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Kevin Meza Landeros
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 early exponential phase	Growth_phase
 mid to late exponential phase	Growth_phase
 10 to 40 MPa	Pressure
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+Φ(soxR)	Genetic_background
 allS knockout mutant	Genetic_background
 plasmid pSE380 mutant	Genetic_background
 sdiA knockout mutant	Genetic_background
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 marA knockout mutant	Genetic_background
 allR knockout mutant	Genetic_background
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 fumarate	SUPP
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 casamino acids	SUPP
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 nitrate	SUPP
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+Pb(II)	SUPP
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 ammonium chloride	SUPP
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 UTP 8	SUPP
+N,N,N',N'-tetrakis(2-pyridylmethyl)ethylenediamine	SUPP
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 allantoin	SUPP
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 yoeH	GEN
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 clpPX	TU
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 dadAX	TU
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 dcrB	TU
 dctA	TU
+dcuB-fumB	TU
+dcuB-fumB	TU
 fumB	TU
 dcuC	TU
 dcuD	TU
 dcuD	TU
 dcuR	TU
 dcuSR	TU
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 ddlA	TU
 ddpXABCDF	TU
 ddpXABCDF	TU
 ddpXABCDF	TU
 decR	TU
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 degP	TU
 degQ	TU
 degQS	TU
@@ -14027,11 +14216,16 @@ dhaM	TU
 dhaR	TU
 diaA	TU
 dicA	TU
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+dicC-ydfXW	TU
 dicF	TU
+dinB-yafNOP	TU
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 ybiB	TU
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@@ -14040,9 +14234,18 @@ dmlA	TU
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 dmsABC	TU
 dmsABC	TU
+dnaAN-recF	TU
+dnaAN-recF	TU
+dnaN-recF	TU
+dnaN-recF	TU
+dnaN-recF	TU
+dnaN-recF	TU
 recF	TU
 recF	TU
 dnaB	TU
+dnaK-tpke11-dnaJ	TU
+dnaK-tpke11-dnaJ	TU
+dnaK-tpke11-dnaJ	TU
 tpke11	TU
 dnaQ	TU
 dnaQ	TU
@@ -14054,6 +14257,7 @@ dpiBA	TU
 dppABCDF	TU
 dps	TU
 dsbB	TU
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 yjdC	TU
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 dsdC	TU
@@ -14066,8 +14270,11 @@ dtpB	TU
 dtpC	TU
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 dusC	TU
+dut-slmA	TU
 dxr	TU
+eaeH-insEF-1E-1F-1	TU
 eamA	TU
 eamB	TU
 ebgAC	TU
@@ -14082,13 +14289,16 @@ ecpR	TU
 eda	TU
 eda	TU
 eda	TU
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 efp	TU
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 emrKY	TU
@@ -14100,10 +14310,16 @@ entH	TU
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 entS	TU
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+epd-pgk	TU
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 pgk	TU
 pgk	TU
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+pgk-fbaA	TU
+pgk-fbaA	TU
 epmA	TU
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@@ -14111,6 +14327,8 @@ eptB	TU
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 ettA	TU
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@@ -14127,7 +14345,9 @@ fabA	TU
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 fabI	TU
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@@ -14140,6 +14360,8 @@ fbp	TU
 fdhD	TU
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 feaB	TU
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@@ -14149,9 +14371,11 @@ feaR	TU
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 fepDGC	TU
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 fetAB	TU
 ffh	TU
 ffs	TU
@@ -14171,8 +14395,10 @@ fixABCX	TU
 fklB	TU
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 fkpA	TU
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 fur	TU
 fur	TU
+uof-fur	TU
 fldB	TU
 flgAMN	TU
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@@ -14181,6 +14407,8 @@ flgKL	TU
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 tcyJ	TU
 fliC	TU
 fliDST	TU
@@ -14195,6 +14423,9 @@ flk	TU
 flxA	TU
 fnr	TU
 fnrS	TU
+focA-pflB	TU
+focA-pflB	TU
+focA-pflB	TU
 pflB	TU
 pflB	TU
 pflB	TU
@@ -14202,6 +14433,11 @@ pflB	TU
 pflB	TU
 folA	TU
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+folD-ybcJ	TU
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 fpr	TU
 frdABCD	TU
 fre	TU
@@ -14214,6 +14450,7 @@ fruBKA	TU
 frvABXR	TU
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 frwD	TU
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 fsaA	TU
 fsr	TU
 ftnA	TU
@@ -14245,6 +14482,8 @@ gadC	TU
 gadC	TU
 gadEF	TU
 gadEF	TU
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+gadEF-mdtEF	TU
 mdtEF	TU
 mdtEF	TU
 mdtEF	TU
@@ -14269,9 +14508,11 @@ gapA	TU
 gapA	TU
 gapA	TU
 gapA	TU
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 yeaD	TU
 gapC_1C_2	TU
 garD	TU
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 rnpB	TU
 gatR_1	TU
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@@ -14279,7 +14520,9 @@ gatYZABCD	TU
 gatZABCD	TU
 gcd	TU
 gcd	TU
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 glxK	TU
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 gcvA	TU
 gcvB	TU
 gcvR	TU
@@ -14289,6 +14532,7 @@ gcvTHP	TU
 gdhA	TU
 gfcA	TU
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+gfcE-etp-etk	TU
 ggt	TU
 ghoST	TU
 ghoST	TU
@@ -14298,6 +14542,7 @@ ghxP	TU
 glcC	TU
 glcBA	TU
 glcDEFGBA	TU
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 glgAP	TU
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 glgCAP	TU
@@ -14320,6 +14565,7 @@ glnLG	TU
 glnHPQ	TU
 glnHPQ	TU
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 glnS	TU
 glnS	TU
 gloB	TU
@@ -14336,19 +14582,26 @@ glnB	TU
 glnB	TU
 glnB	TU
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+glsA-ybaT	TU
+glsB-yneG	TU
 gltA	TU
 gltA	TU
 gltBDF	TU
+gltI-sroC-gltJKL	TU
+gltI-sroC-gltJKL	TU
 gltP	TU
 gltS	TU
 gltX	TU
 gltX	TU
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 glyA	TU
 glyQS	TU
 glyU	TU
 glyU	TU
 glyVXY	TU
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 gmhB	TU
 gmk	TU
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@@ -14368,6 +14621,8 @@ gor	TU
 gor	TU
 gpmA	TU
 gpmA	TU
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+gpmM-envC-yibQ	TU
 gpp	TU
 gpr	TU
 gpt	TU
@@ -14407,16 +14662,23 @@ hcaR	TU
 hcaT	TU
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 hchA	TU
+hcp-hcr	TU
+hcp-hcr	TU
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@@ -14424,8 +14686,10 @@ hemL	TU
 hemL	TU
 hemL	TU
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 higBA	TU
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 hisL	TU
@@ -14440,13 +14704,16 @@ hokA	TU
 hokB	TU
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 valS	TU
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 hscC	TU
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@@ -14467,15 +14734,21 @@ hxpB	TU
 hyaABCDEF	TU
 hybOABCDEFG	TU
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 hyuA	TU
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@@ -14504,11 +14777,48 @@ ilvY	TU
 inaA	TU
 infA	TU
 infA	TU
