report_Run5_v12.txt
37.3 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.23610502350349594, 'c2': 0.012937351889081112}
best CV score:0.823974602152804
model size: 0.07M
Flat F1: 0.8154893949023028
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 0.970 0.985 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.595 0.568 0.581 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.912 0.795 0.849 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.857 0.838 0.848 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.856 0.783 0.815 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.551246
Supp -> Supp 5.265793
Med -> Med 5.192055
OD -> OD 4.960431
Anti -> Anti 4.737548
Gtype -> Gtype 4.456051
Air -> Air 4.356392
O -> O 4.237654
Gversion -> Gversion 4.194909
Technique -> Technique 3.408063
Phase -> Phase 3.272046
pH -> pH 2.877933
Agit -> Agit 2.462655
Substrain -> Gtype 1.914531
Gtype -> Supp 1.466352
Air -> O 1.200948
O -> Supp 1.195298
O -> Technique 1.075185
O -> Gtype 0.834658
Technique -> Air 0.681997
Temp -> O 0.631597
Supp -> O 0.592839
Med -> O 0.500660
Gtype -> pH 0.116373
O -> Med 0.095966
OD -> O 0.019210
O -> Gversion 0.011620
O -> Phase 0.000337
Phase -> O 0.000264
O -> pH 0.000010
Supp -> Med -0.202579
OD -> Air -0.392508
Gtype -> O -0.400653
Phase -> OD -0.584240
Technique -> pH -0.657852
O -> Air -0.739787
Substrain -> O -0.833036
Med -> Supp -0.937213
Technique -> Gtype -1.373402
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.551246
Supp -> Supp 5.265793
Med -> Med 5.192055
OD -> OD 4.960431
Anti -> Anti 4.737548
Gtype -> Gtype 4.456051
Air -> Air 4.356392
O -> O 4.237654
Gversion -> Gversion 4.194909
Technique -> Technique 3.408063
Phase -> Phase 3.272046
pH -> pH 2.877933
Agit -> Agit 2.462655
Substrain -> Gtype 1.914531
Gtype -> Supp 1.466352
Air -> O 1.200948
O -> Supp 1.195298
O -> Technique 1.075185
O -> Gtype 0.834658
Technique -> Air 0.681997
Temp -> O 0.631597
Supp -> O 0.592839
Med -> O 0.500660
Gtype -> pH 0.116373
O -> Med 0.095966
OD -> O 0.019210
O -> Gversion 0.011620
O -> Phase 0.000337
Phase -> O 0.000264
O -> pH 0.000010
Supp -> Med -0.202579
OD -> Air -0.392508
Gtype -> O -0.400653
Phase -> OD -0.584240
Technique -> pH -0.657852
O -> Air -0.739787
Substrain -> O -0.833036
Med -> Supp -0.937213
Technique -> Gtype -1.373402
Top positive:
6.644000 Phase b'lemma:mid-log'
6.104168 O b'lemma:1'
6.064563 O b'lemma:2'
6.026331 Anti b'-2:lemma:antibody'
5.963579 O b'-2:lemma:_'
5.881278 Gtype b'lemma:type'
5.645610 O b'lemma:_'
5.406364 O b'lemma:3'
5.365614 Technique b'lemma:chipseq'
5.333293 Air b'lemma:anaerobic'
5.288705 Strain b'lemma:k-12'
5.151897 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
5.074164 O b'postag:VBG'
4.988267 Technique b'+2:lemma:ph5'
4.965833 Supp b'lemma:pq'
4.903131 Supp b'lemma:no3'
4.874907 Gtype b'lemma:wt'
4.597727 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
4.566442 O b'postag:IN'
4.531479 Supp b'-2:lemma:shake'
4.488061 Med b'lemma:MOPS'
4.486121 Phase b'-2:lemma:phase'
4.408291 O b'lemma:b'
4.346643 Gtype b'+1:lemma:type'
4.277079 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
4.172930 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
4.140730 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
4.097346 O b'lemma:rpob'
4.079050 O b'lemma:-'
4.065849 Technique b'lemma:rna-seq'
4.049802 Supp b'lemma:Iron'
4.049802 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.937512 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.935133 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.934876 Supp b'lemma:glucose'
3.910882 Air b'lemma:aerobic'
3.881487 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.777935 Med b'lemma:LB'
3.709794 Supp b'lemma:nh4cl'
3.670517 O b'lemma:Cra'
3.596186 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.578503 Technique b'lemma:chip-seq'
