report_Run5_v12.txt 37.3 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.23610502350349594, 'c2': 0.012937351889081112}
best CV score:0.823974602152804
model size: 0.07M

Flat F1: 0.8154893949023028
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     0.970     0.985        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.595     0.568     0.581        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.912     0.795     0.849        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.857     0.838     0.848       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.856     0.783     0.815       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    5.551246
Supp   -> Supp    5.265793
Med    -> Med     5.192055
OD     -> OD      4.960431
Anti   -> Anti    4.737548
Gtype  -> Gtype   4.456051
Air    -> Air     4.356392
O      -> O       4.237654
Gversion -> Gversion 4.194909
Technique -> Technique 3.408063
Phase  -> Phase   3.272046
pH     -> pH      2.877933
Agit   -> Agit    2.462655
Substrain -> Gtype   1.914531
Gtype  -> Supp    1.466352
Air    -> O       1.200948
O      -> Supp    1.195298
O      -> Technique 1.075185
O      -> Gtype   0.834658
Technique -> Air     0.681997
Temp   -> O       0.631597
Supp   -> O       0.592839
Med    -> O       0.500660
Gtype  -> pH      0.116373
O      -> Med     0.095966
OD     -> O       0.019210
O      -> Gversion 0.011620
O      -> Phase   0.000337
Phase  -> O       0.000264
O      -> pH      0.000010
Supp   -> Med     -0.202579
OD     -> Air     -0.392508
Gtype  -> O       -0.400653
Phase  -> OD      -0.584240
Technique -> pH      -0.657852
O      -> Air     -0.739787
Substrain -> O       -0.833036
Med    -> Supp    -0.937213
Technique -> Gtype   -1.373402


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    5.551246
Supp   -> Supp    5.265793
Med    -> Med     5.192055
OD     -> OD      4.960431
Anti   -> Anti    4.737548
Gtype  -> Gtype   4.456051
Air    -> Air     4.356392
O      -> O       4.237654
Gversion -> Gversion 4.194909
Technique -> Technique 3.408063
Phase  -> Phase   3.272046
pH     -> pH      2.877933
Agit   -> Agit    2.462655
Substrain -> Gtype   1.914531
Gtype  -> Supp    1.466352
Air    -> O       1.200948
O      -> Supp    1.195298
O      -> Technique 1.075185
O      -> Gtype   0.834658
Technique -> Air     0.681997
Temp   -> O       0.631597
Supp   -> O       0.592839
Med    -> O       0.500660
Gtype  -> pH      0.116373
O      -> Med     0.095966
OD     -> O       0.019210
O      -> Gversion 0.011620
O      -> Phase   0.000337
Phase  -> O       0.000264
O      -> pH      0.000010
Supp   -> Med     -0.202579
OD     -> Air     -0.392508
Gtype  -> O       -0.400653
Phase  -> OD      -0.584240
Technique -> pH      -0.657852
O      -> Air     -0.739787
Substrain -> O       -0.833036
Med    -> Supp    -0.937213
Technique -> Gtype   -1.373402


Top positive:
6.644000 Phase    b'lemma:mid-log'
6.104168 O        b'lemma:1'
6.064563 O        b'lemma:2'
6.026331 Anti     b'-2:lemma:antibody'
5.963579 O        b'-2:lemma:_'
5.881278 Gtype    b'lemma:type'
5.645610 O        b'lemma:_'
5.406364 O        b'lemma:3'
5.365614 Technique b'lemma:chipseq'
5.333293 Air      b'lemma:anaerobic'
5.288705 Strain   b'lemma:k-12'
5.151897 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
5.074164 O        b'postag:VBG'
4.988267 Technique b'+2:lemma:ph5'
4.965833 Supp     b'lemma:pq'
4.903131 Supp     b'lemma:no3'
4.874907 Gtype    b'lemma:wt'
4.597727 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
4.566442 O        b'postag:IN'
4.531479 Supp     b'-2:lemma:shake'
4.488061 Med      b'lemma:MOPS'
4.486121 Phase    b'-2:lemma:phase'
4.408291 O        b'lemma:b'
4.346643 Gtype    b'+1:lemma:type'
4.277079 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
4.172930 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
4.140730 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
4.097346 O        b'lemma:rpob'
4.079050 O        b'lemma:-'
4.065849 Technique b'lemma:rna-seq'
4.049802 Supp     b'lemma:Iron'
4.049802 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.937512 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.935133 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.934876 Supp     b'lemma:glucose'
3.910882 Air      b'lemma:aerobic'
3.881487 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.777935 Med      b'lemma:LB'
3.709794 Supp     b'lemma:nh4cl'
3.670517 O        b'lemma:Cra'
3.596186 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.578503 Technique b'lemma:chip-seq'
