report_Run2_v11.txt
44.6 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
1217
1218
1219
1220
1221
1222
1223
1224
1225
1226
1227
1228
1229
1230
1231
1232
1233
1234
1235
1236
1237
1238
1239
1240
1241
1242
1243
1244
1245
1246
1247
1248
1249
1250
1251
1252
1253
1254
1255
1256
1257
1258
1259
1260
1261
1262
1263
1264
1265
1266
1267
1268
1269
1270
1271
1272
1273
1274
1275
1276
1277
1278
1279
1280
1281
1282
1283
1284
1285
1286
1287
1288
1289
1290
1291
1292
1293
1294
1295
1296
1297
1298
1299
1300
1301
1302
1303
1304
1305
1306
1307
1308
1309
1310
1311
1312
1313
1314
1315
1316
1317
1318
1319
1320
1321
1322
1323
1324
1325
1326
1327
1328
1329
1330
1331
1332
1333
1334
1335
1336
1337
1338
1339
1340
1341
1342
1343
1344
1345
1346
1347
1348
1349
1350
1351
1352
1353
1354
1355
1356
1357
1358
1359
1360
1361
1362
1363
1364
1365
1366
1367
1368
1369
1370
1371
1372
1373
1374
1375
1376
1377
1378
1379
1380
1381
1382
1383
1384
1385
1386
1387
1388
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.016776004340952593, 'c2': 0.06399138580052764}
best CV score:0.8265144607685903
model size: 0.11M
Flat F1: 0.811149891507703
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 0.857 0.800 0.828 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.595 0.568 0.581 88
Anti 0.750 0.923 0.828 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.923 0.769 0.839 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.870 0.838 0.854 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.852 0.779 0.811 484
Top likely transitions:
Med -> Med 4.803921
Temp -> Temp 4.630645
Supp -> Supp 4.578238
OD -> OD 4.501257
Air -> Air 4.415022
Anti -> Anti 4.342036
Gtype -> Gtype 4.244552
Phase -> Phase 3.839115
Gversion -> Gversion 3.784468
O -> O 3.291605
pH -> pH 2.985296
Technique -> Technique 2.503901
Agit -> Agit 2.356459
Substrain -> Gtype 1.553281
Technique -> Air 1.184572
Air -> O 0.972879
Gtype -> Supp 0.927763
O -> Supp 0.918019
O -> Technique 0.608453
O -> Gtype 0.601629
Gtype -> Air 0.546490
O -> Strain 0.229277
Gtype -> pH 0.223728
O -> Phase 0.096555
Supp -> O 0.089807
Med -> O 0.083571
Temp -> O 0.079842
Strain -> O 0.078307
Phase -> Air 0.018157
O -> pH 0.017667
O -> Vess 0.000002
Temp -> Gversion -0.000500
Gtype -> Strain -0.002642
Med -> Anti -0.004907
Substrain -> Med -0.006759
O -> Temp -0.007594
Temp -> pH -0.008953
Med -> Gversion -0.011336
Gversion -> Anti -0.012971
Supp -> Strain -0.014771
OD -> Gversion -0.021261
Air -> Substrain -0.021624
Gversion -> Agit -0.024445
Strain -> Air -0.025560
Agit -> Gtype -0.028820
OD -> Agit -0.035397
Strain -> OD -0.036253
Med -> Agit -0.039622
Air -> Anti -0.039644
Temp -> Anti -0.046898
Substrain -> Air -0.048791
Substrain -> pH -0.058817
Anti -> Gversion -0.060300
Temp -> Technique -0.062143
pH -> Gversion -0.063598
Phase -> Gversion -0.065138
pH -> Gtype -0.066626
Gversion -> pH -0.066843
pH -> Med -0.069124
Gtype -> Vess -0.074024
Med -> OD -0.086402
Strain -> Supp -0.086873
Phase -> pH -0.089213
Substrain -> OD -0.091883
Agit -> Technique -0.093938
Gversion -> Med -0.095649
Technique -> Phase -0.105174
Air -> Gversion -0.107145
Agit -> O -0.108393
pH -> Agit -0.116926
Med -> pH -0.116960
Supp -> Substrain -0.121256
Technique -> Substrain -0.125488
Gversion -> Temp -0.126643
pH -> O -0.133016
Substrain -> Supp -0.137286
OD -> O -0.143513
pH -> Temp -0.146522
Supp -> Vess -0.149497
O -> Agit -0.151853
Agit -> Supp -0.156130
Strain -> Gtype -0.166069
Gtype -> Agit -0.170365
Anti -> Phase -0.172165
OD -> pH -0.175596
OD -> Gtype -0.180003
Med -> Gtype -0.182921
Technique -> Anti -0.184311
Supp -> Agit -0.184533
Med -> Temp -0.186345
Technique -> Agit -0.188541
pH -> Air -0.189897
Air -> pH -0.189969
Temp -> OD -0.193791
Air -> Gtype -0.205377
Technique -> Temp -0.212412
pH -> OD -0.223568
Temp -> Supp -0.224426
Anti -> OD -0.224798
Temp -> Gtype -0.228406
Gversion -> OD -0.229780
Anti -> Air -0.230792
OD -> Med -0.239115
Phase -> Temp -0.239897
Agit -> Air -0.253469
Med -> Air -0.270288
Phase -> Anti -0.272869
Gversion -> Technique -0.278371
Anti -> Technique -0.291191
Phase -> Supp -0.304525
Gtype -> Substrain -0.313505
Air -> Technique -0.313939
pH -> Supp -0.313997
Gversion -> Gtype -0.320655
OD -> Temp -0.325382
O -> Anti -0.328229
Phase -> Gtype -0.338204
Anti -> pH -0.338328
Supp -> Phase -0.341623
Gversion -> Air -0.361875
Supp -> Air -0.367471
Temp -> Air -0.369395
Supp -> Anti -0.378847
Air -> OD -0.394842
Gversion -> Supp -0.399748
Supp -> Gversion -0.407235
Supp -> pH -0.407576
Anti -> O -0.428443
O -> Gversion -0.429853
Supp -> Technique -0.436401
Med -> Technique -0.442403
Air -> Med -0.443738
O -> OD -0.450411
Supp -> Temp -0.454578
Technique -> Med -0.459671
OD -> Supp -0.463121
OD -> Technique -0.469370
Anti -> Med -0.469996
Supp -> OD -0.479802
O -> Substrain -0.481447
Phase -> O -0.508550
Air -> Temp -0.509150
Gtype -> OD -0.511791
Anti -> Gtype -0.523690
Technique -> Gversion -0.534708
Phase -> OD -0.552888
Gtype -> Phase -0.560612
Phase -> Med -0.563880
Supp -> Gtype -0.568623
Air -> Supp -0.571297
Gtype -> Gversion -0.572835
Anti -> Supp -0.575192
Air -> Phase -0.642738
Gversion -> O -0.644082
Technique -> Supp -0.647509
Gtype -> Technique -0.651363
Air -> Agit -0.694876
O -> Med -0.810014
Gtype -> O -0.882045
Temp -> Med -0.882395
OD -> Air -0.887749
Gtype -> Med -0.911063
Gtype -> Anti -0.968466
Gtype -> Temp -0.973629
Technique -> Gtype -0.976101
Phase -> Technique -1.023242
Anti -> Temp -1.035582
Technique -> OD -1.093866
O -> Air -1.172302
