992321 O b'lemma:\xce\xbcl'
0.990692 Supp b'lemma:20'
0.988558 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.987726 Gtype b'-2:postag::'
0.987674 Supp b'+2:lemma:be'
0.985969 O b'+1:lemma:30'
0.985940 O b'lemma:genotype'
0.982778 Gversion b'postag:NN'
0.977969 Gtype b'lemma:the'
0.977384 O b'lemma:,'
0.977384 O b'postag:,'
0.974349 Supp b'+1:postag:VBD'
0.967356 Anti b'hGreek'
0.959225 Gtype b'hLower'
0.957117 Supp b'-2:lemma:+'
0.956881 Supp b'postag:NNP'
0.955575 O b'-2:lemma:od600'
0.950577 Gtype b'+2:postag:NN'
0.950166 Strain b'-1:lemma:.'
0.950166 Strain b'-1:postag:.'
0.949117 Phase b'+2:lemma:od600'
0.948359 O b'-2:postag:FW'
0.943210 Technique b'postag:NNP'
0.940155 Supp b'-2:lemma:1'
0.934032 Supp b'-2:postag:CD'
0.933941 O b'+2:lemma:Cold'
0.930816 Med b'+1:lemma:-lrb-'
0.930422 OD b'-1:lemma:od600'
0.924215 O b'+1:lemma:o.d.'
0.924215 O b'+2:lemma:600nm'
0.920886 Supp b'lemma:nitrate'
0.918008 Med b'+1:lemma:media'
0.914785 Temp b'-2:lemma:see'
0.908294 Supp b'-1:postag:CC'
0.903608 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
0.903589 Air b'lemma:co2'
Top negative:
0.002031 Agit b'-1:postag:-LRB-'
0.001999 O b'lemma:25'
0.001992 Gtype b'+1:lemma:knock-out'
0.001929 Phase b'+2:postag:NN'
0.001835 Gtype b'+2:lemma:strain'
0.001813 Anti b'lemma:\xcf\x8332'
0.001812 O b'+2:lemma:5'
0.001782 Substrain b'postag:NN'
0.001697 O b'+2:lemma:min'
0.001661 O b'+2:lemma:25'
0.001626 Temp b'-2:lemma:culture'
0.001524 O b'+1:lemma:add'
0.001172 O b'-1:lemma:MOPS'
0.001159 O b'lemma:dna'
0.001136 Temp b'+2:lemma:m9'
0.001054 O b'-2:lemma:;'
0.001049 O b'-1:lemma:fnr'
0.001014 Gtype b'+2:postag:DT'
0.000906 pH b'+2:postag:CD'
0.000824 O b'+2:lemma:nh4cl'
0.000612 Med b'-1:lemma:g/l'
0.000565 O b'-2:lemma:of'
0.000537 O b'-1:postag:FW'
0.000467 Anti b'-1:lemma:fnr'
0.000349 Supp b'+1:lemma:phosphate'
0.000334 Technique b'+1:lemma:Anaerobic'
0.000321 Med b'-2:lemma:2'
0.000310 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.000266 O b'+2:lemma:grow'
0.000219 Temp b'postag:VB'
0.000111 O b'-2:lemma:wt'
0.000086 O b'+2:lemma:wash'
0.000071 O b'lemma:\xc2\xb0c'
0.000069 O b'-1:lemma:Aerobic'
0.000064 O b'-2:lemma:use'
0.000062 O b'lemma:hs2'
0.000061 Gtype b'-1:lemma:k-12'
0.000038 O b'+1:lemma:ml'
0.000027 Supp b'-2:lemma:0.3'
0.000024 O b'-2:lemma:2.5'
0.000023 Technique b'postag:NN'
0.000023 Med b'-1:lemma:-rrb-'
0.000013 O b'-1:lemma:at'
0.000012 Med b'+2:lemma:10'
0.000008 Med b'-1:postag:-RRB-'
0.000005 Technique b'+1:postag:NNP'
0.000004 O b'+2:lemma:\xce\xb4arca'
0.000002 Supp b'-2:lemma:m'
0.000001 O b'-1:lemma:anti-myc'
0.000001 O b'+1:lemma:Santa'
0.000001 O b'+2:lemma:Cruz'
0.000001 O b'+1:postag:VBP'
0.000000 Med b'+2:lemma:0.2'
-0.000000 Gtype b'lemma:-lrb-'
0.000000 O b'-2:lemma:mutant'
0.000000 O b'lemma:\xce\xb4fnr'
-0.000002 Temp b'-1:lemma:at'
-0.000002 O b'+1:postag:VBG'
-0.000002 O b'-1:postag:VB'
-0.000002 O b'-2:lemma:m'
-0.000006 Gtype b'postag:-LRB-'
-0.000008 Temp b'+2:lemma:.'