3.545118 Supp     b'lemma:acetate'
3.528482 Gtype    b'lemma:pk4854'
3.514874 O        b'lemma:.'
3.514874 O        b'postag:.'
3.458564 Supp     b'lemma:2h'
3.458564 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.438491 O        b'lemma:with'
3.352909 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
3.352585 O        b'postag::'
3.307644 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
3.264764 Air      b'-2:lemma:IP'
3.209011 Substrain b'lemma:mg1655'
3.201344 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
3.181780 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
3.179280 Supp     b'lemma:iptg'
3.162484 O        b'-1:postag:NNS'
3.160768 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
3.119234 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.118942 Gtype    b'lemma:dfnr'
3.114548 O        b'lemma:rep2'
3.114548 O        b'lemma:rep1'
3.098016 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
3.074561 O        b'-1:lemma:type'
3.055990 Technique b'lemma:chip-exo'
3.033055 Med      b'lemma:lb'
3.028441 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.020019 Air      b'-1:lemma:-'
3.000731 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
3.000353 O        b'postag:VBN'
2.995736 O        b'-2:lemma:myc'
2.970277 O        b'postag:CC'
2.958786 Supp     b'lemma:Adenine'
2.957510 O        b'-1:lemma:tag'
2.937934 O        b'+2:lemma:crp'
2.935088 Supp     b'lemma:arginine'
2.922134 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.836530 O        b'+1:lemma:wt'
2.821527 Med      b'lemma:media'
2.807214 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.792930 Air      b'lemma:aerobically'
2.790531 Temp     b'-1:lemma:sample'
2.761456 Supp     b'lemma:nacl'
2.717508 Med      b'+2:lemma:b2'
2.715625 Supp     b'-1:lemma:Cra'
2.672527 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.654339 O        b'lemma:a'
2.643053 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.611075 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.578131 Supp     b'+1:lemma:1'
2.558393 Gtype    b'-2:lemma:delta'
2.540602 Technique b'-2:lemma:Fur'
2.536901 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.529739 O        b'lemma:CEL'
2.512506 Med      b'lemma:minimal'
2.483357 O        b'lemma:gadx'
2.434482 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.430729 Air      b'postag:RB'
2.385955 pH       b'lemma:ph5'
2.385955 pH       b'+1:lemma:.5'
2.359388 pH       b'+1:postag:CD'
2.352857 Technique b'-1:lemma:IP'
2.306969 O        b'+1:postag:RB'
2.304505 Temp     b'lemma:43'
2.244282 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.238091 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.237343 O        b'-1:lemma:0.3'
2.236926 Supp     b'+1:lemma:2'
2.233310 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.230594 O        b'lemma:affyexp'
2.223083 O        b'postag:DT'
2.220371 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.218904 Supp     b'lemma:Leu'
2.218904 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
2.218190 Med      b'+2:lemma:b1'
2.210469 O        b'+1:lemma:od600'
2.204288 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.200840 O        b'lemma:harbor'
2.190427 Gtype    b'lemma:ptac'
2.187249 O        b'lemma:culture'
2.137010 O        b'lemma:soxr'
2.137010 O        b'lemma:soxs'
2.126343 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.119274 Supp     b'-2:lemma:media'
2.082855 Supp     b'lemma:fructose'
2.081953 O        b'-1:lemma:glucose'
2.061468 Gversion b'lemma:.2'
2.061468 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.041868 O        b'lemma:chip'
2.027347 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.017764 Med      b'lemma:m63'
2.012894 Med      b'+1:lemma:g/l'
2.003360 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
2.003360 Gtype    b'+2:lemma:.5'
1.998133 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.974856 Temp     b'lemma:37'
1.969938 O        b'postag:VBD'
1.964660 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
1.964660 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
1.957465 Supp     b'-1:lemma:with'
1.953998 Temp     b'-1:lemma:37'
1.945939 Gversion b'lemma:u00096'
1.945939 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.910452 Med      b'-1:lemma:ml'
1.899208 Supp     b'-1:lemma:+'
1.888180 Supp     b'+2:lemma:feso4'
1.881025 O        b'-2:lemma:medium'
1.872703 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.872703 Strain   b'-2:lemma:str'
1.843864 O        b'-1:lemma:lb'
1.841093 Air      b'-1:lemma:co2'
1.840580 OD       b'lemma:0.3'
1.839571 O        b'lemma:ompr'
1.813079 Technique b'lemma:rnaseq'
1.799343 Technique b'-1:lemma:input'
1.787802 O        b'+1:lemma:pq'
1.777582 O        b'lemma:genotype/variation'
1.777114 Vess     b'lemma:flask'
1.777114 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.777114 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.777114 Vess     b'+2:lemma:43'
1.772403 O        b'lemma:ml'
1.769350 Med      b'+2:postag:CC'
1.744788 Air      b'-2:lemma:fnr'
1.708432 O        b'-2:lemma:='
1.706819 O        b'postag:NNS'
1.700720 O        b'-1:lemma:min'
1.699371 O        b'lemma:purr'
1.693546 O        b'lemma:\xcf\x8332'
1.685033 O        b'-2:lemma:min'
1.681156 Gtype    b'lemma:wild-type'
1.677150 O        b'-1:lemma:anaerobic'
1.675692 O        b'+1:postag:NNP'
1.652361 Agit     b'lemma:rpm'
1.644522 Med      b'+1:lemma:0.4'
1.627189 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.621412 O        b'+1:lemma:250'