Technique -> O -1.264732
Supp -> Med -1.286183
Substrain -> O -1.397687
Med -> Supp -1.663953
Technique -> pH -1.958616
Top unlikely transitions:
Med -> Med 4.803921
Temp -> Temp 4.630645
Supp -> Supp 4.578238
OD -> OD 4.501257
Air -> Air 4.415022
Anti -> Anti 4.342036
Gtype -> Gtype 4.244552
Phase -> Phase 3.839115
Gversion -> Gversion 3.784468
O -> O 3.291605
pH -> pH 2.985296
Technique -> Technique 2.503901
Agit -> Agit 2.356459
Substrain -> Gtype 1.553281
Technique -> Air 1.184572
Air -> O 0.972879
Gtype -> Supp 0.927763
O -> Supp 0.918019
O -> Technique 0.608453
O -> Gtype 0.601629
Gtype -> Air 0.546490
O -> Strain 0.229277
Gtype -> pH 0.223728
O -> Phase 0.096555
Supp -> O 0.089807
Med -> O 0.083571
Temp -> O 0.079842
Strain -> O 0.078307
Phase -> Air 0.018157
O -> pH 0.017667
O -> Vess 0.000002
Temp -> Gversion -0.000500
Gtype -> Strain -0.002642
Med -> Anti -0.004907
Substrain -> Med -0.006759
O -> Temp -0.007594
Temp -> pH -0.008953
Med -> Gversion -0.011336
Gversion -> Anti -0.012971
Supp -> Strain -0.014771
OD -> Gversion -0.021261
Air -> Substrain -0.021624
Gversion -> Agit -0.024445
Strain -> Air -0.025560
Agit -> Gtype -0.028820
OD -> Agit -0.035397
Strain -> OD -0.036253
Med -> Agit -0.039622
Air -> Anti -0.039644
Temp -> Anti -0.046898
Substrain -> Air -0.048791
Substrain -> pH -0.058817
Anti -> Gversion -0.060300
Temp -> Technique -0.062143
pH -> Gversion -0.063598
Phase -> Gversion -0.065138
pH -> Gtype -0.066626
Gversion -> pH -0.066843
pH -> Med -0.069124
Gtype -> Vess -0.074024
Med -> OD -0.086402
Strain -> Supp -0.086873
Phase -> pH -0.089213
Substrain -> OD -0.091883
Agit -> Technique -0.093938
Gversion -> Med -0.095649
Technique -> Phase -0.105174
Air -> Gversion -0.107145
Agit -> O -0.108393
pH -> Agit -0.116926
Med -> pH -0.116960
Supp -> Substrain -0.121256
Technique -> Substrain -0.125488
Gversion -> Temp -0.126643
pH -> O -0.133016
Substrain -> Supp -0.137286
OD -> O -0.143513
pH -> Temp -0.146522
Supp -> Vess -0.149497
O -> Agit -0.151853
Agit -> Supp -0.156130
Strain -> Gtype -0.166069
Gtype -> Agit -0.170365
Anti -> Phase -0.172165
OD -> pH -0.175596
OD -> Gtype -0.180003
Med -> Gtype -0.182921
Technique -> Anti -0.184311
Supp -> Agit -0.184533
Med -> Temp -0.186345
Technique -> Agit -0.188541
pH -> Air -0.189897
Air -> pH -0.189969
Temp -> OD -0.193791
Air -> Gtype -0.205377
Technique -> Temp -0.212412
pH -> OD -0.223568
Temp -> Supp -0.224426
Anti -> OD -0.224798
Temp -> Gtype -0.228406
Gversion -> OD -0.229780
Anti -> Air -0.230792
OD -> Med -0.239115
Phase -> Temp -0.239897
Agit -> Air -0.253469
Med -> Air -0.270288
Phase -> Anti -0.272869
Gversion -> Technique -0.278371
Anti -> Technique -0.291191
Phase -> Supp -0.304525
Gtype -> Substrain -0.313505
Air -> Technique -0.313939
pH -> Supp -0.313997
Gversion -> Gtype -0.320655
OD -> Temp -0.325382
O -> Anti -0.328229
Phase -> Gtype -0.338204
Anti -> pH -0.338328
Supp -> Phase -0.341623
Gversion -> Air -0.361875
Supp -> Air -0.367471
Temp -> Air -0.369395
Supp -> Anti -0.378847
Air -> OD -0.394842
Gversion -> Supp -0.399748
Supp -> Gversion -0.407235
Supp -> pH -0.407576
Anti -> O -0.428443
O -> Gversion -0.429853
Supp -> Technique -0.436401
Med -> Technique -0.442403
Air -> Med -0.443738
O -> OD -0.450411
Supp -> Temp -0.454578
Technique -> Med -0.459671
OD -> Supp -0.463121
OD -> Technique -0.469370
Anti -> Med -0.469996
Supp -> OD -0.479802
O -> Substrain -0.481447
Phase -> O -0.508550
Air -> Temp -0.509150
Gtype -> OD -0.511791
Anti -> Gtype -0.523690
Technique -> Gversion -0.534708
Phase -> OD -0.552888
Gtype -> Phase -0.560612
Phase -> Med -0.563880
Supp -> Gtype -0.568623
Air -> Supp -0.571297
Gtype -> Gversion -0.572835
Anti -> Supp -0.575192
Air -> Phase -0.642738
Gversion -> O -0.644082
Technique -> Supp -0.647509
Gtype -> Technique -0.651363
Air -> Agit -0.694876
O -> Med -0.810014
Gtype -> O -0.882045
Temp -> Med -0.882395
OD -> Air -0.887749
Gtype -> Med -0.911063
Gtype -> Anti -0.968466
Gtype -> Temp -0.973629
Technique -> Gtype -0.976101
Phase -> Technique -1.023242
Anti -> Temp -1.035582
Technique -> OD -1.093866
O -> Air -1.172302
Technique -> O -1.264732
Supp -> Med -1.286183
Substrain -> O -1.397687
Med -> Supp -1.663953
Technique -> pH -1.958616
Top positive:
7.383724 O b'lemma:_'
5.053517 Gtype b'lemma:wt'
4.694169 Supp b'lemma:Iron'
4.683994 Air b'lemma:anaerobic'
4.524263 Technique b'lemma:chipseq'
4.215614 Supp b'lemma:pq'
3.976653 O b'postag::'
3.840990 Supp b'lemma:glucose'
3.698102 O b'lemma:1'
3.696357 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
3.645607 O b'lemma:Cra'
3.616487 Phase b'lemma:mid-log'
3.524061 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
3.516060 Supp b'lemma:2h'
3.516060 Supp b'-1:lemma:additional'
3.455741 Gtype b'lemma:type'
3.443465 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.427007 O b'lemma:-'
3.424279 O b'lemma:2'
3.408113 Gversion b'lemma:asm584v2'
3.372476 Supp b'lemma:nh4cl'
3.347068 Gtype b'lemma:arca8myc'
3.337138 Gtype b'hGreek'
3.322425 Air b'lemma:aerobic'
3.246518 O b'lemma:b'
3.189109 Air b'lemma:aerobically'
3.133480 Strain b'lemma:k-12'
3.125552 Phase b'lemma:stationary'
3.125552 Phase b'lemma:exponential'
3.119452 O b'-1:lemma:tag'
3.060543 O b'lemma:chip-arca'
3.049849 O b'lemma:rpob'
3.034460 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.023912 Supp b'lemma:no3'
3.005935 Gtype b'+1:lemma:type'
3.000649 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.999956 Gtype b'lemma:WT'
