report_Run13_v11.txt 40.1 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 1141 1142 1143 1144 1145 1146 1147 1148 1149 1150 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160 1161 1162 1163 1164 1165 1166 1167 1168 1169 1170 1171 1172 1173 1174 1175 1176 1177 1178 1179 1180 1181 1182 1183 1184 1185 1186 1187 1188 1189 1190 1191 1192 1193 1194 1195 1196 1197 1198 1199 1200 1201 1202 1203 1204 1205 1206 1207 1208 1209 1210 1211 1212 1213 1214 1215 1216
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.044938026445574486, 'c2': 0.023864978593171392}
best CV score:0.8337888246126737
model size: 0.12M

Flat F1: 0.8145108182911498
             precision    recall  f1-score   support

         OD      1.000     1.000     1.000        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      1.000     0.800     0.889        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.895     0.386     0.540        88
       Anti      0.929     1.000     0.963        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.940     0.808     0.869        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.859     0.853     0.856       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.915     0.758     0.815       484


Top likely transitions:
Temp   -> Temp    5.362535
Anti   -> Anti    5.062815
Med    -> Med     4.986020
OD     -> OD      4.457320
Phase  -> Phase   4.419280
Gtype  -> Gtype   4.320990
Gversion -> Gversion 4.142873
Air    -> Air     3.913853
Supp   -> Supp    3.549861
Technique -> Technique 3.511695
pH     -> pH      3.339224
O      -> O       3.089398
Substrain -> Gtype   2.020575
Agit   -> Agit    1.714631
Technique -> Air     1.217547
O      -> Technique 0.610924
Gtype  -> pH      0.373332
O      -> Gtype   0.297974
Gtype  -> Supp    0.201312
Air    -> O       0.143801
Anti   -> O       0.131315
Temp   -> O       0.011780
Med    -> Air     -0.000000
Phase  -> Technique -0.000003
Agit   -> Supp    -0.000315
Strain -> Supp    -0.001726
O      -> Agit    -0.003839
Air    -> Temp    -0.005184
Agit   -> O       -0.005433
Gtype  -> Temp    -0.013677
Air    -> pH      -0.019173
Technique -> OD      -0.026750
pH     -> O       -0.033644
Phase  -> Air     -0.043394
Supp   -> Gversion -0.045267
Substrain -> Supp    -0.049406
Anti   -> Gtype   -0.058109
O      -> pH      -0.062425
Gtype  -> Phase   -0.073059
Gtype  -> OD      -0.082284
Med    -> O       -0.109509
Supp   -> Temp    -0.113668
O      -> Temp    -0.118274
Air    -> Technique -0.157503
Supp   -> pH      -0.171209
O      -> Phase   -0.174534
Supp   -> Phase   -0.179897
Supp   -> OD      -0.192457
Gtype  -> Anti    -0.215453
Gtype  -> Gversion -0.243374
O      -> Gversion -0.245285
OD     -> Gtype   -0.254269
O      -> Med     -0.301097
Air    -> OD      -0.313693
O      -> OD      -0.319615
Temp   -> Supp    -0.356295
Supp   -> Air     -0.383512
O      -> Supp    -0.383843
Anti   -> Supp    -0.396088
Phase  -> O       -0.414747
pH     -> Supp    -0.472269
Gtype  -> Med     -0.481170
Air    -> Agit    -0.486581
Supp   -> Technique -0.500191
Gversion -> O       -0.508977
Air    -> Phase   -0.518752
Gtype  -> Technique -0.548181
Supp   -> Gtype   -0.571656
O      -> Anti    -0.571796
Gversion -> Supp    -0.629680
Phase  -> Supp    -0.632820
Temp   -> Med     -0.648442
Technique -> Supp    -0.682036
Agit   -> Air     -0.771449
Air    -> Gtype   -0.794079
OD     -> Supp    -0.820739
Supp   -> O       -0.851065
Phase  -> OD      -0.862089
OD     -> Air     -0.877050
Supp   -> Med     -0.987466
OD     -> O       -1.098930
Technique -> pH      -1.160399
Air    -> Supp    -1.310463
Gtype  -> O       -1.407818
Substrain -> O       -1.586478
Technique -> Gtype   -1.674669
O      -> Air     -1.804700
Med    -> Supp    -2.115879


Top unlikely transitions:
Temp   -> Temp    5.362535
Anti   -> Anti    5.062815
Med    -> Med     4.986020
OD     -> OD      4.457320
Phase  -> Phase   4.419280
Gtype  -> Gtype   4.320990
Gversion -> Gversion 4.142873
Air    -> Air     3.913853
Supp   -> Supp    3.549861
Technique -> Technique 3.511695
pH     -> pH      3.339224
O      -> O       3.089398
Substrain -> Gtype   2.020575
Agit   -> Agit    1.714631
Technique -> Air     1.217547
O      -> Technique 0.610924
Gtype  -> pH      0.373332
O      -> Gtype   0.297974
Gtype  -> Supp    0.201312
Air    -> O       0.143801
Anti   -> O       0.131315
Temp   -> O       0.011780
Med    -> Air     -0.000000
Phase  -> Technique -0.000003
Agit   -> Supp    -0.000315
Strain -> Supp    -0.001726
O      -> Agit    -0.003839
Air    -> Temp    -0.005184
Agit   -> O       -0.005433
Gtype  -> Temp    -0.013677
Air    -> pH      -0.019173
Technique -> OD      -0.026750
pH     -> O       -0.033644
Phase  -> Air     -0.043394
Supp   -> Gversion -0.045267
Substrain -> Supp    -0.049406
Anti   -> Gtype   -0.058109
O      -> pH      -0.062425
Gtype  -> Phase   -0.073059
Gtype  -> OD      -0.082284
Med    -> O       -0.109509
Supp   -> Temp    -0.113668
O      -> Temp    -0.118274
Air    -> Technique -0.157503
Supp   -> pH      -0.171209
O      -> Phase   -0.174534
Supp   -> Phase   -0.179897
Supp   -> OD      -0.192457
Gtype  -> Anti    -0.215453
Gtype  -> Gversion -0.243374
O      -> Gversion -0.245285
OD     -> Gtype   -0.254269
O      -> Med     -0.301097
Air    -> OD      -0.313693
O      -> OD      -0.319615
Temp   -> Supp    -0.356295
Supp   -> Air     -0.383512
O      -> Supp    -0.383843
Anti   -> Supp    -0.396088
Phase  -> O       -0.414747
pH     -> Supp    -0.472269
Gtype  -> Med     -0.481170
Air    -> Agit    -0.486581
Supp   -> Technique -0.500191
Gversion -> O       -0.508977
Air    -> Phase   -0.518752
Gtype  -> Technique -0.548181
Supp   -> Gtype   -0.571656
O      -> Anti    -0.571796
Gversion -> Supp    -0.629680
Phase  -> Supp    -0.632820
Temp   -> Med     -0.648442
Technique -> Supp    -0.682036
Agit   -> Air     -0.771449
Air    -> Gtype   -0.794079
OD     -> Supp    -0.820739
Supp   -> O       -0.851065
Phase  -> OD      -0.862089
OD     -> Air     -0.877050
Supp   -> Med     -0.987466
OD     -> O       -1.098930
Technique -> pH      -1.160399
Air    -> Supp    -1.310463
Gtype  -> O       -1.407818
Substrain -> O       -1.586478
Technique -> Gtype   -1.674669
O      -> Air     -1.804700
Med    -> Supp    -2.115879


Top positive:
