report_Run13_v11.txt
40.1 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt
best params:{'c1': 0.044938026445574486, 'c2': 0.023864978593171392}
best CV score:0.8337888246126737
model size: 0.12M
Flat F1: 0.8145108182911498
precision recall f1-score support
OD 1.000 1.000 1.000 21
pH 1.000 1.000 1.000 10
Technique 1.000 1.000 1.000 33
Med 1.000 0.821 0.902 56
Temp 1.000 0.800 0.889 15
Vess 0.000 0.000 0.000 0
Agit 0.000 0.000 0.000 7
Phase 1.000 0.762 0.865 21
Air 0.895 0.386 0.540 88
Anti 0.929 1.000 0.963 13
Strain 0.000 0.000 0.000 0
Gtype 0.940 0.808 0.869 78
Substrain 0.000 0.000 0.000 0
Supp 0.859 0.853 0.856 136
Gversion 1.000 0.500 0.667 6
avg / total 0.915 0.758 0.815 484
Top likely transitions:
Temp -> Temp 5.362535
Anti -> Anti 5.062815
Med -> Med 4.986020
OD -> OD 4.457320
Phase -> Phase 4.419280
Gtype -> Gtype 4.320990
Gversion -> Gversion 4.142873
Air -> Air 3.913853
Supp -> Supp 3.549861
Technique -> Technique 3.511695
pH -> pH 3.339224
O -> O 3.089398
Substrain -> Gtype 2.020575
Agit -> Agit 1.714631
Technique -> Air 1.217547
O -> Technique 0.610924
Gtype -> pH 0.373332
O -> Gtype 0.297974
Gtype -> Supp 0.201312
Air -> O 0.143801
Anti -> O 0.131315
Temp -> O 0.011780
Med -> Air -0.000000
Phase -> Technique -0.000003
Agit -> Supp -0.000315
Strain -> Supp -0.001726
O -> Agit -0.003839
Air -> Temp -0.005184
Agit -> O -0.005433
Gtype -> Temp -0.013677
Air -> pH -0.019173
Technique -> OD -0.026750
pH -> O -0.033644
Phase -> Air -0.043394
Supp -> Gversion -0.045267
Substrain -> Supp -0.049406
Anti -> Gtype -0.058109
O -> pH -0.062425
Gtype -> Phase -0.073059
Gtype -> OD -0.082284
Med -> O -0.109509
Supp -> Temp -0.113668
O -> Temp -0.118274
Air -> Technique -0.157503
Supp -> pH -0.171209
O -> Phase -0.174534
Supp -> Phase -0.179897
Supp -> OD -0.192457
Gtype -> Anti -0.215453
Gtype -> Gversion -0.243374
O -> Gversion -0.245285
OD -> Gtype -0.254269
O -> Med -0.301097
Air -> OD -0.313693
O -> OD -0.319615
Temp -> Supp -0.356295
Supp -> Air -0.383512
O -> Supp -0.383843
Anti -> Supp -0.396088
Phase -> O -0.414747
pH -> Supp -0.472269
Gtype -> Med -0.481170
Air -> Agit -0.486581
Supp -> Technique -0.500191
Gversion -> O -0.508977
Air -> Phase -0.518752
Gtype -> Technique -0.548181
Supp -> Gtype -0.571656
O -> Anti -0.571796
Gversion -> Supp -0.629680
Phase -> Supp -0.632820
Temp -> Med -0.648442
Technique -> Supp -0.682036
Agit -> Air -0.771449
Air -> Gtype -0.794079
OD -> Supp -0.820739
Supp -> O -0.851065
Phase -> OD -0.862089
OD -> Air -0.877050
Supp -> Med -0.987466
OD -> O -1.098930
Technique -> pH -1.160399
Air -> Supp -1.310463
Gtype -> O -1.407818
Substrain -> O -1.586478
Technique -> Gtype -1.674669
O -> Air -1.804700
Med -> Supp -2.115879
Top unlikely transitions:
Temp -> Temp 5.362535
Anti -> Anti 5.062815
Med -> Med 4.986020
OD -> OD 4.457320
Phase -> Phase 4.419280
Gtype -> Gtype 4.320990
Gversion -> Gversion 4.142873
Air -> Air 3.913853
Supp -> Supp 3.549861
Technique -> Technique 3.511695
pH -> pH 3.339224
O -> O 3.089398
Substrain -> Gtype 2.020575
Agit -> Agit 1.714631
Technique -> Air 1.217547
O -> Technique 0.610924
Gtype -> pH 0.373332
O -> Gtype 0.297974
Gtype -> Supp 0.201312
Air -> O 0.143801
Anti -> O 0.131315
Temp -> O 0.011780
Med -> Air -0.000000
Phase -> Technique -0.000003
Agit -> Supp -0.000315
Strain -> Supp -0.001726
O -> Agit -0.003839
Air -> Temp -0.005184
Agit -> O -0.005433
Gtype -> Temp -0.013677
Air -> pH -0.019173
Technique -> OD -0.026750
pH -> O -0.033644
Phase -> Air -0.043394
Supp -> Gversion -0.045267
Substrain -> Supp -0.049406
Anti -> Gtype -0.058109
O -> pH -0.062425
Gtype -> Phase -0.073059
Gtype -> OD -0.082284
Med -> O -0.109509
Supp -> Temp -0.113668
O -> Temp -0.118274
Air -> Technique -0.157503
Supp -> pH -0.171209
O -> Phase -0.174534
Supp -> Phase -0.179897
Supp -> OD -0.192457
Gtype -> Anti -0.215453
Gtype -> Gversion -0.243374
O -> Gversion -0.245285
OD -> Gtype -0.254269
O -> Med -0.301097
Air -> OD -0.313693
O -> OD -0.319615
Temp -> Supp -0.356295
Supp -> Air -0.383512
O -> Supp -0.383843
Anti -> Supp -0.396088
Phase -> O -0.414747
pH -> Supp -0.472269
Gtype -> Med -0.481170
Air -> Agit -0.486581
Supp -> Technique -0.500191
Gversion -> O -0.508977
Air -> Phase -0.518752
Gtype -> Technique -0.548181
Supp -> Gtype -0.571656
O -> Anti -0.571796
Gversion -> Supp -0.629680
Phase -> Supp -0.632820
Temp -> Med -0.648442
Technique -> Supp -0.682036
Agit -> Air -0.771449
Air -> Gtype -0.794079
OD -> Supp -0.820739
Supp -> O -0.851065
Phase -> OD -0.862089
OD -> Air -0.877050
Supp -> Med -0.987466
OD -> O -1.098930
Technique -> pH -1.160399
Air -> Supp -1.310463
Gtype -> O -1.407818
Substrain -> O -1.586478
Technique -> Gtype -1.674669
O -> Air -1.804700
Med -> Supp -2.115879
Top positive:
5.862541 O b'lemma:1'
5.459093 O b'lemma:_'
5.445896 O b'lemma:2'
5.194453 Anti b'-2:lemma:antibody'
5.101253 Air b'lemma:anaerobic'
5.011248 Supp b'lemma:no3'
4.973468 O b'-2:lemma:_'
4.948372 O b'lemma:3'
4.878732 Supp b'lemma:pq'
4.812771 Phase b'lemma:mid-log'
4.643333 Technique b'lemma:chipseq'
4.449087 Gtype b'lemma:\xce\xb4fur'
4.437079 Gtype b'-2:lemma:genotype/variation'
4.366654 Gtype b'lemma:wt'
4.134358 Phase b'-2:lemma:phase'
4.048775 O b'lemma:-'
4.039699 Gtype b'lemma:\xce\xb4cra'
4.007091 Strain b'lemma:k-12'
3.902142 O b'lemma:with'
3.677190 Gtype b'-2:lemma:genotype'
3.657615 Technique b'lemma:rna-seq'
3.653974 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.622815 Gtype b'lemma:type'