2.989085 O b'lemma:.'
2.989085 O b'postag:.'
2.959612 O b'lemma:3'
2.937440 O b'lemma:rep2'
2.937440 O b'lemma:rep1'
2.909579 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.894137 O b'postag:IN'
2.879022 Med b'lemma:MOPS'
2.861251 O b'lemma:genotype/variation'
2.836868 Air b'lemma:anaeroibc'
2.820182 O b'lemma:\xcf\x8332'
2.798728 Gtype b'lemma:fnr8myc'
2.792561 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.791908 Air b'postag:RB'
2.791635 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.790046 Supp b'lemma:acetate'
2.789923 Air b'-1:lemma:-'
2.762188 O b'lemma:CEL'
2.745099 O b'lemma:chip-fnr'
2.733291 O b'postag:VBG'
2.710905 Supp b'lemma:rifampicin'
2.684084 Substrain b'lemma:mg1655'
2.642460 Supp b'lemma:arginine'
2.632549 Supp b'+1:lemma:1'
2.620201 Supp b'+1:lemma:Deficient'
2.574600 O b'-1:lemma:glucose'
2.573233 Med b'+1:lemma:0.4'
2.570692 Supp b'lemma:nacl'
2.567794 Vess b'lemma:flask'
2.567794 Vess b'-1:lemma:warm'
2.565048 pH b'lemma:ph5'
2.565048 pH b'+1:lemma:.5'
2.542193 Technique b'-1:lemma:_'
2.531253 Med b'lemma:LB'
2.516593 Gtype b'lemma:pk4854'
2.484703 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.454240 Anti b'lemma:seqa'
2.443691 Gtype b'lemma:dfnr'
2.436482 Supp b'lemma:Adenine'
2.431859 O b'+1:lemma:pq'
2.403683 Supp b'-1:lemma:with'
2.401357 O b'+1:lemma:wt'
2.400876 Technique b'lemma:rnaseq'
2.395282 Supp b'lemma:Leu'
2.387917 O b'+1:lemma:od600'
2.385691 Med b'lemma:medium'
2.377344 Gtype b'lemma:delta-fnr'
2.376228 Supp b'lemma:iptg'
2.375303 Supp b'+1:lemma:2'
2.371740 O b'lemma:a'
2.369186 Supp b'lemma:Fe'
2.353577 O b'+1:lemma:coli'
2.343545 Substrain b'lemma:mg1655star'
2.340453 Anti b'lemma:none'
2.333951 O b'+1:postag:RB'
2.329720 Supp b'lemma:dpd'
2.329368 O b'-1:lemma:lb'
2.324804 Air b'-1:lemma:co2'
2.282843 Med b'-1:lemma:ml'
2.261471 Med b'lemma:lb'
2.253233 Temp b'-1:lemma:37'
2.252560 O b'lemma:with'
2.244762 O b'-1:lemma:0.3'
2.227206 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.227206 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.216844 Gtype b'lemma:deltaseqa'
2.216844 Gtype b'-1:lemma:old'
2.199974 Agit b'+1:lemma:rpm'
2.173359 Temp b'lemma:43'
2.154127 pH b'+1:postag:CD'
2.140285 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.138733 Supp b'+1:lemma:mm'
2.124280 Anti b'lemma:\xcf\x8332'
2.121131 Agit b'lemma:rpm'
2.111052 O b'+1:lemma:k-12'
2.109890 Temp b'lemma:37'
2.108516 Strain b'+1:lemma:substr'
2.095161 Phase b'lemma:phase'
2.085008 Supp b'-1:lemma:+'
2.083708 Technique b'hUpper'
2.073284 Supp b'+1:lemma:iptg'
2.070056 O b'+1:lemma:43'
2.039590 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.037704 Agit b'-1:lemma:250'
2.030702 O b'-1:postag:NNS'
2.027675 Supp b'+1:lemma:deficient'
2.023514 O b'postag:VBN'
2.008069 Temp b'-1:lemma:43'
1.981010 Supp b'-1:lemma:vol'
1.966264 Gtype b'lemma:crp'
1.954186 Med b'+1:lemma:2.0'
1.949439 O b'+1:lemma:ph5'
1.949428 Air b'lemma:Anaerobic'
1.944939 Med b'lemma:media'
1.937417 Gtype b'lemma:wildtype'
1.934607 Vess b'-1:postag:VBN'
1.929731 Agit b'lemma:250'
1.927765 Gversion b'lemma:000913'
1.902740 Gtype b'-1:lemma:_'
1.899465 Gtype b'+1:postag::'
1.882852 Gtype b'+1:lemma:_'
1.877112 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.871519 Gversion b'lemma:u00096'
1.871519 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.860945 OD b'+1:postag:IN'
1.857700 Gtype b'lemma:delta-arca'
1.857302 Gversion b'lemma:.2'
1.857302 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.854213 Med b'lemma:glucose'
1.852556 Vess b'+1:lemma:at'
1.846042 O b'lemma:chip'
1.845130 Phase b'-1:lemma:mid-log'
1.840608 O b'lemma::'
1.839972 Gtype b'+1:lemma:cra'
1.832886 Med b'lemma:minimal'
1.828331 O b'lemma:soxr'
1.828331 O b'lemma:soxs'
1.826015 Supp b'+1:lemma:hour'
1.822417 Supp b'lemma:Trp'
1.815900 Substrain b'-1:lemma:.'
1.815900 Substrain b'-1:postag:.'
1.809078 OD b'lemma:od450'
1.808111 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.800064 pH b'+1:lemma:5.5'
1.799027 Phase b'-1:lemma:until'
1.794251 Supp b'+1:lemma:_'
1.784496 O b'-1:lemma:nh4cl'
1.766934 Gtype b'+1:lemma:with'
1.764505 O b'lemma:-rrb-'
1.763383 Med b'-1:lemma:in'
1.754094 O b'lemma:at'
1.751441 O b'-1:lemma:no3'
1.747824 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
1.745279 Supp b'-1:lemma:potassium'
1.731981 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.731981 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.726996 Gtype b'+1:lemma:control'
1.726461 Air b'-1:lemma:ryhb'
1.721326 Air b'-1:lemma:_'
1.719623 Supp b'-1:lemma:contain'
1.716630 Gversion b'lemma:nc'
1.714267 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.713015 O b'postag:CC'
1.705794 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.696323 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.692662 Gtype b'lemma:ptac'
1.687629 O b'lemma:s'
1.684965 Supp b'lemma:fructose'
1.684744 Gtype b'-1:lemma:wild'
1.683018 O b'lemma:argr'
1.680598 O b'postag:DT'
1.680395 O b'-1:lemma:pq'
1.680169 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.678115 O b'lemma:affyexp'
1.675820 Supp b'-1:lemma:without'
1.675735 Phase b'postag:NN'
1.674269 O b'lemma:ompr'
1.668870 Med b'-1:lemma:fresh'
1.652115 Med b'lemma:m63'
1.641047 Gtype b'hLower'
1.622334 O b'lemma:gadx'
1.619356 O b'-1:lemma:type'
1.614348 O b'-1:lemma:wt'
1.614215 O b'lemma:purr'
1.613272 Gtype b'lemma:wild'
1.609680 O b'+1:lemma:sparging'
1.606433 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.604617 Technique b'lemma:rna-seq'
1.604106 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.601303 Strain b'-1:lemma:.'