5.862541 O        b'lemma:1'
5.459093 O        b'lemma:_'
5.445896 O        b'lemma:2'
5.194453 Anti     b'-2:lemma:antibody'
5.101253 Air      b'lemma:anaerobic'
5.011248 Supp     b'lemma:no3'
4.973468 O        b'-2:lemma:_'
4.948372 O        b'lemma:3'
4.878732 Supp     b'lemma:pq'
4.812771 Phase    b'lemma:mid-log'
4.643333 Technique b'lemma:chipseq'
4.449087 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
4.437079 Gtype    b'-2:lemma:genotype/variation'
4.366654 Gtype    b'lemma:wt'
4.134358 Phase    b'-2:lemma:phase'
4.048775 O        b'lemma:-'
4.039699 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
4.007091 Strain   b'lemma:k-12'
3.902142 O        b'lemma:with'
3.677190 Gtype    b'-2:lemma:genotype'
3.657615 Technique b'lemma:rna-seq'
3.653974 Technique b'lemma:ChIP-exo'
3.622815 Gtype    b'lemma:type'
3.610918 O        b'lemma:Cra'
3.575303 O        b'lemma:b'
3.525340 Supp     b'lemma:Iron'
3.525340 Supp     b'-2:lemma:Anaerobic'
3.427724 O        b'lemma:.'
3.427724 O        b'postag:.'
3.399033 O        b'lemma:rpob'
3.340745 Phase    b'lemma:stationary'
3.340745 Phase    b'lemma:exponential'
3.319772 Supp     b'lemma:nh4cl'
3.314000 O        b'postag:VBG'
3.287847 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
3.252857 Supp     b'lemma:2h'
3.252857 Supp     b'-1:lemma:additional'
3.236892 Supp     b'-2:lemma:shake'
3.230115 Technique b'lemma:chip-seq'
3.176784 Supp     b'lemma:acetate'
3.170396 Supp     b'lemma:iptg'
3.160507 O        b'+2:lemma:\xc2\xb0c'
3.147589 Gversion b'lemma:chip-seq'
3.129402 Supp     b'lemma:nacl'
3.049940 Technique b'+2:lemma:ph5'
3.023397 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.967441 Substrain b'lemma:mg1655'
2.947094 O        b'lemma:CEL'
2.925994 Air      b'-2:lemma:IP'
2.925040 O        b'lemma:purr'
2.908799 O        b'-2:lemma:flagtag'
2.850361 Air      b'lemma:aerobic'
2.835883 Supp     b'+1:lemma:2'
2.822051 Supp     b'-1:ner:SUPP'
2.818958 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.792588 Supp     b'-1:lemma:Cra'
2.788324 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
2.760281 pH       b'lemma:ph5'
2.760281 pH       b'+1:lemma:.5'
2.740587 O        b'lemma:soxr'
2.740587 O        b'lemma:soxs'
2.739657 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.730914 O        b'-1:lemma:tag'
2.712172 Gtype    b'+1:lemma:type'
2.706368 Med      b'lemma:LB'
2.703836 Air      b'lemma:aerobically'
2.699443 O        b'-2:lemma:myc'
2.670919 Gtype    b'lemma:dfnr'
2.670343 O        b'postag:IN'
2.661582 O        b'lemma:rep2'
2.661582 O        b'lemma:rep1'
2.660716 Gtype    b'-2:lemma:affyexp'
2.642982 Med      b'+2:lemma:b2'
2.641731 O        b'+1:postag:RB'
2.598348 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
2.575213 O        b'-1:lemma:glucose'
2.560420 Med      b'lemma:MOPS'
2.552456 O        b'-2:lemma:='
2.546422 O        b'lemma:a'
2.546311 O        b'lemma:trpr'
2.544041 Gtype    b'-1:ner:GEN'
2.543781 O        b'+2:lemma:crp'
2.538073 Supp     b'+1:lemma:1'
2.536453 O        b'postag::'
2.533733 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.513911 Supp     b'lemma:Adenine'
2.503612 Substrain b'-2:lemma:substr'
2.494741 Supp     b'+2:lemma:iptg'
2.479077 O        b'-2:lemma:ChIP-Seq'
2.471669 O        b'lemma:at'
2.466748 Med      b'lemma:lb'
2.463134 O        b'-1:lemma:0.3'
2.447810 O        b'-2:lemma:fructose'
2.436607 O        b'lemma:ompr'
2.433029 O        b'postag:VBN'
2.432131 O        b'-1:lemma:pq'
2.418942 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
2.417495 Air      b'-1:lemma:-'
2.412757 Supp     b'-1:lemma:with'
2.390206 O        b'-1:postag:NNS'
2.365782 Gtype    b'lemma:\xce\xb4oxyr'
2.355890 Supp     b'-2:lemma:media'
2.352400 Air      b'lemma:anaeroibc'
2.341227 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.332825 Supp     b'-1:lemma:+'