-0.000008 Temp b'+2:postag:.'
-0.000014 O b'+1:postag:VB'
-0.000020 Supp b'postag:NNS'
-0.000027 Temp b'postag:CD'
-0.000039 Gtype b'+1:postag:-LRB-'
-0.000134 Gtype b'postag:NNP'
-0.000165 O b'+1:lemma:antibody'
-0.000194 O b'lemma:sample'
-0.000205 Med b'-1:postag:IN'
-0.000220 O b'-2:lemma:-rrb-'
-0.000316 Supp b'-1:lemma:the'
-0.000353 pH b'-2:postag:NN'
-0.000361 Gversion b'symb'
-0.000498 O b'-1:lemma:g/l'
-0.000568 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.000814 O b'lemma:95'
-0.000915 Med b'+1:postag:IN'
-0.001080 O b'lemma:mm'
-0.001180 Gtype b'lemma:delta'
-0.001212 O b'-2:lemma:1'
-0.001290 O b'-1:lemma:cra'
-0.001528 Med b'-2:postag:CC'
-0.002095 Anti b'-2:postag:JJ'
-0.002794 OD b'+2:lemma:for'
-0.002951 O b'+1:lemma:95'
-0.003012 O b'lemma:phosphate'
-0.003075 O b'+1:lemma:.'
-0.003075 O b'+1:postag:.'
-0.003135 Technique b'+2:postag:CD'
-0.003438 O b'-1:lemma:25'
-0.003455 Med b'-1:postag:CD'
-0.003532 Supp b'+2:lemma:final'
-0.003951 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.003951 Gtype b'-1:postag:,'
-0.004057 OD b'+1:lemma:for'
-0.004373 O b'+1:lemma:7.6'
-0.004373 O b'-2:lemma:1m'
-0.004373 O b'+2:lemma:;'
-0.005112 O b'+2:lemma:0.4'
-0.005181 O b'-1:lemma:~'
-0.005325 Supp b'-1:postag::'
-0.006561 O b'-2:lemma:100'
-0.006874 O b'+2:lemma:sample'
-0.006896 O b'+2:lemma:the'
-0.007526 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.007788 Supp b'-2:postag:VBD'
-0.008428 Supp b'postag:VBN'
-0.009168 O b'+1:lemma:medium'
-0.009769 O b'+1:lemma:b'
-0.010004 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.010675 O b'-2:lemma:50'
-0.011422 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.011425 pH b'postag:NN'
-0.012502 Supp b'+2:lemma:mm'
-0.012561 Air b'-1:postag:VBN'
-0.012928 Temp b'-2:lemma:at'
-0.014604 O b'-2:lemma:g/l'
-0.014972 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.015512 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.015940 O b'+1:lemma:25'
-0.016001 O b'+2:postag:RB'
-0.017416 Air b'-2:lemma:be'
-0.017693 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.017896 Med b'-2:lemma:m9'
-0.018028 OD b'-2:postag:VBN'
-0.019783 Med b'-2:postag:VBN'
-0.022148 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.022430 Temp b'-1:postag:CD'
-0.023156 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.023530 O b'+1:lemma:a'
-0.024535 Supp b'postag::'
-0.025597 Gtype b'+1:postag:NN'
-0.026818 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.028679 O b'lemma:lb'
-0.031688 O b'+1:lemma:co2'
-0.031847 O b'-2:lemma:grow'
-0.032925 O b'-2:postag:DT'
-0.033637 Temp b'-2:postag:CD'
-0.034686 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.034732 Gtype b'+1:postag:CD'
-0.035413 Temp b'-2:postag:IN'
-0.036801 Supp b'lemma:vol'
-0.036801 Supp b'-1:lemma:1/100'
-0.036959 OD b'+2:postag:DT'
-0.037490 OD b'+2:postag:CC'
-0.037647 O b'+2:lemma:total'
