report_Run13_v12.txt
38 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.12085102452052962, 'c2': 0.029125817132466404}
best CV score:0.8317218364725953
model size: 0.10M
Flat F1: 0.8165354169753308
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.590 0.557 0.573 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.912 0.795 0.849 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.853 0.853 0.853 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.854 0.787 0.817 484
Top likely transitions:
OD -> OD 5.365800
Supp -> Supp 5.343237
Temp -> Temp 5.287323
Med -> Med 5.234489
Air -> Air 5.114681
Anti -> Anti 4.786896
Gtype -> Gtype 4.275076
Phase -> Phase 4.175218
Gversion -> Gversion 3.987383
Technique -> Technique 3.666524
pH -> pH 3.245165
O -> O 3.143716
Agit -> Agit 1.809271
Substrain -> Gtype 1.650982
Technique -> Air 1.555581
Air -> O 1.173691
Gtype -> Supp 1.064689
O -> Technique 0.793816
O -> Supp 0.724723
O -> Gtype 0.454981
Gtype -> pH 0.238604
Supp -> O 0.168107
Anti -> O 0.057696
Temp -> O 0.006139
Phase -> Air 0.000989
Gtype -> Air 0.000001
Med -> O -0.024700
Phase -> O -0.030099
O -> Temp -0.060013
O -> Gversion -0.066934
O -> Med -0.079722
Supp -> Med -0.104049
Gtype -> Med -0.107935
OD -> Air -0.119417
Agit -> Air -0.130830
OD -> O -0.138394
O -> Phase -0.142670
Gtype -> Technique -0.169850
O -> OD -0.180767
Gtype -> Gversion -0.223380
Temp -> Med -0.315687
Gversion -> O -0.454383
O -> Anti -0.712679
Technique -> pH -0.799839
Phase -> OD -0.835240
O -> Air -1.107786
Technique -> Gtype -1.196254
Gtype -> O -1.216017
Med -> Supp -1.468960
Substrain -> O -1.469796
Top unlikely transitions:
OD -> OD 5.365800
Supp -> Supp 5.343237
Temp -> Temp 5.287323
Med -> Med 5.234489
Air -> Air 5.114681
Anti -> Anti 4.786896
Gtype -> Gtype 4.275076
Phase -> Phase 4.175218
Gversion -> Gversion 3.987383
Technique -> Technique 3.666524
pH -> pH 3.245165
O -> O 3.143716
Agit -> Agit 1.809271
Substrain -> Gtype 1.650982
Technique -> Air 1.555581
Air -> O 1.173691
Gtype -> Supp 1.064689
O -> Technique 0.793816
O -> Supp 0.724723
O -> Gtype 0.454981
Gtype -> pH 0.238604
Supp -> O 0.168107
Anti -> O 0.057696
Temp -> O 0.006139
Phase -> Air 0.000989
Gtype -> Air 0.000001
Med -> O -0.024700
Phase -> O -0.030099
O -> Temp -0.060013
O -> Gversion -0.066934
O -> Med -0.079722
Supp -> Med -0.104049
Gtype -> Med -0.107935
OD -> Air -0.119417
Agit -> Air -0.130830
OD -> O -0.138394
O -> Phase -0.142670
Gtype -> Technique -0.169850
O -> OD -0.180767
Gtype -> Gversion -0.223380
Temp -> Med -0.315687
Gversion -> O -0.454383
O -> Anti -0.712679
Technique -> pH -0.799839
Phase -> OD -0.835240
O -> Air -1.107786
Technique -> Gtype -1.196254
Gtype -> O -1.216017
Med -> Supp -1.468960
Substrain -> O -1.469796
Top positive:
5.932496 O b'lemma:_'
5.621950 O b'lemma:1'
5.389912 O b'lemma:2'
5.244684 Anti b'-2:lemma:antibody'
5.104631 Supp b'lemma:no3'
4.920756 Air b'lemma:anaerobic'
4.844089 Phase b'-2:lemma:phase'
4.680123 Phase b'lemma:mid-log'
4.607582 Technique b'lemma:chipseq'
4.581691 O b'lemma:3'
4.451164 O b'-2:lemma:_'
4.446054 Gtype b'lemma:wt'
4.273070 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
4.247605 Supp b'lemma:pq'
4.150923 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
4.034262 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
3.998654 Strain b'lemma:k-12'
3.637450 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.515672 O b'postag:VBG'
3.510453 O b'lemma:-'
3.465912 O b'lemma:b'
3.460414 O b'lemma:Cra'
3.424242 Supp b'lemma:Iron'
3.424242 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.420837 Gtype b'lemma:type'
3.406193 Supp b'lemma:iptg'
3.350084 O b'lemma:rpob'
3.332640 O b'lemma:with'
3.325772 Technique b'lemma:rna-seq'
3.269128 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.251613 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.249499 O b'postag::'
