report_Run10_v11.txt 41.7 KB
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 825 826 827 828 829 830 831 832 833 834 835 836 837 838 839 840 841 842 843 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 854 855 856 857 858 859 860 861 862 863 864 865 866 867 868 869 870 871 872 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 890 891 892 893 894 895 896 897 898 899 900 901 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 1141 1142 1143 1144 1145 1146 1147 1148 1149 1150 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160 1161 1162 1163 1164 1165 1166 1167 1168 1169 1170 1171 1172 1173 1174 1175 1176 1177 1178 1179 1180 1181 1182 1183 1184 1185 1186 1187 1188 1189 1190 1191 1192 1193 1194 1195 1196 1197 1198 1199 1200 1201 1202 1203 1204 1205 1206 1207 1208 1209 1210 1211 1212 1213 1214 1215 1216 1217 1218 1219 1220 1221 1222 1223 1224 1225 1226 1227 1228 1229 1230 1231 1232 1233 1234 1235 1236 1237 1238 1239 1240 1241 1242 1243 1244 1245 1246 1247 1248 1249 1250 1251 1252 1253 1254 1255 1256 1257 1258 1259 1260 1261 1262 1263 1264 1265 1266 1267 1268 1269 1270 1271 1272 1273 1274 1275 1276 1277 1278 1279 1280 1281 1282 1283 1284 1285 1286 1287 1288
********** TRAINING AND TESTING REPORT **********
Training file: training-data-set-70-NER.txt

best params:{'c1': 0.010465875252095174, 'c2': 0.007629920691847446}
best CV score:0.8375337951545059
model size: 0.10M

Flat F1: 0.8093965884561052
             precision    recall  f1-score   support

         OD      0.913     1.000     0.955        21
         pH      1.000     1.000     1.000        10
  Technique      1.000     1.000     1.000        33
        Med      1.000     0.821     0.902        56
       Temp      0.857     0.800     0.828        15
       Vess      0.000     0.000     0.000         0
       Agit      0.000     0.000     0.000         7
      Phase      1.000     0.762     0.865        21
        Air      0.590     0.557     0.573        88
       Anti      0.765     1.000     0.867        13
     Strain      0.000     0.000     0.000         0
      Gtype      0.967     0.756     0.849        78
  Substrain      0.000     0.000     0.000         0
       Supp      0.864     0.838     0.851       136
   Gversion      1.000     0.500     0.667         6

avg / total      0.853     0.777     0.809       484


Top likely transitions:
Anti   -> Anti    6.358656
Phase  -> Phase   6.347395
Med    -> Med     5.517722
Gversion -> Gversion 5.350673
OD     -> OD      5.294566
Gtype  -> Gtype   5.145209
Temp   -> Temp    5.037564
Technique -> Technique 4.419229
pH     -> pH      4.319235
Supp   -> Supp    3.991588
Agit   -> Agit    3.873996
Air    -> Air     3.489104
O      -> O       3.373856
Substrain -> Gtype   1.754943
Technique -> Air     1.744718
Gtype  -> pH      0.475572
O      -> Technique 0.463868
O      -> Strain  0.087931
O      -> Vess    0.002669
O      -> Agit    0.001369
Med    -> pH      -0.000077
Gtype  -> Agit    -0.000079
Substrain -> Med     -0.000768
OD     -> Technique -0.006598
pH     -> OD      -0.015397
Gtype  -> Supp    -0.026655
Air    -> Gversion -0.029780
Temp   -> O       -0.035514
Agit   -> Supp    -0.040520
Supp   -> Vess    -0.059405
O      -> Substrain -0.068730
Supp   -> Agit    -0.090578
Anti   -> OD      -0.094288
pH     -> Temp    -0.114788
Gversion -> Air     -0.138632
O      -> Gtype   -0.150672
pH     -> Air     -0.152496
O      -> pH      -0.157584
Gtype  -> Gversion -0.166460
Anti   -> Med     -0.179389
Temp   -> Phase   -0.184212
Gversion -> Med     -0.188774
Technique -> Med     -0.196139
Strain -> Gtype   -0.200942
Med    -> Phase   -0.204513
Anti   -> Air     -0.205805
Substrain -> Supp    -0.222262
Technique -> O       -0.229401
O      -> Gversion -0.231214
Air    -> pH      -0.234120
O      -> Phase   -0.241913
OD     -> Gtype   -0.256841
Anti   -> Gtype   -0.292307
Phase  -> Temp    -0.304182
Med    -> Technique -0.317231
Med    -> Gtype   -0.318345
Supp   -> Gversion -0.326695
OD     -> Med     -0.333399
Gversion -> O       -0.336212
Gtype  -> Technique -0.360426
Technique -> Supp    -0.375713
Phase  -> Air     -0.382823
Gtype  -> Air     -0.392614
Supp   -> pH      -0.394983
Air    -> Gtype   -0.435431
Gtype  -> OD      -0.442096
Phase  -> Med     -0.452998
Anti   -> Supp    -0.456357
Anti   -> Phase   -0.461502
Phase  -> O       -0.501815
Gversion -> Supp    -0.512804
Air    -> Med     -0.530468
Med    -> Temp    -0.531178
OD     -> O       -0.609293
Temp   -> OD      -0.644378
O      -> Anti    -0.654382
Air    -> O       -0.670873
Med    -> OD      -0.696726
Temp   -> Gtype   -0.701977
O      -> Supp    -0.707169
Supp   -> Anti    -0.725677
pH     -> Supp    -0.733166
Agit   -> Air     -0.794876
OD     -> Supp    -0.812700
Air    -> Technique -0.841453
Gtype  -> Med     -0.845497
Phase  -> Supp    -0.863987
OD     -> Temp    -0.927770
Phase  -> Gtype   -0.937844
Med    -> Air     -0.942880
Technique -> OD      -0.955941
Gtype  -> Anti    -0.956892
Supp   -> Phase   -1.004228
Temp   -> Supp    -1.063489
Supp   -> Gtype   -1.080500
Phase  -> Technique -1.127070
Gtype  -> Temp    -1.177846
Temp   -> Air     -1.228350
Supp   -> Temp    -1.228750
Supp   -> OD      -1.273419
Technique -> Gtype   -1.338454
Air    -> OD      -1.357774
Supp   -> O       -1.370964
Gtype  -> Phase   -1.372627
Gtype  -> O       -1.394148
Med    -> O       -1.460063
O      -> Med     -1.470437
Supp   -> Technique -1.472701
Anti   -> Temp    -1.663806
Air    -> Temp    -1.721993
Temp   -> Med     -1.722970
Supp   -> Air     -1.724804
O      -> OD      -1.743961
Air    -> Agit    -1.818199
O      -> Temp    -1.849689
Air    -> Supp    -1.955773
OD     -> Air     -2.001321
Phase  -> OD      -2.018804
Substrain -> O       -2.185804
Technique -> pH      -2.370594
Air    -> Phase   -2.463932
O      -> Air     -3.086268
Supp   -> Med     -3.238929
Med    -> Supp    -3.671494


Top unlikely transitions:
Anti   -> Anti    6.358656
Phase  -> Phase   6.347395
Med    -> Med     5.517722
Gversion -> Gversion 5.350673
OD     -> OD      5.294566
Gtype  -> Gtype   5.145209
Temp   -> Temp    5.037564
Technique -> Technique 4.419229
pH     -> pH      4.319235
Supp   -> Supp    3.991588
Agit   -> Agit    3.873996
Air    -> Air     3.489104
O      -> O       3.373856
Substrain -> Gtype   1.754943
Technique -> Air     1.744718
Gtype  -> pH      0.475572