1.601303 Strain b'-1:postag:.'
1.597969 O b'-1:lemma:-80'
1.596815 Technique b'-1:lemma:IP'
1.595283 O b'+1:lemma:0.2'
1.591795 O b'symb'
1.586596 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.579025 OD b'-1:lemma:od450'
1.578694 Technique b'+1:lemma:gadx'
1.577237 O b'lemma:-lrb-'
1.568338 Anti b'hGreek'
1.563047 OD b'-1:lemma:~'
1.562959 Gtype b'lemma:nsrr'
1.562624 O b'lemma:or'
1.559633 O b'+1:lemma:250'
1.559141 O b'lemma:A'
1.558558 Anti b'-1:lemma:fnr'
1.552559 O b'lemma:for'
1.552001 pH b'lemma:5.5'
1.548873 Supp b'lemma:leucine'
1.541661 OD b'+1:lemma:of'
1.539411 O b'-1:lemma:into'
1.530415 Technique b'lemma:chip-exo'
1.529959 Technique b'hLower'
1.529305 Anti b'-1:lemma::'
1.524790 Air b'postag:JJ'
1.523280 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.516474 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.514347 Technique b'-1:lemma:1'
1.505543 O b'-1:lemma:Anaerobic'
1.499370 Gtype b'lemma:phtpg'
1.497510 O b'lemma:-80'
1.494343 O b'lemma:culture'
1.487972 Med b'+1:lemma:+'
1.487661 Gtype b'-1:lemma:from'
1.485324 pH b'lemma:.5'
1.485324 pH b'-1:lemma:ph5'
1.484470 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
1.469430 OD b'-1:lemma:at'
1.468010 O b'lemma:harbor'
1.466516 O b'lemma:~'
1.458083 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
1.456690 O b'postag:-RRB-'
1.455460 Med b'+1:lemma:-lrb-'
1.453974 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.452043 OD b'lemma:0.3'
1.451523 Supp b'-1:lemma:sodium'
1.447997 Med b'+1:postag:-LRB-'
1.441563 O b'-1:lemma:Aerobic'
1.433054 Temp b'-1:lemma:sample'
1.432521 O b'lemma:+'
1.432222 Technique b'-1:lemma:input'
1.423628 Gversion b'+1:lemma:genome'
1.420784 O b'+1:lemma:30'
1.418927 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.413866 Gversion b'lemma:_'
1.412682 O b'lemma:Lrp'
1.404950 Gversion b'postag:NN'
1.404334 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.399160 Supp b'-1:lemma:mm'
1.398532 OD b'+1:postag:JJ'
1.397511 Supp b'-1:lemma:final'
1.393269 Gtype b'hUpper'
1.392539 Med b'+1:postag:CD'
1.385395 O b'-1:lemma:phase'
1.384209 Air b'lemma:Aerobic'
1.383680 O b'postag:SYM'
1.382248 Air b'-1:postag::'
1.380503 O b'lemma:oxyr'
1.379019 O b'-1:lemma:aerobic'
1.374104 O b'lemma:C'
1.373511 Med b'postag:NNP'
1.369113 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.364734 Med b'postag:NNS'
1.360253 Supp b'+1:lemma:leucine'
1.358378 O b'-1:lemma:.5'
1.350481 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.348124 Supp b'-1:lemma:respiration'
1.348124 Supp b'+1:lemma:mmol'
1.345423 O b'lemma:trpr'
1.342518 Supp b'-1:lemma:30'
1.342508 O b'-1:lemma:stpa'
1.339659 Supp b'lemma:30'
1.336823 Med b'symb'
1.332194 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.330356 O b'lemma:input'
1.330356 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.329809 O b'postag:-LRB-'
1.326258 O b'lemma:c'
1.324802 O b'-1:lemma:nacl'
1.322590 O b'-1:lemma:mg1655'
1.321375 Supp b'lemma:tryptophan'
1.321375 Supp b'-1:lemma:mg/l'
1.314787 pH b'-1:lemma:at'
1.310200 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.297858 Anti b'-1:lemma:myc'
1.297010 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.295230 pH b'lemma:ph'
1.278814 Anti b'lemma:anti-rpob'
1.276713 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
1.276686 Gtype b'+1:lemma:the'
1.274545 Supp b'lemma:glutamine'
1.274545 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.272864 O b'+1:lemma:wash'
1.268368 O b'-1:lemma:arginine'
1.266193 Gtype b'lemma:wild-type'
1.258976 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.255326 Supp b'-1:lemma:2'