3.545118 Supp b'lemma:acetate'
3.528482 Gtype b'lemma:pk4854'
3.514874 O b'lemma:.'
3.514874 O b'postag:.'
3.458564 Supp b'lemma:2h'
3.458564 Supp b'-1:lemma:additional'
3.438491 O b'lemma:with'
3.352909 Gtype b'-2:lemma:genotype'
3.352585 O b'postag::'
3.307644 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
3.264764 Air b'-2:lemma:IP'
3.209011 Substrain b'lemma:mg1655'
3.201344 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
3.181780 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
3.179280 Supp b'lemma:iptg'
3.162484 O b'-1:postag:NNS'
3.160768 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
3.119234 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.118942 Gtype b'lemma:dfnr'
3.114548 O b'lemma:rep2'
3.114548 O b'lemma:rep1'
3.098016 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
3.074561 O b'-1:lemma:type'
3.055990 Technique b'lemma:chip-exo'
3.033055 Med b'lemma:lb'
3.028441 Substrain b'-2:lemma:substr'
3.020019 Air b'-1:lemma:-'
3.000731 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
3.000353 O b'postag:VBN'
2.995736 O b'-2:lemma:myc'
2.970277 O b'postag:CC'
2.958786 Supp b'lemma:Adenine'
2.957510 O b'-1:lemma:tag'
2.937934 O b'+2:lemma:crp'
2.935088 Supp b'lemma:arginine'
2.922134 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.836530 O b'+1:lemma:wt'
2.821527 Med b'lemma:media'
2.807214 O b'-2:lemma:flagtag'
2.792930 Air b'lemma:aerobically'
2.790531 Temp b'-1:lemma:sample'
2.761456 Supp b'lemma:nacl'
2.717508 Med b'+2:lemma:b2'
2.715625 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.672527 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.654339 O b'lemma:a'
2.643053 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.611075 Supp b'lemma:rifampicin'
2.578131 Supp b'+1:lemma:1'
2.558393 Gtype b'-2:lemma:delta'
2.540602 Technique b'-2:lemma:Fur'
2.536901 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.529739 O b'lemma:CEL'
2.512506 Med b'lemma:minimal'
2.483357 O b'lemma:gadx'
2.434482 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.430729 Air b'postag:RB'
2.385955 pH b'lemma:ph5'
2.385955 pH b'+1:lemma:.5'
2.359388 pH b'+1:postag:CD'
2.352857 Technique b'-1:lemma:IP'
2.306969 O b'+1:postag:RB'
2.304505 Temp b'lemma:43'
2.244282 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.238091 Anti b'+1:lemma:antibody'
2.237343 O b'-1:lemma:0.3'
2.236926 Supp b'+1:lemma:2'
2.233310 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.230594 O b'lemma:affyexp'
2.223083 O b'postag:DT'
2.220371 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
2.218904 Supp b'lemma:Leu'
2.218904 Supp b'-2:lemma:Lrp'
2.218190 Med b'+2:lemma:b1'
2.210469 O b'+1:lemma:od600'
2.204288 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
2.200840 O b'lemma:harbor'
2.190427 Gtype b'lemma:ptac'
2.187249 O b'lemma:culture'
2.137010 O b'lemma:soxr'
2.137010 O b'lemma:soxs'
2.126343 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.119274 Supp b'-2:lemma:media'
2.082855 Supp b'lemma:fructose'
2.081953 O b'-1:lemma:glucose'
2.061468 Gversion b'lemma:.2'
2.061468 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.041868 O b'lemma:chip'
2.027347 Gtype b'-1:lemma:ptac'
2.017764 Med b'lemma:m63'
2.012894 Med b'+1:lemma:g/l'
2.003360 Gtype b'+1:lemma:ph5'
2.003360 Gtype b'+2:lemma:.5'
1.998133 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.974856 Temp b'lemma:37'
1.969938 O b'postag:VBD'
1.964660 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
1.964660 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
1.957465 Supp b'-1:lemma:with'
1.953998 Temp b'-1:lemma:37'
1.945939 Gversion b'lemma:u00096'
1.945939 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.910452 Med b'-1:lemma:ml'
1.899208 Supp b'-1:lemma:+'
1.888180 Supp b'+2:lemma:feso4'
1.881025 O b'-2:lemma:medium'
1.872703 Strain b'+1:lemma:substr'
1.872703 Strain b'-2:lemma:str'
1.843864 O b'-1:lemma:lb'
1.841093 Air b'-1:lemma:co2'
1.840580 OD b'lemma:0.3'
1.839571 O b'lemma:ompr'
1.813079 Technique b'lemma:rnaseq'
1.799343 Technique b'-1:lemma:input'
1.787802 O b'+1:lemma:pq'
1.777582 O b'lemma:genotype/variation'
1.777114 Vess b'lemma:flask'
1.777114 Vess b'-1:lemma:warm'
1.777114 Vess b'-2:lemma:pre'
1.777114 Vess b'+2:lemma:43'
1.772403 O b'lemma:ml'
1.769350 Med b'+2:postag:CC'
1.744788 Air b'-2:lemma:fnr'
1.708432 O b'-2:lemma:='
1.706819 O b'postag:NNS'
1.700720 O b'-1:lemma:min'
1.699371 O b'lemma:purr'
1.693546 O b'lemma:\xcf\x8332'
1.685033 O b'-2:lemma:min'
1.681156 Gtype b'lemma:wild-type'
1.677150 O b'-1:lemma:anaerobic'
1.675692 O b'+1:postag:NNP'
1.652361 Agit b'lemma:rpm'
1.644522 Med b'+1:lemma:0.4'
1.627189 Gtype b'+1:lemma:with'
1.621412 O b'+1:lemma:250'