1.609032 Gversion b'-2:lemma:build'
1.600958 Supp     b'+1:lemma:_'
1.589653 Gtype    b'+1:lemma:pq'
1.567283 OD       b'lemma:od450'
1.548462 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.546552 O        b'lemma:argr'
1.535687 Technique b'-2:lemma:wt'
1.526014 Agit     b'-1:lemma:250'
1.522174 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.502613 Supp     b'-2:lemma:agent'
1.496267 O        b'+1:lemma:coli'
1.494176 Med      b'+1:lemma:medium'
1.493860 Air      b'lemma:anaeroibc'
1.490166 pH       b'lemma:5.5'
1.471562 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
1.471125 Temp     b'-1:lemma:43'
1.451403 O        b'-1:lemma:into'
1.448488 Supp     b'-1:lemma:_'
1.447482 Supp     b'-2:lemma:purr'
1.444598 OD       b'-2:lemma:od450'
1.442788 Gtype    b'postag:JJ'
1.437381 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.437381 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.434230 O        b'lemma:growth'
1.432268 Air      b'postag:JJ'
1.425334 Supp     b'lemma:dpd'
1.409263 O        b'lemma:input'
1.409263 O        b'+1:lemma:chip-seq'
1.403969 OD       b'+1:lemma:of'
1.402035 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.394481 Phase    b'-2:lemma:until'
1.391724 O        b'lemma:-rrb-'
1.387370 O        b'lemma:-lrb-'
1.382428 OD       b'postag:CD'
1.380963 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.379541 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.379541 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.379541 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
1.367875 Phase    b'lemma:stationary'
1.367875 Phase    b'lemma:exponential'
1.366866 O        b'-1:lemma:l1'
1.361666 Supp     b'-2:lemma:pahse'
1.360617 O        b'-1:lemma:wt'
1.358761 O        b'lemma:fresh'
1.356724 Air      b'-2:postag:CD'
1.350842 Med      b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.349515 Supp     b'-1:postag:CD'
1.343078 O        b'lemma:oxyr'
1.342915 O        b'lemma:additional'
1.342915 O        b'+1:lemma:2h'
1.337352 Supp     b'-2:lemma:argr'
1.318404 O        b'-2:lemma:overnight'
1.316642 O        b'+2:postag:JJ'
1.310697 Gversion b'lemma:000913'
1.310697 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.309668 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.305576 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.293893 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.291881 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.285818 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.277003 O        b'lemma:trpr'
1.275742 Technique b'-1:lemma:_'
1.273510 Supp     b'lemma:Fe'
1.267352 OD       b'-2:lemma:phase'
1.267001 O        b'lemma::'
1.263361 O        b'lemma:for'
1.246888 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.236473 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.235630 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.232747 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.213138 Agit     b'lemma:250'
1.213065 Gtype    b'postag:-RRB-'
1.206957 O        b'-1:lemma:antibody'
1.202540 pH       b'lemma:.5'
1.202540 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.197957 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.197957 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.191759 O        b'lemma:A'
1.188054 O        b'-1:lemma:nacl'
1.187292 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.179312 Technique b'lemma:-lrb-'
1.174381 O        b'lemma:genotype'
1.172977 Med      b'lemma:medium'
1.164648 Technique b'postag:-LRB-'
1.163390 Agit     b'+2:lemma:at'
1.162475 Supp     b'lemma:0.2'
1.159839 Supp     b'-2:lemma:10'
1.159171 Air      b'-2:lemma:%'
1.159136 Vess     b'+1:lemma:at'
1.157094 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.152945 Gversion b'postag:CD'
1.151825 pH       b'+1:lemma:5.5'
1.147364 O        b'+1:lemma:k-12'
1.146523 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.146278 Med      b'+2:lemma:+'
1.140166 O        b'-2:lemma:be'
1.137840 Supp     b'-2:lemma:for'
1.123961 O        b'+1:lemma:acetate'
1.122499 O        b'lemma:to'
1.122499 O        b'postag:TO'
1.121352 OD       b'-1:postag:IN'
1.120827 O        b'+1:lemma::'
1.115842 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.115842 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.102461 O        b'-2:lemma:co2'
1.098339 Gversion b'-2:postag:VB'
1.095922 Supp     b'-2:lemma:20'
1.092888 Med      b'-1:lemma:in'
1.092085 OD       b'+1:postag:IN'
1.088766 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.071221 OD       b'lemma:od600'
1.066321 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.065684 O        b'+2:lemma:of'
1.065299 Gtype    b'-2:postag:JJ'
1.058874 Med      b'postag:NNP'
1.051724 Gtype    b'+1:postag::'
1.042467 O        b'+1:lemma:20'
1.041876 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.037194 O        b'postag:FW'
1.036854 O        b'+2:postag:NNP'
1.029563 Supp     b'-1:postag:IN'
1.027459 Gtype    b'+2:postag:NN'
1.026870 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.025462 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.023146 Air      b'+2:lemma:%'
1.022899 pH       b'-2:lemma:at'
1.022605 Gversion b'lemma:nc'
1.022605 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.021720 Supp     b'+2:lemma:add'
1.013121 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
1.012212 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.010797 Gtype    b'-2:postag::'
1.004708 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.002904 O        b'lemma:at'