3.224193 Supp b'lemma:2h'
3.224193 Supp b'-1:lemma:additional'
3.211646 Gtype b'-2:lemma:genotype'
3.194498 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
3.088933 Air b'lemma:aerobic'
3.033905 Med b'lemma:lb'
3.028049 Supp b'lemma:nh4cl'
2.960891 O b'lemma:.'
2.960891 O b'postag:.'
2.939549 Air b'lemma:aerobically'
2.907732 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.902336 Supp b'lemma:nacl'
2.858000 O b'-2:lemma:myc'
2.855475 Technique b'lemma:chip-seq'
2.812354 O b'-2:lemma:flagtag'
2.772933 O b'postag:IN'
2.764661 Air b'-2:lemma:IP'
2.754879 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
2.751563 Substrain b'lemma:mg1655'
2.731842 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
2.731504 O b'-1:lemma:type'
2.716148 Gversion b'lemma:chip-seq'
2.696816 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.694856 Supp b'-2:lemma:shake'
2.670960 O b'-1:lemma:tag'
2.661885 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.655985 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
2.632267 Med b'lemma:LB'
2.591961 Med b'lemma:MOPS'
2.589768 pH b'lemma:ph5'
2.589768 pH b'+1:lemma:.5'
2.587620 Med b'lemma:m63'
2.585904 Supp b'lemma:acetate'
2.551737 O b'+2:lemma:crp'
2.547610 O b'-1:postag:NNS'
2.522211 Med b'+2:lemma:b2'
2.520295 Gtype b'lemma:dfnr'
2.512205 Gtype b'+1:lemma:type'
2.496660 O b'lemma:ompr'
2.486044 O b'-1:lemma:glucose'
2.484534 O b'lemma:rep2'
2.484534 O b'lemma:rep1'
2.470380 O b'lemma:affyexp'
2.469810 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.459417 O b'lemma:CEL'
2.458315 Gtype b'lemma:pk4854'
2.436003 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.410188 O b'lemma:a'
2.401443 pH b'+1:postag:CD'
2.398123 Air b'-1:lemma:-'
2.361293 Supp b'lemma:fructose'
2.354132 O b'+1:lemma:wt'
2.336048 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.318857 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.298949 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.290294 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.289343 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.289335 Gtype b'-1:ner:GEN'
2.276222 Technique b'-2:lemma:wt'
2.275441 O b'lemma:purr'
2.269759 Air b'lemma:anaeroibc'
2.253077 O b'lemma:harbor'
2.235014 O b'lemma:soxr'
2.235014 O b'lemma:soxs'
2.224445 Technique b'lemma:chip-exo'
2.222619 O b'-2:lemma:='
2.209422 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.208284 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.206608 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
2.198734 Temp b'-1:lemma:37'
2.196420 Temp b'-1:lemma:sample'
2.182308 Med b'lemma:media'
2.156214 O b'postag:VBN'
2.155271 Gtype b'+1:lemma:with'
2.152340 Supp b'lemma:Adenine'
2.147345 O b'lemma:\xcf\x8332'
2.137573 Gversion b'lemma:.2'
2.137573 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.132932 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.122155 O b'+1:lemma:pq'
2.114527 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.114527 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.091304 Supp b'+1:lemma:2'
2.075513 Supp b'-1:lemma:with'
2.067328 Med b'+2:postag:CC'
2.060636 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.057153 Temp b'lemma:37'
2.050334 O b'lemma:trpr'
2.042988 Gtype b'+1:lemma:pq'
2.041127 Med b'+2:lemma:b1'
2.025814 Supp b'+1:lemma:1'
2.011393 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.009309 Supp b'lemma:glucose'
2.000279 Supp b'-1:lemma:+'
1.985670 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.981086 Supp b'lemma:arginine'
1.975350 O b'lemma:chip'
1.961058 O b'lemma:culture'
1.947409 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.936152 Air b'postag:JJ'
1.907226 O b'lemma:input'
1.907226 O b'+1:lemma:chip-seq'
1.904057 O b'-1:lemma:pq'
1.891647 O b'lemma:argr'
1.885047 O b'+1:lemma:od600'
1.884267 Gtype b'lemma:ptac'
1.852503 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.852194 Supp b'+2:lemma:feso4'
1.846869 Supp b'-2:lemma:argr'
1.846531 O b'-1:lemma:0.3'
1.840635 Supp b'-1:lemma:Cra'
1.836503 Technique b'-1:lemma:IP'
1.833597 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.824271 Temp b'lemma:43'
1.822795 O b'lemma:gadx'
1.822781 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.820729 Gtype b'+1:lemma:ph5'
1.820729 Gtype b'+2:lemma:.5'
1.819639 Gtype b'lemma:arca8myc'
1.819639 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
1.807899 Vess b'lemma:flask'
1.807899 Vess b'-1:lemma:warm'
1.807899 Vess b'-2:lemma:pre'
1.807899 Vess b'+2:lemma:43'
1.805362 O b'lemma:growth'
1.798609 Supp b'-2:lemma:media'
1.790848 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.790175 Gversion b'lemma:u00096'
1.790175 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.786411 Supp b'lemma:dpd'
1.774656 Supp b'-1:lemma:_'
1.773207 Supp b'-2:lemma:agent'
1.771080 Air b'postag:RB'
1.770847 Gtype b'-1:lemma:rpob'
1.770150 O b'-1:lemma:lb'
1.758089 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
1.756958 O b'+1:lemma:coli'
1.756750 O b'+1:postag:RB'
1.736067 O b'-2:lemma:fructose'
1.729672 O b'-1:lemma:min'
1.727709 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.720110 O b'-1:lemma:wt'
1.713645 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
1.713020 Vess b'-1:postag:VBN'
1.706220 O b'lemma:at'
1.695457 Phase b'lemma:stationary'
1.695457 Phase b'lemma:exponential'
1.693967 Temp b'-1:lemma:43'
1.676000 O b'lemma:genotype'
1.666240 Agit b'lemma:rpm'
1.657742 Med b'lemma:medium'
1.654269 Supp b'-2:lemma:for'
1.649066 O b'lemma:or'
1.638871 Agit b'-1:lemma:250'
1.626882 O b'lemma:oxyr'
1.626050 Air b'-2:lemma:fnr'
1.613193 Med b'+1:lemma:0.4'