O      -> Technique 0.463868
O      -> Strain  0.087931
O      -> Vess    0.002669
O      -> Agit    0.001369
Med    -> pH      -0.000077
Gtype  -> Agit    -0.000079
Substrain -> Med     -0.000768
OD     -> Technique -0.006598
pH     -> OD      -0.015397
Gtype  -> Supp    -0.026655
Air    -> Gversion -0.029780
Temp   -> O       -0.035514
Agit   -> Supp    -0.040520
Supp   -> Vess    -0.059405
O      -> Substrain -0.068730
Supp   -> Agit    -0.090578
Anti   -> OD      -0.094288
pH     -> Temp    -0.114788
Gversion -> Air     -0.138632
O      -> Gtype   -0.150672
pH     -> Air     -0.152496
O      -> pH      -0.157584
Gtype  -> Gversion -0.166460
Anti   -> Med     -0.179389
Temp   -> Phase   -0.184212
Gversion -> Med     -0.188774
Technique -> Med     -0.196139
Strain -> Gtype   -0.200942
Med    -> Phase   -0.204513
Anti   -> Air     -0.205805
Substrain -> Supp    -0.222262
Technique -> O       -0.229401
O      -> Gversion -0.231214
Air    -> pH      -0.234120
O      -> Phase   -0.241913
OD     -> Gtype   -0.256841
Anti   -> Gtype   -0.292307
Phase  -> Temp    -0.304182
Med    -> Technique -0.317231
Med    -> Gtype   -0.318345
Supp   -> Gversion -0.326695
OD     -> Med     -0.333399
Gversion -> O       -0.336212
Gtype  -> Technique -0.360426
Technique -> Supp    -0.375713
Phase  -> Air     -0.382823
Gtype  -> Air     -0.392614
Supp   -> pH      -0.394983
Air    -> Gtype   -0.435431
Gtype  -> OD      -0.442096
Phase  -> Med     -0.452998
Anti   -> Supp    -0.456357
Anti   -> Phase   -0.461502
Phase  -> O       -0.501815
Gversion -> Supp    -0.512804
Air    -> Med     -0.530468
Med    -> Temp    -0.531178
OD     -> O       -0.609293
Temp   -> OD      -0.644378
O      -> Anti    -0.654382
Air    -> O       -0.670873
Med    -> OD      -0.696726
Temp   -> Gtype   -0.701977
O      -> Supp    -0.707169
Supp   -> Anti    -0.725677
pH     -> Supp    -0.733166
Agit   -> Air     -0.794876
OD     -> Supp    -0.812700
Air    -> Technique -0.841453
Gtype  -> Med     -0.845497
Phase  -> Supp    -0.863987
OD     -> Temp    -0.927770
Phase  -> Gtype   -0.937844
Med    -> Air     -0.942880
Technique -> OD      -0.955941
Gtype  -> Anti    -0.956892
Supp   -> Phase   -1.004228
Temp   -> Supp    -1.063489
Supp   -> Gtype   -1.080500
Phase  -> Technique -1.127070
Gtype  -> Temp    -1.177846
Temp   -> Air     -1.228350
Supp   -> Temp    -1.228750
Supp   -> OD      -1.273419
Technique -> Gtype   -1.338454
Air    -> OD      -1.357774
Supp   -> O       -1.370964
Gtype  -> Phase   -1.372627
Gtype  -> O       -1.394148
Med    -> O       -1.460063
O      -> Med     -1.470437
Supp   -> Technique -1.472701
Anti   -> Temp    -1.663806
Air    -> Temp    -1.721993
Temp   -> Med     -1.722970
Supp   -> Air     -1.724804
O      -> OD      -1.743961
Air    -> Agit    -1.818199
O      -> Temp    -1.849689
Air    -> Supp    -1.955773
OD     -> Air     -2.001321
Phase  -> OD      -2.018804
Substrain -> O       -2.185804
Technique -> pH      -2.370594
Air    -> Phase   -2.463932
O      -> Air     -3.086268
Supp   -> Med     -3.238929
Med    -> Supp    -3.671494


Top positive:
9.422189 O        b'lemma:_'
9.100004 Supp     b'lemma:Iron'
7.946201 Air      b'lemma:aerobically'
7.323838 Technique b'lemma:chipseq'
6.533969 Air      b'lemma:anaerobic'
6.423288 Gtype    b'lemma:wt'
6.305102 O        b'-1:lemma:glucose'
6.256597 Phase    b'lemma:stationary'
6.256597 Phase    b'lemma:exponential'
6.204382 Air      b'-1:lemma:ChIP-Seq'
6.146395 Supp     b'lemma:2h'
6.146395 Supp     b'-1:lemma:additional'
6.110691 Supp     b'-1:lemma:Cra'
6.104716 Supp     b'lemma:pq'
6.092997 O        b'lemma:Cra'
5.983782 O        b'lemma:-'
5.909590 O        b'-1:lemma:tag'
5.791586 Med      b'lemma:MOPS'
5.732246 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5m'
5.638219 O        b'-1:lemma:0.3'
5.608816 Strain   b'lemma:k-12'
5.250328 O        b'lemma:b'
5.213232 Technique b'lemma:ChIP-exo'
5.162232 O        b'lemma:chip-fnr'
5.148653 Gtype    b'hGreek'
5.121455 O        b'lemma:\xcf\x8332'
5.036136 O        b'lemma:purr'
5.023304 Gversion b'lemma:asm584v2'
5.012929 O        b'lemma:1'
5.002786 O        b'lemma:CEL'
4.961820 O        b'+1:lemma:od600'
4.910166 Supp     b'lemma:no3'
4.868737 O        b'lemma:chip-arca'
4.861825 Gtype    b'+1:lemma:type'
4.782878 Air      b'-1:lemma:-'
4.767145 Air      b'lemma:aerobic'
4.753869 O        b'lemma:at'
4.751285 Med      b'lemma:LB'
4.724266 Gtype    b'lemma:WT'
4.664886 O        b'-1:lemma:lb'
4.664125 Med      b'lemma:media'
4.658729 O        b'lemma:with'
4.640592 Med      b'-1:lemma:ml'
4.610147 Gtype    b'lemma:type'
4.585325 Phase    b'lemma:mid-log'
4.570831 Supp     b'lemma:iptg'
4.518999 Gtype    b'lemma:dfnr'
4.501373 O        b'-1:lemma:pq'
4.461402 O        b'lemma:2'
4.425446 O        b'lemma:trpr'
4.402994 Supp     b'+1:lemma:Deficient'
4.400975 Anti     b'lemma:seqa'
4.397212 Anti     b'lemma:none'
4.396737 Supp     b'-1:lemma:vol'
4.280827 O        b'lemma::'
4.270182 Supp     b'+1:lemma:iptg'
4.264989 Supp     b'lemma:nh4cl'
4.255929 Vess     b'lemma:flask'
4.255929 Vess     b'-1:lemma:warm'
4.239221 O        b'lemma:or'
4.236081 Supp     b'lemma:Fe'
4.233496 Air      b'lemma:anaeroibc'
4.207565 Gversion b'lemma:chip-seq'
4.202958 O        b'-1:lemma:nacl'
4.173998 Med      b'+1:lemma:0.4'
4.167682 O        b'lemma:a'
4.148085 Gtype    b'-1:ner:GEN'
4.109309 Supp     b'-1:lemma:+'
4.096292 OD       b'lemma:od450'
4.081865 Supp     b'lemma:nacl'
4.052041 Supp     b'+1:lemma:2'
3.969497 Anti     b'lemma:\xcf\x8332'
3.969454 O        b'lemma:3'
3.968786 O        b'lemma:for'
3.964820 O        b'lemma:affyexp'
3.948787 O        b'postag:VBG'
3.941131 Gtype    b'lemma:wildtype'
3.930196 Technique b'lemma:rnaseq'
3.918031 O        b'lemma:rep2'
3.918031 O        b'lemma:rep1'
3.895626 Temp     b'-1:lemma:37'
3.885357 Gtype    b'lemma:pk4854'
3.883701 Supp     b'lemma:Leu'
3.883693 Agit     b'+1:lemma:rpm'
3.869277 Substrain b'lemma:mg1655star'
3.866979 Substrain b'lemma:mg1655'
3.856183 O        b'-1:lemma:acetate'
3.843593 O        b'lemma:soxr'
3.843593 O        b'lemma:soxs'
3.837892 O        b'lemma:rpob'
3.793165 Gtype    b'lemma:arca8myc'
3.778579 O        b'-1:lemma:fructose'
3.776496 O        b'lemma:argr'
3.762008 Gtype    b'lemma:deltaseqa'
3.762008 Gtype    b'-1:lemma:old'
3.733459 pH       b'lemma:ph5'
3.733459 pH       b'+1:lemma:.5'