-0.037802 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.037881 Vess b'symb'
-0.037919 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.038014 O b'-2:lemma:ph'
-0.040451 O b'+1:lemma:ph'
-0.040900 pH b'hUpper'
-0.042386 Med b'-2:lemma:in'
-0.042549 O b'-2:lemma:%'
-0.042677 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.042723 O b'+2:lemma:then'
-0.043993 O b'-1:lemma:%'
-0.044540 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.044618 O b'-2:lemma:stir'
-0.044700 Air b'-1:postag:CC'
-0.045990 OD b'+2:postag:IN'
-0.049780 O b'-1:lemma:in'
-0.049859 O b'-2:lemma:at'
-0.049886 O b'lemma:5'
-0.050539 Phase b'+2:postag:IN'
-0.050797 O b'+1:lemma:o2'
-0.052046 O b'+2:lemma:media'
-0.052515 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.054208 O b'+2:lemma:0.3'
-0.055240 O b'-1:postag:DT'
-0.055352 O b'+1:lemma:1/100'
-0.055352 O b'-2:lemma:sodium'
-0.055352 O b'+2:lemma:vol'
-0.057897 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.058976 O b'+2:lemma:m9'
-0.059558 Supp b'-2:postag:NN'
-0.059617 Supp b'lemma:,'
-0.059617 Supp b'postag:,'
-0.059906 Supp b'-2:lemma:of'
-0.060495 O b'+2:lemma:od600'
-0.060772 Temp b'-2:postag:JJ'
-0.061229 O b'lemma:m9'
-0.061347 OD b'+1:lemma:0.3'
-0.061390 O b'-2:lemma:0.1'
-0.061603 O b'-1:lemma:contain'
-0.061772 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.062124 Supp b'lemma:.'
-0.062124 Supp b'postag:.'
-0.062645 O b'-1:lemma:final'
-0.064570 Med b'-2:postag:IN'
-0.066250 O b'+1:lemma:sample'
-0.066279 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.067193 O b'+2:lemma:o2'
-0.068790 Gtype b'-2:lemma:,'
-0.068790 Gtype b'-2:postag:,'
-0.069326 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.069350 O b'-1:lemma:the'
-0.069661 pH b'hLower'
-0.069862 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.070237 O b'+1:lemma:pahse'
-0.070782 O b'+2:lemma:rnase'
-0.071966 Supp b'-1:lemma:in'
-0.073795 O b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.074003 O b'-2:lemma:70'
-0.074961 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.075310 O b'+1:lemma:n2'
-0.077077 O b'+1:lemma:contain'
-0.078614 O b'+1:lemma:~'
-0.082462 Supp b'+2:lemma:and'
-0.082517 Temp b'-2:postag:NN'
-0.083845 Supp b'-2:postag:DT'
-0.086058 O b'-1:lemma:m9'
-0.087457 O b'-1:lemma:='
-0.087729 O b'+1:lemma:2.0'
-0.088009 O b'+1:lemma:supplement'
-0.088085 O b'lemma:;'
-0.088085 O b'-1:lemma:7.6'
-0.091611 OD b'lemma:~'
-0.092521 Med b'+1:postag:CC'
-0.093891 Supp b'+2:postag:NN'
-0.096891 O b'-2:lemma:cell'
-0.098335 O b'-2:lemma:25'
-0.098592 OD b'postag:NN'
-0.103477 O b'-1:lemma:o2'
-0.104706 Supp b'postag:CD'
-0.104993 O b'+2:lemma:~'
-0.107027 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.107330 O b'-2:lemma:n2'
-0.108062 Temp b'+1:postag:NN'
-0.115268 Air b'+2:lemma:70'
-0.115468 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.117248 O b'+1:lemma:m'
-0.117648 Supp b'-1:lemma:.'