1.609032 Gversion b'-2:lemma:build'
1.600958 Supp b'+1:lemma:_'
1.589653 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.567283 OD b'lemma:od450'
1.548462 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.546552 O b'lemma:argr'
1.535687 Technique b'-2:lemma:wt'
1.526014 Agit b'-1:lemma:250'
1.522174 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.502613 Supp b'-2:lemma:agent'
1.496267 O b'+1:lemma:coli'
1.494176 Med b'+1:lemma:medium'
1.493860 Air b'lemma:anaeroibc'
1.490166 pH b'lemma:5.5'
1.471562 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
1.471125 Temp b'-1:lemma:43'
1.451403 O b'-1:lemma:into'
1.448488 Supp b'-1:lemma:_'
1.447482 Supp b'-2:lemma:purr'
1.444598 OD b'-2:lemma:od450'
1.442788 Gtype b'postag:JJ'
1.437381 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.437381 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.434230 O b'lemma:growth'
1.432268 Air b'postag:JJ'
1.425334 Supp b'lemma:dpd'
1.409263 O b'lemma:input'
1.409263 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.403969 OD b'+1:lemma:of'
1.402035 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.394481 Phase b'-2:lemma:until'
1.391724 O b'lemma:-rrb-'
1.387370 O b'lemma:-lrb-'
1.382428 OD b'postag:CD'
1.380963 OD b'+2:lemma:0.3'
1.379541 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.379541 Gtype b'-1:lemma:old'
1.379541 Gtype b'-2:lemma:seqa'
1.367875 Phase b'lemma:stationary'
1.367875 Phase b'lemma:exponential'
1.366866 O b'-1:lemma:l1'
1.361666 Supp b'-2:lemma:pahse'
1.360617 O b'-1:lemma:wt'
1.358761 O b'lemma:fresh'
1.356724 Air b'-2:postag:CD'
1.350842 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.349515 Supp b'-1:postag:CD'
1.343078 O b'lemma:oxyr'
1.342915 O b'lemma:additional'
1.342915 O b'+1:lemma:2h'
1.337352 Supp b'-2:lemma:argr'
1.318404 O b'-2:lemma:overnight'
1.316642 O b'+2:postag:JJ'
1.310697 Gversion b'lemma:000913'
1.310697 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.309668 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.305576 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.293893 Gtype b'+1:lemma:_'
1.291881 Supp b'-2:lemma:induce'
1.285818 Supp b'-2:lemma:supplement'
1.277003 O b'lemma:trpr'
1.275742 Technique b'-1:lemma:_'
1.273510 Supp b'lemma:Fe'
1.267352 OD b'-2:lemma:phase'
1.267001 O b'lemma::'
1.263361 O b'lemma:for'
1.246888 Med b'+1:lemma:minimal'
1.236473 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.235630 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.232747 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.213138 Agit b'lemma:250'
1.213065 Gtype b'postag:-RRB-'
1.206957 O b'-1:lemma:antibody'
1.202540 pH b'lemma:.5'
1.202540 pH b'-1:lemma:ph5'
1.197957 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.197957 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.191759 O b'lemma:A'
1.188054 O b'-1:lemma:nacl'
1.187292 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.179312 Technique b'lemma:-lrb-'
1.174381 O b'lemma:genotype'
1.172977 Med b'lemma:medium'
1.164648 Technique b'postag:-LRB-'
1.163390 Agit b'+2:lemma:at'
1.162475 Supp b'lemma:0.2'
1.159839 Supp b'-2:lemma:10'
1.159171 Air b'-2:lemma:%'
1.159136 Vess b'+1:lemma:at'
1.157094 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.152945 Gversion b'postag:CD'
1.151825 pH b'+1:lemma:5.5'
1.147364 O b'+1:lemma:k-12'
1.146523 Med b'+1:lemma:2.0'
1.146278 Med b'+2:lemma:+'
1.140166 O b'-2:lemma:be'
1.137840 Supp b'-2:lemma:for'
1.123961 O b'+1:lemma:acetate'
1.122499 O b'lemma:to'
1.122499 O b'postag:TO'
1.121352 OD b'-1:postag:IN'
1.120827 O b'+1:lemma::'
1.115842 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.115842 Gtype b'-2:lemma:transcription'
1.102461 O b'-2:lemma:co2'
1.098339 Gversion b'-2:postag:VB'
1.095922 Supp b'-2:lemma:20'
1.092888 Med b'-1:lemma:in'
1.092085 OD b'+1:postag:IN'
1.088766 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.071221 OD b'lemma:od600'
1.066321 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.065684 O b'+2:lemma:of'
1.065299 Gtype b'-2:postag:JJ'
1.058874 Med b'postag:NNP'
1.051724 Gtype b'+1:postag::'
1.042467 O b'+1:lemma:20'
1.041876 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.037194 O b'postag:FW'
1.036854 O b'+2:postag:NNP'
1.029563 Supp b'-1:postag:IN'
1.027459 Gtype b'+2:postag:NN'
1.026870 Med b'-1:lemma:minimal'
1.025462 Supp b'-2:postag:VBG'
1.023146 Air b'+2:lemma:%'
1.022899 pH b'-2:lemma:at'
1.022605 Gversion b'lemma:nc'
1.022605 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.021720 Supp b'+2:lemma:add'
1.013121 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
1.012212 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.010797 Gtype b'-2:postag::'