2.309448 Med      b'lemma:m63'
2.291171 Supp     b'lemma:fructose'
2.271903 O        b'lemma:culture'
2.266265 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
2.254114 O        b'+1:lemma:wt'
2.245494 Technique b'lemma:chip-exo'
2.242873 Supp     b'-2:lemma:agent'
2.236478 O        b'lemma:harbor'
2.229450 O        b'+1:lemma:od600'
2.217054 Air      b'postag:JJ'
2.206553 Gversion b'lemma:.2'
2.206553 Gversion b'-1:lemma:u00096'
2.205878 O        b'-1:lemma:lb'
2.202680 O        b'-1:lemma:type'
2.197009 Supp     b'lemma:arginine'
2.191384 O        b'-1:lemma:wt'
2.185171 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
2.176591 Supp     b'+1:lemma:_'
2.151791 Phase    b'+2:lemma:o.d.'
2.145391 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
2.141182 Air      b'-1:lemma:co2'
2.125820 Temp     b'-1:lemma:sample'
2.124804 Med      b'+2:lemma:b1'
2.117784 Gtype    b'lemma:arca8myc'
2.117784 Gtype    b'-2:lemma:chip-arca'
2.111056 O        b'lemma:argr'
2.109893 Technique b'-2:lemma:wt'
2.106373 O        b'+1:lemma:pq'
2.089284 Temp     b'-1:lemma:37'
2.086823 Gtype    b'lemma:pk4854'
2.075230 OD       b'lemma:0.3'
2.074131 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxs'
2.070284 Gtype    b'lemma:\xce\xb4soxr'
2.049731 Supp     b'+2:lemma:rifampicin'
2.044570 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
2.041668 O        b'lemma:oxyr'
2.039422 Med      b'+1:lemma:0.4'
2.038972 O        b'lemma:for'
2.030030 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.030030 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.029665 Supp     b'lemma:glucose'
2.018083 Supp     b'-2:lemma:argr'
2.017626 O        b'-1:lemma:media'
2.007532 O        b'lemma:input'
2.007532 O        b'+1:lemma:chip-seq'
2.001024 Gtype    b'postag:JJ'
2.000946 O        b'lemma:treatment'
1.981051 Supp     b'+2:lemma:feso4'
1.977894 O        b'-1:lemma:min'
1.971236 Supp     b'-2:lemma:10'
1.969662 Air      b'-2:lemma:fnr'
1.966802 Supp     b'+2:lemma:A'
1.959491 O        b'lemma:affyexp'
1.956492 pH       b'+1:postag:CD'
1.953764 Gtype    b'+1:lemma:pq'
1.953045 Med      b'lemma:media'
1.940793 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
1.940793 Gtype    b'+2:lemma:.5'
1.939502 Gtype    b'+1:lemma:with'
1.938940 Med      b'+2:postag:CC'
1.937576 Temp     b'lemma:37'
1.936265 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
1.935009 Temp     b'-2:lemma:\xcf\x8332'
1.934643 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
1.921718 Technique b'-1:lemma:input'
1.910998 Supp     b'-2:lemma:induce'
1.904319 Med      b'lemma:minimal'
1.895442 Strain   b'+1:lemma:substr'
1.895442 Strain   b'-2:lemma:str'
1.894869 Gtype    b'lemma:ptac'
1.889549 Supp     b'-2:lemma:for'
1.888203 Med      b'+1:lemma:2.0'
1.869060 Temp     b'-1:lemma:43'
1.865301 O        b'-1:lemma:aerobic'
1.862465 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
1.853525 O        b'lemma:\xcf\x8332'
1.852637 Supp     b'-2:postag:VBG'
1.847744 Gversion b'lemma:u00096'
1.847744 Gversion b'+1:lemma:.2'
1.843907 O        b'lemma:genotype/variation'
1.842841 O        b'lemma:gadx'
1.840609 O        b'lemma:chip'
1.832146 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
1.829991 Technique b'-2:lemma:Fur'
1.829323 O        b'lemma:cra'
1.818259 O        b'lemma::'
1.809884 O        b'-2:lemma:medium'
1.804097 Supp     b'lemma:Leu'
1.804097 Supp     b'-2:lemma:Lrp'
1.801863 O        b'lemma:growth'
1.783160 Air      b'postag:RB'
1.770635 O        b'postag:DT'
1.769152 Vess     b'lemma:flask'
1.769152 Vess     b'-1:lemma:warm'
1.769152 Vess     b'-2:lemma:pre'
1.769152 Vess     b'+2:lemma:43'
1.760301 O        b'-1:lemma:nacl'
1.754831 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
1.754831 Gtype    b'-1:lemma:old'
1.754831 Gtype    b'-2:lemma:seqa'
1.751643 O        b'-1:lemma:acetate'
1.722682 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
1.720193 Technique b'lemma:rnaseq'
1.718792 Supp     b'-1:lemma:vol'
1.718792 Supp     b'-2:lemma:1/100'
1.718792 Supp     b'+2:lemma:1m'
1.713158 Supp     b'-1:lemma:_'
1.703653 O        b'postag:CC'
1.699555 Anti     b'+1:lemma:antibody'
1.698240 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
1.694447 Agit     b'lemma:rpm'
1.690925 Supp     b'-1:lemma:final'
1.689305 Temp     b'lemma:43'
1.684994 Gversion b'-2:lemma:build'
1.672306 Agit     b'-1:lemma:250'
1.669557 pH       b'lemma:.5'
1.669557 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.663209 Med      b'-1:lemma:in'
1.650372 O        b'+2:lemma:allow'
1.637282 Substrain b'lemma:mg1655star'
1.631674 O        b'+1:lemma:rifampicin'
1.631348 Gversion b'lemma:asm584v2'
1.624724 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
1.622722 Supp     b'lemma:Fe'
1.621899 Technique b'-1:lemma:IP'
1.615755 O        b'+1:ner:MED'
1.591765 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
1.591765 Gtype    b'-2:lemma:chip-fnr'
1.591648 Gversion b'lemma:nc'
1.591648 Gversion b'+2:lemma:000913'
1.584973 Air      b'-1:lemma:_'
1.584371 Med      b'-1:lemma:minimal'
1.571915 OD       b'+2:lemma:0.3'
1.566879 O        b'+1:lemma:250'
1.565981 O        b'-2:lemma:overnight'
1.561713 Technique b'-2:lemma:pt7'
1.547365 Med      b'+2:lemma:+'
1.547095 OD       b'lemma:od450'
1.541094 Strain   b'-2:lemma:strain'
1.539220 OD       b'postag:CD'
1.529992 O        b'+1:lemma:20'
1.528332 Med      b'+1:lemma:+'
1.526745 O        b'+1:lemma:coli'
1.521208 Air      b'-1:postag::'
1.512210 Med      b'-2:lemma:medium'
1.508961 Supp     b'-2:lemma:purr'
1.498170 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.495765 Gtype    b'+1:lemma:control'
1.486547 O        b'lemma:genotype'
1.486243 Med      b'-2:lemma:minimal'
1.484209 O        b'lemma:ml'
1.480660 Gtype    b'lemma:wild-type'
1.471425 Air      b'lemma:Anaerobic'
1.467487 O        b'-2:ner:MED'
1.458412 O        b'lemma:additional'
1.458412 O        b'+1:lemma:2h'
1.456810 O        b'-2:lemma:min'
1.454643 Gversion b'lemma:000913'
1.454643 Gversion b'-2:lemma:nc'
1.447189 Phase    b'-1:lemma:until'
1.435888 O        b'lemma:lrp'
1.424354 O        b'-2:lemma:ml'
1.414638 Vess     b'-1:postag:VBN'
1.414336 O        b'lemma:A'
1.407637 Supp     b'+2:lemma:add'
1.403545 Med      b'lemma:medium'
1.399460 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.398942 Agit     b'+1:lemma:rpm'