3.723358 O        b'lemma:.'
3.723358 O        b'postag:.'
3.713728 O        b'-1:lemma:into'
3.668937 Supp     b'+1:lemma:deficient'
3.648137 Med      b'+1:lemma:2.0'
3.598289 Supp     b'lemma:arginine'
3.594926 O        b'lemma:Genome'
3.589971 O        b'-1:lemma:no3'
3.583823 Supp     b'lemma:Trp'
3.575036 Gversion b'lemma:000913'
3.555999 Med      b'lemma:lb'
3.547592 Supp     b'lemma:dpd'
3.533166 Temp     b'lemma:43'
3.532068 O        b'lemma:cra'
3.519885 O        b'lemma:Lrp'
3.486270 Supp     b'lemma:acetate'
3.482909 Temp     b'-1:lemma:\xcf\x8332'
3.481820 Anti     b'lemma:anti-rpob'
3.457801 Agit     b'lemma:rpm'
3.443599 Supp     b'lemma:Adenine'
3.418927 Agit     b'-1:lemma:250'
3.408158 Med      b'lemma:minimal'
3.386664 O        b'+1:lemma:pq'
3.384236 O        b'lemma:ompr'
3.359751 Med      b'lemma:m63'
3.347299 O        b'-1:lemma:nh4cl'
3.345513 Air      b'-1:lemma:ryhb'
3.344073 O        b'+1:lemma:wt'
3.336057 O        b'-1:lemma:arginine'
3.328266 Med      b'lemma:medium'
3.325392 Temp     b'-1:lemma:sample'
3.300161 O        b'lemma:oxyr'
3.297130 Supp     b'+1:lemma:1'
3.293448 Air      b'lemma:Anaerobic'
3.244194 Supp     b'-1:ner:SUPP'
3.236320 O        b'-2:ner:MED'
3.233729 Anti     b'lemma:anti-rpos'
3.228593 Gversion b'lemma:u00096'
3.228593 Gversion b'+1:lemma:.2'
3.220928 Gtype    b'lemma:\xce\xb4fur'
3.191133 Air      b'postag:RB'
3.176920 O        b'-1:lemma:mg1655'
3.167703 Strain   b'+1:lemma:substr'
3.151944 O        b'+1:lemma:250'
3.148574 O        b'lemma:Nac'
3.100735 O        b'lemma:chip'
3.085092 Gversion b'lemma:.2'
3.085092 Gversion b'-1:lemma:u00096'
3.061607 O        b'+1:lemma:o.d.'
3.051216 O        b'-1:lemma:Anaerobic'
3.049366 O        b'lemma:genotype/variation'
3.047561 Gtype    b'lemma:\xe2\x88\x86'
3.020586 Gversion b'-1:lemma:nc'
3.020586 Gversion b'+1:lemma:000913'
2.984149 Gtype    b'-1:lemma:nsrr'
2.984149 Gtype    b'+1:lemma:flagtag'
2.978223 O        b'-1:lemma:type'
2.976245 Anti     b'+1:lemma:antibody'
2.958927 Substrain b'+1:lemma:phtpg'
2.957004 Gtype    b'lemma:phtpg'
2.944667 Gtype    b'-1:lemma:rpob'
2.933604 Gtype    b'lemma:fnr8myc'
2.904382 Temp     b'-1:lemma:43'
2.893312 O        b'-1:postag:NNS'
2.891821 O        b'+1:lemma:43'
2.884323 Gtype    b'+2:ner:SUPP'
2.875993 O        b'-1:lemma:anaerobic'
2.872421 Phase    b'-1:lemma:until'
2.869838 Supp     b'+1:lemma:hour'
2.868700 O        b'+1:lemma:mid-log'
2.848205 O        b'-1:lemma:dpd'
2.845760 O        b'lemma:harbor'
2.833760 O        b'-1:lemma:min'
2.806382 O        b'lemma:delta'
2.800765 Supp     b'lemma:rifampicin'
2.793311 Technique b'-1:lemma:input'
2.787093 O        b'+1:lemma:coli'
2.779145 Air      b'-1:lemma:co2'
2.779073 O        b'+1:lemma:k-12'
2.774281 O        b'-1:lemma:0.3-0.35'
2.771554 O        b'lemma:C'
2.742371 O        b'lemma:pt7'
2.717606 Technique b'lemma:rna-seq'
2.706556 Med      b'+1:lemma:+'
2.700996 Phase    b'postag:NN'
2.687591 O        b'-1:lemma:Aerobic'
2.681920 O        b'-1:lemma:grow'
2.679245 Gtype    b'lemma:flagtag'
2.678873 Technique b'+1:lemma:chip-exo'
2.674490 Supp     b'+1:lemma:\xc2\xb5l'
2.673952 O        b'lemma:2-3'
2.672483 O        b'lemma:\xcb\x9ac'
2.661068 Anti     b'lemma:anti-myc'
2.656757 Gtype    b'-1:lemma:ptac'
2.656603 O        b'lemma:lrp'
2.630382 Technique b'-1:lemma:_'
2.627582 Gtype    b'-1:lemma:phtpg'
2.627399 O        b'lemma:ntrc'
2.627399 O        b'lemma:csir'
2.611827 Gtype    b'-1:lemma:_'
2.606163 Supp     b'-1:lemma:contain'
2.596139 O        b'-1:lemma:shake'
2.595682 O        b'+1:lemma:minute'
2.582575 Gtype    b'lemma:nsrr'
2.579938 O        b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.574077 O        b'+1:lemma:wash'
2.573433 O        b'-1:lemma:medium'
2.554173 Med      b'-1:lemma:fresh'
2.550364 Gtype    b'-1:lemma:wild'
2.550128 O        b'-1:lemma:induce'
2.540259 pH       b'+1:postag:CD'