3.610918 O b'lemma:Cra'
3.575303 O b'lemma:b'
3.525340 Supp b'lemma:Iron'
3.525340 Supp b'-2:lemma:Anaerobic'
3.427724 O b'lemma:.'
3.427724 O b'postag:.'
3.399033 O b'lemma:rpob'
3.340745 Phase b'lemma:stationary'
3.340745 Phase b'lemma:exponential'
3.319772 Supp b'lemma:nh4cl'
3.314000 O b'postag:VBG'
3.287847 Air b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.252857 Supp b'lemma:2h'
3.252857 Supp b'-1:lemma:additional'
3.236892 Supp b'-2:lemma:shake'
3.230115 Technique b'lemma:chip-seq'
3.176784 Supp b'lemma:acetate'
3.170396 Supp b'lemma:iptg'
3.160507 O b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.147589 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.129402 Supp b'lemma:nacl'
3.049940 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.023397 Temp b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.967441 Substrain b'lemma:mg1655'
2.947094 O b'lemma:CEL'
2.925994 Air b'-2:lemma:IP'
2.925040 O b'lemma:purr'
2.908799 O b'-2:lemma:flagtag'
2.850361 Air b'lemma:aerobic'
2.835883 Supp b'+1:lemma:2'
2.822051 Supp b'-1:ner:SUPP'
2.818958 Temp b'lemma:\xc2\xb0c'
2.792588 Supp b'-1:lemma:Cra'
2.788324 Gtype b'lemma:\xce\xb4ompr'
2.760281 pH b'lemma:ph5'
2.760281 pH b'+1:lemma:.5'
2.740587 O b'lemma:soxr'
2.740587 O b'lemma:soxs'
2.739657 O b'-1:lemma:anaerobic'
2.730914 O b'-1:lemma:tag'
2.712172 Gtype b'+1:lemma:type'
2.706368 Med b'lemma:LB'
2.703836 Air b'lemma:aerobically'
2.699443 O b'-2:lemma:myc'
2.670919 Gtype b'lemma:dfnr'
2.670343 O b'postag:IN'
2.661582 O b'lemma:rep2'
2.661582 O b'lemma:rep1'
2.660716 Gtype b'-2:lemma:affyexp'
2.642982 Med b'+2:lemma:b2'
2.641731 O b'+1:postag:RB'
2.598348 Supp b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.575213 O b'-1:lemma:glucose'
2.560420 Med b'lemma:MOPS'
2.552456 O b'-2:lemma:='
2.546422 O b'lemma:a'
2.546311 O b'lemma:trpr'
2.544041 Gtype b'-1:ner:GEN'
2.543781 O b'+2:lemma:crp'
2.538073 Supp b'+1:lemma:1'
2.536453 O b'postag::'
2.533733 Gtype b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.513911 Supp b'lemma:Adenine'
2.503612 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.494741 Supp b'+2:lemma:iptg'
2.479077 O b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.471669 O b'lemma:at'
2.466748 Med b'lemma:lb'
2.463134 O b'-1:lemma:0.3'
2.447810 O b'-2:lemma:fructose'
2.436607 O b'lemma:ompr'
2.433029 O b'postag:VBN'
2.432131 O b'-1:lemma:pq'
2.418942 Gtype b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.417495 Air b'-1:lemma:-'
2.412757 Supp b'-1:lemma:with'
2.390206 O b'-1:postag:NNS'
2.365782 Gtype b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.355890 Supp b'-2:lemma:media'
2.352400 Air b'lemma:anaeroibc'
2.341227 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.332825 Supp b'-1:lemma:+'
2.309448 Med b'lemma:m63'
2.291171 Supp b'lemma:fructose'
2.271903 O b'lemma:culture'
2.266265 Phase b'-1:lemma:mid-log'
2.254114 O b'+1:lemma:wt'
2.245494 Technique b'lemma:chip-exo'
2.242873 Supp b'-2:lemma:agent'
2.236478 O b'lemma:harbor'
2.229450 O b'+1:lemma:od600'
2.217054 Air b'postag:JJ'
2.206553 Gversion b'lemma:.2'
2.206553 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.205878 O b'-1:lemma:lb'