1.002039 Air      b'lemma:%'
1.001009 Supp     b'-1:lemma:ompr'
0.994543 O        b'+2:postag:VBD'
0.994188 Air      b'+1:lemma:%'
0.992765 O        b'+1:postag::'
0.992236 Med      b'+1:lemma:+'
0.988146 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
0.986966 Substrain b'-1:lemma:.'
0.986966 Substrain b'-1:postag:.'
0.959325 Technique b'-1:lemma:1'
0.957287 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
0.956309 Agit     b'-2:postag:RB'
0.955790 Technique b'-2:postag:NNP'
0.955711 Med      b'+1:postag:-LRB-'
0.951763 O        b'-1:lemma:-80'
0.948598 Supp     b'lemma:20'
0.943729 Supp     b'-1:lemma:potassium'
0.943729 Supp     b'-2:lemma:mmol'
0.938592 pH       b'-1:lemma:ph'
0.935970 Phase    b'lemma:phase'
0.935163 O        b'lemma:rnase'
0.934572 O        b'postag:-LRB-'
0.931874 Supp     b'lemma:glutamine'
0.931874 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
0.931708 O        b'+1:postag:NN'
0.923946 O        b'-1:lemma:nitrate'
0.923624 OD       b'lemma:of'
0.921447 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.919035 Supp     b'-1:lemma:final'
0.914461 Air      b'-2:lemma:cm20'
0.911065 O        b'+2:lemma:wt'
0.910471 Gtype    b'-2:postag:NN'
0.905681 Gtype    b'-1:postag:VBP'
0.904307 O        b'-2:lemma:Wild'
0.902434 Med      b'-2:postag:JJ'
0.899855 O        b'+1:lemma:43'
0.897511 Air      b'+2:postag:CD'
0.894242 Air      b'-1:postag:CD'
0.892253 O        b'-1:lemma:pq'
0.891527 Gtype    b'-2:lemma:the'
0.885946 Gtype    b'+2:postag::'
0.884438 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
0.884291 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.884291 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.883929 Gtype    b'lemma:nsrr'
0.883929 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
0.877656 O        b'-1:postag:NNP'
0.876902 O        b'-1:postag:JJ'
0.874170 O        b'lemma:cra'
0.872121 O        b'-2:lemma:~'
0.871381 O        b'+1:lemma:ph5'
0.871381 O        b'+2:lemma:.5'
0.871301 O        b'lemma:be'
0.869264 Gtype    b'-2:postag:NNS'
0.864460 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
0.861165 O        b'+1:lemma:nacl'
0.861077 O        b'lemma:,'
0.861077 O        b'postag:,'
0.859458 Supp     b'+2:lemma:A'
0.857845 Phase    b'postag:NN'
0.855652 O        b'+2:lemma:allow'
0.852055 O        b'+2:postag:NN'
0.849484 O        b'lemma:chip-arca'
0.849484 O        b'+2:lemma:arca8myc'
0.847827 O        b'+1:postag:VBN'
0.836993 Gversion b'+1:postag:CD'
0.835816 O        b'-1:lemma:mg1655'
0.829952 pH       b'-1:postag:NN'
0.824499 Gtype    b'+1:lemma:the'
0.823033 O        b'lemma:treatment'
0.822896 O        b'lemma:s'
0.822896 O        b'-2:lemma:parameter'
0.811776 Supp     b'+1:lemma:be'
0.811221 O        b'postag:-RRB-'
0.810785 Supp     b'-1:lemma:mm'
0.807468 O        b'lemma:old'
0.807468 O        b'-1:lemma:seqa'
0.807468 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
0.804601 Technique b'lemma:-rrb-'
0.804116 Supp     b'-1:lemma:vol'
0.804116 Supp     b'-2:lemma:1/100'
0.804116 Supp     b'+2:lemma:1m'
0.797963 Gtype    b'-1:lemma:_'
0.795172 Supp     b'lemma:of'
0.792697 pH       b'-1:lemma:at'
0.782335 Substrain b'+2:lemma::'
0.782263 Supp     b'-1:lemma:respiration'
0.782263 Supp     b'+1:lemma:mmol'
0.782263 Supp     b'+2:lemma:potassium'
0.782030 Supp     b'postag:NNP'
0.778966 Supp     b'-1:lemma:without'
0.774503 Air      b'-2:postag:SYM'
0.770750 Gtype    b'lemma:ryhb'
0.767956 OD       b'+2:postag:CD'
0.767143 O        b'-2:lemma:in'
0.766627 Supp     b'-1:postag:CC'
0.756737 OD       b'-1:lemma:of'
0.749447 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.748740 Temp     b'-2:lemma:keep'
0.748274 Med      b'-1:postag:JJ'
0.745816 O        b'-1:postag:NN'
0.744402 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
0.743878 Anti     b'postag:JJ'
0.740885 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
0.733213 Temp     b'-2:lemma:see'
0.731005 Gversion b'+1:lemma:genome'
0.729300 O        b'-1:lemma:dpd'
0.726537 Air      b'-2:lemma:mid-log'
0.725580 Anti     b'+2:postag:NNP'
0.724947 Air      b'-1:lemma:phase'
0.723563 OD       b'-1:lemma:od450'
0.713114 Supp     b'+1:postag:VBD'
0.710612 Gtype    b'lemma:the'
0.706872 Temp     b'lemma:sample'
0.705940 Gtype    b'+2:lemma:lacz'
0.702806 OD       b'-1:lemma:~'
0.688012 Substrain b'+2:postag::'
0.675203 Supp     b'+2:postag:IN'
0.672447 O        b'+1:postag:VBZ'
0.670415 O        b'lemma:chip-fnr'
0.670415 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
0.668636 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
0.659859 O        b'lemma:4'
0.657286 Air      b'+1:lemma:b'
0.655796 Gtype    b'lemma:phtpg'
0.652410 Med      b'+2:lemma:with'
0.646279 O        b'-2:lemma:250'
0.643065 O        b'+1:lemma:sparging'
0.636604 O        b'-1:postag:RB'
0.633217 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
0.630504 Air      b'lemma:Anaerobic'
0.630414 Med      b'-1:lemma:glucose'
0.630167 Supp     b'-2:lemma:nitrate'
0.628210 Technique b'postag:-RRB-'
0.626627 O        b'+2:lemma:fructose'
0.623192 Med      b'-2:lemma:treatment'
0.608980 Air      b'-1:lemma:%'
0.608585 Air      b'-1:lemma:_'
0.607761 O        b'-1:lemma:short'
0.605563 OD       b'-1:lemma:at'
0.604961 Med      b'postag:NNS'
0.602877 OD       b'+2:lemma:culture'
0.602296 O        b'-1:lemma:medium'
0.602244 OD       b'postag:IN'
0.601535 OD       b'+2:lemma:~'
0.599876 Phase    b'lemma:pahse'
0.595453 Air      b'lemma:co2'
0.592054 O        b'+2:lemma:constant'
0.591019 Supp     b'-2:postag:CD'
0.588802 O        b'-1:lemma:4'
0.586072 O        b'-2:lemma:fructose'
0.585149 OD       b'+1:lemma:0.3'
0.583157 Technique b'-2:lemma:-lrb-'
0.579598 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.578339 Gtype    b'postag:NN'
0.576581 O        b'+2:lemma:_'
0.572192 Gversion b'postag:NN'
0.568706 Air      b'-2:lemma:0.3'
0.568552 Phase    b'-2:postag:IN'
0.568430 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
0.565274 O        b'-2:postag:FW'
0.565125 pH       b'-2:lemma:glucose'
0.561991 O        b'postag:SYM'
0.560557 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.559610 Med      b'-1:lemma:fresh'
0.556493 O        b'+2:lemma:aerobically'
0.556477 Med      b'+1:postag:CD'
0.555391 Phase    b'+1:lemma:-lrb-'
0.554806 O        b'-2:lemma:no3'
0.552490 pH       b'lemma:ph'
0.549463 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.548868 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.548868 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.547121 Phase    b'+1:postag:-LRB-'
0.546827 Air      b'+2:lemma:37'
0.545504 Med      b'+2:postag:NN'
0.543854 Technique b'postag:NNP'
0.543521 O        b'-1:lemma:.5'
0.543521 O        b'-2:lemma:ph5'
0.531142 Air      b'-1:postag:NN'
0.527942 O        b'-1:lemma:media'
0.525414 O        b'+1:postag:VBD'
0.524903 Agit     b'+2:postag:-RRB-'
0.521096 Phase    b'-2:lemma:to'
0.521096 Phase    b'-2:postag:TO'
0.520015 O        b'+2:postag:NNS'
0.519739 Supp     b'-1:lemma:sodium'
0.519739 Supp     b'+2:lemma:1/100'


Top negative:
0.175575 O        b'-2:lemma:.2'
0.175251 Med      b'+1:lemma:media'
0.175218 Air      b'-2:lemma:5'
0.173918 Gtype    b'+1:lemma:small'
0.171979 O        b'lemma:hs2'
0.167906 OD       b'+1:lemma:a'
0.166777 OD       b'-2:lemma:at'
0.166152 O        b'+1:lemma:rnase'
0.166076 Gtype    b'postag:DT'
0.164597 Supp     b'+1:lemma:ph'
0.164230 O        b'lemma:IP'
0.160839 Temp     b'lemma:-rrb-'
0.160086 Air      b'+1:lemma:until'
0.158843 Supp     b'-1:lemma:30'
0.155193 Gtype    b'+2:lemma:2'
0.155078 O        b'-2:postag:NNP'
0.153162 Supp     b'+2:lemma:nh4cl'
0.151883 Air      b'+2:lemma:n2'
0.151249 O        b'-2:postag:IN'
0.148081 Supp     b'-2:lemma:condition'
0.148071 O        b'-2:postag:VBD'
0.148014 Agit     b'-1:postag:-LRB-'
0.145743 O        b'-2:postag:NNS'
0.143470 Gtype    b'lemma:crp'
0.139883 O        b'+2:lemma::'
0.138134 O        b'lemma:0.4'
0.137068 O        b'-2:lemma:strain'
0.136322 Supp     b'lemma:;'
0.136322 Supp     b'-1:lemma:7.6'
0.135010 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
0.134171 Gtype    b'-2:lemma:dna'
0.134106 O        b'+1:lemma:final'
0.133557 O        b'lemma:short'
0.129484 Gtype    b'lemma:fnr-8myc'
0.129348 Supp     b'lemma:phosphate'
0.129075 OD       b'+1:postag:DT'
0.127585 O        b'+1:postag:CC'
0.127099 Air      b'-1:lemma:cm20'
0.127099 Air      b'-2:lemma:\xc2\xb5l'
0.125864 Gtype    b'lemma:-rrb-'
0.125038 Agit     b'-1:lemma:-lrb-'
0.124798 O        b'-2:lemma:sample'
0.124075 O        b'+2:lemma:to'
0.124075 O        b'+2:postag:TO'
0.121284 Air      b'+1:postag:NN'
0.119375 O        b'+1:lemma:genbank'
0.119031 O        b'lemma:genbank'
0.116785 Temp     b'+2:lemma:and'
0.116389 Supp     b'lemma:150'
0.116389 Supp     b'+1:lemma:mg/ml'
0.116389 Supp     b'-2:lemma:concentration'
0.115961 OD       b'+2:postag:NNS'
0.114908 Supp     b'+1:postag:CD'
0.112924 Med      b'+1:postag:VBN'
0.111303 Gtype    b'+2:lemma:fnr'
0.109721 Gtype    b'-1:lemma::'
0.109464 O        b'-1:lemma:5'
0.105576 O        b'-2:lemma:.'
0.105576 O        b'-2:postag:.'
0.104876 Med      b'+2:lemma:2'
0.104554 Temp     b'+2:lemma:in'
0.104427 Med      b'-1:lemma::'
0.104415 Supp     b'-2:lemma:\xc2\xb5m'
0.104415 Supp     b'+2:lemma:\xc2\xb5l'
0.102944 O        b'lemma:lrp'
0.102289 Temp     b'-1:postag:NN'
0.100943 Supp     b'lemma:leucine'
0.098730 Supp     b'+2:lemma:fecl2'
0.098713 Supp     b'+1:lemma:hour'
0.093067 Supp     b'+2:lemma:treat'
0.091701 Air      b'+2:lemma:mid-log'
0.087320 O        b'-1:lemma:m63'
0.087208 O        b'-1:lemma:Iron'
0.086729 O        b'lemma:antibody'
0.086375 O        b'-2:lemma:mg/ml'
0.086079 OD       b'+1:postag:CD'
0.084997 O        b'-1:lemma:grow'
0.084141 Gtype    b'-1:lemma:the'
0.083509 O        b'-2:lemma:use'
0.081255 Supp     b'+2:lemma:of'
0.078646 OD       b'+2:lemma:,'
0.078646 OD       b'+2:postag:,'
0.078309 Med      b'+1:lemma:2'
0.076573 Temp     b'+2:postag:CC'
0.075841 Supp     b'-1:lemma::'
0.075624 Supp     b'-2:lemma:rpob'
0.074444 Supp     b'-2:lemma:cell'
0.072148 Technique b'-1:postag:CD'
0.071469 O        b'+2:lemma:buffer'
0.071254 O        b'+2:postag::'
0.067516 Gtype    b'-1:lemma:harbor'
0.063687 Temp     b'+1:postag:NN'
0.061051 O        b'+2:lemma:%'
0.060136 Med      b'lemma:g/l'
0.059411 Supp     b'-1:lemma:0.1'
0.057830 O        b'lemma:from'
0.057364 O        b'-2:postag:VBN'
0.057074 Technique b'postag:NN'
0.056154 O        b'-1:lemma:to'
0.056154 O        b'-1:postag:TO'
0.052890 O        b'-1:postag:VBN'
0.049713 Supp     b'lemma:in'
0.049456 Technique b'-1:postag:NN'
0.047361 O        b'+1:lemma:with'
0.045297 O        b'+1:lemma:anerobically'
0.045297 O        b'-2:lemma:600nm'
0.045251 Anti     b'-1:lemma:polymerase'
0.044959 Gtype    b'-2:lemma:factor'
0.043657 Gtype    b'+2:lemma:1'
0.043064 Anti     b'-2:lemma:rna'
0.041445 Supp     b'+1:lemma:10'
0.041324 O        b'lemma:supplement'
0.039777 Med      b'+2:postag:CD'
0.038077 O        b'-2:lemma:culture'
0.037067 Supp     b'-1:lemma:ph'
0.035875 O        b'lemma:mg1655'
0.034633 O        b'-1:lemma:%'
0.033730 O        b'lemma:min'
0.033587 Gversion b'+2:lemma:use'
0.030240 Anti     b'-2:postag::'