1.251186 Supp b'lemma:20'
1.250841 O b'-1:lemma:min'
1.249328 O b'lemma:E.'
1.248164 O b'-1:lemma:acetate'
1.245335 Substrain b'postag:NN'
1.244450 O b'+1:postag:NNP'
1.242248 Gtype b'lemma:Wild'
1.238221 Gtype b'+1:lemma::'
1.236611 Gversion b'-1:lemma:the'
1.235052 Anti b'lemma:anti-rpos'
1.234660 O b'+1:postag:VBZ'
1.234565 Supp b'-1:lemma:1m'
1.232986 OD b'-1:postag:IN'
1.226154 Supp b'+1:lemma:min'
1.225761 Gversion b'postag:CD'
1.224407 O b'lemma:ml'
1.222948 Air b'+1:lemma:at'
1.221241 Supp b'-1:lemma:0.2'
1.220688 Supp b'+1:lemma:1/100'
1.218595 O b'-1:lemma:l1'
1.213999 O b'lemma:2-3'
1.213052 Supp b'lemma:phosphate'
1.212255 O b'lemma:agitation'
1.210999 Supp b'+1:lemma:1m'
1.204560 O b'-1:lemma:shake'
1.203543 Anti b'-1:postag::'
1.201223 Phase b'-1:lemma::'
1.198583 O b'-1:lemma:or'
1.197473 Supp b'lemma:nitrate'
1.194144 O b'+1:lemma:20'
1.192744 Supp b'-1:lemma:soxr'
1.192744 Supp b'-1:lemma:soxs'
1.191927 Air b'+1:lemma:%'
1.190113 Technique b'+1:postag:NN'
1.186974 O b'-1:lemma:media'
1.185869 Technique b'lemma:chip-seq'
1.185497 Anti b'+1:lemma:-lrb-'
1.184677 O b'+1:lemma:mid-log'
1.184492 Gtype b'lemma:flagtag'
1.182732 Med b'-1:lemma:minimal'
1.181152 Technique b'postag:NNP'
1.178945 O b'lemma:0.4'
1.178772 Med b'+1:lemma:g/l'
1.175510 O b'+1:lemma:acetate'
1.173350 Air b'-1:lemma:cm20'
1.165518 Vess b'+1:postag:IN'
1.163821 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.163472 O b'+1:lemma:or'
1.157560 O b'postag:CD'
1.151883 pH b'-1:lemma:ph'
1.146312 Air b'-1:lemma:%'
1.140150 Med b'+1:lemma:medium'
1.139547 OD b'+1:lemma:0.3'
1.138137 OD b'postag:IN'
1.137763 Gtype b'+1:lemma:mg1655'
1.137157 O b'-1:postag:RB'
1.134019 Anti b'+1:postag:-LRB-'
1.127146 Supp b'+1:lemma:anaerobically'
1.124263 O b'lemma:,'
1.124263 O b'postag:,'
1.122998 OD b'lemma:od600'
1.122311 O b'+1:lemma:nacl'
1.121034 OD b'+1:lemma:,'
1.121034 OD b'+1:postag:,'
1.120641 Supp b'-1:lemma:phosphate'
1.119181 Temp b'lemma:sample'
1.118819 O b'+1:postag::'
1.116052 Supp b'-1:lemma:\xce\xb4ompr'
1.110655 Supp b'+1:lemma:be'
1.106745 O b'lemma:Genome'
1.106726 Air b'lemma:%'
1.106265 Supp b'lemma:sodium'
1.089415 Supp b'lemma:cm20'
1.089415 Supp b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.088527 O b'+1:lemma:aerobically'
1.086911 Med b'-1:lemma:LB'
1.084895 O b'lemma:k-12'
1.083322 Air b'+1:lemma:b'
1.082855 O b'+1:lemma:read'
1.078599 Anti b'lemma:anti-flag'
1.078599 Anti b'+1:lemma:mab'
1.078418 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
1.078026 OD b'lemma:of'
1.070816 Anti b'lemma:mab'
1.070816 Anti b'-1:lemma:anti-flag'
1.070343 Gtype b'-1:lemma::'
1.067963 O b'+1:lemma:dpd'
1.064725 O b'-1:lemma:fructose'
1.061323 Gtype b'-1:lemma:vector'
1.058405 Temp b'+1:lemma:in'
1.058368 O b'lemma:EB'
1.055375 O b'+1:lemma:m9'
1.055326 Gtype b'lemma:fur-8myc'
1.055326 Gtype b'lemma:cra-8myc-tagged'
1.053600 O b'-1:lemma:nitrate'
1.053481 O b'lemma:cra'
1.048112 Air b'+1:lemma:or'
1.047116 Supp b'-1:postag:CC'
1.046775 Supp b'lemma:feso4'
1.045895 Anti b'lemma:anti-myc'
1.042793 O b'+1:lemma:minute'
1.041554 Supp b'symb'
1.038162 O b'-1:lemma:one'
1.037299 O b'lemma:contain'
1.036641 Gtype b'lemma:cra'
1.035368 Gtype b'+1:lemma:ph5'
1.031770 Supp b'lemma:1m'
1.023433 Gversion b'-1:postag:DT'
1.017000 Supp b'-1:lemma:m'
1.016300 Supp b'-1:postag:CD'
1.014305 O b'lemma:genotype'
1.011078 O b'-1:lemma:4'
1.008474 Gtype b'lemma:vector'
1.005310 Supp b'lemma:0.2'
1.004765 O b'+1:postag:VBN'
1.003492 O b'-1:lemma:grow'
0.997337 Supp b'+1:lemma:phosphate'
0.997115 pH b'-1:postag:NN'
0.996608 O b'lemma:to'
0.996608 O b'postag:TO'
0.995957 OD b'lemma:0.3-0.35'
0.995867 Gtype b'-1:lemma:pk4854'
0.994034 Air b'-1:lemma:phase'
0.991807 Med b'-1:postag:JJ'
0.987089 Supp b'postag:NNP'
0.983481 Anti b'-1:postag:JJ'
0.982656 Gtype b'-1:lemma:knock-out'
0.980027 Supp b'lemma:2g/l'
0.980027 Supp b'+1:lemma:glutamine'
0.980013 Phase b'+1:lemma:for'
0.975984 Med b'+1:lemma:minimal'
0.975443 Phase b'lemma:pahse'
0.974961 Supp b'lemma:in'
0.974720 O b'lemma:Nac'
0.974030 O b'lemma:600'
0.973247 Anti b'+1:lemma:from'
0.972363 Gversion b'+1:postag:CD'
0.960888 Gtype b'+1:lemma:knock-out'
0.957996 Gtype b'lemma:the'
0.957888 Agit b'-1:postag:-LRB-'
0.952949 O b'+1:postag:VBD'
0.952748 O b'postag:NNS'
0.950057 O b'lemma:delta'
0.949309 Med b'-1:lemma:glucose'
0.949128 Supp b'lemma:\xc2\xb5m'
0.947786 O b'hLower'
0.945187 Gtype b'-1:lemma:of'
0.942818 O b'lemma:additional'
0.942818 O b'+1:lemma:2h'
0.941904 O b'-1:lemma:induce'
0.941331 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
0.939794 Supp b'-1:lemma:dissolve'
0.939794 Supp b'+1:lemma:methanol'
0.938935 Supp b'+1:postag:VBD'
0.936514 pH b'+1:lemma:.'
0.936514 pH b'+1:postag:.'
