report_Run14_v12.txt 36.8 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.26150615938542243, 'c2': 0.03027455131788803}
best CV score:0.8529397672009222
model size: 0.08M

Flat F1: 0.81840861471915
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.857     0.923        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.899     0.795     0.844        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.870     0.838     0.854       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.856     0.787     0.818       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    5.851219
OD     -> OD      5.262478
Med    -> Med     5.185420
Anti   -> Anti    5.156619
Supp   -> Supp    4.871843
Air    -> Air     4.359134
Gversion -> Gversion 4.351135
Gtype  -> Gtype   4.108829
Phase  -> Phase   3.991678
pH     -> pH      3.764078
Technique -> Technique 3.695614
O      -> O       2.683649
Agit   -> Agit    2.499079
Substrain -> Gtype   1.812258
Technique -> Air     1.440183
Air    -> O       0.574295
O      -> Technique 0.533396
O      -> Supp    0.314416
Supp   -> O       0.270768
Gtype  -> Supp    0.199083
O      -> Gtype   0.164544
Med    -> O       0.134157
Temp   -> O       0.113880
O      -> Anti    -0.000714
O      -> Med     -0.001903
Phase  -> O       -0.008028
OD     -> Air     -0.010011
Gtype  -> Med     -0.027089
O      -> OD      -0.088974
OD     -> O       -0.095624
Technique -> O       -0.217007
Gtype  -> Temp    -0.333287
Technique -> pH      -0.727325
Med    -> Supp    -0.930662
O      -> Air     -0.936428
Substrain -> O       -1.030149
Gtype  -> O       -1.358102


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    5.851219
OD     -> OD      5.262478
Med    -> Med     5.185420
Anti   -> Anti    5.156619
Supp   -> Supp    4.871843
Air    -> Air     4.359134
Gversion -> Gversion 4.351135
Gtype  -> Gtype   4.108829
Phase  -> Phase   3.991678
pH     -> pH      3.764078
Technique -> Technique 3.695614
O      -> O       2.683649
Agit   -> Agit    2.499079
Substrain -> Gtype   1.812258
Technique -> Air     1.440183
Air    -> O       0.574295
O      -> Technique 0.533396
O      -> Supp    0.314416
Supp   -> O       0.270768
Gtype  -> Supp    0.199083
O      -> Gtype   0.164544
Med    -> O       0.134157
Temp   -> O       0.113880
O      -> Anti    -0.000714
O      -> Med     -0.001903
Phase  -> O       -0.008028
OD     -> Air     -0.010011
Gtype  -> Med     -0.027089
O      -> OD      -0.088974
OD     -> O       -0.095624
Technique -> O       -0.217007
Gtype  -> Temp    -0.333287
Technique -> pH      -0.727325
Med    -> Supp    -0.930662
O      -> Air     -0.936428
Substrain -> O       -1.030149
Gtype  -> O       -1.358102


Top positive:
5.751215 O        b'lemma:_'
5.746754 Anti     b'-2:lemma:antibody'
5.515625 Gtype    b'lemma:type'
5.189280 O        b'lemma:1'
5.136348 Air      b'lemma:anaerobic'
5.064437 O        b'-2:lemma:_'
4.994799 Gtype    b'lemma:wt'
4.680063 Gtype    b'hGreek'
4.569055 O        b'lemma:2'
4.523464 Technique b'lemma:chipseq'
4.319988 Supp     b'lemma:no3'
4.136724 Gtype    b'+1:lemma:type'
3.970493 Supp     b'lemma:pq'
3.930290 Strain   b'lemma:k-12'
3.918648 O        b'lemma:-'
3.918452 O        b'lemma:3'
3.825013 Phase    b'lemma:mid-log'
3.727272 Phase    b'-2:lemma:phase'
3.558296 Med      b'lemma:MOPS'
3.519419 Supp     b'lemma:Iron'
3.519419 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.388708 Air      b'lemma:aerobic'
3.359985 O        b'lemma:b'
3.346878 Supp     b'lemma:nh4cl'
3.326300 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
3.283776 O        b'postag::'
3.254811 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.157492 Supp     b'lemma:2h'
3.157492 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.154479 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
3.114892 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.023191 O        b'lemma:.'