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 serW	TU
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 insQ	TU
 intA	TU
 intB	TU
@@ -14525,20 +14835,26 @@ iraP	TU
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 flu	TU
 flu	TU
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 istR	TU
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 uhpABC	TU
 ivy	TU
 ivy	TU
 katE	TU
 katG	TU
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 kch	TU
 kdgK	TU
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@@ -14548,7 +14864,9 @@ kdpFABC	TU
 kduD	TU
 kduI	TU
 kefFC	TU
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 kptA	TU
 kup	TU
 kup	TU
@@ -14561,6 +14879,8 @@ lacZYA	TU
 lafU	TU
 lapAB	TU
 lapAB	TU
+lapAB-pyrF-yciH	TU
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 ldcA	TU
 ldcC	TU
 ldhA	TU
@@ -14584,13 +14904,17 @@ leuO	TU
 leuO	TU
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 leuV	TU
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 leuX	TU
+lexA-dinF	TU
 lfhA	TU
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 lit	TU
@@ -14599,8 +14923,11 @@ livKHMGF	TU
 livKHMGF	TU
 lldPRD	TU
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 prs	TU
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 lpcA	TU
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@@ -14608,12 +14935,18 @@ lpp	TU
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 lptD	TU
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 tam	TU
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@@ -14626,6 +14959,7 @@ lysO	TU
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 lysU	TU
 lysU	TU
 lysZ	TU
@@ -14638,6 +14972,7 @@ maeB	TU
 mak	TU
 malEFG	TU
 malI	TU
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 malPQ	TU
 malQ	TU
 malS	TU
@@ -14649,6 +14984,7 @@ manXYZ	TU
 maoP	TU
 dapD	TU
 glnD	TU
+map-glnD-dapD	TU
 marC	TU
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 matP	TU
@@ -14666,15 +15002,19 @@ mdh	TU
 mdh	TU
 mdlAB	TU
 baeSR	TU
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 mdtJI	TU
 mdtK	TU
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 mdtNOP	TU
 mdtQ	TU
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 melR	TU
+menA-rraA	TU
+menA-rraA	TU
 rraA	TU
 menBCE	TU
 menDHBCE	TU
@@ -14700,10 +15040,17 @@ metK	TU
 metNIQ	TU
 metR	TU
 metR	TU
+glnW-metU-glnVX	TU
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 metY	TU
 metY	TU
+metY-rimP-nusA-infB	TU
+metY-rimP-nusA-infB-rbfA-truB-rpsO-pnp	TU
+metY-rimP-nusA-infB-rbfA-truB-rpsO-pnp	TU
 pnp	TU
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 rpsO	TU
+rpsO-pnp	TU
 metZWV	TU
 mfd	TU
 mfd	TU
@@ -14717,6 +15064,8 @@ mgtLA	TU
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 mhpABCDFE	TU
 lacI	TU
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+mhpR-lacI	TU
 mhpT	TU
 miaB	TU
 micA	TU
@@ -14731,6 +15080,7 @@ mlaFEDCB	TU
 mlaFEDCB	TU
 mlaFEDCB	TU
 mlc	TU
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 ynfK	TU
 mliC	TU
 mlrA	TU
@@ -14739,6 +15089,7 @@ mltB	TU
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 mngAB	TU
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 moaABCDE	TU
 moaBCDE	TU
@@ -14758,14 +15110,20 @@ modEF	TU
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 mpl	TU
 mpl	TU
 mppA	TU
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 mqo	TU
 mqsRA	TU
 mqsRA	TU
 ftsAZ	TU
+ftsLI-murEF-mraY-murD-ftsW-murGC-ddlB-ftsQAZ-lpxC	TU
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 ftsQ	TU
 ftsQAZ	TU
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@@ -14773,6 +15131,8 @@ ftsZ	TU
 ftsZ	TU
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@@ -14796,28 +15156,43 @@ mstA	TU
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 mtr	TU
 mtr	TU
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 murQP	TU
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+mutY-yggX-mltC	TU
+mutY-yggX-mltC	TU
+mutY-yggX-mltC-nupG	TU
+mutY-yggX-mltC-nupG	TU
 nupG	TU
 yggX	TU
+yggX-mltC	TU
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 nac	TU
+nadA-pnuC	TU
 nadB	TU
 nadC	TU
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 nadK	TU
 nagA	TU
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 nagC	TU
 nagC	TU
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 nagE	TU
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 nanA	TU
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 nanC	TU
 nanCM	TU
 nanCMS	TU
@@ -14825,6 +15200,8 @@ nanS	TU
 nanR	TU
 ccmABCDEFGH	TU
 napFDAGHBC	TU
+napFDAGHBC-ccmABCDEFGH	TU
+napFDAGHBC-ccmABCDEFGH	TU
 narGHJI	TU
 narK	TU
 narK	TU
@@ -14841,6 +15218,7 @@ gloA	TU
 nemA	TU
 nemR	TU
 nemRA	TU
+nemRA-gloA	TU
 nepI	TU
 nfo	TU
 nfrBA	TU
@@ -14857,8 +15235,11 @@ nimR	TU
 nimT	TU
 cysG	TU
 cysG	TU
+nirBDC-cysG	TU
 nlpA	TU
 nlpC	TU
+nlpD-rpoS	TU
+nlpD-rpoS	TU
 rpoS	TU
 rpoS	TU
 rpoS	TU
@@ -14866,18 +15247,27 @@ rpoS	TU
 rpoS	TU
 nlpI	TU
 nmpC	TU
+nohA-ydfN-tfaQ	TU
 nohB	TU
 norR	TU
 norR	TU
 norVW	TU
+nrdAB-yfaE	TU
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+ribE-nusB-thiL-pgpA	TU
 nrfABCDEFG	TU
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+yebC-ruvC	TU
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 nudE	TU
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 nudG	TU
 nudI	TU
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@@ -14896,6 +15286,10 @@ ompC	TU
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 ompG	TU
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+ompR-envZ	TU
+ompR-envZ	TU
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@@ -14915,6 +15309,8 @@ osmB	TU
 osmC	TU
 osmC	TU
 osmE	TU
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+osmF-yehYXW	TU
 osmY	TU
 otsA	TU
 otsBA	TU
@@ -14924,10 +15320,13 @@ oxyS	TU
 paaABCDEFGHIJK	TU
 paaXY	TU
 paaZ	TU
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+pabC-mltG-tmk-holB-ycfH	TU
 pagP	TU
 panBC	TU
 panD	TU
 panD	TU
+panE-yajL	TU
 panZ	TU
 paoABCD	TU
 parC	TU
@@ -14935,6 +15334,10 @@ patA	TU
 pbl	TU
 pbpG	TU
 pck	TU
+pcnB-folK	TU
+pcnB-folK	TU
+pcnB-folK	TU
+pcnB-folK	TU
 pdeA	TU
 pdeB	TU
 pdeC	TU
@@ -14942,6 +15345,7 @@ pdeD	TU
 pdeF	TU
 pdeG	TU
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+pdeI-dgcI	TU
 pdeK	TU
 pdeL	TU
 pdeL	TU
@@ -14949,7 +15353,13 @@ pdeN	TU
 pdeR	TU
 aceEF	TU
 lpd	TU
+pdhR-aceEF-lpd	TU
+pdxB-usg-truA-dedA	TU
+usg-truA-dedA	TU
+pdxH-tyrS-pdxY	TU
 pdxY	TU
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+tyrS-pdxY	TU
 pdxI	TU
 pdxK	TU
 pepA	TU
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 pepD	TU
 pepE	TU
 pepN	TU
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 pepT	TU
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 pfkA	TU
@@ -14973,6 +15384,7 @@ pgaABCD	TU
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 pgl	TU
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 pgrR	TU
 pgsA	TU
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@@ -14981,6 +15393,7 @@ pheU	TU
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 phnCDE_1E_2FGHIJKLMNOP	TU
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 plsB	TU
@@ -15014,16 +15428,21 @@ potFGHI	TU
 potFGHI	TU
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 recC	TU
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 pphA	TU
 pphB	TU
 ppiA	TU
 ppiA	TU
 ppiA	TU
 ppiA	TU