2.538906 Gtype    b'-1:lemma:from'
2.536738 Gversion b'lemma:nc'
2.536635 O        b'lemma:A'
2.516982 Supp     b'-1:lemma:with'
2.516504 Supp     b'-1:lemma:\xce\xb4cra'
2.503672 O        b'lemma:input'
2.503672 O        b'+1:lemma:chip-seq'
2.497493 Med      b'-1:lemma:minimal'
2.495435 Gtype    b'lemma:\xce\xb4cra'
2.490226 O        b'lemma:culture'
2.486626 Temp     b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
2.474899 Air      b'-1:lemma:cm20'
2.468792 OD       b'lemma:0.3-0.35'
2.463216 O        b'lemma:gadx'
2.461075 O        b'-1:lemma:-80'
2.449165 O        b'lemma:treatment'
2.445027 O        b'-1:lemma:ChIP-exo'
2.436126 Gtype    b'-1:lemma:factor'
2.433142 Supp     b'lemma:tryptophan'
2.433142 Supp     b'-1:lemma:mg/l'
2.432731 Anti     b'hGreek'
2.427410 Gtype    b'+1:lemma:the'
2.425328 Air      b'-1:lemma:_'
2.424669 Anti     b'-1:lemma:fnr'
2.421076 Gtype    b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
2.407085 Temp     b'lemma:37'
2.402467 Substrain b'-1:lemma:.'
2.402467 Substrain b'-1:postag:.'
2.401933 O        b'lemma:s'
2.377466 O        b'lemma:+'
2.362329 Gtype    b'+1:lemma::'
2.359609 Supp     b'-1:lemma:final'
2.357911 Gtype    b'lemma:delta-soxr'
2.357911 Gtype    b'lemma:delta-gadx'
2.357911 Gtype    b'lemma:delta-gadw'
2.357911 Gtype    b'lemma:delta-oxyr'
2.357911 Gtype    b'lemma:delta-gade'
2.357911 Gtype    b'lemma:delta-soxs'
2.356675 Gtype    b'lemma:gade-8myc'
2.354545 Med      b'+1:lemma:with'
2.343521 Air      b'+1:lemma:b'
2.342733 Gtype    b'lemma:ptac'
2.315032 Supp     b'-1:lemma:potassium'
2.313859 O        b'-1:lemma:stpa'
2.311262 O        b'postag::'
2.309905 Temp     b'lemma:\xc2\xb0c'
2.300893 Supp     b'+1:lemma:_'
2.300052 O        b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
2.294618 O        b'lemma:~'
2.293819 O        b'+1:lemma:0.2'
2.278952 Air      b'postag:JJ'
2.258283 Gtype    b'+1:postag::'
2.257161 O        b'+1:lemma:sparging'
2.254138 Gtype    b'+1:lemma:control'
2.253510 Gtype    b'lemma:wild'
2.244502 OD       b'lemma:0.3'
2.241691 Gtype    b'+1:lemma:cra'
2.240886 Gtype    b'lemma:fur-8myc'
2.240886 Gtype    b'lemma:cra-8myc-tagged'
2.238962 Supp     b'lemma:glutamine'
2.238962 Supp     b'-1:lemma:2g/l'
2.234391 Gtype    b'lemma:delta-fnr'
2.230098 pH       b'+1:lemma:5.5'
2.229403 OD       b'-1:lemma:od450'
2.225215 Gversion b'+1:lemma:genome'
2.221272 O        b'lemma:growth'
2.211806 O        b'lemma:ecolus'
2.204250 Gtype    b'lemma:ompr-8myc'
2.198612 O        b'-1:lemma:leucine'
2.186732 O        b'+1:lemma:\xcb\x9ac'
2.150233 Gtype    b'lemma:fnr-8myc'
2.145728 Vess     b'+1:lemma:at'
2.141129 Technique b'-1:lemma:rna-seq'
2.140071 O        b'lemma:contain'
2.103585 Anti     b'-1:lemma:monoclonal'
2.097507 O        b'+1:lemma:dpd'
2.091238 Gtype    b'lemma:wild-type'
2.086135 Supp     b'-1:lemma:1m'
2.082992 Supp     b'lemma:final'
2.079469 Vess     b'-1:postag:VBN'
2.078214 Technique b'-1:lemma:chip-exo'
2.064246 O        b'+1:postag:RB'
2.061765 O        b'lemma:-80'
2.060433 Air      b'lemma:Aerobic'
2.056303 Air      b'+1:lemma:-'
2.054136 O        b'-1:lemma:aerobic'
2.047344 Supp     b'-1:lemma:without'
2.043575 Strain   b'-1:lemma:.'
2.043575 Strain   b'-1:postag:.'
2.041385 Gtype    b'-1:postag:VBP'
2.036719 Med      b'+1:postag:CD'
2.035584 Agit     b'lemma:250'
2.034971 Gtype    b'+1:lemma:pq'
2.027814 Anti     b'+1:lemma:from'
2.017894 O        b'+1:lemma::'
2.016942 Gtype    b'+1:lemma:with'
2.013291 Gtype    b'+1:lemma:mg1655'
2.011574 O        b'postag:DT'
2.010188 O        b'+1:lemma:20'
2.005844 O        b'+1:lemma:30'
1.994949 Supp     b'+1:lemma:mm'
1.994949 Supp     b'+1:ner:KWSUPP'
1.990124 O        b'lemma:until'
1.976394 O        b'lemma:one'
1.975615 Technique b'+1:lemma:rna-seq'
1.968786 O        b'+1:lemma:b2'
1.967377 O        b'lemma:c'
1.966710 Med      b'-1:lemma:glucose'
1.966499 O        b'-1:lemma:genotype/variation'
1.966023 Gtype    b'-1:lemma:Wild'
1.963665 Supp     b'+1:lemma:mg/l'
1.958911 O        b'-1:lemma:.5'
1.950558 Technique b'hUpper'
1.948251 Supp     b'-1:lemma:respiration'
1.948251 Supp     b'+1:lemma:mmol'
1.924929 Supp     b'lemma:30'
1.924017 O        b'-1:lemma:genbank'
1.920426 pH       b'lemma:.5'
1.920426 pH       b'-1:lemma:ph5'
1.919425 O        b'lemma:tag'
1.915015 Supp     b'-2:ner:MED'
1.911309 O        b'-1:lemma:wt'
1.905176 O        b'+1:lemma:fnr-8myc'
1.903720 Supp     b'+1:lemma:m'
1.882465 O        b'+1:lemma:b1'
1.881462 Gtype    b'lemma:purr-8myc'
1.879263 Supp     b'-1:lemma:sodium'
1.878994 O        b'-1:lemma:rpm'
1.872253 pH       b'-1:lemma:ph'
1.870618 pH       b'lemma:5.5'
1.852696 O        b'-1:lemma:l1'
1.845425 O        b'lemma:600'
1.844672 Supp     b'+1:lemma:min'
1.835211 pH       b'-1:lemma:at'
1.831393 Gtype    b'-1:lemma:vector'
1.830209 OD       b'lemma:o.d.'
1.830209 OD       b'+1:lemma:600nm'
1.823902 OD       b'-1:lemma:600nm'
1.820369 pH       b'lemma:ph'