1.004708 Vess b'-1:postag:VBN'
1.002904 O b'lemma:at'
1.002039 Air b'lemma:%'
1.001009 Supp b'-1:lemma:ompr'
0.994543 O b'+2:postag:VBD'
0.994188 Air b'+1:lemma:%'
0.992765 O b'+1:postag::'
0.992236 Med b'+1:lemma:+'
0.988146 Med b'+1:lemma:-lrb-'
0.986966 Substrain b'-1:lemma:.'
0.986966 Substrain b'-1:postag:.'
0.959325 Technique b'-1:lemma:1'
0.957287 Anti b'-2:lemma:polymerase'
0.956309 Agit b'-2:postag:RB'
0.955790 Technique b'-2:postag:NNP'
0.955711 Med b'+1:postag:-LRB-'
0.951763 O b'-1:lemma:-80'
0.948598 Supp b'lemma:20'
0.943729 Supp b'-1:lemma:potassium'
0.943729 Supp b'-2:lemma:mmol'
0.938592 pH b'-1:lemma:ph'
0.935970 Phase b'lemma:phase'
0.935163 O b'lemma:rnase'
0.934572 O b'postag:-LRB-'
0.931874 Supp b'lemma:glutamine'
0.931874 Supp b'-1:lemma:2g/l'
0.931708 O b'+1:postag:NN'
0.923946 O b'-1:lemma:nitrate'
0.923624 OD b'lemma:of'
0.921447 Supp b'+1:lemma:mm'
0.919035 Supp b'-1:lemma:final'
0.914461 Air b'-2:lemma:cm20'
0.911065 O b'+2:lemma:wt'
0.910471 Gtype b'-2:postag:NN'
0.905681 Gtype b'-1:postag:VBP'
0.904307 O b'-2:lemma:Wild'
0.902434 Med b'-2:postag:JJ'
0.899855 O b'+1:lemma:43'
0.897511 Air b'+2:postag:CD'
0.894242 Air b'-1:postag:CD'
0.892253 O b'-1:lemma:pq'
0.891527 Gtype b'-2:lemma:the'
0.885946 Gtype b'+2:postag::'
0.884438 Supp b'+1:lemma:Deficient'
0.884291 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.884291 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.883929 Gtype b'lemma:nsrr'
0.883929 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
0.877656 O b'-1:postag:NNP'
0.876902 O b'-1:postag:JJ'
0.874170 O b'lemma:cra'
0.872121 O b'-2:lemma:~'
0.871381 O b'+1:lemma:ph5'
0.871381 O b'+2:lemma:.5'
0.871301 O b'lemma:be'
0.869264 Gtype b'-2:postag:NNS'
0.864460 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
0.861165 O b'+1:lemma:nacl'
0.861077 O b'lemma:,'
0.861077 O b'postag:,'
0.859458 Supp b'+2:lemma:A'
0.857845 Phase b'postag:NN'
0.855652 O b'+2:lemma:allow'
0.852055 O b'+2:postag:NN'
0.849484 O b'lemma:chip-arca'
0.849484 O b'+2:lemma:arca8myc'
0.847827 O b'+1:postag:VBN'
0.836993 Gversion b'+1:postag:CD'
0.835816 O b'-1:lemma:mg1655'
0.829952 pH b'-1:postag:NN'
0.824499 Gtype b'+1:lemma:the'
0.823033 O b'lemma:treatment'
0.822896 O b'lemma:s'
0.822896 O b'-2:lemma:parameter'
0.811776 Supp b'+1:lemma:be'
0.811221 O b'postag:-RRB-'
0.810785 Supp b'-1:lemma:mm'
0.807468 O b'lemma:old'
0.807468 O b'-1:lemma:seqa'
0.807468 O b'+1:lemma:deltaseqa'
0.804601 Technique b'lemma:-rrb-'
0.804116 Supp b'-1:lemma:vol'
0.804116 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.804116 Supp b'+2:lemma:1m'
0.797963 Gtype b'-1:lemma:_'
0.795172 Supp b'lemma:of'
0.792697 pH b'-1:lemma:at'
0.782335 Substrain b'+2:lemma::'
0.782263 Supp b'-1:lemma:respiration'
0.782263 Supp b'+1:lemma:mmol'
0.782263 Supp b'+2:lemma:potassium'
0.782030 Supp b'postag:NNP'
0.778966 Supp b'-1:lemma:without'
0.774503 Air b'-2:postag:SYM'
0.770750 Gtype b'lemma:ryhb'
0.767956 OD b'+2:postag:CD'
0.767143 O b'-2:lemma:in'
0.766627 Supp b'-1:postag:CC'
0.756737 OD b'-1:lemma:of'
0.749447 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.748740 Temp b'-2:lemma:keep'
0.748274 Med b'-1:postag:JJ'
0.745816 O b'-1:postag:NN'
0.744402 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
0.743878 Anti b'postag:JJ'
0.740885 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
0.733213 Temp b'-2:lemma:see'
0.731005 Gversion b'+1:lemma:genome'
0.729300 O b'-1:lemma:dpd'
0.726537 Air b'-2:lemma:mid-log'
0.725580 Anti b'+2:postag:NNP'
0.724947 Air b'-1:lemma:phase'
0.723563 OD b'-1:lemma:od450'
0.713114 Supp b'+1:postag:VBD'
0.710612 Gtype b'lemma:the'
0.706872 Temp b'lemma:sample'
0.705940 Gtype b'+2:lemma:lacz'
0.702806 OD b'-1:lemma:~'
0.688012 Substrain b'+2:postag::'
0.675203 Supp b'+2:postag:IN'
0.672447 O b'+1:postag:VBZ'
0.670415 O b'lemma:chip-fnr'
0.670415 O b'+2:lemma:fnr8myc'
0.668636 Supp b'+2:postag:-LRB-'
0.659859 O b'lemma:4'
0.657286 Air b'+1:lemma:b'
0.655796 Gtype b'lemma:phtpg'
0.652410 Med b'+2:lemma:with'
0.646279 O b'-2:lemma:250'
0.643065 O b'+1:lemma:sparging'
0.636604 O b'-1:postag:RB'