+ppiB-lpxH	TU
 ppiC	TU
 ppiD	TU
 ppiD	TU
+ppk-ppx	TU
+ppk-ppx	TU
 ppnN	TU
 ppnP	TU
 pppA	TU
@@ -15037,19 +15456,25 @@ pqqL	TU
 preTA	TU
 prfC	TU
 priA	TU
+priC-ybaM	TU
 prkB	TU
+prlC-rsmJ	TU
+prlF-yhaV	TU
+prmB-aroC-mepA-yfcA-epmC-yfcL	TU
 proBA	TU
 proC	TU
 proK	TU
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 proP	TU
 proP	TU
+proQ-prc	TU
 proS	TU
 proVWX	TU
 proVWX	TU
 proVWX	TU
 prpBCDE	TU
 prpR	TU
+psd-mscM	TU
 psiE	TU
 pspABCDE	TU
 pspBCDE	TU
@@ -15060,17 +15485,29 @@ pspF	TU
 pspG	TU
 pssA	TU
 phoU	TU
+pstB-phoU	TU
+pstB-phoU	TU
+pstCAB-phoU	TU
 pstS	TU
 pstSCA	TU
+pstSCAB-phoU	TU
 psuKG	TU
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+pth-ychF	TU
 ychF	TU
 ptrA	TU
+ptrA-recBD	TU
 ptrB	TU
+ptsA-fsaB-gldA	TU
 ptsG	TU
 ptsG	TU
 crr	TU
 crr	TU
+ptsHI-crr	TU
+ptsHI-crr	TU
+ptsHI-crr	TU
+ptsHI-crr	TU
+ptsHI-crr	TU
 purA	TU
 purC	TU
 purEK	TU
@@ -15106,9 +15543,13 @@ eno	TU
 eno	TU
 eno	TU
 eno	TU
+pyrG-eno	TU
+pyrG-eno	TU
+pyrG-eno	TU
 pyrH	TU
 pyrLBI	TU
 pyrLBI	TU
+qmcA-ybbJ	TU
 qorA	TU
 qorB	TU
 qseBC	TU
@@ -15126,7 +15567,10 @@ radD	TU
 raiA	TU
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+ratA-yfjF	TU
+ravA-viaA	TU
 rayT	TU
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 rbsDACBKR	TU
@@ -15142,6 +15586,7 @@ rcsC	TU
 rcsB	TU
 rcsB	TU
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+rcsF-trmO	TU
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@@ -15149,21 +15594,31 @@ rdlC	TU
 rdlD	TU
 recA	TU
 recAX	TU
+recET-ralR-ydaC-xisR-intR	TU
 recN	TU
 recQ	TU
 mazEFG	TU
 mazEFG	TU
 relA	TU
 relA	TU
+relA-mazEF	TU
+relA-mazEF	TU
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 relBE	TU
+relBE-hokD	TU
 rem	TU
 emrE	TU
+renD-emrE	TU
 rep	TU
+rfaD-waaFCL	TU
+rfaD-waaFCL	TU
+rfaD-waaFCL	TU
+rfaD-waaFCL	TU
 rfaE	TU
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 rfbACX	TU
 rfbBDACX	TU
+rfe-wzzE-wecBC-rffGHC-wecE-wzxE-rffT-wzyE-rffM	TU
 rhaBAD	TU
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@@ -15172,14 +15627,24 @@ rhaT	TU
 rhlB	TU
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+rhoL-rho	TU
+rhsA-yibA	TU
 yibA	TU
 rhsB	TU
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 rhtA	TU
 rhtB	TU
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 ribA	TU
 ribC	TU
+ileS-lspA-fkpB-ispH	TU
+ileS-lspA-fkpB-ispH	TU
+ileS-lspA-fkpB-ispH	TU
+lspA-fkpB-ispH	TU
+ribF-ileS-lspA-fkpB-ispH	TU
 ridA	TU
 rihA	TU
 rihB	TU
@@ -15187,20 +15652,26 @@ rihC	TU
 rimJ	TU
 rimL	TU
 rimO	TU
+rirA-waaQGPSBOJYZU	TU
 waaQGPSBOJYZU	TU
 waaYZ	TU
 waaZU	TU
 rlhA	TU
 rlmA	TU
 rlmD	TU
+rlmE-ftsH	TU
+rlmE-ftsH	TU
 rlmF	TU
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+rlmL-uup	TU
 rlmM	TU
 rlmN	TU
 rluB	TU
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 rluF	TU
 rmf	TU
 rmf	TU
@@ -15208,6 +15679,9 @@ rmuC	TU
 rna	TU
 rnb	TU
 rnb	TU
+pdxJ-acpS	TU
+rnc-era	TU
+rnc-era-recO-pdxJ-acpS	TU
 rnd	TU
 rne	TU
 rne	TU
@@ -15220,29 +15694,52 @@ rnlAB	TU
 rnlB	TU
 rnlB	TU
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 rob	TU
 rodZ	TU
 roxA	TU
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 rplY	TU
 rpmE	TU
+rpmH-rnpA	TU
+rpmH-rnpA	TU
+rpmH-rnpA	TU
 rpnA	TU
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+rpnE-ypaA	TU
 rpoH	TU
 rpoH	TU
 rpoH	TU
 rpoH	TU
 rpoH	TU
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 rprA	TU
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 tufA	TU
 tufA	TU
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+rpsMKD-rpoA-rplQ	TU
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 rpsT	TU
 rpsT	TU
 rpoD	TU
@@ -15250,17 +15747,47 @@ rpoD	TU
 rpoD	TU
 rpoD	TU
 rpsU	TU
+rpsU-dnaG-rpoD	TU
+rpsU-dnaG-rpoD	TU
+rpsU-dnaG-rpoD	TU
 rraB	TU
 rraB	TU
+rrlA-rrfA	TU
+rrsA-ileT-alaT-rrlA-rrfA	TU
+rrsA-ileT-alaT-rrlA-rrfA	TU
+rrlB-rrfB	TU
+rrsB-gltT-rrlB-rrfB	TU
+rrsB-gltT-rrlB-rrfB	TU
+rrsC-gltU-rrlC-rrfC	TU
+rrsC-gltU-rrlC-rrfC	TU
+rrsD-ileU-alaU-rrlD-rrfD-thrV-rrfF	TU
+rrsD-ileU-alaU-rrlD-rrfD-thrV-rrfF	TU
+rrlE-rrfE	TU
+rrsE-gltV-rrlE-rrfE	TU
+rrsE-gltV-rrlE-rrfE	TU
 rrfG	TU
+rrsG-gltW-rrlG-rrfG	TU
+rrsG-gltW-rrlG-rrfG	TU
+rrlH-rrfH	TU
+rrsH-ileV-alaV-rrlH-rrfH	TU
+rrsH-ileV-alaV-rrlH-rrfH	TU
 rsd	TU
 rsd	TU
+rpoE-rseABC	TU
+rpoE-rseABC	TU
 rseABC	TU
+rseD-rpoE-rseABC	TU
+rseD-rpoE-rseABC	TU
+rseD-rpoE-rseABC	TU
+rseD-rpoE-rseABC	TU
 rseP	TU
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 rsgA	TU
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 rsmF	TU
 rsmI	TU
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@@ -15276,6 +15803,7 @@ rutR	TU
 rutR	TU
 ruvAB	TU
 ruvAB	TU
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 rybB	TU
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 rydC	TU
@@ -15288,19 +15816,25 @@ ryjB	TU
 rzoD	TU
 rzoR	TU
 sad	TU
+safA-ydeO	TU
 ydeO	TU
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 sapABCDF	TU
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 sbcB	TU
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 sbmC	TU
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+scpA-argK-scpBC	TU
 sdaA	TU
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 sucABCD	TU
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 sdiA	TU
 sdiA	TU
 sdiA	TU
@@ -15311,29 +15845,44 @@ sdiA	TU
 sdsN	TU
 sdsN	TU
 sdsR	TU
+secE-nusG	TU
 leuU	TU
 secG	TU
+secG-leuU	TU
+secG-leuU	TU
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 selAB	TU
 selC	TU
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 serA	TU
 serA	TU
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 serC	TU
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 serU	TU
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 setC	TU
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+dksA-gluQ	TU
+dksA-gluQ	TU
+dksA-gluQ	TU
+sfsA-dksA	TU
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 sroA	TU
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 shiA	TU
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@@ -15343,6 +15892,7 @@ sibD	TU
 sibE	TU
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 sixA	TU
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 slyB	TU
@@ -15361,11 +15911,13 @@ sohB	TU
 sohB	TU
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 soxR	TU
 soxS	TU
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 speC	TU
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@@ -15373,8 +15925,11 @@ sraA	TU
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 ssb	TU
@@ -15384,8 +15939,11 @@ sspAB	TU
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 ssrS	TU
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+ssrS-fau	TU
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 sthA	TU
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 stpA	TU
@@ -15400,9 +15958,14 @@ syd	TU
 symE	TU
 symR	TU
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 talA	TU
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+talA-tktB	TU
 tktB	TU
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 tas	TU
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 tatABCD	TU
@@ -15416,10 +15979,14 @@ tdcBCDEFG	TU
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 tdk	TU
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+yajC-secDF	TU
 thiCEFSGH	TU
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@@ -15428,8 +15995,15 @@ thrL	TU