-0.117648 Supp b'-1:postag:.'
-0.122943 O b'lemma:o2'
-0.123748 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.124311 O b'+2:lemma:reference'
-0.125802 Temp b'+2:postag:IN'
-0.126522 O b'+1:lemma:mm'
-0.129682 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.140157 Supp b'postag:IN'
-0.140332 Gversion b'hLower'
-0.140386 Med b'+2:lemma:contain'
-0.140599 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.141680 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.142873 Temp b'symb'
-0.156813 Phase b'+2:postag:CD'
-0.158180 O b'-1:lemma:of'
-0.158601 OD b'symb'
-0.161578 O b'-1:lemma:1'
-0.161707 O b'lemma:7.6'
-0.161707 O b'+1:lemma:;'
-0.163390 O b'-2:lemma:glucose'
-0.168116 O b'-2:lemma:minimal'
-0.168988 O b'-1:lemma:sodium'
-0.168988 O b'+2:lemma:1/100'
-0.169396 O b'lemma:0.1'
-0.171177 Supp b'-1:postag:DT'
-0.171469 Med b'+2:postag:VBG'
-0.172137 Gtype b'symb'
-0.172433 O b'+2:lemma:antibody'
-0.173380 O b'+2:lemma:follow'
-0.177499 OD b'postag:JJ'
-0.180841 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.181301 Phase b'-2:postag:NN'
-0.183018 O b'-2:lemma:20'
-0.184157 O b'+1:postag:IN'
-0.185687 O b'+1:lemma:phase'
-0.187760 Supp b'lemma:-rrb-'
-0.188439 Med b'+2:lemma:supplement'
-0.190004 OD b'+2:postag:NN'
-0.190174 O b'-2:lemma:o2'
-0.190477 O b'lemma:min'
-0.195599 O b'+2:lemma:genome'
-0.195995 O b'lemma:methanol'
-0.195995 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.196788 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.198975 O b'lemma:fructose'
-0.200108 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.202097 Supp b'+2:lemma:with'
-0.203224 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.203626 O b'-1:lemma:1m'
-0.203626 O b'+2:lemma:7.6'
-0.204615 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.206794 O b'+1:lemma:5'
-0.211369 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.217346 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.217346 Gtype b'+1:postag:,'
-0.220030 O b'+1:lemma:minimal'
-0.221261 O b'+2:lemma:10'
-0.223144 O b'lemma:nh4cl'
-0.223525 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.227961 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.230698 O b'-1:lemma:.'
-0.230698 O b'-1:postag:.'