3.023191 O        b'postag:.'
2.959336 Supp     b'-2:lemma:shake'
2.930906 O        b'lemma:rpob'
2.831223 O        b'postag:VBG'
2.824658 Supp     b'lemma:nacl'
2.814947 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.786121 Air      b'-1:lemma:-'
2.732634 O        b'lemma:with'
2.668254 Supp     b'lemma:Adenine'
2.632238 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.627066 O        b'postag:IN'
2.615166 Air      b'-2:lemma:IP'
2.613314 Med      b'lemma:LB'
2.611369 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
2.597643 Med      b'lemma:lb'
2.571335 Gtype    b'lemma:dfnr'
2.554220 Med      b'lemma:media'
2.548691 O        b'-1:postag:NNS'
2.540852 Supp     b'-1:ner:SUPP'
2.525275 Gtype    b'lemma:pk4854'
2.524894 O        b'lemma:Cra'
2.518847 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.498738 Supp     b'lemma:iptg'
2.489135 Gtype    b'-1:ner:GEN'
2.475532 Substrain b'lemma:mg1655'
2.468214 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.434573 O        b'lemma:a'
2.425485 Supp     b'+1:lemma:1'
2.380526 pH       b'lemma:ph5'
2.380526 pH       b'+1:lemma:.5'
2.323102 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.320034 Supp     b'-1:lemma:+'
2.299012 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.254177 O        b'-1:lemma:tag'
2.249873 Supp     b'-1:lemma:Cra'
2.223365 Technique b'+2:lemma:ph5'
2.212100 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
2.204500 pH       b'+1:postag:CD'
2.180715 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
2.179980 Supp     b'-1:lemma:with'
2.174037 Air      b'-1:lemma:co2'
2.168851 Air      b'postag:RB'
2.138787 Air      b'lemma:aerobically'
2.133066 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.129416 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.113778 Med      b'lemma:m63'
2.110846 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.110846 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.103855 O        b'lemma:genotype/variation'
2.099527 O        b'-1:lemma:0.3'
2.088978 Supp     b'-2:lemma:media'
2.082862 Supp     b'+1:lemma:2'
2.077075 O        b'+1:lemma:wt'
2.048571 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.033796 Med      b'+2:postag:CC'
2.019964 O        b'-1:lemma:type'
2.013731 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.012122 O        b'-1:lemma:lb'
2.011892 Temp     b'-1:lemma:37'
2.010160 O        b'lemma:rep2'
2.010160 O        b'lemma:rep1'
2.009106 Supp     b'lemma:fructose'
1.996340 Temp     b'-1:lemma:sample'
1.995346 Technique b'lemma:ChIP-exo'
1.992135 Technique b'hUpper'
1.969319 Anti     b'+1:lemma:antibody'
1.967594 O        b'-1:lemma:glucose'
1.955547 O        b'lemma:CEL'
1.955199 O        b'-2:lemma:myc'
1.924528 Med      b'+2:lemma:b2'
1.916868 Phase    b'postag:NN'
1.916101 Med      b'lemma:minimal'
1.913068 Air      b'lemma:anaeroibc'
1.905345 Gtype    b'+1:postag::'
1.902791 O        b'+1:lemma:coli'
1.899410 O        b'+2:lemma:crp'
1.897739 O        b'+1:lemma:pq'
1.896288 Technique b'-2:lemma:wt'
1.887679 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
1.877877 O        b'lemma:\xcf\x8332'
1.789575 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
1.771760 OD       b'lemma:od600'
1.760355 O        b'lemma:harbor'
1.742145 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.734060 O        b'postag:CC'
1.720857 Temp     b'lemma:37'
1.713202 Technique b'-1:lemma:_'
1.711657 Agit     b'lemma:rpm'
1.690307 Agit     b'-1:lemma:250'
1.673683 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.670938 Air      b'postag:JJ'
1.648365 Supp     b'-2:lemma:for'
1.638096 Supp     b'lemma:acetate'
1.619529 Temp     b'lemma:43'
1.598864 O        b'postag:VBN'
1.597990 Vess     b'lemma:flask'
1.597990 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.597990 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.597990 Vess     b'+2:lemma:43'
1.597286 Air      b'+2:postag:CD'
1.550987 Supp     b'lemma:Leu'
1.550987 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
1.538433 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.531479 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.531103 O        b'+1:lemma:od600'
1.521458 O        b'-1:lemma:pq'
1.507459 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.503826 O        b'-1:lemma:mg1655'
1.503334 O        b'lemma::'
1.497150 Med      b'lemma:medium'
1.488341 Supp     b'lemma:arginine'
1.487779 O        b'lemma:culture'
1.474476 Supp     b'+1:lemma:_'
1.459034 O        b'-1:lemma:min'
1.451669 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.442945 Gversion b'lemma:u00096'
1.442945 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.441760 OD       b'-1:postag:IN'
1.441239 Supp     b'+2:lemma:feso4'
1.436630 Gversion b'lemma:.2'
1.436630 Gversion b'-1:lemma:u00096'
1.431847 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.431594 Med      b'-2:postag:JJ'
1.428148 O        b'postag:-RRB-'
1.425694 O        b'+1:postag:RB'
1.420166 Technique b'hLower'
1.411182 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.406567 Technique b'-2:postag:NNP'
1.389801 O        b'+1:lemma:0.2'
1.387977 O        b'-1:lemma:wt'
1.386748 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
1.381948 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.379117 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.378811 Temp     b'-1:lemma:43'
1.377562 Med      b'+2:lemma:b1'
1.368495 Supp     b'lemma:glucose'
1.367155 OD       b'lemma:0.3'
1.361726 O        b'-2:ner:MED'
1.345303 O        b'symb'
1.331994 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.324500 O        b'-2:lemma:medium'
1.323886 Supp     b'-1:postag:CD'
1.309986 Gtype    b'postag:JJ'
1.300618 O        b'lemma:chip'
1.297682 O        b'lemma:ompr'
1.287131 Gtype    b'lemma:arca8myc'
1.287131 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
1.286572 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.284096 O        b'lemma:purr'
1.282939 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.282286 Gversion b'-2:lemma:build'
1.273933 Agit     b'lemma:250'
1.264299 O        b'-1:lemma:nacl'
1.264265 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.259991 O        b'lemma:-lrb-'
1.248615 O        b'-1:lemma:l1'
1.240978 O        b'-1:lemma:-80'
1.218319 Med      b'+1:lemma:0.4'
1.206210 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.198847 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.196064 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.188109 Supp     b'-1:lemma:_'
1.187200 O        b'-2:lemma:fructose'
1.184541 OD       b'lemma:od450'
1.180029 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.177090 Air      b'-2:lemma:fnr'
1.175354 Supp     b'-2:lemma:20'
1.168675 Technique b'lemma:rnaseq'
1.154670 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.137719 O        b'lemma:ml'
1.136522 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.131697 Technique b'lemma:rna-seq'
1.130850 O        b'postag:-LRB-'
1.126934 Gversion b'-2:postag:VB'
1.118604 O        b'-2:lemma:min'
1.112636 Technique b'-1:lemma:input'
1.112150 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
1.111806 Supp     b'lemma:Fe'
1.107939 Gversion b'lemma:000913'
1.107939 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.104692 Supp     b'-2:lemma:agent'
1.101427 O        b'lemma:trpr'
1.100670 Med      b'+2:lemma:+'
1.099971 Gversion b'lemma:nc'
1.099971 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.098783 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.097700 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.095428 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.093124 O        b'-2:lemma:overnight'