1.807453 Med      b'+1:lemma:minimal'
1.806122 O        b'-1:lemma:.2'
1.805962 Supp     b'lemma:glucose'
1.795146 Technique b'-1:lemma:1'
1.794127 OD       b'lemma:od600'
1.793320 Gtype    b'lemma:delta-arca'
1.790424 Anti     b'-1:lemma:myc'
1.782925 O        b'lemma:additional'
1.782925 O        b'+1:lemma:2h'
1.782404 Gtype    b'postag:JJ'
1.781434 O        b'+1:lemma:od450'
1.774756 Supp     b'-1:lemma:30'
1.769636 Anti     b'lemma:mab'
1.769636 Anti     b'-1:lemma:anti-flag'
1.765066 Supp     b'-1:lemma:0.3'
1.756816 Med      b'+1:lemma:-lrb-'
1.755358 Gtype    b'lemma:crp'
1.750779 Med      b'+1:lemma:g/l'
1.742185 Technique b'+1:ner:TF'
1.735687 Med      b'+1:postag:-LRB-'
1.735671 O        b'-1:lemma:0.35'
1.733317 O        b'lemma:acetate'
1.730153 O        b'postag:CC'
1.721076 Supp     b'lemma:2g/l'
1.721076 Supp     b'+1:lemma:glutamine'
1.713590 Air      b'-1:lemma:fur'
1.705625 O        b'-1:lemma:phase'
1.695672 Med      b'postag:NNS'
1.694509 Supp     b'lemma:fructose'
1.693844 Gversion b'lemma:_'
1.686978 O        b'+1:lemma:ph5'
1.686382 Med      b'-1:postag:JJ'
1.678106 Air      b'+1:lemma:at'
1.676827 Med      b'postag:NNP'
1.669797 O        b'-1:lemma:media'
1.660133 Supp     b'-1:lemma:ompr'
1.656712 Supp     b'lemma:m'
1.648427 O        b'-1:lemma:4'
1.646945 O        b'postag:SYM'
1.625647 OD       b'-1:lemma:at'
1.620226 Temp     b'lemma:sample'
1.620111 Temp     b'+1:lemma:short'
1.605899 Phase    b'+1:lemma:culture'
1.604239 Technique b'lemma:chip-exo'
1.601164 Supp     b'+1:lemma:1m'
1.594423 O        b'-1:lemma:concentration'
1.594423 O        b'+1:lemma:150'
1.594080 Gtype    b'+1:lemma:small'
1.590743 Gversion b'+1:postag:CD'
1.590622 Vess     b'+1:postag:IN'
1.580191 Technique b'+1:lemma:gadx'
1.572997 O        b'+1:lemma:m9'
1.563499 O        b'-1:lemma:fnr'
1.554952 Supp     b'+1:lemma:and'
1.553773 OD       b'lemma:600nm'
1.553773 OD       b'-1:lemma:o.d.'
1.553731 O        b'-1:lemma:w0002'
1.547767 O        b'+1:lemma:old'
1.542256 Technique b'lemma:ChIP-Seq'
1.542081 Supp     b'lemma:cm20'
1.542081 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5l'
1.538044 Supp     b'+1:postag:NNS'
1.537541 Phase    b'-1:lemma:mid-log'
1.537248 Technique b'-1:lemma:IP'
1.536877 O        b'+1:lemma:acetate'
1.530023 Supp     b'lemma:150'
1.530023 Supp     b'+1:lemma:mg/ml'
1.523939 O        b'+1:lemma:37'
1.520203 O        b'lemma:EB'
1.516174 OD       b'+1:lemma:of'
1.509148 Supp     b'+1:lemma:anaerobically'
1.501677 O        b'lemma:Fur'
1.492917 Air      b'+1:lemma:%'
1.491829 O        b'-1:lemma:Leu'
1.486989 O        b'-1:lemma:genotype'
1.473001 Med      b'-1:lemma:in'
1.470631 O        b'lemma:ml'
1.470299 Temp     b'lemma:see'
1.469511 Gtype    b'lemma:Wild'
1.461797 Supp     b'-1:lemma:_'
1.460647 Supp     b'+1:lemma:1/100'
1.454285 Supp     b'lemma:1m'
1.453546 O        b'lemma:10'
1.452523 Gtype    b'lemma:ryhb'
1.447104 Gtype    b'lemma:the'
1.436921 Supp     b'-1:lemma:\xc2\xb5m'
1.436015 Technique b'hLower'
1.434117 OD       b'lemma:0.35'
1.433577 OD       b'+1:postag:IN'
1.429900 O        b'-1:lemma:nitrate'
1.429367 O        b'-1:lemma:one'
1.428911 Air      b'+1:lemma:C'
1.428602 Gtype    b'+1:lemma:_'
1.426237 O        b'+1:lemma:respiration'
1.426170 Gtype    b'lemma:lack'
1.425685 Supp     b'lemma:sodium'
1.421054 Gtype    b'-1:lemma:knock-out'
1.411350 O        b'-1:lemma:glutamine'
1.401895 Technique b'lemma:chip-seq'
1.401871 OD       b'+1:lemma:0.3-0.35'
1.398674 Anti     b'+1:lemma:-lrb-'
1.396365 Gtype    b'+1:lemma:chip'
1.395912 Gtype    b'lemma:vector'
1.394603 O        b'-1:lemma:Fe'
1.392642 Gtype    b'hUpper'
1.390845 OD       b'-1:lemma:about'
1.389526 O        b'-1:lemma:Iron'
1.380444 Gtype    b'+1:postag:FW'
1.370459 Temp     b'postag:VB'
1.360231 OD       b'+1:lemma:,'
1.360231 OD       b'+1:postag:,'
1.350786 O        b'-1:lemma:0.15'
1.348181 O        b'lemma:genome'
1.347910 Anti     b'lemma:anti-flag'
1.347910 Anti     b'+1:lemma:mab'
1.346348 Gtype    b'lemma:\xce\xb4ompr'
1.345557 Gtype    b'-1:postag:VBG'
1.344889 Supp     b'lemma:1g/l'
1.343615 pH       b'+1:lemma:.'
1.343615 pH       b'+1:postag:.'
1.341950 Supp     b'lemma:leucine'
1.341462 O        b'-1:lemma:Adenine'
1.333262 O        b'+1:lemma:treat'
1.330564 O        b'+1:lemma:crp'
1.328513 Air      b'lemma:co2'
1.313486 Agit     b'-1:lemma:-lrb-'
1.309901 O        b'lemma:concentration'
1.298020 Anti     b'+1:postag:-LRB-'
1.295786 O        b'-1:lemma:after'
1.294817 O        b'-1:lemma:2.5'
1.292344 Supp     b'-1:lemma:0.2'
1.291921 Air      b'-1:lemma:phase'
1.290953 O        b'-1:lemma:tryptophan'
1.289077 O        b'-1:lemma:chipseq'
1.286000 Agit     b'-1:postag:-LRB-'
1.284383 O        b'postag:VBN'
1.281627 Supp     b'+1:lemma:phosphate'
1.277166 O        b'+1:lemma:nacl'
1.275998 O        b'lemma:induction'
1.275962 Air      b'+1:lemma:95'
1.266024 Gtype    b'+1:lemma:ph5'
1.258603 Supp     b'-1:lemma:phosphate'
1.255528 Technique b'+1:postag:NN'
1.255253 Anti     b'-1:lemma::'
1.250025 OD       b'-1:lemma:~'
1.249422 Supp     b'+1:lemma:leucine'
1.249420 O        b'lemma:agitation'
1.243880 O        b'lemma:paraquat'
1.242035 Temp     b'-1:lemma:see'
1.241346 O        b'+1:lemma:tritonx-100'
1.239483 O        b'+1:lemma:genbank'
1.239389 O        b'-1:lemma:anti-rpos'
1.239389 O        b'+1:lemma:neoclone'


Top negative:
0.016040 Supp     b'lemma:4'
0.015481 Gtype    b'-1:lemma:control'
0.015242 Air      b'-1:postag:-LRB-'
0.014312 Anti     b'-2:ner:TF'
0.013798 Air      b'postag:NNP'
0.013027 O        b'-1:lemma:edta'
0.011702 Med      b'-1:postag:CC'
0.010704 O        b'-1:lemma:two'
0.010297 O        b'-1:lemma:cell'
0.010151 Gtype    b'+1:lemma:carrying'
0.009920 Air      b'-1:lemma:-lrb-'
0.009860 O        b'+1:lemma:culture'
0.009796 Strain   b'hUpper'
0.009775 Anti     b'-1:lemma:pre-cleared'
0.008823 Agit     b'symb'
0.008816 Phase    b'+1:postag:NN'
0.007871 Substrain b'+1:postag:NN'
0.007779 O        b'lemma:%'
0.007190 O        b'-1:postag:VBZ'
0.007158 O        b'lemma:phosphate'