1.609592 Gversion b'-2:lemma:build'
1.607838 Strain b'+1:lemma:substr'
1.607838 Strain b'-2:lemma:str'
1.603936 O b'lemma:genotype/variation'
1.594682 OD b'lemma:0.3'
1.590455 O b'-2:lemma:medium'
1.584827 O b'postag:DT'
1.577534 Gtype b'postag:JJ'
1.561024 Air b'-1:lemma:co2'
1.559847 Supp b'lemma:Leu'
1.559847 Supp b'-2:lemma:Lrp'
1.557013 Gtype b'+1:lemma:_'
1.549149 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.549149 Gtype b'-1:lemma:old'
1.549149 Gtype b'-2:lemma:seqa'
1.543642 O b'-2:ner:MED'
1.539523 Gversion b'lemma:nc'
1.539523 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.520404 O b'-1:lemma:nacl'
1.514785 OD b'lemma:od450'
1.511813 O b'-1:lemma:aerobic'
1.505498 Supp b'-2:lemma:induce'
1.500333 Air b'lemma:Anaerobic'
1.496084 OD b'-2:lemma:od450'
1.494533 O b'lemma::'
1.481612 O b'-2:lemma:min'
1.479410 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.478576 Technique b'-1:lemma:input'
1.472028 Technique b'lemma:rnaseq'
1.452585 Agit b'+2:lemma:at'
1.451880 Air b'-2:lemma:%'
1.447025 Gversion b'lemma:000913'
1.447025 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.440756 Supp b'+1:lemma:Deficient'
1.435416 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.434706 Supp b'-2:lemma:purr'
1.433780 O b'-1:lemma:l1'
1.429950 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.429609 O b'lemma:treatment'
1.415653 O b'-1:lemma:nitrate'
1.410518 O b'lemma:A'
1.403420 Med b'+1:lemma:+'
1.398181 Supp b'+2:lemma:A'
1.386440 Med b'-1:lemma:in'
1.384254 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.377813 Med b'postag:NNP'
1.375634 Supp b'-2:lemma:10'
1.371397 Phase b'-1:lemma:until'
1.358944 Supp b'lemma:0.2'
1.344350 Supp b'-1:lemma:final'
1.343469 Med b'lemma:minimal'
1.340582 O b'+1:ner:MED'
1.335450 Air b'-1:postag::'
1.326104 OD b'+1:postag:IN'
1.325527 O b'-1:lemma:into'
1.322426 Supp b'+1:lemma:_'
1.318756 O b'-2:lemma:overnight'
1.307069 OD b'postag:CD'
1.306578 O b'-1:ner:TF'
1.301024 O b'lemma:ml'
1.299071 Gversion b'-2:postag:VB'
1.296201 Substrain b'-1:lemma:.'
1.296201 Substrain b'-1:postag:.'
1.295363 Supp b'lemma:Fe'
1.293143 Med b'+2:lemma:+'
1.288728 Med b'+1:lemma:2.0'
1.283831 Gtype b'lemma:wild-type'
1.279152 OD b'+1:lemma:of'
1.278121 Gtype b'+1:lemma:control'
1.267818 O b'lemma:cra'
1.266096 O b'+2:postag:JJ'
1.265904 Supp b'-1:postag:CD'
1.261301 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.244580 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.242028 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.242028 Gtype b'-2:lemma:transcription'
1.234926 O b'postag:CC'
1.234227 Med b'-1:lemma:ml'
1.233526 Supp b'-2:lemma:20'
1.227064 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.222785 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.222123 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
1.216060 pH b'lemma:5.5'
1.214578 Gtype b'+1:postag::'
1.214150 Air b'-2:lemma:0.3'
1.213807 pH b'lemma:.5'
1.213807 pH b'-1:lemma:ph5'
1.213694 O b'lemma:for'
1.213441 O b'-1:lemma:genotype/variation'
1.204551 Air b'+1:lemma:%'
1.204137 Gtype b'-1:lemma:wild'
1.203848 Phase b'+2:lemma:o.d.'
1.202675 Phase b'-2:lemma:until'
1.201643 Air b'-1:lemma:_'
1.200778 O b'-1:lemma:acetate'
1.200552 O b'lemma:additional'
1.200552 O b'+1:lemma:2h'
1.190844 Technique b'lemma:-lrb-'
1.185651 Supp b'lemma:rifampicin'
1.182494 Agit b'lemma:250'
1.181511 Technique b'postag:-LRB-'
1.180409 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.179140 Med b'postag:NNS'
1.172680 O b'-1:lemma:media'
1.171147 Air b'lemma:%'
1.166029 O b'-1:lemma:medium'
1.164664 Air b'-2:lemma:mid-log'
1.160736 Air b'-1:lemma:phase'
1.158210 Med b'-1:lemma:minimal'
1.158181 Phase b'lemma:phase'
1.157433 Strain b'-2:lemma:strain'
1.153554 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.153554 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.149753 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.145713 O b'postag:NNS'
1.142991 O b'-2:lemma:ml'
1.136663 OD b'lemma:od600'
1.136144 Med b'-2:lemma:minimal'
1.131628 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.131628 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.121358 OD b'+2:lemma:0.3'
1.118777 Med b'+1:lemma:g/l'
1.117216 Air b'-1:lemma:%'
1.115696 Air b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
1.115341 Vess b'+1:lemma:at'
1.110233 Gtype b'-2:lemma:delta'
1.110041 Anti b'-1:lemma::'
1.109791 Gtype b'-2:postag:NNS'
1.108836 OD b'-1:postag:IN'
1.104564 Gtype b'-2:postag:JJ'
1.104482 Technique b'-1:lemma:_'
1.102252 O b'postag:VBD'
1.101736 OD b'+2:lemma:~'
1.101459 Supp b'postag:NNP'
1.100296 O b'-2:lemma:in'
1.097672 O b'+1:lemma:43'
1.093119 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.091629 O b'+1:lemma:250'
1.090802 O b'+2:lemma:fructose'
1.089606 Supp b'+2:lemma:add'
1.085294 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.081203 O b'postag:-RRB-'
1.073565 Air b'+2:postag:CD'
1.072842 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.072541 O b'+1:lemma:20'
1.069291 Phase b'+1:lemma:phase'
1.069127 O b'+1:lemma::'
1.064630 Air b'+2:lemma:%'
1.061179 Technique b'+1:ner:TF'
1.059676 Gtype b'-2:lemma:dna'
1.058537 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.054357 Med b'+1:lemma:minimal'
1.053013 O b'+2:postag:VB'
1.052354 Substrain b'+2:lemma::'
1.044905 Technique b'-1:lemma:1'
1.040553 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.040462 Air b'-2:lemma:cm20'
1.034397 O b'lemma:chip-arca'
1.034397 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.031635 Supp b'-2:postag:VBG'
1.026999 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.025170 Anti b'postag:JJ'