0.935625 O b'-1:postag:NNP'
0.934231 O b'lemma:pt7'
0.933798 O b'lemma:lrp'
0.930952 Agit b'+1:lemma:-rrb-'
0.930404 O b'+1:lemma:tritonx-100'
0.927062 Temp b'+1:lemma:and'
0.925117 Anti b'lemma:tag'
0.922971 Supp b'-1:lemma:cra'
0.921480 O b'lemma:%'
0.921051 Med b'+1:lemma:with'
0.919600 OD b'lemma:o.d.'
0.919600 OD b'+1:lemma:600nm'
0.916203 O b'-1:lemma:medium'
0.911735 Gtype b'+1:lemma:small'
0.911441 O b'lemma:IP'
0.909953 Agit b'+1:postag:-RRB-'
0.909197 O b'lemma:Fur'
0.908891 Gtype b'lemma:factor'
0.908891 Gtype b'-1:lemma:transcription'
0.908891 Gtype b'+1:lemma:Fur'
0.908318 Agit b'-1:lemma:-lrb-'
0.908218 Air b'lemma:co2'
0.906832 Technique b'lemma:ChIPSeq'
0.904265 Temp b'+1:lemma:short'
0.902430 O b'lemma:ntrc'
0.902430 O b'lemma:csir'
0.887996 Gtype b'lemma:ryhb'
0.887054 O b'-1:lemma:dpd'
0.886579 Supp b'lemma:final'
0.879942 Gtype b'+1:lemma:fur'
Top negative:
0.060579 pH b'-1:lemma:\xce\xb4gade'
0.060212 O b'-1:lemma:by'
0.060207 O b'lemma:\xce\xb4arca'
0.058857 O b'lemma:FDR'
0.057884 Gversion b'+1:postag:NN'
0.057143 OD b'+1:lemma:in'
0.055382 Air b'-1:lemma:-lrb-'
0.054379 O b'hUpper'
0.053818 O b'-1:lemma:FDR'
0.053818 O b'+1:lemma:0.01'
0.053522 Gtype b'+1:lemma:lacx74/ptg2'
0.053191 O b'lemma:treat'
0.052856 O b'lemma:voluman'
0.052718 O b'+1:lemma:MOPS'
0.051624 O b'+1:lemma:0.1'
0.049895 O b'lemma:EcoCyc'
0.048938 O b'-1:lemma:b2'
0.048739 Technique b'postag:NN'
0.047774 O b'-1:lemma:hns'
0.046622 O b'lemma:ompr-8myc'
0.045358 O b'+1:postag:CD'
0.043803 Gtype b'+1:lemma:lacx74/ptrc99a'
0.043502 O b'lemma:Neoclone'
0.041447 Gtype b'-1:postag:NNP'
0.040941 Supp b'lemma:um'
0.040526 O b'-1:lemma:subsequently'
0.040329 Air b'+1:lemma:-rrb-'
0.039373 O b'-1:postag:DT'
0.036973 Gtype b'lemma:zupt'
0.036973 Gtype b'+1:lemma:k12'
0.035589 Air b'postag:-LRB-'
0.034812 Air b'+1:postag:-RRB-'
0.033342 O b'lemma:nput'
0.033342 O b'-1:lemma:vs'
0.033342 O b'+1:lemma:-rsb-'
0.033322 O b'lemma:reference'
0.031667 O b'lemma:mg/ml'
0.031667 O b'-1:lemma:150'
0.031605 Gtype b'+1:postag:IN'
0.031299 O b'lemma:antibody-protein-dna'
0.031299 O b'-1:lemma:capture'
0.029951 Temp b'symb'
0.029155 O b'-1:lemma:solution'
0.028951 Air b'lemma:-rrb-'
0.028752 O b'+1:lemma:7.6'
0.028352 O b'+1:lemma:hs1'
0.028141 O b'+1:lemma:wildtype'
0.027800 O b'lemma:sds'
0.027151 O b'-1:lemma:300'
0.026656 O b'lemma:period'
0.026142 O b'-1:lemma:25'
0.026042 Anti b'-1:postag:NNP'
0.025684 O b'+1:lemma:wild'
0.022906 Gtype b'lemma:feoa'
0.022689 Air b'lemma:-lrb-'
0.021338 O b'lemma:grow'
0.020644 Gversion b'-1:postag:NN'
0.020147 pH b'hUpper'
0.020079 O b'+1:postag:VBG'
0.018001 O b'+1:lemma:delta-arca'
0.017911 Air b'postag:-RRB-'
0.017741 O b'lemma:harvest'
0.017693 Gtype b'+1:lemma:rpoh'
0.017039 O b'+1:lemma:co2'
0.016969 OD b'postag:JJ'
0.015823 O b'-1:lemma:ethanol'
0.015649 O b'-1:lemma:deficient'
0.014147 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
0.014081 Air b'postag:CC'
0.014066 O b'-1:lemma:anaerobically'
0.013833 O b'+1:lemma:then'
0.013742 Supp b'hUpper'
0.012394 O b'+1:lemma:tag'
0.012377 O b'-1:lemma:volume'
0.012088 Supp b'lemma:ph'
0.011995 O b'+1:lemma:n2'
0.011222 Supp b'lemma:vol'
0.011222 Supp b'-1:lemma:1/100'
0.011039 O b'-1:lemma:m9'
0.010454 O b'-1:lemma:TEX'
0.010385 O b'+1:lemma:l1'
0.010051 O b'lemma:95'
0.009289 O b'lemma:1/100'
0.009289 O b'+1:lemma:vol'
0.008899 O b'lemma:edta'
0.008855 O b'lemma:l2'
0.008810 O b'-1:lemma:od600'
0.008736 O b'lemma:constant'
0.008630 Technique b'-1:postag:CD'
0.007650 O b'lemma:all'
0.007184 O b'+1:lemma:dtt'
0.007015 O b'+1:lemma:ga'
0.006437 O b'+1:lemma:beginning'
0.005619 Med b'+1:lemma:.'
0.005619 Med b'+1:postag:.'
0.005600 O b'-1:lemma:kcl'
0.005406 Supp b'lemma:250'
0.005179 Air b'-1:lemma:aerobically'
0.005013 O b'lemma:saline'
0.004974 Gtype b'lemma:tonb'
0.004298 O b'lemma:site-specific'
0.004298 O b'-1:lemma:flp-mediated'
0.004298 O b'+1:lemma:recombination'
0.004067 O b'+1:lemma:of'
0.004051 O b'+1:lemma:lysate'
0.003642 O b'lemma:two'
0.003595 Gtype b'lemma:lacx74/ptg2'
0.003071 Med b'lemma:m9'
0.002977 O b'+1:lemma:x'
0.002883 O b'+1:lemma:tex'
0.002026 O b'+1:lemma:with'
0.001814 O b'-1:lemma:two'
0.001702 Gtype b'lemma:rpoh'
0.001351 Gtype b'lemma:lacx74/ptrc99a'
0.001309 O b'-1:lemma:b1'
0.000550 O b'lemma:fur-8-myc'
0.000279 O b'-1:postag:VB'
0.000211 O b'+1:lemma:rrna'
0.000204 O b'lemma:6'
0.000182 O b'+1:lemma:escherichia'
0.000157 O b'lemma:wash'
0.000132 O b'lemma:.0.0'
0.000132 O b'-1:lemma:v1'
0.000069 O b'-1:lemma:condition'
0.000068 Supp b'+1:lemma:media'
0.000032 O b'lemma:licl'
0.000024 O b'-1:lemma:,1.2'
0.000024 O b'+1:lemma:kcl'
0.000017 Med b'-1:postag:NNP'
0.000012 O b'lemma:neg'
0.000010 O b'-1:lemma:\xce\xb4fnr'
0.000008 Vess b'hLower'
0.000005 Gtype b'-1:lemma:hn'
0.000005 Gtype b'+1:lemma:stpa'
0.000004 Gtype b'lemma:stpa'
0.000003 O b'lemma:e.g.'
-0.000000 O b'-1:lemma:\xce\xb4soxs'
0.000000 O b'lemma:second'
0.000000 O b'+1:lemma:interval'
0.000000 O b'lemma:nuclease'
0.000000 O b'-1:lemma:micrococcal'
-0.000016 Supp b'-1:lemma:300'
-0.000027 O b'-1:lemma:\xce\xb4soxr'
-0.000055 O b'-1:lemma:pre-cleared'
-0.000265 Gtype b'+1:lemma:glucose'
-0.000439 Temp b'postag:JJ'
-0.002387 Gtype b'-1:lemma:-'
-0.003939 O b'-1:lemma:70'
-0.004824 O b'+1:lemma:o2'
-0.007840 Supp b'-1:lemma:Fe'
-0.012002 O b'lemma:chip-exo'
-0.012929 Supp b'+1:postag:IN'
-0.012932 pH b'postag:NN'
-0.013049 O b'+1:lemma:a'
-0.013083 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.014555 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.018986 O b'+1:lemma:0.3'
-0.019203 O b'+1:postag:IN'
-0.019268 OD b'hGreek'
-0.020903 O b'lemma:phosphate'
-0.021145 Supp b'-1:lemma:8'
-0.021322 O b'lemma:min'
-0.024533 O b'lemma:25'
-0.024763 O b'-1:postag:VBG'
-0.026177 O b'-1:lemma:in'
-0.028277 O b'+1:postag:FW'
-0.029190 O b'lemma:5'
-0.031849 Med b'-1:lemma:MOPS'
-0.032325 O b'-1:lemma:k-12'
-0.033014 O b'+1:lemma:phosphate'
-0.036618 Gtype b'lemma:-lrb-'
-0.037525 OD b'+1:lemma:.'