2.202680 O b'-1:lemma:type'
2.197009 Supp b'lemma:arginine'
2.191384 O b'-1:lemma:wt'
2.185171 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
2.176591 Supp b'+1:lemma:_'
2.151791 Phase b'+2:lemma:o.d.'
2.145391 O b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.141182 Air b'-1:lemma:co2'
2.125820 Temp b'-1:lemma:sample'
2.124804 Med b'+2:lemma:b1'
2.117784 Gtype b'lemma:arca8myc'
2.117784 Gtype b'-2:lemma:chip-arca'
2.111056 O b'lemma:argr'
2.109893 Technique b'-2:lemma:wt'
2.106373 O b'+1:lemma:pq'
2.089284 Temp b'-1:lemma:37'
2.086823 Gtype b'lemma:pk4854'
2.075230 OD b'lemma:0.3'
2.074131 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.070284 Gtype b'lemma:\xce\xb4soxr'
2.049731 Supp b'+2:lemma:rifampicin'
2.044570 Gtype b'-1:lemma:rpob'
2.041668 O b'lemma:oxyr'
2.039422 Med b'+1:lemma:0.4'
2.038972 O b'lemma:for'
2.030030 Gtype b'-1:lemma:nsrr'
2.030030 Gtype b'+1:lemma:flagtag'
2.029665 Supp b'lemma:glucose'
2.018083 Supp b'-2:lemma:argr'
2.017626 O b'-1:lemma:media'
2.007532 O b'lemma:input'
2.007532 O b'+1:lemma:chip-seq'
2.001024 Gtype b'postag:JJ'
2.000946 O b'lemma:treatment'
1.981051 Supp b'+2:lemma:feso4'
1.977894 O b'-1:lemma:min'
1.971236 Supp b'-2:lemma:10'
1.969662 Air b'-2:lemma:fnr'
1.966802 Supp b'+2:lemma:A'
1.959491 O b'lemma:affyexp'
1.956492 pH b'+1:postag:CD'
1.953764 Gtype b'+1:lemma:pq'
1.953045 Med b'lemma:media'
1.940793 Gtype b'+1:lemma:ph5'
1.940793 Gtype b'+2:lemma:.5'
1.939502 Gtype b'+1:lemma:with'
1.938940 Med b'+2:postag:CC'
1.937576 Temp b'lemma:37'
1.936265 Supp b'+1:lemma:Deficient'
1.935009 Temp b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.934643 Gtype b'-1:lemma:ptac'
1.921718 Technique b'-1:lemma:input'
1.910998 Supp b'-2:lemma:induce'
1.904319 Med b'lemma:minimal'
1.895442 Strain b'+1:lemma:substr'
1.895442 Strain b'-2:lemma:str'
1.894869 Gtype b'lemma:ptac'
1.889549 Supp b'-2:lemma:for'
1.888203 Med b'+1:lemma:2.0'
1.869060 Temp b'-1:lemma:43'
1.865301 O b'-1:lemma:aerobic'
1.862465 O b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.853525 O b'lemma:\xcf\x8332'
1.852637 Supp b'-2:postag:VBG'
1.847744 Gversion b'lemma:u00096'
1.847744 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.843907 O b'lemma:genotype/variation'
1.842841 O b'lemma:gadx'
1.840609 O b'lemma:chip'
1.832146 O b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.829991 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.829323 O b'lemma:cra'
1.818259 O b'lemma::'
1.809884 O b'-2:lemma:medium'
1.804097 Supp b'lemma:Leu'
1.804097 Supp b'-2:lemma:Lrp'
1.801863 O b'lemma:growth'
1.783160 Air b'postag:RB'
1.770635 O b'postag:DT'
1.769152 Vess b'lemma:flask'
1.769152 Vess b'-1:lemma:warm'
1.769152 Vess b'-2:lemma:pre'
1.769152 Vess b'+2:lemma:43'
1.760301 O b'-1:lemma:nacl'
1.754831 Gtype b'lemma:deltaseqa'
1.754831 Gtype b'-1:lemma:old'
1.754831 Gtype b'-2:lemma:seqa'
1.751643 O b'-1:lemma:acetate'
1.722682 Temp b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.720193 Technique b'lemma:rnaseq'
1.718792 Supp b'-1:lemma:vol'
1.718792 Supp b'-2:lemma:1/100'
1.718792 Supp b'+2:lemma:1m'
1.713158 Supp b'-1:lemma:_'
1.703653 O b'postag:CC'
1.699555 Anti b'+1:lemma:antibody'
1.698240 O b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.694447 Agit b'lemma:rpm'
1.690925 Supp b'-1:lemma:final'
1.689305 Temp b'lemma:43'
1.684994 Gversion b'-2:lemma:build'
1.672306 Agit b'-1:lemma:250'
1.669557 pH b'lemma:.5'
1.669557 pH b'-1:lemma:ph5'
1.663209 Med b'-1:lemma:in'
1.650372 O b'+2:lemma:allow'
1.637282 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.631674 O b'+1:lemma:rifampicin'
1.631348 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.624724 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.622722 Supp b'lemma:Fe'
1.621899 Technique b'-1:lemma:IP'
1.615755 O b'+1:ner:MED'
1.591765 Gtype b'lemma:fnr8myc'
1.591765 Gtype b'-2:lemma:chip-fnr'
1.591648 Gversion b'lemma:nc'
1.591648 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.584973 Air b'-1:lemma:_'
1.584371 Med b'-1:lemma:minimal'
1.571915 OD b'+2:lemma:0.3'
1.566879 O b'+1:lemma:250'
1.565981 O b'-2:lemma:overnight'
1.561713 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.547365 Med b'+2:lemma:+'
1.547095 OD b'lemma:od450'
1.541094 Strain b'-2:lemma:strain'
1.539220 OD b'postag:CD'
1.529992 O b'+1:lemma:20'
1.528332 Med b'+1:lemma:+'
1.526745 O b'+1:lemma:coli'
1.521208 Air b'-1:postag::'
1.512210 Med b'-2:lemma:medium'
1.508961 Supp b'-2:lemma:purr'
1.498170 Gtype b'+1:lemma:_'
1.495765 Gtype b'+1:lemma:control'
1.486547 O b'lemma:genotype'
1.486243 Med b'-2:lemma:minimal'
1.484209 O b'lemma:ml'
1.480660 Gtype b'lemma:wild-type'
1.471425 Air b'lemma:Anaerobic'
1.467487 O b'-2:ner:MED'
1.458412 O b'lemma:additional'
1.458412 O b'+1:lemma:2h'
1.456810 O b'-2:lemma:min'
1.454643 Gversion b'lemma:000913'
1.454643 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.447189 Phase b'-1:lemma:until'
1.435888 O b'lemma:lrp'
1.424354 O b'-2:lemma:ml'
1.414638 Vess b'-1:postag:VBN'
1.414336 O b'lemma:A'
1.407637 Supp b'+2:lemma:add'
1.403545 Med b'lemma:medium'
1.399460 Gtype b'-1:postag:VBG'
1.398942 Agit b'+1:lemma:rpm'
1.391591 Substrain b'-1:lemma:.'
1.391591 Substrain b'-1:postag:.'
1.388106 Gtype b'-1:lemma:Wild'
1.388046 Vess b'+1:lemma:at'
1.383975 Supp b'lemma:dpd'
1.376659 Med b'-1:lemma:ml'
1.375792 O b'-1:lemma:l1'
1.375355 Agit b'lemma:250'
1.373690 Agit b'+2:lemma:at'
1.373293 O b'-2:lemma:anaerobic'
1.371343 Anti b'+2:lemma:antibody'
1.367025 O b'+2:lemma:rpm'
1.364503 OD b'+1:lemma:of'
1.364446 Supp b'lemma:glutamine'
1.364446 Supp b'-1:lemma:2g/l'
1.357804 O b'+1:lemma:mid-log'
1.356648 Gtype b'lemma:phtpg'
1.353320 Air b'+2:postag:CD'
1.353063 Air b'-2:lemma:mid-log'
1.349684 Air b'-1:lemma:phase'
1.345414 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.342691 O b'-1:lemma:induce'
1.340540 Anti b'-2:lemma:polymerase'
1.336828 Technique b'lemma:-lrb-'
1.335197 Supp b'-1:lemma:30'
1.330860 O b'-1:lemma:dpd'
1.329156 Supp b'-1:lemma:ompr'
1.327827 Technique b'postag:-LRB-'
1.326538 Gversion b'-2:postag:VB'
1.323779 O b'+1:lemma::'
1.318466 O b'lemma:chip-arca'
1.318466 O b'+2:lemma:arca8myc'
1.313013 Phase b'-2:lemma:until'
1.310971 Supp b'+2:lemma:ph'
1.308065 Med b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.307656 Gtype b'-2:lemma:dna'
1.304820 Temp b'-2:lemma:keep'
1.286471 Med b'postag:NNP'
1.280283 Supp b'lemma:30'
1.276560 Air b'-2:lemma:0.3'
1.270773 OD b'+1:postag:IN'
1.268899 Med b'+1:lemma:minimal'
1.267781 OD b'-1:postag:IN'
1.247112 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.239105 O b'-1:lemma:fructose'