1.391591 Substrain b'-1:lemma:.'
1.391591 Substrain b'-1:postag:.'
1.388106 Gtype    b'-1:lemma:Wild'
1.388046 Vess     b'+1:lemma:at'
1.383975 Supp     b'lemma:dpd'
1.376659 Med      b'-1:lemma:ml'
1.375792 O        b'-1:lemma:l1'
1.375355 Agit     b'lemma:250'
1.373690 Agit     b'+2:lemma:at'
1.373293 O        b'-2:lemma:anaerobic'
1.371343 Anti     b'+2:lemma:antibody'
1.367025 O        b'+2:lemma:rpm'
1.364503 OD       b'+1:lemma:of'
1.364446 Supp     b'lemma:glutamine'
1.364446 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
1.357804 O        b'+1:lemma:mid-log'
1.356648 Gtype    b'lemma:phtpg'
1.353320 Air      b'+2:postag:CD'
1.353063 Air      b'-2:lemma:mid-log'
1.349684 Air      b'-1:lemma:phase'
1.345414 Gversion b'-2:lemma:genome'
1.342691 O        b'-1:lemma:induce'
1.340540 Anti     b'-2:lemma:polymerase'
1.336828 Technique b'lemma:-lrb-'
1.335197 Supp     b'-1:lemma:30'
1.330860 O        b'-1:lemma:dpd'
1.329156 Supp     b'-1:lemma:ompr'
1.327827 Technique b'postag:-LRB-'
1.326538 Gversion b'-2:postag:VB'
1.323779 O        b'+1:lemma::'
1.318466 O        b'lemma:chip-arca'
1.318466 O        b'+2:lemma:arca8myc'
1.313013 Phase    b'-2:lemma:until'
1.310971 Supp     b'+2:lemma:ph'
1.308065 Med      b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
1.307656 Gtype    b'-2:lemma:dna'
1.304820 Temp     b'-2:lemma:keep'
1.286471 Med      b'postag:NNP'
1.280283 Supp     b'lemma:30'
1.276560 Air      b'-2:lemma:0.3'
1.270773 OD       b'+1:postag:IN'
1.268899 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.267781 OD       b'-1:postag:IN'
1.247112 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
1.239105 O        b'-1:lemma:fructose'
1.238632 O        b'+1:lemma:43'
1.235077 Technique b'-1:lemma:_'
1.232469 O        b'lemma:Fur'
1.228251 Supp     b'lemma:rifampicin'
1.219082 O        b'-1:lemma:nitrate'
1.217952 Strain   b'+2:lemma:.'
1.217952 Strain   b'+2:postag:.'
1.213542 pH       b'lemma:5.5'
1.212762 Technique b'+1:ner:TF'
1.211360 Substrain b'+2:lemma::'
1.207765 O        b'lemma:s'
1.207765 O        b'-2:lemma:parameter'
1.202807 Supp     b'-2:lemma:rpob'
1.197820 O        b'+1:ner:SUPP'
1.197283 Supp     b'lemma:0.2'
1.193383 Gtype    b'+2:lemma:glucose'
1.193146 Gtype    b'+1:postag::'
1.192323 O        b'-1:ner:TF'
1.189274 Air      b'-2:postag:CD'
1.184607 Phase    b'+1:lemma:phase'
1.178697 pH       b'-2:lemma:at'
1.178547 Technique b'-2:lemma:Nac'
1.178295 Anti     b'postag:JJ'
1.178230 OD       b'lemma:od600'
1.175252 Gtype    b'lemma:nsrr'
1.175252 Gtype    b'+2:lemma:flagtag'
1.174936 Gtype    b'-2:postag:NNS'
1.174474 Supp     b'-1:postag:CD'
1.169859 Technique b'-1:lemma:1'
1.162203 Gtype    b'+2:lemma:lacz'
1.161896 Supp     b'+2:postag:IN'
1.161122 O        b'postag:VBD'
1.153751 Gtype    b'-1:lemma:phtpg'
1.153468 Vess     b'-2:postag:JJ'
1.149093 O        b'postag:NNS'
1.147069 O        b'+2:lemma:fructose'
1.146380 OD       b'-1:lemma:at'
1.144734 O        b'-2:lemma:co2'
1.139064 O        b'+2:lemma:constant'
1.137666 O        b'postag:FW'
1.137367 Agit     b'-2:lemma:aerobically'
1.135904 Substrain b'+2:postag::'
1.130721 Gtype    b'-1:lemma:wild'
1.128190 Technique b'-2:lemma:strategy'
1.123846 O        b'-1:lemma:-80'
1.120558 Gtype    b'-1:lemma:factor'
1.120558 Gtype    b'-2:lemma:transcription'
1.117392 Air      b'-2:lemma:%'
1.110162 Gtype    b'-2:lemma:delta'
1.105657 O        b'-1:lemma:medium'
1.101576 Supp     b'-2:lemma:trpr'
1.096914 Air      b'+2:lemma:37'
1.094989 O        b'lemma:rnase'
1.094933 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gade'
1.092503 Gtype    b'-1:lemma:from'
1.090312 O        b'+1:postag:NNP'
1.090264 Supp     b'postag:NNP'
1.088603 Agit     b'-2:postag:RB'
1.087201 Temp     b'+2:postag:DT'
1.085283 O        b'-1:ner:_'
1.084511 Gtype    b'+2:lemma:fnr'
1.083879 Gtype    b'+2:lemma:rep2'
1.083879 Gtype    b'+2:lemma:rep1'
1.083790 Anti     b'+2:postag:NNP'
1.078288 pH       b'-1:lemma:ph'
1.073570 OD       b'-1:lemma:od450'
1.073022 O        b'-1:lemma:into'
1.070606 Gtype    b'lemma:wild'
1.070087 Gtype    b'-2:lemma:genoype'
1.067275 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
1.066171 Gtype    b'-1:postag:VBP'
1.064513 O        b'lemma:-80'
1.064513 O        b'-2:lemma:freeze'
1.058444 Air      b'-1:postag:CD'
1.055823 Gversion b'-1:lemma:nc'
1.055823 Gversion b'+1:lemma:000913'
1.054325 O        b'-2:lemma:Cra'
1.054025 O        b'-1:lemma:genotype'
1.052581 Supp     b'-2:lemma:20'
1.039538 Temp     b'+1:lemma:see'
1.038156 Supp     b'+1:lemma:hour'
1.036626 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gadw'