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 thrW	TU
 tig	TU
 tig	TU
@@ -15440,12 +16014,20 @@ tktA	TU
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 tnaC	TU
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+tolB-pal-cpoB	TU
+tolB-pal-cpoB	TU
+tolC-ygiABC	TU
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+tolC-ygiABC	TU
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 tonB	TU
 topA	TU
 topA	TU
 topA	TU
 topA	TU
 topA	TU
+topAI-yjhQ	TU
 torCAD	TU
 torI	TU
 torR	TU
@@ -15469,6 +16051,7 @@ trg	TU
 trkA	TU
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@@ -15481,6 +16064,7 @@ trxA	TU
 trxA	TU
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 yeaY	TU
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@@ -15499,6 +16083,8 @@ tynA	TU
 tyrB	TU
 tyrP	TU
 tyrP	TU
+tyrTV-tpr	TU
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 uacT	TU
 ubiCA	TU
 ubiD	TU
@@ -15510,6 +16096,7 @@ ubiK	TU
 ucpA	TU
 ucpA	TU
 dcd	TU
+udk-dcd	TU
 udp	TU
 ugd	TU
 ugpBAECQ	TU
@@ -15520,8 +16107,10 @@ uidR	TU
 ulaABCDEF	TU
 ulaG	TU
 ulaR	TU
+umpG-pcm	TU
 umuDC	TU
 ung	TU
+upp-uraA	TU
 ushA	TU
 uspA	TU
 uspA	TU
@@ -15545,26 +16134,38 @@ uxaCA	TU
 uxaCA	TU
 uxuAB	TU
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+valUXY-lysV	TU
 valVW	TU
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 ves	TU
 waaA	TU
 waaA	TU
+waaA-coaD	TU
 waaH	TU
 waaH	TU
 wbbIJK	TU
 wbbL_2	TU
+wcaCDEF-gmd-fcl-gmm-wcaI-cpsBG-wcaJ-wzxC	TU
 wcaKLM	TU
 wecH	TU
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+wza-wzb-wzc	TU
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 xapAB	TU
 xapR	TU
 xapR	TU
 xdhABC	TU
 xdhABC	TU
 dsbC	TU
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+prfB-lysS	TU
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+xerD-dsbC-recJ	TU
 xseA	TU
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 yajO	TU
 xthA	TU
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@@ -15580,6 +16181,7 @@ yaaW	TU
 yaaX	TU
 yabI	TU
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+yacC-speED	TU
 yacH	TU
 yacL	TU
 yadE	TU
@@ -15588,9 +16190,14 @@ yadI	TU
 yadC	TU
 yadMLKC	TU
 yadN	TU
+yadV-htrE	TU
+yadV-htrE	TU
+yadV-htrE	TU
 yaeF	TU
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+yaeP-rof	TU
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 yaeR	TU
 yafC	TU
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 yafT	TU
 yafU	TU
 yafV	TU
+yafY-ykfBF-yafX-ykfGH-yafW-ykfI	TU
+ykfBF-yafX-ykfGH-yafW-ykfI	TU
+ykfBF-yafX-ykfGH-yafW-ykfI	TU
+ykfGH-yafW-ykfI	TU
+yagAB-insX	TU
 yagEF	TU
 yagGH	TU
 yagJ	TU
@@ -15635,10 +16247,12 @@ yaiZ	TU
 yajD	TU
 ampG	TU
 yajG	TU
+yajG-ampG	TU
 yajI	TU
 yajQ	TU
 yajR	TU
 ybaA	TU
+ybaB-recR	TU
 ybaE	TU
 ybaK	TU
 ybaL	TU
@@ -15655,6 +16269,7 @@ ybcH	TU
 ybcI	TU
 ybcK	TU
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 ybcQ	TU
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@@ -15671,12 +16286,17 @@ ybdO	TU
 ybdR	TU
 lipB	TU
 ybeD	TU
+ybeD-lipB	TU
 ybeF	TU
 ybeL	TU
 ybeM_1M_2	TU
 ybeQ	TU
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 ybeT	TU
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+ybeX-lnt	TU
 ybeZY	TU
+ybeZYX-lnt	TU
 ybfA	TU
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 ybfE	TU
@@ -15687,7 +16307,13 @@ ybfOC	TU
 ybfP	TU
 ybfQ	TU
 phr	TU
+ybgA-phr	TU
+ybgA-phr	TU
+ybgC-tolQRA	TU
+ybgC-tolQRA	TU
 ybgD	TU
+ybgI-pxpBCA-nei	TU
+ybgI-pxpBCA-nei	TU
 ybgQPO	TU
 ybgS	TU
 ybhA	TU
@@ -15700,6 +16326,7 @@ ybhJ	TU
 ybhK	TU
 ybhL	TU
 ybhM	TU
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 ybhQ	TU
 ybiA	TU
 ybiI	TU
@@ -15710,6 +16337,8 @@ ybiU	TU
 ybiV	TU
 ybiX	TU
 ybiYW	TU
+rimK-ybjN	TU
+ybjC-nfsA-rimK-ybjN	TU
 ybjN	TU
 ybjD	TU
 ybjG	TU
@@ -15717,18 +16346,23 @@ ybjH	TU
 ybjJI	TU
 ybjL	TU
 ybjM	TU
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 ybjP	TU
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 ybjX	TU
 ycaC	TU
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 ycaK	TU
 ycaL	TU
 ycaM	TU
 ycaN	TU
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 ycbJ	TU
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 ycbX	TU
 ycbZ	TU
 yccA	TU
@@ -15743,8 +16377,15 @@ ycdZ	TU
 yceA	TU
 yceB	TU
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+acpP-fabF	TU
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 fabF	TU
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+rpmF-plsX-fabHDG	TU
+yceD-rpmF	TU
+yceD-rpmF	TU
 yceF	TU
 yceH	TU
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@@ -15766,6 +16407,8 @@ ycgX	TU
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+ymgA-ariR	TU
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@@ -15774,6 +16417,7 @@ ychJ	TU
 ychN	TU
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 yciA	TU
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@@ -15781,6 +16425,7 @@ yciE	TU
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 yciGFE	TU
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 yciN	TU
 yciVOQ	TU
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@@ -15789,19 +16434,27 @@ yciT	TU
 yciZT	TU
 ycjD	TU
 ycjG	TU
+ycjMNOPQRSTUV-ymjB	TU
 ycjW	TU
 tyrR	TU
 ycjXF	TU
+ycjXF-tyrR	TU
 mpaA	TU
 mpaA	TU
 ycjY	TU
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 ydbA_1	TU
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+ydbK-ompN	TU
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@@ -15813,6 +16466,9 @@ ydcL	TU
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 ydcR	TU
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+ydcSTUV-patD	TU
+ydcSTUV-patD	TU
 ydcY	TU
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 yddE	TU
@@ -15848,7 +16504,10 @@ ydgA	TU
 ydgC	TU
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+ydgK-rsxABCDGE-nth	TU
 ydhB	TU
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 ydhF	TU
@@ -15863,19 +16522,26 @@ ydhYVW	TU
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 ydiE	TU
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+selD-topB	TU
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 ydjE	TU
 ydjF	TU
 ydjLKJIHG	TU
 ydjM	TU
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@@ -15884,6 +16550,7 @@ yeaK	TU
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@@ -15902,6 +16569,8 @@ yecDE	TU
 yecF	TU
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 yecJ	TU
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 yecR	TU
 yecT	TU
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@@ -15922,9 +16591,11 @@ yeeL_1L_2	TU
 yeeN	TU
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 yeeX	TU
 yeeY	TU
 yeeZ	TU
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 yegD	TU
 yegH	TU
 yegI	TU
@@ -15951,6 +16622,7 @@ yeiL	TU
 yeiL	TU
 yeiP	TU
 yeiQ	TU
+yeiR-lpxT	TU
 yeiW	TU
 yejABEF	TU
 yejG	TU
@@ -15962,6 +16634,8 @@ yfaATS_1S_2QP	TU
 yfaH	TU
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+yfaX-rhmD-yfaVU	TU
 yfaY	TU
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@@ -15971,6 +16645,7 @@ yfbN	TU
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 yfcD	TU
@@ -15991,6 +16666,7 @@ frc	TU
 oxc	TU
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 yfdY	TU
 yfeCD	TU
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@@ -15999,6 +16675,8 @@ yfeN	TU
 yfeO	TU
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+dapE-ypfN	TU