0.633217 O b'-1:lemma:genotype/variation'
0.630504 Air b'lemma:Anaerobic'
0.630414 Med b'-1:lemma:glucose'
0.630167 Supp b'-2:lemma:nitrate'
0.628210 Technique b'postag:-RRB-'
0.626627 O b'+2:lemma:fructose'
0.623192 Med b'-2:lemma:treatment'
0.608980 Air b'-1:lemma:%'
0.608585 Air b'-1:lemma:_'
0.607761 O b'-1:lemma:short'
0.605563 OD b'-1:lemma:at'
0.604961 Med b'postag:NNS'
0.602877 OD b'+2:lemma:culture'
0.602296 O b'-1:lemma:medium'
0.602244 OD b'postag:IN'
0.601535 OD b'+2:lemma:~'
0.599876 Phase b'lemma:pahse'
0.595453 Air b'lemma:co2'
0.592054 O b'+2:lemma:constant'
0.591019 Supp b'-2:postag:CD'
0.588802 O b'-1:lemma:4'
0.586072 O b'-2:lemma:fructose'
0.585149 OD b'+1:lemma:0.3'
0.583157 Technique b'-2:lemma:-lrb-'
0.579598 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.578339 Gtype b'postag:NN'
0.576581 O b'+2:lemma:_'
0.572192 Gversion b'postag:NN'
0.568706 Air b'-2:lemma:0.3'
0.568552 Phase b'-2:postag:IN'
0.568430 Gtype b'-2:lemma:mg1655'
0.565274 O b'-2:postag:FW'
0.565125 pH b'-2:lemma:glucose'
0.561991 O b'postag:SYM'
0.560557 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.559610 Med b'-1:lemma:fresh'
0.556493 O b'+2:lemma:aerobically'
0.556477 Med b'+1:postag:CD'
0.555391 Phase b'+1:lemma:-lrb-'
0.554806 O b'-2:lemma:no3'
0.552490 pH b'lemma:ph'
0.549463 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.548868 Supp b'+1:lemma:1m'
0.548868 Supp b'-2:lemma:vol'
0.547121 Phase b'+1:postag:-LRB-'
0.546827 Air b'+2:lemma:37'
0.545504 Med b'+2:postag:NN'
0.543854 Technique b'postag:NNP'
0.543521 O b'-1:lemma:.5'
0.543521 O b'-2:lemma:ph5'
0.531142 Air b'-1:postag:NN'
0.527942 O b'-1:lemma:media'
0.525414 O b'+1:postag:VBD'
0.524903 Agit b'+2:postag:-RRB-'
0.521096 Phase b'-2:lemma:to'
0.521096 Phase b'-2:postag:TO'
0.520015 O b'+2:postag:NNS'
0.519739 Supp b'-1:lemma:sodium'
0.519739 Supp b'+2:lemma:1/100'
Top negative:
0.175575 O b'-2:lemma:.2'
0.175251 Med b'+1:lemma:media'
0.175218 Air b'-2:lemma:5'
0.173918 Gtype b'+1:lemma:small'
0.171979 O b'lemma:hs2'
0.167906 OD b'+1:lemma:a'
0.166777 OD b'-2:lemma:at'
0.166152 O b'+1:lemma:rnase'
0.166076 Gtype b'postag:DT'
0.164597 Supp b'+1:lemma:ph'
0.164230 O b'lemma:IP'
0.160839 Temp b'lemma:-rrb-'
0.160086 Air b'+1:lemma:until'
0.158843 Supp b'-1:lemma:30'
0.155193 Gtype b'+2:lemma:2'
0.155078 O b'-2:postag:NNP'
0.153162 Supp b'+2:lemma:nh4cl'
0.151883 Air b'+2:lemma:n2'
0.151249 O b'-2:postag:IN'
0.148081 Supp b'-2:lemma:condition'
0.148071 O b'-2:postag:VBD'
0.148014 Agit b'-1:postag:-LRB-'
0.145743 O b'-2:postag:NNS'
0.143470 Gtype b'lemma:crp'
0.139883 O b'+2:lemma::'
0.138134 O b'lemma:0.4'
0.137068 O b'-2:lemma:strain'
0.136322 Supp b'lemma:;'
0.136322 Supp b'-1:lemma:7.6'
0.135010 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
0.134171 Gtype b'-2:lemma:dna'
0.134106 O b'+1:lemma:final'
0.133557 O b'lemma:short'
0.129484 Gtype b'lemma:fnr-8myc'
0.129348 Supp b'lemma:phosphate'
0.129075 OD b'+1:postag:DT'
0.127585 O b'+1:postag:CC'
0.127099 Air b'-1:lemma:cm20'
0.127099 Air b'-2:lemma:\xc2\xb5l'
0.125864 Gtype b'lemma:-rrb-'
0.125038 Agit b'-1:lemma:-lrb-'
0.124798 O b'-2:lemma:sample'
0.124075 O b'+2:lemma:to'
0.124075 O b'+2:postag:TO'
0.121284 Air b'+1:postag:NN'
0.119375 O b'+1:lemma:genbank'
0.119031 O b'lemma:genbank'
0.116785 Temp b'+2:lemma:and'
0.116389 Supp b'lemma:150'
0.116389 Supp b'+1:lemma:mg/ml'
0.116389 Supp b'-2:lemma:concentration'
0.115961 OD b'+2:postag:NNS'
0.114908 Supp b'+1:postag:CD'
0.112924 Med b'+1:postag:VBN'
0.111303 Gtype b'+2:lemma:fnr'
0.109721 Gtype b'-1:lemma::'
0.109464 O b'-1:lemma:5'
0.105576 O b'-2:lemma:.'
0.105576 O b'-2:postag:.'
0.104876 Med b'+2:lemma:2'
0.104554 Temp b'+2:lemma:in'
0.104427 Med b'-1:lemma::'
0.104415 Supp b'-2:lemma:\xc2\xb5m'
0.104415 Supp b'+2:lemma:\xc2\xb5l'
0.102944 O b'lemma:lrp'
0.102289 Temp b'-1:postag:NN'
0.100943 Supp b'lemma:leucine'
0.098730 Supp b'+2:lemma:fecl2'
0.098713 Supp b'+1:lemma:hour'
0.093067 Supp b'+2:lemma:treat'
0.091701 Air b'+2:lemma:mid-log'
0.087320 O b'-1:lemma:m63'
0.087208 O b'-1:lemma:Iron'
0.086729 O b'lemma:antibody'