1.238632 O b'+1:lemma:43'
1.235077 Technique b'-1:lemma:_'
1.232469 O b'lemma:Fur'
1.228251 Supp b'lemma:rifampicin'
1.219082 O b'-1:lemma:nitrate'
1.217952 Strain b'+2:lemma:.'
1.217952 Strain b'+2:postag:.'
1.213542 pH b'lemma:5.5'
1.212762 Technique b'+1:ner:TF'
1.211360 Substrain b'+2:lemma::'
1.207765 O b'lemma:s'
1.207765 O b'-2:lemma:parameter'
1.202807 Supp b'-2:lemma:rpob'
1.197820 O b'+1:ner:SUPP'
1.197283 Supp b'lemma:0.2'
1.193383 Gtype b'+2:lemma:glucose'
1.193146 Gtype b'+1:postag::'
1.192323 O b'-1:ner:TF'
1.189274 Air b'-2:postag:CD'
1.184607 Phase b'+1:lemma:phase'
1.178697 pH b'-2:lemma:at'
1.178547 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.178295 Anti b'postag:JJ'
1.178230 OD b'lemma:od600'
1.175252 Gtype b'lemma:nsrr'
1.175252 Gtype b'+2:lemma:flagtag'
1.174936 Gtype b'-2:postag:NNS'
1.174474 Supp b'-1:postag:CD'
1.169859 Technique b'-1:lemma:1'
1.162203 Gtype b'+2:lemma:lacz'
1.161896 Supp b'+2:postag:IN'
1.161122 O b'postag:VBD'
1.153751 Gtype b'-1:lemma:phtpg'
1.153468 Vess b'-2:postag:JJ'
1.149093 O b'postag:NNS'
1.147069 O b'+2:lemma:fructose'
1.146380 OD b'-1:lemma:at'
1.144734 O b'-2:lemma:co2'
1.139064 O b'+2:lemma:constant'
1.137666 O b'postag:FW'
1.137367 Agit b'-2:lemma:aerobically'
1.135904 Substrain b'+2:postag::'
1.130721 Gtype b'-1:lemma:wild'
1.128190 Technique b'-2:lemma:strategy'
1.123846 O b'-1:lemma:-80'
1.120558 Gtype b'-1:lemma:factor'
1.120558 Gtype b'-2:lemma:transcription'
1.117392 Air b'-2:lemma:%'
1.110162 Gtype b'-2:lemma:delta'
1.105657 O b'-1:lemma:medium'
1.101576 Supp b'-2:lemma:trpr'
1.096914 Air b'+2:lemma:37'
1.094989 O b'lemma:rnase'
1.094933 Gtype b'lemma:\xce\xb4gade'
1.092503 Gtype b'-1:lemma:from'
1.090312 O b'+1:postag:NNP'
1.090264 Supp b'postag:NNP'
1.088603 Agit b'-2:postag:RB'
1.087201 Temp b'+2:postag:DT'
1.085283 O b'-1:ner:_'
1.084511 Gtype b'+2:lemma:fnr'
1.083879 Gtype b'+2:lemma:rep2'
1.083879 Gtype b'+2:lemma:rep1'
1.083790 Anti b'+2:postag:NNP'
1.078288 pH b'-1:lemma:ph'
1.073570 OD b'-1:lemma:od450'
1.073022 O b'-1:lemma:into'
1.070606 Gtype b'lemma:wild'
1.070087 Gtype b'-2:lemma:genoype'
1.067275 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.066171 Gtype b'-1:postag:VBP'
1.064513 O b'lemma:-80'
1.064513 O b'-2:lemma:freeze'
1.058444 Air b'-1:postag:CD'
1.055823 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.055823 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.054325 O b'-2:lemma:Cra'