1.092829 Substrain b'-1:lemma:.'
1.092829 Substrain b'-1:postag:.'
1.091995 Gtype    b'hUpper'
1.089363 Supp     b'+2:lemma:add'
1.089315 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.089315 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.089315 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
1.087991 Gtype    b'lemma:ptac'
1.086713 Supp     b'-2:lemma:supplement'
1.082791 Gversion b'postag:NN'
1.080526 Med      b'-2:lemma:minimal'
1.071289 O        b'-1:lemma:nitrate'
1.063042 Supp     b'lemma:dpd'
1.050973 Phase    b'-2:lemma:until'
1.037535 O        b'-2:lemma:='
1.036640 Supp     b'-2:lemma:pahse'
1.036172 pH       b'lemma:.5'
1.036172 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.031036 O        b'lemma:-rrb-'
1.029510 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.025511 Supp     b'-2:lemma:argr'
1.023240 OD       b'+1:lemma:of'
1.022168 O        b'lemma:,'
1.022168 O        b'postag:,'
1.008923 O        b'+1:postag:NNP'
1.007935 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.006589 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.006277 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.006021 O        b'lemma:chip-arca'
1.006021 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.005139 OD       b'lemma:of'
1.003687 Gtype    b'+1:lemma:the'
1.001292 Agit     b'+2:lemma:at'
1.000543 Vess     b'+1:lemma:at'
0.999003 Air      b'-2:lemma:%'
0.994539 Strain   b'+1:lemma:substr'
0.994539 Strain   b'-2:lemma:str'
0.984556 Gtype    b'+1:lemma:pq'
0.977115 Gversion b'postag:CD'
0.969307 Supp     b'lemma:glutamine'
0.969307 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
0.960352 Vess     b'-1:postag:VBN'
0.959727 O        b'+1:lemma::'
0.955098 Agit     b'-2:postag:RB'
0.955087 Air      b'-2:lemma:cm20'
0.951551 pH       b'lemma:5.5'
0.947970 Air      b'+1:lemma:%'
0.945025 O        b'+1:lemma:250'
0.940086 Air      b'+2:lemma:%'
0.930385 O        b'lemma:chip-fnr'
0.930385 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
0.929362 Gtype    b'lemma:nsrr'
0.929362 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
0.926955 O        b'+2:postag:VBD'
0.926879 Substrain b'+2:lemma::'
0.926393 pH       b'+1:lemma:5.5'
0.920582 Med      b'+1:lemma:+'
0.920337 Gtype    b'lemma:wild-type'
0.918742 O        b'+1:postag:VBN'
0.916873 Supp     b'lemma:rifampicin'
0.915162 O        b'lemma:gadx'
0.912855 O        b'lemma:input'
0.912855 O        b'+1:lemma:chip-seq'
0.909743 Gtype    b'hLower'
0.908210 O        b'lemma:0.4'
0.907116 Supp     b'-1:lemma:final'
0.905109 O        b'lemma:for'
0.901995 O        b'lemma:growth'
0.895113 O        b'+1:ner:MED'
0.894791 Med      b'+1:lemma:2.0'
0.892699 Gtype    b'-2:postag:JJ'
0.891101 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
0.887670 Technique b'-1:lemma:IP'
0.887578 Supp     b'+1:lemma:iptg'
0.883117 Technique b'-2:lemma:Fur'
0.877973 Gtype    b'+1:lemma:control'
0.874633 Air      b'lemma:%'
0.871131 Air      b'-1:lemma:%'
0.869979 O        b'+1:ner:SUPP'
0.866849 O        b'lemma:argr'
0.863600 O        b'+2:postag:JJ'
0.860491 O        b'-1:lemma:acetate'
0.859915 Supp     b'postag:NNP'
0.859626 Air      b'-2:lemma:mid-log'
0.858808 Med      b'-1:postag:JJ'
0.857267 O        b'postag:DT'
0.856747 Supp     b'lemma:20'
0.854495 Air      b'-1:lemma:phase'
0.854119 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
0.850236 O        b'-1:lemma:4'
0.846216 O        b'+1:postag::'
0.845114 Supp     b'-2:lemma:induce'
0.842460 Temp     b'+2:postag:DT'
0.835646 O        b'-2:lemma:od600'
0.835204 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
0.834537 Air      b'-2:postag:CD'
0.827246 O        b'+1:lemma:k-12'
0.827045 pH       b'-1:postag:NN'
0.826820 Phase    b'lemma:phase'
0.816229 pH       b'lemma:ph'
0.813327 O        b'+2:lemma:wt'
0.805229 Supp     b'-1:lemma:vol'
0.805229 Supp     b'-2:lemma:1/100'
0.805229 Supp     b'+2:lemma:1m'
0.801655 Temp     b'-2:lemma:keep'
0.797305 Gtype    b'+2:ner:SUPP'
0.792201 O        b'+1:lemma:ph5'
0.792201 O        b'+2:lemma:.5'
0.785038 O        b'lemma:affyexp'
0.782843 Gversion b'-1:lemma:nc'
0.782843 Gversion b'+1:lemma:000913'
0.782567 Substrain b'+2:postag::'
0.781949 Temp     b'-2:lemma:see'
0.781393 Supp     b'lemma:0.2'
0.781112 O        b'lemma:A'
0.780617 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
0.780617 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
0.777304 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
0.774743 O        b'+2:lemma:_'
0.767743 Supp     b'-1:lemma:ompr'
0.762362 Supp     b'-1:postag:IN'
0.760991 Gtype    b'-1:lemma:wild'
0.760537 Temp     b'lemma:sample'
0.759668 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.759135 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.759135 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.757281 Med      b'-1:lemma:glucose'
0.757082 O        b'postag:VBD'