1.036626 Gtype    b'lemma:\xce\xb4gadx'
1.032495 OD       b'-2:lemma:at'
1.030107 O        b'-2:lemma:~'
1.030093 O        b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
1.028411 O        b'-2:lemma:neg'
1.027996 OD       b'lemma:o.d.'
1.027996 OD       b'+1:lemma:600nm'
1.026783 OD       b'-2:lemma:od450'
1.026264 Gtype    b'-2:postag:JJ'
1.023789 Vess     b'+1:postag:IN'
1.022993 Supp     b'-1:lemma:mm'
1.022785 OD       b'+2:lemma:~'
1.022742 O        b'lemma:chip-fnr'
1.022742 O        b'+2:lemma:fnr8myc'
1.021392 OD       b'-1:lemma:od600'
1.018478 Gtype    b'-1:lemma:_'
1.018317 Med      b'postag:NNS'
1.017049 O        b'+2:lemma:of'
1.016735 Phase    b'+2:lemma:follow'
1.012218 OD       b'postag:IN'
1.005219 OD       b'-2:lemma:phase'
0.999071 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
0.997713 O        b'+2:lemma:chipseq'
0.992472 O        b'lemma:be'
0.991976 Air      b'+1:lemma:%'
0.990643 Supp     b'-2:lemma:condition'
0.990005 Anti     b'-1:lemma::'
0.989988 Med      b'-2:lemma:fresh'
0.987378 O        b'-1:lemma:w0002'
0.987150 Gtype    b'-2:lemma:ecolus'
0.987056 Supp     b'-2:ner:SUPP'
0.986158 O        b'-1:lemma:mg1655'
0.979595 Anti     b'-1:lemma:monoclonal'
0.979595 Anti     b'+2:lemma:NeoClone'
0.978951 Supp     b'-1:lemma:contain'
0.978227 O        b'+1:lemma:nacl'
0.974669 Supp     b'-1:lemma:soxr'
0.974669 Supp     b'-1:lemma:soxs'
0.970796 Anti     b'-2:lemma:\xc3\x9f'
0.970324 Strain   b'-1:lemma:.'
0.970324 Strain   b'-1:postag:.'
0.967832 Gtype    b'-2:lemma:mg1655'
0.967312 Gtype    b'-1:lemma:harbor'
0.967014 O        b'-2:lemma:Leu'
0.966973 Supp     b'+2:lemma:-lrb-'
0.966032 O        b'-1:lemma:0.35'
0.966031 Air      b'-2:lemma:cm20'
0.964534 Technique b'-2:ner:TF'
0.961943 Supp     b'-2:lemma:pahse'
0.958733 Air      b'+1:lemma:b'
0.954699 Technique b'postag:NNP'
0.953301 Air      b'-2:postag:SYM'
0.952712 Supp     b'+1:lemma:1m'
0.952712 Supp     b'-2:lemma:vol'
0.950952 O        b'+2:postag:JJ'
0.950898 Anti     b'+1:lemma:from'
0.950595 Gtype    b'+2:lemma:control'
0.949588 Gtype    b'postag:-RRB-'
0.949468 Gtype    b'lemma:flagtag'
0.949468 Gtype    b'-2:lemma:nsrr'
0.948887 Supp     b'-1:postag:IN'
0.948189 Gtype    b'-2:lemma:-rcb-'
0.947773 O        b'lemma:old'
0.947773 O        b'-1:lemma:seqa'
0.947773 O        b'+1:lemma:deltaseqa'
0.936991 OD       b'lemma:of'
0.936737 Gtype    b'lemma:Wild'
0.932957 O        b'lemma:4'
0.931805 Gtype    b'-1:lemma:vector'
0.931643 Supp     b'-2:lemma:nh4cl'
0.931415 O        b'+1:lemma:ph5'
0.931415 O        b'+2:lemma:.5'
0.928931 Supp     b'lemma:of'
0.927672 Gtype    b'lemma:crp'
0.927352 Air      b'-2:lemma:nh4cl'
0.926550 O        b'-2:lemma:no3'
0.924787 pH       b'+1:lemma:5.5'
0.920864 O        b'lemma:antibody'
0.919748 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
0.918784 Gversion b'lemma:_'
0.918106 Technique b'+1:lemma:rpos'
0.916606 O        b'lemma:respiration'
0.916606 O        b'+2:lemma:mmol'
0.914994 Anti     b'lemma:antibody'
0.913209 O        b'+1:lemma:acetate'
0.909706 Med      b'-1:lemma:fresh'
0.909405 O        b'-1:lemma:genbank'
0.909379 Technique b'-2:postag:NNP'
0.905884 O        b'-1:lemma:Iron'
0.905143 OD       b'-1:lemma:of'
0.903507 Supp     b'+1:lemma:deficient'
0.903374 Supp     b'+2:postag:-LRB-'
0.903006 Agit     b'+2:postag:IN'
0.902504 Gtype    b'-1:lemma:pk4854'
0.897900 Supp     b'-1:lemma:without'
0.895933 Med      b'+1:lemma:g/l'
0.890164 Supp     b'+1:lemma:m'
0.888964 O        b'-1:lemma:nh4cl'
0.887346 Temp     b'-2:lemma:see'
0.885109 O        b'lemma:from'


Top negative:
-0.003951 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.004402 O        b'+1:lemma:with'
-0.005059 Supp     b'-2:lemma:,'
-0.005059 Supp     b'-2:postag:,'
-0.005618 Supp     b'+2:lemma:mm'
-0.005618 Supp     b'+2:ner:KWSUPP'
-0.005723 O        b'-1:lemma:25'
-0.005744 O        b'+2:lemma:the'
-0.006268 O        b'-1:lemma:a'
-0.006305 O        b'+2:postag:CC'
-0.006555 O        b'-2:lemma:phosphate'
-0.007222 O        b'+1:lemma:medium'
-0.007560 O        b'-1:lemma:gadx'
-0.007611 O        b'-2:lemma:at'
-0.007778 O        b'lemma:final'
-0.008151 O        b'-2:lemma:to'
-0.008151 O        b'-2:postag:TO'
-0.008223 Supp     b'-2:lemma:.'
-0.008223 Supp     b'-2:postag:.'