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@@ -16013,6 +16691,7 @@ yfgM	TU
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@@ -16020,13 +16699,18 @@ yfiF	TU
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@@ -16063,9 +16747,12 @@ ygeV	TU
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@@ -16076,6 +16763,8 @@ yggN	TU
 yggN	TU
 yggN	TU
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 yghA	TU
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@@ -16090,8 +16779,10 @@ yghU	TU
 yghW	TU
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 ygiS	TU
@@ -16129,20 +16820,27 @@ yhcN	TU
 yhcO	TU
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+yheO-tusDCB	TU
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 nfuA	TU
 nfuA	TU
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@@ -16155,6 +16853,8 @@ yhhT	TU
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 yhiJ	TU
 yhiK	TU
 yhiL	TU
@@ -16177,6 +16877,8 @@ yiaD	TU
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+yiaKLMNO-lyxK-sgbHUE	TU
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@@ -16187,7 +16889,9 @@ yibIH	TU
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@@ -16198,6 +16902,9 @@ yicN	TU
 mutM	TU
 mutM	TU
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@@ -16213,8 +16920,10 @@ yidX	TU
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@@ -16231,12 +16940,14 @@ yihQ	TU
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 yiiE	TU
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 yiiM	TU
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 yiiX	TU
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@@ -16266,6 +16977,17 @@ yjdIJ	TU
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+miaA-hfq-hflXKC	TU
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+mutL-miaA-hfq-hflXKC	TU
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+yjeF-tsaE-amiB-mutL-miaA-hfq-hflXKC	TU
+yjeF-tsaE-amiB-mutL-miaA-hfq-hflXKC	TU
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 yjeH	TU
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@@ -16300,6 +17022,7 @@ yjhP	TU
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@@ -16309,9 +17032,13 @@ yjiT	TU
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 dnaTC	TU
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+yjjB-dnaTC-yjjA	TU
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@@ -16319,7 +17046,9 @@ yjjY	TU
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+ykfA-yafZ	TU
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 ykgA	TU
 ykgEFG	TU
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@@ -16332,22 +17061,33 @@ ykiB	TU
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 ylbG	TU
 yliI	TU
+ymcE-gnsA	TU
 clsC	TU
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 yncD	TU
 yncE	TU
@@ -16363,11 +17103,14 @@ yneJ	TU
 yneK	TU
 yneL	TU
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 yniB	TU
@@ -16384,7 +17127,11 @@ yoaE	TU
 yoaF	TU
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 yobH	TU
 yodB	TU
 yodC	TU
@@ -16402,9 +17149,11 @@ yojI	TU
 ypdABC	TU
 ypdI	TU
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@@ -16416,9 +17165,13 @@ ypjB	TU
 ypjC	TU
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 ypjM_1M_2	TU
+ypjM_3-yfjU	TU
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 kbp	TU
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+yqaE-kbp	TU
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@@ -16438,9 +17191,12 @@ yqgEF	TU
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 yqhH	TU
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+yqjA-mzrA	TU
+yqjA-mzrA	TU
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 yqjG	TU
@@ -16453,14 +17209,24 @@ yraP	TU
 yraP	TU
 yraQ	TU
 yraR	TU
+kdsC-lptCAB	TU
+kdsC-lptCAB	TU
+kdsC-lptCAB	TU
 lptAB	TU
 lptAB	TU
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+rpoN-hpf-ptsN-rapZ-npr	TU
+yrbG-kdsD	TU
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@@ -16475,7 +17241,11 @@ ytfI	TU
 ytfJ	TU
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+ytfQRT-yjfF	TU
+idlP-iraD	TU
+ytiCD-idlP-iraD	TU
 ytjA	TU
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 ytjC	TU
 yzcX	TU
 yzfA	TU
@@ -16506,7 +17276,9 @@ C0719	Op
 IS128	Op
 aaeR	Op
 aaeXAB	Op
+aas-lplT	Op
 aat	Op
+abgABT-ogt	Op
 abgR	Op
 abpAB	Op
 abrB	Op
@@ -16514,6 +17286,7 @@ accA	Op
 accBC	Op
 accD	Op
 aceBAK	Op
+ackA-pta	Op
 acnA	Op
 acnB	Op
 acpH	Op
@@ -16523,6 +17296,8 @@ acrD	Op
 acrEF	Op
 acrR	Op
 acrZ	Op
+acs-yjcH-actP	Op
+ada-alkB	Op
 add	Op
 adeD	Op
 adeP	Op
@@ -16537,6 +17312,7 @@ aegA	Op
 aer	Op
 aes	Op
 agaR	Op
+agaS-kbaY-agaBCDI	Op
 agp	Op
 agrA	Op
 agrB	Op
@@ -16544,6 +17320,7 @@ ahpCF	Op
 ahr	Op
 aidB	Op
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 alaC	Op
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@@ -16560,6 +17337,7 @@ alr	Op
 alsK	Op
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 amn	Op
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@@ -16567,6 +17345,7 @@ ampDE	Op
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@@ -16576,6 +17355,7 @@ apt	Op
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 araJ	Op
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@@ -16593,11 +17373,16 @@ argO	Op
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 argU	Op
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 arnBCADTEF	Op
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 aroG	Op
 aroH	Op
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+aroL-yaiA-aroM	Op
 aroP	Op
 arpA	Op
 arpB_1B_2	Op
@@ -16613,11 +17398,13 @@ aslB	Op
 asmA	Op
 asnA	Op
 asnB	Op
+asnC-mioC-mnmG-rsmG	Op
 asnS	Op
 asnT	Op
 asnU	Op
 asnV	Op
 asnW	Op
+aspA-dcuA	Op
 aspC	Op
 aspS	Op
 aspT	Op
@@ -16633,6 +17420,8 @@ avtA	Op
 azoR	Op
 azuC	Op
 bacA	Op
+bamA-skp-lpxD-fabZ-lpxAB-rnhB-dnaE	Op
+bamB-der	Op
 bamD	Op
 bamE	Op
 barA	Op
@@ -16645,10 +17434,14 @@ bcsEFG	Op
 bcsQ	Op
 bdcA	Op
 bdcR	Op
+bdm-sra	Op
+bepA-yfgD	Op
 betIBA	Op
 betT	Op
+bfd-bfr	Op
 bglA	Op
 bglGFB	Op
+bglH-yieLK	Op
 bglX	Op
 bhsA	Op
 bioA	Op
@@ -16663,11 +17456,13 @@ bluF	Op
 bluR	Op
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 borD	Op
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 bsmA	Op
 bssR	Op
 bssS	Op
 btsSR	Op
 btsT	Op
+btuB-murI	Op
 btuCED	Op
 cadBA	Op
 cadC	Op
@@ -16687,6 +17482,7 @@ cdd	Op
 cdgI	Op
 cdh	Op
 cdsA	Op
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 cedA	Op
 cfa	Op
 chaA	Op
@@ -16704,9 +17500,15 @@ clcA	Op
 clcB	Op
 clpA	Op
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+clpPX-lon	Op
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+clsA-yciU	Op
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@@ -16719,11 +17521,13 @@ cpxRA	Op
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 crl_1	Op
 crp	Op
 csdAE	Op
 csgBAC	Op
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+csiD-lhgO-gabDTP	Op
 csiE	Op
 csiR	Op
 cspA	Op
@@ -16745,6 +17549,7 @@ curA	Op
 cusCFBA	Op
 cusRS	Op
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+cvpA-purF-ubiX	Op
 cvrA	Op
 cyaA	Op
 cyaR	Op
@@ -16754,6 +17559,7 @@ cybC	Op
 cycA	Op
 cydAB	Op
 cydDC	Op
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 cynTSX	Op
 cyoABCDE	Op
@@ -16772,17 +17578,22 @@ dacB	Op
 dacC	Op
 dacD	Op