0.029878 Temp     b'-1:postag:VB'
0.028534 O        b'+1:postag:SYM'
0.027290 Temp     b'-2:postag:VB'
0.024899 Med      b'-2:lemma:-rrb-'
0.023914 Temp     b'postag:-RRB-'
0.023344 Med      b'-1:lemma:m9'
0.020730 O        b'+2:postag:IN'
0.020602 Gtype    b'+1:postag:DT'
0.020564 O        b'-1:lemma:2.5'
0.018701 O        b'+2:lemma:TEX'
0.017934 O        b'+2:postag:CC'
0.017129 Gtype    b'+1:lemma:nacl'
0.016766 O        b'+1:lemma:_'
0.016307 Gversion b'+2:postag:NN'
0.015054 OD       b'-2:lemma:of'
0.014390 O        b'lemma:and'
0.014238 Temp     b'lemma:30'
0.013364 O        b'+2:lemma:k-12'
0.011649 Gtype    b'-1:lemma:Fur'
0.011390 Gtype    b'-2:lemma:Fur'
0.010873 Supp     b'lemma:final'
0.009983 O        b'+1:lemma:5'
0.009951 Supp     b'-1:postag:NN'
0.009567 O        b'+2:lemma:min'
0.009458 O        b'-1:lemma:w0002'
0.009292 OD       b'-1:lemma:-lrb-'
0.009129 Air      b'-2:lemma:nh4cl'
0.009113 Air      b'-2:postag:RB'
0.007671 O        b'lemma:%'
0.007090 Temp     b'lemma:-lrb-'
0.005457 O        b'postag:RB'
0.005308 O        b'+1:lemma:be'
0.005243 O        b'-2:lemma:treat'
0.005228 O        b'-1:lemma:or'
0.004962 Temp     b'postag:-LRB-'
0.004590 Med      b'-2:postag:NN'
0.004359 Med      b'-1:postag::'
0.004074 O        b'-1:lemma:at'
0.003961 O        b'lemma:um'
0.003961 O        b'+2:lemma:paraquat'
0.003010 O        b'-2:lemma:m9'
0.002991 Supp     b'-1:postag::'
0.002918 O        b'-1:lemma:genotype'
0.002812 O        b'-1:lemma:phase'
0.002796 Air      b'+1:postag:-RRB-'
0.002545 Supp     b'-2:postag:VBN'
0.002296 O        b'lemma:stop'
0.002035 Phase    b'+1:lemma:culture'
0.001975 Gtype    b'lemma:factor'
0.001975 Gtype    b'-1:lemma:transcription'
0.001975 Gtype    b'+1:lemma:Fur'
0.001697 Anti     b'-1:postag::'
0.001536 O        b'+1:lemma:minute'
0.001522 O        b'+1:lemma:um'
0.001501 Agit     b'-2:postag:-LRB-'
0.001491 O        b'-2:lemma:2.5'
0.001352 Agit     b'-2:lemma:-lrb-'
0.001088 Med      b'-2:postag:-RRB-'
0.000948 O        b'+2:lemma:dpd'
0.000946 O        b'lemma:c'
0.000888 O        b'-2:lemma:n2'
0.000862 Supp     b'-2:lemma:without'
0.000854 O        b'lemma:2.0'
0.000464 O        b'lemma:paraquat'
0.000464 O        b'-2:lemma:um'
0.000423 O        b'-2:lemma:final'
0.000334 O        b'-2:lemma:%'
0.000328 Temp     b'+2:postag:NN'
0.000275 Med      b'-2:lemma:2'
0.000247 Med      b'+2:lemma:without'
0.000230 Phase    b'+2:postag:NN'
0.000219 Supp     b'-2:lemma:stir'
0.000191 O        b'lemma:induction'
0.000171 Supp     b'-2:postag::'
0.000114 O        b'-2:lemma:at'
0.000104 O        b'+2:lemma:70'
0.000096 Gtype    b'+1:lemma:ryhb'
0.000080 Phase    b'+2:lemma:follow'
0.000075 Supp     b'+2:lemma:,'
0.000075 Supp     b'+2:postag:,'
0.000068 Supp     b'+1:lemma:%'
0.000067 Phase    b'+1:postag:NNS'
0.000060 Phase    b'-1:lemma:the'
0.000051 O        b'-2:lemma:or'
0.000044 Phase    b'+2:lemma:od600'
0.000039 Supp     b'+1:lemma:iptg'
0.000035 Phase    b'-2:lemma:grow'
0.000032 Phase    b'-1:postag:DT'
0.000029 Phase    b'+2:postag:VBN'
0.000025 O        b'+2:lemma:rpm'
0.000024 Med      b'-1:lemma:2'
0.000022 Med      b'-1:lemma:-rrb-'
0.000021 Supp     b'-2:lemma:with'
0.000021 Med      b'-1:postag:-RRB-'
0.000021 Supp     b'-1:lemma:iptg'
0.000018 Supp     b'+1:lemma:7.6'
0.000018 Supp     b'-2:lemma:1m'
0.000018 Supp     b'+2:lemma:;'
0.000017 Supp     b'+1:postag:RB'
0.000013 Supp     b'+1:lemma:300'
0.000010 Supp     b'-2:lemma:ph'
0.000007 Gtype    b'+2:lemma:rna'
0.000006 Phase    b'-1:lemma:to'
0.000006 Phase    b'-1:postag:TO'
0.000005 Supp     b'lemma:sodium'
0.000004 Temp     b'-2:lemma:grow'
0.000004 O        b'-2:lemma:5'
0.000004 Gtype    b'-2:lemma:small'
0.000004 Supp     b'lemma:Trp'
0.000003 Supp     b'+1:lemma:m'
0.000002 O        b'lemma:5'
-0.000000 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.000000 O        b'+1:lemma:300'
-0.000001 Air      b'-1:lemma:aerobically'
-0.000007 Air      b'+2:lemma:-rrb-'
-0.000007 Air      b'+1:lemma:-rrb-'
-0.000008 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.000009 Air      b'+2:postag:-RRB-'
-0.000009 O        b'+1:lemma:until'