-0.008666 Supp     b'-2:postag:NN'
-0.009158 Gtype    b'-1:ner:_'
-0.009507 O        b'lemma:1/100'
-0.009507 O        b'+1:lemma:vol'
-0.009766 O        b'-1:lemma:to'
-0.009766 O        b'-1:postag:TO'
-0.009880 Anti     b'-1:ner:_'
-0.010065 OD       b'lemma:2.0'
-0.010416 Phase    b'-2:ner:_'
-0.010582 O        b'-2:postag:JJ'
-0.011439 O        b'+1:lemma:0.4'
-0.012165 Gtype    b'+2:ner:GEN'
-0.012520 O        b'+1:lemma:95'
-0.013116 OD       b'+2:lemma:2.0'
-0.013236 Temp     b'+2:postag:JJ'
-0.013403 Technique b'-1:postag::'
-0.013703 Air      b'+2:postag:JJ'
-0.014242 Med      b'+1:lemma:and'
-0.014314 O        b'+1:lemma:70'
-0.014485 O        b'+2:postag:VBG'
-0.014921 Air      b'-1:lemma:aerobically'
-0.015726 O        b'+2:postag:IN'
-0.016337 Supp     b'lemma:vol'
-0.016337 Supp     b'-1:lemma:1/100'
-0.016824 Anti     b'-2:ner:_'
-0.016950 O        b'-2:lemma:ph'
-0.018182 OD       b'-2:lemma:a'
-0.019539 O        b'lemma:\xc2\xb0c'
-0.020717 O        b'-1:postag:CD'
-0.020732 OD       b'-1:postag:NN'
-0.021412 OD       b'+1:lemma:for'
-0.021825 O        b'+1:lemma:antibody'
-0.022106 O        b'+1:lemma:10'
-0.022129 O        b'-2:lemma:for'
-0.023484 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.028924 OD       b'+1:ner:_'
-0.030650 O        b'+1:lemma:dissolve'
-0.031030 Supp     b'+2:postag:JJ'
-0.031956 Air      b'-2:postag:VBD'
-0.032073 O        b'+1:lemma:glucose'
-0.033455 O        b'-1:postag:DT'
-0.034214 Air      b'-2:lemma:be'
-0.035332 O        b'-2:lemma:5'
-0.037412 O        b'+2:lemma:then'
-0.038078 Supp     b'postag::'
-0.039856 O        b'+1:lemma:25'
-0.039997 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.041170 Supp     b'postag:IN'
-0.041404 Gtype    b'+1:lemma:-lrb-'
-0.042938 O        b'+2:lemma:use'
-0.043264 O        b'+2:lemma:0.4'
-0.043695 O        b'-1:lemma:in'
-0.044837 Supp     b'+2:postag:NN'
-0.045330 Strain   b'postag:NN'
-0.045512 Med      b'lemma:-lrb-'
-0.046006 O        b'+1:lemma:media'
-0.046582 O        b'-2:lemma:25'
-0.047770 O        b'-1:lemma:70'
-0.049216 O        b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.049984 Gtype    b'-1:postag:JJ'
-0.051235 O        b'+2:lemma:agitation'
-0.052245 O        b'lemma:phase'
-0.053211 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.054030 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.054766 O        b'+2:lemma:o2'
-0.055405 O        b'-2:lemma:chip-exo'
-0.055593 O        b'-2:postag:RB'
-0.055727 O        b'-2:lemma:\xc2\xb0c'
-0.056658 Supp     b'+2:lemma:glucose'
-0.058459 Med      b'postag:-LRB-'
-0.059447 O        b'-2:lemma:into'
-0.060940 O        b'-2:lemma:cell'
-0.061271 Anti     b'-2:postag::'
-0.061298 O        b'+1:lemma:o2'
-0.061530 OD       b'-2:ner:_'
-0.062454 Gversion b'+2:ner:_'
-0.062874 O        b'+2:lemma:rna'
-0.064466 O        b'-2:lemma:rna'
-0.064764 Supp     b'lemma:,'
-0.064764 Supp     b'postag:,'
-0.067244 Supp     b'+2:postag:NNS'
-0.067244 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.067301 O        b'lemma:nitrate'
-0.067705 O        b'-1:lemma:o2'
-0.069353 Gtype    b'-1:postag:CD'
-0.069423 Supp     b'-1:lemma:.'
-0.069423 Supp     b'-1:postag:.'
-0.071168 O        b'+1:lemma:ph'
-0.071733 O        b'lemma:mg/ml'
-0.071733 O        b'-1:lemma:150'
-0.071963 O        b'-2:lemma:70'
-0.072612 Gtype    b'+2:lemma:cra'
-0.072852 O        b'lemma:o2'
-0.075433 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.075521 O        b'-2:postag:IN'
-0.076023 O        b'-2:lemma:-lrb-'
-0.076187 O        b'+1:lemma:7.6'
-0.076187 O        b'-2:lemma:1m'
-0.076187 O        b'+2:lemma:;'
-0.076192 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.076246 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.076246 O        b'+2:lemma:1/100'
-0.076364 O        b'+2:lemma:ph'
-0.077664 OD       b'-1:ner:_'
-0.080273 O        b'-2:lemma:fnr'
-0.080827 O        b'+2:lemma:total'
-0.081315 O        b'lemma:m9'
-0.082311 O        b'lemma:;'
-0.082311 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.084672 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.084710 O        b'+1:lemma:300'
-0.085458 Supp     b'-1:lemma:and'
-0.086125 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.086125 O        b'-2:lemma:sodium'
-0.086125 O        b'+2:lemma:vol'
-0.086429 O        b'-2:lemma:m'
-0.086849 O        b'-2:postag:DT'
-0.088413 Phase    b'+1:postag:NN'
-0.089494 O        b'+2:lemma:at'
-0.089803 Temp     b'-2:postag:NN'
-0.093315 O        b'+1:lemma:of'
-0.093349 O        b'-1:lemma:final'
-0.095286 O        b'+1:postag:VB'
-0.095907 O        b'-2:postag:-RRB-'
-0.097344 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.097360 O        b'+1:lemma:5'
-0.098815 Phase    b'+2:postag:NN'
-0.099289 O        b'lemma:%'
-0.099760 Air      b'postag:CD'
-0.100445 O        b'+2:lemma:media'
-0.102612 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.102992 Air      b'+2:lemma:70'
-0.103231 Supp     b'lemma:-rrb-'
-0.103527 Med      b'+2:ner:MED'
-0.103798 Med      b'-1:postag:IN'
-0.105634 O        b'+1:lemma:culture'
-0.106015 O        b'+1:lemma:sample'
-0.107837 Air      b'-1:postag:VBN'
-0.108078 Gversion b'+1:ner:_'
-0.110157 O        b'-2:lemma:o2'
-0.110463 Supp     b'lemma:um'
-0.110463 Supp     b'+2:lemma:paraquat'
-0.111017 Supp     b'lemma:paraquat'
-0.111017 Supp     b'-2:lemma:um'
-0.111573 Phase    b'+2:ner:_'
-0.111728 Air      b'-2:lemma:95'
-0.112628 Med      b'-1:lemma:m63'
-0.113371 O        b'+1:lemma:_'
-0.113409 O        b'postag:NN'
-0.115644 OD       b'+2:postag:NN'
-0.116858 Med      b'-2:lemma:grow'
-0.116979 O        b'-2:lemma:0.1'
-0.117937 O        b'+2:lemma:0.2'
-0.118035 O        b'+2:lemma:in'
-0.118397 Air      b'-2:ner:TF'
-0.119421 Supp     b'-2:lemma:glucose'
-0.120453 O        b'+1:lemma:a'
-0.120727 O        b'-1:lemma:with'
-0.120959 Supp     b'+2:postag:NNP'
-0.121319 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.121966 O        b'lemma:250'
-0.122901 Supp     b'+2:lemma:dpd'
-0.124762 O        b'+2:lemma:fecl2'
-0.124828 Supp     b'postag:-RRB-'
-0.125069 O        b'-1:lemma:.'
-0.125069 O        b'-1:postag:.'
-0.125927 Med      b'-2:lemma:m9'
-0.127256 O        b'+1:lemma:n2'
-0.134105 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.134662 O        b'-2:lemma:1'
-0.135673 O        b'lemma:m'
-0.136052 O        b'-1:postag:IN'
-0.139413 Gtype    b'-1:lemma:-'
-0.143297 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.148522 O        b'lemma:ph'
-0.150771 Med      b'+2:lemma:contain'
-0.152729 Supp     b'+2:lemma:-rrb-'
-0.152810 O        b'-1:lemma:mm'
-0.153164 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.153846 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.153846 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.154113 Supp     b'-2:lemma:-lrb-'
-0.155269 Supp     b'lemma:.'