1.054025 O b'-1:lemma:genotype'
1.052581 Supp b'-2:lemma:20'
1.039538 Temp b'+1:lemma:see'
1.038156 Supp b'+1:lemma:hour'
1.036626 Gtype b'lemma:\xce\xb4gadw'
1.036626 Gtype b'lemma:\xce\xb4gadx'
1.032495 OD b'-2:lemma:at'
1.030107 O b'-2:lemma:~'
1.030093 O b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
1.028411 O b'-2:lemma:neg'
1.027996 OD b'lemma:o.d.'
1.027996 OD b'+1:lemma:600nm'
1.026783 OD b'-2:lemma:od450'
1.026264 Gtype b'-2:postag:JJ'
1.023789 Vess b'+1:postag:IN'
1.022993 Supp b'-1:lemma:mm'
1.022785 OD b'+2:lemma:~'
1.022742 O b'lemma:chip-fnr'
1.022742 O b'+2:lemma:fnr8myc'
1.021392 OD b'-1:lemma:od600'
1.018478 Gtype b'-1:lemma:_'
1.018317 Med b'postag:NNS'
1.017049 O b'+2:lemma:of'
1.016735 Phase b'+2:lemma:follow'
1.012218 OD b'postag:IN'
1.005219 OD b'-2:lemma:phase'
0.999071 O b'-1:lemma:genotype/variation'
0.997713 O b'+2:lemma:chipseq'
0.992472 O b'lemma:be'
0.991976 Air b'+1:lemma:%'
0.990643 Supp b'-2:lemma:condition'
0.990005 Anti b'-1:lemma::'
0.989988 Med b'-2:lemma:fresh'
0.987378 O b'-1:lemma:w0002'
0.987150 Gtype b'-2:lemma:ecolus'
0.987056 Supp b'-2:ner:SUPP'
0.986158 O b'-1:lemma:mg1655'
0.979595 Anti b'-1:lemma:monoclonal'
0.979595 Anti b'+2:lemma:NeoClone'
0.978951 Supp b'-1:lemma:contain'
0.978227 O b'+1:lemma:nacl'
0.974669 Supp b'-1:lemma:soxr'
0.974669 Supp b'-1:lemma:soxs'
0.970796 Anti b'-2:lemma:\xc3\x9f'
0.970324 Strain b'-1:lemma:.'
0.970324 Strain b'-1:postag:.'
0.967832 Gtype b'-2:lemma:mg1655'
0.967312 Gtype b'-1:lemma:harbor'
0.967014 O b'-2:lemma:Leu'
0.966973 Supp b'+2:lemma:-lrb-'
0.966032 O b'-1:lemma:0.35'
0.966031 Air b'-2:lemma:cm20'
0.964534 Technique b'-2:ner:TF'
0.961943 Supp b'-2:lemma:pahse'
0.958733 Air b'+1:lemma:b'
0.954699 Technique b'postag:NNP'
0.953301 Air b'-2:postag:SYM'
0.952712 Supp b'+1:lemma:1m'
0.952712 Supp b'-2:lemma:vol'
0.950952 O b'+2:postag:JJ'
0.950898 Anti b'+1:lemma:from'
0.950595 Gtype b'+2:lemma:control'
0.949588 Gtype b'postag:-RRB-'
0.949468 Gtype b'lemma:flagtag'
0.949468 Gtype b'-2:lemma:nsrr'
0.948887 Supp b'-1:postag:IN'
0.948189 Gtype b'-2:lemma:-rcb-'
0.947773 O b'lemma:old'
0.947773 O b'-1:lemma:seqa'
0.947773 O b'+1:lemma:deltaseqa'
0.936991 OD b'lemma:of'
0.936737 Gtype b'lemma:Wild'
0.932957 O b'lemma:4'
0.931805 Gtype b'-1:lemma:vector'
0.931643 Supp b'-2:lemma:nh4cl'
0.931415 O b'+1:lemma:ph5'
0.931415 O b'+2:lemma:.5'
0.928931 Supp b'lemma:of'
0.927672 Gtype b'lemma:crp'
0.927352 Air b'-2:lemma:nh4cl'
0.926550 O b'-2:lemma:no3'
0.924787 pH b'+1:lemma:5.5'
0.920864 O b'lemma:antibody'
0.919748 Gtype b'lemma:delta-fnr'
0.918784 Gversion b'lemma:_'
0.918106 Technique b'+1:lemma:rpos'
0.916606 O b'lemma:respiration'
0.916606 O b'+2:lemma:mmol'
0.914994 Anti b'lemma:antibody'
0.913209 O b'+1:lemma:acetate'
0.909706 Med b'-1:lemma:fresh'
0.909405 O b'-1:lemma:genbank'
0.909379 Technique b'-2:postag:NNP'
0.905884 O b'-1:lemma:Iron'
0.905143 OD b'-1:lemma:of'
0.903507 Supp b'+1:lemma:deficient'
0.903374 Supp b'+2:postag:-LRB-'
0.903006 Agit b'+2:postag:IN'
0.902504 Gtype b'-1:lemma:pk4854'
0.897900 Supp b'-1:lemma:without'
0.895933 Med b'+1:lemma:g/l'
0.890164 Supp b'+1:lemma:m'
0.888964 O b'-1:lemma:nh4cl'
0.887346 Temp b'-2:lemma:see'
0.885109 O b'lemma:from'
Top negative:
-0.003951 OD b'+1:lemma:2.0'
-0.004402 O b'+1:lemma:with'
-0.005059 Supp b'-2:lemma:,'
-0.005059 Supp b'-2:postag:,'
-0.005618 Supp b'+2:lemma:mm'
-0.005618 Supp b'+2:ner:KWSUPP'
-0.005723 O b'-1:lemma:25'
-0.005744 O b'+2:lemma:the'
-0.006268 O b'-1:lemma:a'
-0.006305 O b'+2:postag:CC'
-0.006555 O b'-2:lemma:phosphate'
-0.007222 O b'+1:lemma:medium'
-0.007560 O b'-1:lemma:gadx'
-0.007611 O b'-2:lemma:at'
-0.007778 O b'lemma:final'
-0.008151 O b'-2:lemma:to'
-0.008151 O b'-2:postag:TO'
-0.008223 Supp b'-2:lemma:.'
-0.008223 Supp b'-2:postag:.'
-0.008666 Supp b'-2:postag:NN'
-0.009158 Gtype b'-1:ner:_'
-0.009507 O b'lemma:1/100'
-0.009507 O b'+1:lemma:vol'
-0.009766 O b'-1:lemma:to'
-0.009766 O b'-1:postag:TO'
-0.009880 Anti b'-1:ner:_'
-0.010065 OD b'lemma:2.0'
-0.010416 Phase b'-2:ner:_'
-0.010582 O b'-2:postag:JJ'
-0.011439 O b'+1:lemma:0.4'
-0.012165 Gtype b'+2:ner:GEN'
-0.012520 O b'+1:lemma:95'
-0.013116 OD b'+2:lemma:2.0'
-0.013236 Temp b'+2:postag:JJ'
-0.013403 Technique b'-1:postag::'
-0.013703 Air b'+2:postag:JJ'
-0.014242 Med b'+1:lemma:and'
-0.014314 O b'+1:lemma:70'
-0.014485 O b'+2:postag:VBG'
-0.014921 Air b'-1:lemma:aerobically'
-0.015726 O b'+2:postag:IN'
-0.016337 Supp b'lemma:vol'
-0.016337 Supp b'-1:lemma:1/100'
-0.016824 Anti b'-2:ner:_'
-0.016950 O b'-2:lemma:ph'
-0.018182 OD b'-2:lemma:a'
-0.019539 O b'lemma:\xc2\xb0c'
-0.020717 O b'-1:postag:CD'
-0.020732 OD b'-1:postag:NN'
-0.021412 OD b'+1:lemma:for'
-0.021825 O b'+1:lemma:antibody'
-0.022106 O b'+1:lemma:10'
-0.022129 O b'-2:lemma:for'
-0.023484 Gtype b'-1:lemma:-lrb-'
-0.028924 OD b'+1:ner:_'
-0.030650 O b'+1:lemma:dissolve'
-0.031030 Supp b'+2:postag:JJ'
-0.031956 Air b'-2:postag:VBD'
-0.032073 O b'+1:lemma:glucose'
-0.033455 O b'-1:postag:DT'
-0.034214 Air b'-2:lemma:be'
-0.035332 O b'-2:lemma:5'
-0.037412 O b'+2:lemma:then'
-0.038078 Supp b'postag::'
-0.039856 O b'+1:lemma:25'
-0.039997 O b'-1:lemma:phosphate'
-0.041170 Supp b'postag:IN'
-0.041404 Gtype b'+1:lemma:-lrb-'
-0.042938 O b'+2:lemma:use'
-0.043264 O b'+2:lemma:0.4'
-0.043695 O b'-1:lemma:in'
-0.044837 Supp b'+2:postag:NN'
-0.045330 Strain b'postag:NN'
-0.045512 Med b'lemma:-lrb-'
-0.046006 O b'+1:lemma:media'
-0.046582 O b'-2:lemma:25'
-0.047770 O b'-1:lemma:70'
-0.049216 O b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.049984 Gtype b'-1:postag:JJ'
-0.051235 O b'+2:lemma:agitation'
-0.052245 O b'lemma:phase'
-0.053211 Supp b'-1:postag:DT'
-0.054030 O b'+1:lemma:pahse'
-0.054766 O b'+2:lemma:o2'
-0.055405 O b'-2:lemma:chip-exo'
-0.055593 O b'-2:postag:RB'
-0.055727 O b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.056658 Supp b'+2:lemma:glucose'
-0.058459 Med b'postag:-LRB-'
-0.059447 O b'-2:lemma:into'
-0.060940 O b'-2:lemma:cell'
-0.061271 Anti b'-2:postag::'
-0.061298 O b'+1:lemma:o2'
-0.061530 OD b'-2:ner:_'
-0.062454 Gversion b'+2:ner:_'
-0.062874 O b'+2:lemma:rna'
-0.064466 O b'-2:lemma:rna'
-0.064764 Supp b'lemma:,'
-0.064764 Supp b'postag:,'
-0.067244 Supp b'+2:postag:NNS'
-0.067244 O b'-1:lemma:rifampicin'
-0.067301 O b'lemma:nitrate'
-0.067705 O b'-1:lemma:o2'
-0.069353 Gtype b'-1:postag:CD'
-0.069423 Supp b'-1:lemma:.'