1.024986 Strain b'+2:lemma:.'
1.024986 Strain b'+2:postag:.'
1.021563 Supp b'lemma:glutamine'
1.021563 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.021145 pH b'-1:lemma:ph'
1.016501 O b'+1:postag:NNP'
1.012396 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
1.007296 Med b'-2:lemma:medium'
1.006488 O b'+1:lemma:mid-log'
1.001517 O b'lemma:Fur'
1.001085 Agit b'-2:postag:RB'
0.998322 O b'lemma:old'
0.998322 O b'-1:lemma:seqa'
0.998322 O b'+1:lemma:deltaseqa'
0.997957 Gtype b'lemma:wild'
0.993747 O b'-1:lemma:genbank'
0.990822 Gtype b'-1:lemma:_'
0.987892 Air b'-2:postag:CD'
0.983246 Air b'-2:postag:SYM'
0.976446 O b'-1:lemma:genotype'
0.975328 O b'+2:lemma:constant'
0.973143 O b'+2:lemma:allow'
0.966212 pH b'-2:lemma:at'
0.964616 Gtype b'+2:lemma:lacz'
0.958749 Gtype b'+1:ner:GEN'
0.957451 Temp b'+1:lemma:see'
0.956475 Supp b'lemma:20'
0.955285 Substrain b'+2:postag::'
0.949549 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
0.944918 O b'+2:ner:_'
0.928916 O b'-1:ner:_'
0.926804 Gtype b'-1:lemma:vector'
0.923175 O b'lemma:s'
0.923175 O b'-2:lemma:parameter'
0.922559 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
0.916358 Supp b'-1:postag:SYM'
0.907141 O b'postag:FW'
0.906558 OD b'+2:postag:CD'
0.904593 Gtype b'lemma:nsrr'
0.904593 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
0.903906 O b'+1:lemma:0.2'
0.903810 Supp b'-2:lemma:pahse'
0.903528 Med b'+1:lemma:supplement'
0.902618 Supp b'-2:lemma:condition'
0.902337 OD b'-2:lemma:phase'
0.901883 Supp b'-1:lemma:vol'
0.901883 Supp b'-2:lemma:1/100'
0.901883 Supp b'+2:lemma:1m'
0.901486 Supp b'-2:lemma:supplement'
0.896690 Gtype b'+2:lemma:glucose'
0.895963 Air b'-2:lemma:nh4cl'
0.892690 O b'-1:lemma:mg1655'
0.891520 O b'+1:lemma:k-12'
0.890924 O b'lemma:lrp'
0.890443 Med b'+1:lemma:-lrb-'
0.889880 Phase b'-2:postag:IN'
0.886790 Supp b'-1:lemma:contain'
0.884355 Med b'-1:ner:MED'
0.882533 Supp b'+2:lemma:ph'
0.881175 O b'+1:lemma:acetate'
0.880526 O b'lemma:chip-fnr'
0.880526 O b'+2:lemma:fnr8myc'
0.880271 Supp b'-1:lemma:sodium'
0.880271 Supp b'+2:lemma:1/100'
0.874294 Gtype b'-1:lemma:from'
0.874037 Med b'+1:postag:-LRB-'
0.871038 Gtype b'lemma:phtpg'
0.869206 O b'+1:lemma:ph5'
0.869206 O b'+2:lemma:.5'
0.862870 Air b'-1:lemma:cm20'
0.862870 Air b'-2:lemma:\xc2\xb5l'
0.862693 Supp b'-1:lemma:without'
0.861534 O b'+1:ner:SUPP'
0.860237 Temp b'+1:lemma:and'
0.858144 O b'-1:lemma:w0002'
0.857774 O b'+1:postag:VBN'
0.854093 Med b'-2:postag:JJ'
0.852151 Technique b'postag:NNP'
0.852008 Supp b'-2:lemma:trpr'
0.851525 O b'-1:lemma:-80'
0.848867 Technique b'-2:ner:TF'
0.845325 Gtype b'+1:lemma::'
0.844656 Supp b'+1:lemma:iptg'
0.843514 Gtype b'-2:lemma:mg1655'
0.842293 Air b'-1:postag:CD'
0.835524 Air b'+1:lemma:until'
0.833586 O b'lemma:rnase'
0.831344 O b'+2:lemma:chipseq'
0.830324 Strain b'-1:lemma:.'
0.830324 Strain b'-1:postag:.'
0.827875 Supp b'+1:lemma:1m'
0.827875 Supp b'-2:lemma:vol'
0.827001 Gtype b'+2:lemma:control'
0.825050 Agit b'+2:postag:IN'
0.824615 Gtype b'-2:lemma:genoype'
0.820162 Supp b'-1:lemma:potassium'
0.820162 Supp b'-2:lemma:mmol'
0.818138 OD b'-1:lemma:~'
0.816119 Supp b'-1:postag:IN'
0.815205 O b'-1:lemma:antibody'
0.810832 Air b'+1:postag:IN'
0.808433 Gversion b'postag:CD'
0.807361 O b'+1:postag::'
0.800718 Gtype b'+2:ner:SUPP'
0.797908 Supp b'-1:lemma:ompr'