-0.155269 Supp     b'postag:.'
-0.155982 Med      b'-2:postag:IN'
-0.157155 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.157694 O        b'-1:ner:GEN'
-0.160046 O        b'+1:lemma:phase'
-0.161197 Temp     b'+2:postag:IN'
-0.161624 O        b'+1:lemma:b'
-0.163668 O        b'-2:lemma:n2'
-0.163713 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.164032 Strain   b'-2:ner:_'
-0.164300 O        b'+1:lemma:~'
-0.165151 O        b'lemma:n2'
-0.166684 Agit     b'-2:ner:_'
-0.167478 O        b'lemma:20'
-0.168640 Supp     b'-2:postag:-LRB-'
-0.169019 Med      b'+1:ner:MED'
-0.170451 O        b'lemma:0.1'
-0.171068 O        b'+1:lemma:co2'
-0.173229 O        b'+2:lemma:n2'
-0.177478 OD       b'lemma:='
-0.179154 Supp     b'+2:postag::'
-0.179860 O        b'lemma:150'
-0.179860 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.179860 O        b'-2:lemma:concentration'
-0.179921 Med      b'+2:postag:VBG'
-0.180125 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.180671 O        b'+2:lemma:sample'
-0.183089 Air      b'+2:postag:IN'
-0.186941 Supp     b'+2:ner:_'
-0.187835 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.188398 O        b'+1:lemma:genome'
-0.192382 O        b'+1:lemma:contain'
-0.193157 Substrain b'-2:ner:_'
-0.195038 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.195318 O        b'+2:lemma:250'
-0.199247 Med      b'-2:postag:VBN'
-0.201161 Med      b'+1:postag:NN'
-0.205238 Gversion b'-2:postag:NN'
-0.205378 O        b'-2:postag:-LRB-'
-0.206186 OD       b'+2:postag:RB'
-0.207174 O        b'-1:lemma:n2'
-0.209040 Gtype    b'lemma:delta'
-0.211295 O        b'-2:lemma:mg1655'
-0.213611 Supp     b'lemma:10'
-0.216126 O        b'lemma:methanol'
-0.216126 O        b'-2:lemma:dissolve'
-0.222883 O        b'+2:lemma:~'
-0.224244 O        b'+2:lemma:37'
-0.226683 O        b'-1:lemma:%'
-0.230327 OD       b'postag:NN'
-0.230859 Gtype    b'postag::'
-0.231699 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.231936 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.232867 O        b'-1:lemma:1m'
-0.232867 O        b'+2:lemma:7.6'
-0.233055 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.241363 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.244390 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.245769 Agit     b'+1:ner:_'
-0.247437 Vess     b'-1:ner:_'
-0.251923 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.252785 O        b'-1:lemma:at'
-0.252859 O        b'+2:lemma:pk4854'
-0.253542 Gtype    b'+1:lemma:and'
-0.255049 O        b'lemma:dissolve'
-0.255049 O        b'+2:lemma:methanol'
-0.258520 O        b'lemma:1m'
-0.259616 Temp     b'postag:JJ'
-0.262170 Med      b'-1:postag:NN'
-0.262477 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.264199 Temp     b'-2:postag:JJ'
-0.264261 O        b'lemma:medium'
-0.266464 Phase    b'-2:postag:NN'
-0.270119 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.270640 O        b'-2:lemma:stir'
-0.273024 O        b'lemma:pahse'
-0.274193 O        b'lemma:7.6'
-0.274193 O        b'+1:lemma:;'
-0.277467 O        b'-1:postag:VBG'
-0.278747 Temp     b'+2:ner:_'
-0.279941 O        b'-2:postag::'
-0.280978 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.281548 Med      b'-2:ner:MED'
-0.281841 Anti     b'+1:ner:_'
-0.281995 Phase    b'-1:postag:NN'
-0.282144 O        b'-1:lemma:of'
-0.284651 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.284651 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.286831 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.287396 Gtype    b'+1:ner:_'
-0.288714 Med      b'-2:lemma:in'
-0.288984 O        b'-1:lemma:rna'
-0.290093 O        b'lemma:sample'
-0.295570 Gtype    b'+1:postag:CC'
-0.298613 O        b'-2:lemma:g/l'
-0.298681 Agit     b'-1:ner:_'
-0.302045 Gtype    b'-1:postag:CC'
-0.302873 O        b'-2:lemma:grow'
-0.302903 Supp     b'-2:lemma:treat'
-0.303019 O        b'+2:lemma:co2'
-0.303756 Substrain b'+2:ner:_'
-0.306314 Technique b'-2:postag:NN'
-0.308615 O        b'+1:postag:NNS'
-0.310691 O        b'+1:lemma:mg1655'
-0.311214 Med      b'postag:CD'
-0.313254 O        b'+2:lemma:nitrate'
-0.317093 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.317680 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.317680 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.319731 O        b'-2:lemma:supplement'
-0.319926 Phase    b'+1:ner:_'
-0.325910 O        b'-1:lemma:harbor'
-0.328876 O        b'lemma:dpd'
-0.330331 Vess     b'-2:ner:_'
-0.331010 Supp     b'postag:CC'
-0.336027 O        b'+1:lemma:%'
-0.336511 Gtype    b'+1:lemma:crp'
-0.337194 O        b'lemma:co2'
-0.337896 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-0.342456 Gtype    b'lemma:ompr'
-0.343277 O        b'lemma:fecl2'
-0.344545 Gtype    b'lemma:control'
-0.346146 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.346878 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.350264 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.351403 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.356467 Vess     b'postag:NN'
-0.357233 O        b'+1:lemma:1m'
-0.357233 O        b'-2:lemma:vol'
-0.362576 Supp     b'+2:lemma:acetate'
-0.362647 O        b'+2:lemma:0.3'
-0.367724 O        b'-2:lemma:rpob'
-0.372294 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.372473 O        b'+1:postag:CD'
-0.375225 O        b'-1:lemma:~'
-0.376482 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.380510 O        b'-2:lemma:100'
-0.381408 Air      b'-2:postag:-RRB-'
-0.383037 Temp     b'+1:lemma:with'
-0.383096 Air      b'-2:lemma:-rrb-'
-0.385979 Strain   b'-1:ner:_'
-0.388093 Vess     b'+2:ner:_'
-0.401054 Supp     b'+2:lemma:and'
-0.407672 O        b'-1:lemma:the'
-0.408126 Supp     b'-2:postag:JJ'
-0.408669 Supp     b'+2:postag:-RRB-'
-0.410426 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.415835 Phase    b'+2:postag:CD'
-0.416947 Vess     b'+1:ner:_'
-0.420700 Substrain b'-1:ner:_'
-0.423156 O        b'-1:lemma:fresh'
-0.423586 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.426406 O        b'+2:lemma:add'
-0.429470 O        b'+2:lemma:10'
-0.433323 Technique b'-2:ner:_'
-0.436752 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.436996 O        b'+2:lemma:rnase'
-0.439571 pH       b'-2:ner:_'
-0.449543 O        b'lemma:rifampicin'
-0.454074 O        b'+2:lemma:-rrb-'
-0.454226 O        b'-2:lemma:of'
-0.456007 O        b'-2:lemma:50'
-0.459188 O        b'lemma:0.2'
-0.460637 Gtype    b'-2:postag:CC'
-0.466863 O        b'+2:postag:RB'
-0.474700 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.483055 O        b'+1:postag:-LRB-'
-0.484976 O        b'+2:lemma:reference'
-0.489233 O        b'lemma:lb'
-0.492231 Supp     b'+2:postag:CC'
-0.494773 O        b'+2:lemma:follow'
-0.495924 O        b'+2:lemma:mid-log'
-0.499104 O        b'+2:lemma:m9'
-0.520292 Gtype    b'-2:postag:NNP'
-0.521964 O        b'+1:lemma:until'
-0.522731 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.522968 O        b'lemma:of'
-0.523068 O        b'+2:lemma:genome'
-0.526195 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.529613 O        b'lemma:anaerobic'
-0.529950 O        b'-2:lemma:fresh'
-0.530639 O        b'-1:lemma:od600'
-0.533021 O        b'postag:RB'
-0.537651 O        b'-2:lemma:nitrate'
-0.538401 O        b'+2:lemma:.'