0.006573 O        b'+1:lemma:ompr'
0.006540 Phase    b'+1:postag:IN'
0.005792 pH       b'-1:ner:_'
0.005637 Air      b'symb'
0.004920 Gtype    b'+1:postag:NNP'
0.003666 Agit     b'+1:ner:_'
0.003260 O        b'+1:lemma:pk4854'
0.002892 O        b'-1:lemma:po'
0.002345 O        b'+1:lemma:be'
0.002274 Supp     b'-1:lemma:-'
0.001774 Agit     b'+1:postag:NN'
0.001388 Vess     b'postag:NN'
0.001377 O        b'lemma:build'
0.001340 O        b'lemma:\xce\xbcm'
0.001337 O        b'+1:lemma:gadw'
0.001212 Agit     b'postag:CD'
0.000843 O        b'+2:ner:Organism'
0.000812 O        b'lemma:chip-exo'
0.000721 O        b'+1:lemma:\xce\xbcl'
0.000655 Anti     b'lemma:anti-fur'
0.000625 O        b'-1:lemma:strain'
0.000513 Anti     b'lemma:fnr'
0.000436 Gtype    b'+1:lemma:lacx74/ptg2'
0.000425 O        b'-1:lemma:FDR'
0.000425 O        b'+1:lemma:0.01'
0.000418 O        b'-1:lemma:chip-arca'
0.000418 O        b'+1:lemma:arca8myc'
0.000359 Temp     b'-1:lemma:-lrb-'
0.000356 Temp     b'-1:postag:-LRB-'
0.000272 Anti     b'+1:lemma:polyclonal'
0.000264 Anti     b'lemma:ihf'
0.000254 O        b'-1:lemma:build'
0.000236 O        b'-1:lemma:licl'
0.000204 Temp     b'-1:postag:JJ'
0.000177 Gversion b'-1:postag::'
0.000132 O        b'+1:lemma:aerobic'
0.000102 OD       b'+1:lemma:in'
0.000101 pH       b'+1:ner:_'
0.000081 OD       b'+1:lemma:0.15'
0.000080 O        b'lemma:acid'
0.000080 O        b'+1:lemma:phenol'
0.000059 O        b'+1:lemma:TEX'
0.000058 Supp     b'+1:postag:NNP'
0.000051 O        b'-1:lemma:Deficient'
0.000042 O        b'lemma:FDR'
0.000025 Supp     b'lemma:8'
0.000025 Supp     b'lemma:16'
0.000025 O        b'+1:lemma:NeoClone'
0.000023 Gtype    b'lemma:-lcb-'
0.000013 Gtype    b'-1:lemma:lacx74/ptg2'
0.000013 O        b'lemma:neoclone'
0.000011 Gtype    b'+1:lemma:delta'
0.000004 Supp     b'-1:lemma:\xce\xb4oxyr'
0.000002 Gtype    b'lemma:lacx74/ptg2'
0.000002 O        b'-1:lemma:flagtag'
0.000001 O        b'lemma:50'
0.000001 Gversion b'-1:lemma:version'
-0.000002 O        b'+1:lemma:A'
-0.000004 pH       b'hGreek'
-0.000014 Gtype    b'lemma:fnr'
-0.000018 Gversion b'-1:postag:CD'
-0.000053 Med      b'-1:lemma:MOPS'
-0.000115 Gtype    b'-1:lemma:crp'
-0.000180 O        b'lemma:deletion'
-0.000354 Gtype    b'+1:lemma:b'
-0.000428 O        b'+1:lemma:mutant'
-0.000624 Gtype    b'postag:FW'
-0.000986 O        b'lemma:vol'
-0.000986 O        b'-1:lemma:1/100'
-0.001985 Supp     b'lemma:250'
-0.002074 O        b'lemma:95'
-0.002649 Gtype    b'+1:lemma:pk4854'
-0.003313 O        b'lemma:mutant'
-0.003480 O        b'-1:lemma:deletion'
-0.003991 Anti     b'+1:ner:_'
-0.004490 O        b'+1:lemma:='
-0.004654 O        b'-1:lemma:rifampicin'
-0.004853 Med      b'hGreek'
-0.004878 O        b'-2:ner:GEN'
-0.005438 Temp     b'+2:ner:_'
-0.006429 Gtype    b'lemma:-rrb-'
-0.006736 O        b'+1:lemma:0.4'
-0.008339 Temp     b'postag:NN'
-0.009421 Med      b'-1:postag:NNP'
-0.009722 O        b'-1:lemma:25'
-0.010357 OD       b'+1:lemma:0.4'
-0.012076 O        b'+1:lemma:of'
-0.012288 O        b'-1:lemma:k-12'
-0.012996 Air      b'+1:postag:NN'
-0.014738 Air      b'postag:-LRB-'
-0.015582 Gtype    b'+1:postag:-RRB-'
-0.016828 O        b'-1:lemma:anaerobically'
-0.018965 Gversion b'+1:postag:NN'
-0.019468 O        b'-1:lemma:affinity'
-0.021179 Air      b'lemma:-lrb-'
-0.022224 O        b'+1:postag:NNS'
-0.023271 Supp     b'-1:lemma:250'
-0.024900 O        b'-1:lemma:control'
-0.025492 O        b'-1:lemma:0.1'
-0.025898 Gtype    b'postag:NNP'
-0.027062 O        b'+1:lemma:phosphate'
-0.028382 Gtype    b'-1:postag:NN'
-0.029040 Supp     b'-1:lemma:;'
-0.029050 Temp     b'hGreek'
-0.029491 Supp     b'+1:lemma:-rrb-'
-0.030879 O        b'-1:lemma:m9'
-0.031369 O        b'lemma:lb'
-0.031957 O        b'-1:lemma:um'
-0.031957 O        b'+1:lemma:paraquat'
-0.032120 O        b'postag:VB'
-0.032540 O        b'-1:lemma:20'
-0.032903 Substrain b'+2:ner:_'
-0.033007 Technique b'-2:ner:_'
-0.033933 O        b'+1:lemma:.'
-0.033933 O        b'+1:postag:.'
-0.034206 Phase    b'-2:ner:_'
-0.034336 O        b'lemma:sodium'
-0.034577 Air      b'postag:CD'
-0.036158 Gtype    b'-1:postag:SYM'
-0.036238 O        b'-1:lemma:70'
-0.037842 O        b'lemma:1/100'
-0.037842 O        b'+1:lemma:vol'
-0.040259 Temp     b'+1:postag:-LRB-'
-0.040671 O        b'+1:lemma:0.3'
-0.041843 O        b'lemma:\xce\xb4soxr'
-0.043283 Gtype    b'+1:postag:IN'
-0.044354 Supp     b'+1:lemma:in'
-0.044992 O        b'+1:lemma:fnr'
-0.045588 O        b'lemma:\xc3\x9f'
-0.045602 O        b'+1:lemma:rna'
-0.046664 O        b'+1:lemma:25'
-0.046854 O        b'lemma:25'
-0.050681 O        b'+1:lemma:a'
-0.050925 Temp     b'+1:lemma:-lrb-'
-0.051240 Supp     b'-1:lemma:%'
-0.052441 Gversion b'-1:ner:_'
-0.053733 O        b'-1:lemma:of'
-0.053891 O        b'-1:lemma:for'
-0.057308 Gtype    b'postag:VBG'
-0.058574 O        b'lemma:5'
-0.059450 O        b'lemma:final'
-0.059601 Supp     b'postag:IN'
-0.060475 O        b'+1:lemma:70'
-0.060770 Gtype    b'-1:lemma:-lrb-'
-0.060910 OD       b'lemma:='
-0.061471 O        b'-1:lemma:mm'
-0.062268 Supp     b'lemma:,'
-0.062268 Supp     b'postag:,'
-0.063231 Strain   b'-1:ner:_'
-0.063756 O        b'-1:lemma:harbor'
-0.063804 O        b'lemma:70'
-0.063935 O        b'lemma:;'
-0.063935 O        b'-1:lemma:7.6'
-0.064736 O        b'+1:lemma:pahse'
-0.065275 Med      b'-1:ner:MED'
-0.067315 Supp     b'+2:ner:KWSUPP'
-0.068862 Technique b'-1:postag:SYM'
-0.069961 O        b'lemma:nitrate'
-0.070651 OD       b'postag:JJ'
-0.072225 Gtype    b'lemma:,'
-0.072225 Gtype    b'postag:,'
-0.072341 Anti     b'-1:ner:_'
-0.078518 Phase    b'+2:ner:_'
-0.078535 O        b'+1:lemma:o2'
-0.080478 O        b'+1:lemma:n2'
-0.083059 Supp     b'hUpper'
-0.083063 O        b'lemma:0.2'
-0.084445 Phase    b'-1:lemma:at'
-0.085105 O        b'-1:lemma:gadw'
-0.085171 Substrain b'+1:ner:_'
-0.087430 Anti     b'-1:postag:CD'
-0.087558 Technique b'postag:-RRB-'
-0.088349 O        b'+1:lemma:95'
-0.088922 Air      b'hLower'
-0.091176 O        b'-1:lemma:to'