0.756863 Gtype    b'lemma:the'
0.756525 O        b'-1:lemma:media'
0.755743 O        b'-1:lemma:antibody'
0.748840 O        b'-2:ner:_'
0.748542 Anti     b'hGreek'
0.738852 pH       b'-1:lemma:ph'
0.730108 OD       b'+1:postag:IN'
0.728605 Supp     b'+2:lemma:A'
0.727744 O        b'lemma:genotype'
0.725157 Gtype    b'+1:lemma:with'
0.724209 O        b'+1:lemma:43'
0.723242 Gtype    b'-2:ner:_'
0.721818 Air      b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.721664 Supp     b'-1:lemma:mm'
0.721074 O        b'+2:lemma:k-12'
0.720718 O        b'lemma:soxr'
0.720718 O        b'lemma:soxs'
0.714062 Phase    b'+1:lemma:phase'
0.713848 Technique b'-1:lemma:1'
0.713627 Gtype    b'+2:postag::'
0.713052 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
0.709662 O        b'+1:lemma:20'
0.708505 Gtype    b'+1:lemma::'
0.707976 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
0.707926 Supp     b'+2:postag:IN'
0.707301 O        b'+1:lemma:acetate'
0.705892 Med      b'postag:NNP'
0.705818 pH       b'-1:lemma:at'
0.703938 O        b'hLower'
0.695590 Anti     b'+2:postag:NNP'
0.689547 Supp     b'-1:lemma:sodium'
0.689547 Supp     b'+2:lemma:1/100'
0.688947 Supp     b'-1:lemma:1m'
0.688947 Supp     b'+2:lemma:7.6'
0.685794 Technique b'+2:postag:-RRB-'
0.685721 Med      b'+2:lemma:with'
0.684837 Technique b'-2:lemma:dpd'
0.683566 Technique b'lemma:chip-exo'
0.680893 Gtype    b'lemma:wild'
0.680886 Strain   b'-1:lemma:.'
0.680886 Strain   b'-1:postag:.'
0.680796 Gtype    b'-2:lemma:the'
0.680718 Air      b'-1:postag:CD'
0.676635 Supp     b'-2:lemma:10'
0.673394 Phase    b'-1:lemma::'
0.673236 O        b'-2:lemma:~'
0.672836 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.671581 Gversion b'+1:postag:CD'
0.669917 Vess     b'-2:postag:JJ'
0.669187 O        b'lemma:-80'
0.669187 O        b'-2:lemma:freeze'
0.667634 Gtype    b'+1:ner:GEN'
0.664459 Gtype    b'-2:lemma:delta'
0.661437 O        b'+2:ner:_'
0.660035 Air      b'-2:postag:SYM'
0.658987 Supp     b'symb'
0.657933 O        b'-1:ner:_'
0.656894 Gtype    b'-2:postag:NN'
0.655592 O        b'-1:lemma:into'
0.654021 Supp     b'+1:lemma:hour'
0.651846 Supp     b'+2:lemma:be'
0.651136 OD       b'+2:postag:CD'
0.650834 Supp     b'+1:lemma:be'
0.648744 O        b'lemma:additional'
0.648744 O        b'+1:lemma:2h'
0.645892 Med      b'+1:lemma:medium'
0.635263 Gtype    b'+2:lemma:rep2'
0.635263 Gtype    b'+2:lemma:rep1'
0.634634 OD       b'postag:IN'
0.630392 Med      b'+1:lemma:supplement'
0.628652 Supp     b'lemma:30'
0.623567 OD       b'-2:lemma:od450'
0.622821 Med      b'-1:lemma:in'
0.622786 Supp     b'+2:postag:VBD'
0.616633 O        b'-1:lemma:genotype'
0.612867 Temp     b'+1:lemma:and'
0.609947 O        b'lemma:at'
0.609285 Med      b'symb'
0.602721 Anti     b'-1:lemma::'
0.600691 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
0.599568 Supp     b'postag:NN'
0.592255 Gtype    b'-1:postag:VBP'
0.590754 Strain   b'+2:lemma:.'
0.590754 Strain   b'+2:postag:.'
0.583525 Supp     b'-1:lemma:,'
0.583525 Supp     b'-1:postag:,'
0.583455 Gtype    b'-2:lemma:dna'
0.576637 Gtype    b'lemma:vector'
0.576501 Temp     b'-2:postag:VB'
0.574934 OD       b'+2:lemma:culture'
0.574874 Phase    b'-1:lemma:until'
0.574559 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
0.573621 Temp     b'-1:lemma:see'
0.572926 Med      b'-1:lemma:ml'
0.572262 Med      b'hUpper'
0.570880 Temp     b'-2:postag:VBD'
0.569746 Supp     b'-2:lemma:trpr'
0.567176 O        b'+1:lemma:rifampicin'
0.556961 Supp     b'-1:lemma:contain'
0.556453 O        b'-2:lemma:250'
0.551689 Anti     b'hLower'
0.548419 O        b'+2:lemma:fructose'
0.547682 O        b'lemma:~'
0.545826 Supp     b'+1:lemma:mm'
0.545826 Supp     b'+1:ner:KWSUPP'
0.545154 Med      b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
0.544762 Temp     b'+1:lemma:sample'
0.543101 Air      b'+1:lemma:b'
0.542688 Supp     b'+1:postag:VBD'
0.541198 Anti     b'-2:ner:_'
0.540661 OD       b'-1:lemma:od450'
0.539380 O        b'lemma:s'
0.539380 O        b'-2:lemma:parameter'
0.538026 Supp     b'-1:postag:SYM'
0.536377 Gtype    b'-2:postag:NNS'
0.535157 Air      b'+2:lemma:37'
0.535077 Phase    b'-2:lemma:to'
0.535077 Phase    b'-2:postag:TO'
0.530387 O        b'+1:lemma:mid-log'
0.527877 Temp     b'+1:postag:JJ'
0.527778 O        b'+2:lemma:of'
0.525807 Gtype    b'+2:lemma::'
0.524506 Temp     b'-1:postag:VB'
0.519870 OD       b'+1:ner:_'
0.518748 O        b'-2:lemma:in'
0.516564 OD       b'-1:lemma:of'
0.515151 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
0.514350 Temp     b'+1:ner:_'
0.513460 Air      b'+1:lemma:until'
0.510245 Anti     b'postag:JJ'
0.507690 Agit     b'+2:postag:IN'
0.505589 Supp     b'lemma:tryptophan'
0.505589 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
0.505120 Supp     b'lemma:cm20'
0.505120 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
0.504734 Air      b'-2:ner:_'
0.502277 pH       b'+1:lemma:.'