-0.037525 OD b'+1:postag:.'
-0.038307 O b'lemma:sodium'
-0.039354 Technique b'hGreek'
-0.041740 O b'lemma:paraquat'
-0.042576 O b'+1:lemma:70'
-0.042706 Anti b'-1:postag:NN'
-0.043164 Supp b'postag:-LRB-'
-0.044331 O b'lemma:7.6'
-0.044331 O b'+1:lemma:;'
-0.047469 Supp b'-1:lemma:and'
-0.049925 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.052655 O b'-1:lemma:\xce\xb4ompr'
-0.052758 O b'+1:lemma:pahse'
-0.053763 Supp b'+1:lemma:final'
-0.055364 O b'lemma:0.1'
-0.056442 Supp b'postag:VBN'
-0.057635 O b'+1:lemma:-lcb-'
-0.060519 Supp b'+1:lemma:of'
-0.061481 O b'-1:lemma:of'
-0.062594 O b'+1:lemma:.'
-0.062594 O b'+1:postag:.'
-0.064274 Temp b'-1:postag:IN'
-0.066002 Substrain b'hGreek'
-0.068547 O b'-1:lemma:affinity'
-0.069007 O b'lemma:70'
-0.071926 Supp b'-1:lemma:250'
-0.072574 O b'lemma:phase'
-0.074993 O b'-1:postag:IN'
-0.077278 Anti b'-1:postag:CD'
-0.077603 O b'+1:lemma:1/100'
-0.078487 O b'+1:lemma:25'
-0.080445 Gtype b'-1:postag:SYM'
-0.080618 Supp b'postag::'
-0.083862 Technique b'+1:lemma:-rrb-'
-0.085595 Technique b'+1:postag:JJ'
-0.085874 Supp b'lemma:and'
-0.085948 O b'lemma:8'
-0.088527 Technique b'+1:postag:-RRB-'
-0.089390 O b'-1:lemma:%'
-0.091032 Gtype b'postag:CD'
-0.091621 Temp b'postag:NN'
-0.092261 Gtype b'lemma:control'
-0.092702 Agit b'postag:NN'
-0.094690 O b'+1:lemma:delta'
-0.098089 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.100450 Supp b'lemma:.'
-0.100450 Supp b'postag:.'
-0.104363 OD b'lemma:2.0'
-0.106327 Gtype b'lemma:_'
-0.108192 Med b'+1:lemma:m9'
-0.113440 Gtype b'-1:postag:CD'
-0.118111 O b'lemma:\xc3\x9f'
-0.118136 Phase b'+1:postag:NN'
-0.119023 O b'+1:lemma:5'
-0.119729 Vess b'symb'
-0.122392 Supp b'-1:postag:NN'
-0.122866 Supp b'-1:lemma:the'
-0.123615 Supp b'lemma:mm'
-0.129760 O b'lemma:deletion'
-0.130127 Gversion b'hGreek'
-0.130481 Med b'hGreek'
-0.133819 Gversion b'symb'
-0.135815 pH b'hGreek'
-0.143508 O b'+1:lemma:mutant'
-0.145637 O b'lemma:final'
-0.149561 O b'-1:lemma:~'
-0.150813 O b'-1:lemma:.'
-0.150813 O b'-1:postag:.'
-0.153955 Air b'postag:NNP'
-0.158202 O b'lemma:dpd'
-0.159398 O b'lemma:0.2'
-0.161531 O b'+1:lemma:purify'
-0.161716 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.163554 Gtype b'postag:NNS'
-0.167882 Supp b'+1:lemma:glucose'
-0.168037 O b'+1:postag:VB'
-0.169188 Gtype b'+1:lemma:b'
-0.169544 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.173743 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.175493 O b'-1:lemma:iptg'
-0.176436 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.178222 O b'lemma:;'
-0.178222 O b'-1:lemma:7.6'
-0.179503 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.181139 O b'+1:lemma:until'
-0.181657 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.182920 O b'+1:lemma:pk4854'
-0.186593 Gtype b'-1:lemma:and'
-0.187759 O b'-1:lemma:0.2'
-0.188527 O b'lemma:o2'
-0.189075 O b'+1:lemma:strain'
-0.191330 O b'lemma:co2'
-0.192499 Air b'postag:CD'
-0.196951 O b'lemma:n2'
-0.201339 O b'-1:lemma:harbor'
-0.203286 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.203424 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.213288 O b'lemma:rna'
-0.214229 O b'+1:lemma:media'
-0.215171 Gtype b'+1:lemma:2'
-0.219394 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.226516 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.226579 O b'+1:lemma:ph'
-0.229273 O b'-1:lemma:control'
-0.230504 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.230700 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.230700 Gtype b'+1:postag:,'
-0.230971 O b'-1:lemma:cra'
-0.232676 O b'-1:lemma:the'
-0.233644 Air b'+1:postag:NNS'
-0.234750 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.235645 Gtype b'+1:postag:-LRB-'
-0.237335 Supp b'lemma:10'
-0.241798 Gtype b'+1:lemma:-rrb-'
-0.243899 Med b'postag:-LRB-'
-0.244745 Air b'lemma:anaerobically'
-0.249863 Gtype b'postag:NNP'
-0.250044 O b'lemma:lb'
-0.252895 Anti b'postag:CD'
-0.256600 O b'+1:lemma:min'
-0.258475 O b'-1:lemma:minimal'
-0.259193 O b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.261737 O b'lemma:mutant'
-0.262841 O b'lemma:hour'
-0.262903 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.262903 Gtype b'-1:postag:,'
-0.263055 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.263235 Phase b'hGreek'
-0.266702 Agit b'hLower'
-0.269377 O b'+1:lemma:deletion'
-0.278826 O b'+1:lemma:the'
-0.281285 O b'-1:lemma:n2'
-0.281998 Med b'+1:postag:NNS'
-0.283401 Supp b'postag:NNS'
-0.285654 O b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.285969 Gtype b'+1:postag:NNS'
-0.289692 O b'-1:lemma:gade'
-0.290490 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.292469 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.296844 Air b'-1:postag:CC'
-0.301439 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.302541 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.304012 O b'-1:lemma:gadw'
-0.305098 O b'+1:lemma:gadw'
-0.312469 Supp b'lemma:300'
-0.314775 O b'+1:lemma:fnr'
-0.324083 O b'+1:lemma:gade'
-0.328145 O b'-1:lemma:gadx'
-0.328715 O b'+1:lemma:95'
-0.330061 O b'lemma:fecl2'
-0.330663 Substrain b'hLower'
-0.330810 O b'-1:lemma:deletion'
-0.333644 O b'-1:lemma:um'
-0.333644 O b'+1:lemma:paraquat'
-0.333878 O b'+1:lemma:sample'
-0.341047 O b'-1:lemma:sodium'
-0.342705 O b'-1:lemma:purify'
-0.343368 O b'+1:lemma:rna'
-0.343719 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.344060 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.346775 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.348674 O b'lemma:pahse'
-0.355899 Supp b'-1:lemma:;'
-0.357896 O b'-1:lemma:with'
-0.358805 Supp b'lemma:,'
-0.358805 Supp b'postag:,'
-0.359020 Supp b'lemma:2'
-0.361758 Med b'lemma:-lrb-'
-0.365997 OD b'hLower'
-0.369719 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.369822 O b'postag:RB'
-0.372221 Supp b'postag:CC'
-0.372299 Gtype b'+1:lemma:crp'
-0.372586 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.374794 Med b'-1:postag:CD'
-0.375330 O b'+1:lemma:~'
-0.383348 O b'lemma:150'
-0.383348 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.383678 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.387057 O b'+1:lemma:minimal'
-0.388648 O b'+1:lemma:%'
-0.389987 Gversion b'hLower'
-0.395087 O b'+1:lemma:_'
-0.399638 Supp b'-1:postag:DT'
-0.403709 O b'+1:lemma:from'
-0.404528 O b'lemma:1m'
-0.407235 O b'+1:lemma:b'
-0.408562 Phase b'postag:JJ'
-0.408595 O b'+1:lemma:contain'
-0.410649 Anti b'postag:NNP'
-0.411658 Med b'+1:postag:IN'
-0.415727 O b'+1:lemma:arginine'
-0.416252 O b'lemma:ph'
-0.422057 Supp b'-1:lemma:in'
-0.424449 O b'lemma:od600'
-0.427939 OD b'lemma:='
-0.428513 O b'-1:lemma:final'
-0.434248 O b'lemma:m'
-0.437516 Gtype b'postag:VBG'
-0.438589 O b'-1:lemma:g/l'
-0.439962 O b'-1:lemma:mm'
-0.441380 O b'+1:lemma:300'
-0.447005 Supp b'-1:lemma:.'