-0.091176 O        b'-1:postag:TO'
-0.092224 O        b'lemma:250'
-0.093993 OD       b'lemma:2.0'
-0.094134 O        b'+1:lemma:antibody'
-0.094334 O        b'-1:lemma:purify'
-0.096526 O        b'+1:lemma:purify'
-0.097513 O        b'-1:postag:VBG'
-0.097962 O        b'+1:lemma:mm'
-0.097962 O        b'+1:ner:KWSUPP'
-0.099771 Supp     b'postag:NNS'
-0.100100 O        b'+1:lemma:b'
-0.100339 O        b'-1:lemma:250'
-0.100622 O        b'+1:lemma:co2'
-0.102633 O        b'lemma:hour'
-0.104237 O        b'-1:lemma:Fur'
-0.107854 Med      b'+1:postag:NNS'
-0.110818 Supp     b'+1:postag:SYM'
-0.114225 O        b'lemma:0.1'
-0.116885 Gtype    b'lemma:-lrb-'
-0.116886 O        b'+1:lemma:arginine'
-0.117165 O        b'-1:lemma:gadx'
-0.119130 O        b'lemma:1m'
-0.119925 Gtype    b'+1:postag:NNS'
-0.123142 Supp     b'+1:ner:SUPP'
-0.125069 O        b'hUpper'
-0.127281 Supp     b'+2:ner:_'
-0.130039 pH       b'hUpper'
-0.130781 O        b'+1:lemma:1/100'
-0.131926 O        b'lemma:m9'
-0.132159 O        b'-1:lemma:='
-0.133456 O        b'+1:lemma:the'
-0.134447 O        b'+1:postag:FW'
-0.140915 Technique b'+1:postag:-RRB-'
-0.143211 O        b'+1:lemma:minimal'
-0.144203 Technique b'+1:lemma:-rrb-'
-0.152000 O        b'+1:lemma:ph'
-0.159173 O        b'lemma:mg/ml'
-0.159173 O        b'-1:lemma:150'
-0.159693 O        b'-2:ner:SUPP'
-0.159938 O        b'lemma:7.6'
-0.159938 O        b'+1:lemma:;'
-0.162186 O        b'-1:lemma:\xe2\x88\x86'
-0.162363 O        b'+1:lemma:-rrb-'
-0.163174 pH       b'hLower'
-0.164422 Temp     b'-1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.164899 Phase    b'hGreek'
-0.166464 Supp     b'-1:lemma:Fe'
-0.167155 O        b'-1:lemma:dfnr'
-0.167918 O        b'lemma:\xce\xb4soxs'
-0.171171 O        b'lemma:phase'
-0.171333 O        b'+1:postag:VBG'
-0.174047 O        b'-1:postag:CD'
-0.174237 OD       b'postag:NN'
-0.174565 O        b'-1:lemma:phosphate'
-0.175901 O        b'+1:lemma:2.0'
-0.176667 Strain   b'+2:ner:_'
-0.177493 O        b'-1:lemma:sodium'
-0.177639 O        b'+1:lemma:~'
-0.179857 Anti     b'-1:postag:NN'
-0.182632 O        b'lemma:n2'
-0.185377 O        b'-1:lemma:minimal'
-0.185759 O        b'+1:lemma:media'
-0.185836 Supp     b'-1:postag:VBG'
-0.187828 O        b'postag:NN'
-0.188556 Agit     b'postag:NN'
-0.189237 Agit     b'-1:ner:_'
-0.189890 Gtype    b'-1:postag:CD'
-0.191979 Med      b'-1:postag:NN'
-0.194942 Agit     b'-2:ner:_'
-0.197775 Phase    b'-1:postag:IN'
-0.200638 Supp     b'+1:postag:-RRB-'
-0.202857 O        b'+1:lemma:7.6'
-0.204778 Supp     b'+1:lemma:dpd'
-0.211827 Temp     b'symb'
-0.219283 Supp     b'-1:postag:VBN'
-0.220457 O        b'-1:lemma:the'
-0.220585 O        b'-1:lemma:from'
-0.220899 O        b'-1:lemma:in'
-0.225626 Med      b'+1:lemma:m9'
-0.227584 Phase    b'+1:ner:_'
-0.227622 O        b'lemma:\xce\xb4oxyr'
-0.228061 O        b'+1:postag:VB'
-0.228781 O        b'lemma:o2'
-0.229310 Anti     b'symb'
-0.233487 O        b'+1:lemma:sample'
-0.234392 Supp     b'lemma:-lrb-'
-0.235655 Air      b'-2:ner:TF'
-0.236425 pH       b'postag:NN'
-0.236995 O        b'+1:lemma:5'
-0.238439 Phase    b'-1:postag:JJ'
-0.241112 Supp     b'-1:postag:NN'
-0.252779 O        b'-1:lemma:~'
-0.256469 Gversion b'hLower'
-0.256685 Supp     b'-1:lemma:the'
-0.259191 Supp     b'-1:postag:DT'
-0.259434 O        b'-1:lemma:0.2'
-0.261234 O        b'lemma:\xe2\x88\x86'
-0.263136 O        b'+2:ner:MED'
-0.266318 O        b'lemma:20'
-0.275824 O        b'lemma:dpd'
-0.278079 Vess     b'-2:ner:_'
-0.278501 Supp     b'postag:-LRB-'
-0.278591 O        b'-1:lemma:g/l'
-0.280873 Supp     b'+1:lemma:rifampicin'
-0.280938 Air      b'lemma:anaerobically'
-0.282983 O        b'lemma:fecl2'
-0.289596 Supp     b'lemma:and'
-0.295885 OD       b'+1:lemma:.'
-0.295885 OD       b'+1:postag:.'
-0.296223 Supp     b'postag:CC'
-0.300555 O        b'lemma:min'
-0.301515 O        b'-1:lemma:iptg'
-0.302791 O        b'-1:lemma:mid-log'
-0.303240 O        b'-1:lemma:\xc3\x9f'
-0.308711 OD       b'symb'
-0.311553 Strain   b'+1:ner:_'
-0.311763 Anti     b'postag:NNP'
-0.323322 O        b'+1:lemma:-lrb-'
-0.326300 O        b'-1:lemma:delta'
-0.336015 O        b'lemma:co2'
-0.342756 Gtype    b'postag:-RRB-'
-0.342929 O        b'+2:ner:TF'
-0.344771 O        b'lemma:fructose'
-0.346752 O        b'-1:postag:VB'
-0.347366 O        b'+1:lemma:until'
-0.351279 O        b'lemma:m63'
-0.356401 Vess     b'-1:ner:_'
-0.359498 O        b'lemma:rna'
-0.360575 Gtype    b'-1:lemma:and'
-0.364604 O        b'-1:lemma:%'
-0.368676 O        b'+1:lemma:\xc2\xb0c'
-0.371920 O        b'+1:lemma:min'
-0.372841 Anti     b'postag:CD'
-0.373371 pH       b'+2:ner:_'
-0.388366 Med      b'-1:ner:_'
-0.392939 O        b'+1:lemma:fecl2'
-0.416056 Supp     b'lemma:paraquat'
-0.417887 Technique b'+2:ner:_'
-0.418000 Gtype    b'+1:lemma:-rrb-'
-0.430066 O        b'lemma:dissolve'
-0.438010 Gversion b'symb'
-0.443402 O        b'-1:lemma:-lrb-'
-0.448121 O        b'lemma:sample'
-0.453576 O        b'+1:lemma:1m'
-0.454306 O        b'+1:lemma:%'
-0.454336 O        b'-1:lemma:dissolve'
-0.454336 O        b'+1:lemma:methanol'
-0.462252 Technique b'-1:postag:CD'
-0.470165 O        b'lemma:ph'
-0.471181 O        b'+1:lemma:supplement'
-0.478623 Gtype    b'+1:postag:-LRB-'
-0.481661 Med      b'-1:postag:IN'
-0.494226 Supp     b'+1:postag::'
-0.495161 O        b'+1:lemma:300'
-0.502392 O        b'-1:lemma:o2'
-0.505344 Supp     b'lemma:300'
-0.507603 O        b'-1:lemma:od600'
-0.511172 Vess     b'symb'
-0.513597 O        b'-1:ner:SUPP'
-0.514642 O        b'+1:postag:-RRB-'
-0.515145 Med      b'+1:ner:MED'
-0.522333 OD       b'+1:lemma:2.0'
-0.528059 O        b'+1:postag:IN'
-0.528550 O        b'-1:lemma:n2'
-0.528993 Substrain b'-2:ner:_'
-0.529011 Gtype    b'-1:lemma:,'
-0.529011 Gtype    b'-1:postag:,'
-0.529943 O        b'-1:postag:-LRB-'
-0.540267 Gversion b'+1:ner:_'
-0.540469 O        b'lemma:minimal'
-0.544244 Gversion b'-1:postag:NN'
-0.557222 Phase    b'-2:ner:SUPP'
-0.566972 pH       b'-2:ner:_'
-0.573824 O        b'-1:lemma:.'