0.502277 pH       b'+1:postag:.'
0.499040 Air      b'-2:lemma:0.3'
0.498616 Gtype    b'+2:postag:NN'
0.498463 Med      b'+2:lemma:then'
0.497999 Agit     b'-2:lemma:-lrb-'
0.496552 O        b'-2:lemma:no3'
0.496548 Air      b'-1:postag::'
0.496130 Gversion b'+2:lemma:reference'
0.493959 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.492449 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
0.490520 O        b'postag:NNS'
0.486536 Med      b'+1:postag:CD'
0.482537 O        b'-2:postag:FW'
0.482166 Supp     b'+1:lemma:anaerobically'


Top negative:
0.046371 O        b'+2:lemma:mmol'
0.045921 O        b'lemma:E.'
0.045398 Gtype    b'-1:lemma:Wild'
0.044132 O        b'-1:lemma:with'
0.043527 Temp     b'+2:postag:NN'
0.043479 O        b'+2:lemma:%'
0.043464 O        b'-1:lemma:for'
0.042833 O        b'-2:postag:NN'
0.042583 O        b'-1:lemma:%'
0.042193 Air      b'symb'
0.040600 Technique b'lemma:-rrb-'
0.040564 O        b'+2:lemma:min'
0.038828 O        b'+1:lemma:be'
0.038275 Phase    b'+2:postag:VBN'
0.037677 O        b'-2:lemma:n2'
0.037489 Supp     b'+2:lemma:of'
0.037465 O        b'+2:lemma:20'
0.037439 Supp     b'+1:lemma:of'
0.037321 Phase    b'+1:lemma:aerobically'
0.036627 O        b'-2:postag:VBP'
0.036247 Air      b'-1:ner:_'
0.035053 Air      b'+1:postag:CD'
0.033084 O        b'+1:lemma:genbank'
0.032416 Med      b'+2:postag:CD'
0.029392 Supp     b'-2:lemma:of'
0.028464 Supp     b'+1:lemma:m'
0.028296 OD       b'-1:postag:NN'
0.028223 Supp     b'-2:ner:SUPP'
0.027764 O        b'-2:lemma:5'
0.027701 Phase    b'+1:postag:NNS'
0.027357 O        b'lemma:or'
0.027272 Phase    b'-1:lemma:the'
0.027136 O        b'+2:ner:SUPP'
0.025834 Technique b'+1:lemma:Anaerobic'
0.025762 Phase    b'+1:postag:RB'
0.024667 Gtype    b'+2:postag:VBN'
0.024354 O        b'-1:lemma:grow'
0.022278 O        b'lemma:co2'
0.021883 Supp     b'-2:postag:IN'
0.021502 Med      b'-2:lemma:fresh'
0.020122 Supp     b'lemma:final'
0.019127 Air      b'postag:CD'
0.019066 Supp     b'hUpper'
0.018833 O        b'lemma:od600'
0.018324 Supp     b'+1:lemma:%'
0.016438 O        b'-2:lemma:strain'
0.015039 O        b'-1:postag:CD'
0.015001 O        b'+1:lemma:to'
0.015001 O        b'+1:postag:TO'
0.014272 Supp     b'-1:lemma:0.1'
0.013705 O        b'lemma:mm'
0.013705 O        b'-1:ner:KWSUPP'
0.013675 Air      b'+1:lemma:and'
0.012493 OD       b'-2:lemma:at'
0.011634 O        b'-2:lemma:%'
0.010173 O        b'-2:postag:JJ'
0.009426 pH       b'-2:ner:SUPP'
0.009361 Supp     b'-2:lemma:rpob'
0.009327 Gtype    b'+2:lemma:tag'
0.009264 Supp     b'lemma:0.3'
0.008832 Technique b'+1:postag:NNP'
0.008144 O        b'lemma:2.0'
0.007693 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
0.006698 Air      b'+2:lemma:Iron'
0.006667 Temp     b'+1:lemma:short'
0.006576 Supp     b'-1:lemma:iptg'
0.006134 Temp     b'+2:lemma:in'
0.005450 Anti     b'-1:lemma:polymerase'
0.005389 O        b'+2:lemma:ml'
0.005205 Gtype    b'+1:lemma:small'
0.004909 O        b'-1:lemma:n2'
0.004906 O        b'+2:postag:CC'
0.004888 O        b'-2:lemma:.2'
0.004673 Gtype    b'lemma:ryhb'
0.004404 Anti     b'-2:lemma:rna'
0.004255 Supp     b'+1:lemma:at'
0.004017 O        b'-1:lemma:short'
0.003948 O        b'lemma:5'
0.003917 Med      b'-2:ner:SUPP'
0.003713 O        b'-2:lemma:at'
0.003481 O        b'-1:lemma:Iron'
0.003226 Air      b'-2:lemma:nh4cl'
0.003113 Phase    b'+2:postag:IN'
0.002582 Med      b'-2:lemma:medium'
0.002519 O        b'-2:lemma:use'
0.002488 O        b'-1:lemma:in'
0.002178 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
0.001901 O        b'-1:lemma:5'
0.001735 OD       b'-1:lemma:to'
0.001735 OD       b'-1:postag:TO'
0.001662 Gtype    b'+1:lemma:ryhb'
0.001569 Gtype    b'-2:lemma:of'
0.001559 Air      b'-2:lemma:and'
0.001495 Agit     b'+2:ner:_'
0.001467 Supp     b'+1:postag:RB'
0.001447 Supp     b'-1:postag::'