-0.000009 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.000009 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.000009 O        b'+2:lemma:vol'
-0.000011 Med      b'postag:JJ'
-0.000015 O        b'+2:lemma:ph'
-0.000015 O        b'+2:lemma:follow'
-0.000040 Air      b'+2:lemma:70'
-0.000044 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.000051 Air      b'lemma:,'
-0.000051 Air      b'postag:,'
-0.000070 Air      b'-2:postag:-LRB-'
-0.000080 Air      b'-2:lemma:-lrb-'
-0.000123 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.000130 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.000145 O        b'-2:lemma:cell'
-0.000150 O        b'-1:lemma:in'
-0.000164 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.000177 OD       b'+2:postag:NN'
-0.000226 Supp     b'lemma:250'
-0.000231 OD       b'postag:NN'
-0.000264 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.000321 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.000398 Air      b'+2:lemma:,'
-0.000398 Air      b'+2:postag:,'
-0.000515 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.000519 O        b'lemma:m9'
-0.000544 Air      b'+1:postag:CD'
-0.000599 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.000697 O        b'lemma:m63'
-0.000941 Supp     b'lemma:um'
-0.000941 Supp     b'+2:lemma:paraquat'
-0.001067 O        b'-1:postag:VBG'
-0.001267 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.001332 Temp     b'+2:postag:IN'
-0.001555 O        b'lemma:lb'
-0.001578 O        b'+2:lemma:media'
-0.001619 O        b'+1:lemma:.'
-0.001619 O        b'+1:postag:.'
-0.001880 O        b'lemma:sample'
-0.002743 Air      b'+2:postag:CC'
-0.002818 Supp     b'-2:lemma:,'
-0.002818 Supp     b'-2:postag:,'
-0.003041 O        b'-1:lemma:37'
-0.003091 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.003214 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.003299 O        b'+1:lemma:n2'
-0.003592 O        b'+2:lemma:at'
-0.003727 Supp     b'lemma:2'
-0.003756 O        b'-1:postag:DT'
-0.004123 Air      b'postag:CD'
-0.004503 O        b'+1:lemma:hour'
-0.004582 O        b'+2:lemma:n2'
-0.004788 Supp     b'+2:postag:VBN'
-0.004796 Air      b'lemma:and'
-0.004993 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.007202 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.007277 Supp     b'-2:lemma:0.2'
-0.009255 Air      b'-1:lemma:and'
-0.010782 Supp     b'+1:lemma:of'
-0.012266 O        b'+1:lemma:a'
-0.014097 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.015378 O        b'lemma:mm'
-0.017969 Technique b'-2:postag:NN'
-0.019168 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.020056 Supp     b'postag:IN'
-0.021202 Temp     b'postag:CD'
-0.021397 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.022815 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.023286 O        b'-2:lemma:to'
-0.023286 O        b'-2:postag:TO'
-0.025102 Supp     b'+2:postag:NNS'
-0.029183 O        b'+1:lemma:ph'
-0.029609 Supp     b'-2:postag:IN'
-0.036130 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.036239 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.037544 Med      b'+1:postag:IN'
-0.037914 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.038896 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.040275 Air      b'-1:postag:RB'
-0.040721 Supp     b'postag:CD'
-0.041600 O        b'+2:postag:RB'
-0.044186 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.044224 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.051842 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.053769 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.054733 O        b'+1:lemma:media'
-0.054789 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.055387 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.056875 O        b'+2:lemma:10'
-0.057760 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.058374 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.060884 Air      b'-1:lemma:,'
-0.060884 Air      b'-1:postag:,'
-0.062035 O        b'lemma:;'
-0.062035 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.063129 O        b'-1:lemma:.'
-0.063129 O        b'-1:postag:.'