-0.573824 O        b'-1:postag:.'
-0.575371 O        b'-1:lemma:with'
-0.575485 O        b'+2:ner:SUPP'
-0.579567 Supp     b'lemma:10'
-0.582898 O        b'lemma:od600'
-0.597428 O        b'lemma:mid-log'
-0.598353 Med      b'+1:postag:NN'
-0.608353 Supp     b'-1:lemma:-lrb-'
-0.609535 Med      b'hLower'
-0.611985 O        b'hGreek'
-0.618631 O        b'lemma:150'
-0.618631 O        b'+1:lemma:mg/ml'
-0.618912 O        b'lemma:\xce\xb4ompr'
-0.622645 OD       b'hUpper'
-0.633060 O        b'-1:lemma:1m'
-0.637565 O        b'lemma:methanol'
-0.647853 O        b'+1:lemma:gadx'
-0.650571 O        b'+1:postag:DT'
-0.654852 O        b'+1:lemma:nitrate'
-0.659097 Anti     b'hUpper'
-0.661457 Med      b'+1:postag:CC'
-0.666686 O        b'lemma:pahse'
-0.669887 Gtype    b'+1:lemma:,'
-0.669887 Gtype    b'+1:postag:,'
-0.670109 O        b'lemma:purify'
-0.673725 O        b'-1:postag:IN'
-0.675651 Gtype    b'-1:lemma:mg1655'
-0.687151 Supp     b'-1:postag:-LRB-'
-0.692697 Gtype    b'+1:lemma:and'
-0.696990 OD       b'hLower'
-0.700033 O        b'+1:lemma:from'
-0.700088 Supp     b'+1:postag:VBN'
-0.712250 Supp     b'-1:lemma:dpd'
-0.724052 Air      b'-1:lemma:grow'
-0.727180 O        b'-1:lemma:ph'
-0.759485 O        b'-1:lemma:1'
-0.761472 Gtype    b'postag:CD'
-0.769904 O        b'+1:lemma:g/l'
-0.779492 pH       b'symb'
-0.779681 Gtype    b'-1:lemma:fur'
-0.797342 O        b'lemma:aerobic'
-0.829029 Anti     b'+2:ner:_'
-0.847548 O        b'lemma:of'
-0.871514 Gtype    b'+1:postag:CC'
-0.874045 O        b'-1:lemma:37'
-0.879456 O        b'-1:lemma:IP'
-0.884807 Agit     b'hLower'
-0.895980 Substrain b'hLower'
-0.967151 O        b'postag:RB'
-0.973312 Temp     b'+1:postag:IN'
-0.976370 O        b'+1:lemma:at'
-0.986881 Substrain b'-1:ner:_'
-0.993075 O        b'lemma:m'
-0.997570 Supp     b'lemma:2'
-1.001665 O        b'-1:ner:GEN'
-1.007787 O        b'+1:postag:-LRB-'
-1.023624 Technique b'-1:lemma::'
-1.033250 O        b'-1:lemma:final'
-1.056214 Gtype    b'+1:lemma:crp'
-1.062487 Med      b'-1:postag:CD'
-1.062521 Gtype    b'+1:postag:JJ'
-1.071057 Vess     b'hUpper'
-1.079400 O        b'+1:lemma:contain'
-1.083208 Air      b'postag:NN'
-1.102871 Gtype    b'+1:lemma:-lrb-'
-1.114242 Med      b'+1:postag:IN'
-1.115963 O        b'-1:lemma:rna'
-1.136821 Med      b'postag:CD'
-1.143591 Med      b'lemma:-lrb-'
-1.170657 Supp     b'postag:JJ'
-1.184854 O        b'-1:lemma:m'
-1.205750 Phase    b'symb'
-1.231311 O        b'lemma:medium'
-1.236229 O        b'+1:lemma:m'
-1.239932 O        b'lemma:rifampicin'
-1.257399 Med      b'postag:-LRB-'
-1.265540 Air      b'-1:postag:VBN'
-1.290995 O        b'lemma:anaerobic'
-1.298223 O        b'lemma:0.3'
-1.335612 Technique b'-1:postag::'
-1.381610 Phase    b'postag:JJ'
-1.404670 O        b'-1:lemma:rpob'
-1.416409 O        b'lemma:aerobically'
-1.418184 Gtype    b'-1:postag:CC'
-1.418858 Gtype    b'postag::'
-1.424312 Med      b'-2:ner:MED'
-1.447484 O        b'lemma:nh4cl'
-1.465927 O        b'-1:postag::'
-1.489320 O        b'lemma:37'
-1.492838 Temp     b'hLower'
-1.493480 O        b'-2:ner:TF'
-1.496599 Supp     b'+1:lemma:acetate'
-1.500257 O        b'-1:lemma:co2'
-1.506601 O        b'+1:lemma:in'
-1.527686 O        b'-1:lemma:30'
-1.549243 O        b'lemma:30'
-1.565101 Technique b'+1:ner:_'
-1.623660 Agit     b'hUpper'
-1.626987 Strain   b'symb'
-1.679073 O        b'-1:lemma:ml'
-1.689936 O        b'lemma:nacl'
-1.702622 Supp     b'+1:lemma:nacl'
-1.721335 Supp     b'+1:lemma:-lrb-'
-1.744902 OD       b'+1:postag:NN'
-1.769507 O        b'+1:lemma:genome'
-1.799622 Supp     b'+1:postag:-LRB-'
-1.802724 Supp     b'-1:postag:NNP'
-1.806385 O        b'-1:lemma:contain'
-1.835684 Supp     b'+1:lemma:,'
-1.835684 Supp     b'+1:postag:,'
-1.855386 Strain   b'hLower'
-1.912011 Gtype    b'+1:lemma:\xe2\x88\x86'
-1.912380 O        b'-1:lemma:2'
-1.924347 Supp     b'hGreek'
-1.972564 O        b'-1:lemma:until'
-1.973213 Gtype    b'symb'
-2.041412 O        b'+1:lemma:2'
-2.071938 O        b'lemma:wt'
-2.089763 O        b'lemma:media'
-2.152509 O        b'-1:lemma:fresh'
-2.300475 O        b'+1:lemma:+'
-2.302993 O        b'-1:lemma:vol'
-2.372929 O        b'-1:lemma:sample'
-2.437846 O        b'+1:lemma:_'
-2.473980 O        b'+1:lemma:hour'
-2.665268 O        b'-1:lemma:_'
-2.762336 O        b'+1:lemma:1'
-2.891788 Technique b'symb'
-3.387512 Temp     b'+1:lemma:with'
-4.032646 Phase    b'hUpper'
-6.113182 O        b'-1:lemma::'