0.796462 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
0.789674 O b'lemma:fresh'
0.781666 Gtype b'-2:lemma:ecolus'
0.780355 Gtype b'-1:postag:VBP'
0.778305 O b'-1:lemma:dpd'
0.777552 Supp b'+2:postag:IN'
0.771386 Gversion b'lemma:_'
0.761726 Gversion b'+2:lemma:genome'
0.760449 OD b'-2:lemma:od600'
0.757150 Supp b'-1:lemma:respiration'
0.757150 Supp b'+1:lemma:mmol'
0.757150 Supp b'+2:lemma:potassium'
0.756811 pH b'+1:lemma:5.5'
0.756504 OD b'lemma:of'
0.753437 Gtype b'+2:postag::'
0.751800 Supp b'lemma:30'
0.749606 Gtype b'lemma:flagtag'
0.749606 Gtype b'-2:lemma:nsrr'
0.748748 Gtype b'lemma:Wild'
0.748310 Supp b'lemma:tryptophan'
0.748310 Supp b'-1:lemma:mg/l'
0.748097 O b'+1:lemma:30'
0.743090 O b'-1:lemma:fructose'
0.740331 Temp b'-2:lemma:see'
0.736725 Supp b'+1:lemma:m'
0.735841 Vess b'-2:postag:JJ'
0.731586 Gtype b'+1:lemma:the'
0.731488 Phase b'-1:lemma::'
0.729239 O b'+1:lemma:dpd'
0.728010 OD b'-1:lemma:at'
0.722722 O b'-2:lemma:neg'
0.722113 Supp b'-1:lemma:0.2'
0.718906 Temp b'lemma:sample'
0.713875 Gtype b'+2:lemma:rep2'
0.713875 Gtype b'+2:lemma:rep1'
0.713028 Supp b'+2:lemma:be'
0.712578 O b'-2:lemma:Cra'
0.712062 O b'+2:lemma:of'
0.711667 Technique b'lemma:-rrb-'
0.710351 Supp b'lemma:0.1'
0.708713 Gversion b'+1:postag:CD'
0.708437 O b'lemma:from'
0.707165 Technique b'+2:lemma:-rrb-'
0.706812 Air b'+2:lemma:37'
Top negative:
0.000083 Supp b'-2:ner:MED'
0.000080 O b'-2:ner:Organism'
0.000078 Technique b'-2:lemma:Fe'
0.000077 O b'lemma:ntrc'
0.000077 O b'lemma:csir'
0.000068 Supp b'-2:lemma:iptg'
0.000064 Gtype b'-2:lemma::'
0.000060 Technique b'+1:lemma:gadx'
0.000060 O b'-2:lemma:1:100'
0.000059 Phase b'+1:lemma:aerobically'
0.000047 Gversion b'+2:postag:NN'
0.000043 OD b'-1:lemma:to'
0.000043 OD b'-1:postag:TO'
0.000034 O b'+1:lemma:glucose'
0.000029 Supp b'+1:lemma:in'
0.000027 Temp b'lemma:30'
0.000025 Temp b'-1:postag:IN'
0.000022 Supp b'lemma:mg/l'
0.000022 Supp b'+1:lemma:tryptophan'
0.000020 Gtype b'+2:lemma:-lrb-'
0.000017 Supp b'+2:lemma:no3'
0.000016 Gtype b'postag:NNP'
0.000013 Gtype b'+1:lemma:carrying'
0.000013 Gtype b'-2:lemma:lacx74/ptg2'
0.000013 Gtype b'+2:lemma:inducible'
0.000012 O b'+2:lemma:to'
0.000012 O b'+2:postag:TO'
0.000011 O b'-2:lemma:lb'
0.000008 Agit b'postag:CD'
0.000008 O b'lemma:ip'
0.000007 O b'-2:ner:GEN'
0.000006 O b'-1:lemma:2.5'
0.000005 Gtype b'-2:lemma:lack'
0.000004 Gtype b'+2:postag:JJ'
0.000004 Gtype b'lemma:Fur'
0.000004 Air b'-1:lemma:-rrb-'
0.000004 Air b'-1:postag:-RRB-'
0.000004 Supp b'lemma:min'
0.000004 OD b'+2:lemma:about'
0.000003 Gtype b'lemma:wildtype'
0.000002 O b'-2:lemma:m63'
0.000002 O b'lemma:Genome'
0.000002 O b'+2:lemma:build'
0.000002 O b'+1:lemma:anaeroibc'
0.000001 Supp b'+1:lemma:with'
0.000001 Gtype b'lemma:transcription'
0.000001 Gtype b'+1:lemma:factor'
0.000001 Gtype b'+2:lemma:Fur'
0.000001 Med b'-1:lemma:w2'
0.000000 Supp b'-2:lemma:\xce\xb4fur'
0.000000 Technique b'-1:postag:-LRB-'
-0.000000 O b'+1:lemma:2.0'
0.000000 Supp b'-2:lemma:MOPS'
-0.000001 O b'+1:lemma:95'
-0.000004 O b'-1:lemma:in'
-0.000005 Vess b'+2:ner:_'
-0.000005 OD b'+2:postag:RB'
-0.000005 Supp b'lemma:250'
-0.000008 O b'+2:lemma:37'
-0.000009 Med b'-1:lemma:m63'
-0.000014 Med b'-2:lemma:m9'
-0.000014 O b'-2:lemma:nh4cl'
-0.000015 Supp b'+1:postag:NNP'
-0.000018 OD b'+1:lemma:.'
-0.000018 OD b'+1:postag:.'