-0.069423 Supp b'-1:postag:.'
-0.071168 O b'+1:lemma:ph'
-0.071733 O b'lemma:mg/ml'
-0.071733 O b'-1:lemma:150'
-0.071963 O b'-2:lemma:70'
-0.072612 Gtype b'+2:lemma:cra'
-0.072852 O b'lemma:o2'
-0.075433 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.075521 O b'-2:postag:IN'
-0.076023 O b'-2:lemma:-lrb-'
-0.076187 O b'+1:lemma:7.6'
-0.076187 O b'-2:lemma:1m'
-0.076187 O b'+2:lemma:;'
-0.076192 Air b'-1:lemma:grow'
-0.076246 O b'-1:lemma:sodium'
-0.076246 O b'+2:lemma:1/100'
-0.076364 O b'+2:lemma:ph'
-0.077664 OD b'-1:ner:_'
-0.080273 O b'-2:lemma:fnr'
-0.080827 O b'+2:lemma:total'
-0.081315 O b'lemma:m9'
-0.082311 O b'lemma:;'
-0.082311 O b'-1:lemma:7.6'
-0.084672 Supp b'+1:lemma:dpd'
-0.084710 O b'+1:lemma:300'
-0.085458 Supp b'-1:lemma:and'
-0.086125 O b'+1:lemma:1/100'
-0.086125 O b'-2:lemma:sodium'
-0.086125 O b'+2:lemma:vol'
-0.086429 O b'-2:lemma:m'
-0.086849 O b'-2:postag:DT'
-0.088413 Phase b'+1:postag:NN'
-0.089494 O b'+2:lemma:at'
-0.089803 Temp b'-2:postag:NN'
-0.093315 O b'+1:lemma:of'
-0.093349 O b'-1:lemma:final'
-0.095286 O b'+1:postag:VB'
-0.095907 O b'-2:postag:-RRB-'
-0.097344 O b'-1:lemma:iptg'
-0.097360 O b'+1:lemma:5'
-0.098815 Phase b'+2:postag:NN'
-0.099289 O b'lemma:%'
-0.099760 Air b'postag:CD'
-0.100445 O b'+2:lemma:media'
-0.102612 O b'-1:lemma:0.1'
-0.102992 Air b'+2:lemma:70'
-0.103231 Supp b'lemma:-rrb-'
-0.103527 Med b'+2:ner:MED'
-0.103798 Med b'-1:postag:IN'
-0.105634 O b'+1:lemma:culture'
-0.106015 O b'+1:lemma:sample'
-0.107837 Air b'-1:postag:VBN'
-0.108078 Gversion b'+1:ner:_'
-0.110157 O b'-2:lemma:o2'
-0.110463 Supp b'lemma:um'
-0.110463 Supp b'+2:lemma:paraquat'
-0.111017 Supp b'lemma:paraquat'
-0.111017 Supp b'-2:lemma:um'
-0.111573 Phase b'+2:ner:_'
-0.111728 Air b'-2:lemma:95'
-0.112628 Med b'-1:lemma:m63'
-0.113371 O b'+1:lemma:_'
-0.113409 O b'postag:NN'
-0.115644 OD b'+2:postag:NN'
-0.116858 Med b'-2:lemma:grow'
-0.116979 O b'-2:lemma:0.1'
-0.117937 O b'+2:lemma:0.2'
-0.118035 O b'+2:lemma:in'
-0.118397 Air b'-2:ner:TF'
-0.119421 Supp b'-2:lemma:glucose'
-0.120453 O b'+1:lemma:a'
-0.120727 O b'-1:lemma:with'
-0.120959 Supp b'+2:postag:NNP'
-0.121319 Supp b'-1:lemma:250'
-0.121966 O b'lemma:250'
-0.122901 Supp b'+2:lemma:dpd'
-0.124762 O b'+2:lemma:fecl2'
-0.124828 Supp b'postag:-RRB-'
-0.125069 O b'-1:lemma:.'
-0.125069 O b'-1:postag:.'
-0.125927 Med b'-2:lemma:m9'
-0.127256 O b'+1:lemma:n2'
-0.134105 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.134662 O b'-2:lemma:1'
-0.135673 O b'lemma:m'
-0.136052 O b'-1:postag:IN'
-0.139413 Gtype b'-1:lemma:-'
-0.143297 Supp b'+1:postag:VBN'
-0.148522 O b'lemma:ph'
-0.150771 Med b'+2:lemma:contain'
-0.152729 Supp b'+2:lemma:-rrb-'
-0.152810 O b'-1:lemma:mm'
-0.153164 O b'+1:lemma:2.0'
-0.153846 Gtype b'-1:lemma:,'
-0.153846 Gtype b'-1:postag:,'
-0.154113 Supp b'-2:lemma:-lrb-'
-0.155269 Supp b'lemma:.'
-0.155269 Supp b'postag:.'