-0.231209 O b'lemma:anaerobic'
-0.234975 Temp b'postag:NN'
-0.235459 Gtype b'postag:VBG'
-0.236628 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.237252 O b'+1:lemma:%'
-0.237525 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.237923 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.239184 O b'lemma:medium'
-0.240615 O b'-2:lemma:phase'
-0.242760 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.245101 O b'lemma:m63'
-0.247264 O b'+2:lemma:n2'
-0.251871 O b'+2:lemma:250'
-0.253731 O b'+1:lemma:of'
-0.254242 O b'+2:lemma:ph'
-0.255736 O b'lemma:mid-log'
-0.258743 O b'+1:lemma:media'
-0.259450 O b'lemma:0.2'
-0.259681 O b'lemma:150'
-0.259681 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.259681 O b'-2:lemma:concentration'
-0.262765 Technique b'-2:postag:NN'
-0.262765 Med b'-1:lemma:m63'
-0.263479 Supp b'-1:postag:VBG'
-0.265789 O b'+1:lemma:min'
-0.266529 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.266600 O b'lemma:ph'
-0.269280 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.269564 O b'-1:lemma:37'
-0.269779 O b'lemma:n2'
-0.271034 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.273812 Gtype b'postag:NN'
-0.274620 O b'-2:postag::'
-0.279264 Supp b'postag:-RRB-'
-0.283425 O b'lemma:250'
-0.285849 O b'-1:lemma:n2'
-0.291783 O b'lemma:dissolve'
-0.291783 O b'+2:lemma:methanol'
-0.291865 Gtype b'postag::'
-0.295707 O b'-2:lemma:10'
-0.301731 O b'+1:lemma:until'
-0.303509 Air b'-2:lemma:95'
-0.307011 Air b'+2:postag:IN'
-0.307489 O b'lemma:the'
-0.307682 O b'-1:lemma:mm'
-0.313126 pH b'symb'
-0.314740 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.314740 O b'+1:lemma:methanol'
-0.316070 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.317694 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.321416 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.324579 O b'hGreek'
-0.324815 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.325598 O b'-1:lemma:with'
-0.327555 Med b'-1:postag:NN'
-0.330264 O b'+1:postag:DT'
-0.333215 O b'+2:lemma:at'
-0.334740 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.337529 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.344026 O b'+2:lemma:co2'
-0.346823 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.347610 O b'+2:lemma:tag'
-0.349022 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.357330 Supp b'postag:-LRB-'
-0.357874 Temp b'+2:lemma:with'
-0.358955 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.359551 O b'-1:lemma:minimal'
-0.361850 O b'lemma:co2'
-0.362747 O b'-1:lemma:rna'
-0.367883 O b'+2:lemma:.'
-0.367883 O b'+2:postag:.'
-0.371268 O b'lemma:fecl2'
-0.371783 O b'+2:lemma:fnr'
-0.376502 O b'lemma:acetate'
-0.376596 O b'-1:lemma:until'
-0.378510 Anti b'postag:NNP'
-0.392168 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.400852 O b'lemma:nacl'
-0.401178 Technique b'-1:lemma::'
-0.401821 O b'+2:lemma:add'
-0.402189 O b'-2:lemma:supplement'
-0.403647 Supp b'+1:postag:JJ'
-0.414375 O b'+1:lemma:gadx'
-0.424961 O b'+1:lemma:+'
-0.426758 OD b'+2:postag:RB'
-0.428607 Temp b'+1:postag:IN'
-0.438879 O b'-1:lemma:0.2'
-0.449284 O b'lemma:20'
-0.449481 O b'lemma:minimal'
-0.453046 O b'-1:lemma:ml'
-0.454600 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.456150 Temp b'+1:lemma:with'
-0.459018 O b'-1:lemma:ph'
-0.464662 O b'-2:lemma:genome'
-0.466198 O b'lemma:1m'
-0.470903 O b'-2:lemma:dna'
-0.480405 Supp b'postag:CC'
-0.485152 O b'lemma:dpd'
-0.498015 O b'lemma:of'