0.001406 Temp     b'+2:lemma:short'
0.001403 Gtype    b'-2:lemma:factor'
0.001077 Supp     b'-2:postag:CC'
0.001026 Air      b'+2:postag:NNP'
0.000818 Air      b'+2:lemma:250'
0.000749 Supp     b'+2:lemma:,'
0.000749 Supp     b'+2:postag:,'
0.000739 Anti     b'-1:postag:NN'
0.000651 O        b'-2:postag:NNS'
0.000602 Med      b'+1:postag:VBG'
0.000590 Gversion b'+2:ner:_'
0.000567 Agit     b'-1:postag:CD'
0.000465 Gtype    b'+2:lemma:mg1655'
0.000427 Gversion b'-1:ner:_'
0.000426 O        b'-1:lemma:.5'
0.000426 O        b'-2:lemma:ph5'
0.000420 Gversion b'+2:postag:NN'
0.000402 Technique b'-2:postag:JJ'
0.000338 OD       b'+2:lemma:total'
0.000313 Phase    b'-1:postag:NN'
0.000305 O        b'-1:lemma:induce'
0.000287 Supp     b'+1:lemma:and'
0.000279 O        b'+1:lemma:anerobically'
0.000279 O        b'-2:lemma:600nm'
0.000278 O        b'+2:lemma:glucose'
0.000264 Air      b'lemma:n2'
0.000244 O        b'-1:lemma:at'
0.000223 O        b'+1:lemma:for'
0.000222 pH       b'-1:postag:IN'
0.000204 Strain   b'postag:NN'
0.000202 O        b'-2:lemma:m63'
0.000170 Air      b'-2:postag:NNP'
0.000157 Supp     b'lemma:in'
0.000155 O        b'-2:lemma:Iron'
0.000148 O        b'-2:lemma:Wild'
0.000128 Gtype    b'-2:lemma:culture'
0.000124 Gtype    b'+2:postag:NNP'
0.000109 Med      b'+2:lemma:10'
0.000107 Med      b'+1:postag:NNS'
0.000107 Supp     b'+1:postag:CC'
0.000105 Med      b'+1:lemma:contain'
0.000103 Air      b'-1:postag:NNP'
0.000101 O        b'-1:lemma:stpa'
0.000100 O        b'+1:lemma:minute'
0.000081 O        b'+2:lemma:rpm'
0.000074 Supp     b'+1:lemma:7.6'
0.000074 Supp     b'-2:lemma:1m'
0.000074 Supp     b'+2:lemma:;'
0.000069 OD       b'+1:lemma:0.3'
0.000064 Phase    b'+2:lemma:30'
0.000053 Temp     b'lemma:-rrb-'
0.000049 OD       b'+2:lemma:,'
0.000049 OD       b'+2:postag:,'
0.000046 O        b'-1:lemma:2.5'
0.000045 Med      b'+2:lemma:media'
0.000040 O        b'+1:lemma:tritonx-100'
0.000015 Technique b'postag:-RRB-'
0.000011 O        b'+2:postag:-LRB-'
0.000011 OD       b'-2:lemma:-lrb-'
0.000011 OD       b'-2:postag:-LRB-'
0.000010 O        b'+2:lemma:-lrb-'
0.000009 Supp     b'lemma:ph'
0.000007 O        b'-2:lemma:mg/ml'
0.000006 OD       b'-1:postag:JJ'
0.000006 O        b'lemma:um'
0.000006 O        b'+2:lemma:paraquat'
0.000002 Temp     b'-1:postag:NN'
0.000001 Temp     b'+1:postag:NN'
0.000001 O        b'+2:lemma:4'
0.000001 Temp     b'-2:lemma:grow'
0.000001 O        b'lemma:IP'
0.000001 O        b'+2:lemma:stop'
0.000001 Supp     b'lemma:\xc2\xb5l'
0.000001 Supp     b'+1:lemma:cm20'
-0.000000 Air      b'+2:postag:RB'
-0.000005 O        b'+1:lemma:7.6'
-0.000005 O        b'-2:lemma:1m'
-0.000005 O        b'+2:lemma:;'
-0.000007 O        b'+2:lemma:media'
-0.000008 O        b'lemma:7.6'
-0.000008 O        b'+1:lemma:;'
-0.000012 O        b'+1:lemma:95'
-0.000013 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.000014 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.000026 O        b'+2:lemma:ph'
-0.000053 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.000053 O        b'+2:lemma:reference'
-0.000064 Supp     b'postag:NNS'
-0.000135 Med      b'+1:postag:IN'
-0.000140 OD       b'+2:postag:CC'
-0.000155 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.000196 O        b'+2:postag::'
-0.000233 O        b'+2:lemma:total'
-0.000302 O        b'+1:lemma:contain'
-0.000323 O        b'-2:lemma:10'
-0.000324 OD       b'+2:postag:NN'
-0.000399 O        b'+1:postag:NNS'
-0.000412 O        b'lemma:anaerobic'
-0.000764 Air      b'lemma:-lrb-'
-0.000764 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.000861 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.000889 Air      b'hUpper'
-0.000994 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.001034 Med      b'-2:postag:NN'