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 dapB	Op
 dauA	Op
+dcm-vsr	Op
 dcp	Op
 dcrB	Op
 dctA	Op
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 dcuC	Op
 dcuD	Op
 dcuSR	Op
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 degP	Op
 degQS	Op
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@@ -16804,9 +17615,14 @@ dhaKLM	Op
 dhaR	Op
 diaA	Op
 dicA	Op
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+dicC-ydfXW	Op
 dicF	Op
+dinB-yafNOP	Op
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+dinJ-yafQ	Op
 dinQ	Op
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 dmlA	Op
 dmlR	Op
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 dnaQ	Op
 dnaX	Op
 dosCP	Op
@@ -16822,6 +17640,7 @@ dpiBA	Op
 dppABCDF	Op
 dps	Op
 dsbB	Op
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 dsbG	Op
 dsdC	Op
 dsdXA	Op
@@ -16832,8 +17651,11 @@ dtpB	Op
 dtpC	Op
 dtpD	Op
 dusA	Op
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 dusC	Op
+dut-slmA	Op
 dxr	Op
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 eamA	Op
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@@ -16843,13 +17665,16 @@ eco	Op
 ecpA	Op
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 efp	Op
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@@ -16858,6 +17683,8 @@ endA	Op
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@@ -16865,6 +17692,8 @@ eptB	Op
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@@ -16877,7 +17706,9 @@ exuT	Op
 fabA	Op
 fabB	Op
 fabI	Op
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+fadD-sroD	Op
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@@ -16889,13 +17720,17 @@ fbp	Op
 fdhD	Op
 fdhF	Op
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+fdoGHI-fdhE	Op
+fdrA-ylbEF-ybcF	Op
 feaB	Op
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+fepA-entD	Op
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 ffh	Op
 ffs	Op
@@ -16911,12 +17746,14 @@ fiu	Op
 fixABCX	Op
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 flgAMN	Op
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@@ -16926,8 +17763,14 @@ flk	Op
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 fnr	Op
 fnrS	Op
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@@ -16939,6 +17782,7 @@ fruBKA	Op
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@@ -16955,6 +17799,7 @@ fumD	Op
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@@ -16962,12 +17807,15 @@ galP	Op
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 higBA	Op
+hinT-ycfL-lpoB-thiK-nagZ-ycfP	Op
 hipBA	Op
 hisLGDCBHAFI	Op
 hisS	Op
@@ -17068,11 +17931,14 @@ hofQ	Op
 hokA	Op
 hokB	Op
 hokE	Op
+holC-valS	Op
+holD-rimI-yjjG	Op
 holE	Op
 hprRS	Op
 hpt	Op
 hrpA	Op
 hrpB	Op
+hscBA-fdx-iscX	Op
 hscC	Op
 hsdRMS	Op
 hslJ	Op
@@ -17087,9 +17953,14 @@ hxpB	Op
 hyaABCDEF	Op
 hybOABCDEFG	Op
 hycABCDEFGHI	Op
+hydN-hypF	Op
+hyfABCDEFGHIJR-focB	Op
+hypABCDE-fhlA	Op
 hypT	Op
 hyuA	Op
+iaaA-gsiABCD	Op
 iap	Op
+ibaG-murA	Op
 ibpAB	Op
 icd	Op
 icdC	Op
@@ -17104,9 +17975,46 @@ ilvIH	Op
 ilvLXG_1G_2MEDA	Op
 ilvY	Op
 inaA	Op
+infA-serW	Op
+insA-4AB-4B-4	Op
+insA-7	Op
+insAB-1A-1B-1	Op
+insAB-2A-2B-2-afuBC	Op
+insAB-3A-3B-3	Op
+insAB-5A-5B-5	Op
+insB-7_1B-7_2	Op
+insC-1CD-1D-1	Op
+insC-5CD-5D-5-yqiGHI	Op
+insC-6CD-6D-6	Op
+insCD-2C-2D-2	Op
+insCD-3C-3D-3	Op
+insCD-4C-4D-4-ygeONM	Op
+insE-3EF-3F-3	Op
+insE-5EF-5F-5	Op
+insEF-2E-2F-2	Op
+insEF-4E-4F-4	Op
 insG	Op
+insH-1	Op
+insH-10	Op
+insH-11	Op
+insH-2	Op
+insH-3	Op
+insH-4	Op
+insH-5	Op
+insH-6	Op
+insH-7	Op
+insH-8	Op
+insH-9	Op
+insI-2	Op
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 insK	Op
+insL-1	Op
+insL-2	Op
+insL-3	Op
+insMI-3	Op
+insN-1I-1O-1	Op
+insN-2	Op
+insO-2-yjhWV	Op
 insQ	Op
 intA	Op
 intB	Op
@@ -17121,12 +18029,17 @@ iraP	Op
 iscRSUA	Op
 ispB	Op
 ispDF	Op
+ispG-sroE	Op
 ispU	Op
 isrB	Op
+isrC-flu	Op
 istR	Op
+ivbL-ilvBN-uhpABC	Op
 ivy	Op
 katE	Op
 katG	Op
+kbaZ-agaVWA	Op
+kbl-tdh	Op
 kch	Op
 kdgK	Op
 kdgR	Op
@@ -17136,11 +18049,14 @@ kdpFABC	Op
 kduD	Op
 kduI	Op
 kefFC	Op
+kefGB-yheV	Op
 kgtP	Op
+kilR-ydaE	Op
 kptA	Op
 kup	Op
 lacZYA	Op
 lafU	Op
+lapAB-pyrF-yciH	Op
 ldcA	Op
 ldcC	Op
 ldhA	Op
@@ -17158,11 +18074,15 @@ leuE	Op
 leuLABCD	Op
 leuO	Op
 leuQPV	Op
+leuS-lptE-holA-nadD-cobC	Op
 leuX	Op
+lexA-dinF	Op
 lfhA	Op
 lgoD	Op
 lgoR	Op
 lgoT	Op
+lgt-thyA	Op
+ligA-ypeB	Op
 ligB	Op
 lipA	Op
 lit	Op
@@ -17170,16 +18090,21 @@ livJ	Op
 livKHMGF	Op
 lldPRD	Op
 loiP	Op
+lolA-rarA	Op
+lolB-ispE-prs	Op
 lolCDE	Op
+lomR_2-stfR-tfaR	Op
 lpcA	Op
 lpoA	Op
 lpp	Op
+lptD-surA-pdxA-rsmA-apaGH	Op
 lptFG	Op
 lpxL	Op
 lpxM	Op
 lpxP	Op
 lrhA	Op
 lrp	Op
+lsrACDBFG-tam	Op
 lsrRK	Op
 luxS	Op
 lysA	Op
@@ -17188,6 +18113,7 @@ lysO	Op
 lysP	Op
 lysQ	Op
 lysR	Op
+lysT-valT-lysW	Op
 lysU	Op
 lysZ	Op
 maa	Op
@@ -17197,6 +18123,7 @@ maeB	Op
 mak	Op
 malEFG	Op
 malI	Op
+malK-lamB-malM	Op
 malPQ	Op
 malS	Op
 malT	Op
@@ -17205,6 +18132,7 @@ malZ	Op
 manA	Op
 manXYZ	Op
 maoP	Op
+map-glnD-dapD	Op
 marC	Op
 marRAB	Op
 matP	Op
@@ -17218,15 +18146,18 @@ mdaB	Op
 mdfA	Op
 mdh	Op
 mdlAB	Op
+mdtABCD-baeSR	Op
 mdtG	Op
 mdtH	Op
 mdtJI	Op
 mdtK	Op
 mdtL	Op
+mdtM-yjiN	Op
 mdtNOP	Op
 mdtQ	Op
 melAB	Op
 melR	Op
+menA-rraA	Op
 menFDHBCE	Op
 mepH	Op
 mepM	Op
@@ -17242,6 +18173,8 @@ metJ	Op
 metK	Op
 metNIQ	Op
 metR	Op
+metT-leuW-glnUW-metU-glnVX	Op
+metY-rimP-nusA-infB-rbfA-truB-rpsO-pnp	Op
 metZWV	Op
 mfd	Op
 mglBAC	Op
@@ -17251,6 +18184,7 @@ mgsA	Op
 mgtLA	Op
 mgtS	Op
 mhpABCDFE	Op
+mhpR-lacI	Op
 mhpT	Op
 miaB	Op
 micA	Op
@@ -17261,6 +18195,7 @@ minCDE	Op
 mipA	Op
 mlaA	Op
 mlaFEDCB	Op
+mlc-ynfK	Op
 mliC	Op
 mlrA	Op
 mltA	Op
@@ -17268,6 +18203,7 @@ mltB	Op
 mltD	Op
 mltF	Op
 mmuPM	Op
+mnaT-ydcZ	Op
 mngAB	Op
 mngR	Op
 mnmA	Op
@@ -17275,6 +18211,7 @@ mnmC	Op
 mnmE	Op
 mntH	Op
 mntP	Op
+mntR-ybiR	Op
 moaABCDE	Op
 mobAB	Op
 mocA	Op
@@ -17283,11 +18220,16 @@ modEF	Op
 moeAB	Op
 mog	Op
 mokB	Op
+mokC-hokC	Op
 molR_1	Op
+molR_2R_3-yehI	Op
+motAB-cheAW	Op
 mpl	Op
 mppA	Op
+mprA-emrAB	Op
 mqo	Op
 mqsRA	Op
+mraZ-rsmH-ftsLI-murEF-mraY-murD-ftsW-murGC-ddlB-ftsQAZ-lpxC	Op
 mrcA	Op
 mrcB	Op
 mreBCD	Op
@@ -17304,20 +18246,29 @@ mstA	Op
 msyB	Op
 mtfA	Op
 mtlADR	Op
+mtn-btuF-yadS	Op
 mtr	Op
 mug	Op
+murB-birA	Op
 murJ	Op
+murQP-yfeW	Op
 murR	Op
 mutH	Op
 mutS	Op
+mutY-yggX-mltC-nupG	Op
 nac	Op
+nadA-pnuC	Op
 nadB	Op
 nadC	Op
 nadE	Op
 nadK	Op
+nagBAC-umpH	Op
 nagE	Op
+nagK-cobB	Op
+nanATEK-yhcH	Op
 nanCMS	Op
 nanR	Op
+napFDAGHBC-ccmABCDEFGH	Op
 narGHJI	Op
 narK	Op
 narP	Op
@@ -17327,6 +18278,7 @@ narXL	Op
 narZYWV	Op
 ndh	Op
 ndk	Op
+nemRA-gloA	Op
 nepI	Op
 nfo	Op
 nfrBA	Op
@@ -17337,17 +18289,26 @@ nhoA	Op
 nikABCDER	Op
 nimR	Op
 nimT	Op
+nirBDC-cysG	Op
 nlpA	Op
 nlpC	Op
+nlpD-rpoS	Op
 nlpI	Op
 nmpC	Op
+nohA-ydfN-tfaQ	Op
 nohB	Op
 norR	Op
 norVW	Op
+nrdAB-yfaE	Op
 nrdDG	Op
 nrdHIEF	Op
+nrdR-ribDE-nusB-thiL-pgpA	Op
 nrfABCDEFG	Op
+nsrR-rnr-rlmB-yjfIJ	Op
+nudB-yebC-ruvC	Op
+nudC-hemE-nfi	Op
 nudE	Op
+nudF-yqiB-cpdA-yqiA-parE	Op
 nudG	Op
 nudI	Op
 nudK	Op
@@ -17361,6 +18322,7 @@ ompC	Op
 ompF	Op
 ompG	Op
 ompL	Op
+ompR-envZ	Op
 ompW	Op
 ompX	Op
 omrA	Op
@@ -17376,6 +18338,7 @@ ortT	Op
 osmB	Op
 osmC	Op
 osmE	Op
+osmF-yehYXW	Op
 osmY	Op
 otsBA	Op
 oxyR	Op
@@ -17383,9 +18346,12 @@ oxyS	Op
 paaABCDEFGHIJK	Op
 paaXY	Op
 paaZ	Op
+pabB-nudL	Op
+pabC-mltG-tmk-holB-ycfH	Op
 pagP	Op
 panBC	Op
 panD	Op
+panE-yajL	Op
 panZ	Op
 paoABCD	Op
 parC	Op