-0.538401 O        b'+2:postag:.'
-0.542116 O        b'+2:postag:-RRB-'
-0.561341 Temp     b'-2:postag:CD'
-0.562567 O        b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.570406 O        b'+1:lemma:hour'
-0.572479 O        b'-2:lemma:dna'
-0.573575 Med      b'-1:ner:_'
-0.575605 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.576150 O        b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.581089 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.587535 Strain   b'+2:ner:_'
-0.588035 O        b'-2:lemma::'
-0.596936 O        b'-2:lemma:aerobically'
-0.607672 Strain   b'+1:ner:_'
-0.611786 O        b'+1:postag:IN'
-0.616207 Temp     b'+2:lemma:with'
-0.616269 O        b'lemma:m63'
-0.632502 Agit     b'postag:NN'
-0.651595 Supp     b'+1:lemma:,'
-0.651595 Supp     b'+1:postag:,'
-0.660419 O        b'-2:lemma:20'
-0.662658 Supp     b'lemma:1'
-0.670729 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.682342 O        b'-2:lemma:antibody'
-0.690015 pH       b'+2:ner:_'
-0.692347 O        b'+2:lemma:antibody'
-0.695229 O        b'-2:postag:VBG'
-0.695999 O        b'-1:lemma:vol'
-0.695999 O        b'-2:lemma:1/100'
-0.695999 O        b'+2:lemma:1m'
-0.697750 O        b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.701761 O        b'+2:lemma:anaerobically'
-0.703390 pH       b'postag:NN'
-0.707635 O        b'lemma:fructose'
-0.709814 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.710132 O        b'lemma:od600'
-0.712116 O        b'-2:lemma:rifampicin'
-0.714349 O        b'-2:lemma:until'
-0.744169 O        b'-2:lemma:minimal'
-0.746988 O        b'-1:lemma:contain'
-0.756904 O        b'-1:lemma:1'
-0.759596 O        b'+1:postag:DT'
-0.766646 O        b'-2:lemma:pahse'
-0.774263 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.778967 O        b'+1:lemma:+'
-0.788204 O        b'-2:postag:SYM'
-0.788892 Anti     b'+2:ner:_'
-0.793338 Anti     b'postag:NNP'
-0.795867 O        b'+1:lemma:at'
-0.809862 O        b'+2:lemma:fnr'
-0.810990 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-0.815662 O        b'-1:lemma:ml'
-0.824162 O        b'-1:lemma:IP'
-0.833220 O        b'-2:lemma:the'
-0.866069 Supp     b'-1:postag:NNP'
-0.879104 O        b'+1:lemma:m'
-0.900319 O        b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.905154 O        b'lemma:37'
-0.915234 O        b'-1:lemma:30'
-0.919155 O        b'-1:lemma:37'
-0.920162 O        b'-1:lemma:ph'
-0.925749 Supp     b'+2:lemma:fructose'
-0.937338 O        b'-1:lemma:until'
-0.972310 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-0.990780 Supp     b'+2:postag:CD'
-0.995784 O        b'+1:lemma:in'
-0.999872 O        b'-2:lemma:genome'
-1.012677 Supp     b'lemma:2'
-1.028473 O        b'-2:lemma:iptg'
-1.039845 O        b'-2:lemma:dpd'
-1.040935 O        b'+2:lemma:tag'
-1.047476 O        b'lemma:minimal'
-1.083860 O        b'lemma:nacl'
-1.097657 Air      b'postag:NN'
-1.106544 O        b'lemma:nh4cl'
-1.144233 O        b'+1:lemma:g/l'
-1.146258 O        b'lemma:mid-log'
-1.152575 Supp     b'+2:lemma:2'
-1.175881 Med      b'+2:postag:VBN'
-1.195157 O        b'-1:lemma:co2'
-1.213598 O        b'lemma:30'
-1.237718 Supp     b'+2:lemma:1'
-1.240922 Gtype    b'-2:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.242473 O        b'lemma:media'
-1.250147 Gtype    b'-2:postag:CD'
-1.261589 O        b'-1:postag::'
-1.273099 O        b'-1:lemma:rpob'
-1.280640 Supp     b'postag:JJ'
-1.282883 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.304976 O        b'-2:lemma:IP'
-1.319097 O        b'-2:lemma:media'
-1.360481 Technique b'+1:ner:_'
-1.373385 O        b'+2:lemma:+'
-1.422120 Gtype    b'postag:VBG'
-1.457138 O        b'-2:ner:TF'
-1.481207 OD       b'+1:postag:NN'
-1.492634 O        b'-1:lemma:sample'
-1.561181 O        b'-1:lemma:2'
-1.677048 Temp     b'postag:NN'
-1.689041 O        b'lemma:aerobically'
-1.737337 O        b'lemma:aerobic'
-1.749904 O        b'-2:lemma:0.3'
-1.765560 O        b'+1:lemma:2'
-1.841018 O        b'+2:lemma:rifampicin'
-1.949972 O        b'lemma:0.3'
-2.018608 O        b'+2:lemma:b'
-2.041957 O        b'lemma:wt'
-2.045921 Phase    b'postag:JJ'
-2.215779 OD       b'+2:lemma:aerobically'
-2.324186 O        b'+1:lemma:1'
-2.439527 O        b'+2:lemma:iptg'
-3.120529 O        b'-1:lemma::'
-3.569599 O        b'-1:lemma:_'