0.086375 O b'-2:lemma:mg/ml'
0.086079 OD b'+1:postag:CD'
0.084997 O b'-1:lemma:grow'
0.084141 Gtype b'-1:lemma:the'
0.083509 O b'-2:lemma:use'
0.081255 Supp b'+2:lemma:of'
0.078646 OD b'+2:lemma:,'
0.078646 OD b'+2:postag:,'
0.078309 Med b'+1:lemma:2'
0.076573 Temp b'+2:postag:CC'
0.075841 Supp b'-1:lemma::'
0.075624 Supp b'-2:lemma:rpob'
0.074444 Supp b'-2:lemma:cell'
0.072148 Technique b'-1:postag:CD'
0.071469 O b'+2:lemma:buffer'
0.071254 O b'+2:postag::'
0.067516 Gtype b'-1:lemma:harbor'
0.063687 Temp b'+1:postag:NN'
0.061051 O b'+2:lemma:%'
0.060136 Med b'lemma:g/l'
0.059411 Supp b'-1:lemma:0.1'
0.057830 O b'lemma:from'
0.057364 O b'-2:postag:VBN'
0.057074 Technique b'postag:NN'
0.056154 O b'-1:lemma:to'
0.056154 O b'-1:postag:TO'
0.052890 O b'-1:postag:VBN'
0.049713 Supp b'lemma:in'
0.049456 Technique b'-1:postag:NN'
0.047361 O b'+1:lemma:with'
0.045297 O b'+1:lemma:anerobically'
0.045297 O b'-2:lemma:600nm'
0.045251 Anti b'-1:lemma:polymerase'
0.044959 Gtype b'-2:lemma:factor'
0.043657 Gtype b'+2:lemma:1'
0.043064 Anti b'-2:lemma:rna'
0.041445 Supp b'+1:lemma:10'
0.041324 O b'lemma:supplement'
0.039777 Med b'+2:postag:CD'
0.038077 O b'-2:lemma:culture'
0.037067 Supp b'-1:lemma:ph'
0.035875 O b'lemma:mg1655'
0.034633 O b'-1:lemma:%'
0.033730 O b'lemma:min'
0.033587 Gversion b'+2:lemma:use'
0.030240 Anti b'-2:postag::'
0.029878 Temp b'-1:postag:VB'
0.028534 O b'+1:postag:SYM'
0.027290 Temp b'-2:postag:VB'
0.024899 Med b'-2:lemma:-rrb-'
0.023914 Temp b'postag:-RRB-'
0.023344 Med b'-1:lemma:m9'
0.020730 O b'+2:postag:IN'
0.020602 Gtype b'+1:postag:DT'
0.020564 O b'-1:lemma:2.5'
0.018701 O b'+2:lemma:TEX'
0.017934 O b'+2:postag:CC'
0.017129 Gtype b'+1:lemma:nacl'
0.016766 O b'+1:lemma:_'
0.016307 Gversion b'+2:postag:NN'
0.015054 OD b'-2:lemma:of'
0.014390 O b'lemma:and'
0.014238 Temp b'lemma:30'
0.013364 O b'+2:lemma:k-12'
0.011649 Gtype b'-1:lemma:Fur'
0.011390 Gtype b'-2:lemma:Fur'
0.010873 Supp b'lemma:final'
0.009983 O b'+1:lemma:5'
0.009951 Supp b'-1:postag:NN'
0.009567 O b'+2:lemma:min'
0.009458 O b'-1:lemma:w0002'
0.009292 OD b'-1:lemma:-lrb-'
0.009129 Air b'-2:lemma:nh4cl'
0.009113 Air b'-2:postag:RB'
0.007671 O b'lemma:%'
0.007090 Temp b'lemma:-lrb-'
0.005457 O b'postag:RB'
0.005308 O b'+1:lemma:be'
0.005243 O b'-2:lemma:treat'
0.005228 O b'-1:lemma:or'
0.004962 Temp b'postag:-LRB-'
0.004590 Med b'-2:postag:NN'
0.004359 Med b'-1:postag::'
0.004074 O b'-1:lemma:at'
0.003961 O b'lemma:um'
0.003961 O b'+2:lemma:paraquat'
0.003010 O b'-2:lemma:m9'
0.002991 Supp b'-1:postag::'
0.002918 O b'-1:lemma:genotype'
0.002812 O b'-1:lemma:phase'
0.002796 Air b'+1:postag:-RRB-'
0.002545 Supp b'-2:postag:VBN'
0.002296 O b'lemma:stop'
0.002035 Phase b'+1:lemma:culture'
0.001975 Gtype b'lemma:factor'
0.001975 Gtype b'-1:lemma:transcription'
0.001975 Gtype b'+1:lemma:Fur'
0.001697 Anti b'-1:postag::'
0.001536 O b'+1:lemma:minute'
0.001522 O b'+1:lemma:um'
0.001501 Agit b'-2:postag:-LRB-'
0.001491 O b'-2:lemma:2.5'
0.001352 Agit b'-2:lemma:-lrb-'
0.001088 Med b'-2:postag:-RRB-'
0.000948 O b'+2:lemma:dpd'
0.000946 O b'lemma:c'
0.000888 O b'-2:lemma:n2'
0.000862 Supp b'-2:lemma:without'
0.000854 O b'lemma:2.0'
0.000464 O b'lemma:paraquat'
0.000464 O b'-2:lemma:um'
0.000423 O b'-2:lemma:final'
0.000334 O b'-2:lemma:%'
0.000328 Temp b'+2:postag:NN'
0.000275 Med b'-2:lemma:2'
0.000247 Med b'+2:lemma:without'
0.000230 Phase b'+2:postag:NN'
0.000219 Supp b'-2:lemma:stir'
0.000191 O b'lemma:induction'
0.000171 Supp b'-2:postag::'
0.000114 O b'-2:lemma:at'
0.000104 O b'+2:lemma:70'
0.000096 Gtype b'+1:lemma:ryhb'
0.000080 Phase b'+2:lemma:follow'
0.000075 Supp b'+2:lemma:,'
0.000075 Supp b'+2:postag:,'
0.000068 Supp b'+1:lemma:%'
0.000067 Phase b'+1:postag:NNS'
0.000060 Phase b'-1:lemma:the'
0.000051 O b'-2:lemma:or'
0.000044 Phase b'+2:lemma:od600'
0.000039 Supp b'+1:lemma:iptg'
0.000035 Phase b'-2:lemma:grow'
0.000032 Phase b'-1:postag:DT'
0.000029 Phase b'+2:postag:VBN'
0.000025 O b'+2:lemma:rpm'
0.000024 Med b'-1:lemma:2'
0.000022 Med b'-1:lemma:-rrb-'
0.000021 Supp b'-2:lemma:with'
0.000021 Med b'-1:postag:-RRB-'
0.000021 Supp b'-1:lemma:iptg'