-0.155982 Med b'-2:postag:IN'
-0.157155 O b'-1:lemma:-lrb-'
-0.157694 O b'-1:ner:GEN'
-0.160046 O b'+1:lemma:phase'
-0.161197 Temp b'+2:postag:IN'
-0.161624 O b'+1:lemma:b'
-0.163668 O b'-2:lemma:n2'
-0.163713 OD b'+1:lemma:0.4'
-0.164032 Strain b'-2:ner:_'
-0.164300 O b'+1:lemma:~'
-0.165151 O b'lemma:n2'
-0.166684 Agit b'-2:ner:_'
-0.167478 O b'lemma:20'
-0.168640 Supp b'-2:postag:-LRB-'
-0.169019 Med b'+1:ner:MED'
-0.170451 O b'lemma:0.1'
-0.171068 O b'+1:lemma:co2'
-0.173229 O b'+2:lemma:n2'
-0.177478 OD b'lemma:='
-0.179154 Supp b'+2:postag::'
-0.179860 O b'lemma:150'
-0.179860 O b'+1:lemma:mg/ml'
-0.179860 O b'-2:lemma:concentration'
-0.179921 Med b'+2:postag:VBG'
-0.180125 Supp b'-1:postag:VBN'
-0.180671 O b'+2:lemma:sample'
-0.183089 Air b'+2:postag:IN'
-0.186941 Supp b'+2:ner:_'
-0.187835 O b'+1:lemma:-lrb-'
-0.188398 O b'+1:lemma:genome'
-0.192382 O b'+1:lemma:contain'
-0.193157 Substrain b'-2:ner:_'
-0.195038 O b'+1:lemma:minimal'
-0.195318 O b'+2:lemma:250'
-0.199247 Med b'-2:postag:VBN'
-0.201161 Med b'+1:postag:NN'
-0.205238 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.205378 O b'-2:postag:-LRB-'
-0.206186 OD b'+2:postag:RB'
-0.207174 O b'-1:lemma:n2'
-0.209040 Gtype b'lemma:delta'
-0.211295 O b'-2:lemma:mg1655'
-0.213611 Supp b'lemma:10'
-0.216126 O b'lemma:methanol'
-0.216126 O b'-2:lemma:dissolve'
-0.222883 O b'+2:lemma:~'
-0.224244 O b'+2:lemma:37'
-0.226683 O b'-1:lemma:%'
-0.230327 OD b'postag:NN'
-0.230859 Gtype b'postag::'
-0.231699 O b'+1:lemma:fecl2'
-0.231936 O b'+1:lemma:-rrb-'
-0.232867 O b'-1:lemma:1m'
-0.232867 O b'+2:lemma:7.6'
-0.233055 Temp b'+1:postag:IN'
-0.241363 Supp b'+1:lemma:rifampicin'
-0.244390 O b'-1:lemma:mid-log'
-0.245769 Agit b'+1:ner:_'
-0.247437 Vess b'-1:ner:_'
-0.251923 O b'+1:lemma:supplement'
-0.252785 O b'-1:lemma:at'
-0.252859 O b'+2:lemma:pk4854'
-0.253542 Gtype b'+1:lemma:and'
-0.255049 O b'lemma:dissolve'
-0.255049 O b'+2:lemma:methanol'
-0.258520 O b'lemma:1m'
-0.259616 Temp b'postag:JJ'
-0.262170 Med b'-1:postag:NN'
-0.262477 Gtype b'-1:postag:NN'
-0.264199 Temp b'-2:postag:JJ'
-0.264261 O b'lemma:medium'
-0.266464 Phase b'-2:postag:NN'
-0.270119 Supp b'-1:lemma:dpd'
-0.270640 O b'-2:lemma:stir'
-0.273024 O b'lemma:pahse'
-0.274193 O b'lemma:7.6'
-0.274193 O b'+1:lemma:;'
-0.277467 O b'-1:postag:VBG'
-0.278747 Temp b'+2:ner:_'
-0.279941 O b'-2:postag::'
-0.280978 Supp b'lemma:-lrb-'
-0.281548 Med b'-2:ner:MED'
-0.281841 Anti b'+1:ner:_'
-0.281995 Phase b'-1:postag:NN'
-0.282144 O b'-1:lemma:of'
-0.284651 O b'-1:lemma:dissolve'
-0.284651 O b'+1:lemma:methanol'
-0.286831 O b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.287396 Gtype b'+1:ner:_'
-0.288714 Med b'-2:lemma:in'
-0.288984 O b'-1:lemma:rna'
-0.290093 O b'lemma:sample'
-0.295570 Gtype b'+1:postag:CC'
-0.298613 O b'-2:lemma:g/l'
-0.298681 Agit b'-1:ner:_'
-0.302045 Gtype b'-1:postag:CC'
-0.302873 O b'-2:lemma:grow'
-0.302903 Supp b'-2:lemma:treat'
-0.303019 O b'+2:lemma:co2'
-0.303756 Substrain b'+2:ner:_'
-0.306314 Technique b'-2:postag:NN'
-0.308615 O b'+1:postag:NNS'
-0.310691 O b'+1:lemma:mg1655'
-0.311214 Med b'postag:CD'
-0.313254 O b'+2:lemma:nitrate'
-0.317093 Supp b'postag:-LRB-'
-0.317680 Gtype b'+1:lemma:,'
-0.317680 Gtype b'+1:postag:,'
-0.319731 O b'-2:lemma:supplement'
-0.319926 Phase b'+1:ner:_'
-0.325910 O b'-1:lemma:harbor'
-0.328876 O b'lemma:dpd'
-0.330331 Vess b'-2:ner:_'
-0.331010 Supp b'postag:CC'
-0.336027 O b'+1:lemma:%'
-0.336511 Gtype b'+1:lemma:crp'
-0.337194 O b'lemma:co2'
-0.337896 Supp b'+1:lemma:acetate'
-0.342456 Gtype b'lemma:ompr'
-0.343277 O b'lemma:fecl2'
-0.344545 Gtype b'lemma:control'
-0.346146 O b'-1:lemma:0.2'
-0.346878 O b'+1:lemma:nitrate'
-0.350264 O b'-1:lemma:minimal'
-0.351403 Supp b'+1:lemma:-rrb-'
-0.356467 Vess b'postag:NN'
-0.357233 O b'+1:lemma:1m'
-0.357233 O b'-2:lemma:vol'
-0.362576 Supp b'+2:lemma:acetate'
-0.362647 O b'+2:lemma:0.3'
-0.367724 O b'-2:lemma:rpob'
-0.372294 O b'-1:lemma:g/l'
-0.372473 O b'+1:postag:CD'
-0.375225 O b'-1:lemma:~'
-0.376482 O b'+1:postag:-RRB-'
-0.380510 O b'-2:lemma:100'
-0.381408 Air b'-2:postag:-RRB-'
-0.383037 Temp b'+1:lemma:with'
-0.383096 Air b'-2:lemma:-rrb-'
-0.385979 Strain b'-1:ner:_'
-0.388093 Vess b'+2:ner:_'
-0.401054 Supp b'+2:lemma:and'
-0.407672 O b'-1:lemma:the'
-0.408126 Supp b'-2:postag:JJ'
-0.408669 Supp b'+2:postag:-RRB-'
-0.410426 O b'-1:postag:-LRB-'
-0.415835 Phase b'+2:postag:CD'
-0.416947 Vess b'+1:ner:_'
-0.420700 Substrain b'-1:ner:_'
-0.423156 O b'-1:lemma:fresh'
-0.423586 Supp b'+1:postag:-RRB-'
-0.426406 O b'+2:lemma:add'
-0.429470 O b'+2:lemma:10'
-0.433323 Technique b'-2:ner:_'
-0.436752 Temp b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.436996 O b'+2:lemma:rnase'
-0.439571 pH b'-2:ner:_'
-0.449543 O b'lemma:rifampicin'
-0.454074 O b'+2:lemma:-rrb-'
-0.454226 O b'-2:lemma:of'
-0.456007 O b'-2:lemma:50'
-0.459188 O b'lemma:0.2'
-0.460637 Gtype b'-2:postag:CC'
-0.466863 O b'+2:postag:RB'
-0.474700 Gtype b'-1:lemma:mg1655'
-0.483055 O b'+1:postag:-LRB-'
-0.484976 O b'+2:lemma:reference'
-0.489233 O b'lemma:lb'
-0.492231 Supp b'+2:postag:CC'
-0.494773 O b'+2:lemma:follow'
-0.495924 O b'+2:lemma:mid-log'
-0.499104 O b'+2:lemma:m9'
-0.520292 Gtype b'-2:postag:NNP'
-0.521964 O b'+1:lemma:until'
-0.522731 Supp b'-1:lemma:-lrb-'
-0.522968 O b'lemma:of'
-0.523068 O b'+2:lemma:genome'
-0.526195 O b'-1:lemma:dfnr'
-0.529613 O b'lemma:anaerobic'
-0.529950 O b'-2:lemma:fresh'
-0.530639 O b'-1:lemma:od600'
-0.533021 O b'postag:RB'
-0.537651 O b'-2:lemma:nitrate'
-0.538401 O b'+2:lemma:.'