-0.000021 O b'+2:lemma:rnase'
-0.000022 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.000037 O b'+2:ner:SUPP'
-0.000045 O b'-1:lemma:iptg'
-0.000065 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.000097 O b'+2:lemma:pk4854'
-0.000114 O b'lemma:5'
-0.000162 Gtype b'+2:lemma:,'
-0.000162 Gtype b'+2:postag:,'
-0.000172 OD b'+2:postag:DT'
-0.000338 O b'-2:lemma:stir'
-0.000705 O b'+2:lemma:the'
-0.000889 Technique b'-1:postag::'
-0.000906 O b'-2:lemma:2'
-0.001197 O b'-1:lemma:sodium'
-0.001197 O b'+2:lemma:1/100'
-0.001307 Gtype b'+2:ner:GEN'
-0.001480 O b'lemma:phase'
-0.001805 Air b'+1:lemma:70'
-0.001970 Gtype b'-1:lemma:-'
-0.002202 Gtype b'lemma:,'
-0.002202 Gtype b'postag:,'
-0.002735 OD b'-1:ner:_'
-0.003035 OD b'+2:postag:JJ'
-0.003185 O b'-1:lemma:;'
-0.003185 O b'-2:lemma:7.6'
-0.003285 OD b'-2:postag:VBN'
-0.003532 Air b'lemma:-lrb-'
-0.003602 Med b'-2:lemma:grow'
-0.003650 O b'+1:lemma:n2'
-0.003878 O b'+2:lemma:medium'
-0.004406 O b'+1:lemma:300'
-0.004408 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.004408 Gtype b'-1:postag:,'
-0.004624 Med b'-2:lemma:in'
-0.005320 O b'-2:lemma:10'
-0.005503 Air b'postag:CC'
-0.006605 Air b'postag:-LRB-'
-0.007264 Air b'+1:lemma:and'
-0.007267 Air b'-1:lemma:aerobically'
-0.007450 O b'+2:lemma:then'
-0.007544 Air b'-2:postag:VBD'
-0.007945 Supp b'+1:ner:SUPP'
-0.008164 O b'+1:lemma:co2'
-0.008490 Air b'-1:postag:VBN'
-0.009001 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.010919 Med b'+1:postag:IN'
-0.010993 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.011582 O b'lemma:n2'
-0.011587 O b'-1:lemma:at'
-0.012948 OD b'lemma:='
-0.013235 O b'+1:lemma:0.4'
-0.013647 Supp b'postag::'
-0.014456 O b'lemma:o2'
-0.014781 O b'-2:lemma:at'
-0.014834 Supp b'-2:postag:NNS'
-0.015992 O b'+2:postag:IN'
-0.016109 O b'+2:lemma:0.2'
-0.016425 O b'+1:lemma:7.6'
-0.016425 O b'-2:lemma:1m'
-0.016425 O b'+2:lemma:;'
-0.017072 Anti b'-1:ner:_'
-0.017590 Strain b'-1:ner:_'
-0.017755 O b'-1:lemma:o2'
-0.019489 O b'-2:lemma:ph'
-0.020263 O b'+2:lemma:250'
-0.020451 OD b'+2:postag:NN'
-0.020576 O b'-1:lemma:rna'
-0.022023 Vess b'-2:ner:_'
-0.022682 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.022835 Gversion b'+1:ner:_'
-0.023856 O b'+1:postag:VB'
-0.024152 Supp b'lemma:vol'
-0.024152 Supp b'-1:lemma:1/100'
-0.024341 Air b'-2:lemma:aerobically'
-0.025481 O b'lemma:final'
-0.026091 Med b'-2:postag:IN'
-0.030093 Supp b'-2:lemma:mm'
-0.030093 Supp b'-2:ner:KWSUPP'
-0.030800 OD b'-2:lemma:grow'
-0.030927 Air b'-1:lemma:grow'
-0.032174 O b'+1:lemma:phase'
-0.032226 Supp b'lemma:paraquat'
-0.032226 Supp b'-2:lemma:um'
-0.033948 O b'+2:postag:DT'
-0.034198 Gtype b'lemma:ompr'
-0.034300 Gtype b'-1:postag:JJ'
-0.034802 Supp b'-1:lemma:10'
-0.036075 O b'-1:lemma:n2'
-0.036275 Substrain b'-1:ner:_'
-0.036314 O b'+1:lemma:1/100'
-0.036314 O b'-2:lemma:sodium'
-0.036314 O b'+2:lemma:vol'
-0.036875 O b'+2:lemma:5'
-0.037339 O b'+2:lemma:in'
-0.039852 Supp b'postag:-LRB-'
-0.041180 O b'lemma:mg/ml'
-0.041180 O b'-1:lemma:150'
-0.043219 O b'+1:lemma:10'
-0.045066 O b'+1:lemma:pahse'
-0.045689 O b'lemma:1/100'
-0.045689 O b'+1:lemma:vol'
-0.046056 Supp b'lemma:um'
-0.046056 Supp b'+2:lemma:paraquat'
-0.050072 O b'-1:ner:GEN'
-0.050372 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.050680 O b'+1:lemma:of'
-0.050730 Supp b'lemma:ph'
-0.051232 Temp b'-2:postag:NN'
-0.051473 Supp b'-1:lemma:.'
-0.051473 Supp b'-1:postag:.'
-0.052959 O b'+2:postag:CC'
-0.054137 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.054809 O b'+1:lemma:contain'
-0.055581 Gtype b'-2:postag:CC'
-0.055814 Supp b'postag:CD'
-0.056923 O b'-2:lemma:100'
-0.059253 Anti b'+1:ner:_'
-0.059294 Gtype b'lemma:control'
-0.059838 O b'+1:lemma:5'
-0.060526 O b'+1:lemma:mm'
-0.060526 O b'+1:ner:KWSUPP'
-0.062165 O b'-2:lemma:n2'
-0.062994 O b'+2:lemma:sample'
-0.064112 Gtype b'postag::'
-0.064152 Phase b'+1:postag:NN'
-0.065310 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.065430 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.067318 Air b'-2:lemma:be'
-0.067945 O b'lemma:%'
-0.069829 O b'-2:lemma:%'
-0.073571 Supp b'-2:lemma:.'
-0.073571 Supp b'-2:postag:.'
-0.074914 Strain b'+2:ner:_'
-0.075674 Supp b'lemma:.'
-0.075674 Supp b'postag:.'
-0.075877 Phase b'+2:postag:CD'
-0.076960 Supp b'lemma:,'
-0.076960 Supp b'postag:,'
-0.077471 Air b'+2:postag:IN'
-0.078206 Supp b'postag:CC'
-0.081422 O b'+2:lemma:ph'
-0.082891 Med b'-2:ner:MED'
-0.083106 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.083435 O b'-1:ner:MED'
-0.084660 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.086443 O b'+1:lemma:ph'
-0.088442 O b'-2:lemma:1'
-0.089061 pH b'-2:ner:_'
-0.089516 O b'+1:lemma:.'