0.000018 Supp b'+1:lemma:7.6'
0.000018 Supp b'-2:lemma:1m'
0.000018 Supp b'+2:lemma:;'
0.000017 Supp b'+1:postag:RB'
0.000013 Supp b'+1:lemma:300'
0.000010 Supp b'-2:lemma:ph'
0.000007 Gtype b'+2:lemma:rna'
0.000006 Phase b'-1:lemma:to'
0.000006 Phase b'-1:postag:TO'
0.000005 Supp b'lemma:sodium'
0.000004 Temp b'-2:lemma:grow'
0.000004 O b'-2:lemma:5'
0.000004 Gtype b'-2:lemma:small'
0.000004 Supp b'lemma:Trp'
0.000003 Supp b'+1:lemma:m'
0.000002 O b'lemma:5'
-0.000000 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.000000 O b'+1:lemma:300'
-0.000001 Air b'-1:lemma:aerobically'
-0.000007 Air b'+2:lemma:-rrb-'
-0.000007 Air b'+1:lemma:-rrb-'
-0.000008 O b'-1:lemma:iptg'
-0.000009 Air b'+2:postag:-RRB-'
-0.000009 O b'+1:lemma:until'
-0.000009 O b'+1:lemma:1/100'
-0.000009 O b'-2:lemma:sodium'
-0.000009 O b'+2:lemma:vol'
-0.000011 Med b'postag:JJ'
-0.000015 O b'+2:lemma:ph'
-0.000015 O b'+2:lemma:follow'
-0.000040 Air b'+2:lemma:70'
-0.000044 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.000051 Air b'lemma:,'
-0.000051 Air b'postag:,'
-0.000070 Air b'-2:postag:-LRB-'
-0.000080 Air b'-2:lemma:-lrb-'
-0.000123 Air b'-1:postag:VBN'
-0.000130 O b'-2:lemma:g/l'
-0.000145 O b'-2:lemma:cell'
-0.000150 O b'-1:lemma:in'
-0.000164 O b'-1:lemma:0.2'
-0.000177 OD b'+2:postag:NN'
-0.000226 Supp b'lemma:250'
-0.000231 OD b'postag:NN'
-0.000264 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.000321 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.000398 Air b'+2:lemma:,'
-0.000398 Air b'+2:postag:,'
-0.000515 Med b'-2:lemma:m9'
-0.000519 O b'lemma:m9'
-0.000544 Air b'+1:postag:CD'
-0.000599 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.000697 O b'lemma:m63'
-0.000941 Supp b'lemma:um'
-0.000941 Supp b'+2:lemma:paraquat'
-0.001067 O b'-1:postag:VBG'
-0.001267 O b'-1:lemma:g/l'
-0.001332 Temp b'+2:postag:IN'
-0.001555 O b'lemma:lb'
-0.001578 O b'+2:lemma:media'
-0.001619 O b'+1:lemma:.'
-0.001619 O b'+1:postag:.'
-0.001880 O b'lemma:sample'
-0.002743 Air b'+2:postag:CC'
-0.002818 Supp b'-2:lemma:,'
-0.002818 Supp b'-2:postag:,'
-0.003041 O b'-1:lemma:37'
-0.003091 Supp b'-1:lemma:250'
-0.003214 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.003299 O b'+1:lemma:n2'
-0.003592 O b'+2:lemma:at'
-0.003727 Supp b'lemma:2'
-0.003756 O b'-1:postag:DT'
-0.004123 Air b'postag:CD'
-0.004503 O b'+1:lemma:hour'
-0.004582 O b'+2:lemma:n2'
-0.004788 Supp b'+2:postag:VBN'
-0.004796 Air b'lemma:and'
-0.004993 Temp b'+1:postag:IN'
-0.007202 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.007277 Supp b'-2:lemma:0.2'
-0.009255 Air b'-1:lemma:and'
-0.010782 Supp b'+1:lemma:of'
-0.012266 O b'+1:lemma:a'
-0.014097 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.015378 O b'lemma:mm'
-0.017969 Technique b'-2:postag:NN'
-0.019168 Supp b'-1:lemma:%'
-0.020056 Supp b'postag:IN'
-0.021202 Temp b'postag:CD'
-0.021397 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.022815 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.023286 O b'-2:lemma:to'
-0.023286 O b'-2:postag:TO'
-0.025102 Supp b'+2:postag:NNS'
-0.029183 O b'+1:lemma:ph'
-0.029609 Supp b'-2:postag:IN'
-0.036130 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.036239 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.037544 Med b'+1:postag:IN'
-0.037914 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.038896 O b'-2:lemma:minimal'
-0.040275 Air b'-1:postag:RB'
-0.040721 Supp b'postag:CD'
-0.041600 O b'+2:postag:RB'
-0.044186 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.044224 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.051842 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.053769 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.054733 O b'+1:lemma:media'
-0.054789 Phase b'+2:postag:CD'
-0.055387 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.056875 O b'+2:lemma:10'
-0.057760 Phase b'+1:postag:NN'
-0.058374 Phase b'-2:postag:NN'
-0.060884 Air b'-1:lemma:,'
-0.060884 Air b'-1:postag:,'
-0.062035 O b'lemma:;'
-0.062035 O b'-1:lemma:7.6'
-0.063129 O b'-1:lemma:.'
-0.063129 O b'-1:postag:.'