-0.001150 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.001322 Air      b'+1:postag:NN'
-0.001420 OD       b'-2:lemma:od600'
-0.001563 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.001661 O        b'-2:lemma:mm'
-0.001661 O        b'-2:ner:KWSUPP'
-0.001815 O        b'-2:lemma:nh4cl'
-0.002128 Supp     b'+1:postag:NNP'
-0.002218 Air      b'+2:lemma:and'
-0.002425 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.002962 OD       b'symb'
-0.003238 O        b'+1:lemma:mm'
-0.003238 O        b'+1:ner:KWSUPP'
-0.003398 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.003720 Supp     b'+1:ner:SUPP'
-0.003814 O        b'+2:lemma:tag'
-0.004050 O        b'lemma:150'
-0.004050 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.004050 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.004877 O        b'+1:lemma:ph'
-0.005010 Air      b'postag:-LRB-'
-0.005049 Air      b'-1:lemma:-lrb-'
-0.005463 Gtype    b'-1:postag:CC'
-0.005677 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.005771 Air      b'+2:ner:_'
-0.005866 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.005866 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.006080 O        b'+1:lemma:300'
-0.006504 Gtype    b'postag::'
-0.006575 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.007875 O        b'lemma:n2'
-0.008258 Supp     b'-2:lemma:mm'
-0.008258 Supp     b'-2:ner:KWSUPP'
-0.010019 Supp     b'lemma:1'
-0.010051 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.010267 Air      b'-1:postag:-LRB-'
-0.010947 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.011896 Supp     b'postag:IN'
-0.012012 Gtype    b'-1:postag::'
-0.013691 Air      b'+2:postag:-RRB-'
-0.014767 Supp     b'-1:postag:NN'
-0.020543 O        b'+2:lemma:~'
-0.021003 Supp     b'-1:lemma:10'
-0.021178 Med      b'-1:postag:IN'
-0.022191 O        b'-1:ner:MED'
-0.023424 Supp     b'postag:CD'
-0.023576 O        b'hUpper'
-0.023888 O        b'lemma:dissolve'
-0.023888 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.025038 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.025660 Supp     b'-2:postag:NNS'
-0.028205 O        b'+1:lemma:_'
-0.028895 Supp     b'hLower'
-0.033316 O        b'lemma:1m'
-0.033557 Air      b'+2:postag:IN'
-0.034109 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.034377 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.034993 Air      b'+1:lemma:-rrb-'
-0.035357 Med      b'-2:ner:MED'
-0.035645 Med      b'+1:ner:MED'
-0.036073 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.037600 O        b'-1:lemma:final'
-0.038935 O        b'postag:NN'
-0.040158 Supp     b'lemma:mm'
-0.040158 Supp     b'-1:ner:KWSUPP'
-0.043752 O        b'+2:postag:DT'
-0.044880 Technique b'-2:ner:_'
-0.045431 Air      b'-1:postag:CC'
-0.045531 Air      b'+1:postag:-RRB-'
-0.045934 Temp     b'postag:NN'
-0.047756 O        b'+1:lemma:.'
-0.047756 O        b'+1:postag:.'
-0.049538 Supp     b'+2:ner:_'
-0.051564 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.053068 Anti     b'-1:ner:_'
-0.056901 O        b'-2:lemma:1'
-0.059515 Gtype    b'+1:lemma:and'
-0.060946 Gtype    b'-1:ner:_'
-0.061465 O        b'lemma:methanol'
-0.061465 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.062569 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.065891 O        b'+2:postag:IN'
-0.066622 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.067267 O        b'-2:postag:DT'
-0.070220 O        b'lemma:;'
-0.070220 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.070644 O        b'-2:lemma:o2'
-0.073936 O        b'-2:lemma:to'
-0.073936 O        b'-2:postag:TO'
-0.077135 O        b'-1:lemma:~'
-0.077319 pH       b'+2:ner:_'
-0.078405 O        b'+1:lemma:media'
-0.079539 O        b'+2:lemma:sample'
-0.079982 O        b'+1:lemma:~'
-0.081848 Supp     b'+1:postag:CD'
-0.083468 O        b'-1:lemma:.'
-0.083468 O        b'-1:postag:.'