-0.063166 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.069085 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.076443 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.091574 O        b'-1:lemma:mm'
-0.099056 O        b'-1:lemma:ml'
-0.099854 Air      b'-1:postag:CC'
-0.102537 O        b'+1:lemma:of'
-0.112218 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.112960 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.114859 O        b'-2:lemma:glucose'
-0.114904 O        b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.115102 Med      b'postag:CD'
-0.118741 Air      b'-2:postag:CC'
-0.119489 O        b'-1:lemma:~'
-0.126085 Air      b'+2:postag:IN'
-0.130085 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.130362 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.131788 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.132640 O        b'lemma:dissolve'
-0.132640 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.136830 O        b'-1:lemma:until'
-0.137816 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.138631 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.139901 Med      b'-1:postag:IN'
-0.139970 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.140509 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.147678 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.148397 O        b'-1:lemma:contain'
-0.150570 Technique b'-1:postag::'
-0.151339 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.153060 O        b'lemma:nacl'
-0.160791 O        b'-1:postag:IN'
-0.169388 O        b'-2:lemma:of'
-0.170086 O        b'+1:lemma:~'
-0.171491 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.175251 O        b'lemma:nitrate'
-0.179779 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.180370 O        b'+2:lemma:~'
-0.180497 O        b'lemma:medium'
-0.186798 O        b'+1:postag:CD'
-0.190395 O        b'lemma:0.2'
-0.195527 O        b'-2:lemma:20'
-0.195829 O        b'lemma:ph'
-0.198458 O        b'lemma:fecl2'
-0.202949 O        b'-1:lemma:of'
-0.203051 Med      b'-1:postag:NN'
-0.204363 O        b'+1:lemma:mm'
-0.211788 O        b'+2:lemma:genome'
-0.212922 O        b'+2:lemma:tag'
-0.222072 O        b'-1:lemma:1m'
-0.222072 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.224721 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.224721 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.234666 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.246701 O        b'lemma:0.1'
-0.250933 O        b'lemma:nh4cl'
-0.256008 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.260120 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.264252 O        b'-2:lemma:genome'
-0.265155 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.266499 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.268806 O        b'-2:postag::'
-0.278036 Gtype    b'postag:VBG'
-0.281759 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.286028 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.293452 O        b'-2:lemma:until'
-0.296489 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.299840 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.302980 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.303227 O        b'-1:lemma:the'
-0.311308 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.322685 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.329013 O        b'+1:lemma:1m'
-0.329013 O        b'-2:lemma:vol'
-0.350773 pH       b'postag:NN'
-0.363049 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.365268 O        b'+1:lemma:+'
-0.381142 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.391467 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.391467 Supp     b'+1:postag:,'
-0.401803 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.402643 O        b'+2:lemma:m9'
-0.405511 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.405806 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.406778 O        b'lemma:37'
-0.409336 O        b'-2:postag:VBG'
-0.415413 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.420265 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.424195 O        b'+2:lemma:.'
-0.424195 O        b'+2:postag:.'
-0.425786 O        b'-2:lemma:IP'
-0.427368 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.429312 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.442127 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.462011 O        b'+1:lemma:at'
-0.464454 O        b'-2:postag:SYM'
-0.466538 O        b'lemma:aerobic'
-0.481098 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.505001 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.510192 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.518187 O        b'+1:postag:IN'
-0.522781 O        b'+2:lemma:add'
-0.536229 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.536940 O        b'-2:lemma::'
-0.549859 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.550829 O        b'-2:lemma:media'
-0.564666 O        b'+2:lemma:+'
-0.569791 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.572748 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.578159 Med      b'+1:postag:NN'
-0.578530 O        b'lemma:minimal'
-0.582875 O        b'+1:lemma:%'
-0.605892 O        b'lemma:wt'
-0.616855 Temp     b'postag:NN'
-0.617247 O        b'-1:lemma:IP'
-0.636070 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.651008 O        b'-1:lemma:vol'
-0.651008 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.651008 O        b'+2:lemma:1m'
-0.660096 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.680201 Anti     b'postag:NNP'
-0.699386 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.705289 O        b'+1:postag:DT'
-0.725551 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.746607 O        b'-2:lemma:iptg'
-0.749639 O        b'lemma:mid-log'
-0.750094 O        b'lemma:rifampicin'
-0.775221 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.782645 Gtype    b'-2:postag:CD'
-0.820273 O        b'-1:postag::'
-0.893493 Air      b'postag:NN'
-0.904051 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.952668 O        b'-2:lemma:the'
-0.957081 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.983365 O        b'-1:lemma:30'
-0.988705 Supp     b'-1:postag:NNP'
-0.994157 O        b'+2:lemma:mid-log'
-1.014296 O        b'-1:lemma:1'
-1.050327 O        b'-1:lemma:co2'
-1.100095 OD       b'+1:postag:NN'
-1.128420 O        b'+2:lemma:b'
-1.144463 Supp     b'postag:JJ'
-1.227846 O        b'lemma:media'
-1.263490 O        b'-2:lemma:0.3'
-1.268195 Phase    b'postag:JJ'
-1.355173 Supp     b'+2:postag:CD'
-1.357229 O        b'+1:lemma:in'
-1.376719 O        b'lemma:30'
-1.381125 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.452688 O        b'lemma:aerobically'
-1.460131 O        b'-1:lemma:ph'
-1.476266 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-1.485622 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.490132 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-1.582726 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-1.619994 O        b'-1:lemma:sample'
-1.973905 O        b'lemma:of'
-2.008257 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.041188 O        b'lemma:0.3'
-2.130445 O        b'-1:lemma:2'
-2.500565 O        b'+1:lemma:1'
-2.613429 O        b'+1:lemma:2'
-3.943876 O        b'-1:lemma::'
-4.385335 O        b'-1:lemma:_'