-0.447005 Supp b'-1:postag:.'
-0.470493 O b'+1:lemma:m'
-0.472859 O b'lemma:dissolve'
-0.473609 Phase b'symb'
-0.483573 Med b'-1:postag:NN'
-0.485347 O b'-1:lemma:from'
-0.493140 O b'+1:lemma:2.0'
-0.495222 Gtype b'-1:lemma:fur'
-0.500097 O b'lemma:purify'
-0.500157 O b'lemma:medium'
-0.517041 pH b'symb'
-0.522769 Med b'+1:postag:NN'
-0.528681 O b'+1:postag:DT'
-0.530391 O b'-1:lemma:1m'
-0.542835 Supp b'+1:postag::'
-0.544833 Supp b'postag:CD'
-0.549697 Gtype b'postag::'
-0.550755 Air b'-1:lemma:grow'
-0.567062 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.571234 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.572919 O b'-1:lemma:rna'
-0.573786 Phase b'-1:lemma:at'
-0.575252 O b'lemma:mid-log'
-0.578479 O b'lemma:20'
-0.589397 O b'lemma:glucose'
-0.598575 Air b'-1:lemma::'
-0.599342 Temp b'hGreek'
-0.604738 Med b'-1:postag:IN'
-0.604965 O b'+1:lemma:antibody'
-0.612659 O b'lemma:acetate'
-0.629088 Supp b'postag:IN'
-0.631428 O b'-1:lemma:contain'
-0.651468 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.658207 O b'hGreek'
-0.668746 Technique b'-1:lemma::'
-0.671989 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.687413 O b'-1:lemma:o2'
-0.690410 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.692072 O b'+1:lemma:supplement'
-0.703565 Temp b'hLower'
-0.724157 O b'lemma:250'
-0.729327 O b'-1:lemma:delta'
-0.733297 O b'-1:lemma:250'
-0.738117 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.752023 O b'-1:lemma:37'
-0.765628 Med b'postag:CD'
-0.768055 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.768437 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.768437 O b'+1:lemma:methanol'
-0.787339 Med b'hLower'
-0.796294 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.800285 O b'-1:lemma:1'
-0.804945 Air b'-1:postag:VBN'
-0.807166 O b'+1:lemma:1m'
-0.811307 Temp b'+1:postag:IN'
-0.811382 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-0.814691 O b'lemma:m63'
-0.825219 O b'+1:lemma:at'
-0.828045 O b'lemma:sample'
-0.831879 Technique b'-1:postag::'
-0.836868 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.848170 O b'-1:lemma:ph'
-0.848587 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.848963 O b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.852257 O b'lemma:methanol'
-0.866544 O b'lemma:fructose'
-0.869789 OD b'hUpper'
-0.877948 O b'+1:lemma:gadx'
-0.881220 O b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.890805 O b'lemma:aerobic'
-0.903555 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.920454 O b'lemma:nh4cl'
-0.928781 O b'+1:lemma:g/l'
-0.961329 O b'lemma:0.3'
-0.962957 O b'+1:lemma:genome'
-0.968316 O b'-1:lemma:30'
-0.968619 O b'+1:lemma:mm'
-0.978188 Gtype b'symb'
-0.988532 O b'-1:lemma:m'
-1.051151 O b'lemma:minimal'
-1.081545 O b'+1:lemma:in'
-1.089259 O b'lemma:37'
-1.106270 Vess b'hUpper'
-1.108129 OD b'+1:postag:NN'
-1.109253 O b'lemma:anaerobic'
-1.120747 Supp b'+1:lemma:acetate'
-1.121448 O b'-1:lemma:rpob'
-1.133868 Agit b'hUpper'
-1.144989 O b'lemma:nacl'
-1.149461 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.161377 O b'lemma:nitrate'
-1.174323 O b'lemma:30'
-1.196976 Supp b'+1:lemma:,'
-1.196976 Supp b'+1:postag:,'
-1.208161 Strain b'hLower'
-1.222734 O b'-1:lemma:IP'
-1.242880 O b'lemma:of'
-1.253121 O b'+1:lemma:+'
-1.261324 O b'-1:postag::'
-1.272433 O b'-1:lemma:until'
-1.295316 Supp b'+1:lemma:nacl'
-1.355898 O b'-1:lemma:fresh'
-1.360059 Air b'postag:NN'
-1.390193 O b'-1:lemma:sample'
-1.420651 O b'-1:lemma:2'
-1.456947 Supp b'postag:JJ'
-1.472337 Strain b'symb'
-1.497049 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-1.513425 Supp b'hGreek'
-1.520445 O b'-1:lemma:ml'
-1.578065 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-1.585764 O b'lemma:media'
-1.593148 O b'+1:lemma:1'
-1.604632 O b'+1:lemma:hour'
-1.663162 O b'+1:lemma:2'
-1.730278 O b'lemma:wt'
-1.795168 Temp b'+1:lemma:with'
-1.952852 O b'-1:lemma:co2'
-2.083450 O b'lemma:rifampicin'
-2.295566 O b'-1:lemma:vol'
-2.369081 O b'lemma:aerobically'
-2.370503 Technique b'symb'
-2.440774 Phase b'hUpper'
-3.187517 O b'-1:lemma:_'
-3.382325 O b'-1:lemma::'