@@ -17393,6 +18359,7 @@ patA	Op
 pbl	Op
 pbpG	Op
 pck	Op
+pcnB-folK	Op
 pdeA	Op
 pdeB	Op
 pdeC	Op
@@ -17400,10 +18367,14 @@ pdeD	Op
 pdeF	Op
 pdeG	Op
 pdeH	Op
+pdeI-dgcI	Op
 pdeK	Op
 pdeL	Op
 pdeN	Op
 pdeR	Op
+pdhR-aceEF-lpd	Op
+pdxB-usg-truA-dedA	Op
+pdxH-tyrS-pdxY	Op
 pdxI	Op
 pdxK	Op
 pepA	Op
@@ -17411,6 +18382,7 @@ pepB	Op
 pepD	Op
 pepE	Op
 pepN	Op
+pepQ-yigZ-trkH-hemG	Op
 pepT	Op
 perR	Op
 pfkA	Op
@@ -17421,6 +18393,7 @@ pgaABCD	Op
 pgi	Op
 pgl	Op
 pgpB	Op
+pgpC-tadA	Op
 pgrR	Op
 pgsA	Op
 pheLA	Op
@@ -17428,6 +18401,7 @@ pheP	Op
 pheU	Op
 pheV	Op
 phnCDE_1E_2FGHIJKLMNOP	Op
+phoA-psiF	Op
 phoBR	Op
 phoE	Op
 phoH	Op
@@ -17440,6 +18414,7 @@ pitA	Op
 pitB	Op
 plaP	Op
 pldA	Op
+pldB-yigL	Op
 pliG	Op
 plsB	Op
 plsC	Op
@@ -17455,11 +18430,15 @@ potABCD	Op
 potFGHI	Op
 ppa	Op
 ppc	Op
+ppdAB-ygdB-ppdC-recC	Op
+ppdD-hofBC	Op
 pphA	Op
 pphB	Op
 ppiA	Op
+ppiB-lpxH	Op
 ppiC	Op
 ppiD	Op
+ppk-ppx	Op
 ppnN	Op
 ppnP	Op
 pppA	Op
@@ -17471,25 +18450,36 @@ pqqL	Op
 preTA	Op
 prfC	Op
 priA	Op
+priC-ybaM	Op
 prkB	Op
+prlC-rsmJ	Op
+prlF-yhaV	Op
+prmB-aroC-mepA-yfcA-epmC-yfcL	Op
 proBA	Op
 proC	Op
 proK	Op
 proL	Op
 proP	Op
+proQ-prc	Op
 proS	Op
 proVWX	Op
 prpBCDE	Op
 prpR	Op
+psd-mscM	Op
 psiE	Op
 pspABCDE	Op
 pspF	Op
 pspG	Op
 pssA	Op
+pstSCAB-phoU	Op
 psuKG	Op
 psuT	Op
+pth-ychF	Op
+ptrA-recBD	Op
 ptrB	Op
+ptsA-fsaB-gldA	Op
 ptsG	Op
+ptsHI-crr	Op
 purA	Op
 purC	Op
 purEK	Op
@@ -17507,8 +18497,10 @@ pykA	Op
 pykF	Op
 pyrC	Op
 pyrD	Op
+pyrG-eno	Op
 pyrH	Op
 pyrLBI	Op
+qmcA-ybbJ	Op
 qorA	Op
 qorB	Op
 qseBC	Op
@@ -17524,7 +18516,10 @@ racR	Op
 radD	Op
 raiA	Op
 ralA	Op
+rapA-rluA	Op
 rarD	Op
+ratA-yfjF	Op
+ravA-viaA	Op
 rayT	Op
 rbn	Op
 rbsDACBKR	Op
@@ -17536,31 +18531,44 @@ rcnR	Op
 rcsA	Op
 rcsC	Op
 rcsDB	Op
+rcsF-trmO	Op
 rdgC	Op
 rdlA	Op
 rdlB	Op
 rdlC	Op
 rdlD	Op
 recAX	Op
+recET-ralR-ydaC-xisR-intR	Op
 recN	Op
 recQ	Op
+relA-mazEFG	Op
+relBE-hokD	Op
 rem	Op
+renD-emrE	Op
 rep	Op
+rfaD-waaFCL	Op
 rfaE	Op
 rfaH	Op
 rfbBDACX	Op
+rfe-wzzE-wecBC-rffGHC-wecE-wzxE-rffT-wzyE-rffM	Op
 rhaBAD	Op
 rhaM	Op
 rhaSR	Op
 rhaT	Op
 rhlB	Op
 rhlE	Op
+rhoL-rho	Op
+rhsA-yibA	Op
 rhsB	Op
+rhsC-ybfB	Op
+rhsD-ybbC-ylbH-ybbD	Op
+rhsE-ydcD	Op
 rhtA	Op
 rhtB	Op
 rhtC	Op
 ribA	Op
 ribC	Op
+ribF-ileS-lspA-fkpB-ispH	Op
 ridA	Op
 rihA	Op
 rihB	Op
@@ -17568,47 +18576,81 @@ rihC	Op
 rimJ	Op
 rimL	Op
 rimO	Op
+rirA-waaQGPSBOJYZU	Op
 rlhA	Op
 rlmA	Op
 rlmD	Op
+rlmE-ftsH	Op
 rlmF	Op
 rlmG	Op
 rlmI	Op
 rlmJ	Op
+rlmL-uup	Op
 rlmM	Op
 rlmN	Op
 rluB	Op
 rluC	Op
+rluD-pgeF	Op
+rluE-nudJ	Op
 rluF	Op
 rmf	Op
 rmuC	Op
 rna	Op
 rnb	Op
+rnc-era-recO-pdxJ-acpS	Op
 rnd	Op
 rne	Op
 rnhA	Op
 rnk	Op
 rnlAB	Op
+rnt-lhr	Op
 rob	Op
 rodZ	Op
 roxA	Op
+rph-pyrE	Op
 rpiA	Op
 rpiB	Op
+rplKAJL-rpoBC	Op
+rplM-rpsI	Op
+rplNXE-rpsNH-rplFR-rpsE-rpmD-rplO-secY-rpmJ	Op
+rplU-rpmA-yhbE-obgE	Op
 rplY	Op
 rpmE	Op
+rpmH-rnpA	Op
 rpnA	Op
 rpnB	Op
 rpnC	Op
+rpnD-yjiQ	Op
+rpnE-ypaA	Op
 rpoH	Op
+rpoZ-spoT-trmH-recG	Op
+rppH-ptsP	Op
 rprA	Op
+rpsF-priB-rpsR-rplI	Op
+rpsJ-rplCDWB-rpsS-rplV-rpsC-rplP-rpmC-rpsQ	Op
+rpsLG-fusA-tufA	Op
+rpsMKD-rpoA-rplQ	Op
+rpsP-rimM-trmD-rplS	Op
 rpsT	Op
+rpsU-dnaG-rpoD	Op
 rraB	Op
+rrsA-ileT-alaT-rrlA-rrfA	Op
+rrsB-gltT-rrlB-rrfB	Op
+rrsC-gltU-rrlC-rrfC	Op
+rrsD-ileU-alaU-rrlD-rrfD-thrV-rrfF	Op
+rrsE-gltV-rrlE-rrfE	Op
+rrsG-gltW-rrlG-rrfG	Op
+rrsH-ileV-alaV-rrlH-rrfH	Op
 rsd	Op
+rseD-rpoE-rseABC	Op
 rseP	Op
 rseX	Op
+rsfS-rlmH-mrdAB-rlpA	Op
 rsgA	Op
 rsmB	Op
 rsmC	Op
+rsmD-yhhL	Op
+rsmE-gshB	Op
 rsmF	Op
 rsmI	Op
 rspAB	Op
@@ -17621,6 +18663,7 @@ rttR	Op
 rutABCDEFG	Op
 rutR	Op
 ruvAB	Op
+rybA-mntS	Op
 rybB	Op
 rydB	Op
 rydC	Op
@@ -17633,32 +18676,48 @@ ryjB	Op
 rzoD	Op
 rzoR	Op
 sad	Op
+safA-ydeO	Op
+sanA-yeiS	Op
 sapABCDF	Op
 satP	Op
 sbcB	Op
 sbcDC	Op
+sbmA-yaiW	Op
 sbmC	Op
 sbp	Op
+scpA-argK-scpBC	Op
 sdaA	Op
 sdaCB	Op
+sdhCDAB-sucABCD	Op
+sdhE-ygfX	Op
 sdiA	Op
 sdsN	Op
 sdsR	Op
+secE-nusG	Op
+secG-leuU	Op
+secMA-mutT	Op
 selAB	Op
 selC	Op
 selU	Op
+seqA-pgm	Op
 serA	Op
+serB-radA-nadR	Op
+serC-aroA	Op
 serS	Op
 serT	Op
 serU	Op
+serV-argVYZQ	Op
 serX	Op
 setB	Op
 setC	Op
 sfmA	Op
 sfmCD	Op
 sfmHF	Op
+sfsA-dksA-gluQ	Op
 sfsB	Op
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+sgrST-setA	Op
 shiA	Op
 shoB	Op
 sibA	Op
@@ -17668,6 +18727,7 @@ sibD	Op
 sibE	Op
 sieB	Op
 sixA	Op
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 slt	Op
 slyA	Op
 slyB	Op
@@ -17684,24 +18744,31 @@ sodC	Op
 sohB	Op
 sokB	Op
 sokC	Op
+solA-yceO	Op
 soxR	Op
 soxS	Op
 speAB	Op
 speC	Op
+speF-potE	Op
 spf	Op
 sppA	Op
 spy	Op
 sraA	Op
 sraB	Op
 sraG	Op
+srkA-dsbA	Op
+srlAEBD-gutM-srlR-gutQ	Op
 srmB	Op
+sroG-ribB	Op
 sroH	Op
 ssb	Op
 sseB	Op
 sspAB	Op
 ssrA	Op
+ssrS-fau	Op
 sstT	Op
 ssuEADCB	Op
+stfE-tfaE	Op
 sthA	Op
 stpA	Op
 sufABCDSE	Op
@@ -17714,7 +18781,11 @@ syd	Op
 symE	Op
 symR	Op
 tabA	Op
+tag-yiaC	Op
+talA-tktB	Op
 talB	Op
+tamAB-ytfP	Op
+tar-tap-cheRBYZ	Op
 tas	Op
 tatABCD	Op
 tatE	Op
@@ -17725,15 +18796,20 @@ tdcABCDEFG	Op
 tdcR	Op
 tdk	Op
 tehAB	Op
+tesA-ybbO	Op
 tesB	Op
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 tfaS	Op
 tfaX	Op
+tff-rpsB-tsf	Op
+tgt-yajC-secDF	Op
 thiCEFSGH	Op
 thiI	Op
 thiMD	Op
 thpR	Op
 thrLABC	Op
+thrS-infC-rpmI-rplT-pheMST-ihfA	Op
+thrU-tyrU-glyT-thrT-tufB	Op
 thrW	Op
 tig	Op
 tilS	Op
@@ -17741,8 +18817,12 @@ tisB	Op
 tktA	Op
 tldD	Op
 tnaCAB	Op
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+tolC-ygiABC	Op
+tomB-hha	Op
 tonB	Op
 topA	Op
+topAI-yjhQ	Op
 torCAD	Op
 torI	Op
 torR	Op
@@ -17762,6 +18842,7 @@ trg	Op
 trkA	Op
 trkG	Op
 trmA	Op
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 trxA	Op
 trxB	Op
 trxC	Op
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 tsaD	Op
 tsgA	Op
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@@ -17784,6 +18866,7 @@ tusE	Op
 tynA	Op
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@@ -17792,6 +18875,7 @@ ubiF	Op
 ubiG	Op
 ubiK	Op
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 udp	Op
 ugd	Op
 ugpBAECQ	Op
@@ -17801,8 +18885,10 @@ uidR	Op
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+upp-uraA	Op
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@@ -17818,19 +18904,28 @@ uxaB	Op
 uxaCA	Op
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+valZ-lysY	Op
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+waaA-coaD	Op
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+xanQ-guaD-ghxQ	Op
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@@ -17844,6 +18939,7 @@ yaaW	Op
 yaaX	Op
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 yacH	Op
 yacL	Op
 yadE	Op
@@ -17851,9 +18947,12 @@ yadGH	Op
 yadI	Op
 yadMLKC	Op
 yadN	Op
+yadV-htrE	Op
 yaeF	Op
 yaeH	Op
 yaeI	Op
+yaeP-rof	Op
+yaeQ-arfB-nlpE	Op
 yaeR	Op
 yafC	Op
 yafDE	Op
@@ -17865,6 +18964,8 @@ yafS	Op
 yafT	Op
 yafU	Op
 yafV	Op
+yafY-ykfBF-yafX-ykfGH-yafW-ykfI	Op
+yagAB-insX	Op
 yagEF	Op
 yagGH	Op
 yagJ	Op
@@ -17894,10 +18995,12 @@ yaiX_2O	Op
 yaiY	Op
 yaiZ	Op
 yajD	Op
+yajG-ampG	Op
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 yajQ	Op
 yajR	Op
 ybaA	Op
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 ybaK	Op
 ybaL	Op
@@ -17914,6 +19017,7 @@ ybcH	Op
 ybcI	Op
 ybcK	Op
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 ybcQ	Op
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@@ -17928,11 +19032,15 @@ ybdM	Op
 ybdN	Op
 ybdO	Op
 ybdR	Op
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 ybeF	Op