-0.089516 O b'+1:postag:.'
-0.090143 Air b'+1:ner:_'
-0.091059 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.091128 O b'-1:lemma:0.1'
-0.092593 Supp b'postag:IN'
-0.092751 O b'-1:lemma:harbor'
-0.093811 O b'+1:lemma:~'
-0.093879 O b'+2:lemma:media'
-0.096004 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.096036 Gtype b'+1:ner:_'
-0.096156 Supp b'-1:lemma:250'
-0.099289 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.104949 Agit b'-1:ner:_'
-0.105341 Med b'-1:postag:IN'
-0.108701 O b'-2:lemma:50'
-0.109166 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.109859 O b'lemma:ph'
-0.112597 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.114147 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.114147 Gtype b'+1:postag:,'
-0.114789 Supp b'-2:ner:_'
-0.114898 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.116395 Supp b'-2:lemma:;'
-0.117118 O b'-2:lemma:to'
-0.117118 O b'-2:postag:TO'
-0.117329 Phase b'-2:postag:NN'
-0.119074 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.120145 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.120238 O b'+2:lemma:~'
-0.122795 O b'+1:lemma:a'
-0.123732 O b'+2:lemma:agitation'
-0.125600 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.126318 Air b'+2:lemma:70'
-0.128030 O b'-1:lemma:.'
-0.128030 O b'-1:postag:.'
-0.129051 Supp b'-2:lemma:glucose'
-0.129653 Air b'+2:ner:_'
-0.131530 O b'-1:postag:VBG'
-0.133965 Supp b'+2:ner:SUPP'
-0.134897 Air b'-1:postag:CC'
-0.135425 O b'-1:lemma:mm'
-0.135805 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.136943 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.137543 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.137750 O b'lemma:150'
-0.137750 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.137750 O b'-2:lemma:concentration'
-0.139450 O b'+1:lemma:media'
-0.143171 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.145033 O b'lemma:dpd'
-0.145499 Air b'+2:lemma:or'
-0.145919 O b'lemma:medium'
-0.148137 Phase b'+2:ner:_'
-0.148143 OD b'-2:ner:_'
-0.149191 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.149695 O b'-1:lemma:~'
-0.151183 O b'+2:lemma:0.3'
-0.151269 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.153395 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.155847 O b'lemma:methanol'
-0.155847 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.158936 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.159581 O b'-2:postag:DT'
-0.161808 O b'-2:lemma:0.1'
-0.162060 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.163071 O b'+1:lemma:%'
-0.166931 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.168650 Med b'+1:postag:NN'
-0.168670 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.171437 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.172845 Supp b'-2:postag:NN'
-0.173187 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.174192 Supp b'+1:lemma:final'
-0.176044 O b'-1:lemma:0.2'
-0.179255 O b'+2:lemma:n2'
-0.180614 O b'lemma:20'
-0.180732 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.182500 O b'postag:NN'
-0.183984 Supp b'+2:postag:NN'
-0.184529 O b'-2:postag::'
-0.186395 Air b'-2:postag:CC'
-0.189252 O b'+1:lemma:minimal'
-0.190233 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.190233 O b'+1:lemma:methanol'
-0.190865 O b'-2:lemma:grow'
-0.196237 Supp b'lemma:1'
-0.197907 O b'lemma:;'
-0.197907 O b'-1:lemma:7.6'
-0.198026 O b'lemma:sample'
-0.199352 O b'lemma:dissolve'
-0.199352 O b'+2:lemma:methanol'
-0.199826 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.201372 Med b'postag:CD'
-0.201729 Supp b'-1:postag:NN'
-0.202153 Vess b'postag:NN'
-0.203069 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.204688 Air b'postag:CD'
-0.205931 O b'lemma:fecl2'
-0.209751 O b'-2:lemma:m'
-0.211554 O b'-1:lemma:with'
-0.212745 O b'-1:postag:DT'
-0.214097 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.215668 Vess b'+1:ner:_'
-0.216153 Temp b'postag:JJ'
-0.216671 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.216744 O b'-2:lemma:20'
-0.216853 Med b'-2:postag:VBN'
-0.219366 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.219466 Temp b'+1:lemma:with'
-0.219872 Vess b'-1:ner:_'
-0.220323 Supp b'+2:postag::'
-0.225224 O b'-2:lemma:o2'
-0.225688 O b'+1:postag:NNS'
-0.226565 O b'lemma:lb'
-0.231746 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.233435 O b'-1:lemma:1m'
-0.233435 O b'+2:lemma:7.6'
-0.236966 O b'-2:lemma:antibody'
-0.239511 O b'-2:lemma:of'
-0.239664 Supp b'+2:ner:_'
-0.240962 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.242378 Technique b'-2:ner:_'
-0.247060 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.256545 O b'lemma:1m'
-0.257438 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.263310 Temp b'-2:postag:CD'
-0.263656 O b'-1:lemma:final'
-0.264656 O b'lemma:7.6'
-0.264656 O b'+1:lemma:;'
-0.266859 OD b'postag:NN'
-0.266916 Supp b'lemma:10'
-0.282137 O b'lemma:m63'
-0.285097 O b'-1:lemma:minimal'
-0.290616 O b'lemma:pahse'
-0.294814 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.297200 Anti b'+2:ner:_'
-0.298486 Strain b'+1:ner:_'
-0.299122 O b'+2:lemma:follow'
-0.300114 Technique b'-2:postag:NN'
-0.301347 O b'-2:lemma:supplement'
-0.302283 O b'+2:lemma:m9'
-0.307840 O b'lemma:nacl'
-0.313866 O b'-1:postag:IN'
-0.317754 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.321915 O b'-2:lemma:dna'
-0.330214 O b'-1:lemma:ml'
-0.333803 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.334436 O b'-1:lemma:g/l'
-0.338088 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.340953 O b'+1:lemma:1m'
-0.340953 O b'-2:lemma:vol'
-0.342216 O b'-2:lemma:g/l'
-0.342827 Med b'-1:ner:_'
-0.343015 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.344654 O b'-1:lemma:fresh'
-0.346644 Air b'-1:ner:_'
-0.346912 O b'+2:lemma:co2'
-0.348612 O b'-1:lemma:the'
-0.348698 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.350624 O b'lemma:co2'
-0.351716 O b'-2:ner:SUPP'
-0.364404 Temp b'+2:lemma:with'
-0.364918 Supp b'lemma:2'
-0.372542 O b'+2:lemma:reference'
-0.378139 O b'+2:lemma:.'