-0.501781 OD b'hUpper'
-0.502264 Supp b'hGreek'
-0.505618 Supp b'+1:postag::'
-0.508749 O b'-1:lemma:vol'
-0.508749 O b'-2:lemma:1/100'
-0.508749 O b'+2:lemma:1m'
-0.510003 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.527489 Technique b'-1:postag::'
-0.535066 O b'-2:lemma:the'
-0.537219 OD b'hLower'
-0.542147 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.549305 Supp b'+2:postag:NNS'
-0.553237 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.566249 Supp b'+2:postag::'
-0.580757 O b'postag:RB'
-0.581512 Med b'postag:CD'
-0.593577 O b'+1:lemma:in'
-0.602888 O b'-1:lemma:IP'
-0.610669 O b'-2:postag:SYM'
-0.629664 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.634585 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.641053 O b'-1:lemma:fresh'
-0.644272 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.652711 Med b'-2:lemma:grow'
-0.661210 Supp b'+1:lemma:,'
-0.661210 Supp b'+1:postag:,'
-0.670086 O b'lemma:aerobic'
-0.679933 O b'-1:lemma:rpob'
-0.692915 O b'lemma:37'
-0.701136 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.710442 Supp b'lemma:2'
-0.720557 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.728557 O b'lemma:glucose'
-0.738561 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.742157 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.752209 O b'-2:lemma::'
-0.754302 OD b'lemma:='
-0.762837 O b'lemma:od600'
-0.780889 O b'-1:lemma:30'
-0.792010 O b'lemma:nitrate'
-0.799589 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.824543 Strain b'hLower'
-0.832002 O b'-2:lemma:pahse'
-0.840707 O b'+1:lemma:1m'
-0.840707 O b'-2:lemma:vol'
-0.860461 Strain b'symb'
-0.865850 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.884431 O b'+1:lemma:_'
-0.920953 Vess b'hUpper'
-0.922493 O b'+2:lemma:in'
-0.927684 O b'lemma:pahse'
-0.947164 Temp b'hLower'
-0.984540 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.992974 Supp b'+2:postag:CC'
-1.034263 Med b'+2:postag:VBN'
-1.039912 Anti b'hUpper'
-1.051185 Agit b'hUpper'
-1.060403 O b'-1:lemma:co2'
-1.070889 O b'lemma:30'
-1.078767 O b'-2:postag:VBG'
-1.083382 Med b'hLower'
-1.090923 Gtype b'-2:postag:CD'
-1.136530 O b'-1:lemma:2'
-1.142652 O b'lemma:rifampicin'
-1.174546 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.206069 Med b'+1:postag:NN'
-1.255067 O b'-1:postag::'
-1.279198 O b'-2:lemma:IP'
-1.283081 O b'-2:lemma:aerobically'
-1.296863 O b'-2:lemma:rpob'
-1.310565 O b'+1:lemma:g/l'
-1.317980 O b'-2:lemma:until'
-1.319865 Air b'postag:NN'
-1.391245 O b'-2:lemma:fresh'
-1.417281 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-1.434490 O b'-2:lemma:dpd'
-1.435304 O b'+2:lemma:+'
-1.451200 O b'+1:lemma:at'
-1.489702 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.491003 O b'-2:lemma:media'
-1.541259 Supp b'+2:lemma:2'
-1.684006 O b'-2:lemma:0.3'
-1.709961 Supp b'+2:postag:CD'
-1.712083 O b'-1:lemma:sample'
-1.743261 OD b'+1:postag:NN'
-1.799976 O b'lemma:wt'
-1.885455 Supp b'postag:JJ'
-1.919294 Supp b'+2:lemma:1'
-1.948739 O b'-2:lemma:iptg'
-1.958698 O b'lemma:media'
-2.090484 O b'+2:lemma:b'
-2.147413 O b'lemma:0.3'
-2.464729 O b'lemma:aerobically'
-2.532850 Phase b'symb'
-2.910084 O b'+2:lemma:rifampicin'
-3.011487 Technique b'symb'
-3.103589 O b'+1:lemma:2'
-3.124196 Phase b'postag:JJ'
-3.226049 OD b'+2:lemma:aerobically'
-3.307945 O b'+2:lemma:iptg'
-3.806485 O b'+1:lemma:1'
-4.115131 O b'-1:lemma::'
-4.311667 Phase b'hUpper'
-5.314634 O b'-1:lemma:_'