-0.538401 O b'+2:postag:.'
-0.542116 O b'+2:postag:-RRB-'
-0.561341 Temp b'-2:postag:CD'
-0.562567 O b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.570406 O b'+1:lemma:hour'
-0.572479 O b'-2:lemma:dna'
-0.573575 Med b'-1:ner:_'
-0.575605 O b'-2:ner:SUPP'
-0.576150 O b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.581089 Supp b'-1:postag:-LRB-'
-0.587535 Strain b'+2:ner:_'
-0.588035 O b'-2:lemma::'
-0.596936 O b'-2:lemma:aerobically'
-0.607672 Strain b'+1:ner:_'
-0.611786 O b'+1:postag:IN'
-0.616207 Temp b'+2:lemma:with'
-0.616269 O b'lemma:m63'
-0.632502 Agit b'postag:NN'
-0.651595 Supp b'+1:lemma:,'
-0.651595 Supp b'+1:postag:,'
-0.660419 O b'-2:lemma:20'
-0.662658 Supp b'lemma:1'
-0.670729 Supp b'+1:lemma:-lrb-'
-0.682342 O b'-2:lemma:antibody'
-0.690015 pH b'+2:ner:_'
-0.692347 O b'+2:lemma:antibody'
-0.695229 O b'-2:postag:VBG'
-0.695999 O b'-1:lemma:vol'
-0.695999 O b'-2:lemma:1/100'
-0.695999 O b'+2:lemma:1m'
-0.697750 O b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.701761 O b'+2:lemma:anaerobically'
-0.703390 pH b'postag:NN'
-0.707635 O b'lemma:fructose'
-0.709814 Supp b'+1:postag:-LRB-'
-0.710132 O b'lemma:od600'
-0.712116 O b'-2:lemma:rifampicin'
-0.714349 O b'-2:lemma:until'
-0.744169 O b'-2:lemma:minimal'
-0.746988 O b'-1:lemma:contain'
-0.756904 O b'-1:lemma:1'
-0.759596 O b'+1:postag:DT'
-0.766646 O b'-2:lemma:pahse'
-0.774263 Phase b'-1:postag:JJ'
-0.778967 O b'+1:lemma:+'
-0.788204 O b'-2:postag:SYM'
-0.788892 Anti b'+2:ner:_'
-0.793338 Anti b'postag:NNP'
-0.795867 O b'+1:lemma:at'
-0.809862 O b'+2:lemma:fnr'
-0.810990 Supp b'+1:lemma:nacl'
-0.815662 O b'-1:lemma:ml'
-0.824162 O b'-1:lemma:IP'
-0.833220 O b'-2:lemma:the'
-0.866069 Supp b'-1:postag:NNP'
-0.879104 O b'+1:lemma:m'
-0.900319 O b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.905154 O b'lemma:37'
-0.915234 O b'-1:lemma:30'
-0.919155 O b'-1:lemma:37'
-0.920162 O b'-1:lemma:ph'
-0.925749 Supp b'+2:lemma:fructose'
-0.937338 O b'-1:lemma:until'
-0.972310 Gtype b'+1:postag:JJ'
-0.990780 Supp b'+2:postag:CD'
-0.995784 O b'+1:lemma:in'
-0.999872 O b'-2:lemma:genome'
-1.012677 Supp b'lemma:2'
-1.028473 O b'-2:lemma:iptg'
-1.039845 O b'-2:lemma:dpd'
-1.040935 O b'+2:lemma:tag'
-1.047476 O b'lemma:minimal'
-1.083860 O b'lemma:nacl'
-1.097657 Air b'postag:NN'
-1.106544 O b'lemma:nh4cl'
-1.144233 O b'+1:lemma:g/l'
-1.146258 O b'lemma:mid-log'
-1.152575 Supp b'+2:lemma:2'
-1.175881 Med b'+2:postag:VBN'
-1.195157 O b'-1:lemma:co2'
-1.213598 O b'lemma:30'
-1.237718 Supp b'+2:lemma:1'
-1.240922 Gtype b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.242473 O b'lemma:media'
-1.250147 Gtype b'-2:postag:CD'
-1.261589 O b'-1:postag::'
-1.273099 O b'-1:lemma:rpob'
-1.280640 Supp b'postag:JJ'
-1.282883 Gtype b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.304976 O b'-2:lemma:IP'
-1.319097 O b'-2:lemma:media'
-1.360481 Technique b'+1:ner:_'
-1.373385 O b'+2:lemma:+'
-1.422120 Gtype b'postag:VBG'
-1.457138 O b'-2:ner:TF'
-1.481207 OD b'+1:postag:NN'
-1.492634 O b'-1:lemma:sample'
-1.561181 O b'-1:lemma:2'
-1.677048 Temp b'postag:NN'
-1.689041 O b'lemma:aerobically'
-1.737337 O b'lemma:aerobic'
-1.749904 O b'-2:lemma:0.3'
-1.765560 O b'+1:lemma:2'
-1.841018 O b'+2:lemma:rifampicin'
-1.949972 O b'lemma:0.3'
-2.018608 O b'+2:lemma:b'
-2.041957 O b'lemma:wt'
-2.045921 Phase b'postag:JJ'
-2.215779 OD b'+2:lemma:aerobically'
-2.324186 O b'+1:lemma:1'
-2.439527 O b'+2:lemma:iptg'
-3.120529 O b'-1:lemma::'
-3.569599 O b'-1:lemma:_'