-0.378139 O b'+2:postag:.'
-0.378401 O b'-1:lemma:until'
-0.379516 O b'lemma:0.2'
-0.381123 O b'-2:lemma:minimal'
-0.381129 O b'+1:postag:CD'
-0.385058 O b'+2:lemma:genome'
-0.385937 O b'+2:lemma:add'
-0.387726 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.391882 O b'-1:lemma:37'
-0.397178 O b'lemma:od600'
-0.404188 O b'lemma:minimal'
-0.408497 O b'-1:lemma:IP'
-0.414456 Med b'-1:postag:NN'
-0.442210 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.451695 O b'lemma:37'
-0.451799 O b'lemma:rifampicin'
-0.454489 Supp b'+1:lemma:,'
-0.454489 Supp b'+1:postag:,'
-0.455847 O b'-1:lemma:of'
-0.458035 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.460779 O b'+2:lemma:fnr'
-0.471075 O b'+1:lemma:until'
-0.473737 O b'-2:lemma:pahse'
-0.473915 Supp b'+2:lemma:and'
-0.480471 O b'lemma:0.1'
-0.484585 O b'+2:lemma:antibody'
-0.485971 O b'lemma:nh4cl'
-0.492206 O b'+1:postag:IN'
-0.503443 Phase b'+1:ner:_'
-0.516764 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.529169 Med b'+2:postag:VBN'
-0.534813 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.538314 O b'-2:lemma::'
-0.542729 Agit b'postag:NN'
-0.543006 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.543463 pH b'+2:ner:_'
-0.545395 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.546989 O b'+2:postag:RB'
-0.558514 O b'+1:lemma:+'
-0.560982 O b'+1:lemma:supplement'
-0.567115 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.571934 O b'-2:postag:SYM'
-0.580905 O b'+1:lemma:m'
-0.585029 O b'-2:lemma:fresh'
-0.609732 O b'postag:RB'
-0.610050 O b'+1:postag:DT'
-0.610170 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.619077 O b'+2:lemma:10'
-0.619388 Supp b'+2:postag:CC'
-0.635101 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.639230 O b'+1:lemma:hour'
-0.642311 Med b'+1:ner:MED'
-0.653871 O b'-1:lemma:vol'
-0.653871 O b'-2:lemma:1/100'
-0.653871 O b'+2:lemma:1m'
-0.674674 O b'+1:lemma:in'
-0.675519 Anti b'postag:NNP'
-0.675687 O b'-1:postag::'
-0.678026 pH b'postag:NN'
-0.690342 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.694519 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.701378 O b'+1:lemma:at'
-0.701545 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.709519 O b'-1:lemma:rpob'
-0.730430 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.741564 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.777680 O b'-2:lemma:rpob'
-0.779298 O b'-1:lemma:1'
-0.780884 O b'-2:lemma:genome'
-0.784520 Gtype b'-2:postag:CD'
-0.788682 O b'-2:lemma:dpd'
-0.792492 O b'-1:lemma:contain'
-0.798574 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.801139 Gtype b'postag:VBG'
-0.821061 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.863523 O b'+1:lemma:g/l'
-0.868993 O b'-2:postag:VBG'
-0.872831 O b'-2:lemma:until'
-0.884812 O b'-1:lemma:co2'
-0.933538 O b'-2:lemma:IP'
-0.962720 O b'+2:lemma:tag'
-1.024907 O b'lemma:mid-log'
-1.027393 O b'-2:lemma:the'
-1.027880 O b'lemma:of'
-1.055919 Technique b'+1:ner:_'
-1.060967 O b'-2:lemma:media'
-1.067125 O b'+2:lemma:anaerobically'
-1.081127 Supp b'+2:lemma:2'
-1.120519 O b'-2:lemma:aerobically'
-1.184531 O b'lemma:wt'
-1.201976 O b'-2:lemma:iptg'
-1.237296 O b'lemma:aerobic'
-1.238818 Supp b'-1:postag:NNP'
-1.252120 Temp b'postag:NN'
-1.253815 Air b'postag:NN'
-1.256772 O b'lemma:media'
-1.319701 O b'-2:ner:TF'
-1.333714 OD b'+2:lemma:aerobically'
-1.356232 Supp b'postag:JJ'
-1.375562 Supp b'+2:postag:CD'
-1.376970 O b'-1:lemma:30'
-1.409074 O b'+2:lemma:rifampicin'
-1.421350 OD b'+1:postag:NN'
-1.443437 O b'lemma:aerobically'
-1.446140 O b'lemma:30'
-1.534097 O b'+2:lemma:+'
-1.542772 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.566268 Supp b'+2:lemma:1'
-1.797619 O b'-1:lemma:ph'
-1.813666 O b'+1:lemma:2'
-1.818182 O b'+2:lemma:b'
-1.835494 O b'lemma:0.3'
-1.836499 O b'-1:lemma:2'
-1.989599 Phase b'postag:JJ'
-2.031641 O b'-2:lemma:0.3'
-2.084306 O b'-1:lemma:sample'
-2.126589 O b'+2:lemma:iptg'
-2.138431 O b'+1:lemma:1'
-3.489346 O b'-1:lemma::'
-3.797900 O b'-1:lemma:_'