-0.063166 Supp b'-2:postag:NN'
-0.069085 Supp b'+2:lemma:and'
-0.076443 Temp b'-2:postag:CD'
-0.091574 O b'-1:lemma:mm'
-0.099056 O b'-1:lemma:ml'
-0.099854 Air b'-1:postag:CC'
-0.102537 O b'+1:lemma:of'
-0.112218 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.112960 O b'-2:lemma:0.1'
-0.114859 O b'-2:lemma:glucose'
-0.114904 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.115102 Med b'postag:CD'
-0.118741 Air b'-2:postag:CC'
-0.119489 O b'-1:lemma:~'
-0.126085 Air b'+2:postag:IN'
-0.130085 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.130362 Supp b'+2:postag:NN'
-0.131788 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.132640 O b'lemma:dissolve'
-0.132640 O b'+2:lemma:methanol'
-0.136830 O b'-1:lemma:until'
-0.137816 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.138631 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.139901 Med b'-1:postag:IN'
-0.139970 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.140509 O b'+1:lemma:supplement'
-0.147678 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.148397 O b'-1:lemma:contain'
-0.150570 Technique b'-1:postag::'
-0.151339 Temp b'+2:lemma:with'
-0.153060 O b'lemma:nacl'
-0.160791 O b'-1:postag:IN'
-0.169388 O b'-2:lemma:of'
-0.170086 O b'+1:lemma:~'
-0.171491 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.175251 O b'lemma:nitrate'
-0.179779 O b'+1:lemma:minimal'
-0.180370 O b'+2:lemma:~'
-0.180497 O b'lemma:medium'
-0.186798 O b'+1:postag:CD'
-0.190395 O b'lemma:0.2'
-0.195527 O b'-2:lemma:20'
-0.195829 O b'lemma:ph'
-0.198458 O b'lemma:fecl2'
-0.202949 O b'-1:lemma:of'
-0.203051 Med b'-1:postag:NN'
-0.204363 O b'+1:lemma:mm'
-0.211788 O b'+2:lemma:genome'
-0.212922 O b'+2:lemma:tag'
-0.222072 O b'-1:lemma:1m'
-0.222072 O b'+2:lemma:7.6'
-0.224721 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.224721 O b'+1:lemma:methanol'
-0.234666 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.246701 O b'lemma:0.1'
-0.250933 O b'lemma:nh4cl'
-0.256008 O b'-1:lemma:fresh'
-0.260120 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.264252 O b'-2:lemma:genome'
-0.265155 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.266499 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.268806 O b'-2:postag::'
-0.278036 Gtype b'postag:VBG'
-0.281759 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.286028 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.293452 O b'-2:lemma:until'
-0.296489 O b'-2:lemma:fresh'
-0.299840 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.302980 O b'+1:lemma:g/l'
-0.303227 O b'-1:lemma:the'
-0.311308 Temp b'+1:lemma:with'
-0.322685 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.329013 O b'+1:lemma:1m'
-0.329013 O b'-2:lemma:vol'
-0.350773 pH b'postag:NN'
-0.363049 O b'+2:lemma:fnr'
-0.365268 O b'+1:lemma:+'
-0.381142 O b'-1:lemma:rpob'
-0.391467 Supp b'+1:lemma:,'
-0.391467 Supp b'+1:postag:,'
-0.401803 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.402643 O b'+2:lemma:m9'
-0.405511 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.405806 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.406778 O b'lemma:37'
-0.409336 O b'-2:postag:VBG'
-0.415413 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.420265 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.424195 O b'+2:lemma:.'
-0.424195 O b'+2:postag:.'
-0.425786 O b'-2:lemma:IP'
-0.427368 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.429312 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.442127 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.462011 O b'+1:lemma:at'
-0.464454 O b'-2:postag:SYM'
-0.466538 O b'lemma:aerobic'
-0.481098 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.505001 O b'-2:lemma:rpob'
-0.510192 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.518187 O b'+1:postag:IN'
-0.522781 O b'+2:lemma:add'
-0.536229 O b'-2:lemma:supplement'
-0.536940 O b'-2:lemma::'
-0.549859 O b'-1:lemma:minimal'
-0.550829 O b'-2:lemma:media'
-0.564666 O b'+2:lemma:+'
-0.569791 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.572748 O b'-2:lemma:pahse'
-0.578159 Med b'+1:postag:NN'
-0.578530 O b'lemma:minimal'
-0.582875 O b'+1:lemma:%'
-0.605892 O b'lemma:wt'
-0.616855 Temp b'postag:NN'
-0.617247 O b'-1:lemma:IP'
-0.636070 Supp b'+2:postag:CC'
-0.651008 O b'-1:lemma:vol'
-0.651008 O b'-2:lemma:1/100'
-0.651008 O b'+2:lemma:1m'
-0.660096 Med b'+2:postag:VBN'
-0.680201 Anti b'postag:NNP'
-0.699386 O b'-2:lemma:dpd'
-0.705289 O b'+1:postag:DT'
-0.725551 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.746607 O b'-2:lemma:iptg'
-0.749639 O b'lemma:mid-log'
-0.750094 O b'lemma:rifampicin'
-0.775221 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.782645 Gtype b'-2:postag:CD'
-0.820273 O b'-1:postag::'
-0.893493 Air b'postag:NN'
-0.904051 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.952668 O b'-2:lemma:the'
-0.957081 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.983365 O b'-1:lemma:30'
-0.988705 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.994157 O b'+2:lemma:mid-log'
-1.014296 O b'-1:lemma:1'
-1.050327 O b'-1:lemma:co2'
-1.100095 OD b'+1:postag:NN'
-1.128420 O b'+2:lemma:b'
-1.144463 Supp b'postag:JJ'
-1.227846 O b'lemma:media'
-1.263490 O b'-2:lemma:0.3'
-1.268195 Phase b'postag:JJ'
-1.355173 Supp b'+2:postag:CD'
-1.357229 O b'+1:lemma:in'
-1.376719 O b'lemma:30'
-1.381125 Supp b'+2:lemma:1'
-1.452688 O b'lemma:aerobically'
-1.460131 O b'-1:lemma:ph'
-1.476266 OD b'+2:lemma:aerobically'
-1.485622 Supp b'+2:lemma:2'
-1.490132 O b'+2:lemma:rifampicin'
-1.582726 O b'-2:lemma:rifampicin'
-1.619994 O b'-1:lemma:sample'
-1.973905 O b'lemma:of'
-2.008257 O b'+2:lemma:iptg'
-2.041188 O b'lemma:0.3'
-2.130445 O b'-1:lemma:2'
-2.500565 O b'+1:lemma:1'
-2.613429 O b'+1:lemma:2'
-3.943876 O b'-1:lemma::'
-4.385335 O b'-1:lemma:_'