-0.086122 Air      b'-2:postag:CC'
-0.088391 Anti     b'+1:ner:_'
-0.091946 O        b'-2:postag::'
-0.092353 O        b'lemma:37'
-0.096366 Gtype    b'postag:VBG'
-0.099413 Technique b'-2:postag:NN'
-0.101741 Gtype    b'+1:postag:CC'
-0.103928 O        b'+1:lemma:sample'
-0.104784 O        b'-1:ner:SUPP'
-0.108321 Gtype    b'postag:NN'
-0.112957 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.114867 O        b'+2:lemma:in'
-0.117150 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.118196 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.118789 O        b'+1:lemma:5'
-0.118941 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.118970 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.119060 O        b'-1:ner:GEN'
-0.119917 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.119917 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.120327 Phase    b'+1:ner:_'
-0.122766 O        b'-1:postag:DT'
-0.125711 O        b'+1:lemma:of'
-0.126716 O        b'lemma:ph'
-0.130686 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.132768 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.135402 O        b'lemma:fecl2'
-0.136313 O        b'-2:postag:SYM'
-0.139279 O        b'-2:lemma:genome'
-0.141319 O        b'-2:lemma:grow'
-0.143797 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.144039 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.144522 O        b'+1:lemma:hour'
-0.145800 O        b'-1:lemma:mm'
-0.148596 Phase    b'postag:JJ'
-0.149456 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.149765 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.150050 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.153944 O        b'-1:lemma:until'
-0.155255 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.155662 Phase    b'+2:ner:_'
-0.160548 O        b'+2:lemma:genome'
-0.161250 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.163241 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.164581 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.172562 OD       b'-2:ner:_'
-0.175968 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.181806 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.182621 O        b'+2:lemma:at'
-0.191659 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.199738 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.202770 O        b'+1:lemma:%'
-0.203438 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.205010 O        b'-2:lemma:of'
-0.205156 O        b'lemma:medium'
-0.215652 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.220765 O        b'+2:lemma:m9'
-0.223855 O        b'-1:lemma:contain'
-0.225771 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.226137 O        b'hGreek'
-0.227513 O        b'-1:lemma:IP'
-0.227524 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.229067 Gtype    b'symb'
-0.231392 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.232339 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.246679 O        b'+2:lemma:10'
-0.246809 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.248746 Supp     b'-2:lemma:glucose'
-0.268028 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.269304 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.269690 O        b'+2:lemma:co2'
-0.270147 O        b'lemma:nacl'
-0.271090 O        b'-1:lemma:rna'
-0.272938 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.275514 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.278732 Strain   b'hLower'
-0.278946 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.281731 Med      b'postag:CD'
-0.282742 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.282742 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.284071 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.285204 O        b'+1:postag:CD'
-0.286535 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.287105 O        b'lemma:sample'
-0.290722 O        b'-1:lemma:1'
-0.296729 O        b'-1:lemma:rpob'
-0.299296 O        b'-1:lemma:1m'
-0.299296 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.299591 Technique b'-1:lemma::'
-0.308180 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.316276 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.317962 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.321118 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.323422 O        b'-1:lemma:of'
-0.323659 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.327501 Med      b'+1:postag:NN'
-0.329625 O        b'lemma:20'
-0.329856 O        b'+1:lemma:+'
-0.333376 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.360285 O        b'-2:lemma:20'
-0.368079 O        b'-2:lemma:until'
-0.369702 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.373105 O        b'+2:postag:RB'
-0.375647 Supp     b'hGreek'
-0.383010 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.388869 O        b'-1:postag:IN'
-0.404152 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.404425 O        b'+2:lemma:.'
-0.404425 O        b'+2:postag:.'
-0.405533 O        b'+1:lemma:1m'
-0.405533 O        b'-2:lemma:vol'
-0.408509 Med      b'-1:postag:NN'
-0.413461 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.427280 O        b'+2:lemma:add'
-0.453286 O        b'postag:RB'
-0.458472 O        b'lemma:rifampicin'
-0.463524 Anti     b'+2:ner:_'
-0.477330 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.477953 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.482123 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.482123 Supp     b'+1:postag:,'
-0.489447 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.489622 O        b'-2:postag:VBG'
-0.494280 O        b'-2:lemma:dpd'
-0.495796 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.504562 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.507100 O        b'-1:lemma:the'
-0.510637 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.529409 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.532411 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.537226 O        b'lemma:mid-log'
-0.537420 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.538626 Phase    b'symb'
-0.543501 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.549775 Vess     b'hUpper'
-0.552198 pH       b'symb'
-0.561249 O        b'-1:lemma:vol'
-0.561249 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.561249 O        b'+2:lemma:1m'
-0.573342 Gversion b'hLower'
-0.590145 OD       b'hLower'
-0.610654 Med      b'-1:ner:_'
-0.628555 Supp     b'lemma:2'
-0.672929 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.684880 O        b'+1:lemma:at'
-0.686652 Anti     b'hUpper'
-0.689695 O        b'-1:lemma:30'
-0.702884 Med      b'+2:postag:VBN'
-0.707589 Strain   b'symb'
-0.723647 Agit     b'hUpper'
-0.734690 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.752815 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.757343 O        b'-2:lemma::'
-0.770545 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.786971 O        b'lemma:30'
-0.798926 O        b'+1:postag:IN'
-0.800735 O        b'lemma:aerobic'
-0.824869 Air      b'postag:NN'
-0.835701 O        b'lemma:wt'
-0.837175 Technique b'-1:postag::'
-0.859451 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.859865 O        b'+2:lemma:+'
-0.923240 Supp     b'-1:postag:NNP'
-0.955219 O        b'-1:lemma:co2'
-0.967632 Supp     b'+2:postag:CD'
-0.977353 O        b'-1:postag::'
-0.983071 Med      b'hLower'
-0.989844 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.017693 O        b'+1:lemma:in'
-1.051560 O        b'-2:lemma:media'
-1.065680 O        b'lemma:of'
-1.067697 OD       b'hUpper'
-1.101722 Supp     b'postag:JJ'
-1.116016 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-1.157581 O        b'-1:lemma:ph'
-1.163741 Technique b'+1:ner:_'
-1.167152 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.169094 O        b'+1:postag:DT'
-1.180898 Temp     b'hLower'
-1.188414 O        b'-1:lemma:2'
-1.218923 O        b'-2:lemma:the'
-1.239845 Gtype    b'-2:postag:CD'
-1.244127 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-1.250755 O        b'lemma:media'
-1.301164 OD       b'+1:postag:NN'
-1.305536 O        b'-2:ner:TF'
-1.306445 O        b'lemma:0.3'
-1.309721 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-1.314088 O        b'-2:lemma:IP'
-1.387428 O        b'lemma:minimal'
-1.398926 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.477614 O        b'+2:lemma:b'
-1.482976 O        b'lemma:aerobically'
-1.560677 O        b'-1:lemma:sample'
-1.580092 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.647686 O        b'+1:lemma:1'
-2.001406 O        b'+1:lemma:2'
-2.010765 O        b'+2:lemma:iptg'
-2.030388 O        b'-2:lemma:0.3'
-2.324962 Phase    b'hUpper'
-2.572423 Technique b'symb'
-3.357992 O        b'-1:lemma::'
-4.081981 O        b'-1:lemma:_'