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@@ -17942,7 +19050,10 @@ ybfL	Op
 ybfOC	Op
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 ybgS	Op
 ybhA	Op
@@ -17955,6 +19066,7 @@ ybhJ	Op
 ybhK	Op
 ybhL	Op
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 ybhQ	Op
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@@ -17965,24 +19077,30 @@ ybiU	Op
 ybiV	Op
 ybiX	Op
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@@ -18032,12 +19154,18 @@ yciY	Op
 yciZT	Op
 ycjD	Op
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 ycjW	Op
+ycjXF-tyrR	Op
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 ydbA_2	Op
 ydbD	Op
+ydbH-ynbE-ydbL	Op
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 ydcC	Op
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 ydcL	Op
 ydcO	Op
 ydcR	Op
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 ydcY	Op
 yddAB	Op
 yddE	Op
@@ -18079,7 +19208,9 @@ ydgA	Op
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 ydgD	Op
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 ydhB	Op
 ydhC	Op
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 ydhYVWXUT	Op
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 ydiK	Op
 ydiL	Op
 ydiM	Op
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 ydiP	Op
+ydiQRST-fadK	Op
 ydiU	Op
 ydiV	Op
 ydiY	Op
 ydiZ	Op
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 ydjE	Op
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 yeaL	Op
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 yqjG	Op
@@ -18638,9 +19840,13 @@ yraN	Op
 yraP	Op
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+yrbG-kdsDC-lptCAB-rpoN-hpf-ptsN-rapZ-npr	Op
 yrbL	Op
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@@ -18655,7 +19861,10 @@ ytfI	Op
 ytfJ	Op
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@@ -18682,6 +19891,7 @@ IS1A	Tp
 IS1I	Tp
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 IS5A	Tp
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 IS911B	Tp
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+IS911B-1	Tp
 IS1F	Tp
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View file @ecd0843
+++ b/CoreNLP/input/MultWord_NOAlphanum.txt 0 → 100644
View file @ecd0843
+Luria broth	MED
+minimal defined medium	MED
+ethyl acetate extract of conditioned medium	MED
+ethyl acetate extract of LB	MED
+N-C- medium	MED
+M56 medium	MED
+M9 minimal medium	MED
+LB medium	MED
+conditioned culture medium	MED
+LE392 conditioned medium	MED
+MacConkey agar	MED
+poor medium	MED
+chloroacetic acid	MED
+rich medium	MED
+MED L broth	MED
+LB broth media	MED
+Luria broth	MED
+minimal defined media	MED
+ethyl acetate extract of conditioned media	MED
+ethyl acetate extract of LB	MED
+N-C- media	MED
+M56 media	MED
+M9 minimal media	MED
+LB media	MED
+conditioned culture media	MED
+LE392 conditioned media	MED
+MacConkey agar	MED
+poor media	MED
+chloroacetic acid	MED
+rich media	MED
+MED L broth	MED
+dioxygen 10 µM	Aeration
+oxygen atom	Aeration
+dioxygen > 10 µM	Aeration
+dioxygen < 10 µM	Aeration
+mid exponential phase	Growth_phase
+exponential phase	Growth_phase
+early to mid exponential phase	Growth_phase
+stationary phase	Growth_phase
+early stationary phase	Growth_phase
+early exponential phase	Growth_phase
+mid to late exponential phase	Growth_phase
+10 to 40 MPa	Pressure
+0.1 MPa	Pressure
+plasmid pBAD/Myc-HisA mutant	Genetic_background
+λ(truncated soxR)	Genetic_background
+allS knockout mutant	Genetic_background
+plasmid pSE380 mutant	Genetic_background
+sdiA knockout mutant	Genetic_background
+relA knockout mutant	Genetic_background
+rpoS knockout mutant	Genetic_background
+oxyR knockout mutant	Genetic_background
+pdhR knockout mutant	Genetic_background
+narL knockout mutant	Genetic_background
+metE knockout mutant	Genetic_background
+metR knockout mutant	Genetic_background
+marR knockout mutant	Genetic_background
+multicopy plasmid pAMC35 (pexB) mutant	Genetic_background
+plasmid pGB2 mutant	Genetic_background
+plasmid pSU2719 mutant	Genetic_background
+multicopy plasmid pGS613 (pdhR) mutant	Genetic_background
+multicopy plasmid pBA11 (birA) mutant	Genetic_background
+plasmid pSXS (IPTG-induced soxS) mutant	Genetic_background
+plasmid pSXR (IPTG-induced soxR) mutant	Genetic_background
+plasmid pALS13 (not induced truncated relA) mutant	Genetic_background
+plasmid pSXR (not induced soxR) mutant	Genetic_background
+crp knockout mutant	Genetic_background
+cra knockout mutant	Genetic_background
+nrdA knockout mutant	Genetic_background
+nrdB knockout mutant	Genetic_background
+metC knockout mutant	Genetic_background
+znuA knockout mutant	Genetic_background
+arcA knockout mutant	Genetic_background
+marB knockout mutant	Genetic_background
+hydH knockout mutant	Genetic_background
+multicopy plasmid pGS623 (pdhR-lpd) mutant	Genetic_background
+multicopy plasmid pDEL15 (maoB) mutant	Genetic_background
+fhlA knockout mutant	Genetic_background
+cyaA knockout mutant	Genetic_background
+himA knockout mutant	Genetic_background
+fnr knockout mutant	Genetic_background
+iclR knockout mutant	Genetic_background
+hydG knockout mutant	Genetic_background
+lrp knockout mutant	Genetic_background
+ihfB knockout mutant	Genetic_background
+yiaJ knockout mutant	Genetic_background
+spoT knockout mutant	Genetic_background
+soxS knockout mutant	Genetic_background
+soxR knockout mutant	Genetic_background
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+zntR knockout mutant	Genetic_background
+plasmid pRL48 (from nt -1398 to nt +70 relative to rpoS translational start site) mutant	Genetic_background
+multicopy plasmid pRB38 (arcA) mutant	Genetic_background
+C-T transition at nt -10 from bioA translational start site	Genetic_background
+plasmid pALS13 (IPTG-induced truncated relA) mutant	Genetic_background
+marA knockout mutant	Genetic_background
+plasmid pSKOG (K. oxytoca hydG) mutant	Genetic_background
+allR knockout mutant	Genetic_background
+plasmid pCX16 (sdiA) mutant	Genetic_background
+pH 7.0	pH
+pH 6.5	pH
+Escherichia coli	Organism
+casamino acids	SUPP
+cadmium dichloride	SUPP
+ammonium sulfate	SUPP
+sodium nitrate	SUPP
+sodium nitroprusside	SUPP
+sodium salicylate	SUPP
+sodium arsenite 	SUPP
+sodium citrate	SUPP
+sodium formate	SUPP
+sodium molybdate	SUPP
+sodium selenite	SUPP
+desferrioxamine B mesylate	SUPP
+casamino acids	SUPP
+ethidium bromide	SUPP
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+vitamin assay casamino acids	SUPP
+yeast extract	SUPP
+nalidixic acid	SUPP
+homoserine lactone	SUPP
+leucine 	SUPP
+CCCP 10 µM	SUPP
+CTP 800 µM	SUPP
+cadmium dichloride	SUPP
+copper(II) sulfate	SUPP
+N-Decanoyl-DL-homoserine lactone	SUPP
+thiamine 	SUPP
+thiamine hydrochloride	SUPP
+nickel dichloride	SUPP
+p-hydroxybenzoic acid	SUPP
+p-aminobenzoic acid	SUPP
+iron(2+) sulfate (anhydrous)	SUPP
+EGTA 	SUPP
+Hg(II) 1 to 10 µM	SUPP
+hydrogen peroxide	SUPP
+L-glutamine zwitterion	SUPP
+sodium chloride	SUPP
+ammonium chloride	SUPP
+methyl methanesulfonate	SUPP
+protox assay	SUPP
+zinc sulfate	SUPP
+UTP 8	SUPP
+V. harveyi autoinducer	SUPP
+N-(3-oxohexanoyl)-L-homoserine lactone	SUPP
+amino acids	SUPP
+ZnCl2 	SUPP
+zinc sulfate 	SUPP
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View file @ecd0843
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View file @ecd0843